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 1 Target                                              100.0% 100.0%    -------------------------------------CCGAAGAGGCCAGAGAAAGGCCA-GATGTTGGGGCCCCCTTGGCCATAGCGGGCC------------AGCTGGAGAGTGTGGAGGCCTGGGCTGGGCAGGCGCCCACCTGCACAAGAAGGGCTGCACTGGGGG-AAGG-----------TACGGGTCACCTGGCCTCAGAGGCCATCCTGTCCACTTGCCACTGCC--GGCTG-----------------CTTGGAGGGTCCAGTGGC----C-----------T-----CAAGTTCCTGCAC-----------------CTTTCTGTGCAAC-TGG--------------------------------------------------G-ACTGC---TTTGGA--CACCTGTGACCATCAC---------AAGTCCTCCTGTCCATCCCTCCAC---------------------ACCGGGTGGCCGGATGAC---AGAAGAAAGGTGTCTGCTGGCCCTCCCTCTGGGCCC-TGTGGGAGCTGGATCCTTC---TAGC-AGCAGCTGGGCCACCAGGGGAGCAT------GAGCCTGGCTGCTGTCCTCCCCCTGCTCTGGGG-CCGGTGGAAGGTGGAGGGC---AGGTCAGGTGGCGCGGCCGATGGAGT---AT----GGCTGGCCATCGAGAACCT-GTCCCCACGCTCTAGGACACTGGCCGTTCC-AGCTC-CCCCAGGGCTCTGTGCACACGGACC---------------------AGGAGCCACCCAAGGGGGCAGAACAAAGTCAGGCCCCAGG--------GCCCCCTCCGGCCTGCTCCCCTGCCGAGCTGGGTACTGCC-ATGGGGT--------CAGGCCCTTC---------------CCTCCACAACGCCCCCA---CCTCCTGCTGAGAGCTGGAGTGGCTGCCACACG-G----AGGGCGCTGCCAGAGGAGAGGG-------------CAGAGCGTCTGTCCCTGCGGTGCCCTCCAGGTGTGCCTAGG-GTG-GC--CCCA-GCCCC----ACAGGCCCCGGGCACTTGCCCTTG-------------GTTCCCCTGCCCTTG-CTGGGACCCCTCAGGCCCAGCCTGAC---TCTGGGATCCCT-GGGCTCCTAGCA-------CGACCACTCTGGGGTCCTGCCTGTGGGGAGGGCTCGAGGCACCGACTC-ACACTCCTGATAAAATAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCTCCCAGACGTGCGGG-GGG-----ACAAGTGGCTTCTCTCAGACGTTTAAATAATCTCCGCCATATGTG----------------     
 2 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-98204_99168           94.1%  73.8%    --------------------CCTGGCCTTGGCTGTCCTGGAGGAGGCTGAAGAAAGGCCA-GGTGTTGGGGCCCCCTTGGCCATAGCTGGCC------------GGCTGGAGAGCGTGGAGGCCTGGGCTGGGCAGGCGCCCACCGGCCCAGGAAGGGGCTGCTCTGGAGGGAGGCT--C---GGGGCACGGGGCACCGGCCTCAGAGGCCGTCCTGTCCACTCGCCCCTGCT--GACTG-----------------CTCAGAGTGTCCAGTGAC----T-----------A-----CAAATTCCTGATGAGGGGCA--------C-CTTTCTGTGGAAC-TGGGACCCTGGCT----------------------------------------G-AGGGT---TTTGGA--CACCTGTGACTGTCAC---------AAGTCCTCCCACCCATCCTC-CAC---------------------ACCT-----CGTGGCTGG---ATGACAGAGGTGTCTGCTGGTCCTCCCTCCGGACCC-TGCAGGAGCCCGGTCCTCC---TAGC-ACCCACTGGCCCACCAGGGGAGCAT------GAGGCTGGCTGCTGTCCTCCCCCTGCTCTGTCA-CCAGTGGAAGGTGGAGGGC---AGGTCGGGCAGCGAGGCTGATGCAGC---TT----GGCTGGCCATCGAGAATCT-GTCCCCACCTTTCAGGGCGCTGGCCGTCCC-AGCTC-CCCCAGGGCTCTGAGCACACTGACC---------------------AGGAGCCACCCACGGGGGCAGAACACAGCCAGGCCCCAGG--------GCCCCCTCCGGCCCACTCCTCTGCCGAGCTGAGAGCTGCC-ATGGGGT--------CAGGCCCTCC---------------CCTCGACAACCCCC-CG---CCTCCTGCCGAGAGCTGGAGTGGCCACCACAGG-G----AGGGTGCTGCGAGGAAAGGGCA-------------GA--GCACCTG-TCCTGTGGTGCCCTCCAGGTGTGCCTGGG-GGCGGC--CCCG-GCCCC----ACGGGCCCCCGGCACCTGCCCTTG-------------GTTCTTCTGCCCTTC------------------------------------------------------C-------TGGGACCCGTGGGGTCGTGCCTGAGGGGAGGGCTCGAGGCACAGACTC-ACACTCCTGATAAAATAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCTCCCAGACGTGCGGG-GGG-----ACAAGTCGCTTCTCTGAGACGTTTAAATAATCTCCGCCATATGTGTGTGGGCCCGGCCCTC     
 3 Sus_scrofa-NC_010448.4-165538_165688                 82.7%  32.9%    -------------------------------------------TGGGCAGGGGCAGGCTG-AACGTTGGGA-CCCCGCT----GTGCTGCCC------AGGCCCCCGTGGTGCTCAGAAGGCCCCATGACAGTGTGGGGTATCTC--CAGGGGGAGGCGCAGG------GCAGGGCG--CTGGACACCCCCCACCCCCTGTCTCAGAGAATGGCCTGTTGCTTG-TGCCCTCTGCTGCAGGA----------------GAGGGGACAGCTATGTA----TGGTGGGA-CCGT-T--GTGAATGCTCTGTTC----CG--------T-CACTGTCGGGTGG-TGGACAGAAAGGTCCCTGGG-------------GCTGATCCT-GGCAGGGGCCCGGGCTG---------------------------GGGGGCC-AGGCTGCTGCTGTTCCCGCCCGGAG-----CAGGA--GCACCTGGGGCCTCT-GCGGGCAGGTGG-AAGGTGTAGAC----------------------------------------CATC---------------AGAGTCTGTC-CCCTCGTCT----AGGTCACTCGCTCCCCAGCTCCCTGAGGTCTGGAGAGGGTGGCTGGACAGAAGCA----------------GCCTGG----GCA---------------GAGCAAAGCCT-----GGCCTGCT----CACC--------TCCCACCCACCCTCCTCACTGCCGAGTTGGGCCGTA-------CCCCACCCTACC--GGAGGCCAGGCCCCTGGCATCAAACG---CGCATCTCTCCCGCTGGG-GGGCCCAGC----TCCCTGCCC-TGGGCGTGGGCTCTGCGGGAGGAAA--------AGGGCACATCCTGGCAACCATCTCCCTCCCCAGCTGCTTCCCCCTCCTCGTCCTCCCCTCCTCCCCCGCTCCTCCCCC-CACCCCGTCCTCTGCTCCCCTGTCCC--------------CACCTCCCGTCCTCTGCCTCCCCCTGCCAGGCTTGTCTG-G-GGCCAAGCCCAAGCCTTGCTGACCTGGCC------------AAATGGCCCTCCG-----GCTCCACTGCCCTGG-CATGGA--TCCTGTGGGCCAGCCTGG---GCTCCTGTGCCCCCAGCCCTGGGCACGGCCACCCTGGGGTC-----TTGCCTG-GGAGGGTGGGCTTGAGGTGCCAACTCACACTCCCTGATAAAATAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCGCCCAGACGTG-------CGGGGG-GACGCGCTGCTTCTCAGACGTTTAAAAAATCTCCGCCATATGTG----------------     
