Job

PLCH2_human-child_71

Submission Status: Success!

Full Status

1. Iteration

Blast

Select Sequences

Alignment

RNAcode

Input

CAAGAGCCAGAAGCCGGGCCGCAGGGGCTTCCCGGAGCTGGTCCTGGGTACACGGGACACAGGCTCCAAGGGGGTGGCAGACGATGTGGTGCCCCCCGGGCCCGGACCTGCTCCGGAAGCCCCAGCCCAGGAGGGGCCCGGCAGCGGCAGCCCCCGAGGTAAGGCGCCAGCTGCGGTGGCAGAGAAGAGCCCTGTGCGAGTGCGGCCCCCGCGTGTCCTGGACGGCCCCGGGCCTGCTGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGATCCTGCGCCGGCGTGAACACCGGGGGCCTGCAGAGGGAGCGGCCACCCAGCCCGGGGCCTGCAAGCAGGCAGGCAGCCATTCGCCAGCAGCCCCGGGCCCGGGCTGACTCACTGGGGGCCCCCTGCTGTGGCCTGGACCCTCACGCTATCCCGGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCAAGGGTCCTGGGGCCTGGAGGCAGGGTCCAGGCGGTAGCGGCTCCATGTCCTCGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCGGGCATCCCCGAAAGGTCCCCCCGCTGGCCTGAGGGTGCCTGCAGGCAACCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAGTGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCGCCGGTAAGCCCCTCTTGCCCTGCGTGGTCCTCCCGCACGCCCCTGGCATGGCTGGGCCTGGGTCACCTGCTGCTGCTTCTGCGTGGACGGTGTCGCCTCGTGTGCTCGTGCTCGTGGCTCTGTATCCGTGGCACTGTCTCCGTGGCACTCTGCTCCCTTGGCTTGCCTGTGGCCCATAGCCCCAGCCCTCCTGTCTGAGCTTGAGGCCCTGGGACTTGGGTGGAGCTGGTTTGAGGCCCGACAGGCTGGGAAGAACCAGCTGCTCTTGCTGAGGGTCTGGGGCCGGGACTGTGGCCTGACATGCTGGGCCCCTCCGGCTGGGCGCTTCCCCAAACTCACCTCCT

Selection Arguments

Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.

Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.

Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.

Results

Coding Regions.

High Scoring Segment plot

Distribution of HSS in the input sequence

HSS Segment Plot

Filter regions

p-val
Select the result by p-value. Show only results which have a lower p-value than provided. Must be above 0 and below 0.05. Check the box if you wish to see only the best segment in a group of multiple overlaping segments. Often a strong conservation signal can be observed as a shadow on the opposite strand.

Result Table

HSS id Strand Frame Length Start End Score P Show Result
1 0 + 1 220 35004 35663 119.340 0.000e+00 Plot
2 1 - 3 127 35009 35389 59.995 6.972e-10 Plot

Predicted protein sequence Download sequences as fasta

HSS id Sequence
1 0 SQKPGRRGFPELVLGTRDTGSKGVADDVVPPGPGPAPEAPAQEGPGSGSPRGKAPAAVAEKSPVRVRPPRVLDGPGPAGMAATCMKCVVGSCAGVNTGGLQRERPPSPGPASRQAAIRQQPRARADSLGAPCCGLDPHAIPGRSREAPKGPGAWRQGPGGSGSMSSDSSSPDSPGIPERSPRWPEGACRQPGALQGEMSALFAQKLEEIRSKSPMFSAGK
2 1 PSESARARGCWRMAACLLAGPGLGGRSLCRPPVFTPAQDPTTHFMHVAAIPAGPGPSRTRGGRTRTGLFSATAAGALPRGLPLPGPSWAGASGAGPGPGGTTSSATPLEPVSRVPRTSSGKPLRPGF

