CAAGAGCCAGAAGCCGGGCCGCAGGGGCTTCCCGGAGCTGGTCCTGGGTACACGGGACACAGGCTCCAAGGGGGTGGCAGACGATGTGGTGCCCCCCGGGCCCGGACCTGCTCCGGAAGCCCCAGCCCAGGAGGGGCCCGGCAGCGGCAGCCCCCGAGGTAAGGCGCCAGCTGCGGTGGCAGAGAAGAGCCCTGTGCGAGTGCGGCCCCCGCGTGTCCTGGACGGCCCCGGGCCTGCTGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGATCCTGCGCCGGCGTGAACACCGGGGGCCTGCAGAGGGAGCGGCCACCCAGCCCGGGGCCTGCAAGCAGGCAGGCAGCCATTCGCCAGCAGCCCCGGGCCCGGGCTGACTCACTGGGGGCCCCCTGCTGTGGCCTGGACCCTCACGCTATCCCGGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCAAGGGTCCTGGGGCCTGGAGGCAGGGTCCAGGCGGTAGCGGCTCCATGTCCTCGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCGGGCATCCCCGAAAGGTCCCCCCGCTGGCCTGAGGGTGCCTGCAGGCAACCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAGTGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCGCCGGTAAGCCCCTCTTGCCCTGCGTGGTCCTCCCGCACGCCCCTGGCATGGCTGGGCCTGGGTCACCTGCTGCTGCTTCTGCGTGGACGGTGTCGCCTCGTGTGCTCGTGCTCGTGGCTCTGTATCCGTGGCACTGTCTCCGTGGCACTCTGCTCCCTTGGCTTGCCTGTGGCCCATAGCCCCAGCCCTCCTGTCTGAGCTTGAGGCCCTGGGACTTGGGTGGAGCTGGTTTGAGGCCCGACAGGCTGGGAAGAACCAGCTGCTCTTGCTGAGGGTCTGGGGCCGGGACTGTGGCCTGACATGCTGGGCCCCTCCGGCTGGGCGCTTCCCCAAACTCACCTCCT
Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.
Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.
Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.
Distribution of HSS in the input sequence
HSS id | Strand | Frame | Length | Start | End | Score | P | Show Result | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 0 | + | 1 | 220 | 35004 | 35663 | 119.340 | 0.000e+00 |
Plot |
2 | 1 | - | 3 | 127 | 35009 | 35389 | 59.995 | 6.972e-10 |
Plot |
HSS id | Sequence | |
---|---|---|
1 | 0 | SQKPGRRGFPELVLGTRDTGSKGVADDVVPPGPGPAPEAPAQEGPGSGSPRGKAPAAVAEKSPVRVRPPRVLDGPGPAGMAATCMKCVVGSCAGVNTGGLQRERPPSPGPASRQAAIRQQPRARADSLGAPCCGLDPHAIPGRSREAPKGPGAWRQGPGGSGSMSSDSSSPDSPGIPERSPRWPEGACRQPGALQGEMSALFAQKLEEIRSKSPMFSAGK |
2 | 1 | PSESARARGCWRMAACLLAGPGLGGRSLCRPPVFTPAQDPTTHFMHVAAIPAGPGPSRTRGGRTRTGLFSATAAGALPRGLPLPGPSWAGASGAGPGPGGTTSSATPLEPVSRVPRTSSGKPLRPGF |
Reference sequence (1): Target Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% |
cov pid 1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . . . 4 . . . . : . . . . 5 . . . . : . . . . 6 . . . . : . . . . 7 . . . . : . . . . 8 . . . . : . . . . 9 . . . . : . . . . 0 . . . . : . . . . 