 4 Heterocephalus_glaber-NW_004624818.1-168530_168732   78.9%  29.5%    -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CACCACTGTGAGCTGAGCTGCCACGTGCCACCAGCTAGGGACAGAGGAG---------------------------------ACACTGAGGGGTAGGCTGGGCTCTGCTGGGTGGGCAGAGGAAGGCCGGATGTTGGGGAGTCCTGATTGGAAGGCACCATGCCCCCCTCTATTAAGACACCTGGAAGACAGCGTGGGGTGAGGGTCCTGTGT--GGGCAGGAGTGGGGACCCT-----TGGATGAGA-AGGGCTTCCTTGGGGCCAGTGCTGG--CCAGGGAATGGCCCTGGCCTTAGA--G--AATGTCATCTTGCTGCTGCTGCCAGCCAAGTGCACCGCCTGGTGGCAGAGCTCCTGACACTGCTGGGTCCTTGCCACCAGAGGGCCAGCTGGAGGCCCCTGGGCTGCCGCCCTGCCTCTGGACCGGGATGGGGGCTGGCTCGGATGGGCCAAGTTGCTGCTGTCTCCAG-CCCAGCCCAGCCATCCAGGCCAGGCTGCTCACGTCC-CGGGACCTCACTCTGAGGGAAG-GCAAGGCTTGGGCC-TGGGGATGGCCAGTGGTGCAG-GGGA-------------CAGA--GCATGG---GCTCGG---GATGACGGTGTC-----TATCC--TCTAAGACGCTCGCTACCCTGGCTGCCCCTGGGGTCTGAGTGCTGCGGA-----------------------------GCCAGAT----GAGGCAGG-G----G---TCAGGTCCTCCCCACGCCAGAAGC-------CT---CCACACCTGCTGATGG--CTGGGGTCACCCGTGACACGGCAGGCCCAGCTGGAGGACCAGGGTGTGTGTGGCTCTTCCC-AGCTTG-TCTGGGGCGGGCCTGGCTTGCTGACTGGTCACTAACCCAGGGATGGGCAGTGGCCACTGTCTCACTG-CCC---TTGCTGAGACC-CCTACAG----CCCTGGCT-CTGGTGTCCTGGAGGGACAGGCAGCACCACCATGGGGTCCTGCTG-GG-GGAGGCTGGAGGGAGCCGACTCACGCTCCCTGATAAAGTAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCACCCAGACGTGCGGGGGGG-----ACGAGTCGCTTCTCCCAGCCGTTTAAATAATCTCGGCCATATGTGTG--------------     
 5 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-231090_231225  84.4%  41.2%    ----------------------------------------------------------------------ACACCCC-----------------------------------------------------------CGGCCTGATCACTCGCTGCCACTGCTGGCTGCTTGGAATGT--CCAGTGGCTGCGAGCTCCTGATGTCAGACACCGTCCTGTGC-----CGGGTGTCAGGACAG-----------------TAGGAAGGT-------CC----C-----------C-----ACTGGCCCTTCCTTTGGGCC--------T-GATGGGGACCAGA-TCCCTCTGGCAGGAGCTGGTGCCACCAGCTGGGGATGGGCCA-GGCTGCTGCTG-AGTCC---CCTGCC--CGGCAGTCCAGGACCTGGCTGGA-CGAGTCC--CCAGGGATCCCTGGGGTAGGTGGAAGGTGGAGGCTCAGGC-------CTAGGGACAGTTTGGTCCGTGTGTCAGTTAGAGCATG--------G--CTGGCCATTTCGTGTGTGT---TCCC-AGCCACCAGGATGTGTGCTGTCCCT------GGCTCCTGCAG---GCGTCTGAGTG-------------CACAGACTGGAGGG--------GAGGGGCCAGAGGCCACGGAAG---TA----GGCTGGCCATTTCGTGTGT-GTTCCCAGCCACCAGGATGTGTGCTGTCCCTGGCTC-CTGCAGGGGTCTGAGTGCACAGACTGGAGGGGAGGGGCC-------AGAGGCCACGGAAGTGGGCAGAACAAAGTCTGGCCGGCCCATCCTCAGGGCCCCTCTGGCCTTCCTCACTGCTGGACCAGGCGATGCC-ATGGAGT--------CAGGCCTCC-----------------CACCCCCTGAACTCTCACCAGTCCCACTGCAAGCCGCAGCCACCGGCCCTGC-GG-ACAGGGCACTGCTGGAGGAAACGGTGTATCCGACCAGCAGAGCATCGTGCCCTGCGGTTCCCTCCCCAGCCCTT--------------------------------CCCCAGGCCTGTCTGGGGCCGGCCCCAGGTGCTGGCCTAGGCCCGTG-AGCCCCAGTCTGTGCAGTGGCCACTG---GCTCCTGTGCCC-CCAGCACCAGGT-------GTGGCTCCCGGGAGT--CCTGCCTGGGGAGGACTGAGGAAGCCGACTC-ACATTCCTGATAAAATAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCGCCCAGACATGCGGG-GGG-----GACGAGTGCTTCTCTCAGACGTTTAAATAATCTCCGCCATATGTGT---------------     
 6 Octodon_degus-NW_004524689.1-169363_169507           78.3%  30.3%    --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TAACATGATTAACGCTATCGCTGTGAGCTGAGCTC-TGCATGCCACCAGCTGGGGACAGAGGGGACCCCGAGGGGCAGGAAGGGGGG--------------------CAGCCCTGGCCTCCATTGAGAAGGCAGGGGAAGGTCTGATGTTGGGGGCTCTTGGGGGT-----ACCATGGCCCTTGTCCTC-GAGGTACCTGGAAGAAGCACAGGGTGGGTGTCCCGTGT--GGGCAGGAGCCAGAACCTT-----GTCCTGAGAAGTGGCTTCCCTGGGGTAAGTGCTGG--GCAGGAGACACCCCGGCCTTAGAG--A--AGTCACTT--CACTCCCATG--------------------GGCGACGGAGTCCCTGACACTGCTGATCCCTC--CATGGGATGGCCGGCTGG-AGGCCCTGGGGCTGCCGTCCTGAACCTGGGCTGGGTGGGAGCCGGATCAGATGACCCAGATGGCTG---------------------CTGTCCTGGCCAGGCTGTGCCCATCCCGGGGACCTCTTGTGGATGGGAG-GGGAGGCTTGGGCC-CTGTGACGGCCAGCGGTGCGG-GGAG-------------GG-A--GTGTGG----ATGCT--GGGTACGTGTGCC-----CGCCC--TCTAAGATGTGAGCTACCCTGGCCACTCCCAGAATCTGAGCCTGGGGCAGGAAAGAGCA---GTGGCCGTGCTTCGGAGCCAGGC----GAGGCAGG-G----G---TCAGGCCCTCCCTAGCCCGGATGC-------CT---CCGTACCTGCTGATGG--AGGGG-TCCCCTTGCTCATGGCAGGCCCAGCTGAAGGATCAGGGTTTCTACAGTTCCTCCCTGGCTTGTCTGGGGGTGGCCCTGGCCTGTGTCCCTGTCACTGACCCCAGGCTAAGCAGTGACTACTGTGTCACTG-TCC---TTGCTGTGGCC-CT-AAGA----CCCTGGCT-GTGG-TGCCCTGGGGGACTGGCGGTGCCACCCTGGGGTCCTGCTG-GGGGAGGGCTGGAGGGAGCCGACTCATACTCCCTGATAAAGTAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCGCCCAGACGTGCGGG-GGG-----ACGCGTCACTTCTCCCAGCCGTTTAAATAATCTCGGCCATATGTG----------------     
