Job

PLCH2_human-child_72

Submission Status: Success!

Full Status

1. Iteration

Blast

Select Sequences

Alignment

RNAcode

Input

CGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCGGGCATCCCCGAAAGGTCCCCCCGCTGGCCTGAGGGTGCCTGCAGGCAACCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAGTGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCGCCGGTAAGCCCCTCTTGCCCTGCGTGGTCCTCCCGCACGCCCCTGGCATGGCTGGGCCTGGGTCACCTGCTGCTGCTTCTGCGTGGACGGTGTCGCCTCGTGTGCTCGTGCTCGTGGCTCTGTATCCGTGGCACTGTCTCCGTGGCACTCTGCTCCCTTGGCTTGCCTGTGGCCCATAGCCCCAGCCCTCCTGTCTGAGCTTGAGGCCCTGGGACTTGGGTGGAGCTGGTTTGAGGCCCGACAGGCTGGGAAGAACCAGCTGCTCTTGCTGAGGGTCTGGGGCCGGGACTGTGGCCTGACATGCTGGGCCCCTCCGGCTGGGCGCTTCCCCAAACTCACCTCCTGGGCGGCTGGCGACCTGCATGGCCCCTGATGCCTTTCCTGGGACTGGGGGCCACGTACCATCCCATTCCCACCTCCCTCTAGGGCAGGCTCCAGGGGTCCCTACTGGGAAGTCTGATGTGGGCAGGTAGTGCAGCTGCTGGGCGTCTCCTGCGCCCCTGGGACGCCTGGAGCCTGCTGAGTGCTGCGTGGAGTAGATTCCCTGGGCCCCAGGGCTTCGCTGCTTTGGGCTGAAGCACCCCACTAGAAGGGTGTCTCCTTAGCCTGGAGGGAGGGACATACACGGAGCCCGCCCCACACCACCCTGCCCCTCCAGACCCCCCTGACCAAGCTTTCCTTTCTGCCCCCACCCACGCTGCCTCCGTAGTTAGGAACTGAGAGCGGCGAGTGACAGGTAACGGGGCCCAGCCCCGGTGTCCCGTGCTGTCCCAGCCCAAGGAGGGCCCCGTGTGCGGCACAGGGCGTGGACTGGGCCCCAGCAGCAGCAGGGTGGGGACACCGA

Selection Arguments

Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.

Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.

Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.

Results

Coding Regions.

High Scoring Segment plot

Distribution of HSS in the input sequence

HSS Segment Plot

Filter regions

p-val
Select the result by p-value. Show only results which have a lower p-value than provided. Must be above 0 and below 0.05. Check the box if you wish to see only the best segment in a group of multiple overlaping segments. Often a strong conservation signal can be observed as a shadow on the opposite strand.

Result Table

HSS id Strand Frame Length Start End Score P Show Result
1 0 + 1 37 35553 35663 14.931 0.014 Plot
2 1 + 2 12 35530 35565 13.427 0.034 Plot

