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 1 Target                                              100.0% 100.0%    --------------------------------------------------GGGGAGGGGCCACACCAGCCCCTTGTCC-------CATGCCCCCCCATGTGTCCCCAGTGCTGGGTCCTGAACTCAGGCAGTGAGGCCTAGG-GTCCCCTCCCCGGGCCTCTGCTCCTCTATCTCAA-GAGGGGCTGCTGTGGGGGCCTGGCTCCTGAGCCACCA-------------GTGCCCA---CCTCTG--ATCTCAGGGCTGGCTTTGGGCATCTCGGGCAG-----GACAGGTCCTGAGTGC-TCCGGGCCTTGC----CCCGCCCTGTGTCA-------------------CCCATGCCTGTCTCAGACTCTTG---GGGGCCTTGCAGC-CTCCACCCCTACAGTGCTGCCATCTGGCTTCTCAGCAGGGACCGAGTGATGCCCCTCTCCCCTCTACTACCCCCCACCCCTCTACTTCCTGGTGTCACGTGGAAGGCAGCTGCCCGGGTTTGCCTGTGACTCCACACCCAGCATGTCTGTCCCCTGCC---------CCAGGTCAGGGTGGGG---------------CCTCGGCTTCCGCAGGAAGTGGTCTTGGTGCCAGCCC-----------------TGCTGCCCTGGCTTTGAGCTGGGGCCCAGTGCCCTCTGGGTCCTGCTGGC------TGCAGCT--GGCCCTCGGGGAA-CCCGCACACACAGCAGGAGGGGCCTGCC------CAGGCCCAGTGCTGACTCTCTCCTGCCATGCTCTCGGGCCCAGAGGTGCCATCCAGCCCCTGCCGTCTATCCACCCATCTGTTCCTCGTCCCCCAGGCTGCAGGGCTCCCCACG------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCACTGCTGTGGCCGCCTCACCTGCTCCCCCTGTCTCTTTGGTCTTGCAGTCGGCTTCTCTATGGCCA--CAGCCTACTTTTAGAAGTGCAGCTCTGTTAGGAGCCTTGAAGGTACCCGGTGCGCGGGACAGTGCGGCCCGCCGC------CCCTGCATGCCCA--GGCCGCACCCCATTAGCATCCATGATTCCTGGTAGCATTTGGAG---ACTGTCGCTCATGTGACGTGGATCATGACATGGCTCCGGGGGCCCTGGCC--ATCCCCAGCCA--TAGTGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGGTTCAGCTGG------------------------     
 2 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-204688_205620     93.3%  70.1%    ------------------------TGTCAGCCCTGGCCACTGGCCATCGTGGGGACAGGCT--GTATCAGCCCTTGTC-------TCATAACCCCCATGTGTCCCCAGGGCTGGCTCCTGAGCTGAGGCAGTGAGGCCTAGG-GTCCCTTCCCCAGGCCTCTGCTTCTCTCACCTGC-AAGAGGGGG---------------TGCTGGGGGGCCA-------------GTGCTCA---CCTCTG--ACCCCAGGGCCGGTTGTGGGAGTCTTGGGTAA-----CGCGGAGCCCCAGTGC-CCTGTGCCTTGC----TCTGCCCTGTACCA-------------------CCACCGCCTGTCTCAGACTCTCG---TGGGGGCCTCACAGGCCTCACCCCACAGTGTGGCCACCTGGCTTCTCAGCATGGACCGAGCGGTGGCCTTCCCCTCGCT---CACCCCCATCCCCCTACTTCTTGGCGTCACGTGGAAGGCAGCTGCCCGT----------GACTCCACACCCAGCGTGTGTGTCCCCCGGC---------CTC--------------------------------AGCTTCTGCAGGAGGGGGTCGCGGTGCCGGTCCTGCTGCCCTGCAGAGCTGGCAGCCCTGACTCTCAGCTGGGGCCCAATGCTCTCTGGGTCCC------------------------GCAGGCTATA-GCTGCACACACAGCACGAGGGGCCTGCC------CAGGCCCAACCCTGACTCTCTCCTGCCATGCTCTCAGGCCCAGAGGTGCCGTCCAGCCCCCTCCGTCTCCCAC-CCATCCACTCCTCGTCCCCCAGGCCTCGGGGCTCCCCACA------------------------------------------------------------------------------------------------------------CGGCTGCCGTGGCCGCCTCACC-CACCCCTCTGTCTCTTTGGTCTTGCAGTCGGCTTCTCTATGGCCA--CAGTCTACTTTTAGAAGCGCAGCTCCGTTAGGAGCCTTGAAGGTACCCGGCGCGCGGGACAGTGCCACCCGCCGC------CCCTGCATGCCAG--G--CCATGCCCATTAGCATCCGTGACTCCTAGTGGCATCTGGAG---ACTGTCGCTCATATGACATGGATCATGACATGGTTCCGGGGGCCCTGGCC--ATTCCCAGCCG--GAGCGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGGTTCAGCTGGGCGGCCACCTTCTCCTGGCCTCCC     
 3 Macaca_fascicularis-NC_052255.1-225153_225834        86.4%  74.1%    -----------------------------------------AGCCATCGTGGGAAGGGGCCGCACCAGCCCCTTGTCC-------TATGCACCCCCATGTGTCCCCAGGGCTGGGTCCTGAACTCAGGCAGTGAGGCCTAGG-GTCCCCTCCCCGGGCCTCTGCTCCTCTACCTGCAAGAGGGGGTGCTGTGGGGGTCTGGCTCCTGAGCCACCA-------------GTGCCCA---CCTCTG--ACCCCAGGGCTGGCTGTGGGCATCTCCGGCAG-----GGCGGGTCCCAAGTGC-TCTGGGCCTTGC----CCCGCCGGCCT--------------------------------------------------------CGCAGGCTCCACCCCCACAGTGCTGCCATCTGGCTTCTCAGCAGGGACTGAGTGGTGCCCCC-TCCCCTCTCTCACCCCCTACCCCTCTACTTCCTGCTGTCACATGGAAGGCAGCTGCCCCGGTTTGCCTGTCACTCCACACCCAGCATGTCTGTCCCCTGCC---------CCAGGTCAGAGTGGGG---------------ACTCGGCTTCCGCAGGAAGGGGTGCTGGTGCCGGCCCTGCTGCCCTGCAGAGCCGGATGCCCTGGTTCTCAGCCGAGGCCCAGTGCCCCCTGGGTCCTGCTGGT------TGCAGTT--GGCCCTTGGAGGACCCTGCTCACACAGCACGAGGGGCCTGCC------CAAGCCCAGTGCTGACT--CTCCTGCCGTGCTCTTGGGCCCAGAAGTGCCATCCGGCCTCTGCCGTCTATACACCCATCTGTTCCTCGTCCCCCAGGCCGCAGGGCTCCCCCAGGCCGCAGGGCTCCCCAGGCCGCAGGGCTCCCCAGGCCGCAGGGCTCCCCC-AGGCCGCAGGGCTCCCCAAGGCCGCAGGGCT--CCCCAGGCCGCAGGGCTCCCCATGCCGCTGCTGTGGCTGCCTCACCT-GCTCCCTCTTCTCTTTGGTCTTGCAGTCGGCTTCTCTATGGCCTCAGTCTCTACCTTTAGAAGCCCAGCTCTGTTAGGAGCCTTGAAGGTACCCGGTGCGCGGGACAGTGCGGCCCGCCAC------CCCTGCATGCCCA--GGCCATGCCCCATTAGCATCCGTGATTCCTGGTAGCATTTGGGG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 4 Urocitellus_parryii-NW_020540697.1-295733_296184     84.7%  37.0%    --------------------------------------------GGCCAG-----GGGAGGGCTGCTCCCGCTCCTTACCCACCCCCACCCCG--------------------------------------------------GCTGTGTCCCTGGGC-TGCTCCTCACCCTTGGC--ATTGTGGCCTGGAGACCAGCT-----------CTCTG-------------GTCCCC----TCTACCTGTGACGTGGGGAG--TTGGGGGATGCAACCCCAGAGCCTTCTAGTGCTGAGCCCAGGTCTCAAAGGG-----GATCTGGGCAGCCCAGGGC---AGGTGTGAGCGAAATGTCCTTGTCCCAAGAAGGGAGCCCCTGGGCCCCTCCCTGCCCTCCTGTGTTGCCAGTGCCA-GGC-----CAGCCTCAGT----CTCCCTGGTG-GCCTTGC-CAGGGGTGCCCGGCTGTCTTCTCAGGAGAGGTGAGAAGAACTCACAGCCCTT--CCTGTGGCTCTC------------------CCTCCCT--GTCCYGCCGGCCCAGGGCAGGGTCT-----------GCCTGGACTTGCCCATTACCTGGCC---------CCCAGC-AC-A-----------TTTGCCCCTGCCCAGACTAGGGCAGGACGRGGGTCTCAGCTTTTGGAGCTG-----GCTACTCTGGTTCGGAGTGG------GCCTGGCATCCTTAGGGTGCTGCCCAGGGCAG-CTGGTGCCTGGGTCTGTGACACACAGC-----------ACAGGGTCCTGCCCAGGGCC-AGCACTGACCTTCTCTCCTGCCATG--TCTGCGGGCCCAGAGGCTCTG-CCGGCTCCGGCACTCCTGTGCC-------------------ACTGTCTGTCCG-------TC--------TGTCACGTGTCTGCT-GTCTCTGCGGCCCTGGGTCCCCTCCCCACACAGTCGGGGCCTCGCCACCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTACAG--TGGGCTTCTCTGTGTCCAAAGTCTACTTTTAGACGTGCAGCCTTGTTAGGAGTCACCAGGTACCCTGCGC-GGCGGGAC--AGTGTAGCCCGCCGCCCACCTGCATGCCAGG----CCG-CACCCATTAGCATCCATGATTCCTGGTAGCATTTTGGA-GACTGTCCGTTCATGTGACATGGGTCATGACATGGTTCCGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGCAGCATTTACGAGGCAGATCCAGG----------------------------------     
 5 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-257326_257895  84.6%  39.6%    -------------------------------------------------------TGGGTCCTCGCCCAGCCCAGCCC-CCA---ACAGTGTCCCAAAGGCCA----------GCTCCTGAACCCCAGCAGTGGTGCCTACTGGTCACCTCCCTGGGCCTCTGTTCCTCCACCTAC--CCTGAGCCTGC-----------------------------------G---GTGCGGACCTCCA-----GTCGAGGGCAAGGCATGGGGC----------------CCAAGTGCCCCTGCCCCAGGGAGGAGTGCCCCTGGTTGTCCCTACTCCCTCGGTGGCCCTCCCCAAGCCCCACCTGG--CTTCTCAGCA---GGAAAGGAGCATGGTGGCCCTTCCTGGGCGCCCACAGCTGGTCTCT-------CTCCCTCTCCTGA-------------G----TGGCCCCTGCTCTGGCTACTTCCCAGAATTATCCGGAAGGTGCCACCTGG--GTTCGCCC----TATTACCC--GCCCCCCCAACA-----CGTTTGCCTTGCCCAG-------------------------------GCCAAGGCAAGACAGCTGGC--------------------------ATCCGCAGGACAGGGGTCTTGGCTCTGA-CCTTTCCATTCTGCAGAGCCC----AGCCGCCCCAGTTCTGAGCTG-----GACCCAGTGCCCTTAGGGTCCTGCCAGGTGCAGCCCGAACTCGGGGGTCTGTGATCGCATAGCAC-------GTGGGTCCTGCCCAGGGCCC-CACGCTAACCGTCTCTCTCCTGCTGCGCTTGTGGGCCCAGAGGTGCCA-GCCCAACCCAGCCTC-TGCAGG-------------CACCCGGCTCTCTGTCTGCTGTCCGTCTGTCTGTCCTGTGCCCGCCTGTCTCCACGGGCCGCGGGGCGCCCCCCCGGCTGTCGTTGCCGCCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTCGGTCTTACAG--TGGGCTTCTCTATGTCCAAAGTCTACTGTTAGAAGCACAGCCTTGGTAGGAGCCTCCAAGGTACCCCGGCGCCGGGACAGTGTGGCCCGCCGCTC--CCACCTGCATGCCCA--AGCCGCACCCCATTAGCATCTGTGGCTCCCAGTAGCATTTTGGA-GACTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGCCATGGCTCCGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGACAGCAGCATTTACCAT---------------------------------------------     
 6 Marmota_monax-NW_025724459.1-189095_189537           81.2%  34.8%    --GAGGCCTCCATCTTTGTGCACGTGGCTGTCAGTGACATCAGTGGTAAGGTGAGTGTGGCCTGGCGGGAAGGGCTGTGGCCAGGGGAGGGCT--------------------------------------------------GCTCCCGCTCCTTAC-CCACCCCCACCCTCGGC--ATTGTGGCCTGGAGACCAACT-----------CTCTG-------------GTCCCC----TCTACCTGTGACATGGGGTG--TTGGGGGATGCCACCCCAGAGCCTCCCAGTACTGGGCCCAGGTCTCAAAGGG-----GATCTGGGCAGCCCAGGGC---AGGTGTGAGCTAAAGGTCCTTGACCCAAGAAGGGAGCCCCTGTGTCCCCCCCTGCCCTCCTGTGTTGCCAGTGCCA-GGC-----TAGCCTCCGT----CTCCCTGGTG-GCCTTGC-CAGGGGTGCCTGGCTGCCTTCTCATGAAGGGTGAGAAGAACTTACCGCCCTT--CCTGGGGCTCTC------------------CCTCCCT--CTCCCGCCGGCCCAGGGCAGGATCT-----------GCCTGGACTTGCCCATTACCTGGCC---------CCCAGC-AC-A-----------TTTGCCCCTGCCCAGACTAGGGCAGGATGGGGGTCTCAGCTTTTGGAGCCT----GGCTACTCTGGTTCTGAGTGG------GCCTGGCATCCT------------------------------------------------------------TAGGGTCCTGCCCAGGACC-AGCACTGACCTTCTCTCCTGCCATG--TCTGCGGGCCCAGAGGCTCTG-CCGGCTCCAGCACTCTTGTGCC-------------------ACTGTCTGTCCG-------TC--------TGTCACGTGTCTGCT-GTCTCTGCGGCCCTGGGTCCCCTCCCCACACAGTCGGGGCCTCGCCACCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTACAG--TGGGCTTCTCTGTGTCCAAAGTCTACTTTTAGACGTGCGGCCTTGTTAGGAGTCACAAGGTACCCTGCTGCTGCGGGAC--AGTGTAGCCCGCCGCCCACCTGCATGCCAGG----CCGCATCCCATTAGCATCCATGGTTCCTGGTAGCATTTTGGA-GACTGTCCGTTCATGTGACATGGGTCATGACATGGTTCCGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGACAGCGGCATTTACGAGGCAGATCCAG-----------------------------------     
