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 1 Target                                              100.0% 100.0%    ------AGC-------CCTGTGCCCTTCCTGGGTCAGCT---------G--------G----------------------------------------------------------------TGTGTGGGT----------G----------------GGGGCCGACCCAGGGAGCACCTCACTGGCTCCCAAAAGGCAGGAGTGGG--AGACAGGGCAGCCAGCCCAGCCCCAG-GGCCAGCTTGAGCAGGGAGGTCCAGACAGGGACGGAACG---AC----TATACAAGATCCCAGAAACTTCAGGC----AGGGAAGCTCAGAGG---------------GCCAGCTCCATCTCCAGGACACCCTCTCTG----------------TCTGAGACTCTCTGGCAGAGCATTCGTGG------------GGCTGCTCCCCGG----CCTGGCAGTGGCCCGGGGTGCTCTGGCCGGGAAGAGCAGCCCCG-----TGCCGGGACGGATGTGGCGGGCTCAGCCTCCTGTTTCCTCGCCTCCTCCGTGGCTCCATGCCTGCTCTGCCTGGCAGCGG---------CCCAGCTGCCACCCT-----CCCTCCCGCGC----CTGGCTATGGGCTGGGGGCAGGGCTGGCTCTGACCAC-----------TTGGCCCGAGGACCCTCCCCTTGGAGCTGCAGCCCCCTCCCCTCACTCGGCAGGAGCTCCCT-CTCTCCCAGCTGGCAGGCCAGGCTCCATCTGGTGACTTTTCAGGAAAGGCTCCCC---CACCGTGGCTGC-----CACGAGCCTGGCTCCCTCTGCAGCTCCTCT------GGGGTGTCC-TGGACGGTGGCTG-----GGGGCAAGGC------------------CGTGCACCTGCCTTCAGAGAGCCCCAGGCCAGGTGGGTGCGATG---CCCCTGCTGGCCATGCCCTGCTCAGTGAGGGCAGAGAGGCAGCCAGGGCCTCAGAGAAACCAGTGACTTGTGGCAGGGACAGGAGCCTCCAGGGACACACAATGGGGGGGGCACTCGCGGTGGGGGGAGGAAGCTGTGAAATGGGCTATTAATAGGGTCCCCTTCCTGATGGGGCTGTCAAGTGCGATTAATACCGCTGCTGTGAGCTGGGCTGCCACCAGCTGGGGATGGCTGGGGACGGCGA---GGGGGCA-GGAAGGGGAGCCCACTCTGGGAGGGA-----CCCTTACTGAGA-----------TGGGGACCTGGCCCTGGCTGTC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 2 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-176152_177119     98.4%  79.8%    ------AGC-------GCTGTGCCCTTCCTGGGTCAGCT---------A--------G----------------------------------------------------------------TGTGTGGGT----------A----------------GGGGCCGGCCCAGGGAGCGCCTCACTGGCCTGGAAAAGGCAGCAGTGGG--AGACAGGGCAGCTGGCCCAGCCCTAG-GGCCAGCTTGAGCAGGGAGATCCAGAGAGGGGCTGAGCAA--AC----TGTACAAGATGCCAGAAACTTCGGGC----AGAGAAACTCGGAGG---------------GCCA-GGCCATCTCCAGGACACCGACTCTC----------------TCCAAGGCTCTCTGCGGGAGCATTTGAGGGGCTGTTGGAGAAGCAGCTGCCCGG----CCTGCCGGTGGCCTGGGCTGCTCTGGCCGGGAGGAGCAGCTCTG-----TG-CAGGACGGATGCAGTGGGCTGGGCCTTCTGTTTCTTCGCCTCCTTTGTGGCTCCGTGCCTGCTCTGCCTGGCGGCCCG--------CCCAGCTCCCACTGC-----CCCTCCCGTGT----CTGGCTCTGCGCTGGGGGCAGGGCTGGCTCCGCCCAT-----------GTGGCTCAATAACCCTCCCCTTGGAGCTGCAGCCCCCTCCCCTCACCTGGCAGGAGCTCCCT---CTCCCAGCTGGCAGGCCGGGCTCCATCTGGTGACTTTTCAGGAAAGGCCCCCC---CCACTG---CTG-----CACGAGCCTAGCTCCCTCTGCAACTCCTCC------GGGGTACGC-TGGGCAGTGGCTGGGG--TGCCCTGGGA------------------AGTGCACCTGCCTTCAGAGAGCCCCAGGAGAGGTGGGGGTGATG---CCCTGGCTGGCCATGTCCTGCTCAGTGGGGGCAGAGAGGCAGCTAGGGCCTCACAGAAGCTAGTGGCTGGTGGCAGGGACAGGAGCCCCGAGGGACACACAGAGGGGACACTTGCAG-------GAGGGGAAGCTGT-GAAATGGTCTATAATAGGATCCCCTTCCTGATGGGGCTGTCAAGTGCGATTAATACCGCCGCTGTGAGCTGGGCTGCCGCCAGCTGGGGACGGCCGGGGACGGTGA---GGAGGCA-GGAAGGGGAGCCCACATTGGGAGGGA-----ACAGACCTGGCC-----------TTGGCTGTCCTGGAGGAGGCT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 3 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-165282_165955   89.9%  49.7%    -------------------------------------------------AGACCCTTGCGCGG---------------CCCAGGCCACATTC----------------CGA--GGGACT---TAGCCGTCT----------C----------------CCCGTCACACCGGGCAGGCTCCGGCTGCACC----ATTTCCTCCTGAAG--CTCCATGGCACTGACTTTCAGACC--------CCTGATT---------TTGGGCAGCCCTTGCCCTC--CT-GGGTCAGTGGGGGCAGGGAGAGCTGTGCT----GGCCCCCCAAGGGCAGGAGGCACCGATGGGGG--------ACCCGCGAGAGCAGGGGCAT----------------CGGGGCGGGGACACGTCACAGGATGCTGGGATGCTCGAGGAAGCTGCTC-CTGG----CCTCGCGGTGGCCCGGGCTG-CCTGGCCTGGCGGAGTGGCCCAGCGCCCGGGCACGGATCCCATGGCCCGGC-CACCTTCCGTTTCCTCGTCTCCTC-TGTGCGCCGTGCCTGCCCTGCCTGGCGGCTG---------CCCAGCTACCACCCTGCTTCCCCGCCTGGC-----GGGGCTCTGGGGTGGGGGCAGGGCTGGCTCCACACAC-----------ATGGCCTCCGGGGCCCTCCCCTGGAGCTGCAGCCCCTGCCCCACGG----TGGGGGCTCCCC-CTCTTCCCAGCTGGCAGGCCGGGGCCTTCTGGTGACTTTCAGGAAAGGCC-----------CATGGCTGC-----CGTGAGCCCGGCTCCCTCTCCAGCTCTGCC------GGGGGTGTCCTGGGCAGTGGCCTGGGGCCAGCAGCAGC------------------CACGCACCTGCCTCCAGAGAGCCCCAGGCCAGCCGGGGCAGCTGTGTCCCTCGACGGCTGTGCCCTGCTCGGGGAGTGAAGAGGAG----------------GCCA-CTGTGACTTGTGGTGGGGACAGAGCC-CCCAGGG----ACATGTGAATGAGGGACACCTCCAG-------GGATGGGGAAATGGGCTACTAGCAGAGTCCTCTTCCCCACTGGACTGTCGTATGTGATTAATGCCACTGCTGTGAGCTGAGCTGCCACACGCTGCCGACTGGGGATCGGGGACGGAAAGGGGCAGGAATGGGGAGCCTGTCCCAGGAGGGA-----GCCCCGCTATGG-----------CCAAGACATGGCTCGACCAGTGTGAGGAGGCCC--------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 4 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-229383_230062  83.1%  36.9%    -------------------------TCCACGGCTCCGATGTTCAGCCCCTGTGACTGAG-CTG--A------------------CCAAAGGCTGGGTT----------TTGGGGAGCCCAATTCTCAGAGGCAGCCCCTGTGCCCCTCCTGGAGTA-GCTCAGTGGGTGGCAGGTGGGGGACCAACCC--TGAAGGGCAGGAGGCAG---AGATGGGCAGCTGGCCCAGCCCCCAGGGCTGATGTGAGCAGGGTAGGAGTT-----GG-------------ACAGAGCCTGGGCGAGAAACT--TTAGAC----AGTCAAACTT---------------GGAAGGCCA-GCCCGTTTCCGGAGCTTC------------------------------CTCTCTGT----------------------------------CCAAGGCT----T---GCGGTGGCGGACGGAGCGGCCAGCGCCCA---------GGGCCT---G--GCCGCGTGGGCTCAGCCTTCTTCTATTTCCTCG-TCTCCCCATGGCGCTGTGCCCGCTCTGCCCAGTGGCCACTCGGCCCTGCCAGCTGCTGTCCTCCTTCCCCCAAGGCCTGG--GCTCTGGGGGTGTGTTCAGGGGGCAGGCTGGCCCTGCCCACTGGGCGGCCAACTCAGGACCCTCCCCTTGGAGCTGCAGCCCCCTGCCCCTCCCTCGATGGGAGCTGCCTCTCCTTCCCACAGGCAGGCTGGGCTCCATCTGGTGACTTTTCAGGAAATGGCCCCC---ACCCTCTAGCGG------CTGCCTG-GAGC---CTCGCTCCCTCTC-------CAGCTGCTCCAGGGGGTCTGTGCAGTGGCTTGAGGGCGAG----GCC----------------CTGTCCCCAAGAGCCCCAGGC-CAGGTGGATACATGTC--CGCTTGGCCTGCAGGTCCTGCTCAGTGAGGAGGCAGTGA-GGC------CTTGGGGAAACGAGTGGCTGA-TGCAGGGACAGGAGCCTG---G------GGCGCGTGAATGGGTGC--CTGTGGCACAGGAAGCTGTGAAATGGGCTGTTAACA--GAGCCCTCTCCTGCAGAGCTGTCGAGGGTGATTGATGTCCCACTGTGAGCTGGGCTGCGCACGCCACCAGCT------------------------GGGGATGGCCAG--GGACGGTAGGGGACA----------------------------GAAAGGGGAGCCCA-GC-----CTGGGAAGGACCCTTCCT-------AAGGGT------------TGGACACAACCCTGG---------------------------------------------------------     
 5 Microcebus_murinus-NC_033661.1-162542_162883         78.7%  39.0%    -------------------------------------CTCCGCCTGCTCAGACCCTCGTGCGG---------------CCCAGGCCACACGC----------------CCA--GGGACTCGGCCAGAGTCT----------C----------------CATGTCACCCCGGCCAGGCCTGGGCTGCGCT----ATTTACTCCTGAAG--CTCCATGGCACCGACTTTGAGACC--------CCTGATT---------TCGGGCAGCCCCTTGCCCT--CCTGGGTCAGCGGGGGCGGGGCAGACGCAGGG----AGAGCCGCGCTGGCCC--CCACAGGGGACGGG--------GACCCGGAAAGCAGGGGGAT----------------TGGGGCAGGGCCAGGTCACAGGATGCGGGGACGCTCGAGGAAGCTGCTC-CTGG----CCTC----------------------------GCAGTGGCCCAGCGCCCGGGCACGGGTCCCATGGCCCGGC-CGCCTTCCGTTTCCTTGTCTCCGC-TGTGCGCTGCGCCTGCCCTGCCTGGCGGCTG---------CCCAGCTGCCACCCTCCTTCCTTGCCTGGCC----GGGGCTCTGGGGTGGGGGCAGGGCTGGCTCCACGCAC-----------GTGGCCTCCGGGACCCTCCCGAGGAGCTGCAGCCCCTGCCCCGCATGTGGTGGGCGCTCCTG-CTCCTCCCAGCTGGCAGGCCGGGTCCTTCCGGTGACTTCCAGGAAAGGCCC----------CATGGCTGC-----CGTGAGCCTGGCTCCCTCTGCAGCTCCTCC------GGGGTGTCC-T-GCGCCTTGGCGGGGGCCAGCATCAGC------------------CACGCTCCTGCCTCCAGAGAGCCCCAGGCCAGCCTGGTGTGGGACACCTCCGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------GACAGG-------GAGCTGTGAAATGGGCTATTAGCAGAGTCCTCTCCCCTACCGGGCTGTCGTATGTGATTAAGGCCACTGCTGTGAGCTGAGCTGCCACATGTCACGCCGG-----CTGGGGATGGAAAGGGGCAGGAATGGGGAGCCCGTTCCAGGAGGGA-----GCTCAGCTGAGG-----------CCAAGACACGGCCGGGCCAGCGCAAGGAGGCTCCAGGCTCTGCTGAGAAAGGCCAGGTGTTGGCCCTCCCTGGGCTGAAGTCACCAGATCCCCGTAGCAGGAGGGAGGCGGAGTGGGGGGTCCTCTGGGGGCAGGCG     
 6 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-130374_130889        86.0%  39.1%    -----------------------GGGCCACATGTCC--TCCATGGCCCCAGG--------C-----------------------TCCTACG-----------------GTCAGGTCCCAGGTTCCCAGGTCCCTCCTGGGTCAGCAGTGCCCGTGG--GGGGCAGACCTGGGGAGAGCCTACTGGCCC--CAGAGGATAGGAGGCAG---AGACGGGCAGCCTGCCCGGCCTGGGGCCTGTGTG-AGCAAGGGGTGTCCATA----TGGGGGGAGC-A---ATGCCGCAGGGTGCCGGCAGTGGTGGGCAGGAGACTTCGGGCTGG------------CGCCGGCCCAGGACACCCTCTGGGCCCTGCTCTCTG-----------GT--GGTGTGTCCTACGACTGCACAGGGGCAGAGCTCTCCAGAGGCTGCCACTGGCCTC-------T-CGGT-GGCCTGGCCAGCTCTGGCCAGGAGGA---------ACGGCC---A--GTGCTGGGGCCTCAGCCTTCTCCTGTTTCCTGC-TCCCTCCGAGGCTTGGTGCCCC-------------------------------------------TCCCTCCCCCGCT----GGCCTGGCTGGGTGGGGACAGGCCTGGTCCCACC----C--------ACACAGCCAAGGACCC-TCCG----TGCACATGACCCCTCCCCTCCCTCAGCAGGAGCTGTCT--CTCTCCCCACTGGCAGGCTGGCTCTGTCTGGTGGCTTTTCAGGAAAGGTCTCCC---ACCGCAGCTGCT------GCCCGCC-CGGCTCCCTCTGTGGCTGTG-------TGGGGGTGTCCCGGGCAGTGACCTGGGCAAGGCCTGCGCC----TGGCCGTACGCCT---------GCTCCAGAGAGCCCCGGG-CCGGCGTGTGGGTGTC-----------CCGGTGACCTGCTCAGCGACGGAGCAGCAG-GGC-------CTCGGGGAAGCCAGGGGCTGTGGCGGGGACAGGCGCCCC---C------AGGGACAGAATGGGCAC-CTGCGGGAGCAGGAAGCTGTGAAATGGGCTATGAATAGAGTCCTCTTCCCGGCTGGGCTGTCGAATGTGATTAATGCTGCCGTGAGCTGAACTGCCACATGC-CACCGGCTGAGGAAGGCGAG-G----------GTGGAAAGGGAGCCGGCTTGTCGGGGAAC------CCTCACGGTGG-----------CCAAGACATGGCCTGAC------CGGCCACAAGGGGACCC-------CG---G--------------------------------------------CT--------------------------------------     
