CGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCGGGCATCCCCGAAAGGTCCCCCCGCTGGCCTGAGGGTGCCTGCAGGCAACCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAGTGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCGCCGGTAAGCCCCTCTTGCCCTGCGTGGTCCTCCCGCACGCCCCTGGCATGGCTGGGCCTGGGTCACCTGCTGCTGCTTCTGCGTGGACGGTGTCGCCTCGTGTGCTCGTGCTCGTGGCTCTGTATCCGTGGCACTGTCTCCGTGGCACTCTGCTCCCTTGGCTTGCCTGTGGCCCATAGCCCCAGCCCTCCTGTCTGAGCTTGAGGCCCTGGGACTTGGGTGGAGCTGGTTTGAGGCCCGACAGGCTGGGAAGAACCAGCTGCTCTTGCTGAGGGTCTGGGGCCGGGACTGTGGCCTGACATGCTGGGCCCCTCCGGCTGGGCGCTTCCCCAAACTCACCTCCTGGGCGGCTGGCGACCTGCATGGCCCCTGATGCCTTTCCTGGGACTGGGGGCCACGTACCATCCCATTCCCACCTCCCTCTAGGGCAGGCTCCAGGGGTCCCTACTGGGAAGTCTGATGTGGGCAGGTAGTGCAGCTGCTGGGCGTCTCCTGCGCCCCTGGGACGCCTGGAGCCTGCTGAGTGCTGCGTGGAGTAGATTCCCTGGGCCCCAGGGCTTCGCTGCTTTGGGCTGAAGCACCCCACTAGAAGGGTGTCTCCTTAGCCTGGAGGGAGGGACATACACGGAGCCCGCCCCACACCACCCTGCCCCTCCAGACCCCCCTGACCAAGCTTTCCTTTCTGCCCCCACCCACGCTGCCTCCGTAGTTAGGAACTGAGAGCGGCGAGTGACAGGTAACGGGGCCCAGCCCCGGTGTCCCGTGCTGTCCCAGCCCAAGGAGGGCCCCGTGTGCGGCACAGGGCGTGGACTGGGCCCCAGCAGCAGCAGGGTGGGGACACCGA
Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.
Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.
Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.
Distribution of HSS in the input sequence
HSS id | Strand | Frame | Length | Start | End | Score | P | Show Result | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 0 | + | 1 | 37 | 35553 | 35663 | 14.931 | 0.014 |
Plot |
2 | 1 | + | 2 | 12 | 35530 | 35565 | 13.427 | 0.034 |
Plot |
HSS id | Sequence | |
---|---|---|
1 | 0 | PEGACRQPGALQGEMSALFAQKLEEIRSKSPMFSAGK |
2 | 1 | SPKGPPAGLRVP |
Reference sequence (1): Target Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% |
cov pid 1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . . . 4 . . . . : . . . . 5 . . . . : . . . . 6 . . . . : . . . . 7 . . . . : . . . . 8 . . . . : . . . . 9 . . . . : . . . . 0 . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . ] 1376 1 Target 100.0% 100.0% -----------------------------------------------------CGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCGGGCATCCCCGAAAGGTCCCCCCGCTGGCCTGAGGGTGCCTGCAG---GCAACCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAGTGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCGCCGGTAAGCCCCT----CTTGCCCTGCGTGGTCCTCCCGCACGCCCCTGGCATGGC------TGGGCCTGG---------GTCACCTGCTGCTGC-TTCTGCGTGGACGG-TGTCGCCTCGTGTGCTCGTGCTCGTG--GCTCTGTATCCGTGGCACTGTCTCCGTGGCACTCTGCTCCCTTGGCTTGCCTGTGGCCCATAGCCCCAGCCCT--CCTGTCTGAGCTTGAGGCCC-----TGGGACTTGGGTGGAG----C-----TGGT-----TT-GA-GGCCCGACAGGCTGGGAAGAACCAGCTG-----------