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 1 Target                                                  100.0% 100.0%    --------------------------------------------------------------------------------GGGCGGCTGGCGAC----CTGCATGGCCCCTGATGCCTTTCCTGGGACTGGGGGCCACGTACCATC--CCATTC-----CCACCTCCCTCTAGGGCAGGCTCCAGG----GGTCC-CTACTGGGAAGTCTGATGTGGGCA-GGTAGTGCAGCTGCTGGGCGT--CTCCTGCG----CCCCTG--GGACGCCTGGAGCCTGCTGAG---TGCTGCGTGGAGTAGATTCCCTGGGCCCCAGGG----CTTCGCTGCTTTGGGCTGAAGCACCCCA-CTAGAAGG--GTGTCTCCT--------------TAG--------CCTGGAGGGAGGGACATACACGGAGCCCGCCCCACAC---CAC----CCTGCCCCTCCAGACCCCCCTGACCAAG------------CT-TTCCTTTCTGCCCCCA---CCCACGCTGCCTCC--------G-----------------TAGTTAGGAACTGAGAGCGGCGAGTGACAGGTAACGGGGCCCAGCC-CCG--GTGTCCCG--TGCTGTCCCAGCCCAAGGAGGGCCCCGTGTGCGGCACAG----GGCGTGG------------ACTGGGCCCCAGCAGCAGCAGGGTGGGGACACCGAGTGTGCCGCGCCC-----GGGGGATGCCTCGGGGTGG--G---------------------AGCTGGGCCTGGCGACCCTCGG-----CACAGGGCACC-----GGGGACACCACCCTGATCCGACTCCTCTCC-GCCTCTCTCCCT-GCCTCCCTCTCTC----TCTTCTGCTTCT------CCCTCTGGCTCTCTCTCACTCCCCCACCTCCCCACAGACACCCGCCCCCTCTCCACGCAGCGGCCACTCCCCCCACTGTGCAGCCTGGAAACCATCGCTGAGGAGCCCGCCCCAGGCCCTGGTCCCCCGCCACCAGCGGCTGTCCCCACCAGCTCTTCTCAGGGACGGCCCCCATACCCCACAGGACCCGGAGCCAATGTGGCAAGCCCCCTAGAGGACACTGAGGAGCCCCGAGACAGC------------------------------------------------------------------AGGCCTCGGCCGTGCAACGGCGAGGGCGCCGGCGGGGCATACGAGAGGGCCCCCGGCAGCCAGACGGACGGCAGGAGCCAGCCCCGGACCCTGGGCCACCTGCCCGTGATTAGAAGGGTGAAGAGTG----------------------------     
 2 Papio_anubis-NC_044976.1-228365_229298                   94.3%  81.3%    ------------------------------------------CCCC-----TCTGACTGGGCGCTTCC---------TCAAACTCACCTCCCAG----GCGGCTGGCGACTGATGCCCTTCCTGGGACTGGGGGCCACGTCCCATC--CCATTC-----CCACCGCCCTCCAGGGCAGGCTCCAGG----GGTCC-CTCCTGGGAAGTCTGATGTGGGCA-GGTAGTGCAGCTGCTGGGTGT--CTCCCGCG----TCCCTG--GGACGCCTGGAGCTTGCCGAG---TGCTGTGTGGAGTGGATTCCCTGGGCCCTGA-------------------------------------------------------------------------------------GGGAGGGACATACACGGAGCCCACCCCACAC---CAC----CCTGCCCCTCCA-GACCCCCTGACCGAG------------CT-TTCCTTTCTGCCCCCA---CCCACGCTGCCTCC--------G-----------------TAGTTAGGAACTGAGAGCGGCGAGCGACAGGTAACGGGGCCCAGCC-CTG--CTGTCCCG--TGCTGTCCCAGCCCCAGGAGGGCCCCATGTGTGGCACAG----GGCATGG------------ACTGGGCCTCACCAGCAGCAGGGTGGGGACACTGAGTGTGCCGCGCCC-----GGGGGATGCCTCGGGGTGG--G---------------------AGCTGGGCCCGGCGACCCTCGG-----CACAGGGTACT-----GGGGACACCACCCTGATTCAACTCCTCTCC-GCCTCTCTCCCT-GTCTTCCTCTCTTTCTCTCTTCTGCTTCTCCCTCTGGCTCTCTCTCGCTCTCACTCCCCTACCTCCCCACAGACACCCGCCCCCTCTCCACGCAGCGGCCGCTCCCTCCACCGTGCAGCCTGGAAACCATTGCCGAGGAGCCCGCCCCAGGCCCTGGCCCCACGCCACCAGCGGCCGTCCCCACCAGCTCTTCTCAGGAACGGCCCCCATACCCCACAGGACCGGGAGCCGATGTGACAAGCCCCCCAGAGGACACTGAGGAACACCGAGACAGC------------------------------------------------------------------AGGCCTCGGCCGTGCAATGGCAAGCGTCCCGGCGGGGCATACGAGGGGGCCCCCAGCAGCCAGTCGGACGGCAGGAGCCAGCCCCGGACCCCGGGCCACCTGCCCGTGATTAGAAGGGTGAAGAGTGAGGGTCAGGTGCCCACAGAGCCC-----     
 3 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-128712_129651             93.0%  70.0%    ---------------------------------------------------TCCTGCTGGGTGCTTCCCCAAACTCACCTCCCAGGCTGGCAAC----CGGCATGGCCCCTGATGCCCCTCCTGGGACTGGGGGCCACTTCCCATC--CCCTTC-----CTGCCTCC-TCCAGGGCAGGCTCCAGG----GGTCC-CTACTGGAAGCCTGATGTGGTGCA-GCCA---------C--------------------------A--GGGCGCCTTTGTGCCCAGGAC---ACCTGCATGAAGGGGACTCC-CTGGGCCCCGGG----CCTTGTTGCTTTGGGCTGAGGCGTCCCA-CCATGAGG--ACATCGCCA--------------TAG--------CCTGGAGGGAGGGAGAGACAGGGAGCCCGCCCCGCCC---TCC-CCACCCTGCCCCTCCAGCCCCCCTGACCGAG------------CT-TTCCTTTCTGCCCCCA---CCCACGCTGCCTCC--------G-----------------TAGTTAGGAACTGAGAGCGCGAGCGAC-AGGTAACGGGGCCCG-GC-CCC--CGTATCCC--TGCTGTCCCAGTCCCAGGAGGGCCCCGTGTGTGGCACAG----GGCGTGG------------ACTGCGCCGTAGCAGCAGCAGGGTGGGGGCACTGAGTGTGCGGGGGGA-----TGCCTCGGG------GTGG--G---------------------GCC---------------------------CGGGCACC-----GGGGACTCCACCCTGATCCGACTCTCCTCTCGCCTCTCTT-------GTTGTCTCCCTCTCTCTTCTGCTCCTCCCTGTGGCGCTCTCTCTCA---CTCCCCCCACCTCCCCACAGACACCCGCCCCCTCTCCACGCAGCGGCCGCTCCCTGCACCGTGCAGCCTGGAGACCATTGCCGAGGAGCCTGCCCCAGGCCCCGGCCCCCCGCCACCAGCGGCCGTCCCCACCAACTCTTCTCAGGAATGGCCCCCGTGTCCCACGGGACCCGGAACCAATGTGGCAAGCCCCCCAGAGGACCCTGAGGAGCCCCGAGACAGC------------------------------------------------------------------AGGCCGAGGCCGTGCCATGGCAGGGGCCCCAGCGAGGCATGCGAGGGGACCCCCAGCAGTCAGACGGACGGCAGAAGCCAGCCCCGGCCCCTGGGCCCCCTGCCCGTGATTAGAAGGGTAAAGAGTGAGGGGCAGGTGCCCACAGAGCCCCTGGC     
