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 1 Target                                                  100.0% 100.0%    ---------------------------------------------------------------------------AACGCGTCCAGCGAGGCAGTG--TCCAGGCAGGCCCAGGTCCAGGCTGGGGAGAGCGGGCAGCAGT-CGGAGCTGTTTGCTGTG-GCGTGGCTGAGCGC-CGAGTGTCTGTGGTCATGA--GAGCTACAGTGGCCTCTTTGCAGCAGTGTGGGAG--CATCCAGGGGTGTGGGAGGGTG-TGTGTGCAGGGGCGTGCTGTGGGTGTTGCAGGGGTGTGTGCAGAGGGGTGGGCGTGTACAGGGGCATGGCCACGGGTGGGTGATGTGTC-CGCTTCTGG-CGGAAGCCCCCTCCTAACAGGGACCGCTGC-TG--CA-------GGCCCACGGCTTTGCTGTGTTTCAAAGAAAGTAGCCCCCACCCTTGGTGGGGGA----------------CAG------GATGTG---------------------GTATGGG-AGCCCCTCCTGAGCACAGCTGGGCCATGTTTTGGAGGTGTC--T-GTGGGAGGGGCTGCA-GG-----------------------------------------GGTCAGGTGGTGGCACAGGCTCTGCTGGTTCCATTGGGAATGAGCTTTGGGG-TGAATGAGCAGCTCGTGAGGCAGCCCTGGGTTCG----------------------------------------------------GCGGGGGGCAGGCAGGGTAGCCCTGGATGTGTCTGCTACTTATACA-GCG-GTAGGAAGGCTC-ACAG--TGGTTT-----------------------CCTGGGGTTCCC-CAGCT--CAGAACCCGCCTCAGGGAGTGCCCACCTGGAGCCGTGTGTCTGATTAGGGATACCCGCGC--ACTGCGG--------GAACA-GGTCAG-GGCCGTGGAATGCTCGTAA---AAGGGTTGCGCAAGCAGGCCT----------G--------GCCGAGCAGTATTCCAGGCACACAAACGCAGTTA-TTACGTAGTCACCACTGGTGGGA-AAAAAG---GATTCA-----GAACTTAACGAGTTTAAAACAACACATGAGAGACGCTGAGGCAGGTGTGAGCGAATGTTTC-----CACCGGGGCCTGAC--TTTCAGGCC---------GCTTCTCCTCGGCAGCTGCCTCTGCCC---CAGGGTG--------GACTGGGAACGGCTGCCACGGG-GGCTC-CCCAA-CCT---GTCCCCGCCCTGCC-CTC-------CCCTCCCGTCTGCCT---TACTCCAGACCTGGCTCAAGCC----------------------     
 2 Macaca_nemestrina-NW_012011823.1-218911_219913           99.1%  85.3%    -----------------------------------------------------------------------------TGCGTCCGGTGAGGGAGTG--TCCAGGCAGGCACAGGTCCAGGCTGGTGAGAGCGGGGAGCAGT-AGGAGCGGTTTGCTGCG-GCGTGGCTGAGCGC-CGAG--TCTGTGGTCGTGA--GAGCTGCAGTGGCCTCTTTGCAGCAGTGTGGGAG--CATCCGTGGGTGTAGGAGGGCG-TGTGTGCAGGGGCGTGTTGTGGGTGTTGCAGGGGTGTGTCCAGAGGGGTGGGCGTCTACAGGGGCACGGCCACGGGTGGGTGCTGTGTC-CGCTTCTGG-CGGAAGTTCCTCTCTAACAGGGACCCCTGC-TG--CA-------AGCCCAGGGCTTCGCGGTGTTTCGAAGAAAGCAGCCCCCACCCTTGGTGGGGGA----------------CAG------GATGTG----------------------CATGGG-AGCCCCTCCTGAGCACAGCCGGGCCATGTTTTGGGGGTGTC--T-GTGGAGGGGGCTGCA-GG-----------------------------------------GGTCAAGTGGCAGCACAGGCTCTGCTGGTTCCATTGGGAATGAGCTTTGGGA-TGAATGAGCAGTTGGTGATGTGGCCCGGGGTTCA----------------------------------------------------GCGGGGGGCAAGCAGGGGAGCCCCGGATGTGCCTGCTGCTTACACA-GTG-GTAGGAAGGCTC-ACAG--TGGCTT-----------------------CCTGGGGTTCCC-TGGTT--TACGGCCCGCCTCAGGGAACGCCCACTGGAGCTGTCTGTCTGATGACGAGGTACCTGCGC--GTTATGGGAACAGGTCAGGG-CGGCAG-GGCCACGGAACGCTCGTAA---AAGGGTTACGCAAGCAGGCCT----------G--------GCCGAGGAATATTCCAGACACACAAATGCAGTTA-TTATGTAGTCACCACTGGTGGGG-AAAAAA---GATTGC-----GAACTTAATGAGTTTAAAATAACGCATGAGAGACGCTGAAGCAGGTGTGAGCACATGTTTC-----CACCGGGGCCTGCC--TTCCAGGCT---------GCTGCTCCTCAGCAGCTGGCTCTGCGC---CAGGGCG--------GACTGGGAACGGCGGCCACCGG-GCTCC-C-CAA-CCT---GTCCCCGCCCTGCC-CTCTC-----CTCCCCCGTCTGCCT---TACTTCAGACCTGGCTCAA-------------------------     
 3 Trachypithecus_francoisi-NW_022681457.1-212679_213249    95.8%  63.0%    ------------------------------------------------------------------------TCCGATGCGTCTGGTGAGGGAGTG--TCCAGGCAGGCACAGGTCCAGGCTGGTGAGAGCGGGGAGCAGT-AGGAGCGGTTTGCTGCG-GTGTGGCTGAGCGC-TGAG--TCTGTGGTCGTGA--GAGCTGCAGTGGCCTCTTTGCAGCAGTGTGGGAG--TATCCGTGGGTGTAGGAGGGCG-TGTGTGCAGGGGCGTGTTGTGGGTGTTGCAGGGGTGCGTCCAGAGGGGTGGGCGTCGACAGGGGCATGGCCACGGGTGGGTGCTGTGTC-CGCTTCTGG-CGGAAGTTCCTCTCTAACAGGGAC-CCTGC-TG--CA-------AGCCCACAGCTTCGCTGTGTTTCAAAGAAAGCAGCCCCCACCCTTGGTGGGGGA----------------CAG------GATGTG----------------------TATGGG-AGCCCCTCCTGAGCACAGACGGGCCATGTTTTGGGGGTGTC--T-GTGGAAGGGGCTGCC-GG-----------------------------------------GGTCACGGGGCAGCACAGGCCCTGCTGGTTCCATTGGGAATGAGCTTTGGGA-TGAATGAGCCGTTTGCGATGTGGCCCGAGGTTCA----------------------------------------------------GCGGGCGGCAAGTAAGGGAGCCCCGGATGTGCCTGCTGCTTATACA-GCG-GTAGGAAGGCTC-GGCC--GGGCGC-----------------------GGTGGCTCAAGC-CTGTA--ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGACGGGTGGATC--ACGAGGTCAGGAGATCGAGACCA--TCCTGGCTAACATGGTGAAA-CCCCGT-CTCTACTAAAAAATACAAA---AA----------------ACT----------A--------GCCGGGCGACATGGCGGGCG----------------CCTGTAGTCCCAGCTGCTTGGG-AGGCTG---AGGCAG-----GAG---AATGGCGTAAACCT--AGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGACCCGGCCACTG-----CACTCCAGCCTGGG--CGGCAGAGCGAGA---CTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA---AAAAAAG--------GAAGGCTCACCGTGGCTTCCTG-GGGTT-TCCTG-GTTCACGGCCCGCCTCAGGG-AGCGCCCACCTGGAGCTGTTTGTCTGATTACGTGGGATCTGCGTGTTACGGGAACAGGTCAGG---------     
