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 1 Target                                                  100.0% 100.0%    ------------------------------------------------------------------------------------------GTGGCCGCCTTCTCACTGGCC-TCTCCT---CCCCTCCCCTCCCTCAGTCC--TCCCTCCCCTCCCTCAGTCCTCCCTCCCCTCCCTCAGT-----C-------CTCCCTCCCCTCCCTCAGTCC------TCCCTCCCCTC-----CCTCAGCCCCTTCCCTGGCGGGCAGCCCGCTGGAGCCCCCACTGTGC--CCCTCCTATCCCCC-TCCT---------TCTCTCTCCTG-----CCCCCATCTCGGACCCTCAGGCTGTTGGTTCTGAGTTCGCCTCCC--ACTCCCTC----CCTGTC-CTTGCCAACCATGC-CAGTGCATGGGA-TGAGGGCACCCCTGAGGCCGGCGCTCCGAGCCAGAATCCCGGATCTGCTTCTAAATGGCTTCC-CAGCCACTGTGACCAAA--TGCGTAGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGCCATCTGAACGCATCTGCCCAGAGGCGCCCCTGCAGGGGGGTGACCCACCTGCCGGGCCTGGGCCGCTCTGTGCACGAGCACGGCTC--GTCATGGGGGCGCGGTGGG-TGC----TGTCTCG-------------------------GGGGCATCTGGCATGTGAGGGCCCCTCTGGCCTCTGCG----------CCCTGGAGATGCGGCTGCCTCC-CTCTCAGCAGCTGTTCTGCCCAGGCAGGGACCTCCTGGGCC------------------------------------------------------------------------------CA---GCTGTCCAGG---AAGATT----GGCTGTGGCCAGGTGCT--GGTGGGCTGG----------------GAGTCTGAGCCCATCTTGGCAGGGCTCAGGGGG-CAGCAAGCCAGCTGCGGGCCTTGGGGGCTCACATGAGTGGAGG---GCAGGGCAAGAC----CAGAAAAGGCTGCCTGGGGGAATTCAGGAAGGCTTCCTGGAAGAGGTGGTACTTCCTAGGGCACG-AGTATCACCATGGGAGTGGGCAGGACACGGGCCG----GGC-----A-AGTGGGCCTCCCGC--TGCACCTGGCTACTCCTGCTGTGGACCAGCTACTCCTGCCTGAGGGT----GGGGCACACACAACCA----GGGA-GTGCCACGCCA-GTGT-CCCCTGCTAGCGCCGGGGGCTGCGGG-----CC-----------------TCTGAGCAGGTGCAGGCT------------------------------------------     
 2 Nomascus_leucogenys-NC_044404.1-224773_225690            99.4%  89.0%    ------------------------------------------------------------------------------------------AT----GACATGGCTCTGGGG-GCCCTG---GCCATCCCCAGCCATAGTGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGGTTCAGCTGGGTGGCCGCC-----G-------TCTCACTGTCCTCCCCCCTCC------TCCCTCCCCTA-----CCTCAGCCCCTTCCCTGGCGGGGATCCCGCTGGAGCCCCCGCTATGC--CCCTCCTATCCCCC-TCCT---------TCTCTCTCCTG-----CCCCCATCTCGGACCCTCAGGCTGTTGGTTCTGAGTTCCCCTCCT--GCTCCCTC----CCTGTC-CTTGCCAACCATGCCCAGTGCCTGGGA-TGAGGGCACCCCTGAGGCCGGTGCTCCAGGCCAGAATCCCGGATCTGCTTCTAAATGGCTTCC-CAGCCACTGTGACCAAA--TGCGTAGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGCCATCTGAACGCATCTGCCCAGAGGGGCCCCTGCAGGGGGGTGACCCACCTGCCGGGCCTGGGTCGCTCTGTGCACGAGCACGGCTC--GTCATGGGGGCGCAGTGGG-TGCTGCTGGTCTCG-------------------------GGGGCATCTGGCATGTGAGGGCCCCTCTGGCCTCTGTG----------CCCTGGAGATGCGGCTGCCTCC-CTCTCAGCAGCTGTTCTGCTCAGGCAGGGACCTCCTGGGCC------------------------------------------------------------------------------CA---GCTGTCCAGG---AAGATC----GGCTGCGGCCAGGTGCT--GGTGGGCTGG----------------GAGCCTGAGCCCATCTTGGCAGGGTTCAGGGGG-CAGCAAGCCAGCTGTGGGCCTTGGGGGCTCACACGAGTGGAGG---GCAGGGCAAGAC----CAGAAAAGGCTGCCTGGGGGAATTCAGGAAGCCTTCCTGGAAGAGGTGGTACTTCCTAGGGCAGG-AGTATCACCATGGGAGTGGGCAGGACAGGAGCCA----GGC-----A-AATGGGCCTCCCAA--TGCACCTGGCTACTCCTGCTGTGGACCAGCTACTCCTGCCTGAGGGT----GGGGCACACACAACCA----GGGA-GTGCCACACCA-GTGT-CCCCTGCCAGCGCCCGGGCCTGCGGG-----CC-----------------TCTGAGCAGGTGCAGG--------------------------------------------     
 3 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-205639_206440         98.5%  74.8%    ------------------------------------------------------------------------------------------------GACATGGTTCCGGGG-GCCCTG---GCCATTCCCAGCCGGAGCGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGGTTCAGCTGGGCGGCCACCTTCTCC-------TGGCCTCCCGTCCCTCAGCCC------TCCCGCCCCTC-----GCTCAGTCCCTTCCCTGGTGGGGAGCCTCCTGGAGCCCCCGCTGTAC--CCCTCCTGCCCCCC-TCCT---------TCTCTCTGGTG-----CCCCCACCTCGGCCCCTCAGGCCGTTGGTTCTGAGTCCCCCTCCT--GCTCCCTC----CCTGTC-TTTGCCAACCACGCCCAGTGCCTGGTT-GAGGGCAC--CCTCGAGGCTGGTGCTCAAGCCGGAATCCCGGATCTGCTTCTAAATGGCTTCC-CAGCCACTGTGACCAAAT-TGCGTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGCCATCTGAACGCATCTGCCCAGAGGCACCCCTGCAGGGGCTGAC--CCACCGGGGGGCCTGGGCCACTCTGTGCAGGAGCACGGCTC--GTCATGGGGGCTCGGTGGG-TGCTGCCGGTCTCA--------------------------GGGCGTCTGGTATGTGAGGGCCCCTCTGGCCCCGGCA----------CCCTGGAGATGCAGCCGCCTCG-CTCTCACCAGCCGTTCCGCTCAGGCAGGGACCTCCTGGGCC------------------------------------------------------------------------------CA---GCTGTCTGGG---AAGACT----GGCTGTGGCCTGCTGCT--GGCAGGCGGG----------------GAGCCTGAGTCCATCTTGGCAGGGCTCACGGGG-CAGCAAGACAGCTATGGGCCTTGGGAGCTCACACGGGCAGAGG---ACAGGGCAAGAT----CGGAAAAGCCTGCCCAGGACAGTTCAGGAAGGCTTCCTGGAAGAGGTGGCACCTCCCCGGGCAGG-AGCTTTGCCATGGGAGTGGGCAGGACAGGGGCTG----GGC-----G-AGTGGGCCTCCGTC--TGCACCTGGCTACTCCTGAGGGCAGGGCAGATGCAAGCAGGGAGACT----CGGGATTCTACTCTCTCCTGTCTC-TGGCTCCACAC-CAGT-GCCCCTGCCAGACCTGGGGCTGCCGG-----CC-----------------TCCAGGCAGGTGCA----------------------------------------------     