 4 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-160345_161043            92.8%  52.4%    ------------------------------------------------------------------CCACCCACCCACCTCCCTCCTGGGCCAGGTTTCCTGCTGGGCAGTCCGACGGGGACCGGGGCACAGCGGCAGGGCGCCCCAAGCCCTG-----GAATGCCTGGACAGGGCTGACCAGTGG----GTCCCGGCCCTGGGACATGTGTCTGGCTGACCCATGGGCAGCTCCA--------CTCA-GGG----CCCCAG--GTGGGCATC------------------------CACCTATGATCCTGGAAGGAAGGG----ATATGTCTACCTGCTCTGTGCCCCCTGC-CAAGTGTCCTGTGTCCACG--------------TGTC-------TCTACCCGCGTGTGCATCCACATGTCCCTT----------------GGTCCATGTGCCAGCCCACACTGACTGTG------------CTCTCTTTCTGTCCATGTC---CCCACGCTGCCTCT--------G-----------------TAGTTAGGAACTGAGCCACGAGT--GACAGGTAACGGGGCCCAGCC-CCCGTGTGCCCTG--TGCCATCCCAGCCCCAGGAGGGCCCCATGTGGGCCCCGG----AGCAGCCCAGCCCGCGACTCCTCAGCCTCAGTGGCCGCAGGGCGGGGGCACTGAGGGCACCGTGTGG-----GAAGTTTGGATGGAAGAGC--TGGCCATGGGAGGCCCTGGGGGGGGCGGGGCTGTCGTCCC-CAG-----CACAGGGGCCC-----CGGG------ACGTCCCCTGACACGGCTCTCCTCTCTCTCCGT-CTACGTCACTCCAATCCTCTCCCACTGTTCTCCCCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCGCCTCCCCCCAGAAGCCCACCCCTTCTCGGCGCAGCGGCCCACCTCCCCCCTCTTTAGCCTGGAGACCATCGCCGAGGAGCCAGCCCCAGGTCCCGGGCCCCCACCACCGGAGGCCGTCCCTGCCAGGCCCTCCCGGGCAGGGCCCCTGTGCTCTCCAGGACCCGGAGCTAATGTGGCGTGTCCCCCAGGGGACCCTGAGGAGCCCCAGAAGCGG------------------------------------------------------------------GCGGTGGCT--GTGCCACGGAGGCCGT----------GCCACAGCCAGGCCCCTGGCAGCCAGGTGGACAGCAGGAGCCAGCCCTGGGTCCTGGGCCACCTGCCTGCGATCCAG-----------------------------------------     
 5 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-260860_261611      81.5%  35.9%    -------TGCTGGGT---GCAGTGT--------GGAGCGCGGTCCGTGTGCACGTGGCCTGGGGTTCACTCCTGGCCTGGCCTGCGCTGGCAGCTCTGCCCTGC-------------ACTCTGGGGTGGCGGGCACACACAGTTGC--TCGCTG-----GCACCTCGTCAGCGGGGCACAGGCAGGGCCCAAGGGGTGCTTTGGACCCCTGCCTGGGCGG--GAGGAGTGT-------------GCCCTGAG----CCTGTCCCCCGCTGCTGTGCTC--CCACC-------CTGCCTTGCCTTGTCCTGCTGTCCATCCAGCGTCCGTCCAGCCGCCCACCCTGCCCCAACC-TGACCATATTCTCCTTTTCTGTCCCTGCGCCCTACGCCGTCTCGTAGTTAGGAACTGAGAGCAGCGAG-------TGCCA--------------GGTAACGGGGCCCGGCCCCCCCGT-------------GCCCTGTGCTGCCCCCAGC---CCCAGGAGGACCCT--------G-----------------AGTGTGGGCACAGGGCCTGTGGCATCCTGGCCCGC------------------CCACTCC--CCCGGCCCCAGCAGCAGCAGGGTGGGGGGCACT-----C----AGCGTGC--------CCGTGTCA--GATGCGT------------GCGCGACTGGAGGGTCCC-----------------GGGGGATGGGGG--CTGGCCCCGTG--------------------------------------TTCCTCACACA-----GGGG------------------GCCGCGGGGACA--CC----A-CCCTGACATGATTCTCTTTGTCTCTCTGTCCCTGTCTCTGTGT---GTGTCTCTGTCCCTAACACCCCACAGACACCCGCCCCTTCTCCATGCAGCGGTCAATCTCTCCCCTGTGCAGCCTGGAAACTATTGCTGAGGAGCCAGCCCTGGGCCCCAGCCTCATGACACGGGCAGCCACCCCCACCAGCCCCTCCCGGGAAGGGCCCCCGAGCCCCATAAGACCGGGAGCCACAGTGGCTGGCCTCTCAGGGATGGCTCTGGGAACATCCGTGCCCCTCCAGCTCAGGACTGGGAGCCTCAGGAGC------ACCGAGGAGCCTCCAGAAAGCAGGCAGTGGC---------CCTGCCATGGCGGGGGCCCTGGTGGGGCATGCGAGAGGGCTCCTGGCAGCCACATGGATAGTAGGAGCCACCCCCGGGCCTT---------------------------------------------------------------     
 6 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-193646_194607       85.4%  42.5%    --------------------------------------------------------------------------AACCCGCCTCCCCAGTCTACTGCTGCCTGGGGGCCCTGGTGCCCTTCCTGGGACTGGGGGCCGCTTCCTGCC--CCCACC-----CCACCTCCCTCCAGGGCCAGGCTGCAG-GGGTGTCCCTCCCGGGGAGGCCGGCCTGGCTCG--GTGGTGTAGCCGCGGGG---------------------CGCCTCCATCCCCCGAGACTCCGAATGGTGCTCAGAGTTCGCAAGTGC-TGAGGGGCGCAGATGCCCCGTGCCTCTGGGGCCCTGAGACCCGT-GT--CTGGCTAAACCCC----------ACTGAGCACCTCTGCTGCGGCCCAGGAGGGAGGGGTGTGCACCGAGCTGCGCTG---TGCGCCGGTCTGTCCCGGCCCCTGTGCTGACCGAGT-----------TCTCCTTTCTGTCCCTGCA---CTCACGCTGCCTCC--------A-----------------TAGTTAGGAACTGAGCGCG------CAAGTGACAG------------------GTAACGG--GGCAGCCCCAGCCCCGGGAGGACCCTGGCCCAT-----C----CAC-------------TGCCCCA--GCC------------------CCCACA---------------------------GCAGCAGGGCGG--GGGCGCCAAGTGTGCCCGTCGGATGTGTGTGATGGGGGT----------GCCTGGGGGTG-----GGGGCTG---GCCCTGTCTGGTGGTGTAGGGGCC--CCTGGGA-CACCGCC--------CCTGAGACGTGCCTCCCTCTCTCTCTGCCTCT-CTCTCCCTGTCCCTCTTCCCGCAGGTGGCCGCCCCTTCTCCCTGCAGTGGTCCATGTCCCCCCTGTGCAGCCTGGAAACGATTGCAGAGGAACCAGCCCTGGGCTCCGGCTCCCTGCCACCGGCGGGCAGTCCGACCAGCCCCTCCCGGGAAGGGCCCCAGGGCCCCA------------------------------CAGGGTTGGCCCCGGGGGCTTCTGTGCCCCTCTGGCTCAGGGCTGGGAGCCCTGGGCAC------ACTGAGGAGCCCCCAGAGGCCCAGCAGCAGCAGCTGCGC------CACAGTGGGGGCCCCGGCGGGGCATGCGAGGGGGCTCCCGGCAGCCAGACGGACAGCAGGACCCAGCCCCGGGCCGCGGGCCGTCTGCCCACGATCAGAAGGGCCAAGAGTGAGGGGCAGG-------------------     
