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 1 Target                                              100.0% 100.0%    ------------------------------GCT------TTGAGCT-------GGG-------GCCCAGTGCC--------CTCTGGGTCCTGCTGGCTGCAGCTGGCCCTCGGGGAA-CCCGCACACACAGCAGGAGGGGCCTGCCCAGGCCCAGTGCTGA-CTCTCTCCTGCCATGCTCTCGGGC-CCAGAGGTGCCATCCAGCCCCTG-CCGTCTATCCACCCATCTGTTCCTCG--TCCCCCAGGCTGCAGGGCTCCCCACGCCACTGCTGTGGCCGCCTCACCTGCTCCCCCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTCGGCTTCTCTATGGCCACAGC--CTACTTTTAGAAGTGCAGCTCTGTTAGGAGCCTTGAAGGTACCCGGTGCGCGGGACA--GTGCGGCCCGCCGCCCC------TGCATGCCCAGGCCGCACCCCATTAGCATCCATGATTCCTGGTAGCATTTGGAGA---CTGTCGCTCATGTGACGTGGATCATGACATGGCTCCGGGGGCCCTGG--CCATCCCCAGCCATAG--TGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGGTTCAGCTGGGTGGCCGCCTTCTCACTGGCCTCTCCTCCCCTCCCCTCCCTCAGTCCTCCCTCCCCTCCCTCAGTCCTCCCTCCCCTCCCTCAGTCCTCCCTCCCCTCCCTCAGTCCTCCCTCCCCTCCCTCAGCCCCTTCCCTGGCGGGCAGCCCGCTGGAGCCCCCACTGTGC---CC-----CTCCTATCCCCCTCCTTCTCTCTCCTG-CCCCCATCTCGGACCCTCAGGCTGTTGGTTCTGAGTTCGCCTCCCACTCCCTCCCTG----TCCTTGCCAACCATGC-CAGTGCATGGGATGAGGGCACCCCTGAGGCCGGCGCTCCGAGCCAGAATCCCGGATCTGCTTCTAAATGGCTTCC-CAGCCACTGTGA-CCAA-ATGCGTAGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGCCATCTGAACGCATCTGCCCAGAGGCGCCCCTGCAGGGGGGTGACCCACCTGCCGGGCCTGGGCCGCTCTGTGCACGAGCACGGCTCGTCATGGG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 2 Theropithecus_gelada-NC_037668.1-225679_226613       93.7%  82.3%    CCCTGCTGCCCTGCAGAGCCGGCTGCCCTGGTT------CTCAGCT-------GAG-------GCCCAGTGCC--------CTCTGGGTCCTGCTGGTTGCAGTTGGCCCTCGGAGGACCCTGCTCACACAGCACGAGGGGCCTGCCCAAGCCCAGTGCTGA-C--TCTCCTGCTGTGCTCTCGGGC-CCAGAAGTGCCATCCGGCCTCTG-CCGTCTATACACCCATCTGTTCCTCG--TCCCCCAGGCCGCAGGGCTCCCCATGCCGCTGCTGTGGCTGCCTCACCTGCTCCCTCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTCGGCTTCTCTATGGCCTCAGTCTCTACCTTTAGAAGCCCAGCTCTGTTAGGAGCCTTGAAGGTACCCGGTGCGCGGGACA--GTGCGGCCCGCCACCCC------TGCATGCCCAGGCCATGCCCCATTAGCATCCGTGATTCCTGGTAGCATTTGGGGA---CTGTCGCTCTTGTGACGTGGATCATGACATGGCTCTGGGGGCCCTGG--CCATCCCCAGCCAGAG--TGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGGTTCAGCTGGGTGGCCGCCTTCTCACTGGCCTCCCCTCTCCTCCTCTTCCTCAATC------------------------------------------------------------CTCCCTCCCCTCCCTCAGCCCCTTCCCTGGTGGGGAGCCCGCTGGAGCCCCCGCTGTGC---CC-----CTCCTATCCCCCTCCTTCTCTCTCCTG-CCCCCCTCTCGGACCCTCAGGCTGCTGGTTCTGAGTTCCCCTCCCGCTCCTTCCCTG----TCCTTGCCAACCATGCCCAGTGCCTGGGATGAGGGCACCCCTGAGGCCGGTGCTCCGAGCTGGAATCCCGGATCTGCTTCTAAATGGCTTCC-CAGCCACTGTGA-CCAA-ATGCGTGGATTTGGAATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGCCATCTGAACGCATCTGCCCAAAGGTGCC-CTGCAGGGAGGTGACCCACCTGCCGGGCCTGGGCTGCTCTGTGCACAAGCACGGCTCATCATGGGGGCAGAGTGGGTGCTG----------------CCGGTCTCGGGGG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 3 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-125877_126407         89.7%  69.2%    ---------------------GCTGCCCTGCAG------AGCAGCTGGGAGCCAGT-------GCCCAGTGCC--------CTCTGGGTCCT-----------------GCTGGCTACAGCTGCACACACAGCACGAGGGGCCTGCCCAGGCCCAACCCTGA-CTCTCCTCTGCCATGCTCTCAGGC-CCAGAGGTGCCATCCGGCCCCTG-CCATCTCCCA-CCCATCCACTCCTCG--TCCCCCAGGCCTCGGGGCTCCCCACGCGGCTGCCATGGCCGCCTCACCC-GCCCCTCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTCGGCTTCTCTATGGCCACAGT--CTACTTTTAGAAGCGCAGCTCCGTTAGGAGCCTTGAAGGTACCCGGCGCGCGGGACA--GTGCTGCCCGCCGCCCC------TGCATGCCAGG--CCGTGCCCATTAGCATCCGTGACTCCTAGTAGCATTTGGAGA---CTGTCGCTCATGTGACATGGATCATGACATGGTTCCGGGGACCCTGG--CCATCCCCAGCCAGAG--TGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGGTTCAGCTGGGCGGCCGCCTTCTCCCGGCCTCCTGTCCCTCAGGC-----------CTCCCTCCCCTCACTCAGT-----------------------------------------------------------------CCCTGGTGGGGAGTCGGC-TGTAGCCCCCCCGTAT---CC-----CTCCCGCCCCCCTCCTTCTCTCTGGTG-CCCCCACCTCGGCCCCTCAGGCCGTTGGTTCTGAGTCCCCCTTCTGCTCCCTCCCTG----TCTTTGCCAACCACGCCCAGTGCCTGGATGAGGGCA-CTCC-CAAGGCTGGTGCTCGAGCCGGAATCCCGGATCTGCTTCTAAATGGCTTCC-CAGCCACTGTGA-CCAAATTGCGTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGCCATCTGAACGCATCTGCCCAGAGGCACCCCTGCAGGGACTGACC---CACTGGGGGCCTGGGCCGCTCTGTGCACGAGCACGGCTCGTCATGGGGGCTCGGTGGGTGCTG----------------CTGGTCTTGGGGTGTCTGGTATGTGAGGGCCCC---TCTGGCCCCGGCACCCTGGAGATGCAGCTGCCTCA---------------------------------------------------------------------------------------     