Alignment Info

Alignment Tree

Alignment Tree

Full Alignment

Reference sequence (1): Target
Identities normalised by aligned length.
Colored by: consensus/70%
                                                          cov    pid  1 [        .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         .         .         .         4         .         .         .         .         :         .         .         .         .         5         .         .         .         .         :         .         .         .         .         6         .         .         .         .         :         .         .         .         .         7         .         .         .         .         :         .         .         .         .         8         .         .         .         .         :         .         .         .         .         9         .         .         .         .         :         .         .         .         .         0         .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .   ] 1164
 1 Target                                              100.0% 100.0%    -------------------CAAGAGCCAGAAGCCGGGCCGCAGGGGCTTCCCGGAGCTGGTCCTGGGTACACGGGACACAGGCTCCAAGGGGGTGGCAGACGATGTGGTGCCCCCCGGGCCCGGACCTGCTCCGGAAGCCCCAGCCCAGGAGGGGCCCGGCAGCGGC---AGCCCCCGAGGTAAGGCGCCAGCTGCGG------------------TGGCAGAGAAGAG---CCCTGTGCGAGTGCGGCCCCCGCGTGTCCTGGACGGCCCCGGGCCTGCTGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGATCCTGCGCCGGCGTGAACACCGGGGGCCTGCAGAGGGAGCGGC---CACCCAGCCCGGGGCCTGCAAGCAGGCAGGCAGCCATTCGCCAGCAGCCCCGGGCCCGGGCTGACTCACTGGGGGCCCCCTGCTGTGGCCTGGACCCTCACGCTATCCCGGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCAAGGGTCCTGGGGCCTGGAGGCAGGGTCCAGGCGGTAGCGGCTCCATGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCGGGC---ATCCCCGAAAGGTCCCCCCGCTGGCCTGAGGGTGCCTGC---AGGCAACCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAGTGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCGCCGGTAAGCCCCT----CTTGCCCTGCGTGGTCCTCCCGCACGCCCC----TGGCATGGC--TGGGCCTGGGTCACCT-------GCTGCTGCTTCTGCGTG---GACGGTGTCGCCTCGTGTGCTCGTGCTCGTGGCTCTGTATCCGTGGCACTGTCTC------------CGTGGCACTCTGCTCCCTTGGCTTGCCTGTGGCCCATAGCCCCAGC------CCTCCTGTCTGAG-----CTTGAGGCCCTGGGACTTGGGTGGAGCTG-GTTTGAGGC-CCGACAGGCTGGGAAGAACCAG----------CTG-CTCTTGCTGAGGGT----CTGGGGCCGGGAC-TGTGGCCTGACATGC--TGGGCCCC---TCCGGCTGGGCGCTT----CCCCAAACTCACCTCC----------------------------T-----------     
 2 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-127718_128709         97.9%  86.3%    ---------------CGACCAAGAGTCAGAAGCCGGGCCGCAAGGGCTTCCCGGAGCTGGTCCTGGGCTCGCAGGACGCGGGCTCCAAGGGGGCGGCAGACGACATGGTGCCCCCCAGCCCTGGCCCCACTCCGGAAGCCCCGGCCCAGGAGGGGCCCAGCAGTGGC---AGCCCCCGAGGTAAGGCGCCAGCTGTGG------------------TGACGGAGAAGAG---CCCGGTGCGTGTGCGGCCCCCGCGTGTCCCAGAGGGCCCGGGGCCTGCTGGGATGGCCGCCACGTGCATGAAGTGCGTGGTGGGATCCTGCGCTGGCGTGAACACCGAGGGCCTGCGGAGGGAGCGAC---CACCCAGCCCGGGGCCGGCCAGCAGGCATGCCGCCATTCGCCAGCAGCCCCAGGCCCGCGAGGACTTGATGGGGGCCCCCTGCAGTGGCCTGGACCCTCAAGCTCTCTCGGGGAGAAGCAGAGAGGCCCACAAGGGGCCCGGGGCCTGGGGGCAGGGTCCAGGAGGTAGCGGCTCCATGTCC---TCGGACGCCAGCAGCCCAGACAGCCCGGGC---AGCCCCGAAGTGGGAGCCCGCTGGCCCGAGGGTGCCTGC---AGGCAGCCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAGTGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGATATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCGCCGGTAAGCCCCGCCCTCCTGCCCTGCGCGGTCCTCCCGCACGCCCC----TGGCATGGC--TGGACCTGGGTCACCT-------GCTGCTGCTTCTGTGTG---GACAGTGTCGCCCCGTGTGCTCG--------------------TGGCTCTGTCTC------------CGTGGCACTCTGCTCCCTTGGCTTGCCTGTGGCCTGTAGCCCCAGC------CCTCCTGTGTGAT-----CTTGAGGCCCTGGGACTCGGGTGGAGCTG-GTTTGCGGC-CCGACGGGCTGGGCTGGGGCTCTCAGCAGGAGCTG-CTCCTGCTGAG-GA----CCTGGGCCTGGAG-TGTGGCCTGACGTGC--TGGGCCCC---TCCTGCTGGGTGCTT----CCCCAAACTCACCTCC----------------------------CAGG--------     
 3 Mandrillus_leucophaeus-NW_012103199.1-235432_236066  98.1%  55.4%    --------NNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------------NNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCAGCCCCGGGCCCGGGCTGACTCACTGGGGGCCCCCTGCTGCGGCCTGGACCCTCAAGCTATCGCAGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCAAGGGTCCCGGGGCCTGGAGGCAGGGTCCAGGCGGTAGCGGCTCCGTGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCTGGGC---ATCCCTGAAAGGTCCCCCCACTGGCCTGAGGGTGCCT---GCAGGCAACCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAGTGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACCGGTAAGCCCCTCCTGCCCTGCGCGGTCCTCCCGCACGCCCC--------TGGCATGGC--TGGGCCTGGGTCACC-------TGCTGCTGCTTCTGCGTA---GACGGCATCGTCTCGTGTGCTCGTGGCTCTGTCTCCGTGGCACTGTCTC------------------CGTGGCACTCTGCTCCCTTGGCTTGCCTGTGGCCGGTAGCCCCAGC------CCTCCTGTCTGAC-----CTTGAGGCCCTGGGACTTGGGGTGGAGCTGGTTTGAGGC-CCGACAGGCTGGAAAGAACCAG-----------CTGCTCTTGCTGAGGGT----CCGGGACCAGGAG-TGTGGCCTGACATGC--TGGGCCCC---TCTGACTGGGCGCTT----CCTCAAACTCACCTCCCGG-------------------------------------     