 7 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-209719_210321            80.6%  34.6%    -------TA-CAGAC---TGCTGAT--------GGAGCACAGTCCATGTGCTCTGGGGGCCCGGGTTCACTAAAGCCTGGGCTGGCCGAGCAGCTCAGCTCCAGGAGCCTCCAGGAGCCCCCAGGGCCGTGGCGCCAGACACGTGC--TGGCTG-----GTACTTA----GCAGGAAAGCAGGAGA-GCTGAGCTGGCTCCTGAACTCCAGCCTGGGAGG--GAGGGATGT-------------TCCCTGAG----CCTGTACCCGGCCACCCTATGCTCCCCAG-------CGTACCTGCCCAGTCTCACTGTC----AT-----CTGTCTGCCCACTGCCCCGCCCCACTC-TGACCGCATTCTCCTTTCTGTCCCCGCACCCCATGCTGCCTCCGTAGTTAGGAACTGAGAGCAGCCTT--------GCCA--------------GGTAACGGGGCCCAGCCCCTCCGTGT-----------GCTCTGTGCTGCCCCAAGC---CCCAGGAGGGCTCC--------G-----------------TGTGGGG--AGAGGCACCCAGGCTCCCTCCCCCAG------------------------------------CTCAGCAGCAGCAGGGGGGACACT-----G----AGGTTGC--------CTTTGTTG--GATAAGCA--CAAATGGAGAAGCTGCTGGGTGTGCCC-----------------TCGGGTGGGAGG--CTGGCCCTATCGTCCCTTG-GCACAGAGGCCTACGGGTTATCACCCA--CCCCTGACACA-----ATTCTCG---TCTTTATCTCTGTCCTTTCTGCCC--CCCTTCC-ACTCTGTCTCTATTTCTCGGTCTCTCTGTGTCTCCCTCTGTTC---CTCTCCCTCTCTCTTTCTGCCTCCAGACTCCCGCCCCTTCTCCATGCAGCGGTCGATCTCCCCTCTGTGCAGCCTGGAAACCATCGCTGAGGAGCCAGTCTTGGGCCCAGGACCCCTGCCACTGACGGCCACCCTCACCAGCCCCTCCCAGGAAGGGCCCCAGTGCCCTGCAAGCCCTGGAGCCAAAGTGGCGAGCCTTCCAGGGATGGCTCTGGGAGCTTCCAGGGACTTCCAGCTCAAGACTGGAGGCCACAGGGAC------CCTGAGGACTCCCTAGAGAGCGGGCAGTGGC---------CTTGTAATGATGGATGCCCCAGTGGGGCACGGGA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 8 Ictidomys_tridecemlineatus-NW_024405058.1-192396_192729  76.0%  33.1%    -----------CAGA------------------GGAGCAGGTCCCCTGGGGCCCTGGGGCCCTGGACC-TGTGGCTGTCAGATGGCATGGAGGCCTCCGGGT-----GCGCAGTCCTCAGGCAGACAGCTGC-CGGCCTGCCCTGGCTCAGTTTGCTGAGCCCAGCCCAGTGGGAGGGACGTGCACCAAGCTTTCCCCT-----------------------------------------------------------GCCACCATGCTCCTCCC-------TCACCT-GCCAAGCCTTGCT----------GTC----CG---TCTGTCCATCTGCCAGACCCACCCTGTGC-TGACCACGTTCTCCTTTCTGTCCCTGCACCCCGTGCTGCCTCCGTAGTTAGGGACTGAGAGCTGCA-----GTGCCAGGTAACAGGCCCAGCCCCGTGTGCCCCTT----GTTGCCCTGGCCCCAGAAGACCCGTCCTGGCCTGCCAGCCAGACCCCTGTGGACTCTGCACATGAGTGGACACAGGGCCGGGCACCTTGCCCACTGGCCCCCAGCA-GCGGTGGGGAGGGGCACTGGCACTCTGAGCAAGCTGTGTGGGATGTATGCAAATGGACCAGCCTGGTTGCTGGGGAGGCCCTGGGTGGGGAGCCGGCCCGACTG---------------------------------------------------CC------------C--------------CTCGG------------------------CACAGAGGGTCACGGGACACCATTTCTTGACA--CG--ACTTTTCCTCCCTGTCCCTCCCTGTCTCTGT--------------CTCTGTCTCCCTGTCTCTCTCTC-CTCTCTGTCCCTCTCCTCGCTCCCTCTTCCCCCAGATGCTCGCCCCTTCTCTGGGCAGCGGTCAGTCTCCCCTCTGTGCAGCCTGGAAACCATTGCCGAGGAGCCGGTCCTGGGCCCTGGCCCCCCACCACAGGCAGCTGGCCCCACCAGCTCCCGCAGGGAAGGGCCCCAGTCCCCTGCGGGACCTGGAGCCAAAGTGGCCAGCACACCACGGACTGCTCTGGGAGCCTCTGAGCCCCTACAGCTCAGAACCAGGCATGAAGGGGAC------CGCGAAGAGCCCCCCAGGGA------------------GCCGCGCCATGGTGGTGCCA---GCAGGGCATGCCCAGGGTCCCCTGTCGGCCAGATGCACAGCAAGAGCCACCCC-----------------------------------------------------------------------     
 9 Mesocricetus_auratus-NW_024429219.1-194341_194595        74.6%  31.5%    CACACAGTGCTGAGCGGGGGAAGCTCCCAGGGACCTGCAATGCCCTCATGGCGCTTACCCTC----TG-ACCACCCACCCTCTTGGCTGGCAGTTCCTGGCC-----TACACCTGGCCAGCAGGAGTATGAGGGGAACTGGGCCGAGCTGGTTACCTGAGCCCTAGCCTGGGTGGGGGTGGA---GGGGGGGTCTGCCT--------------------------------------------------------GCTTTCATTGCACTTCTGCT-------GCTCCT-GCCCAGCCTCATCGTCTAT--CTGC-----------CCCTCCGTCCGGCCCACCCACCCAACAC-TGACCATGTTCTCCTTTCTGTCCCCGCTCCCTGTGCTGCTTGCATAGTTAGGGACTGAGACCGGCG-----AGTGCCAGGTAACAGGCCCAACCCCTGTGTGTCCCCATGCTGCCCCAGTCCAAGGAGGATCGGGCCTGGCCTGCCCACT-GCCCCGTGTGGGGTCCGGGCACCACTCCT--------C----CCCCGACGTTAGCAGGGTGGGGG-GGTGCTCTGAGTGTTACG--------------------TTACGTTTGTATACATGGAGACACCTAGCTGCTGGGATGCCCTGGGGTGGGCTGGCCCCTACCCTTGGCTCAGGGGTCAGAAATTAGCTCTCACTGATGGGATTAATATTCATATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCC-CTCT----------------------GC-----------------------------------------------------------------------------------------------------CTCTTGTCTCCCATCCCTCTTCCCCCCCCCCCCAGATACCCGCCTCTTTCCCCTGCAGCGGCCCATCTCCCCCCTGTGCAGCCTGGAACCCATTGCTGAGGAACCAGCCCTGGGCCCTGGCCCCTCACCGCAGGCAGCTGTCCCCACAGGCCCTTCTCAGGAAGGGCCCCAGTGCCCTGTAGAAACAGGAGCCAAAGTGACCAGCCCCCAGCGGACAACTCTGGGAGCTTCTGGAACCCTCCAGCTCGGGACTGGGACTGGGGACAACAGGGACAGTGAAGAGCCACCCCCAAA------------------ACCACACAGTGGTGGGATCCCCAATGGGCCACGCGAGGGGACCTCTGGCAGACAGACAGACAGCAAGAGC-----------------------------------------------------------------------------     