1 . . . . : . ] 1164 1 Target 100.0% 100.0% -------------------CAAGAGCCAGAAGCCGGGCCGCAGGGGCTTCCCGGAGCTGGTCCTGGGTACACGGGACACAGGCTCCAAGGGGGTGGCAGACGATGTGGTGCCCCCCGGGCCCGGACCTGCTCCGGAAGCCCCAGCCCAGGAGGGGCCCGGCAGCGGC---AGCCCCCGAGGTAAGGCGCCAGCTGCGG------------------TGGCAGAGAAGAG---CCCTGTGCGAGTGCGGCCCCCGCGTGTCCTGGACGGCCCCGGGCCTGCTGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGATCCTGCGCCGGCGTGAACACCGGGGGCCTGCAGAGGGAGCGGC---CACCCAGCCCGGGGCCTGCAAGCAGGCAGGCAGCCATTCGCCAGCAGCCCCGGGCCCGGGCTGACTCACTGGGGGCCCCCTGCTGTGGCCTGGACCCTCACGCTATCCCGGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCAAGGGTCCTGGGGCCTGGAGGCAGGGTCCAGGCGGTAGCGGCTCCATGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCGGGC---ATCCCCGAAAGGTCCCCCCGCTGGCCTGAGGGTGCCTGC---AGGCAACCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAGTGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCGCCGGTAAGCCCCT----CTTGCCCTGCGTGGTCCTCCCGCACGCCCC----TGGCATGGC--TGGGCCTGGGTCACCT-------GCTGCTGCTTCTGCGTG---GACGGTGTCGCCTCGTGTGCTCGTGCTCGTGGCTCTGTATCCGTGGCACTGTCTC------------CGTGGCACTCTGCTCCCTTGGCTTGCCTGTGGCCCATAGCCCCAGC------CCTCCTGTCTGAG-----CTTGAGGCCCTGGGACTTGGGTGGAGCTG-GTTTGAGGC-CCGACAGGCTGGGAAGAACCAG----------CTG-CTCTTGCTGAGGGT----CTGGGGCCGGGAC-TGTGGCCTGACATGC--TGGGCCCC---TCCGGCTGGGCGCTT----CCCCAAACTCACCTCC----------------------------T----------- 2 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-127718_128709 97.9% 86.3% ---------------CGACCAAGAGTCAGAAGCCGGGCCGCAAGGGCTTCCCGGAGCTGGTCCTGGGCTCGCAGGACGCGGGCTCCAAGGGGGCGGCAGACGACATGGTGCCCCCCAGCCCTGGCCCCACTCCGGAAGCCCCGGCCCAGGAGGGGCCCAGCAGTGGC---AGCCCCCGAGGTAAGGCGCCAGCTGTGG------------------TGACGGAGAAGAG---CCCGGTGCGTGTGCGGCCCCCGCGTGTCCCAGAGGGCCCGGGGCCTGCTGGGATGGCCGCCACGTGCATGAAGTGCGTGGTGGGATCCTGCGCTGGCGTGAACACCGAGGGCCTGCGGAGGGAGCGAC---CACCCAGCCCGGGGCCGGCCAGCAGGCATGCCGCCATTCGCCAGCAGCCCCAGGCCCGCGAGGACTTGATGGGGGCCCCCTGCAGTGGCCTGGACCCTCAAGCTCTCTCGGGGAGAAGCAGAGAGGCCCACAAGGGGCCCGGGGCCTGGGGGCAGGGTCCAGGAGGTAGCGGCTCCATGTCC---TCGGACGCCAGCAGCCCAGACAGCCCGGGC---AGCCCCGAAGTGGGAGCCCGCTGGCCCGAGGGTGCCTGC---AGGCAGCCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAGTGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGATATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCGCCGGTAAGCCCCGCCCTCCTGCCCTGCGCGGTCCTCCCGCACGCCCC----TGGCATGGC--TGGACCTGGGTCACCT-------GCTGCTGCTTCTGTGTG---GACAGTGTCGCCCCGTGTGCTCG--------------------TGGCTCTGTCTC------------CGTGGCACTCTGCTCCCTTGGCTTGCCTGTGGCCTGTAGCCCCAGC------CCTCCTGTGTGAT-----CTTGAGGCCCTGGGACTCGGGTGGAGCTG-GTTTGCGGC-CCGACGGGCTGGGCTGGGGCTCTCAGCAGGAGCTG-CTCCTGCTGAG-GA----CCTGGGCCTGGAG-TGTGGCCTGACGTGC--TGGGCCCC---TCCTGCTGGGTGCTT----CCCCAAACTCACCTCC----------------------------CAGG-------- 3 Mandrillus_leucophaeus-NW_012103199.1-235432_236066 98.1% 