AGGCAGCCCTGGGTTCGGCGGGGGGCAGGCAGGGTAGCCCTGGATGTGTCTGCTACTTATACAGCGGTAGGAAGGCTCACAGTGGTTTCCTGGGGTTCCCCAGCTCAGAACCCGCCTCAGGGAGTGCCCACCTGGAGCCGTGTGTCTGATTAGGGATACCCGCGCACTGCGGGAACAGGTCAGGGCCGTGGAATGCTCGTAAAAGGGTTGCGCAAGCAGGCCTGGCCGAGCAGTATTCCAGGCACACAAACGCAGTTATTACGTAGTCACCACTGGTGGGAAAAAAGGATTCAGAACTTAACGAGTTTAAAACAACACATGAGAGACGCTGAGGCAGGTGTGAGCGAATGTTTCCACCGGGGCCTGACTTTCAGGCCGCTTCTCCTCGGCAGCTGCCTCTGCCCCAGGGTGGACTGGGAACGGCTGCCACGGGGGCTCCCCAACCTGTCCCCGCCCTGCCCTCCCCTCCCGTCTGCCTTACTCCAGACCTGGCTCAAGCCCACCTCTTCCAGGAAGGCCTTCTGGGACCACCAGGGGCTGTCCCGGCCTCCCTGCCTGGTTCAAGGCTAGACTCACCTTGTCCCTGTCTCTCCCCTGGACTCAGAGCAAGGCTGAAGAGGACGTGGAGTCTGGGGAGGATGCCGGGGCCAGCAGACGCAATGGCCGCCTCGTCGTGGGAAGCTTCTCCAGGCGCAAGGTCCGGCGCAGCTCCCAGGCCAGGGTCCCGGTCTGGGCCCAGTGTCCTCCCTGCTCCCAGTGCCCCGTGTCCTCCCTGCTCCCAGTGCCCCGTGTCCTCCCTGCTCCCAGTGCCCCAGTGGGCCCTGCCCCAGCCAGAGCAGATGGGGGTCTCCTCCAGTCCCCAGGGTTCCCAGCCTGGCTCACAGGATCCCCTCTGAGTCAGGCCGAGCTATCGGTTGCAGGTGCCAGGGACTGGGCCAGAAGCCTGGGCTCGGAGCTGGTGGGAACAGGTGCCTGGCTGGCTCACATCCCTTCTCTGGCC
Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.
Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.
Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.
Distribution of HSS in the input sequence
HSS id | Strand | Frame | Length | Start | End | Score | P | Show Result | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 0 | + | 2 | 36 | 27601 | 27708 | 32.644 | 3.621e-10 |
Plot |
2 | 1 | - | 1 | 15 | 27612 | 27656 | 13.783 | 0.002 |
Plot |
3 | 2 | - | 2 | 16 | 27637 | 27684 | 11.353 | 0.015 |
Plot |
HSS id | Sequence | |
---|---|---|
1 | 0 | QSKAEEDVESGEDAGASRRNGRLVVGSFSRRKVRRS |
2 | 1 | RLLAPASSPDSTSSS |
3 | 2 | EASHDEAAIASAGPGI |
Reference sequence (1): Target Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% |
cov pid 1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . . . 4 . . . . : . . . . 5 . . . . : . . . . 6 . . . . : . . . . 7 . . . . : . . . . 8 . . . . : . . . . 9 . . . . : . . . . 0 . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 ] 1310 1 Target 100.0% 100.0% ----------------------------------------------------------------------------AGGCAGCCCTGGGTTCGGCGGG-GGGCAGGCAGG---GTAGCCCTGGATGTGTCTGCTACTTATACA-GCGGTAGGAAGGCTCACAGT--GG-TTTCCT------------------GGGGTTCCCCAGCTCAGAACC-CGCCTCAGGGAGTGCCCACCTGGAGCCGTGTGTCTGATTAGGGAT-ACCCGCGCACT---------GCGGGAACAG-GTCAGGGCCGT--GGAATGCTCGTAAAAGGGTTGCGCAAGCAGGCCTGG-----------CCGAG-CAGTATTCCAGGCACACAAACGCA-----GT-TATTACGTAGTCACCACTGG--TGGGAAAAAAGGA----------TTCAGA-ACTTA---ACGAGTTTAAAACAACACATGAGAGACGCTGAGGCAGG-TGTGAGCGAATGTTTCCA-----CCGGGGCC----TGACTTTCAGGCCGCTT-CTCCTCGGCAGCTGCCTCTGCCCCAGGGTG------------GACTGGGAACGG-----CTGCCACGGGGG--CTCCCCAACCTGTCCCCGCCCTGC--CCTCCCCTCCCGTC-TGCCTTACTCCAGACCTGGCTCAAGCCCACCTCTTCCAGGAAGGCCTTCTGGGACCAC----------------CA-GGGGCTGTCCCGGCCTCCCTGCCTGGTTCAAGGCTAGACTCACCTTG----TCCCTGTCTCTCCCCTGGACTCAGAGCAAGGCTGAAGAGGACGTGGAGTCTGGGGAGGATGCCGGGGCCAGCAGACGCAATGGCCGCCTCGTCGTGGGAAGCTTCTCCAGGCGCAAGGTCCGGCGCAGCTCCCAGGCCAGGGTCCCGGTCTGGGCCCAGTGTCCTC----------CCTGC-TCCCAGTGCCCCGTGTCCTC-CCTGCTCCCAGTGCCC--C-GTGTCCTCCC-TGCTCCCAGTGCCCCAGTGGGCCCTGCCCCAGCCAGAGCAGA----TGGGGGTCTCCTCCAGTCCCCAGGGTTCCCAGCCTGGCTCACAGGATCCCCTCTGA--GTCAGGCCGAGCTATC-GGTTGCAGGTGCC--AGGGACTGGGCCAGAAGCCTGGGCTCGGAGCTGGTGGGAAC---------AGGTGCCTGGCTGGC------TCACA--TCCCTTCTCTGGCC---------------------------------------------------------------- 2 Cercocebus_atys-NW_012001716.1-219608_220568 94.9% 76.3% --------------------------------------ATGAGT--------GAGCAGT----TGGTGA---TGTGG--CCCGGGGTTCA---TCGGG-GGGCAAGCAGG---GGAGCCCTGGATGTGCCTGCTGCTTATACA-GTGGTAGGAAGGCTCACAGT--GG-CTTCCT------------------GGGGTTCCCTGGTTCACGGCC-CGCCTCAGGGAGCAC-CCACTGGAGCTGTCTGTCTGATGACGTGG-TACCTGCGCGTTATGGGAACAGGTCAGGGC-GGCAGGGCCAC--GGAACGCTCGTAAAAGGGTTACGCAAGCAGGCCTGG-----------CCGAG-GAATATTCCAGACACACAAATGCA-----GT-TATTATGTAGTCACCACTGG--TGGAGAAAAAAGA----------TTCCGA-ACTTA---ATGAGTTTAAAATAACGCATGAGAGACGCTGAGGCAGG-TGTGAGCACATGTTTCCA-----CCGGGGCC----TGCCTTCTAGGCTGCTT-CTCCTCAGCAGCTGGCTCTGCCCCAGGGTG------------GACTGGGAACGG-----CGGCCACGGGGC--TCCCC-AACCTGTCCCCGCCCTGCCCTCTCCTCCCCCGTC-TGCCTTACTTCAGACCTGGCTCAAGCCCACCTCCTCCAGGAAGGCCTCCTGTGGCGAC----------------CAGGGAGCTGTCCCGGCCTCCCTGCCTGGTTCAAGGCTGGGCTCACCGTG----TCCCTGTCTCTCCCTTGGACTCAGAGCAAGGCTGAAGAGGACGTGGAGTCTGGGGAGGATGCTGGGGCCAGCAGACGCAACGGCCGCCTCGTCGTGGGAAGCTTCTCCAGGCGCAAGGTCCGGTGCAGCTCCCAGGCCAGGGTCCCCGTCTGGGCCCAGTGTTCTC----------CCTGC-TCCCAGTGCCCCGGTGGGCC-CTGCCCCAGCCCCCAG--G-G---------------------------------------------TTCCCAG----CCCCCAGGGTTCCCAGCCCCCAGGGTTCCCAGCCTGGCTTGCAGGATCCCTTCTGA--GTCGGGCTGAGCTATC-GGCTGCAGGTGCC--AGGGACTGGGCCAGGAGCCTGGGCTTGGAGCTGGTGGGAAC---------AGGTGCCTCGCTGGC------TCACA--TCCCTTCTCTGGCCCACGCTGGCCCTTGTCC----------------------------------------------- 3 Trachypithecus_francoisi-NW_022681457.1-213557_214420 92.0% 