10 Peromyscus_maniculatus-NC_056009.1-192396_192625         81.2%  35.0%    ---------------------------------------------------------------------------------------------TTCCTGGCC-----TACACCTTGTCAGCAGGAGTATGAGGGA-ACTGGACTGAGCTGGTCACCTGAGCCCTCGCCTGGGTGGGAGGGAG----------TCTGCCT--------------------------------------------------------GCTTCCACTGCACGCCTCCT-------GCTCCT-GCCCAGCCTCATTGTCCAT--CTGTCTC-----------TCTGCCAGCCC-----ACCCCACAC-TGACTGTGTTCTCCTTTCTGTC-CCTGCTCCCATGCTGCTTCCATAGTTAGGGATTGAGACCTGCG-----AGTGCCAGGTAACAGGCCCAAGCCCTGT--GTCCCCATGCTGCCCCAGTCCAAGGAGAATCAGGCCTGGCCTGCCTATT-GCCCTGTGGAGCCTGTGTGGGGCCCAGGC--------ACCACTCCTCCAACTTTAGCAGGGTGGG-GGTACTCTGAGTGCCAC---------------------ACTGCAATGCATAAATGGAGACACCTAGCTGCTGGGATATCCTGGGATGGGATGGCCCCTAGCCTTGGCTCAGGGGTCAGGAATCAGCAAGCACTCATTGAAGAGATTCATATATTCTCATTCATATTCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT-CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT--CCC-----------------CCGTCCCCTCTCTGTTCCA-CTTGTGTCTTTAATTTCTCCCTGGTTTTGTCC-CTCTCTGTATATCCCTCTGCCTCTTTGTCTCCCACCCCTCTCTCCCCACAGATCCCCGCCTCTTCCCCTTGCAGCGGCCCATCTCCCCCCTGTGCAGTCTGGAACCCATTGCAGAGGAACCAGCCCTGGGCCCTGGCCCCCCACTACAGGCAGCTGTCCCCACGGGTCCTTCTCAGGAAGGGCCCCAGTGCCCTGCAGAACCAGGAGCCAAAGTGACCAGCCCCCAGCGGACAGCTCTGGGAGCTTTTGGAACCCTCCAGCTCAGGACCGGG------GGCAGTAGGGAAAATGAAGAGCCACCCCTAAA------------------ACCACACAATGGTGGGATCCCCAGTGGGCCACGTGAGGGGACCTCTGGCAGACAGACAGACAGCAAGAACCGCTCC-----------------------------------------------------------------------     
11 Lemur_catta-NC_059130.1-192396_193072                    86.4%  43.7%    --------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGCCCTGGTGCCC-------------------T--TCCTGC--CCCCAC-----CTGCCTCCCTCCAGGGCCAGGCTGTAG-GGGTGTCCCTCCTGGGGAGTCTGACATGGGTGG--GGCCGCCGGGGGGCTCCTTCATCCCCCGAG----ACTCCCGGGTGGCACTCAGAGCCTCGGTCAGGTCCTCAGAGTTGGCAAGGTGCTGAGGGGAGCAGACACCCCTGGGGCCCTGAGACCGTGCCCGGCT-ACACCCCACTGAGCATCTCTGCTCCAGCCCAGCTGGCACCTCGCTAGTGCAGGAGGGAGGGGCGTGTGCCGAGCTGCGCTG---TGCGCCGGTCCGTCCCGGCCCCGGTGCTGACCGAGT-----------TCTCCTTTCTGTCCCTGCA---CTCACGCTGCCTCC--------A-----------------TAGTTAGGAACTGAGCGCA------CAAGTGACAG------------------GTAACGG--GGCAGCCCCAGCCCCGGGAGGACCCCGGCCCCC-----G----GCC-------------CATCATT--GCCCAG-------------CCCCCACA---------------------------GCAGCAGGGCGG--GCG-CCAAGTGTGCCCTTCGGGACGTGGGCGACAGGGGT----------GCCTGGGGTGG-----GGGCTGG---CCCTGTTGCCCGGCAGTGCAGGGG--CCTCAGG-ACACCAC--------CCTGAGACGTGTCTCCCTCC---TCTGCCTCTCTCTCCCCCGGCCCTCTTCCCCCAGGTGGCCGCCCCTTCTCCCTGCAGTGGTCCATGTCCCCCCTGTGCAGCCTGGAAACCATCGCCGAGGAGCCAGCCCTGGGCCCCGGCTCCCTGCCACCGGCTGGCAGCCCCACCGGCCCCGCCCGGGAAGGGCCCCAGGGCCCCACGGGACCCAGAGCCAACGCGGCCAGCCCCACGGGGTTGGCTCTAGGGGCTTCTGTGCCCCTCCAGCTCAGGACTGGGAGCCCCAGGGAC------CCTGAGGAGCCCCCAGAGGGCCAGCAGCA---------GCTGTGTGACAGTGGGGGCCCTGGCAGGGTGCACGAGGGGGCTCCTGGGAGCCAGACAGACAGCAGGAGCCAGCCCTGGGCCACGGGCCGTCTGCCCACGATCAGAAGGGCCAAGAGCG----------------------------     
12 Microcebus_murinus-NC_033661.1-192396_192785             83.1%  40.7%    ----------------------TCT--------TCAGCAGGGGCCCCCAGAAAGGGCT--------GG-GCCCAAACCTGCCTCCCCGGTCTGCTGCTGCCTGGGGGCCCTGGCGCCCTTCCTGGGACTGGGGGCGCTTCCTGCCC--CCA--C-----ACGCCTCCCTCCAGGGCCAGGCCGCAG---GTGTCCCCCCCAGGGAGGCTGGCATGGGCCG--GTGGTGCAGCCGCGGGG---------------------CACTCCAT-CCCTGAGACTCCCGCATAGCGCTCAGAGCTCGCAAGTCGCTGAGGGGAGCAGACTCCCCGGGGCCCCGAGACCGCGTCTGGCTA-AA--CCCGCTGGGCACCTC------T-GCCCAGCTGGCCCCTCACTAGCACCGGGGGAGGGCTGTGTGCCGAGCTGCCCAG---TGCGCCGGTCCGTCCCTGCCCCCGTGCTGACCGAGT-----------TCTCCTTTCTGTCCCTGCA---CTCACGCTGCCTCC--------G-----------------TAGTTAGGAACTGAGCGCG------CAAGTGACAG------------------GTAACGG--GGCAGCCCCAGCCCCGGGAGGACCCGGCCCGTC-----C----ACC-------------CCTA------CC------------------CCCACA---------------------------GCAGCAGGGCGG--GTG-CCAAGTGTGCCCTGTTGGACGTGTGTGAAGGGGGT----------GCCTGGGGCGG-----GGGGTGC---CCGTCGGCCGGTGGTGCAGGGGCC--GCAGGGA-CACCGCC--------CCTGAGACGAGCCTCCCTCCCTCTCTCC-----------CCCGCTCCTCTCCCCCAGGTAGCCGCCCCTTCTCCCTGCAGAGGTCCATGTCCCCCCTGTGCAGCCTGGAAACCATCGCGGAGGAGCCAGCCCTGGGCCCCGGCTCCCTGCCGCCGGCAGGCAGCCCCACCGGCCCCTCCCGGGAAGGGCCCCAGGGCCCCG------------------------------CAGGGTGGGCTCCCGGGGCTTCTGTGCCCCTCCAGCTCAGGACTGGGAGCCCCAGGGAC------ACTGAGGAGCCCCCAGAGGGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGTGCGGCAGGGGGGGCCCCGGCGGGGTGCGCGAGGGGGCTCCCGGCAGCCAGACGGACAACGGGACCCGGCCGCGGGCCACGGGCCGCCCGGCCACGATGA-------------------------------------------     
