Reference sequence (1): Target
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 1 Target                                                  100.0% 100.0%    --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTCATGCCTGGATTTACAGTCGCTCGTGGCTCTGGGTCACTGCAGCATT-TTGGGGATGTTTAAGGAGCTGT-GAAGTGTGGTGGCCCCGACCGG-CTCCAGGCGCACTGTCAGTCTGGCTCCTAGCGCCTCTCCCGGCAG-------CCGTGGCACCAATAAATTCAGAGGAAACCGGGGCTGGCTTTTCTGGAGGT---GGAGAGAGACGAGC--ATGTCTG-AGAGCCATGTGGACCT-GGACAACCTGGGAGCCTCCTGCTGCAGTGCAC----GTGGGGCCTCGGGCTCCAG------------C-----C-------AGTGC-----AGCCTGG-TGACGGGAAGGCCCCTTGGCCACTCTGGGCCGTGGGGAGGGCCGTCCA-ATCCCATCCTGGCTCCCTATGAGGGTGA--AGGAGGGGCAGGGCACACCTCTGGGCCGTGGTACCCAGAGCA-----------------------CAGGGAGGCTGGC----GGGAGCTCCCCGGCCGCATCAACAGGACTGAGAGGCCCGT--CT-GGCATGGGG----CCTGC--GGACGCGACGTGCCCT-GATTTCCAACGCG--TCCAGCGAGGCAGTGTCCA---------GGCAGGCCCAGGTCCAGGCTGGGGAGAGCGGG-----CAGCAGTCGGAGCTG---TTTGCTGTGGCGTGGCTGAGCGCC------GAGTGTCTGTGGTCATGAGAG--CTACAGTGGCCT-----------CTTTGCAGCAGTGTGGGAGCATCC-AGG----GGTGTGGG-AGGGTGTGTGTGCAGG-------------GGCGTGCTGTGGGTGTTGCA-----------GGGGTGTGTGCAGAGGGGTGGGCGTGTAC--AGGGGCATGGCCACGGGTG-GGTGA-----------------------------------------------------------------------------------------------TGTGTCCGCTTCTGGCGGAAGCCCCCTCCTA-ACAGGGACCGCTGCT-GCAGGCCCACGGC---TTTGCTGTGTTTCAAAGAAAGTAGCCCC----CA----CCCTTGGTGGGGGACAGGATGTGGTATGGGAGCCCCTCCTGAGCACAGCTGGGCCATGTTTTGGAGGTGTCTGTGGGAGGGGCTGCAGGGGTCAGG-TGGTGGCACA--GGCTCTGCTGGTT------CCA-TTGGGAATGAGCTTTGGGGTGAATGAGCAGCTCGTG-----------------------------------------------------     
 2 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-198447_199375         93.5%  68.7%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------TCCGTCTCCTGGGTCAG-CACATCCCTCT-CCTTGGTCACGCCTGGATTGACAGTCGCTCGTGGCTCTTGGTCACTGCGGCATT-TTGGGGATGTGTAAGGAGCTGT-GAACTCTGGCGGCTCCGACTGG-CCCCAGGTGTGCTGTGAATCCAGCTCCCAGTGCCTCTCCCGGCAG-------CAGTGGCATCAATAAATTAAGAGGAAACTGGGGCTGGCTTTGCTGGAGGT---GGAGAGAGAGAAGC--ACCTCCG---AGCCGGCAGGGCCT-GCACAACCCGGGAGCCCTCTGCCGCGGTGCAC----ATGGGGCCTTGGCCTC-TG------------C-----C-------GGTGC-----CACCTGG-GAATGGGAAGGACCCTTGGCCACTCTGGGCCATGGGAAGGGCCATCCG-ATCCTATCCTGGCTCCCTATGAGGGCGA--AGGAGGGGCAGGGCACACACCCAGGCCAAGGTACCCAGAGCA-----------------------CAGCAAGGCTGGC----AGGAGCTCCGCAGCCACATCTGCAGGACTGGGAGGCCGCC--TG-GCATGG--G----GCCTG--CCATGACATGTGTCCT-GATTCCCAATGCG--CCCAGCGAGGAAGTGTCCA---------GGCAGGCGCCGGTCCAGGCTGGTGAGGCCGGG-----GAGCAGGAGGCGCTG---TTGGCTGTGGCACAGCCGAGTGCC------GCGTGTCTGTGGTCACGGGAG--CATCCGTGGGTG-----------TGTGAGGCA-------------------------------------------------------------CGTGTGCTGTGGGTGTGGCA-----------GGGATGTGTCCAGAGATGTGGGTGTGCGC--AGGGCTGTGGCTGTGGGTG-GGCAC-----------------------------------------------------------------------------------------------CGCGTCGGCCTCTGGTCGAAGCCCCTCTCTA-ACAGGGA-CCCTGCT-TCGGGCCCACGGC---TTCGTGGTGTTAGAAAGAAAGCACCCCC---CCC----CCCACTGGTGGGGACAGGATGGGGGATGGCAGACCCTCCTGAGCAGAGCTGGGCAAAGCTTTGGGGGTGTCTGTGAAAGGGGCTGCAGGGCTCGGG-GTGGCTCCAT--TGG------------------------GACTGAGCTTTGGGATGAATGAGCACTTTGGATGCGGCCCCGGGTTGGGCGGGGGCGGGGAGCG---------------------     
 3 Sapajus_apella-NW_022437067.1-193715_194608              90.1%  64.1%    ----------------------------------------------------------------------------------------CGTGCTGTGTCTGGCCGTCCATCTCCTGGGTCAG-CACATGCCTCT-CCTCGGTCACGCCTGGATTGA-CATCGCTCGTGGCTCTTGGTCACTGTGGCATT-TTGGGGATGTGTAAGGAGCTGT-GAACCATGGTGGCTCCAACTGC-CCCCAGGCGCGCTGTGAATCTGGCTCCCAATGCCTCTCCCAGCAG-------CCGTGGCATCAATAAATTAAGAGGAAACTGGGGCTGGCTTTGCTGGAGGT---GGAGAGAGAGGAGC--ACCTCCG---AGCCAGCAGGGCCT-GAACAACCCGGGAGCCTTCTGCCGCGGTGCAC----ACGGGGCCTTGGGCTCCGG------------C-----C-------AGTGC-----CACCTGG-GAATGGGAAGGCCCGTTGGCCGCTCTGGGCCATGGGAAGGGCTATCCG-ATCCTATCGTGGCTCCCTGTGAGGGTGA--AGGAGGGGCAGGGTACACACCCAGGCCAAGGTACGCAGAGCA-----------------------CAGCGAGGCTGGC----AGGAGCTCCGCAGCCACGTCTGCAGGACTGAGAGGCCGCC--TG-GCATGG--G----GCCTG--CCATGACGTGTGTCCT-GATTTGCAATGCG--CCCAGCGAGGAAGTGTCCA-------------------------GGCTGGTGAGGCCGGG-----GAGCAGGAGGCGCTG---TTGGCTATGGCACGGCTGAGTGCC------ACGTGTCTGTGGTCATGGGAG--CATCCGTGGGTG-----------TGTGAGGCG-------------------------------------------------------------CGTGTGCTGTGGGTGTGGCA-----------AGGATGTGTCCAGAGGTGTGGGTGTGGCC--GTGG------------GTG-GGCAC-----------------------------------------------------------------------------------------------CGTGTCTGTCTCTGGTCGAAG----CCCCTA-ACAGGGA-CCCTGCT-GCAGGCCCACGGC---TTCGTGGCGTTTGAAAGAAAGCAACCCC----------TCCACGGGCGGGGGCAGGATGAGGGGTGGGAGACCCTCCTGAGCAGAGCTGGGCAAAGCTTTGGGGTTGTCTGTGGAAGGGGCCGCAGGGCTCGGG-GTGGCTCCGT--CAG------------------------GAAGGAGCTTTGGGATGAATGAGCACTTTGGATGCGGCCCTGGGTTGGGCGGGGGCGAGGAGTGGAGCCCTGGTTGTGCCT----     