 7 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-206454_206782        81.1%  36.9%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGGGCCTCCTGCTCTTGCCTCTCGCCCCACGTTCCCAGCAGTG------TCCCCAGAGCCAACTCCTGACCCCGCAGTGAAGCCTAGCAGTTACTTCTCTGGACTTTCCCCCTGGTACAGGGG--CTGTTGGGGGACACCTGACCC---TGAGTAGGAACCCTAGGGCAGGGTGTAGGGC----CCAAGTGTCTCCCCCCTAGG---------------AAGGGGTGC------CCTGGG---CGTCCCTCGCAGTGTATGTTTCCCTCGGTGGCCTCCCAGGCCCT------------------------------------------------GCCCTGGCTCCTCAGCAGGGATGGAACACAGC--AGGCTTCC--TGGTGCTGACCATCCCCCCTC--C--CTCTCCTTCCGCTTCCCAGGATCGCAGGAGATGGCTGCCCGGGTCAGCCCCATTTCTTTCCCCAGCACATTAGCCTCCTG-CCCCCGGC-CAGGCTAGAACGGGGGTGCCTCTGCAGGATGCTCTTGGCTCTGA-CTTTCCCAGGCTGCAGAGCCT----TTCAAAC---CTTCTGGGT----------CTGGGCCCAGTTGTGT----GCTGGGGTCTAGCACCCTTCGGTGA------------GGTTG---GCACTGGGGTCCTGTCCAGAGCCC-AATACTAACAATTTCTCTCCTGCTGCACTTGTGGGCCCGGAGATGCCC-ACCGGACGCGAGCTCCGCAGCATCCAGCTCTCCGCCTGCCGTCCATCTGTCTGTCGTGTGTC----TGCCTGTCTCCGC-------GGGCCCACAGGGCTCCCCAACCCTGGCCGCCATTGCCTCCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGCAGTGTGGGCTTCTCTATGTCCAAAGTCTACTTTTAGAAGCACAGCCTTGTTAGGAGCCTTGAAGGTACCCCACTGCCACGGGACGGTGTAGCCCGCCGCCCCCACTTGCATGCTCAGGCCGCACCCCACATTAGCATCCGTGACTCCTGGTAGCATCTTGGA-GACTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACGTGGTTCCGGGATCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGGGAGTGGCATTTAGGAGGCAGATCCAGG----------------------------------     
 8 Mus_caroli-NC_034573.1-190792_191086                 84.5%  31.6%    ------------------------------------------------------------------NNNNNNNNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------------------N------------NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNGGATGCCCTGGTACC-----TGTCTCCCTGCTGTCCTGGGATGGGATGC----CCTGGTACCTGTCTCC-------------CTGTCCTCTGTCTGT---------------------TACCAGTCCTAGTTTTCCTCAGTAGCCTCTGATGTCCT---------GTACATCTAGGA-------------------GCACTGACTGCTTGGATTCTTGGCAAGGGTA-GAGCGCCATGACCCCTCC--CGTGGCTTTCCTTGTCCTGAGTGACACATCCCTCTG---CATTTCTGTTTCCTCAAAGGGATCTACA-------TACATTTATTTGCCCACTACCTGGAACCTCAGGTCCCTATC-CCATG----------TACCCC-CGCCCCAGGCCAGAACAGAAAG-TGTTCTCAGTCTGTGGAGTCT----AGCTGCTAGAGCTCTAAGGG-------------AGGCCCTGGGGTACAACTTGGTGCAACCAACCCTTCGGGGCCTGTAACCACACAGTGA-------GTGGGTCCTGCTGGGCC--C-A------GCACCAACTCTCTGGTAGCATTA-TGGGTCCAGAGGTACTA-AAAGTGTCCCCTTACTTGCCAC-------------TACCCATCCATCTATCCTGTGTCTGCC--------TCTCTCTGAGGGCCATCCCTGGCTGGGTAGGCCCTGCTCTGGCCACCACGGCCACCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGCAG--TGGGCTTCTCTATGTCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCTCAGCCTTGTTAGGAGTCTCAAAGGTACCCGGCGCCGCGGGAC--GGTGTAGCCCGCCGCCCCACCTGCATGCCAG----GCCGCGCCCATTAGCATCCGTGATACTTGGTAGCATTTTGGAGA-CTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACACGTTTCTGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTCA-----------------------------     
 9 Mus_musculus-NC_000070.7-191136_191430               84.5%  36.0%    ---------------------------------------------------------------------AC--TTCTC-------TGGGTCCCTTCCTTAGTTTGTGA-----TGTGGGGTACTGGGGGATGCTGACCCTGGAG------------------------C------------CTTCTAGTGCTATC--TCCATGTCCCAGGGGGGCTTCGGGAATC---CAAGTGTGCTAAGTGTCCCCGTCCT----GGGATGGGACGCCCTGGCCAC-----TGTCTCCCTGCTGTCCTGGGATGGGGTGC----CCTGGTACCTGCCTCC-------------CTGTCCTCTGTCTGT---------------------TACCAGTCCTAGTTTCCCTCAGTAGCCTCTGATGTCCT---------GTACATCTGGGG-------------------ACGCTGACTGCTTGGATTCTTGGCAAGGGTA-GAGCGCCATGACCCCTCC--CGTGGCTTTCCTTGTCCTGAGTGACACATCCCTCTG---CATTTCTGTTTCCTCAAAGGGATCTACA-------TACATTTATTTGCCCACTATCTGGAACCTCAGGTCCCTATC-CCATG----------TACCCCCCGCCCCAGGCCAGAACAGAAAG-TGTTCTCAGTCTATGGAGTCT----AGCTGCTAGGGCTCTAAGGG-------------AGGCCCTGGGGTACAACTTGGTGCAACCAACCCTTCGGGGCCTGTAACCACACAGTGA---GTGAGGGGGTCCTGCTGGGCC--C-A------GCACCAGCTCTCTGGTAGCATCA-TGGGTCCAGAGGTACTA-AAAGTGTCCCCTTACTTGCCAC-------------CACCCATCCATCTATCCTATGTCTGCC--------TCTCTCTGAGGGCCATCCCTGGCTGGGTAGGCCCTGCTCTGGCCACCACGGCCACCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGCAG--TGGGCTTCTCTATGTCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCTCAGCCTTGTTAGGAGTCTCAAAGGTACCCGGCGCCGCGGGAC--GGTGTAGCCCGCCGCCCCACCTGCATGCCAG----GCCGCGCCCATTAGCATCCGTGATACTTGGTAGCATTTTGGAGA-CTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACACGTTTCTGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTCA-----------------------------     
10 Jaculus_jaculus-NC_059106.1-188919_189218            85.2%  36.1%    -----------------------------------------------------------------GCCACCTGCAGCTATGGGAAGGGAAGTACCAGACCCTTGCCCCACCCTGGCCAACCT--TTGGGACAGGGGCTTAGCAGACACCTCCCTGAGCCTCCTCCTCATGATGTGG--GG-----TGTTGGAGAAGGTTGACTAGTGCCCATC-------------------------TCCATATCCCAAGGGGCTGTGAGCAGCCAATAAGTGTATG-----CCAAGGGTTCCTGTCCTGGGAAGAAATAC----TCTGGTATCTTCCTTCTTCC-----CTTCCTGCCCTCCACCTAT---------------TGTCAGCCCTAATCTCAGTGTTCCTTGGTGGTCTCATCTGGGACCT-------GGTCACCCGGGA-------------------ACACTGACTACCTGGA----------------CAAAACACTGGTCCCTCC--TGTGACTCTCCCTGCCCTGGGCCTTCCC-TACCACTTCTACTTCCGGTCTTCTGGAAGACATCT-----------GCCTGGGTTTGCCCAACACCCC-------AG-CCCCACAG-TTCAT----------GTGGTCCTGCCCCAGGTGAGGCCAGGAGG-GGCTCTCATTCTGTGGAGTCC----AGCTGACCCAGTTCTGAACAGGGCCGATGCACC