13 Ursus_americanus-NW_025577642.1-205724_206222            84.3%  40.1%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCTGCTGTGGGTCGGTG-----GTGCCCTGCAAGGCGGCCCCCGAGACCCCC-GACGGTGCCCGGCCCCAGTGCTTGCAGGGAGTGGAGTAGATGGCGCCTGCCC-CTCGGCCCTGGGCCTTCATTTCTGGCCTGAG-----CTGCGCTGAACAGCTTTT-------GCG-------AGGTTGTGTGACAGGCAACAGCCTGAGGG----CACCTTGTCGGGGAGCCCTAGCCTGCTGGCGGGGGGGGGGGGGGGCTGAAA--GCTGAGCCATTCCCCTCCCCCAGATCCCGATCCCACCCTGCA-------CCCCACCC---AGCCTTGCTGTTTGTCTGTCCACCTGCCAGCCCCACCCACACGCTGACCACCCTGTTCTCCTTTCTGTCCCCACGCT--GC-----------------------CTCCATAGTTAGGGACTGAGAGC--AGC-CGA-GTGCCAGGTAATGGGGCCC-----------------------AGCCCCCGTGTGCCCTGTGCTGTCCCCAGCCC-----------------------T-GG-ACTGTTGGGGGGCCCTGTGGACCCTGCCTGTGGGCATAGACCG-TCTGCTCC----------------------CC-CAGCCCCAGCAGCAGCAGAGCCGGAGGGCAGGG-TGGGGGCAGCTGTATGCACATGGAGGGGC-CTGGCCGCTGAGGGTCCTGTGGGCACTGTCCACGG--GGGATGCACCCAACATGCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTCCACAGATACTCGCCCCTTCTCCATGCAGAGGACGGGTTCCTCCCTAGGTGGCCTGGAAACCATTGCCGAGGAGCCAGCCCTGGGCCCTGGCCCCCCACCTCTGGTGGCTGCTCCCCCCAGCCCCTCCCCGGGAGGGCCCCCGTGTGCCTCAGGACCCAGTGCCGAAGTGGCGAGCCCCCCTGCGGTAGCTCTGGGAGCTTCCGTGTCCTTCCAGCCCAGGACCTGGCGCAGAGGGGAC------ACGGAGCCGGCCCCGGAAAGC---------CGGCGGAGGGCATACAACGGCGGGAGCCCCGGGGGGGCGTGCGAGGAGGCTCCTAGCAGCCAGATGGTCAGAAAGGCTGAGA-------------------------------------------------------------------------     
14 Pteropus_alecto-NW_006429611.1-212405_212788             81.3%  33.0%    ---------------------------------CCC-------AGCTG---GGCTGGTCCC----GAC-GGCCGGGGCCAGCGCCT-----------ATCCCCAATCCCGGTCTCCCTCCAGGGCCAGC--------------ACCAGGGGTCCCGGCCCCTGGCCC-CGCACCGCAGTCCTCC--GGGATGTCGGCCGCAGTCAGTGGTT----CCCCGC--T-------GGACGGCCCCGCTGCCCCAAA-----C-------------CTGT-------GCA-------CGGTGCTCAGAGCCG----TGACGTCGGG----GCTTCAGAGTTTGCA-----AAGCGCTGAGTGGAGCC-TGTGT-------C--CCTCGGCC-CCA---------GGGACTCATTTACGGCCTGAA-------TTG--------CACTGAGCAGCCCCGCTCCCGAAGCCCTGGCCAGGGCCGGTGACAGAGCACCCCGTCATGGGGGGTGGACCCCAGAC-CGG-----------------------GGGGAGGGGTGGAAGCTGAGCCGTCCTC-CTGCTCCCCCCGCACCCCTGCAGCCTTGCTGTGCGTCTGTCCGTCCACCAGCCCCACCCCCACGCTGACCACCCTGTTC--TCTCTGTCCCCCATGCTGCCTCCGTAGTTAG-----GAACTGA-GAGCGGCCCAGTGCCAGGTAACGG-G--GCCCGGCC-CCCGTGCGCCCGATGCCGCCCTCCGCCCCAGGAGGCCCC-----CGTGG------------------CAGAGCA-----------------GCAGCGGAGCTGGAGGGCAGGGTG-----------------------CAGGGCAGCCACATGGGCGCGGGGCCCTGACTCGCTCCTCCCCCTCTGCCCACAGAGGCCCGCTCCTTCTCCACGCAGAGGTCGGTCTCCTCCCTGTGCAGCCTGGAGACCATCGCCGAGGAGCCAGCTCCGGGCCCCGGCCCCCAACCTCTGCTGGCTGCCCCGCCCAGCCCCTGCCCGGGACCCGGTGCCAAAGCCCCGAGCACT---CCAGGGGTGGC------------------ACGGGGAGCCTCCGGGCTCCTCCAGCTCAGGACCGGGAGCCACGGAGAC------ACTGAATCGGTCCCTGACAGC---------AGGCAGCAGGCGTGCAATGGCGAGGTCCCCAGTGGGGTGTGCGAGGGCACCCCCAGCAGCCAGACGGACAGCAGGGGCCACCCCCGGGCCCCGGGCCCCCTGCCCGTGGTC--------------------------------------------     
15 Myotis_myotis-NW_023416355.1-1025788_1026161             81.8%  35.1%    ---------------------------------CCT-------GGCCT---GGGGCCTTCC----TAG-GACTCGGGCAGCGTCCAGCCACACACC-CACCCCAGCCCCCGCCTCCCTCCAGGGAAGG----------------CTGAGGGGTCCTGCCCCTGCCCC-TGCCCCACAGTCCTCT--GGGGAGTGGGCCCTAATGCCCCTGA----CTCCTG----------GCCGGGGCTCCGAGCCCCAGG-----T-------------CGCA-------GCT-------TCCACGCGCACCCGG----CCCCGGGGTG----CATTCAGGCCTGGAGCCCCTCCCGGCCGGCTGCCGAC-TGGGGAGGGGGAA--GCTGAGCCGTC--------------CTGCTCCCCTCCCTGCA-------CCC--------CGCCCTGCTGTCCCTCTGCCCACTGGCCAGCCCCGCCCCCACGCTGACCACCCTGTTCTTTCT---GTTCCCAT-GC-GGC-----------------------CTCCGTAGTTAGGAACTGA--GAGCAGC-CAA-GTGCCAGGTAACGGGGCAGCCCCCGTGTGCCCTGTGCGGC-----CCCCGTGTGCCCTGTGCAGCCCCCGTGTGC--CCTGTG-------------------CGGCCCCGTGTGCCCTGTGTGGCCCCCGTGTGCCGTGTG------------GGCC-CCCGTGTGCCCTGTACGGCCCCTGCCTGGAGGGCCCAGC-----AGCAGCGGAGTGGAGGGCAGGGTGCAGCCC-----------------CCGTGTGGCCTGGAGGGGCCTGGT-----------------------CAC-TGGGGCCTGGGGCACAGGCTGCGCCCGACACCCACCTCTCCCTCTCCGCAGATCCCCGCCCCTTCTCCATGCAGAGGTCGGTCTCCTCGCTGTGCAGCCTGGAGACCATAGCTGAGGAGCCAGCGCTGGGCCCCGGGCCCCCGCCTCCGCCGGCCACCCCACCCCGCCCCGCCCAGGGGGGACCCTGGTGCACCACGGGCCCCGCAGTCCAGGCTGA------------------GCGCCCCCCAGCGGTGTCCCTCCAGCTCAGGACCGGGAGCCAGGGGGAC------ACAGGACTAGCCCCCCACAGC---------AGGTGGCAGGCGTGCCATGGTGGGGGCCCCAGTGGAGCATGTGAGGGGGCGCCCGGCAGCCAGACGGACAGCAGGGGCCACCCCCGGGCCCTGGGCCATCTGCCCTTGGTC--------------------------------------------     
16 Callorhinus_ursinus-NW_020313076.1-205295_205493         82.9%  37.6%    -----------------------------------------------------GGCCGGGCT---GCA-GGTGTTTGGCTGCTGGCCCTGCA-----CTGCAGTCCTCCGAGAAGCCTGGTGTGGGTCGGTG-----CGGCACTGCAAGGCGGCCCCCAACGCCACC-GCCGGTGCCCGGGCCCCAGCGTTTGCAGGGCTGGGGCAGATCGCACCTGCCCCCCCGGCCCTGGGCGCTCCGTTGTGGCCTGAG-----CCGAGCCGA-----------------GC-------CGCGGCTGGGACAGGCAACAGCCCGAGGG----CACCCTGTCAGGGAACCCCAGCCTGG------------GGAGGGGCTGAAA--GCTGA-GCCGTTCCCTCCCCCAGACCCCCATCCCTCCCTGCG-------CCCCGCCC---AGCCTTGCTGTTTGTCTGTCCACCTGCCAGCCCCACCCACACGCTGACCACCCTGTTCTCCTTTCTGTCCCCACGCT--GC-----------------------CTCCATAGTTAGGGACTGAGAGC--AGC-CGA-GTGCCAGGTAATGGGGCCC-----------------------AGCCCCCGTGTGCCCTGTGCCATCCCCGGCCCC----GGCC-------------CC-GG-CCTGTCCGGGGGCCCCGTGGACCCTGCCTGTGGGCACAGACTG-TCTGCTCC----------------------CCCCCGCCCCAGCCGCAGCAGAGCCGGAGGGCAGGG-TGGGGGCAGCTGTGTGCACACGGAAGAGC-CTGGCCGCTGAGGGTCCTGGGAGCACTGTCCACGG--GGGGACGCGCCCA-------------------------------GCATGGTTCTCTCCCTCTTCTCCACAGATACCCACTCCCTCTCCGTGCAGAGGACGGGCTCCTCCCTATGTGGTCTGGAAACCATTGCTGAGGAGCCAGCCCCAGGCCCCGGCCCCCCACCTCTGGCGGCTGCCCCCCCCAGCCCCTCCCCGGGAGGGCCCCCACGCACCTCGGGGCCCCGCGCCAAAGTGGCGAGCCCCCCAGCGGCAGCTCCGGGAGCTTCCGCGCCCTTCCAGCCCGGGACCCAGAGCCGAGGGGAC------ACGGAGCCAGCCCCGGAAAGC---------CGACGCAGGGTGTACAACGGCGGGGGCCCCGGGGGGGCGCGCGAGGGGGCCCCTAGCAGCCAGACGGTCCGGGAGG-------------------------------------------------------------------------------     