 4 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-119271_119881             86.7%  60.0%    ----------------------------TG-----GGAG-------CGTGGTTGGGTGTCGCTGTCTCCTGTGTGGGAGTCCCGGGGTGATGGTGGGTCTGGCCGTCCATCTCCTGGGTCAG-CACATGCCTCT-CCTCGGTCACGCCTGGATTGACAGTCGCTTGTGACTCTTGGTCACTGCAGCATT-TTGGGGATGTGTAAGGAGCTGT-GAACTGTGC-GGCTCCGACTGG-CCCCAGGTGCGCTGTGAATTCGGCTTCCAGCGCCTCTCCCGGCAG-------CTGTGGCATCAATAAATTAAGAGGAAACTGGGGCTGGCTTTGCTGGAGCT---GGAGGGGGAGCACC-----TCCG---AGCTGGCAGGGCCC-GCACAACCCCGGAGCCTTCCGCCGCGGTG------------------------------------------------------------------------------------------CACACGGGGCCTTGGGAAGGGCCATCCG-ATCCTACCCTGGCTCCCTATGAGAGTGA--AGGAGGGGCAGGGCACACATCCAGACCCAGGTACCCAGAGCA-----------------------CAGCGAGGCTGGC----AGGAGCTCCCCAGCCACGTCCGCAGGACTGAGAGGCCGCC--TG-GCATGG--G----GCCTG--CCATGACGTGTGTCCT-GATTTCCAATGTG--CCCAGTGAGGAAGTGTCCA---------GGCAGGCGCCGGTCCAGGCTGGTGAGGCCGGG-----GAGCAGGAGGCGCTG----------TGGCACGGCTGAGCGCC------ACGTGTCTGTGGTCGTGGGAG--AATCCGTGGGTG-----------TGTGAGGCG-------------------------------------------------------------CATGTGCTGTGGGTGTGGCG-----------GGGATGTGTCCAGAGGTGTGGGCGTGTGC--AGGGGTGTGGCCGTGGCTG-GGCGC-----------------------------------------------------------------------------------------------CGTGTCTGCCTCTGGTTGAAGCCCCTCTCTA-ACAGGGA-CCCTGCT-GCGGGCCCATGGC---TTCGTGGTGTTTGAAAGAAAGCAGCCCC----------CCCACGGGTGGGGACAGGGTGAGGGCTGGGAGACCCTCCTGAGCAGAGCTGGGCAAAGTTTTGGGGGTGTCTGTGGAAGGGGCTGCAGGGCTCGGG-GCGGCTCCGT--CGG------------------------GAATGAGCTTTGGGATGAATGAGCCGTTTGGATGCGGCCCCAGGCTGGGCGGGGGCAGGGACCGGAG------------------     
 5 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-150985_151120            84.9%  34.5%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCTCAGTTAGGCCTGGATTTACAGCTGCTCATCTTTGGGTAAC-----TGCGCATTTCAGGGTGTTTAAAGAGCTGC-GAAGCGTGGCAGCCCCGGCGGG-CTCCAGCGCG--TGGTGATCCGGCTTCTAGTGCCTCTCCCTGGCCG------AGGCATCACCACTGCA---CCAGAGGGAGCGGGCTGGCTCAGCCGGGAGC---TTAGCATGAGTGTCC-CTCCCTG---GGGCAT----------------------------------------------------CTGGGGCTCGCC------------C-----T-------CCGGC-----AGCCTGG-TGACCGGAAGGCCCCTTGGTGCAGGGGTATGCCTATG-GGAGTGTCTGTGGGGTGTCCACGGTCACAGACAGGGGTGCATGTGCTGTGTCTGCTCTGGCTGAAGCCCTT---CTCTAACGGGGACCCCAGGCGGGCACCCAGCTGCATGTGTTTGACAGA-GACCAGTCCCCACCCAGGGTGCAAGGTATGGGTGGAGCA---TG-CAGAGTGCA----GCATGCAGGGTGCAGCTGAGCCTGAGCTCCGGTCGTC--TGTGGAGG------GGGCA---------GCAGGTTGTGGCTCCATCCCTGAGC--TCGAGG----CACCTGTGGA----------CGGGGTGGTGGGCAGTGGTGCG------GGCTCTGGCTGGCTTTGAGGTGTGGAGCTTCGGGA-----------TAAATGAGTGGTTTGTGTGG------TG----GCCCTGGGGCGGGATGGCCCAGGAGC--TGCCTGA---ACCGGCCTGGGGGGGCGG-------------GGGCGGGGAGCCCAGGTGTGCCTGTTCTCGTGGTGCTGG--GAAGGCTCCCTGGGC----TCCCCCTCA-GAGTCCACAGGGGCCGCAGCTCTGGGTGGGTGCTGGCTAGGCG-ACACCTGAGCTGCCAGACACGGGCAGG-----A--C-ACGAGCTGCATAGCCTCGCAAGCGTTGCATAAGCAGCCGAGGAGCGTTCCAGATACACAAA---TGCATGTTATGTAGCCGCCAT-----------------CTGCGGG--GAGAAAGAACTG---------GGAACTTAATGAGTTT--------AAAACATCAAGAGAAGCTGTGTGGGGGGAGTGAGGGTT----------TTCAC--GGGCCTGGCTTTCCA-GATCCC--------------TCCTCCTGGC------------------------------------------------------AACTGCCTC---     
