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 1 Target                                                  100.0% 100.0%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCCCCCCA-CACTGGCCGAGG-GCCCCAGGGCAGGGCAGGT-----ACTCTTTCCCCTGTGAGT-------CAGTGCCTGTGTAGGTGGGCCTGCA---------------CCTGGCACCAAAGAGACAGG-------AGCTGA-GGACGGGAG-GA---GAGCCAGCCTGGGGATCTGCGGGTCAGGCAGGGGCATGGCCTGTGGGGGAGGGGCCACCCCCAGGA--------AGAGGTCCCTGCAGGCTG---------------------------GTGCAATGCCAATGGGCTTCCTGGAGGAGGTGG--GGTAGTGC---TGGGCCCACAGGAGGCAGAGGCCCCAGGCCTGG---GCTTGTTGG-----------------GTGTATCTGGGGTCTTGGGACCTTTAAGTAGAATGGG--------GGGCAGAGCAGGTGGGGGCCCTGGGAGGCTGTGACCTCATGACCCTGCTGACCCACACTGCTCCAGGCTACAGACACGTGTACCTAGAAGGGATGGAAGAGGCCTCCATCTTCGTGCATGTGGCTGTCAGTGACATCAGCGGTAAGGTGAGTGTCACCCCCTGCCACCAGCC--ATCATGGGGAGGGGCCACACCAGCCCCTTGTCC---CATG------CCCCCCCATGTGTCCCCAGTGCTGGGTCCTGAAC-TCAGGCAGTGAGGCCTAGG-GTCCCCTCCCCGGGCCTCTGCTCCTCTATCTCA-AGAGGGGCTGCTGTG-GGGGCCTGGCTCC-------------TGAGC--CACC----------AGT-GCCCACCTCTGATCTCAGGGCTGG-CTTTGGG-CATCTCGGGCAGGACAGGTCCTGAGTG--CTC--CGGGCCTTGCCCCG---CCCTGTGTCACCCATGCCTGTCTCAGACTCTTGGGGGCCTTGC-----AGC-CTCCACCCCTACA----------------GTGCTGCCA-----------------TCTGGCTTCTCAG-----CAGGGACCGAG----TGATGCCCCTCTCCCCTCTAC-------TACCCCCCA---------CCCCTCTACTTCCTGGTGTCACGTGGA-AGGCAGCTGCCCGG-GTTTGCCTGTGACTCCACACCCAGCATGTCTGTCCCCTGCCCCAGGTCAGGGTGGGGCCTCGGCTTCCGCAGGA-AGTGGTCTTGGTGCCAGCCCTGCTGCCCTG------------------------------------------------------------------------------------------     
 2 Cercocebus_atys-NW_012001716.1-225203_226067             96.5%  80.8%    --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCCTGTGCGGGAGAGGTCACT-CCCGGGAAGA-G-GGCTGAGGACAGGACAAGAGCCAGCCTGGGGCTCTGTGGGTC-------TGATGGGGACATAGCCTGTGCGGGA---------------GAGGTCACTCCCGGGAAGAG-------GGCTGA-GGACAGGAC-AA---GAGCCAGCCTGGGGACCTGTGGGTCGGGGTGGGGCACGGCCTGTGGGGGAGGGGCCACCCCCAGGA--------AGAGGACCCTGCAGGCTG---------------------------GTGCAATGCCAGTGGGCTTCCTGGAGGAGGTGG-GGGTAGTGC---TGGGCCCACGGGAGGCAGAGGTCCCAGGCCTGG---GTTTGTCGG-----------------CTGTATCTGGGGTCTTGGGACCTTTGAGTAGAGTGGG--------GGCCAGAGCAGGTGGGGGCCTCGGGAGGCTGTGACCTCATGACCCTGCTGACCCACACTGCTCCAGGCTACAGGCACGTGTACCTGGAGGGGATAGAAGAGGCCTCCATCTTCGTGCACGTGGCTGTCAGTGACATCAGTGGTAAGGTGAGTGTCACCCCCTGCCACCAGCC--ATCGTGGGAAGGGGCCGCACCAGCCCCTTGTCC---TATG------CACCCCCATGTGTCCCCAGGCCTGGGTCCTGAAC-TCAGGCAGTGAGGCCTAGG-GTCCCCTCCCCGGGCCTCTGCTCCTCTACCTGCAAGAGGGGGTGCTGTG-GGGGTCTGGCTCC-------------TGAGC--CACC----------AGT-GCCCACCTCTGACCCCAGGGCTGG-CTGTGGG-CATCTCCGGCAGGGCGGGTCCCGAGTG--CTC--TGGGCCTTGCCCCG---CCG---------------------------------GCCTCAC-----AGG-CTCCACCCCCACA----------------GTGCTGCCA-----------------TCTGGCTTCTCAG-----CAGGGACTGAG----TGGTGCCC-CCTCCCCTCTCT-------CACCCCCTA---------CCCCTCTACTTCCTGCTGTCACATGGA-AGGCAGCTGCCCGG-GTTTGCCTGTCACTCCACACCCAGCATGTCTGTCCCCTGCCCCAGGTCAGAGTGGGGACTCGGCTTCCGCAGGA-AGGGGTGCTGGTGCTGGCCCTGCTGCCCTGCAGAGCCGGCTG---------------CCCT-----------------------------------------------------------     
 3 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-124966_125864             97.0%  75.6%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCAGGAAGA-G-GGCTGAGGACAGGAT--GAGGCTGCCTGGGGTTCTGCTGGTCAGGCTGGGGCATAGCCTGTGCCCTGTAGGGGA---------------GAGGTGTCCCTCAGGAAGGG-------TGCTGA-GGACCAGAC-GA---GAGCCAGCCTGGGGCTCTGCAGGTTAGGCTGGGGCGCAGCCTGTGCAGAAGAGGTCACCCCCAGGA--------AGAGGTCCCTGCAGGCTG---------------------------GTGCAATGCCAGTGGACTTCCTGGAGGAGGTGAGGGGTAGTAC---TGGGCCCACAGGAGGCAGAGGTCCCCAGCCTGG---GCTTGTTGG-----------------CTGTATTTGGGGTCTTGAGACCTTTAAGTAGAGTGGGCTGGTCGGGGGCAGAGCAGGTGGGGGCCCTGGGAGGCTGACACCTCATGACCCCACTGACCCGTGCTGCTCCAGGCTACCGGCATGTGTACCTGGAGGGGATGGAAGAGGCCTCCATCTTTGTGCATGTGGCTGTCAGTGACATCAGCGGTAAGGTGAGTGTCACCCCTGGCCACTGGCC--ATCATGGGGACGGGCCGTACCAG-CCCTTGTCC---CATA------CCCCCCCATGTGTCCCCAGGGCTGGCTCCTCAGC-TGAGGCAGTGAGGCCTGGG-GTCCCTTCCCCAGGCCTCTGCTTCTCTACCTGCAAGAGGGGGTGCTGG--GGGGCCTGGCTCC-------------TGAGC--CGCC----------AGT-GCTCACCCCTGACCCCAGGGCCGG-TTGTGGG-AGTCTTGGGCAATGCGGGGCCCCAGTG--CCC--TGTGCCTTGCTCTG---CCCTGTGTCACCAATGCCTGTCTCAGACTCTCTTGGGGGCCTC-----GCAGGCCTCACCCCACA----------------GTGTGGCCA-----------------CCTGGCTTCTCAG-----CATGGACTGAG----TGGTGGCCCTCCCCCCCCGCC-------CCCTCCCCTC----GCTCACCCCTATCCTTTTGGTGTCACGTGGA-AGGCAGCTGCCCGGGATTTACCCGTGACTCCACACCCAGCATGTGTGTCCCTCAGCCT-----------------CAGCTTCTGCAGGA-GGGGGTCGCGGTGCCAGCCCTGCTGCCCTG------------------------------------------------------------------------------------------     
