GTGTGCCGCGCCCGGGGGATGCCTCGGGGTGGGAGCTGGGCCTGGCGACCCTCGGCACAGGGCACCGGGGACACCACCCTGATCCGACTCCTCTCCGCCTCTCTCCCTGCCTCCCTCTCTCTCTTCTGCTTCTCCCTCTGGCTCTCTCTCACTCCCCCACCTCCCCACAGACACCCGCCCCCTCTCCACGCAGCGGCCACTCCCCCCACTGTGCAGCCTGGAAACCATCGCTGAGGAGCCCGCCCCAGGCCCTGGTCCCCCGCCACCAGCGGCTGTCCCCACCAGCTCTTCTCAGGGACGGCCCCCATACCCCACAGGACCCGGAGCCAATGTGGCAAGCCCCCTAGAGGACACTGAGGAGCCCCGAGACAGCAGGCCTCGGCCGTGCAACGGCGAGGGCGCCGGCGGGGCATACGAGAGGGCCCCCGGCAGCCAGACGGACGGCAGGAGCCAGCCCCGGACCCTGGGCCACCTGCCCGTGATTAGAAGGGTGAAGAGTGAGGGGCAGGTGCCCACGGAGCCCCTGGGAGGGTGGCGGCCCCTGGCCGCTCCCTTTCCAGCTCCTGCCGTGTACTCCGATGCCACGGGCAGTGACCCGCTGTGGCAGCGGCTGGAGCCATGTGGCCACCGAGACAGCGTTTCCTCCTCCTCCAGCATGTCATCCAGCGACACTGTCATTGACCTCTCCCTGCCCAGCCTGGGCCTGGGCCGCAGCCGTGAGAACCTCGCTGGAGCCCACATGGGACGCCTGCCCCCCAGGCCCCACTCGGCTTCGGCTGCCCGCCCAGACCTGCCACCTGTGACCAAGAGCAAATCCAACCCCAACCTTCGGGCTACAGGCCAGCGGCCTCCCATACCTGACGAACTGCAGCCCAGGTCCCTGGCCCCAAGGATGGCTGGCCTCCCCTTCCGGCCTCCCTGGGGCTGCCTTTCCCTGGTGGGCGTGCAGGACTGCCCCGTGGCTGCCAAGTCCAAGAGCCTGGGCGACCTCACTGCTGAT
Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.
Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.
Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.
Distribution of HSS in the input sequence
HSS id | Strand | Frame | Length | Start | End | Score | P | Show Result | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 0 | + | 1 | 272 | 36684 | 37499 | 123.078 | 5.551e-16 |
Plot |
2 | 1 | - | 3 | 117 | 37016 | 37366 | 62.841 | 1.990e-07 |
Plot |
HSS id | Sequence | |
---|---|---|
1 | 0 | STQRPLPPLCSLETIAEEPAPGPGPPPPAAVPTSSSQGRPPYPTGPGANVASPLEDTEEPRDSRPRPCNGEGAGGAYERAPGSQTDGRSQPRTLGHLPVIRRVKSEGQVPTEPLGGWRPLAAPFPAPAVYSDATGSDPLWQRLEPCGHRDSVSSSSSMSSSDTVIDLSLPSLGLGRSRENLAGAHMGRLPPRPHSASAARPDLPPVTKSKSNPNLRATGQRPPIPDELQPRSLAPRMAGLPFRPPWGCLSLVGVQDCPVAAKSKSLGDLTAD |
2 | 1 | SSSGMGGRWPVARRLGLDLLLVTGGRSGRAAEAEWGLGGRRPMWAPARFSRLRPRPRLGRERSMTVSLDDMLEEEETLSRWPHGSSRCHSGSLPVASEYTAGAGKGAARGRHPPRGS |
Reference sequence (1): Target Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% |
cov pid 1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . . . 4 . . . . : . . . . 5 . . . . : . . . . 6 . . . . : . . . . 7 . . . . : . . . . 8 . . . . : . . . . 9 . . . . : . . . . 0 . . . . : . . . . 1 . . . . ] 1146 1 Target 100.0% 100.0% ------------------------GT------GTGCCGCGCCCGGGGGATGCCTCGGGGTGGGAGCTGGGCCTGGCGACCCTCGGCACAGGGCACCGGGGACACCACCCTGATCCGACTCCTCTCC----GCCTCTCTCCCTGCCTCCCTCTCTCTCTTCTGCTTCTCCCTCTGGCTCTCTCTCA------CTCCCCCACCTCCCCACAGACACCCGCCCCCTCTCCACGCAGCGGCCACTCCCCCCACTGTGCAGCCTGGAAACCATCGCTGAGGAGCCCGCCCCAGGCCCTGGTCCCCCGCCACCAGCGGCTGTCCCCACCAGCTCTTCTCAGGGACGGCCCCCATACCCCACAGGACCCGGAGCCAATGTG------------------------------------------------------GCAAGCCCCCTAGAGGACACTGAGGAGCCCCGAGACAGCAGGCC---------TCGGCCGTGCAACGGCGAGGGCGCCGGCG--GGGCATACGAGAGGGCCCCCGGCAGCCAGACGGACGGCAGGA-GCCAGCCCCGGACCCTGGGCCACCTGCCCGTGATTAGAAGGGTGAAGAGTGAGGGGCAGGTGCCCACGGAGCCCCTGGGAGGGTGGCGGCCCCTGGCC---GCTCCCTTTCCAGCTCCTGCCGTGTACTCCGATGCCACGGGCAGTGACCCGCTGTGGCAGCGGCTGGAGCCATGTGGCCACCGAGACAGCGTTTCCTCCTCCTCCAGCATGTCATCCAGCGACACTGTCATTGACCTCTCCCTGCCCAGCCTGGGCC------TGGGCCGCAGCCGTGAGAACCTCGCTGGAGCCCACATGGGACGCCTGCCCCCCAGGCCCCACTCGGCTTCGGCTGCCCGCCCAGACCTGCCACCTGTGACCAAGAGCAAATCCAACCCCAACCTTCGGGCTACAGGCCAGCGGCCTCCCATACCTGACGAACTGCAGCCCAGGTCCCTGGCCCCAAGGATGG------------CTGGCCTCCCCTTCCGGCCTCCCTGGGGCTGCCTTTCCCTGGTGGGCGTGCAGGACTGCCCCGTGGCTGCCAAGTCCAAGAGCCTGGGCGACCTCACTGCTGAT------------------- 2 Mandrillus_leucophaeus-NW_012103199.1-236499_237376 98.7% 78.9% ----------------------------------GCCGCGCCCGGGGGATGCCTCGGGGTGGGAGCTGGGCCCGGCGACCCTCGGCACAGGGTACTGGGGACACCACCCTGATTCAACTCCTCTCCGCCTCTCTCCCTGTCTTCCTCTCTTTCTCTCTTCTGCTTCTCCCTCTGGCTCTCTCTCGCTCTCACTCCCCTACCTCCCCACAGACACCCGCCCCCTCTCCACGCAGCGGCCGCTCCCTCCACCGTGCAGCCTGGAAACCATTGCCGAGGAGCCCGCCCCAGGCCCTGGCCCCACGCCACCAGCGGCCGTCCCCACCAGCTCTTCTCAGGAACGGCCCCCATACCCCACAGGACCGGGAGCCGATGTG------------------------------------------------------ACAAGCCCCCCAGAGGACACTGAGGAACACCGAGACAGCAGGCC---------TCGGCCGTGCAATGGCAAGCGTCCCGGCG--GGGCATACGAGGGGGCCCCCAGCAGCCAGTCGGACGGCAGGA-GCCAGCCCCGGACCCCGGGCCACCTGCCCGTGATTAGAAGGGTGAAGAGTGAGGGTCAGGTGCCCACAGAGCCCCTGGGAGGATGGCGGCCCCTGGCT---GGTCCCTTTCCAGCCCCTGCCGTGTACTTCGATGCCACGGCCAGTGACCGGCTGTGGCAGCGGCTGGAGCCATGTGGCCACCGAGACAGCGTTTCCTCCTCCTCCAGCATGTCGTCTAGCGACACTGTCATTGACCTCTCCCTGCCCAGCCTGGGCC------TGGGCCGCAGCCGTGAAAGCCTCCTCGGAGCCCATGTGGGACGCCTGCCCCCCAGGCCCCACTCAGCTTCAGCCGCCCGCCCAGACCTGCCACCTGTGACCAAAAGCAAATCCAACCCCAACCTGCGGGCTGCGGGCCAGCGGCCTCCCACGCCTGATGAACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNNN------NNNN------------- 3 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-129209_130133 98.0% 82.6% ---------------------GGACTGCGCCGTAGCAGCAGCAGGGTGGGGGCACTGAGTGTGCGGGGGGATGCCTCGGGGTGGGGCCCGGGCACCGGGGACTCCACCCTGATCCGACTCTCCTCTC---GCCTCTCTTGTTG--TCTCCCTCTCTCTTCTGCTCCTCCCTGTGGCGCTCTCTCTCAC---TCCCCCCACCTCCCCACAGACACCCGCCCCCTCTCCACGCAGCGGCCGCTCCCTGCACCGTGCAGCCTGGAGACCATTGCCGAGGAGCCTGCCCCAGGCCCCGGCCCCCCGCCACCAGCGGCCGTCCCCACCAACTCTTCTCAGGAATGGCCCCCGTGTCCCACGGGACCCGGAACCAATGTG------------------------------------------------------GCAAGCCCCCCAGAGGACCCTGAGGAGCCCCGAGACAGCAGGCC---------GAGGCCGTGCCATGGCAGGGGCCCCAGCG--AGGCATGCGAGGGGACCCCCAGCAGTCAGACGGACGGCAGAA-GCCAGCCCCGGCCCCTGGGCCCCCTGCCCGTGATTAGAAGGGTAAAGAGTGAGGGGCAGGTGCCCACAGAGCCCCTGG------------------CC---GGGCCCTTCCCGGCCCCTGCCGTGTACTCCGACGCCACGGGCAGTGACCGGCTGTGGCAGCGGCTGGAGCCACATGGCCACCGAGACAGCGTTTCCTCGTCCTCCAGCATGTCATCCAGTGACACTGTCATCGACCTCTCCCTGCCCAGTCTGGGCC------TGGGCCGTAGCCGAGAGAGCCTCGCCGGAGGCCCCGTTGGACGCCTGCCCCCCAGGCCCCACTCGGCTTCAGCTGCCCGCCCAGACCCGCCACCGGTGACCAAGAGCAATTCCAACCCTAACCTGCGGGCTGTGGGCCAGCGGCCTCCCACGCCTGAGGACCTGCGGCCCAGGCCCCTGGCTCCACGGATGC------------CTGGCCTCCCGCTCCGGCCGCCCTGGGGCCGCCTCTCCCTGGGGAGCCTGCAGGACTGCCCCGTGGCTGCCAAGTCCAAGAGCCTGGGGGACCTCACTGCGGATGACTTTGC----------- 