Job

PLCH2_human-child_59

Submission Status: Success!

Full Status

1. Iteration

Blast

Select Sequences

Alignment

RNAcode

Input

CCTGGCCTCCTCTCCACATAGCGATTCTAGGCCAGACCCAGGCCCCGAGCCCAGCTCTCCCCTGCTCAGAACCTTCCAGAAGCCCCCACACCTGCCACGCTTGGCAGGCCACGTCATCCTCCACTGCACACAGTGCCTAGGGACTTTGCACCTGCTGGTAGCTCCCAGCCAGCCCACATCCTGCCCAGCACTCAGGTTTCCGCAGCCCGCGGCCCAGTCTGGCGTCCGTCTCTGATGGTTCGGGGCCTGCTGCGTGAATTAATGAGGCTGCCCGAGCCCTGGAGCCCGTCTCACGGAGCTGGGTGCCAGGCTGGCCCTGGACGGGAGGGGTTCTGACCCCCTGCACCTGCCACAGGGCGACCCGGCAGAAGAAGACCATGAAGCTGTCCCGGGCCCTCTCTGACCTGGTGAAGTACACCAAGTCCGTGGCCACCCACGACATAGAGATGGAGGGTGAGTGGCTCGGGGACCTGGGGCCACGGGCGGAGGCCTCCCTGTCCCCCATCCCTGCTATGCTGCTGGGCGCCGGGCGAGGTCGAGGACTGGCAGTCTGATGCCCGGTCACCGGCGCCACAGCGGCGTCCAGCTGGCAGGTGTCGTCCTTCAGCGAGACCAAGGCCCACCAGATTCTGCAGCAGAAGCCGGCGCAGTACCTACGCTTCAACCAGCAGCAGCTCTCCCGCATCTACCCCTCCTCCTACCGTGTGGACTCCAGCAACTACAACCCGCAGCCCTTCTGGAACGCCGGCTGCCAAATGGGTGGGTGCGGGCATGGTGCGCTGGGTGTGGTGGGGAGGGCTCGGCTCAGACGGTCCCTGAAGCCCAAGGGGCGAGCAGGGGACCCGCTGGGGCCTCGGTTCTGTCCTGGGCTCTATTGCCCTTGGAGCCTCCACACCTCTGTGGCATGCTGCCGACACCAGGCTGCCACTGACACCAGGCTAGCACTGGGGCAGGGTCCTTCAGGCCTTGTGGGGGATGTGGGAGCGATGGTGCAGGCCTG

Selection Arguments

Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.

Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.

Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.

Results

Coding Regions.

High Scoring Segment plot

Distribution of HSS in the input sequence

HSS Segment Plot

Filter regions

p-val
Select the result by p-value. Show only results which have a lower p-value than provided. Must be above 0 and below 0.05. Check the box if you wish to see only the best segment in a group of multiple overlaping segments. Often a strong conservation signal can be observed as a shadow on the opposite strand.

Result Table

HSS id Strand Frame Length Start End Score P Show Result
1 0 + 2 61 29578 29760 32.231 5.247e-05 Plot