 7 Lemur_catta-NC_059130.1-163634_164190                89.1%  45.7%    --TGGCCAC-------ACTGCCCTGGGGCTGGGTCCCCTCCGCCTGCTCAGACACTCGCGTGG---------------CCCAGGCGCACA------------------CTC--TGAGGGCCTCTGCCGTCT----------C----------------CATGTCACACCGGCCGGGCCCCGGCTGCACC----ATTTCCTCCTGGAG--CTCCATGGCACTGACTTTCAGACC--------CCTGATT---------TCGGGCAGCCCCGTGCCCT--CCTGGGTCAGCGGGGGCGGGGCAGACGCAGGG----ACTGCCGCGCCGGCCCCCAAAGGGCAGAGGCACTGATGGGACCTGCCAGAGC-AGGGGAC----------------TGGGGCGGGGCCACGTCAC--AGGTGCTGGAAGCTCGAGGAAGCTGCTC-CTGG----CCTCACGGTGGCCGGGCTG--CCCGGCCTGGAGGAGTGGCCCA---------------------------------------------------GCA-TCCGGCACGGGGCTACCTGGCCTGGCGGCTG---------CCCAGCTACCACCCTCCTTCCCCGCCCCGC-----AGGGCTCTGGGGTAGGGGCAGGGCTGGCTCCTCCCTC-----------GCGGCCTCCAGGGCC-CCCCGCAGAGCTGCAGCCCCTGGCCGGCAGGCGGTGGGCGCCCCCT-CTCCTCCCAGCGGGTAGGCTGGGTC-CTTCTGTGACTTCCAGGAAAGGCCC----------CACAGCTAC-----CGTGAGCCCGGCCCCCTCTCCAGCTCCTCC------CAGAGTGCCCTGGGCGGTGGCCCGCGGCCAGCATGAGC------------------CATGCACCGGCCTCCAGAGAGCCCCTGGCCAGCGGGCGT----GTGTCCCTCGCCGGCCGTGCCCTGCTCGGAGAGTGAAGAGGAG----------------GCCACCCATGGCTTGTGGTGAGGACGGAGCC-CCCAGGG----ACATGGGAACCAGGGACACCTCCAGGGACGGGGAGCTGTGAGATGGGCTGTTAACAGAGTCCTCGTCCCGACCAGACTGTCGCGTGTGATTAATGTCACTGCTGTGAGCTGAGCTGCCACCCACCGCCGGCGGAGGATGGAGGACGGAAAGGGGCAGGGAAGGGGAGCCCGTTCCAGGGGGAG-----CCCCGGGGAG-G-----------CCAAGACCCCGCCCGGCCAGCACGAGGAGGC----------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 8 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-162643_163530      90.4%  48.9%    -----------------------TTCAGCT-----------TCATTCTCAG------GGGAGC---------------CCCTGTC-----------------------CTC--CTGAGTCAGCAAAATGAG----------G----------------AACACAGCCCTGGGGAGAGCCCCACTGGCCCCCA-AAAGCAGGAGGCAC--AGACAGGGCAGTCAACTCAGGCCC--------AGGGGAA---------CCGGGGAGGGGCTAGGCCA------CGTCACAAGATGCTAGTAAACTTGAGGC----AGTGCAGCATGGAGGGCAGCTCTGTTTC--TCAACATGCTTTTTGTCTGAGT-CTCTCTG----------------TAACCTTCCCAGGGCTGTGGAGACTCTGGGGGTCTTGAGGAAGCTGCTC-CTGG----TCTTGTGGTGGCCCAGGCTG-CCTGGCCTGGAGGAACGGCCCAGTGCCCGGGCACTGATCCCAGAGGCTCGACCGTCTTCTGTTTCCTCCTCTCCTCGGCGGCTCTGTGCCTGCTCTTCCTGGCGGCTG---------CCCAGCTGCCACCCTCCCTCCCCTGTCTGGC----CAGGATCTGGGGAGGGGGCAGGGCTGGCTCTGCCCAC-----------ACAGCCTTGAGCCCT--CCTTTGGAGTTGCAGCCCCTAATCCTCACATAGCAGCC----CCC-CTCCTCC--------TAACTGGCTTCATCTGGTACCTTCAGGAAGGACCTC----------CATGGCTGT-----CCTGAGCCCAGCTCCTCTT-CAACCCTTCT------GGGGGTGTCCTGGGCAGTGGACTGGGGCCAAGGCCCTG------------------TACCCCCC-----------ATTGGCTGTACACCTGCCTCCAGAGAGCCCCTGGTTGGGCTGGCCTTGCTTGGAGAGTGAAGAGGAG----------------GCCGCCCGTGGCTTGTGGTGGGGCAGG-AGC-CCTAGGA----ACATGTGAACAAGGGGCACCTGTGGGGACAGGAAGCTGTGAAATGGGCTATTAATAGAGCCCTCTTCCCAACGGGACTGCCAAGCGTGACTAATGCCACTGGGAACTGACTGCCACTCACCATTGGCTGGAGATGGCCAGGGATGGAAAGAGGGCAGGAATGGGGTGCTGGTTCTGGGAGGCA-----GAACTGAGCGGG-----------CCCACAGTTGTAGCAGGCAGGCAGAGAGGCAGCGT------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 9 Urocitellus_parryii-NW_020540697.1-268634_269083     83.1%  37.3%    ----------------------------------------------------GGCAGGAGTAG--CTGGCCCCGGGAGCCCTCCAGCTCCACCCAGAAGGAGACCGGAAGGTCCTGGGGTGTGAGGGTGG---------------------------GGTCCCAGCTCAGGGGAGCAGGCCACTCATTCCT----------GGGGGC--GGGTCCTGTAGCCTGCTTAGG-----------CCTCATAGCCCGTGGACCTCCAAGGGTCTCGGGCATTGTGACTTCATGAGATGCCGGGAGCCTTTAGGG----AGACGGACTG---------------GGAGGGCCAGCTCTGTCTCCAGAACGCCCCCCACTGGC------TACCTGTGAGTGCTGTGGGGCTG-TGGAGGACCCAGGGCTCTCAGGAA-----GCTGCTCCCTGGCCTCCCGGTGGCCTGGGCTGCTCTGGCAGGGTGGAGTGCCCCAGAGGCGAG---GACTCACCCAAGGTGCTCAGCCCTCCCGTGTTTTCT-TCTCCCAGG---CTCTGCCTGGCCCCA----------------------CTCGGGCTGCCCATCCCTCCTGCCTGACCTGGGCTCCAGGCAGCAAGGAGAAACGTGGGGTTGGCTCTGC-----------------------------------------CCACAGCCTGGAGGACTCTCCCTGGGAGT------TTCGGGCCCCCCACCCAGGGCTCCATCTGGTGACCTTCCAGGTTTAAAGAGCC---CCA-------CC------CCAAGGC-TACTCCCTCTCCAGTTCCTC------CTGGAGTGTCCTGGGCAGTGGCGTGGGGGCC-AGACCTGTCCCCCATGCTGG----CCGTGCACCTGTCTTCAGGGAGCCGTGGC-CAAGTGTGTGTGCATC--TGC-TC---AGCCAGGCCTGCTCAAGGGCGAGGGGACGA-GAACTGAGGCTCGGGAAAGCCAGTTGTTGGT--GTSAGGGACAGGGCCCCAGGG----ACATGGGGCTGAGGGGCACCTGCGGGAGCAGGGAGCTGTGAAATGGGCTATTAATAGAGTCCTCTTCCTGGA-GGACTGTCGAGTGTGATTAATGCCACCACTGTGAGCTGAGCTGCCACATGCCACCAGCTGGGGCTGTGCGGGG--------CAGGGAGAGGCGCATTCTCTGG--------------------AGGGA----------CCCTCACTGAGG--------------CTGGACTTGGCCCTGGGGCTGAA-----------------AG---------------------------------------------------------------------     
10 Equus_asinus-NC_052181.1-172240_172539               80.5%  35.5%    ---------------------------GGTGGCTCC--TCCTGAGCTC---CCTCCCAG-GTC-----------------------AGCGGCAGTGAG----------TGTGGGATGGCATGGAGG----GGAGCCAGGGTGAGACC--------------------CAGAGAGGGCCCACCTGGCCC--CACAGGGCAGGAGGCAG---GGACAGGCAGCCAGCCCAGTCTCCAGGCAGGAGTAAGGTGGG--------GG----TC-------------ATGTGTGAGATGTGGGAAAAC--TTAGGA----TGTCAATCCT---------------AGAGGGCCTGGCCCGGTTCGAGAACATC------------------------------CTCTCCATG-CTGTGGCCCCAGGGCTCTCGAGGAAGCTGCCTCCTGCCTC----TGAGGTGGCCCTGGCAGGGAGGGGCACCGGGCC---------TAGGAT---G--GATGCACAGGCTCAGCCTTCTTCTGTTTCCTGT-CTCCTCCGTGGCTCTGTGCCCACTCTGCCCGGCGGCCGTCCAGCCCTGCCAGCTGCTGCTCGGCCTCCCCCGCGGCCCGG--GTGGGTGGGGGGTGGGGGCAGGGCCGGCTCTGCC-------------AATGCCTCAAGGACCCCTCCCTCGGCG--CTGCTGCCCCTTTCTCTCACTGCAGGAGTTTCCTCTCTTCCCCGCAGGCAGGCTGGGCTCCATCTGGTGACTTTTCAGGAAAGTGCCCCC---ACCCCCTGCGCC------AGCACTG-TGAGCCTCTCTCTTCCTCTC-------TAGCTACTCCCTGGGCACTCCCCAGGGCCCTGTCCCTGTC----CCCGATGTAGCCGAGTCCCT-GCCTCCAGGAAGC---------------------TT--GGCTCT---CCCAGCCTCTGCTCAGTGAGTGCGCGGGAA-GTG------AGTGCTGGAGCCCGATGGGAG-TCCCGGCATGTGACCTGG---G------AGCACTTG--CAGGAGC--AGGA------------GGCCTCGGACGCTATTAATA--GCGGCCTTTCCCACAGGACTGTTGAAAGTGATTAATGCACCACCTTGGCTGCGCTGGGACTGGGACCGCGGGAGTGGCT-----------------GGGGGCTGGGAC--GGACCCTGGCTGAGG----------------------------CTGGGACTGGCCCT-GC-----CCGGGTTCGAGGAGCCCT-------GGG-CTCTGCTGAGCAGGCAGAGGAAGGCCAGATGTCCAGATC---CTGCCTTGC-----------------------------------     