CTCTTGCTGAGGGTC---------------TGGGGCCGGGACT------GTGGC---------------------------CTGACATGCTGGGCCC----------CTCCGGCTGGGCGCTTCCCCA--AAC-TCACCTCCTG-GGCGGCTGGCGACCT-G-------CATGGCCCCTGATGCCTTTCCTGGGACTGG-GGGCCA---------CGTACCATCCCATTCCCACCTCC-CTCTAGGGCAGGCTCCAGGGG----TCCCTACTGGGAAGTCTGATGTGGGCAGGTAGTGCAGCTGCTG--GG--CG-TCTCCTGCGCCCCTGGGACGCCTGGAGCCTGCTGAGTG---CTG--CGTGGAG--TAGATTCCCTGGGCCCCAGGGCTTCGCTGCTTT-----GGGCTGAAGCACCCCACTA------GAAGGGTG-T---CTCCTTAGCCTGGAGGGAGGGACA---TACACGGA--GCCC----GCCCCACACCAC-----------------CCTGCC----------------------------------CCTCCAGACCCCCCTGAC----CAAGCTTTCCTTTCTGCCCC--CACCCACGCTGCCTCCGTAGTTAGGAACTGAGAGCGGCGAG-TGACAGGTAACG----GGGCCCAGCCCCGGTGTCCCGTGCTGTCCCAGCCCAAGGAG----GGCCCCGTGTGCGGCACAGGGCGTGGACTGGGCCCCAGCAGCAGCAGGGTGGGGAC--ACCGA-------------------------------------------------------------------------- 2 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-207539_208498 94.4% 72.1% ----------------------------------GGTAGCGGCTCCATATCCTCGGACGCCAGCAGCCCAGACAGCCCGGGCAGCCCCGAAGTGGGGGCCCGCTGGCCCGAGGGCGCCTGCAG---GCAGCCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAGTGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGATATCAGGAGTGAATCCCCCATGCTCTCCGCCGGTAAGCCCCGCCCTCCCGCCCTGCGCAGTCCTCCTGCACGCCCCTGGCATGGC------TGGACCGGG---------GTCACCTGCTGCTGC-TTCTGTGTGGACAG-CGTCGCCCCGTGTGCTC----------------------GTGGCTCTGTCTCCGTGGCACTCCGCTCCCTTGGCTTGCCTGTGGCCTGTAGCCCCAGCCCT--CCTGTGTGACCTTGAGGCCC-----TGGGACTCGGGTGGAG----C-----TGGT-----TT-GT-GGCCTGACGGGCTGGGCTGGGGCTCTCGGCA-GGAGCTGCTCCCGCTG-AGGCC---------------CTGGGCCCGGAGT------GTGGC---------------------------CTGGCGTGCTGGGCCC----------CTCCTGCTGGGCGCTTCCCTA--AAC-TCGCCT-CCC-AGGTGGCGACCAGCA-T-------GGCCCCTGACGCCCCCCTCCCCGGGACTGG-GGTCCA---------CTTCCCATCCCGTTCCTGCCTCC--CCCAGGGCAGGCTCCAGGGG----TCCCTACCGGGAAGCCTGAGGTGGTGTAGCCGCAGGGTGCCTT--GT------------------------------GTGCCAGGGACGC---CTG--CGTGGAG--GGGACTCCCTGGGC-CCCAGGTCTTCTTGCTTT-----GGGCTGAGGCGTCCCACTG------TGAGGGCA-T---CACCATAGCCCGGAGGGAGGGACA---GACAGGGA--GCCT----GCCCTGCCCTCCCCAC-----------CCCGTCCC----------------------------------TCCAG---CCCCCCTGAC----CGAGCTTTCCTTTCTGCCCC--CACCCACGCTGCCTCCATAGTTAGGAACTGAGCGCGCGAGC--GACAGGTAACG----GGGCCCAGCCCCCG-TGTCCCTGCTGTCCCAGTCCCAGGAG----GGCCCCATGTGTGGCACAGGGTGTGGACTGCGCCGGAGTAGCAGCAGGGTGGGGGC--AGAGTGCCAGGGGATGCCTCA----------GG---------------------------------------------- 3 Cebus_imitator-NW_016107460.1-202964_203857 88.2% 64.2% 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4 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-193117_194054 84.3% 