 4 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-256370_256967      93.0%  53.4%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CACTCGGCCCC-CCCAGACTGAGG-GCTCCAGGGCAGGGTGGGGCTCAGCTTCCTATTGT---AAGTTAG------CACCTGCTGTGGGTGGGCCTGGT---------------CCTGCTGCCAAAGGGA-------------CAGA-GGGAGCTCA-CA---AGGACAGCAAGT---GAGGCCAGGGGGCTTTGTGGACCAGGGCTAGGGTGTGGGTCACCCCCAGGA--------GGAGGTCCCTGCAGGCTG---------------------------GGGCAACACTGGTGGGCTTCCTGGAGGAGGCGA--GCTGTTGC---CGGGCCCATGGGAGGCAGGGTCCCCAGGACTGG---GCTCACTGG-----------------TTGTGTTCAGGGCCTTCAGACCTTTAAGTAGAGTGTGGCCGTGGGGGGGACAGGGGTGGGGGG----------------AGCTCTGGTGAGCCCGTGACCTGCTGCTCCAGGCTATCGGCATGTGTACCTGGAGGGGATGGAAGAGGCCTCCATCTTCGTGCACGTGGCTGTCAGTGACATCAGCGGTAAGGTGAGTGTCACCTGCCAGGCCACCTGTGGTCGTGGGAAGGGTCAGCACTGGGTCCTCGCCCAGCCCAG------CCCCCAACAGTGTCCCAAAGGCCAGCTCCTGAAC-CCCAGCAGTGGTGCCTACTGGTCACCTCCCTGGGCCTCTGTTCCTCCACCTACCCTGAG-CCTGCGGTG-CGGACCTCCAGTCG------------AGGGC--AAGG----------CAT-GGGGCCCAAGTGCCCCTGCCCCAG-GGAGGAG----------TGCCCCTGGTTGTCCCTA--CTC--CCTCGGTGGCCCTC---CCCAAGCCCCACCTGGCT--TCTCAGCAGGAAAGGAGCATGG----------TGGCCCTTCCTGG----------------GCGCCCACA-----------------GCTGGTCTCTCTC-----CCTCTCCTGAG----TGGCCCCT------------------------------------GCTCTGGCTACTTCCCAGAATTATCCGGA-AGGTGCCA-CCTGGGTTCGCCCTATTAC-CCGCCCCCCCAACACGTTTGCCTTGCCCAGGCCAAGGCAAGACAGCTGGCATCCGCAGGACAGGGGTCTTGGCTCTGACCTTTCCATTCTGCAGAGCCCAGCC---------------GCCCCAGTTCTGAGCTGGACCCAGTGCC-----------------------------------     
 5 Lemur_catta-NC_059130.1-188498_188924                    87.7%  43.8%    -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCAGCATGATGCCAGGTGGGTGGGGCCAAGG-GCTCCAGGGCCGGGTGTGCACCTGCCGTGG----------GCCCCGTGGGCCTGGCCCTGGTGCCAAAGGGACA---------------GAGGGAGCTGGCTGGGACCC---------------AGCGCAAG-GC---TGTGAGGCCTTGTGGACCGGGGTGGGATGGGTCGCAACCTGTGAGG----GGGCTCACCCCCAGGA--------GGACGTC-CTGCTGGCCA---------------------------GAGCAATGCTGGCAGGCTGCCTGGAGGAGGTGGAGGCTGCG---C-TGGGTCCACA-GGGGACAAAATCCCAGGCCTGGGCTTGTCGTTGG-----------------TGGCACTCAGGGCCTTGGGATCTTTAAGTAGAGAGTGGCT-GGTGGAG--------GCCGG------GCAGGGGGAGCCCTGGGACCCTGACGTCGCCCCCACTGCTCCAGGCTATCGGCACGTGTACCTGGAGGGGATGGAAGAGGCCTCCATCTTCGTGCATGTGGCTGTCAGTGACATCAGCGGTAAGGTGAGCGTCACCCGAGGGCCACCTGCGGTC--CTGGGAGGAGCAGCACCAGCCCTGTGCCC-ACCCCA------CCCCCAGCAGTCTCCCCAG-GGCGGCTCCTGAGT-CTGGGCTGAGAGGC-CCACGGTCCCCCCACC-AT----------------------CGGGGGTGCAGGG-GACGCCTGATCCC--------------AGGC--CTGT----------GAG-CT-------------CCGTATCCA-GCGCTGGCAGCAGAGGGCAAGGCAGGGCCGTGTGCCCTGC--TGTCCCTGACCCTGCTCTCGGTGGGCACCAGCGCCCATCTCAGCCTGGCTCTGGCCTCAC-----CCAGGCCCTGTCCCTGC-------------TGGCACCCGGGCTGCT------GGGTGGGGACGAACACTCAG-----CCCTTCCTGGC----ACTCGCAGCCCTCCCTTCCTCT------CCTG---------------GCCCCCCTCCCCCGGAGTCACCCGGA-TAGTGGCC------GCCTGCCT-TTGCCCCAGGCCAGGGCAGG---------------------------ACAGGGCAGTCCAGG-----ATGGGTCTTGGCCCGGCCCCTCCCTATCTGCAGAGCCGGCAC-----------------CCCAGGTCCGAGCTCGGGCCAGAGCCCTCG-GGGACTGTAGAC-G--CAGCT---------     
 6 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-190020_190464       88.8%  46.4%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCCGCCAAGGCCGAGG-GCTCCAGGCCAGGGTGTGCACCTGCCGTGG----------GCCCCATGGGCCTGGCCCTGCTGCCGAAGGGACA---------------GAGGGAGCTGACCTGGACCCA----GCGGGACT-CAGCACAAG-GT---TGTGGGGCCTTGTGGACCCAGGTGGGATGGGGCGCAGCCTGTGGG---GAGGGCTCACCCCCAGGA--------GGACGTC-CTGCTGGCCA---------------------------GAGCAATACTGGCAGGCTGCCTGGAGGAGGTGGAGGTTGTG---C-TGGGTCCACA-GGGGATGGAGTCCCAGGCCTGGGCTTGTCGTTTG-----------------TGGCACTCAGGGCCTTGGGACCTTTAAGTAGAGAGTGGGCTGGTGAAG--------GCGGG------GCAGGGGGAGCCCTGTGACCCTGATGTCACCCCCATTGCTCCAGGCTATCGGCACGTGTACCTGGAGGGAATGGAAGAGGCCTCCATCTTCGTGCATGTGGCTGTCAGTGACATCAGCGGTAAGGTGAGCATCACCTGAGGGCCACCTGTGGTC--CTGGGAGGGGCAGCACCAGCCCTGTGCCCCACCCCAACCCCCCCCCCAGCAGCGTCCCCAG-GGTGGCTCCTGAGT-CTGGGCAAAGAGGC-CCATGGTCCCCCCACC-AC----------------------TGGGGATGCAGGG-GACGCCTGACCCC--------------AAGC--CTGC----------GGT-GAGGAGCTCCGTGTCCCAGGGCTG-GCGTGG-----------------GCGGCCGGGTGCCCTGC--TGTCCCTGACCCTGCTCTCGGGGGGCACCAGCGCCCATCTCAGCCTGGCTCTGGCCTCAC-----CCGAGCCCTGTCCCTGC-------------TGGCGCCGGGCTGCGG------GGTGGGGACTGAGCACTTGG-----CCCTTCCTGGC----GCCTGCAGCCT-CCCTTCCTCT------CCTGGCCTCC----CCCACCCCTCCACGGTCTGGAGTCACCTGGA-CAGTGGCCACCTGCATTTGCCC-TTGCCCCAGGCCAGGGCAGG---------------------------GCAGGGAGGTCCAGG-----ATGGGTCCTGGCCCGGC-CTTCCCGATCTGTAGAGCTGGCGT-----------------CCCAGGTCCCAGCTGGGGCCTGGAGCCCTTGGG----------------------------     