11 Desmodus_rotundus-NW_020090861.1-181115_181407       81.8%  32.6%    ------------------------------------------------------------------------------------CCACATGCTCGCCTGCCAGCTGCACTGCTGTTTGCTTTGGAAATTCTTCCTGGAGCTGAGGCTCCTGCGGGG--AAGAGCCA-----------------CCACCCCCTCCCAGTCAGTGGGAG------------GCTGGGGCGCGGCGCAGAGGAGAGACAGGGAGAGCCCACCTTG----GGACAGGTGG-TAGGGACCAACAGTGGGCCCAGCCC--CCAGGCAGGCAGAGCAGAAT---------------GAGGCTCCTGCTCGAGGTTAAAAGTCAAACTTGGA-----------CA--CTGGTGCCCCCTCCGTG-CCAAGGCCCCAGGGCTCTTCAGGCAGCTGGCTGTCCT-------------------------GGCTGGAGGAACAGG---------GGCTGG---G--GACAGCTTCAGGCTCAGCCATCCTGCTTCCTGT-CTCCTCCGTGGCTCTGGGCCCGCTCTGCCCGGCAGCCATCCAGCCCGCCAGCTGCCACCCGGCCTCCCCTGATGCCCG----GTGGGTGTGCTATGGGGGCACGGCTGGCTCCACC-------------AAAGCCTCCAGGACCCCTCCC--T-GGGAGCTGTGGC-CCCCCTCACCCTGCAGGAGCTTCCTCCCCTCCCCTCAGGCAGGCTGGGCTCCATCTGGTGACTTTTCAGGAAAGTGCCCCC---ACCCCCGGTCGC------TGCTGTG-AGCC----TCGCTTCCTTTC-------TAGCTGCTTACTCAGGGCCCCCTGGGGCCCGTCCCCGCCT----AGGCTGAGCACCC---------CCTCCAAGGAACTCTGACGTAGGTGGGTGTGCATG--GGCCCTC-CTCCGGGCCCCTCCCAGCTGCCACACTGCTG-CCTGGCCAAGGGCCCCCAGAGCACCGGAAC-GGGCACCTGTGAGGGCAG---G------AGGCAGTGGATGGC---------------------------------TATTAATA--GTACCC-TCTCCACAGGACTGTTGCATGTGATTAGCGCCACGAGGGAGCTGAGGTGGGGACCACCTCGGCCGCAAGGGCCAGGGTGCTGCTCC---GGGGGGGCCCTCTCGGAGGCCGGGCT-------GGCTTGGCCCGGGGCTGCCAGGCAAGCAGAAGAAGGCCGGGCA---CTGGGAGCAGGACACCCCAGGACCCCG--------TGGC----TC----------------------------------------------------------------------     
12 Heterocephalus_glaber-NW_004624818.1-167453_167757   83.7%  33.4%    ------------------------------------------------GGGCTCCTGGGGGTGAGAG---------GCCCCTCCAGCTTTGC-CAGGAGGAGCCAGGCAGGCCCTGGGTTCTGGGAAGCCCT-GTCCGGGGCAGTGG------GCT--GCCTTGTTGTGGGGGATGGTCCCCTCAGCC------TGCTCAGGAGCAC-------------A-GCCCTGGGGC---------TCTGAGG------------------AACTTGGA-------GCATCTCAACCCCAGGTTAATCAGCGGGG--TCCCTGCAGTCAGCAC-----------TCCGTTCCCCCCGAAGCTGCTGGCCACTGGGGTCA-----AGCCGACCGACTGCGGCCAGCTGGTGTGCAGGCCACCTCGAGCTCAGAG-GTGGGGACAGAGCAGGGA-G--AGCCTC-ACC---TGTCCGC------------A----TGGGTGGGACACAGGGCTGGGGTAG---------------------------CCAGCCGAGTGTCCGGGCTGGCGAGAGCGGGCGGGCACCT------GGACAGGACTGGCGACTCACACGGTGGTGGG----AAACTTTAGAGCGTCAAACTTGGGGACCAGCTTG--------------GTTCCCGAACATGCTCTGCC--G-AGGCTCCCAGGCCAGTGCCCAGCTGGCTGGAGTGGCCC---AGCCCTGGGCTCTGGCCCTCGGGGCTCTGCTGGCCGTGTC---CTCCACCCCCGGGGTCCAGACTGGCCCTGGCCCCTGGGAAGCC-CCACCTCTGCAGCCCC------TCTGGGCACCAGGCAGTGGCTCGGGGGGCCAGGACCTGT-----------CCCATCTGGACACCTGCCCCTAGGAGGCCAGGC--CAGGCAGGTGCTGTGT---GCTTG---GCCAGGCCCCGCTGGAGAGTGAGAGGCA----GC--GGAGGCCTCAAGGAAGAGTGGCTGGTGGCAGGGAAAGGAGCCCCCGGGG----ACACAGGGATGCAGGGCACCTGCGGGAGCAGGAAGCTGTGAAATGGGCTATTAATAGAGTCCTCTTCCTGGCGGGGCTGTCAAACGTGATTAATGCCACCACTGTGAGCTGAGCTGCCACGTGCCACCAGCTAGGGACAGAGGAGACACTGAGGGGTAGGCTGGGCTCTGCTGGGTGGGCAGA-------GGAAGGCCGGA-TGTTGGGGAGTCCTGATTGGA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
13 Miniopterus_natalensis-NW_015504651.1-665085_665419  80.4%  33.4%    ---------------------------------------------------------------------------------------------AGCCCGTCAGCCGCCCTGCTGTTCGCTTAGGAAACTCTCCCTGGTGTTCAGGCCCCAAGGTGG--GGAGGTGGATCAGGTGGCTCCTCCTGAGGTCCCTTCTGATCAGTGGTGGGCGTGTGGGGAGATGGCCCAGAGAAGCAGGTGAGACCCGTGGAGGGCCCACCTTG----GGGCAGGAGG-TAGGATCGGGCAGCTGGCCCAGCCC--CGGGCAGGGGAGCAAAA--T----------------GGGGTCCTGCCCGAGGAACAGGAACTCGGAGGCC-----------TG--GCCCTGTCCTCTCCATG-CCAAGGCCCCAGGGCTCTCGAGGAAGCTGCCTCCAGC-------------------------TGCCCCCTGCCCTGG--------------G---G--GAGGAGCTGAGGCCAGGACAGCCTGTTTCCCGT-CTCCTCCGAGGCTCTGCCCGCTCT--------------------------GCCCTCTAGCCTGGCCAGCTACTGCCCG----GTGTGAGTGTGGTGGGGGCAGGGCTGGCTCCACC-------------AGAGCCTTGAGGACCCTCCCT--GGGAGCTGTGGCCCCTTCCCTCACCCTGCAGGAGTTTCCTCTCCTCCCAGCAGGCAGGCCGGGCTCCATCTGGTGACTTTTCAGGAAAGCGCCCCC---ACCCCG--GAGC------TGCTGGG-AGCT----TCTCTTCCTTTC-------CAGCTGCTCCCTGGGGGCTCCCTGGGGCCCGTTCCCTCAG----AGGCCGGCACCTC---------CCTCCAGGGAGCTCTGGCTGAGGTGGGTGCGTTGG--GCCCTCC-CACATGCCCTC--C-------------------TAACTGCAGCCCCCGGAACACACAAATCA-GGGCACCTGCGAGGGCAG---G------AGGCTGTGGACGGC---------------------------------TATTAATA--GAGTCC-TCCCCGCAGGACTGTCGCATGTGATTAATGCCACCGAGGTAGCTGAGGTGGGACTGCCTCGGTGGCAAAGGGGCAGGGGGACCTTCGCTGAGGCCGGGCCGGCCCCGGCTGGGTGCAA----GGCGGCCCCGGGCTCTGCTAGATAGGCGG----------AGGGAGGCTGGGTGCTGGACACCTCGGGTCCCCCATGGCATCCGGC----AGGCTTGGTGACAAATG---AGGGCCTGCTGC----------------------------------------     