 4 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-206454_207266        95.6%  55.0%    --------------------------------T------GTGTGCTGGGGTCTAGC----ACCCTTCGGTGA---------GGTTGGCACTGGGGTCCTGTCCAGAGCCCAATACTAACAATTTCTCTCCTGCTGCACTTGTGGGCCCGGAGATGCCCACCGGACGCGAGCTCCGCA-GCATCCAGCTCTCCGCCTGCCGTCCATCTGTCT----GTCGTGTGTCTGCCTGTCTCCG---CGGGCCCACAGGGCTCCCCAACCCTGGCCGCCATTGCCTCCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGCAGTGTGGGCTTCTCTATG--TCCAAAGTCTACTTTTAGAAGCACAGCCTTGTTAGGAGCCTTGAAGGTACCCCACTGCCACGGGACGGTGTAGCCCGCCGCCCCCACTTGCATGCTCAGGCCGCACCCCACATTAGCATCCGTGACTCCTGGTAGCATCTTG-GAGACTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACGTGGTTCCGGGATCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGGGAGTGGCATTTAGGAGGCAGATCC-------AGGATTCGGCGAAGGCCGCCTGCCGTGTGCCTATCTCCCTGTGATGCCTGCCCTCCCTCC----CCACTGGGCTCTCTCACCT---TCCGTCTTCCCGGCCC---------------ACCCATCAA-TGGCCCTTTCTCTGGCTG--AGATCTCTTGAGCACCCCTTTGGGCC-CCTTCCCTTTTCCTCTTCTTCCCCCTCTGTCCTCCACCCCTGCCCCCACCCCCAAGCTGTCATTTCTTAGTCTTGCTCCCTTTTCCCTCCTGG-GTCTGTGCAGACCACGCCTGGTGCCTGGGGTGGGGGATGTCCCTGAGCTCAGGAATCCAAGCCCGAATCCTGGATCTTCCTCTAAATGGCTTTC-CAGCCCCCTTCACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGATGCTGATTCAAGTGCTGGCA-CTTCAATGCCTCTGCCCAGAAGCGCCCCTGCTGGGGGTGACCTGCCCGCCAGGCCCGGGGCCACTCTGCGCACGAGCACGGCCCATCAGGGG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 5 Marmota_flaviventris-NW_023144724.1-189066_189518    80.9%  38.7%    ---------AGTGGGCCT--GGCATCCTTAGGG------TGCTGCCCAGGGCAGC-----TGGTGCCTGGGTCTGTGG---CACACAGCACAGGG-TCCTGCCCAGGACCAGCACTG--ACCTTCTCTCCTGCCATGTCTGCGGGCCCAGAGGCTCTGCCGGCTTCAGCACTCTTGTGC-----CACTG---------------TCTGTCCGTCTGTCACG--------TGTCTGCTGT-CTCTGCG-GCCCTG--GGTCCCCTCCCCACACAGTCGGGGCCTCGCCACCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTAC--AGTGGGCTTCTCTGTG--TCCAAAGTCTACTTTTAGACGTGCGGCCTTGTTAGGAGTCACAAGGTACCCTGCTGCTGCGGG-ACAGTGTAGCCCGCCGCCCAC-----CTGCATGCCAGGCCGCATCCCATTAGCATCCATGGTTCCTGGTAGCATTTTG-GAGACTGTCCGTTCATGTGACATGGGTCATGACATGGTTCCGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGACAGCGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTGAGCCAAGGCCACGTGCTTCCCCGCTGTCCTGTCTCTCCACCCGCTGC---CCTCTTCTGT----CCGGAG-------------------------------------------------------C----------TCT----CCTGGGCTCCCTGTGCCCCTT---CCG----T------TCTC-CT-------------CCCCCCACCTTCCCTCTCCAT------------CCCTCCTCATG---CTGCGACTTTGCCACTCC--TGATCCT-------------GCCAGGGCCTGGGGTGGGGCCACCTGGGCAGGAGCTCCGAGCCGGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCCTCC--AGCCACATGGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGTGGCTACTTTACTGCCT-CTGCCACTGGGGCCCTAGGCCACTCCGCGCACGAGCAC-----------------------------AGCCCGGCCTGGGGGAGCGG-TGGG----TGTTGTCGGGGCCTCTGTGGGATGCAGAGTGTTTGGCATGTGAGGATCCTCCTGG---C-CTCTGCACTGTGAGATGCAGCTGGCCA-GCCTTCTCCA------------------GCAGCGACCCAGGA---AGGGGCTGCAGGAGAGGCCT----------------------     
 6 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-257345_257895  90.8%  48.9%    ----------------------GGTCCTGCCAG------GTGCAGCCCGAACTCGG----GGGTCTGTGATC---------GCATAGCACGTGGGTCCTGCCCAGGGCCCCACGCTAACCGTCTCTCTCCTGCTGCGCTTGTGGGCCCAGAGGTGCCAGCCCAACCCAGCCTCTGCAGGCACCCGGCTCTCTGTCTGCTGTCCGTCTGTCT----GTCCTGTGCCCGCCTGTCTCCA---CGGGCCGCGGGG----CGCCCCCCCGGCTGTCGTTGCCGCCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTCGGTCTTAC--AGTGGGCTTCTCTATG--TCCAAAGTCTACTGTTAGAAGCACAGCCTTGGTAGGAGCCTCCAAGGTACCCCGGCGCCGGG--ACAGTGTGGCCCGCCGCTCCCACCTGCATGCCCAAGCC--GCACCCCATTAGCATCTGTGGCTCCCAGTAGCATTTTG-GAGACTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGCCATGGCTCCGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGACAGCAGCATTTACCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTCGGCTGAGGCCGCTACATGCCCCTTCCC--------------------CGCTCC----CTCCTGGTGCCT----------GCCC-----------------------------------T-GTACCCCTTCTTTGGCTGTGAGCTCTCTTGAACCCCCCATGCCCCCTCCTTCCCAGTTTCGTCTCCTCCTTTCCTATTCTC------CCTCCAGCCCCCCAGTTGCTCATTTCTCAGTCTCCCTCCTG-TTTTCCTTCCC-CATTGTGTGGACAATGCCCAGTGCCTGGGATGGGGGACGTCCCAGGGCCAGGAGCTCCAAGTCTGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTTTC-CAGCCACACTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGCCACTTGGACGCCTCTGCTCAGAAGTGCCCCAGCTGGGGGTGATCTGCCCGCTGGGCCCTGGGCCACTCTGCGCACGAGCACGGCCCATCATGGGGGAATGGTGGGTGTTG---TTGGGGTCTCTGTGGGGGGCACGCG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 7 Mus_caroli-NC_034573.1-190792_191086                 84.5%  40.8%    --------------------GGGGTACAACTTG------GTGCAACCAACCCTTCG--------------GGGCCTGTAACCACACAGTGAGTGG-GTCCTGCTGGGCCCAGCACCA------ACTCTCTGGTAGCATTATGGGTCCAGAGGTACTAAAAGTGT---CCCCTTACT------------TGCCACTACCCATCCATCTATCC----TGTGTCTGCCTCTCTCTGAGGGCCATCCCTGGCTGGGTAGGCCCTGCTCTGGCCACCACGGCCACCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTGGGCTTCTCTATG--TCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCTCAGCCTTGTTAGGAGTCTCAAAGGTACCCGGCGCCGCGGG-ACGGTGTAGCCCGCCGCCCCA-----CCTGCATGCCAGGCCGCGCCCATTAGCATCCGTGATACTTGGTAGCATTTTG-GAGACTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACACGTTTCTGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTCAGCCAAAGCCAAGGACCTATCCTCCTATCCTGTCCTCACCCTGCGCACCTTCTGCCCTTC----CCGACT-------------------------------------------------------------------------GTAGGTCTCTCTGCACAGCCT---TGCAGCTCCT----CTGC-T---------------GTCTTGTC---CCCTCTACCTGCCTACACTGTCAGTTACTGGCCCCTCTAG-CTCTCTCCTCTGTGTATGCTAGGGTCTGAGTTAGGGTTGG-------GGGCAGGGGTACCCAGCGGGCGCTCCAGCTCGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTTTC-CAACCACATTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGCCACTCTATTGCCTCCGCAGAAGATGCCCCTGGCCGCCAGGCCCTGGGCTGCTCC--A------------ACGCACGAGCACGGCCCATCATGGGGGTGGG--------GT---GGGCGTTGTTGGTGGGATGCAGGGGTGTGTGGCATGTAAGGA---TCCCTATGGCCCCTGTCCTCTTAAGAGGTGGCCACAG--ATCCTCTCCA------------------GCAGTGA----------------------------------------------------     