44.4% --------------------------------------------------------------------CCGAGAGCCCGGGCAGCCCCCAGGGGGTCTGCGGCC---GGCAGGAGGCCGGCAG---GCAGCCAGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTGCAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCTATGTTCTCCACCGGTAAGACCAGCCGCCCGCCCGCCCATGCTGTCCT------CCCGCA-----GC-CGTGCATGGCCTGGGCCTCGC--GCCACCTGCTGCTGC-TTCCGCGT-CACGGACGCCACCGTGTGTGCTCGT-------------------------GGTGCCTCTGTGCTGCTCTGCTCCGCTGGCTTGTCCTGAGGCTGCCGGCCCCAGCCC--TCCTGCCTGCCTGACCCCGGGCC--CCAGTCTCTGGGAGGG----T-----GGGG-----AC-AGGTTTGAGCCACAGTGTGCCA---TGCCGAGAG-CCGGCCACACTTGCGGAGGGCC---------------CAGGGCCCCAAGT------GTGGCCTTGTGAACTAGCCCCTCCCACCAGGCTTCAGCTGGGA---GC---------CCCGAGAA--AGGGCTGAGCCC--CAACCCGCCTCCCC-AGTCTAC-TGCTGCC-T--------GGGGGCCCTGGTGCCCTTCCTGGGACTGG-GGGCCG---------CTTCCTGCCCCCACCCCACCTCCCTCCAGGGCCAGGCTGCAGGGGTG--TCCCTCCCGGGGAGGCCGGCCTGGCTCGGTGGTGTAGCCGC----GG--GG-CGCCTCCATCCCCCGAGACTCCGAAT-GGTGCT---------------CAGAG--TTCGCAAGTG-------------------CTGAGGG--GCGCAGATGCCCCGTGCCT------CTGGGGCC-C---TGAGACCCGTGTCTGGCTAAACCC---CACTGAGCACCTCT----GCTGCGGCCCAGGAGGGAGGGGTGTGCACCGAGCTG--CGCTGTGC-------------GCCGGTCTGTCCCGGCCCCTGTGCTGAC----CGAGTTCTCCTTTCTGTCCCTGCACTCACGCTGCCTCCATAGTTAGGAACTGAGCGCGCAAGT--GACAGGTAACG----GGGCAGCCCC-----------------------------------------------------------------AGCCCCGGGAGGACCCTGGCCCATCC--ACTGCCCCAGCCCCCACAGCA----------GCAGGGCGGGGGCG--------CCAAGTGTGCCCGTCGGATGTG---- 5 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-208820_209191 83.7% 34.1% ----------------------------------------------------TCGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCGGGAAGCCCCAAGGTGGCCACCCACTGGCCCGAGGGCACCCACAGGCAGCAGCCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGTTCAAAAACTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGACCAGCGGCTCTTCCCAGTGTCCTGTGATGTCTTCCTGCATGGCCTCT---GGCATGGCCTGGGCCTAGTGTCACCTGCTG--CTGC--------TTCCATGTCACAGAACCATTGCCTTGGTGTGCTCGTGGCATCTCCATTGTATTTTGCTCCATTG----------GCTTGTCCTGCGGCCCCTTC-CGCCCTGGCCCTGC---------CATCTGATCACGAGGCCCTGGGACTCCGGGAGGG----------TGTG---------CTGTAGCG-GAGTGTGGTCTCAGCACGTGCTGGGCACTTCGTGCTTTCTCAAGTCC---GGGAGACTCGCCATGTGAAGCCCCCTCCTGCCAGGTCTCAGCAAGGTGCTC------CC-----TGA--------GAAATGACC---CCTCCCTCCTCAATCGCTGAGCCCACGCCAACCTTCCCGGTCGGTGCCTGCCCCAGT-CGCCCCTGATGTCCTCTCCGC--TCCC-CGCC-----T-----------------CCCATGCTTCTAGAGA------CTCCTAGTGCGCTCAGA----------GTTTACAGACTGC--TGATGGAGCACAGTCCATG------TGCT-CTGGGGGCCCGGGTTCAC-------------------------------------------TAAAGCCTGGGCTGGCCGAGCAGCTCA-------GCTCCAGGAGCCTCCAGGAGC----CCCCAGGGCCGTGGCGCCAGACACGTGCTGGCTGGTACT---T----AGCAGGAAA----GCAGGA------GA-GCTGAGCTGGCTCCTGAACTCCAGCCTGGGAGGGAGGGATG-TTCCCTGAGCCTGTACCCGGCCACCCTATG----CTCCCCAGCGTACCTGCCCA--GTCTCACTGTC-----------------------ATCTGTC-TGCCCACTGCCCCGCCCCACTCTGACCGCATTCTCCTTTCTGTCCCCGCACCCCATG--CTGCCTCCGT----------AGTTAGGAACTGAGAGCAGCCTTGCCAGGTAACGGGGCCC------------------------------------------------------------------------------- 