 4 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-206823_207651            90.5%  51.3%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGC-GAAGGC---CGCCTGCCGTGTGCCTATCTCCC--------------------TGTGATGCCTGCCCTCCCTCCCCACTGGGCTCTCTCACCTTCCGTCTTCCC------GGCCCACCCAT-----CAATGGCCCTTTCTCTGGCTGAGAT--CTCTTGAGCACCCCTTTGGG--CC--CCTTCCCTTT-TCCTCTTCTTCCCCCTCTGTCCTCC----ACCCCTGCCCCCACCCCCAAGCTGTCATTTCTTAGTCTTGCTCCCTTTTCCCTCC----TGGGTC-TGTGCAGACCACGCCTGGTGCCTGGGGTGGGGGATGTCCCTGAGCTCAGGAATCCAAGCCCGAATCCTGGATCTTCCTCTAAATGGCTTTC-CAGCCCCCTTCACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGATGCTGATTCAAGTGCTGGCA-CTTCAATGCCTCTGCCCAGAAGCGCCCCTGCTGGGGGTGACCTGCCCGCCAGGCCCGGGGCCACTCTGCGCACGAGCACGGCCC--ATCAGGGGGGAGCGCTGGG-TGTTGTTGGGGTTTCTGGGAAA-------------TGTGGGGGTACCTGGCATGTGAGGATCCTTCTGGCCTCAGCA----------TACCTAAGATGCAGCTGCCTGG-CTCTCTCCAGCTAATCTCAGAGCCCC-----------------------------TTGGTTGTCCTCCTCAGGCAGGGAGGCT-----------------GCAGGAACCG-CCCAGGCCCA---GTTGTCCAGG---CTATGG----C-------CTGGTGACC--TGGGGACTGG----------------AAGCCTGAGTCCATTTGGACAATGGTTTATAGAGTATCTTGTCATTGGCCCTCA----AGAGCTGTGTGAGCAGAGAGCAGGGTGATGAGGC----TGGGAAAGTCTCCCTGGGGGACTTCAGGAAGGCTTCCTGTAAGAGGCAGCATCTCCGGGGGCCAGGTGCTTCACCAGGGGAGTGGGCAGGGTAAGGACCA----CAG-----G-AGATCAGACTTCAG--CTAACCAAGCTGCTGGCTGTTTGCTTTTATGGCCAGAAGCTGGTGGC----TGAGGGCAGGTAACCA---------------CAACC-CAGG----GTGGTA------CCGGCTGCCAG-----TT-----------------TCTCCGTCTTT-------------------------------------------------     
 5 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-258091_258440      89.3%  54.7%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------TGGGCC-ATCCTC---AGCCAGACAGCAGCATTTACCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTCGGCTGAGGCCGCTACATGCCCCTTCCCCGCTCCCTCCTGG-------------------TGCCTGC-----CCTGTACCCCTTCTTTGGCTGTGAGCTCTCTTGAACCCCCCATGCCC--CCT-CCTTCCCAGT-TTCGTCTC-----CTCCTTTCCTA-----TTCTCCCTCCAGCCCCCCAGTTGCTCATTTCTCAGTCTCCCTCCTG-TTTTCCTT----CCCCAT-TGTGTGGACAATGCCCAGTGCCTGGGATGGGGGACGTCCCAGGGCCAGGAGCTCCAAGTCTGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTTTC-CAGCCACACTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGCCACTTGGACGCCTCTGCTCAGAAGTGCCCCAGCTGGGGGTGATCTGCCCGCTGGGCCCTGGGCCACTCTGCGCACGAGCACGGCCC--ATCATGGGGGAATGGTGGG-TGTTGTTGGGGTCTCTGTGGGGG--------G---CACGCGGATGTCTGGCATGTGAGGATCCTTCTGGCCTCTGCA----------CACTTGAGACACAGCTGTCTGG-CTGTCTCCAGCGGTGACCCAGCACTTGCCAGCTGGTCCCGGGA--------TCCCGTGGCTGCTCTCTTCAGGCAGGAGCTGCAGG----AGAGCACTGTGCAGGGACTG-CC-TGGTCCA---GCTCTCCAGG---AAGGTC----GGCTGTGGCCTGACACT--GGTGGGCCAG----------------GAGCCTGAGCCCATCTGGGCAGTGGTTTAGGAAGCACAGAGCCAGCTGTGAGCCTCAGTGGCTCCCATGAGCAGAGAAC--AGGGTGAGGCT----GGAATAGGTTGCCGGCGGGGAATTCAGGAAGGCTTCCTGGAAGAGGCAGCACCTCCAGGGGGCAGAAGCATCACCAGAGAAGTGGACAGGACAGGGGCCG----TGG-----G-GGTGCAGACCTCAG--CCGCACCTGGCAGCCTTGCTCCGTGGTGCCTGACAGC--------------AGGGCGGACGCTAC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 6 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-157848_158402            90.4%  49.0%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------GACGCGGGT-CCTTCG---GGCCATCCTCAGCCGAGCAGCATTTACGAGGCAGATCCAGGACTCAGCGAGCACCTCCTCCTCTGAGATGTCCTCCCCCCTGCTGCCCTCACCCTCTGACTTGCCCACCCT-----GCTGATCCCTTCCTCTGACTG------AGCTCCAG----------CC--CCCTCCGTACCCGC-TCCTCCC------CCGCCGGCCCTC----ACTGTGTCCCCGGCCCCCACGCTGTCGCTTATCACTCCCGTGTCC--------CT----CCTGTG-TGT-GCGACTGTGCCCAGGGC----CTGAGAGGGGAATGTCAGGGCCAGAGCTCCAAGCCCGAATCCTGGATCTTCTTCTAAATGGCTTCC-TAGCCACTCGGATCAAATTGCTCTAGATTTGGGGTCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTAGCCATCATAACGCATCTGCCCGGAAGTGCCTGCCA--------------------GGCCCTGGGTCGCTCTGTGCACGAGCACGGCTC--GTCATGGGGGCACGCCGAG-TGTTGGCGGGATCTCTTGGGGGG--------GGGCGGAGGAGAAGCCTGGCATGTGAGGATCCTCCTGGCCTCGGTA----------CACTGGGGGCACAGCTGCCCAG-CCCTCGCAAGCTGACTGAGGACCATGGCTCTCCTCAGGTGC---------------------------------GAAGGCTGTGGG----GGAGACCTGTGCAGGGACCT-CTGGGCCCC----------------------------ACTGTGCAGGTCGGCG--TGGCGAGCGG----------------GAGCCTGAGCCCCTGTGGGCAGGGCTTCAGGA--GAGCCAGTCAGCTGTGGGTCCCGGGGGCTCACAAGAGCAGAGCAGGGCAAGGAAGCGC----CGGAAAAGCCTGTCTGGGGGAGTTCAGGAAGGCTTCCCGGAAGAAGTGGTACCTCCCAAGGGCAGGACGGGTTGTGGGAGCACAGGCCTCAGGCCGCCTG----GCT-----G-CACTTGCTTC--TG--TGC---GGGCTGGTGCCAAGGGTGGGAAA-TGCCCCCAGGGTGAGGT----GGGCTCCCGGCGTCCCCCTGTGTC-TCTCTCCATGC-CAGC-ACCG-----------AGGGCTCCTCT-----GC-----------------CAGCGGGCCCTGCCAAG-------------------------------------------     