 7 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-166673_166874     77.3%  31.4%    --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCACCAGCTGGGGACAGAGGGGACACTGAGGGGCAGGAAGAGATCTGGGGGGGGGATGCCCTCCTGGAGGCTGGGTTCTGCTGGGGGGGCAGAGGGAGGCTTGATGTTGGAGGCCCCTGAACAGAAGGCACCATGCTCCCTGCCACTGGGGTGCCCAGCAGACAGGGTCTCGTGCG-------------GGCAGGAGCCAGAACCCT-----TGCATGAGAAGGGGCTTGCCTGGGCTAAGTACGGG--GCAGGGGACACCCCTGGCCTTAG------GATGTCATTTGCCTCCCACTGCCAGCCA-AGTATCCGTCTGGTGACAGAGTTCCTGCCACTGCCGGGTCC-TGCTGCGGGAGGGTCGGCTGGAGGCCCCTGGGGCTGCCGTCCTGCATCTGGACCGGGTGGGGGCTGGGTTGGAGGAGACAAATTGCTGCCGCTCCCTTGCCCACTCCAGCCGTCCTGGCCAGGTCGCATGTGTCCCCAGGACCTCACGTGGGTGGAAG-GTGAGGCTTGGGCC-CGGCGATGGCCAGCGGTGTGG-GGGC-------------TGGA--GTGTGG---ACGCTG--GGGGAAGCGTGCC-----CATCC--TCTAAGATGCTTGCTACCCCGGCCACTCCTGAGGTCCGAGTGCTCAGAAAGACAGAGCA---GGGGCCTTG------CTTTAGGC----GAGGCGGG-C----G---TCAGGCCCTTCCCACCGCAGAGGC-------CT---CCACACCTGCTTACGG--CTGGGGTCCCCTGCCTCACGGCAGGCCCAGCGGAAGGACCAGGGTGTGTATGGTTCCTGCT-GT----------------GCTGACCTGTGGACCTGTCACTGACTCCAGGCTGGGCAGTGGCTACCGTCTCACTG-CCC---TTGCTGCTACC--CTAAGG----CCTTGGCT-CTGGTGCCCTGGGGAGACTGGCGGCACCGTAATGGGGTCCTGCTG-GGGGAGGGCTGGAGGGAGCCGACTCACGCTCCCTGATAAAGTAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCGCCCAGACGTGCGGG-GGG-----ACGCGTCACTTCTCCCAGCCGTTTAAATAATCTCGGCCATATGTGTG--------------     
 8 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-172240_172445     82.2%  23.6%    ---------ACAG------GGGCTGGGACAGCTGTAAATG--GCTGTGACCATCATGAATGCTTC-TGTCT-CATCACTACCTGTTGGGTGACATACAGAAAGGTCTTACTGGGCCTCCCTCAGGCCAATCCTCCAGGAGCTCAGGCCATCAGCTGGGGA--------------------TGGGCCAGGCTGCCGCAGTCCCACCCAGAGCCCGAG----------------TGCCCAGG-------------------------GGCCTCTGGG----G----------------------AGGTGGGAGGT--------------------------------------------------GCAGGCCTGGGGCTGGTCAGTGGACGAAGTGTGGCTGGCCATCG-------------------------------GAGTCTGTTCCCACCCTCTAGGA-----CACTCGTGGTCCCTGGCTCCCTGGGGTCTG--------AGTGCACAGGCCAGGAAAGGGCGGGGTGGCCAGA--AGCAGCCA--AGGGGGAGA---GCAA-AGTCTGCCCTCCTCCCCCTGCCCCTGG--GCTCCTCTG---GCCCTCCTCGCTGTGGAGCTGGGCAACGCTGGGTGAAGTGG---TGGGGCCAGGCACCCCCCCAACGAAACTCGTGTTGCTCGCTGGAAGCCCAAGCTGC-CTGCCCCACGGAGAGGGCCGTGGGAGGAGAAGGGCACATCCTGGCGAGCGGAGCCTCTGGTG-------TAGACTTTTCTC--TCCCACTGCTCCCCTGGCCCCAGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----------------------------------------------------------------NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCC---GGCCAAATGACCCCCAG-----GCACCACTGCCCTCG-T--GTG--ACCCTTGAGCCAGCCCTGGCTCCCGTGAC-CCCCGGGCGCCCAGCACAGCCACCCTGGGGTCCTGCCTTGG----GGGGAGGGGGTTGAGGGCTCCGAGTCACACTCCTTGATAAAATAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCGCCCA-------------GACGTGGGGTGAGCTGCTTCTCAGACGTTGAAATAATCTCCACCATATGTGTG--------------     
 9 Camelus_bactrianus-NW_011514262.1-164338_164502      81.7%  30.7%    ------------------------------------CTGG--GAGGGCAGAGGAATGTTG-ACTATTGGGA-CCCTGCT----GTCCTGAGGACCCCAGGCCCCCCGCGGTGCTCAGAAGGCTCTGTAATGGCATGGGGGCTCACTGCACGGGAAGGGGCTTCTCCAGGGGGCCATG--CAGGACACT-GGACCCCCCTACCTTAGAGAACCTCCTGTCCACCCATGCCCCCT----------------------------GGGACAGCTGTGGA----TGGCTGCA-ACCA-GCACAGGTGCTTCTGTCCCATCTC--------G-CTCTGCTGGGTGG-TGGACAGGGAGGCCCCGCTGGCCCTGCCTC-CAGCTGATCCT-GCCAGGGGCTCCTGCCACCAGCTGGG--GATGGGCCAGGCAGCTGCCATCC-AGGCAGCTGCCATCCCTGCCAAGAG-----CAGGA--GCGGCTGGGGGCTCCTGAGAGCTGGTGG-ACGGTGCCGGCCCAG-CC-----------AGCTGGC--CTGTTGGTGGTGGATGG---------------AGAGTCGGCT-CCCACCTTT----AGGACACTCAGTCCCTGACTCCCTGAGGTCTGGGGCACAGGCCAGGAGAAGGGGT----------------GGCGCA----GAA---------------CCTGGTCTGCT-----GGCCCCCA----GGTC--------CCCCTCTGGCCCTCCTCACTGCGGAGCTGGGCAATA-------CGGGGGGGGGGG--GCC--AGGCCCCCTGCCCACCAAATG---CTGATCTCTCCCGCTGCA-GGA-CGAGC----TGCCTGCCC-CGTGGAGAGGGCTCGCGGGAGGAAA--------AGGGCACATCCTGGCGAGGGGTGTCTCCCTCC------------------------------------------------------CCGGCTGCTTCCTTGCCCC--------------CACATT----GGCCCTCAGCCCTCCCCCAGGCTTGTCTG-G-GACCCG--------------------GCC------------ACACCCTGCTCTG-----GCTCTGCTGCCCTGC-CCTCGGGCTGGCCTGGGCCCCTGTGC---CCCACCCGCTCCCTGGCCCCAGGCACAGCCACCCTGGGGTC-----TTGCCCA-GGGGGTGGGCTTGAGGGAGCCAACTCAGACTCCCTGATAAAATAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCACCCAGACGTG-------CGGGGGGGACGAGCAGCTTCCCAGACGTTTAAATAATCTCCACCATATGTG----------------     