 8 Jaculus_jaculus-NC_059106.1-188919_189218            84.8%  40.8%    ---TTCTGAACAGGGCCG--ATGCACCCTTAGG------GTACAACCCACCCTT---------------------GGGAGCCTGTGACCACGTGG-GTCCTGCCACAGCCAGCACTG------ACTCTCCCACTGCATCTGTGGGCCCAGAGGCTTTGCAGGAGT------CCTGT------------TCTCTGCTGCTGTCAATCTGTCC----TGTGCCTGCCTGTCTC----TGAGGGCCAAGGGCCAGTAGGCCCCATCCTAGTCACTGTGGTCGCCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTGGGCCTCTCTATG--TCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCGCAGCCTTGTTAGGAGTCTCAAAGGTACCCGGCGTTGCGGG-ACGGTGTAGCCCGCCGCCCCA-----CCTGCATGCCAGGCCGTGCCCATTAGCATCTGTGACTCTTGGTAGCATTTTG-GAGACTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACATGGTTCTGG-GTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGCGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTCAGCTGAAGCCAAGGACCTGTCCTGCTATTTTCTCTTCCTCCCACCCACCTGCTGTCTACC----CTTTCC-------------------------------------------------------C-TCAACTATAG------------CTCTCAGCATGGCCA---TGCCGCTCTC----TTCC-TG-------------TCCTTCCCTCCCCTCCCTGCCTACCCATTTGGTCATTCCTCAGCCCCTCCTT-CTCCCTCCTCAGGCTATACCAGCATCTGGATGGCGGGGGTGGGTATGTGTAGGGGGTCTCTTGCAGGTGCTCAAGTCCGAATCCTGTATCTCCTTCTAAATGGCTTTC-CAGCCACCTTGACCAAATTGCACTGCATTTGGGATCTTGAATCGGAGAGCCGATTCAAGTGCTGGACACTTTATCGCCTCTGCCAGAAGGGCCCCTGCCCACCGTGCCCTGGGCCGCTC---T------------GTGCACAAGCACAGCCCATCTTGGGGGAGTGGAAGCAGTGGGTATTGGTATCTTTGTGGGATGCAGGGGCGTGTGGCATGTGAGGA---CCCCTGTAGCCTCTGCCCTCATGAAATA--------------------------------------------------------------------------------------------------     
 9 Onychomys_torridus-NC_050444.1-190992_191360         85.5%  40.6%    --------------CCTT--AGGGTACAATTTG------GTGCAACCAACCCTGTA----GGGCCTGTAAC----------CACACAGTGAGTGG-GTCCTGCTGGGTCCAGCACTG------ACTGTCTTGTAGCACCATGGGCCTAGAGGCACTGCAGGTGT-------CCTGT------------TCTAGGATACCATCTATCTGTCC----TGTGTCTGCCTGCCTT---TGAGGGCCAAGGGCTGGGTAGGCCCTGCTCTGGCCACTATGGCCACCTCACCTGCCTTCATTCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTGGGCTTCTCTATG--TCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCTCAGCCTTGTTAGGAGTCTCAAAGGTACCCGGCGCTGCGGG-ACGGTGTAGCCCGCCGCCCCA-----CCTGCATGCCAGGCCGCGCCCATTAGCATCTGTGATTCTTGGTAGCATTTTGGAGACTTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACACAGTTCTGGGGTTCCTGGGGCCATCCTCAGCCAGGGAGTGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTCAGCCAGGGCCAAGGGCCTGCCCTAATACCCTGTCCTCATCCTACCCACCCTCTGCCCTTC----CTCTCC-------------------------------------------------------C-CTCCCATTCCCTAACGGCAGCTCTCTCTGCACAGCCT---TGCAGCTCCT----TTC-------------------CTAACCTACCCCCTCTGTCTGCCTATGATGTCATTTCTCAGCCTGTCTAG-CTCTCTCCTCAGTCTATGCCAGGGTTTTAGTTGGGGT------------GGGGGGTTACGCAGCAGGTGCACCAGCTTGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTTTC-CAACCATGTTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGACCATTTTATTGCCTCTGCAGAAAGGCCCCTGGGCGCCA-GGCCCTGGGCTGCTCC--A------------ACGCACGAGCACGGCCCATCTTGGGGGAATGGTGGG-----------TGTTG------TTGGTGGGATGTGTATGGCATGTGAGGA---CCCCTATGGCCTCTGCCCTCTTAAGAGGTAGCTGCAT--ATCCTCTACA------------------GCAGT------------------------------------------------------     
10 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-189617_189993     82.3%  40.3%    ---------------------------------------------------CAGGGATCTCAACCTGTGAGCCTGGCG---G-CT-CTTCCAAGT-GGGGGGTCTGGGCCCCACTGA--CCTCTCTCTCCTGCTGTGCCTGTGGGCCCAGAGGCTCTGCAGGGTGCTGCTCTCTGCTGC-----TGCGGT---CCGTCTGTCTGTCCGTCCGTCCGTC-AGTCTTTCGTGTCCGCCTGT-CTACAAGGGCCACGGGCCCCCTCCCTGGCCTCTGGGACCTCTCACCGGCCTTCACTCTGTTTCTTTGGTCTTTC--AGTGGGCTTCTGTATG--TCCAAAGTCTACTTTTAGAAGCGCGGCCTTGTTAGGAATCTCGAAGGTACCCGGGGCGCCATG-GGCCTGTGCA--GCCCGCGCC-----CCTGCATGCCAGGTCGCACTCATTAGCATCTGTGACTCCTGGTAGCATTTTG-GAGACTGTCAGTTCATTTGACATGGGCCATGACGTGG-TTCCGGGTGCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGTG--GCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTCAGCTGAAGCCGCTGCCTCCTCCCCACTGTCCTGTGTCCCCCTCTCCT---CCTTGCCCTC----GGGCAT-------------------------------------------------------C----------GCT----TC-----------------------------TGT--C-CCTC-CC-------------CCTCCTCCCTCCCCTCCGTATCCCCCATGCTGTCATTTCTCAGCCCACTTCCATTCTCTCCT--G--TCG--CC-------------AGTGCCTGGGGTGGGGGCACCATGGGGCCTGGCACTCCAAGCCTGAATCCTGGATCTCCTTCTGAATGGCGTTCCAGCCCACGTTGACCAAATTGCATTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGACACTGATTCAAGTGCTGGCCACGTTAGTGCCTCGCCAGAAGGGT-CCCCATCTGCCAGGCCCTGGCCTGCTCTGTA------------CCAAGTGCGGCCCGTCCGTCCTGGGGAGCGG-TGGG----TGCTGCAGGGCCTTCATGGGGTGCAGGGGTGTCTGGCATGTGGCGACCCC---TG---C-TCTGTACTCGGGAGCTGCAGCTGCCCC-GTGCTCTCCA------------------GCAGGGACCCCGGT---GGGGACTGCAGGGGAGGCCTGTGCAG----------------     