55.4% --------NNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------------NNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCAGCCCCGGGCCCGGGCTGACTCACTGGGGGCCCCCTGCTGCGGCCTGGACCCTCAAGCTATCGCAGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCAAGGGTCCCGGGGCCTGGAGGCAGGGTCCAGGCGGTAGCGGCTCCGTGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCTGGGC---ATCCCTGAAAGGTCCCCCCACTGGCCTGAGGGTGCCT---GCAGGCAACCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAGTGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACCGGTAAGCCCCTCCTGCCCTGCGCGGTCCTCCCGCACGCCCC--------TGGCATGGC--TGGGCCTGGGTCACC-------TGCTGCTGCTTCTGCGTA---GACGGCATCGTCTCGTGTGCTCGTGGCTCTGTCTCCGTGGCACTGTCTC------------------CGTGGCACTCTGCTCCCTTGGCTTGCCTGTGGCCGGTAGCCCCAGC------CCTCCTGTCTGAC-----CTTGAGGCCCTGGGACTTGGGGTGGAGCTGGTTTGAGGC-CCGACAGGCTGGAAAGAACCAG-----------CTGCTCTTGCTGAGGGT----CCGGGACCAGGAG-TGTGGCCTGACATGC--TGGGCCCC---TCTGACTGGGCGCTT----CCTCAAACTCACCTCCCGG------------------------------------- 4 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-192617_193446 93.0% 61.4% -------CAGCGCCCCGACCAAGAGCCAGAAGCCCGGCCGCAAAGGCTGCCCAGAGCTGGTCCTGGGCACGCGGGACACGGGCGCCAAGAGGACAGCTGATGACGCGGCGCCCCCCAGCCCTGGCCCGGCCCTGGAGGCCCCGGCCTGGGAGGGGCCCGGCAGCGGC---AGCCCCCGAGGTAAGGTGCCTGCAGCGG------------------AGGCGGAGAGGAG---CCCGGCGCAGGCACGGCCTCTGCGGGTGACTGAGGGCCTGGGGCCCGCGGGGATGGCCGCCACGTGCATGAAGTGCGTGGTGGGTTCCTGTGCCGGCGTGGGTGCTGAGGGCTTGTGGCGGGAGCAGC---CAGCTAGCCCGGGGCCCGCAGGTGGGCACACGGCCATCAGCCAGCAGCCCCGGGCCCGGGCGGACTCACTGGGGACCCCCTGCTGCGGCCTGGACCCCCGCACCACCCCGGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCGAGGGCCCTGGGGCCTGGCGGCCGGGTCCAG------GCGGTGGCGGCTCCGTGTCCTCGGACTGCAGCCCCGAGAGCCCGGGC---AGCCCCCAGGGGGTCTGCGGCCGGC---AGGAGGCCG---GCAGGCAGCCAGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTGCAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCTATGTTCTCCACCGGTAAGACCAGCCGCCCGCCCGCCCATGCTG--------TCCTCC--CGCAGCCGTGC--ATGGCCTGGGCCTCGCGCCACCTGCTGCTGCTTCCGCGTCACGGACGCCACCGTGTGTGCTCGTGGTGCCTCTGT----GCTGCTCTGCTCCGCTGGCTTGTCCTGAGGCTGCCGGCCCCAGCCCTCCTGCCTGCC-T------------GACCCCGGGC--CCCAGTCTCTGGG-----AGGGTGGGGACAGGTTTGAGCCACAGTGT-GCCA---TG-CCGAGAGCCGGCC----ACACTTGCGGAGGGCCCAGGGCC---------------CCAAGTGTGGCCTTGTGAACTAGCCCCTCCCACCAGGC---TTCAGCTGG--GAGC----CCC----------------GAGAAAG------------------------------ 5 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-208332_209191 95.6% 66.3% ------------CCCCAACCAAGAGCCAGAAGCCAGGCCGCAAGGGCTTCCCGGAGCTGGTGCTGGGCACACAGGATGCGGGCTCCGAGGGGACGGCTGATGATGTGGCACCCCCCAGCCCTGGCCCTGCTCCGGAAGCCCTGTCTCGGGAAGGGCCCGGCAGTAGC---AGCCCTCGAGGTAAGGCACTGGCGGCAG------------------CGGCAGAGAAGAG---CCTGGCACAGGTGCAGACCCCGCGTGGCCCCGAGGGCCCTGGGCCTGCAGGCATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTAGGCTCCTGCAGCGGCGTGGATGCTGAGGGCCTGCGGAGGGACCGGC---TGCCCAGCCCAGGGCCTGTGGACAGGCATGCAGCCATCAGCCAGCAGCCCCAGGCCCGGGCAGACTCGCTGGGAGCCCTCCGCTGTGGCCTGGGCCCTCGAGCAATCCCAGGGAAGAGCAGG------