TCCACCTACTCCCAGGGATACCTGCCTGCGAGGCTGGCTGCGCCAGCTCCGGGGATGTCCCTCCAGGATGTGCTGGCCTCAGTCCTGCACAGGTGTGAACCTTGGAGTCCCATTCACATTGGGTGAACGAGGGGCAGACGGCAGATACGCGGCAGCTGTGCAGGGGAGGCTAGCGTGTGGTGGTGGGTGGGCGGGGCACACACCTGGAAGGTCAGGTGCTGACCAGGGCAGCCTTGTGTCACCCTCGCAGTTGCCCTGAACTACCAGTCAGAGGGGCGGATGCTGCAGCTGAACCGAGCCAAGTTCAGCGCCAACGGTGGCTGCGGCTACGTACTCAAGCCTGGGTGCATGTGCCAGGGTGAGGCACTCGGACACTCAGGGCTCGGACGCTCAGGGCTCGGATGGGCCTCCTGGGTGTCCCCAGAACAGAGATCGGAGCCCCACAGGCTAGCAAGGGGGTGGGGGCGGCTTTGGCAGAGTCCCCTGGAGGGTCAGGTTGGGACGAAGCTCCCAGGATGCTGGGGAGGTGGGTGGGGGAACCCTCCTTGCTAGCGTTGCAAAGAAGGGCCCAGCTCCGTCAGGAATCCAGGGATGGAGAACTGGGGAGCCTGGGCCCCACATGAGATTCATGGCAGGACTTGTCTGAGGGGCCCCAGTGCCAGCGACCCAGCCCCCTGTGCCTGGCCCCTCTGTGGGTCTCAGGACCTGGGTCTGGGCTGGGTGTTTGGAGGAACCTCCTCCCGGCTCTCAGACACCTCTGTTTTGTCTGCTGTGGATGACTTCCAGCTTGGTCCCCCTGTGGCCCTGGCAGGAGTATCACCATGGGAGAGGGCAGGACAGGGGCTGGGCGAGCAGGCCTCCCACTAGACCAGGCTACTCCTGCTGTGGACCAGCTACTTCCACCTCTGCCCTTGGCTTGCCCTCCTCAGAGTTCTCAGCCTGAGTGGGCCCTGGGGACACTGTCACCAGAGACCCCACCCCTCATACCCCCAGGGACCCA
Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.
Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.
Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.
Distribution of HSS in the input sequence
HSS id | Strand | Frame | Length | Start | End | Score | P | Show Result | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 0 | + | 1 | 41 | 30249 | 30371 | 30.317 | 7.732e-08 |
Plot |
2 | 1 | - | 3 | 42 | 30269 | 30394 | 14.096 | 0.005 |
Plot |
HSS id | Sequence | |
---|---|---|
1 | 0 | VALNYQSEGRMLQLNRAKFSANGGCGYVLKPGCMCQGEALG |
2 | 1 | PERPSPECPSASPWHMHPGLST*PQPPLALNLARFSCSIRPS |
Reference sequence (1): Target Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% |
cov pid 1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . . . 4 . . . . : . . . . 5 . . . . : . . . . 6 . . . . : . . . . 7 . . . . : . . . . 8 . . . . : . . . . 9 . . . . : . . . . 0 . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 ] 1309 1 Target 100.0% 100.0% ----------------------------TCCAC---CT--ACTCCCAGGGATACCTGC---CTGCGAGGCTGGCTGCGCCAGCT----CC----G--GGGATGTCCCTC-----CAGGATGTGCTGGCCTCAGTCCTGCACAGGTGTG-----------AACCTTGGAGTCCCATTCACATTGGGTGAACGAGGGGCAGACGG-CAGATACGCG--GCAGCTGT--GCAGGGGAGGCTAG-CGTGTGGTG--GTGGGTGGGCGGGGCACACACCTGGAAGGTCAGGTGCTGAC-CAGGGCAGCCTTGTGTCACCCTCGCAGTTGCCCTGAACTACCAGTCAGAGGGGCGGATGCTGCAGCTGAACCGAGCCAAGTTCAGCGCCAACGGTGGCTGCGGCTACGTACTCAAGCCTGGGTGCATGTGCCAGGGTGAGGCACTCGGACACTCAGGGCTCGGACGCTCAGGGCTCGGATGGGCCTCCTGGGTGTCCCCAGAACAGAGATCGGAGCCCCACAGG--CTAGCAAGGGGGTGGGGGCGGCTTTGGCAGAGTCCCCTGGAGGGTCAGGTTGGGACGAAGCTCCCAGGATGCTGGGGAGGTGGGTGGGGGAACCCTCCTTGCTAGCGTTGCAAAGAAGGGC-------CCAGCTCC-GTCAGGAATCCAGGGAT---GGAGAACTG--------------GGGAGCCTGGGCCCCACATGAGATTCATGGCAGGACTTGTCT-GAGGGG---------CCCCAGTGCCAGCG-------A------C-C-----------CAGCCCCCTGT----GCCTG--GC----CCCTCTGTGGGTCTCAGGAC---------------------CTGGGTCTGGGCTGGGTGTTTGGAGGAA-CCTCCTCCCGGCTCTCAGACACCTCTGTTTTGT-------CTGCTGTGGATGACTTCCAGCTTGGTCCCCCTGTGG-------CCCTGGC---------AGGAGTATCACCATGGG-AGAG-GGCAGGACAGGGGC------------------TGGGCGAGCAGG-----CCTC---------CCACTAGAC---C--AGGCTACTCCTGCTG--TGGACCAGCTACTTCCACC--------------------TCTGCCCTTGGCTTGCCCTCCTCAGAGTTCTCAGCCTGAGTGGGCCCTGGGGACACTGT------CACCAGAG----ACCCCACCCCTCATACCCCCAGGGACCCA-------------------------------------------------- 