Predicted protein sequence Download sequences as fasta

HSS id Sequence
1 0 PEGACRQPGALQGEMSALFAQKLEEIRSKSPMFSAGK
2 1 SPKGPPAGLRVP

Alignment Info

Alignment Tree

Alignment Tree

Full Alignment

Reference sequence (1): Target
Identities normalised by aligned length.
Colored by: consensus/70%
                                                          cov    pid  1 [        .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         .         .         .         4         .         .         .         .         :         .         .         .         .         5         .         .         .         .         :         .         .         .         .         6         .         .         .         .         :         .         .         .         .         7         .         .         .         .         :         .         .         .         .         8         .         .         .         .         :         .         .         .         .         9         .         .         .         .         :         .         .         .         .         0         .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         .     ] 1376
 1 Target                                              100.0% 100.0%    -----------------------------------------------------CGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCGGGCATCCCCGAAAGGTCCCCCCGCTGGCCTGAGGGTGCCTGCAG---GCAACCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAGTGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCGCCGGTAAGCCCCT----CTTGCCCTGCGTGGTCCTCCCGCACGCCCCTGGCATGGC------TGGGCCTGG---------GTCACCTGCTGCTGC-TTCTGCGTGGACGG-TGTCGCCTCGTGTGCTCGTGCTCGTG--GCTCTGTATCCGTGGCACTGTCTCCGTGGCACTCTGCTCCCTTGGCTTGCCTGTGGCCCATAGCCCCAGCCCT--CCTGTCTGAGCTTGAGGCCC-----TGGGACTTGGGTGGAG----C-----TGGT-----TT-GA-GGCCCGACAGGCTGGGAAGAACCAGCTG-----------CTCTTGCTGAGGGTC---------------TGGGGCCGGGACT------GTGGC---------------------------CTGACATGCTGGGCCC----------CTCCGGCTGGGCGCTTCCCCA--AAC-TCACCTCCTG-GGCGGCTGGCGACCT-G-------CATGGCCCCTGATGCCTTTCCTGGGACTGG-GGGCCA---------CGTACCATCCCATTCCCACCTCC-CTCTAGGGCAGGCTCCAGGGG----TCCCTACTGGGAAGTCTGATGTGGGCAGGTAGTGCAGCTGCTG--GG--CG-TCTCCTGCGCCCCTGGGACGCCTGGAGCCTGCTGAGTG---CTG--CGTGGAG--TAGATTCCCTGGGCCCCAGGGCTTCGCTGCTTT-----GGGCTGAAGCACCCCACTA------GAAGGGTG-T---CTCCTTAGCCTGGAGGGAGGGACA---TACACGGA--GCCC----GCCCCACACCAC-----------------CCTGCC----------------------------------CCTCCAGACCCCCCTGAC----CAAGCTTTCCTTTCTGCCCC--CACCCACGCTGCCTCCGTAGTTAGGAACTGAGAGCGGCGAG-TGACAGGTAACG----GGGCCCAGCCCCGGTGTCCCGTGCTGTCCCAGCCCAAGGAG----GGCCCCGTGTGCGGCACAGGGCGTGGACTGGGCCCCAGCAGCAGCAGGGTGGGGAC--ACCGA--------------------------------------------------------------------------     
 2 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-207539_208498     94.4%  72.1%    ----------------------------------GGTAGCGGCTCCATATCCTCGGACGCCAGCAGCCCAGACAGCCCGGGCAGCCCCGAAGTGGGGGCCCGCTGGCCCGAGGGCGCCTGCAG---GCAGCCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAGTGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGATATCAGGAGTGAATCCCCCATGCTCTCCGCCGGTAAGCCCCGCCCTCCCGCCCTGCGCAGTCCTCCTGCACGCCCCTGGCATGGC------TGGACCGGG---------GTCACCTGCTGCTGC-TTCTGTGTGGACAG-CGTCGCCCCGTGTGCTC----------------------GTGGCTCTGTCTCCGTGGCACTCCGCTCCCTTGGCTTGCCTGTGGCCTGTAGCCCCAGCCCT--CCTGTGTGACCTTGAGGCCC-----TGGGACTCGGGTGGAG----C-----TGGT-----TT-GT-GGCCTGACGGGCTGGGCTGGGGCTCTCGGCA-GGAGCTGCTCCCGCTG-AGGCC---------------CTGGGCCCGGAGT------GTGGC---------------------------CTGGCGTGCTGGGCCC----------CTCCTGCTGGGCGCTTCCCTA--AAC-TCGCCT-CCC-AGGTGGCGACCAGCA-T-------GGCCCCTGACGCCCCCCTCCCCGGGACTGG-GGTCCA---------CTTCCCATCCCGTTCCTGCCTCC--CCCAGGGCAGGCTCCAGGGG----TCCCTACCGGGAAGCCTGAGGTGGTGTAGCCGCAGGGTGCCTT--GT------------------------------GTGCCAGGGACGC---CTG--CGTGGAG--GGGACTCCCTGGGC-CCCAGGTCTTCTTGCTTT-----GGGCTGAGGCGTCCCACTG------TGAGGGCA-T---CACCATAGCCCGGAGGGAGGGACA---GACAGGGA--GCCT----GCCCTGCCCTCCCCAC-----------CCCGTCCC----------------------------------TCCAG---CCCCCCTGAC----CGAGCTTTCCTTTCTGCCCC--CACCCACGCTGCCTCCATAGTTAGGAACTGAGCGCGCGAGC--GACAGGTAACG----GGGCCCAGCCCCCG-TGTCCCTGCTGTCCCAGTCCCAGGAG----GGCCCCATGTGTGGCACAGGGTGTGGACTGCGCCGGAGTAGCAGCAGGGTGGGGGC--AGAGTGCCAGGGGATGCCTCA----------GG----------------------------------------------     
 3 Cebus_imitator-NW_016107460.1-202964_203857          88.2%  64.2%    CAAGGGTCCTGGGGCCTGGGGGCAGGGTCCAGGAGGTAGCGGCTCCATGTCCTCCGACGCCAGCAGCCCAGACAGCCCGGGCAGCCCCGAAGTGGGGGCCCACTGGCCCGAGGGCACCTGCAG---GCAGCCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAGTGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGCTATCAGGAGAAAATCCCCCATGTTCTCCGCCGGTAAGCCC-GCCCTCCTGCCCTGCGCGGTCCTTCCGCACGCCCCTGGCATGGC------TGGACCTGG---------GTCACCTGCTGCTGC-TTCTGTGTGGACAG-CGTCGCCCCGTGTGCTC----------------------GTGGCTCTGTCTCCGTGGCACTCTGCTCCCTTGGCTTGCCTGTGGCCTGTAGCCCCAGCCCT--CCTGTGTGACCTTGAGGCCC-----TGGGACTCGGGTGGAG----C-----TGGT-----TC-GC-GGCCCAACGGGCTGGGCCCTCCCGCTGGGCG-C-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTCCCCA--AAC-TTGCCTCCCG-GGCTGGCGACCGGCA-T-------GGCCCCT---GATGCCCCTCCTGGGACTCG-GGGCCA---------CTTCCCATCCTGTTCCTGCCTCC--CCCAGGGCAGGCTCCAGGGG----TCCCTACCGGGTAGCCTGATGTGGTGCAGTCGCAGGGCGCCTT--GT------------------------------GTGCCCAGGATGC---CTT--CGTGGAG--GGGACTCCCTGGGC-CCTGAGTCTTGTTGCTTT-----GGGCTGAGACGTCCCACTG------TGAGGACA-T---CGCCATAGCCTGGAGGGAGGGACA---GACAGGGA--GCCT----GCCCTGCCCTCCCCAC-----------CCCGCCCC----------------------------------TCCAGCCAGCCCCCTGAC----AGAGCTTTCCTTTCTGCCCC--CACCCACGCTGCCTCCGTAGTTAGGAACTGAGAGCACGAGC--GACAGGTAACG----GGGCCCAGCCCCCG-TATCCCTGCTGTCCCAGTCCCAGGAG----GGCCCTGTGTGTGGCACAGGGCGTGGACTGTGCCGTGCCAGCAGCAGGGTGGGGGC--ACAGAGTGTGCCGGGGATGCC----------TCAGGGTGGGGGCC----GGGCACTGGGGACTCCACCCTG--------     