Predicted protein sequence Download sequences as fasta

HSS id Sequence
1 0 ASSWQVSSFSETKAHQILQQKPAQYLRFNQQQLSRIYPSSYRVDSSNYNPQPFWNAGCQMG

Alignment Info

Alignment Tree

Alignment Tree

Full Alignment

Reference sequence (1): Target
Identities normalised by aligned length.
Colored by: consensus/70%
                                                          cov    pid  1 [        .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         .         .         .         4         .         .         .         .         :         .         .         .         .         5         .         .         .         .         :         .         .         .         .         6         .         .         .         .         :         .         .         .         .         7         .         .         .         .         :         .         .         .         .         8         .         .         .         .         :         .         .         .         .         9         .         .         .         .         :         .         .         .         .         0         .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :       ] 1258
 1 Target                                              100.0% 100.0%    ------------------------------------------------CCTGGCCTCCTCTCCACATAGCGA-----------T-TCTAGGCCAGAC------CCAGGCCCCGAGCCCAGCTCTCCCCTGCTCAGAACCTTCCAGAA------------GCCCCCACACCTGCCACGCTTGGCAGGCC-ACGTCAT------CCTCCAC------T--------GCACACAGTGCCTAGGGACTTTGCACCTGCTGGTAGCTCCCAGCC--------AGCCCACATCCTGCCCAGCACT-CAGGTTTCC-GCAGCCCGCGGC-------CCAGTCTGGCGTCCGTCTCTGATGGTTCGGGGCCTGCTGCGTGAATTAATGAGGC----TGCCCGAGCCCTGGAGCCCGTCTCACGGAGCTGGGTGCCAGGCTGGCCCTGGACGGGAGGGGTTCTGACCC---------------------CCTG-CACCTGCCACAGGGCGACCCGGCAGAAGAAGACCATGAAGCTGTCCCGGGCCCTCTCTGACCTGGTGAAGTACACCAAGTCCGTGGCCACCCACGACATAGAGATGGAGGGTGAGTGGCTCGGGGACCTGGGGCCACGGGCGGAGGCCTCCCTGTCCCCCAT---CCCTGCTATGCTGCTGGGCGCCGGGCGAGGTCGAGGACTGGCAGTCTGATGCCCGGTCACCGGCGCCACAGCGGCGTCCAGCTGGCAGGTGTCGTCCTTCAGCGAGACCAAGGCCCACCAGATTCTGCAGCAGAAGCCGGCGCAGTACCTACGCTTCAACCAGCAGCAGCTCTCCCGCATCTACCCCTCCTCCTACCGTGTGGACTCCAGCAACTACAACCCGCAGCCCTTCTGGAACGCCGGCTGCCAAATGGGTGGGTGCGGGCATGGTGCGCTGGGTGTGGTGGGGAGG----GCTCGGCTCAGACGGTCCCTGAAGC-CCAAGGGGCGAGCAGGGGACCCGCTGG---------GGCCTCG----GTTCTGTCCTGGGCTCTA--TTGCCCTTGGAGCCTCCACACCTCTGTGGC-A------TGCTGC-------CGACACCAGGCTGCCACTGACACCAGGCTAGCA--CTGGGGCAGGGTCCTTCAGGC--CTTGTGGGGGATGTGGGAGCGATGGTGCAGGCCTG---------------------------------------------------------------------------     
 2 Mandrillus_leucophaeus-NW_012103199.1-221930_222871  99.5%  87.6%    ---------------------------------------------GACCCCGGCCTCCTCTCCACATAGTGA-----------T-TCTAGTCCAGAC------CCAGGCCCTGACCCCAGCTCTCCCCTGCTCAGAACCTTTCAGAA------------GCCCCCACACCTGCCACGCTTGGCAGACC-ACATCAT------CCTCCAC------C--------GCACACAGTGCCTGGAGCCTTTGCCTCTGCCGGTAGCTCCGAGCC--------AGCCCACATCCTGCCTGGCACT-CGGGTTTCC-GCAGCCTGCAGC-------CCAGTCTGGGGTCTGTCTCTCAGGGTTCAGGGCCTGCTGCGTGAATTAATGAACC----TGCCTGAGTCCTGGAGCCCGTCTCACGGAGCTGGGTGCCAGGCTGGCCCTGGATGGGAGGGGTTCTGACAC---------------------CCTG-TACCTGCCACAGGACGACCCGGCAGAAGAAGACCATGAAGCTGTCCCGGGCCCTCTCTGACCTGGTGAAGTACACCAAGTCCGTGGCCACCCACGACATAGAGATGGAGGGTGAGTGGCTCAGGGACCTGGC---ACGGGTGGAGGCCTCCCTGTCCCCAAT---CCCTGCTATGCTGCTGGGCGCCGGGCGAGGTCGAGGACTCGCAGTCTGACGACCGGTCACCGGTACCACAGCGGTGTCCAGCTGGCAGGTGTCGTCCTTCAGCGAGACCAAGGCCCACCAGATTCTGCAGCAGAAGCCGGCGCAGTACCTGCGCTTCAACCAGCACCAGCTCTCCCGCATCTACCCCTCCTCCTACCGCGTGGACTCCAGCAACTACAACCCACAGCCCTTCTGGAACGCCGGCTGCCAAATGGGTGGGTGCGG-CGTGGCGCACTAGGTGTGGTGGGGAGG----GCTCGGCTCAGAGGGTCCCTGGAGC-CCAAGGGGTGAGCAGGGGACCTGCTGG---------GGCCTTG----GTTCTGTCCG-AGCTCTC--TTGCCCTTGGAGCCTCCACACCTCCGCGGC-G------TGCTGC-------CGACACCAGGCTGCCACTGACACCAGGCTGCCA--CTGACACCAGGCTGCCACNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------------------------------------------------------------------------     
 3 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-201160_202154     99.5%  85.3%    -----------------------------------------------CCCTGGCCTCCTCTCCACATAGTGA-----------T-TCTAGGCCAGAC------CCAGGCCCCGACCCTAGCTCTC-CCTGCTCAGAACCTTCCAGAA------------GCCCCCACCCCTGTGACGCTTGGCAGGCC-ACGTCCT------CCTCTGCAC---AC--------ACACATGGTGCCCAGGGCCTTGGCATCTGCTTGTAGCTCCGAGCC--------CGCCCACGTCCT-GCTGGCACT-CGGGTCTCC-GTGGCCTGCGGC-------CCAGTCTGGGGTCTGTCTCTGAGAGTTCAGGGGCTGCCGCGTGAATTAACGAACC----TGCCCGAGCCCTGGAGCCCATCTCATGGAGCCGGGTGCCAGGCTGGCCCTGAATGGGAGGGGTGCTCACCC---------------------CCTGCCACCTGCCACAGGATGGCACGGCAGAAGAAGACCATGCAGCTGTCCCGGGCCCTCTCCGACCTGGTGAAGTACACCAAATCCGTGGCCACCCACGACATAGAGGTGGAGGGTGAGAGGCTCGGGGACCGGGGCCCACGGGCGGAGGCCTCCCTGTCCCCTAC---CCCTGCTGTGCTGCGGGGTGCCGGGCGAGCTCCAGGACCCGGCGTCTGACGGCCGGCCCCCGGCGCCACAGCGGCGTCCAGCTGGCAGGTGTCGTCCTTCAGCGAGACCAAGGCCCAGCAGATCCTGCAGCAGAAGCCGGCGCAGTACCTGCGCTTCAACCAGCAGCAGCTCTCCCGCATCTACCCCTCCTCCTACCGCGTGGACTCCAGCAACTACAACCCGCAGCCCTTCTGGAATGCCGGCTGCCAGATGGGTGGGTGCGGGCACGGCGCGCTGGGGGCTGTGGGGAGG----GCTCGGCTCAGACGGTCCCTGAAAC-CTGAGGGGCAAGCAGGG-ACCCGCGGG---------GGCCTTA----GTTCTATGCTGGGCTCTC--TCGACCTCGAAGCCTCCACACCCCCGAGGC-C------TGCCGC-------CCACACCAGGCCGACACTGACACGGGCTGGCAC--TGGGGCACAGCCTCTAAGA----CCTCCGGGGGCTATAGGAGAGTTAGTGCAGGTCCG---------------------------------------------------------------------------     