 7 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-189378_189648          77.8%  28.9%    -------------------------------------------CTGTGATTCCTGGTAGTATTCTGGAGACTGTCTGCTCATGTCACATGGATCATGACATGGTTCCGGGGACCCCTGGGCCATCATCAGTGGGCAGTGGCATT-TATGAGGCAGATCCAGGATTCAACAGGCTGCTGCCAGCGCTGCCTGA-----------GCCT--------------CCACACCCCAC---CAGGGCCTCTTCCTCCTG----CT-----------------------GCGAGCTCTTGAGCCCCTGCTGAG-----------CCCCGC-----------------TGTGCCCCCATGTGCCATTTCTTAGCCCCCCTCATGTGACCCCTTTCCCCATGCCAGCCACACCCA-------------AGGCTTGGGTGGGTTGTCCCTGGTGGAGCTCCCAGCCTGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTTCCCAGCCTACTTTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGAAAGCTGATTCAAGTGTTAGCCAGTTTGATGCCTCTGCCCGGAAGTGCCCCTGCCAGGGGTGACCGCTCTGTGCATAAGCACGGC------------------------TCGTCATGGGGGA---------GCAGTGGG-----------TTGGGGTCTTGGGGCACGCGGCTGTCTGGCATGTGAGGCTCCTTCTG----------ACCTCTGCACACTTGAGATGCAGCTGCCGGG-CCTCT-CTGGTGGTAACCCTGA--------CTTGCTCGCTGGTCCTGGCTGCTCTCAGGCAGGGAAGCTGCAGAACAGG--CCTGTGCAGGGACTGTCC-AGAAGACCGGCTATGGC--TTGAGGCTGGT-GGCCAGGAGCCC----AGCCCATCTGGGCAGTG-----GTGCTGG--G-AGCACC------AAGCCAGCTGTGAGCCTCAGACCCCCTCCCCCCATGAACAGAGAGCAG-----GAC-GAGGCTG-GGAAGGC------------------------------CTCCTGCATGAGGTGGCACCTCCAGGAGACAGGCGT---------GT---TACTGGGGGTGGCTGGGCAGCAGCTGAGGGAGAGTAGCTTTCAGGCTGCAG-GAGATGTACCTGCTTCCCCGGCCTGCAGCA----------------CCTGAAGGCAGGGCA-GATGC-ACCAGGGGGTGACG--TCAGCCTT-TCTCCCTCATGCCAC-------------------------------GC-------------------------CCTGTCCCCTGTGGGCTTCTG--------------------------------------     
 8 Heterocephalus_glaber-NW_004624818.1-190184_190617       78.9%  31.4%    ------------------------------------------------ACTCCTGGTAGCATTTTGGAGACTGTCAGTTCATTTGATATGGGCCATGACATGGTTCCGGGTCCCCTGGGC-CATCTTCA--GCCACAGTGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTCCGCCGAGGCCACTGCCCCTCCCTGCT-----------CTTC--------------GTGTGCCCCGG---GCGT--CTGCTTCTTT------GG-----------------------TGTGGGCTCTGCCCCAGTGCCGTC--CTTCCCGGGACCCTT-CC-TCCCTT--CCCTCTGTGTCCCGTGCTGTCATTTCTCAGCCCCCTTCCATTCCCTCCTC------ACTCTCCCAGGGCCTG-------------GGGTGGGGGACGCCACGCGGCCTGGTACTCCAAGCCTGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCGTTCCAGCCAACGTTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGACGCTGATTCAAGTGCTGGCCATGTTATCACCTCTGCCAGAAGGGCCCCCGCCCACGGGGCCCTGGGCTGCTCTGTACCAAGCGG---------------AG------CTCGTCCGGGGGAG--CGGTGGGTGCTGTG-----------GGGTCTCCGGGGGCCTCAGGGGTGTCTGGCATGTGAGAATCTCTGCTCTACACTTG----------T----GAGATGCAGCTGCCCGT-GCTCT-CCAGCAGGG--------------------------AGCCCGGAGGGGACCTTCCCGCCCAGCTGGACAGGAAGCAGCTGT----GGCCTGGCGGGCTGGGAG---CCTGAGCCCAGCTAGTCAGTGGTCTGGCACCGAGCCAGCTGGGGACGCAGGCTCTCGCAGGCCAGGGT-AGGGCCA-GGCTGGAGGAGGCTC-----------------CTGGAGCAGTGTCCCTGCAGGTCACCAG-GAG-CG--------GGCAG------------G----------GCAGGGCTGGGGCGAGCAGTC-GCCCGCCACACCTGGCTGTGCTTGCTTTCACGACTGCTGCTGCTGAGGCCTTGGCAGTGTGACCCACAGCAAGCT-----CA-----GCACCTTGCTTCTCTG----------------------CAGTCCACAGAGCTGGGCCAGGTGCAGTGG-CCGGGGCTAGGCTTGAAGTGTCCTTGAGAGGCCCAT-GGAT-GGGTGGCTCCTACCTCCACCCA----------------------------------------------------------------------------------------     
 9 Ictidomys_tridecemlineatus-NW_024405058.1-189806_190050  77.7%  28.4%    -----------------------AGGCCGCACCCCATTAGCATCCATGATTCCTGGTAGCATTTTGGAGACTGTCCGTTCATGTGACATGGGTCATGACATGGTTCCGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGCAGCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTGAGCCAAGGCCACGTGCTTCCCCGCTG-----------TCCT--------------GTCT------C---TCC-------ACCCGCTGCCCTCC----------------TCTGTCTGGAGCTCTCCTGGGCTCCCTGTGCCCCTTCCCTCTCCATCCCTC----------------------------------CTCGTGCT-GTGACTTTGCCACTCC----TGATCCTGCCAGGGCCTGGG-----------------GTGGGGCCGCCTGGGCAGGAGCTCCGAGCCGGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGG-CTTC-CAGCCACATGGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGTGGCCACTTACTGCCTC--TGCCAGAAGGGCCCCCGCCACAGGGGCCCTAGGCCGCTCCGTGCACGAGCA---------------CAGCCC--GGCCTGGGGGAGCGGTGGGTGTCGTCGG---------------GGCCTCTGTGGGATGCAGGGTGTTTGGCATGTGAGGATCCTCC--TGGCCAGCC----------TTCTCCAGCAGTGACCCAGGCC-GGGGCTGCAGGAGAGGCCTGTGGAGGGA--CTTCCAGCCCGGGTGGCCAGGGAGCTGGGCT-GTGGTCTGGAGCTGGAGGCCTGGAACCGAGCCTTCTGAGGCAGTGGTCCAGAGCCCAATGGTAGGCCCAGGCTCC---ATG----AGCAGAGGGC-------------AGGGGG----------------AAGGCGCCTGGGGATCCAGGAAGGCTTCCTGGAAGGGATGGCCCCTCCAGGCAGGA-G-------CACCCCTGGGA---AGCAGGTGGGTCG-------GGGCCTGTGGTCGAGC-AGGC-CTTGGCCAACCCAGGGACTGGCTTCTGTGGATGCTGGTGCCCACGA--TGG-GTGGACATGACCCATGACCC-----TGAAG-------CCTTC------CCCTCGAGCCAGGGCTGCAGGCGTAAGGTGTGC-------------------TCGCCGGGTTCTGGAGTTGAGATCTGTCCTTGAGAGACCC-CAGGAAGG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------     
10 Mastomys_coucha-NW_022196900.1-191548_191800             83.8%  33.3%    --------------------------------------------------------------------------------ATGTGACATGGATCATGACACGTTTCTGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTCAGCCAAGGCCAAGAACCTATCCTCCA-----------ATCC--------------AGTCCTCAT-C---CTGCCTACCTTCTACCCTTCCCCA----------------TGACTGTAGGTGTCTCTGCACAGCCTTGCAG---CTCCTCTACTGTCCTGT-TCCCTCTGC-CTGCCTACACTTGTCAGTTACTGACCCTTCT-CTCTAGCTCTCTCCTC----AGTCTATGGTAGGGTCTGAGTTGG-------GGTTGTGGGTGGGGATACCTGGTGGGCGCTCCAGCTCGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTTTC-CAACCACATTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGCCACTCTATTGCCTCTGCAGAAGGGCCCCTGGCCACTAGGCCCTGGGCTGCTCCAATGCACGAGCA---------------CGGCCC--ATCATGGGGGA-----------GTGGTGGG-----------TGTTGTTGCTGGGATGCAGGGGTGTATGGCATGTGAGGACCCCTATGGCCTCTGTC----------CTCTTAAGAGGTG--GCCAACAATCCTCTCCAGCAGTGATCTATGCAGAGGGGACTGCACAGAA-------------GCTGGCT-GTGGC------CTGACA--CTGGTC----ACATGTTGAGCCAGTTG----AGGGCCTCAGGAGCTCAG--------------------------GTCAGA-------GTGCAAG----------------CTGGCCTGGGAGAGTTCGACAAGGCTTCCTAGAAAGGCGGCCCTCTAG---------GAGGGAGGAGAGGCTCCTGGGAAGTAGGGAGGCAGAAGCCAAGGGAGAG--------C-AAGC-TTTCAAGGCTGC----------------------T-----ACACAGGGCAGGGTGAGTGTAACCATGGTGA------TGCCAGACCCCAACTTTTCTTTCCCCCAGATCTGAGGCTACAGTCTTCAGTTCCTCAAGGCTGGGACAAGTGGGTGGCCAGGGTGTAGTGATTGAATTCTGTCCTTGAGATAACA-CCGGGAAGGTTCTCTAGCTTCCGTCTCAAGTTTAGTCTGAAGGGT-----------GAAG-------------------------------------------------------     