 4 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-193117_194054   84.3%  44.4%    --------------------------------------------------------------------CCGAGAGCCCGGGCAGCCCCCAGGGGGTCTGCGGCC---GGCAGGAGGCCGGCAG---GCAGCCAGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTGCAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCTATGTTCTCCACCGGTAAGACCAGCCGCCCGCCCGCCCATGCTGTCCT------CCCGCA-----GC-CGTGCATGGCCTGGGCCTCGC--GCCACCTGCTGCTGC-TTCCGCGT-CACGGACGCCACCGTGTGTGCTCGT-------------------------GGTGCCTCTGTGCTGCTCTGCTCCGCTGGCTTGTCCTGAGGCTGCCGGCCCCAGCCC--TCCTGCCTGCCTGACCCCGGGCC--CCAGTCTCTGGGAGGG----T-----GGGG-----AC-AGGTTTGAGCCACAGTGTGCCA---TGCCGAGAG-CCGGCCACACTTGCGGAGGGCC---------------CAGGGCCCCAAGT------GTGGCCTTGTGAACTAGCCCCTCCCACCAGGCTTCAGCTGGGA---GC---------CCCGAGAA--AGGGCTGAGCCC--CAACCCGCCTCCCC-AGTCTAC-TGCTGCC-T--------GGGGGCCCTGGTGCCCTTCCTGGGACTGG-GGGCCG---------CTTCCTGCCCCCACCCCACCTCCCTCCAGGGCCAGGCTGCAGGGGTG--TCCCTCCCGGGGAGGCCGGCCTGGCTCGGTGGTGTAGCCGC----GG--GG-CGCCTCCATCCCCCGAGACTCCGAAT-GGTGCT---------------CAGAG--TTCGCAAGTG-------------------CTGAGGG--GCGCAGATGCCCCGTGCCT------CTGGGGCC-C---TGAGACCCGTGTCTGGCTAAACCC---CACTGAGCACCTCT----GCTGCGGCCCAGGAGGGAGGGGTGTGCACCGAGCTG--CGCTGTGC-------------GCCGGTCTGTCCCGGCCCCTGTGCTGAC----CGAGTTCTCCTTTCTGTCCCTGCACTCACGCTGCCTCCATAGTTAGGAACTGAGCGCGCAAGT--GACAGGTAACG----GGGCAGCCCC-----------------------------------------------------------------AGCCCCGGGAGGACCCTGGCCCATCC--ACTGCCCCAGCCCCCACAGCA----------GCAGGGCGGGGGCG--------CCAAGTGTGCCCGTCGGATGTG----     
 5 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-208820_209191        83.7%  34.1%    ----------------------------------------------------TCGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCGGGAAGCCCCAAGGTGGCCACCCACTGGCCCGAGGGCACCCACAGGCAGCAGCCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGTTCAAAAACTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGACCAGCGGCTCTTCCCAGTGTCCTGTGATGTCTTCCTGCATGGCCTCT---GGCATGGCCTGGGCCTAGTGTCACCTGCTG--CTGC--------TTCCATGTCACAGAACCATTGCCTTGGTGTGCTCGTGGCATCTCCATTGTATTTTGCTCCATTG----------GCTTGTCCTGCGGCCCCTTC-CGCCCTGGCCCTGC---------CATCTGATCACGAGGCCCTGGGACTCCGGGAGGG----------TGTG---------CTGTAGCG-GAGTGTGGTCTCAGCACGTGCTGGGCACTTCGTGCTTTCTCAAGTCC---GGGAGACTCGCCATGTGAAGCCCCCTCCTGCCAGGTCTCAGCAAGGTGCTC------CC-----TGA--------GAAATGACC---CCTCCCTCCTCAATCGCTGAGCCCACGCCAACCTTCCCGGTCGGTGCCTGCCCCAGT-CGCCCCTGATGTCCTCTCCGC--TCCC-CGCC-----T-----------------CCCATGCTTCTAGAGA------CTCCTAGTGCGCTCAGA----------GTTTACAGACTGC--TGATGGAGCACAGTCCATG------TGCT-CTGGGGGCCCGGGTTCAC-------------------------------------------TAAAGCCTGGGCTGGCCGAGCAGCTCA-------GCTCCAGGAGCCTCCAGGAGC----CCCCAGGGCCGTGGCGCCAGACACGTGCTGGCTGGTACT---T----AGCAGGAAA----GCAGGA------GA-GCTGAGCTGGCTCCTGAACTCCAGCCTGGGAGGGAGGGATG-TTCCCTGAGCCTGTACCCGGCCACCCTATG----CTCCCCAGCGTACCTGCCCA--GTCTCACTGTC-----------------------ATCTGTC-TGCCCACTGCCCCGCCCCACTCTGACCGCATTCTCCTTTCTGTCCCCGCACCCCATG--CTGCCTCCGT----------AGTTAGGAACTGAGAGCAGCCTTGCCAGGTAACGGGGCCC-------------------------------------------------------------------------------     
 6 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-259874_260102  83.0%  37.9%    -----------------------------------------------------------CCAGCAGCCCGGACAGCCCGGGCAGCCCCAAGGCGGCCCCACTCTGGTCCGAGGGCTCCGGCAG---GCAGCCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGCTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACCGGTAAGACCAGTGGCTCCTCCCGTGTCCCCTGTGGCGTCCTCCTGCA--CGGCCCCTGGCATGGCCCGGGCCTCAT--GCTGCCCGCG-CTGC-TTCCCCATCGCAGACCGTGGCCCAGTGTGCTCCT-------------------------GGCATCTCCATGTGATTGTGCTCCGCTGGCTTGTCCTGGGGGTCCCCTGCCTGACCT--TGAGGTCCTGGGATTTTGAA-----------AGGGGTGGGG----A-----CTGA-----GA-GAGTCCGAGTCATAATACAGCA---AACCGAGA--GTGGCCAGGATTGCTGGGAGCC---------------TGGAGCTGCAAGT------GTGGCCTCAGCAAGGTGCTCCCCAGGAAAGGGCTCC--------------------------------CCGCTGAGCCC--AAACCTACTTCTCT-GGCTGACCGGTTGCCCG--------GACTTCCCCTGACACCGTCCTGGGACTAG-GGGCAG---------TGCTCACCCCCGACCCC-------TGCCAGGGCCAGGCCCTGCACTGCATTCCTCCTGGGAAGTC--ACATTGGTCAG-GGTGCGGCTGTAGGGAA--GC-CTCGTGGTGCCCTGGAGACTCCTGGATGGAGCT---------------CAGAA--GCTTGCAGTCGGGGCCTCAGGGCTGCTGGGTGCAGT--GTGGAGCGCGGTCCGTGTG------CACGTGGC-C---TGGGGTTCACTCCTGGCCTGGCCT---GCGCTGGCAGCTCT----GCCCTGCACTCTGGGGTGGC-GGGCACACACAGTTGCTCGCTGGCACCTCGTCAGC--------------GGGGCACAGGCAGGGCC----CAAGGGGTGCTTTGGACCCCTGCCTGGGCGGGAGGA------GTGTGCCCTGAGCCTGTCCCC------------------------CGC-----------------------------------------------------------------TGCTGTGCTCCCACCCTGCCTTGCCT--TGTCCTGCTGTCCATCCAGCG----------TCCGTCCAGCCGCCCACCCTGCCCCAACCTGACCATATTCTCCTTTTC     
 7 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-191712_191946     80.9%  30.5%    -----------------------------------------------------CGGACTCCAGCAGCCCAGGCAGCCCAGGCAGCTCCCAAGTGGTCCCCTGCCCGCCTGAGGGTGCCCACAG---GCAGCTGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGAGATGAGGAGTAGTTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCAGCCGTTCCTCTGCGCCGTGCCCTCCACCTGCCCCGGCATGCCTG---GGCCTCGTGTCTCCTGCTGTGCTCGTGTCT--CTGC--------TTCAGTGTG------------------CTCTTCAGCCTTGTCTGCCCTGGCTCCTGCCCCTCTG-CACAAGAGGCCCTGGCACTCTGCGGGTGG-CACCCCT------------------------TGTCCAGCCAGGCCTCTGCCAGTCCAGGGCTCCCCCTGCT--GGGAAGTCTGCCAAAAGGCAGTGGTGTAGCCATAGGGCGCCCCCAGATGTCCTGCAGCCTGGGCTGGTGCTCCGGCCGGGATGCTGGGCCTGAGTTTGCAAAGGGCTGGGACTGCTT------CCCTTACTCC--------CGGGGCCCAT--GACTTGGCAGCACCAGGAGACTCCAGCCAATCCTGGCGGACAGCGGGTGGAGGGTAC-AGCTGGGGTGCCAGACCCTAGCCTGGGTGGGA-----GGGACATGTGCCGAGCCCCTCACTCTGCTCTGCA------CCCCTGTCCGCCTTGCTGTCCGTCTACCCCTTGCCTAGCC--CCA-----CCCTGCTGACCTTTTTCTCTT-TCT-G---TCCCTGCACCCTGGCTGCCTCATAGTTA-----------------------GGGACT-----------GAGAGCCGCGTGTGCCAGGTAATGGCCCGGCCCCCATGTG-----------CCC-----GCGTTGCCCCAGGCCCCACAGACC---TCGCATGTGGGCACAGGGCCTGGGCACCTTGC-CCG--TTCACAGCCCAGCCCCAATGGCAGCAGGGAGGGGGG-CACATCGAGTGTGCCATGCTATCTGTGTGC-AGATGGACAGGCCTGGCTGCTGA--AGGTCCTGGGGAGCCCTTAGACCCGTGG----------CAC-AGGGGGCTGCAGGGTCCATCTTTGACCTGGCTCAACTTTCCCCTCCTC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------T-------------------------------------     