 4 Lemur_catta-NC_059130.1-186123_186602                85.5%  40.9%    ------------------------------------------------------------------CTCAGAAC-C-----TTC-CAGAAACCCCCA--CATCT-CTCAGCGCAGCCCTGGCCCCACGTCTACCTGAGT-GGGT-GT-----------TGTCCTCCCGCACAC-CTACGCGAGGGCCCCGGGCCTT------TCTGGC-CACTGCC---AGCCCAGCCCGCAG-CCCACCTGGCGCTCGCATGTCCTTGGCCCCCAGCACGGTCTGGGG---GCGTCTCTGGGGCTCGGT-GCCTGCCCCCAGC--ACCAT-GCGGTGTCCA-CGCCACGCCGGGAATCAGTGGCGTGTGGCACGGTGGACACGTGCTGGATGCTG----------------------------CTGCCTGTGC--CCTGGAGCCCGTCTCCGGGGCTGGCGCC-AGGACGGCC-CCCCAGGCC-CCTGACCCTGTGGCCCCCGCAGGACGACCAGGCAGAAGAAGACCATGAAGCTGTCCCGGGCTCTCTCGGACCTGGTCAAGTACACCAAGTCCGTGGGCACCCACGACGTGGACTCGGAGGGTGAGGGGG-CGCGGGTGGGGCTGGGTGG---------GGCCTCCCTGTCCCAGCTCCGGC-CGCACCGTGTGGTGCCCGGAGGACCCAAGGACGCAGAGTCTGACGCTGGTGGCTGGCGCCACAGTGGCGTCCAGCTGGCAGGTGTCCTCCTTCAGCGAGACCAAGGCCCACCAGATCCTGCAGCAGAAGCCGGCCCAGTACCTGAGCTTCAACCAGCACCAGCTGTCCCGGGTCTACCCCTCCTCCTACCGCGTGGACTCCAGCAACTACAACCCACAGCCCTTCTGGAACGCCGGCTGCCAGATGGGTGGGCACCCAGAGCTGCGGGGGGCTGGGACCGGGGGCCTTGG---C-TGTCC-------------C-TGGCTCTCTCCAGGC---------------------------------------------------------------T-GGCACTGGGGCGGGGCC-GTAAGACCCCGAGGCCCTGTGGAACGGCAGCTGCAGGGCTGCTGCGCACTCCT----GGGGGCACGCGGGGGGGCGTCCTGCCTCACATGGGGG-----GGCCCCGCGCCTGCACGGCTGCGCGTGCCCGAGCCCG--GCTCACTGTGGGTGAGCGGGGGGCAGACGGCGGGTGTGGG----------     
 5 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-187592_188074   88.7%  44.3%    ------------------------------------------------------------------------AC-C-----TTC-CAGAAGCCCCCA--CATCT-CTCAGCGCAGCCCTGGCCCCATGTCCGCCTGAGC-TGGGCGC-----------CCTCCTCCCGCACAC-CCACCCGAGGGCCCAGGGCTTT------TGCGGCCACGGGGC---AGCCCAGCCCGCAT-CCTGCCTGGTGCTCGCATTTCCTCGGCCTCCGGCGCGGCCTGGGG---TCGTCTCTGGGGGCTTGGCGCCTGCCCCCAGCACCACCC-GGGGTGTCCA-CGCCACACCGGGCACCGGCAGCATGTGGCGCGGTGGACACGTACTGGATGCGA----------------------------CGCCGGTGCC--CTGGAGCCCATTTTGCAGGGCTGGCGCC-AGGCCGGCC-CCCCAGGACCCTGACCCCTGTGGTCCCCACAGGACGACCAGGCAGAAGAAGACCATGAAGCTGTCCCGGGCTCTCTCGGACCTGGTCAAGTACACTAAGTCCGTGGGCACCCACGACGTGGACTCGGAGGGTGAGGGGCGCACAGGTGGGGCTGGGCGG---------GGCCTCCCTGTCCCAACTCCGGC-CGCGCAGTGTGGTGCCCGGAGGACCGGAGGACGCAGTGTCTGACACTGGTGGCCGGCGCCACAGTGGCGTCCAGCTGGCAGGTGTCCTCCTTCAGCGAGACCAAGGCCCACCAGATCCTGCAGCAGAAGCCGGCCCAGTACCTGAGCTTCAACCAGCACCAGCTCTCCCGGGTCTACCCCTCCTCCTACCGCGTCGACTCCAGCAACTACAACCCACAGCCCTTCTGGAACGCCGGCTGCCAGATGGGTGGGTGCCCAGAGCCGCGTGGGGGGCTGCGGACGGGGGGGCC---T-TGGCC-------------G-TCTCTTTCTCGCCCC------------TCGCTTTGTGGAAGCT--CCG-TGGCGTGTGGCCATGA-----CACCAGTCT-GGCACTGGGGCGGGGCC-TTAAGACCCCAGGGCCATGTGGAACGGCAGCTGCGGGGCTGCGGCGCACTCCC----GGGGCGCACGCGTGGGGCCTGGCCTCACTGGCTCTGG-----GACGTCCCGCCTCA-------------------CACA--GGACCCTGCTCCTG------------------------------------     
 6 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-253809_254331  95.3%  57.7%    ----------------------------GATC---------CA--GACACTGCCCTATCTGTCCCCTGCAGA-----------G-TAC-----------------CGCCCGCCAGCCGTGCTCACAAGTG--CCGGCACCTGCTGGC------------AGCTCCAGGCCAGCCATGCCCTCCAGCCT-CTGTCAG------GGTCTGGGAGTCCA--------TCTCCAAGGGGCTCAGACCTGCCCCCCTAGCTTTGTCCTGAGGCC--------TGGTCTCCTCTC--TCTGTCCA-CCCATGTCT-GGCACCTGGCAC-------GTGCGGTGCAGTGGACGCTTGATTGACATTGGGTTGTTGGGTGAATTAGTGAAAC----TGCCCAAGCCCTGGGGCTCGTCTCACGGAGCTGGGCACCAGGCTGACCCTGAGTGGGAGGGGCGCCAACCTCAGGGTCCTGACCACACCCTGCTGACCACCCCCCGCAGGACAACCCGGCAGAAGAAGACCATGAAGCTGTCGCGAGCCCTCTCGGACCTGGTGAAATACACCAAGTCCGTGGGCATCCACGACGTGGAGATGGAAGGTGAGGGGCGACGGGCTCAGGGGGCCCCGGGGCGGGACCCCAGTACCCTGAT---CCTGG-------------------TTGCGTGTTGGGACGCAGCATCCGACACCCGCTGGTCTGTGTCACAGTCACGTCTAGCTGGCAGGTGTCGTCCTTCAGTGAGACCAAGGCCCATCAGATCCTGCAGCAGAAGCCAGCACAGTATCTGCGCTTCAACCAGCGCCAGCTCTCCCGCGTGTACCCCTCTTCCTACCGTGTCGACTCCAGCAACTACAACCCACAGCCCTTCTGGAACGCCGGCTGCCAGATGGGTGGGTGCCCAGCGCGGTGCGTCGGGCGGGATGCTGTGGAGGGGCTGGCCCAGCTGTCATGGGGTGT-CCCTACAGTGAGCAGGGACCCATGAGG---------GGCCCGG----CTGTGTCCCTGCCCTCT----CTCCCATGGCTTTAGAGGAACTCCGCAGC-ATGG---TGCTGG-------CAACGCCAGACTGGCGCTGCGCTGGGTCCTTAA------------GACTCCAGGAC--ATTGTGGGAAAGGC-CGCAGGTCCGCCCAGGCACAGCTGA----------------------------------------------------------------------     
 7 Microcebus_murinus-NC_033661.1-186247_186709         82.0%  39.2%    CCCTCTGTGCCCCGCGCCTCTTCTCCCCCGAC------CCAGACTTCACCCCGAGTCTCCCCCCTGCTCAGAAC-C-----TTC-CAGAA---GCCC--CATCT-CTCAGTGCAGCCCTGGCCCCTTGT-------TGC-CAGGCAG-----------CGTCCTCCCGCACAC-CCACGCGAGCACCCGGGGACAT------TTGCGCCACGCGCA---GCCCCAGCCCGCAT-CCCGCCTGGCGCTCGCATTTCCTCGGCCCCCAGCGT-----------------------------------------------GACC-CGGGTGTCCA-CGCCACG-CCGGGCACCGCAGCATGTGGGGCGGTGGACACATGCCGGACGCTG----------------------------CTGCCTGTGC--CCTGGAGGCTGTCTCGCGGGTCTGGCGC-CAGGCGGGC-CCCCCCCGACCCTGACCCCATGGCCCCCACAGGACGACCCGGCAGAAGAAGACCATGAAGCTGTCCCGGGCTCTCTCGGACCTGGTCAAGTACACCAAGTCCGTGGGCTCCCACGACGTGGACTCGGAGGGTGAGGGGCGCACGGGCGGGGGCCGGGCG---------G-----------------------GGGCCGGTGTGGTGCCCGGAGGACCCGAGGCGGCGGTATCTAACGCCAGCGGCCGGCGCCACAGTGGCATCCAGCTGGCAGGTGTCCTCCTTCAGCGAGACCAAGGCCCACCAGATCCTGCAGCAGAAGCCGGCCCAGTACCTGAGCTTCAACCAGCACCAGCTCTCCCGGGTCTACCCCTCCTCCTACCGCGTGGACTCCAGCAACTACAACCCACAGCCCTTCTGGAACGCCGGCTGCCAGATGGGTGGGTGCCCAGAGCCGCGCGGGGGGGGGCCTGGGGACGGGGG---C-CTGGGGGTCCTTGGCCGTC-TCTGGCTCTCACCCC------------TCCTGTTGTAGAAGCT--CCA-CGGTGTGTGGCCACGA-----CACCAGGCT-GGCACCGGGGCGGGGCC-TTCGGACTGGCCCCGGGGTGC-------------------------------------------ACGGTGGGGGGGTGGCCTCCCTGGCTCTGG-----GACCTCCCGCCTCATGCGGGGACGCT-------------------GCTGGGTGAATGGGGGGCAGACGGCGGATTTGGGGGCTGGCGGG     