69.7% -----------------------------CCTAGGAGGCGGAGC--------TTGCAGT----GAGCTGAGACCCGGCCACTGCACTCCAGCCTGGGC-GGCAGAGCGAG---ACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-AAAAAAGGAAGGCTCACCGT--GG-CTTCCT------------------GGGGTTTCCTGGTTCACGGCC-CGCCTCAGGGAGCGCCCACCTGGAGCTGTTTGTCTGATTACGTGG-GATCTGCGTGTTACGGGAACAGGTCAGGGC-GGCAGGGCCAC--AGAACGCTTGTAAAAGGGTTACGCAAGCAGGCCTGG-----------CCGAG-GAATATTCCAGACACACAAATACA-----G--TATTATGTAGTCACCACTGG--TGGGGAAAAAAGA----------TTCAGA-ACTTA---ATGAGTTTAAAATAACACAGGAGAGACGCTGAGGCAGG-TGTGAGCAGGTGTTTCCA-----CTGGGGCC----TGCCTTCCAGGCTGCTG-CTCCTCAGCAGCTGGCTCTGCCCCAGGGCA------------GACTGGGAACGG-----TGGCCACGGGGC--TCCCC-AACCTGTCCCCGCCCTGCCTCT--CCTCCCCGTC-TGCCTTACTTCAGACCTGGCTCAAGCCCACCTCTTCCAGGAAGGCCTTCTGTGGCCAC----------------CAGGGAGCTGTCCCGGCCTCCCTGCCTGGTTCAAGGCTGGGCTCACCTTG----TCCCTGTCTCTCCCTTGGACTCAGAGCAAGGCTGAAGAGGACGTGGAGTCTGGGGAGGATGCCGGGGCCAGCAGACGCAACGGCCGCCTCGTCGTGGGAAGCTTCTCCAGGCGCAAGGTCCGGCGCAGCTCCCAGACCAGGGTCCCCGTCTGGGCCCAGTGTTTTC----------CCTGC-TCCAAGTGCCCCAGTGGGCC-CTGCCCCAGCCC------------------------------------------------------------------------------------CCAAGGTTCCCAGCCTGGCTTGCAGGATCCCTTCTGA--GTTGGGCTGAGCTATC-GGCTGCAAGTGCC--AGGGACTGGGCCAGGAGCCTGGGCTAGAAGCTGGTGGGAGC---------AGGTGCCTCGCTGGC------TCACA--TCCCTTCTCTGGCCCATGCTGGCCCTTGTCCCAAGCTCAGGTGCC-------------CTG----------------- 4 Callithrix_jacchus-NC_048389.1-199334_200284 93.0% 67.5% -------------------------------------------CTTTGGGATGAATGAG----CAGTTTGGATGCAGCCCTGGGTTGGGCAGGGGCAG-GGGCAGGGAGC---GGAGCCCTAGTTGTGCCTGCTGCTTGCACA-GCAATCAGAAGGCTCACAGT--GG-CATCCT------------------GGGGTTCC-CGGCTCAGAGTC-TGCCTTGGGGTGCGCCCACCTGGAGCTGTTTGTCTGATGAGGTGA-TACCTGCGTGCTGTGGGAA-GAGGCCCAGG-CAGAGGGCTGA--GGAATGCTCATAAAAGGGTTTCGTAAGCAGCCCTGG-----------CCGAG-GAATATTCCAGACACACAAATGCA-----TT-TATTATGCAGTCTCCACTGG--TGGGGAAGAAATT-----CAGAATTGGGA-ACTTA---ATGAGTTCAAGACAACACAGGAGGGAGACTGAGGCAGC-GTG-AGTGAATGTTCCCC-----CCACAGGC----CTGCCTCCCAGGGCCTT-CCCACCAGCAACTGCCTCTGCCCCAGGGTG------------GACTGGGAACAG-----CAGCCACAGGAG--CTCCCCAACCTGGCCCCACCCTGCCTTTC---------------TGCCCCCAGG---CCTTTCAAGTCCACCTCTTGCAGGAAGGCCTCCTGGGGCCAC----------------CAGGGAGCTGCCCCAGCCTCCCTGCCGGGTTCAAGGCTGGGCTCACCCTG----TCCCTGTCTCTCCCTTGGACTCAGAGTAAGGCTGAAGAGGACGTGGAATCTGGGGAGTACGCTGGGGCCAGCAGACGCAACAGCCGCCTTGTCGTGGGAAACTTCTCTAGGCGCAAGGTCTGGTGCAGCTCCCAGCCCAGGGTCCCCGTCTGGGCCCAGCGTCCTT----------ACTGC-TCTTAGTGCCCCAGCGGCCC-CTGCCCCAGCCA------------------------------------------------------GAGCAGA----TGGGGGTCTCCTACAGCCCCCAGGGTTCCCGGCCTGGCTTGCAGGATCCCCTCTGAGTCTTGGGCTGAGCGGCC-GGCTGCAGGTGCC--AGTGGCTGGGCCAGGAGCCTGGGCTGGAAGCTGGTGGGAGC---------AGGCGTCTTCCTGGC------TCATT--CCCGC-CTCTGGCCCTCACCCCAAGCTCA----------GGTGCC-------------CT------------------ 5 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-199384_200292 88.8% 