 6 Lemur_catta-NC_059130.1-183781_183916                    86.0%  38.9%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGTCCTGCCTGGATTTATAGTTGCCTGTGGCTCTCGGAGACTGCGGCGTT-TTGGGGACATTTAAAGAACTGT-GGGGCGTGTCGGCCTCAACGGG-CTCCAAGTGCACCGTGAACGTCCTCCCGGCGCCCCTGCCGGCACTG------TCGGGTCCGCAGGG-----AGGAGGACGCTGGGCT-GCAGTGACG---------------------GT-GGCTGCG-AAAGCACTCAGGGTGC-AGACGGCCTGGCCACGCCCCT--GCCGTGGCT----C---TGCCTCGCGCCGTGG------------C-----C-------CGCGC-----GGCCTGG-TGAC-TAGAGGGCCCCGGGCCACTCCGGGCAGGATGC---ACCGTCCAGCCTGCGCC-TGGCTCCCCATGAGGGAGGAGGGG----CCGGGGCTGCTGGGAAGGCCCCG---------------------GAACGGGTGGAGCACAGGGTGCGGC------AGGAGTGTCC------------AGGCCGTGCCTGGCACCG-------------A----GC-CG---GTGGTGGTGACG-TGCTGTTTCCAGTGTG--TCTGACCAGGTGGTGTCGG---------G--CGGGAGGTGTCCAGGCAGAAGAGATCAAAGGG-GCAGGCTCTGCAGCT----CATGGTGGGGTTGGCCAG--GCGC------TGAGGTCCGTGGCGGTCAGACGCCCACGCCGTGCG-----------CTGTGCAGCGGCTTTGCAGCATCC-ATG----GGTGTGTGCG----------------------------------GGGT--GTGTCCAC-----------GGGCGTGGGCCACGTGTCCGCCTCTGGCT--GAAGCTGTCTCTCACAGG----GACCCGCTCCTCTCCG-TGGTGTTTGAC-----AGACACCAGCCCTCACCTGGGTGGGGG-ACGAG-GTGGGGTGGGGGCACCTCTGG-----A--G-CACAGCGGGGCCGAGTTTGGGGGCGTCTGTGGAAGGGAT--TGGGGA-GGGCGGCGGCAGC---TGCCTCGTGG--CACATGTGCTGGCACA----G----ACTCCTTG--TG-CGTGAGCTT---------GGGGACCAACGAGCAGTGTGTG--ACACGGTCCTGGGGCTCTGGGGGAGGGGCTGGGAGGGT--------GTCCCCC--CCCCGTGCCCCTTCT--GTACCCGGGGAAGCGGGGCTCATCCAGCAGCTCCCC--------------------------------GGAGTCGCCGGCTGAGGCCGCCTTTG-     
 7 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-251099_251655      91.0%  48.0%    --------------------------------------------------------------------------------TGCGGTGCGGGCTGCGGCTGGCCACCATGTCTCCCAGGCCAG-TGCGCGCTCCT-CCTTAGTTACATCCAGATTTATAGCCGCTTGCGGCTCTCAGTAACCACAGTGTT-TTGGGAAGCCGCAAAGCGT-----------GTCGGCCTCAAGTGG-CTCTGAATACACTGTGAGTGCGGCCTCCAGCTCCTCTCCCAGCGCGCGGCTGTGGCATCATCAGTGAATTAGGAGGAAAACGGCTG--GTGTTGCTGGAGGCTGCACAGGGAGAGGAAC--GTCGCTG-AGAGCAGCTCGAGATT-AGATGGTGAGCGGA------GGTCATGTGC-----------GCCTCGGGCTCTGG------------------------------------------------------------------ATCAGCACAGCGGGAGGGTCAGCCAC-ACCCTGGTCCTGACCCGTGTGAGGGCAA-AGGAGGGGGCAGGGCACAGATCTGGGCCAAGCTGCTGGGGGAG-----------------------CACGAGGCGTCTC----AGGAACTTCCGGGCAGCGTCAGCGGCTTGA-CAGGCCGCG--TC-CGGCGGGGA----GCCTC-GGCTGGTACCCTGCTCC-ACCCTCCGGTGTG--TCTGGCGA-GGCATGTCTG---------CGCGGGGGGTGGTCCAGGCAGGGAACAAGGGG-----CAGGCGTGAGGTGTT---TGTCCTATGGTTGGCCGAGGGCCG------AGGGCTCTGTGGTTGTCAGATGCCCACAGTGGGTT-----------TTTTGTGGCAGCTTTAGAGTGTCC-ACG----GGCATGTGCAGGGCATGTCCACGGA-------------TGTGTGCAGG-----------------------GGTGAACACAGT---GGGGCACACACC--AGAGTTCTCTGACGGGTGT-GCATG-----------------------------------------------------------------------------------------------GTGGTCTGCCTCTCGTTGAAGCCCCTCTCTA-ACAGGGACCCCTGACTGCAGGTGCACAGC---TCCATCATGTCTGACAGAGACCAGCCCC---CA-----CTCTGCATGGGTGACAAGACGTGGGATGGGAC-ACCTCCTGAGCAG----------AGCTTTGGGGGCCTCTGTGGAAGGAGCTTAGGGGGACCAG-GGATGGCAGC--TGCAGTGGCCTCAGG-GACACACATGTCCCAGCACAGGAGCCCGATGGCTCAGTATGAATGAGCTTCA--------------------------------------------     
 8 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-185208_185345       87.7%  35.7%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGTCATGCCTGGATTTATAGTTGCTTGTGGTTCTTGGAGACTGCGGCGTT-TTGGGGACGTTTACAGAACCGC-GGGGTGTGTTGGCCTCAACTGG-CTCCCAGCACACCGTGCATGCGGCTCTCGGCGCCCTGCCGGCGGCT------GGGGGTCAGCAGTG-----AGGAGGGTATGGGGCT-GCACCGCGGG-------GGCTGCAGCAGTGGC-GTCTGCA-AACGCA-CTCGGGCGC-AGATGGCCTGACCGCCTCCGT--GGCCGGGGC----T---CTGCCCGTGCTGTGG------------C-----C-------TGCGC-----GGCCTGG-TGAC-TAGCGGGCCCTGGGCCCCTCTGGGCAGGATGG---ACCATCCAGCCTGCATCCTGGCTCCCCATGAGGCGGGAGGGG----GCAGGGCTGCTGGGAAGGCCCCG---------------------GAAGGGGCAGAGCACAGGAGCGTCC------GGACCGTGCGCGG------CACCGAGCCTGCGCGGCACCG-------------A----GC-CG---GTGACGGCACCGTGCTCGTTTCCAGTGTG--TCTGACCAGGTGATGTCGG---------GGCGGGCCGTGGTCCAGGCAGAAGAGGTCAAAGGG-GCAGGCTCCGCAGCG----TGTGGTGGGGTTGGCC-G--GCGC------TGAGGTCCGTGGTGGTCGGACGCCCACGCTGTGCN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN----NNNNNNNNNN----------------------------------NNNN--NNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNN---NNNNNNNNNN-NN-NNNN--NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----N--N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN-NNGGGGGGGTGGC---TGCCTCGTGG--CACATGAGCCAGCACA----G----GCTCCTTG--TG-CGTGAGCTT---------GGGGACGAATGAGCAGTTTGTG--ACACGGCCCTGGGGGTCTGGGGGAGGGCAGGGAAGGTG--------CC-------CCTTGCACCCCTTCT--GTACCTGGGGAGGGGGGGCTCGTCCTGCAGCTCCCG--------------------------------GAGCTGTGCCTCCGA------------     
