GTGGTGGGCCAGGCTGGGGCTCGAGGTCTCTCCTCCGGAGGGAAAGACCTTCTCTCCATGCCCCTCAAGGGCCCCACATGCCCTGGACAGGTCAGGCGAGGGCAGTTTCTGCCGGAAGGGTGGGGTGGGCCATGTGTACTTAGATCTGTAGCAGCTACTGTCCCAGGCAGAGCTGCCCTAGGGACCCTGCTCCTGAAGGCCCTGGTGTGTCCACACACCCCCAGCCTGAGGTGGCCCAGCCCCTCGGACCGAGACACGCATGGCACGTCTGTGGCACGGTCTGGAGAGCTGGCCCTGGGGGAGCAGCTGCAGCTGGGCTGGGACCCCTGGCAACAGCTACATGGGCTCCTTCTCTTGCAGGTCAAGCAGGCTCTGGGCCTAAAAGGCCTCTTCCTCCGAGGCCCAAAGCCCGGCTCGCTGGACAGTCATGCTGCTGGGCGGCCCCCGGCCCGGCCCTCCGTTAGCCAGCGGATCCTGCGGCGCACGGCCAGCGCCCCGACCAAGAGCCAGAAGCCGGGCCGCAGGGGCTTCCCGGAGCTGGTCCTGGGTACACGGGACACAGGCTCCAAGGGGGTGGCAGACGATGTGGTGCCCCCCGGGCCCGGACCTGCTCCGGAAGCCCCAGCCCAGGAGGGGCCCGGCAGCGGCAGCCCCCGAGGTAAGGCGCCAGCTGCGGTGGCAGAGAAGAGCCCTGTGCGAGTGCGGCCCCCGCGTGTCCTGGACGGCCCCGGGCCTGCTGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGATCCTGCGCCGGCGTGAACACCGGGGGCCTGCAGAGGGAGCGGCCACCCAGCCCGGGGCCTGCAAGCAGGCAGGCAGCCATTCGCCAGCAGCCCCGGGCCCGGGCTGACTCACTGGGGGCCCCCTGCTGTGGCCTGGACCCTCACGCTATCCCGGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCAAGGGTCCTGGGGCCTGGAGGCAGGGTCCAGGCGGTAGCGGCTCCATGTCCT
Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.
Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.
Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.
Distribution of HSS in the input sequence
HSS id | Strand | Frame | Length | Start | End | Score | P | Show Result | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 0 | + | 1 | 214 | 34854 | 35495 | 127.589 | 1.110e-16 |
Plot |
2 | 1 | - | 3 | 141 | 34973 | 35395 | 56.557 | 1.282e-06 |
Plot |
HSS id | Sequence | |
---|---|---|
1 | 0 | LQVKQALGLKGLFLRGPKPGSLDSHAAGRPPARPSVSQRILRRTASAPTKSQKPGRRGFPELVLGTRDTGSKGVADDVVPPGPGPAPEAPAQEGPGSGSPRGKAPAAVAEKSPVRVRPPRVLDGPGPAGMAATCMKCVVGSCAGVNTGGLQRERPPSPGPASRQAAIRQQPRARADSLGAPCCGLDPHAIPGRSREAPKGPGAWRQGPGGSGSM |
2 | 1 | GAPSESARARGCWRMAACLLAGPGLGGRSLCRPPVFTPAQDPTTHFMHVAAIPAGPGPSRTRGGRTRTGLFSATAAGALPRGLPLPGPSWAGASGAGPGPGGTTSSATPLEPVSRVPRTSSGKPLRPGFWLLVGALAVRRR |
Reference sequence (1): Target Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% |