 8 Equus_asinus-NC_052181.1-200229_200725               88.4%  44.4%    ---------------------------------------------CAGCGGGAATCA-GATGCAGGCCTGGTGG-C-----GGCTCAGGGACAGTGC-----------AGTGGGGTGT---------------GGACCCTGGAGTGGAGGGGCCGGACTGGCCAGCCCGG-ATCCTGTGCTGGTTTCCGTGGTGCC--------------CGTCAC--------GGTCTGAGAGGCTTTCTTTGGTGGGCT--CAGTG---CCTGCCCCCTCCCCCAGGGTCACCTCTCAGTGTGTCTGCTGCAAGTCCTGGACCCTCCTGGAACACGGGGGTGTAGCGGGTGTAGCGGACTCCTGATGGACGTTCTGCATGAATCAGTGATCC----TGGCTGAGCCCTGGAGCCCACCTCTCGGACTGGGGCTCCCAGGCTGGCCTGAGTGGAGAGGGGTGCCAACTCCAGG-GTCC-TG--ACCCTGCCCCCCCTTCCCTGCAGGGCGACCCGGCAGAAGAAGACCATGAAGCTGTCACGGGCCCTCTCGGACCTGGTGAAGTACACCAAGTCCGTGGGCATCCACGACGTGGAGACGGAGGGTGAGGGGTGGCCGGGGCTGGGAGGCACCCAGGAG----------------------------------------GGCCGGGCTCTGACCCCGGTGCCCCTGACGCAGGCCGGTCTGCGCCCGTAGTGGCGTCCAGCTGGCAGGTGTCGTCCTTCAGTGAGACCAAGGCCCAGCAGATCCTGCAGCAGAAGCCGGCGCAGTACCTGCGCTTCAACCAGCACCAGCTGTCCCGCATCTACCCCTCTTCCTACCGCGTCGACTCCAGCAACTACAACCCGCAGCCCTTCTGGAATGCCGGCTGCCAGATGGGTGGGTTCCCCGGAGCCGCGCGTCTGCTGGCCGGGATGATGAGGAGGGGGCGACCCAGTGCTCCGCA--GCGGCCGTGCCTGGTTCTCTCGCCTGTGGCTTCTGAGAACC------------TCTGCCAGCTT-----CCCCAGGCT-GGGCCTGGGGTCGGGTCCTTAGGAGCCCAG--------GGCCGGGTGGGAAGC-------------------------------AGATGCTGGTCCGCCTGTGAGCTCCTCAGT--GTGCGTGGGGGGCCGGCTGCGTGGGCTCC--GGGGGAC-----------------GTTCCGCCAAG------------------------     
 9 Orcinus_orca-NW_004438465.1-187486_187899            86.8%  42.2%    ---------------------------------------------------AGGGTCAGTGCCTGCCTCC-ATGCCGGGCCCCTGAAGAGGCAGCGCGGCGGCACGCGCTGGGACCCTTGTCCTGGCGACGGTCAGCGTCACACGCGCAG---------GCTCAGGGAC--CCGCACGGTGGGGAGCGGCCGTGGGGGCCCAGGGCAGGGACCCC---------GGGGTGCAGGGCCAGACTG-GCCAGC-----GCG-------------GGTCCCCGTGCTCGTTTCTGT--------AGCA------GCTGTCGCGGTCGGCCACCTGCCCCCTCCCCCAG-------------TGTCACCTCTCAGTACGTCCGCCGCAT----GTCCCGACGCCTGGAACACGGGGGCATAGTGGACGCCTGAGGGATGCTCCCCGGAGCCTGAACAGGGAGGCGTGCG-ACC--CAGGTCCTGACCCCACCCCTCCCGCAGGGCCACCCGGCAGAAGAAGACCGTGAAGCTGTCCCGGGCCCTCTCAGACCTGGTCAAATACACCAAGTCCGTGGGCATCCACGACGTGGAGATGGAGGGTGAGGGGCCCCTGGGGGGCGGGGGAATC--GGGGCCCT--------------------------------------GGGGGGGTGTCTGGCCCGGTACCCTGACGCTGCCCGTCTCACCCTGCAGTGGCGTCCAGCTGGCAGGTGTCTTCCTTCAGCGAGACCAAGGCCCAGCAGATCCTGCAGCAGAAGCCGGCTCAGTACCTGCGCTTCAACCAGCACCAGCTCTCTCGCATCTACCCCTCCTCCTACCGAGTGGATTCCAGCAACTACAACCCGCAGCCCTTCTGGAACACCGGCTGCCAGATGGGTGGGCGCCGGGGCCTGGGGCGGCCGGGCTGGCGAGGGGGTGCAGCTGGGTTCTCCGCGGCCTCTCC--GCTTGCC--CT---------------TGGCTCTGGAGAACCT--TCGCGGCATCCAGCCAACTT-----CACCAGGATGGCGCCGGGGTGGGGGCCGCTGGGGCGGGGGCCTT---AGGACCCCAGGGCAAGGCGGGAAAGACACAGGTGCGCGTCCAGGCTCC---------------------TGAGG------TGCGCGGGGCCGCTGTGCCGG----------CT------------CTGCGGGAAGTCCTGCCGGGTCGCACG-GC--------------     
10 Phyllostomus_hastatus-NW_025334013.1-187880_188405   87.4%  44.3%    ---------------------------------------CAGCCAGAGCCGAGGGTC-AGGGCTGCCCCTCCCCCCGAACCCCAGCCCCTGGAGT---------------AGACGCAG---------------GGGCGAGTGCTGAGGCCGCCGC--CCGGCCGCAGCCGAAGGCAGACGCGGGCTCGGGGG-CTG--------------CTTC-----------CCGGAGCCGGTGGGCGCG----------GTGCT------GCCCCTCCCCGCGGCGTGTCCTCTCCGCGTGTCCACCGAGCGTCCACCACTCGTCCGGG--CACCTGGAACGTGGGGCCCAGCGGATGCTTGATGGGCGTTCCGTGTGAACCAATGGAG-----TTGGCCGAACCTGGAGCCCGCCTCTGGGACCGGGGTGCCCAGGCTGGCCTGAGTCGGGAGGGGTGCGGACCCGGGG-TCCT-GA--CCCCCACGCCGCCCTCCCCGCAGGGCCGCCCGGCAGAAGAAGACCATGCAGCTGTCACGGGCCCTGTCGGACCTGGTGAAGTACACGAAGTCCGTGGGCACCCACGACGTGGACACGGAGGGTGAGGGGCGGGCGACCTGGGCTCTGGGGGGCCCCGGGCAGGGCGGG-----------------GCCGCGGGGAGGGCGGGGCCGCAGAGCCCC-GCGCCCCTGACGCCGCCGGCCGCGCCCACAGTGGCGTCCAGCTGGCAGGTGTCCTCCTTCAGCGAGACGAAGGCGCAGCAGATCCTGCAGCAGAAGCCGGAGCAGTACCTGCGCTTCAACCAGCGCCAGCTGTCCCGCATCTACCCGTCCTCCTTCCGCGTGGACTCCAGCAACTACGACCCGCAGCCCTTCTGGAACGCGGGCTGCCAGATGGGTGGGTGGGCGGGTGGCGCCGGGGCGGCGGGGGCTGCGGGCCTCGCCCCGCCCTG-----------------------CTCGCTTCTCC------CCGAGGCTTTGGGCCC--GCCCGCATCC-TGCCAGCTC------GCCAGACC-AGCG-CGGGGGTGGGTCCTTAGTCCTGGGG--------TGCCTGAGGGCGGCTTCTGCCTGG----------------------ACGCTGGGCCCTGGCTGTGCGCGGCTGTGA---GCCCTGGGGCCCCTGCTCAGGGGGGCGACGGCGGGGCTCCTGGGCAGA-----------------------------------------     