 8 Heterocephalus_glaber-NW_004624818.1-191771_192004   79.1%  30.7%    ----------------------------------------------------TCGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCTGGGCAGTCCCCAAGTGGCCCCCTGCCCGCCTGAGGGTGTCCACAG---GCAGCTGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGCTCAAAAGCTGGAGGAGATGAGGAGTAGTTCCCCCATGCTCTCCGCCGGTAAGGCCAGCCGCTCCTCCGCACTGCGTGCCCTGCACACCCCAGCATGCCTG---GGCCT-CCTGTCCCTGCTGTGCTCATGTCT--CTGC--------TTCAGTGTG-----------------CTCCCGCTGCCCTGCCTGCCCTGGCTCCTGCCCCTCTG-CACCAGAAGCCCCGGCCCTCTATGGGTGA-CACTAGGGGAATCGGTCCCACTCACTGTGCTGGACCCCTG------------------------------------------------GCCCAGTGGTGCAGCGATAGGGTGC-CCCCGATGTCCTGCGCCCTGATG--GTACTCGGGCCTGGACGCTGGGCCTCAGTTTGCGGAAGGCTGAGCTCGCTT------CCCTTGCCCT--------GGGCCCAC--------------------GACTCTGCCCCCACTCCG--CAGACAGTGAGCAGAGGGTGG-AGCTAGAGTGCCAGACCCCCGGCTGGGTGGGA-----GGGGCGTGCACCAAGCCCCTCACCCTGCTCTGCA------CCCTGGCCCGCCTCGCTGTCCGCCCACCCCTCTGCAAGCC--CCA-----CCCTGCTGACCTTGTTCTCCT-TTC-TGTCCCTGCACCCCGGGCTGCCTCCATAGTTA-----------------------GGGACT-----------GAGAGCAGCGCACGCCAGGTAACGCCCAGCCCCTGTGTGC-----------GCC-----GTGTTGCCCCGGGCCCCGGAGACC---CTGCGTGGGAGCACAGGGCACGGGCATCTTGC-CCA--TCCACA-CCCGGACCCAGCAGCAGCAGGGATGGGGG-CACCTGGTGTGAGCCATGTTAGCCGAGTGC-AAATGGGCAGGCCTGGCTGCTGG--GGACCCTGCGGGGCTCAGACTGGCGGAC----------GGG-GTGCAGGGCACCAT-----CACTGACCTGGCTCTCCTTCCCCGTCTCT-----------CCTCGGACC------------------------------------------------------------------CAATCT--------------------TCCCCTCCTTCC----GTCTCCCTGTCTTGTCCCCGCC     
 9 Marmota_flaviventris-NW_023144724.1-191280_191443    77.4%  30.7%    ----------------------------------------------------TCGGACTCCAGCAGCCCGGACAGCCTGGGGAGCCCCAAGGTGGCCCCCTGCCAGCCTGAGGGTGCTCACAG---GCAGCCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAACTCCCCCATGTTCTCCGCGGGTAAGGCAGCTGCCCCCCCGCAGCCTGTGTTCGCACCCCG------------------GCATGCCTGGGCCAGTGTCCCTGCCTTG--CTGCCCCCTTGCTGTGCTCCTGCATCTCTGCTGGCTTGACCCGCAG-CCCCATCTGCCCCAGCCCTC--TCCCTTG-AGCAAGAGGCCCTGGCACTT------TGG-AGGGGTGGGGACCT---------GGGGAGTGGGAGTCACCAGTGGCCTTACTGAGAA----------CCTG--GAGATGCACGTGGAGGCTCCCTGGCTGAGCCCCACCCCCT-------------CCTGGGTCCA---GGCAGCT----TCCAGTCCTCACCTGACCGTCCTCCAGGACGAGGTTCAGA------GT--CACCCT--------GCCACAGACC--C---TCTTGGGTAACC------------TGTCAGTCAGG-----GTACAGCCATAGG-ACAGCA----------TCCAG--GTTGTCCCC-----A-----------------GGGACCCTGAATGATG------CTCAGAGCCTTGAAGTGGGGCCTC-------GGAGTT-----TGAAAGTGCAGAGGAGCAGGTCCCAT-----------------------------------------------------------------GTGTCCCTGGGGCCCTGGACCTGTGACTGTCAGATGGCATGGAGCCCTCCAGGTG--------CGCAGCCTTCAGGCAGACAGCTGCTGGCCTG-------------------------------------CC-CTGGCTCAGTTTGCTCAGCCCCAACCCAG-TGGGAGGGACG-TGCACCGAGCCTTCC----CC----TGCCACCATGCTCCTCCCTCACCTGCCAA--GCCTTGCTGTCCGTCTGTCCATCTGCCAG----------------------ACCCACCCCGTGCTGACCACGTTCTCCTTTCTGTCCCTGCACCCCGTG--CTGCCTCCGT----------AGTTAGGGACTGAGAGCTGCAGTGCCAGGTAACAGGCCCAGCCCCGTGTGCCCCTTGTTGCCCTGGCCCCAGAAGACCCGTTCCTGGCCTGCCAGCCAGACCCCTGTGGACTCTGCACA     
10 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-191026_191669      85.7%  44.2%    -----------------------------------------------CGTCCTCAGACTGTAGCAGCCCAGAGAGCCCGGGTGGCCCCCAGGGGGTCTGTCGCTGGCAGGAGGCCATTGGCAG---GCAGCCTGGGGCCCTGCAGGGAGAGCTGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATGAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACCGGTAAGACTAGCTGCCTGCCCGTGCCCCGTGCTGTCTTCCTGCACGC-----CT-CCAGCATGGCCTAGGCCTTGT--GCCACCTGCTGCTGC-TTCTGCGT-CACAGACCCGCCTGTGTGCTGT------------------------------GGCACCTATGTTGCTGTGCTCCACTGGCTTGTCCTGCGGCTGCAGCCCCAGCCCT--CCAGCCTGACCTGGGGCCCGGGG--A----CTTTGGGAGGG----A-----GGAG-----AT-GA-GC--TGAGCCGGTGAGCCA---TCCCAAGAG-GAAGCCATGCCTGCTCAGAACC---------------CCAGAGCTCCTGC------TAGGCTTCAGCC--------------AGGACCCTGAGATGGGG---CC---------ACC--------CAGCTGGGCCA--AGCCCACCTCCCTG-GTCGGTC-AGCTGCC-T--------GGGTGCCCCAGAGCCCTTCCTAGAACTGT-GGGCCA---------CTTCCCATCTCTACCCCTGCCTCCCTCCAGAGCCAGGCCCTGGGCTG--TCCCTCCTGGGCAGGT--GACATGGTCAGTGGTGCAGCCAC----AG--GG-CACCCCCAGCCCCCAAGACTCCTGGCTGGTGCT---------------CAGCC--TAGAAGTTGGGT-CC-------TTGCAGTTTGCAAA--GTGTTGAGCGGAGGCTCCC------TGTGCTCC-T---GGGGCTCTGTGTCTGGCTGACCCC---CACTGAGAAGCTCT----GCTTCGGCCCCGTGGGTCCCTCTGTAGCTCTAGCTC--GGGAGGGAGGGTGTAAGGGCTGTGCTGCCATCCCCGCCCCCATGCTGAC----CGAGTTCTC-CTTCTGTCCCTGCACTCATGCTG-CCTTCTAGTTAGGAACTGAGCACGCAAGT--GACAGGTAACG----GGGCAGCCCC-----------------------------------------------------------------AGCCCCGGGAGGCCCCCACCTGT-CC--ACTGTCCCAGCCCCCACATGG----------CAGGGGAGGGCGC----------CAAGC--------------------     