11 Castor_canadensis-NW_017871110.1-189220_189814           80.3%  33.5%    --------------------------------------------------------TAGCATTTTGGAGATTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACATGGTTCTGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGCGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTCCACTCAGCCAAGTGTCCTGTCTCCAG-----------CTGC--------------CTTCCCATCTG---ACCTGCCCCACCCCAGCTCTTTCC----------------TCTGGCTGCTGCTCTCGGGGGCACTCTTATGGTCCTGCCTTTCCCTGCCCT-CTCCTTCTCACTCTGTCCCCCATGCTGTCATTTTTCAGTAC-CTCCCTTTCCCTCCTC----ACTCTATGCCAGTGTCTAGG-----------------GTGGGGCATCTGGGCCCAATGCGCCGAGCCTGAATCCTGGATCTCCCTCTAAATGGCTTTC-CAGCCACAGTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCGGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGCTACTTTACCGCCTCTGCCAGAAGGCCCTGG----------------GCCGCTCTGCACATAAGCA---------------CAGCCC--ATCTTGGG-GAGCAGTGGGTGTTTG--G----------------GGAATCTGGGGCACAGGGGTGTTTGGCATGTGAGGATCTCTCTGGCCTCGGCC----------CTGTCCAGCAGTGACCTGGGCA-GGGACTGCAGGAGAGGCCTGTGCAGGGG--CCTCCAGCCCAACCATCCAGGAAGGTTCTCT-GTGGCCTGGTGCTGGTGGGCTAGGAGCCTGAGTCCAGCTGGGTGGTGATCCACCAGCAAGCCAGCCATGGGAGCAGAGAGC----AGGTCAGGCT-------------AGAGAA----------------GACGGCCTGAGGAGTTCAGAAAGGCTTCCTGGGAGAGGTGGCCCCTCAGGGCCCAG-A-------AATGGCACCTCGGGAATGGGCAGGG-C-------AGGGCCATGGGGGAGC-AGGC-CATAGGCTGCACTGGCTGA--GTTTGCTTCATTAACGTCCCCAGAGGGTGGGGGGTAGGTGGCCCTTTGTAA-----AGAAAGCTGCAACTTCTCTTTCTCTGCAGAGCATTGGCTGCAGCCCT-----------------------------CAGAGCAAGCCAGGGTTGAGGTTGGCCTTTGAGAGAACT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
12 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-191443_191946       74.7%  28.7%    -----CGCCCCACCTGCATGCCCAGGCCGCGCCCCATTAGCACCCATGATTCCTGGTAGCATTTTGGAGACTGTCAGCTCTTGTGACGTGGATCATGACATGGTCCGGGGT-CCCCTGGGCCATCCTCAGCCGATAGCGGCATT-GACAAGGCAGATCCAGGATTCGACAGGCCGCAGCCTCCGCCCGACCC-----------CCGT--------------GCCGCCCTCAG---TCTCTGACT-GGCCCGC------------------------------------------ACTCCAGCCGAG-----------CCCCTC-----------------TGCGCC---------------------CCCGCCCTGGGTCCCCGCGTGCCATTTCTCCTGTGTCCC-------------CGCCGTGCCACCATGCCCAGGGCCAGAGCGCCGGGCCTGAATCCTGGATCTCCCTCCACATGGCTTTCCAGCCCACTCTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGGTCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGCGCTGGCCATTTTAACGCCT-CTGCCCAGAGTGCCCCTGCGGGGTGACCACTCTGTGCACGAGCACGGCGC------------------------GTCGCGGGGTAGC---------GGAGGGTG-----------TCGGGTCTCCGGGGTGCGGGGCCGCCTGGCATGTGAGGCTCCTTCC----------GGCCTCTGCACACGTGCCACGCAGCTGCCGGC---CTCCCCAGCGCTGACCCTGC--------ACTTCCGGCGGGTCCTGGGCACCCG--------GCTGCTCTCAGAGAGG--CCTGTGCAGGGACCATCCAGGGTGTCGG----------------------------GAGCCC----AAGCCCACCCGGGAGCACTTGGGTTCAGG--G-AGCGCC------GAGCCAGCCGTGGGCC------TCGGGCCTCGTGTGAGCAGAGAGCAG-----GGC-CGGGCTG-GGAAGCTGCTGGGGGTTCGGGA------------GGATTCCCGGTCGAGGTGGCACCGCTGGGGGTGGGGGC----------C-----------------------------ATGGGAGCGCAGAT-GCAGGCTGCGCCAGGCCGTGCCTGCTTCCGTGGCCTGAGCCG----------------GGCAGAGGCAACCCCGGGTGGTGCCACGCCCTTCCTCCTGCGGCTTCTGCACCCGAAGCCCTGCCAGAGCCCAGGCTGGGGGCCCCCGAGCAGGC-------------------------GCAGGGTGTGGTGGGCCGGTGCCGAGGAG------------------------------     
13 Microtus_oregoni-NW_024543064.1-191602_191868            75.9%  27.8%    -------------------------------------------------------------TTTGGAGACTTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACACGGTTCTGGGGTTCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTCAGCCAAGGCCAGGGGCCTGTCCTAAC-----------TTAC--------------TGTCCACCCTC---TGCCCTCTCCCCTGCCACCGAAGCT-------------------------CTCTCCAACACAGCCCTGCAG---GTCCTTTCCTGCCCTTC-CC--TTCTG-TCTGTCTGCCTAAGCCGTCAGTTCTCAGCCT-GTCTAGCTCTCTCCTC----AGTCTATGCCAGGGTCTTAGCTGG-------GGTG------GGGGTTACCCAGTAGGTGCTCCAGCTCGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTTTC-CAACCATGTTCACCAAATTGCATTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGCCATTTTATTGCCTCTGCAGAAGGGCCCCTGGCCACCAGGCCCCGGGCCGCTCCAACGCACGAGCA---------------CGGCCC--ATCTTGGGGGA-----------ACGGTGGG-----------TGTTGTTGGTGGGAT------GTGTATGGCATGTGAGGACCCCTGTGGCCTCTGCC----------CTCTAAAGAGGTA--GCTGCATATACTCTCCAGCAGTGACCTATGCAGAGGGGAATGCAGGGTGGGGCTGGGCACTGGTCAAAT-GCTGA----GCCAGCCT--GGAGGAAAGGCGGCCTGCTAGGAGGCA----GAAGTACCTGGGAAGTAGGGAGGCAGAGCCC----AA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGAGATCAGGC-CTTCCAGGCTGC-------------------TGCC-----ACACAGGGCAGGGTGAGTGTGACCCACAGCGGCAAC---AGACCCCCACTTTTCTCTCTCCCCATAGCTGGGAGCCGCAGCTCTCAATTCCTCAAGGCTGGGACAAGGGGGTGGCCAGGGTGTAGGGATTGCGGTCTGCCCTTGAGATAACA-TGGGGACGGTTCTCGAGCCTCCCTCCCAAGTTTGGGAAAGGACACATTTGTAGTCTGAAGGATGACGTGGTGTTGTCCTTAGTAGAGCTGCCAGGAAACCCTGCTCCCTGTATGT     