10 Cavia_porcellus-NT_176233.1-169771_169963            77.7%  27.6%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCAG--AGCCTCCCTGGCCATTGCCTGGCTGGCTTGAGTCCTAGGGCTGGGGTCTGGCCGCTAGGGGCTCTGCTGGCCATACCCTCCATCCCC----------------------------AGGCTCCAGACTGG-CCCTGCTCTCCAGGAAGCTG---------------------CACCCCTGCAGCTCTCCTGGGCAGGCAGGCAATGGCTCTGGGGCC--------GGAACCTGTCCCAGCTGGGCCCCTGC-CTCAGGGAGC--------CAGGCCAGGTGGGTGCTGCCTTCA--CG---------------------------------GCCAGGCCCTGGGGAGAACACAAG--GCAGGCAAGGCCTCAGGG--------A--AGTGTGGCCAGTAGGGGGATA-------------------GGAGCCCCAGGGACCAGGGATGCAGGGCACCTGCGGGAGCTGGAAGCTGTGAAATGGGCTATTAATAGAGTCCTCCTCCCGGCGGGGCTGTCGGACATGATTAATGCCACC----GCTGGAGCTGAGCTGCTGTGTGCCACCAGCTGG---GGACTGAGGGGATGCTGAGGGGCAGAAAG----GGACC-CACTGGGGTCCTCC-TGGAGATGGGCTCTGCTGGGG-GGCA-------------G--A--GGAAGG---CCCAGT--GTTGGCGGCTGCT-----GAGCAGAAGGCACACACACCCTGCCATCGAGGCCCCTGGAAAGACA-----------GCATGAGTG---GGGGTCCTGTGTGGGCAGGAAGCT--GGACCCCAG-CGTGAG---AAGGGGCTTCCCCAGAATAGGTGCTGGGCAGGG---CACCGCCTGGCCTTAG--AGAATGTCGTTTTGCTC----------CTGCTGCCAGC-----CAAGTGCACCGTCTGGTGACAGAGTTCCTGACGCTGCTGGGTCCTGCGGACCAGTCGCTGACCCTGGGCTCAGCAGTGGCTTCTGTCTCACTG-CCC---TTGCTCTGACC-CT-AAGG----CCCTGGCT-CTG---------GCGCCCTGGCGGCACCACCCCAGGGTCCTGAAG-GGGGAGGGCTGGAGGGAGCCGACTCACGCTCCCTGATAAAGTAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCGCCCAGACGTGCGGG-GGG-----ACTCGTCGCTTCTCCCAGCCGTTTAAATAATCTCGGCCATATGTGTGTGGGC---------     
11 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-164304_164453      74.5%  24.8%    ----TGACTGCCACTCAC-CATTGGCTGGAGATGGCCAGG--GATG----GAAAGAGGGC-AGGAATGGGGTGCTGGTT---CTGGGA-GGCAGAACTGAGCGGGCCCACAG-------------------------------TTGTAGCAGGCAGGCAGA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GAGGCAG-CGTGGGGGGCTGACTTGAGGGGAAGCACTGGGGACAAAGACCTCAGGGAGTGGCCTGTCCAAATGCTGCCCCCACCAGTTGATGGGATGTCCAGTGACTGTAAGTCCCAATGCTCGCT-CAGCCCTTCTCACATAGATGGGAGA--GCTCTGGACG-CTCTGATCATCAT--G--AATGCTTCT-CTCCCTCACTC--------------CCTATTGGGCGA------GTGA----------GCC-----------------TGGCT-TGAACCTGGCAGGGGTCTGATCCTTCTCACAGAAGCTGGTGCCACCAGGGATGGGCCAGGCTCTCTTGACCCCGCATGCCCTCCTCACTATGTTG---------TGGCCAA-------------------TGGAAGGGGAAGACTCAGGGCCAGGGACTGTTCAGTGAGTGTGGTGGGTGGAGCATGGTTAGCCA--TCTCCCACTGTCTTTGCCCACTAGGATGCACATCCCATGG--TCCCCCACCCTC-----GATTTTTGTCCACAGGTCAGGGGAGTGGAGCTCAAGTGGGAAGAAGTCCCACCAGCCCGCCCTCAGGAC-CCCCCGCCCC-ATCTCC---CTTGCTGCTGAGCCATGCAGTGCTGTGGGGTCTGGCCCTCTTACCCTCC-----GAACTCTCACCTCTCCTGCTGAGGGCTGGG----------------------GCTGCTAGAGGAAAAGAGCACATCCTGCCAGGG-GGATGTCAGCCCCTGATGCCCCCTGCCCAGCCTTCTTTGACCCAGCAAAG-TACAGCAGGCTGGGCAGTTATCGCT----GGCTCCAT-AGGCTTAGCTCCCGGACCCCAGCACAGCCACCTGGGGACCAGTCT-GGGGAGGGCTTCAGGGAGCG--ACTCACACTCCTGATAATATAAAAATAGT-TGGGAGGAGGCGCCCAGACGTGC-GG-GGG-----GTGAGTTGCTTCTCTCAGATGTTTAAATTATCTCTGCCATATGTGTG--------------     
12 Castor_canadensis-NW_017871110.1-159794_159930       85.3%  42.3%    ---------------------------------------------------------------------------CC-----------------------------------------------------------AGGTTCACCTGCACAAGAAGGGGATTCTTTGGGGACAG-GC--ACCAGCAATGGATACCTCTGGCCTTAAAGAATATTCCGTCCACTTGCTGTCCTGCTGGCTG-----------------CATGGAGAG-----------------------------------TTCCTGAAATCTGGCA--------C-CTTCCCATGTGGC-TTTGGATCTGTGGCTGTCACGTGTGC---T-------CCTGT-CCCTCAC-----TCTCT---GTTGGG--TTGTGGGCAGCGGGAAGGCCCGC-TCTGGCCTGGGCCACCCCTCTGGGCTGGTTGAGGGATGG------AACCTGGGGCCACCAGCTGAGAATGGGCCAGGTTGCTGCTGTCCCCCG---CCCACTCTCTAGTAATCCAGGGTCAGG---TCCA-------CATGCCCCCAGGGATCTCT------GCGAGTAGTTG---GGAGGTGGAGG-------------CTAAGGCCCAGGAAT---GAGTCATTTGGTGTGGTGTATGAGCC---AT----GGGTGACTATGGGGAACCC-TTTCCCACCCTTCAGGGTGCTGGTCTCCCCTGGCTG-TCCCAGGTGTCTGAGTGCTCGGGTGGACAAGGACAGGGTAGCCAGAA---GCCCCTCAGGTGGTCAGGACATGGTCTGG-TTGGCCTGCTTCA-GGCCCTTCTGGTCCTCCCCACTGCTGGACTGTGGGCGATTTGTGGGGT--------CAGGCCCTCG---------------CCACCCACAGAAGTCACT--GCTCCTGCTGGAAGTTGTGCTCCTGTGTGGTGA-G------GGCACTGGAGGAAAAA--GGTATCTCCAACTGCACA---CAGCACAGCTATTGCTCCCTCCCCAGGCTTGTTGG-GGCCCC--CCAG-GCTTGCCAACCAGGTCAAATGACCCTGTGCTGGGCACTGACTGTTGTCCCCACTGCCCAGC---CTGACTCCTCCTGCGCTAGCCCTG---GCTCAG----GG-CCCCAAGAAAC--------AGACAGCCCTGGGGT--CCTCCTGGGGAGGGCTGGGGGGAGCTGGCTCACACTCCCTGATAAAGTAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCGCCCAGACATGCGGG-GG-------ACAGTTGCTTCTCTCAGACGTTTAAATAATCTCAGCCATATGTGT---------------     
13 Microcebus_murinus-NC_033661.1-163678_163811         78.1%  26.6%    -------------TCCGG-GGTGTCCTGCGCCT---TGGC--GG-G----GGCCAGCATC-A---GCCACGCTCCTGCC---TCC--A-GAGAGCCCCAGGCCAGCCTGGTGTGGGACACCTCCGGGGACAGGGAGCTGTGAAATGGGCTATTAGCAGAGTCCTCTCCCCTACCGGGCTGTCGTATGTGATTAAGGCCACTGCTGTGAGCTGAGCTGCCACATGTCACGCC-----------------------------------------------------------------------GGCTGGGGATGGAAA--GGGGCAGGAATGGGGAGCCCGT-TCCAGGAGGGAGCTCAG----CTGAGGCCAAGACACGGCCGGGCCAGCGCAAGGAGGCTCC---------AGGCTCTGCTG----AGAAAG---GCCAGGTGT-TGGCCCTCCCTGGGCTGAAG-------TCACCAGATCCCCGTAGCAGGAGG----------------------GAGG--------------CG----GAGTGG------GGGG----------TCC-----------------TCTGG-GGGCAGGCGGTGGGAGCCACAGCCTCAGGGAACGTCCCGTCCACTCG------------CTGCCATTGCCAACTGCTCGGGGCATCTCTGA----------------------------------------------GTGCGAGTTCCTGA--CCATCAGCCCTTCCCGTGCA---GCTGGGACAGCTCTGGACG--CCTGTG---CCCATCACAAACCCTGCTGTTCACTCCCTGT--GGGGTGACCCTCGCTCTGGGCTCCGTGGG--GGCCCTGATCCTTCTCGTACCA---------GTGGGGGTGG------------AC-CTGACTCT---GCTGAC---CCCCCTTTGTAGAACCGGCAGCGCTGTGGGTCTGACCCTCTCGTCCTCC-----AAACTCTGCCCTCTGCGGCCGAGTGCCGAGCAGCCTGCCACGCAGAGCGGGCGCAGCTAGAGGAGGAGGGCACATCCGGACACGTGGGGCGCCGGTCCCTGCTGCCCCCTGCCCAGGCCTCTCCGGGGATGTCCGG-CCGGCCTGC------------C---------GCCGCC-CCACCGCCCCGCCACCGCCCTGCGCAGCCACGCGGGGTCCTGCCGGGGGGGGGGGCTCAGGGAGCC--GACTCACACTCTGATAAAGTAAAAATAGC-CGG-AGGAGGCGCCCAGACGTGCGGG--GG-----GCGAGTCGCTTCTCTCAGATGTTTAAATAATCTCCGCCATATGTGTG--------------     