11 Cavia_porcellus-NT_176233.1-191327_191493            80.8%  32.1%    ----------------------------------------------------TCGGACTCCAGCAGCCCAGGCAGCCCGGGCAGCCCCCAAGGGGCCCCCTGCCCACCTGAGGGTGCCCACAG---GCAGCTGGGGGCGCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGCTCAAAAGCTGGAGGAGATGAGGAGTAGTTCCCCCATGTTTTCCACGGGTAAGGCCAGCTGCTCCCCCGCACCGTGTCCTCTGCATATCCGG-CATGCCTG---GGCTGTGTGTCCCCCGCTCTGCTCGGCTC----TGC--------TTCCGTGTG-----------------CTCCTGCAGCCCTGTCTGCCCTGGTTCCTGCCCCTCTG-CCCAAGAAACCCCGGTACTCTGTGGGTGG-CATGAAGGGAGTTTATGTCACGCCCCTGCCTGACCCGGCCAAGCCTCCTCCGGGCCCAGAGCTCCCCCTGC--TGGAAGTATGCTGGAGGACGGTGGTGTAGCCAGAGGGCGCCCACAGATGTCCTGCATCCTGGGCTGGTGCTCTGGTCTGGCCGCGGCGCCTGAGTCTGCAAAGGGCTGAGACTGCTT------CCCCTGCTCT--------TGGGCCTGTG-ACTCTGAGCAGCTGTGGGAGGCCACAGCCAATCCTGGCAGACAGTGGGTGGAGGGTGG-AGCTGGGGCGCCAGACCCCAGCGTGGACAGGA-----GGGACATGTGCTGGGCCCCTCACTCTGCTCCGCA------CCCT-GCCCACCTCGCTGTGCGTCTGCCCCTAGCCCAGCC--CCA-----CCCGGCTGACCTTGTTCTCCT-TTC-TGTCCCTGCACCCCGGGCTGCCTTCGTAGTTA-----------------------GGGACT-----------GAGAGCCGCGAGTGCCAGGTAACAGCCCGGCCCTGTGTGC-----------CCC-----GTGTAGCCCCAGGCCCCAAAGACC---TTGTGAGTGGGCACAGAGCCCAGGCACCTTGT-CCG--TCTACGCCCCAGCCCCAATGGCGGCAGGGAGGGAGA-C--ACTGAATATACCATGTTAGCTGTGTGC-AAATGGATAGGCCTGGCTGCTGG--GGGTCGGGGGGCCCTTAGCCCGCTGT-------------GC-AGGGGCTGGAGGGTTCCCATTTTGACAT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
12 Elephantulus_edwardii-NW_006399795.1-190953_191179   82.4%  33.0%    ---------------------------------------------------CTCAGACTCCAGCAGCCCGGATAGCCGTGGCAGCCCCGAGGAGGCCCCCCACTGGCGTGAGGGCACCCGCAG---GCCACCAGGGGCCCTGCAGCGGGAGCTGAATGCCCTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATTAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCAGCCGGTAAGGCTGGCCCTGCCTGGGCCCCCGTGTCCC--------CCCTGTCGGCAT---GGCCTGGCTCTG-TCCCTGC----TGCTGC--CTGACCCC-------GATCCTAGGCGTGCCATTGCTTTCGTTCC----GCTGTGCTCCATCAGCTTATCCCACCTG-CCCCCTCAGCCCTGGTCCTCCCTCCCGACCCTCC----TGT-TC-----TAACCACGGGGCCTGCTCCTCCTGGAGCCTGAGGGAGCGGGGTGGCCTGGATCCTGC---------------------CA-----GAGTGCACGTAGGTGAGGGCCAGGGAGCAGTGT--TTG--------CTGAGGCCACATGTGGCCCAGTGCATACCTAGCCCTCGTG------GTCGGGCCCGCATCCTAGGGGCCCATAGAAAACCAG--GGCTCAGATACTCCTGACACCTTTCCTGGAC--CTTGGTGGGCTCCCAC-CTCGTCCCCTTTTGAATCTCCAGCCCCTGGAA-----G--------------GCAAGGCTCCTGCCCTCAC------CCCAGCTGCTCACA---GATACTCCCCAGGTCTGAACTTG--TTACAGGCTAGTTCTGAGCCCCC-ACTCGAGGC-TTGCCGTTCTCCAGAGGTGCCCAGGGTGCTGAGGGATTCTATGT-----GGCTT-------------------------------------------------------------------------GA--GCCTGACACCTGCAGCTGTACCAAATGTGGCTGGCTCACAGAAGCGTCACGGTCATGATCACGGTCACAGGCTCTGAGAGCCAGCCTAGGGGCCAGGGAAG-CGTCGC----------CTTCCTTTCCTCTGAGCTCCCTGCCCTGCACTTGCCTA--GCCTCGCTGTCAGTCTGTTCATCTGTCAGC--------------CACCTGCCCCCTTCCTCCTCTGATGATCTTCTCCTTTCTGTCCCCA--CCCCGTG--CTGCCTCGTT----------AGTTAGGAACTGACGGCGGCCGAGCGCCAGGTAACAG----------------------------------------------------------------------------------     
13 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-206714_206977     86.3%  40.2%    --------------------------------------------------------------CAGACTCGAGCACCCCGGGCAGCCCCGAGGGGGCCCCCCGCTGGCCCGAGGGCGCCCGCAG---GCAGGCGGGGGCCCTGCAGAGGGAGATGAATGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATTAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGACCAGATGCTCCTCCCTGGCATCCCCCCGGGTGTCCCCCACGCCGCCCCTCGGCATGGCCTGGGCCCGGCGTCCCTGCTGCCTGTGC-TTCCGTGTCCACAGCCATCGCCCCGTGTGCTCAT-------------------------CGTGCCTTCATTTCCCTTTGCTCCATCGGCTTGTCCCGCAGGCCCTGAAGCCCCAGC--CCCCCATCTGAGCACGACTGACCCCCCGGCCTCTTGCTCTC----T-----GAGG-----CC-CC-CCTGCACTCCCCAGGGGCC---AGAGAAGAG-AGAGCCGGTCTGGCTGCAGCCA---------------CCCTCACCCCACATAGGGAGTGAGTCCAACCAGTGGCCCCGAGGGCCAGGCCGTGCTTGCTGAGGCCCGCAG---CCCCAGGCATGGCCTCCTGGCCC--AGCCCCAGTGCCCG-TGCCGACCTCCTTCCCTGCCTGACCGGCTGCTCCCACACCCTTCGTAGGACCCAGGAGCAG---------CTTCCAGGCCCCCTCCCACCTCCCTCCAGGGCCAGGCTGCACCGCA---GTCCTCCA-GGAAGTCTGGTGTGGGTCGGTGGTTCACCGCA--GTGC--AG-CCTCTGGTGCCCTTGGGACTCCTGGATGGTGCT---------------CAGAG--CCTTGACGCTGGGGCCTCAGAGTTTGCAAAGTG-----GAGCAGACTGCATGTGCCC------CTTGGCCC-T---GGGAGGGCGTTGATGGCTGAATTG---CGCTGAGCAGCCCT----GCTCGGGAAGCCCCC------------------------------------------------------GCCTGGCCTGGTTGTGAC----AGGCAACTG---------------CTCAAGGCCACCTTGTCACGGGGAGCGGAGCCCAGCCTG--GGGAGGGAGGG----TGGGAGCTGA-----------------------------------------------------------------G------CCATCCTCCTCCCGCTGCC----TCCCTGCGCCCCACCAGCC----------TTGCT-------G----------TCAGTCTGTCCATCTGCCAGCC---     
14 Arvicola_amphibius-NC_052052.2-193074_193241         83.1%  32.8%    ----------------------------------------------------TCGGACTCCAGCAGCCCAGGCAGCCCGGGCAGCCCCAAGGTGGCCCCCTGCCAGCCAGAGGGTGCCTACAG---GCAGCAGGGGCCACTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTCATTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCCGCCATTCCTCCGCGTCCCGTGTGCTGCACACACCGCTGCACACC---TGGCATGCCTAGGCAGTTCGTGCCTGCTGT--GTTC-TTGTGGCTCTGCTTCACCTGCTCCATCAGCTTAACCTGCGG--CCTATCTGCCCCATAACCCTCCCCTCTG----------CCCT-------GCACTTTGG-AGGGGTGGGGAAGA---------GGGCAGTGTGAGTCACCTTGGCT-TTTCTGAGGG----------CTGC---------ATGCTGAGGAACCTAGGGATGTCCATCCAGCCCTCAGTAAGGGCTTCCCTGATGCC---TTGCT-----------GGCTGCCCCGGCTGGGTGCCCTGATGACGGGGTCT------GACAGGGTCT--------AAAAGGGTTC--CAGCTCCTAGCCCTGC------------CCACCCTCCAG-----GGCCAGAGTCAAC-GATGAC---TCTGTACTTCAG--TCCCTT-CG-----G-----------------GAAAGTCTGATGCCAG------TTGGTCGTGGTACCAAAGGGTATC---CCTTGGAGTCTCC--TCCGAGACCAGGCTAGAAGGTGCTCAGAA-CACAGTGCTGAGA-GAAGCTCCCAGGGGC-----------------------------------------------CCGTACTGCCCAGATGGCGGCGCTTAGCATCTCTGTCTGA-----CCACCTGCCGTCTGGGCTCACAGTTCCTGGCCTGCCCC---TTGTCAGCAGCAGT----ATGAGGGAACTGGA-CTGAGCTGGTCACCTGAGCCCTAGCCTGGCGGGAGGGGGCC-TGCCT-----------GCTTCCATTGC----------ACTCCTGCTCCTGCCCA--AACTCATTGTCCGTCTGTCTGTCTGCTGGCC-----------------------CACCCCACACTGACCATGTTCTCCTTTCTGTCCCTGCTCCCTGTG--CTGCTTCCAT----------AGTTAGGGATTGAGACCCGCGAGTGCCAGGTAACAGGCCCGACCCCTGTGTGTCCCCATGCT---------------------------------------------------------     