cov pid 1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . . . 4 . . . . : . . . . 5 . . . . : . . . . 6 . . . . : . . . . 7 . . . . : . . . . 8 . . . . : . . . . 9 . . . . : . . . . 0 . . . . : . . . . 1 . . . . : . . ] 1180 1 Target 100.0% 100.0% ---------------------------------------------------------------------------GTGGTGGGCCAGGCTGGGGCTCGAGGTCTCTCCTC---CGGAG-GGAAAGACCTTCTCTCCATG---CCCCTCAAGGGCCCCACATGCCCTGGACAGGTCAGGCGAGGGCAGTTTCTGCCGGAAG---GG----------------------------TGGGGTGGGC-----CATGTGTACTTAGATCTGTAGCAGCTACTGTCCCAGGC----AGAGCTGCCCTAGGGACCCTGCTCCTGAAGGCCCTGGTGTGTCC-----ACACACCCCCAGCCTGAGGT---GGCCC-AGC-CCCTCGGACCGAGACACGCATGGCACGTCTGTGGCACGGTCTGGA-GAGCTGG-CCCTG-GGGGAGCAGCTGCAGCTGGGCTGGGACCCCTGGCAACAGCTACATGGGCTCCTTCTCTTGCAGGTCAAGCAGGCTCTGGGCCTAAAAGGCCTCTTCCTCCGAGGCCCAAAGCCCGGCTCGCTGGACAGTCATGCTGCTGGGCGGCCCCCGGCCCGGCCCTCCGTTAGCCAGCGGATCCTGCGGCGCACGGCCAGCGCCCCGACCAAGAGCCAGAAGCCGGGCCGCAGGGGCTTCCCGGAGCTGGTCCTGGGTACACGGGACACAGGCTCCAAGGGGGTGGCAGACGATGTGGTGCCCCCCGGGCCCGGACCTGCTCCGGAAGCCCCAGCCCAGGAGGGGCCCGGCAGCGGCAG---CCCCCGAGGTAAGGCGCCA---GCT---------------GCGGTGGCAGAGAAGAG---CCCTGTGCGAGTGCGGCCCCCGCGTGTCCTGGACGGCCCCGGGCCTGCTGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGATCCTGCGCCGGCGTGAACACCGGGGGCCTGCAGAGGGAGCGGC---CACCCAGCCCGGGGCCTGCAAGCAGGCAGGCAGCCATTCGCCAGCAGCCCCGGGCCC---GGGCTGACTCACTGGGGGCCCCCTGCTGTGGCCTGGACCCTCACGCTATCCCGGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCAAGGGTCCTGGGGCCTGGAGGCAGGGTCCAGGCGGTAGCGGCTCCATGTCCT--------------- 2 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-127246_128217 98.5% 83.8% ---------------------------------------------------ACACCAG-------T---------GCCTCTGCCAGACCTGGGGCTGCGGGCCTCTCCTC---CAGAG-GAAAGGACCTTCTCTCTGTG---CACCTCGAGGGCCCCACAGGCCCTGTACAGCTTGGCAGGGGCAGGTT-CTGCCGGAG-----G----------------------------GTGGGGGCGC-----CATCTGTCCTTAGATCTGCAGCAGTCACTGTC-CCGGC----AGAGCTGCCCCAGGAACCCTGCTCCTGAAGGCCCTGGTGTGTCC-----ACACCCACCCAGCCCGAGGC---AGCCG-GCC-CCTCGC----------ACTGAGACCTGTCTGTGGCGCGGTCTGGA-GAGCTGG-CCCT--GGGGTGCATGGGCAGCTGGGCTGGGCGCCCTGGCACCAGCTATGTGGGCTCCTTCCCTTGCAGGTCAAGCAGGCTCTGGGCCTAAAAGGCCTCTTCCTCCGAGGCCCAAAGCCCGGCTCGCTGGACAGTCATGCTGCTGGCCGGCCCCTGGCCCGGCCCTCCGTTAGCCAGCGGCTCCTGCGGCGCACGGCCAGCGCCCCGACCAAGAGTCAGAAGCCGGGCCGCAAGGGCTTCCCGGAGCTGGTCCTGGGCTCGCAGGACGCGGGCTCCAAGGGGGCGGCAGACGACATGGTGCCCCCCAGCCCTGGCCCCACTCCGGAAGCCCCGGCCCAGGAGGGGCCCAGCAGTGGCAG---CCCCCGAGGTAAGGCGCCA---GCT---------------GTGGTGACGGAGAAGAG---CCCGGTGCGTGTGCGGCCCCCGCGTGTCCCAGAGGGCCCGGGGCCTGCTGGGATGGCCGCCACGTGCATGAAGTGCGTGGTGGGATCCTGCGCTGGCGTGAACACCGAGGGCCTGCGGAGGGAGCGAC---CACCCAGCCCGGGGCCGGCCAGCAGGCATGCCGCCATTCGCCAGCAGCCCCAGGCCC---GCGAGGACTTGATGGGGGCCCCCTGCAGTGGCCTGGACCCTCAAGCTCTCTCGGGGAGAAGCAGAGAGGCCCACAAGGGGCCCGGGGCCTGGGGGCAGGGTCCAGGAGGTAGCGGCTCCATGTCCTCGGACGC-------- 