14 Onychomys_torridus-NC_050444.1-191522_191791             84.1%  33.6%    ----------------------------------------------------------------------------------GTGACATGGATCATGACACAGTTCTGGGGTTCCTGGGGCCATCCTCAGCCAGGGAGTGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTCAGCCAGGGCCAAGGGCCTGCCCTAAT-----------ACCC--------------TGTCCTCATCC---TACCC-ACCCTCTGCCCTTCCTCTCCC--CTCCCATTCCCTAACGGCAGCTCTCTCTGCACAGCCTTGCAG---CTCCTTTCCTAA---CC-TACCCCCT---CTGTCTGCCTATGATGTCATTTCTCAGCCT-GTCTAGCTCTCTCCTC----AGTCTATGCCAGGGTTTTAGTTGG-------GGTGG-----GGGGTTACGCAGCAGGTGCACCAGCTTGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTTTC-CAACCATGTTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGACCATTTTATTGCCTCTGCAGAAAGGCCCCTGGGCGCCAGGCCCTGGGCTGCTCCAACGCACGAGCA---------------CGGCCC--ATCTTGGGGGA-----------ATGGTGGG-----------TGTTGTTGGTGGGAT------GTGTATGGCATGTGAGGACCCCTATGGCCTCTGCC----------CTCTTAAGAGGTA--GCTGCATATCCTCTACAGCAGTTACCTATGCAGAGGGGAATGCAGGTTGGGACTGGGCAGAAGTTGACT-A---T----GGCTGGCA--CTGGT----CAAATGCTGAGCCAGCTG----AGGGCCTCAGGAACTCATGGGGCCAGAGTGC----AAGCCAGCCTGGAGG-------AGTCTTC----------------CTGGGGG-----AGTTCAAGAAGGCTTCCTAGGAAGGCAGCCCTCTAG---------GAGGCAGGAGAACCTGGGAAGTAGAGAGGCAGAAGGGAGGCAGAGCCCAAGGGAGAGCAG-GC-CTTCCAGGCTGC-------------------TGCC------ACCAGGTCAGGGTGAGCGTGACCCACAGCGACAAC----AGACCCCAGTTTTTCTTTCTCCACAAAGCTGGGGCTGCAGTCCTCAATTCCTCAAGGCTGAAACAAGTGGGTGGCCAGGGTATAGGGATTTAGGTCTGCTCTTGAGGTAACA-TGGGGACAGTT--------------------------------------------------------------------------------------------------------     
15 Lemur_catta-NC_059130.1-189886_190423                    76.4%  29.2%    -----------------ATGCCCAGGCCGCG-CCCCATTAGCACCATGATTCCTGGTAGCATTTTGGAGACTGTCAGCTCTTGTGCTGTGGATCATGACATGGTTCCGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCGACAGCGGCATT-TACGAGGCAGATCCAGGATTCGACAGGCCGCGGCCTCTGCCCTCAGT-----------CCTC--------------CGACTCGCCTA---CACCCCAGCTGAGCCCCT----CT-----------------------GC-------------------GTG-----------CCCCAA-----------------CCCCGG---------------------GGCCCCGCGTGCCATTTCTTAGGCCCCCTCCCATGTCCC-------------CGCCGGGCCACTGTGCCCAGGGCCCGAGCGCCGGGCCTGAATCCTGGATCTCCCTCCACATGGCTTTCCAGCCCACTCCGACCAAATTGCGCTGGATTTGGGGTCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGTCATTTTAACACCTCTGCCCAGAAGTGCCCCTGCGGGGTGACCACTCTGTGCACGAGCACGGGCG------------------------TCGTGGGGGAGCG---------GA--GGGG-----------GTCGGTCTCTGGGGCACAGGGCCGTCTGGCATGTGCGGCTCCTTCCGGCTCCTTCCGGCCTCTGCACACGAGCGATGCAGCCGCCGGT---CTCCCCAGTGCTGACCCTGC--------ACTCCCAGCTGGTCCTGGGGACCCC-----------GGCTGCTCTCAGG--CCTGTGCAAGGACCATCCAGGATGGTGGGCTGTGGC--CTGCTGCTGGC-GGCCGGGAGCCC----AAGCCCACTTGGGAGCACTTGGGTTCAGG--G-AAGTGC------CAGGCCAGCCCGGGCC------TCAGGCCTCGCGTGAGCAGAGAGCAG-----GGC-CAGGCTG-GGCAGCTGCTGGGGGTTCAGGA------------GGATTCCCGGTCGAGGTGGCACCTCTGGGGGCGGGGGC----------C-----------------------------ATGGGAGAGCAGAC-TCAGGCTGCGCCAGGCCGTGCCGGCTTCCTTGGCCTGAGT-G----------------GGCAGAGGCAACCCCGGCTGGCGCCATGCCCTGCCTTCTGTGGCTTCTGCACCCGCAGCCCTGCCAGAGCCCGGGCTGGGGCTC-CTGAGCAGGC-------------------------GCAGGGTGTGGTGGGC-------------------------------------------     
16 Cricetulus_griseus-NW_003616165.1-66552_66833            83.3%  32.3%    ------------------------------------------------------------------AGACTTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACATGGTTCTGGGGTTCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTTAGCCAAGGTCAAGGGCCTGTCCTGTC-----------CCCA--------------TCC-----------TACCC-ACCCTTTGCCCTTCCTCCCCA--CA---------CCTCACCGTGACTCTCCACACAGCCTTGCAG---CTCCTTTTCCGTCCTTC-CCGTCCCC---CTGTCTGTCTGCACTGTCAGTTCTCAGCCT-GTCTAGCTCTCTCCTC----AATCTATGCCAGGGTCTGAGTTGG-------GTTGA-----GGGGTTACTCAGCAGGCTCTCCAGCTCGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTTTC-CAACCATGTTGACCCAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAATCTGATTCAAGCGCTAGCCATTTTACTGCCTTCGCAGAGGGT-CCCCGGCCACCAGGCCCTGGGCTGCTCCAGTGCACGAGCA---------------CGGCCC--ATCTTGGGGGA-----------ATGGTGGG-----------TGGTGT---TGGGAT------GTGTATGGCATGTGAGGACCCCTACGACCTCTGCC----------CTCTTAAGAGGTA--GCTGCATACCCTCTCCAGCAGTGACCTATGCAGAGGGGAGTGCAGGGTGGGAGTGGG-------------CTGTG----GCCTGGCA--CTGAT----CAAATGCTGAGCCAGCTG----AGGGCTTCAGGAGCTCATGGGGCCAGAGTGC----AAGCCAGCCTGGAGG-------AGCCTGC----------------CTGGGGA-----ATCTCAAGAAGGCTTCCTAGAAAAGCGGCCCTCTAG---------GAGGCAGGAGAAGTACCTGAGGAGTAGGGAGGCAGAGACA----------AGGGAGAGCAGGC-CTTCCAGGCTGC-------------------TGCC-----ACACAGGGCAGGGTGAGTGTGACCCACAACTT-----------------TTCTTTGTCCCCAAAGCTTGGGGGGCCACAGTCCTCAATTCCTCAAGGCTGGGACAAGTGGGTGGCTAGGGTGTAAGGATTGAGGTCTGCCCTTAAGATAACA-TGGGGACGGTTCATTTATAGTTTGAAGGGTGACATCCTGTTGTC-----------------------------------------------------------------------     