14 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-170587_170899     83.4%  38.5%    ------------------------------------------GAGCCC---CCTCCCGG-GTC--A--------------------GCGGTGGGCGCC----------TGGGGGACGGCATGGAGG----GTAGTCAGGGTGAGACC--------------------TGGGAAGGGCCCACCTGGCCC--CACAGGGCAGGAGGCAG---GGACGGGCAGCTGGCCCAGCCTCCAGGCAGGAGCGGGGTGGAGTTTCCCACA----TC-------------ATGCACGAGATGTGGGAAACT--TTAGGA----AGTCAATCCT---------------GGAGGGCCTGGCCCCACTCGGGAACATC------------------------------CTCTCAGTGCCTGTGGCCCTAGGGCTCTCGAGGAAGCTGCCTCCTGGCTC----TGAGGTGGCCCTGGCGGGAAGGAGGGCTGGGCC---------CAGGAT---G--GATCCGCCGGCTCAGCCTTCTTCTGTTTCCTGT-CTCCTCCATGGCTCTGTGCCCACTCTGCCCGGCGGCCGTCCAGCCCTGCCAGCTGCTGCCCAGCCTCTCCCGTGGCCTGG--GTGGGTATGG-GTGGGGGCAGGGCCGGCTCTGCC-------------AGTGCGCAAAGACCCCTCCCTCGGGGC--GGCTGCCCCTTCTCTCACCCTGCAGGAGTTTCCTGTCTTCCCAACAGGCAGGCTGCGCTCCATCTGGTGACTTTTCAGGAAAGTGCCCCC---ACTCCCTGTGCC------GCTGCTG-TGAGCCTCTCTCTCCCTCTC-------TAGCTGCTCCCTGGGGGCTCCCTGGGGCCATGTCCCCGTC----CCTGAGGTAGGCCAGGTACCTGCCTCCAGGAAGCTCTGGT-CAAGGTGGTGCCCATT--GGCCCT---CCCAGCCTCCGCTCAGTGAGCTCGTGGGAA-GTG------AGCCTGGAGCCAGGACGGGAG-CCCCAGCACGTGATCCAG---G------GGCACCCG--TGGGAGC--AAGA-GGCTGTGCACGGCTGTTAATAGCTATTAATA--GCTTCCTTTCCCGCAGGACTATTGAGTGTGATTAATGCACCGCTGTGGCTGTGCTGGGACCACCGGGGTGGCCA-GGGG-----------------GCAGGAGGGGAG--GGACCCTGGCTGAGG----------------------------CTGGGACTTGCCCT-GC-----CTGGGTTCGAGGAGGTGC-------CGGGCTCTGCTGGGTGGGGAGAGG------------------------------------------------------------------     
15 Castor_canadensis-NW_017871110.1-158336_158778       87.4%  40.8%    ---------------------------------------------------------------------------------CAGCCCAGTTCTCAGAGGAATCT-GTGCCCCTCTGGGTCAGCCTGGTGAG-----------------------------AGTAGAACTGGGGAGAGCCTCACTCAGCCCCAAAGGGCGAGAGGCAG--GGACAAGGCAGCTGGCCTAGTCTGAG-GTCCGGCGCAAACAGGGTGGACATCT----GAACAGG-----------TGCCAGCAACTTCGAGGAAACTAGGA----AGTCAAACTT---------------GGAGAGCCAGCTCAGTTTCCAGAATACCATCA-CTGCTGAAGCTCCCTGCTGAGTGCTCTGGGACTA-CAGAGGGTCCAGGGTCCTCCAGGAAGCCACTCCCAGTCTTCGAGCTGGGTGGCCCTTGTTGCTTTGGCAGGGTGGAG---------------------TGGCCCAACCTTTCCTTGACTCCTGTCTCCTCT-GGGCTTTGG--GCTCTGCTTGGCTCCACTCAGCTCTGC-----------CAGATGCTGCTTTCCCTCCCTGCCTGGCCTGGGTTCCAGGATATAAGGAACAGAGCAGGGCTGGTTCTGCCC---------AGTG--------------------CTCACTTAGGGACCTTGAGGACTCTCTCTGAGCTGCAT-CCCCCTCCCCTCCCTCCTCAGGCTGAATCTGGTGACTTTCTAGGA--AGAGCCCT---ACATAGACAGCT------GCAGCCT-GGCTTTTTCTCCAGCTTCTGCTAGGGGTATCCCATCCTGGGAAGTGACTTGGGGGCCAGGATCTGAC----------------CAGGCACCTGCCTTCAGGGAGTCCAGGC-TAGG-TGTTGCATGTC--TGTTCG---GTTGGGCCCTGCTGGAGGAAGGCAAGGC---AGCTGAAGCCTTGTGAAAGCAAGTAGCTGGATGCAAGGACAGGATCCCCCAGGG----ACACAGGACTGAGGGGCACCTGTGGGAGCAGGAAGCTGTGAAATGGACTATTAATAGAGTCATCTTCCTGGCAGGACTGCTGAATGTGATTAATGCCACCGCTGTGAGTTGAGGTGCCATATGCCAGTGCCTGGGGATGACCAGGG--------ACAGTGAGGAGACATGGGAGGGTCTCT-------------GGAGGGA----------CCCTCACTGAGG--------------CCAGTACATCACCCTGGTGTCC-----------------------------------------------------------------------------------------     
16 Artibeus_jamaicensis-NW_023552099.1-166588_166873    79.9%  31.7%    ACTGTCCTGGGGGCCCGTCAGCCAGCTCAGATAAGAGACCCGCAGACACACCTCTGAGGGGTCCGGGAGCT-----GGCCCAGCCTGCCTGCTCCCCCACCAGCTGCGCTGCTGTTTCTTTTGGACATTCTCCCTGGGGGTGAGG-----------------------------------------CCCCCTCCCAGTCAGTGGGGG------------GCCGGGGCGCGGCGCAGAGGAGAGACAGGGAGAGCCCACCTCG----GGGCAGGGGG-CAGGTGGAGC--------------------------------AGAGC----------------GGGGCCCTGCCCTGGGTCAGGGAGCCCGAGTTGG-----------AG--GCTGGCGCCCCTCCGTG-CCGAGGCC--------------------------GGG-------------------------GGCTCTCCAAGCAGC---------CGGCCG---C--CCTAGCCGGAGGAGCAGCCATCCTGCTTCCTGC-CTCCTCTGTGGCTCTGGGCCCACTCTGCCCGGCAGCCTTCCAGCCTGCCAGCTGCCACCCGGCGTCCCCTGGCGCCCA----GTCGGTGTGGAGTGGGGGCACGGCTGCCTCCACC-------------AAAGCCTCCAGGACCCCTCCC--T-GGGAGCCGTGGC-CCCCCTCACCCTGCAGGAGTTTCCCCCCCTCCCGACAGGCAGGCCGAGCTCCATCTGGTGACTTTTCAGGAAAGTGCCCCC---ACCCCCGGTTGC------TGCTGTG-AGCC----TCGCTTCCTCTC-------TAGCTGTTTACTGCGGGCCCCCTGGGGCCCGTCCCCACCT----GGGCTGGGTGGCCC--------CCGCCAAGGAGCCCTGATGTAGGCGGGTGCTCGTG--TGCCCTC-CCCCAGGCCCCTCCCAGCCGCCGCTCGGCCT-CCTGGC---CGGGCCCGGGAGTACACGTAG-GGGCACCTGCGAGGGTAG---G------AGGCGGGGGACCAC---------------------------------TATTAATA--GTGCTC-TCTCCACAGGACTGTCACATGCGATTAATGCCACAAGGGAGCTGAGGTGGGGACCACCTCGGCCGTGGGGGCCGTGGGGGCTGCTCCGGGGGGGGGGCCTCTCTGAGGCTGGGCT-------GGCCTAGCGGGGGGCCAGGGGGCAGCAGGGGGCTGCCAGGCCGGCGCTGGGAGCAGGACCCCCCAGGACCCCG--------TG------------------------------------------------------------------------------     