3 Mandrillus_leucophaeus-NW_012103199.1-228011_228622 94.3% 48.4% -----------------------------------------------------------------------------------------------------------CTG---AGCAG---GTGCAGGCTGTGGTG------GGCCGGGCTGGGACTTGAGGTCTTTCCTCC-AGA-GGAAGGACCTTCTCTCCATGC----CCCTCACAGGCCCCACATGCCC------A-GGAGGGTGGGGTGGGCCATCTGTACTTAGATCTGTAGCAACCACTGTCCCAGG-----CAGAATGCCCTAGGGACCCTGCTCCTGAAGGCCCAGGTGTGTCC-----ACACGCCCCCAGCCTGAGGT-----GGCCCGGCCGCTCGGACCGAGACACGCACGGCACGTCTGTGGCACAGTCTGGA---GAGCTGGCCCTGGGGGTGCAGCTGCAGCTGGGCTGGGACCCCTGGCAACAGCTATGCGGGCTCCTTCTCTTGCAGGTCAAGCAGGCTCTGGGCCTAAAAGGCCTCTTCCTCCGAGGCCCAAAGCCCGGCTCACTGGACAGTCATGCTGCTGGGCGGCCCCCGGCCCGGCCCTCCGTTAGCCAGAGGCTTCTGCGGCGCACAGCCAGTGCCCCAACCAAGAGCCAGAAGCCGGGCCGCAAGGGCTTCCCGGAGCTGGTCCTGGGCACTCAGGACACAGGCTCCCAGGGGGTGGCGGACGACATGGTGCCCCCCAGCCCTAGACCTGCTCTGGAAGCCCCAGCCCAGGAGGGGCCCGGCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN--- 4 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-192396_193116 97.0% 68.6% ----------------------------------------CAGGGTGTGGTGGGCCGG-------T---------GCCGAGGAGAAGCCTGGGGAACGATGCCTC--CCCCGCCAGCG-CCCCCGGCCAGACCCGCTTGCCCTG------CGGCCGCTGCCTCCCTCCAGAGCTCAGGGAAGGAGATT---------------CC----------------------------TCCTTGGAAAGGAATCTTGTTTGGTAGC---------GGTCTGTGGTCCCGGC----AGAACTGCTGGGGAGGTGCGGGTTCTGATGGCCGATGTCGCTAC-----ACGCAGCCCCG-CTGGCCAG---CCCTGGAGG-CAGCCCCAGCCCACCGCACCTGCACACTCACCGGCGCCCTCCGGA-GCGCGGC-CCGTG-GGCAGCAGCTGTGGCTGGGCTGGTGGTTCCCGGCGCCAGCTATGTGGGCTCCTTCTCTTGCAGGTCAAGCCGGTTCTGGGCCTAAAAGGCCTCTTCCTCCGTGGCCCAAAGCCCGGCTCCCTGGACAGTCATGCTGCTGGGCAGCCCCCGCCCCGGCCCTCCGTTAGCCGGCGGCTGTTGCGGCGCACGGCCAGCGCCCCGACCAAGAGCCAGAAGCCCGGCCGCAAAGGCTGCCCAGAGCTGGTCCTGGGCACGCGGGACACGGGCGCCAAGAGGACAGCTGATGACGCGGCGCCCCCCAGCCCTGGCCCGGCCCTGGAGGCCCCGGCCTGGGAGGGGCCCGGCAGCGGCAG---CCCCCGAGGTAAGGTGCCT---GCA---------------GCGGAGGCGGAGAGGAG---CCCGGCGCAGGCACGGCCTCTGCGGGTGACTGAGGGCCTGGGGCCCGCGGGGATGGCCGCCACGTGCATGAAGTGCGTGGTGGGTTCCTGTGCCGGCGTGGGTGCTGAGGGCTTGTGGCGGGAGCAGC---CAGCTAGCCCGGGGCCCGCAGGTGGGCACACGGCCATCAGCCAGCAGCCCCGGGCCC---GGGCGGACTCACTGGGGACCCCCTGCTGCGGCCTGGACCCCCGCACCACCCCGGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCGAGGGCCCTGGGGCCTGGCGGCCGGGTCCAGGCGGTGGCGGCTCCGTGTCCT--------------- 5 Microcebus_murinus-NC_033661.1-190575_191291 