 4 Callithrix_jacchus-NC_048389.1-198887_199807             94.9%  64.2%    ----------------------------------------------------------TGTGTGTCCTGATTTCCAATATGCCCAGTGAGGAAGTG--TCCAGGCAGGCGCCGGTCTAGGCTGGTGAGGCCGGGGAGCAGG-AGGCACTGTTGGCTGTG-GCAAGGCTGAGCGC-TGCGTGTCTGTGGTCTTGG--GAGCATCCGTGGGTGTGT---------------------------------------------GAGGCATGTGTGCTGTGGGTGTGGCAGGGATGTGTCCAGAGGTGTGGGCGTGTGCAGGGGTGTGGCCATGGATGGGCACCGTGTC-TGCCTCTGG-TCAAAGCCCCTCTCTAACAGGGAC-CCTGC-TT--CG-------GGCCCACAGCTTCGTGGTGTTTGAAAGAAAGCAGCCCCC--CCATGGGTGGGGA----------------CAG------GATGAG---------------------GGATGGG-AGACCCCCCTGAGCAGAGCTGGACAAAGTTTTGGGGGTGTC--A-GTGGAAGGGGCTGCA-GG-----------------------------------------GCTCGG--GGTGGCAGAGGCTCTGGTGACTCTGTCAGGAATGAGCTTTGGGA-TGAATGAGCAGTTTGGATGCAGCCCTGGGTTGGGCAGG------------------------------------------------GGCAGGGGCAGGGAGCGGAGCCCTAGTTGTGCCTGCTGCTTGCACA-GCA-ATCAGAAGGCTC-ACAG--TGGCAT-----------------------CCTGGGGTTCCC-GGCTC--AGAGTCTGCCTTGGGGTGCGCCCACCTGGAGCTGTTTGTCTGATGAGGTGATACCTGCGT--GCTGTGGGAAGAGGCCCAGG-CAGA-G-GGCTGAGGAATGCTCATAA---AAGGGTTTCGTAAGCAGCCCT----------G--------GCCGAGGAATATTCCAGACACACAAATGCATTTA-TTATGCAGTCTCCACTGGTGGGG-AAGAAA---TTCAGAATTGGGAACTTAATGAGTTCAAGACAACACAGGAGGGAGACTGAGGCAGCGTGAGTGAATGTTCCC-----CCCACAGGCCTGCC--TCCCAGGG----------CCTTCCCACCAGCAACTGCCTCTGCCC---CAGGGTG--------GACTGGGAACAGCAGCCACAGG-AGCTC-CCCAA-CCTGGCCCCACCCTGCCTTT-CTGCCCCCAGGCCTTTCAAG--TCCACCTCTTGCAGGAAGGCCTCCTGGGGCCAC-----------------     
 5 Cebus_imitator-NW_016107460.1-194210_195099              91.3%  59.1%    ---------------------------------------GGCATGGGGCCTGCCATGACGTGTGTCCTGATTTCCAATGCGCCCAGCGAGGAAGTG--TCCAGGCAGGCGCCGGTCCAGGCTGGTGAGGCCGGGGAGCAGG-AGGCGCTGTTGGCTATG-GCACGGCTGAGTGC-CACGTGTCTGTGGTCATGG--GAGCATCCGTGGGTGTGT---------------------------------------------GAGGCGCGTGTGCTGTGGGTGTGGCAGGGATGTGTCCAGAGGTGTGGGTGTGGCCGT------------GGGTGGGCGCCGTGTC-TGCCTCTGG-TCGAAGC----CCCTAACAGGGAC-CCTGC-TG--CA-------GGCCCACGGCTTCGTGGCGTTTGAAAGAAAGCAACCCCT--CCATGGGTGGGGG----------------CAG------GATGAG---------------------GGGTGGG-AGACCCTCCTGAGCAGAGCTGGGCAAAGCTTTGGGGTTGTC--T-GTGGAAGGGGCCGCA-GG-----------------------------------------GCTCGA--GGT---------------GGCTCCGTCGGGAAGGAGCTTTGGGA-TGAATGAGCACTTTGGATGCAGCCCTGGGTTGGGCGGG------------------------------------------------G------GCGAGGAGCGGAGCCCCGGTTGTGCCTGCTGCTTGTGGA-GCA-ATCGGAAGGCTC-ACGG--TGGCGT-----------------------CCTGGGGTTCCC-GGCTC--AGAGCCCGCCTCAGGGAGCGCCCACCTGGAGCTGTTTGTGTGACGAGGTGATACCTGCGT--GCTGTGGGAAGAGGCCCGGG-CAGCGG-GGCTGAGGGATGCTCGTAA---AAGGGTTTCGTAAGCAGTCCC----------G--------GCCGAGGAGTGTCCCAGACACACAAATGCATTTA-TCACGCAGTCTCCACTGGTGGGG-AAGAAA---TTCAGAATTGGGAACTTAATGAGTTTAAGACAACACAGGAGGGAGACCGAGGCAGCGTGAGTGAATGTCCCC------CCACGGGCTTGCC--TCCCAGGG----------CCTTCCTGCCAGCAGCTGCCTCTGTCC---CAGGGTG--------GACTGCAAACAGCAGCCTCGGG-GGCTC-CCCAA-CCCGGCCCGCCCTGCCTTTC-CACCCCCCAGGCCTCGCTCGAGTCCACCTCTTGAGGG-AGGCCTCCTGGGGCCACCAGGGAGCTGCCCCGGC     
 6 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-199105_199451            89.8%  45.8%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCAAGGATGCAGCCATGAGTT------------GTTCGCTGTGA-------GCTTGGTCAAGAGCATACGTTTCTGTGATTGTCAGATGCCCCCAGTGGGCTCTGTGGCCACTTAG---AG--CACCCGTGGATGTGTGCAGGGGTGGGCGGG--------------GTGTTCGCAGTGGGGCGTGT--ACAGGAGT-CCTTGATGAATGTGGGTGCAGCTGCCTGTGCTATGCC-CGCCTCTGG-TGGAAGACCTA-----AGTG-GGACTGTGG-TT--GT-------TGGGACAGGGCACACCATATCTGGTAGAAGCCAGCCCCTACTTCGAGCAGGGAA----------------TGA------GATTTG---------------------GCAGGGG-GGCACCTCCTGCACCGAGCTGGGTTGAG-TTTGGGGTCATC--T-GTAGAAAGAAGGGCT-GGGGGGAAGTGGGCGGC--AGCTGCAGCATCCCGAGA-----TGCAAGCACACCCGCACAGCCTCCCGGCGGCTCTGTGTGAATGGGCTTTGGGA-TGA-ATGGCAGTGTGTGACTCACCCCTGGGTGGTGGTG----GAGGGTGCTGCCAGACCAGGC-------------------CTGGGGCAAGGGCCAGGAGGGGCGCCCTGGATGTACTCATTTTATTCACA-GCAGGTAGGAAGGCTT-GTCTTGCTGCTT-----------------------CCTGGGGTTTGCTGGCAT----GAAGGCCTTTGGGGAGTGTGGACCTGGTATTGTTTGTCTAATTAGACAATACCTTTGC--ACTGCAAGAAGAGTGCAGGA-CATCAGAGCTGCAGGCATCCTCATAG---AAGGGTTACATAAGCAGGCGC----------A--------GCTGAGGAATATTCCAGACACACAAACTGCGTTTATTGTGTAGTCACCATCTGTGGGAAAAAAAA---TTCAGAACTGGGAACTTAATGAGTTTAAAACAACACATCATGAGAAGCTGATACGGGTGTGTG-----------A--GCGAACCTCCTGCT--TTTCAGGCC----------TCTCCTGCCATGTGCCTCCAAGGCAG---AAC----------------TGGGGCAGCAGCCAGTCGGTGGGG-CTCAGCACCGGCCCCGACTCCCTGGC-CTGGCCCTCCCCATCTTCTCTGCCTTCCTCTTGG-AACTGGCTTAA--------------------------     