11 Meriones_unguiculatus-NW_018657773.1-189149_189442   81.8%  36.9%    -------------GCCCT--GAGGGTACAGCCG------GTGCAACCAACCCTT--------------TGGGGCCTGTAGCCACACAGTGAGTGG-GTCCTGCTGGGCCCAGCACTG------ACTCTCCTGTGGCACCACGAGCCCAGAGGCACTACAGCTGTCCTATCCTC----------------TGCCACCACCCATGGTCTATCC----TGTGCCAGCCTGTCTC---TGAGGGCCACGGGCTGGGTAGGCCCTGCTCTGGCCACCACGGCCACCTCACCTGCCTTCACCCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTGGGCTTCTCTATG--TCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCTCAGCCTTGTTAGGAGTCTCAAAGGTACCCGGCGCCGCGGG-ACGGTGTAACCCGCCGCCCCA-----CCTGCATGCCAGGCC-GCGCCATTAGCATCCGTGATTCTTGGTAGCATTTTG-GAGACTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACACGGTTCTGGGATCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTATGGGGCAGATCCAGGATTCAGCCACAGCCAAGGTCCTGTCCTTCTGGTCCTCTGCCCTTCCCCAAGACTGTAGCTCT-------------------------------------------------------------------------------------------CTCTCTGCACAGCCT---TGCGGCTCCT----TCC------------------TGTGCATCTCTCCCCTCTACTGTCTACACTGCCAGTTCTTGGCCCCTCTCG-CTCTCTCCTCAGTATATACCAGGGTCTGAGTTGGGGTGGGGTGGGGTGGGGTGGGGTACCCAGCAGGCATTCTAGCTCGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTTTC-CAACCACATTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGTGTTCGCAGAAG---------------GG-CCCCTGGCCACCAGGCCCTGGGCTGCTCC--A------------GCGCACGAGCACGGCCCATCTTGGGGGAATGGTGGA-----------TGTTGCTGGTGGGATGCAAGGGTATGTGGCATGTGAGGA---CCCCTGCGACCTCTGCCATCTTAAGAGGCAGCCGCAG--ATCCCCTCCA------------------GCAGGGATCTATGCAGAGGGGAATGCAGGA-----------------------------     
12 Mesocricetus_auratus-NW_024429219.1-191040_191335    84.5%  41.7%    --------------------GTCGGATGCACCC------TTAGGATGCCACCTTCA--------------GGGCCTCTAACCGCACAGTGAGTGG-GTCCTGCCGGGCCCAGCGCTG------ACTCTCTTGTAGCACCATGGGGCCAAGAGGCGCTGCTGGTGTCCTGCCCTATG------------CCACACCACCCGTCCATCCACCC----TGCACCTGCCTGTCTCTGAGGG---CCAAGGGCTGGGCCGGCCCTGCTCTGGCCACGATGGCCACCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTGGGCTTCTCTATG--TCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCTCAGCCTTGTTAGGAGTCTCAAAGGTACACGGCGCCGCGGG-ACGGTGTAGCCCGCCGCCCCA-----CCTGCATGCAGGCC-GCGCCCATTAGCATCCGTGAATCTTGGTAGCATTTTGGAGACTTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACACAGTTCTGGGGTTCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTCAGCCAAGGTCAAAGGCCTGTCCTAATATCCTGTCTGCATCCTACCCACCCTCTGCCCTCC----CCCTGC-------------------------------------------------------------------------CACTGTAACTCTGCACAGACT---TGCAGCTCCT----TTCC-C---------------GTCCTTCCCCTCCCTCTGTCTGTCTGCACTGTCAGTTCTCAGCCTGTCTAG-CTCTCTCCTCAGTCTGTGCCAGGGTCTGGGTTGGGGTGG----------GGGCGGTTACCCAGCAGGCACTCCAGCTGGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTTTC-CAACCATGTTGACCCAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAACCTGATTCAAGTGCTAGCCATTTTACTGCCTCCGCAGAGGGT--CCCTGGCCGCCAGGCCCTGGGCTGCTCC--G------------GCGCACGAGCACGGCCCATCTTGGGGGAGCG--------GT---GGGCGGTGTTGGGGTGTGGA---------TGGCATGTGAGGA---CCCCTGTGGCCTCTGCCCTTTTAAGAGGTAGAGCTGCATATCCTCTCCA------------------GCAGTGACTCGTGCAG-------------------------------------------     
13 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-191016_191302   74.7%  37.3%    ----CCTGGCCCGGCCTTCCCGATCTGTAGAGCTGGCGTCCCAGGTCCCAGCTGGGGCCTGGAGCCCTTGGGGACTGTAAACGCA-G--CTCAGGGGCCGCCCGGGGCCCAACGGCGACCATTTCTCTCCTGCTGCGCTCGTGGGCCCAGAGGCACAAGCTGGACGGG--------------------CTCCG-CAGGCGT-----------------------CCGTCCG---------TCTCCGCGG--------CCACGGGCCCTGCCGCTGTCCTGCCGCCTCACGTCCTTCCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTGGCCTCCCCA-TG--TCCAAAGTCTACTTTTAGAAGCACGGCCTTGTTAGGATCCTCCAAGGTACCCCAGCGCCGCGGGGCCGTGTGGCCCGGCGCCCCA---CCTGCATGCCCAGGCCGCGCCCCATTAGCACCCATGATTCCTGGTAGCATTTTG-GAGACTGTCAGCTCTTGTGACGTGGATCATGACATGGTCCGGGGT-CCCCTGGGCCATCCTCAGCCGATAG-CGGCATTGACAAGGCAGATCCAGGATTCGACAGGCCGCAGCCTCCGCCCGACCCCCGTGCCGCCCTCAGT--------------------------CT-------------------------------------------------------C---------TGACTGGCCCG-----------CACTCCAGCCGAGCCCCTCT----GCGC-C-----------------------------------------------------------CCCGCCCTGGGTCCCCGC---------GTGCCATTTCTCCTGTGTCCCCGCCGTGCCACCATGCCCAGGGCCAGAGCGCCGGGCCTGAATCCTGGATCTCCCTCCACATGGCTTTCCAGCCCACTCTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGGTCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGCGCTGGCCATTTTAACGCCTCTGCCCAGAGTGCCCCT---GCGGGGTGACCACTCTGTGCACGA--------------------GCACGGCGCGTCGCGGGGTAGCGGAGGGTGTCG---------GGTCTCCGGGGTGCGGGGCCGCCTGGCATGTGAGGCTCCT---TCCGGCCTCTGCACACGTGCCACGCAGCTGCCGGCCTCCCCAGCGCTGACCCTGCACTTCC-GGCGGGTCCTGGGCACCCGGCTGCTCTCAGAGAGGCCTGTGCAGGGACCATCCAGGGTGT     