17 Mus_musculus-NC_000070.7-191636_191890                   82.4%  33.3%    ---------------------------------------------------------------------------AGCTCATGTGACATGGATCATGACACGTTTCTGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTCAGCCAAAGCCAAGGACCTATCCTCCT-----------ATCC--------------TGTCCTCAC-C---CTGTGCACCTTCTGCCCTTCCCCA----------------TGACTGTAGGTCTCTCTGCACAGCCTTGCAG---CTCCTCTGCCGTCCTGT-CCTCTCTAC-CTGCCTACACTGTCA-----GTTACTGGCCC-CTCTAGCTCTCTCCTC----TGTGTATGCTAGGATCTGAGTTAG-------GGTTGGGGGCAGGGGTACCCAGCGGGCGCTCCAGCTCGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTTTC-CAACCACATTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGCCACTCTATTGCCTCCGCAGAGGGGCCCCTGGCCGCCAGGCCCTGGGCTGCTCCAACGCACGAGCA---------------CGGCCC--GTCATGGGGGT------------GGGTGGG-----------CGTTGTTGGTGGGATGCAGGGGTGTGTGGCATGTAAGGATCCCTATGGCCTCTGTC----------CTCTTAAGAGGTG--GCCACAGATCCTCTCCAGCAGTGATCTATGCAGAGGGGAATGCAGGAGGGGACTGGGCAGAAGCTGGCT-GTGGC------CTGATG--CTGGTTACGTACGTGTTGAGCCAGTTG----AGGGCCTCAGGAACTCATGGGGCCCCGAGTG----CAAGCTGGCCTGGAG-------GAAGGAG----------------TCTGCCTGGGGGAGTTCAACAAGGCTTCCTAGAAAGGCAGCCCTCTAG---------GAGGGAGGAGAGGCTCCTGGGAAGTAGGGAGGCAGAGGCCAACGGAGAG--------C-AGGC-CTTCCAGGCTGC----------------------T-----GGGCAGGTCACGGTGAGTGCAACCATGGTGA------TGGCAGACCCCGACTTTTCTTCCCCCTAGATCTGGGGCTACAGTCCTCAGTTCCTCAAGGCTGGGACAAGTGGGTGGCTACAGGTCCATGGTAGCTACAGGTCCATGGTAGCTAC-AGGTTCAGAA---------------------------------------------------------------------------------------------------------     
18 Mesocricetus_auratus-NW_024429219.1-191538_191784        82.7%  32.4%    -------------------------------------------------------------------GACTTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACACAGTTCTGGGGTTCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTCAGCCAAGGTCAAAGGCCTGTCCTAAT-----------ATCC--------------TGTCTGCATCC---TACCC-ACCCTCTGCCCTCCCCCTGCC--ACTGTAA-----------------CTCTGCACAGACTTGCAG---CTCCTTTCCCGTCCTTC-CCCTCCCT---CTGTCTGTCTGCACTGTCAGTTCTCAGCCT-GTCTAGCTCTCTCCTC----AGTCTGTGCCAGGGTCTGGGTTGG-------GGTGG---GGGCGGTTACCCAGCAGGCACTCCAGCTGGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTTTC-CAACCATGTTGACCCAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAACCTGATTCAAGTGCTAGCCATTTTACTGCCTCCGCAGAGGGT-CCCTGGCCGCCAGGCCCTGGGCTGCTCCGGCGCACGAGCA---------------CGGCCC--ATCTTGGGGGA-----------GCGGTGGG-----------CGGTGT---TGGGGT------GTGGATGGCATGTGAGGACCCCTGTGGCCTCTGCC----------CTTTTAAGAGGTAGAGCTGCATATCCTCTCCAGCAGTGACTCGTGCAGAGGGGAATGCAGGATGGGAGTGGGCAGGAGCTGGCT-GTGTG----GCCTGGCA--CTGGT----CAAATGCTGAGCCAGCTG----AGGGCTTCGGGAACTCACAGGGCCAGAGTGC----AAGCCAGCCTGAAGG-------AGTCTGC----------------CTGCCTGGGGTTATTTCAAGAAGGCTTCCTAGACAGGCGGCCCTCTAG---------GAGGCAGGAGAAGTACCTGAGAAGTAGGG-------AGAGCAGATCCCAAGGGAGAGCAGGTC-CTTCCAGGCTGC-------------------TGCC-----ACACAGGGCAGGGTGAGTGTGACCCACAGCGACAGACACCCCCCCCAACTCTTCTTTCTCCCCACAACTGGGGCCCGCAGTCCTCAATTCCTCAAGGCCGGGTCAAGTGGGTGGCTAGGGTGTAGGGAGTGAGGTCTGCCCTTAAGATAACA-TGGG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
19 Arvicanthis_niloticus-NC_047662.1-191553_191792          82.0%  33.0%    --------------------------------------------------------------TTGGAGACTTGCCAGCTCATGTGACATGGATCATGACACGTTTCTGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTCAACCAAGGCCAAGGACCTATCCTCCT-----------ATTC--------------TGTCTTCAATC---CTACCCACCTTCTGCCCCTCCGCA----------------TGACTGTAGGTCTCTCTGCACGGCCTTGCAG---ATCCTTTGCTGTCTGCT-TCCCTCCAC-CTTCCTACCCAGCCA-----GTTACTGACCC-CTCTAGCTCTCTCCTC----AGTCTATGCTAGGGTCTGAGTTAG-------GGTGGGGG--------------CGGGTGTTTCAGCTGGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTTTC-CAACCTCATTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGCCACTCTACTGCCTCCGCAGAAGGGCCCCTGGCCGCCAGGCCCTGGGCTGCTCCGGCGCACGAGCA---------------CGGCCC--ATCATGGGGGA-----------GCGGTGGG-----------TGTTGTTGGTGGGATGCAGGGGTGTATGGCATGTGAGGACCCCTGTGGCCTTTGTC----------CTCTTAAGAGGTG--GCCACAGATCCTCTCCAGCAGTGAGGGGAATGCAGAGGGGACTGG--------GAAGAAGAAGCTGGCT-GCGGC------CTGACA--CTGGTC----GCATGTTGAGCTGGTTG----AGGGCCCCAGGAACTCATGGGGCCAGAGT-G----TAAGCAGG---CCTG-------GAGGAGT----------------CTGCTTGGGGGGAATTCAACAAGGCTTCCTAGAAAGGCAGCCCTCTAG---------GAGGGAGGAGAGGCTCCCGGGAAGTAAGGAGGCAGAGGCTGAGGGAGAG--------C-AGGC-CTTCTAGGCTGC----------------------T-----CCACAGCGCAGGGTGAGTGTAACCATGGTGA------TGACAGACCCA-ACTATTCTTTCTCCCAGATCTGGGGCTACAGTCCTCAGTTCCTCAAGGCTGGGACAAGTGGGTGGCCAGGGTGTAGGGATTGAGTTCTGCCCTTGAGGTAACA-CTGGGAAGGTTCTAGGTTTAGTATGA-----------------------------------------------------------------------------------------     