 7 Lemur_catta-NC_059130.1-184379_185031                    87.4%  41.6%    --------------CGGCAGGAGTGTCCAGGCCGTGCCTGGCACCGAGCCGGTGGTGGTG--ACGTGCTGTTTCCAGTGTGTCTGACCAGGTGGTG--TCGGGCGGG--AGGTGTCCAGGCAGAAGAGATCAAAGGGGCAGGCTCTGCAGCTCATGGTGGGGTTGGCCAGGCG--CTGAGGTCCGTGGCGGTCAGACGCCCACGCCGTGCGCTGTGCAGCGGCTTTGCAG--CATCCATGGGTGTGTGCG----------------------------------------------------------------GGGTGTGTCCACGGGCGTGGGCCACGTGTC-CGCCTCTGG-CTGAAGCTGTC-TCTCACA------------GG--GA-------CCCGCTCCTCTCCGTGGTGTTTGACAGACACCAGCCCTCACCTGGGTGGGGGA------------------CG------A-GGTG---------------------GGGTGGG-GGCACCTCTGGAGCACAGCGGGGCCGAG-TTTGGGGGCGTC--T-GTGGAAGGGATTGGG-GAGGGCGGCGGCAGCTG-------------CCTCGT------GGCACATGTGCTGGCAC----------AGACTCCTTGTGCGTGAGCTTGGGGA-CCAACGAGCAGTGTGTGACACGGTCCTGGGGCTCTGGG-------------------------------------------------GGAGG-GGCTGGGAGGGTGTCCCCCCCCCGTGCCCCTTCTGTACC-CGGGGAAGCGGGGCTC-ATCCAGCAGCTC-----------------------CCCGGAGTC-GC-CGGCT--GAGGCCGCCTTTGAGGAGCACGGAGCTGGAGTTATTTGTCTGATTAGGTAACACCTTGGC--GCTGCCAAAAGCGGGTCAGCACATCAGCGCTTCAGGGGTGCTCGTGA---AA-----GGGCCGCAGAAGTA----------G--------GCTGAGGAATGTTCCAGACACACATAATGCATTTATTACGCAGTCACCATCTGTGGGAAAA-------CTCAGAACCGGGGACTTAATGAGTGTAGAACAACACGTGGTGAGAGGCCAGCGTGGGTGTGAGTGGCTGTTCC----CACCGGGCTCAGCC--TGTCCCCCCAAGG---GCAGCTCTGGGCCCGGGCGCCCGACTGGG---CTC------------CCGCCTGCCCGCCCTCCGCCCG---GGC-GTGGCTCCAGCCCACCTCTTCCAGGA-AGGCCACTGGGCAGCTGGGGGAGT-----------ATCCGCC------------------------------     
 8 Camelus_dromedarius-NC_044523.1-199765_200001            78.6%  28.9%    ------------------------------GGGAGGCGGGGC----------TGGCATCCCCAGCCCAAGCTCCAGGCTCTTCTGCCA--GGCGAC--TCGAACCCAAACCTG--AGGGGC---TCTGCT------C-----CTCTGCTGGGTGGGAGG-C-----------------------------------CGGCCAGGAGGGGCTGTGGTCAGGGGTGTGCAGGA-GCGT---CCA-----CGGGGGCAAGTGCAGAAG-CT-----------------------------------------CG------------CAGAGGTGCGGGTGGAGTGTGTGTGCAGATG-CGTGTGCCCCTGGCTAATGGAGAACTTTGGCCG--CA-------GGTGCCCGGCTCCCGGGAGCCTGAGGGAAGCCAGCTCCTGCCCTGG------------------------------------------TGGGCACATCATGAGCAAAGTTGGG----------------AGAGTTTG---G------GGGGCATC--T-GGGGAAGG----TGGAGGGGTGGCTAGTG----GCGGTGGCAGTGGCCTCGGGGA-CCCTGGC------ACAGGCTCCCAGCTGCTCCAGGGGTGTGACGAG--CTTCAGGATGGACGAGGGGTTTGTGCCTTGGCCCCAGAGGGGGACAG-GCTGTGGTGTTGCCAGGCCCGG------GGGCCCCTCGGGCAGGGGCAGGGGCGTCAGGAGGGGAGCCCCTGATGCGCGAGTTCTCTAAACG-GCAGCGAGGAAGGCTCAGCCCTGAGACTTCAGGAG-----ATCTGCCGCAGCCCTGAGTGTGGACAGCAAGCGGCCGCCACTCTGTGGGGA-GCAGAGCCAAGTTACTTGTCTAAT-----------------TAGGTGAAGAAGCAGGCCAGGACTCCGGGGCTGCAGGGCCCTTGTGTG----AGGGTTATATAAGCA-GGCA----------A--------GCTGAGGAATGTTCCAGATGCACAGACAACATTCATTATGCAGTCACCATGCACGGGAAAAA--TAGT--CAGAACTGGGAACTTAATGAGTTTAAAACAACACATCGCGGGGAGCTGATGCGGGCAC-GTGAGCGAGCGTTTCCACTGGTCCTCGCCT-TG--------------------GCTCTCAGGCCCCTGCTCCCG-GCAGCTGCCTGT----------GCGCACCCAGG--GTGGGCTGGAGACGGTGCCACCAG-------GGCCTGGG--GCAGCAGCCAGCCCAGGGCCCG--GC--TCCCC--CTTCCTCCCGCTCTTGGTTCTC-----C---------     
 9 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-251993_252204      89.5%  44.4%    -----------------------------------------------------------GC------------------------GCGGGGGGTGG--TCCAGGCAGGGAACAAGGGGCAGGCGTGAGGT------------GTTTGTCCTAT-------GGTTGGCCGAGGGCCGAGGGCTCTGTGGTTGTCAGATGCCCACAGTGGGTTTTTTGTGGCAGCTTTAGAG--TGTCCACGGGCATGTGCAGGGCATGTCCACGGATGTGTGCAGGGGTGAACACAGTGGGGCACAC--ACCAGAGTTCTCTGACGGGTGTGCATGGTGG-------------TC-TGCCTCTCG-TTGAAGCCCCTCTCTAACAGGGACCCCTGACTG--CA-------GGTGCACAGCTCCATCATGTCTGACAGAGACCAGCCCCCACTCTGCATGGGTGA----------------CAA------GACGTG---------------------GGAT-GG-GACACCTCCTGAGCAGAG---------C-TTTGGGGGCCTC--T-GTGGAAGGAGCTT-A-GGGGGACCAGGGATGGC--AGCTGCAGTGGCCTCAGGGA---CACACATGTCCCAGCACAGGAGCCCGATGGCTCAGTATGAATGAGCTTCAGTT-GCA-TGAGCATTT-GCGACATGGCCCTGGGGGGGG--G----GTGAGTGCTGCCAGGAACAGA-------------------CCT---------------GGGGGGCCCTGG------------GGGTAGAG-GAAGGGAGCCTGGCTG-GTCCCGCAGCTC-----------------------CCCGGGATCCCACGGCAC--AGAGCCCGCTGTGGGGAGCGCAGACCTGGTGTTACCCCTCTAACCAGGCAACACCTTTGC--GCGGGA-GAAGCAAGCAGGA-CGTCAGAGCTG-CAGGACCCTCGCAG---AAGGGTTACATAAGCAGGCCT----------G--------GCTGTGGAACATTCCAGACACACACGCTGCATTTATTATGTAGTCACCATCTGTGGGAAAA---A---TTCAGAACTGGGAACTTAATGAGTCTGAAACATCGCAGCACGAAAACAGCGCTGGCCTGAGAACATTTCCACTGG--GCTCGTGCCCTGCT--TTTCAGGCC----------ACTCCTCTGGGCAGCTGCCTCTGT-G---CCC----------------TCGGGCAGACGGGGGCAG-ACGGG-GGCAGACGGGGGCAGGGGGTCAAGCC-CTGGCCCCCTGCACCCTCCCTGCCTTCCTCCCAG-GCCCGGCT-----------------------------     