15 Jaculus_jaculus-NC_059106.1-191124_191356            83.7%  33.0%    ---------------------------------------------------CTCAGACTCCAGCAGCCCTGACAGCCCAGGCAGCCCCAAGGTGGCCCCTTGCCAGCCAGAGGGTGCCCACAG---GCAGCAGGGGGCTCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAATTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCTGCCCCTCCTCCCACGTGCGTTCCGCATACCCGGC-----------------ATGCCTGG-GCCTCCACACCTGCTGT--ACTC-CTGCAGCCCTGCTTCTCTCGCTTCATTGGCTTGTCCTGTGG--CCTGTCTGCCTTGGCCCCACCCCTTCTG-CCCAAGAGTCCCCAGCACTTTG-----GA-AGGGTTGGGGGCTG---------GAACAGTTTGAGTCAGCATGGCC-CTCCTGAGAG----------CCAA--GAGCTGCTTGCTGAAGGACCCGGGATCCTTAGGCCAGGCCTCACTACAAGCTTTCCTGGCTAA---GCCCAAA-------CCTGCTGCCC--------------------------T------TCCTGAGTCT--------GAGAAGCTC---TAGCTTTCAGCTCTGT-------------CTCCCTCCAG-----GGCTAGGTGCAGG-GGTTGTTC-TGCCCAATTCAG--TCCCTCCTG-----G-----------------GGAAGTCTGCGTTAGG------TTGGTCGGGGGCT------------------GCAGAGCCT--GTGGCGATCAGGGTGGGAGGTTCTCAGAG-CATGGAGCTCGCCAGCCTTGGAGCACATAGCGCTGGGAGGAA---------------CAAGTTCTGAGTGCTGCCGGGGCTCTGCACTGCCTCAGTGGCCCTGAGTCTCTGGCTGGCTGACCAC-CTACCT----GC------TTGCCTGGTAGTTATC---TTGTCAGTGGGA-------------------G-AGCGAGTGAGTAGCTGAACCCCAGTCTAGGTGGGAGGGAGG-TGCATCAAGTCTGCCTATCCCTGCTGTGCTCCCCCTGCCAT----CCCCGCCTA--GCCTCACTGTCCGTCTTTCCATCTGTC-----------------------AGCCCGTTCCACACTGACCATGTTCTCCTTTCTGTCCCTGCTCCCTGCG--CTGCCTCCAT----------AGTTAGGGACTGAGACCTACGAGTGCCAGGTAACAGGCCCAGACCCTCTGTGCCCCATGCTGCC-------------------------------------------------------     
16 Mus_musculus-NC_000070.7-193074_193240               84.3%  34.4%    ----------------------------------------------------TCGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCAGGCAGCCCCAAGGTGGCCCCCTGCCAGCCGGAGGGTGCTCACAG---GCAGCAGGGGGCGCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTCATTCCCCCATGTTCTCCACCGGTAAGGCCTGCCGTTCCGCTGCATCCCATGCTCTCTACAC------------C---TGGCATGCCTAGGCGGTCCGTGCCTGCCTG--CCGC-TCTCTGCTTCATTTGTCC------GTCAG-CTTAGCTGTGG--CCTGTCTGCCTCAGATCCCCACCCCTGC-C-CTAATGGCCCTGTACTTTGTGGGGGCG-GGGGTGGGGGAAGA---------GGGCTGCTCGAGTCATCAAGGCA-TTTCTGAGAG----------CTGC---------TTGCTGAGGAACCCAGGGATATCCAGCCAGCCCTCAGCAAGGGCTTCCCTGGTGCC---TGCT------------GGCTGCCCTGACTGGCTGCTCTGATGGCCTACCTT------CC-TAGGTCT--------GAAAAGATCC--CAGCTCTTAGCCCTGCCTCCCCCCACCCCCACCCCCAAG-----GGTCAGATGCAAG-AATGAC---TCTGCCTTTCGG--TCCT----A-----T-----------------GGGAGCCTGCTGTCAA------TTGGTGGTGGTACCTCAGGGTATCCCCTCTTGGAGACTCC--TCAGAGACCAGGGGAGAAGGTGCTTAGAA-CTGAGGT--CTGG-GCCTCAGAGCTTAGG--------------------------------GGGAG-CAGCTTCCAGGGACCTGCATTGTCCAAATGTCACTAAGCCTTTTTGTGA-----CCCTCCTTCCT---GGCTGACACTTCCTGACC----------------TTGGAGT----GTGAGGGAACTGGT-CTGAGCTGGTTACT-GAGCTCTAGCCTGG-GCAGAGGGAGG-TCCCTGGAGTCTGCCTGCTTCCATTGTATTCCCCCCGACCCCCGCTCCTGCCCA--GCATTGTTGTCCATCTGTCCATCTGCCAGTGCCCCACCACC-ACCACCACCACCACCAATACACTGACTGTGTTCTCCTTTCTGTCCCTG--CTCCGTG--CTGCTTCCAT----------AGTTAGGGATTGAGACCTGCG--------------------------------------------------------------------------------------------------     
17 Octodon_degus-NW_004524689.1-191407_191624           79.6%  28.7%    -----------------------------------------------------CTGTGTCCTTGGACTCCAGCAGCCCAGGCAGCCCCCAAGTGGCCCCCTGCCCGCCTGAGGGTGCCCACAG---GCAGCTGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGCTCAAAAGCTGGAGGAGATGAGGAGTAGTTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCAGCCACTCCTCGGCACCTTGTCCTCCACCCGCCAGGCATGCCTGG---GCCTG--CGTCCCCTGCTGTGCTCGTGTC----TGC--------TTCTGTGTG-------------------CTCCTCAGCCTGTCTGCCCTGGCTCCTGCCCCTCTG-CACAAGAGGCCCTGGCACTCTGGGGGGCA-GCCCTTGTCCAG-------------------------------------CCCGTCCAGGGCTCGCCTTGCT--GGGAA-GTCTGTTGAAGGCAGTGGTGCAGCCCTAGGGCGT-CCCCAGTGTCCTGCAGCCTGGGCTGCTGCTCTAGC-CTGATGCCCGGCCTGAGTCTGGAAAGGGCTGAGACTGCTT------CCATTATTCC--------TGGGCCCACG-ACTCAGCAGCTCCA--GCAGACCC-TAGCCCTTCTGGTGGACAGCAGGTGGAGGGTGG-AGCTGGGGGCCAGACC-CCAGCCTGG--GCGG-----GGGGATGTGCCTGAGCCCCGCACTCCGCTCCACA------CTCCTGCCCGCCTTGCTGTCCGTCTGCCCCTTGTCTAGCC--CCA-----CCCCGCTGACCTTGTTCTCCT-TTC-TGTCCC--TGCACCCCGGCTGCCTCGTAGTTA-----------------------GGGACT-----------GAGAGCCGCAAGTGCCAGGTAATGGCCCGGCACCCCGTGC-----------CCC-----GCTTCGCCCCAGACCCCACAGACC---TTGTGAGTGGGAACAGGGCCTGGGCACTGTGT-CTG--TCCATGCCCTGGCCCTAGTGGCAGTGG-GAGGGGGG-TACACTGAGTGTGCCATATTACCTAGGAGC-AAACGAAGAGGCCTGACCACTGG--GGTCCTGGGGAGCCCTGTGCAGGGTCGC-----------CC-TTTGCAGGGC------CCCCTCTGACCTGGCCCTCCCTCCCTGCCTTG-----------CATCTTTGA------------------------------------------------------------------CTGTTT--------------------TTCCCCCCTGCC----------CTGTCT----------     
18 Mastomys_coucha-NW_022196900.1-193074_193240         83.1%  32.4%    ----------------------------------------------------TCGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCAGACAGCCCCAAGGTGGCCCCCTGCCAGCCGGAGGGTGCCCACAG---GCAGCAGGGGGCGCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTCATTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCTGCCATTCCGCTGCATCCCATGCTCTCTACAC------------C---TGGCATGTCTAGGCGGTCCATGC----CTG--CCGC-TCTCTGCTTCATTTGTCC------ATCAG-CTTAACTGTGG--CCTGCCTGCCTCAGACCCCCCACCCCCA-CCCTAATGGCCTTGTACTTTTT-----TT-TT------GGGGGG---------GGGGT-------------------GCTCCAGTCA----------AGGC---------TTGCTGAGGAACCCAGGGATATCCAGCCAGCCCTTTGAAGGGCTTCCCTGGGGCTG---CCCTGCCTTGCTTGCTGGCTGCCCTGACTGGCTGCTCTGACAAC---CTTC------CT-TAGGTCT--------GAAAAGGTCT--CAGCTCTTAGACCTG-------------CCTCCCCGCAG-----GGCCAGATGCAAG-AATGAC---TCTGCCCTGTAG---TCT----A-----C-----------------AGGAGCCTGCTGTCAA------TTGGTAGTGGTACCACAGGGTGTCCC-CCTTGGAGGCTCC--TCAGAGACCAGGGGAGAAGGTGCTTAGAA-CTGAGGT--CTGG-ACCTCAGAGCACCCGGTGCTTA------------------------GAGGAG-CAGCTCCCAGGGAGCTGCATGGTCCGAATGGCACTTAGCCATTGTGTGA-----CCACCCACCCTCCTGGCTAACAGTTCCTGACCCACACT---TGGTCTGCGGGAGT----GTGAGGGAACTGGT-CTGAGCTGGTTATCTGAGCTCTAGCCTGGGCTGGAGGGAGG-CACCCAGGGTCTGCCTGCTTCCACTGCACT-------CCTCCCGCTCCTGCCCA--GCCTCGTTGTCCATCTGTCCATTTGCCAGCGGC------------------CCC--ACACATACTGACCGTGTTCTCCTTTCTGTCCCTG--CTCCATG--CTGCTTCCAT----------AGTTAGGGATTGAGACCTGCGAGTGCCAGGTAACAGGCCCAAGCCCTATGTGTCCCCAT------------------------------------------------------------     