63.5% ----------------------GGTGGCTCCATTGGGACTGAGCTTTGGGATGAATGAG----CACTTTGGATGCGGCCCCGGGTTGGGC------GG-GGGCGGGGAGC---GGAGCCCCAGTTGTGGCTGGTGCTTGCCCA-GCAGTCGGAAGGTTCACGGT--GG-TGTCCT------------------GGGGTTCC-CGGCTCGGACC--CGCCTCAGGGAGCGCCCACCTGGAGCTGTTTGTCTGATGAGGTGA-TACCTGGCACCGTGGGAAG-AGGCCCGGGC-AGCAGGGCGGA--GGAACGCTCGTAAAAGGGTTTCGTAAGCAGCCCTGG-----------CCGAG-GAATATTCCAGACACACAAATGCA-----TT-TATTATGCAGTCTCCACTGG--TGGAGAAGAAATT-----CAGAATTGGGA-ACTTC---ATGAGTTTAAGACAACACAGGAGGGAGACTGAGGCAGC-GTG-AGGGAATGTTCCAG-----CCACGGGC----CTGCCTCCCAGC------------------TGCCTCTGCCCCAGGGTG------------GACTGGAAACAG-----CCGCCACGGGGG--CTCCCCAACCCGGCCCCACCCTGCCTTTC---------------CGCCCCCCAGGCCTCGCTTGAGTCCACCTCTTGCAGGAAGGCCTCCTAGGGCCAC----------------GAGGGAGCTGCCCCGGCCTCCCTGCGGGGTTCGAGGCTGGGCTCACCCTG----TCCCTGTCTCTCCCTTGGACTCAGAGCAAGGCTGAAGAGGACGCGGAGTCTGGGGAGGACGCTGGGGCCAGCAGACGCAACAGCCGCCTCGTCATGGGAAGCTTCTCCAGGCGCAAGGTCCTGCGCAGCTCCCAGCCCAGGGTCCCCGTCTGGGCTCAGCGTCCTC----------CATGC-TCCCAGTGCCCCAGCGACCC-CTGCCCCAGCCA------------------------------------------------------GAGCAGA----TGGGGGTCTCCTACAGCCCCCAGGAT---------------------TCCCTCTGAGTCTTGGGCTGAGCGGTC-GGCTGCAGGTGCC--AGTGGCTGGGCCAGGAGCCTGGGCTGGGAGCTGGTGGGAGC---------AGGGGTCTTGCTGGC------TCATT--CCCTC-CTCTGGCCCTCACTGGCCCTCACCCCAAGCTCAGGTGAC-------------CTGTGGCCGCCCT------- 6 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-199105_199852 92.0% 51.9% ---------------------------------------------------------------------------------------------GGCAA-GGGCCAGGAGG---GGCGCCCTGGATGTACTCATTTTATTCACAGCAGGTAGGAAGGCTTGTCTTGCTG-CTTCCT------------------GGGGTTTGCTGG--CATGAAG-GCCTTTGGGGAGTGTGGACCTGGTATTGTTTGTCTAATTAGACAA-TACCTTTGCACTGCAAGAAGAGTGCAGGACATCAGAGCTGCA--GGCATCCTCATAGAAGGGTTACATAAGCAGGCGCAG-----------CTGAG-GAATATTCCAGACACACAAACTGC-----GTTTATTGTGTAGTCACCATCTGT-GGGAAAAAAAATT-----CAGAACTGGGA-ACTTA---ATGAGTTTAAAACAACACATCATGAGAAGCTGATACGGGTGTGTGAGCGAACCTCCTGC-TTTTCAGGCC----TCTCCTGCCATGTGCCT-CCAAGGCAGAACTGGGGCAGCA------GC------------CAGTCGGTGGGG-----CTCAGCACCGGC--CCCGACTCCCTGGC------CTGGCCCTCCCCATCTTCTCTGCCTTCCTCTTGGAACTGGCTTAATTTCGCCTCTTCTAGGAAGGCCTCCTGGGGCCACTAGGGGGTGGGGGTGGGGGTGGGGTGTCCCGCCCTCACTGCCTGATTTGAGGCTGGGCTCATCCTGTCACTCTCTGTCTCTCCCTTGGCATCAGAGCAAGACGGAGGAGGACGTGGAGTCTGGGGAGGACGCGGGAGCCAGCAGACGGAACAGCCGCCTCCTAATGAGCAGCTTCTCCAAGCGCAAGGTCCAGCAGGGCTCCTGGCCTAGGGGGCCCTATCTGGGAGGGCCCAGTC----------TGAGC-CCACCGTCCTCCTAGCCCTC-TGTGCACCAGCCAGGG--G-AGGGTTTCTG-TAGGCCCT-------CGGAGCCCCTGCCT--------------------GGCTCCCAGACTCTTCCCTTGAGTCTTAGGCTATGTCGTCTGGCTACAGGTGGAGCTGTGT----------------CTGGGGTC--AGGGTCTCAGGGTCGAGGCTTGTCT-----------GGAAC---------AGGTGCCTGATGGTGCTCTGGCCCCT--GCCCTGTGCTGGCCCAAGCTGGCCAGGATCCTGGA----------------------------GCTG----------- 