10 Hipposideros_armiger-NW_017731634.1-184375_184603        78.7%  30.6%    -----------------------------------------A----------CCTCTTCCAGGGGACTAGGGTCTTGCTCACCTCCTT--CCCGCG--TGAGGGGCTGGTGAG--CCAGGC---TGGAGC------G-----TTCTTTGGGGTCTGGTG-TGT-----GTCC----C------------------------ACAGGGACACATGTGCAGATGGCACACGGG-CACA---TTC-----GGGGCACGTGTGTGAGTG-TG-----------------------------------------TG------------CAGGCGTGTGCGCAACGTGAC-TGTCTCTGG-CTGAAG--CCACTTTAACATGAACCCTTGGCCA--CA-------GGTGCACGGCTCCTGCAAGCCTGACAAAGCCAGCCCCAC--CCTGGATGGAGAC---------------AAGTCGTGGGGAGGGGGC-CCTGCATATCCTGAGCAGAACTGGG----------------TGGGTTTC---G------GGGGCATC--T-GTGGAGGGG-------CCTGGGGCTGATG----GTGGCTGCAGCGGGCTCAGGGA-CGCTGGC------ACAGGCTCCCGGCAGCTCCACGCGTGTGAATGAGCTTCAAGAGGG--TGAGAGGTTCGTGCCTCGGACCCACAGGGGAATGG-GCCACGGTGCTGCCAGCAGCCGGCCGGGTGGCCCC-TCG-------------GGCAGGGAGGACAGCCCTGGCCATGCACGTTCTAT-------ACACGTGGAAGGCTCAGTCCTGTGTGGTCAGGGA-----TTCACCACA--GCGTGAGAGGGAACCGGAAACAGCCCGCCGCTGTG-GGGAGCGCAGCCCCTGTTATCTGTCTAATTAGGGAAAACCTTTGC-TGCTGCAAGAAACAGGCCAGCACATCAGAGCTGCAGGGTTCTCATAAA----AGGGTTACATAAACAGGCTC----------G--------GCTGGGGAATATTCCAGACACAGAAGGCATTGATT---AGTAGTCGCCATCAGTGGGAAAAA---ACC--CAGAACTGGGAACCTAATGAGTTTAAAGCAACACATGTCAAGTTGCTGATGCAGGTGA-GGGGCCATCCACCAGGGCCCTC------------------------CCTTGTTCTTCTCGGGCCTCTGCTACCT-CCGTG----------------------CCCCGG--GTGGGCTGGGGACGGTGCCTCCCTCCCACGAGGCCTGGG--GCAGCCAGCCCACCCGGCCCCG--CT--CAGGT--TTCTCTCTTCCAGGAAGGCCAC-----CTG-------     
11 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-151811_151982            89.1%  41.0%    --------------------------------------------------------------------------------------TGATCCGGCT--TCTAGTGCCTCTCCCTGGCCGAGGCATCACCA------------CTGCACCAGAGGGAGCG-GGCTGGCTCAGCCGGGAGCTTAGCA------TGAGTGTCCCTCCCTGGGGCATCTGGGG---------CT--CGCCCTCCGGCAGCCTGGTGACCGGAAGGCCCCTTGGTGCAGGGGTATGCCTATGGGAGTGTCT--GTGGGGTG---TCCACGGTCACAGACAGGGGTGCATGTGCTGTGTC--TGCTCTGG-CTGAAGCCCTTCTCTAACGGGGACCCCAGGCGG--GC-------ACC----CAGCTGCATGTGTTTGACAGAGACCAGTCCCCACCCAGGGTGCAAGG----------------TAT------GGGTGG---------------AG-CATGCAGAGT-GCAGCATGCAGGGTGCAGCTGAGCCTGA-GCTCCGGTCGTC--T-GTGGAGGGGGCAGCA-GGTTGTGGCTCCATCCCTGAGCTCGAGGCACCTGTGGACGGGGTGGTGGGCAGTGGTGCGGGCTCTGGCTGGCTTTGAGGTGTGGAGCTTCGGGA-TAAATGAGTGGTTTGTGTGGTGGCCCTGGGGCGGGATG--GCCCAGGAGCTGCCTGAACCGGC-------------------CTGGGGGGGCG---GGGGCGGGGAGCCCAGGTGTGCCTGTTCTCGTGGTG-CTGGGAAGGC-----------------TC-----------------------CCTGGGCTCCCC-CTCAG--AGTCCAC-----AGGGGCCGCAGCTCTGGGT---GGGTGCTGGCTAGGCGACACCTG--A--GCTGCCAGACACGGGCAGGA-CACGAG------CTGCATAGCCTCGC---AAGCGTTGCATA------AGC----------A--------GCCGAGGAGCGTTCCAGATACACAAATGCATGT---TATGTAGCCGCCATCTGCGGGG------A---GAAAGAACTGGGAACTTAATGAGTTTAAAACATCAAGAGAAGCTGTGTGGGGGG---AGTGAGGGTTT---------TCACGGGCCTGGCT--TTCCAGATC----------CCTCCTCCTGGCAACTGCCTCCATGC---CCTGGGC--------AGACCCAAGCAGCAGGCGGGGG----AG-GCGGGTAGGGAAGGGGTGATCAAGCT-CTGGCCCATCTCCCCCG-CCAGCCTTCCCCTCCC-CATCTTCCTCCC-------------------------     
12 Microcebus_murinus-NC_033661.1-184549_184736             86.6%  40.4%    --------------ACGGCGGGAGCGTCAGGCCGTGTGTGGCACCGAGCTGGTGACGTGA--GGAGCCCGCCTCCAGCCTGTCTGGCCCGGTGGTG--TCGGGGCGG--GCAGGGCT-------------------CCAGGCAGCCGCGGTGTGTGGTGGGCTTGGCCGGGCG--CGGAGGTCCGTGGGGGTAAGACGCCCACACTGTGTGCTTCTCAGGGGCTTTGGGG--CATCCCCGGGCGTGTGCGGGGCGT-------------------------GTGTGGGGCG-------TGTGCGGGGCACGTGCGGGGCGTGTCCCGGGCGAGGGCCATGTGCC-TGCCCCTGG-CTGAAGCCGTC-TCTAACA------------GG--GA-------CCCGCTCCTGCCCATGGTGTTCGACAGACACCAGCCCTCACCTGGGTGGGGGC------------------GA------GACGTG---------------------GGGTGGG-GGCACCCCCGGGGCACGGCTGGGCCGGG-TTTGGGGGCGCC--T-GTGGGAGGGGCTGG-------GGGTGCCGGCTG-------------CCTCCT------GGCACATGTGCCAGCAC----------AGGCTCCTTGTGGGCGAGCTTGGGGGACAAACGCGCAGTCTGTGACACGGCCCTGGGGGTCTAGG-------------------------------------------------GGAGG-GCGGGGAGGGCG-------CCCCATGCCCCTTCTGCA---CCGGGGAAGGGGGCTC-GTCCTGCAGCTC-----------------------CCCAGAGTGGCG-GCTCC--GAGCCCGCCTTTGAGGAACATGCACCTGGAGTTGTTTGTCTGACTAGGCAACATCTTGGC--GCAGCCAAAAGCAGGTCAGAGCTTCAGGGATGCTCGTGCAGGGCT------------------GCAGAGGC----------A--------GCTGAGGAACGTTCCAGACACACAGAGCGCGTTAACCATGTAGTCGCCATCTGGGGGAGAA-------ACTCAGAACTGGAAGCTGATGAGTTTGCAGCAGCATGTCAGGAGAGGCCAGCGCGGGAGTGGGTGGCTGTTCC----CGCCGGGCTCGGCC--TGTCCCCCCGCGG---GCACCTCTGAACCCGGGTGTCCGACCAGG---A--------------------GCCCGTCCTCCGCCCA---GGC-CTGGCTCCAGCCCACCTCCTCCAGGG-AGGCCGCTGGGCGGCTGGGGGAGC-----------GTCCGCCCTCCCGGGGCTCACG-----CT--------     