--------------CTTAGGGTACAACCCACCCTTGGGAGCC-----------TGTGA---CCACGTGGGTCCTGCCACAGC--C-A------GCACTGACTCTCCCACTGCATCTGTGGGCCCAGAGGCTTTG-CAGGAGTCCTGTTCTCTGCTGC-----------------TGTCAATCTGTCCTGTGCCTGCC--------TGTCTCTGAGGGCC----AAGGGCCAGTAGGCCCCATCCTAGTCACTGTGGTCGCCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGCAG--TGGGCCTCTCTATGTCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCGCAGCCTTGTTAGGAGTCTCAAAGGTACCCGGCGTTGCGGGAC--GGTGTAGCCCGCCGCCCCACCTGCATGCCAG----GCCGTGCCCATTAGCATCTGTGACTCTTGGTAGCATTTTGGA-GACTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACATGGTTCTGGG-TCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGCGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTCAG----------------------------     
11 Peromyscus_leucopus-NC_051064.1-191026_191325        86.1%  40.0%    ----------------------------------------------------------------------------------ACTGGATAGTACCAGCCCCTTGCTCCTGCCCAGTCCCCTT--CTGGGGCTAGGGCCTGCCACTCACTCCTCTGGGCCTCTTCCTCAATCTTTGA--TGTGGGCTATTGGGAGATGCCGACCCTGGAGCCTACCA------------GTGCTGCCTCCATATC--CCAAGGG----GGTTTTGGGCATCCAAGTGTG-----CCAAATGTCCGTGTCCTGGGATGGAACTC----CCTGGCGTCCACCTCCCTGC-------------CCTCCATCTGT---------------TG----TGTCAGCCTCAGTTTTCCTCCGTGGCCTCCTATGCCCT---------GTACATCTGGGA-------------------GCACTGACTGCTTGGCTTCTCAGCAGGGACA-GAGCACGGTGACCTCTCC--CAGGGCTTTCCTTGTCCTG----AGAGTCCCATCCCTCTGCTTCCTATTACCTGAAAGGGATCT-----------ACTTGCATTTGCCCACTACCTGGTCCCTGGG-CCCCCCAC-CC-CA----------TGTGCCCTGCCCCAGGCCAGAACAGGAA-------------------GTCC----AGCTGTCTGGGTTCTAAGTGGGGTCTGATG---CACCCTTAGGGTACTGTTTGGTGCAACCAACCCTTTAGGGCCTGTGACCACACAGTGC-------GTGGGTCCTGCTGGGTC--C-A------GCACCGACTCTCTTGTAGCACCA-TGGGCCTAGAGGCACTG-CAGGTGTCCTGTTCTAGGATAC-------------CACCCA----TCTGTCCTGTGTCTGCC--------CGTCTTTGAGGGCCA---AGGGCTGGGTAGGCCCTGCTCTGGCCACTATGGCCACCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGCAG--TGGGCTTCTCTATGTCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCTCAGCCTTGTTAGGAGTCTCAAAGGTACCCGGCGCTGCGGGAC--GGTGTAGCCCGCCGCCCCACCTGCATGCCAG----GCCGCGCCCATTAGCATCTGTGATTCTTGGTAGCATTTTGGAGACTTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACACAGTTCTGGGGTTCCTGGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTCA-----------------------------     
12 Mastomys_coucha-NW_022196900.1-191042_191334         85.2%  35.1%    ----------------------------------------------------------------------GGATGCCC-------TGG----------TACCTTCCTC-----CCCGCTGCCCCGGGATGGGATGCCC-----TGGTACCTCC------TCCCCGCTGCCCCGGGA--TGGGATGCCCTGGTACCTTCCTCCCCGCTGCCCCGGGATGGGATGCC---CTGGTACCTTCCTCCCCGCTGCCCT----GGGATGGGATGCCCTGGTACC-----TTCCTCCCCGCTGCCCTGGGATGGGATGT----CCTGGTACCTCCAT---------------------------------------------CTGTTTTACCAGTCCTAGTTTTCCTCAGTAGCCTCTGATGTCCT---------GTACATCTGGGA-------------------GCACTGACTGCTTGGATTCCTGGCAAGGGTA-GAGTGCCATGACCCCTCC--CATGGCTTTCTTTGTCCTGAGTGCCACATCCCTCTG---CATTTCTGTTTCTTCAAAGGGATCTACG-------TGCATTTATTTGCCCACTACCTGGAAAGTCAGGTCCCTATC-CCATG----------TATC-CCCGCCCCAGGCTAGAACAGGAAG-TGTTCTCAGTCTGTGGAGTCC----AGCTACTAGGGCTCTAAGGG-------------AGGCCTTGGGGTACAACTTGGTGGCATCAATCCTTAAGGGCCTATAACCACACAGTGA-------ATGGGTCCTGTTGGGCC--C-A------GCAGTAACCCTCCGGTAGCACCA-TGGGTCCCAAGGTACTA-AAGGTGTCCCGTTACTTGCCAC-------------CACCCATCCATCTATCCCATGTCTGCC--------TGTCCCTGAGGGCCATCCATGGCTGGGTAGGCCCTGCTCTGGCCACCACAACCACCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGCAG--TGGGCTTCTCTATGTCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCTCAGCCTTGTTAGGAGTCTCAAAGGTACCCGGCGCCGCGGGAC--GGTGTAGCCCGCCGCCCCACCTGCATGCCAG----GCCGCGCCCATTAGCATCCGTGATTCTTGGTAGCATTTTGGAGA-CTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACACGTTTCTGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTCA-----------------------------     
13 Meriones_unguiculatus-NW_018657773.1-189149_189442   86.0%  36.5%    --------------------------------------------------------GCCTCCCTGGCCTCCTGTAGCCACAGAAAGGACAGTGCCAACCCCTCACTCCCACCGTGTC-------------------------CTCTTCTGGGGCTAGGGCCTTCCTCAGCCTGTGA--TGTGGGCTATTGGGAGATGCTGACCCTGGAGCCTACCA------------GTACTGCCTCCGAGTC--CTGAGG-----GGCTTTGGGCATCCAAGTGTG-----CCAGATGTCCCTGTCCTGGGACGGAAGCT----CCTGGCATCTGCCTCCCTGC-------------TCTCCCTCTGT---------------TACCAGTGCTAG--TCTGTTTTCCTCAGTGACCTCCTATACCCT---------GTACATCTGGGA-------------------GCACAGGGTGCTTGGATTCTCTGCAGGGACAGAGCACAT---GACCCTCC--TGTGGCTTTCCTTGTCCTGAGTGT----CCCACCCCTCTGCACCCTATTTCCTGCACTTG--------------------------CCCACTAC----------AG-GCCCCCAT-CC-CA----------GGTGCCCCTGCCCCAGGCCAGAACAGGAG-TAGTCTCAGTGTGTGTAGTCC----AGCTGTCTGCGCTCTAAGGGGGCCCTTAGGAGGGGGCCCTGAGGGTACAGCCGGTGCAACCAACCCTTTGGGGCCTGTAGCCACACAGTGA-------GTGGGTCCTGCTGGGCC--C-A------GCACTGACTCTCCTGTGGCACCA-CGAGCCCAGAGGCACTA-CAGCTGTCCTATCCTCTGCCAC-------------CACCCAT-GGTCTATCCTGTGCCAGCC--------TGTCTCTGAGGGCCA---CGGGCTGGGTAGGCCCTGCTCTGGCCACCACGGCCACCTCACCTGCCTTCACCCTGTCTCTTTGGTCTTGCAG--TGGGCTTCTCTATGTCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCTCAGCCTTGTTAGGAGTCTCAAAGGTACCCGGCGCCGCGGGAC--GGTGTAACCCGCCGCCCCACCTGCATGCCAG----GCCGCGCC-ATTAGCATCCGTGATTCTTGGTAGCATTTTGGA-GACTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACACGGTTCTGGGATCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTATGGGGCAGATCCAGGATTCAG----------------------------     