17 Peromyscus_leucopus-NC_051064.1-163815_164069        81.0%  33.6%    -----CCTG-------CTGAAGCTCCTCAGG-------TCTCTAGCTTCTAGACCTGGGGTTGAGATGACTTAGGTTTTGACAGCCCAGTTCTCAGATGCAGCTCATGCTGTTTTGGGTTACCAGGGATGACGGAACAACACAGAGAACATCCCAGGAGGTCCAGAGCCAGGGAGTCTCG--CCCGGCCTCAGCAAGAACACGGTGG--GAGGGAAGCGGTGGCTGTGGAGG---------TGTCCAGCAGGGC----------------AGGCGT--CTCCAACTTCAGGAGACACAGGCACTGGAGAA----AGTCACACTT---------------GGAGAGCCACTTTCCTCTGAGGCTGACTGGCCAGT---------TC--------------TCCGGCC-CTGTGG----------------AGGGCCCAGTGCTCTCTAGCCTCAAGGTGGCCCTTGTTGCCCAGC-GCGGGGCAC---------------------TTA-TTCAGGGGCTCCGACCTCTTAT-----GT-CGTCTCTGG--CCCCTGCTTGACCGTACCCAGAGGCCA-CCCACCCTGTCAGCTGCTGCCATCCCTCCTTGCCTGGTCT------GA-------------GCTCCAGGACTGGCTCTTCTC---------ATTC--------------------TTACTTGC--------------------------------GCTCTTGAGAGAAATCCCTACCCGAATCTGGTGACTTTCCAGCA--GGGGCTCC---ACACTGATGACT------ACAGTCT-GACTC-TGTAACAGCTCCTCCA-A------GGTGTCCCGGGCAGTGGCTTG-GGGTCAGAATCTATCCCAGACAGTGG----CTGATCGCTTGCCTTCA--GGAGCCCAGC-ACAA-GTATGCGTGGC--TGC-TG---ACTAGGCCCTGCTGGAGGAAGAGAGGGC---AGCTGTGGCCTCAGGGAAGTGAGTGGCTGGTGGCAAAGACAGGAACCCCCAGGG----ACACAGGAAGGAGGGCCACCTGGGGGAGCAGAAAACTGTGAAATGGACTATTAATAGAGTTCTCTTCCTAGCAGAGCTGTCGAATGCGATTGAAGCCACTGCTGTGAGCTGAGCTGCTACATGCCACCAGCTAGTGAT----AGCC--------AGGGACAGTGAGAGGGTAGGAAGGGTACCAGTTCTGTTC-TGGGGAA----------CTCTGATTATGG--------------TCCTGGAGCTCTGCTGGAGA-------------------------------------------------------------------------------------------     
18 Octodon_degus-NW_004524689.1-168323_168593           85.6%  32.7%    --------------------------------------------------------------------------------------CTGGGG-ACCAGGCCTCCCTTTCCACCCTGAGTTGTGGGA---CAA-GGTGCCTTGCTGCC------AGA--CAGTTGTCACGGGTGATGGCCCCCTCGCCC------TGCTCAGAAGCAG-------------GGGCCAGGGACC---------CCTGAGG------------------AACTTGGG-------GTACCTCAGCTTGAGGCAAGACTGTGTTA--TA-CTGCAGCCTGTGCT----------CCGTTCCCTCCTGAAGCTGCTGACCCCTGGGGCCG-----AGCCCACCATGGCCG-----CCTGGGGTGGGGGCACCCAGCACTCAGAG-GTGGCCTGAGCCACCCTG-G--TTCAGT-GCAGCGTGTGGCCAGCAGGGACAGAG----CGAGAAGAACCTCACCTGTCCCCCACAGGCTGTGATATGGAGATGGGACA-GCCAGCTGACCGTCAGAGCTGGAGTGAGCAAGTGGGTGTCT------GGACAGGGCTGGCGCCTGCACGAGCAACCAG----GAAACTTGGGACTTCAAGCCTAGACGCCAACTCA---------------GTTCAGAACAGCCTCTGCA--G-GGCTTCCTTGGCCAGTGC-CAGCTGGCTGGAGAGTCCC---AGGACCGGCCTGGTCCC---CGGGCTTTGCTGGCCTTTCC----CTCTGCCCTCAGGCCCCAACTGGCCTTGTCCACTACGAAGCCCCAGCCCCTGCCCCTTT------TCTGGGAGCAG----GAGTGGCTCGGGCGCAGGACTCGT-----------CCTGTCCGGATGGCTGCCTCTAGGAAGCCAGGC--CAGGCAGGTTCTGTCT---GCGTG---CC-AGGCCCTGTTGGAGAGCACAAGGCA-----G--CGAGGCCGCAGGGAAGAGTGGCCAGTGGCAGGGA-CGGGGGCCCCAGGG----ACACGGGGATGCAGGGCACCTGCGGGAGCAGGAAGCTGTGAAATGGGCTATTAATAGAGTTCTCTTCCTGGTGGGGCTGTCTAACATGATTAACGCTATCGCTGTGAGCTGAGCTCTGCATGCC-ACCAGCTGGGGACAGAGGGGACCCCGAGGGGCAGGAAGGGGGGCAGCCCTGGCCTCCA-------TTGAGAAGGCA-GGGGAAGGTCTGATGTTGGGG----------------GCTCTTGGG----------------------------------------------------------------------------------------------------     
19 Cricetulus_griseus-NW_003616165.1-37549_37836        81.9%  35.2%    ---------------------------------------------------------------AAATGACCTAGGCTTTGGCAGCCCATTTCTCAGATGCAGCCCATGCTGTTTTGGGTTACCATGGGCAATGGAGCAGTACAGAAAACATCCCAGGAGGTCCAGAACCAGGGAGACCCTCACCCAGCCTCAACAAGTACAAGGTGG--GAATGAAGCAGCTGCTGTTGAGC---------TGTCCATCAGGGGAGACATCC----AGACAGGTGT--CTGCAACCTCAGGAGATAGAGACACTGTGGGA----AGTCAAACCT---------------GAGGAGCCAGCTCCTTGTGCAGAAAAGTGCTTTCCTCTGAGGCCCA--------------CTGGGTT-CCATGG----------------AGGGCCCGGTGCTCTCTAGCCTCAAGGTGGCCCTTGTTACCCAGC-ACTGGGCAC---------------------TTA-TTCAGGGGCTCAGACCCCTTGTTTCCTGT-CGTCTCTGG--CCCCTGCTTGACCATACCCAGAGGCCA-CCCACCCTGTCAGCTGCTGCCGGCCCATCCCTTTTCCGGGGT----GAG------CAGCAGGGCAGGGCTGGCTCTTTTCTC---------ATTA--------------------ATAATTGC--------------------------------ACTCTGGAGTGATATCCCCACCCGGATCTGATGACTTCCCAGAA--GGGGCTGC---ACACTAGTGGCT------ACAGCCT-GATTCCTGTGACAGCTCCTCCA-A------GGGTGTCCTGGCAGTGGCTTG-GGGTCAGAACCTGTCCCAGACGGTGGGTGATTGATCACTTGCCTTCA--GGAACCCAGC-ACAA-GTACGCACGGC--TGC-TG---ACCAGGCCCTGCTGGAGGAAGAGAGGGC---AGCTGTGACCTCAGGGAAGAGAGTGACTGGTGGCAGAGACAGGAACCCCCAGGG----ACACGGGAATGAAGGCCACCTGGGGGAGCAGAAAGCTGTGAAATGGGCTATTAATAGAGTCCTCTTCCTAGCAGGGCTGTCGGATGTGATTGAAGCCACTGCTGTGAGCTGAGCTGCTGCGTGCCAGCCTCCAGCTAGTGATAGCC--------AGGGACAGTGA--GGGTAGGGAGGGTACCAGTTCCACTCTGGAGGGA----------CTCTGACTGTGG--------------CCTTGGAGCTCCGCTCGAGA-------------------------------------------------------------------------------------------     