13 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-198755_198912         80.9%  35.5%    -----------------------------------------------------------------------------------------------------GAGGC-CGGCGG--ACAGGC---AGGGGC------A-----TGGTCGTGGGGGAGGTG-CGT-----GTGT----G-C--AAGG-------GG--CATCCACAGGGGTGTGTGTACAGAAGTG-CACGTG-GGTG---TGT-----GCGGGCCGTGTGCAGACG-TG-----------------------------------------TG------------CAAGGGTGCATGAGGCGTGTC-TGTCTCTGG-CTGAAGGCCCTTTCTAACACGGACCCTCAGCCA--AA-------GGTGCCCGGTTCCAGCATGCCTGACAAAAACCAGCCCCTGTCCTGGATGGGGAT---------------GAGTCGTGGGAGGGGGGGCCCCGCACAGCCTGAGCAGAACTGGG----------------CGATTTCG---G-------GGGCATC--T-GTGGAAGGG--GCTTGGGGGCGAGCAGTG----GTGGCTGCAGCGTGCTCAGGGA-CACTGGC------ATAGGTTCCTGGCGGCTCCAGGGGTGTGAATGAG-CTTTGGGATGGATGAGAGGTTTGTGCCTCAGCCCCAGAGGA---TGG-GTCTCGGTGCTGCCAGGACCAGGCTTGGGGGGCCCCTTGAGCAGGGGACAGGGGCAGGGAGGGGAGCCCCAGATGTGCATGTTTCGTGAATG-GCTGAGAGGAAGGCTCAGTCCTGTGGCTTTGGGGG-----ATTGGCTGCAGCCCCGAGGGTGGACAGCAAACAGCCGGCTGCGTTGGGGAGCGCAGCCTCGTGTTGTTTGTCCAATTAGGTAATACCTTTGC-CACTGCTAGAAGCAGGCCAGGACACCAGAGCTGCAGGGGTCTTCGCAA----AGAATGACACAAGCAGGCAG----------G--------GCTGAGGAATGTTCCAGATACATAAACAGCATTTATAATGCAGTCACCATCCGTGGGAAAAAA---CT--CAGAACTGGGAACTTAATGAGTTTGTAACAACACATCCTGAAGAGCTGATAGGGGCGT-GTGGGCGAACATCTCCATTGGGGACCTCTT-CTGTCAGGGCCCTC-CGTGCCTGGTCTCAGGCCTCTGCTCCGG-GCAGCTGCCTCT----------GTGC-TCCAGG--GGGCGCTGGGGACTGTGCCTC----CTCCCAGGCCTGGG--GCAGCAGCCAGCCCG-GC-------T--C-CCT--GCTTCC-------------------------------     
14 Equus_asinus-NC_052181.1-198919_199155                   77.6%  30.8%    ---------------------------T--CAGCCAGGCAAC----------CAGAATCCATACCTGAAGGGCCTCGCCCGTCTCCT------GGA--TGAGAGGC-TGTCGG--CCAGGC---TGGGGC------G-----TGGGT--GGAGGAGGTG-TGT-----CTG-----T-G--CAGG-------GG--CATCCACAGGGGTGCACATGCAGAAGTG-CACATG-GGGC---CGT-----ATACAGAGTG----------------------------------------------------TG------------CAGGGGTGTGTGACAC-GTGT-CTCCTCTGG-GTGAAGCCCCTCTCTAACACGGACCCTCAGCCA--AA-------GGTGCACGGCTGCAGCGTGCCTGACAGAAGCCAGCCCCGGTTCCAGACGGGAAC---------------GAGGCATGGGATGGGGGCCCT-GCACAGGCTGA---GCAGCAGG----------------GCAGGTTC---G-------GGGCGTC--T-GTGGAAGGG--GCTAGGCGGTGAGTGGTG----GCGGCTGCAGCGTGCTCAGGGA-CACAGGC------TCAGACTCCCAGTGGCTCCCGGGCTGTGAGGGAGCCTCCGGGATGGATGAGAGGTTTGTGCCTCGGCCCCAGAGGA---CGG-GCCTCGGTGCTGCCAGAATCAGGCCTGGGGGGGCCCTTGAGCAGGGG-----------------AGCCCCAGATGTGCGTCTTCTATAAATG-GCTGCGAGGGAGGCTCAGCCCTGTGGCTTCGGGGG-----ACCCC----------GGGGCTGGACAGCAAACAGCCGG--------------CAGCTCTGGTGGTACTCGTCTAATTAGCCAGTCCCTTTGC-TGCTGCAAGAAGCAGGCCAGGACACCAGAGCTGCAGGGCTCCTCGTAA----AGGATTACATAA----GCAT----------G--------GCTGAGGAATGTTCCAGGTAGACAAACAGCATTTATAATGCAGTCACTGTCCCTGGGAAAAAACCCCT--CAGAACTGGGAACTTAATGAGTTTAAAACAACACAGCCTGAGGAGGTGAGATGGGTGG-GCGAGCGAACATTTCCGTCAGTGCCGCT------------------GGCCGCTGGTCTCCGGCCTCTGCTCCAG-GGCTGCGGCCTC----------TGTG-CTCCAG--GTGGGCTGGAGACTGTGCCTC----CCACCACACCTGGG--GCAGCAGCCGGCCTG-GC-------C--T-GGC--TCCCCGCCTCCTCCAGGCCCCG-----CTCAGT----     
15 Manis_javanica-NW_023436200.1-186846_186972              77.9%  25.2%    -----GCAACTCAAGCCTTAGCCGCCCT--GA--------------------GCGCCTTCAGTGTTGTGG--GCCTGTGCCTCTCCGC---GCAGC--CCACCAGA-GGGCAC--AAAGGG--CACAGCC------A------------GGCCCCTCCG-CCA---CTCTGG----C-A--ACAGAAG----GG--CCG--CCCGAGGCACCTGTGCTGACTCCCCAGGAG-GGCG----GA-----GGATGAGGGGTGAGGGGC-AC----AGGAGTG------------------------------GG------------GAGAGGTCAGGGGTCAGATGGAGCTCCAAGG-GGGCTG----ACACTGACAGGCAGTGTCCCTGC--CA-------CGTGCTC-----CCTCCCTAGTG------TGCGAGCCACTGTGGGCAGTGTCCA---------------GGCTGGTAAGGTCAAGGGGCAGGCACTCTCTGATCATCCTT------------CCCTCTCCCTGTGTCCCCAGCTGGAGCTCCAGGCGACCGGAGCCCATCCCTGAGGGGGCCTTGCTCACCTCCTGGATGAGAGGCCAGCGGGAGGGCTGGGGTGTGGCCGGGTGGTGCCCAGGTGCAGGGCTGTGTC-----------------TGTGGGCGTTGTGCGGGGGCG---------------CCCACAGTGGTGGCGTGCAGATG-----------------------------TGTGCGTATGGGACCAGCCTGGGGGAAGCCTCGGTGGG----GGTTGGCGCAGGGAGGGACCTCTGTGCTCAGGAAGGCTGAGTGCCTGGAATCACTGTGCCCGAGGGTGAAGGGGAGC----AGCTGGTGGGGGGGGGTTCTTTTA---------------------------TCTGTCTGATCGGTGAGGATGCCCCCGGAGTTGCAGGGATCCTGTAA----AAGCCTTACAGAAGCAGGCGC----------A--------GCTGGGAAATGTTCTAGACACACAAACAGCGTTTCTCATGCAGTCACTGTCTGGGAAAAACT--------CAGAACTGGGAACCTAATGAGTTTAAAACATCACATCAGGGTGAGCTGATGAGGTCGGGGGGAAAGACCATCCCATCGGAACCCCTGTT-------------------CTCAGCTCCCAGGCAGCTGCCTCAGTGCACCCAGGCCC-GTTCAGCTCCCTGCCTCCTG--GAAGGCTGCCTGGGCTGCCCCGCC------CTACCTGGT--GCAAAACTGGGCTCACTCTGCG--CC--C--CT--GTCTCCCC-----------------------------     
16 Balaenoptera_acutorostrata-NW_006725355.1-196806_196902  79.1%  28.7%    ---------------------------------------GCC----------TCGCATCTCCCGCTTGAGCTCCAGGCTC-CCTGCTC--GGCGAC--CGGAACCCAGACCTG--AGGGGT---TCTGCT------C-----ATTTTCTGGATGAGGCC-AGC-----GAGC----C-A--GGCAGGGGCGTGG--CCGAGGGAGGCGCGTGTGCGCAG----------------G---GGCGCCC-ACAGGGGGTGCGTACAAG-CT-TGTGTGGGTGCACGCAGAGTGC-----------------GTG------------TGCAGATGTGTGCAGATGTGTGTGCCCCTGG-CTGAAGCCCCTCCTTGACAGGGAACCTCGGCTG--CG-------AA---------------------------GCCGGCTCCCGCCCT------------------------------------------GGTGGGCACGTCCTGAGCAAAGTTGGG----------------AGAGTTGG---GGGG---GGGGCATC--T-GTGGAAGGG--GCTGGGGGGCGGCTGGTGACGGCTGTGACGAGGGACCTCGGGGA-CGCTGGC------ACGGACTCTCAGCCGCTCCAGAGGTGTGACTGAGCCTCA-GGATGGATGAGAGCTTTGGGCCTCGGCCCCAGAGGGGCACAG-GCCGCGGTGCCGCCGGGACCGGGGGCCC--------CTCGGGTGGGGGCAGGGGCCGGGAGGGGAGCCGCCAACGCGCATGGTCTGTAAACA-GCAGCGAAGAAGCTG--GTCCTGCAGCCTCGGGAG-----GTTCACCGCAGCCCCGAGTGCAAACGGT------------GACGGTAAATGGCCACAGCCCAGGGGATTGTCTAAGTAGGTAATAGCTTTGC-CGCTGCAAGAAGCAGGCGGGGACTCCTGAGCTGCGGGATCCCCGTATG----AGGATTACCTAAG-CGGGCA----------A--------GCCGAGGAATGTTCCAGACACACAAGCGGCATTTATTAGGCCGTCACCATCTGTGGGAAAAAATCAGC--ACTGGGCGCTGCCGAATGGC------------ACACTGTGGGGAGCTGATACGCGCGCCCCGTTCTCACGTCTCTGCTCCCGGCAGCCGCCTATGTGCACCCCG-GGGGGCTGGAGCAGTG-GCCAGCCTGGGCCCGGCTCCCCCC-----------TTCCTCCACG--CCCCTCTCAGCTCCCTCTCTTCCAGGAAGGCGGCCCGGG--GCCTCTGGGAGGAGC----------------------TGCCCAGCCC-C-------------AT--------     