14 Cervus_elaphus-NC_057828.1-179047_179255             81.1%  31.2%    -----------------------------------------------------------------------------------------GCTGAATGTTGGAAACGGTGGTGCTCAGATGGCTCCAGGACAGTGTGGGGGCACACTGTGTGGTAAGGGGCTTCTCCAGGGTGCAGGTG-CAGGGCGCCGGACACCCCCTGCCCCAGAAAGTGTCCTGTCCACCG-TGCCCACTGCCACAGGAGG-------------CTGTGGGACAGCTGTGGA----CAGCTTCG-ACCC-C---CGTGTGTGCTTCGGCTCTGC--------T-TTCTGTTGGTTGG-TGGACAGAAAGATTCCGCAGGCCC-TCCTG-GGACTGATCCT-GGCGGGAACTTGGGCCACCGGCTGCA--GAGGGAGC---AGGGTGGTAGGG-AGGCTGCTGCTGTCCCCGGCCAGAG-----CAGGA--GCACCAAGGGCCTCTGGGCAGGTG---G-AAGGGACAAGCTCAGCCC-----------GACTGGC--CTGCTGGATGGGGCAAGGC---T----GGCCGTCAGTCTGTCCCCATCCTCTAG--AACACTCTTGATCCCCAGCTTCCTGAGATCCAGTGCGCAGGCTAGCAGAGGGCTG---GTAGTCAGAAGCAGCCCGAGATGGCA---------------GAGCAGAGCCTGG-CCGCTCACCC----CTGC--------CCCCACTGACCCTCCTCACTGCCCAGCTGGGTGAGA-------CATCCG-----------GGCCAGGCCCCCGCCAACCAAAG---GCTCCTCTTTGTGCTGGA-GGACCGAGC----TGCCTGCCT-GCGGGAGGGGCCCAGCGGGAGGAAA--------AGGGCATAGCCTGGTGACAGTGTCTCCCTCCCCGG---------------------------------------------------------------CAGCTGC--------------CCCCGCCACCAGCCCTCAGCCCTACCCCAGGACTGTCGG-G-GGCCAGGCCCAGGCCTTGCTGACCTGGTG------------AAGTGGCCCTTCA-----ACTCCACTGCCTGGT-GTGGA---CCCCTCGGGCCAGCCTGG---GCTCTGTGCCCCCAGGCCTTGGGCACAGCTTCCCCGAGGTC-----TCGCCTGGGAGGGTGGACTTGAAGGCGCCAGCTCACACTGCCTGGTAAAATAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCTCCCAGACGTG-------CGGGGGGACG-CGCTG-CTTCTAGACGTTTAAATAATCTCCGCCATATGTGA---------------     
15 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-166783_166916   78.5%  26.6%    --------------------------TGGGGAT---CGGG--GA-C----GGAAAGGGGC-AGGAATGGGGAGCCTGTC---CCAGGA-GGGAGCCCCGCTATGGCCAAGACAT-GGCTCGACCAGTGTGAGGAGGCCCCGAGCTCTGCTGGGCAGGCAGA---------GAAAGGCCAGATGTTGGTGCCTCCTTGGGCT-----GAAGTCACCAGGCCCCCGT-----------------------------------------------------------------------------GGCCGGAGCAGGAGG--GAGGCAG-AGTGAGGGGCTCCTCTGGGGGCAGGCACTGGGAGCCACGGCCTCAGGGAATGTCCCGTCCACTGCCAGCTGCTTG----------GGACGTCCGTGAGTGTGAGCT---CCTGACGCT-TGGCCCTTCCCATGCAGCTGGGACA--GCTCCGGACGCCTGTGACCGTCAG--A--AATCCTTCT-GTCCACCACTC--------------CCCATGGGGTGA------CCCT----------CCC-----------------TGTGG-GCCCAGAGGG--GGCCCCGATTATTCTCGCAGCAGTGGGTGCCACCG------------GCGGGGGTGGGCCCGGATCTGCTGACCCTGCT----------------------------------------------CTGGGGGTTGGGCGCAGGAATGGATCAGCTGGTGTGACGGGTGGAGCACGGCTGGCCC--TCGAGA---GTCTGTCCCCACCCTCCAGGAC---GCACAG--CCCCTGACCCCTACTCAAGTCTTTGTGCACAGGCCGGGAGGGTGGGGCCACAA---------GTGGCCCA---------------A--GTGGGCC---AAGTCC---TGCCGCCTGCCCTCGGGACGGCGCTGTGGGCCTGGGCCTCTCGCCCTCC-----AAATTCTCCCCTCTGCGGCCGAGGGCCGGGCTGCCCGCCACGCGGAGAGGGCGTAGTTCGGGGAGAAGGACACATCCGGGCAGGTGGGGCTCCAGGCCCTGCTGCTCCCTGCCCAGCCTTCTCTGGGGACGGCCAA-GCC---TGC------------C---------GATGCC-CCACTGCCCCGCTGCCGCCCGGCACAGCCACGGGGGGTCCTGCCT-GGGGGGCGGTCCAGGAAGCC--GACTCACACTCTGATAAAGTAAAAATAGT-CGG-AGGAGGCGCCCAGACGTGCGGG-GGG-----GCCAGTCGCTTCTCTCAGATGTTTAAATAATCTCCACCATATGTGTG--------------     
16 Hipposideros_armiger-NW_017731634.1-161868_162082    81.1%  31.0%    TCACTGAGGCCAGGTTCAGGGAGGCCCCGGGCTCTGCTGG--GCAGGCAGAGGAAGGCCAGGTGT-TGGGA-CCC--------------CGCTGTGCTGAAGATCGGTGGCGCTCAGCAGGCTTGGTGACAATATGGGAGCCCACTGCATTGGAGGGGGCTTCTCCAGGGGGAGGGCC-CTGGGCACCGGACACCACCAGCCTCAGAGAACGTCCTGTGCACTCATGCCAC-TGCCGCAG-------------------------GAGCTGGGGC----C----------------------ACTGTGCCCATCACT--------C-CCTGCTGGGTGAT-GGGACAGAAAGGTCCCTGTGGCCCTCCCTTGGGCCCGATCTT-GGTAGGAGCGAGTTCCACCAGCTAGG--AGTGCGCCA----------------GGCTGCTGCTGTCCTTGCCCAGAG-----CACGAGTGCCC--AGGGACCTCGTGGGAAGG-GGG-AAGGTGCAGGCCCAGGCCTGGGGCTAGTTTGGTGGC--ATGGGGGACAGAGCGTGGC---TGG--CCACCAGAGCCTGTTCCCACCCTCTGG--CACGCTCGACGTCCCTGGCTCCCTGGGGTCTA-GTGCAC--------------------AGGCTAGGAGCA--GCCTACGGGCA---------------GAACAAAGCCTGG-CGGCCGGCCG--CAGGCG--------CCG--------CTGGTGTCCTGATGCCCAGCTGGGC-------CAGGTG---------GGGCCGGGCCCCCTGCCCACAGAACTCTCATCTCTGC--CGTGGTG-AGCCCGAGC----CTCCTGGCCCACGGAGAGGGCTCTGCAGGAGGAAA--------AGGCCACATCCCC----------------------------------GCCTCC-----CA----------------------------------------------------------------CTCCCGGCCCCCAGCCCTCCCCCAGGCTGGCCTG-G-GGCCAGCCAAGG-CCTTGCCGACTCTGCG-----------AAGCGACTCCCCAG-----GCTCCACTGCCCTGG-TGTGGA--CCCCTCAGCCCAGCCCTGGCTCCTGTGCCCCCCCAGGTACTGGGCACAGCCACCCTG-----------GGGTCCTGTGGGAAGGGTGGGAGGAGCCGACTCACACTCTCTGATAAAATAAAAATAGTTGGGAGGAGGCACCCAGACGTGCGGGG-GGAGG---GGGCGAGCTGCTTCTCAGACGTTTAAATAATCTTGGCCATCTGTG----------------     