 9 Microcebus_murinus-NC_033661.1-184549_184736             75.2%  32.5%    TGCGACGACATGCACGGGTTGTGCAGATGCGCTGCGTAGCCACGCCCATTACCGGGTCTTATTTT---CAGGGTGGGGCTTCTATTGCGCAAATGC--TTAG-AAATCCTGCTGGGGCTTATTTTATGGGTAGGTCTTAGTTTCAAGGAAACTCGGTAGTGGCTTGTGGCTCTCGGAGACTGTGGAGAT-TCGGGGACGCTTCCAGAACCGT-GGAGTGTGTTGGCCTCAACGGG-CTCGCAGCACACTGAACGTGGCTCC--TGGCGCCCCGCCGGCAGCT------GGGGGTCGGCAGTG-----GGAGGA--------------CAGGGGC-------CGAGGCCGCGGCGGC-GTCTGCA-GAAGCACTCGGGGCGC-AGACGGCCTGACCGTCCCCGC--GGCCCTGC---------------------CTC------------G-----T-------GCTGC-----GGCCTGG-TAAC-GAGAGGGCCCGGAGCCCCTCTGGGCGGGATGG---ACCGCCCCGCCCGCGTCCTGGCTCCCCGCAACGGGGAGGG------GCAGGGCAGCTGGGAAGGCCCCG---------------------GCC-GGGCAGAGCACAGGGCACGGC------GGGAGC-------------GTCAGGCCGTGTGTGGCACCG-------------A----GC-TG---GTGACG-TGAGGAGCCCGCCTCCAGCCTG--TCTGGCCCGGTGGTGTCGG---------GGCGGGCAGGGCTCCAGGCAGCCGC----------------------GGTG----TGTGGTGGGCTTGGCCGG--GCGC------GGAGGTCCGTGGGGGTAAGACGCCCACACTGTGTG-----------CTTCTCAGGGGCTTTGGGGCATCC-CCG----GGCGTGTGCGGGGCGTGTGTGGGGCG--TGTGCGGGGCACGTGCGGGG--CGTGTCCC-----------GGGCGAGGGCCATGTGCCTGCCCCTGGCT--GAAGCCGTCTCTAACAGG----GACCCGCTCCTGCCCA-TGGTGTTCGAC-----AGACACCAGCCCTCACCTGGGTGGGGG-CGAGACGTGGGGTGGGGGCACCCCCGG-----G--G-CACGGCTGGGCCGGGTTTGGGGGCGCCTGTGGGAGGGGC--TG-------GGGGTGCCGGC---TGCCTCCTGG--CACATGTGCCAGCACA----G----GCTCCTTG--TG-GGCGAGCTT---------GGGGGACAAACGCGCAGTCTGT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
10 Callorhinus_ursinus-NW_020313076.1-196763_196951         77.4%  26.5%    ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAGATTCTGGCTGAGGCTGC------------CGCTGCTTCTCCAGGGTGCGCGGCGTTTCGGGCGGTGTTTACAGAGCTGC-GAAGCGTGTCGGCCCCGACTGG-CTCCAGACACACCACGCACACGGCTCCCAGCGCCTCTGCCAGTGTG---CCGTGGAACCATCAATAAACTAGGAGGGAGACGGGGC-GGTGTTGCTGGGCTGGG-GAAGAGAAAGAGAAACACTTCTG-AGAGCAAT-TGGACTGTAGCTGATGCTGAGCACCCCTGTTGCTGCTGAC----CTGGGCCTCAGGCTTCGGGCCGGCTCCTTCTGTGCTGA-------CTAGC-----AAGGTGTGAGCAGAGCGGCCCCAGGGCGGACACCGGAGCTGCAGA--------GCTGACCATCATGTGTCCCCCTGTTGGGCA--CAGTGGGGCCCAGCTTGAG-CTCCAGGGTCC-----AGGCTGCAAGCCTGGCAGTCCAGGCTGGGCCGGGGTT----GGCG---GGGAGGTGTGGACGTGC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGGGGTGCGC-CCACG-------------GGTGTGTGTGGAC-----------GGGGCCTGGGGAGCCCCCTTTGGCAGGGCGGGGA-----------AGGAATCCCCTAAGTAGCGGCCAGGAAGGCTCACGGTAGCCCTGACGCGAACAAGGGCAGCTTCGGGGGCGCAGACCCGCATTTGGCTCCCCAAGAAGCGGGGCCGGACCCCAGAGCCGCAGGGAGCT-TGTAC--GGGCCTTACAGAAG--CACGCACGGCCGAG------GAACCTTGCAGACACACAAACGGCGTTTATCATACA-------CTCACCCACTGCGGGG----AAAAAAATTCAGA---ACTGGGGCCTTAATGGGCTTAAAGCAAC-----------------ACATCTCGAGGGGCTCCCTCTCAGACCCCT-------GCTCCCTGGCCGCT-GC--CACTGAGAACCCAGGGAGGGCTGAGGAATGTGTCTCCACGGGCCCCAC----------C---TGCCCCTGCTGCCTCCGAGCTCCTTGCGGGAGGG------GTGCCTGGAGCCCCTGGGACTGA---GGC--------CAGGTC-CCGCCCCCCGCCGTCACC----TCTGTC-----------------TCCCTCTCCCCCAGGCTGAGGAGGACGTGCAG     
11 Equus_asinus-NC_052181.1-197531_197673                   80.8%  29.1%    --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCGCCTGCCTTGGTTGTGCCCA------------GTTTTATAGGCGCTTTTGTGCGGCGTTTCAGGCGATGTTTAAAGAGCTGT-GAAGCGTGTTGGCCTCAACTAG-CTCTGAGCTCCGTGAACACAGCTCCCAGCG--CCTCTG-CCAGCAG---CCGCGGAATCTTTAATAAATTAGGAGGAAAG-CAGCT-GGTGTTGCTGAGGCCGGAGA---GACAGAGAAACATCTCTA-AAAGCACTTTGGGACTTAGACGGTCCTGAGCGCCAGGGTCACTGCGGAT----CTGCGATTCTCTGGCGGCCT-----------------GCCAACCGGATGTGC---ATG-TGGAGGGTCAGCAGGCCACTCGGCTGCTCTGGGG----------------------GAGGGCAGACC-----CAGGCTG-GAGGCAGGAGCCGGAGGGGT-GCCCGTCCCGAC----TCCCCACGAGGGCAGAGGAGGGGAGCGGGGCGCAGATGTGGGCCA---AGAGGCTCCTGGAGCCAGGAGCGGGCAGGGCCAGGGGAGT--------G----G----CTGGAGCTCGGGCAGCTGCCCAG-AGCCTCCAGACAT--TAC---CAGGTGGGGTCTG--CGG---TCACTGCTCTGTCTCCCAGCATGTGAGCCGAGATGG----TGTCCAGGTGGCTGAGACC----GAG-GGGCAGGCACCCT-------CAGCCCCATGGCGGTCGGATGCTCACAGTGGGTT-----------CTTTGAGGCAGCTCTGGAGCATGGGATC-----CCCTCCCCTTTGCCCACGGGGCGGACGCTGATGGTCCACCATACC---CCAC----CAGGCGGAGCGGGCCTGGAGTCC------------------------------CCAGGTCG--AGCTCTAGGCTGCC-------------TCAGCCAGGCAACCAGAATCCATACCTGAAGGGCC-TCGCCCGTCTCCTGGATGAGAGGCTGTCGGCCAGGCTGGGGCGTGGGTGGAGGAGGTGTGT--CTGT-GCAGGG-GCATCCACAGGGGTGCACATGCA---GAAGTGCACATGGGGCCGTA-------TACA-GA--GTGTGCAGG----------GGTGTGTGACACG-T------GTCTCCTC----------TGGGTGAAGCCCCTCTCTAACACG-----------------------------------GACCCTCA---GCCAAA-GGTGCACGGC-TGCAGCGTGCCTGAC--------------------------------------------------------------     