14 Nannospalax_galili-NW_008355419.1-188943_189238      82.5%  38.5%    -----CTGATGCACCCTT--TGGGCATAACCTG------GTATAGCCAGCCCTCAG--------------GG--GTCGGTAACTACAGTGTGTGG-GTCTCAATGGACCCAGCACTG------ACTCTCCTGCAGCACCCATGGGCCCAGAGGCTCTGTGGGTGTCCTGTTCTATG------------CT--ATCA---------CCCGTC----CGTTCACGCCTGTCTC---CGAGGGCCAAGGGCTGGATAGGCCCCACTCTGGTCACCATGGCCACCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTGGGCCTCTCTATG--TCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCTCATCCTTGTTAGGCGTCTGAAAGGTACCCGGCGCCGCGGG-ACGGTGTAACCCGCCGCCCCA-----CCTGCATGCCAGGCCGCGCCCATTAGCATCCGTGATTCTTGGTAGCATTTTG-GAGATTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACATGGTTCCTGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGCGGCATTTACAAGGCAGATCCAGGATTCAGCCAAGGCCAAGGGCCTGTCTATCCTGTCTTCCTCTCCCACCCTCTTC-----CCTTTC----CTTATT-------------------------------------------------------------------------GTGGTTTTCTCTGCACACTCA---GCTCCCTTC-----CTGG-C---------------CTCTCCTTCCTTTCCCTGTCTGCCCACACTGCCATTTCT-CACCTCCCCCA-CTTCTTCCTCAGTCTGTGCCAGTGTCTGGGTTGGGGTCG----------GGGGTGATACCCAGTAGGCACTCCGGCCTGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTGTC-CAGCCACATTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCGGGAAGCCGATTCAAGTGCTGGCCACTCTATCGCCTCTGCAGAGGGGCCTCTGGCCTCCA-GGCCCCGGGCTACTC---C------------ACTCACAAGCACGGCCCATCTTGGGGGATGGTGGGTGTTGT---TGGGATCTTCTGTGGGATGGAGGGGTGTATGGCATGGGAGGA---CTGCTGTGGCCTCTGCCCTCTTGAGATGCCGCTGCTTG-GCCCTCTCCA------------------GCAGTGA----------------------------------------------------     
15 Castor_canadensis-NW_017871110.1-188749_189063       83.5%  41.4%    --------------------------CGGCCCG------GTGTGGCCAGCACTCAG----GGATCTGTAAACGC----------ACAGCACATGGATCCTGCCTGGGCCCATCATTGACCTTCTCTCTTCTGCTGTGCCTGGGGGCCCAGGGGCTCTGCAGGTGTCCAGTTC---T------------CCTTTGCTGCCGTCTGTCTGTCT----GCGTGTTGTATGTCTG---CGTGTCTCCACAGGCCCGCGGGCCCCACCCCAGCCACCGTAACCGCCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGCTCTTGC--AGTGGGCTTCTCTATG--TCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCGCTGCCTTGTTAGGCATCTCGAAGGTACCCCGATGCCGCGG-GACGGTGTAGCCCGCCACCCCACCTGCATGCCAGGCCACGCCCCCCCATTAGCATCCGTGATTCCTGGTAGCATTTTG-GAGATTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACATGGTTCTGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGCGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTCCACTCAGCCAAGTGTCCTGTCTCCAGCTGCCTTCCCATC---------TGACCTGCCCCA----CCCCAG------------------------------------------------------------CTCTTTCCTCTGGCTGCTGCTCTCGGGGGCACTC---TTATGGTCCTGCCTTTCC-CT-------------GCCCTCTCCTTCTCACTCTGTCCCCCATGCTGTCATTTTTCAGTACCTCCCT-TTCCCTCCTCACTCTATGCCAGTGTC-----------------TAGGGTGGGGCATCTGGGCCCAATGCGCCGAGCCTGAATCCTGGATCTCCCTCTAAATGGCTTTC-CAGCCACAGTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCGGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGCTACTTTACCGCCTCTGCCAGAAGGCCCTGGGCCGCTCTGCACATAAGCAC-------------------------------AGCCCATCTTGGG-GAGCAGTGGGTGTTT-------GGGGAATCTGGGGCACAGGGGTGTTTGGCATGTGAGGA---TCTCTCTGGCCTCGGCCCTGTCCAGCAGTGACCTGGGCAGGGACTG-CA------------------GGAGAGGCCTGTGC---------------------------------------------     
16 Microtus_oregoni-NW_024543064.1-191116_191404        81.7%  38.4%    ---------AGCAGGAAC--GGTTCTCAATCTG------TGGAGTCCAACTGTCTG----GGTTCTAAGTGGGGTCTGATACATCCTTAGGGTAC-AACTTGATGCAACTAACCCTT------CAGGGCCTG------TGACCACAGTAAGTGGGTCCCACTGG-------GCCCA------------CCCCTGACTGCATCCATCTGTCC----CGTGTCTGCCTGTCTC---TGAGGGCCAAGGGCTGGGTAGGCCCTGCTCTGGCTGCCATGGCCACCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AG----------------TCCCAAGCCTACTTTTAGAAGCTCAGCCTTGTTAGGAGTCTCAAAGGTACCCGGCGCCGCGGG-ACGGTGTAGCCCGCCGCCCCA-----CCTGCATGCCAGGCCGCGCCCATTAGCATCCGTGATTCTTGGTAGCATTTTGGAGACTTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACACGGTTCTGGGGTTCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTCAGCCAAGGCCAGGGGCCTGTCCTAACTTACTGTCCACCCTCTGCCCTCTCCCCTGCCACC----GAAGCT-------------------------------------------------------C-T----------------------CTCCAACACAGCCC---TGCAGGTCCT----TTCC-T---------------GCCCTTCCCTTCTGTCTGTCTGCCTAAGCCGTCAGTTCTCAGCCTGTCTAG-CTCTCTCCTCAGTCTATGCCAGGGTCTTAGCTGGGGT------------GG-GGGTTACCCAGTAGGTGCTCCAGCTCGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTTTC-CAACCATGTTCACCAAATTGCATTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGCCATTTTATTGCCTCTGCAGAAGGGCCCCTGGCCACCA-GGCCCCGGGCCGCTCC--A------------ACGCACGAGCACGGCCCATCTTGGGGGAACGGTGGG-----------TGTTG------TTGGTGGGATGTGTATGGCATGTGAGGA---CCCCTGTGGCCTCTGCCCTCTAAAGAGGTAGCTGCAT--ATACTCTCCA------------------GCAGTGACCTATGCAGAGGGGAATGCAG-------------------------------     