 7 Microcebus_murinus-NC_033661.1-188223_188670             89.0%  45.6%    -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGTGGGTGGGGCCCCACG----CGTGCGCCG-GCGTCCCCCCCAGCCCGAGGGCTCCAGGGG----------GGGGTGTGCGCCTGGCCCTGGTGCCAAAGGGGCA---------------GAGGGAGCTGACCGGGACCC---------------AGCGCGAG-GC---TGTGGGGCCTTGTGGACCGGGGTGGGGTGGGGCGCAGCCTGTGGGGAGGAGGGCTCACCCCCAGGA--------GGGCGTC-CTGCTGCCCA---------------------------GAGCAGTGCTGGCGGGCTGCCTGGAGGGGGTGGAGCTTGTGCTGG-TGGGTCCGCA-GGGGACGGAGTCCCAGGCCTGGGCTTCTCGTTGG-----------------TGGCACTCAGGGCCCTGGGACCTTTAAGTAGAGAGTGGGCTGGTGGGG--------GCGGG------GCAGGGGGAGCCCTGTGACCCTGACATCACCCCCACTGCTCCAGGCTATCGGCACGTGTACCTGGAGGGGATGGAAGAGGCCTCCATCTTTGTGCATGTGGCTGTCAGTGACATCAGTGGTAAGGTGAGTGTCACCTGAGGGCCACCTGCCATC--CTGGGAGGGGCGGCAGCAGCCCTGCGCCCCACCCCA------CCCCCAGCAGGGTCCCCAG-GGCGGCTCCTGAGT-CTGGGCAGAGAGGC-CCCCCGTCCCCCCCACCAC----------------------TGGGGGTGCAGGG-GACGCCTGACCCC--------------AAGC--CTGC----------CGT-GGGGAACTCCGTGTCCCAGGGCTG-GCGTGGGCAGCCGAGGGCAGGGCGGGGCCGCGTGCCCTGC--TGTCTCTGACCCTGCTCTCGGTGGGCACCAACGCCCGGCTCAGCCTGGCGCCCGGGCTGC-----TGGCTGGGTGGGG----------------------------------------------ACTGAGCACTCGG-----CCCTTCCTGGC----GCCTGCAGCCT-CCCTTCCTCA------CCTGGCCTCC----CCCGCCCCCTCCACGGCCGGAGTCACCTGGA-CAGTGGCCA-CTGCGTTTGCCC-TCGTCCCAGGCTGGGGCAGG---------------------------ACAGGGCGGTCCAGG-----ATGGGTCTTGGCTCGGC-CCTCCCGATCTGCAGAGCCGGCGC-----------------CCCAGGTCCGAGCTGGGGCCCACAGCCCCGGGGGACTGTAAAC------------------     
 8 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-187905_188306          87.6%  41.5%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGAGGGACTTCATTGGCCAAAGGACGCTGGCCTTTAGCAGCCTGATGCCAGGTGGGCAGGG-------CCCCTCATCCCCCCATCAGCTGAGGGCCAAAGGACA---------------GAGGGAGCTGACCAGGACCA---------------AACAAGAG-GT---TATGGGGCTCTGTGGCCTTGGTGG-GGTATGG-------CCCATGGGCAAGGGCTCATGCCCAGGA--------GGGAGTCCTACAGGGCCA---------------------------CAACAATGCTGGCAGGCTTCCTGGAGGAGGGAGAGGGGCTGTG-C-TGAGTCCCCA--GGAGCAGAGTCCCAGGCCTGG---GCTCACTGG-----------------TGGCACTTGGGGCTTTGAGACCTTTAAGAACAGAATAGGCTAGTGGGG--------GTGGGGTAGGGCGGGGGAGCCCTGTGACCCCATGGCATCATCCCTGCTCTCCCAGGCTATCGGCACGTGTACCTAGAGGGGATGGAAGAGGCCTCCATTTTCGTGCACGTGGCTGTCAGTGACATCAGTGGTAAGGTGAGCATCACCTGGGGGCCATCTGCGTCC--TGGGAGGGGCAGCAGC----CCCTTGCCCCACTTC-------ACCCCAGCAGTGTCCCCAG-TT--GGCCCTGAGT-CTAGGGGGAGAGGCCTCACAGCCCTTTCTTCCAG----------------------TGGAAGTGGAGGG-GACACCTGATCCC--------------CAGC--CTGC----------AGG-GCTAACCTTGTGTCCCAGGGCCAG-CTGTGGGCAGCCGAGGGCTGGGTGGAGCCCCACAC-CCTA--TTAACCCCAACCTGCTTTTGGTGGGCACCAGCACCCGTCTGAACCTGGCTCAGCCCTTGC-----CCAGGTCTTGTCCTTGC-------------TGAGGCTGGTGCCCAG------GTTTGAGAGCACAGACAGAC-----C--------------------------TCTCTCAACT------GCTAACCTAA----CCCCTCCTCCTACTGTCCAGAGTCCCCTGAA-AGGTGGCTGCCTGCCTTTGCCC-TTGCCCCAGGCCAGGGCAGG---------------------------ATGGTGGGCTGTCCA-----GGATGGCT------CAGGCCTCCCAGTCTAAAGAGCCAGTGC-----------------CCCGGGTCTGAGCTGGGGCCCGGTGCCCTCAGGGACTGTAAAC-G--C-------------     
 9 Equus_przewalskii-NW_007674960.1-204979_205345           81.7%  33.9%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGTCCCCC--ATAGAGACCAGTGTCCCCCACAGGCCAG-----CTGAGGGCTCCAGGACAGGGTGGAGCTCAGCTTCCTCCTGCAAGGTAGCTTCTGCCACAGGTGGGCCTGGGGGACACAGAAGGAGCTGAGGAGG--GCATGTGCAGCCACAGCTGCTTTGTGGATGA-----GGTAG----GGGAGGGGA-----GCTCAGG----------CT---GCAGAGC-CCCC-CAGCCCCCTGGAAGAGGATGAGGTCCCTGCAGGGTGGAGCAATACCAGCAGGCTTCCTGGAGGAGGTGGAGTCCTCAG--GAGTGGGCTCACTGGTTGTATTTAGGGCCTTGGG-CCTTTAAGTAG----------------------AGTGTGGGGGC------------------AGGGTGAGCCATGACCCTGGCTATTTCAGGCTACCGGCACGTGTACCTGGAGGGGATGGAGGAGGCCTCCATCTTTGTCCACGTGGCTGTCAGTGACATCAGTGGTAAGGTGAGTGCCACTTGCAGGGCACCTGCCGTCAGGAAGGGGCGTGCCAGCCCCACTCCCAGCCCCGCCCCAGCACTGACCCCTGG-----------GCCGGCTCCTGACCGCAGGCCCCTGGGGCCTAGTGGTCACCTCACTGGGCCTGTG--TCTGCACCTGCGCCCCAGCACTTCTGG-CCCGCCGCAGGATGGGGTCTTGCTCTACTGT----------------------------------CCCAGCCTGCAGAGCCCAGGGC--CCAGGCAGGCCGGCCCACGGCGG------TCAGTCAGGCACACACGAGGGGCCTGCGAGG-TCCCAGCACTAACCATCTCTCTCCTGCCACGCTC---TACGGGCCTGAGGTGCGGGCCAGATACAGCTCTCCGCCTCCCGTCTGTCTGTCTGTCTGTTGTGTCTG-CCTGTCTCCGCGGGCTCC-GCGCCCCCGCCGTCCATGTCTCACGGTCTTCACTCTGTCTCTTTGGTCTTGCAGTG-T-CTTCTCTATGTCCA--AA---------GT-CTACTTTTAGAAGCACAGCCCTGTTAGG-----GGC-----------------T----CGAAGGTACCCC-------AG---CGCGGGGCGGTACTGCCCGCC---CCACC--T--G--------------CATGCTCAGGCCGCCCCGTT--------------------------------------------     