14 Cricetulus_griseus-NW_003616165.1-66052_66351        86.1%  39.8%    ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAATCTCCTT--CTGGGGCTGGGGCCTGATATTCACCTCTCTGGACCTCTTCTTCAATCTTTGA--TGCAGGCTATAGGGAGATGCTGGCCCTGGAGTCTACCA------------GTGCTGCCTCTGTGTC--CCAAGGG----GGTTTTGGGCATACAAGTGTA-----CCAACCATCCCTGTCCTGGGATGGAATTC----CCTGGTGTCTACCTCCCCAC-------------CCTCCATCTAT---------------TGCCAATGCTAGTCTCAGTCTTCCTCAGTGGCCTCCTATGCCCT---------GTACATCTGGGA-------------------GCACTGGTTGCTTGGCTTCTCAGCAGGGGACAGAGCACCATGGTCTCTCC--TGTGGCTTTCCTTGTCCCAGGCATCCGTCCCATCCCTCTGCTTCCTGTTTCCTGAAAGGGATCT-----------ATCTGCATTTTCCCACTGCCTGACCCCTGGG-CCCCCATC-C--CA----------TGCGCCCTGCCCCAGGCCAAAACAGGAAG-TGCTCTCAATCTGTGGAGTCC----AGGTGTCTGGATTCTAAGTGATGTCGGATGCA-CCCCCTTAGGATACAACTTGGTGCAACCAACACTTCAGGGCCTCTAACCACACAGTGA-------ATGGGTCCTGCCTGGCC--C-G------GCACTGACTC--TTGTAGCGCCG-TAGGCCGAGAGGCACTG-CTGGTGTCCTGTTCTGTGCCAC-------------CACCCATCCGTCTTTCCTGTACCTACC--------TGTCTCTGAGGGCCA---ACGGCTGGGTAGGCCCCGCTCTGGCCACTATGGCCACCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGCAG--TGGGCTTCTCTATGTCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCTCAGCCTTGTTAGGAGTCTCACAGGTACCCGGCGCCGCGGGAC--GGTGTAGCCCGCCGCCCCACCTGCATGCCAG----GCCGCGCCCATTAGCATCTGTGATTCTTGGTAGCATTTTGGAGACTTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACATGGTTCTGGGGTTCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTTA-----------------------------     
15 Rattus_rattus-NC_046154.1-191034_191328              85.7%  36.1%    --------------------------------------------------------------------------TTTC-------T------------TAATCTGTGG-----TATGGGCTACTGGGGGATGCTGACCCTGAGCTTCCAGTGG------TCCCTCCACGTCCCAGA--GGGGTTTTGGGCATCCAAGTATGCCAAGCGTCCTGGGATGGGATGCC---CTGTTACCTGCCTCCCTGCTGCCCT----GGAATGGGATGCCCTGTTATC-----TGCCTCCCTGCTGCCCTGGGATGGGATGC----CCCAGTACCTGTCTCC-------------CTGCCCTCTGTCTGT---------------TGCCAATCCCAGTCTTAGTTTTCCTCAGTAGCCCCTGATGTCCT---------GTACATCTGGGA-------------------GCACTGACTGCTTGGATTCTTGGCAAGGGTA-GAGCGCCATGATCCCTCC--CGTGGCTTTCCTTGTCCTGAGTGTCACATCCCTCTG---AATTTCTATTTCCTAAAAGGGATCTC---------TACATGCATCTGCCCACTACCTGGAACCTCAGGTCCCCACC-CCACG----------TACC-CCTGCCCCAGGCCAGAACAGGAAG-TGTTCTCAGTCTGTGGAGTCC----AACTGCCAGGGCTCTAAGGG-------------AGGCCCTGGGATAC----------AACCAGTCCTTCGGGGCCTGTAACCACACAGTGC-------CTGGGTCCTGCTGAGCC--C-A------GCACTAACTCTCTGGTAGCACCA-TGGGTCCAGAGGTGCTG-CAGGTGTCCTGTTACTTGCCAC-------------TACCCACCCATCTATCCTGTGTCTGCC--------TGTCTCTGAGGGCCA----TGGCTGGGTAGGCCCTGCCCTGGCCACCACGGCCACCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGCAG--TGGGCTTCTCTATGTCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCTCAGCCTTGTTAGGAGTCTCAAAGGTACCCGGCGCCGCGGGAC--GGTGTAGCCCGCCGCCCCACCTGCATGCCAG----GCCGCGCCCATTAGCATCCGTGACTCTTGGTAGCATTTTGGAGA-CTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACACGTTTCTGGGGTCCCTTGGGCCATCCTCAGCTAGAGAGTGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTTA-----------------------------     
16 Mesocricetus_auratus-NW_024429219.1-191040_191335    85.5%  38.8%    --------------------------------------------------------------------------------------GATAGTGCCAGCCCCTTGCTCCCACCCGGTCCCCTTCTGGGGCTCTATTGCCTGCCATTCACCTCTCTGGGCCTCTCCTTCGATCTTTGG--TGCAGGCTGTAGGGAGATGCTGGCCCCGGAGCCTACCA------------ATGCCGCCTCTGTGTGTCCCAAGGG----GGTTTTGGGCATCCGAGTGTA-----CCAAACGTCCCTGTCCTGGGATGGGATTC----CCTGGTGTCTACCCTGCCCA---------CCCTCCTCCATCTGT---------------TGCCAATGCTAATCTCAGTTTTCCTCAGTGGCCTCCTAATGC--------------------CCT-------------------GTACTGATTGCTTGGCTTCTCAGCAGGGGACAGAGCACCATGGCCTCTCC--CGTGGCTTTTCCTG-------------TCCCATCCCTCTGCTTCCTGTTTCCCGAAAGGGATCT-----------ACCTGCATTTCCCCACTACCTTGCCCCTGGGGCCCCCCAT-CC-CA----------TGCGCCCTGCCCAAGGCCAGAGCAGGAAG-TGCTCTCAATCTGTGGAGTCC----AGCTGTCTGGCTTCTAAGTGGAGTCGGATGCACCCTT------------------AGGATGCCACCTTCAGGGCCTCTAACCGCACAGTGA-------GTGGGTCCTGCCGGGCC--C-A------GCGCTGACTCTCTTGTAGCACCATGGGGCCAAGAGGCGCTG-CTGGTGTCCTGCCCTATGCCAC-----------ACCACCCGTCCATCCACCCTGCACCTGCC--------TGTCTCTGAGGGCCA---AGGGCTGGGCCGGCCCTGCTCTGGCCACGATGGCCACCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGCAG--TGGGCTTCTCTATGTCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCTCAGCCTTGTTAGGAGTCTCAAAGGTACACGGCGCCGCGGGAC--GGTGTAGCCCGCCGCCCCACCTGCATGCAGG-----CCGCGCCCATTAGCATCCGTGAATCTTGGTAGCATTTTGGAGACTTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACACAGTTCTGGGGTTCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTCA-----------------------------     