19 Myotis_myotis-NW_023416355.1-1024658_1024812         88.9%  44.2%    ----------------------------------------------------TGCTCGGTGTCGGGCTCAGGCAGCCCCGGCAGCCCCGAGGGGGCCCCCCGCTGGCCCGAGGGCGCCCGCAG---GCAGCCGGGGGCCATGCAGAGGGAGATGAATGCCCTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATTAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACCGGTAAGACCAGGAGCACCCCGGCTTCCCCGTGGCGTGCCCTCCGCATGGCCTGG----CCGGACCCCGC--CCGCTGTGCTTCCT----GTCC-GACTGCCG---CGCACGCCCCCTGCTCCGCTGGC------T--TC------CCCGCGGCCCCGCCCCAACT--CCTGCCTGACCCAGCCTGATCCCGGGCCTCTTGCTCTTGGGGG--CCCCCCACCCCCG------------AGGGCCCAGGGGAGAG----A-----GCAG-----GT-GCAGTCCCGGCGCCCT-----C---ACCCCGGAA-TGTC---CCCTGGGTG-----------------------GGGACTGAAGCCAGGCTGTGCCCACGGAGGCCTGCAG------CCGGAGCAAT-------------------------------GCCGCTGGGGCC--GGCCCTG-TGCCCC-TGCCGCTCCCCTCCC--------------TGGCCTGGGGCCTTCCTAGGACTCGGGCAGCGTCCAGCCACACACCCACCCCAGCCCCCGCCTCCCTCCAGGGAAGGCTGAGGGGTCCTGCCCCTGCCCCTGCCCC--ACAGTCCTCTGGGGAGTGGGCCC---------------T--AATGCCCCTGACTCCTGGCCGGGGCTCCGAG---CCC--CAGGTCG--CAGCTTCCACGCGCACCCGGCCCC--GGGGTGC-------ATTCAGGCCTGGAGCCC------CTCCCGGC-C---GGCTGCCG--ACTGGGGAGGGGGA---AGCTGAGCCGTCCT----GCTCCCCTCCCTGCA-----------CCCCGCCCTG----CTGTCC--CTCTG----CCCACTGGCCAGCCCCGCCCCCACGCTGAC----CACCCTGTTCTTTCTG------TTCCCATGCGGCCTCCGTAGTTAGGAACTGAGAGCAGCCAAGTGCCAGGTAACG----GGGCAGCCCCCGTGTGCCCTGTGCGGCCCCCGTGTGCCCTGTGCAGCCCCCGTGTGCCCTGTGCGGCCCCG--TGTGCCCTGTGTGGCCCCCG----------------TGTGCCGTG----------------------------------------------------------------     
20 Orycteropus_afer-NW_006921723.1-190841_191007        82.0%  34.4%    ----------------------------------------------------TCGGATTCCAGCAGCCCGGACAGCCGTGGCAGCCCCGAGGAGGGCCCCCGCTGGCCAGAGGGTGCCCGCAG---GCCACCAGGGGCCCTGCAGCGGGAGATGAACGCCCTGTTCATTCAAAAGCTGGAGGAGATTAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCAGCTGGTAAGGCCAGCCCCGCCCAGCCCCCTCCCTGCAGTGTCCCCTGCTCTCAGCAT---GGCCTGGTTCTG-TCTCCAC----CGCTGT--CTGTCAAACACCGCCACCCTGGGTGCACCATCCGCTTTTGTTGT----GCTGTGCTCCATCAGCTGGTCCCACCTG-CCCCTTAAGCCCCACCCAGCCCTCCCTATCACCACTTCTCTCTG-----GTCTGAGGGGCCCTGGTGCTCCTGGAACCCAGGGGAGTAGGGTGGCCTAGGTGCTATGGTTCTGCATCCCATCCCTGCTA-----GGATGAGCCCAGACAAGGGCCTGTGAGCAGCAT--TTGC-------TGAGGGTCACATCTGGCCCAGTGCACACCTGGCCTTCCCA------GCCGGGCTCTCATCACAGGGGCCCATAGGAGACCTAGAGGCTCAGATGTTCCCAATGCCCTTCCTGCAC--CTCAGTTGGCTTGTGG-GCTCCCCCTACCCAAATCTCCAGCCCATCCAA-----G--------------GTGAGGCTTCTGCCCCCAC------CTCAGCTGCTGGCCACAGTCACCCCCCAAGTCTGACATGT--CAGGGGC-CAGCCGTAACCCTTCCTACTA-----------GTGGCCCAGGGCACTCAGAGTACT-----------------------GATGGAGTCGATTCTTAGCCCCACATGCACCTAGCACCTAACTCAGAGGCCCTGCCAGG--------CCAGTCCTA--CAGTGCTACCTGCACCTGTACAAAGTATATAGAGCTCACTGCAGGCAGGGTCATAGGGG---CTCTGAGCCGTTGGAGAGCCAGCCTGGGGGCAGGGCAAG-CTGGCTTGCCTT----CCCTCCCTCCCTTTGAGCTCCTGCCCTGTACCTGCCCA--ACCTTGCTATCAGTCTATCTGCCTGCCAGG--------------CCACCTTACCCCCAG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
21 Peromyscus_leucopus-NC_051064.1-193098_193311        84.7%  34.1%    ----------------------------------------------------TCGGACTCCAGCAGCCCAGGCAGCCCAGGCAGCCCCAAGGTGGCCCCCTGCCAGCCGGAGGGTGCTCACAG---GCAGCAGGGGGCACTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTCACTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCTGCCGTTCCTCCGCATCCCATGCTCTACGCAC------------C---TGGCATGCCTAGGCAGTCCGTGCCCGCTGT--CTTC-TTGTGGCTGCGCTTCATTTGCTCCATCAGCTTAACCTGTGG--CCTGTCCGCCTCAGACCCCTCCCCTCTG-CCCAAACAGCCCTGCACTTT-------GG-AGGGATGGGGAAGA---------GGAAAGTTTGAGTCACCATGGCA-TTTCTGAGGG----------CTGC---------TTGCTGAGGAACCCAAGGATGTCCAGCCAGCCCTCAGTGAGGGCTTCCCTGGTGCC---TTGCT-----------GGCTGCCCCG-----------------ATGACCTT------CC-AAGGTCT--------GAAAAGGTCC--CAGCTCTTAGCCCTCCCTC---------GCTCCCTCCAG-----GGCCAGATTCCAG-CATCCC---TCTGCCTTGCAG--TCCC-T-TA-----G-----------------GAAAGCCTGCTGTCAG------TTGGTGGTGGTACCAAAGGGTGTC---CCTTGGAATCTCC--TCAGAGACCAGGGTAGAAGGTGCTCAGAA-CTGGGAGGTCAGG-GCCTCAGAGCACACAGTGCTGA------------------------GAGGAGAAAGCTCCCAGGGACCTGCGTCGTCCAGATGGCGCTTAGCCTCTGTCTGA---------CTACCATCTTGGCTGACAGTTCCTGGCCTACACC---TTGTCAGCAGGAGT----ATGAGGGAACTGGA-CTGAGCTGGTCACCTGAGCCCTCGCCTGGGTGGGAGGGAGT-CTGCCT----------GCTTCCACTGCAC-------GCCTCCTGCTCCTGCCCA--GCCTCATTGTCCATCTGTCTCTCTGCCAGCC-----------------------CACCCCACACTGACTGTGTTCTCCTTTCTGTCCCTG-CTCCCATG--CTGCTTCCAT----------AGTTAGGGATTGAGACCTGCGAGTGCCAGGTAACAGGCCCAAGCCCTGTGTGTCCCCATG-----------------------------------------------------------     
22 Trichechus_manatus-NW_004444058.1-190885_191048      81.8%  33.1%    ----------------------------------------------------TCGGACTCCAGCAGCCCGGACAGCCGTGGCAGCCCCGAGGATACCCCCTGCTGGCCTGGGGGTGCCCGCAG---GCCACCGGGGGTCCTGCAGCGGGAGATGAACGCCCTGTTTGTTCAAAAACTGGAGGAGATTAGGAGTAAATCTCCCATGTTCTCAGCTGGTAAGGCTGGCCCCGCTGGGCCTTCCCGTGTCC-------CTGCTCTTGGCAT---GGCCTAGCTCTG-CCG-------------------CTGTCAACCTCCACCCTCGGCCTGCCATCCGCTTTCATTTC----ACTGTGCTCCATCGGCTAGTCTCACCTG-CCCCCTCAACCCCAGCTGTCCCT----TCTGACCCTCCCATCTG-----ACCTGAGCGGCCCTGGTGCTCCTGGAGCCCAGGGGTGGGGGTAAGG---GGGCTGGGCAGCATGTCTCCCACCCCTGATA-----AGGTGGGTCCAGGCGAGGGCCTGTGGGCAGCAT--TTGC-------TGAGGGCCACATCCAGCCCAGTGCACACCCAGCCCTCCCA------GCTGGGCCCTCATCATAGGAGCTCATAGGAGACCGGGGGGCTCCGATGCTCCTGACACCCTTCCTGAAC--CTCAGTCAGCTTCAGT-CCCCCACCCCCGCAGCTGCTGGCCACAG-------------------------------------------------------------------TCACTCCCCAAGTCTGATGCGT--CAAGGGC-CAGCCCCAACCCTGCCACCGGTGGCCCAGAGCCCTCCGGATGGCACTCAGAGTGCTGATGGAGTTGATTCCACGTGGCTTGGCCTGAGCTCTCTCGGCCCGACATGCAACGAGTGTCCAACCCAGAGGCCCTTCCAGA--------TGGGTCCTA--CAGTGCTGCCTGCAGCAGTACTGAGTGCTGCGGGTCCACAGCAGGGC-AAGGTCACAGG---CTGTGAGCTGTTGGAGAGCCAGCCTGGGGGCAGGGGAAG-CTGGCCCTCCCT----CCCTCCCTCC-TTCAAGCTCCCGCCTTGCACCTGCCTC--GCCTTGCTATCAGTCTGTCCATCTGCCAGC--------------CACCTCACTCCCACCCCCTCTGACCATCTTCTCCTTTCTGTCCCTG--CCCCCA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