17 Sus_scrofa-NC_010448.4-186567_186674                     82.2%  30.5%    ------------CCTGCCTCCTCTGCTG--GGCATGGGACGC----------CTTGTGCCCCTGCTTGAGCTCCAGGCTCCTCTGCCA--CGCGCC--AGAAAGCCAGACCTG--AGGGGC---TCCGCT------C-----CTTTGCTGGGGGAGAGG-CCA-----GCAG----C-C--AGGGAGGCACCCG--TGTGCAGATGCGCCCGTGTGCAGGTGTGCCTGCGTGCAGG---TGCGCCC-GCAGGCTGCATGTAGAAG-CA-CGCATGGGC-GCAGCAGGGCAC-----------------AGG------------TGCAGATATGCGCCGATGCATGTGCCTTCAG-CTGAAACCCCTCCCTAACACGGGACTTTGGCTG--CA-------GGTGCACGGCTCCAGGGAGCCTGACAGAAGCCAGCTCCCGCCCCGG------------------------------------------TGGGCACATCCTGAGCAATGTTGAG----------------AGAGTTTG---G------GGGGCATC--C-GTGGAAGGG--GCTG-GGGGTGGCTGGTG----GCAGCTGCGGCAGCCTCTGGGA-CACTA-T------ACAGGCTCCCAGCTGCTCTGGGGATGTGGCTGAGCATCA-GGGTGGGTGGCAGTTTTGTGCCTTGGCCCAGGAGC------------------------------------------CCTTGGGCCGGGGGCCGGGAGCCAGGAGGGAGCCGCTGACACGCGTGTTCTGTAAATG-GTGGCAAGGAACCTCAGCCTTTGCTGA--------------------------------GTGAACGGTGC-----------------ACGGCCGCAGCTCTGGGGGTTGTCTAAGTAGGTAAATACCTCTGC-TGCTGCAAGAAGCAGGCCAGGACTCCAGAGCCGCAGGGATCCTCCTCGTCCGAGCATTACATAAG-CAGGCA----------C--------GCTGAGGAATGTTCCAGACACACAAACGGCATTTATCATGCAGTCAGCATCCATGGGAGAAAAATTCC--CTGGGA-----ACCTAAGGAGTTTAAACAGCACATCCCGGGGCCTGAGAGGGGCATGTGCAGAGCGAGCATCTCCTTTGGGCCC-------------------T-GTGCGCTGGTCCCAGGCGGCTGCTTCCTGGCTGCTGACACT----------GCGCCCCCAGA--GTGGGTTGGGGACTGCGCCTCTCGGGGGCTGGGCACTGGGAGCAGCCCCCCGCCCA---------------CGG--CTGTCTCCCCTCCCAGGGC------------------     
18 Callorhinus_ursinus-NW_020313076.1-197399_197512         76.1%  24.0%    -------------AAGCTTGGGTGTGTG--GGCGTTGGGGGG---------GGGCGGCAGCAGATTCTGGCTGAGGCTGCCGCTGCTTCTCCAGGG--TGCGCGGCGTTTCGG--GCGGTG---TTTACA------G-----AGCTGCGAAGCGTGTCG-GCCCCGACTGGCTC--C-A--GACACACCACGCA--CACGGCTCCCAGCGCCTCTGCCAGTGTGCCGTGGAACCATCAATAAACTAGGAGGGAGACGGGGCGGTG-TT---GCTGGGCTGGGGAAGAGAAA------------------GA------------GAAACACTTCTGAGAGCAAT-TGGACTGTAG-CTGATG-----------CTGAGCACCCCTGTTG--CT-------GCTGACCTGGGCCTCAGGCT---------------------------------------------------------------TCGGGCCGGCTCCTTCTGTGCTGACTAGCA-----------A----GGTGTGAG---CAGAGCGGCCCCAGG--GCGGACACCGG-AGCTGCAGAGCTGACCATCATGTGTCCCCCTGTTGGGCACAGTGGGGCCCAGC-----------TTGAGCTCCAGGGTCCA----------------------GGCTGCAAGCCTGGCAGTCCAGGCTGGGCCGGGGTTGGCGGGGAGGTGTGGACGTGCAGGGGTGCGCCCACGG----GTGTGTGTGGACGGGGCCTGGGGAG------------CCCCCTTTGGCAG-----GGCGGGGAAGGAATCCCCTAAGTAGCGGCCAGGAA----GGCTCACGGTAGCCCTG----AC----------GCGAACAAGGGCAGCTTCGGGGGC--------------------GCAGACCCGCATTTGG-CTCCCCAAGAAGCGGGGCCGGACCCCAGAGCCGCAGG-GAGCTTGTAC---GGGCCTTACAGAAGCACGCAC----------G--------GCCGAGGAACCTTGCAGACACACAAACGGCGTTTATCATACACTCACCCACTGCGGGGAAAAAAA---TTCAGAACTGGGGCCTTAATGGGCTTAAAGCAACACATCTCGAGGGGCTCCCTCTCAGACCCC---TGCTCCCTGGCCGCTGCCACT---------GAGAAC-----CCAGGGAGGGCTGAGGAATGTGTCTCCACGGGCCCCACCTG----CCCCTGCTGCCTCCGA---GCTCCTTGCGGGAGGGGTGCCTGGAGCCCCTGGGACTGAG-GCCAGGTCCCGCCCCCCG-----------------CCGTCAC--------------------CTC-------     
19 Chelonia_mydas-NC_051258.2-107720_107799                 76.7%  22.6%    --AGGAGGGTTCAGGGGTCAGGGCAGAG--GGCTGGGGGT-------------------GCGTGAGGGAGGTGCAGGGGTCAGGGCA-------G---AGGGCTGGGGGGGTT--CAGGGT---CAGGGC------A-----GAGGGCTGGGTGTGTGA-GAA------GG-----G-T--GCAGGGGTCAGGG--CAGAGGGCTGGGTGTGTGTGAGGAGGGTTCAGGGGTCAG----GGCAGAGGGCTGGGGGTGCGTGAGGG-AGGTGCAGGGGTCAGGGCAGAGGGG-----------------TGG------------GGGGGTTCAGGGTCAGGGCAGAGGGCTGGGG-G-----------------------TGTGTGAGG--GA-------GGTGCAGGGGTCAGGGCAGAG--------G-----------GCTGGGGGGTTCA------------------GGGTCAGGGCAGAGGGCTGGGTTTGTGTGAGGAGGGGTCAGGGCAGAGGGCTG----GGGGTGTG------------GGCTGGGGTCGTGGGGGTGCTCCCAGCCCCCTACCCTGAGCGGCTCACAGCAGGGGGCTGGAGGGGATATGCCGATTCCACCCCCTTCCCCAATGTCCCCGGAGCAGAGAGTGCGCTG-------AGGCTCCGTTTTTCCCTCTCCCCTCCTTAGCAAGGGCCGTTAGCTGATCGGC--CGCAGG----------------------G---AGGGAGAGAAGGAGGGGCAGGAACCCTGCACGCTGGGGGAAGAGGCGGGGGGGGAGGGGGAAGCTTGCCTGCCCTGCAA--------GGAGAGAGCGGTGGGTGGGGGCAGAGAAGAGTGGG-------CCGGGCCGGGC--------AGGATTTTTAATTGCATGCTGCTGTCCCCGGCAGACAGCAGTGTGCCATTAAAAATTGGCTCGCATGCCGTGTTTGG--CACGCGTGCCATAGGTTGCCGACCCCTGGGTTAGAGCATGGGCTTTTGTTTCTGGCTTTGCTATTGACTTCACATGTGACCCTGGGCACATCACTATGAGGATG--------------ATACCCTCACTTGGGCTAATTCATATTTGTAAAGTGTGTTCAGGTCCTTGAAGGAAAAGTGCCAAGTAACATTACTT-------------------------------TTAGTAGAGCTGGGAGAGTGCTTATTTGCAC--------A-GTTCATGCCAG--A----AGTGGATCTATATCTACTT------TAGA-------AGAGAATTAAGCA-----------------------------------------------------------     