17 Fukomys_damarensis-NW_022900935.1-191050_191332      82.5%  39.2%    ----------------AC--ACATTGGCCACAG------GCCAGACCAGGGCAGGGTCTCCAGCCTGTGAGCTGGCTG---C--T-CTTCCCAGG---GGGTTCTGGGCCCTGGTGA--CCTCTCTTTTCTGCTGTGCCCATGGGGCCAGAGGCTCTGCAGGGTCCTGTTCTCTGCTGC-----TGC-CGTCC------GTCTGTCTGTCC-------------GTCATGTCCTCCT---GTCTCCATGGCCGCGGCCCCCTCCCCAGCCTCCCAGGCCACTCACCGGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTGGGCTTCTGTATG--TCCAAAGTCTACTTTTAGAAGCGCAGCCTTGTTAGGAACCTCGAAGGTACCCG-GGTGCCACA-GGCCTGTGCA--GCCTGCGCC-----CCTGCATGCCAGGTCGCGCTCATTAGCATCCGTGACTCCTGGTAGCACTTTG-GAGACTGTCAGTTCATTTGATATGGGCCATGACATGG-TTCCGGATCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGTG--GCATTTATGAGGCAGCTCCAGGATTCAGCCACCTCCTCCTCCCAGCACTTCCATGTCCCCGTCCCTCCTCCTC---ACCCTTG-------------------------------------------------------------------------------GGT----GTCCGCGTCTCTACCCCGATG---CCC--TGTCC--T-TTCC-CC-------------TTTCCTCCCTTCCCTCTGTGCCCCCTGTGCTGTCATTTCTCAGTGCCCTCCCATTCCCTCCTCAA--TCTGCCA-------------GTGCCTGGGGTGGGGGACGCCATGGGGCCTGGCACTCCAAGTCTGAATCCTGGATCTCCTCCTAAATGGCATTCCAGCCCATGTTGACCAAATCGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGACACTGATTCAAGTCTG-GCCATGTTATCACCTCTGCCAGCAGAGCCCC-GGCCTCCGGGCCCTGGGGTGCTCTGCA------------CCAAGCACAGC----CTGTCCTGGGGACCAG-TGGG----TGTTGCAGAGTCTCCGTGGGGCTCAGGGGTTTCTGGCATGTGAGGACCTC---TG---C-TCTGCACTTGTGAGATGCAGCTGCCCG-TGCTCTCCAG------------------TGGAGACCCCATGG---TGACCTTC----------------------------------     
18 Ursus_americanus-NW_025577642.1-202646_203314        92.2%  45.4%    --------CTGTCT----------CCCCAGTTC------TGTGCTCCGGGCCTGGGCGGGGCCAGCGAGTGGTGGGCTGCCAGGTGTGCATGGGGGGCCCGCGTGGTCCTGCCACTGACAGTCTCTCTCCTGCCACCTCCACGGCCC-GAGGTGCTGCCGGGCACAGCG-CCACAG---------G--CCGCTCGGCTCTT--GCCCACCG----TCAAGCCGTCTGTCTGT--CCTGCGTCTGCCTGTCTCCGCGGGCT-CTGCGCCCAGCTGTCGGTGTCTCACGGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTGGGCTTCCCCATG--TCCAAAGTCTACTTTTAGAAGGACAGTCCCGTTAGGAGCTCGAAGGTACCCCAGCGCCAGGGCGGCAGAGCCCGCCCGCCCCC-----CACCTGCATGCTCAGGCCGTCCCATTAGCATCCGTGATTCCTGGTAGCATTTTG-GAGACTGTCAGCTCATGTGACATGGATCGTGACGTGGTTCTGGGGTCCCTGGGGCCATGTTCAGCCGCAGGGCAGCATTTATGAGGCAGGTCCAGGACTCTGGCGAGGCCTCCTGTGCGTGGACCCCTCCTGGCCTTCCGTCCCTCCTCTGTCCTCTGTC--------TGACGCCT-------CGTGC-----CCCTGCCCACC--------CTGC---CCCTCTG-TGTCTGGTCCTCTAGCTTGGAGTGCCCCTGGCATCCC----GG----C------ACCC-GTCCCCCTCCCTGCCCTCACCCTTC---CTCCCGGCCACCTC------CACCGC--CCCCCCCGGT--GTGCTCCCTGGCTCTGT-GTGCGCCCAGGATGCCTGCTGTGGTGTGGGGAGGCCCCAGGGACCAGGAGCTCTGAGCTTGAATCCTGGACCTTCTTCTAAATGACTTTGCAGCCAACTTTGACCAAATTGCTCTGGATTTGGGATCTTGAATCGGGAAGCCGATTCAAGTGCTGGCCACGTGAACATCTCTGCCCAGAAGTGCCCCCGAGTCCCCGGGGAGTTGTGGCTGT-TGTTGGGGCCTCTGCATGTGAGGACCCTTCTGGCCCCTGCACTCTGGAG------------------ACGCA-----------------------------GC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
19 Heterocephalus_glaber-NW_004624818.1-189603_190026   82.2%  39.2%    --------CAGCCCCCAC--ACATTTGCCACGG------GCCAGGCCAGGGCAGGGGTCTCAGGCCGTGAGCCCAGCT---G--C-TCTTCCAAG-TGGGGGGCTGGGCCCTGGTG----ACCTCTCTCCTGCAGTGCCCTCAGGGCCAGAGGCTCTGCAGGGTCCTGCTCTCTGCTGC-----CATCTGTCT------GTCCGTCCATCT-------------GTCATGTCCGCCT---GTCTACATGGCCGCGGC-CCCTCCCCAGCCGTCTGGGCCACTCACCGGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTGGGCTTCTGTATG--TGCAAAGTCTACTTTTAGAAGCGCAGCCTTGTTAGGAACCTCGAAGGTACCCG-GGCGCCACA-GGCCTGTGCA--GCCCGCG-C-----CCTGCATGCCAGGTCACGCTCATTAGCATCCGTGACTCCTGGTAGCATTTTG-GAGACTGTCAGTTCATTTGATATGGGCCATGACATGG-TTCCGGGTCCCCTGGGCCATCTTCAGCCACAGTG--GCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTCCGCCGAGGCCACTGCCCCTCCCTGCTCTTCGTGTGCCCCGGGCGT-----CTGCTTC-------------------------------------------------------------------------------TTT----GGTGTGGGCTCTGCCCCAGTG---CCGTCCTTCC--C-GGGA-CC-------------CTTCCTCCCTT--CCCTCTGTGTCCCGTGCTGTCATTTCTCAGCCCCCTTCCATTCCCTCCTCAC--TCTCCCA-------------GGGCCTGGGGTGGGGGACGCCACGCGGCCTGGTACTCCAAGCCTGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCGTTCCAGCCAACGTTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGACGCTGATTCAAGTGCTGGCCATGTTATCACCTCTGCCAGAAGGGCCCCCGCCCACGGGGCCCTGGGCTGCTCTGTA------------CCAAGCGGAGC----TCGTCCGGGGGAGCGG-TGGG----TGCTGTGGGGTCTCCGGGGGCCTCAGGGGTGTCTGGCATGTGAGAATCTC---TG---C-TCTACACTTGTGAGATGCAGCTGCCCG-TGCTCTCCAG------------------CAGGGAGCCCGGAG---GG----------------------------------------     