20 Bos_indicus-NC_040091.1-164911_165217                77.8%  28.9%    -----------------------AGCCAAGCTCTGTTTCCTTCAGAAACTCCTCCTGGAGGTCAGAG-----------------CCATGTGGTGGACC----------TGCCAGTGGGCCAGGTTCAGTGTCCTCCTCGGTCAGCGAGTGGCATGA-------------GTGTGGGGTCCACTGGGCC--CCCAGGGTAGGAGGCAG---GAGTGGGCTGTTGGGCCA-----------------G--------------CC----CC-------------CGGTGGGGAGGGTGGGCAGCT--TCAGGA----AGTCAGACTC---------------TGGGGGCCC-ACCCGATCCTGGGACATC------------------------------TTCTCAGTGCCC-AGGCCCCAGGGCTCTCGAGGAAGCCGCCTGGAGGTGG----C-CGGT-GCCCTGGCTGGGAAGC-TTGGCTGGG---------CTGGGG---G--ATGGGCCCGGGCAT------CCTCTGTTCTCTG-CTCCTTCGTGGCTCTGTGCCCACTCTGCCTGGTGGCCATCCAGCCCCACCAGCTGCTGCGCGGCCTCCCCACGG-GGCCTGGGTGGGTATGGGGTTGGGGCAGGACTGGCTCATC--------------AGTACACAAGGACCCC-TCCC--TTGGAGCTGCCCCCCCCTCCCAGCCCGGCAGGAGTTTCCTCTCCTCCCCCCAGGCAGACCAGGTTCCATCTGGTGACTTTTCAGGAAAGTGCCCCC---CTTCCAGTGCCG------CTGTGAG-TTGC----TCTCTCCCCCTC-------CAGCTGCTCCCGGTGGCTCCCCGGGGCCCATCCTGACATG----TGCTGGCCCACATGGCGTCCAGCCTTGCCCAGTG--ATGC-CATGAGGG--------------------GA-----------------------CTCA-GGA------GCACCCAGAACACGGGCACTG-GGGTGCCTTTGAGGGCTG---G------AGGTCATGAACACTGCTAGCGGAGTCCTCT-CCCAAAATCTGTGGAATGGGATGA--GCGCCATATAGCCAGGCAGGGGACCCGGGGCTT--TCACTGTCCCTGGCTGGTGCGAAGCGACCCCGGCTCTGCTGCAT-----------------GGGCAGAGGAAGGCTGAATGTTGGAAACC-----------CCTGGCCCCTGTG-GTGCTCAGATGGCTCCA-GG-----ACAATGTGGGGGCACACTGTGTGGGAAGGGGCTTCTCCAGGGGGCAGGTGCAGGGCACTGGACACCC------------------------------------------------     
21 Nannospalax_galili-NW_008355419.1-157375_157587      80.5%  33.7%    ---------------------ACTTTTCAGG-------TCTCCAGCTTCTGGCCCTGTAGTTGAGATAACTGACTGGCAGCC-CAGTTTGCAGATGCTGCTGCCTGTGCCATTTTGGGTCATCAGGGATGATGAGATAGCATAGAAGGCATCCCGGGAGGGCCAGAACTAGAGAGAGCCTTACCCCGTCTCGTAGGGCAGAATGTAG--GGATGGAGCAGAGGT------------------ATTGGGCAGGGTAGATGTCT----GGACAGATGTCTTGGACTTCAGGGGATGCTGAGACACTTTAGGA----AGTCAGACTT---------------AGAGAGCCAGCTCAGTGTCCAGAAGCACCCTTTCTTCTGAGGCCTACCAGCTAGTTCTCTGGGACTA-TGGA-------------------AGACCCAGGACTCTCTAGCCTTGA-----------CTGTCCAGGGCTGGGCATG---------------------GAT-TCCAGGGGCTTAGCCCTCCTGTTTCCTAT-TTCCTCTGG--GCTCTGCTTGACCCCACCCACAGGCTG-CCCACCCAGTCAGCTGCTGCTCTCCTTCCTCATGACTCTGTC----CATTGGCACTCAGGGCTCTCA-AGGAGCACCTGC----------------------------------------------------------------------------------------CCATCCCTTCCAATCTGACGACCTTCCAGAAGAGACCATGA---ACATTCATGGCT------GAAGGCT-GGCTCCCATACCAGCTCTGGG---------GATGTCCTGGGCAGTGGCTTGAGGACAAGGATCTGTCCCAGACACTGG----CCCGGCACCTGTCTTTG--GGAGTGCAGC-CCAA-GTGTGCTTGGC--TGTTGG---GCTGGACCCTGCTGGAGGAAGAAAGGGC---ATCCATGGCCTCAGGGAAGTGAGTAGCTGGTGGCAAACATAGGGCCCCCCAGAG----ACACAGGAATGAGGGCCACCTGGGGGAGCAGGAAACTGTGAAATGGGCTATTAATAGAGTCCTCTTCTTGGTAGGACTGTCGAACGTGATTAATACCACTGCTGTGAGCTGAGTTGCTACACACCACCAGCTGGTGATGGCCAGGG--------ACAGCGAGGGATAGGAAGAGTGCCTGGTCTACTCTGCTCCAGAGGGA----------CCCTCTCTGAGG--------------CTGTGGAGCCCAGA-------------------------------------------------------------------------------------------------     
22 Meriones_unguiculatus-NW_018657773.1-161576_161897   81.1%  33.6%    ----------------------------------------------------------------GATGACTTAGGTGGTGGCAGCCTGGTTTTCAGACATAGCCCGTGCTGTTTTGGGTGACCAGGGGTGATGGGAGAGCACAGAAAACATCCCAGGAGAGCCTCACC----------------CCACCTCACCAAGTGCAAGGCGG--GAATGAAGCAGCTGGTACAGAGC---------TGTCCAGCCCAGCCA-----------GGGCTGGTG--CCTTCAGTGCGGGAGACACATGCACTGTAGGA----AGTCAAACTT---------------GGAAAGCCAGCTCTGTGTGCAGAAAAGTGCTTTCCTCTGCGGCTCGCTGACCAGTTCTCTGGCACTG-GGGGGG----------------GGGGGGCAGTGCTCTCTAGCCTCAAGGTGGCTCTTGTTGCCCAGT-GCTGGGTAC---------------------TTA-CTCAGGACCTCAGGCCTCTTGTTTCC-TG-CGTCTCTGG--CCTCTGCTTGAATATAGCCAGAGGACA-CCCACCCTGTCAACTGCTGCCATCACTCTGCCTGGTCTGGGC----TCCAGGGGAAGCAGCAGGGCACGGCTGACTCTGCTC---------ATTA--------------------CTATTTAC--------------------------------GCTCTCGAGGGACATCCTTCTCCATGTCTGATGACTTTCCAGAA--GAGGCTAC---ACACTGGCTGCT------ACAGCCC-GATTCCCGTGACAGATCCTCCT-GCTGTCAGGTGTCCTGGGCAGTGGCTTG-GGGTCAGAACCTGTCCCAGACACTGG----CTGATCACTTGCCTTTA--GGAGCCCAGC-CAGA-GTGTGCATGGC--TGC-TG---ACCAGGCCCTGCTGGAGGAAGAGAGGGC---AGCCATGCCCTCAGGGAAGTGAGTGGCTGGTGGCAAAGATAGGAACCCCCAGGG----ACACAAGAATGAGGGCCACGTGGGAGAGCAGAAAACTGAGAAGTGGGCTATTAATAGAGCCCTCTTCCTAATGGGGCTGTCGAATGTGACTGAAGCCACTGCTTTGAGCTGAGCGGCTACGTACTACCAGCTAGTGAT----AGTC--------AGGGAGGCTGAGAGGGTAGGAAGGGTGCCTGTTCTGCTTTGGAGGGA----------CCCTTATTGTGG--------------CCTCGGAGCCCAGAAGACAGGGG-----------------C----------------------------------------------------------------------     
