RNAcode could not find significant results in the alignment.
GGCGCGGTGGGTGCTGTCTCGGGGGCATCTGGCATGTGAGGGCCCCTCTGGCCTCTGCGCCCTGGAGATGCGGCTGCCTCCCTCTCAGCAGCTGTTCTGCCCAGGCAGGGACCTCCTGGGCCCAGCTGTCCAGGAAGATTGGCTGTGGCCAGGTGCTGGTGGGCTGGGAGTCTGAGCCCATCTTGGCAGGGCTCAGGGGGCAGCAAGCCAGCTGCGGGCCTTGGGGGCTCACATGAGTGGAGGGCAGGGCAAGACCAGAAAAGGCTGCCTGGGGGAATTCAGGAAGGCTTCCTGGAAGAGGTGGTACTTCCTAGGGCACGAGTATCACCATGGGAGTGGGCAGGACACGGGCCGGGCAAGTGGGCCTCCCGCTGCACCTGGCTACTCCTGCTGTGGACCAGCTACTCCTGCCTGAGGGTGGGGCACACACAACCAGGGAGTGCCACGCCAGTGTCCCCTGCTAGCGCCGGGGGCTGCGGGCCTCTGAGCAGGTGCAGGCTGTGGTGGGCCAGGCTGGGGCTCGAGGTCTCTCCTCCGGAGGGAAAGACCTTCTCTCCATGCCCCTCAAGGGCCCCACATGCCCTGGACAGGTCAGGCGAGGGCAGTTTCTGCCGGAAGGGTGGGGTGGGCCATGTGTACTTAGATCTGTAGCAGCTACTGTCCCAGGCAGAGCTGCCCTAGGGACCCTGCTCCTGAAGGCCCTGGTGTGTCCACACACCCCCAGCCTGAGGTGGCCCAGCCCCTCGGACCGAGACACGCATGGCACGTCTGTGGCACGGTCTGGAGAGCTGGCCCTGGGGGAGCAGCTGCAGCTGGGCTGGGACCCCTGGCAACAGCTACATGGGCTCCTTCTCTTGCAGGTCAAGCAGGCTCTGGGCCTAAAAGGCCTCTTCCTCCGAGGCCCAAAGCCCGGCTCGCTGGACAGTCATGCTGCTGGGCGGCCCCCGGCCCGGCCCTCCGTTAGCCAGCGGATCCTGCGGCGCACGGCCAGCGCCCCGAC
Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.
Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.
Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.
Reference sequence (1): Target Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% |
cov pid 1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . . . 4 . . . . : . . . . 5 . . . . : . . . . 6 . . . . : . . . . 7 . . . . : . . . . 8 . . . . : . . . . 9 . . . . : . . . . 0 . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . ] 1322 1 Target 100.0% 100.0% 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2 Callithrix_jacchus-NC_048389.1-205734_206708 97.3% 74.9% 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3 Microcebus_murinus-NC_033661.1-190575_190795 85.3% 43.8% 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4 Lemur_catta-NC_059130.1-190892_191100 88.9% 48.8% 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5 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-190973_191193 83.7% 35.9% 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6 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-192396_192616 86.5% 45.0% 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7 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-208110_208331 88.0% 49.5% 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8 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-259161_259379 87.9% 52.3% 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9 Fukomys_damarensis-NW_022900935.1-192396_192570 79.3% 31.3% 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10 Equus_asinus-NC_052181.1-205491_205657 82.7% 37.5% 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11 Ailuropoda_melanoleuca-NC_048228.1-204890_205056 83.9% 41.3% 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14 Mustela_putorius-NW_025422005.1-203807_204031 82.3% 37.8% 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15 Balaenoptera_acutorostrata-NW_006725355.1-203088_203242 79.4% 33.8% 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16 Bubalus_bubalis-NC_059161.1-192396_192550 80.6% 36.2% 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19 Phyllostomus_discolor-NC_040907.2-192396_192562 84.2% 39.8% 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21 Eptesicus_fuscus-NW_007370721.1-190231_190392 83.4% 33.9% 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23 Pteropus_alecto-NW_006429611.1-210645_210809 81.8% 37.8% 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25 Hyaena_hyaena-NW_024080942.1-205401_205565 84.8% 41.4% 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