94.4% 64.2% -CTGGG------------------GGCCCCTGAGCGGGCGCAGGGTGTGGTGGGCCAG-------T---------AC---CGAGAAGCCTGGGGAAGGATGTCCC--CAC---CACCA-CACCTGGCCAGCCCCGCCTGCCCTGTGGCCACCGCCTCTGGCTCCGCCCAGAGCTCAGGGAAGGCGAGCTTCCTCCTCGGAAAGG------------------------------CGTGGGCCGCCCTGGCTTGTTGGGAGC---------AGCCTGTGGTCCTGGC----AGAACTGCCGTGGAGAGGGGGGTTCTGCT--------------------------------------------TCTGGAGG-CGGCCCCAGCCCACCGCACCTGCATGCTCGCTGGCGCCCTGCAG--ATCCGGC-CCGTG-GGCAGCGGCCGCGGCTGGGCTGGTGGAGCCCAGCGCCAGCTATGTGGGCTCCTTCTCTTGCAGGTCAAGCAGGCTCTGGGCCTAAAAGGCCTCTTCCTCCGTGGCCCAAAGCCCGGCTCCCTGGACAGTCATGCTGCTGGGCAGCCCCCGCCTCGGCCCTCCGTTAGCCAGCGCTTCCTGCGGCGCACGGCCAGCGCCCCGACCAAGAGCCAGAAGCCGGGCCGCAAGGGCTTCCCGGAGCTGGTCCTGGGCACGCAGGACCCGGGCGCCGAGAGGGCAGCCCACGACGTGGCGCCCCCCAGCCCCCGCCCCGCGCCGGAGGCCCCGGCCTGGGAGGGGCCCGGCAGCGGCGGCAGCCCCCGAGGTAAGGCGCCT---GCA---------------GCGGCGGTGGAGAGGAGCCCGGCGGCGCAGGCACGGCTCCCAAGGGTGCCTGAGGGCCCGGGGCCCGCGGGGATGGCCGCCACGTGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCGCCGGCGTGGAAGCCGAGGGCTTGTGGCGGGAGCGGC---CAGCCAGCCCGGGGCCTGCAGGTGGGCACGTGGCCGTCAGCCAGCAGCCCCGGGCCC---GGGCGGACTCACCGGGGACCCCCTGCTGCGGCCTGGACCCCCGCGCCGCCCCGGGGAGAAGCAAGGAGCCCTCCGGGGGCCCTGGGGCCCCGCAGCCGGGTCTGGGCGGCGGCGGCGGCGGCT------------------ 6 Lemur_catta-NC_059130.1-190892_191600 98.2% 69.5% ----------------------------------------------------GGGCCG-------G---------CGCCAGGAGAAGCCTGGGGAAGGATGATCC--CCG---CACCG-CCTCTCTCCGGCCCCGCCTGCCCTG------AGGCCCCTGCCTCCGGCCAGAGCTCAGGGAAGGCGAGATTCCTCCCTCGGAAAGG----------------------------CGTGGGCCAGCCTTGCTTGTTTGGTAGC---------GGCCTGTGGTCCTGGC----AGAACTGCTGTGGAGACACGGGTTCCGCTGGCCACTGTCCCTAC-----ACGCAGCCCTGGCCAGCCAG---CCCCGGAGG-CGGCCCCAGCCCACCGCACCTGCACGCTCGCCGGCGCCCTCCGGA-GCGCAGC-CTGTG-GGCAGCAGCCGTGGCGGGGCTGGTGGTTCCTGGCGCCAGCTATGTGGGCTCCTTCTCTTGCAGGTCAAGCAGGCTCTGGGCCTAAAAGGCCTCTTCCTCCGTGGCCCAAAGCCCGGCTCCCTGGACAGTCATGCTGCTGGGCAGCCCCCGCCCCGGCCCTCCGTTAGCCAGCGGCTGCTGCGGCGCACGGCCAGCGCCCCGACCAAGAGCCAGAAGCCAGGCCGCCGAGGCTTCCCAGAGCTGGTCCTGGGCACGCGGGACCCGGGAGCCCAGAGGACAGCTGACGACCTGGCGCCCCCCAGCCCCGGCCCCGCGCTGGAGGCCCCGGCCTGGGAGGGGCCCGGCAGCGGCAG---CCCGCGAGGTAAGGCGCCC---GCC---------------GCGGTGGTGGAGAAGAG---CCTGGAGCAGGCACAGCCTCTGCGAGTGCCTGAGGGCCCGGGGCCCACGGGGATGGCCGCCACGTGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCGTGTGCCGGCGTGGATGCCGAGGGATTGTGGCGGGAGCAGC---CGGCCAGCCCGGGGCCTGCAGGTGGGCATGCCGCTGTCAGCCAGCAGCCCCGGGCCC---GGGCGGACTCGCTGGGACCCCCCTGCTGCGGCCTGGACCCCAGAGCCGCCCCGGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCGAGGGCCCTGGGACCCAGCGGCCAGGTACAGGCGGTGGCGGCTCCGTGTCC---------------- 