23 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-165636_165916     84.8%  32.6%    ----------------------------------------------------------------GAG---------GCGCCTCCTGCTCTGG-CCAGAGGAGCCAGGTGGCCCTGGGTGGTGGAAAAGCCCT---GTCTGGCAGCAG------GGC--ACTTTGTCACAGGGGACAGTCCCCTCAGCT------TGCTCAGAAACAG-------------CAGCCCAGGGAC---------CCTGAGG------------------AACTTGGG-------GCATTTCAACGTGAGGCTAGACTGTGCAT--C--TTGCAGCTAGTACC----------CTGTTCCCTGCCGAAGCTGCTGACTGCTAGGGTCC-----AA----CCCACTGTGGCCAGCTGGGGTGGAGGGTGCCCAGCGCTCAGAG-GTGGCCCAAGCCACCCTG-G--TTCAGC-ACAATGTGTGGCCAGTGGGGACGGAG----TGAGGAGAACCTCACCTGTCCCCCA---------------------------CAAGCTGGGACGCAGGGATGGTGTGAGTAAGCGGGCACCT------GGAGAGGGCTGGTGACCTCACAAGGAGCCGG----GGAACTTTAGGTCATCAGCTTGGAGGCTGCCTCC--------------ATTCCAGAACATGCTCTGTG--G-AGACTCCCTGGCCAGTTCCTAGCTGGCTAGTGTCCCAA---GGCCAGGGTCTGGCCCCCACGG-GCTCTCCTGGCCATTCCCCCGCCCCCCACCAGGCTCCAGACTGGCCTTGCCCTCTGGGAAGCTGCAACCCCTGCAGCTCT------TCTGGGAAAGCAGGCAGTGGCTCCAGGGCCAGGACCTGT-----------CCCATCTGGGCACCTGCCTCTAGGAAGCCAGGC--CAGGCAGGTTCTGATG---T-GTG---GCCAGGCTCTGCTGGCGAGCATGAGGCA----GT--GGAAGCCTCAGGGAAGAGTGGCCGGTGGCAGAGACAG--CGCCCCAGGG----ACACAGGGATGCAGGGCACCTATGGGAGCAGGAAGCTGTGAAATGGGCAATTAATAGAGTCCTCTTCCTGGCGGGACTGTCTGGTACGATTAATGCCATCACTGTGAGCTGAGCTGCATGCCA---CCAGCTGGGGACAGAGGGGACACTGAGGGGCAGGAAGAGATCTGGGGGGGGGATGCC-------CTCCTGGAGG----CTGGGTTCTGCTGGGGGGG----------------CAGAGGGAGGCT-------TG----------------------------------------------------------------------------------------     
24 Sturnira_hondurensis-NW_023520724.1-167244_167535    79.4%  31.8%    ----------------------------------------------------------------------T-----GGCCCGGCGCGAATGCTCGCCCACCGGCTGGGCTACTGTTTGTTTTGAACCTTCTTCCTGGGGCTGAGGCTCCTGCAGGG--GTCGGGGA-----------------GGG--------AAGCCAGTGGGGG------------GCCGGGGCATGGCACAGAGGAGGGACCGGGAGAGCCCACCTTG----GGACAG-GGG-TAGGGACCAGCAGCTGGCCCAGCCC--CTGGGCAGGGGGAGCAGAGT---------------GGGGCTCCTGCCCTGGGTCAGGGAGCCAAGGTTGG-----------AG--GCTGGTGCCCCTCCGCA-CCGAGGCCCCGGGGCTCTCCAGGCAGCTGGCTGCCCT-------------------------AGCGGGAGGAGCAGC---------AGCTGG---G--GACAGCCTTGGGCTCAGCCGTCCTGTTTCCTGT-CTCCTCGGTGGCTCTGGGCCCACTCTGCCCGGCAGCCTTCCAGCCTGCCAGCTGCCACCCGGCGTCCCCTGGAGCCCA----GTCGGTGTGTAGTGGGGGCATGGCTGCCTCCACC-------------AAAGCCTCCAGGACCCCTCCC--T-GGGAGCTCAGATCCCCCCTCGCCCTGCAGGAGTTTCCTCCCCTCCCGACAGGCAGGCTGAGCTCCATCTGGTGACTTTTCAGGAAAGTGCCCCC---ACCCCCGGTTGC------TGCTGTG-AGGT----TCGCTTCCTCTC-------TAGCTGCGGCCCCCCACCCCC-----------------------GGGCTAGGCACCC---------CCTCCAAGGAGCTCTGACGTAGGTGGGCCCTTGGG--GGCCCTC-CCCCAGACCCCTCCAG-CCACTGCACGGCCA-CCTGGCCAGGGC--CCGGGAGTCCACGAAG-GGGCACCTGCGAGGGCAG----------GAGGCGGGGGCCTC---------------------------------TATTAATA--GTGCTC-TCTCCACAGGACTGTCACATGCGATTAATGCCGCGAGGGAGCTGAGGTGGGGACCACCTCAGCCGCGGGGTTGGGGGTGCTTCTCC---CGGGGGACCCTCCCTGAGGCTGGGCT-------GGCCTAGCGGGGGGCAAGGCGGCAGCACAGGGCTCCCAGCAGG---CT--GAGCAAGAGGGCCCATGGCCCTG--------GGAG----GGGCTTCTTGGGGGCAG-----GCCCCCCCGC----------------------------------------     
25 Sus_scrofa-NC_010448.4-164146_164405                 78.7%  31.9%    -----------------------------------------------------CCTGGCGGTCAGGC-----------------CCTTGCTGTGGAGG----------TGACTGTGGCCCCTCCTGAGCTTCCTCCCAGGTCAGCAGTGTGCGTTTGGGGGTTTTACCCAGGCAGGGCCTACAGGCTC--CACAGGGCGGGGGGCAG---GGGTGGGCAGCTGGCCCAGTGCCCAGGTGAGGTGGG--------------GG----TC-------------CTGCAGGATGTGTGGGAAACT--TGAGGA----AGTCAGACTT---------------GGAGGCCCC-GCCCCCTTTCTGGACCCC------------------------------CTTTCTGTGCTG-AGGCCCTGGGCTCTCGAAGAAGCTGCTCTCGGGGTGG----C-TGCT-GTCCTGGCTGGATGGC-CCGGCCGGG---------CTGGGG---G--ATGGATCCGCAGGCTCAGCCTTCTGTTTCTTGT-CTCCTCCGTGGCTCTGTGCCCGCTCTGCCCGGCGGCTGTCCAGCCCCGCCAGCTGCCGCCCAGCCTCCCTGTGCCGGCCTGGGTGGGTGTGGGGTGGGGGCAGGGCCAACTGGCC--------------AGGACCGCAAGGACCCCACCC--TGGAAGCTGCCCCC--TCACGCACCCTGCAGGAGTTTCCTC-TCCTCCGACAGGCAGACCGGGCTCCATCTGGTGACTTTTCAGGAACGAGCCCCA---CCCCCGGTGCCG------CTGTGAG-CCGC----TCTGTCCCTCC---------AGCCGCTCCCCGGGGCTCCCTGGGGCCCAGCTCGAGGTA----GGAGCTTGGACCTAGGTGGGTGCGTGGCCCTCCT--GCCC-CACGCCCT--------------------GCCAGCCTCGCTTAGTAAGGGCCGGGAGA-TGG------GGGCCCTGAACACAGGCAGCA-GGGC-CCTCGGGGGGCAG---G------AGGCCACGGATGGCTGTGGGCAAGGCTTCTCCCCAAAGTCTACAGGATGTGATGA--AGCCA-----------------------------------CTGCTGAGCAGGGACTGCAGACCCTAGGCTCTGCTGGGT-----------------GGGCAGGGGCAGGCTGAACGTTGGGACCCCGCTGTGCTGCCCAGGCCCCCGTG-GTGCTCAGAAGGCCCCA-TG-----ACAGTGTGGGGTATCTCCAGGGGGAGGCG----------------CAGGGCAGGGCGCTGGACACCCCCCACCCCCTGTC-----------------------------------     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                           .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         *     . *                                                            :                                                                                                                                                                                                                                                                           *  *  .