17 Urocitellus_parryii-NW_020540697.1-270030_270164     84.6%  37.9%    -------------------------CTGTGGCCAGACTGCCTGGAGG----GGACGGGAT-GGG---GCAGGAGCMC-----------------------------------------------------------AGGGCCACCTACACAAGAAGGGCCTTCTCTGAGGGGATGTG--CTGGACAGTGGCTA--CCCGGCCTCAGAGAATGTCCTGTCCATTTCTGCCACTGCAGGCTG-----------------TGTGGACCACCCTGGGAC----T-----------G-----AGAGCTCCTGATGTTCAGCA--------C-CTTTGCRTGCAGC-TGGACACCTGTGGACCTCTGTCCGTCAGACGG---TGTCCAT-CCCTAAG-----TCCCT---ATTGGT--GGTGAGACTAYAAGA-G--------GCCCTGTGAGTGCTCTCCCTGGGC-CAAGTGGGGCTGGATCCCGGAGCTAATGCCGGGAGCTGAGGATGGCCAGGTTGC-TGCCATCCCCAC---GCCTAA--CGCAACAGCCGGAGCTGGC---TGCA-------CAAGC-CCCAGGGACCTTT------GGGAGCAGGTG---GAAG--------------------GTCAGGCCGGGGTG------AGCCAGGTGTGTGGTGAATGGAGC---AT----GGATGGCCACAGGGGACCC-TCTTCCATTCCCTGGGTTGCTCGCTGTCCCTGCCTG-GCTCTGGGGTCTGAGAGCTCTGGTGGGAGAAGGCAGGGTGGACAGAA---GCTGCCCAAGTGGGCACAGCAAGACCTGGCCAGCCTGCCCTGC-GGCTCTGTC-------CTAGCTGTGGAGCTGCACGCC----ATAGGGT--------TGGGTCCTCC---------------CCTCCCCTCCCCTCCTCTCCCTCCCCAAGAGAACCCTTAGCTCCCTGCTGAAA-GCCAGCAGCCTGCCCTGYAGGAAGGGG---------------------------------------------GCTGC-TGG-GGGAAA--TTGT-GTCCTCTGAGCAAAGCACCTGTCCCTGATGTCTCTTCCCAAGCT--TGTCTGGGGCTGACCCCATCAAATGACCCTGGGCTGGCCACT---GCCATC---------GTCTCCCAG--------CAAGCTGCCCGGGGT--CCCTCTGGG-GAGGGCTGGAGGAGTCGACTCACACTC-CCTGATAAGTAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCGCCCAGACGTGCGGG-GGG-----ACGCGCTGCTGCTCTCAGACGTTTAAATTATCTCGGCCATATGTGT---------------     
18 Fukomys_damarensis-NW_022900935.1-168452_168589      77.1%  25.5%    --AGCGAGAGGCAGCGGAGGCCTTGGGAAGAGTGGCTGGT--GGCAG---GAAAAGGAGC-CCCCAG--------------------------------GGACACAGGGATGCAGGGCACCTGCAGGAGCAGGAAGCTGTGAAATGGGCTATTAATAGAGTACTCTTCCCGGCGGGGCTGTTGAACGTGATTAATGCCACCACTGTGAGCTGAGCTGCTGTCTGCCACCAGCTGGGGACAGAGGGG---------------------------------ACACTGAGGAGTAGACTGCACTCTGCTGGGTGGGCAGAGGAAGGCCAGATGTTGGGGAGTC-TGATTGGAAGTCACCACGCCCCCGTCCATCAAGACGCCTGGGAGACAGCGTGGACTGAGGGCCCCATGT--GGGCCGCATGGGGTGAGGG-----T--CCCGTG-TAGGTTTCCCCGGGGTAGGTACTGG--ACAGGGGATGACTCTGGCTTTACA--G--AATGTCATCTTGCTGCTGCCACCAGCCAAGTGTACCGTCTGGTGTCAGAGTGCCTGACACTGTCTGGTCCTTGCTGCCAGAGAGCCAGCTGGAAGCCCCTGGGGATGACATCCTGCCTCTGGACTGGGAGGAGGCTGGCTTGGATGGGCCAAGTTGCTGCTGTACCCCTGCCCACACCCTCCGTCCAGGCCAGGCTGCATGTGTTC-CAGGACCTCACATTGGTGTAAG-GTGAGGCTTGGGCC-TGCGGATGTCCAGTGGTGCAG-GGGA-------------CAGA--GCATGG---ACTCGG---GGTGACCGTGCC-----CAACT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTAAGATGCATGCTCCCT-GGCTTG-TCAGAGGCAGCCCTGGCTTGCTGACTGGTCACTGACCATGGGATGGGCAGTGGCTACTGTCCCACTG-CCC---TCACTGAGAAC-CCTTTGG----CACTGGCT-CTG--TCCCTGGGGGGACAGGCAACACTGCCATGGGGTCCTGCTG-GG-GGAGGCTGGAGGGAGCCGACTCATGCTCCCTGATAAAGTAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCGCCCAGACATGCGGG-GGG-----ACGCGTCGCTTCTCCCAGCCGTTTAAATAATCTCGGCCATATGTG----------------     
19 Odobenus_rosmarus-NW_004450599.1-177044_177220       82.6%  30.7%    ---------------------------------------------------------------------GA-CCCCACTGTGCTG-----AAGACCCCGGGTTCTCACGGTGTTCAGCAGCCTTCGTGACAGTGTGGCGGCCCAGTGCATGGGAAGGGGCTTCTTCAGTGGGAGGGCG-CTGGGCACTGGACACCATCTTGTCCACGGTGCCCACTGCTGCAGGAGC-----CCGGACT---------------------------GTCTGTGGG----C----------------------GGCTTGTCCAT-CAC--------A-CCCTGTCAGGTGA-CTCTCAGAAAGTTCCCGGGGGCCTTCTCTCAGGCCTGGTCCC-AGCAGGAGCTTTTGTCACCAGCTAGG--AATGCGCCC----------------AGCTACTGCTGTCCCCTGCCCAGA-----AGCACGAGCTCCCAGGGTCTTCTGTGGAAG------ATGGAGGC----CTGGGGCTGGTCACTCAGCATGGC--GGACGGGGCATGGGGGCCA---TCGG-AGC--ACGTTCCCCCCCCACCCCCCAG--CATGCTTGCTG-CCCTGGCTCCCTGGGGTCTGAGCGCACAGGCCGGGAAAGGGTG-GGTAGGCCGGAAGCAGCCCAACAGGGCA---------------GAGCAACGTCTGA-CTGGTCTCCCCCCAGGAC--------TCCCTCTGGCCCTCCTTGCTTCTGAGCTGGGTGATG-------CCGTGG---------GGCTGGGCC-CCCTGCCCACAAAAC---TCTCAGGCGCTTGCTGGA-AGGCTGAGC----CGCCTGCCCCACGGGGAGGGTGTCGCGGGAGGAAG--------CAGACACGTTCTGGCAGGTGGGGTGTCTAGCATGGACCTCCATCCTCCGCTTCTCCCCTG----------------------------------------------------------------CC-CCAGCCCCTAGCCCTCCTCCAGGCTTGTCTG-C-GGCCCGCCCTGGGCCTCGCCAACCTGGCT------------GACCATCCCCCAG-----GGGACCCTGCCCTCA-TGCAC---ACCCTCGGGCTGGCACTGGCTC--CATGC-CCCTGGGCACTGGGCACGGTCACCCTGGAGTCCTGCCTGGGGGTGGGGGGGGGGCTTGAGGGAGCCGACTCACACTCCCTGATAAAATAAAAATAGTTGGGAGGAGGCGCCCAGACGTGCAGGG-GGAGGGGGGCACGAGCTGCTTCTCAGACGTTTAAATAATCTCCGCCA----------------------     