20 Panthera_pardus-NW_017619882.1-204882_204992             79.2%  28.7%    ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GAAGCGCGTCG-GCCTCAAGCGGCTG--C-A--A--ATGCCCGGCG--CCCGGCTGCCGGCGCCTCTGCCCGCGGGCCGCGGAGCCATCAAGTCAGG---AGGGAGATGGGCTGGTG-TT---GCCAGGCCAGGGGAGGGA----------------------------------GAGACACTTGTCGGCGCAGTCTGGGGCGGGG-CTGACG-----------CCCAGCGCCTCTGCTG--CG-------GCGGGTCTGTGCCCAGGGGTCGGCACG--AACGCCTCCCGTGCTGCCCCCTGACGGGGTNCCACGGTGCACGGCGTTCAGGTGGGGGGCCGAGGGCGCGGGCGCCACAGTGGG-----------C----TCTCTGCG---GCATGAGGTCCCGTC--CCCTGTGCCCC-TGGGGTGGAGCTGACCCTCGTGTCCTTCCCCCTCGGGCACAGTGGGGCCTAGC-----------TTGAGCCCCTGACCAGGAGCCTTGCTCACCTCTT-----GGCCGAGAGGCCGGCGGCCCAGGCCGGGGCACGGTTGGCGGGGAGTTGCGTGTGTGCAGACGCACGTACGGGACCGGGTCTCGGGGGGGGGGGGCTGGGGGGGAGCAGGGAAGGTGCTCCATAGAAA-----ACCGTGCGGAAGCTC---CCAGAAGCTCCCAGA------AGCTCCCAGAAGCCCCGAGGGTG----------ATGTGAAACGGCCGCTTCGGGGGCACAGACCGCATCTGTCTAATTAGGTAATACTTTGGT-CTCTGCAAGAAGCAGGACAGGACGTCAGAGCTGCAGGGGTCTTCATAA---AAGCCTCACATAAGCATGCTC----------G--------GCCGAGGAACGTTCCAGACACACAAACAGCACTTATTGTACACTCACCCTCCATGGG-AAAAGCA---TTCAGAACTGGGGCCTTAATGAGTTCAAAACAGCACTTCTGGAGGAGCCCGTGGGGCCTCCACACTCCCTCTCAGACCCCTGCCTCT---------GCACCC-----CCGGGGCGGGCTGGGGAAGGCTGCCCGGAGCCTCGGAGCCT----GGGGCCCTGAGCCCGGGCGCCCCCTTCACCGC--TGTCTCTCCGTCCCCTAGGCTGAGG-ACGGCGTGGAGTCCGGGG-----------------AGGACA-------------------------------     
21 Pteropus_alecto-NW_006429611.1-204673_204797             77.5%  28.2%    ---------------------------------CAGACGCAG----------TGGGGTCTGCACCAGAGGGGCCTTGCTCCCCGC-------------CGGGAGGAGGGTCTG--GTGGGC---C------------------------GGCTGG---------------------G-G--CGTGGGGGGCTCG--TGT--GCAGGGGCACGTGTGCAGAGATGGGCAT---------------------------------------------------------------------------------G------------TGCAGGGTCACGTACGCGCCACTGCCTCTGG-CTGAAG--CGCCTCCAGCATGGACCCTCGGCCA--CG-------TGTGCAGGGCTTCGGCAAGCCTGTCAGCCAGCT---CCCACCCCGGACGGGTCC---------------GAGTCATGGGGCAGTGGCCTGTGCCGGGTGTGCCCAGCACCCGGGGCCCCCTGCCCTGTCCCTGTGCCCGCCGGA---GCTGCATGGGT-GTGGGGGCG---TCTGCGGAGAGGCTGGGAGGTGTGGCTGCAGCGGCCTTGGGGG-TGCTGGC------ATGGGCTCCCAGCAGCTCCCAGGGTGTGAATGACTCTTGA-GGT--GGATGAGGTTTGTGCCCCGGCCCCGGAGGAAAGCAG-GCCGCGGTGCTGCCAGGAGCAGGGGTGGCCCTGGGGCGG------GTGGCGGTGTGGCTGGG-------ACGGGTGCCGGGGTGTGTA------AGGGGCGGAAGGCTCCGTCCTGGGCGGT---TGG-----CCGCACGGCAGCCCTGAGGGTGAACCGGAGACAGCCGCA---GCTGTGGGGCACGCAGGCCCCCATTCTCTCCAATTAGGTAATACCTTGGC-CGCTGTGAGAAGCAGGCCAGCAGACCAGAGCTGCAAGGCGCCCGCAGA----AGGGTTACATAAGCAGACTT----------G--------GCTGAGGAATGTTCCAGACATACAAACGGCATTGATTGTGCAGTCATCATCAGTGGGGGAAAAAGCCACTCAGGGCTGGGAACTTAATGAGTTTACGACTCATCCCGAGCAGCCGATGCAGGCGACGCAGGCGAGGGCCATCGCCATCAGGGCCC------T-------------GCCTGCCCTCCTCGGGCCTCTGCTGCCT-----------CT------------GTGCCCCAG--GCGGGCTGTGGACTGTGCCTCCCGCGGGGCTGGGG------GCAGCAGCCAGCCCACCCAGCT--GC--CCGCT--GTGCACCAGCCCCG---CT--------CTGGGA----     
22 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-186201_186422       84.9%  28.0%    --AGGAGCGTCCGGACCGTGCGCGGCACCGAGCCTGCGCGGCACCGAGCCGGTGACGGCAC-CGTGCTCGTTTCCAGTGTGTCTGACCAGGTGATG--TCGGGGCGGGCCGTGGTCCAGGCAGAAGAGGTCAAAGGGGCAGGCTCCGCAGCGTGTGGTGGGGTTGGCC-GGCG--CTGAGGTCCGTGGTGGTCGGACGCCCACGCTGTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------------------------NNNNNNNNNN-----------------------NNN--NNNNNNNNNNNNN---NNNN-N-NN-NN-NNNNN--NNNNN-NN-NN-NNNNNNN------------N---NN-------N-N-NNNNNNNN-NNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNN------NNNNNNNNN------------------NN------NNNNNN---------------------NNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--N-NNNNNNNNNNNNNNN-NNNNGGGGGGGTGGCTG-------------CCTCGT------GGCACATGAGCCAGCAC----------AGGCTCCTTGTGCGTGAGCTTGGGGA-CGAATGAGCAGTTTGTGACACGGCCCTGGGGGTCTGGG-------------------------------------------------GGAGG-GCAGGGAAGGTGCC-----CCTTGCACCCCTTCTGTACC-TGGGGAGGGGGGGCTC-GTCCTGCAGCTC-----------------------CCGGAGC-TGTG-CCTCC--GAGCCCGCCTTTGAGGAACGCGGACCTGGAGTTATTTGTCTAATTAGGTAACATCCTGGC--GCTGCCAGAAGCAGGTCAGCACATCAGAGCTTCAGGGATGCTCGTGA---AA-----GGGCCGCAGAAATA----------G--------GCTGAGGAATGTTCCAGACACACAATAT--ATTTATTATGCAGTCACCATCTGTGGGAAA--------ACTCAGAACGGGAACTTAATGAGTTTGGAACAATACGCCGTGAGAGGCCAGCGTGGGTGTGGGCGGCTGTTCC----TGCCGGGCTCAGCC--TGTCCCCCTGCGG---TCGCCCCTGGGCCCCCGGTGCC----------------------------------CGACCTCCGCCCA---GGC-CTGGCTTCAGC-CCCCCCTTCCAGGA-AGGCCGCTGGGTGGCCGGGGGAGC-----------GTCTGCCCTCCCTGCGCTCACG-----CTGGCC----     