12 Neomonachus_schauinslandi-NC_058406.1-196076_196209      80.5%  30.8%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCGGATTCTGGCTGAGGCTGC------------CGCTGCTTCTTTAGGGCGCGCGGCGTTTTGGGCGGTGTTTACAGAGCTGC-GAAGCGTGTTGGCCCCGACTGG-CTCCAGACACACCACGCACACGGCTCCCAGGGCCTCCGGCAGTGTG---CCGTGGAACCATCAATAAATTAGGAGGGAGACGGGCG-GTTGTTGCTGGGCTGGG-GAAGAGGAAGAGAAACACTTTTG-AGAGCAGC-TGGACCGTAGCTGATGCTGAGCACCTCTGTTGCTGCCGAC----CTGGGCCTCGGGCTTCGGGCTGGCTCCTTCTGTGCTGA-------CTAGC-----AGGGCGTGAGCAGAGCGGCCCCAGGGCGGACACCGGAGCTGCAGA--------GCTGACCATCATGTGTTCCCCCGTCGGGCA--CAGTGGGGCCCGGCTTGAG-CTCCAGGGTCC-----AGGCTGCGAGGCCGGCGGTCCAGGCCGGGGCATGGTT----GGCG---GGGAGCTGCAGAGCTGACCATCATGTATTCCCCCGTCGGG--------C----A----CAGTGGGGCCCAGCTTGAGCTCC-GGGGTCCAGGCTG--CGA---G-GCCGGTGGTCC--AGG---CCGGGCCATAGTTGGCAGGGAGCTGCAGATGTGCAGGGGTGCCGCCCACAGGTGTGTGCGGATGCGTGTGCAGGAC-----------GGGGCCTGGGGAGCCCTCTCGGGCGGGGCGGGGA-----------AGGAGTCCCATAAGTAGCGGCCAGGAAGGCTCACAGTAGCCCTGACGCCAACAAGGGCAGCTTTGGGGGCGCAGACCCGCATTTGTCTCCGCAAGAAGCAGGGCCGGACCCCAGAGCCACAGGGAGCTTTGCAC--GGGCCTTACGGAAG--CGCGCACGGCCGAG------CAACCTTGCAGACACACAAACGGCGTTTATCATACA-------CTCACCCACTGCGGGG----AAA-AAGTTCAGA---ACTGGGGCCTTAATGGGCTTAAAGCAAC-----------------ACATCTCGAGGGGCTCCTCTTGGACCCCCG-------CTC-----CCTGCG-GC--CGCTGAGCCCCCAGGGCGGGCTGCGGAGTGTGTCTCCACAGGCCCCAC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
13 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-183295_183391          78.0%  35.7%    --------------------------------------------------ACAGAGTCTCACTTTATTGCCTTCG---------GTAGAGTGCTGT---------GGCGTCACATAGCTCAC-AGCAACCTCC--------------------------------------------AACTCCCGGGCT-TAGG-----------------------------TGATTCTCTTGC-CTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCACGACAACGCCCGGCTATTTTTT--TGTTGCAGTTTGGCTGGGGCCGGGTTTGAAACCGCCACCCTTGGTATATGGGGCCGATGC-CTTACCC-ACTGAACCACAGGTGC-TGCCCACCCCTGCCTCTTCTG------CTAGG----ACTCTGCCTTATGCTCTGG------------C-----C-------ACCAA-----AGCCTGG-TGAC-TGAAGGCCCCTGGGACACTCTGGGCAAGATGG--GCCAGTCCAACCTGCATCATGACTCCCAATGAGGGCAG---GAGACGGCTGGGCACA-ATGGAGGCTAAG---CTCCCTGGAGGTCCC-TGGACTGGGCAGAGCACAGGGTGCTGGTG----GAGATGT------------------------CAGGGCTGT--GTCTGGCTTAGT----GCCTG---CGACAGCCCTGCTCC-AGTTTCACATATGTCTGTTAGGTGGGTCTGGGCA---------GGCAGTGAGTGGTCCAGGCAGGAGAGACTGAGGGG-GCAGGTGCGATG---------GTTTGTGGTGAGGTCAGCTGAG------AGCTGTG-TCTGTTGTCAGGTGCCCAGAGTGGACT-----------CTGTGCAGCAGCTTTTGAAGATTC-ACG----GTCGTGTCCAGGGCATGTGCAGGGCG--TGCCTGTGGATGTGTCCTGGGCGTGTCCATGTCCGTG-TGCCGGGTGTGTCCACAGGCATGTGTGGACATGTCCATGTGTGTGCTGGGTGTGTGTAGTGTCTGTCCTCTG-ACGTGCAGGGC-----ATGCCCAGGGTGTGGCCAGGGTGGGTG-CAGAGCGTGTTCACAGAGTGTGCAAGGTGTGTG--CATTGTGTCATGTCTGGCTGAAGCCTGTCTGTA-ACAGGGG--TGCCACTGCAGGTGCTCAGC---TCTGTGGCATTCGACAGATACCAGCCCT---TAC----CTGGGTG--GACGGTGCAGTGTGAGGTGGGGGCCCTTGCTGTGCACAGCTGGGCT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
14 Orycteropus_afer-NW_006921723.1-180628_180811            79.3%  25.2%    --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGGCCCAGGCTGATGAGCATCA------------GAGGCTGTCAGTAGCAGCGGTGGCATTTTGGGTGATGTTTAAAGAGTGGC-GGAGCATGTCGCCCCCCACGGG-CTCTGAACAGACGCAAGAGCAGCTTCCAGC-GCC---TCCCGCACA---GCTCGGCAGCATCAATAAATTAAGAGGAAAACGGGCT-GCTGTTGCTGGGGGCTGTGGAGAGAGACACACATCTCTC---CAAGCAAT-TAGGA----CCTAATCCTGAATGCCTCCGTCACTGAGAGT----CTGTGCCCGGGCTGTGGC-CAGAGTCCCACTGCTACAGGCTCTGGCATGGGGGGGGGGTGGACAGTAGGAGGGCAGGGCCAGGGTAGCCAGACCTAGGGC--------GTGGTCATGGGTCTGTCTGGATTTTTGATGCGGGAAAAAGGAAGGAGGAAG-GTCTAGGTC-A-----TGGGTACAAGCTCTGGAG-CTCAAGAATGGCTGGGGCAGCTGCCA---GCCATATCCATGACTGACAGGAGGTCTGGCCTGGGGCCTG--------C----A----GCCTGTGAAGTGCTCTGTTTTCA-AATTGCCTGGCGT--GGT---GTCCAGCCA-GGG--TGC--------ACGCAGTTTTGTTGACTGTGAGGTTGGCTCCAGTGCCACGGCTTCTGTGCTTTCTGAATGCCACGGTGGGCACCT-----TTGGGTGCTTTGGAGCATGGATCCT------AGGGC-----------TGGGAGCACCCTACTTGCAGGGCAGTAGGCACCCCCCCCCCCGGGAGCAGCGTA--------GATGAGGCTCCCAGCT----------CCATGTTCA-TGA---------------------GGGCTCCAGGTGAGGAAAGCCACCCAGG--AGGGGACCTTGTTCACCA--CCTG------------------GACCAAAAAGTGCCAAGCCA-GGGCCTTAGCAGGGGGCT--GAGCCAAATGTGG---TGGAGAGAGTCTAGGGGGTTGCTGAAGG-----------AC--------------------------------------------------------------------------------------------CTCACATCAGGGGCCA----------GGTGTGAATGAGGGGCCCAAAATTGGTTGTCAGCCTGG------ATTCCCGAGGTGTGCTGGCCTTT---ACAAAGGGGTGGAGGGC-CCCCCAGCTGGCCACACC----AGTGGG-----------------GACA-----------------GCAGCC-----     
15 Ursus_arctos-NW_020656172.1-197415_197489                79.5%  27.5%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCGCCTCTCCTTG-CTGTGCCCA------------GATTTAAAGTTGCTTGTGCATGGCATTTCAGGCAATGTTTACAGAGCTGC-GGAGCGTGTCGGCCTCAACTGT-CTCCACGCGCACTGTGCACACGGCTCCCAGCGCCTCTACGAGCGCG---CCGCAGAGCATTCAGGAAACTGGGAGGCAAATGGGCT-GGTGTTGCTAGGGCCGGGGATGAGAAAGAGAAACACTTCTA-GAGCAAGC-TGGAGCAGAGTGGACGCTGAGCTCCTCTGTGGTG---GAT----CCGTGCCTCGGGCTTTGGACCAGCTCCTTCCGTGCAGCCCGCTGACCAGC-----AGGGTGCGAGCGGGGGAGACCCAGGGCGCAGGCAGGAGCTGGAGA--------GCCGCGGCCTGACTCCCCACG----------------GGCCCAAGCTCC-T-CCCCAGAGCAGG----TGTGGGCAGGGCCCGGGCAGCCGGTGGAGTTTGGGGTAGCTGCCC---GCCAGCATCGTGGGCCACACGCTCCTTTTCCAATGTGTG---------A----G----CCGT---GGCGGTGTTCAGGCCG-AGGGGGCAGGCAC--CAC---ACGGGGCTCTTCG--GGG----------------------CAGCTCCGGAGCACGAGGTCTTGTCCCCTCT-GTCCCTGG----GGCACGGCTGACC-------------ATCTTGTGCTCCCCCATCAGGCACAGTGGGGC------------------CCAGCTTGAGCTCCAGGGTCCACACCG---------------------------------------GAGGGGCCTTTCTCCCCTCCTGGCTGAGGGCCGGCGTCC--AGGCTGGGGCATGGTTGGAG--GGGAGGTACGGACG--GGCGGAGGTGCATCCCCG--GGTGTGTGTGGACGTGTGTACAGGACTGGGCCTGGAGAGTCCCTTGGGTGGGGGCAGGGAAGGAAGGCGTTCCGTA---AGTAGTGCCATGGAAGGCTCACGGTAGC-----------------CCTGAGGTGAACGAGGG----TTAGCGCAG-------CTTGGGGGGCGCAG-AC--CAG--CGCCTTTCTCCTGAGGTGAGACCTCTGTCTCCGTGAGAAGCAG----------GGCCGGACGCCAGAGCCGCAGGGAGCTTCGTGCGAGCC------TTAC-GTAAGCACGCACGGCTGA---GCC--------AC----------------------------------------------------------------------------------     
16 Elephantulus_edwardii-NW_006399795.1-180117_180172       78.3%  25.6%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGGCGCCTGTGGCTCGTGGCAGC------------GGCAGTGGCAGTAGCAGTAGCAGCATTTTGGGTGATGTTTAAAGAGCAGT-GGAGCGTGCCGGCCTCCACGGG-CTCTGAGCACGGCTTCCAGGTCCTC--------------CTGCAC----CCATCACATCATCAATAAATTAAGAGGACGAGA---A-GTCGCTGCTGGAGCCTGTGCAGAGAGACC--GATCTCTC---AGAGTGTT-TGGGG----ACTTA----GTATGTGTCTCTTACTAAGAGT----CTGTGTCCAGGCACTGGT-CAGTGTGCCACCATTGTGCGCTGAGGGGTGGGGGCAGAGGCGC-AGTGGGAAGGGATGGCCAGGT----------------------------------------------TTCTGCTT-CTGGAGAAGGGAAGAGGAAG-GTCTGGGCT-G-----TGGCCATGGGCTCTGGGG-CACAGGAGTGGCCGGGGCAGCTGCTG---GCCACGTCCACAC-TGACAGACTGTCTGACATG-GGTCCG--------C----A----GCCAGCGACGTGCTCTGTCTACA-GATGTCTGG-CTC--GGT---GTCTGGCTGGTGG--TGG--------CAATGATTTGATCGACTGTAAAGGTGTCTCT---------------ATACTTGCTGAATGCCTTTAAGGTGTGTT-----GGGG---ATGTGGACCCCACTTTCG------GG-TT-----------AGATACCCACCTTCTT------------------TCTGACTGGGGAGCAAGATA--------TATGAGGCACTCAGCT----------CCACTTTCT-GAAGGCCCCAGGTCATAGTCACAGGGGTGCCAGCTGTGGGCCTGCACAGAAG--GCTGGGCCTGAGTCACAG--AGAG---------AGAGATGGGGGCACTTACGTGCCAAGGTCCTGGGCGCTGGGATGGTGA--GGCCACTTTGTTT---TCTAGAGGGTCTAGGGGTGTTTGTAAAGTGTGGAGGGTGTCTTCCCCTTGGGGGTCTGAGCT-TATTTATCACCCTGGGGAGCTGCCTTGCCAGTA-CC--AGCTGATGACCCCTCCAGAGGCCAGTGCCAAGGCTACCCCGGCAGCTA----------GTTGTGAATGTGGGGTCCATAAGAGGCTGTTAGCCTCA------GTTCCTCAGGCGGCTGACACTCA-------------------------------------------AGAAGT-----------------GACA-----------------CTGGCCTTC--     