20 Ursus_arctos-NW_020656172.1-177014_177234            82.5%  30.1%    ----------------------------------------------------------AG-GACGTTGGGA-CCCCACTGCGCTG-----AAGACCGCGGGTCCCCACGGTGCTCAGCAGCCTTGGCGATGGCGTGGTGGCCCAGTGCATGGGAAGGGGCTTCTCCAGTAGGAGGGCA-CTGGGCACTGGACACCATCTAGTCCACTATGCGCACTGCTGCAGGAGC-----TTGGGCC---------------------------ATCTAGGGG----C----------------------TGCTTGTGCCT-CAC--------A-CCCAATCAGGTGA-CTCAGAGAAAGTTCCTGCTGGCCTTCCCTCAGGCCTGGTCCT-GGCAGGAGCTTGTGTCACCTGCTAGG--AACGGGCCA----------------AGCTGCTGCTGCCCCCTGCCCAGA-----AGCATGAGTACCCAGGGGCTCCTGTGGGAG------GAAGCTGCAGGCCTGGGGCTGGTCAGTGGCATGGTG--GATGGGGC--AGGGGGCCA---TTGG-AGCACGTCCCCCCCCCCCGCCCCCTGC--CATGCTTGCTG-CCCTGGCTCCCTGGGGTCTGAGTGCACGGGCCGGGAAAGGGTGGGGTAGGGCAGAAGCCGACCAAAGGGGCA---------------GAGCAACGTCTGA-CGGGTCTGCCCCCAGGAC--------TCCCTTGGGTCCTCCTTGCTTCTCAGCTGGCTGATG-------TGTGGG---------GC-CAGGCC-CCCTGCCCACAAAAC---CCTCAGGCTCCTGCTGGA-AGGCTGGGC----CATCTGCCGCAC--------------GGGAGGAAG--------AAGGCATATCCTGGCAGGGTGGGTGTCTAGCATGGACCTCCATCCTCCGCTTCTCCCCTG----------------------------------------------------------------CCCCCAGCCCCTAGCCCTCCTCCAGGCTTGTCTG-G-GGCCAGCCCTGGGCCTGGCCGACCCAGCC------------GACCGTCCCCCAG-----GGTCCCCCGCCCTCA-CGGAG---ACCCTCAGGCCAGCACTGGCTC--CGTGC-CCCTGGGCACTAGGCACAGTCACCCTGGAGTCCTGCCTGGGCAG----GGGGGGCTTGAGGGAGCCGACGCACACTCCCTGATAAAATAAAAATAGTTGGGAGGAGGCGCCCAGACGCTCAGGG-GGAGGGGGGCACGAGCTGCTTCTCAGACGTTTAAATAATCTCCACCATAT-------------------     
21 Acinonyx_jubatus-NW_020834739.1-177425_177629        82.1%  31.0%    -----------------------------GGCTCTGCTGG--GCAGGCAGAGGAAAGCAG-GATATTGGGACCCCACCCTGTGTT-----GAAGACCCATGTCCCCGTGGTGCCCAGCAGCCTCAGTGACAGTGTGGTGGCCCATTGCATGGGAAGGGGTTTCTGCAGCGGGAGGGCA-CTGGGCACCGGATACCCACTGCTTCAGGA------------------G-----CCTGGAC---------------------------AGCTGTGGA----C----------------------TCCTGGCCCCT-CAC--------A-CCCTACCGGGTGA-CAGACAGAAAGTTCCCGCTGGCCTTCCCTCAGGGCTGGTCCT-GGCAGGATCCTGTGTCACCGGCTAGG--AATGGGCCA----------------GGCTGCTGCCGTCCCCTGCCCAGA-----AGCGCAGGCACCCCGGGCCTCCGTGGGTGG------CAGGTGCGGGCCCGGGCCCGGGGCCGGTCAGTCGGC--AGGG--GGGGGGCGGGACA---TCGC-TGGCTGCCAGAGC------------------------------------CCGTCTCCAC-CCGATGACACTCTCAGGAAAGGGTGGGGTGGCCTGAAGCAGCCCAGAGGGGCA---------------GAGCAAAGTCTGG-CTGGTCCACCCCCATGAT--------GCCCTCGGGC-CCCCTTGCTTCTGAGCCAGGTGATG-------CCGCGG---------GGCTAGGCCCCCCTGCCCACAAAACTCTCTCCTGGCTCTTGCTAGA-AGGCTGAGC----CTCTGGCCCCACGGCGAGGATGCTGTGGGAGGAGA--------GAGGCACATCCTGGCAGGTGGAGTGTCCAGCATGAAGCCCCATCCCCGGCTGCTCCCCTG----------------------------------------------------------------TCCCCCGGCC------CTCCCCCAGTCTTGTCTG-G-GGCCAGCCCTGGGCCTCGCTGGCCTGGCCAACCG---CCCCCCCCTCCCCCCAG-----GGTCTGCTGCCCTCG-TGCAG---ACCCTCGGGCCAGTCCTGGCTCCTGTGCC-CCCTGGGCGCTGGGCACGGTCACCCTGGAGTCCTGCCTGGGGCGGGGAGGGGGACTTGAGGGAGCCGACTCGCACTCCCTGATAAAATAAAAATAGTTGGGAGGAGGCGCCCAGACGGGCAGGG-GGAGGGGGGCGCGAGCTGCTTCTCAGACGTTTAAATAATCTCCGCC-----------------------     
22 Dipodomys_ordii-NW_012267222.1-161942_162075         78.1%  28.7%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCCACGCTGGCTGGGAATGGTGGGTG-----GGGCAGGAGAGGGAGCCCAGAATCCTGGCTGAGCCGGGACCGGACATGGCTCTGGCACCCA----------GAGAGG-CCCTGGCGCTGGGGCAGGCAGG----GAGGGCCAGATGAG-GAGACCATGCAGGCCCCTGGACATGGAGGC----------AGGCTGAGAGGCTTGGGCGGGAG-----------------CCCAGGGGCCTCTGGGGAGAGGCACTGGGCGGTGGA---------CACTCACGGCCTTACAAT-----ATCCTGTGTGGAGAGTTCCTGGGGTTGAGCCCTGT--CCTGGGTAG-CCTTGGGCCCTGGA--C--CCTCAGGCCTGCTTCCC-CTCCCCG-------------------------CCCCCGCAGCT------CCC-TGGGGGTGGCGCCCCCTCTGG----CTCT-CATCTGGAGAGCTGGGCCTGGGGCTGTTACCACGGGCCCAGGATGGGCCAGGTTGTTGCTATCCACCTTCCCCT--------TGTAGTCCAGGCCCAAGACCTCTGAGGCA------------GGAGG-CAGAGGCGCAGACC-AGGGACAGGCCAGTCATTATG-GAGAGTGGACAGCCCTGGGGA--GTCTGT---TGGAGTGCTGGTGAGCCAGGGCAGGGGGGCAGAGCCAAGGTCTCAGCAGGCCTGCCCCAGCCCCGGCCCCGGC----------CCCTGCCCC---AGGCCCCTG------CCCCAGGC------------------C---CCAGCCCCCCCCAGGCCCAGCTCCCCCCCCCCCAGCCTCCCCATGCTGTGTGGTGAGACCTCTCCATTTCCTCGGGAAGCCAGGCC-CCTGCTGAGGGGAGGGCTGCTGGAG----GAA------AAGGGCACATCCGACCAAGCGGGGCTCCGGAGGCTCCCCGCCTGGGCCTGCCGACTGGTCCACAG-CCA---TCGTCCCGCGT----CCCT----GCCTGGCC-CCG--CCGAGCTCCGGCCTTGGCTCTGGGCCCCTGGG-TCCTGCC-GGGGAGGGCTGCAGGGAGACGGCTCGCACTCCCTGATAAAGTAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCGCCCAGACGTGGGGGGGGG-----T---GCCTTGCCTCTCAGACGTTTAAATAATCTCAGCCATATGTGT---------------     