10 Camelus_bactrianus-NW_011514262.1-190144_190357          81.3%  33.6%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATG---GGGAGGGCAGAGCCCTGGGTCAGCATCCCCTGCAGGCCAG-----CAGAGGGCTCCAGCACAGGGCAGGGCTCAACCTCCTCCAGCGAGTTGACTCCTGCCACGGGTGGGCGTGGGGA-CACGGAGGGAGCAGAGGAGG--AGGGTGCAAGGCCACAGCACTCCATAGACAG-----GGTGG----GGGAGGGGA-----GCCCCAG----------CT---GCGGAGT-CCCC-CGGTCTCCAGGAAGAGGAAGAGATCCCTGCAGGCCAGAGCAGTACCGGCAGGCTTCCTGGAGGAGGCAGAGGCCCCAG--GACTGGACTCACAGGTTGTATTCAGGGCCTTAGGACCTTTAAGTAG----------------------AGCGTGGGGGACATGGGCAGGTAGGTGCTGGGGTGAGCTGTGACCCAGACTATTTCAGGCTATCGGCATGTGTACCTGGAGGGGATGGAAGAGGCCTCCATCTTTGTTCACGTGGCCGTCAGTGACATCAGTGGTAAGGTGAGTGCCACCTGCAGGGCCAATTGCTGCCCAGAAGAGGCGCACCAGCGCCAGCCCCAGCCCCAG------------CCCCA-----------CCCGATCCATGCCCCCAGGGCCATGAGGTCTAGCGGTCACCTCGCTGGGACTGTG--TCTCCACCTGCGAAATGAGTGGCTGGG-CCCCTGGCACGCCTCTGCCAGCCCTGACCTC----------------------------------CACGTCCTGGGGCCACTGTGGC--C-ATCAGGAGATGGACACCACAG------CCCTTCCTG-----------------------GGCACCCCCTGCCCACCTTCCATCTCTCCTGGGCCTTCCCCTTCTACTTCTCAGGGTCCCCAGGTTCTCCATCCCTCCTTGA----AGGCGTCTGGCTTTGCCCC-AGATCCCCACCAGTCC-C-TAGT--------------------------TTACCCAGGATGGGGGTCTCGCTCCA-ACTTCCCCAGTCTGCA--GAGCCCATGGGTC-CTGGGTTCTGTGCTCAGGGCCTAGCAGG-----GCC-----------------ATACACGGTGGTCTGTC-------AGGCACACGCTGGGGTCCTCGCAGGT---CCAGC--A-CT--------------AACCGTCTCTCTCCTGCCTCGCTTCTCGGCCCCGAGGCTGGC----------------------     
11 Nannospalax_galili-NW_008355419.1-187901_188205          78.2%  29.0%    ---------------------------------------------------------------------------------TGATGCCAGGTAGGGAGG------------------AGGCCAGGATCAAGGAGACTTAGCACTGGCCAG-AATTCCCCACCCAAACTGACTAAGGGCTCCA-------G---------AACAGGGGAGGGCTCAGCCTCATGCTGTGAGTGGGCCTGGGCCTGGTAAGGAGTGGAGGGAG-TCTATGAG----------GCT--------GGCTGCATAGATGTGGGTGGGGT----------GGGTCATCCCAAGAGAGAGGTCCCTGCAGGTGGACCC-----------------------ATGCCCAAG----------GGCTGCCCCAAG------AA--GT------------GGAGCAGGTA-----TTG--GGCCTATGGGAAGGGGTTTCCCCAGGACTGGGCTCATTGG--TGCT---------------TCTCAAGGCTTGGGGACCTTTAAGGA--------------------AAGGTTTGGCAGGCTAGGGAGGGGT-GAGAGCCCTGATAACTGGTGACCCTGCTGCTCCAGGCTATCGGCACGTGTACCTGGAAGGGATGGAAGAGGCCTCTATCTTTGTCCATGTAGCTGTTAGTGACATCAGTGGTAAGGTGAGTGTTGTCCCCCAGGCCATCTGAGGCTGGAAAAGGGGAGT-ATCTGCC-CCTCATCCCACTCTGTAACCCCGTCTGGACT--------------------GGGG-CCTGGTAGTCACCTTCCTGGGCCTCCTCCTC-AA--------------CATATGATGTGGGGTGTTGGG-AGACTCTGACCCTGGAGCCCACCAGTGCTGA--CCTCAACATCCTAAGGGGGCTGCGGGCAGTCAACTGGACCAA-ACATCCCTGTC--CTGGGATCCCCCTGGTATCTCC--CTC--CCTGC------CCTCTGTGTGCTGCTAATG---CTAGTCCCAGTCTTCCTTGGTGGC--------TCC---------------------------TGGCCCTGCCTATCTGGGAGCACTGACCGCTTGGCTCCTCAG-----CAGGGACAGAA--CACTGTAGCCCCTTCCTGTGGCTT----TCCTTGTCCTGAGCCCCGCCCCCAACCTACTTCCAGGGTCACCTGGA-AGGGATCTGCCTGC-ATT----TTCCCA-------------------------------------------CTACTCCA--------------GAACCCCAGCCCATGTGTTCCTGCT---CCAG---GCCA---------GAGCAGGAA-GGGCTCTCAATCTGTGGAGCCCCGCTGTCCCAGTTCTCAA-------------------     
12 Castor_canadensis-NW_017871110.1-187804_188103           81.4%  30.8%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GATGCCTGCAG-GATTCAACCCCATGTGGGAGGAGACCCTGGT-------GTTCACTGTGCACATGCCTGAAATCGCACTCGTTCGCTTCCTTGTCTGGGACCATGATCCCATTGGGCGTGACTTCATTGGCCA-GAGGACACT-AGCCTTCAGCAGTATGATGCCAGGTGAGCAGGGGGCCTGGGGCTGTGGGAGGGACAGGGTCACTCCCAGGGAGAGGT-----------------------CCCTGCAGG-----------------------------CTGAG------------CAATGCCGGT-----GGG--CTTCCTGGAAAAGGCAGAATAGTCAGGACCTGCTCGCTGG--TCCT---------------ACTCAGGGCCTGGGGACCTTTAAGGGA----------------AGAGTGAGGGTTTGGGGTGAGGATAGGTTAGGGCCCTGGTGATCCTGTGACCCCACTGTCCCAGGCTATCGGCATGTGTACCTGGAAGGGATGGAAGAGGCCTCCATCTTTGTGCATGTGGCTGTCAGTGACATCAGCGGTAAGGTGTGTGTCACCTGCGGGGCCACCCGTGGTTGTGGGAAGGACCACCCTGCCCCCACCAGCAGTATC----CCAGGGAAGCTCCT--------------------GATC-CATGGTGTTCACCTCCCTGGGACT---CCTG-TA--------------CCTGTGACGTGGGGTGTTGGG-GGATGCTGATCTCTATCTCCATGGTAGATGT--GGGCA-------------GCTGAGGGCAGGTGTGTGAGATGA-GCGTCCCCACT--TCTGGAAGGAATTGCGTCCTCC--CTC--CACGTACTAGTCCCATCTTCCTTGGTGGCTTCACCCAGGTCCTGCCTATCAGGGCACTGTCC---ACCTGGCTTCTCAGTTAGGAGGGAGCACTATGGCCCTAAGCCTCTC--TACCATCTCTACTTCCAGAGTTGC-----------CTGGA--A-----GGCGTCTTCCTGGGTTTG----CCCTCGACCC------------CATCCCTGCCCCAGGTCAGCGCATG-ACAGACTCTCAGTC-AGTTCTGTGTGGG-------------------------------------------CCAGGCACTTTTAT-------AGGACCCGGCCC-GGTGTGGCCAGCA---CTCA-----GG---------GATCTGTAA-ACGC--ACAGCACATGGATCCTGCCTGGGCCCATCATTGACCT--TCT-----------     
13 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-203830_204053         82.8%  