2 Sapajus_apella-NW_022437067.1-197502_198271 95.8% 70.4% ------------AGGTGGTGCAGGTCTGTCCCC---AC--GGTCCCAGGGACACCT-G---CCTCGAGGCTGGCAGCACTGGCC----CC----G--GGGACGTCCCTT-----CAGGATG-TCAGGCCCCAGTCCTGCACAGGTGGA-----------GGCCTTGGGTCACCACTCATATCAGGGGGACGAGGGGCAGACGG-CGGACTGGCA--GCAGCTGT--GCAGGGGGTGCTGG-TGTGTGGTG--GTGGG---AGGGGTGACACGCCTGGAAGGTCAGGTGCCGAC-TGGGGCAGCCTTATG-TCCCCTCACAGTTGCCCTGAACTACCAGTCAGAGGGGCGGATGCTGCAGCTGAACCGAGCCAAGTTCAGTGCCAACGGCGGCTGTGGCTACGTACTGAAGCCCGAGTGTATGTGCCAGGGTGAGGCGCTTGGACGCTCAGG---------------GCTTGGACAGGCCTCCCGGGTGTCCCCAGAACAGAGATCAGAGCCCCACAGG--CTGGCAAGGGGGTG--GGCACCTTTGTCAGGGTCCCCTGAAGGATCAGGCTGGGATAAAGCTCCCAGGACACTGGGGAGGTGGGCGGGGGCACCGTCCTTGCTGGGGTTGCAAACAATGGT-------CCAGCTCT--GCAGGAATCCAGGGAC---GGAGAATTC--------------AGGAGCCTGGGCCCCACGTGGGATTCATGGCAGGACTTGCCT-GAGGGGG--------GCCCAGTGCCAGCG-------A------C-C-----------CAGCCCCCTGT----GCCCA--GC----CCATCTTTGGATCTCAGGAC---------------------CTGGGACTGGGCTAGGCATTTGAAGGAA-CCTCCGGAACCTCCTC----CCCTCCATTTTGT-------CTGCTGTGGATGAGTTCCAGCTTGCCCATGTGG----------CCCTGGC---------TCCTCTCCCACCTCTGC-CCTT-GGCTTGTCCTCCTCAGAGTTCTCACACTGAGGGGGCCCCAGGGC-----ACTG---------CCACCAGAG---GCCCCACCCCACATACCC--CCAGGGACCCAGACCCACC--------------------CCTAGAAGCCGTGTGACCTCCTTGGCTCACCCA-----TGGGAGGCCTGGGCTCTGTCCCACGTGCTGCAGTG----GCCACAAAAGTGACCCACACTGG-------------------------------------------------------- 3 Nomascus_leucogenys-NC_044404.1-221995_222379 94.5% 58.5% ---------------------------GTCCAC---GT--ACTCCCAGGGATACCTGC---CTGCGAGGCTGGCTGTGCCAGCT----CT----G--GGAACGTCCCTC-----CAGGATGTGCTGGCCTCAGTCCTGCACAGGTGCG-----------AACCTTGGAGTCCCATTCATATTGGGTGAACGAGGGGTAGACGG-CAGATCCGCG--GCAGCTGT--GCAGGGGAGGCTAG-CGTGTGGTG--GCGGGTGGGTGGGGCACACACCTGGAAGGTCAGGTGCTGAC-CAGGGCAGCCTTGTG-TCCCCTCATAGTTGCCCTGAACTACCAGTCAGAGGGCCGGATGCTACAGCTGAACCGAGCCAAGTTTAGTGCCAACGGTGGCTGCGGCTACGTACTCAAGCCTGGGTGCATGTGCCAGGGTGAGGCGCTCGGACGCTCAGGGCTCGGGTGGGCCTCCTAGGGGACTTGCTGAGGGCTGGGCCACTGACCACCTGCCCGG-----CATC--CCCTCAGGCGTGTTCAACCCCAACTCGGAGGACCCCCTGCCCGGGCAGCTCAAGAAGCAGCTGGTGCTCCGGATCATCAGTGGCCAGCA---G-------------CTTCCCAAGCCGCGC-------GACTCCATGCTGGGGGACCGCGGGGA---------GGT--------------GGGGGCCAGCCCCGCACAGGCGGGTG-GGGTGGGAGTGGGGG-GCGGGCC--------GGGCATCGCGATGG-------G------C-CCCGATGCCACCCCTACTCCTGT---GTCCCA--GA----TCATCGACCCCTTTGTGGAG---------------------GTGGAGATCATCGGGCTTCCTG--TGGA-CTGCAGCAGGGAGCAG----ACCCGCGTGGTGGA------CGACAATGGTGAGGCTCGGCCGTGGCTCCGTCACGC-------CTGTGAT---------GGAAGTCTGATGG---G-GGAG-GGTTGGGGCTA-CCTGGTGTGCCAGGGTGCTCTGCCCAGGCCTC-----CCTC--GGTGACAGTCCTAGGC---GCCACTCCCCTCTAGGTG--GGCAGT-CCCAGAAGCAGCACC--------GGGAGTGGCACTGGGAGTGGTGTGGGCTGG---GGGC-TCCAGGCTGGAGCGGTGCTGGGCTGG--------------GCCC----TCCCCATGGGACACTCCTCCTGGCGC----------------------------------------------------- 4 Microcebus_murinus-NC_033661.1-186955_187453 85.2% 