23 Orycteropus_afer-NW_006921723.1-156255_156389        89.2%  40.3%    ---------------------------------------------------------CAG-TGGGT-TTGGTTGTTTCTTTTTTTGC-------------------------------TGGGCCGGAGCAGGGCCTGGAGCCATCTGCACAGGAAGGGGCTTGTACAAGCGGAGCAT--GTAGGACCTGGA----CCCCAGCCTCAGGCAGCTCGTGTCCATGCCCTACCCA----GCTG-----------------CTAGAACTGCT--CAGTG----A-----------C-----ACTGTTCCTGGTGTCCCGCC--------C-CTTCCCAGGTTG---------------------------------------CCTCT-GACCATCACAG-AGACC---CCTGGG--TGAGTGACAGGACAGAA----AG-TCCTTGCTGGCCCTCATCTATACCC--AGCGGGGACTTC------ATTCTTCTGGCCAGGGATACAGCTGCCACCCCCTAACCCAAGTAGTCAGGGCCAGGCCTCTGAGGCTCCTGGACCTCT---GTGG-ACCAAACAGGTCCTGAGCTACAGGG------AGGTGGTGCCTCAGGCCTGGGATAGGCCTC----CCTGCTCTGAAAAGAGCTC-----AGCTCAGTGTGGTGGACAGAAAGA---AT----GACTGGCCACTGAGAGCCT-GTCCC-TGCTCTTAGGATACATGCTGTCCCTGGCTT-CCTGAGGGGTCAAATGCATAGGTAG-TGGAGGCTAAGGTGG-----CCAGAGAAGCCCAGAGGGCAGAATAAAGTCTGGCCTGCCAGCTCCCAGGGGTGCCCCATGCCTGGGC---------------CATG-CTGTGGAGT--------CAGGTTCTCC---------------TGCCTGAAGGACTC-TTGTTGCTCCTGGGGGAAACTAGAGCTGCTGCTGAGTG-G--AGAGGGTGCTGCTGCGGGAATGGACACTGCTGG----CAG---------GGCCCAGCTGCACCCCCT-GGCCTCTCAG--------------------------TGTCCCCAGCTTGTCAGAGGGCTGCCCCGGCTTGGCT-----GACCAGG-CTGAAACCACTATGGGCTGGGGAGTG---GCTGCTGGGACCCGAGTGCTGGGCA-------CTGGCCACCCCCAGGTCCTGCCTGGGGGAGGTCTGAGAGAACCGACTCACATTCCCTGATAAAATAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCGCCCAGACGTGTGGG-GGG-----ATGAGCTGCCTCTCAAGA-CGTTGAAATCATCTCTGCCATCTGTG----------------     
24 Suricata_suricatta-NC_043707.1-178390_178593         81.8%  28.5%    ----------------TCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCTGG--GGCCGCCAGGACAGGAGGGGCGGGAAAGACCCTCACTGAGGCTGGTGTGAGCAGGCCCTGGGCCCTGCTGGGCAGAGGTCTCCGCTGTGCTGGAGACCCCAGGTCCCGTGGCGCTCCGCACCTTGGTGACAGCGCG-GTGGCCCACTGCACGGAGGGGGTTTCTGCGGTGGGAGACACTGGGCAC-----TGCTGCC---------------------------CCGTCACCA----G----------------------TGCTTCTGTCC-ATC--------A-CACTCTACCCGGT-GATGGACAAGTTTCCCGCTGGTCTTCCCTCAGGGCTGGTCCT-GGCAGGACCCTGTGTCACC-ACTAGG--AATGGGCCA----------------AGCTGCTGCTGTCCCTTGCCCAGA-----AGCACAGGCACCTGGGGCCTCCGTGGGTGG------ACGGTGCAGGCCCCAGCCTGGGGCTGGTCAGTCGAC--AGGCGAGATGGGACACCGC---TGG--CCGCCAGAGCCTGTCCCCACCCAAGGG--CACTCTTGGTG-CCCGGGCTCC-TGAAGTCTGAGTAGCACAGGCCAGGAAAGGGTGAGGTGGCCGGAAGCATCCCAAAGGGGCC---------------GAGCAACGTCTGG-CTGGTCCACTCCCACGAC--------GCCCTCAGGCCCTTCTTGCTTCTGAGCCGGTTGATG-------CTGCAG---------GGCCAGGCCCCACAGGGAAGATGCTGC------------------------------------------------------------GGAGGAGA--------GAGGCCTATCCTGGCCGG-------CAGAGCCCGGATCTCCATCCCCGGCTGCTCCCTTG----------------------------------------------------------------GCCCCCCCCC------CCCCCGCAGTCTTGTCTAGG-GACCCAGCCTGAGCCTCGCTGACC---------T---GGCCAACCACCCCCCAG-----GGTCTGCCGCCCCCA-TACAG---ACCCTCAGGCCAGTGCTGGCTCCTGTGGC-CCCTGGGCACTGGGCACAGTCACCTTGG-ATCCTGCCTGAGGCCGGGAGGGGGGCTTGAGGGAGCCGACTCACACTCCCTGATAAAATAAAAATAGTTGGGAGGAGGCGCCCAGACGGACAGGG-GGAGGGGGGCGCGAGCTGCTTCTCAGACGTTTAAATAATCTCCGCCA----------------------     
25 Jaculus_jaculus-NC_059106.1-159485_159625            85.9%  38.9%    ------------------------------------CTCAAGGCCAT----TGCAGGCAG-GCT---GGGAAAGCCT-----------------------------------------------------------GAGGCCACGTAAATGTGTAGAGACTTCTCTAGGTGGAGACA--CCAGACAGTGGACACTGCTGACCTTAGAAAATGTCTTGTCCACTTGCTGCTACTGTGGCTG-----------------TGGGGAGAA-----------------------------------GACCTGAGTCTTGGCA--------C-TTTCCCACACAAC-GAGACAGCTTTGAACCGGGGT--------C-------CCTCT-CCCATGT-----TGT---------GC--AGTGGGTCAGCAAGAAG--------GTCTTGTGAACCCCATCTCTGGGCTAGGTAGGGGCTGGATCTTGGAGCTAGTGCCACCAGCTGAGGATGGGCCGGGCTGCTGCCCACC---------------CTAGCTATCCAGGGCCAGG---TCCC-------CATGCTGCA-GGGACCCCT------GAGAGATAATG---GATGGTGGTGG-------------CTCAGGCCAGGGGTG---G-GATAGTTACTGTAATGAGTA-----------------GAGTGTGGAGAGCTC-ATTTCCACCCTCTTGAGTGCTCAA-GTTCCTGGCTG-CTCCAGGCACCTGAATGCTCAGGTGGGCTAGGAAGAATGGTCAGCACCCCCCACCCCCAATAGGCCAAGCAAGGTTTGACTGGCCTGCCCTCA-GCCCTCTCTGGCCCTCCTCACTGCTGAGCCAGGTGATG--TGTGGGAT--------CAG-ACCCCT---------------TCATCCATAGAACTTATT--GCCCCTGCTGGAAGCCGGAGCTGCCTGCCATGG-GG---CAGGCTCTGCTGGAAGAAAAGGGCACATTCACCCAACA---GAGCCCGCCTGCTGTTCTGTCCCC--------AGG-GCAGCC--CCAC-GCTTGCTGACCCAGTCAGATGGTCTCCAGCTGGGCAGTGACCATCTTTTCCACGGCCCTCA-CAGAGACTGCTCGGGCCTCAGCCCTG---GTTCTGGTGCTT-CCAGAAGCAGG--------CACAGCCTCTGGGGT--CTGGCTGAGGAGGGTGGGAAGGAGTCGGCTCTCACTCCCTGATACAGTAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCGCCCAGACGTGCGGG-GGG-----ACGCGTTGCTTCTCTCAGACGTTTAAATAAGCTTGGCCATATGTG----------------     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .    ....                   .::.:.*********   ** .*..*   **..                               *   ..  *** ***: * **  .**