34.6%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ACAGGCCAG-CATCCCC--CCA------------CACAGACC---AGCATCCCTCATAGAGACCAGTGTCCCCCCCACAAGCCAG-----CTGAGGGCTCCAGGACAGGGTGGAGCTCAGCTTTCTCCTGCAAGTTGGCTTCTGCCACGAGCGGTCCTGGGGGACACAGAGGGAGCTGAGGAGG--GCGCGCGAGGCCACAGGAGCTTTGTGGGCGG-----GGTGG----GGCAGGGGA-----GCTCTGG----------CT---GCGGAGT-GCCC-C-TGTCCCTGGAAGAGGACAAGGTCCCTGCAGGATGGAGCAATACCAGCGGGCTTCCTAGAGAAGGCGAGGTCCTCAG--GACTGGGCTCACTGGTTGTACTTAGGGCCTTGGGAGCTTTAAGTGG----------------------AGTGTAGGGGC------------------AGAGCGAGCCGTGCCCCTGGCTGTTTCAGGCTATCGGCACGTGTACCTGGAGGGGATGGAAGAGGCCTCCATCTTTGTCCACGTGGCCGTCAGTGACATCAGTGGTAAGGTGAGTGCCACTTGCAGGGCCACCTGCCGTCGGGGAGGAGTGCGCCAGCCCCACCCCAGCCCCACCCTAGCAGTGACCCCTGG-----------GCCGGCTCCTGACCCCAGGGCCGTGAGGCCTAGTGGTTACCTCGCTGGGCCTGTT--TCTCCACACACGAAATGGGTGGTGGGG-GCACCTGGATTCCGTGTCCCGGGGCCGCGGC-------------------------------------GGGCACCAGGAGGTGGAGG--C---CCTGGCC-CTTCTCGGGCG------CCC--CTGGCTCTCCCTCCCTGTCTCTCCTG-AGCCTCCCCTGCCCCTCTTACTTCTC--AGGGTC-----------------------CACCCGGTTCTCTATCCCTCCTCAGAAGGTGTCTGCTGGCTTTGCCCC-ACGACCCCACCCTGCTCC-CCAGCAC--------ATCTG------CCCCCGCCCCGTGACGGGGGTCTTGCTCCA-T-TTTCGCAGTGTGGA--GAACCCTGGGGTC-CTGGTTTTGTGCTCAGAGCCCAGGCAGG-----CTG-----------------GCCCGCGGTGGTCAGTC-------AGGCACACACGGGGGTCCTGCGAGGT---CCCAG--CACT--------------AACCGTCTCTCTCCCCTG----------------------------------------------     
14 Phocoena_sinus-NC_045763.1-190096_190308                 77.8%  30.7%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTGGGG---GAGGGCCAGTGCCCCCCGTAGCGCGTCCCCCACAGGCCAG-----CAGAGGACGCCAGGACCGGGCGGGGCTCAGCTTCCTCCTGCGAGTTGCCTTCTGCCACGGGGCGGCCTGGGGATACCGAGGGAGCCGAGGAGGA--GGATTCAAGGCCACAGCACTTTTGTGGTCAG-----GGTGG----GGGAGGGTA-----GCACCAG----------CT---GCGGAGC-CCCT-CAGCCCC----CAGAAGATGGTTGCTCTGCAGGCGAGAGCAATCCTGGCAGGCTTTCTGGAGGAGGTAGCGGCCCCAG--GACCGGGCTCACAGGTTGTATTCAGGGCTTTGGGACCTTTAAGTAG----------------------AGTGTGGGGGACGTGGGTGGGTAGGAGCCGTGGTG-AGCGTGACCCCGGCTGTTTCAGGCTATCGGCACGTGTACCTGGAGGGGATGGAAGAGGCCTCCATCTTTGTCCACGTGGCCGTCAGTGACATCAGTGGTAAGGTGAGTGCCACCTGCAAGGTCACTTGCTGTTGGAAAGGGGTGCCCCAGCCCCAGCCCCACCCCATC-----------------------------------CGTGTCCCTGGGGCCATGAGGCCTAGTGCTTACCTCGACGGGCCTGTG--TCTCCATCCACGAAACGAGTGGCGGGG-CCCCCGGGCGCGCCTCTATGTCCCGGGGCCA---------------------------------GTGTGGCCACCAGCATAT-------------------GGAAGCCATGG------CCCTTCCTGGGCAGCCGCGGCCCCTCC-------------------------CGTCTCT-CCTGAGCCTCCCCTTCTAATGCTCGGGGTCCCCTGGTTCTCTGTCCCTCCTCGAAGGCGTCTGCCTGGCTTTGCCCC-GTCCCTCACC-------------------------TGCTCCCAGTACATTTGCCCCAGGATGGGGTCTCACTCCG-ACTTCCCCAGTCTGCA--GAGCCCAGGGGTC-CCTGGTTCTAAGTTTGGGGCCTAGCAAG-----GCT-----------------GCACGCGGTGGTCTGTC-------AGGCACACACGGGGGTCCATGTGGCT---TCCGG--CACT--------------AACCGTCTCTCTCCTACCGTGTTCCTCGGCCCTGCGTGCTGCCGACGGAGGCCCCGCAGGCCTC     
15 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-205523_205766            87.2%  39.5%    --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCGTGGGGGAG------------------------AATGGAGCCCTGAGCCAGTGCCTCCCCCATAGCA----GTGTGCCCCAAACAACCAACTGAGGGCTCCGGGGCAGGGC------AGGGTGCGCCAGCATCTTGGGAATTA----GCAGCTGC-TGTGG-----GT---ACCTGAGCCTGGTGACAAAGGGAGAGGACAGT-GA---GCAAGCAGGCCATGGGGTAGGGG--TGG--------GGTGTGGCCTGTCAGGAA---------------------------GGGTCACCCAGGAAACATCCCTGCAGGAGGAGGTGCAGTGAGTGT-TGAGCCCACG-TGAGCCGAGTCTCCAGGACTGG---GCTCATAGG-----------------CCAGATTCTGGGCCTGGGCACCTTTAAGTCAGAGTGCAGG-------C--------CAGTGTGGGGGTGGCAGGTGGCAGCCCTGGTGAGCTTACAACCCTGCCGCTCTAGGCTACCGGCATGTGTATCTGGAGGGGATGGAAGAGGCCTCCATCTTTGTGCATGTGGCTGTCAGTGACATCAGTGGTAAGGTGAGTGCTACCTGCTGGGCCTCCTGCTCTTGCCTCTCGCCCCACGTTCCCAGCAGTGTC----------------------------CCCAGAGCCAACTCCTGACC-CCGC--AGTGAAGCCTAGCAGTTACTTCTCTGGACTTTCCC-C------CTGGTACAGGGGCTGTTGGGGGACACCTGACCCTGAGTAGGAACCCTAGGGC--AGGG----------TGT-AGGGCCCAAGTGTCTCCCCCCTAG-GAAGGGG-TGCCCTGGGCGTCCCTCGCAGTGT-----ATG--TTTCCCTCGGTGGCC--TCCCAGGCCCTGCCCTGGCTCCTCAGCAGGGATGGAACACAGC-----AGGCTTCCTGGTGCTGA----------------CCAT---------------------------CCCCCCTC-----CCTCTCCTTCC---------------------------------------------------------GCTTCCCAGGAT--CGCAGG-AGATGGCTGCCCGGGTCAGCCCCATTTCTTTCCC--CAGCACATTAGCCTCCTGCCCCCGGCCAGGCTAGAACG-GGGGTGCCTCTGCAGGATGCTCTTGGCTCTGACTTTCCCAGGCTGCAGAGCCTTTCAAACCTTCTGGGTCTGGGCCCAGTTGTGTGCTGGGGTCTAGCACCCTTCGGTG--------------------------     
16 Arvicola_amphibius-NC_052052.2-190276_190371             71.0%  25.8%    AGACCCCAGTGGGATATGAGGGCCTGACCCCAGAGGAAGCAGTCAGGGCCACCTGCTGGGGGCCCAGTATCCTGTCCACTCTGGGGCCCCTTAGGCGCCAGTCATTGGTTCC-----AGCTTCTGCTGATTCTGTCCCCACGATCTCTAG-GATTCAATCCCATGTGGGAGGAGACATTGGT-------GTTCACTGTGCACATGCCCGAGATTGCACTTGTACGCTTCCTTGTCTGGGACCATGACCCCATTGGACGTGACTTCATTGGCCA-GAGGACACT-GGCCTTCAGCAGCATGATGCCAGGTAGGGAAGAGGCCCAGGCCTAAA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GACCTTTGAGGAA----------------AGCAAGAGTTGGCAG--GGTAGGGAGGT-GGGGACTTTGATGACTGGTGACCCTGTTGCTCCAGGATACCGCCACGTGTACCTAGAAGGGATGGAAGAAGCCTCTATCTTCGTACATGTGGCTGTCAGTGACATCAGTGGTAAGGTGAGTGTTGCCTCCGAGTCCTCCCATAGCCACAGGAACGACAGTACCAGCC-CCTCGCTCCCACCCAGTCCACTTCTGGGGCT--------------------AGGG-CCTGGCAATCACCTCTCTGGGTCTCTTCCTC-AG--------------TCTTTGATGTGGGCTATTGGG-AAGTGCTGACCCTGGATACCACCAGTGCTGC--CTCTGCCTCCC-AAGGG-GTTTGGGGCATCCAAGTGTGCAAA-GCGTCCCTGTC--CCAGGATGGACTTCCCTTGTGC--CCA--CCTCC------TTGCCCTCCTCTGTTGCCAGTGCCAGTCTCCATTTTCCTCAGTGCCCTCCTATGCCCTGTACA---------------------------------------------------------TCTGGG-----AGTAGACAGAA--AACCG-TGACCTCTCCCGTGGCTT----TTCTTGTCCCGAGTATCCTATCCCTCTGCTTCCTA---GTCCCTGAA-AGGGATCTACCTGC-ATT----TGCCCA-------------------------------------------CTACCTGGCCCT-T-------GGGTCCCCATCC-CATGTGCCCTGCC---CCAG---GTCA---------GAGCAGGAA-CAGTTCTCAATCTGTGGAGTCCAACTGTCTGGGTTCTAAGTGG--GGTCTGATA---C-     