32.8% ---------CTGGCTCTCACCCCTC------------------------------------CTGTTGTAGAAGCTCCACGGTGT----GTGG--C--CACGACACCAGGC----TGGCACCGGGGCG-GGGCCTTCGGACTGGCCCCG--GGGTGCACGGTGGGG-GGGTGGCCTCCCTGGCTCTGGGACCTCCCGCCTCATGCGGGGACGCTG--CTGGGTGAATGGGGGGCAGACGGC-GGATTTGGGGGCTGGCGGGCAGGCAGGGCGCGCGCCAGGAAGGCCAGACGCTGACCGGACGGCCGTGTCCCCTCCCCCAGTTGCCCTGAACTACCAGTCGGAGGGGCGGATGCTGCAGCTGAACAGGGCCAAGTTCAGCGCCAACGGCAGCTGCGGCTACGTGCTGAAGCCCCAGTGCATGTGCCAGGGTGAGGCGCCCGGCGCTCGGGGCTGCAGGGGGTGCTGCCTGGGGTTGCCCAGAAACCCGGATCGGGCTGCACAAGACAGTGGGGGGCTG--GGCGG----CCTCG--GCAGCTTCCCGGAGGGT--CATGCTGGG-----CCATGACTCCCAGGGTGC-----------TGGAGG--GCGGTGCCCTCCCTGCAGGGGCTGCAAAGAAGGA--------CCCACCTCTGCCGGGACCCTGGGTGG----GGCAGTGGGGACCCCTCCCCG-GCCCGG--CCCAGCCCCCAGAGATCCATCCGCAGGACTGGTCTGAGGGGTCC----CGGCCCAGAGACCCGGCACCCCCGAGCCTGGCTCCTCTCTGGGGCGCGAAGCTGTCCGGC----------------------CTCTGCACGCGGCGACTCATG--------CCG-TGGGCC----AAAGGCCAGGCCCGAC---CTCACGCCCGGCGTCCGCTCAGGCGTCTTCAACCCCAACTCCGAGGACCC--------CCTGCCCGGGCAGCTCAAGAAGCAGC--------------------TGGCGCTGCG--CAT-CATCAGCG---------GGCAGC-------AGCTCCCCAAGCCGC---GCGACTCCATGCTGG-GGGACCG----CGGCGAGGTAGGGCCGGCCCCGCCCGG-------------G---------TGGGGAC--GGGGTGCC----------------------AGACCTGA----GCCCGGGCCCGAGACCACCCTCCCCCGCCTC---CCCAGATCATCGACCCCTTCGTGGAGG---------------------------------------------------- 5 Lemur_catta-NC_059130.1-186852_187327 84.8% 32.8% ---------CTGGCTCTCTCCAGGCTGGCACTGGGGCGGGGCCGTAAGACCCCGAGGCCCTGTGGAACGGCAGCTGCAGGGCTG-------C--T--GCGCACTCCTGGG----GGCACGCGGGGGG-GCGTCC---------------------TGCCTCACATGGGGGGGCCCCGCGCCTGCACGGCTGCGCGTGCCCGAGCCCGGCTCACT--GTGGGTGAGCGGGGGGCAGACGGC-GGGTGTGGGGGCCGGCGGGCAGGCAGGGCACACGCCTGGAAGGCCAGACGCCGACC-GGCAGCCGCCTGCCCTCCCCCAGTCGCCCTGAACTACCAGTCGGAGGGGCGGATGCTGCAGCTGAACAGGGCCAAGTTCAGCGCCAACGGCAACTGTGGCTACGTGCTGAAGCCCCCGTGCATGTGCCAGGGTGAGGCGCTCGACGCTTGGGGCACACAGGGGCCGCCTG-GGGGTGCCCAGAACCCGGGGTCAGGGCTGCGCAAGACGGCAAGGGGCTG--GGCGG----CCTCG--GCAGCTGCCTGGAGGGT--CAGGCTGGG-----ACG-----------------------------------CGGTGCCCTCCCTGCAGGGGTGCAG-AGAAGGA--------CCCACCTCTGCCCGGAACCTGGGGTG----GGGGAGCGGGGAGCC---CTC-CCCCGG--CCCGGCCCCCTAAGATCCACGGGCAGCACTTGTCTGAGGGGTCC----CGGCCCAGCGACCCAGCACCCCGTGCCCGGC-CCCTCTCTGGGGCGCAGGGCTGTGCGGCACTT--GAGGC-TCCTTCCGGCCTCTGCATGCGAGC---GATG--------CCG-GG------------------GCCTGGGTGGGCACCTCCGGCCTCAGTCGCGCCGTTTCCTCCCCTTGGTGC-----TGC--------GCGACCCGGGCTCCTCCTCCCGCCCCT-----------------CCTGCTCCCGCG--CCT-GCCTCACC---------TGCACT-------G--GCCTCAGGGTGC---GCAGCCCACCGCATCCGGGACTCCCCGCCCAGAGGCAGGG-CTGCCTCTCGTGC-------------C---------TGCGGAGCCCTGCGGGTGCC----CACAG---GGGTGAGCAGG---C----ACGCAGGGGAGCAACCCGCCTGTCGAGACCC---CCGAGATGCTGCCTTCCCCTCCC-------------------------------------------------------- 6 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-188389_188849 85.5% 34.5% --------------------------GGCACTGGGGCGGGGCCTTAAGACCCCAGGGCCATGTGGAACGGCAGCTGCGGGGCTG-------C--G--GCGCACTCCCGGG----GCGCACGCGTGGG-GCCTGGCCTCACTGGCTCTG--GGACGTCCCGCCTCACACAGGACCCTGCTCCTGCGCGGCTGCGCGTGCCTGAGCCCCGCACACA--GTGGGTGAACGGGGGGCAGACGGT-GGATTTGGGGGCC--GCGGCAGGCAGGGCACACGCCTGGAAGGCCAGATGCTGACCGGACGGCCGCGTCCCCTCCCCCAGTTGCCCTGAACTACCAGTCGGAGGGGCGGATGCTGCAGCTGAACAGGGCCAAGTTCAGCGCCAACGGCAACTGCGGCTACGTGTTGAAGCCCCAGTGCATGTGCCAGGGTGAGGCGCGCGACGCTCAGGGCTCGCAGGGTTTGCCCG-GGGGAGCCCAGAGCCCCGGGGTCGGGCTGCACCAGACAGCAAGGGGCTG--CGCCG----CCTGG--GCAGCTTCCCGGAGGGT--CAGGGTGGG-----ATG-----------------------------------CGGCGCCCTCCCTGCAGGGGCTGCAAAGAAGGA--------CCCACTTCTGCCAGGAACCTGGGGGG----GGAGTGGG-GGGCCC---TCG-CCCAGC--CCGGCCCCCGTGAGATCCGCCTGCAGGACTTGTCTGAGG-GTCC----CGGCCCAGCGACCCAGCACCCCGTGCCCAGC-CCCTCTCTGGGGCGGGGGCTGCCTG-GCACGC--GAGGC-TCC-TCTGGCCTCTGCACAGGAGC---GGTG--------CCG-TGGGCC----TGGGCTGGGCCCGTTGGGAGCCGCCTTCTGCCTCAGACGCGCCGTTTCCTCCCTGCAGTGT-----TGC--------CTGACTCCAGCTTCTCCCCTTTCACCCCGCTCCCCTCCCGCCCCCTTGCTCCTACG--CCC-CCTTCACC---------TGCACT-------GGGCCCCCAGGGTGC---CCAGCCCGCTGTGTCCGGGACCTGCCCCACAGAGGCGGGG-CCGCCCCTCGTGC-------------C---------TGTGGAGCCTGAGGCCCACC----CGTGA---GAGGGTGGGCTCTGC----CCGCAGGTGACCAGGCGGAG--------------------------------------------------------------------------------------------- 