 4 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-192617_193446   93.0%  61.4%    -------CAGCGCCCCGACCAAGAGCCAGAAGCCCGGCCGCAAAGGCTGCCCAGAGCTGGTCCTGGGCACGCGGGACACGGGCGCCAAGAGGACAGCTGATGACGCGGCGCCCCCCAGCCCTGGCCCGGCCCTGGAGGCCCCGGCCTGGGAGGGGCCCGGCAGCGGC---AGCCCCCGAGGTAAGGTGCCTGCAGCGG------------------AGGCGGAGAGGAG---CCCGGCGCAGGCACGGCCTCTGCGGGTGACTGAGGGCCTGGGGCCCGCGGGGATGGCCGCCACGTGCATGAAGTGCGTGGTGGGTTCCTGTGCCGGCGTGGGTGCTGAGGGCTTGTGGCGGGAGCAGC---CAGCTAGCCCGGGGCCCGCAGGTGGGCACACGGCCATCAGCCAGCAGCCCCGGGCCCGGGCGGACTCACTGGGGACCCCCTGCTGCGGCCTGGACCCCCGCACCACCCCGGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCGAGGGCCCTGGGGCCTGGCGGCCGGGTCCAG------GCGGTGGCGGCTCCGTGTCCTCGGACTGCAGCCCCGAGAGCCCGGGC---AGCCCCCAGGGGGTCTGCGGCCGGC---AGGAGGCCG---GCAGGCAGCCAGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTGCAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCTATGTTCTCCACCGGTAAGACCAGCCGCCCGCCCGCCCATGCTG--------TCCTCC--CGCAGCCGTGC--ATGGCCTGGGCCTCGCGCCACCTGCTGCTGCTTCCGCGTCACGGACGCCACCGTGTGTGCTCGTGGTGCCTCTGT----GCTGCTCTGCTCCGCTGGCTTGTCCTGAGGCTGCCGGCCCCAGCCCTCCTGCCTGCC-T------------GACCCCGGGC--CCCAGTCTCTGGG-----AGGGTGGGGACAGGTTTGAGCCACAGTGT-GCCA---TG-CCGAGAGCCGGCC----ACACTTGCGGAGGGCCCAGGGCC---------------CCAAGTGTGGCCTTGTGAACTAGCCCCTCCCACCAGGC---TTCAGCTGG--GAGC----CCC----------------GAGAAAG------------------------------     
 5 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-208332_209191        95.6%  66.3%    ------------CCCCAACCAAGAGCCAGAAGCCAGGCCGCAAGGGCTTCCCGGAGCTGGTGCTGGGCACACAGGATGCGGGCTCCGAGGGGACGGCTGATGATGTGGCACCCCCCAGCCCTGGCCCTGCTCCGGAAGCCCTGTCTCGGGAAGGGCCCGGCAGTAGC---AGCCCTCGAGGTAAGGCACTGGCGGCAG------------------CGGCAGAGAAGAG---CCTGGCACAGGTGCAGACCCCGCGTGGCCCCGAGGGCCCTGGGCCTGCAGGCATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTAGGCTCCTGCAGCGGCGTGGATGCTGAGGGCCTGCGGAGGGACCGGC---TGCCCAGCCCAGGGCCTGTGGACAGGCATGCAGCCATCAGCCAGCAGCCCCAGGCCCGGGCAGACTCGCTGGGAGCCCTCCGCTGTGGCCTGGGCCCTCGAGCAATCCCAGGGAAGAGCAGG------------GGCCCTGGGACCCGGCACCTGGGGCCAGGCAGCAGCGGTTCCATGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCGGGA---AGCCCCAAGGTGGCCACCCACTGGCCCGAGGGCACCCACAGGCAGCAGCCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGTTCAAAAACTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGACCAGCGGCTCTTCCCAG-TGTCCTGTGATGTCTTCCTGCATGGCCTCTGGC--ATGGCCTGGGCCTAGTGTCACCTGCTGCTGCTTCCATGTCACAGAACCATTGCCTTGGTGTGCTC-----------------------GTGGCATCTC------------CATTGTATTTTGCTCCATTGGCTTGTCCTGCGGCCCCTTCCGCCCTGGCCC---TGCCATCTGAT-----CACGAGGCCCTGGGACTCCGGGAGGGTGT-GCTGTAGCG-G----AGTGTGGTCTCAGCACGTGCTGGGCACTTCGTGCTTTCTCAAGTC----CGGGAGACTCGCCATGTGAAGCCCCCTCC--TGCCAGGT---CTCAGCAAGGTGCTC----CCTGAGAAATGACCC-----------------------------------------     
 6 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-259380_260102  93.9%  63.6%    ----------------------GAGCCAGAAGCCGGGCCGCAAGGCCTTCCCAGAGCTGGTCCTAGGCACGCAGGACATGGGCTCCGAGGGGGCAGCTGATGACGTGGTGCCCCCCAGCC------CTGCTCCGGAGGCCCTGGCCCGGGAAGGACCTGCTGGCAGC---AGCCCCCGAGGTAAGGCGCTGGCAGCAG------------------CAGCAGAGAGGAG---CCCGGCACGGGTGCGGTCCCCACGCATCCCCGAGGGTCCTGGGCCTGCCGGAATGGCTGCCACGTGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCGCTGGTGTGGACACTGAGGGCCTGCGGAGGGAACGGC---CACCCAGCCCAGGGCCTGCAGGCCGGCATGCGGCCATCAGCCAGCAGCCCCAGGCCCAGGCGGACTTGCTGGGGGTCCCCTGCTGCGGCCTGGGCCCCCGAGCCACCCCAGGGAGAAGCTGCGATCTGCCCAGGGGCCCCAGGGCCCGGCGGCAGGGTCCAGGTGGCAGTGGCTCTGTGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCGGACAGCCCGGGC---AGCCCCAAGGCGGCCCCACTCTGGTCCGAGGGCTCCGGC---AGGCAGCCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGCTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACCGGTAAGACCAGTGGCTCCTCCCGTGTCCCCTGTGGCGTCCTCCTGCACGGCCCCTGGC--ATGGCCCGGGCCTCATGCTGCCCGCGCTG-CTTCCCCATC--GCAGACCGTGGCCCAGTGTGCTC-----------------------CTGGCATCTC------------CATGTGATTGTGCTCCGCTGGCTTGTCCTGGGGGTCCCCTGCCTGACCTTGAGGTCCTGGGATTT-----TGAAAGGGGTGGGGACTGAGAGAGTCCGA-GTCATAATA-C----AGC--AAA--CCGAGAGTGGCCA--------GGATTGCTGGG-----------AGCCTGGAG-----------CTGCA--AGTGTGGC---CTCAGCAAGGTGCTC----CCCAGGAAAGGGCTCCCCGCTGAGCCCAA-----ACCTACTTCTCTGGCTGACCGG     
 7 Marmota_flaviventris-NW_023144724.1-190789_191443    92.0%  56.4%    --------------CCAACCAAGAGCCAGAAGCCGGGCCGCAGGGGCTTCCCGGAGCTGGCCCTGGGCACGCAGGACACTGGCTCCGAGGGGGCAGCTGACGACGTGGTACCCCCCAGCCCTGGCCCTGCTCCCGAGGCCTTGGTGTGTGAGGGTCCCAGCAGTAGC---AGCCCGCGAGGTAAG---------------G---------------CGTCAGCAGAGAGGAGCCCAGGGCAGGTGCGGCCCCCGTGTGCCCCTGAGGGCCCCGGGGCTGCCGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCTCCGGTGTGGACGCTGAGGGCCTGCCGAGGGAGCAGC---TGCCCAGCCTGGGGCCTGCTGGAGGGCACACGGCCATCAGCCAACAGCCCCAGGCCCGGGCAGACTTGCTAGGGGACCCCCACTGCAACCTGGGCCCTCAAGCCACCCCAGGGAGAAGCAAGGAGGCCTTCAAGGGCCCCGGGGCCCGGCGGCAGGGTCTAGGCGGCAGCGGCTCCGTGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCGGACAGCCTGGGG---AGCCCCAAGGTGGCCCCCTGCCAGCCTGAGGGTGCTCACAGGCAG---CCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAACTCCCCCATGTTCTCCGCGGGTAAGGCAGCTGCCCCCCCGCAGCCTGTGTTCGC-ACCCCGGCATGCCTGGGCCAGT--GT--CCCTGCCTTGCTGCC-----------------------CCCTTGCTGTGCTCCTGCATCTCTGCTGGC----TTGACCCGCAGCCCCATCTGCCCCAGCCCTCTCCCTTG--AGCAAGAGG-CCCTGGCACT-TTGGAGGGGTGGGGACCTGGGGAGTGGGAGT-------------CACCAGTGGCCTTACTGAGAACCTG-------GAGATG--CACGTGGAGGCTC-CCTGGCTGAGCCC-CACCCCCTCCTGGGTCCAGGCAGCTTCCAGTCCTCACCTGACCGT-CCTCCAGG-ACGAGGTTCAGAGTCACCCTGCCAC------------------------------AGACCCTCTTGGGTAACCT-------------     