20 Fukomys_damarensis-NW_022900935.1-191468_191904          79.2%  30.6%    --------------------------------------------------TCCTGGTAGCACTTTGGAGACTGTCAGTTCATTTGATATGGGCCATGACATGGTTCCGGATCCCCTGGGC-CATCCTCA--GCCAGAGTGGCATTTATGAGGCAGCTCCAGGATTCAGCCACCTCCTCCTCCCAGCACTTCC-----------ATGT--------------CCCCGTCCCTC---CTCCTCACCCTTGGGT------GT-----------------------CCGCGTCTCTACCCCGATGCC--C--TGTCCTTTCCCCTTT-CC-TCCCTTCCCTCTGTGCCCCCTGTGCTGTCATTTCTCAGTGCCCTCCCATTCCCTCCTC------AATCTGCCAGTGCCTG-------------GGGTGGGGGACGCCATGGGGCCTGGCACTCCAAGTCTGAATCCTGGATCTCCTCCTAAATGGCATTCCAGCCCATGTTGACCAAATCGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGACACTGATTCAAGTCTG-GCCATGTTATCACCTCTGCCAGCAGAGCCCC-GGCCTCCGGGCCCTGGGGTGCTCTGCACCAAGCAC---------------AG------CCTGTCCTGGGGAC--CAGTGGGTGTTGCA-----------GAGTCTCCGTGGGGCTCAGGGGTTTCTGGCATGTGAGGACCTCTGCTCTGCACTTG----------T----GAGATGCAGCTGCCCGT-GCTCT-CCAGTGGAG--------------------------ACCCCATGG-TGACCTTCCCGCCCAGCTGGACAGGAAGTGGCTGT----GGCT-GATGGGCTGGGAG---CCTGAGTCCAGCCGGGCAGTGGTTCAGTGCCGACC-AGCTGAGGATGCAGGCTTTTGCAGGCCAGGGGTAGGGCTGGGCAAGTGGAGGCTGC-----------------CTGGAGCAGTGTCCCTGTGGGTCACCAG-GAG-CA--------GGCAG------------G----------CAGGGCTGGGGGCGAGCAGGC-TGCCGGCACATCCGGCTGTGCTTGCTTTCACAACAGCTGCTGCTGGGGGCTTGGTGATGTGACCCACAGCAACAG-----CA-----ACACCTTGCTTCTCTG----------------------CAGTCCACAGAACGGTGCTAGTGTGGTGGG-CGGGG-CTAGGCTTGAGGCAGTCC-TTGAGGCCCAG-GGAA-GGGTGATTCCTGCCTCCACCCAGAGCT-----------------------------------------------------------------------------------     
21 Microcebus_murinus-NC_033661.1-189648_189909             74.6%  27.9%    CCCGGCGCCCCACCTGCATGCCCAGGCCGCGCCCCATTAGCACCCATGACTCCCGGTAGCATTTTCGAGACTGTCAGCTCTTGTGACGTGGATCATAACATGGTTCCGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCGACAGCGGCATTATACGAGGCAGATCCAGGATTCGACAGGCCGCAGCCTCCGCCCCGCCC-----------CCCT--------------GCCCCCGTGCC---GCCCTCAGT-CTCCCGAT----GC-----------------------AC------CTGCACCCCCGCCGAG-----------CCCCTC-----------------TGTGCC---------------------TCC-ACCCTGGGCCCTGCGTGCCATTTCTCCCGTGTGCC-------------TGCCGG-------------GCCACCATGCCCAGGGCCTGAATCCTGGATGTCCCTCCACATGGCTTTCCAGCCCACTCAGACCAAATTGCGCTGGATTTGGGGTCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGCCATCTTAACGCCTC-TGCCCAGAAGTGCCCCTGCGGGGTGACCACTCTGCGCACGAGCACGGCGC------------------------GTCCGGGGGAG-----------GGAGGGCG-----------TCGGGTCTCCAGGGCGCGGGGCTGTCTGGCATGCGAGGCTCCTCCC----------GGCCTCTGCACACGGGCAACGCGGCCGCCGCC-CCCCACCCAGCGCTGACCCTGC--------GCTTCCAGCCGGTCCTGGAGACCCC--------GCTGCTCTCAGAGGGG--CCTGTGCGGGGACCACCCGGGACGGTCAGCTGTGGC--CTGGCACTGGC-GGCTGGGAGCCC----AAGCCCACCCGGGCGCACCTGGGTTCAGA--G-AG-----------CGCTGGCCGTGGGCC------ACGTGCCTCGCGTGAGCAGAGAGCAG-----GGC-AGGCTGG-GACGGCCGCTGGGGGCTCAGGA------------GGATTCCTGGTAGAGGTGGCAGCTCTGGGGGGGCGGGGC---------C-----------------------------GTGGGAGCGCAGGC-TCAGGCTGCGCCAGGCCG-TGTGGCTTCCGTGGCCGGAGCGG----------------AGCAGAGGCAACGCCGGGTGGCGCCAGGCCCTGCCTCCTGCGGCTTCTGCACCTGCCAGAGCT---------GAGCTGGGGGCCCCTGAGCGGGC-------------------------GCAGGGTGTGGTGGGCC------------------------------------------     
22 Jaculus_jaculus-NC_059106.1-189452_189963                85.5%  33.8%    --------------------------------------------------------------------------------------------------------TTCTGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGCGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTCAGCTGAAGCCAAGGACCTGTCCTGCT-----------ATTT--------------TCTCTTCCTCC---CACCCACCTGCTGTC-TACCCTTTCC--------------CTCAACTATAGCTCTCAGCATGGCCATGCCG---CTCTCTTCCTGTCCTTC-CCTCCCCTC-CCTGCCTACCCATTTGGTCATTCCTCAGCCC-CTCCTTCTCCCTCCTC----AGGCTATACCAGCATCTGGATGGCGGGGGTGGGTATGTGTAGGGGGTCTCTTGCAGGTGCTCAAGTCCGAATCCTGTATCTCCTTCTAAATGGCTTTC-CAGCCACCTTGACCAAATTGCACTGCATTTGGGATCTTGAATCGGAGAGCCGATTCAAGTGCTGGACACTTTATCGCCTCTGCCAGAAGGGCCCCTGCCCACCGTGCCCTGGGCCGCTCTGTGCACAAGCA---------------CAGCCC--ATCTTGGGGGAGTGGAAGCAGTGGGTATTG-----------GTATCTTTGTGGGATGCAGGGGCGTGTGGCATGTGAGGACCCCTGTAGCCTCTGCC----------CTCATGAAATACAGCTACTTGG-TCCTCTCTAGCAATACCTAGAT-AGAAGGACTACAAAAGAGGCCCGGGCAGAGACCTTCCA-GCCTA----GTCAGCCCGAAAGATGACTTTGGTCTGACGCTAGTGG-----------GTGGGGAGCCT-------GAACCC----ATCTGAGCATTGA--------------TG----------------CCACAGCGAGCCAACTGAAGAAGGCCTCAGGGCCTTGTGGGGGCAGAAAGTGGGCC-AGGCTGGAAGAGGCTGCCTGGAGGAGCTCAGGAA--------GGCTTCCTGGAAGGGACAGTC-CTTCAGGAGGCAGGAGA----GGTACCTGGGGAGT-----CAGTAGGGCAGGGTCTGAGGGAAAGCAGGTCTCAGTAGGGCTGC---TGTACTTGCTTTCCTGGCTGTTG-----------------GCGCCCAAGGCAGGGTGAAC---------ATGACCCAT-----------------GGTGACAATG-GATCCCAACTTCTCCCCAG---AGCTGGGGTTGTAACT------------------CAGGCAAGG--------------------------------------------------     