6 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-259874_260102 83.0% 37.9% -----------------------------------------------------------CCAGCAGCCCGGACAGCCCGGGCAGCCCCAAGGCGGCCCCACTCTGGTCCGAGGGCTCCGGCAG---GCAGCCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGCTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACCGGTAAGACCAGTGGCTCCTCCCGTGTCCCCTGTGGCGTCCTCCTGCA--CGGCCCCTGGCATGGCCCGGGCCTCAT--GCTGCCCGCG-CTGC-TTCCCCATCGCAGACCGTGGCCCAGTGTGCTCCT-------------------------GGCATCTCCATGTGATTGTGCTCCGCTGGCTTGTCCTGGGGGTCCCCTGCCTGACCT--TGAGGTCCTGGGATTTTGAA-----------AGGGGTGGGG----A-----CTGA-----GA-GAGTCCGAGTCATAATACAGCA---AACCGAGA--GTGGCCAGGATTGCTGGGAGCC---------------TGGAGCTGCAAGT------GTGGCCTCAGCAAGGTGCTCCCCAGGAAAGGGCTCC--------------------------------CCGCTGAGCCC--AAACCTACTTCTCT-GGCTGACCGGTTGCCCG--------GACTTCCCCTGACACCGTCCTGGGACTAG-GGGCAG---------TGCTCACCCCCGACCCC-------TGCCAGGGCCAGGCCCTGCACTGCATTCCTCCTGGGAAGTC--ACATTGGTCAG-GGTGCGGCTGTAGGGAA--GC-CTCGTGGTGCCCTGGAGACTCCTGGATGGAGCT---------------CAGAA--GCTTGCAGTCGGGGCCTCAGGGCTGCTGGGTGCAGT--GTGGAGCGCGGTCCGTGTG------CACGTGGC-C---TGGGGTTCACTCCTGGCCTGGCCT---GCGCTGGCAGCTCT----GCCCTGCACTCTGGGGTGGC-GGGCACACACAGTTGCTCGCTGGCACCTCGTCAGC--------------GGGGCACAGGCAGGGCC----CAAGGGGTGCTTTGGACCCCTGCCTGGGCGGGAGGA------GTGTGCCCTGAGCCTGTCCCC------------------------CGC-----------------------------------------------------------------TGCTGTGCTCCCACCCTGCCTTGCCT--TGTCCTGCTGTCCATCCAGCG----------TCCGTCCAGCCGCCCACCCTGCCCCAACCTGACCATATTCTCCTTTTC 7 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-191712_191946 80.9% 30.5% -----------------------------------------------------CGGACTCCAGCAGCCCAGGCAGCCCAGGCAGCTCCCAAGTGGTCCCCTGCCCGCCTGAGGGTGCCCACAG---GCAGCTGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGAGATGAGGAGTAGTTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCAGCCGTTCCTCTGCGCCGTGCCCTCCACCTGCCCCGGCATGCCTG---GGCCTCGTGTCTCCTGCTGTGCTCGTGTCT--CTGC--------TTCAGTGTG------------------CTCTTCAGCCTTGTCTGCCCTGGCTCCTGCCCCTCTG-CACAAGAGGCCCTGGCACTCTGCGGGTGG-CACCCCT------------------------TGTCCAGCCAGGCCTCTGCCAGTCCAGGGCTCCCCCTGCT--GGGAAGTCTGCCAAAAGGCAGTGGTGTAGCCATAGGGCGCCCCCAGATGTCCTGCAGCCTGGGCTGGTGCTCCGGCCGGGATGCTGGGCCTGAGTTTGCAAAGGGCTGGGACTGCTT------CCCTTACTCC