7 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-254761_254927 90.0% 45.1% CTG---------AGGTGCATGGGGGGTGGCCAT---GCAGGCTGCAGGGGATGCTC-------------------TGCCGGGAC----GC----A--TGGCTGGCCCCT-----CATGGTGTGAGTCCTGGAGCCCTCTCATGGTGCA-----------TGAAT-GATGGGCAATTAGCA---GACTCATGGGCAGTCATGCA-GGGAGGCGGG--CGTGCCGT--GGCGGGCAGGCAGG-AGGCTGTGT--GGGCCTGGTGGACGGTGGCACCTGGAGGGCGGGGCACTGAC-CAGGACGGCCTCCTG-TGCCCCTGCAGTCGCCCTGAACTACCAGTCAGAGGGGCGGATGCTGCAGCTGAACCGGGCCAAGTTTAGCACCAACGGCGGCTGCGGCTACGTGCTCAAGCCTCCATGCATGTGCCAGGGTGAGGCGCTGGCTCCATGGCCTCCTGGGGCTCAGGAACACGGGGCTCGGGGGTAATAGTGGGCAGCTTCGGCAG------------GG--CTTCCTGGAGGGTCGGGCTCCCA------G--GATACTGGAA------------------------------------GGTGGGCGTGGGCACCTTCCCTGCTCAGAGTGCAGAGAAGGAC-------GCCAACCCTGCCAGGAATCTGAAGGT---GGGGAATTA--------------GGGAGCCCATCCCCCATGTTCCAGGCCCACATGAGCTTCGGGAACCGGGG--------GCCTGGTGCCAGCCGCCCCTGC------C-CCCTGTGCCC--GGCCCACCTGT---GGGCTC--AG----GCAG---CAGTGCCCTAGAC---------------------CTGGGTTTGGGCTGGCGTTTTA-GGGAG-CTGCCTCGTCCCTCTGAGGCACTTTGATTTTCTCCCTGATATGCTGCAAATGACTTCTGGGTTCTTTCCATTTAATC--CTAGCCCTCCCCCCA-CGCCCCTTCTCGGTTCCTATT-GCAT-CTTTATCTGTCTGCGCCCTACTCCAAGTTATCTGCCCGAGTAAGC---ACCTGGCTGTGCGGGTGGCAGGA---ACCCCCCACCTCACTGTGCCCCTGGGCACCAGCCCCCCA--------------------GCCAGAAGCAGTGTGACCCTCCCAC----GAGGGCCTGTGAGAGGGATGGGCTCTCTCCCATATTGTAGGGTG----GTCACCGAGGGGAC----------------------------------------------------------------- 8 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-203507_203852 88.2% 46.3% ---------------------AGGTTTGCCCAT---G----CTCTCCTGGGGGGGTTT---CCTGGAGGCTGGCTGTGCTATAT----GCCA--G--GGGACGTCCTGCCAGGACACATACACATAGCCCCAGTCCTGCACAGCTGTG-----------GCCTCCAGGGCCCAGTGCATAGTGGGCGAGTGGCCGACTTGTAGGTCGTTGTGCA-GGGGAGAGG--GCTGGTGTGACAGG-AGGCAGGTGGCCTCAAGCCTGAGGACACGTGCCTGAAGGACTGGGTACTGACCCGGGTGGCCTGTGTCCTCCCTCCACAGTGGCCCTGAACTACCAGACAGAGGGGCGGATGCTGCAGCTGAACCGGGCCAAGTTCAGTGCCAACGGCAACTGTGGCTACGTGCTCAAGCCCCAGTGCATGTGCCAGGGTGAGGCATTAAGGGCTTGGGTAGACCTCTTGGGAGGACCCTGGAACACTGGAGTTGGGGGC-------------------TGCACAAG--ATAGCAAAGGGGATGGGC-AGCTTTGGCAG-GCTTCCTGGAAGCTCATGCAGCTCCCAGGGTGCTGGGAG--------GTGGG----GGGAGTACTCCTCTGCTGGGGTGCAGTGAAGGAC-------CCCCACTCCACCGAGAATCCAGGGCCGTTCAGGAATTAGGGAGTCCTTCTGCTGTGGCCCAGACCCCATGTGAGAGTCCCTGGTAGGATTTGTCAGTG------------ACTTGGTGCCAGCCGTTCTCCG------A-C---------GCCTACCCACTGT---GCCCAA--AC----TCATCTGTGGGCCTCGGGCC------AAGTCCCTTTAGTCCAAGAGTATGGGCTGAGCAGTTTGAGGCG-CCTCCCC---TCCCCATCAGATGTCAGCCTTCTCCCTGACATGCTACAGGTGGCTGGCAGATTCCCCCCCACGTTAATGCCGGCCCTTCGCCCACTCCCTCGGCTCATGCAGCACC-ACCT-CTCACCTGCGCTGCGCTCTCCTGGAGGTTGTCTGCCCGAGCAAGG---CCCTGGCTGCTCTTTTCACTGG---------GACTCTATTACTGCCTTTAGGGACCCT--------------------------------------------------------GCTTGCCACTGGGAGGGACGGGCTTTGTGCC------------------------------------------------------------------------------------------------ 9 Miniopterus_natalensis-NW_015504651.1-691686_691846 85.7% 