17 Nannospalax_galili-NW_008355419.1-188943_189238      86.9%  38.8%    --------------------------------------------------------------------------------------GGGAGTATCTGCCCCTCATCCCACTCTGTAACCCCG--TCTGGACTGGGGCCTGGTAGTCACCTTCCTGGGCCTCCTCCTCAACATATGA--TGTGGGGTGTTGGGAGACTCTGACCCTGGAGCCCACCA------------GTGCTGACCTCAACATC-CTAAGGG----GGCTGCGGGCAGTCAACTGGA-----CCAAACATCCCTGTCCTGGGATCCC--------CCTGGTATCTCCCTCCCTGC-------------CCTCTGTGTGC---------------TGCTAATGCTAGTCCCAGTCTTCCTTGGTGGCT--CCTGGCCCT---------GCCTATCTGGGA-------------------GCACTGACCGCTTGGCTCCTCAGCAGGGACAGAACACTGTAGCCCCTTCC--TGTGGCTTTCCTTGTCCTGAGCCCCGCCCCCAACCTAC-TTCCAGGGTCACCTGGAAGGGATCT-----------GCCTGCATTTTCCCACTACTCCAGA-------ACCCCAGC-CC-AT----------GTGTTCCTGCTCCAGGCCAGAGCAGGAAG-GGCTCTCAATCTGTGGAGCCC----CGCTGTCCCAGTTCTCAACCTGATG--------CACCCTTTGGGCATAACCTGGTATAGCCAGCCCTCAGGGGTCGGTAACTAC--AGTGT-------GTGGGTCTCAATGGACC--C-A------GCACTGACTCTCCTGCAGCACCCATGGGCCCAGAGGCTCTG-TGGGTGTCCTGTTCTATGCTAT-------------C---------ACCCGTCCGTTCACGCC--------TGTCTCCGAGGGCCA---AGGGCTGGATAGGCCCCACTCTGGTCACCATGGCCACCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGCAG--TGGGCCTCTCTATGTCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCTCATCCTTGTTAGGCGTCTGAAAGGTACCCGGCGCCGCGGGAC--GGTGTAACCCGCCGCCCCACCTGCATGCCAG----GCCGCGCCCATTAGCATCCGTGATTCTTGGTAGCATTTTGGA-GATTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACATGGTTCCTGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGCGGCATTTACAAGGCAGATCCAGGATTCA-----------------------------     
18 Lemur_catta-NC_059130.1-189465_189748                83.4%  32.4%    AAGAGGCCTCCATCTTCGTGCATGTGGCTGTCAGTGACATCAGCGGTAAGGTGAGCGTCACCCGAGGGCCACCTGCGGTCCTGGGAGGAGCAG---------------------------------------------------CACCAGCCCTGTGC--CCACCCCACCCCCAGC--AGTCTCCCCAGGGCGGCTCCTGAGTCTGGGCTGAGAG-------------GCCCAC----GGTCCCCCCACCATCGGGGGTGCAGGGGACGCCTGATCCCAGGCCTGTGAGCTCCGTATCCAGCGC------------------TGGCAGCAGAGGGC---AAGGCAGGGCCGTGTGCCC------------------TGCTGTCCCTGACCCTGCTCTCGGTGGGCACCAGCGCCCATCT-----CAGCCTGGCTCTGGCCTCACCCAG-GCCCTGT-CCCTGCTGGCACCCGGGCTG-----CTGGGTGGGGACGAACACTCAGCCCTT--CCTGGCACTCGCAGC-----------CCTCCCTTCCT--CTCCTGGCCCCCCTCCC---------------------CCGGAGTCACCCGGATAGTGGCC---------G--CCT-GC-C-----------TTTGCCCCAGGCCA-----GGGCAGGACAGGGCAGTCCAGGATGGGTCTTGGCCCGGCCCCTCCCTATCTGCA--G------AGCCGGCACCCC--AGGTCCGAGCTCGGG-CC-AGAGCCCTCGGGGACTGTAGACGCAGC-----------TCGGGGTCCGCCCGGGGCCC-AACAGTGACCGTGTCTCTCCTGCTGCACTCGTGGGCCCAGAGGCACAA-GCTGGACCGGGCTCC--------------------------------------------------------GCAGGCGTGTGTCT-GTCTCCGCGGCCGTGGGCCCT------CCCGCTGTCTTGCCGCCTCACCTCCTTCCTGTCTCTTTGGTCTTGC----AGTGGCTCCCCATGTCCAAAGTCTACTTTTACAAGCACGGCCTTGTTAGGGCCTCCAAGGTACCCCGGCGCCGCGGGGC--AGTGTGGCCGGCGCCCCACCTGCATGCCCAG----GCCGCGCCCCATTAGCACCATGATTCCTGGTAGCATTTTGGA-GACTGTCAGCTCTTGTGCTGTGGATCATGACATGGTTCCGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCGACA-GCGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTCGACAG-------------------------     
19 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-189617_189902     82.4%  35.0%    ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGG--------------GCGGGGAGGCCCTGCTGACCGCATGGCCGTG--------------CCCCAGGCTATCGGCACGTGTACCTGGAGGGGATGGAAGAGGCCTCCATCT-TTGTGCACGTGGCCA-----TCAGCGACATCAGCGGTAAGGTGAGTGCCCCAGGGGAAGAAGGCAGTGCTTAGTGGCAGTCCCAGAGACTGAGGCCTGCGGTGACCTCGCTGGGCTTCCTCCTCTACCTGAAGTGGGGTACGGGGGTGCTGGCTCTGGGGC-------------CT-GCCAGGGCTGACCTCGTGTCCCTGCCCTGGGAAGGAGTTCCCTGGTTTCCCC--TCCTGCCTCCTACC---TGTGCCTG-GCTCAGTCACCCTTGCTGGCCCCACCTGGGAGTGCTGACCA---------CCTGG--CTGACAGGGACAGTGCACCGTGG-CCTCCCAT-GGCCTTCTCCCC---TC--CCTCTCTCCTCAGCCTCCCTGGCTG-CCTCCTCTTCCAGAGTTGCCT----GGATTTG--CCCTGTACCCA-------GCCCCCAGCACATTGGCCCCAGGCCAGGCCAGAGCAGGGATCTCAACCTGTGAGCCTGGCGGCTCTTCCAAGTGGGGGGTCTGG------G-CCCCACTGACCTCTCTCTCCTGCTGTGCCTGTGGGCCCAGAGGCTCTG-CAGGGTGCTGCTCTC-TGCTGCTGCGGT------CCGTCTGTCTGTCCGTCCGTCCGTC-AG--TCT---TTCGTGTCCGCCTGTCTACAAGGGCCACGGGCCCCCTCCCTGGCCTCTGGGACCTCTCACCGGCCTTCACTCTGTTTCTTTGGTCTTTCAG--TGGGCTTCTGTATGTCCAAAGTCTACTTTTAGAAGCGCGGCCTTGTTAGGAATCTCGAAGGTACCCGGGGCGCCATGGGCCTGTGCAGCCCGC----GCCCCTGCATGCCAG----GTCGCACTCATTAGCATCTGTGACTCCTGGTAGCATTTTGGA-GACTGTCAGTTCATTTGACATGGGCCATGACGTGG-TTCCGGGTGCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGTG--GCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTCAGCT--------------------------     