23 Trichechus_manatus-NW_004444058.1-189346_189529          88.3%  39.2%    --------------------------------------------------------------------------------------------------CCTCTCCCTGCCT-CCCGTC---CCCTTGTCT-----TCCCCTCCCTCCTGCCTCCCCTTCTCTATTTCCATCCCT---CTCCCT--GCCCTCA--TATTCCTCTCCGTGTCCCCCCTCAGCCAGTTTCCCCTCCCACTGCATCCTCCTTCCTCTCCCTCCTCTTGTCTCTGTGC-CCCCATAACC--T---CCTTCCCCTG-TGTC-CCCCTTCCTGTCTGTGCTCCCCCACTCTGTCCCCCAACCCCGACTTTGTCATTTCTTAGCCCCCTTCCC---------------------TGCCCCCTCCGCCCATCTGTGTCTGGGGTGGGAAGGTCTGGGGACTGGGAGCTCCAAGCCTGAATTCTGGATCTTCTTCTAAATGTCTTTG--GCCGACTCTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCGGGATGCTGATTCAAGTGCTGCCA-TGTGAACGCCTCTGCCTAGAGGTGCTGATGGGGGTGACTGCCCG---CCAGGCCGCAGGGCTGCTCTGTGCACGAGCCCAAGGGTCACCAGGGAGGAGAGGGGCAGGGGTGGCAGGGTCTGGGGTGGCAGAGTTTCTGGGAGCACGGTGTGTCTGGCATGCTAGGACC--CCTGGTCTGTGCA----------AACCTGGGACATGGCCGCCAGG-CCCTCTCAATGGTGACTGGGACCGCC---------TGA-----------------------------------CCGGGGCCCCGGG----CCAGCTGTCCAGAAGGGCTG-CGTGGCTGGCGCTGGCATCTGAG---AGGCAG----GAGCCTGAACCCTGGGC--TTGCAATGGG----------------GTCCCTGAGCCTCCATTG----GGGTTCGGGGGGCACTGAGCAGGCACGGGCTC----TGCCCCCCAAGCGTGGCAG---GAATGTACCTCT----GAAAGCAGGCTGCTGGCCCCAGTCCTCTGTG-ACTGCTCCAG-GCCTGCCAGCACCTGAGGGCAGGAGTC-----------------CCTTGGAGTCCTA----GCT-----CTGATGTCTTTCTCTC--CACACCAGCACCCCTGGCAGAGTTGGGGGCTGTGGGCCTCGAGGGGT----GCAGTGTGTGGTGGGT-----------GCTGGATCT-CAT--------------------GTTCCAAG-----TC-----------------T--------CTGTT----------------------------------------------     
24 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-190042_190572         78.7%  32.6%    -----------------------------------------ATCTGTGACTCCTGGTAGCATTTTGGAGACTGTCAGTTCATTTGACATGGGCCATGACGTGGTTCCGGGTGCCCTGGGC-CATCCTCA--GCCAGAGTGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTCAGCTGAAGCCGCTGCCTCCTCCCCAC-----------TGTC--------------CTGTGTCCCCC---TCTC--CTCCTTGCCC------T-------------------------------------CGGGCATCGCT--TCTGTCCCTCCCCCT-CC-TCCCTCCCCTCCGTATCCCCCATGCTGTCATTTCTCAGCCCACTTCCATTCTCTCCTG------T----CGCCAGTGCCT-------------GGGGTGGGGGCACCATGGGGCCTGGCACTCCAAGCCTGAATCCTGGATCTCCTTCTGAATGGCGTTCCAGCCCACGTTGACCAAATTGCATTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGACACTGATTCAAGTGCTGGCCACGTTAGTGCCTCGCCAGAAGGGTCCCC-ATCTGCCAGGCCCTGGCCTGCTCTGTACCAAGTGC---------------GGCCCG--TCCGTCCTGGGGAG--CGGTGGGTGCTGCA-----------GGGCCTTCATGGGGTGCAGGGGTGTCTGGCATGTGGCGACCCCTGCTCTGTACTCG----------G----GAGCTGCAGCTGCCCCG-TGCTCTCCAGCAGGGACCCCGG---TGGGGACTGCAGGGGAGGCCTGTGCAGGGACCTCTGGCCCAGCTGGACAGGAAGCAGCTGT----AGCCTGGCAGGCTGGGAG---CCTGAGTGCAGCTAGGCAGTGGTCCAGCACCGAGCCAGCTGGGGCTGCAGGCTCACTCAGGCTGAGAGTAGGGCTGGGCTGGAGGAGGCTGCAGAGTTCAGAAAGGCTCCTGGAGCAGTGTCCCTGTGGGGGCACCA-GGGGCAGCCAGGGCAGCCA------------G----------GGCAGGGCGGGGCAAGCAGGC-CGCAGGTGCACCCAGCTGTGCTTGCTTCCGTGACTGCCGCTGCTGAGGGCTTGGGGATGTGACCCACAGCGGCCA-----CA-----GCGCCCTGCTTCTCTC----------------------TAGTCCAAGAGCGGAGCCAGGTGTGGTGGC-CAGGGCCAGGGC-TGAGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
25 Nannospalax_galili-NW_008355419.1-189437_189733          82.0%  31.6%    ----------------------------------------------------------------------TTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACATGGTTCCTGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGCGGCATTTACAAGGCAGATCCAGGATTCAGCCAAGGCCAAGGGCCTGTCTATCC-----------TGTC--------------TTCCTCTCCCA---CCCTCTTCCCTTTCC-------TT------------------ATTGTGGTTTTCTCTGCACACTC----AG---CTCCCTTCCTGGCCTCT-CCTTCCTTTCCCTGTCTGCCCA-CACTGCCATTTCTCACCT-CCCCCACTTCTTCCTC----AGTCTGTGCCAGTGTCTGGGTTGG-------GGTCG---GGGGTGATACCCAGTAGGCACTCCGGCCTGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTGTC-CAGCCACATTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCGGGAAGCCGATTCAAGTGCTGGCCACTCTATCGCCTCTGCAGAGGGGCCTCTGGCCTCCAGGCCCCGGGCTACTCCACTCACAAG-CA---------------CGGCCC--ATCTTGGGGGATGGTGGG---TGTTGTTGG-----------GATCTTCTGTGGGATGGAGGGGTGTATGGCATGGGAGGACTGCTGTGGCCTCTGCC----------CTCTTGAGATGCCGCTGCTT-GGCCCTCTCCAGCAGTGATCTAAACAAGTGGGGTGGAGGGAGGACTGCAGGAGAGGTCTGGGC-CAAGA----GCCTGGCA--CCGGT----CTGGTACTGAGCTAGCCG----AGGGCCTCAGAGGATCATGCGGGCAGAGAAC----AAGCCAACCTGGAGG-------AATCTGC----------------CTGGGGGA--------GTTCATGGCTTCCTAGAAGGGCAGCCCTCCAG---------AGTCAGG-AAAGGTAGCTGGGGAGTAGGCAGGGCA-------GAACCCGAGGGAGAGT----------------AG-------------------GTCT-----CACTGGGGCAAGGGAAACGTGACTCATGGTGACAA-----CAGAC----------------CCCAACTTTTCTTGGGCTGCAGTCAAGTCCTCAAAGAAAGGACAAGTGGGTGGCCAGGGTCTAGGATGGAAGTCAGCCATTAG--AGAACA-CAGTGAAGGTTCTCTGGCCTCCAGCCTTAGTTTGGGAAAGGACAA----------------------------------------------------------------------     
   clustal                                                                                                                                                                                                  .                                       .                                                                                                                                                    .                                                                                                                              .       .*   **** * * ** * *  * ..***        . *       * *.**      *. *******.*********.*..  * ********                            ..                                                                                                                                    *** ***    .                                      .                    .