17 Rattus_norvegicus-NC_051340.1-194431_194613              79.7%  31.4%    -----------------------------------------------------------------GCA-CTTAGCCACCATCCTAGCTGACAGTTCCTGGCC-----TACACCTGGTCTGCAGGAGTGTGAGGGA-ACTGGTCTGAGCTGGTCTCA---GCTCTAGTCTGGGTGGGAGGGAGGCACCTGGAGTCTGCCT--------------------------------------------------------GCTTCCATTGTACTCCTCCC-------GCTCCT-GCCCAGCCTTGTTGTCCAT--C--------TG---TCCATCTGCCAGCGG--CCCCCCACACAC-TGACCGTGTTCTCCTTTCTGTC--CCTGCTCCGTGCTGCTTCCATAGTTAGGGATTGAGACCTGCG-----AGTGCCAGGTAACAGGCCCAAGCCCTATGTGTCCCTATAATGCCCCAGTTCAATGAGGATTAGACTTGACCTTCTTGTT-GCC--------CCTGTGTGAGGCCCAGGC--------GTGACTCCAGCTT---TAGTGGGGTGGG-GTACTCTTGAGTGTCACG--------------------GTACAGGTGTATAAACGGAGAAGTCTGATTGTTGGGATATCCTAGGGTGGGGTAGTCCCTACCCTTGGCTCAGGGGGTTGGGAACCAGTGCTGATTGGTAAGATTCATCTC------TCTCTCTTATTCTCTCTCTCCCCCTACCCCCTCTC-TCCCTCTCTTTCCCCATCCCTTCTCTGTTTCTTGATTCTCCTCACTTCTGCCTT--TAACC-------TG-----------------------------------CCTGACCCTCCTATGTCTACCTC-TCTACCTCTTATCTCCGGTCCCTCTTTCCCCACAGACACTCGCCTCTTCCCCCTGCAGCGGCCCATCTCCCCCCTGTGCAGCCTGGAACCCATTGCTGAGGAACCAGCCCTGGGCCCTGGCCTCCCGTTACAGGCAGCTGTCCCCACAGGTCCATCTCAGGAAGGGCCCCAGTGCCCTGTAGGACAGGGAGCCAAAGTGACCGGCCCCCAGCAGACGTCTCTGGGAGCTTCTGGAACCCTCCAGCTCAGGACTGGG------GGCGATAGGGAAAAGGAAGAGCCACCTCTCAG------------------GCCACACAACGGTGGGATTCCCCACGGGCCACGTGAGGGGACATCTGGAAGACAGACAGACAGCAAGAGCCGCTCCT----------------------------------------------------------------------     
18 Castor_canadensis-NW_017871110.1-192396_192835           83.1%  36.1%    --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGAGAGCTGCGAGCACCAGG-TAATGGGCTCAGCCCCTGTGCATCCGTGTTG-----------CCCAGTCCCAGG-AGGACCTACAACTGGCCTGCCAGACCCAGCAG--CAGCAGGGTGG---GGGATAAGCTG------AGCACACCATGT-TGGATGTGTGTAAAATGGTCAG-GCCTGGCTGCTGGGGGTGCCCTGGGGAGGGAGATGAACCACAGACCCTTGACATAGGGGTCAGGAGACACCATTCCTTGACCTGATTCTCCCTCTCTCCCTCC-CCATCTGTTTCTGCCTGCCTCCCTCCCTCCTTTCCTCCCT------CCCTCT---------CTATCTCTTCTCTCTGTTCCGTCCTGATTCTGAATTTCTCTATCTCTGACCCTCCCTGTCCCCCTTTTTGTCTATTTTTCTCCCTTTTCATCTCCTTCTTCCCGT------CTGT----CCCCTCCTCCCACTCTC---------TCCACCTCTGTCCCCCTGACTCTGT-------------CTCTTTCCATTTCTGTCTCTCTCCCCCTTTCTCTCCTGTCTGTCCTTCTCCTTGTCTTTCTGTCTCTCTCTCTCATTTTCCTCTCTGTCTGCCTGTCTCTGTCTTTCTCTGTCTCCCTTTCTCCCTTC--CATCTCTGCCTTCCCCGTCCCTCTCTCTGTGTCTC-CTTCTCCATCTCCCTGTCTGTCCCTCTCTCCCCAGATACCCGCCTCTTCCCCATGCAGCGGCCCATCTCCCCCCTGTGCAGCCTGGAAACCATTGCTGAGGAGCCGGCCCTGTGCCCTGGCCTCCTACCCCAGGGGGTCTCTCCCGCAAGCCCTTCCCAGGAGGGGCGGCAGTGCCCTGCAGGACCTGGAAGCAAAGTGGCTGCTCCTCCACAGTCAGCTCTGGGAGCTTCTGGGCCCCTCCAGCTCAAGACTGGG------GGCCACGGGGACAATGAAGAGCCCCCTCAAAA------------------GCTGCACAATGGTGGGGGCCCTAGTGGGGCATGTGAGGGGGTCCCTGGGAGCCAGCCAGACAGCAAGAGCCACCCCCAGGCCCTGGGCCATCTGCCCGTA-----------------------------------------------     
19 Pipistrellus_kuhlii-NW_023425534.1-192396_192766         82.1%  34.8%    ---------------------------------TGC-------CCCGT---GTGGGCTCCG----TGT-GCCCCGTGTGGGCTCCGTGTGCC-----CCGTGTGGGCTCCGTGTGCCCCGTGTGGGGTCCGT-----GTGCCCCGTGTGGGCTCCGTGTGCCCCATG-TGGGCTCCATGTGCCC--GGTGTGTGCTCCGTGTGCCCCGTGT----GGGCTCCGTGTGCCCCATGTGGGCTCCGTGTGCCCAG-----T-------------GTGT-------GCT-------CCGTGTGCCCCG---------TGTGGGCT----CCGTGTGCCCTGTGGCT--------CCGTGTGCCCCA-TGTGG--GCTCCG--TGTGCCCCGTGT---------GGCTCTGGGTGGCTCCGTGTG-------CCC-----------CGTGTGGCCCGTGTGCCCTG---CGGGGCCCGTGTGCCCTGTGGGGCCCGTGTGCTCCGT---GTGCCCCATGT-GGG-----------------------TTCCGTGTGCCCTATGTGG------CCC-GTG-TGCCCTGTGGGGCCCGTGTGCTCCGTGTGCCCCATGTGGG-----TTCCGTGTGCCCTATGTGGCCCGTG--TGC--CCTGTGGG-----------GCCCGTGTGCTCCGTGTGCCCCGTGTGGGCTCCGTGTGCCCTGTG------------TGGC-CCAT-GTGCCCCGT--GGGGCCCCGCCTGGAGGGCCAGC-----GGCAGCGGAGTGGAGGGCATCGTGCAGGCC-----------------GCCGTGTGCCTGGAGGGGCCTGGT-----------------------CA--GGGGGCCTGTGGCACGGGCTGCGCCCGACGCCCCCTCTCCTCTCCCCGCAGATCCCCGCCCCTTCTCCATGCAGAGGTCGGTCTCCTCGCTGTGCAGCCTGGAGACCATTGCGGAGGAGCCAGCGCTGGGCCCCGGGCCCCCGCCTCAGCCGGCCACCCCGCCCAGCCCCGCCCAGGGGGGGCCCTGGTGCGCCACGGGCCCCGCAGCCACGGCTGA------------------GCGGCCCCCAGGGGTGCCCCTCCGGCTCAGGACGCGGAGCCAGGGGGAC------ACGGAGCCGGCCCCCCACAGC---------AGGTGGCAGGCGTGCCGTGGTGGGGGCCCCGGCGGAGCGTGTGAGGGGGCGCCCGGCGGCCAGACGGACGGCAGGGGCCCCCCCCGGGCCCCGGGCCACCTGCCCTCGGTC--------------------------------------------     