--------CGGGGCCCAT--GACTTGGCAGCACCAGGAGACTCCAGCCAATCCTGGCGGACAGCGGGTGGAGGGTAC-AGCTGGGGTGCCAGACCCTAGCCTGGGTGGGA-----GGGACATGTGCCGAGCCCCTCACTCTGCTCTGCA------CCCCTGTCCGCCTTGCTGTCCGTCTACCCCTTGCCTAGCC--CCA-----CCCTGCTGACCTTTTTCTCTT-TCT-G---TCCCTGCACCCTGGCTGCCTCATAGTTA-----------------------GGGACT-----------GAGAGCCGCGTGTGCCAGGTAATGGCCCGGCCCCCATGTG-----------CCC-----GCGTTGCCCCAGGCCCCACAGACC---TCGCATGTGGGCACAGGGCCTGGGCACCTTGC-CCG--TTCACAGCCCAGCCCCAATGGCAGCAGGGAGGGGGG-CACATCGAGTGTGCCATGCTATCTGTGTGC-AGATGGACAGGCCTGGCTGCTGA--AGGTCCTGGGGAGCCCTTAGACCCGTGG----------CAC-AGGGGGCTGCAGGGTCCATCTTTGACCTGGCTCAACTTTCCCCTCCTC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------T------------------------------------- 8 Heterocephalus_glaber-NW_004624818.1-191771_192004 79.1% 30.7% ----------------------------------------------------TCGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCTGGGCAGTCCCCAAGTGGCCCCCTGCCCGCCTGAGGGTGTCCACAG---GCAGCTGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGCTCAAAAGCTGGAGGAGATGAGGAGTAGTTCCCCCATGCTCTCCGCCGGTAAGGCCAGCCGCTCCTCCGCACTGCGTGCCCTGCACACCCCAGCATGCCTG---GGCCT-CCTGTCCCTGCTGTGCTCATGTCT--CTGC--------TTCAGTGTG-----------------CTCCCGCTGCCCTGCCTGCCCTGGCTCCTGCCCCTCTG-CACCAGAAGCCCCGGCCCTCTATGGGTGA-CACTAGGGGAATCGGTCCCACTCACTGTGCTGGACCCCTG------------------------------------------------GCCCAGTGGTGCAGCGATAGGGTGC-CCCCGATGTCCTGCGCCCTGATG--GTACTCGGGCCTGGACGCTGGGCCTCAGTTTGCGGAAGGCTGAGCTCGCTT------CCCTTGCCCT--------GGGCCCAC--------------------GACTCTGCCCCCACTCCG--CAGACAGTGAGCAGAGGGTGG-AGCTAGAGTGCCAGACCCCCGGCTGGGTGGGA-----GGGGCGTGCACCAAGCCCCTCACCCTGCTCTGCA------CCCTGGCCCGCCTCGCTGTCCGCCCACCCCTCTGCAAGCC--CCA-----CCCTGCTGACCTTGTTCTCCT-TTC-TGTCCCTGCACCCCGGGCTGCCTCCATAGTTA-----------------------GGGACT-----------GAGAGCAGCGCACGCCAGGTAACGCCCAGCCCCTGTGTGC-----------GCC-----GTGTTGCCCCGGGCCCCGGAGACC---CTGCGTGGGAGCACAGGGCACGGGCATCTTGC-CCA--TCCACA-CCCGGACCCAGCAGCAGCAGGGATGGGGG-CACCTGGTGTGAGCCATGTTAGCCGAGTGC-AAATGGGCAGGCCTGGCTGCTGG--GGACCCTGCGGGGCTCAGACTGGCGGAC----------GGG-GTGCAGGGCACCAT-----CACTGACCTGGCTCTCCTTCCCCGTCTCT-----------CCTCGGACC------------------------------------------------------------------CAATCT--------------------TCCCCTCCTTCC----GTCTCCCTGTCTTGTCCCCGCC 9 Marmota_flaviventris-NW_023144724.1-191280_191443 77.4% 