4 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-261215_262110 93.4% 66.4% -------------------------ATGCGTGCGCGACTGGAGGG--T------CCCGGGG---GATGGGGGCTGGCCCCG--------------------TGTTCCTCACACAGGGGGCCGCGGGGACACCACCCT----GACATGA-TTCTCTTTGTCTCTCTGTCCCTGTCTCTGTGTGTGTCTCTGTCCCTAACACCCC---ACAGACACCCGCCCCTTCTCCATGCAGCGGTCAATCTCTCCCCTGTGCAGCCTGGAAACTATTGCTGAGGAGCCAGCCCTGGGCCCCAGCCTCATGACACGGGCAGCCACCCCCACCAGCCCCTCCCGGGAAGGGCCCCCGAGCCCCATAAGACCGGGAGCCACAGT---GGCTGGCCTCTCAGGGATGGCTCTGGGAACATCCGTGCCCCTCCAGCTCAGGACTGGGAGCCTCAGGAGCACCGAGGAGCCTCCAGAAAGCAGGCA---------GTGGCCCTGCCATGGCGGGGGCCCTGGTG--GGGCATGCGAGAGGGCTCCTGGCAGCCACATGGATAGTAGGA-GCCACCCCCGGGCCTTGGGCTCTCTGCCTGTGGTCAGAAGGGCCAAGAGTGAGGGGCAGGTGCCCTTAGAGCCCCTGGGTGGATGGCGGCCCTTGGCT---GGGCCCTCTCCTACCCCCACTGTGTACTCCGACGCCACGGGTGGTGACCGGCTTTGGCAGCGGCTGGAGCCGGGCAACCACCGCGACAGCGTGTCCTCATCCTCCAGCATGTCGTCCAGCGACACTGTCATCGACCTCTCCCTGCCAAGCCTGGGCT------TGGGCCGCAGCCGCGAGAGCCTTGCTGGGGTCCCCATTGGACGCCTGCCCCCAAGGCCCTCCTTGGCCTCAGCTGCCCGCCTGGACCTGGCTCCTGTGACCAAGAGTAAATCCAACCCCAACCTGCAGGCTGCGGGCCAGCTGCCTCCAGTGCCTGACGAGCTGCGCTCCCGGCCCCTGGCCCCACGGCTGC------------CCGGCCTCCGCCTGCAGCCACCCGGGGGCCGCCTCTCCCTGCTGGGCCTTCAGGACTGCCCTGTGGCCGCCAAATCCAA-------------------------------------------- 5 Marmota_monax-NW_025724459.1-192396_193433 92.8% 64.1% ---------GTG-------GGGAGCCGGCCCG----ACTGCCCCTTGG------CACAGAGGGTCACGGGAC--A---CCATTTCTT-----GA-CACGACTTTTCCTCCCTGTCCTGTCTCCCTGT----CTCTCT----CCCTTCC-CCCGTGTCCCCGTCTC-TCTCTTCTCTCTGTCACTCCCCTCGCTCCCTCTTCCC---CCAGATGCTCGCCCCTTCTCTCTGCAGCGGTCAATCTCCCCTCTGTGCAGCCTGGAAACCATTGCCGAGGAGCCGGTCCTGGGCCCTGGCCCCCCACCACAGGCAGCTGCCCCCACCAGCTCCCACAGGGAAGGGCCCCAGTCCCCTGCGGGACCTGGAGCCAAAGT---GGCCAGCACACCACGGACTGCTCTGGGAGCCTCTGAGCCCCTACAGCTCAGAACCCGGCATGAAGGGGACCTCGAAGAGCCCCCC---------AG---------GGAGCCGCGCCATG---GTGGTGCCAGCG--GGGCATGCCCAGGGTCCCCTGTCAGCCAGACGCACAGCAAGA-GCCATCCCCAAGCCCTGGGTCACCTGCCCATGGTCAGAAGAGCCAAGAGTGAGGGCCAGGTGCTGCTGGAGCCCCTGGGTCCCTGGCGGCCCCTGGCC---GGGCCCTCCCCGACCCCAGCCATGCACTCAGACGCCACAGGCAGTGACCGGCTGTGGCAGCGGCTGGAGCCAGGCAGCCACCGTGACAGTGTGTCCTCGTCCTCCAGCATGTCTTCCAGCGACACTGTCATCGACCTCTCCCTGCCAAGCCTGGGCC------TGGGCCGCAGCCGTGAGAGCCTCACTGGGGGCCCGCTTGGACGTCTACCCCCAAGGCCCTGCTCAGCCTCGGCCACTCGCCCTGACCGGCCACCTGTGACCAAGAGCAAATCGAACCCCAACCTGCGGGCCGTGAGCCAGCTGCCTCCTGTATCTGATGAGCTGCGGCCCCGGCCCCTGGCCCCACGCCCGC------------CCGGCCTCCACGCCCGGTCACCCTGGGGCCGCCTCACCCTGGTGGGCTTGCAGGACTGCCCCGCGGCTGCCAAGTC----------------------------------------------- 