11 Mirounga_leonina-NW_023270447.1-198739_199116        86.9%  42.9%    -TCCCTGCG-------ACAGCTGGTGTTGGAT---------------GCGCAGGCTCCGCGGTGGCC-CCGTGACCGCA-CAGTGGGGTGGGGGAGG-----------GGGAGCCCAGGGTGTGGACCTCC--GGGTC--------TCGGGGCC----------------------------------------------------------------------AGACTGGCCAGCACGGGCCCCCGTTCCTGCTCCTAGCGCCTGCCGCGGTTGGAAATGCGTTCCTGGGTGGGCTCGGCGCTGGTGCCTGCCCCTCCCCCT-TGTCCTTCCTCAGTGTCCTGGCACCTACACCAGGGCGTAGTGGGCGTTAGGGAGACGTTC----TGCATGAATCAGTGAGCCTGGCTCGCAAACCGTGGTGCCCAGGCTGGCCTGAGTCGGGAGGGGCGCCCACCCTGGG-GTCCTGACCGCTGTTGCCCACGGTCCCCGCAGGGCGAGCCGGCAGAAGAAGACCATGAAGCTGTCCCGCGCCCTCTCGGACCTGGTGAAGTACACCAAGTCTGTGGGCATGCACGACGTGGAGGCGGAGGGTGAGGGGACGAGGGCCCTGGGGGCGTGGGGGAGGGCTGG----------------------------------GCC-------ACGG-CCTGGGCGTGCCTCTGAGCCCCCGCACCCCCCACCAGTGGCGTCCAGCTGGCAGGTGTCGTCCTTCAGCGAGACCAGGGCCCAGCAGATCCTGCAGCAGAAGCCGGCCCAGTACCTCCGCTTCAACCAGCACCAGCTCTCCCGCATCTACCCCTCCTCCTACCGCGTGGACTCCAGCAACTACAACCCGCAGCCCTTCTGGAACGCGGGCTGCCAGATGGGTGCGTGTTGCTGGGACCGTGAACGGGGGGGCCCAGCGCTCCGAGGAGGCTGGGCTGGGCT-CCCTG--GCCAGTGGCTTTGGAGAG--------CCTCCACCACATCCCG-------CCGTGTCACCGGG--------CT-------GGCACTGGGGTGGGGTCCTTCGGACCCTGGGACACGGTGTGCAAGAGGCACACAGGCCCACGTGCTCCTAGG-GGAGGTGGGGGGCTG------GCTGTGCGGGGCTCCAGGGGCATCCCGCGGGGACGCTGGCCCTG---------GTTGTG---CATCACG---------------------------G---------------     
12 Felis_catus-NC_058375.1-201940_202403                87.2%  42.2%    ----------------------------------------------GGCCGAGGGTCAGTGCCCCGC-CCG-AACGGAC-CGTGGCAGCGGGAGGCG-----------CCCAGGCCCCTGTCTGCGCGGCAGCGGGAGTTGGATGCGCGGGCCCTGGGTGGCGGGGGGACCGCGCGGTGGGCTGGGGGAGTG-GGGGCCCCTGGGCGCGGACCTCGAGGGGGCCGGACTGGCCAGCGTCGCCCCCTGTGCTCCCTTCCAGCGCCCGAGGCGGCTGGGGAGGCATCCTTCGGTGGGGTCCGCGCCGGCACCCGCCCCTCCCC------------------------------------------CACGTCGCTCCTGGGTGGAGC----CGGCTGAGGCCTGGAGCCTGCCTCCCAAACTGGGGTGCGCAGGCTGGCCTGAGTCGGGA---------------GG-CCCTGACCCCCTGTCCCCCGCCGTGTCCGCAGGGCGAGCCGGCAGAAGAAGACCGTGAAGCTGTCTCGCGCCCTCTCGGACCTGGTCAAGTACACCAAGTCTGTGGGCATCCACGACGTGGAGGCGGAAGGTGAGGGGACCGGGGCCCCCCGGGGGGGGCGGGGAGGGGG----------------------------------CGGCGGGGCGCCGGCCTGCCTGCGCCCCTGATGCCGCCCCCCTGCACCGCAGTGGCGTCCAGCTGGCAGGTGTCGTCCTTCAGCGAGACCAGGGCCCAGCAGATCCTGCAGCAGAAGCCGGCCCAGTACCTGCGCTTCAACCAGCACCAGCTGTCCCGCATCTACCCCTCCTCGTACCGCGTGGACTCCAGCAACTACAACCCTCAGCCCTTCTGGAACGCCGGCTGCCAGATGGGTGCGCGTCACGGGGCGGCCGGCCTTGCTCCCTGGCCGCTGGCTTTGGGGAGCCTCTATCACCCCCT--GCCGGTGTCGCCCGGCCG--------GCCCTGCGGGGGGGGG-------GGGGGCGGCCGGG--------AC-------CCCA---GGACGAGGAGG------------------GAGAGACGGAGGCACGTCCGCCCGCGTCCCCGGGG---GTGGACGGGGGCTG------GCGGGGCAGGGCCCCGGGGACGTTCTGCCAGGACGCGCACACAC---------GCCCCGCTCACGCACAG-------------GGCTGTGAGCCC-----------------     
13 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-185815_186235      90.3%  44.3%    --------------------------------------------------------------------------------------AGAAGACCCCA--AATCT-CTCAGAGCTCCCCTGGCCCCACATTGGCCCAAGC-TACTGCC-----------TCGCCCTTCCATAGC-CCACGAGAGGGCCTGTGGCCTT------TGTC-------------------GCCTGCCT-CCTGCCTGGTGCTCACATTTCTGAAGCCTCCAGCACAGCCTGAGGG--TTGTCTCTGGGGGCCCAGTGCCTGTCCCCCCCAGCACCACCGGGCATCCACCATGTGCTCCGGGCACACAAGTGTGTGGTGCAATGGATGTGTGATGGATCTTGCTGCCCTAGATGGTGTTGAGG-----GACTGCCTGTGC--CCTGGAGACCCTCTCT---CTCAGGGCT-GGGTGCAGC-TTCAGGGTACTGATGCCCAGTGAATCCCACAGGACAACTCGGCAGAAGAAGACCATGCAGCTGTCCCGGGCTCTCTCGGACCTGGTCAAATACACCAAGTCTGTGGGCACCCATGACGTGGACATGGAAGGTGAGGGCAAGCAGGCTGGGCACAGGCAGGTGGGTTGGGGCCTCCCCATCCCAACTCTGGTGTGCGTGTCCGTGCACCTGGGGGACCCCTGGACCCGGTGTGTGACGCTGGCTGCTGGCGCCACAGTGGCGTCCAGCTGGCAGGTGTCCTCCTTCAGTGAGACCAAGGCCCACCAGATCCTGCAGCAGAAGCCGGCCCAGTACCTACGTTTTAACCAGCACCAGCTCTCCCGTGTCTACCCCTCCTCCTACCGGGTGGATTCCAGCAACTACAACCCACAGCCCTTCTGGAACGCAGGCTGTCAGATGGGTGGGTGCCCCTGAAGGGTGCATGGGGGGACCCATGCAGGCCTTGCT-TCAGGTGCCCTTGCCTGTG-GCTT------------------------------GGAGAGTCT--GAGCACTGTGCTGTCCACAA-----CACTGGGCT-GGCCCCGGGGTGGGTTC-TTTAAGACCCAGGGCAATGAGGGAAAGGGGCTGAGGGTTGGCAGTGAACTCTG----GGGATGTAACGCAGGGGTGCTG---AACTTGTTCTGA-----GCC--------------------------------CT--GCTCACAGTGGGGAATGGGGTGG---------------------------     
14 Molossus_molossus-NW_023425372.1-185804_186209       89.0%  45.0%    ----------------------------------GATGTGCAAGCCGTCGAGGGTCAGGCTCAGGGCGCTGGGG------------CGGAAGTGGGG-----------CCCAGGGCGT---------------GGCCCCAGGGAGGGGTGG------GCTGGTCGGGCAGGGCCCTGGGCTTGTTCCAAGCGCCATCCCCGTCCGAGCGCCATCCC--------CGTCCGAGCACCATGGTCTGGCAGGCT----CCG---TGAAGCCCCTCGCCCGGCGGCACCTCTCAGGGCGTCCACTGTG-----------CCCACAGC-------ATGTCCTGGGACCTGGACGGAAGCTTGGTGCATGTCTGCGTGAACCGGTGCAC-----TTGGCCGAGCCCGGAGCCGGCCTCTTAGACCAGGGTGCCCAGGCCGGCCTGAGGCAGCAGGGGCGCCCACCTCAGG-GTCCTGA--CCCCGTGCCCACCCTCCCTGCAGGGCGACCAGGCAGAAAAAGACCATGCAGCTGTCCCGGGCCCTGTCCGACCTGGTGAAGTACACGAAGTCCGTGGGCACCCACGACGTGGACACGGAGGGTGAGGGGCGCCCGGGCTCTGGGGCACCGGGCAGG--------------------------------------------GCCGGGCTGCGACCCGATACCCTGACGCCGGCCGCCTGCGCCCACAGTGGCGTCCAGCTGGCAGGTGTCGTCCTTCAGCGAGACGAAGGCCCAGCAGACCCTGCAGCAGAAGCCAGCACAGTACCTGCGGTTCAACCAGCACCAGCTGTCCCGCATCTACCCCTCCTCCTACCGCGTGGACTCCAGCAACTACAACCCGCAGCCCTTCTGGAACGCCGGCTGCCAGATGGGTGGGTGCTGGGCGCCGGCGGGCGGGCCCGGGGCTCTGGCCGACGCCAGCCTGGCACGGG-GT---------GGGGTCCTCAGTCCCGGTGCCCGAGGGCGCCCTGGCTGTGTGGGCGTCGGGCTGGCCGGAG-----GCCACGGCCGGGCGCTGACGGCCGCT-TCACGTCCTGGTC--------TGCAGTCGCCCTGAAC--TACCAGTCGGAGGGGCGGATGCTGCAGCTGAACCGAGCCAAGTTCAGCG------------CCAATGGCAACTGTGGCTACGT--------GCTCAAG------------------------------------CCC-------------     