20 Sus_scrofa-NC_010448.4-194134_194330                     80.9%  31.8%    ------------------------------CGAGCC-------CCCTTTCCGTGGCCTGACT---GCA-GGCCCCCGGGGGCAGCTTCCACG---------CACCCTCCCGCCTCCCTTCAGGGACAGGCTG-----CTGG---------CTTCCCACCCCACATCC-CCCTCCCCCCTGCCCC--CGCCTGCCCGCCGTTCTCTGGGCAG----TCTGGCCTGGGCGCTGGACGGGGCTCAGTTTGCTGAG-----T-------------GTGG-------GGT-------CGGGGGAGCA----G----ACTGCAAGTG----GCCTTAGCCCTGGGG----------------ACTCCC-TCAGG----AGCA--GCTCAGCT----------------CCAGATCCCCTGCCCCCC-------CCC--------------CAACCCCCAAGGGCTGGTGGTGACAGAGGACT--GCTCAGGGCCCCAGGCCACAAGAAGCAGGCCCAGTCTGGGG-----------------------ACGGCAGGCTGGGAGCTGAGCCTCCCTC-CCGCTCCCTCCCTGCACCCGCCCAGCCTGCATCCTCCCGTCTATC-CGCTGGCCCGCCCCCTCTGACCTCTCTGTTCTC--CTTTCTGTCCCCATGCTGCCTCCCTAGTTAGGA------ACTGAGAGTAGCCGAGTGCCAGGTAACGG-G--GGTCCGGCCTCCCAGTGCCCTGACCTGCCCTGGCCCCAGCAGCCCTGGAGCCGGAGGGCAGGGTGGGGGGCAGCTCTGTGTG------------------TCTGGGGGGCCTAACCGGGGGGGC-----------------------CTGGGGCGCAAAGCCATGGGGACACCCCGACACACTCCCCCCCTCTTTCCTACAGACACCCGCCCCTTCTCCACGCAGAGGTCCGTCTCCTCCCTGTGCAGCCTGGAAACCATTGCCGAGGAGCCAGCCCTGGGCCCCGGTGCCCCCCTGCCCGTGGCTGCCCACCCCCAACACTCCCCCGGAGGGCCCCAGTGCTCCGCAGGTCCCGGCGCCAACTCAGCAAGCCCCCCAAGGGTGGCTCTGGGAGCTTCTGGCCCCCCCCAGCTCAGGACCAGGAGCCAAGGGGAC------ACCGAGCCAGCCCCTGAAAGC---------TGGCAGTGGGCGGGTGGCAGCGGAG------------------------GCCCCAGCAACCAGACCGACGGCAGGGGCCATCCTCGGGCTCCAGGCCCT--------------------------------------------------------     
21 Leopardus_geoffroyi-NC_059328.1-210162_210341            80.5%  34.8%    ------------------------------CAGCCCCCCTTGTCTCCCTCCGGGGCCGGGCC---GCG-GGTGTCCGGCCCCTGACTCTGCA-----CCGAAGGCCTCTGGCGAGTCCGGCGTGGGTCGGTG-----GTGCCCTGCAGAGCGGCCCCCGACGCCCCC-GAGACCCCTGGACGGTGCCCAGGGTGTCGAGTGGAGGAGACGG----CGCCTGCTCGGCCCTGGGGCTTCATTTATGGCCTGAG-----CCGCGCTGAG----------------------------------------------------CA----CCGGCTGTG------------ACTGGACCCCGGCCTGTGGAGGGGCTGAAA--GCTGAGCTGT----------------CCCCTCCCCGCCATCC-------CTGCACCC---GCCCAGCCTCGATGTTTGTCCACCGGGCAGCCCCACCCCTATGCTGACCACTCTGTTCTCCTTTCTGTCCCCACGCT--GC-----------------------CTCTGTAGTTAGGGACTGAGAGC--AGC-CGA-GTGCCAGGTAATGGGGCCC-----------------------GGTCCCCCGGTCCCCCGTGCACCCTGTGCCGTC--CCCGGC-------------CTGGC-TTGTTGGCCGGGCCCCGTGGACCCTGCCCGTGGACACAGGCCC-GTCTGCCCACCACCCCACCCCCCCCCCCCCCACCAGCCCCAGCAGCGGCAGAGCCGGAGGGCAGGGTGGGGGGCAGCTGCGTGCCCACCGAGGGGC-CTGGCTGTTGGGGGTCCTGCGGGCACCGTCCCTGG--GGGATGAGC---------------------------------CCGACACGCTCTTCTCCTCTCGTCCACAGACACCCGCCCTTTCTCCGCGCAGAGGCCAGGCTCCTCCCTCCGTGGCCTGGAAACCATTGCCGAGGAGCCAGCCCCGGGCCCCGGCCCCCCACCTCTGGTGGCTGCCCCCCCCAGCCCCTCCCCGGGAGGGCTGCCGTGCCCGTCGGGACCCGCCGCCGAAGTGGCCAGCCCCCCTGTGGTGGCTCTGGGAGCTCCCACGCCCTTCCAACTCAGGACCCAGAGCAGAGGGGAC------ACGGAGCAAGCCCCAGAAAGC---------CATCGGCGGGTGTACAACGGTGGGGGCCCAGGGGGAGCCTGCGAGGGGGCCCCCGGCAGCCAGACGGTCAGAAGGG-------------------------------------------------------------------------------     
22 Arvicanthis_niloticus-NC_047662.1-194458_194673          81.2%  34.6%    --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGAGTGTGAGAGA-ATTGGTCTGAGCTGGTTACCTGAGCTCTAGCCTGGGCGGGA----------GGGAGTCTGCCT--------------------------------------------------------GCTTCTTGTGTACTCCTCCC-------GCTCATTGCCCAGCCTCGTTGTCCAT--CTGTCCATCTG---TCCATCTGCCAACGCCCCCTCCACACACT-GATCCGTGTTCTCCTTTCTGTC--CCTGCACCGTGCTGCTTCCATAGTTAGGGATTGAGACCTGCG-----AGTGCCAGGTAACAGGACCGAGCCCTATGTGTCCCCATGATGCCCCAGTCCAAGGAGGATTAGGCCTGGCCTGCTTGTT-GCCCCATGGACCCTGTGTGGGGCCCAGGC--------ACGACACCAGCTT---TAGTGGGGTGGG-GTACTCTTGAGTGTCACA--------------------GTACGTTTGTATAAATGGAGAAGCCTGGTTGCTGGGATATCCTGGGGTGGGGTGGTCCCTACCCTCGGCTCAGGGAGTTAGAAATCTGTGCTGACTAATGAAATTCTCTC-------TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT-CTCTCTCTCTCTCCCATCCCTTCTCTGTTTCTTGATTCTCCCCACTTCTTTAAT--CTGCCCCTGCCCCTCCTGCCCCTCCTTCCCCCTGCCCCTCCTACCCCCTGCCCCTCCTGCCCCATCTCCCTC-TCTGTCTCTTGTCCCCTGT-CCCTCTTTCCCACAGATACTCGCCTCTTCCCCCTGCAGCGGCCCATCTCCCCCCTGTGCAGCCTGGAACCCATTGCTGAGGAACCAGCCCTGGGCCCTGGCCTCCCGTTACAGGCAGCTGTCCCCACAGGTCCATCTCAGGAAGGGCCCCAGTGCCCTGTAGGACTGGGAGCCAAAGTGACCAGGCCCCAGCAGACATCCCTGGGAGCTTCTGGAACCCTGCAGCTCAGAATTGGG------GGTGACAGGGAAAATGAAGAGCCACCCCTCAG------------------GCCACACAATGGTGGGATCTCCAGCGGGCCACGTGAGGGGACCTCTGGAAGACAGACAGACAGCAAGAGCCGCTCC-----------------------------------------------------------------------     