27.3% ------------------------------------CTTTGGACCTGCACGGTGTCCC---GCC-AACGTCGCCAGTCTGGCAC----AG-A--G--GTGGGGTCCTTGG----TCCTC--GGGGTGCCTGGGGGCTAGGGGAGCGGG----CCTTCTGCCGGGACGTGTGGCCCGGGTTGTGCACAATCCTCCTCAACCTCCGGGCCCCCGCT--TGTG---------TCCGCGATCGC-CAGCCTCACAGGCCGCGGTGCCGGGCTGGCGGGAGGTCATGGCCAGGAGCTGACTGGCCGCCTTGCGTCCCCGCCTGCAGTTGCCCTGAACTACCAGTCGGAGGGGCGGATGCTGCAGCTGAACCGGGCCAAGTTCAGCGCCAACGGCAACTGTGGCTACGTGCTCAAGCCCCAGAGCATGTGCCAGGGTGAGGCCCTGGGGACCCCCGGACACAGGGACAGGGCTGACCAGGGCGGGAGGGGGTCACGCTGGCACTGACACCCTGGCCGGGCCTGG--GAGGGGCCTCCGTA--GGAGCCACCCTCCTCCTC-CTCCCCCGGACACTTCCATTTGCTCCCTGTGC-----------TGAAAA-GACCTGGGTTTCCTCCAGTGGGATCCTACCCTCC-------------------T--CCCACGCCCT-CC----TGGCTTCTCCGGTGCTGACTT-TCTCGC--AGTGTCAGCTGACACAGGCTCCAGCTGCCCAGTCACCAGG-ACC----CCTCACCCTCCACCTGGCCCCGGTCCCCTCCCCGCCATGCTCCCAGGCTCCAAGCC--TCCCAC--CCAGA-GGTGGGGTGGCCCTGCACGCACGCTCAGCCCCCCTTGTTCACTGACACA----AGGGGACGAGCCC-----------ATGTCACAGGAT------GGCACCAAGGCGACCAGCGTACAGGTC--------CCAGCCCCTCCCCTTCCTCCCGGGCTGGGGGTCCCGCCCAGGA-AGTGGGGGAGGGGGCGG-GTGTGCCA--------------T--G----CAGNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNN---NNNNNNNNNNNNNNN----NNN-NNNNNNNNNNNNNNN---------------------------------------------------------------------------------------------- 10 Bos_indicus-NC_032665.1-201023_201144 83.8% 28.0% ------------------ACCAGGATGGCACTG---GTGGGGGCCGCGGGGGTGGGGG---CCT-TAGGACCCCAGGGTAAGGT----GG-T--G--AAAGCCCCAGTCT----GGCCA--AGCTC--TGCCCCTGTGCAGGGGCCGC---------------------TGTGCAGGCTCTAGGAAAGTCCTGCCGGGTCGCAGGGCCCTGGTT--GTGCCTAG----TGTGACCCTAGC-GGACTTGGGCTCACTAGCAGTGCAGAGGTGGGATGCCTGCACCCCCCACTGACCTGGTCACCCCGCGTCCTTCCTGGCAGTCGCCCTGAACTACCAGTCGGAGGGGCGGATGCTGCAGCTGAACCGGGCCAAGTTCAGCGCCAACGGCAGCTGCGGCTACGTGCTCAAGCCTCAGTGCATGTGCCAGGGTGAGGACGCGGCCCGGGAACCCCGACCCTGCCGGGATCTGGAGCCCCTCCCCAGCCCGC----CCCTAC-AYGAGGGTCCCTGGGTGA--GGCGC-----CCTT--GAGCGAGGTKGGCTG-------GGCA--------CTTGCTGCTCCTTCTCA-----------GACCCT------CAGCTTCTCCCGTGTGTGCTGAAAGCAACT--------TGTGGA--------TCTTTTCCT-GC----TGTCACCCTGGA----CCCTA-TCACCG--GGCACC--CAGTCACCCATCCAGAG---------GCAGTGTGGC----CTCGCACCCACACTGAGCCCCTGTGGT--TCACCCATGAGG-------------------------AAACG-AGCTGGGTGCACATCACGGGGTGGTC----------------------A------CAGAGGTGACC-----------GGCCCCTMGGCACCCCTGCATTGGAGTGCT--------------G-----------CCTCCCGTCCCCCTCCTGCACCTGGGACTCCCGTCCAGTC-AGTGGGGGAGAGGTGGG-AGTGGGTGCCTTGGGGCTGCCCCAGCCAG-CCAGTGGGGGGCTCACCCTGCCTGCTCATCCTCTTGCCCCGGCCCCCCACAGGCATCTTCAACCCTAACTCTGAGGACCCCCTGCC---------CGGGCAGCTCAAGAAGCAGC------TGG---TGCTGCGGATCATCA----GTGGTCAGCAGCTGCCCAAGCCGCGGG-------ACTCGATGCTGGGGGACCGAGGGGAGGTAGGTG-GGAGGGCCTGGGCGGGCGGGA------------------------ 11 Myotis_myotis-NW_023416355.1-1020617_1020750 80.8% 30.8% -------------------------TTTCTCTGCGGCTCTGGACCTGCGCAGTCTCCT---GCC-AACTTCCACCGCCAGGCGC----GG-G--G--ATGGGGTCCTTGT----CCTCG--GGCGC--CTGAGGGCTGGGGGGCCGTCTGCCTGGACGGATGGGACACGTGGCCCTGGCTGTGCGCACCTGTGAGCCCCAGGGCCCC---------CGCTGTGT----CAG-------CG-ACCGCCGGGCTCAGGGGCACCGTGCAGGGCCCG-GGGAGGTCACGGCGAA--GACCCGCCCGCTCTCGTCCTGCCTGCAGTTGCCCTGAACTACCAGTCGGAGGGGCGGATGCTGCAGCTGAACCGGGCCAAGTTCAGCGCCAACGGCAACTGCGGCTACGTGCTCAAGCCCCAGTGCATGTGCCAGGGTGAGGGACCGGGCACCCGGGGGGGGGGACGGGGACGGGCTGCAGGGCAGGGGTTCCG---CTGGCACCTGCGCCCCGGCCTTCGCAGG--AGCTGCCC-TCCTC--CGACACCTCGGCGTT-------CTCC--------CGGCTTCCTCCGTGC-------------------------GACCCTCGCCGCCC----CCACACCCTCCT--------GGCGCCTCTCG--CACCCAC-------------