 8 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-159038_159801        93.2%  63.0%    ----GGCCAGTGCCCCGACCAAGAGCCAGAAGCTGGGCTGCAAGGGCTTCCCGGAGCTGGTCCTGGGCTCACAGGACGCGGGCTCTGAGGGGGCAGCCGACGACGTGGCGCCCCCCAGCCCCGGCCCCGCTCCGGAGGCCCTGGCCCACGAAGGCACTGGTGGCAGC---AGCCCCCGAGGTAAGGCACTGGCGGCAG------------------CGGCAGAGAGGAG---CCTGGCGCGGGCACGGCCCCCGCGTGCCCCCGAGGGTCCTGGGCCTGCCGGGATGGCCGCCACGTGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCAGCGGCGTGGACACCGAGGGCCTGCAGAGGGAGCGGC---TGCCCAGTCCAGCGCCTGCAGGCAGGCCCACTGCCATTAGCCAGCAGCCCCGGGCTTGGGCCAACTCGCCCGGGGCCTCCCGCTGTGGCCCGGATCCCCAGGCCTCCTCAGGGAGAAGTAGAGGGGCACCCAGGGGCCCTGGGGCCCGGCAGCAGGGTCCAGGTGGCAGTGGCTCCTTGTTC---TCGGACTCCAGCAGCCCCGACAGCCCGGGC---AGCCCCGAGGGTGCCC------------------------CTAGGCCGCCGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGTTCAAAACCTGGAGGACACCCGGAGCGAATCCCCCATGTTCTCTGCCGGTAAGCCCGTGCCCTGCCCGAGCCATCCTCCTGCCGCCTGGCACTGCTGGGCCGGGC--GTGCCAGC-----------------CGCTGCTCCCTCGTTA--CTGCCTGTCGCCTCACGTGCTCATGGCTGTGTCTCTGTGTCACTGCCCTGGTGGCTTGTCCCACGGCGATGGGCCTGGACTGTCCACCTGTCTCTGAGGCCCTGGGGCACTGGGAGGGCCAGGACACGTCGA-----GTTGATGCCCTGAGAGGTGGCAAGTGCTT-ACTG---GG-CCCAGAGCCTGATGTGAGGCCC---------------------------------CGACGCCAGGCC--------CCTCCTGC--TG----GC---TTCTGAAA---GGAG----CCCTGAGAAGGGCCTCCCACTGAGTCCGA-----GTGCACCTCCCGG---------     
 9 Jaculus_jaculus-NC_059106.1-190619_191356            93.4%  57.9%    ------------------CCAAGAGCCAGAAGCCAAGCCGCAAGGGCTTCCCAGAGCTGGCCCTGGGCACACAGGATGCAGGTTCCGAGGGGGCAGCTGATGATGTGGCACCCCCCAGCCCTAGCCCTGCTCCAGAGGCCCCGACCCACGAGAGGTCAGGCAGCAGC---AGCCCCCGAGGTAAGGCACCAGAGGCGGCAC---------------CGGTGACAGAGAGGAGCCCAGTACAGGGGCGGCCCTCTCAAGCTCCTGAGGGCCCTGGACCTGCAGGGATGGCTGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCACTGGTGTGGACATTGAGGGCCTACGAAGGGAGCAGC---CACCTAGTCCGGGGCCTGCTGGCAGGCACACAGCCATCAGCCAACAGCCCCAGGCCCGGGCTGATTCACTGGGCCCTGCCTGCTGCAGCCTGAGCCCTCCAGCCACCCCAGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCTAAGGGTCCCAGGGCTCGGCAGCAGGGTCCCGGCGGTG---GATCCGTGTCC---TCAGACTCCAGCAGCCCTGACAGCCCAGGC---AGCCCCAAGGTGGCCCCTTGCCAGCCAGAGGGTGCCCACAGGCAG---CAGGGGGCTCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAATTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCTGCCCCTCCTCCCACGTGCGTTCCGCATACCCGGCATGCCT-----------------GGGCCTCCACACC--TGCT-GTACT---------CCTGCAGCCCTGCTTCTCTCGCTTCATTGG-----CTTGTCCTGTGGCCTGTCTGCCTTGGCCCCACCCCTTCTGCCCAAGAGTCCCCAGCACTT-TGGAAGGGTTGGGGGCTGGAACAGTTTGAGT-------------CAGCATGGCCC-TCCTGAGAGCCAA-------GAGCTG--CTTGCTGAAGGAC-CCGGGATCCTTAG-G--CCAGGCCTCACTACAAGCTTTCCTGGCTAAGCCCAAACCTGC-TGCCCTTC-CTGAGTCTGAGAAGCT---------------CTAGCTTTCAGCTCTGTCTCCCT---------------------------------     
10 Lemur_catta-NC_059130.1-191101_191844                92.3%  57.7%    -------CAGCGCCCCGACCAAGAGCCAGAAGCCAGGCCGCCGAGGCTTCCCAGAGCTGGTCCTGGGCACGCGGGACCCGGGAGCCCAGAGGACAGCTGACGACCTGGCGCCCCCCAGCCCCGGCCCCGCGCTGGAGGCCCCGGCCTGGGAGGGGCCCGGCAGCGGC---AGCCCGCGAGGTAAGGCGCCCGCCGCGG------------------TGGTGGAGAAGAG---CCTGGAGCAGGCACAGCCTCTGCGAGTGCCTGAGGGCCCGGGGCCCACGGGGATGGCCGCCACGTGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCGTGTGCCGGCGTGGATGCCGAGGGATTGTGGCGGGAGCAGC---CGGCCAGCCCGGGGCCTGCAGGTGGGCATGCCGCTGTCAGCCAGCAGCCCCGGGCCCGGGCGGACTCGCTGGGACCCCCCTGCTGCGGCCTGGACCCCAGAGCCGCCCCGGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCGAGGGCCCTGGGACCCAGCGGCCAGGTACAG------GCGGTGGCGGCTCCGTGTCCTCGGACTGCAGCCCGGAGAGCCCGGGC---AGCCCCC---------------------AGGGGGTCG---GCAGGCAGCCAGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAGCGCCTTGTTCCTTGCAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACCGGTAAGCCCAGCCGCCCGCCCGCCCGTGCTGTCCGTCCGCACGTC--CCGG------C--ATGGCCTGGGCCTCGC-----ACGTCCGCTGCTTCGTGTCGCAGACGCCGCCATGTGTGCTCGTGGCGCCTCCGC----GCCGCTCCGCTCCGCTGCCTTGTCCCATGGCTGCCGGCCCCAGCCCTCCTGCCTGCC-C----------------GCGGGC--CCCGGTCTCTGGG-----TGGGTGGGGACGAGTCTGGGTGGCAGTGT-GCCA---TG-CCAAGGGCCCCAA----GTGCAGCCTCGAGAACCAGCCCC---------------ACCAGGCTTCAGCGGGGAGCCCCGAGAAAGGGCTGAGC---CCAAACCCG--CCTC----CCCGGTCTACCGGCTGCCTGGGGGCCCTG-----GTGCCCT---------------     
11 Rattus_rattus-NC_046154.1-192571_193240              92.0%  56.6%    -------------------CAAGAGCCAGAAGCCAAGTCGCAAGGGCTTCCCAGAGCTGGCCCTGGGCACACAGGACGCAGGCTCCGAGGGGGCGGCTGACGACGTGGCACCCCCTAGCCCCAACCCAGCTCTGGAGGCCCCTACTCAAGAGAGGTCAGGCAGCAGC---AGTCCCCGAGGTAAGGCACCAGCTGGAGAAG---------------CAACAGAAGAGAGAACACCGGCACAGGTGCGGTCCCCGCGTGCCCCCGAAGGCCCCGGACCTGCAGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCACCGGTATGGACGTTGAGGGCCTTCGAAGGGAGCAGC---AACCCAGTCCTGGGCCTGCAGGCAGCCGCACGGCCATCAGCCAGCAGCCCAGGGCCCGGGTAGATTCACTGGGGGGCCCTTGCTGCAGCCTGAGTCCTCGAACCACCCCAGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCAAGGGTCCTAGGGCTCGGCGGCAGGGTCCAGGTGGCG---GCTCTGTGTCC---TCCGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCAGGC---AGCCCCAAGGTGGCCCCCTGCCAGCCAGAGGGTGCTCACAGGCAG---CAGGGGGCGCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTCATTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCTGCCATTCCGCTGCATCCCATGCTCTCTCTACACCTGGCAT----------GC--CTAGGCGGTCCGTCCG--TGCC-TGCTG---------CGCCCTGCT-----TCA------------------TTTGTCCGTCAGCCTGTCTGCCTCAGACCCCTCCCCCGCCCTAATGGCC--CTGTGCTTT-AGGGGAGATTGAGGAAGAGGGGAGCTTGAGT-------------CATCATGGCAT-TTCTGAGAGCTGC-------TTGCTG--AG-------GAAC-CCAGGGGTATCCA-G--CCAGCCCTCAGCAAGGACTTCCCTGGTGCCTTGCTAGCTGCC-CTGGCTGG-CTGCTCTGATGACCTTCCTAGGTCTGG----AAAGGTCTCAGC------------TCTTAGCCCCGCCTAACCCCCCCC--------     