7 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-151811_152353 90.7% 44.2% ------------------------------------------GGGGCGGGATGGCCCAG----GAGC-----TGCCTGAACCGGCC-------TGGGG-GGGCGGGGGCG---GGGAGCCCAGGTGTGCCTGT----TCTCGTGGTGCTGGGAAGGCTCCCTG-------------------------------GGCTCCC-CCT--CAGAGT----CCACAGGGGCCGCAGCTCTGG--GTG-GGTGCTGGCTAGGCGA-CACCTGAGCTG--CC------AGACACGGGCAGGACACGAGC--TGCATAGCCTCGCAAGC------GTTGCATAAGCAG-----------CCGAG-GAGCGTTCCAGATACACAAATGCA-----TGTTATGTAGC---CGCCATCTG-------CGGGGAGA-----AAGAACTGGGA-ACTTA---ATGAGTTTAAAACATCAAGAGAAGCTGTGTGGGGGGAGTGAGGGTTTT--------------CACGGGCC----TGGCTTTCCAGATCCCT-CCTCCTGGCAACTGCCTCCATGCCCTGGGCAGACCCAAGCAGCAGGCGGGGGAGGCGGGTAGGGAAGGGGTGATCAAGCTCTGGCCCATCTCCCCCGCCAGCCTTCCCCTCCCCATCTTCCTCCCGGGCCTGGCTCAAGTCCACCTCTTCCAGGAAGACCTCCTGGGGCCACTGGGGAAGCTGTCC---------CGGCCTCCCAGTTTCTGCCTGTCCTAAGCCTGGACTCACCCTGTCTCC---CGTTCTCTCCACTGGGTCAGACCAAGGCCGAGGACGACGTGGAGTCTGTTGAGGACGCCGGGGCCAGCAGACGCAACAGCCGGCTTCTCAAGGGCAGCTTGTCCAGGCGCAAGGTCCAGTGGGGTACCTGACTGGGGGCCGATCTGAGCCCGCTGTCCCCCCGTCCCAGCCAGAGAG-GAGGGGTCT-CCTGCAGCCC-CGGGCCCTGGCTCAGGGTG-CAGGGTCCC------CTTTGAGGCCTTGGCTGTGCTGCTGGCTGGGGCTGGTA----GGGAGCCGGTGTCCCTGGGCCACTGGTCACCGCCCACCGTGG----CCCACGCTGACCAATACCCCAAGCT---------CAGG--------------TGCCCTGAGGCTGCCCTAAGAGTCCACTGGGCC---------CAGACCCAGAGGGCA----CCTCAGA--GGCCTTGGCAGGCCCGG------------------------------------------------------------- 8 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-251993_252501 94.1% 50.1% ---------------------------------------------------------------------------------------GGGGGGGGTGA-GTGCTGCCAGG--AACAGACCTGGGGGGCCCTGG--GGGTAGAGGAAGGGAGCCTGGCTGGTCCCGCAG-CTCCCC------------------GGGATCCCACGGCACAGAGCC-CGCTGTGGGGAGCGCAGACCTGGTGTTACCCCTCTAACCAGGCAA-CACCTTTGCGCGGGAGAAG--CAAGCAGGACGTCAGAGCTGC--AGGACCCTCGCAGAAGGGTTACATAAGCAGGCCTGG-----------CTGTG-GAACATTCCAGACACACACGCTGC-----ATTTATTATGTAGTCACCATCTGT-GG---GAAAAATT-----CAGAACTGGGA-ACTTA---ATGAGTCTGAAACATCGCAGCACGAAAACAGCGCTGGCCTGAGAACATTTCCACTGG---G-CTCGTGCC----CTGCTTTTCAGGCCACT-CCTCTGGGCAGCTGCCTCTGTGCCCTCGGG------------CAGACGGGGGCA-----GACGGGGGCAGA--CGGGGGCAGGGGGTCAAGCCCTGGCCCCCTGCACCCTCCCTGCCTTCCTCCCAGGCCCGGCTGGATCCCGCCTCTTCCAGGAAGGCCTCCCGGGCCCG-------------------------CAGGGGAGCTGTCCTGCCCGGTTTGAGGCTGGGCTCACCGTGTCACCCTCTGTGTCTTTCTGGGGGTCAGGGCAAGGCTGAGGAGGACGTGCAGTCTGGGGAGGATGTCGGAGCCAGCAGACGGAGCGGCCGCCTCCTCGCAAGCGGCTTGTCCAAGCGCAAGGTGGAGCAGGGGGACTGGTGGGGAGGCGGGCGGGGTCTCCTCCGGCCCAGGGCCCCTGGCCTGC-TACGTGTGCCGGGG---CTG-GGAGCCCAGAGACAGGCTG-GTAGGAGCCA-GTGCTTTGCTGGCCCTGTGGGCACTGCCTCCTCTGGCCC-------------------ACACTGGCCAATGTCCCAAGCTCAGGTACTCTGTGGCTGCCCTGGGCACAGGCCAAACTGGG-CACTGCAGAGG--------CCTAGGCAGACCTCGTGGGCA-------GGATAGACC---------CGGAGGCCCCCAGAA-------CCCA--GGAG--GAATGGCCCCCTCC-------------------GAGAAC-------------CCGTCC-------------- 