20 Castor_canadensis-NW_017871110.1-188749_189063       81.8%  34.2%    -------------------GCATGTGGCTGTCAGTGACATCAGCGGTAAGGTGTGTGTCACCTGCGGGGCCACCCGTG-------------------------------------------------GTTGTGGG-------AAGGACCACCCT-GCCCCCACCAGCAGTATCCCA--GGGAAGCTCCTGATCCATGGTGTTCACCTCC-------------------CTGGGACTCCTGTACCT-GTGACGTGG-GGTGTTGGGGGATGCTGATCTCT-ATCTCCATGGTAGATGTGGGCAGCTGAGGGCAGGTGTGTGAGATGAGCGTCC-CCA-----CTTCTGGAAGGAATTGCGT--CC-----TCC---CTCCACGTACTAGTCCCATCTTCCTTGGTGGCTTCACCCAGGTC---------CTGCCTATCAGG-------------------GCACTGTCCACCTGGCTTCTCAGTTAGGAGG-GAGCACTAT-----------------------GGCCCTAAGCCTCTCTACCATCTCTACTTCCAGAGTTGCCTGGAAGGCGTCT-----------TCCTGGGTTTGCCCTCGA--------------------------CC----------CCATCCCTGCCCCAGGTCAGCGCATGACA-GACTCTCAGTCAGTTCTGTGT----GGGCCAGGCACTTTTATA-----------------------GGACCCGGCCCGGTGTGGCCAGCACTCAGGGATCTGTAAACGCACAGCAC-------ATGGATCCTGCCTGGGC-CC-ATCATTGACCTTCTCTCTTCTGCTGTGCCTGGGGGCCCAGGGGCTCTG-CAGGTGTCCAGTTCTCCTTTGC--------------TGCCGTCTGTCTGTCTGCGTGTTGTA--------TGTCTGCG---TGTCTCCACAGGCCCGCGGGCCCCACCCCAGCCACCGTAACCGCCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGCTCTTGCAG--TGGGCTTCTCTATGTCCCAAGTCTACTTTTAGAAGCGCTGCCTTGTTAGGCATCTCGAAGGTACCCCGATGCCGCGGGA-CGGTGTAGCCCGCCACCCCACCTGCATGCCAGGCCACGCCCCCCCATTAGCATCCGTGATTCCTGGTAGCATTTTGGA-GATTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACATGGTTCTGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGCGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGAT--------------------------------     
21 Grammomys_surdaster-NW_021620991.1-191019_191314     85.3%  35.6%    --------------------------------------------------------------------------AACC-------T------------GCCTC----------TCTGCTGTCCTGGGATGGGATGCCCCAGTAC----CTGCC------TCCCTGCTGTCCTGGGA--TGGGGTGCCCTGGGACCCACCTCCCTGCTGTCCTGGGATGGGGTGCC---CTGGGACCCACCTCCCTGCTGTCTT----GAGATGGGATCCCCCAGTATC-----TGCCTCCCTGCTGTCCTGGGATGGGATGC----CCTGGTACCTGCCTCC-------------CTCTTCTCTGTCTTT---------------TGCCAGTCCTGGTCTTAGTTTTCCTCAGTAGCCTCTGATGTCCT---------GTACATCCGGGA-------------------GCACTGACTGCTTGGATTCTTGGCAAGGGTA-GAGCAACATGACCCCTCC--TGTGGCTTTCCTTGTCCTGAGTGCCACATCCCTCTG---GATTTCCATTTCCTGAAAGGGATCT-----------ACATGCATTTGCTCACTACCTGGAGCCTCAGGTCCCCATC-CCATG----------TACCCCCCACCCCAGGCCAGAACAGGAAG-TGTTCTCAGTCTGCGGAGTCC----ATCTTCTGGGTCTCTAAGGG-------------AGGCCCTGGGGTACAATTTGGTGCCACCAACCCTTTGGGGCCTGTAACCAGACAGTGA-------ATGGGTCCTGCTGGGCC--C-A------ACACTAACTGTCCAGTAGCACCA-TGGGTCCAGAGGTACTA-AAGGTGTCCTGTTATTTGCCAC-------------CATCCATCCATCTATCCCGTGTCTGCC--------TGTCTCTGAGGGCCA----TGGCTAGGTAGGCCCTGTTCTGGCCACCACGGCCAGCTCACCTGCCTTCACTCT--CTCTTTGGTCTTGCAG--TGGGCTTCTCTATGTCCCAAGTCTACCTTTAGAAGCTCAGCCTTGTTAGGAGTCTCAAAGGTACCCGGCGTCGCGGGACGCGGTGTAGCCCGCCGCCCCACCTGCATGCCAG----GCCGCGCCCATTAGCATCCGTGATTCTTGGTAGCATCTTGGAGACTTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACACGTTTCTGGGGTCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTATGAGGCAGATCCAGGATTCA-----------------------------     
22 Microtus_oregoni-NW_024543064.1-191116_191404        84.4%  37.6%    ----------------------------------------CAGTGGTAAGGTGAGTGTTGCCTCCGAGTCCTCTAGCCACAGGAAGAACAGTACCAGCCCCTTGCTCCCACCCAGTCCACTT--CTGGGGCTAGGGCCTGGCATTCACCTCTCTGGGTCTCTTCCTCAGTCTTTGA--TGTGGGCTATTGGGAAGTGCTGACCCTGGATACCACCA------------GTGCTGCCTCTGCCTC--CCAAGG-----GGTTTGGGGCATCCAAGTGTG-----CAAAGCATCCCTGTCCCGGGATGGACTTC----CCTTGTGCCCACCCCCTTGC--------------CCTCCTCTGT---------------TGCCATTGCCAGTCTCCGTTTTCCTCAGTGCCCTCCTATGC-CC---------GTACATCTGGGA-------------------GCACTGACTGCTTGGCTTCTCAGCAGAGACA-GAAAACCATGACCTCTCC--CGTGGCTTTCCTTGTCCCGA----GTGTCCTATTCCTCTGCTTCCTAGTCCCTGAAAGGGATCT-----------ACCTGCATTTGCCCACTACCTGGGCCTTGGG-CCCCCATC-C--CA----------TGTGCCCTGCCCCAGGTGAGAGCAGGAAC-GGTTCTCAATCTGTGGAGTCC----AACTGTCTGGGTTCTAAGTGGGGTCTGATA---CATCCTTAGGGTACAACTTGATGCAACTAACCCTTCAGGGCCTGTGACCACAGTAAGT-------GG--GTCCC-------------------------------------------------------------------ACTGGGCCCACCCCTG-------------ACTGCATCCATCTGTCCCGTGTCTGCC--------TGTCTCTGAGGGCCA---AGGGCTGGGTAGGCCCTGCTCTGGCTGCCATGGCCACCTCACCTGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGCAG----------------TCCCAAGCCTACTTTTAGAAGCTCAGCCTTGTTAGGAGTCTCAAAGGTACCCGGCGCCGCGGGAC--GGTGTAGCCCGCCGCCCCACCTGCATGCCAG----GCCGCGCCCATTAGCATCCGTGATTCTTGGTAGCATTTTGGAGACTTGTCAGCTCATGTGACATGGATCATGACACGGTTCTGGGGTTCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGAGTGGCATTTACGAGGCAGATCCAGGATTCAGCCAAG-----------------------     