23 Ovis_aries-NC_056065.1-185719_185799                     75.9%  19.5%    GGACTGGGGTCAAGAGAGCAGCGGAGTT--GGTTGGGGGGTG-----------------ACTCCCGGGAGCTGCCAGGTGCCCCCTCTCTAGCACGTGAGCAGAGAAGGCATC--CAGGGG--GATGGGC------C-----TGTGGCTGTCTGTGCCC-CCT---TTTTGCTG--G-G--CTTGAGGGCCTCC--TAT--CCCTTGCTCTAGCTCCAGGCTTCCTGCCTGGTGACCA-GAATCCAGACCTGAAGGGCTCCACTC-AT-CTGCTTGGTGAGGCCAGCGGAC-----------------TGA------------GGGGGGAGCATGTGCAGGGGCGCCCCCAGGG-GTGTGT---------GTACAAGCTCATACGCAG--AG-------TGTGTACGTCTTGCTGAAACCCCTCCCTGACAGGGAATG--TCGCTGCAAAACC---------------AGCTCCTGCCGTGGTGTGGTAGGCACACCCTGAACAAAGCTGGG----------------AGAGTTGT---G------GGGGCATC--T-GTGGAAGGG-GCTGGGGGGGCAGCTGGTGGTGGCTGCAGTGAGTGGCCTCAGGGA-CACAGGC------ACAAGCTTCCAGCCACTCCAGGAGTGTAACTGAGCTTCAGCATGGGCTTCCCTAGATGTCTCAGCAGGTAAAGAAT---CCA-CCCGCAATGCAGGAGA-CCTGGGTTTGATCCCTGGGTTGGGAAGATC-CCCTGGAGAAGGGAATGGCTACCCACTCCGGTATTCTGG--------CCTGGAGAATTCCATGGACTGTATAGT-------------------------------------------------------------------------------------------------CCATAT-TGTTGCAAAGAGTCAGACATGACAGAATGCCTTTCACTTTC----------ATGGATGACAGCTTTGGGCTT----------C--------AATGACAGAGGATAGAGGTGGACAGGCCACAATGTTGC--------------------------------CAGGACTGGGCCCCC-----------------CCGGTGAAGGGGGCAGGGACCGGGAGGGGAGCTGCTCATACGTGTTCTGTAAATGG--TGCTGAGG-------AGGCTTGGTCCTGTGGCTTCAGGAGACTCACTGCAGCCCCAAGTGCAAGAAGTGGACGGCCA--CAGCCCTGGGGACTGTCTAAAGAGGTAACACCTCT------GCAGCTGTGAGAAGCAGGTCAGGGCT--CCTGA--GCTTGGGATCCTCGAACGA------------------     
24 Chrysochloris_asiatica-NW_006408691.1-182758_182894      90.1%  36.0%    -----------------------------------------------------------------------ACCCATAGTGACCCTGTATAGGGTT--TCCAAGGAGTGACTG----------GTGAGCTTGAACCACGG--ACCTTATAGTTCAAATG-GTTTTGCAGTCTGG--C----GCATTAACCCACAGTGCCACACCAGGACTCCTT-TAACCACATA--GGG--CTTCCGAGGCTGTAAAT-----------------CTTTGCCGGAGCAGCAAGCCTCATCTTTCTCCCATGGAATAGCTGG-TAGTTTCG--AGTAGCTGACCTTGCGGTTTG-CAGCCCGCCTCGTAACCACTATGCTACCAGAGTTCCTTATAGGAGTATGCATACAGGGGTGTGAACAGGGGCGTGTGAAGGAGCAAATTACAGAGATGCAGGGGTCTA----------------TGTGCT-GGGATGCATGCAGGGCTGTGCGTCT-ATGGAATGGG-GGCCCCTTCTAAGCACAGCTGGGCTAAGTTTGGTATCAAAG--G-----------------------------------------------GCTGGCAGT--GGCAGGTGGTGAGGGCTCAGGCTCCCAGGGCTTGGGTATGAAGGACCCTCGGGT--GAATGGGCAGGTCCAGAGGTAGCAGGGAGCAGTC-----------------------------------------------------------------AG--GGCCC--AGGACACATGCTTTACAACCA-GCA-GGAGGAAGGTCA-GTCCTGCACCTG-----------------------GCTGCTCTGCTG-CTGGT--TTTTCAG-TTTTCAGTA----CAGCCTGGCCTCGCTCCTCTAATGAGCCTGTCTGTG------CTGGCCGAGCCGTCGGG---TGTCAG----AACACGGGGGTCCTGT---GGGGGTTACATA--AGCAGAC----------A--------GCTGAGGAACATTCCAGACACAGACTGAGTGTG--CTATGCCGTCATT--CTCTATGGAAAACCA---TTTGGAACTGGGAACATGACGAGTTTAAAGAAACACATCTTGTAAAGCTAATGAGCGTGTGCAAGCAAGACTACTTCCATGAGAGTCTCAG--TGGCCCCGTTTGCACTTGGGTTTTCACCAGCAGCTGCCCCCGCTGCCCCCCCCCC--------CAGTGGAACTGGGATCTGCTCT-GGGAG-CCCA----------GAACTCCCTCCA-CTGGGTCCCTCCCCAGGCTGGGCTCACCCCTCCATGCTTTCTCTCCCTCGGG--------------------     
25 Miniopterus_natalensis-NW_015504651.1-689666_689782      78.1%  28.0%    -------GGTCCAGGGCTGGGCCTTCTT--GGCCAGGAGGGGTCTGGCCCGAGGTTGTGCTCCATCCTAGGTGCAGACTCTCCTCCGCCTGCCGTC--TAAACCGCCTCCCTC--CCACCC---CCA----------------AGTTCTCTGTGAGC-----------------------------------------------ACCGGCTGTGTCCAAGGCAG-----------------------GAGGGACCCATGTGGGTC-CT-----CTACTGCCCACAGCCCCC-----------------CTG------------AGGGGGTTGGGGCTTGGGGCTTGGGTTGGTG-CTGTCT------------------CCTTTGCCA--GG-------TTTGGGGTGCATGGGGATTTCGGGGTGACAGCAGAT-----TCTGGCTGCAGCC---------------ACTTCTCCAGGACGCTGGGCCAGCTGAGCCTCTCCTTGGCTGGTCCCAGACTCCTGTGCACTTGTGTGCGGGTTT--CGAGCAATGAGTTTTGGCAGCATCTGGAGGAGCCTGGGGGGCTGGTGGTGGTGCAACGGGCTCGGGGA-CCCTGGC------ACCGGCTCCCAGCAGCTCCAGGCCTGTGAATGAGCTTTGG-GGTGGATGGTGGGGTTGTGCCTTGGGCAGGGGGCGTGGAGG-GAAGGGA-----------------------------------------------------------CCCTGGACAGGCATGTTCCGTC--------GACAGTGAGGCTCAGTCCTGTGGAGCCAGGGT-----TCAC----------CTGGGCCCCAGGGCGAACAGGGGGCAGCCTGGGGAGGGAGGCAGGCCTGTTATCGGTCTCATTAGGGAACACCTTGGC-CGCTGAGGGGAGCAGGCAGCGGGGAGAGCTGTGGGGCTCC---CCTA----AAGGGTCGCATAAGCAGGCCG----------G--------GCGCAGGATTGTCCCGGACACACACACGGGCTTGATGACATTGTCACCGTCTGTGGAAAAAACT------CAGGACTGGGGCCGTAACGAGTTTGAAACAGCCCCTCAGGAGCGGCCATTGCGGGTGTTTTTGGAGGGCCCCCTGCCCTTCTCT-------G-GGACGGTGCCT-CCTGTGGGGCCTGGGGCAGCAGCCAGCCCACCGGGCTACCC----------CTCCCTCCAGC--C----CCTCCCAGTTTCCCCTCCTCCAGAAAGGCCTCCTGGGCTACCTGGAGCACCTGC----------C----------CGCCCCCACC-----------------------     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ..         :