23 Rattus_rattus-NC_046154.1-193076_193240              83.9%  33.0%    ----------------------------------------------------TCCGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCAGGCAGCCCCAAGGTGGCCCCCTGCCAGCCAGAGGGTGCTCACAG---GCAGCAGGGGGCGCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTCATTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCTGCCATTCCGCTGCATCCCATGCTCTCTCTACAC----------C---TGGCATGCCTAGGCGGTCCGTCCGTGCCTG--CTGC-GCCCTGCTTCATTTGTCC------GTCAG-CCTGTCTGCCT--CAGACCCC-------------TCCCCCG-CCCTAATGGCCCTGTGCTTTAG-----GG-GAGATTGAGGAAGA---------GGGGAGCTTGAGTCATCATGGCA-TTTCTGAGAG----------CTGC---------TTGCTGAGGAACCCAGGGGTATCCAGCCAGCCCTCAGCAAGGAC-----------T---TCCCTGGTGCCTTGCTAGCTGCCCTGGCTGGCTGCTCTGATGAC---CTTC------CT--AGGTCT--------GGAAAGGTCT--CAGCTCTTAGCCCCGCC-----TAACCCCCCCCCCCCAG-----GGCCAGATGCAAG-AATGAC---TCTGCCCTGCAG--TCCT----T-----C-----------------AGGAGCCTGCTGTCAA------TTGGTGGTGGCACCACAGGGTACATC-CCTTGGAGGTTCC--TCAGAGACCAGGGGAGAAGGTGCTTAGAA-CTGAGGT--CTGG-GCCTCAGAGCACCCAGTGCTTA------------------------GAGGAG-CAGCTCCCAGGGACCTGCATTGTCCAAAGGGCACTTAGCCATTGTGTGA-----CCACCCACCATCCTAGCTGACAGTTCCTGGCCCACACC---TGGTCTGCAGGAGT----GTGAGGGAACTGGT-CTGAGCTGGT---CTCAGCTCTAGTCTGGGTGGGAGGGAGG-CACCTGGAGTCTGCCTGCTTCCATTGTACT-------CCTCCCGCTCCTGCCCA--GCCTTGTTGTCCATCTGTCCATCTGCCAGCGGC------------------CCCCCCCCCACACTGACCGTGTTCTCCTTTCTGTCCCTG--CTCCGTG--CTGCTTCCAT----------AGTTAGGGATTGAGACCTGCGAGTGCCAGGTAACAGGCCCAAGCCC-------------------------------------------------------------------------     
24 Nannospalax_galili-NW_008355419.1-190981_191147      84.4%  34.2%    ----------------------------------------------------TCGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCAGGCAGCCCCAAGGTGGCCCCCTGCCAGCCAGAGGGTGCCCACAG---GCAGCAGGGGGCGCTACAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGTTGGAGGAGATGAGGAGTAATTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCTGCCATTCCTCCGCATCCCGTGTTCTGCACACCCG---------------GCATGCCTGAGCCATCCACGCCTGCTGT--CTTG----TGGCCCTGCTGTGTTTGCTCCGTTGGCTTAACCTGTGG--CCTGTCTGCCTCAGACCCCTCCCCTCTG-TCCAAGAGGCCCAGCACTTTGA--------AGGGATGGTGACCA---------GGGGAGTTTGAGTCACCATGGCC-CTTCTGAGAG----------CTGG--GAGCTACTTGTGGAGGGACTCGGTACTGTCCAGCCAGGGCTCAACGAGGGCTTACT----------------------TGCTGGCTGACCTGACCGGTTGCCCTGATGTCC-----T------TCCCAGGTCT--------GGGAAGGTTC--CAGCTCCCAGTCCTGCTGC-------------CCTCCAG-----GGCCAGATGCAGG-GATTGT-C-TTGTCAGTGTAA--TCCCTC-TG-----G-----------------GGAAGTCTGCTATTGG------ACTGTAGAGGTGCCA------------CAGAGGAGGTCCC--TCAGAGACCAGGGTGGAAGGTGCTCACAA-CCCGGAGTCAGGG-CCTCAGAACACAGTGCTGGGAG------------------------CATACATGTGCTCCCGGGGCCCTGTGTTGACTAAATGGCGTGGAGCTGCTGTCTGGCCACCCACTGGCTTGTAGCCGCTAACAGTTGCTGGCTCGCACC---TTGTCAGCAGGAGT----GTGAAAGAGCTGAT-CTGAGCTGGTTTCCTGAGCCCCAGCCTGGGTGGGAGGGACG-TGTACCTAGTCTACCTGCCCCCACTGCACTCCTCCCACCCCC-------TCCCA--G----CCTGTCTGTCTGTCCATCTGCCAG-----------------------CCCACCCCACACTGACCATGTTCTCCTTTCTG-CCCTGCTCCCCATG--CTGCCTCCGT----------AGTTAGGGATTGAGACCTGCGAGTGCCAGGTAACAGGCCCAGCCCG-------------------------------------------------------------------------     
25 Fukomys_damarensis-NW_022900935.1-193084_193298      78.5%  27.9%    ----------------------------------------------------TTGGACTCCAGCAGCCTAGACAACCCGGGCAGCCCCCAAGTGGCCCCCTGCCCGCCAGGGGGTGCCCACAG---ACAGCTGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCTTTGTTCACTCAAAAGCTGGAGGAGATGAGGAATAGTTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCAG-TGCTCCTCTGCACTGCGTGCTCTGCACACCCTGGCATGCCTG---GGGCT-CCATCCCCCGTTGTGTTCCTGTCT----GC--------TTCAGTGTG-----------------CTCCTGCGGCCCTGTCT------------GCCCCTCTA-CACCAGAAACCCCAGCACTCTGCGGGCGA-CACCAGGCGAATTTGGGTCACTTGCTGTGCCTGACCCCTGGTCCAGC----------------------------CAGGCCTCTCCCGGCCTAGTGGTGCAGTGATGGGGCAC-CACAGATGTCCTGTGCCAAAGGT--GGCTGGGCCTGCATGCGGGACCTCGGAGTTTGTGGAGGGCTGAGCGCACTT------CCCTTGCTCA--------GAGCCAGC--------------------TCCTGGAGCTGCCACCCAGTCCCGCAGTGAGCAGA-GTGGG-GAGCTGGGTGCCAGACCGCAGCCTGGGTGGGA-----GGGACATGTACTGAGCCCCTCATCCTGCTCTGCA------CCCCTGCCTGTCTTGCTGTCCGTCCACCCCTCTGCCAGCC--CCA-----CCCTGCTGACCTTGTTCTCCT-TTC-TGTCCCTGCACCCCGGGCTGCCTCCATAGTTA-----------------------GGGACT-----------GAGAGCCGCGTACCAG-GTAATGGCCCAGCCCCTGTGTGT-----------GCC-----GTGTTGCCCTGGGCCCTGCAGACC---CTGAGAGGGAGCACAGGGCATGGGCATCTTGC-CTG--GCCACAACCCGGTCCCAGCAGCAGCAGGGATGGGGG-CACACTGAGTGCGCCACGTTAGCCAAGTAC-AAATGGGCAGGCCTGGCTGCTGG--GGATCCTGGGGGGCGGTGCTCACACTTG----------TGG-ACGGCGCTGCAGGG-----AACC----CGTCACTGTT-----GCATCT-----------CCTCTGACT------------------------------------------------------------------CAGTCT--------------------CTGCCCCTCTCCCCACAGGTGCCCGCCCGTTCTCCAC-     
   clustal                                                                                                                                    .. * **  *. .   ** *..          *       .**      .***   .*..   ***   .*.*** *.***.***. **  **** . * .***. ******. ** ****.: . ** ** *** * **..* ****** *                                                                                                                                                                        *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              

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