6 Castor_canadensis-NW_017871110.1-192396_193335 92.9% 62.6% --------CCTT-------GTCTTTCTGTCTC--TCTCTCTCATTTTC------CTCTCTGTCTGCCTGTCTCTGTCTTTCTCTG-------TC-T----CCCTT--TCTCCCTTCCATCTCT----------GCCT----TCCCCGT-CCCTCTCTCTGTGTCT-CCTTCTCCA-----TCTCCCTGTCTGTCCCTCTCTCC---CCAGATACCCGCCTCTTCCCCATGCAGCGGCCCATCTCCCCCCTGTGCAGCCTGGAAACCATTGCTGAGGAGCCGGCCCTGTGCCCTGGCCTCCTACCCCAGGGGGTCTCTCCCGCAAGCCCTTCCCAGGAGGGGCGGCAGTGCCCTGCAGGACCTGGAAGCAAAGT---GGCTGCTCCTCCACAGTCAGCTCTGGGAGCTTCTGGGCCCCTCCAGCTCAAGACTGGGGGCCACGGGGACAATGAAGAGCCCCCT---------CA---------AAAGCTGCACAATGGTGGGGGCCCTAGTG--GGGCATGTGAGGGGGTCCCTGGGAGCCAGCCAGACAGCAAGA-GCCACCCCCAGGCCCTGGGCCATCTGCCCGTAGTTAGAAGGGCCAAGAGTGAGGGCCAGGTGCCCTTGGAACCCGTGGGCACATGGCGGCTCCTGGCT---GGGCCCTCCCCTACCCCTGCCGTGTACTCGGACGCCACGGGCAGCGACCGGTTATGGCAGCGGCTGGAGCCGGGTAGCCACCGCGACAGCGTGTCCTCGTCCTCCAGCATGTCATCCAGCGACACTGTCATTGACCTCTCCCTTCCAAGCCTGGGTC------TGGGCCGCAGTCGTGAGAGCCTCGCAGGGGTCCCGCTCGGATGTCTGTCCCCGTGGTCCTGCTCAGCCTCAGCTGTCCGCCCAGACCCGCCTCCTGTGACCAAGAGCAAATCAAACCCTAACCTGCGGGCCGTGAGCCAGCTGCCTCCCGTACCTGATGAGCTGAGGCCCAGGCCCCTGGCCCCTCAGCCAC------------CCGGCCTCCACACCCGGCCCCCCTGGCGTCGCCTCACCGTGGTGGGCCTGCAGGACTGCCCAGTGACAGCCAAGTCCAAGAGCTT-------------------------------------- 7 Lemur_catta-NC_059130.1-192658_193552 93.2% 64.9% --------------------CAGGGCGGGCGCCAAGTGTGCCCTTCGG------GAC-GTGGGCGACAGG-G--GTGCCTG-----------GG-GTGGGGGCTGGCCCTGTTGCCCGGCAGTGC----AGGGGCCT----CAGGACA-CCACCCTGAGACGTGTCTCCCTC---CTCTGCCTCTCTCTCCCCCGGCCCTCTTCCCCCAGGTGGCCGCCCCTTCTCCCTGCAGTGGTCCATGTCCCCCCTGTGCAGCCTGGAAACCATCGCCGAGGAGCCAGCCCTGGGCCCCGGCTCCCTGCCACCGGCTGGCAGCCCCACCGGCCCCGCCCGGGAAGGGCCCCAGGGCCCCACGGGACCCAGAGCCAACGC---GGCCAGCCCCACGGGGTTGGCTCTAGGGGCTTCTGTGCCCCTCCAGCTCAGGACTGGGAGCCCCAGGGACCCTGAGGAGCCCCCAGAGGGCCAGCA---------GCAGCTGTGTGACAGTGGGGGCCCTGGCA--GGGTGCACGAGGGGGCTCCTGGGAGCCAGACAGACAGCAGGA-GCCAGCCCTGGGCCACGGGCCGTCTGCCCACGATCAGAAGGGCCAAGAGCGAGGGGCAGGTGCCCACAGAGCCCCTGGGTGGATGGCGGCCCCTGGCC---GGGGCCTCTCCCACCCCCGCCGTGTACACGGATGTCACGGGCAGTGACCCGCTATGGCAGCGACTGGAGCCAGGCAGCCACCGCGACAGCGTGTCCTCGTCCTCCAGCATGTCGTCCAGCGACACCGTCATCGGCCTCTCCCTGCCGAGCCTGGGCC------TGGGCTGCAGCCGCGAGAGCCTCATGGGGGGCCCCGCGGGACGCCTGCCCCTGCGGCCCTGCTCAGCCCCCGCCGCCCGCCTGGACCCGCTGCCGGTGCCCAAGAGCAAATCCAACCCCAACCTGCGGGCTGCGGCCCCGCTGCTGCCTGTGCCCGACGAGCCGCGGCCCCGACCTCGGGTCCCGA---------------------------------GGCCGCCCTGGGGCCGCCTCTCCCTGGTGGGCCTGCAGGACTGCCCCGTGGCCGCCAAGTCCAAGAGCCTGGGC---------------------------------- 8 Cavia_porcellus-NT_176233.1-192396_193282 91.7% 