23 Cricetulus_griseus-NW_003616165.1-69299_69516            77.2%  31.3%    -----------------------------GGGACCTGCACGGCCCACATGGCGCTTAGCCTCTGTCTG-ACCACCAGCCATCTTGGCTGGCCGTTCCTGGCC-----TACACCTCCTCAGCAGGAGTGTGAGGGA-ACTGGATCCAGCTGGTTACCTGAGCCCTAGCCTGGGTGGGAGGGAG----------TCTGCCT--------------------------------------------------------GCTTTCATTGCATTCCTGCT-------GCCCCT-GCCCAGCCTCATCATCCAT--CTGTCCCTCCG------------------CACCCACCCAAAAC-TGACCATGTTCTCCTTTCTGTCCCTGCTCCCTGTGCTGCTTCCATAGTTAGGGACTGAGACCTGCG-----AGTGCCAGGTAACAGGCCTAACCCCTGTGTGTCCCCATGCTGCCCTGGTCCAAGGAGGATCAGGCCTGGCCTGCCCATT-GCCCTGTGTG---------TGGTCCAGGC--------ACCACTCCTCCCACGTTAGCAGGGTGGG-GGTGCTCTGAGTGTCA-----------------------------------CATGGAGACATCTAGCTGCTGGGATACCCTGGGAGGGGCTGGCACCTACCCTTGGCTCAGAAATCAGCTCACATTGATGGG-------ATTCATATTCATACTCTCTCTCTCTCTCTCTCT------------CTCTCT-CTCTCTCTCTCTCCCT------CCCTCTCGCTCTCTCCCCATCCCT----------------------TCTCTGTTCCACTGTC---------------TTGGATCTCTCCATCTCTCTATATACCT-CTCTGCCTCTTGTCTCCATCCCTCTTTCCCCCACAGATACTCGCCTCTTCCCCCTGCAGCGGCCCATCTCTCCCCTGTGCAGCCTGGAACCCATTGCTGAGGAACCAGCCCTGGGCCCTGCCCCCCCACTACAGGCAGCTGTCCCCGAAGGCCCGTCTCAGGAAGGGCCCCAGTGCCCTGTAGAACCAGGAGCCAAAGTGACCAGCCCCCAGTGGACAACTCTGGGAGCTTTTGGAAACCTCCAGCTCATGACTGGG------GATAATAGGGACAATGAAGGGTCAACCCCCAA------------------ACCACACAATGGTGGGATCCCCAGTGGGCCACGTGAGGGGACCTCTGGCAGACAAACAGATAGCAAGAGCCGCTCC-----------------------------------------------------------------------     
24 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-192396_192896         79.3%  33.9%    ------------------GAAGTCTGCCAAAAGGCAGTGGTGTAGCCAT------AGGGCGCCCCCAG-ATGTCCTGCAGCCTGGGCTGGTGC----TCCGG-----CCGGGATGCTGGGCCTGAGTTTGCAAAG----GGCTGGGACTGCTTCCCTTACTCCCGGGGCCCATGACTTGGCAGCACCAGGAGACTCCAGCCAATCCTGGCGGACAGCGGG-TGGAGGGTACAGCTGGGGTGCCAGACCCTAGCCTGGGTGGGAGGGACATGTGCCGAGCCCCTCACTCTGCTCTGCACCCCTGTCCGC--CTTGCTGTCCG---TCTACCCCTTG-----CCTAGCCCCACCC-TGCTGACCTTTTTCTCTTTCTGTCCCTGCACCCTGGCTGCCTCATAGTTAGGGACTGAGAGCCGCG-----TGTGCCAGGTAATGGCCCGGCCCCCATGTGCCCGCG---TTGCCCCAGGCCCC------ACAGACCTCGCATGTGGGCACAGGGCCTGGGCACCTT------GCCCGTT--------CACAGCCCAGCCCCAATGGC---------------AGCAGGGAGGGGGGCACATCGAGTGTGCCATGCTATCTGTGTGCAGATGGACAGGCCTGGCTGCTGAAGGTCCTGGGGAG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCTTAGACCCGTGGCACA------G-------GGGG--CTGCAGGGTCCATCTTTG-ACCT------GGCTCAACTTTCCCCTCCTCTCATCTCCCTCTGTCTCCCAACTTCCCTCTGTCTGTCTCCCACTTCTCTCTCCCTACAGACGCCCGCCCCTTCTCTACACAGCGGTCCGTCTCCCCCTTGTGCAGCCTGGAGCCCATCGCGGAGGAGCCAGCCCTGGGCCCTGGTGCCCCTGCCCAGGCAGCCACCCCCACCAGCCCTCCCAGGGGCCAGCCCCAGTCCTTTGTGGGGCCTGCAGCCAAAGTGGCCAGTCCTGCACGGACAGCTCGGGAACCTCCTGGCCCCGTCCAGCTCAGGACTGGGGGC------CAAGGGGACAATGAAAAGGCTCCCAGAAA------------------GCTGCTCAGCGGTGCGGGGCCTGGTGAGGCACGCGAGGGGGCCACTGGCAGCCAGCCAG----------------------------------------------------------------------------------------     
25 Eptesicus_fuscus-NW_007370721.1-192396_192768            82.2%  26.8%    ---------------------------------------------------------NNNN----NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NN-----N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----N-------------NNNN-------NNN-------NNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNN-------------NNNNNNNNNNNNNNNNN-------NNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT---GAGCGGGCTCC-GAG-----------------------ACACGGAGTGGCTGCCCCC--CGCCCCC-GGG-GCTCGGAGACCCTGTGCGGCCCCTGTGTGCCCTGTGCGGC-----CCCCGTGTGCCCTGTGCGGCCCCCGTGTGC--CCTGTGCGGCCCCGTGTGCCCTGTGCGGCCCCGTGTGCCCTGTGCGGCCCCCGGGGGCCCTGTG------------CGGC-CCTGTGTGCCCTGTGCGGCCCCCGCCTGGAGGGCCCAGC-----GGCAGCGGAGTGGAGGGCAGGGTGCGGCCG-----------------CCGTGTGCCCTGGAGGGGCCTGGT-----------------------CAC-TGGGGCCTGTGGGCATAGGCTGCGCCCGACGCCTCCTCTCTCTCCCCGCAGATCCCCGCCCCTTCTCCATGCAGAGGTCGGTCTCCTCGCTGTGCAGCCTGGAGACCATTGCTGAGGAGCCAGCGCTGGGCCCCGGGCCCCCTCCTCAGCCGGCCACCCTGCCCCGCCCCGCCCAGGGGGGGCCCGGGGGCACCACGGGCCCCGTAGCCACGGCTGA------------------GCGCCCCCCCGGGGAGCCCCTCCGGCTCAGGACCGGGAGCCAGGGGGAC------ACAGAACCGGCCCCGCACAGC---------CGGCGGCAGGCGTGCCACGGTGGGGGCCCCGGAGGAGCGTGTGAGGGGGCGCCCGGCAGCCAGACGGACAGCAGGGGCCACCCCCGGGCCCTGGGCCATCTGCCCTTGGTC--------------------------------------------     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *  ***.    *.*    *  *   .*** ** *     *  *       .* *****..* ** ** *****.** *    . *  * .    *      *     *     *   .  .  .    .  *                                                                  .    .                                                                                       . .. .