30.7% ----------------------------------------------------TCGGACTCCAGCAGCCCGGACAGCCTGGGGAGCCCCAAGGTGGCCCCCTGCCAGCCTGAGGGTGCTCACAG---GCAGCCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAACTCCCCCATGTTCTCCGCGGGTAAGGCAGCTGCCCCCCCGCAGCCTGTGTTCGCACCCCG------------------GCATGCCTGGGCCAGTGTCCCTGCCTTG--CTGCCCCCTTGCTGTGCTCCTGCATCTCTGCTGGCTTGACCCGCAG-CCCCATCTGCCCCAGCCCTC--TCCCTTG-AGCAAGAGGCCCTGGCACTT------TGG-AGGGGTGGGGACCT---------GGGGAGTGGGAGTCACCAGTGGCCTTACTGAGAA----------CCTG--GAGATGCACGTGGAGGCTCCCTGGCTGAGCCCCACCCCCT-------------CCTGGGTCCA---GGCAGCT----TCCAGTCCTCACCTGACCGTCCTCCAGGACGAGGTTCAGA------GT--CACCCT--------GCCACAGACC--C---TCTTGGGTAACC------------TGTCAGTCAGG-----GTACAGCCATAGG-ACAGCA----------TCCAG--GTTGTCCCC-----A-----------------GGGACCCTGAATGATG------CTCAGAGCCTTGAAGTGGGGCCTC-------GGAGTT-----TGAAAGTGCAGAGGAGCAGGTCCCAT-----------------------------------------------------------------GTGTCCCTGGGGCCCTGGACCTGTGACTGTCAGATGGCATGGAGCCCTCCAGGTG--------CGCAGCCTTCAGGCAGACAGCTGCTGGCCTG-------------------------------------CC-CTGGCTCAGTTTGCTCAGCCCCAACCCAG-TGGGAGGGACG-TGCACCGAGCCTTCC----CC----TGCCACCATGCTCCTCCCTCACCTGCCAA--GCCTTGCTGTCCGTCTGTCCATCTGCCAG----------------------ACCCACCCCGTGCTGACCACGTTCTCCTTTCTGTCCCTGCACCCCGTG--CTGCCTCCGT----------AGTTAGGGACTGAGAGCTGCAGTGCCAGGTAACAGGCCCAGCCCCGTGTGCCCCTTGTTGCCCTGGCCCCAGAAGACCCGTTCCTGGCCTGCCAGCCAGACCCCTGTGGACTCTGCACA 10 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-191026_191669 85.7% 44.2% -----------------------------------------------CGTCCTCAGACTGTAGCAGCCCAGAGAGCCCGGGTGGCCCCCAGGGGGTCTGTCGCTGGCAGGAGGCCATTGGCAG---GCAGCCTGGGGCCCTGCAGGGAGAGCTGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATGAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACCGGTAAGACTAGCTGCCTGCCCGTGCCCCGTGCTGTCTTCCTGCACGC-----CT-CCAGCATGGCCTAGGCCTTGT--GCCACCTGCTGCTGC-TTCTGCGT-CACAGACCCGCCTGTGTGCTGT------------------------------GGCACCTATGTTGCTGTGCTCCACTGGCTTGTCCTGCGGCTGCAGCCCCAGCCCT--CCAGCCTGACCTGGGGCCCGGGG--A----CTTTGGGAGGG----A-----GGAG-----AT-GA-GC--TGAGCCGGTGAGCCA---TCCCAAGAG-GAAGCCATGCCTGCTCAGAACC---------------CCAGAGCTCCTGC------TAGGCTTCAGCC--------------AGGACCCTGAGATGGGG---CC---------ACC--------CAGCTGGGCCA--AGCCCACCTCCCTG-GTCGGTC-AGCTGCC-T--------GGGTGCCCCAGAGCCCTTCCTAGAACTGT-GGGCCA---------CTTCCCATCTCTACCCCTGCCTCCCTCCAGAGCCAGGCCCTGGGCTG--TCCCTCCTGGGCAGGT--GACATGGTCAGTGGTGCAGCCAC----AG--GG-CACCCCCAGCCCCCAAGACTCCTGGCTGGTGCT---------------CAGCC--TAGAAGTTGGGT-CC-------TTGCAGTTTGCAAA--GTGTTGAGCGGAGGCTCCC------TGTGCTCC-T---GGGGCTCTGTGTCTGGCTGACCCC---CACTGAGAAGCTCT----GCTTCGGCCCCGTGGGTCCCTCTGTAGCTCTAGCTC--GGGAGGGAGGGTGTAAGGGCTGTGCTGCCATCCCCGCCCCCATGCTGAC----CGAGTTCTC-CTTCTGTCCCTGCACTCATGCTG-CCTTCTAGTTAGGAACTGAGCACGCAAGT--GACAGGTAACG----GGGCAGCCCC-----------------------------------------------------------------AGCCCCGGGAGGCCCCCACCTGT-CC--ACTGTCCCAGCCCCCACATGG----------CAGGGGAGGGCGC----------CAAGC-------------------- 11 