62.0% -------GCCTGGCTGCTGGGGGTCG---GGGGGCCCTTAGCCCGCTG------TGCAGGGGCTGGAGGG----TTCCCATTTT--------GA-CATGGCTTTCCTTCC-CCATCTCTCACCTT--------TGAC----TCATTTT-CCC-----------------CTCCTCTCCCATCTCTCTGTCTCTGCCTGTCTCCCCAGA---CCCCCGCCCCTTCTCTACACAGCGACCCATCTCCCCCTTGTGCAGCCTGGAGCCCATCGCGGAGGAGCCGGCCCTGGGCCCCGGTGCCCCTGCACAGGCAGCCACCCCCACCAGCCCTCCCAGGGTGCGGCCCCCGTGCTCCACGGGGCCTGCGGCCAAAGC---GGCCAGTCCCCCACGGACAGCTCAGGGACCTTCCGGGCCCCTCCAGCTCAGGACTGGGGGCCAAGAGGACAATGAAAACTCTCCC---------AG---------AAAGCTGCTCAATGGTGGGGGGCCTAGTG--GGGCATGCGAGGGGGCTGCTGGCAGCCAGACAGACAGCAGGA-GCCAGCCTCGAGCCCTGGGTCTCCTGCCTGTGGTCAGAAGGGCCAAGAGTGAGGGCCAGGTGCCCTCGGAGCCCCCAGGTGTGTGGCGGCCGCTGGCC---GGGCCCTCCCCGACGCCTGCCATCTACTCGGACGCCACAGGCAGTGACCGCATATGGCAGCGGCTGGAGCCAGGCAGCCACCGAGACAGCGTGTCCTCGTCTTCCAGTATGTCCTCCAGCGACACTGTCATCGACCTCTCCTTGACAAGCCTGAGCCTGGGCCTGGGCCGAAGCCGCGAGAGCCTGGCAGGGACCCCTCTAGGCCGCCTGCCCCCACGGCCCTGCTCAGCCTCCACTGTCCGCCCGGACCTGCCTCCCGTGACCAAGAGCAAGTCGAACCCCAACCTGCGGGCTGCGGGCCAGCTGCCGCCTGCGCCCGACGTGCTGCGGCCCCGGCCTCTGGCCCCACGGCTGC------------CTGGCCCGCGGCCCCGGCCTTCCTGGGGGGGCCTTGCCCTGCTGGGCCTGCCGGACTGCCCGGTAGCTGCCAAGTCCAAG------------------------------------------- 9 Microcebus_murinus-NC_033661.1-192396_193263 92.1% 61.8% ACCCCTACCCCCACAGCAGCAGGGCGGGTG-CCAAGTGTGCCCTGTTG------GAC-GTGTGTGAAGGG-G--GTGCCTG-----------GG-GCGGGGGGTGCCCGTCGGCCGGTGGTGCAG----GGGCCGCA----GGGACAC-CGCCCCTGAGACGAGCCTCCCTCCCTCTCTC-----------CCCCGCTCCTCTCCCCCAGGTAGCCGCCCCTTCTCCCTGCAGAGGTCCATGTCCCCCCTGTGCAGCCTGGAAACCATCGCGGAGGAGCCAGCCCTGGGCCCCGGCTCCCTGCCGCCGGCAGGCAGCCCCACCGGCCCCTCCCGGGAAGGGCCCCAGGGCCCCG---------------------------------CAGGGTGGGCTCCCGGGGCTTCTGTGCCCCTCCAGCTCAGGACTGGGAGCCCCAGGGACACTGAGGAGCCCCCAGAGGGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGTGCGGCAGGGGGGGCCCCGGCG--GGGTGCGCGAGGGGGCTCCCGGCAGCCAGACGGACAACGGGA-CCCGGCCGCGGGCCACGGGCCGCCCGGCCACGATGAGAAGGGCCAAGAGTGAGGGGCAGGTGCCCACGGAGCCCCTGGGCGGGTGGCGGCCGCCGGCC---GGGCACTCCCCCAGCCCCGCCGTGTACGCGGATGTCACGGGCAGTGACCGGCTGTGGCAGCGGCTGGAGCCCGGCGGCCTCCGCGACAGCGTGTCCTCGTCCTCCAGCCTGTCGTCCGGCGACACCGTCATCGACCTGTCCCTGTCCAGCCTGGGCC------TGGGCTGCAGCCGCGAGAGCCTCCTCGGGGGCCCCGTGGGGCGCCTGCCCCTGCGGCCTCGCTCGGCCTCTGCCACCCGCCTGGACCCGCTGCCCGTGACCAAGAGCAAGTCCAACCCCAACCTGCGGGCCGCCGCCCAGCAGCCGCCCTCGCCCGACACGCCACCGCCCCGACCTCTGGTCCCGA---------------------------------GGCCGCCCTGGGGCCGCCTCTCCCTGGGGGGCCTCCAGGACTGCCCCGTGGCCACCAAGTCCAAGAGCCTGGGCGATCTGACCG------------------------ 10 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-210102_211031 93.6% 63.8% ---------------------------GCACAGAGGCCTACGGGTTAT------CACCCAC---CCCTGACACAATTCTCG--------------------TCTTTATCTCTGTCCTTTCTGCCCCC-CTTCCACTC----TGTCTCT-ATTTCTCGGTCTCTCTGTGTCTCCCTCTGTTCCTCTCCCTCTCTCTTTCTGCCT---CCAGACTCCCGCCCCTTCTCCATGCAGCGGTCGATCTCCCCTCTGTGCAGCCTGGAAACCATCGCTGAGGAGCCAGTCTTGGGCCCAGGACCCCTGCCACTGACGGCCACCCTCACCAGCCCCTCCCAGGAAGGGCCCCAGTGCCCTGCAAGCCCTGGAGCCAAAGT---GGCGAGCCTTCCAGGGATGGCTCTGGGAGCTTCCAGGGACTTCCAGCTCAAGACTGGAGGCCACAGGGACCCTGAGGACTCCCTAGAGAGCGGGCA---------GTGGCCTTGTAATGATGGATGCCCCAGTG--GGGCACGGGAGGGGAGCCCTGGCAGCCAGCGGGACGGCAAGA-ATCACCTCCGGGTTCCGGGTCATCTGCCCATGGTCAGAAGGGCCAAGAGTGAAGGGCAGGTGCCCTCGGAACCCCTGGGCGGATGGCGGCACCTGGCT---GGGCCCTTCCCCACCCCCGTTGTGTATTCAGACGCTACTGGTGGTGACCGGCTATGGCAGCGACTGGAGCCGGGCAGCCACCGTGACAGCGTGTCCTCATCCTCCAGCATGTCGTCCAGTGACACTGTCATCGACCTCTCCCTGCCGAACTTGGGCC------TGGGCCGCAGCCGTGAGAGCCTCACTGGGGTCCCAGTTGGACGCCTGCCCCCTCGGCCCTGCTCAGCCTCTGCTGCCCGCCCGAACTTGACCCCCGTGACCAAGAGCAAATCCAACCCCAACCTGCGGGCTGCCAGCCAGTTGCCGCCCGTGCCCGATGAGCTGCGGCCTCGACCCCTAGCCCCGCGTCCAC------------CTGGACTGCACCCACGGCTGCACTGGGGACGCCTCTCTCTGGTGGGCCTCCAGGACTGCCCTGTGGCTGCCAAGTCCAAG------------------------------------------- 11 Equus_caballus-NC_009145.3-209086_209704 91.8% 62.5% -------------------------------------------CCGGCCCAGC-AGCAGTG-------GAGTGGAGGGCTGGGGGGG---------AGGCAGCTGTGTGTGCATGGAGGGTCTTGCCGCTGGG--GT----CCTCTG------GGCACAGGG-GCCACAGG-GACACTGCCCAACACGCTCCTCTCCCTCTTCCCCACAGACACCTGCCCCTTCTCCTCGCAGAGGTCGGTCTCCTCCCTGTGCAGCCTGGAAACCATTGCCGAGGAGCCAGTCCTGTGCCCTGGCCCTCCAGCCCTGGTGGCCGCCCCCCCCGGCCCCTGCCCCGGGGGGCCCCAGTTCTCTGTAGGGCCTGGTGCCAAAGC---AGTGAGCCCCCCGGCTGCGGCTCTGGGAGCCTCCATGCTCCTCCAGCTCAGGACTGGGAGCCACAGGGACACTGAGCTGCCCCCCGAAAGTAGGCA---------GCAGGCGTGCAACGGCAGGGTCCCCAGTG--GAGCGTACGAGGGGGCCCCCAGCAGCCAGATGGACAGCAGGG-GTCACCCCCGGGCCCTGGGCCATCTGCCCCTGGTCAGAAGGGCCAAGAGTGAGGGGCAGGTACCCCTGGAGCCCCTGGGTGGACGGCGGCCCCTGGC---------TGGGACCTCTCCTGCCGTGTACTCAGATGCCACGGGCAGCGACCGGCTATGGCAGCGGCTGGAGCCAGGCAGCCACCGAGACAGCGTGTCCTCATCCTCTAGCATGTCATCCAGCGACACGGTCATCGACCTCTCCCTGCCGGGCCTGGGCCTGGG------------CCGTGAGGGCCTTGCAGGAATCCCGGCTGGACGCCTGCCCCTGCGGCCCTGCTCGGCCTCTGCCGTCCACCTAGACCTGCCCGCTGTGACCAAGAGCAAATCCAACCCCAACCTTCGGGCTGCGGGCCAGCTGCCTGCGGTGCCAGATGAGCTGCGGCCCCGCCCCCTGGCCCCAC---------------------------------GGCTGCCCTGGGGCTGCCTCCCCGTGGCGGGCCTCCAGGACTGCCCCGTGGCCGCCAAGTCCAAGAGCCTGGGGGACCTGACGGCCGATGACTTTGCGCCGCGCG--- 12 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-192716_193642 92.4% 61.6% ----------TGGCTGCTGAAGGTCCTGGGGAGCCCTTAGACCCGTGG------CACAGGGGGCTGCAGG----GTCCATCTTT--------GA-CCTGGCTCAACTTTCCCCTCCTCTCATCTC--------CCTC----TGTCTCC-CAA-----------------CTTCCCTCTGTCTGTCTCCCACTTCTCTCTCCCTACAGA---CGCCCGCCCCTTCTCTACACAGCGGTCCGTCTCCCCCTTGTGCAGCCTGGAGCCCATCGCGGAGGAGCCAGCCCTGGGCCCTGGTGCCCCTGCCCAGGCAGCCACCCCCACCAGCCCTCCCAGGGGCCAGCCCCAGTCCTTTGTGGGGCCTGCAGCCAAAGT---GGCCAGTCCTGCACGGACAGCTCGGGAACCTCCTGGCCCCGTCCAGCTCAGGACTGGGGGCCAAGGGGACAATGAAAAGGCTCCC---------AG---------AAAGCTGCTCAGCGGTGCGGGGCCTGGTG--AGGCACGCGAGGGGGCCACTGGCAGCCAGCCAGACAGCAGGA-GTCAGCCACGAGCCCTGGGCCTTCTGCCTGTGGTCAGAAGGGCCAAGAGTGAGGGCCAGGTGCTCTTGGAACCCTTAGGCGCATGGCGGCCGCTGGCT---GGGCCCTCCCCCACCCCTGCCATCTACTCGGACGCCACAGGCAGCGACCGGATATGGCAGAGGCTGGAGCCAGGCAGCCACCGAGACAGTGTGTCCTCGTCTTCCAGCATGTCCTCCAGCGACACTGTCATAGATCTCTCCTTAACGAGCCTGGGCC------TGGGCCGCAGCCGCGAGAGCCTGGCTGCGACCCCCCTGGGCCGCCTGCCCCTGAGGCCTGGTTCGGCCTCTACCATCCGCCCGGACCTGCCTCCTGTGACCAAGAGCAAGTCGAATCCCAACCTGCGGGCTGCGAGCCAGCTGCCTCCCATGCCTGACGCGCTGCGGCCCCGGCCTCTGGCCCCACGCCTGC------------CTGGCCCACGTCCCCGGCCCTCCTGGAGGGGCCTCGCCCTGGTGGGCCTGCAGGACTGCCCGGTGGCTGCCAAGTCCAAGAGCCTG------------------------------------- 13 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-194215_195067 90.7% 60.1% GCCCCAGCCCCCACAGCAGCAGGGCGGGGGCGCCAAGTGTGCCCGTCG------GAT-GTGTGTGATGGG-G--GTGCCTG-----------GG-GGTGGGGGCTGGCCCTGTCTGGTGGTGTAG----GGGCCCCT----GGGACAC-CGCCCCTGAGACGTGCCTCCCTCTCTCTCTGCCTCT-CTCTCCCTGTCCCTCTTCCCGCAGGTGGCCGCCCCTTCTCCCTGCAGTGGTCCATGTCCCCCCTGTGCAGCCTGGAAACGATTGCAGAGGAACCAGCCCTGGGCTCCGGCTCCCTGCCACCGGCGGGCAGTCCGACCAGCCCCTCCCGGGAAGGGCCCCAGGGCCCCA---------------------------------CAGGGTTGGCCCCGGGGGCTTCTGTGCCCCTCTGGCTCAGGGCTGGGAGCCCTGGGCACACTGAGGAGCCCCCAGAGGCCCAGCAGCAGCAGCTGC------GCCACAGTGGGGGCCCCGGCG--GGGCATGCGAGGGGGCTCCCGGCAGCCAGACGGACAGCAGGA-CCCAGCCCCGGGCCGCGGGCCGTCTGCCCACGATCAGAAGGGCCAAGAGTGAGGGGCAGGTGCCCGTGGAGCCCCC------------------GGCC---GGGCCCTCTCCCCCCCCCGCCGTGTATGCGGATGTCACGGGCAGTGACCGGCTATGGCAGCGGCTGGAGCCAGGCAACCACCGCGACAGCGTGTCCTCGTCCTCCAGCGTGTCATCCAGCGACACCGTCATTGACCTCTCCCTGCCGAGCCTGGGTC------TGGGCTGCAGCCGCGAGAGCCTTGTTGGGGGCCCCGTGGGACGCTTGCCTCTGCGGCCGTGCTCGGCCCCCGCCGCCCGCCTGGACCCACTGCCTGTGACCAAGAGCAAGTCCAACCCCAACCTGCGGGCTGCTGCCCAGCTGCTGCCTGTGCCCGGCGAGCTGCGGCCCCGACCCCTGGTCCCGA---------------------------------GGCCGCCCTGGGGCCGCCTCTCCCTGGTAGGCCTGCAGGGCTGCCCCGTGGCCGCCAAGTCCAAGAGTCTGGGGGATCTGACCGCCGACGACTTTGT----------- 14 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-160727_161529 96.1% 65.1% ----GTGG-----------GAAGTTTGGATGGAAGAGCTGGCCATGGGAGGCCCTGGGGGGGGCG----GGGCTGTCGTCCCCAGCACAGGGGC-CCCGGGACGTCCCCTGACACGGCTCTCCTCTCTCTCCGTCTACG--TC--ACTCCAATCCTCTCCCACTGTTCTCCCCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCGCCTCCCCCCAGAAGCCCACCCCTTCTCGGCGCAGCGGCCCACCTCCCCCCTCTTTAGCCTGGAGACCATCGCCGAGGAGCCAGCCCCAGGTCCCGGGCCCCCACCACCGGAGGCCGTCCCTGCCAGGCCCTCCCGGGCAGGGCCCCTGTGCTCTCCAGGACCCGGAGCTAATGTG------------------------------------------------------GCGTGTCCCCCAGGGGACCCTGAGGAGCCCCAGAAGCGGGCGGT---------GGC--TGTGCCACGG----------AGGC--CGTGCCACAGCCAGGCCCCTGGCAGCCAGGTGGACAGCAGGA-GCCAGCCCTGGGTCCTGGGCCACCTGCCTGCGATCCAGAGGACCAAGAATGAGGGGCAGGTGCCCACAGAGCCCCTGGGCAGATGCAGGCTCTTAGCT---GGGCCCACCCTCATTCCGGCAGTGTCCTCAGACGCCACGGGCAGCGACCGGCTGAGGCAGCGGCTGGAGCCAGGCAGCCACTGGGGCAGCATGTCATCACCCTCCAGCATGTCGTCCAGCGACACCGTCATCGACCTCTTCTTGCCCAGCTTGGCCC------TGGGCCTGGGCCATGAGAGCCTGGCCGGGGGCCCGGTGGCACGCCCGTCCCCAAGGC------------------CCTGCCCAGCCCTGCAGCCTGTGGCCAAGAGCAAGTCCAATCCCAACCTGCGGGCCGAGGCCCAACTGCCTCCCCAGCCCGAAGAGCTGCGGGCCCGGCCGCTGGTGTCCAGGCCAC------------CTGGCCTCCATTCCCGGCCACGCTGGGGCCTCCTCTCCCTGGTGGGTCCGCAGGACTGCCCCGTGGCTGCCAAGTCCAAGAGCCTGGGGGATTTGATGGCCGACGACTTCGGCCCCAGT---- 