17 Mus_musculus-NC_000070.7-190233_190346                   84.0%  33.0%    ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCTTTCTTCGCTATCTCCAG-GATTCAACCCCATGTGGGAGGAGACACTGGT-------GTTCACCGTGCACATGCCAGAGATTGCGCTTGTACGCTTCCTGGTCTGGGACCATGACCCCATTGGACGTGACTTCATCGGCCA-GAGGACACT-AGCCTTCAGCAGCATAATGCCAGGTAAGGAGGCTGGGCGAGGTTCAATGTTTGCCAGCGTTCCCCGTCCGTGTT-----------------------------CCCCAG----------GAGCTCCTAACT------AGCTTA------------AGACACAGGA-----AGG--GGGCCCAGCCTCTTCCTCCTATGCACAGGAGGCTCCCTGG--TCCT---------------ACTCAAGGCCCAGACACCTTTGAGGAA----------------AGTGTGGGTTGGCAGGGTGAGGAGATGT-TGGAACCTTGATGACTCGTGACCCTATTGCTCCAGGCTACCGGCATGTGTACCTAGAAGGGATGGAAGAGGCCTCTATCTTTGTTCATGTGGCTGTCAGTGACATTAGTGGTAAGGTGAGTATTACCTCCTGGGCCTCACATAGCCACAGGGAGGATAGGACCAGCCCCCTCGTTCCCACCCTGTCCCCTTCTGGGGCT--------------------ATGG-CCTGGCATTCACTTCTCTGGGTCCCTTCCTT-AG--------------TTTGTGATGTGGGGTACTGGG-GGATGCTGACCCTGGAGCCTTCTAGTGCTAT--CTCCATGTCCC-AGGGGGGCTTCGGGAATCCAAGTGTGCTAA-GTGTCCCCGTC--CTGGGATGGGACGCCCTGGCCA--CTG--TCTCC------CTGCTGTCCTGGGATGGGGTGCCCTGGTACCTGCCTCCCTGTCCTCTGTCTGTTACCAGTCCTAGTTTCCCTCAGTAGCCTCTGATGTCCTGTACATCTGGGGACGCTGACTGCTTGGATTCTTGG-----CAAGGGTAGAG--CGCCA-TGACCCCTCCCGTGGCTT----TCCTTGTCCTGAGTGACACATCCCTCTGCATTTCTG--TTTCCTCAA-AGGGATCTACATAC-ATTTATTTGCCCA-------------------------------------------CTATCTGGAACCTC-------AGGTCCCTATCC-CATGTACCCCCC----GC-C-----C----------CA-------------------------------------------------------------------     
18 Ictidomys_tridecemlineatus-NW_024405058.1-188474_188569  85.1%  31.2%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCATGTGGGAAGAGACCCTGGT-------GTTCACCGTGCACATGCCCGAGATCGCACTGGTCCGCTTCCTCGTCTGGGACCATGATCCCATCGGGCGAGACTTCATTGGCCA-AAGGACACT-GGCCTTCAGCAGCATGCTGCCAGGTGGGCAGGGGCCCAGGCTGGGGG-GTCCCGGGGGTCCCGCCCCACTGCACCCC-----------------------CAGCAGCCCCCATGCATGCTGGTGCCCCACC------CCCCTGGCTGAGGGCTCCAGGGCAGGGA-----GGG--CTGAGTTGGCACTGCTCGGGGGGCATCGGTGCCTGATGGA--GGGGTCTT-ACGAGG-CTGGACTCAAGGCTCGGGACCTTTAAGGA-----------------------------AAGGTGGAGGAGCAGGGACAGGGGGACGTGACGCTGTGCCCTGGCTGCCCAGGCTACCGGCACGTGTACCTGGAAGGGATGGAAGAGGCCTCCATCTTTGTGCACGTGGCTGTCAGTGACATCAGTGGTAAGGTGAGTGTGGCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNGGGGGCTGCTCCCGCTCCTTGCCCA-CC--------------CCCACC---CCGGCTGTGTCC-CTGGGCTGCTCCTCACCCTCGGCACTGTGGC--------------------CTGGAGACCAGCTCTCTGGTC-CC-CTCTACCTGTGACGTGGGGTGTTGGGGGATGCAAC--CCC--AGAGCCTTCCAGTGCTGAGCCCAGGCCTCACAGGGGACCTGGGCAGCCCAGGGCAGGTGTGAGCGAAATGTCCTTGTCCCAAGAAGGGA-------GCCCCTGGGCCGCTC--------CCTGCCCTCCTGTGTTGC-----CAGTGCCAGGC--CAGCCTCAGTCTCCCTGG----TG----GCCTGGCCAGGG-G----TGCCCGGCTGTCTTCTCATGAGGGGTGAG-AAGAACTCACAGCC-CTTCCTGTGGCTCTCCCTCCCTCTCCCG--CCGGCCCAGGGCAGCGTCTGCCTGGACTTGCCCATTAC-C-------TGGCC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
19 Dipodomys_spectabilis-NW_024870976.1-185656_185751       83.1%  32.5%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CGCACTCATCCGCTTCCTGGTCTGGGACCACGACCCCATTGGGCGGGATTTCATCGGCCA-GAGGACGCT-GGCTTTTAGCAGCATGATGCCAGGTGGGCAGGGGCCCTGGGTGCTGGGGGACTCTCCAGGGGGGCTGGGGAGTCTGAGGGCTCCTCCCTGCAGGTGACATCTGCCGCGGGTGGGCCTGGGACTGCAGGCATCCTCGGAGCTGGCCTGGCAGACCAGGGGTGGGCA-----AGGGCGGGCGCTGCGTGTGGGGTCACCCCAGAGCAAGGCCGGTGGAGGCCTGGCGGAGAAGGTGAGCCTCCAGGACCCGCTCCCCGGTCTGC-----------------TCAGGGCCTGAGGACCTCTGGAGAGAGGTCCGCACCCCTCACACGCGACGCCCTGCTCTGCCAGGCTACCGGCACGTGTACCTGGAAGGGATGGAAGAGGCGTCCATCTTCGTGCACGTGTCTGTCAGTGACATCAGCGGTAAGGTGAGCGGCACCTGCGGGAGCTGTGGCTGGGGGAAGGGCGGCACCGGCCCCAGCAGCGCCCCACGG----CTGCTCCTGAGCCTGCT---------GGGCCGCCGGGG-CCTGGCAGTCCTTCCGCGGGCCT----CCTC-CA--------------CGTGTGACACAGGTGCTGG--------CAGTGCTTGGCCTCCCGTCCGGAGGT--GGACGTGGCCGGGGGGT-CGTCCCTGCCCGCCCGGGGGCTCC-CTCCTGCTCT---TGGAGTTGCTAGCGAGACCTCT--CTC--GGTGGCCTCACCCAGGCCCACCCGGCTTCTT--GGGGACCATGGAGAACAGGGTCCCTTCCTGT-GGCTCTCCTTTTCTTTCT------------------AGAGCCTT--------CCCTCAGCTTCGACTTTCAG-----AGTGGCCAGCA--A-----GGCATCTGCCTGGGTTTG----CCCATGATCCCAGC------CCCTGCTACC-CCCGGGCCAGGGTGAGGTGGGGTCTCGATCC-ATGGCTCTCCCCG------------------CCCCCTTTCTACGTGTCTGGCACCCCTCT------------------GGGCCCAGGCCGGCTGGCACTCGG----TTCT---GCCT---------GGCCTGCCACTGAC------TTTCT--------------------------------------------     