12 Castor_canadensis-NW_017871110.1-190355_191072       93.9%  57.4%    --------------------AAGAGCCAGAAGCCAGGCCGAAAGGGCTTCCCGGAGCTGGCCCTGGGCACGCAGGACGCAGGCTTGGAGGGGGCAGCTGATGATGTGGCACCCCCCAGCCCCAGCCCGGCTCCAGAGGCCCTGGCTCACAAAGGATCCGGAGGCAGC---AGTCCCAGAGGTAAGGCGCCAGCAGCAGC---------------------GGTGGAGAAGAGTCCAGCGCAGGTGCGGCGACCATGTGCCCCTGAGGGTCCTGGGCCTGCAGGAATGGCAGCCACGTGCATGAAGTGCGTGGTGGGCTCCTGCACTGGTGTGGATGCTGAGGGCCTGAGGAGGGAGCAGC---CACCCAGCCCAGGGCCTACAGGCAGACACATGGCCATCAGCCAACAGCCCCAGGCCCGGGCAGACTTGCTGGGGGGACCCTGCTGTAGCCTGGACCCTCAAGCCACCCCAGGGAGAAGCAGAGAGGCCTCCAAGGGCCCCAGGGCCCGGCAGCAGGGTCCAGGCGGCACAGGCTCCATGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCTGGACATCCCGGGC---AGCCCCAAGGTGGCCCCCTGTCAGCCTGAGAGTGCCGACAGGCAG---CAGAGGGCCTTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGACTAATTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCTGCCACTCCTCCCGCATCTGTGTTCTCTGCACACCCTGGCATGCCT-----------GGGCCGTCCGCCAC--CCACTGTGTT--CA------CGCATCTCTGCTTTCTTTTGTTCCATTGGC----------------TTGGCCTGCCTCAGCCCCTTCCCCTCTGCCTGAGAGG--CCCTGGCGC-TTTGGAGGGGTGGAGCACGGGGAGTGTGAGT-------------CACTGTGGCAG-TGCTGAGGGTCTG-------CAGGTG--CTGGCCGAGGGCC-CTGAGCACCGCCA-G--CCAGGCCTCAGCAAGGGCTTCCCTGGCTGAGCCCAAACCTAC-CTCCCTGG-GTGACATGGCAGCTGCCCTTGGTGGCCACTCATGGGTCCCGGCAGTTTC--------------------------------------     
13 Cavia_porcellus-NT_176233.1-190819_191493            93.0%  57.1%    -----------------------GAGCCAGAAGCCAGGCCGAAAGGCTTCCCGGAGCTGGTGCTGGGCACACGGGACGTGGGCTCCGAGGGGGCAGCTGACGATGTGGTGCCCCCCAGCCCCGGCCCCACTCCTGAGACCCCAGCCCATGATGGGCCAGGCAGCAGC---ATCTCCCGAGGTAAGGCACCCGG---------GGTGGCAGCAGTGGCTGCTGAACCCAGGAGCCCCACGCAGGTGCGACCTCTACGTGGCCTTGAGGGCTCTGGGCCTGCTGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCACCGGCGTGGACGCTGAGGGCCTGTGGAGGGAGCAGC---CGCCCAGCCCGGGTCCTGTGGGCAGGCTCACAGCCATCAGCCAACAGCCCCAGGCCTGGGTGGACCTGCCGGGGAGC---CCCTGTGGCCTGGGCCCTCGAGCCACCCCAGGGAGAAGCAGAGCGGCCTCTAAGAGTTCCAGGGCTCAGCCTCAGGGTGCAGGTGGCAGCGGCTCTATGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCAGGCAGCCCGGGC---AGCCCCCAAGGGGCCCCCTGCCCACCTGAGGGTGCCCACAGGCAG---CTGGGGGCGCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGCTCAAAAGCTGGAGGAGATGAGGAGTAGTTCCCCCATGTTTTCCACGGGTAAGGCCAGCTGCTCCCCCGCACCGTGTCCTCTGCATATCCGG-CATGCCTGGGCT--GT--GTGTCCCCCGCTCTGC--TCGG-----------CT----CTGCTT------CCGTGTGCTCCTGCA----------------GCCCTGTCTGCCCTGGTTCCTGCCCCTCTGCCCAAGAAACCCCGGTACTC-TGTGGGTGGCATGAAGGGAGTTTATGTCACGCCCCTGCCTGACCCGGCCAAGCCTCCTCCGGGCCCAGAGCTCCCCCTGCTGGAAGTATGCTGGAGG-ACGGTGGTG--TA-G--CCAGAGGGCGCCCACAGATGTCCTGCATCCTGGGCTGGTGCTCTGGTCTGG-CCGCGGCGC---CTGAGTCTGCAAAGGGC----------------------------------------------------------     
14 Microtus_oregoni-NW_024543064.1-192572_193241        93.0%  57.0%    -------------------AAAGAGCCAGAAGCCAAGTCACAAGGGCTTCCCAGAGCTGGCCCTGGGCACACAGGACGCGGGCTCCGAGGGGGCAGCTGATGACGTGGCACCCCCTAGCCCCAACCCAGCTCTGGAGGCCCCTACTCAAGAGAAGTCAGGCAGCAGC---AGTCCCCGAGGTAAGGCACCGGCGGGAGAAG---------------CAACGGAAGAGAGAACCCCGGCACAAGTGCGGTCCCCGCATGTCCCTGAAGGCCCCGGACCTGCAGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCGCCGGGATGGACATTGAGGGCCTACGAAGGGAGCAGC---CGCCCAGCCCGGGGACTGCGGGCAGCCACACAGCCATCAGCCAGCAGCCCCGGGCCCGGGTGGATTCACTGGGGGGCCCTTGCTGCAGCCTGAGCCCTCGAGCCACCCTGGGGAGAAAGAGAGAGGCCCCCAAGGGTCCTAGGGCTCGGCGGCAGGGTCCAGGCAGTG---GCTCTGTGTCC---TTGGACTCCAGCAGCCCAGGCAGCCCGGGC---AGCCCCAAGGTGGCCCCCTGCCAGCCAGAGGGTGCTCACAGGCAG---CAGGGGCCACTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTCATTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCCGCCATTCCTCCGCGTCCCATGTGCTGCACACCGCTGCACACCCGGCAT--GC--CTAGGCAGCCCATGCC--TGCT-GTGTT---------CTTGTGGCTCTGCTTCACCTGCTCCATCAG-----CTTAACCTGCGGCCTGTCTGCCCCAGACCC------CCCCCCCCCTCTG--CCCTGCACT-TTGGAGGGGTGGGGAAGAGGGCAGTGTGAGT-------------CACCTTAGCTT-TTCTGAGGGCTGC-------ATGCTG--AG-------GAAC-CTAGGGATGTCCG-G--CCAGACCTCAGTAAGGGCTTCCCTGGTGCCTTGCTGGCTGCC-CCAGCTGG-CCTGACAGGGTCTA-----------------AAAGGTTCCAGC------------TCCTAGCCCTGCCCACC---------------     