15 Camelus_dromedarius-NC_044523.1-201077_201470        88.0%  42.1%    ------------------------------------------------CCGAGGGTCAGCGCCCTGCCCCCACCCCGGCCCCTGGAGGAAACAGCAG---------TGGGGGAGGTGCTGTCCTGGCAACAGCAGGAGTCAGCCGCGCAG---------GCTCAGGGAC--CGC-ACAGCGGGGAGGGGGCGTGGGGGCCCGGGGCATGGACCCC---------GGAGTGCAGGGGCTGGACTGGCCAGT-----GGG---TC-CTGTGCTCGTTTCGTAGCCCGTCACGGTCAG-----CGCC------CTTTGGTGGGCTCAGCACCTGCCCCTCCCCACCG-------------TGTCAGCTCTCAGCGTGACCACTGCGT----GTCCCGACACCTGGAACACGGGGGCGCAGTGGACGCCTGATGGACATTCAGCATGAATCAG------GGCCCGGCC-TGC--CTGACCCCGTCCCCGCCCTCCCCGCAGGGCTGCCCGGCAGAAGAAGACCATGAAGCTGTCCCGGGCCCTCTCGGACCTGGTGAAGTACACCAAGTCCGTGGGCACCCCTGACGTGGAGACGGAGGGTGAGGGGCCAGCAGGCACGGGGCCGGCCGGGGGGGGGT--------------------------------------GGGGGGGGGCCCAACGCCTGCCCCTGACGCCGCCCGTCGGCACCCGCAGTGGCGTCCAGCTGGCAGGTGTCGTCCTTCAGCGAGACCAGGGCCCAGCAGATCCTGCAGCAGAAACCGGCGCGGTACCTGCGCTTCAACCAGCACCAGCTGTCCCGCATCTACCCCTCCTCCTACCGCGTGGACTCCAGCAACTACAACCCGCAGCCCTTCTGGAACGCCGGCTGCCAGATGGGTGCGTGCCGGCGTGGAGCCAAGGCTGCTGGGCATGGTTCCCCCGCCTGGGCACCCA----------------GCC--CT---------------TAGGACCCCAGGGCGA--GGGAGCGGTGACGCCTGAGCCGGGGGGGCAGGGTCCTGCCAGGATGCCC-CGGCACACATAGGCGGATG---AGGGCTCGTGGGCAGTGCGC---AGGCTGACCTGGCCGCCCCACCTCCCTC-----CCCGCAGTCGCCCTGAACTACCAGTCGGAGGGGCGGATGCTGCAG----------CTG---------AACCGGGCCAAGTTCA------------------------------     
16 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-200143_200548     88.0%  44.0%    --------------------------------------GGCAACAGCGGCAGTCAGA-TGCGCAGGCTGGGTGG-T-----GGCTCAGGGACAGCGC-----------AGTGGGATGT---------------GGATGCTGGGGCAGAGGGGCCGGACTGGCCAGCAAGGATCCCTGTGCTGGTTTCCGTGGTGCT--------------CGGCAC--------GGTCTGAGAGGCTTCCTTTGGTGGGCT--TGGTG---CCGGCCCCCCGACCG--TGTTACCTCTCAGTGTGTCCACTGCGTGTCCTGGCACCTGGAACAG------GGCGTGGTGGGTGTGGTGGACTC----TCGATGGACGTCATGAGTCAGTGATCC----TGGCCAAGCCCAGGAGCCTGCCTCTTGGACTGGGGCACCCAGGCTGGCCTGCGTGGGGAGGGTCCT-GACCAGGGG-TCCT-GC--CCCCTGCCCCCGCTTCCCTGCAGGGCAGCCCGGCAGAAGAAGACCGTGAAGCTGTCGCGGGCCCTCTCAGACCTGGTGAAGTACACCAAGTCCGTGGGCAGCCACGATGTGGAGACGGAGGGTGAGGGGCGGCCGGGGCTGGGGGTGTTGGGG-------------------------------------------AGGCAGGGCCCTGACCCCGTGCCCCTGATGCTGGCTGGTCTGCGTCCGCAGTGGCGTCGAGCTGGCAGGTGTCGTCCTTCAGCGAGACCAAGGCCCAGCAGATCCTGCAGCAGAAGCCGGCGCAGTACCTACGCTTCAACCAGCACCAGCTGTCCCGCATCTACCCCTCTTCCTACCGCGTCGACTCCAGCAACTACAACCCGCAGCCCTTCTGGAATGCCGGCTGCCAGATGGGTGGGTGCCCGAGCGCCGTGTGTCGGCGTGGACGGCGAGGAAGGGTGCGGCTGG----GCCCTCCAC--GGCGCCGTGCACAGTTCTCGTGCCCGTGGCTTTGGAGAACCT--CCATGGCGTCCCGCTAACTT-----CCCCAGGCT-GGTCCTGGGATCGGGTCCATGGGAGCCCAG--------GGCCAGGTGGGAAAAC------------------------------AGACGCAGATCTGCCCAGGAGCTCCTTGGG--GTGCATGGCGGGTCTGGCCCTGTGGGTCCCTGGGGGAT-----------------GTTCTGCCAGG------------------------     
17 Marmota_flaviventris-NW_023144724.1-186335_186715    90.8%  47.4%    ----------------------CCTCTTCATT---------GC--CACTTCCACCTGGGTGC---ACGATGGCACC-----TGC-TTGAGACTCTCC------T-GTGGTA-AACCTTCCGACGTCCCTGCCCAGAATCCTCCAGAA------------ACCCTATGGGCCTC-AAGTGCCGTTGGCCAGG------------------------------------GTTCGTGTTCCTCTCACTCATGCCTGCAAGTGCCCAGGGCCT-TGACC--TGCC---------AGTGGCTCC-TGGCCAGCC-CATGTCCAGCAGCCTGGGTGTGCCCCGCCCCATCCCAGTACCCAAAGAGCGCGGTCTGGGGACCT-GACAGATT----TGCTCGAGCCCTGGAGCCTGGCTCAAGGGGCTGGGCACCCAGAAGGC--CCCGAAGGTGGGTGCCAGCCACA-----GGGCCCTGACCGCTCCTGTGTGCGCCCTGCAGGACAGCCCGGCAGAAGAAGACCATGCAGCTGTCCCGGGCCCTCTCGGACCTGGTGAAATACACCAAGTCCGTGGGCACCCACGACGTGGAGACGGAGGGTGAGGTTCGCAGGTGGGGCGGCACGCTGGGAAGGCCAGCGGCTGG------------------------------------TGTGCACCCGAGGCCTGGACTCACGCCGGCCGGTCTGCACACAGTGGTGTCCAGCTGGCAGGTGTCGTCCTTCAGCGAGACCAAGGCCCACCAGATCCTGCAGCAGAAGCCGGAGCAATACCTGCGCTTCAACCAGCACCAGCTCTCCCGCATCTACCCCTCCTCCTACCGGGTCGACTCCAGCAACTACAATCCGCAGCCCTTCTGGAACGCAGGCTGCCAGATGGGTGGGTGGCTGGCGGGGCAGCAAGGAGGGGCCTGCCTGGCCCAGACCATCCCTGCAGCCCAGCCTC--CCCTGATCCGAGGCCTTGGAGAGCTTCC--------AGGCCTG----CTGCTGCTCCCCGAGTGG--GTCCCCAGGGGTCCCCCAGACCTCAGGCAGCCTGGGAAAACAGC-------------CGGCCTGCCCCA-----------GCTCC-TGGGGTGTGCGGGACTGGGCCAGGCTT-GGGCACCTTCT------GCCAGTTCACGTGCCCCATC----TCATGGCCGTGAG-CCTCAG--------------------------------------------     
18 Miniopterus_natalensis-NW_015504651.1-690905_691408  89.4%  43.5%    ---------------------------------------CCAAGCCATGGAGGGCTC-GGGCGGGGCAGTGGGA-----------CAGAAAGTGGGG-----------ACCCAGGGTG---------------TGTCCCCTGGGGAGGCGGGGCCGGGTGGCCAAGGCAGGCTCCTGGGCTTGTCCCTGGAG-CGC--------------CATCCC--------AGTCTGAGAGGTGTTCTCCGGGAGGC---TTAGT---GCCTGCCCCTCCCTCTGTGTCGCCTTTCGGGGCATCCCCTGTGTGTCCACTGCGCATCCTGG--CACCTGGAACACAGGGCCGAATGGACACTTGATGGATAGTCTCCGGGAACCAATGAAT-----TTGGCCGAACTTGGAGCCTGCCTCTTGGACCAGGGTGCGCAGGCTGGCCTAAGTCAGGAGGGGCATTGGCCTCAGG-GCCC-TG--ACCCTGCCCCGCCCTCCCCGCAGGGCTACCCGGCAGAAGAAGACCATGCAGCTGTCCCGGGCCCTGTCCGACCTGGTGAAGTACACGAAGTCCGTGGGCACCCATGACGTGGACACGGAGGGTGAGGGGTGCCCCGGGCTCCCAGGGCAGAGGGCAGGGCC-----------------------------------GGGCCGGGCCAGGACCCCGAGCGCCCCTGACGGCGACGCCCGCGCCCGCAGTGGCATCCAGCTGGCAGGTGTCGTCCTTCAGCGAGACCAAGGCCCAGCAGATCCTGCAGCAGAAGCCGGCCCAGTACCTGCGCTTCAACCAGCACCAGCTGTCCCGCATCTATCCGTCCTCCTACCGCGTGGACTCCAGCAACTACAACCCGCAGCCCTTCTGGAACGCAGGCTGCCAGATGGGTGGGTGCGAGGGCCGGGGACCGGGGGCCCGGGGATTGTGGCCAGG--------GCTCCGCCT---------GCGTTTCCCTCTCTCCC------TC--GGCTTTGGACCT--GCACGGTGTCCCGCCAACGT-----CGCCAGTCT-GGCACAGAGGTGGGGTCCTTGGTCCTCGGG--------GTGCCTGGGGGCTAGGGGAGCG----------GGCCTTCTGCCGGGACGTGTGGCCCGGGTTGTGCACAATCCTCCTCAACCTCCGGGCCCCCGCTTGTGTCCGCGATCGCCA-------------------------------------------------------     