Cavia_porcellus-NT_176233.1-191327_191493 80.8% 32.1% ----------------------------------------------------TCGGACTCCAGCAGCCCAGGCAGCCCGGGCAGCCCCCAAGGGGCCCCCTGCCCACCTGAGGGTGCCCACAG---GCAGCTGGGGGCGCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGCTCAAAAGCTGGAGGAGATGAGGAGTAGTTCCCCCATGTTTTCCACGGGTAAGGCCAGCTGCTCCCCCGCACCGTGTCCTCTGCATATCCGG-CATGCCTG---GGCTGTGTGTCCCCCGCTCTGCTCGGCTC----TGC--------TTCCGTGTG-----------------CTCCTGCAGCCCTGTCTGCCCTGGTTCCTGCCCCTCTG-CCCAAGAAACCCCGGTACTCTGTGGGTGG-CATGAAGGGAGTTTATGTCACGCCCCTGCCTGACCCGGCCAAGCCTCCTCCGGGCCCAGAGCTCCCCCTGC--TGGAAGTATGCTGGAGGACGGTGGTGTAGCCAGAGGGCGCCCACAGATGTCCTGCATCCTGGGCTGGTGCTCTGGTCTGGCCGCGGCGCCTGAGTCTGCAAAGGGCTGAGACTGCTT------CCCCTGCTCT--------TGGGCCTGTG-ACTCTGAGCAGCTGTGGGAGGCCACAGCCAATCCTGGCAGACAGTGGGTGGAGGGTGG-AGCTGGGGCGCCAGACCCCAGCGTGGACAGGA-----GGGACATGTGCTGGGCCCCTCACTCTGCTCCGCA------CCCT-GCCCACCTCGCTGTGCGTCTGCCCCTAGCCCAGCC--CCA-----CCCGGCTGACCTTGTTCTCCT-TTC-TGTCCCTGCACCCCGGGCTGCCTTCGTAGTTA-----------------------GGGACT-----------GAGAGCCGCGAGTGCCAGGTAACAGCCCGGCCCTGTGTGC-----------CCC-----GTGTAGCCCCAGGCCCCAAAGACC---TTGTGAGTGGGCACAGAGCCCAGGCACCTTGT-CCG--TCTACGCCCCAGCCCCAATGGCGGCAGGGAGGGAGA-C--ACTGAATATACCATGTTAGCTGTGTGC-AAATGGATAGGCCTGGCTGCTGG--GGGTCGGGGGGCCCTTAGCCCGCTGT-------------GC-AGGGGCTGGAGGGTTCCCATTTTGACAT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 12 Elephantulus_edwardii-NW_006399795.1-190953_191179 82.4% 33.0% ---------------------------------------------------CTCAGACTCCAGCAGCCCGGATAGCCGTGGCAGCCCCGAGGAGGCCCCCCACTGGCGTGAGGGCACCCGCAG---GCCACCAGGGGCCCTGCAGCGGGAGCTGAATGCCCTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATTAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCAGCCGGTAAGGCTGGCCCTGCCTGGGCCCCCGTGTCCC--------CCCTGTCGGCAT---GGCCTGGCTCTG-TCCCTGC----TGCTGC--CTGACCCC-------GATCCTAGGCGTGCCATTGCTTTCGTTCC----GCTGTGCTCCATCAGCTTATCCCACCTG-CCCCCTCAGCCCTGGTCCTCCCTCCCGACCCTCC----TGT-TC-----TAACCACGGGGCCTGCTCCTCCTGGAGCCTGAGGGAGCGGGGTGGCCTGGATCCTGC---------------------CA-----GAGTGCACGTAGGTGAGGGCCAGGGAGCAGTGT--TTG--------CTGAGGCCACATGTGGCCCAGTGCATACCTAGCCCTCGTG------GTCGGGCCCGCATCCTAGGGGCCCATAGAAAACCAG--GGCTCAGATACTCCTGACACCTTTCCTGGAC--CTTGGTGGGCTCCCAC-CTCGTCCCCTTTTGAATCTCCAGCCCCTGGAA-----G--------------GCAAGGCTCCTGCCCTCAC------CCCAGCTGCTCACA---GATACTCCCCAGGTCTGAACTTG--TTACAGGCTAGTTCTGAGCCCCC-ACTCGAGGC-TTGCCGTTCTCCAGAGGTGCCCAGGGTGCTGAGGGATTCTATGT-----GGCTT-------------------------------------------------------------------------GA--GCCTGACACCTGCAGCTGTACCAAATGTGGCTGGCTCACAGAAGCGTCACGGTCATGATCACGGTCACAGGCTCTGAGAGCCAGCCTAGGGGCCAGGGAAG-CGTCGC----------CTTCCTTTCCTCTGAGCTCCCTGCCCTGCACTTGCCTA--GCCTCGCTGTCAGTCTGTTCATCTGTCAGC--------------CACCTGCCCCCTTCCTCCTCTGATGATCTTCTCCTTTCTGTCCCCA--CCCCGTG--CTGCCTCGTT----------AGTTAGGAACTGACGGCGGCCGAGCGCCAGGTAACAG---------------------------------------------------------------------------------- 