15 Nannospalax_galili-NW_008355419.1-192396_193274 94.2% 59.2% 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16 Octodon_degus-NW_004524689.1-192396_193277 92.7% 61.8% 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17 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-192396_193032 91.5% 58.7% 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18 Jaculus_jaculus-NC_059106.1-192396_193319 93.0% 59.9% 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19 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-208007_208864 92.3% 60.4% 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20 Orycteropus_afer-NW_006921723.1-192396_193049 93.0% 63.3% 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21 Loxodonta_africana-NW_003573446.1-192396_193052 92.8% 63.3% 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22 Elephantulus_edwardii-NW_006399795.1-192396_193050 92.9% 62.2% 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23 Physeter_catodon-NC_041216.1-207575_208192 90.3% 56.2% 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24 Eptesicus_fuscus-NW_007370721.1-192396_193240 92.7% 59.2% 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25 Miniopterus_natalensis-NW_015504651.1-698422_699296 93.1% 59.8% -----------------------------TCCCTGTGCTGCCCCGGCCCCGAGAACCTGGCGGCAGCAGAGCGGAGCTCAGGATGCA---------GGGCCACTGTGCCCTGGGCAGGGGCCTGGTCGCCGGGGGGT----CCTGCA------GGCACGGGG---CCCTGG-GCCCCACCCCGACGCACGCCTCTCCCTCTCCCCCAC---AGACACCCGCTCCCCCATGCAGAGGTCCGTCTCCTCCCTGTGCAGCCTGGAAACCATCGCGGAGGAGCCAGCCCTGGGCCCCGGCCCCCCACCTCCGCTGGCCACCCCGCCCAGCCCCTCCCAGGGAGGGCCCTGGTGCTCCACAAGCCCAGGAGCCAAAGC---AGAGCGCCCCCCAGGGGCGGCTCTGGGAGCCTCCGTGCCCCTCCGGCTCAGGACTGGGAGCCAGGGCAACATGGAACTGGCCCCCAACAGCAGGCA---------GCAGGCGTGCAAGGGTGGGGGCCCCAGTG--GGGCCAGTGAGGGGGTTCCCAGCAGCCAGATGGACAGCAGGG-GCCACCCCCAGGCCCTGGGCCAGCTGCCCTTGGTCAGAAGGGCCAAAAGTGAGGGGCAGGTGCCCTCGGAGCCCCTGGGTGGAGGACGGCCCCTGGC---------CGGGCCCTCCCCTGCGCTGTACTCGGACGCCACGGGCGGAGACCGGCTATGGCAGCGGCTGGAGCCAGGCAGCCACCCGGACAGCATGTCCTCATTCTCCAGCCTGTCGTCCAGTGACACGGTCATCGACCTCTCGCTGCCAGGTCTGGGCCTGGGCCTGGGCCTGGGTCGGGAGAGCCCCTCGGGGGTCCCGGCTGGACGCCTGCCCCTGCGGCCCTGCTCGGCCTCAGCTGGCCACCCGGATTTCCTCTCTGTGACCAAGAGCAAATCCAACCCCAACCTGCGGGCCGCAGGCCAGTTCCCTGCAGCCCCGGATGAGCTTCGGCCGCGGCCCCTGGCCCCTC---------------------------------AGCCGCCCTGGGGCTGCCTCCCCCTGGCAGGCCTCAGGGACTGCCCCGGGTCAGCCAAGTCCAAGAGCCTAGGGGA-------------------------------- 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