15 Microcebus_murinus-NC_033661.1-190796_191468         93.6%  60.4%    ---------------------AGAGCCAGAAGCCGGGCCGCAAGGGCTTCCCGGAGCTGGTCCTGGGCACGCAGGACCCGGGCGCCGAGAGGGCAGCCCACGACGTGGCGCCCCCCAGCCCCCGCCCCGCGCCGGAGGCCCCGGCCTGGGAGGGGCCCGGCAGCGGCGGCAGCCCCCGAGGTAAGGCGCCTGCAGCGG------------------CGGTGGAGAGGAGCCCGGCGGCGCAGGCACGGCTCCCAAGGGTGCCTGAGGGCCCGGGGCCCGCGGGGATGGCCGCCACGTGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCGCCGGCGTGGAAGCCGAGGGCTTGTGGCGGGAGCGGC---CAGCCAGCCCGGGGCCTGCAGGTGGGCACGTGGCCGTCAGCCAGCAGCCCCGGGCCCGGGCGGACTCACCGGGGACCCCCTGCTGCGGCCTGGACCCCCGCGCCGCCCCGGGGAGAAGCAAGGAGCCCTCCGGGGGCCCTGGGGCCCCGCAGCCGGGTCTGGGCGGCGGCGGCGGCGGCTCCGTGACCTCGGACTGCAGCCCGGAGAGCCCAGGC---AGCGCCCAGGGGGTGTGTGGCTGGC---AGGAGGCCG---GCAGGCAGCCCGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTTGTGGAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTAAATCCCCTATGTTCTCCACCGGTAAGACCAGCCGCCCGCCTGCCCGCCTGCCCGCGCCGTCCTCC--TGCAGCCGTGC--ATGGCCTGGGCCTTGACCAC-------CTGCTTCCGCGTCCCAG-ACGCCGCCTGTGTGCTCGTGGCGCCTCCAT----GCTGCTCTG-CCCGCTGGCTTGTCCCGTGGCTGCCGGCCCCAGCACTCCTGCCTGCC-T------------GACCACGGGT--CCCGGTCTCTGGG-----CGGGTGGGGACGAGTCTGAGCCACGGTGT-GCCA---CG-CTGGGAGCCGGCC----ACGCTTGCCGAGGGCCCGGGCCC---------------CGAAGTGTGGCCTCTCAAACCAGCCTCTGCCTCGGTCT---TCAGCAGGG--GCCC----CCA----------------GAAAGGGCTG-----G---------------------     
16 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-191194_191946     93.0%  58.1%    ----------------------------GAAGCCGGGCCGCAAGGGCTTCACGGAGCTGGCACTGGGCACACGGGACGTGGGCTCTGAGGGGGCAGCAGACGACGTGGTGCCCCCCAGCCCTGGCCCCCCTGCAGAGACCCCGGCCCACAATGGCCTGGGCAGCAGC---AACTCCCGAGGTAAGGCACCGGCAGCCGTGGCGGCGGCAGCAGTGGCTGCTGAGCCCAGGAGCGCTGCACAGGTGCGGCCTCTGCGTGGCCCCGAGGGCTCTGGGCCTGCCGGGATGGCCTCCACGTGCATGAAGTGCGTGGTCGGCTCCTGCACCGGTGTGGACGCGGAGGGCCTGTGGCGGGAGCAGC---CGCCCAGCCCAGGGCCTTCAGGCAGGCTCACGGCCATCAGCCAACAGCCCCAGGCCTGGGTGGACACACCGCGGAGC---CCCTGTGGCCTGGGCCCTCGAGCCACCCCGGGGAGAAGCCAAGAGGCCTCTAAGGGGCCTGGGGCCCAGCGGCAGGGCCCAGGCGGCAGCGGCTCTGTGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCAGGCAGCCCAGGC---AGCTCCCAAGTGGTCCCCTGCCCGCCTGAGGGTGCCCACAGGCAG---CTGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTTGCTCAAAAGCTGGAGGAGATGAGGAGTAGTTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCAGCCGTTCCTCTGCGCCGTGCCCTCCACCTGCCCCGGCATGCCTGGGCC--TC--GTGTCTCCTGCTGTGC--TCGT-----------GT--CTCTGCTT------CAGTGTG-CTCTTCA----------------GCCTTGTCTGCCCTGGCTCCTGCCCCTCTGCACAAGAGGCCCTGGCACTC-TGCGGGTGGCACCCCTT------------------------GTCCAGCCAGGCCTCTGCCAGTCCAGGGCTCCCCCTGCTGGGAAGTCTGCCAAAAG-GCAGTGGTG--TA-G--CCATAGGGCGCCCCCAGATGTCCTGCAGCCTGGGCTGGTGCTCCGGCCGGG-ATGCTGGGC---CTGAGTTTGCAAAGGGC--TGGGACTGCTTCCCTTAC--------------------------------------     
17 Heterocephalus_glaber-NW_004624818.1-191274_192004   91.0%  56.1%    -----------------ACCAAGAGCCAGAAGCCGGGCCGCAAGGGCTTCCCAGAGCTGGCGCTGGGCACACAGGACGTGGGCTCTGAGAGGGCAGCTGACGATGTGGTGTCCCCCAGCCCTGGCCCCACTCCAGAGACCCCGGCCCGTGACGCACCAGGCAGCAGC---ATCCCCCGAGGTAAGGCACCGGCAGCGGCTT---------------CAGTGGAGCGAAGGAGCCCCGCGCAGGTGCGGCCCCCACGTGCCCTTGAGGGCTCTGGGCCCGCGGGGATGGCTGCTACGTGCATGAAGTGCGTGGTGGGCTCCTGCACCCGTGTGGACTCCGAGGGCCTGTGGAGGGAGCAGC---CGCCCAGCCCAGGGCCTGCAGGCAGGCTCACCGCCATCCGCCAACAGCCCCAGGCCTGGGTGGACAAGCCGGGGAGT---CCCTGCG------GCCCCCGAGCCACCCCGGGGAGAAGCAAAGAGGCCTCTAAGGGCCCTGGGGCCCGGCGTCAGGGCGCAGGCAGCAGCGGCTCTGTGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCTGGGC---AGTCCCCAAGTGGCCCCCTGCCCGCCTGAGGGTGTCCACAGGCAG---CTGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGCTCAAAAGCTGGAGGAGATGAGGAGTAGTTCCCCCATGCTCTCCGCCGGTAAGGCCAGCCGCTCCTCCGCACTGCGTGCCCTGCACACCCCAGCATGCCTGGGCC--TC--CTGT-CCCTGCTGTGC--TCAT-----------GT--CTCTGCTT------CAGTGTGCTCCCGCT----------------GCCCTGCCTGCCCTGGCTCCTGCCCCTCTGCACCAGAAGCCCCGGCCCTC-TATGGGTGACACTAGGGGAATCGGTCCCACTCACTGTGCTGGACCCCTGGCCCAGTGGTGCAGCGATAGGGTGCCCCCGATGTCCTGC-------------------------------------------------------GCCCTGATGGTACTCGGGCCTGG-ACGCTGGGC---CTCAGTTTGCGGAAGGC--TGAGCTCGCTTCCCTTGCCCTGG-GCCCACGACTCTGCCCCCACTCCGCAGACA--     
18 Mesocricetus_auratus-NW_024429219.1-192594_193310    93.8%  59.4%    --------------------AAGAGCCAGAAGCCAAGTCGCAAGGGCTTCCCAGAGCTGGCCCTGGGCACACAGGACACGGGTTCTGAGGGGGCGGCTGACGATGTGGCGCCCCCTAGCCCCAACCCAGCTCTGGAGGCCCCTACTCAAGAGAAGTCAGGCAGCGGC---AGTCCCCGAGGTAAGGCACCGGCA---------------------------GAAGAGAGAACCCCGGCACAGGTGCGGTCCCCACATGTCCCCGAAGGCCCTGGACCTGCAGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCGCCGGTATGGACATTGAGGGCCTGCGAAGGGAGCAGCAGCAGCCCAGCCCGGGGAATGCGGGCAGCCGCGTGGCCATCAGCCAGCAGCCCCGGGCCCGGGTAGATTCACTGGGGGACGCTTGCTGCAGCCTGAGCCCTCGAGCCACCCCGGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCAAGGGCCCTAGGGCTCGGCGGCAGGGCCCAGGCAGCG---GCTCTGTGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCAGGCAGCCCCAGCAGCAGCCCCAAGGCGGCCCCCTGCCAGCCAGAGGGTGCGCGCAGGCAGCAGCAGGGGGCGCTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTCATTCCCCCATGTTCTCCACCGGTAAGGCCTGCCACTCCTCCCCGTCGTCCCGTGCTCTGCACGCCTGGCA-------T--GC--CTCGGCAGTCCGCGCC--TGCT-GTGCT--CTCGTGGCTTCTGCTTCGTTTCCGTTTGCTCCATCAGCTTAACCCGTGGCCTGGCCTGTCTGCCTCAGACCCCTCCCCTCTGACCAAATGGCCCCCTGCACT-TTGGAGGGATGGGGAAGAGGGGAGTTCGAGT-------------CGCCATGGGCA-TTTTCTGA------------GGGCTG--CTTGCAGAGGAAC-CCAAGGATGTCCA-G--CCAGCCCTCAGTGAGGGCTTCGCTGATGCCTCACTGACCCCC-CCCACCCC-ATGACCTTCCTAGGTCGCCCTCCAGGG----CCCG----------------------------------------------------     