13 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-206714_206977 86.3% 40.2% --------------------------------------------------------------CAGACTCGAGCACCCCGGGCAGCCCCGAGGGGGCCCCCCGCTGGCCCGAGGGCGCCCGCAG---GCAGGCGGGGGCCCTGCAGAGGGAGATGAATGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATTAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGACCAGATGCTCCTCCCTGGCATCCCCCCGGGTGTCCCCCACGCCGCCCCTCGGCATGGCCTGGGCCCGGCGTCCCTGCTGCCTGTGC-TTCCGTGTCCACAGCCATCGCCCCGTGTGCTCAT-------------------------CGTGCCTTCATTTCCCTTTGCTCCATCGGCTTGTCCCGCAGGCCCTGAAGCCCCAGC--CCCCCATCTGAGCACGACTGACCCCCCGGCCTCTTGCTCTC----T-----GAGG-----CC-CC-CCTGCACTCCCCAGGGGCC---AGAGAAGAG-AGAGCCGGTCTGGCTGCAGCCA---------------CCCTCACCCCACATAGGGAGTGAGTCCAACCAGTGGCCCCGAGGGCCAGGCCGTGCTTGCTGAGGCCCGCAG---CCCCAGGCATGGCCTCCTGGCCC--AGCCCCAGTGCCCG-TGCCGACCTCCTTCCCTGCCTGACCGGCTGCTCCCACACCCTTCGTAGGACCCAGGAGCAG---------CTTCCAGGCCCCCTCCCACCTCCCTCCAGGGCCAGGCTGCACCGCA---GTCCTCCA-GGAAGTCTGGTGTGGGTCGGTGGTTCACCGCA--GTGC--AG-CCTCTGGTGCCCTTGGGACTCCTGGATGGTGCT---------------CAGAG--CCTTGACGCTGGGGCCTCAGAGTTTGCAAAGTG-----GAGCAGACTGCATGTGCCC------CTTGGCCC-T---GGGAGGGCGTTGATGGCTGAATTG---CGCTGAGCAGCCCT----GCTCGGGAAGCCCCC------------------------------------------------------GCCTGGCCTGGTTGTGAC----AGGCAACTG---------------CTCAAGGCCACCTTGTCACGGGGAGCGGAGCCCAGCCTG--GGGAGGGAGGG----TGGGAGCTGA-----------------------------------------------------------------G------CCATCCTCCTCCCGCTGCC----TCCCTGCGCCCCACCAGCC----------TTGCT-------G----------TCAGTCTGTCCATCTGCCAGCC--- 14 Arvicola_amphibius-NC_052052.2-193074_193241 83.1% 32.8% 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15 Jaculus_jaculus-NC_059106.1-191124_191356 83.7% 33.0% 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20 Orycteropus_afer-NW_006921723.1-190841_191007 82.0% 34.4% 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22 Trichechus_manatus-NW_004444058.1-190885_191048 81.8% 33.1% 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23 Rattus_rattus-NC_046154.1-193076_193240 83.9% 33.0% 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24 Nannospalax_galili-NW_008355419.1-190981_191147 84.4% 34.2% 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25 Fukomys_damarensis-NW_022900935.1-193084_193298 78.5% 27.9% 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