GTTCTCAGCCGGCTCAGG--------------------------CCTCACTGCCCTTTC--ACCGGGACCC----CTTCCCCCGGCCCCTGCCCCCCTCACTCCCCCCCAAAGGCG------------------------------------GGTGGCCTTGCCCACGTGCTCAGCCC--TTCGCTCACTGATGCG----AGGGGACGACACC-----------GGGCTGCACAGGGACCGGCGTGCAGGTGCCAGGGCGGGCGCTGCG--------AGGCTGAC---CCTCCCTCCTGGGCTGGGCACCTCCCA---TA-GGTGGGGGTGGC-AGGG-CGCCGTGC--------------A-GC----CCGTGCTG-GGGGGTCTGCCCTGCCGGTCAGCCTCCTGCCC---CGCCTCAGGCATCTTCAACCCCAACTCGGAGGACCCCCTGCC---------CGGGCAGCTCAAGAAGCAGC------TGG---TGCTTCGCATCATCA----GCGGGCAGCAGCTCCCCAAGCC-------GCGCGACTCGATGCTGGGGGACCGCGGGGAGGTAGGAG-GGCGCCGGGCACGGGGCGGAGGCGGGCCGGCCC---------GGC 12 Eptesicus_fuscus-NW_007370721.1-187115_187239 80.5% 30.0% CTGTGCTCTGAGCGCCTCTGCTTGCTTTTCTTGCGGCTCTGGACCTGCCCAGTGTCCT---GCC-AACTTCACCCGCCTGGCGC----GG-G--G--CTGGGGTCCTCGT----CCTCG--GGCGG--CTGAGGCCTGGGGGGGCCGTCTGCCT----GGACGGACGCATGGCCCTGGCTGTGCGCACCTGTGAGGGGTGAGGGGCA---------CGGGG-----------------------------------ACCAGGGTGCAGGGTGGC-GGGAGGTCACGGCCGGGCACAGACCCCCTCTCGTCCTGGCCTGCAGTTGCCCTGAACTACCAGTCGGAGGGGCGGATGCTGCAGCTGAACCGCGCCAAGTTCAGCGCCAACGGCAACTGCGGCTACGTGCTCAAGCCCCAGTGCATGTGCCAGGGTGAGGGACACGGGGCCCCGGGGTGAGGGACACGGGACCCCGTGGTGAGGGACACAGGGCCCCGGGGTGAGGGACACGGGACCCCGTGG--TGAGGGGC-ACAGG--GCGCAGGGTGAGG---------GACA--------CGGGACCCAGGGTGAGG-----------GACACG-----GGACCCAGGGCGGGCGGGGCTGCACGGCAGG--------GGTCCCGCTGG--CACCTGCGCC-CT----GGCCTTCGCAGGATCCTCCCT-CCT-----------------CCTCCGACACCTGGGTTTTC--TCCCGGCCTC----CTGCCCCCTCCCCCCAGGCATCTT---CAACCCCAACTCCG----------------------------------AGGACCCCCTGCCCGGGCAGCTCAAGAA--GC----AGCTGGTGCT----TCGGATCATCAGC-----------GGGCAGCAGC---------------TCCCCAAGCCGCGCGACTCG--------ATGCTG--------------------GGGGACCGCGGG---GA-GGTAG------G-AGGG-CGCGGGGC--------------G-CG----CGGGGC---GGAGGCGAGCCCGGCCGGCCCGGCGTCACCCTGTCCTCCGCGCAGATCATCGACCCCTTCGTGGAGGTGGAGGTCATCGGGCTCCCGGTGGACTGCAGCAAGGAGCAGACCCGCG---TGGTGGACGACAACGGTGAGGGCGCGCCGGCCCCCGTGCCCGCCGGCCCCCGGCCCCCAGGGTTGCTCCCCTCAGCCAGCGAC----------CCCGTCCGGGAGGAGGCTGTGGGCCC------------- 13 Mus_caroli-NC_034573.1-187749_187870 84.4% 32.5% ----------------------------------------------------ACAACCCTTCTGGAACGCTGGTTGCCAGATGG----GTGCGTGTAGCCATGTGGTTCA-GGGTGGGATGGTGAGGAGAGCCATCTCCGAAAGCCTT-------TAGCAACCAGGGTTGGGCCTTCCAGACCCTAGGCTGGCATGAGAAATGTCCTGTCTGCCCCTGTACTCCGCAGCAT---GTATGCTGGGCTTTCAGCCCCAGAACCCATACAGAAGAGCGTGTGAACATCACTGACCTGCCTGGGTTTC---TATCTTCCCTTCAGTTGCCCTGAACTACCAGTCAGAGGGGCGGATGCTACAGCTGAACAGGGCCAAGTTCAGCGCCAACGGTGGCTGTGGCTACGTGCTCAAACCCCAGTGCATGTGCCAGGGTGAGGGACTCAGGCTGGGAGGCGGGGGGGCTCCCATGAGACTACCCTGGATACTGGGGTGGTGGGTAAACAGAGCAGAGGGGAGGGTCAGTCTGAGACTGAGCTG-CCTGGATACTGGAGAGTT-AGAGTGGG------GAGCCTGCTTACTGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTG---TGTGTGTGTGTATGCAGTGAATTCTATGCCAAGG-------ACCCCCGAGGG-TGGGAGTTA-------GGAAGCTCCTCTGTTG----GAC-CCTGGAATCCAGGCTGCATGAGATTCGGGAGCAGCACTTGTGTGAGGTCCTGGTATGCTCCAGGAGATGAAGGTCCAGGTGCTGGACTAAGGATGCT-CAGGTGA-----------------CATTTCTGTCCCATGGGCTTTCCCCGGTGTGCTGTACAGGC------TTCTGTA-------TGCACA-------------G--CGCCTTTTCA---TTACACTTCTTGGCTGCATTGAGCTATGTTTCCATGCATGGTACGC--CCTTGACATTAGCAGCCTGACCACCCTGTGATC----GGGGTCTC---------CTGCC-CACTCCAGTGCAGCTATCCTGTCCCAGGCCAAAGCTTTC----TGACCT-TTCCCTAAGGCTCTTTTTCACCAGAGCCCC-ACAGACCAACAGGTA-GGGGTGTG--------------GTGTCAGCTGTGTACTTGGC------TCA---C-ACCTGCATCCTCT----CAGGTG----------------------------------------------------------------------------------------------------------- 