19 Nannospalax_galili-NW_008355419.1-190481_191147      93.0%  55.8%    ------------------CCAAGAGCCAGAAGCCAAGACGCAAGGGCTTCCCCGAGCTGGCCCTGGGCACTCAGGACGCAGGCTCCGAGGGGGCAGCTGATGACATAGTACCCTCTAGCCCCAACCCAGCTCTGGAGGCCCCTACCCACGAGAGGTCAGGCGGCAGC---AGTCCCCGAGGTAAGACACCAGCAGC---AG---------------CCACGGAAGAGAGGAGCCCTGCACAGGTGCGCTCCCCGCATGTCCCTGAAGGCCCTGGACCTGCAGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGCGTGGTGGCCTCCTGCACCGGTATGGACGTTGAGGGCCTGCCGAGGGAGCAGC---CACCCAGCCCAGGGCCTGTGGGCAGGTACACAGCCATCAGCCATCAGCCCCAGGCTCGGGTGGATTCGCTGGGGGGCCCTTGCTTCAGACTGAGCCCTCGAGCGACCCCAGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCAAGGGCCCTAGGGCTCGGCGGCAGGGTCCAGGTGGTG---GCTCCGTGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCAGACAGCCCAGGC---AGCCCCAAGGTGGCCCCCTGCCAGCCAGAGGGTGCCCACAGGCAG---CAGGGGGCGCTACAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGTTGGAGGAGATGAGGAGTAATTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCTGCCATTCCTCCGCATCCCGTGTTCTGCACACCCGGCATGCCTGAG--------------CCATCCACGCC--TGCT----GT---------CTTGTGGCCCTGCTGTGTTTGCTCCGTTGG-----CTTAACCTGTGGCCTGTCTGCCTCAGACCCCTCCCCTCTGTCCAAGAGG--CCCAGCACT-TTGAAGGGATGGTGACCAGGGGAGTTTGAGT-------------CACCATGGCCC-TTCTGAGAGCTGG-------GAGCTA--CTTGTGGAGGGAC-TCGGTACTGTCCA-G--CCAGGGCTCAACGAGGGCTTA--------CTTGCTGGCTGAC-CTGACCGG-TTGCCCTGATGTCCTTCCCAGGTCTGG----GAAGGTTCCAGC------------TCCCAGTCCTGCT-------------------     
20 Cricetulus_griseus-NW_003616165.1-67562_68231        91.7%  55.8%    ---------------------AGAGCCAAAAGCCAAGTCGTAAGGGCTTCCCAGAGCTGGCCCTGGGCACACAGGACGCGGGTTCTGAGGGGGCGGCTGACGATGTGGCGCCCCCTAGACCCAACCCAGCTCTGGAGGCCCCTACTCAAGAGAAGTCAGGCAGCAGC---AGCCCCCGAGGTAAGGCACCGGCAGGAGAAG---------------CAAACGAAGAGAGAGCCCCGGCACAGGTGCGGTCCCCGCATGTCCCCGAAGGCCCTGGACCTGCAGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCGCCGCTGTGGACATTGAGGGCCTGCGAAGGGAGCAGC---CGCCCAGCCCGGGGACGGCGGGCACCCGCGTGGCCATCAGCCATCAGCCCCGGGCCCGGGTAGATTCACTGGGGGGCCCTTGCTGCAGCCTGAGCCCTCGAGCCCCCCCAGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCAAGGGTCCTAGGGCCGGGCGGCAGGGCCCAGGCAGCG---GCTCTGTGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCTGGCAGCCCCGGC---AGCCCCAAGGCGGCCCCCTGCCAGCCAGAGGGTACTCACAGGCAGCAGCAGGGGGCACTGCAGGGAGAGATGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATCAGGAGTCATTCCCCCATGTTCTCCACCGGTAAGGCTTGCCACTCCTCCGCATCCCGTGCTCGCACACCTGGCATGCC---------------TGGGCAGTCCGTGCC--TGTG-C--TC---------TCGTGGCTTCCGCTTCGTTTACTCCATCAG-----CTTAACCTGTGGCCTGTCTGCCTCAGACCCCTCCCCTCTGCCCAAATGG--CCCTGCACT-CTGGAGGGATGGCATTTC-----------------------------------------TAAGGG--------------CTG--CTTGCTGAGGAAC-CCAGGGATGTCCA-G--CCAGCCCTCAGTAAGGGCTTCCCTGGGGCCTTGCTGCCCCAC-CCCCAGGG-CCAGATTCGAGGATTACTCTGCCCTGC----AGCCCCTTCAGGAAAGTCTGCTGCTGCCAGTTGGTGGTGGTACCAGCG--------     
21 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-206234_206977     91.1%  56.4%    ---------GTGCCCCAACCAAGAGCCAGAAGCCCGGCCACAAGGCTTTCCCAGAGCTGGTCCTGGGCACACAGGATGCAGGCTCTGAGGGGGAGGCCCGTGATGTGGCACCCCCCAGCCCTGGCCCCACTCCGGAGGCCCTGGCCCCGGAGGAGCCCTGCAGCTGC---AGCCCCCGAGGTAAGGGGCCG------------------------------GCGGAGAGGAGCCTGGCGCAGGGACGGCCCCCGCGTGCCCCCGAGGGCCCCGGGCCTGCCGGGATGGCCGCCACCTGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCGCCGGCGAGGATGCTGAGGGCCTGCGGAGAGGGCGGC---TGCCCAGCCCAGGGCCCTCGGGCGAGCACACGGCCATCAGCCAGCAGCCCCGCGCCCGGGTGGACTCGCTGGGGGCTCCCCG---------------------TGCCCCGGGGAGAAGCAGAGGGGCCCCCAAGGGCCCTGGGGCCCAGCGGCAGGGTCCGGGAGGCAGCGGCTCCATGTCC---TCAGACTCGAGCACCCCGGGC------------AGCCCCGAGGGGGCCCCCCGCTGGCCCGAGGGC---GCCCGCAGGCAGGCGGGGGCCCTGCAGAGGGAGATGAATGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATTAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGACCAGATGCTCCTCCCTGGCATCCCCCCGGGTGTCCCCCACGCCGCCCCTCGGCATGGCCTGGGCCCGGCGTCCCTGCTGCCTGTGCTTCCGTGTCCACAGCCATCGCCCCGTGTGCTCATCGTGCCTT-------CATTTCCCTTTGCTCCATCGGCTTGTCCCGCAGGCCCTGAAGCCCCAGCCCCCCATCTGAGCACGACTGACCCCCCGG--CCT------CTT------GCT-------------------CTCTGAG-GCCCCCCTGCACTCCCCAGGGGCC-AGAGAAGAGAGAGCC--GGTCTGGCTGCAGCCACCCTCACCCCA--CATAGGGAGTGAG---TCCA-A-CCAGTGGCCCCGAGGGCCAGGCCGTGC-------TTGCTGAGGCCCGCAGCCCCAG--GC---ATGGCCT-----------------     
22 Pteropus_giganteus-NW_024346980.1-192561_193191      90.5%  56.8%    GCACGGCCAGCGCCCCGACCAAGAGCCAGAAGCCAGGCCGCCAGGCCTTCCCGGAGCTGGCCCTGGGCATGCAGGACGTGGGCTCCGAGGGGGAGGCCCGTGCCGTGGCACCCCCCAGCCCTGGCCCCGCTCCGGAGGCCTTGGCCCAGGAGGGGCCTGGAGGCCGC---AGCCCCCGAGGTAAGGCGCCG------------------------------GTGGACGGGAGCCCTGTGCAGGGGCGGCTCCCTCGTGCCCCCGAGGGCCCTGGGCCTGCCGAGGTGGCCGCCACCTGCATGAAGTGCGTGGTGGGCTCCTGCGCCGGCGAGGACGCCGAGGGCCTGCAGAGGGGCCGGC---CGCCCAGCCCGGGGCCTGAAGGCCGGCACGCGGCCATCAGCCAGCAGCCCCGTGCCCAGGCAGACTTGCTGGGGGCCCCCCTG------------------GCAGCCCCAAGGAGAAGCAGAGGGGCCCCCAAGGGCCCGGGGGCCCGGCGGCAGGGTCCGGGCGGCAGCGGCTCCGCGTCC---TCGGACTCCAGCAGCCCGGGC------------AGCCCCGAGGTGGTCCCCCGCTGGCCCGAGGGC---GCCCGCAGGCAGGCGGGGGCCCTGCAGAGGGAGATGAATGCCTTGTTCGCTCCAAAGCTGGAGGAGATTAGGAGTAAATCTCCCGTGTTCTCCACTGGTAAGACCAGGCGCCCGTCCCCGCACCCCCTGTGGTGTCCCAGCCCCTCGGC-------------ATGGCCTGGCCAAGGTCCCCGCTGCACCTCCATGTCCGGAACCACCGCCTCGTGTGCCCGTCACCTGCA----CTCTCCTTTGCCCTGTCGG-----CTTGCCTCTCGGGCCCCAGTCCCAGCTCCCG---TCTGACCTCGGCTGACTCCCCCG--GGG-CC---AGA------GATGGGGGTGCAGGTCTGGCCACCGTCAC-GGCACCCTGGAGCCCCACCCGGGT-GGAGGCTGGGGCCAG--GCCGTGCTCCCTGACACCTGCG----A--CGTGGAGAGTAG----CCGTGG-ACACGGGCTCTGGTGCCCCTG----------------------CCACCCTCCCCGCCCAG---CTGGGCTGGT--------------     