9 Marmota_monax-NW_025724459.1-184768_185021 86.8% 32.1% ---------------------------------------------------GGGGCACGGAATGGACTGGTGGGAGTGGGAGGTGGGGGCTGCAGCAGCCTCGGGGGCAG--ATGCACAGCT--CGGGCTTCCGGCGGCGC---CAGCGTGGATGGGCTCAGGGACGG-CTGCGTGGACCT------------GGGGGCCGGGGCCAGTGCTC--CCAG----GCCTGAGCTCCAGGGTCCC-----GGGGGGAAGGCCC-GTCCTGTGCTC-CTGGGAT-TCGTGG-------------------GCATGGACTCTGGCTTTGGGGAGTGGGGCCTGGCG-----A------TGCT----TGTCTAGCCTGGCA--CTGCC------AGAGGTGGGTCAGGACAGTGGG--C-TGCAGGGACCT-----CGAGGAAGGCCTGCGCA--GGCGGTCACGGCTGGACCTTCCACTCAAACTGCTTGTCGCAT-----CGTCGCCCTCT-----GCTGGACA----CAGGTTCAGAGCCCG----GAGCTCGCGCTTGCTTCAGACCACACACT--------GTTGTGACCTGGCACAC-GAGTGCAGGCAGCCCTGGG--CCTGGGG--------------TCCTGTTCTCCAGCCCCTAGCCTCCCTAAGGCGGGCTCAGCTCTGCCTCTTCCAGGCAGGCTTCCAG-------G----------------GCTGCAGGGACCTGCCCGGCAGGTGTCGTCC--TGGTTTGAGGCCAGGCTCACCCTCTGTCTCTCCCTTGGGGTCAGAGCAAGGCCGAGGAGGACATGGAGTCTGGGGAGGACGCCGGGGCCAGCAGACGGAACCACCGCCTCCTCATGAGCAGCTTCTCCAAGCGCAAGGTCCAGCGAGGCTCCTGGGCT--------------------GGGGTCCCTGTCCGAGCCCACTGTCCTGCCTGCACCAGGTGCTGGCTGTGGCTGGCCTCAGGAGCCCAGGGGCAGGGGCTGGTC-------TGGGGCAGGTGCCTTGGCCCTTGGG------TCAC--TGCACTCCTCTGGCCCCACTGACTGCTG----TCCTGAGAGCC-----CGCTGGAG------------------CTGGGCGGCCTGGGCACTGCAGACCCTGGGAGAGGCCTGGCAGGCTGGGGCTGCCGGGAGCCCAGGG----CAGGCCCTCCACGCACCCTCCAGCCTTTGCCCATGG-----CCTGGCCTGACCTAGGGCTCC--------------------------------- 10 Camelus_dromedarius-NC_044523.1-199765_200241 88.9% 39.4% ------------------------------------------------------------------------------CAGGGGCAGGG----------GCGTCAGGAGG---GGAGCCCCTGATGCGCGAGTTCTCTAAACGGCAGCGAGGAAGGCTCAGCCCTGAGACTTCAGGAGATCTGCCGCAGCCCTGAGTGTGGACAGCAAGCGGCC-------------GCCACTCTGTGGGGAGCAGAGCC---AAGTTACTTGTCTAATTAGGTGAAGAAGCAGGCCAGGACTCCGGGGCTGC--AGGGCCCTTGTGTGAGGGTTATATAAGCAGGCAAGC-----------TGAGG-A-ATGTTCCAGATGCACAGACAAC-----ATTCATTATGCAGTCACCATGCACGGGA--AAAATAGT-----CAGAACTGGGA-ACTTA---ATGAGTTTAAAACAACACATCGCGGGGAGCTGATGCGGGCACGTGAGCGAGCGTTTCCACTGGTCCTCGCC---TTGGCTCTCAGGCCCCTGCTCCCGGCAGC-TGCCTGTGCGCACCCAGG---------GTGGGCTGGAGACGG-----TGCCACCA------GGG---CCTGGGGCAG----CAGCCAGCC---CAGGGCCCGGCTCCCCCTTCCTCCCGCTCTTGGTTCTCCCTCTTCCAGGAAGGCTGCCTGGAGCT---------GC--------------TG-----GGAGGAGCTGCCTGGTCTGAGGCTGGGCTCACC-CC--------GTCCCTCTGTCTCCT-CTCCTCCCAGGCCGAGGAGGACGTGGAGTCCGGGGACGATGCTGGAACCAGCAGGCGGAACAGCCGGCTTCTCATGGGCAGCTTCTCCAAGCGCAAGGTCTGGGGGCCTCTGGGTGGGGCCCT----GCCAGAGTGCAGCATGCTTCTTGCCCCCGTGTGC-ACCAGCTGCCCCTGTGCCAGCCAGAGGTGGGGGTTTT----------CCTCCAGCCTCGAGGGCCCCTGGGATTCCTGG------------------------CTGCATCTCCTGACTGCAGGTGCTAGGTTTGGAGTCC------------------TGGTCAGGGCTGGA-AGGAGTAAGTGGC--CTCACACTGGCCAGTGCCCAGAGCTCAGGTCACCCAGTGCC---------CAGGCCA-AGCAGGGCAAGGCAGAGGACGGGGCAGGCAGGCCTGCAA--GGTGGGCGCCCGGACCCACGGACGGCAGG---------------------------- 11 Microcebus_murinus-NC_033661.1-185231_185480 87.2% 40.8% GCCTCCTGGCACATGTGCCAGCACAGGCTCCTTGTGGGCGAGCTTGGGGGACAAACGCG----CAGTCTGTGACACGGCCCTGGGGGTCTAGGGGAG--GGCGGGGAGGG--C-------GCCCCATGCCCCTTCTGCA----CCGGGGAAGGGGGCTCGTCCTGCAG-CTCCC-------------------CAGAGTGG-CGGCTCCGAGCCCGCCTTTGAGGAACATGCACCTGGAGTTGTTTGTCTGACTAGGCAA-CATCTTGGCGCAGCCAAAAGCAGGTCAGAGCTTCAGGGATGC--TCGTGCAGGGCT--------------GCAGAGGCAG-----------CTGAG-GAACGTTCCAGACACACAGAGCGC-----GTTAACCATGTAGTCGCCATCTGGGG-----GAGAAAC-----TCAGAACTGGA-AGCTG---ATGAGTTTGCAGCAGCATGTCAGGAGAGGCCAGCGCGGGAGTGGGTGGCTGTTCCCG---------------------------------------CCGGGCTCGGCCTGTCCCCCCGCGGG-----------------------------C--------------ACCTCTGAACCCGGGTGTCCGACCA--------GGAGCCCGTCCTCCGCCCAGGCCTGGCTCCAGCCCACCTCCTCCAGGGAGGCCGCTGGGCGGCTG-----------------------GGGGAGCGTCCGCCCTCCCGGGGCTCACGCTGGCCTCACCGTC-----ACCCTGTCTCTCCCCCGGGCCAGAGCAAGGCGGAGGAGGACGCAGAGACTGGGGAGGACATCGGTGCCGGCAGGCGCAACAGCAGCCTCCTCGCGAGCAGCTTCTCCAGGCGCAAGGTCCGGTGGGGATCCCGGGCTGGGGACCTGTCTGAGCCCCGTCCGTCACCCACCTGCCAGCAGC-CCCCACCGGCCAGAGAGCAGGGGCCGCCCGTCCCCAG----GCCCTGGCCAGTCCCTAGTCTGG---AGTGGGCACCCCCACGGCCCTCCGG---------TCACCCCCTCTCCAGCCCATACTGGCCCGGTCCCC----------ACAGCTGCCCAGAGGGCCATGGCCAC-AGCCTCAGTGCACCCAGCGGAGGGGTGGACAAGGAGGCCACGCAGCCACTGGGG-A---------CCCTCCCAGCCTCCGCCCTGCCC---------TGCTCGGGCCCACGG--CTC------------------------------------------------------ 12 Castor_canadensis-NW_017871110.1-184010_184286 85.4% 31.0% -------------------------------A------ATGTGAGGCATGGTCTCCCAG----CAGCTCTGGTGGGAGCCTC--------------GACCTGCTATATTC-AGGGTGGA-----TGTGA-AGATTTGTGAG---GTGGGGCAAGGTGCTTCTAGAGCC-AACCTGGGGTCC------------TGGGGCAGGGGACTTGGGGG--TGCCCT------------GGGTCTGC-------------CTGGGT-GTCCTGAGCCT-TGGGGAG-TGGCCCTGGAATTCTTTCTTTCATTAAGTGACGCCCCTATTCGGCAAGAAGCAGGGCAGG--ACATTAGGGCTGCAAGGATCCTCTGGAAAGGACTGC-----------ACTAACAGGCTTCGGCTTGG--C-TGGAGAACATT-----CCAGACACAAG-CCGCA---TTTATCTTGTATTCTTTGTCCTTGGGAAAGATGTTCAGAACCAGTACTG---AGTTA-----AAAGCACA----CATTGCGAGAAAGTG----GTGTTGGCATGTGAACAAACTCGATCCCA----------------