7 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-158850_159537 94.7% 59.4% ----------------------------------------AGGGCTCCTC---------------T---------GCCAGCGGGCCCTGCCAAGGCCGGGCAGTGGCGCCC----CGACAGGTGCAGGGGTGGCGG------GCCAAAGCAGAGGCCTG---TCTGTCCTCAGGGGGGTAGGGCGATCTCCCCAGTCCCACGGCCTTGCCTGCCCTGCAGAATGGGGGGCGGGTCTGCGA------GGGAAGGTTGGTGTGGGCTGTCCCTGCTTGTCTG-TAGCT---GCCCACGG----------------------TCCC------CGGCA-----GAGCCGCCTTGGGGCCCT-G---CTCCC-GAT-GGCCCGTG---G--GGACACGCACCACAGCTGGCTGGCCCATCGCACCCATGCGCTCCC-TGTGGCACCAGGGCTGG---GCTGGGGTCCCGGGCACTGGCTATGAGGCTCCTTCTCTTGCAGGTCAAGCAGGCTCTGGGCCTAAAAGGCCTCTTCCTCCGAGGCCCAAAGCCTGGCTCACTGGACAGTCATGCTGCTGGGCGGGCCCCACCCCGGCCTTCCGTTAGCCAGCGGCTGCTGCGGCGCACGGCCAGTGCCCCGACCAAGAGCCAGAAGCTGGGCTGCAAGGGCTTCCCGGAGCTGGTCCTGGGCTCACAGGACGCGGGCTCTGAGGGGGCAGCCGACGACGTGGCGCCCCCCAGCCCCGGCCCCGCTCCGGAGGCCCTGGCCCACGAAGGCACTGGTGGCAGCAG---CCCCCGAGGTAAGGCACTGG---------------------CGGCAGCGGCAGAGAGGAGCCTGGCGCGGGCACGGCCCCCGCGTGCCCCCGAGGGTCCTGGGCCTGCCGGGATGGCCGCCACGTGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCAGCGGCGTGGACACCGAGGGCCTGCAGAGGGAGCGGC---TGCCCAGTCCAGCGCCTGCAGGCAGGCCCACTGCCATTAGCCAGCAGCCCCGGGCTT---GGGCCAACTCGCCCGGGGCCTCCCGCTGTGGCCCGGATCCCCAGGCCTCCTCAGGGAGAAGTAGAGGGGCACCCAGGGGCCCTGGGGCCCGGCAGCAGGGTCCAGGTGGCAGTGGCTCCTTGTTCT--------------- 8 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-259161_259873 93.5% 59.3% ---------------------------------CAGCACTGTGGCTCCTG---------------T---------GCCCACGAACCCTGCCAGAGATGGGGGCTGTGGGGCCTCGGAGCAGGTGCAGCGCGTGGGG------T-GGAGGCCCAG-GCT------------CCCAGG-------------TCTCTGGCCTTCCCCTTTGCTTGCCCGGCAGAAGTGTCACCAGTTCCTGC-------CCCAAGGTTTGAGGAAGAAGCAGATTCTTGGTCC-AAAGG---GCGGGTGG-----GCCGCCC--TTGCTTAGGCCA------GTGCA-----GC-TCCCCATGGCGACAT-C---CGCCC-ACC-CCGGGCTCACCA--GCCCCAAAGGCGCTCGCTGGTGCCCACTGGAGAGATGGCTCTGCG-GCTGCAGCAGCTGCTGG---GCTGGCGGTCCAGGCGCCCGCTATGTGGCTCTTTCTCTTGCAGGTCAAACCGGCTCTGGGTCTAAAAGGCCTCTTCCTCCGAGGCCCAAAGCCCGGCTCTCTCGACAGTCATGCTGCTGGGCAGCCCCTGCCCCGGCCCTCCGTTAGCCAGCGGCTCCTTCGGCGCACGGCCAGCGCCCCGACCAAGAGCCAGAAGCCGGGCCGCAAGGCCTTCCCAGAGCTGGTCCTAGGCACGCAGGACATGGGCTCCGAGGGGGCAGCTGATGACGTGGTGCCCCCCAGC------CCTGCTCCGGAGGCCCTGGCCCGGGAAGGACCTGCTGGCAGCAG---CCCCCGAGGTAAGGCGCTGG---------------------CAGCAGCAGCAGAGAGGAGCCCGGCACGGGTGCGGTCCCCACGCATCCCCGAGGGTCCTGGGCCTGCCGGAATGGCTGCCACGTGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCGCTGGTGTGGACACTGAGGGCCTGCGGAGGGAACGGC---CACCCAGCCCAGGGCCTGCAGGCCGGCATGCGGCCATCAGCCAGCAGCCCCAGGCCC---AGGCGGACTTGCTGGGGGTCCCCTGCTGCGGCCTGGGCCCCCGAGCCACCCCAGGGAGAAGCTGCGATCTGCCCAGGGGCCCCAGGGCCCGGCGGCAGGGTCCAGGTGGCAGTGGCTCTGTGTCCTCGG------------ 9 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-208110_208819 94.6% 59.4% --------------------------------------------CTGCT-------------------------------------GGAGTTTGGGGGCGGGGTGAAGTACCTTAGAAGAGGTACAGGTGTGGTGG------GCTAGGGCCTAGGTTTGAGATCTCTTCTTAGAAGGACTAGGGGA------------GAGGCCTTCCCCGGTCCCTCGGATATGTCACCAGCACCCGCCTCT---ACCCAGAGTGGAGATGGGTGGCCCTTATTCAGGCCATAGC---AGCCACTG-----GCCTGTGGAGAGCCTGCCCCT------GTGGC-----AGATGTCCCTGGCTGGCT-A---GCCAT-GGG-CGGCCCTGGCCCAGCACTCCAACTTGCTTGCCTGTGCCCTGTGGAGAGCTGGCCCCACTGGTTGCAGCCGCGGTTGGGCTGGGTGTTGCCCGGCACCCGCTATGTGGACTCCTTTTCTTGCAGGTCAAGCAGGCTCTGGGCCTAAAAGGCCTCTTCCTCCGGGGCTCAAAGCCCGGCTCACTGGACAGTCATGCTGCTGGGCAGCCCCCGCCCCGGCCCTCCGTTAGCCAACGGCTCCTGCGGCGCACGGCCAGCGCCCCAACCAAGAGCCAGAAGCCAGGCCGCAAGGGCTTCCCGGAGCTGGTGCTGGGCACACAGGATGCGGGCTCCGAGGGGACGGCTGATGATGTGGCACCCCCCAGCCCTGGCCCTGCTCCGGAAGCCCTGTCTCGGGAAGGGCCCGGCAGTAGCAG---CCCTCGAGGTAAGGCACTGG---------------------CGGCAGCGGCAGAGAAGAGCCTGGCACAGGTGCAGACCCCGCGTGGCCCCGAGGGCCCTGGGCCTGCAGGCATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTAGGCTCCTGCAGCGGCGTGGATGCTGAGGGCCTGCGGAGGGACCGGC---TGCCCAGCCCAGGGCCTGTGGACAGGCATGCAGCCATCAGCCAGCAGCCCCAGGCCC---GGGCAGACTCGCTGGGAGCCCTCCGCTGTGGCCTGGGCCCTCGAGCAATCCCAGGGAAGAGCAGGGGCCCT------------GGGACCCGGCACCTGGGGCCAGGCAGCAGCGGTTCCATGTCCTCGGA----------- 10 Urocitellus_parryii-NW_020540697.1-297169_297860 94.5% 62.1% -----------------------------------------GGCCTGT-----------------G---------G---TCGAGCA-------------GGCCTTGGCCAGCCCAGGG-ACTGGCTTCTGTGGATGCTGGTGCCCACGATGGG---TGGACATGACCCATGACCCAGGGCTGCAGGCGTAAGGTG-------TGCTCGCGGGTTCCAGAGTTTGAGGTCTGTCCTTGAGAGACCCCAGGAAGGGTGTCCT----CTCAGGCCCC-ATGTTCCCGCC------ACCTC-----CGAACT-CCAGTCTGGACGGTGGGGTCCTGCC-----ATGCC--GGTGGAGT----G---GCCACGTGG-CCTGCTCCCTGTGGCTCGCGTCCCGCGTGCACTCCTGGCTGGCCCCGGCCCACCGGACT-CGAGCTGCAGCTACCCTGGGCTCGGTACCCCAGCGCCAGCTATGCGGCCTCCTTCTCTTGCAGGTCAAGCAGGCTCTGGGCCTAAAAGGCCTATTCCTCCGAGGCCCAAAGCCAGGCTCACTGGACAGTCATGCTGCTGGGCAGCCCCCACCCCGGCCCTCCGTTAGCCAGCGGCTCCTGCGGCGCACGGCCAGTGCTCCAACCAAGAGCCAGAAGCCGGGCCGCAGGGGCTTCCCGGAGCTGGCCCTGGGCACGCAGGACACCGGCTCCGAGGGGGCAGCTGACGACGTGGTACCTCCCAGCCCTGGCCCTGCTCCCGAGGCCTTGGTGTGTGAGGGTCCCAGCGGTAGCAG---CCCGCGAGGTAAGGCGTC------------------------------AGCAGAGAGGAGCCCRGGGCAGGTGCGGCCCCCGTGTGCCCCTGAGGGCCCCGGGCCTGCCGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCTCCGGTGTGGACGCTGAGGGCCTGCCGAGGGAGCAGC---TGCCCAGCCTGGGGCCTGCTGGAGGGCACACGGCCATCAGCCAACAGCCCCAGGCCC---GGGCAGACTTGCTAGGGGGCCCCCACTGCAACCTGGGCCCTCAAGCCACCCCAGGGAGAAGCCACGAGGCCTTCAAGGGCCCCGGGGCCCGGCGGCAGGGTCTAGGCGGCAGCGGCTCCGTGTCCTCR------------- 11 Jaculus_jaculus-NC_059106.1-190401_191121 94.7% 59.7% ----------------------------------------------------------------------------TCTCCCCAGA------------GCTGGGGTTGTAACTCAGGC-AAGGACAGA-AGGGTGGCCAGGATCTAGGGTGGTGGTCTGT-CCTTGACAGACCATGGGGAAGGTGTCTTTCTTGTTCCTTACTGGTGCCACCAGCTCCAGCTTCCACCCTGAGCTTGCAAAGGGGTAGATTCTTAGAACGCAGGGTGAGGTTCCACTTTCCCTGGTAGAACCTCT-------GGGAGACTGCTCCTGGTGGCTGATA--TCC-------------------------------ACACACAG-ACCTGACAGCCTGTAGCACGCCCAGGCTCAACAGCACCCCCCG--GAGAGCCAGCCCAT-GGCTGCAGCCACAGCTGGGCCCCGTGGTCCAGGCTCCAGCTATGTGAGTTCCTTTCCTTGCAGGTCAAGCCGACTCTGGGCCTAAAAGGCCTGTTCCTCCGCGGCCCAAAGCCAGGCTCGCTGGACAGTCATGCTGCTGGGCAGCCCCCGCCTCGGCCCTCCGTTAGCCAGAGGCTCCTGCGGCGCACGGCCAGCGCCCCAACCAAGAGCCAGAAGCCAAGCCGCAAGGGCTTCCCAGAGCTGGCCCTGGGCACACAGGATGCAGGTTCCGAGGGGGCAGCTGATGATGTGGCACCCCCCAGCCCTAGCCCTGCTCCAGAGGCCCCGACCCACGAGAGGTCAGGCAGCAGCAG---CCCCCGAGGTAAGGCACCAGAGGCG---------------GCACCGGTGACAGAGAGGAGCCCAGTACAGGGGCGGCCCTCTCAAGCTCCTGAGGGCCCTGGACCTGCAGGGATGGCTGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCACTGGTGTGGACATTGAGGGCCTACGAAGGGAGCAGC---CACCTAGTCCGGGGCCTGCTGGCAGGCACACAGCCATCAGCCAACAGCCCCAGGCCC---GGGCTGATTCACTGGGCCCTGCCTGCTGCAGCCTGAGCCCTCCAGCCACCCCAGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCTAAGGGTCCCAGGGCTCGGCAGCAGGGTCCCGGCGGTGGATCCGTGTCC------------------- 12 Equus_caballus-NC_009145.3-206954_207593 93.8% 