20 Suricata_suricatta-NC_043707.1-204615_204715             79.9%  30.0%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCCAGCGTCC-------CCT-G-CAGAGCCCAG-CGTCCCC--ATA------------GAGCCCAGTCCCCCCCCCCCCACACACAGGCCAGTATCCCCT------------------GCAGGTCAGCTGAGGCCAGGACTGGGCTTCCCTCTATGAGTCGGCCCCTGCCATGGGTGGGCCTTGGGA-CACACAGGGAGCTGAGGAGG--AAGGTATGAGGCCACGGGCACTTGTGGGTGG-----GGTGG----GGGAGGGGA-----GCCCAGT----------CT---GTGGAGT-CCCCCTAGCTCCCAGGAAGAGGAAGAGCTCTTTGCAGGACCGAGTGATACCAGAGGGCTTCCTGGA---GGAGGAGTCCTCAG--AACGGGGCTCATGGGTTGTATTCAGGGCCTCAGGACCCTTGAGTAG----------------------AGCGCAGGGCA--------------------GGGTGAGCCGTGACCTGGCTGTTTCAGGCTATCGGCACGTGTACCTGGAGGGGATGGAAGAGGCCTCCATCTTTGTCCATGTGGCTGTCAGTGACATCAGCGGTAAGGTGAGTGCCACCTACAGGGCCACCTGCCTTGCCCCACCCCCAGTCCCGCACCGGCCATGTTG-----------------------------------------------CCAGGCTGTTAGGCCTCGTGGTTACCTCTCTGGGCCTCTT--TTTCCACCTGCAGAATGGGCAGTAGGG-ACAGCTGGCCTCTGCGTCCCAGGGCAGCTGC-------------------------------------AGGCACAGGAGCCAGACAC--CCTGGACCCCCTCCTCCCATCTC------TC---CTGACTCCTCACTCCTACGTCTC----AGGGTCCCCGGTCCCCTGTCCCTCTCTGAAGGGTGTCTGCCTGG-------------------CTTTGCTCCCACCCCTCCCTC--CCTGGACTGGGGTCTCACA-CCA-TCGCCCCAGGTCCC-TGG--------TTCTGTGCTCCCGGCCCA-GGCAGGGCCCGTGTGTGTGTGGTCTG-TCCCGCG-CGCATGGG--GGGCCCGTGTGGT-CCTGGTGCTGTCTCTC--TCCTGCCACC-----CGC-----------G-----TGGCCCTGTGGTCCCGC-------GG--------GCCACTCGGCTCCGGC---CCATC--GTCA--------------GCCTGTCTGCCTGTGGCGAGTCTGCCTGTCTCCGCGGGCTCCTT------GCCCGGCTGT----     
21 Mus_caroli-NC_034573.1-189258_189371                     79.2%  25.4%    --------------------------------------------------------------------GCCCTGTCCACTCTGTGGCTCCTTAGGTGCCAGTCATTGGCTCCATCTCTGGACCTGCTGATCCTTTCTTCACTATCTCCAG-GTTTCAACCCCATGTGGGAGGAGACACTGGT-------GTTCACCGTGCACATGCCGGAGATTGCGCTTGTACGCTTCCTCGTCTGGGACCATGACCCTATTGGACGGGACTTCATTGGCCA-GAGGACACT-AGCCTTCAGCAGCATAATGCCAGGTAATGAGGCTGGGCGAGGTTCAGTGTTTGCCA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCCTCTTCCTCCTATGCATAGGAGGCTCCCTGG--TCCT---------------ACTCAAGGCCCAGACACCTTTGAGAAA----------------AGTGTGGGTTGGCAGGGTGAGGAGATAT-TGGAACCTTGATGACTCGTGACCCTATTGCTCCAGGCTACCGGCATGTGTACCTAGAAGGGATGGAAGAGGCCTCTATCTTTGTTCATGTGGCTGTCAGTGACATTAGTGGTAAGGTAAGTATTACCTCCTGGGCCTCACATAGCCACAGGAAGGATAGGACCAGCC-CCTCATTCCCACCCTATCCCCTTCTGGGGCT--------------------ATGG-CCTGGCATTCACTTCTCTGGGTCCCTTCCTT-AG--------------TCTGTGATGTGGAGTACTGGG-GGATGCTGACCCTGGAACCTTCTAGTGCTAT--CTCCATGTCCC-AGGGGGGCTTCGGGAATCCAAGTGTGCTAA-GTGTCCCTGTC--CTGGGATGGGATGCCCTGGTAC--CTG--TCTCC------CTGCTGTCCTGGGATGGGATGCCCTGGCAACTGCTTCCCTGCTATCCTGGGATAGGATGCCCTGGTACCTGTCTCCCTGCTGTCCTGGGATGGGATGCCCTGGTACCTGTCTCCCTGCTGTCCTGG-----GATGGGAT------GCCC-TGGCAACTGCTNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN-------------------------------------------NNNNNNNNNNNNNN-------NNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN---NNNN---NNNN---------NN-------------------------------------------------------------------     
22 Heterocephalus_glaber-NW_004624818.1-189137_189231       74.6%  26.1%    ---------------------------------GGTGAGCATCCCG-ATGCCCGGCCTGGCAGGGAGAGGCCAGGGCCCCCTGT---TCTCATGTTCTGGGGCACAGGGCTGGGCTGCAGCCCGGTCTACATGGTCTGCCCTCGCTCCAG-GATTCAACCCCATGTGGGAGGAGACGCTGGT-------GTTCACCGTGCACATGCCTGAGATTGCGCTGGTGCGCTTCCTCGTCTGGGACCACGACCCCATCGGGCGCGACTTCATCGGCCA-GAGGACGCT-GGCCTTCAGCAGCATGATGCCAGGTGGGCGGGCCAGGCAGGGAGCGACACCCAGAAGCCCCTCTTCCTGCTGACTGTGGGGTGC-------------------------------------------------------------------------------CC-----TG-------------------------------------------------------------------------GG--------------------------------TGTTCTGTTCT-GGGGCCTCGGGGCAAGGCGGGAAGGCCCTGACGACCCGCGGTGGGACCCCAGGCTACCGGCACGTGTACCTGGAGGGGATGGAAGAGGCCTCCATCTTCGTGCATGTGGCCATCAGCGACATCAGCGGTAAGGTGAGTGCCACACAGGAAGAGGGCGCTGAGGCCGGGCGGTGACCTCCTGGGCTTCCGCCCCTAGCTGGGGGAGGGCACGGGGCA--TGGA-------GCCTGCCGGTG-CG---------GACCTCCGTGTC-----CCT-GC--------------CCTGGGAAGGAGTCCCCTGGT-GTCCCCTTGCCCTCCCCCTTGGGGGTCCTGC--CCGGGAGTGCT---GAC-------------CACTTGGCTCACAGGGATGGCACCTCATGGCCTCCCATGGCCTTCTCT--CTC--TCCCTCCTCTCCTGAGCCTCCCTG-----------GGT-----GCTTCCCTTCCAGAGTTGCCTGGATTTGCCCCCTACCCAGCCCCCACACATTTGCCACGGGCCAGGCCAGGGCAGGGGTCTCAGGCCGTGAGCCCAGCTGCTCTTCCAAGTGGGGGGCTGGGCCCT----GGTGACCTCTCTCCTGCAGTGCCCTCAGGGCCAGAGGCTCTGCAGGGTCC--------TGCTCTCTGCTGCC-ATCTGTCTGTCCGTCCATC--TGTCATG--TCCGCCTGTCTACATGGC--------CG--------------------CGGCCCCTCCCCAGCCGT----------CT-G-----G---------------------GCCACTCACCG-----------------------------------------------     