19 Dipodomys_spectabilis-NW_024870976.1-183477_183876   86.5%  40.4%    --------TCCCCTCCCAT-----CTCTCTCT------CAGGGCTGCACA-------TAGTCCCTGCTACCCTC-A-----CCC-CCAGGTCCTCTC--CCTG---TGGTACCTGACTACACCCCTCAGCACTCCCACATGGCTGGC-----------AGCCCCCCCCCCCAC-CTGCTGATGAGTTCCAGGACCT------TTACAC-----------------------TT----ACTGGTAGCTCCCAGCCAGGCCATGCCCAGCAGTGCCTTTCCACGGTCCCCATGTGGCCTGGTTGTCTGCCCTGGGCAGAGCCGGTGCCTGCC-------------------------------CCCACTGCACACCGTCTCGA-------GGCCTGGCTGCTGGAGAGCAGAGGGCCCGTCCCGGG--GTCCGGGCCAAGCTGCCAGGCCAGG----CCCCAGCCC-GCTCTGAAGGGCCTGGCCCCTGCCACCCACAGGACGGCCAGGCAGAAGAAGACCATGAAGCTGTCCCGGGCCCTCTCCGACCTGGTGAAGTACACCAAGTCCGTGGGTTCCCACGATGTGGAGACGGAGGGTGAGGGCCGTGTGGCGGGCGGGTGGTGTGGGAGGTGGCCCGGC-------------------------------CCAGCATGCATGCGTCCAGCGCAGCGCGGACTCACGCGGTCACCGCCACAGTGGCGTCCAGCTGGCAGGTGACATCCTTCAGCGAGACCAAAGCCCACCAGATCCTGCAGCAGAGGCCAGCCCAGTACCTGCGCTTCAACCAGCGCCAGCTCTCCCGCATCTACCCCTCCTCTTACCGCGTGGACTCCAGCAACTACAACCCACAGCCCTTCTGGAATGCCGGCTGCCAGATGGGTGGGTGCTCGGCTGACGGCGGGGGGCGGGGGTAGTTAGGAGTGCGCACGTGGGGCCCCATCCTGTT-TCGCCCTCTCACCCTTACCCA--ACCATGGCTTTGGAGAACAT--CTAGGCCTG-TCACCAGTTC-----CACTAGGCC-AGTGCCGGGGTGGACGC-TGAGACCCCCAGGCCCGCTGG-GAGAG----TCCAGGTCTGC----ACCTGTG----CGGCTAGAATGTCGGGTGCCTG---TGATCCTTC-------------------------------------------------------TGACAGAATGCAGGGCCCCCTGCTCTTG--------------     
20 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-186591_187046     89.9%  47.0%    ----------------------CCCTATA-GC---------AC--CCCCGCAGTCTCTGCCC---CG--CCTCTCC-----TGC-TCAGGGCCTTCC------A-GAGCCCACATCCTCACCCCTC----CCG----GCCGGCAGCA------------GGCTTGTCCCCATG-GGCTTGGG-ATGCCCAGGCCTT------TGTACCAGCTG-GC--------ACCCTACAGGGGCGTCTGCC--CAGCCTTGCCGTGGCCTGGGTCC-ATGCC--TGACGGGGTTGGCACCTGCTCC-AGGCTTAGC-ACAGTCCCTCAGGCCAAGTGGCCTCTGTG-------TGTGCCCT--GCCCATGCAGTGTGGGCCTGGAAGGACC----TGCCCAGGGGCCGGAGCCCCG-TAGTGGAGCTGGGTGCCTGCCCGGC-TGCCCTGAGCGGGAGGGCACCGCA-----GGGCCCCG-ACTGCCTCTGCCATGCCCCGCAGGACAGCCCGGCAGAAGAAGACCGTGAAGCTGTCCCGGGCCCTCTCGGACCTGGTGAAATACACCAAGTCCGTGGGCTCTCATGACGTGGAGATGGAGGGTGAGGGCCGTGGGGCAGGCATGGGGGGCCCCGGAGCCGGGCTGTG------------------------------------TGTG-CCCTGAGGCCCACAACTCATGCCACGGTCTGCGCCACAGTGGCCTCGAGCTGGCAGGTGTCGTCCTTCAGCGAGACCAAGGCCCACCAGATCCTGCAGCAGAAGCCGGCGCAGTACCTGCGCTTCAACCAGCACCAGCTGTCGCGCATCTACCCCTCATCCTACCGCGTGGACTCGAGCAACTACAACCCGCAGCCCTTCTGGAACGCTGGCTGCCAGATGGGTGCGTGTGGCTGAAGGGCGAGGAGGCCGCGGCCGTGG--CCCTG-CCATCCTGCAGCCGGAGCCCACCACGGGCGTGAAGCCTTGTTTCTGTCCTCACCCCCGACCCATG----GCTTTGGCACACCTCT-A--CTCTGCTAG-------------GCTGGCACCCAGC---------------------------------TGAGTCCTTAAACCCCA-GGCAGCCTGGGAGAGACGGCCCCACTGCCCTGGCCCTGTGTGTGTGTGAGCTGGCGGGGCCCAGC----TGGGGGACCTCC----TGCAGG--------------ATG-------------------------     
21 Jaculus_jaculus-NC_059106.1-185688_186162            92.7%  49.9%    ---------------------TTCCCCTGAGC---------AG--AACCCTCCAGAAAACTTGTGTTCCTTAGAGC-----AGC-CCCTGACTAGAC------AGGCTCCCTTAGCCTTCCTCTTGCGTGT-----TACTTAGAAGT------------ACTCCAGAG--------CCTTTGCACCTG-ACGACTG------CGTCATATAGCCCA--------CATCCAGCCAGCTCGTTTCCACAGCCCCATCAGAGTCTGGGAATCTGTCCCTGAAACAGAGTCAGTACCTGTCCT-CACCTCTGC-ATTGCCTGCCA-------------------GGCCTGGGCTGCCTGGGATGTGTGATTTGGGGAGCAGATGAACT----GGCGTGGGTCCTGGATCCCAACTCACAGAGCTGAATGGCAGGCTGGCCCTGGATGGGAGGGATGCAGCTGAAGGG-TCCTGA----GCAGCCCTGCCGCACCCTCGCAGGACAGCCCGGCAGAAGAAGACCATGAAGCTGTCACGGGCCCTGTCAGACCTGGTGAAATACACCAAGTCTGTGGGCACCCACGACGTGGAGACAGAGGGTGAGGGCCATGGGGCGGGTGGGACTGGGCAGGAGGGCTGTG----------------------------------------GGGTGAAGGCTGTGTGTACTCATACCTGGCCGGTCTGCGCCCAGTGGCGTCCAGCTGGCAGGTGTCATCCTTCAGTGAGACCAAGGCCCACCAGATCCTGCAGCAGAAACCGGCCCAGTACCTGCGATTCAACCAGCACCAGCTCTCGCGCATCTACCCCTCTTCCTACCGTGTGGACTCCAGCAACTACAACCCGCAGCCCTTTTGGAACGCTGGCTGCCAGATGGGTGGGTGCAGGCACAGGGCTCAGCGGGAGGGTGAAGCCGGCCACCCCCGAGTGTGAGCAGGTTTTCG-TTGAGGGCCGCTAGGTTGGCACAGGGG---------TGA--------GTCCTTTCG-----GAGC--ACAGGGTGGGATGGACAAGAGCCTGGCTGCCCCTGTATTGCTAG-------CATGGGTGGGCTTCAAG-CCCGGGAGTCCATAC--AGGGGCGTGGAGAGGTGGG-A--GACACGGGTGTGGTGGATGGCTGCTGACCTGGACACCTGCTG----TCT-------------------------------------------------------------     
22 Cavia_porcellus-NT_176233.1-186457_186938            89.0%  45.3%    ----------------------GCACATGGCT---------GG--GACCCTGTGGTCACTGC---TC--ACTGCCC-----CGC-TCAGTGCCTTCC------A-GAGCCCACATCCTCAGAGGCC----CTCCTGGCTGGGCAGCA------------GCCTCGTCCCCCCC-AGGCTCAGAAGCCTGGGGTCTT------TGCAGTGACTG-GC--------ACCCTAAGAGG--CCTTTGC--CCAGCCCCGCATGGCCTGGACCT-GAGCC--TGACGGGGTTGGCACCTGCCAC-AGCCTTGGC-ATAGTGCCCCAGGTCAAGTGGCCTCTGCA-------TGC--CCT--GCCCATCCACTGGGGGCACAGAAGGACC----CGCCTAG-CCCTGGAGCCCCA-GAGTGGAGCTGGGTACCTGCCTGGCCGGCTCTGAGTGGGAGGGCACCACA-----GGGCCCCG-ACCACCTCTGC-CACGCCTGCAGGACAGCCCGGCAGAAGAAGACCGTGAAGCTCTCCCGGGCCCTCTCGGACCTGGTGAAATACACCAAGTCCGTGGGTTCGCACGACGTGGAGATGGAGGGTGAGGGCCGCGGGCGGGCACAGGGGGGCC-CAGAGCCGGGCTGTG-------------------------------------CAT-CCCCGAGGCCCGAGACTCACAACACGGTCTGCGCCGCAGTGGCCTCGAGCTGGCAGGTATCATCCTTCAGCGAGACCAAGGCCCACCAGATCCTGCAGCAGAAGCCGGCGCAGTACCTGCGCTTCAACCAGCACCAGCTCTCGCGCATCTACCCCTCGTCCTACCGTGTGGACTCCAGCAACTACAACCCGCAGCCCTTCTGGAATGCCGGCTGCCAGATGGGTGTGTGAGGCCAGGGGGTGGGGCGTCCGTGGCTGTGG--CCGGC-TGGGG-----------------------ACAGCAGCCTTGTATCTGTCCTCACCCCCCAGGTGTG----GACAGATACAAGGTGTGG--CTCTCCTGG-------------GCCAGCAGCCTGGGAGAAACCC----------CACGGCCCTGCCCTTGTGCAGTTCTGTCTGA-TGGAGCCCGGCGC--AGGGACCCCCTGCCAGGACATTGGGC----TCAACCTCTCAGCTGAGAGC----TCCAGGCCCACAC-ACTCAGAG--------------GGGGGGA---------------------     