14 Mastomys_coucha-NW_022196900.1-188361_188482 83.3% 31.5% ----------------------------------------------------------CTTCTGGAACGCTGGTTGCCAGATGG----GTGCGTGCAGGCATGTGGTTCA-GGGTGGGATGGTGAGGAGGGTTGTCTCCAAAGGCCTT-------TAGCAACCAGGGTGAGGCCTTTCAGACCCTAGGCTGGCATGAGAAACATCCCGTCAGCCCCTGCACTACACTACTAGCACGTGACTAGGCTTTCAGCCCCAGAACTCATACAGAGGAGCATGTGAACATCACTGACCTGCCTGGACTTCTTCTGTCCTCTCTTCAGTTGCCCTGAACTACCAGTCAGAGGGACGGATGCTGCAGCTGAACAGGGCCAAGTTCAGCGCCAATGGTGGCTGTGGCTACGTGCTCAAACCTCAGTGCATGTGCCAGGGTGAGGGACTCAGGCTGGG------GTGGGCTCCCATGAGACTACCCAGGATACTGGGGTAGTGGATAAACAGAGTGGAGGGGAGGGTTAGTCTAAGACTGAGATA-CCAGGACACTGGAGGGTT-AGAGTCGG------GTACCTGCCTACTGGTGTGCGTATGTGTGTA-----------------------GTGAACACTATGCC--AA-------GGACCTGAGGG-TGGGAGTTA-------GGGAGCTCTTCTGTTA----GGC-CCTGGGCTCCAGGCTACATGAGATTCGGGGGCAGCATTTGTCTGAGGTCCTGGTATGCTCCAGGAGATGCAGGTCCAGGTGCTGGACCTCAGTCCCT-GATGGGCATGCTCAAG----AGCCATATACTGTGCCAAGGGATTCTCCCAGTGTGCAGCACAGGC------TTCTGTC-------TGCTCA-------------G--TGCCTTTTCA---TTACACC--TCAGCTGCACTGAGCTGTGTTTCCCTGCATGGTGTGC--CCCTGATGTTAGCAGTCTGACTACCCTGTGACC----AGGGTCTC---------CTGCCCTGCTCCAGTGCAACTATCCTGCCCCAGGCCAAAGCTTTC----TGAGCC-TTCCTTAGGGCTCTTTTTCACCAGAGCCCC-ACAGACCAACAGGTA-GGTGTGTG--------------GTGTGAGCTGTGAACTTGGC------TCA---C-ACCTGCACCCTCT----CAGGTGTCTTCAACCCCAACTC------------------------------------------------------------------------------------------- 15 Grammomys_surdaster-NW_021620991.1-188119_188240 84.5% 30.9% -------------------------------------------------TCCACAACCCTTCTGGAATGCTGGTTGCCAAATGG----GTGCGTGCAGGCATGTGGCTCA-GGGTGGGATGGTGAGGAGGGCCATCTCCGAAGGCCTT-------TAGCAACCAGGGTGGGGCCTTTCAGATCCTAGGCTTGCATGAGAAACACCCCATCTGGCCCTGTA----CTCCTAGCACGTATGCTGGGCTTTCAGCCCCAGAACTCAC--AGAAGAGCATGTGACCATCACTGACCTGCAAGGGCTTC---TGTCTTCCCTTCAGTTGCCCTGAACTACCAGTCAGAAGGGCGGATGCTGCAGCTGAACAGGGCCAAGTTCAGCGCCAACGGTGGCTGTGGCTACGTGCTCAAACCGCAGTGCATGTGCCAGGGTGAGGGACTCAGGCTGGG------TTGGGGTCCTGTGATACTACCCTGGATACTGGGGTGGTGGGTAAACAGAGCAGAGGGTCAGGTTGTGCTGAGACTGAGCTA-CCAGGACACTGGTGGGTT-AGAGTAGG------GTATCTGTCTACTGGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTG---TGTGTGTATGTGTGTATGTGTGAGTATTTGTGTG-------TGTGTGAGTAT-GTGTGTGTGAGTATTTGTGTGTGTGTGAGTAT----GTG-TGTGTGAGTATGAGTGTATGTG--------TGAGTGTGTGTGTGAGTATGTGTGTGTATATGTGTG-------AGTG----TGTGTGTATGTGTGTG-TGTGAGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGT-GTGTGAGTATGTGTGTGTGTGT-----GAGT------ATGTGTG-------TGTGTGA------------G--TGTGTGTGTA-T-GTGTGTGT-GTGTGCGCAGTGAACCTTA-------GGCCAAGG-----ACCCGTGGGTGGGAGTTAGAGAGCTCGTCTATT----GGGCGCTG--------------------GGTTGCAGGCCTC--------GTGAGATTTATGG----GCAGCACTTGTCTGAGGTCCTTGTGTGCTCCAGGAGATGCAGGCCAGGTGCTGGACCTCAGT--------------CCCTGATTGGCATGCTCGGA------AGC---C-ATCTTCTGTCCCA----CGGGGTTCTCCCAG--TATGCTACACAGGCT---TCTGTCTG----------------------------------------------------------------------- 16 Enhydra_lutris-NW_019154122.1-200693_200848 84.0% 