23 Urocitellus_parryii-NW_020540697.1-295060_295155         80.5%  30.3%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCATGTGGGAGGAGACCCTGGT-------GTTCACAGTGCACATGCCCGAGATCGCACTGGTCCGCTTCCTCGTCTGGGACCATGATCCCATCGGGCGAGACTTCATTGGCCA-AAGGACACT-GGCCTTCAGCAGCATGCTGCCAGGTGGGCAGGGGCCCAGGCTGGGGGGGTCCCGGGGGTCCCGCCCCACCGCACCCC-----------------------CAGCAGCCCCCATGCATGCTGGCGCCCCACC------CCCCTGGCTGAGGGCTCCAGGGCAGGGA-----GGG--CTGAGTTGGCACTGCTGGG-GGGCAGCGGTGCCTGATGGA--GGGGTCTT-ACGAGG-CTGGACTCAAGGCTCGGGACCTTTAAGGA-----------------------------AAGGTGGAGGAGCAGGGACAGGGGAACGTGACGCTGTGCCCTGGCTGCCCAGGCTACCGGCACGTGTACCTGGAGGGGATGGAAGAGGCCTCCATCTTTGTGCACGTGGCTGTCAGTGACATCAGTGGTAAGGTGAGTGTGGCCTGGCGGGAAGGGCTT-----------------------------------------------------------------------------GTGG-CCAGGGGAGGGCTGCTCCCGCTCCTTACCCA-CC--------------CCCACC---CCGGCTGTGTCC-CTGGGCTGCTCCTCACCCTTGGCATTGTGGC--------------------CTGGAGACCAGCTCTCTGGTC-CC-CTCTACCTGTGACGTGGGGAGTTGGGGGATGCAAC--CCC--AGAGCCTTCTAGTGCTGAGCCCAGGTCTCAAAGGGGATCTGGGCAGCCCAGGGCAGGTGTGAGCGAAATGTCCTTGTCCCAAGAAGGGA-------GCCCCTGGGCCCCTC--------CCTGCCCTCCTGTGTTGC-----CAGTGCCAGGC--CAGCCTCAGTCTCCCTGG----TG----GCCTTGCCAGGG-G----TGCCCGGCTGTCTTCTCAGGAGAGGTGAG-AAGAACTCACAGCC-CTTCCTGTGGCTCTCCCTCCCTGTCCYG--CCGGCCCAGGGCAGGGTCTGCCTGGACTTGCCCATTAC-C-------TGGCCCCCAGCACATTTGCCCCTGC----CCAG---ACTA---------GGGCAGGACGRGGGTCTCAGCTTTTGGAGCTGGC-TACTCTGGTTCGGA--------------------     
24 Ochotona_curzoniae-NW_024466389.1-191083_191174          76.8%  27.5%    --------------------------------------------------------CGACAACGGTGAGGGCCG----------------GGGCAGGGGGTGGGGGCGGCCCGGCTGGCCGGCCGTGACCCTGCTCCCCGTGGCTCCCAG-GTTTCAACCCACTGTGGGAGGAGACACTCGT-------GTTCACCGTGCACATGCCCGAGATTGCCCTGGTCCGCTTCCTGGTCTGGGACCACGACCCCATTGGGCGTGACTTCATCGGTCA-GAGGACGCT-GGCGTTCAGCAGCCTCATGCCAGGTGGGTGGGCTCCGCAAGGCCCCAGGGATGGGCCGCCACCCGAGGAGGAAGTGGCAGGGCC-----------------------------------------------------------------------AGGGCAGCAA-----GAGGGCTTCCTGGAACAGG-----------------------------------------------GAGGCAGGCCC--------------------------------GGATGCCCTCAGGAGCGTAGGGGTGGGAGCCTGCAGACCCCGAGCCTGGCGCCTGCTCCCCCAGGCTACCGGCACGTGTACCTGGAGGGGATGGAGGAGGCCTCCATCTTTGTGCACGTGGCTGTCAGTGACATCAGCGGTAAGGTGAGTGTGATGTGGGGTCCCTGGGCGGGGTCAGCTCCCCGCCGTGGTGCAGTGCTGCTGGGTGGGCGGTCAGTGGCCTCCACG--TCCCCTT-TCAGGCACCCGAGG-CTG--GACTCAGGGCCCAGTGCC-----CCT-GC--------------CCTGAGGTGTCCCTGCCTGGG-CGCTGGGTGCCTGCTCCCTTCAGGGGTCTGC--CCAGCTTTGGG---GGTGGGTGGGGGTGGCTGCGTGGTGCACAGCAGTGGCTCCTGGGTCCTCCCCAGGTA---CCCC--CAC--TGGCCGCGCCCCTCGACCTGGGCC-----------AGG-----GCA-----------GGCCTCTGAGGTCCCCAGCTG------CGGGACCCGGCTGCCCCCTGCCCGCTCAGGTCCAGCCTGCCCGGCGCAGCGGGGCCGGCAGTGGCAGGGTGCCTCACTGGCCTCTGCTGTGTCTCTTTGCTCTTGCAGTGA-----GCGCCCCCCTAAGTCCAAAGTCC--------AGTTT---------------AGGAGCCATGCA----------G--GTACCCCGCATGCTCGGC--------CG--------------------CGCCCCGGCACCCGGGGT----------TG-G-----CG---------TAGCATTTGGAGGCTGTGAGCTCCTGG------------------------------------------     
25 Pteropus_alecto-NW_006429611.1-208653_208775             77.8%  29.0%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------TG----------GCCAGAGGAC-------GCT-GGCCCTCAGCAG-CATGATG--CCAGGTGGGCGGGGCCAGCGGGCTGGGCTCAGGTCCCCCGCAGTGACCAGCGTCCCTGCAGGCCAG-----CTGAGGGGTCCAGGGCAGGGCGGAGCTCGACTTCTGCCCCCGAGTCTGCCCT------GGGTGGGCCTGGACA---CAGAGGGAGCTGGGAAGG--GGG-CCGAGGCCACGGGCACTTCGTGT------------CC----AGGG-------------CGGG----------GT---GTCAG-G-CTGCGGGGCCCCCAGGAAGGGGAGGAGGTCCATGTGGGCCAGAGCATTGCTGGCAGGCTTCCCGGAGGAGGCAGAGTCCAGGC----------TTATGGGTTATATTCTGGACTTTGAGACCTCT-----------------------------------------GAGCAGTGTAGGGGGCGGGGTGAGCCGTGACCCCGACTGTTCCAGGCTACCGGCACGTGTACCTGGAGGGGATGGAAGAGGCCTCCATCTTTGTCCACGTAGCCCTCAGTGACATCAGTGGTAAGGTGAGTGCCACCTGCCCCGCCCCCACACTGCCCCCAGGGCTGTGACGCCTGCTGGTTTC---------------------------------------------------------------------------CTCGCTGGGCCTGTT--TCTCCACCCATGCGCTGAGCGGTGGGG-CCACCTGGCAGATCGCACCAGGACACGGACATCCGGCCCTTCCCGGGCGCCCCTGGCCGCCCTCCTGACTCTCCCTGAGCCTACCCC--CCTCTACTGCTCAGTCTCCTCCGACGGCATCTGCCTGGCGCTGCCCCACTGCAGCCCCGT-GGCTGCCCCA----------GGAGGGGCGTCTTGCTCTACTTTCCCGGTCTGCAGGGCCCAGGGGTCCCCGGCTCTGTGTCGGG--TCCAGGCAGGGCCAGCCC--------CTGGGAGTCTGC-GAGGCAC-----GCACGGGCTCCCGAGCGGGTCCCTGCACTGACCGCCTTGTCCTG-CCACACTCGACGTGGA--GCCACCGGCCGGA-C------------TCCGGCCCTGCCGGC-----CG----------------------------------------------------CCCAGCTCTCTGTCGT---CCGGC--GTCC--------------TTCTGCCTGTCTGCCGTGTGTCCGCCGGCCTCCTCGGGCTCAGCACCCCGCTGCCG------G-     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .     .      ..                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .       ***.** .* ** ***** **.**.**.**.**.**.** ** ** ** ** ** **. *  * ** ***** ** ********.:* .  .