23 Pteropus_alecto-NW_006429611.1-206016_206410         88.6%  44.0%    ----------------------------------------CGGTGTGGGGCATGCTG-GGTCTCGTCCTGGCGG-----------CAGCAGAAGCAC-----------AATGGCCCGG---------------GGCGGCTCAGGGGAACTGCAGCGGGGGCCCAGGGCAGGTCCCCGAGCTTGTC------C-CGG--------------AGCCAG--------CACGTCACAGGCATTCTCGGGTGGGC---CCCGT---GCCTGCTCTGCCCCCAGTGTCGCCTCTCGGTGCATCCCCTGCCCGTCCCCTGCCCATCCAGG--CACCTGGAACGTGGGGCTGAGGGGACGCCTAACGTGCATTCTACGTGAATCCGTGAAC-----CTGGCCGGACCGGGAGCCTGCCTCTCAGACCAGGGCACCTGGGCAGGCCTGAGTGGGGCGGGGTGCTGACCCCGGG-TCCTGAC--CCCTGGCCCCGTCCTCCCCGCAGGGCGACCCGGCAGAAGAAGACCATGCAGCTGTCACGGGCACTGTCGGACCTGGTGAAGTACACCAAGTCCGTGGGCGCCCACGACGTGGACACCGAGGGTGAGGGGGGCCGAGACTCGGGGGGCGCCGGG------GA-----------------------------------GGGCCCGGCTGCCACCCAGGGCCCCCTGACGCCGGCCGTCGGTGCCCACAGTGGCGTCCAGCTGGCAGGTGTCGTCCTTCAGCGAGACCAAGGCCCAGCAGACGCTGCAGCAGAAGCCAGCACAGTACCTGCGCTTCAACCAGCGGCAGCTCTCCCGCGTCTACCCGTCCTCCTACCGCGTGGACTCCAGCAACTACAACCCACAGCCCTTCTGGAACGCCGGCTGCCAGATGGGTGGGCGCCCAGAGCCGCGCGGGTGCGGCCGGGGGGGTGGGGGGGGTGGCCGGCGCACCTGGG---------CCCGTGCTCGGTCCCCC------CCGGCTTTGAGGACCT--GCACGGCGTCCTGCCAGCTG-----GCCC------------TGGGAGGGGTCCTTCGTCCTTGGG--------TGCG-TGGGGGTCAGCTGGGCAGGGCCCCAGGGACGGTTGGCCAGGAGGCACGGCCATGCTTGTGCACACGGGTGA---GCCGTGGGCCCCCTGCTCACGGAGGTGAATGCCAGGCTCACG-----------------------------------------------     
24 Hyaena_hyaena-NW_024080942.1-200755_201171           82.9%  40.2%    CAGCATGGAGGAGGAGGCTGAGGACCTGGACTCCCAAGGCAGCCAGAGCCGAGGGTCAGTGCCCTGC-CCTGGACCCAC-GGGGGCAGTGGGAAGGG-----------CCGGGTCCCTTGTCTGTGCAGGAGCGGGAGCGGGC-----------------------GTGCAGGCCCTGGGTGGCAGGGGGCG-GGGGCACCTGGGTGTGGACCTCTGGCGGGGCCGGACCGGCCAGCGTCCACCCTGCGCCCGCTTCTAGCGCCCGATGCGCCTGGGGAGGCATCCTTCGGTGGGCTCTGCGCCAGCACCCGCCGCTCCCG------------------------------------------CATGCCAGGCCTCGGGGAA---------------------GCCTGCCTCGCAGACTGGGGCGCCCGGGCTGGTCCGGGTGGGGG---------------GC-TCCTGAC--CCCTGTCCGCACCCGCTCTGCAGGGCGAGCCGGCAGAAGAAGACCATGAAGCTGTCGCGCGCCCTCTCGGACCTGGTGAAGTACACCAAGTCTGTGGGCATCCACGACGTGGAGGCGGAAGGTGGGGGGCCGGGCGCCCGGGGGGCCGGGGCGGCGGG--------------------------------------------GTGCTG--GCCCGCATGTGCCCGACGCTGCCCCCCCGCACCGCAGTGGCGTCCAGCTGGCAGGTGTCGTCCTTCAGCGAGATGAGGGCCCAGCAGATCCTGCAGCAGAAGCCGGCCCAGTACCTGCGCTTCAACCAGCACCAGCTCTCCCGCATCTACCCCTCCCCCTACCGCGTGGACTCCAGCAACTACAACCCGCAGCCCTTCTGGAACGCCGGCTGCCAGATGGGTGCGCCGCGGGGTGGCCGGTG-------------------GCCGTGGGGAGCCCCTACCAGCCCCT--GCTGGTGTCACCTGGCCG--------GCGCTGCCGAGGGGCC-------CCGGGACGTTTGC--------CC-------GCGT---TCCTGGGGTGG-----ACGGGCGGCTGCGCAGGGCCCCGGGGACGTTCTGCCGGGACGCACGCCCCGCTGGGGCACAGCTAT-GACCCCGGGGTCCCTGCTCACGCAGGTGAGCCCTGGAGTCGGGCAGCC---------GTG------CAGCGGAG-------------GCGGGGGAGGCCGGCTAGGCGCTG-----     
25 Sturnira_hondurensis-NW_023520724.1-187922_188394    85.1%  41.4%    ------------------------------------------CCAGAGCCGAGGGTC-AGGGCCGCCCCCCCGCCC-----CCAGCCCCTCGAGTAG-----------ACGGTGGCAG---------------GGGCGAGTGCTGAGGCCGAGGT--CAGGCCACAGCCAAAGGCAGACCCAGGCTCAGGGG-CAG--------------GGCC-----------GGGTGGGTGGGGAGGGTGGGCAGGCCCTGGGCT---TATTCCCAGAGCTGTGGGTGCGGTGCCAGCTCTTCCCGGGACGTGTCCACTGCGCAGCCTGG--TACCTGAAACACAGGGCCAAGTGGATGCTCGGTGGGCATTCTGTGGGCACCAGTGAAC-----TTGGCCAGATCTGGAGCCCGCCTCTCGGACCGGGGTGCCGAGGCTGGCCTGAGTCGGGAGGGGCCCCAACCTTGGG-GTCC-TG--ACCCCGATGCCGCCCCGCCGCAGGGCCACCCGGCAGAAGAAGACCATGCAGCTGTCCCGGGCCCTGTCGGACCTGGTGAAGTACACGAAGTCCGTGGGCGCCCACGACGTGGACACAGAGGGTGAGGGGTGGCCCGGGCTCCGGGGGCCGT------GGG------------------------------AGGCGGGGCCGGGCTGCAGCCCCGAGCGTCCCTGACGCCGGCCGGCGGCGCCCACAGTGGCGTCCAGCTGGCAGGTATCGTCCTTCAGCGAGACGAAGGCGCAGCAGATCCTGCAGCAGAAGCCGGAGCGGTACCTGCGCTTCAACCAGCGCCAGCTGTCCCGGGTCTACCCGTCCCCCTTCCGAGTGGACTCCAGCAACTGCGACCCACAGCCCTTCTGGAACGCCGGCTGCCAGATGGGTGCGTGGCGCCCTGCCCGCTCTGTCTGGCGACTCTGGACCCACCCCGCATCCCA-----------------------CCCCCTTACCA------GCCCAGCTCCCGGTGG--GTCCTTAGTC-CCTCAGGTG------CC--------TGA-GGGCTGTGAGT-----------------------------GGGCAGCCCC-TGCCTG----------------------TCTGGGGGGCCCGACTGTGCGCAGCTGTGA---GCTCCGGGGCCCCTGCTCATGGGGGTGACCGCCGGGCTCCTGGGCAGAGGGGCAGTGCTGGTGGGAGGGCGTGGCCGGGCGCTGA----     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .                                                                                                                           .****.  .  .*******.******.**.**** ** ** ** ** ** ******** **.***** **.** ****     *. ** .*.**    **.****.*                                                                                                                       **  .  ** ***********.:* ******** ****  *..** ** ****  **********..**.*. *..** ** .* ** *******. ***** ** ** .* ** ** **  * *:*** ** ** ** *******.*.* ** ******** ***** .* ***** **.******* *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  

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