------GGCCCTGGGACCCGGCACCTGGGGCCAGGCAGCAGCGGTTCCATGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCGGGA---AGCCCCAAGGTGGCCACCCACTGGCCCGAGGGCACCCACAGGCAGCAGCCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGTTCAAAAACTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGACCAGCGGCTCTTCCCAG-TGTCCTGTGATGTCTTCCTGCATGGCCTCTGGC--ATGGCCTGGGCCTAGTGTCACCTGCTGCTGCTTCCATGTCACAGAACCATTGCCTTGGTGTGCTC-----------------------GTGGCATCTC------------CATTGTATTTTGCTCCATTGGCTTGTCCTGCGGCCCCTTCCGCCCTGGCCC---TGCCATCTGAT-----CACGAGGCCCTGGGACTCCGGGAGGGTGT-GCTGTAGCG-G----AGTGTGGTCTCAGCACGTGCTGGGCACTTCGTGCTTTCTCAAGTC----CGGGAGACTCGCCATGTGAAGCCCCCTCC--TGCCAGGT---CTCAGCAAGGTGCTC----CCTGAGAAATGACCC----------------------------------------- 6 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-259380_260102 93.9% 63.6% ----------------------GAGCCAGAAGCCGGGCCGCAAGGCCTTCCCAGAGCTGGTCCTAGGCACGCAGGACATGGGCTCCGAGGGGGCAGCTGATGACGTGGTGCCCCCCAGCC------CTGCTCCGGAGGCCCTGGCCCGGGAAGGACCTGCTGGCAGC---AGCCCCCGAGGTAAGGCGCTGGCAGCAG------------------CAGCAGAGAGGAG---CCCGGCACGGGTGCGGTCCCCACGCATCCCCGAGGGTCCTGGGCCTGCCGGAATGGCTGCCACGTGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCGCTGGTGTGGACACTGAGGGCCTGCGGAGGGAACGGC---CACCCAGCCCAGGGCCTGCAGGCCGGCATGCGGCCATCAGCCAGCAGCCCCAGGCCCAGGCGGACTTGCTGGGGGTCCCCTGCTGCGGCCTGGGCCCCCGAGCCACCCCAGGGAGAAGCTGCGATCTGCCCAGGGGCCCCAGGGCCCGGCGGCAGGGTCCAGGTGGCAGTGGCTCTGTGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCGGACAGCCCGGGC---AGCCCCAAGGCGGCCCCACTCTGGTCCGAGGGCTCCGGC---AGGCAGCCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGCTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACCGGTAAGACCAGTGGCTCCTCCCGTGTCCCCTGTGGCGTCCTCCTGCACGGCCCCTGGC--ATGGCCCGGGCCTCATGCTGCCCGCGCTG-CTTCCCCATC--GCAGACCGTGGCCCAGTGTGCTC-----------------------CTGGCATCTC------------CATGTGATTGTGCTCCGCTGGCTTGTCCTGGGGGTCCCCTGCCTGACCTTGAGGTCCTGGGATTT-----TGAAAGGGGTGGGGACTGAGAGAGTCCGA-GTCATAATA-C----AGC--AAA--CCGAGAGTGGCCA--------GGATTGCTGGG-----------AGCCTGGAG-----------CTGCA--AGTGTGGC---CTCAGCAAGGTGCTC----CCCAGGAAAGGGCTCCCCGCTGAGCCCAA-----ACCTACTTCTCTGGCTGACCGG 7 Marmota_flaviventris-NW_023144724.1-190789_191443 92.0% 56.4% --------------CCAACCAAGAGCCAGAAGCCGGGCCGCAGGGGCTTCCCGGAGCTGGCCCTGGGCACGCAGGACACTGGCTCCGAGGGGGCAGCTGACGACGTGGTACCCCCCAGCCCTGGCCCTGCTCCCGAGGCCTTGGTGTGTGAGGGTCCCAGCAGTAGC---AGCCCGCGAGGTAAG---------------G---------------CGTCAGCAGAGAGGAGCCCAGGGCAGGTGCGGCCCCCGTGTGCCCCTGAGGGCCCCGGGGCTGCCGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCTCCGGTGTGGACGCTGAGGGCCTGCCGAGGGAGCAGC---TGCCCAGCCTGGGGCCTGCTGGAGGGCACACGGCCATCAGCCAACAGCCCCAGGCCCGGGCAGACTTGCTAGGGGACCCCCACTGCAACCTGGGCCCTCAAGCCACCCCAGGGAGAAGCAAGGAGGCCTTCAAGGGCCCCGGGGCCCGGCGGCAGGGTCTAGGCGGCAGCGGCTCCGTGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCGGACAGCCTGGGG---AGCCCCAAGGTGGCCCCCTGCCAGCCTGAGGGTGCTCACAGGCAG---CCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAACTCCCCCATGTTCTCCGCGGGTAAGGCAGCTGCCCCCCCGCAGCCTGTGTTCGC-ACCCCGGCATGCCTGGGCCAGT--GT--CCCTGCCTTGCTGCC-----------------------CCCTTGCTGTGCTCCTGCATCTCTGCTGGC----TTGACCCGCAGCCCCATCTGCCCCAGCCCTCTCCCTTG--AGCAAGAGG-CCCTGGCACT-TTGGAGGGGTGGGGACCTGGGGAGTGGGAGT-------------CACCAGTGGCCTTACTGAGAACCTG-------GAGATG--CACGTGGAGGCTC-CCTGGCTGAGCCC-CACCCCCTCCTGGGTCCAGGCAGCTTCCAGTCCTCACCTGACCGT-CCTCCAGG-ACGAGGTTCAGAGTCACCCTGCCAC------------------------------AGACCCTCTTGGGTAACCT------------- 8 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-159038_159801 93.2% 63.0% ----GGCCAGTGCCCCGACCAAGAGCCAGAAGCTGGGCTGCAAGGGCTTCCCGGAGCTGGTCCTGGGCTCACAGGACGCGGGCTCTGAGGGGGCAGCCGACGACGTGGCGCCCCCCAGCCCCGGCCCCGCTCCGGAGGCCCTGGCCCACGAAGGCACTGGTGGCAGC---AGCCCCCGAGGTAAGGCACTGGCGGCAG------------------CGGCAGAGAGGAG---CCTGGCGCGGGCACGGCCCCCGCGTGCCCCCGAGGGTCCTGGGCCTGCCGGGATGGCCGCCACGTGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCAGCGGCGTGGACACCGAGGGCCTGCAGAGGGAGCGGC---TGCCCAGTCCAGCGCCTGCAGGCAGGCCCACTGCCATTAGCCAGCAGCCCCGGGCTTGGGCCAACTCGCCCGGGGCCTCCCGCTGTGGCCCGGATCCCCAGGCCTCCTCAGGGAGAAGTAGAGGGGCACCCAGGGGCCCTGGGGCCCGGCAGCAGGGTCCAGGTGGCAGTGGCTCCTTGTTC---TCGGACTCCAGCAGCCCCGACAGCCCGGGC---AGCCCCGAGGGTGCCC------------------------CTAGGCCGCCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGTTCAAAACCTGGAGGACACCCGGAGCGAATCCCCCATGTTCTCTGCCGGTAAGCCCGTGCCCTGCCCGAGCCATCCTCCTGCCGCCTGGCACTGCTGGGCCGGGC--GTGCCAGC-----------------CGCTGCTCCCTCGTTA--CTGCCTGTCGCCTCACGTGCTCATGGCTGTGTCTCTGTGTCACTGCCCTGGTGGCTTGTCCCACGGCGATGGGCCTGGACTGTCCACCTGTCTCTGAGGCCCTGGGGCACTGGGAGGGCCAGGACACGTCGA-----GTTGATGCCCTGAGAGGTGGCAAGTGCTT-ACTG---GG-CCCAGAGCCTGATGTGAGGCCC---------------------------------CGACGCCAGGCC--------CCTCCTGC--TG----GC---TTCTGAAA---GGAG----CCCTGAGAAGGGCCTCCCACTGAGTCCGA-----GTGCACCTCCCGG--------- 9 Jaculus_jaculus-NC_059106.1-190619_191356 93.4% 57.9% ------------------CCAAGAGCCAGAAGCCAAGCCGCAAGGGCTTCCCAGAGCTGGCCCTGGGCACACAGGATGCAGGTTCCGAGGGGGCAGCTGATGATGTGGCACCCCCCAGCCCTAGCCCTGCTCCAGAGGCCCCGACCCACGAGAGGTCAGGCAGCAGC---AGCCCCCGAGGTAAGGCACCAGAGGCGGCAC---------------CGGTGACAGAGAGGAGCCCAGTACAGGGGCGGCCCTCTCAAGCTCCTGAGGGCCCTGGACCTGCAGGGATGGCTGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCACTGGTGTGGACATTGAGGGCCTACGAAGGGAGCAGC---CACCTAGTCCGGGGCCTGCTGGCAGGCACACAGCCATCAGCCAACAGCCCCAGGCCCGGGCTGATTCACTGGGCCCTGCCTGCTGCAGCCTGAGCCCTCCAGCCACCCCAGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCTAAGGGTCCCAGGGCTCGGCAGCAGGGTCCCGGCGGTG---GATCCGTGTCC---TCAGACTCCAGCAGCCCTGACAGCCCAGGC---AGCCCCAAGGTGGCCCCTTGCCAGCCAGAGGGTGCCCACAGGCAG---CAGGGGGCTCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAATTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCTGCCCCTCCTCCCACGTGCGTTCCGCATACCCGGCATGCCT-----------------GGGCCTCCACACC--TGCT-GTACT---------CCTGCAGCCCTGCTTCTCTCGCTTCATTGG-----CTTGTCCTGTGGCCTGTCTGCCTTGGCCCCACCCCTTCTGCCCAAGAGTCCCCAGCACTT-TGGAAGGGTTGGGGGCTGGAACAGTTTGAGT-------------CAGCATGGCCC-TCCTGAGAGCCAA-------GAGCTG--CTTGCTGAAGGAC-CCGGGATCCTTAG-G--CCAGGCCTCACTACAAGCTTTCCTGGCTAAGCCCAAACCTGC-TGCCCTTC-CTGAGTCTGAGAAGCT---------------CTAGCTTTCAGCTCTGTCTCCCT--------------------------------- 10 Lemur_catta-NC_059130.1-191101_191844 92.3% 57.7% -------CAGCGCCCCGACCAAGAGCCAGAAGCCAGGCCGCCGAGGCTTCCCAGAGCTGGTCCTGGGCACGCGGGACCCGGGAGCCCAGAGGACAGCTGACGACCTGGCGCCCCCCAGCCCCGGCCCCGCGCTGGAGGCCCCGGCCTGGGAGGGGCCCGGCAGCGGC---AGCCCGCGAGGTAAGGCGCCCGCCGCGG------------------TGGTGGAGAAGAG---CCTGGAGCAGGCACAGCCTCTGCGAGTGCCTGAGGGCCCGGGGCCCACGGGGATGGCCGCCACGTGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCGTGTGCCGGCGTGGATGCCGAGGGATTGTGGCGGGAGCAGC---CGGCCAGCCCGGGGCCTGCAGGTGGGCATGCCGCTGTCAGCCAGCAGCCCCGGGCCCGGGCGGACTCGCTGGGACCCCCCTGCTGCGGCCTGGACCCCAGAGCCGCCCCGGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCGAGGGCCCTGGGACCCAGCGGCCAGGTACAG------GCGGTGGCGGCTCCGTGTCCTCGGACTGCAGCCCGGAGAGCCCGGGC---AGCCCCC---------------------AGGGGGTCG---GCAGGCAGCCAGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAGCGCCTTGTTCCTTGCAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACCGGTAAGCCCAGCCGCCCGCCCGCCCGTGCTGTCCGTCCGCACGTC--CCGG------C--ATGGCCTGGGCCTCGC-----ACGTCCGCTGCTTCGTGTCGCAGACGCCGCCATGTGTGCTCGTGGCGCCTCCGC----GCCGCTCCGCTCCGCTGCCTTGTCCCATGGCTGCCGGCCCCAGCCCTCCTGCCTGCC-C----------------GCGGGC--CCCGGTCTCTGGG-----TGGGTGGGGACGAGTCTGGGTGGCAGTGT-GCCA---TG-CCAAGGGCCCCAA----GTGCAGCCTCGAGAACCAGCCCC---------------ACCAGGCTTCAGCGGGGAGCCCCGAGAAAGGGCTGAGC---CCAAACCCG--CCTC----CCCGGTCTACCGGCTGCCTGGGGGCCCTG-----GTGCCCT--------------- 11 Rattus_rattus-NC_046154.1-192571_193240 92.0% 56.6% -------------------CAAGAGCCAGAAGCCAAGTCGCAAGGGCTTCCCAGAGCTGGCCCTGGGCACACAGGACGCAGGCTCCGAGGGGGCGGCTGACGACGTGGCACCCCCTAGCCCCAACCCAGCTCTGGAGGCCCCTACTCAAGAGAGGTCAGGCAGCAGC---AGTCCCCGAGGTAAGGCACCAGCTGGAGAAG---------------CAACAGAAGAGAGAACACCGGCACAGGTGCGGTCCCCGCGTGCCCCCGAAGGCCCCGGACCTGCAGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCACCGGTATGGACGTTGAGGGCCTTCGAAGGGAGCAGC---AACCCAGTCCTGGGCCTGCAGGCAGCCGCACGGCCATCAGCCAGCAGCCCAGGGCCCGGGTAGATTCACTGGGGGGCCCTTGCTGCAGCCTGAGTCCTCGAACCACCCCAGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCAAGGGTCCTAGGGCTCGGCGGCAGGGTCCAGGTGGCG---