17 Chelonia_mydas-NC_051258.2-107720_107799                 79.0%  23.9%    -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGGGTCAGGGCAG------------AGGGCTGGGTGTGTGTGAGGAGGGTTCAGGGGTCAGGGCA-GAGGGCTGGGGGTGCGTGAGGGAGGTGCAGGG-GTCAGGGCAGAGGGCTGGGGGGGT------------TC-AGGGTCA---GGGCAGAGGGCTGGGTGTGTGAGAAGGGTGCAGGGGT-CAGGGCAGAGGGGTGGGGGG----GTTCAGGGGTCAG--GGCAGAGGGCTGGGGGTGTGTGAGG----GAGGTGCAGGGGTCAGGGCAGAG---------------GGCTGGGGGGTTCAGGGTCAGGGCAGAGG-----GCTG--------GGTGTGTGTGAGGAGGGTTCAGGGGTC-------------------------AGGGCAGAGGGCTGGGGGTGTGTGAGGGA-GGTGCAGGGGTCAGGGCAGA-GGGCTGGG--------GGGGTTCAGGGTCAGGGC-------AGAGGGCTGGGTGTGTGTGA---GGAGGGTTCAGGGGTCAGGGCAGAGGGCTGGGGGTGCGTG--------A----G----GGA--GGTGCAGGGGTCAGGGCA-GAGGGCTGGG--G--GGT---TCAGGGTCAGGGC--AGA---GGGCTGGGTGTGTGTGAGGAGGGTTCAGGGGTCAGG-GCAGAGGGCTGGGGGTGCGTGAGGGAGGTGCAGGGGTCAGGGCAGAGGGCTGGGGGGGTTCAGGGTCAGGGCAGAGGGCTGGGT---GTGTGAGAAGGGTGCAGGGGTCAGGGCAG----AGGGCTGGGTGTGTGTG------------AGGAGGGTTCAGGGGTCA-GGGCA------------GAGGGC--TGGGGGTGCGTGAGGGAGGTGCAGGGGTCAGGGCAGAGGGGT--GGGGGGGT-----TCAGGGTCAGG-GCA--GAGGGCTGGGGGTGTGTGAGGGAGGTGCAGGGGTCAGGGCAG-A-GG-GCTGGGGGGTT-------------CAGG------GTCAGGGCAGAGGGCTGGGTTTGTGTGAGGAGGGGTCAGGGCAGAGGGCTGGGGGTGTG--GGCTGGGGTCGTGGGGGTGCTCCCAGCCCCCTACC--CTGAGCGGCTCACAGC------------------------AGGGGGC-------------------TG----GAGGGGATATGCCGATTCCACCCC------CTTCCCCAATG-TCCCCGGAGCA---------------------GAGAGTGCGCTGAGGCTC----CGTTTT-----------------TCCCTCTCCC----------------------     
18 Ovis_aries-NC_056065.1-185719_185799                     80.4%  26.2%    -------CTGGCCTAGGGCTATGAGG----------------------------------------------------------GTGCCAG---------------------------------------------------------------------------GTGGTCCTGCAG---ACCCCATT-TTG---------CAAGACA--------------AGACACATCTGG-CTCTGTGTGCTGGTGGGAGGG--GCTGATGTGGCCCTGCTGCCCAC---ATCCCCCACCGCCAAGG-A---TGGAGAGGGGTGCTGTCTCCCTGCCAAGCTG--GGGTGCCAGGGGAGGGGGTGGTGA-CAGGGGATTCTGGCCC-TGGCTG----CAGCA----------------------------------------------------C-----T-------TCTTC-----AGGATGC-TGGGCTAGCCTGCACCTCTCTGCTCTGTACCTAGATT----CAGGGGGACTGCTGTGCTGGGTGACCACGGGGTTTCAGGCGAGGGTTAACGAGCC-AAGAAGCGTGTC---AGCCTT------------GAGGGCTGCAAACACCGTGAA----------CACAGATTCCCATGCCTCTGCCAGTTCATGGGTTTCCTGAGAGCCTCCATTACCCAGGGTCTGTGGCTTGGGCTTTGCACCAGTGCCCCTCCATGTAGCCTACCAACCGGTGGGAGACAGGACTCCCTGGAAGGTGGAGGAGGGGACTGGGGTCAAGAGA-GCAGCGGAG--------------------TTGGTT-GGGGGGT------GACTCCCGGGAGCTGCCAGGTGCCCCCTCTCTAGC-----------ACGTGAGC---AGAGAAGGCATCC-AGG----GGGATGGGCC----------TGTGGC--TGTCTGTGCCCCCTTTTTGCTGGGC----------------TTGAGGGCCTCCTATCCCTTGCTCTAGCTC-CAGGCTTCCTGCCTGGTG----ACCAGAATCCAGACCTGAAGGGCTCCACTCATCTGCTTGGTGAGGCCAGCGGACTGAGGG-GGGAGCATGTGCAGGGGCGCCCCCAGGGGTGTG--TGTACAAGC--------TCATACGCAGAGTGTG-------T--ACGTCTTGCTGAAACCCCTC---CCTGACAGGGAATGTCGCTGCAAAACCA---------GCTCCTGC--CGTGGTGTGG---------TAGGCACACCCTGAACAAAGCTGGG-AGAGTTGTGGGGGCATCTGTGGAAGGGGCTGGGGGGGCAGCTGGTGGTGGCTGCAGTGAGTGGCCTCAGG-GACACAGG----CACAA---GCTTCCAGCCACTCCAG----------------GAG----------------------------------------     
19 Chrysochloris_asiatica-NW_006408691.1-182758_182841      82.9%  28.3%    ---------------------------------------------------------CTT-------------------------------------------CCTTCCTCCCTGGGATCACCCAGTTCTGTGCTCCTGGGCCCG--------T-----------GGGAGTTGCCCAGGAGGGGGCCTTGCTCACACATAGGCCAGAGCAAA-GGACTGGACCCGGTGTGGTGGG-TTGAGTCTGGGGGTGCTAGAGCACTCAAGCTCCACCTGCAGGGAG----GTGAGGCTGCTCTTTTA-----ACTCTTGACCCCTGGTGACACTGGGGGCGCTACTGAAATGTGGAGA----GTGTCTA---CCTTCT---------TGGGGATCTGAGACCTTCGTG-----------------------GTTCACTCATC------------A-----C-------TCAGC-----AGGG----AGCC-AGCCTGCCAATACCACCTTCCTGGTTCTGAGG------------GGCCAGTATTGAGGCCACATTGGAAGTCA--------GCTGTGAATGTCACCAGGCAATTGAGACTCAGGAAGG-------AATGCTGCGCTTCACTAGGGGATGGAGGGCCCCCAGCTGCCCACACCAGTGGCA-----TAGCAGCCCCAT---GTGAAAGTAGA----GTGTG--TATGTT--GTTGTTGTTAAATACCATTGAGTCCGTTCCGACCCATAGTGAC--------CCTGTATAGGGTTTCCAAGGAGTGACTGGTGAGCTT-GAACCACGGACCTTAT--AGTTCAAATGGTTTTGCAG-----T------CTGGCGCATTAACCCACAGTG-CCACACCAGGACT-----------CCTTTAACC--ACATAGGGCTTCC-GAG----GCTGTAAA------------------------------TCTTTGCCGGAGCAGC------------------AA-GCCTCATC--TTTCTCCCATGGA--ATAGCT----GGTAGTTT---CGAGTAGCTGACCTTGCGGTTTGCAGCCCGCCTCGTAACCACTATGCTACCAGAGTTCCTT-ATA--------GGAGTATGCATACAGGGGTGTG--AACAGGGGCGTGTGAAGGAGCAAAT------TA--------------C--AGAGATGCAGGGG---TCTATGTGCTGGGATGCATGC---------------------AGG--GCTGTGCGTCTATGGAATGGGGGCCCCTTCTAAGCACAGCTGGGCTAAGTTTGGTATCAAAGGGCTGGCAGTGGCAGGTGGTGAGGG-CTCAGGCTCCCAGGGCTTGGGTATGAAGGACCCTCGGGTGAATGGG-CAGGTCCAGAGGT----------------------------------------------------------------     