61.5% -----------------------------------------------------------------G-------------GTGCAGGGTCCAGGGTTTGAAGTCTCTGCTT---GGGAG---AACCTGG-TGGCGGCCTCCTCCCCCCGCTCTCAC-TGGGCCCACTT--GCCCTGAGACCTGCAGACCCTCTGCCAGCGCC-GACTCACTCCAC--CCCAGTGC------A--GGCAGGGCGCATTCCTAGCCTGTGCCGAGGCCATAGCAGACTGTCGCTATCCCTGGTAGAGGTGCCCTGG---------------------ACCCTGAGTGGCCCAAGCCAGACATGCCTGCCAGTGCCCTCGACAAGCTGCTCCCTCGGGCTGCAGCAGGCTCAGCC-AGGCCGCCACCTGCCGGAGCGCGGTTGGATGGGGCTGAGTGGCCCCCATCCCTCTGGCCTGGCCGCCAGCTATGTGGGCTCCTTCTCTTGCAGGTCAAGCAGGCTCTGGGCTTAAAAGGCCTGTTCCTCCGAGGCCCAAAGCCCGGCTCCCTGGACAGTCATGCTGCTGGACGGCCTCTGCCCCGGCCCTCCGTTAGCCAGCGGCTCCTGCGGCGCACGGCCAGCGCCCCGACCAAGAGCCAGAAGCCCGCCCATAAGGCCTTCCCGGAGCTGGTCCTGGGCACACAGGACATGGGCTCCGAGGGGGAGGCACGCGACGTGGCGCCCCCCAGCCCTGGCCCCGCTCCGGAGGCCCTGGCTGGGGAGGAGCCCGGCAGCCGTAC---CCCCCGAGGTAAGGCACCG------------------------------GCAGAGAAGAGGCCGGCGCAGGGGCAGCCCCTGCGTGCCCCCGAGGGCCCCAGGCCTGCTGGGATGGCCGCCACCTGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGTGCCGGTGAGGACGCAGAGGCCTTGCGGATGGGGCGGC---CTCCCAGCCCAGGGCCTGCGGGCGGGCACGCGGCCATCAGCCAACAGCCCCGCGCCC---GGGCGGACTCGCTGGGGGCCCCC------------------CACACTGCCGTGGGGAGAAGCAGAGGGGCCCCCAGGGGCCCCAGGGCCCAGCGGCAGGGTCTGGGCGGCAGCGGCTCCGTGTCCTCGGACTCCAGCAC-- 13 Pteropus_vampyrus-NW_011889090.1-192396_193033 87.0% 56.1% 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14 Rattus_rattus-NC_046154.1-192396_193073 92.8% 57.9% -------------------------GAGTGTAACC------ATGGTGATGGCCGACCCCAACTTTT---------CCTTTCCCCAGATCTAAGGCTACAGTCCTCAGTTCCTCAAGGC-TGGGACAAG-TGGGTGGCCAGGGTGTAGGGATTGAGTTCTGCCCTTGAGATAACACCGGGA-----------------------------AGGTTCTCTAGCTTCCATCTCAAGT------------------TTAGTCTGAAGCGTGAAGTCCTGTGGCCCTTGG-----TAGAGTTGCCAGGAAACCCTGTTCCCTGTATT-------GCA-------------------------------ATATGCTC-TATGGCAGTCCATGGTAAACTACAGGTT-CAGAGCACCCTCTGGAGAGCCAGTTTCCCT-TCTGAAGCCACACCCGGAACCAGGTGGGCCAGGCACCGGCTATGTGGGCTCCTTTTCTTGCAGGTCAAGCAGACTCTGGGTCTAAAAGGTCTCTTCCTCCGAGGCCCAAAGCCAGGCTCACTGGACAGTCATGCTGCTGGGCAGCCCCTGCCCCGGCCCTCCGTTAGCCAGAGGCTCCTGCGGCGCACAGCCAGTGCCCCAACCAAGAGCCAGAAGCCAAGTCGCAAGGGCTTCCCAGAGCTGGCCCTGGGCACACAGGACGCAGGCTCCGAGGGGGCGGCTGACGACGTGGCACCCCCTAGCCCCAACCCAGCTCTGGAGGCCCCTACTCAAGAGAGGTCAGGCAGCAGCAG---TCCCCGAGGTAAGGCACCAGCTGGA---------------GAAGCAACAGAAGAGAGAACACCGGCACAGGTGCGGTCCCCGCGTGCCCCCGAAGGCCCCGGACCTGCAGGGATGGCCGCCACATGCATGAAGTGTGTGGTGGGCTCCTGCACCGGTATGGACGTTGAGGGCCTTCGAAGGGAGCAGC---AACCCAGTCCTGGGCCTGCAGGCAGCCGCACGGCCATCAGCCAGCAGCCCAGGGCCC---GGGTAGATTCACTGGGGGGCCCTTGCTGCAGCCTGAGTCCTCGAACCACCCCAGGGAGAAGCAGAGAGGCCCCCAAGGGTCCTAGGGCTCGGCGGCAGGGTCCAGGTGGCGGCTCTGTGTCC------------------- 15 Castor_canadensis-NW_017871110.1-190133_190854 98.4% 65.3% 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