23 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-190528_191381      93.7%  59.0%    --------AGTGCCCCGACGAAGAGCCAGAAGTCTGGCCGCAAAGGCTTCCCAGAGCTGGTCCTGGGCAAGCAGGACTCGGGCTCTGAGAGGGCAGCCCACAACATAGCACCCCCCAGCCCCGGCCCTGCTCAGGAGGCCCCGGCTTGGGAGGGACCCAGCTGCAGT---AGCCCCCGAGGTAAGGCACCTGCAGTGG------------------TAGCAGAGAGGAG---CCTGGCCCAGGCACGGCCTTCACGGATGCCCGAGGGCCCTGGGCCCGCAGGGATGGCTGCCACATGCATGAAGTGCATGGTGGGTTCCTGCGCCGGCGTGGATGCCGAGGGCCTGTGGAGGGAGCGGC---CACCCAGCCCTGGGCTTGCAGGCCAGCCCACTGCTGTTAGCCAGCAGCCCCAGGCCCGGGTTGACTCCCCAGGGGCACCCTGCTGTGGCCTGGACCCCCGAGCTGCCCCGGGAAGGAGCACAGAGGCCCCTGAGGGCCGCAGGGCCCAGCGGCCAGGTCCAGGTGGTGGCTCCG------CGTCCTCAGACTGTAGCAGCCCAGAGAGCCCGGGT---GGCCCCCAGGGGGTCTGTCGCTGGCAGGAGGCCATTG---GCAGGCAGCCTGGGGCCCTGCAGGGAGAGCTGAACGCCTTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATGAGGAGTAAATCCCCCATGTTCTCCACCGGTAAGACTAGCTGCCTGCCCGTGCCCCGTGCTGTCT--TCCTGC--ACGCCTCCAGC--ATGGCCTAGGCCTTGTGCCACCTGCTGCTGCTTCTGCGTCACAGACCCGCCTGTGTGCTGT-----GGCACCTAT----GTTGCTGTGCTCCACTGGCTTGTCCTGCGGCTGCAGCCCCAGCCCTCCAGCCTGACC-T------------GGGGC----C--CGGGGACTTTGGG-----AGGGAGGAGATGAG---CTGAGCCGGTGA-GCCA---TC-CCAAGAGGAAGCC----ATGCCTGCTCAGAACCCCAGAGC---------------TCCTGCTAGGCTTCAGCCAGGACCCTGAGATGGGGCCA---CCCAGCTGG----GC----CAAGCCCA----CCTCCCTG------------------------------------     
24 Octodon_degus-NW_004524689.1-190892_191624           90.9%  55.1%    ------------------CCAAGAGCCAGAAGCCGGGCCGCAAGGGTTTCCCAGAGCTGGTGCTGGGCACACGGGACATGGGCTGTGAGGGGACAGCCAACGATGTGGTACCCCCCGGCCCTGGCCCCACTCTGGAGACCCCAGCCCATGATGGCCTGGGCAGCAGC---AACTCCCGAGGTAAGGCACCGGCAGCAGC---------GCCAGTGGCTGCTGAGCCCAGGAGCCCCGTGCAGCTGCAACCTCCTCGAGGCCGTGAAGGCTCTGGGCCTGCCGGGGTGGCGGCCACGTGCATGAAGTGCGTGGTGAGCTCCTGCACCGGTGTGCACACAGAGGGCCTGTGGAGGGAGCAGC---CGCCCAGCCCTGGGCCTGCAGGTGGGCTCATGGCCATCAGCCAACAGCCCCGGGCCTGGGGGGACACTCCGGGGAGC---CCCTGTGGCCTGGGCCCTCGAGCCACCCCAGGGAGAAGCGCAGAGGCCTATAAGGGCCCTGGGGCCCAGCGGCAGGGCCCAGGCAGCAGCGGCTCTGTGTCC---TTGGACTCCAGCAGCCCAG---------GC---AGCCCCCAAGTGGCCCCCTGCCCGCCTGAGGGTGCCCACAGGCAG---CTGGGGGCCCTGCAGGGAGAGATGAATGCCTTGTTCGCTCAAAAGCTGGAGGAGATGAGGAGTAGTTCCCCCATGTTCTCCACGGGTAAGGCCAGCCACTCCTCGGCACCTTGTCCTCCACCCGCCAGGCATGCCTGGGCC----T--GCGTCCCCTGCTGTGC--TCGT-----------GT----CTGCTT------CTGTGTG--CTCCTC----------------AGCCTGTCTGCCCTGGCTCCTGCCCCTCTGCACAAGAGGCCCTGGCACTC-TGGGGGGCAGCCCTTGTCCAGCCCGTCCAGGGCTCGCC--------------------------------------TTGCTGGGAAGTCTGTTGAAG-GCAGTGGTG--CA-G--CCCTAGGGCGTC-CCCAGTGTCCTGCAGCCTGGGCTGCTGCTCTAGCCTG--ATGCCCGGC---CTGAGTCTGGAAAGGGC--TGAGACTGCTTCCATTATTCCTGGGCCCACGACTCAGCAGCTCCAGC---------     
25 Sus_scrofa-NC_010448.4-192551_193287                 89.9%  56.5%    -----GCCAGCGCCCCAACCAAGAGCCAGAAGCCGGGCCGCAAGGCCTTCCCGGAGCTGGTCCTGGGCACGCAGGACGTGGGCTCTGAGGGGGAGGCTGGCGACACGGCACCCTCCAGCCCAGGCCCTGCTCTGGAGGTCCCGGCCCCGGAGAAGCCGGGCAGCTGC---AGCCCCCGAGGTAAGGCGCCG------------------------------GCGGAGGGGCGCCCAGTGCAGGAGCCGCCCCCGCGGGCCCCCGAAGGCCCTGGGCCTGCCGGGATGGCCGCCACCTGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCGCCGGCGAGGACAGTGAGGGCCTGCGGAGGGGGCGGC---CGTCCAGCCCGGGGCCCGAGGGCGGGCACTCGGCCATCAGCCAGCAGCCCCGGGCCTGGGCGGATGCACTGGGGGCTGCTTGC------------------GCCGTCCCCGGGAGAAGCGGAAGGGCTCCCAAGGGCCCTGGGGCCCGGCGGCTGGGTCCAGGCGGCAGTGGCTCCGTGTCC---TCAGACTCCAGCAGCCCGGGC------------AGCCCCGAGGTCGCCCCCCACAGCCCCGAGGCCGCCCCCCGCAGGCAGGCGGGGGCCTTGCAGCGGGAGATGAATGCCCTGTTCGTTCAAAAGCTGGAGGAGATTAGGAGTAAATCCCCCGTGTTCTCCACCGGTAAGACCAGAGGCCCCTCCGAGAGTCCCGTGCTGGCCCCCCCGCCCTCGCA-------------TGGCCTGGCCAGGCGTCCCTGCTGCGCTTCCGTGTCAGAACCATCGCCTCCGTGTGCTCACTCCACGCG----CCTTCATTTCCTGTGTTCCATCGGCTGGTCCCTCGGGCCCCTCAG------CCCC---TGGTCCCTGGTCTGTCCGCCCAA--GGGGCT---AAG------GGAATGGGCCCTGGGGTGGGGACCGGGGA-GTCTGC---------------------------GAGCCAG--GCTCTGCTTGCTGAGGCCAGTG----G--CTGAAAGTGTGAC---CTCTGG-AGACCGGCCCCAGGGCCCGTGCCGAGCC---CCCTTTCCGTGGCCTGACTGCAGGCCCCC---GGGGGCAGCTTCCACGCA------     
   clustal                                                                                                  .       .  .     . . ...   . ..      ..     ..      . ..   .           .         .                .                           .  .           . ...  .                                                                              .  ..    ..       .   ...        ..  ..  ...  ....    .  ..         .      . ...  .     . .               .    .                    .   .  .  * ******.. **  . *  .*    .   *                                 *   .*.*..*.                .*    .**.*   *   * .**    *                       :   .    :*** **  *              .   *                                     ..*      .** *  *.*** *.***.***. *** ****     .***  ******* *  .***   . ** ** .** * ** .* ****** *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                

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