GCTCTGTGTCC---TCCGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCAGGC---AGCCCCAAGGTGGCCCCCTGCCAGCCAGAGGGTGCTCACAGGCAG---CAGGGGGCGCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTCATTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCTGCCATTCCGCTGCATCCCATGCTCTCTCTACACCTGGCAT----------GC--CTAGGCGGTCCGTCCG--TGCC-TGCTG---------CGCCCTGCT-----TCA------------------TTTGTCCGTCAGCCTGTCTGCCTCAGACCCCTCCCCCGCCCTAATGGCC--CTGTGCTTT-AGGGGAGATTGAGGAAGAGGGGAGCTTGAGT-------------CATCATGGCAT-TTCTGAGAGCTGC-------TTGCTG--AG-------GAAC-CCAGGGGTATCCA-G--CCAGCCCTCAGCAAGGACTTCCCTGGTGCCTTGCTAGCTGCC-CTGGCTGG-CTGCTCTGATGACCTTCCTAGGTCTGG----AAAGGTCTCAGC------------TCTTAGCCCCGCCTAACCCCCCCC-------- 12 Castor_canadensis-NW_017871110.1-190355_191072 93.9% 57.4% --------------------AAGAGCCAGAAGCCAGGCCGAAAGGGCTTCCCGGAGCTGGCCCTGGGCACGCAGGACGCAGGCTTGGAGGGGGCAGCTGATGATGTGGCACCCCCCAGCCCCAGCCCGGCTCCAGAGGCCCTGGCTCACAAAGGATCCGGAGGCAGC---AGTCCCAGAGGTAAGGCGCCAGCAGCAGC---------------------GGTGGAGAAGAGTCCAGCGCAGGTGCGGCGACCATGTGCCCCTGAGGGTCCTGGGCCTGCAGGAATGGCAGCCACGTGCATGAAGTGCGTGGTGGGCTCCTGCACTGGTGTGGATGCTGAGGGCCTGAGGAGGGAGCAGC---CACCCAGCCCAGGGCCTACAGGCAGACACATGGCCATCAGCCAACAGCCCCAGGCCCGGGCAGACTTGCTGGGGGGACCCTGCTGTAGCCTGGACCCTCAAGCCACCCCAGGGAGAAGCAGAGAGGCCTCCAAGGGCCCCAGGGCCCGGCAGCAGGGTCCAGGCGGCACAGGCTCCATGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCTGGACATCCCGGGC---AGCCCCAAGGTGGCCCCCTGTCAGCCTGAGAGTGCCGACAGGCAG---CAGAGGGCCTTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGACTAATTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCTGCCACTCCTCCCGCATCTGTGTTCTCTGCACACCCTGGCATGCCT-----------GGGCCGTCCGCCAC--CCACTGTGTT--CA------CGCATCTCTGCTTTCTTTTGTTCCATTGGC----------------TTGGCCTGCCTCAGCCCCTTCCCCTCTGCCTGAGAGG--CCCTGGCGC-TTTGGAGGGGTGGAGCACGGGGAGTGTGAGT-------------CACTGTGGCAG-TGCTGAGGGTCTG-------CAGGTG--CTGGCCGAGGGCC-CTGAGCACCGCCA-G--CCAGGCCTCAGCAAGGGCTTCCCTGGCTGAGCCCAAACCTAC-CTCCCTGG-GTGACATGGCAGCTGCCCTTGGTGGCCACTCATGGGTCCCGGCAGTTTC-------------------------------------- 13 Cavia_porcellus-NT_176233.1-190819_191493 93.0% 57.1% -----------------------GAGCCAGAAGCCAGGCCGAAAGGCTTCCCGGAGCTGGTGCTGGGCACACGGGACGTGGGCTCCGAGGGGGCAGCTGACGATGTGGTGCCCCCCAGCCCCGGCCCCACTCCTGAGACCCCAGCCCATGATGGGCCAGGCAGCAGC---ATCTCCCGAGGTAAGGCACCCGG---------GGTGGCAGCAGTGGCTGCTGAACCCAGGAGCCCCACGCAGGTGCGACCTCTACGTGGCCTTGAGGGCTCTGGGCCTGCTGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCACCGGCGTGGACGCTGAGGGCCTGTGGAGGGAGCAGC---CGCCCAGCCCGGGTCCTGTGGGCAGGCTCACAGCCATCAGCCAACAGCCCCAGGCCTGGGTGGACCTGCCGGGGAGC---CCCTGTGGCCTGGGCCCTCGAGCCACCCCAGGGAGAAGCAGAGCGGCCTCTAAGAGTTCCAGGGCTCAGCCTCAGGGTGCAGGTGGCAGCGGCTCTATGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCAGGCAGCCCGGGC---AGCCCCCAAGGGGCCCCCTGCCCACCTGAGGGTGCCCACAGGCAG---CTGGGGGCGCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGCTCAAAAGCTGGAGGAGATGAGGAGTAGTTCCCCCATGTTTTCCACGGGTAAGGCCAGCTGCTCCCCCGCACCGTGTCCTCTGCATATCCGG-CATGCCTGGGCT--GT--GTGTCCCCCGCTCTGC--TCGG-----------CT----CTGCTT------CCGTGTGCTCCTGCA----------------GCCCTGTCTGCCCTGGTTCCTGCCCCTCTGCCCAAGAAACCCCGGTACTC-TGTGGGTGGCATGAAGGGAGTTTATGTCACGCCCCTGCCTGACCCGGCCAAGCCTCCTCCGGGCCCAGAGCTCCCCCTGCTGGAAGTATGCTGGAGG-ACGGTGGTG--TA-G--CCAGAGGGCGCCCACAGATGTCCTGCATCCTGGGCTGGTGCTCTGGTCTGG-CCGCGGCGC---CTGAGTCTGCAAAGGGC---------------------------------------------------------- 14 Microtus_oregoni-NW_024543064.1-192572_193241 93.0% 57.0% -------------------AAAGAGCCAGAAGCCAAGTCACAAGGGCTTCCCAGAGCTGGCCCTGGGCACACAGGACGCGGGCTCCGAGGGGGCAGCTGATGACGTGGCACCCCCTAGCCCCAACCCAGCTCTGGAGGCCCCTACTCAAGAGAAGTCAGGCAGCAGC---AGTCCCCGAGGTAAGGCACCGGCGGGAGAAG---------------CAACGGAAGAGAGAACCCCGGCACAAGTGCGGTCCCCGCATGTCCCTGAAGGCCCCGGACCTGCAGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCGCCGGGATGGACATTGAGGGCCTACGAAGGGAGCAGC---CGCCCAGCCCGGGGACTGCGGGCAGCCACACAGCCATCAGCCAGCAGCCCCGGGCCCGGGTGGATTCACTGGGGGGCCCTTGCTGCAGCCTGAGCCCTCGAGCCACCCTGGGGAGAAAGAGAGAGGCCCCCAAGGGTCCTAGGGCTCGGCGGCAGGGTCCAGGCAGTG---GCTCTGTGTCC---TTGGACTCCAGCAGCCCAGGCAGCCCGGGC---AGCCCCAAGGTGGCCCCCTGCCAGCCAGAGGGTGCTCACAGGCAG---CAGGGGCCACTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTCATTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCCGCCATTCCTCCGCGTCCCATGTGCTGCACACCGCTGCACACCCGGCAT--GC--CTAGGCAGCCCATGCC--TGCT-GTGTT---------CTTGTGGCTCTGCTTCACCTGCTCCATCAG-----CTTAACCTGCGGCCTGTCTGCCCCAGACCC------CCCCCCCCCTCTG--CCCTGCACT-TTGGAGGGGTGGGGAAGAGGGCAGTGTGAGT-------------CACCTTAGCTT-TTCTGAGGGCTGC-------ATGCTG--AG-------GAAC-CTAGGGATGTCCG-G--CCAGACCTCAGTAAGGGCTTCCCTGGTGCCTTGCTGGCTGCC-CCAGCTGG-CCTGACAGGGTCTA-----------------AAAGGTTCCAGC------------TCCTAGCCCTGCCCACC--------------- 15 Microcebus_murinus-NC_033661.1-190796_191468 93.6% 60.4% 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20 Cricetulus_griseus-NW_003616165.1-67562_68231 91.7% 55.8% 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21 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-206234_206977 91.1% 56.4% 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22 Pteropus_giganteus-NW_024346980.1-192561_193191 90.5% 56.8% 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23 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-190528_191381 93.7% 59.0% 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25 Sus_scrofa-NC_010448.4-192551_193287 89.9% 56.5% 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