23 Fukomys_damarensis-NW_022900935.1-191050_191332      82.7%  31.2%    ----------------------------------GCTCCTCTCCTGCTGGCTGTGGGGTGCCCCCAG------------------------------GAGGTCCCTGCAGGCTCCACGATGCACACTGGGGGGTGCTGTGG---GAGGAG-TGTGGGCCTTGGGGCAGA--------------GTGGGGAGGCCCTGATGACCCTGAGATGGTG--------------CCCCAGGCTATCGGCACGTGTACCTGGAGGGGATGGAAGAGGCCTCCATCT-TCGTGCATGTGGCCA-----TCAGCGACATCAGTGGTAAGGTGAGTGCCATGTGAGAAGAAGGTGCTGAGGCCCGCTGGTGACCTCACTGGGCTTCCT----------------------CCCCCAGCTGA----------------------------TA-------------TG-AGGTATAGAGCCTCTGGGTCCCTGCCCTGGGAAGGAGTCCCCTGGTGTCTCC--TCCCTGTC--------------------------CTCCCCCTTGGTGGCCCCAAGAAGTGCCAA-CT---------GTCTG--GCTAAAGGGATGGCACCTCATGG-CCTCTCAC-GGCCTTCTCTCC---CT--CCCCTCTCCTGAGCCTCCCTGGCTG-C-CTCCCTTGCAGAGTTTCTG----GATT--T--GTCCCTACCCA-------GCCCCCACA-CATTGGCCACAGGCCAGACCAGGGCAGGGTCTCCAGCCTGTGAGCTGGCTGCTCTTCCCAGGGGGTT---CTGG------G-CCCTGGTGACCTCTCTTTTCTGCTGTGCCCATGGGGCCAGAGGCTCTG-CAGGGTCCTGTTCTC-TGCTGCTGCC-GTCC---------GTCTGTCTGTCC------------------GTCATGTCCTCCTG--TCTCCATGGCCGCGGCCCCCTCCCCAGCCTCCCAGGCCACTCACCGGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGCAG--TGGGCTTCTGTATGTCCAAAGTCTACTTTTAGAAGCGCAGCCTTGTTAGGAACCTCGAAGGTACCCG-GGTGCCACAGGCCTGTGCAGCCTGC----GCCCCTGCATGCCAG----GTCGCGCTCATTAGCATCCGTGACTCCTGGTAGCACTTTGGA-GACTGTCAGTTCATTTGATATGGGCCATGACATGG-TTCCGGATCCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGTG--GCATTTATGAGGCAGCTCCAGGATTCAGCC--------------------------     
24 Heterocephalus_glaber-NW_004624818.1-189603_190026   83.8%  34.0%    ---------------------------------------------CCAGGCAGGGAGCGACACCCAG------------------------------AAGC---------CCCTCTTCCTGCTGACTGTGGGGTGCCCTGGGTGTTCTGT-TCTGGGGCCTCGGGGCAA--------------GGCGGGAAGGCCCTGACGACCCGCGGTGGGA--------------CCCCAGGCTACCGGCACGTGTACCTGGAGGGGATGGAAGAGGCCTCCATCT-TCGTGCATGTGGCCA-----TCAGCGACATCAGCGGTAAGGTGAGTGCCACACAGGAAGAGGGCGCTGAGGCCGGGCGGTGACCTCCTGGGCTTCCGC----------------------CCCTAGCTGGGGGAGGGCACGGGGCATGGAG--------CC-------------TG-CCGGTGCGGACCTCCGTGTCCCTGCCCTGGGAAGGAGTCCCCTGGTGTCCCC--TTGCCCTC--------------------------CCCCTTGGGGGTCCTGCCCGGGAGTGCTGACCA---------CTTGG--CTCACAGGGATGGCACCTCATGG-CCTCCCAT-GGCCTTCTCTCT---CTCCCTCCTCTCCTGAGCCTCCCTGGGTG-C-TTCCCTTCCAGAGTTGCCT----GGATTTG--CCCCCTACCCA-------GCCCCCACA-CATTTGCCACGGGCCAGGCCAGGGCAGGGGTCTCAGGCCGTGAGCCCAGCTGCTCTTCCAAGTGGGG---GGCT------G-GGCCCTGGTGACCTCTCTCCTGCAGTGCCCTCAGGGCCAGAGGCTCTG-CAGGGTCCTGCTCTC-TGCTGCCATCTGTCT---------GTCCGTCCATCT------------------GTCATGTCCGCCTG--TCTACATGGCCGCGGC-CCCTCCCCAGCCGTCTGGGCCACTCACCGGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGCAG--TGGGCTTCTGTATGTGCAAAGTCTACTTTTAGAAGCGCAGCCTTGTTAGGAACCTCGAAGGTACCCG-GGCGCCACAGGCCTGTGCAGCCCGC----G-CCCTGCATGCCAG----GTCACGCTCATTAGCATCCGTGACTCCTGGTAGCATTTTGGA-GACTGTCAGTTCATTTGATATGGGCCATGACATGG-TTCCGGGTCCCCTGGGCCATCTTCAGCCACAGTG--GCATTTATGAGGCAGATCCAGGAT--------------------------------     
25 Octodon_degus-NW_004524689.1-189338_189629           83.1%  34.4%    --------------------------------------------------------GGTGCC---CC------------------------------TGGGTGTCTGGAGGG------ACGGAGCCCCTGTGG--GGCTGTCAGTCCTGTTCAGGGCCCTGGGCAGACA--------------GGAGGGGCGGCCTGCTGACCACGTGGCCATG--------------CCCCAGGCTATCGGCATGTGTACCTGGAGGGGATGGAAGAGGCCTCCATCT-TTGTGCACGTGGCCA-----TCAGTGACATCAGTGGTAAGGTGAGTGCCACATAGGAAGAAGGCAGTGCCCAGAAACTGTTCCCTCCTC-----------------------------------TACCTGAAGAGGGGTTCGAGGGTGCTG-----------------------------------ACCTCTGTGTCCCTGCCCTGGGAAGCAGCTCTCTGTGTCCCCT--CCCTGCCCTCCACC---TGCACCTG-GCTCAGTCCCCTTTGGTGGCTCTACCTAGGAACGCTGAACA---------CGTGG--CTGATGGGGACAGTAACCGTG---CCT------------CCCATG---GC--CTTCTCCCCCCAGCCTCCATGGCTC-CTTCATCTTCCAGAGTTGCCT----GGATTTG--CCCCCTACCCA-------GCCCCCACAC-ACTGGCCCCGAGCCAGGCCAGGGCAGGGGTCTCAGCCTATGAGCCAGCA-GCTCTTCCAAGTGGGTGGCTTGG------G-CCCCGCTG--GCCTCTCTCCTGCTGTGCCCGTGGGCCTAGAGGCTCTG-CAGTGTCCTGCTCTC-TGCTGCCGCTGCCGT---CCGTCCGTCCGTCCGTCCGTCCACCCTT--CCA---TCTGTGTTCACCTGTCTCCAGGGGCCGTGGGCCCCCTCCCCAGCCTCTGGGGCTGCTCACCGGCCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGCAG--TGGGCTTCTGTATGTCCAAAGTCTACTTTAGGAAGCGCAGCCCTGTTAGGAATCATGAAGGTACCCG-GGCGCCACGGGCCTGTGCAGCCCGT----GCCCCTGCATGCCAG----GTCGCACTCATTAGCATCCGTGACTCCTGGTAGCATTTTGGA-GGTGT-CAGTTCATTTGACATGGGTCATGACGTGGTTCTGGGGTGCCCTGGGCCATCCTCAGCCAGAGTG--GCATTTATGAGGCCGATCCAGGATTCAGCCG-------------------------     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          **** * **** *                       :  ****  *:. *.*  *  *   * ****       ..* :.*.           .            *         .*   .:  *  .          *  .:*:. .:* .**. :*  .**.***  * *..