20 Octodon_degus-NW_004524689.1-189338_189629           84.5%  41.0%    ----------------------------------------------CAGGGCAGGGGTCTCAGCCTATGAGCC-AGCA---G-CT-CTTCCAAGT-GGGTGGCTTGGGCCCCGCTG----GCCTCTCTCCTGCTGTGCCCGTGGGCCTAGAGGCTCTGCAGTGTCCTGCTCTCTGCTGC-----CGCTGCCGTCCGTCCGTCCGTCCGTCCGTCCACCCTTCCATCTGTGTTCACCTGT-CTCCAGGGGCCGTGGGCCCCCTCCCCAGCCTCTGGGGCTGCTCACCGGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTGGGCTTCTGTATG--TCCAAAGTCTACTTTAGGAAGCGCAGCCCTGTTAGGAATCATGAAGGTACCCG-GGCGCCACG-GGCCTGTGCA--GCCCGTGCC-----CCTGCATGCCAGGTCGCACTCATTAGCATCCGTGACTCCTGGTAGCATTTTG-GAGGTGT-CAGTTCATTTGACATGGGTCATGACGTGGTTCTGGGGTGCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGTG--GCATTTATGAGGCCGATCCAGGATTCAGCCGAGGCCACTGCCTCCTGCGCACCATCCTGTGCCCGTCTTCTGC---CCTTGGACAT----CCGCTT-------------------------------------------------------T----------TCT----GGCATGAGCTTTGCCCCTGCT---T----CCTGT--C-CCGC-CT-------------CCTATGTCCCTCCTCTCTATGCCCCCATGCTGTTATTTCTCAGCCTGCTTCCATTTCCCCCC--G--TCTGTCG-------------GGGCCTGGGCTGGGGGACACCATGGGGCCTGGCACTCCAAGCCTGAATCCTGGACCTCCTTCTAAATGATGTTCCAGCCCACGTCGACCAAATTGCACTGAATTTGGGATCTTGAATCAGGACACTGATTCAAGTGCTGGCCACGTTAGGGCCCTGCCAGAAGG-G-CCCCATGTGCCAGGCCCTGGGCTGCTCTGTA------------CCAAGTGCAGCCCGTCCGTCCTGGGGAGTAG-TGGG----TGTTGCAGGGTCTCTGTGGGGTACCGGGGTGCCTGGCATGTGAGGGCCTC---TG---C-TCTGTCCTCGGGTGATGCAGCTGCCTG-GGGCTTCCCA------------------GAAGGGACCCTGG----------------------------------------------     
21 Dipodomys_spectabilis-NW_024870976.1-186393_186686   83.7%  42.3%    -----------------------TCCCCGCCCC------CTTTCTACGTGTCTGGC----ACCCCTCTGGGCCCAG----GCCGGCTGGCACTCG-GTTCTGCCTGGCCTGCCACTGACTTTCTCTCTTTTGCTGCGCCCGGGGGCCCGGAGGCTCTGTAGGTGTCTCCGGT----------------CCTCTGCTACCGTC----CTTCT----GTGTGTCACGTGTCTG---CCTGTCACCCGGGGCCGGTGGG---TCCCTCCCTGGCCAGCACCGCCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTGGGCTTCTCTATG--TCCCAAGTCTACCTTTAGAAGCACAGCCTTGTTAGGCATCTCGAAGGTACCGGGTGCCTCGGG-ACGGTGGAGCCCGGTGGTGCCTCACCTGCATGCCAGGCTGCGCCCCCATTAGCATCTGTGATTCCTGGTAGCATCTTG-GAGATTGTCAGCTCATGGGACATGGGTCATGACAGGGCGCCGGGGTCTCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTTCGCCAGGGCCAGGGCCCTTCCTGCTTCCGGCCAACCTCCCTCCACACCAGGCCTGCCCGT----CCTCTG------------------------------------------------------------CCCTCTTCTCCGAGTGCTGCTCTCTGGGGGCGCC---GTGGGCCGCCTGC-CCCT-CC-------------GCCTCCTGCTCCCCAGTCTGCTCCTCCTGCTGTTG-------------------TTTCTCTTCAGTCGACACCGGGGT------------------TCCCAACGGGGCGTCCCCGCCGCCACTCCAAACCTGAATCCTGGATCTCCCTCTAAATGGCTTTC-CAGCCACCGTGACCAAATTGCACTGGATTTG-GATCTTGAATCGGGAAGCTGATTCAAGTGCTAGCCACATGATCACCTCCCCCAGAGGGCTCACGCCTGCTGGGCGCTGGGTTCGGGGCTGG------------TGGCACCGGCACAGCCCATCTCGGGGGCGTGGTTGGTGCGT-------GGGGTCTCTGGGG--CACGGGTATGTGGCATGTGATGAGGGTTGTTCTGGTCATGGCCCCCTCCAGCGGTACCCTGGGCAGGGGTCT-CC------------------AGCCCA-----------------------------------------------------     
22 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-188926_189205      81.2%  40.9%    ---------------------------AAGAGCCAGTGCCCCGGGTCTGAGCTGGGGCCCGGTGCCCTCAGGGACTGTAAACGCA-TAGCTCAAGGCCCACCTGGGGCCTAAGACTGACCATCTCTCTCCTGCCACACATGCGGGCTCAGAGGTGCAGGCCGGACCAG--------------------GCGCTGCAGGCATCCGTCTCCCC----AGTGT----CCTTCTG---------TCTGTCCGTCTG-CCCGCCTGTCTCCGTGCCCCGTGGTCTTGCCACCTCACCGTCCCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTGGGCTTCTCT-GT--GTCCCAGTCTGCCTTTAGAAGCACAGCCTTGTTAGGAGCCTTACAGGTACCCCGGCGCCGGGGGC-AGTGTAGCCCGGCGTTCCA---CCTGC-ATGCCAGGCCGCACCCCATTAGCACCTGTGATTCCTGGTAGTATTCTG-GAGACTGTCTGCTCATGTCACATGGATCATGACATGGTTCCGGGGACCCCTGGGCCATCATCAGTGGGCAG-TGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTCAACAGGCTGCTGCCAGCGCTGCCTGAGCCTCCACACCCCACCAGGGC---------------------CT-------------------------------------------------------C---------TTCCTCCTGCTGCGAGCTCTTGAGCCCCTGCTGAGCCCCGCT----GTGC-C--------------------------------------CCCATGTGCCATTTCTTAGCCCCCCTCATGTGACCCCTT---------TCCCCATGCCAGCCACACCCAAGGCTTGGGTGGGTTGTCCCTGGTGGAGCTCCCAGCCTGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCTTCCCAGCCTACTTTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGAAAGCTGATTCAAGTGTTAGCCAGTTTGATGCCTCTGCCCGGAAGTGCCCCTGCCAGGGGTGACCGCTCTGTGCATAA--------------------GCACGGCTCGTCATGGGGGAGCAGTGG--GTTG---------GGGTCTTGGGGCACGCGGCTGTCTGGCATGTGAGGCTCCT---TCTGACCTCTGCACACTTGAGATGCAGCTGCCGGGCCTCTCTGGTGGTAACCCTGACTTGCTCGCTGGTCCTGGCT--------GCTCTCA-------------------------------     