31.3% ---------------------------GTC------CTGGGGACCCC-GGGACGAGGT---GGG-AAAGACT-----GAGGCAC----AT-C--T--GCCACGTGGTTCT----CGGGAC-GGTGGGGTCTGGCTGTGCTGGGCTCCAGGAGCCTTCCGCCGGGATGCCTGGCCTGGGTTGTGCATGAGGGTGAGCCCGGGGCCGGCTCCCGTA--GG-----------TGAACGCTGGA-CTCGGGGGCAGCTGAGCAGGGCAGGTGGGGGTGGGGTGCGGGCCGGGCGCTGACAGGCCGCCTCGTGTCCCCCCCCATAGTCGCCCTGAACTACCAGTCGGAGGGGCGGATGCTGCAGCTGAACCGGGCCAAGTTCAGTGCCAACGGGAGCTGTGGCTACGTGCTCAAGCCCGAGTGCATGTGCCAGGGTGAGGCCCGCGGCC-------------CGGGACGCGGGGCGGGCAGGGGCGGCTGCCACAGGCTCACCTCCAAAGTAGGGGTGCCAGA--AGTGGGGGTACGGC----AGAGGGCCCCATG--------CT--------ACCAGGGGCCGGCAGGGA-----------TGAATAAGGGAGACCCTTCACACACCTGGCCCCCACAAGGCCCCCAAGAGGAAACGTCTGGGGCGACTGCCCATGG----GGCAT-CAGAGCTTCCCAATC-CCT-----------------TCCCGGAGCCTCCAGCTTTC--TCACTGCC-----------AGCCGCCAGCAGCCGTGTGGAGCTGTCCCCCTTTTAACCTGGATCCT------TCCCAG--GC--C-TCCTGGCCGGCCTTGGCCACCTTCACTGTACCGCCTGGGGGCACGGGCCTGCAGAGCCCCATCACCGGG-G-AGCCCGGCGTGTGGAGGGTCCCGAGGACGGTCCCAGGGGAGACCGGCATG---CAGACCACTGGTGCGCCCGTGCTGGAACCCTGCTCCTCTGCCCCTGTC-CCCGGCCCGGGACTCCT-GGCTAGTC--AACGGGGTGCAGT-GG----AGTGCCCCGTGCCACCACAAACCCCTCAGCCTGGCGCCCTGGCCCCCCCCAGGCGTCTTCAACCCCAACTCTGAGGACCCTCTGCC---------CGGACAGCTCAAGAAGCAGC------TGG---TGCTCCGCATCATCAGCGG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 17 Molossus_molossus-NW_023425372.1-186362_186497 83.4% 29.9% 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18 Peromyscus_leucopus-NC_051064.1-188612_188733 83.3% 32.6% -----------------------------------------------------CAGCCCTTCTGGAATGCTGGCTGCCAGATGGGTGCGTGCAGGCAGGCATGTGGTACA-GGGTGGGATGGTGAGGAGGGCCATCTCTGACGGTGTT-------TGGCAACCAGGGTGGGGCCTTTCAGACCCTAGGGTGCATGAGAAACACCGTCT---GTCCCTGCA----CTGCTAGCATGTATGCTGGACTTCCAGCCCCAGAACTCGTGCAGAAGAGTGTGCGAACATTACTGACCTGCATGGGTGTC---TGTCTTCCCTCCAGTTGCCCTGAACTACCAGTCAGAGGGGCGGATGCTGCAGCTGAACAGGGCCAAGTTCAGTGCCAACGGTGGCTGTGGCTACGTGCTCAAACCCCAGTGCATGTGCCAGGGTGAGGGGCTCAGGCTGGG------GTGGGCTCCTGTGAGACTGCCCTGAATACTGGGGTGGTGGGTACACAGAGCAGAGGGGAGGGTCAGGCTGAGACTGAACTA-CCAGGACACTGGGAGGTT-AGAGTGGG------ATAACTGCCTTCAGGGGGTGCAGTGACCAC-----------------------------TAACTACACCAGG-------GGCCTGAGGGT-GGGGATTTA-------GGGAACCCCTCTGCTG----GGC-CCTGAGCTCTAGGCTGCTTGAGATTCCGGGGCAGGACTTGTCTGGGGCCCTGGTGTACTCTAGGAGATGCAGGCTCAGGTGCTGGACAGTGCCTGAG-CATCAGTCCCTGATGGG-CATGTCCAGGAGCCATCCATAGTACTCTCCCAGAGTGCTGTGGAGTC------TTCCATA-------TGCATT-------------C--TGTCTTCTCATT-ATGCCCCTCTTGATTGCATTGAGCTGTGTTTCACTTCATGGTGCAC--CCCTGACATTAGCAGCCTGAGCAAGTCCCCACCTACCCTGTGACC---------TGCCCTCACTATGATGCAGCAATCCCATTCCAGACCAAAGCTTTC----TGACTG-TCCCATGGGGCTGTTTTCTGCCAGAGCCCC-ACAGATCAATAGGTA-GGGTTGTG--------------CTATAAGCTATGCATTTGGC------TCA---C-GCCTGTGTCCTCT----CAGGTGTCTTCAACC-------------------------------------------------------------------------------------------------- 19 Arvicanthis_niloticus-NC_047662.1-187372_187507 83.4% 30.1% 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20 Meriones_unguiculatus-NW_018657773.1-186840_186956 83.6% 31.5% 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21 Sus_scrofa-NC_010448.4-188499_188621 83.3% 29.1% 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22 Cricetulus_griseus-NW_003616165.1-63644_63760 83.7% 31.6% 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23 Nannospalax_galili-NW_008355419.1-186455_186571 80.3% 26.6% 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24 Mustela_erminea-NC_045623.1-200013_200160 83.7% 30.8% 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25 Echinops_telfairi-NW_022111357.1-186182_186303 82.8% 30.0% 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