GCCTCCCCA-TTTTCCAGGCCTCACCTAG--GCAGCTGCGCCC---------ACTCACCTACCCGCCCTGCCTTGCTCTCAGGCCGGCTCAACGCCACCTCTTCCTGGAAGACCTTT---------------------------GGGGGCTGTCCTGCCCTCTCTGCCTGGTCC--AAGTCTGGGCTCACCTTCTGAGCCTGTGTTTCCCTCAGGGTCAGAGCAAGGCTGAGGAGGGCGTGGAGTCCGGGGAGGAGGCTGGGGCCAGCAGTCGGAACAACCGTCTTCTTATGAGCAGCTTCTCCAAGCGCAAGGTGAGTGGAGCCCCTCAGCTGGGTGCCGT-----------------------TTATGTCCACTGTCCTTCCTGCACCAGGTGCTAGCTGTGGCTGGGGTCGGGAGCCCAGGGGCAGGGCTGCTCA-------GGAGCAAGTGCCTTGAGGGCCCTCT------GGTCACTGCCTTCCCTAGCCTCCACTGGCTGATGCCAGAGCTCAGGTACCACATGGCTGTCCCGAGAGTACACCAGGGTCAGGGTGGAGCAGGACACAGCAGAGGCCTCTGCAGGTTCAGCTGGGCAGG-----------GTGG----------------------GCCT-------------------------GGTAGGCCGTGTGGACTGCCTGAGAAC--TCAGGTAG-GTGGCC------- 13 Rattus_norvegicus-NC_051340.1-186140_186370 88.4% 33.9% -------------------------------------------------------------------------GAGTGGGTG-GTGATGTCATAACAGTCTGGGAGAAGCCAGTGTGCAGTACAGTTGGTCAGTGACTTTC---ATGTGGACAAGAGACCCGGATGGG-ATCCTGGC----------------------CAGGGCC--TGGGA--GGACCTGGGGTGTGTCTACCCTGTGCCCAGGGCGTAGGTAGTTCT-GTCCTGCGCTC-CTCAGAC-TCA-------GCTGGCTGTATCTGGAATTACTCACTCTATTTGTGCTACAGTAAGAGACT--------------------GGGGCATCAGGGCTTTAAAAA------AGGATTACGTAAGTAGGCTCGG--C-TGAAGAATATT-----CCAGATGCAAG-CTGCG---TTTATTATGCAGCCTCCATCCATGATAAAGAAATTTGGAACTGATTACTTGAGTTTA-----AAACCACC----CACCACGGGAGGCTG----GTGCGGGCATGTGAATAT----ATGCCAC--------TCT-GTCTCTAGTCCAG-CTCTTCAGACCTCTTCCCG--GCAACTGTGCTTGCCCCATACCCCTACCCCAAATCAGTGCCTTGTGTCCAGGCTTAGTCAAATCTACCTCCTGCAGAAAGGCCTTCTGGGGCCACC----------------AGGGAGCTGTCCTGCCTTCCTTGCCTGGTTG--------GAGGTTGGATTCAACTTCTGTCTGTCTCTCAGGCTCAGAGCAAGGCCGAGGAAGATGTGGAGTCTGGGGAGGACACCGGGGTGAGCAGGCGGAACAGCCGTCTCCTCATGAGCAGCTTCTCCAAGCGTAAGGTGAGGAGAGGTCCTGGGCTC--------------------AGGGGTCCCATGCAGTTCTGCCGTCATCCCTGTACCATTCTCTATCTGTGGTTGGGGTCAGGTT-CCCAAGGCAGGAGCTCTGG-------CTACTGCCTTCCCTTGACCCACACT------GGCCAGTGTCT--GAGATTCAGA------------------------------------CACAGGGAGTCCCGAGAGTC-ACCCAGGGCCAGGGCACCGCCAATACCTCTGTGGGCCAATTGGG-TAGGAACTCAGGAACCTGGGCAGATAGC--CCCTACCCTGCACCTCCTGGCCTTTTACATGT-----CCTAGTTTGATCTCAGGTCACAATTCCA-----------C-TT----------- 14 Lemur_catta-NC_059130.1-185110_185330 86.9% 40.4% 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16 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-185359_185528 84.8% 31.3% 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23 Cricetulus_griseus-NW_003616165.1-61027_61249 88.5% 34.3% 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clustal * * * ... **.*. *. . *. * . ** * . .* .. ** .* *. .*.* * * . ..* .. ** ** *.*** ***** |