23 Cavia_porcellus-NT_176233.1-189269_189536            82.8%  40.1%    -------------------------------------------CGCCAGGGCTGGGGTCTCAGCCTGGGAGCCTGAGT---GGCT-ATTCTAGGC-GGGATGTCTGGGCCCTGCTG----ACCTCTCTTCTGCTGTGCCCGCGGGCCCGGAGGCTCTGCAGGGTCTTGCTCTCTGCTGC-----CGTCCGTCC------GTCCATCTGTCCATCTGTCCATCT-GTCGTGTCCGCCTGTTTCCATGGGCCACAGGCCCCCCTCCCTGGCCTCTGGGGCCACTCACCGGCCTTTGCTCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTGGGCTTCTGTATG--TCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCTCAGCCTTGTTAGGAATCTCGAAGGTACCCG-GGCGCCTCG-GGCCAGTGCA--GCCGGCGCC-----CCTGCATGCCAGGCCCCACTCATTAGCATCTGTGACTCCTGGTAGCATTTTG-GAGACCGTCAGTTCATTTGACATGGGTCATGACGTGGTTCCGGGGTCCCCTGGGCCATTCTCAGCCAGAGTG--ACATTTATGAGGCAGATCCAGGATTTAGCCGAGGCCACTGCCTCCTCCCAAGGTCCCTCGTCCATCTCCTCCTTGCCCTCAGGCGT----CTGCTT-------------------------------------------------------C----------TCC----GGTGTGAGCTCTGCCCCTGCC-------CCTTCC--C-CTTC-CC-------------CTTCCTCCCTTCCCTCTGTGTCCCCCGAGCTGTCATTTCTCAGCCCTCTTCCATTCCCTTGTTAG--TCTGCCA-------------GTGCTT---GGGCGGGACGACATGGGGCCTGGCCCGCCAAGCCTGAATCCTGGATCTCCTTCTAAATGGCATCCCAGCCTACATTGACCAAATTGCACTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGGTGCTGATTCAAGTGCTGACCATGTTACTGCCTCTGCCAGAAGGGCCCTGGTCCTGTACTTGG--------------------------T----ACAGAGCAGCCCGTCCTGGGGAGTGG-TGGG----TGCTGTGGGGTCTCTGTGGGATGCAGGGGTGCCTGGCATGTGAGGACCGC---TG---C-TCTGCACTTGTGAGCTGCAGCTGCCCT-GTGCTCTCCA------------------GCAGGGACCCCGGC---GGGGACTGCAGGA-----------------------------     
24 Equus_przewalskii-NW_007674960.1-205458_205892       81.8%  37.8%    -----CTCTACTGT----------CCCAGCCTG------CAGAGCCCAGGGCCCAGGCAGGCCGGCCCACGGCGGTCAGTCAGGCACACACGAGGGGCCTGCGAGGTCCCAGCACTAACCATCTCTCTCCTGCCACGCTCTACGGGCCTGAGGTGCGGGCCAGATACAG----------------------------CTCTCCGCCTCCCG----TCTGTCTGT--CTGTCT--GTTGTGTCTGCCTGTCTCCGCGGGCTCCGCGCCCCCGCCGTCCATGTCTCACGGTCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGT-GTCTTCTCTATG--TCCAAAGTCTACTTTTAGAAGCACAGCCCTGTTAGGGGCTCGAAGGTACCCCAGCGCGGGGCGGTACT-------GCCCGCCC-----CACCTGCATGCTCAGGCCGCCCCGTTAGCGTCCGTGAATCCCGGTAGCATTTTG-GAGACTGTCAGCTCATGTGACATGGGTGGTGATGGGGCTCCTGGGTCCCTCGGGCCATCCTCAGCCACAGAGCAGCATTTACGAAGCAGATCCAGGACTTCACCAGCTGCCTGGGCCCGGCCCCCCGCAGGGTCCGGT-------------------------------------------------------------------------------------------------CCTCTAGCTGAGAGCTCCCGGGGCCCTGG----CC----C------CCTG-CCTGCCCTCCCTCCCTCC---------------------TCA------CCCTGC--CCCCCATATA--TTCCTCTGACTCTGTCTGTGCCCACGGATGTCGAGGGTCGGGGGTGGGGAGGTCCCAGTGACCAGGAGCTCCGAGCTTGAATCCTGGACCTTCTTCTAAATGACTTTCCAGCCA-ATTGGACCAAATTGTTCTGGATTTGGGGTCTTGAATCAGGAAGCTGATTCAAGTGCTGGCCACTTTAATGCCTCTGCCCGGAAGTGCCCCAGTGCCATTGGGGAGCAGTAGCTGT-TATCAGGGTCTCTGCATGTGAGGACCTCTCTGGCCTCCGAACACTGAAG------------------ATGCAGCTGCCGGCCTCTCCAGCATTGACCCAGGCA---CTTGCCAGCCAGTCCCGGGGACCCCAGCTGCCCT---CCTCAGAC------------------AGGGAGGCTGCAGGGAGAGGTCCTGTAGGACAG--------------------------     
25 Bubalus_bubalis-NC_059161.1-190918_191222            86.2%  40.0%    -------------------------------------------GTCCGGGGCC-CAGCGGGGCTGTAGGAGGTGGTCTGTCAGGCACACACGGGGGTCCGCGCATCTCCCGGCACTAACCGTCTCTCTCCTGCCTCGCTCCTTGGCCCCGGGTGCTGCCGGCGGGGGCCCCCACTG---------G--CCTCCCAGCTCCATCGTGCGTCC----GTGGTCACCCTGTCTGT--CCTGTGTCTCCGTCTCCTCGC------TGCACGCCTGCTGTCGGTGT-CTCACGGCCTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGC--AGTGGGCTTCTGTGTG--TCCAAAGTCTACTTTTAGAAGCACAGCTCTGTTAGGAGCTCGAAGGTACCCCAGCGTGGGGGCGGCGTGGCCTG-CCCGCCCC-----CACCTGCATGCTCAGGCCACCCCATTAGCATCTGTGATTCCTGGTAGCATTTTG-CAGACCGTCAGCTCATGTGATGTGGGTCGGGATGTGGTTCCGGGTCCCCT-GGGCCATCCTCAGGCACAGAGCAGCATTTACGAGGCAGGTCCAGGACTTCAGCCAGGCCTCCCTTGTGTCTGCCCCGGGGTCCGGCCCGTCTCTTCCTGCCCCTCCCTA--------GGTCCTCT-------AG--C-----TGCCGGCCCT-------------------CCTG-GCGCCTGTGCTCTT------------------------------------------CC-CTCCCCCTCCTTCTGTGTGCACCGC---CCCCCGAA---TGC------CTGCG----TGCCCCTCT--AATCTCTCTGTGCCTCGATGCCCCGTGCTGGGGGCGGGGAGGAAGGGAGAGGCCCCAGGGACCAGGAGCTCTGAGCTTGAATTCTGGACCTTCCTCTAAATGACTTTCTCGCTGACTCTGACCAAATTGCTCTGGATTTGGGATCTTGAATCAGGCAGCTGATTCAAGTGCTGGCCACTAACACCTCCACCCTGAAGGCCCCGTG------TCATGGGCACCGTGACTGT-TTGCAGGGTCTCTGCATGCGAGGACCCAGTAGGCCTGTCTGGTGTTGAC------------------TGAGA-----------------------------CA---CTTGCCAGCTGGTCCTGGGGACCCTGGCTGCCCT---CCCCGGGT------------------AGGGAGGCTACGGGGAGAGGCCTTGCAGGGA----------------------------     
   clustal                                                                                                                                                                                                 .                 ..                                                                                                                                                 **** **** * **** *  :*                  *.    **.*  *:.**.*  *      * ****       ..* :.*.                                                           *.*****. * .**. :*  .**** *    *  .        * **:*   * .***.  . *. . .      *     *  *  ****   ***  .       .**** *  .   .  :          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ..   **** * * * ** *  * ..***.       .         * *.**      *. ***** ..*********.*.   * ********                             .