20 Ictidomys_tridecemlineatus-NW_024405058.1-184025_184102  79.3%  30.9%    ------------------GTGTGGCCCCTC-----GGAG-------GGTGGCCGGCTGGG-CTGCTTCCTGTGGGGACCTGCGAGGGCCCAGTGTGGGCTGTGGCTAGCTGCCATTGCTCAG-GACCACCAGCCGCCTTGCCTGGGCTGTGCAGATTGGGGTCACAGGGGGCTTAGCAGCAGCCGCATT-CTGGTGATGCTTGAAAAGGCTT-AAAGCACATCAGCCTCAGCCAG-CCCCGGCACACCTGGCGCTCAGCCTCC-------------------------CGCCTCCATCCTTGGAGTAAGGGAGCCGGGGGTG--A--------------------------------GTGTCTC-CAAGGCACTGGGGACA--GATAGCTCTGAGCACCTCTGCTACTGTGGAC----CTCTGGGCAGGAAGCCCAC-----------TG-----A-------CCGGA-----AGGCTGG-GTCA-GTGAGGCCC--CGGCTACTCGGCATCAGGAAG--GGCCACCA--GACCCAGCCCTACTCCGCAGGAGAGTGAAGGAG--GGGGACGGGTG-----------------------------------------------CAGCGAGCGGGGAGCTGGCGGGAGTTTCCAGCAGGACTCAGTGGGTGTGCCTGGCTCGG--GG----TG---T----GGGTGTGGGTGGGGACCTGCTGT-GCTCTCCGTCCTG--TCT---GACAGGGTGGCCC---------CGGGTGGGGTGGTCCAGGCCCAGGCTGCTCTT------------------------------GGGAGGACAAGGAGTGA------AGGGCT---CTGCTGTCAGATCCCTAGCAGC---T-----------CCCAGCAGCAGCCCTGGA------------------------------------------------------------GCATCTGTGAGTGCAGGTG----AGCCTGCGTGCAGGGGCGTCTGTGTGTGTGCACGCGTGTGTGCAGGGTGCACACAGAGGCTCTGTACAG-GAGC----------------------------------------------------------CCTCCCATGTGTGTG--CTGCAGGACGCCTGTGGCTTCACTCAGGGGGTCCTCGGAGTGCAGGACCTGCCCCTCCCCAC---------------------------------------------------CAAGGTCCCCTGCTGCACCTGGGCACCTCCAGAGCAGAGCTGGGCCAAGTTTGGGGGCACAAAATGGACTGGTGGGAGTGGGAGGTGGGGGCTGCAGC--AGCCTCGGGGGCAGA-GGCACA------GCTTGG--GCTTCCGGTGGCGCCAGCGTGGATGAGCTCAGGGACAGC-----TGCCTGGATCTGAGGGCCG-------------     
21 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-198074_198143            91.8%  47.0%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGTTAAGCCCAGATTTACAGTGGCTCGTCATTCGCTGAAACCACAGCGTTTCAGGAGATGTTTAAAGAGCTGT-GAAGCGTGTCAGCCTCGAATGG-GTCTGCACACACCACGAATAAGCTCCGG--GGCCTCCCCTGGCGC---GCTGCAGAATCATCAATATATCTGGAAGAAAACAGGCTGAAGCCTGG-GG-------AGAATGAGACAAGT--GTCTCTA-AAGGCAGTCTG-GCTG-TGACGTCCCGAGCACCTCTTGTCATCATGAAT----CTGCGTCAGC---TCTGGG------------T-----C-------AGCGC-----AGCC----AGGTGGGAAAGTCC-------------------------------------CCTAACCTGACTTCCCATGAGGACGA--GGAGGGGACAGGGCACACATCTGGGCTGTAGTGCTGAGAGAGGGCCCC-TGAACGGACCAGAACACAGGACAGCCGGC----AGAAGCTCCC-AGCCCTGTCTCCAGGACGGAAAGGGCCCT--ATCTGGCATAGA----GCCTGCAGCCAGCACCACGGTCC-CTCTCCCATCACG--TCTGACGAGGTG--CGCCC---------AGGTGACGGTGGTCCAGGCAGATGGGCCCAAGGAT-GCAGCCATGAGTTGTT---CGCTGTGAGCTTGGTCAAGAGCAT------ACGTTTCTGTGATTGTCAGATGCCCCCAGTGGGCT-----------CTGTGGCCA---CTTAGAGCACCC-GTG----GATGTGTGCAGG--------------------------GGTGGGCGGGGTGTTC-GCA-----------GTGGGGCGTGTACAGGAGTC---CTTGAT--GAATGTGGGTGCAGCTGCC-TGTGC-----------------------------------------------------------------------------------------------TATGCCCGCCTCTGGTGGAAGACC-----TA-AGTGGGA-CTGTGGTTGTTGGGAC-AGGG---CACACCATATCTGGTAGAAGCCAGCCCC---TA-----CTTCGAGCAGGGAATGAGATTTGGCAGGGGGGCACCTCCTGCACCGAGCTGGGTTGAGTTTGGGGT-CATCTGTAGAAAGAAGGGCTGGGGGGAAGTGGGCGGCAGC--TGCAGCATCCCGAG---ATGCAAGCACACCCGCACAGCCTCCCGGCGGCTCTGTGTGAATGGGCTTTGGGA-TGAATGGCAGTGTGTGACTCACCCCTG-------------     
22 Manis_pentadactyla-NW_023457939.1-186035_186091          82.7%  36.7%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ACACCTCT-CCTTGGCTGTGCCCCGCTC------------ACAGGCACTTGGTATGCAGCATTTCAGGAGATGTTTAAACAGCTGC-GAAGTGGGTCGGCCCCAGCTGG-CTCTGAGCACTGA----ACTCAGCTTCCAGTGTCTCTGCCAGCCCA---CTGCGGAGTCATCAATGAATTAGGAAAACAGACTG----GCATTGCTGGGGCA----CAGGGGGGTGAG---ATGTCTA-CAGGCAACTCAAGCCTTAGCCGCCCTGAGCACCTTCAG-TGTTGTGGGC----CTGTGCCTCTCCGCGCAGCCCA-------CCA-----G-------AGGGC-----ACGAAGG-GCACAGCCAGGCCCCTCCGCTGCTCTGGCAACAGAAGGGCCGCCCGAGGCACCTGTGCTGACTCCCCAGGAGGATGGGGGAT-GGGGCACAGGAGTGGGGAGAGGTCAGGGGTCAGGTGGAGCTCCGAGGGGGCTGACACTGC-CAGGCAGTGTCCCTGCCACGTGCTCCC-TCCCTAGTGTGCGAGCCACTGTGGGCAGT--GTCCAGGCTGGTAAGGCCGAGGGGCAGGCACTCTGACCATCCTGCCCTCTCCC---------------CGTGTC---------CCCAGCTGGAGCTCCAGGCGACTGGAGCCCATCCC-TGAGGGGGCCTTGCTCACCTCCTGGGTGAGAGGCCAG--CGGG------AGGGCTGGGGTGTGGCCAGGTGGTGCCCATG------------------TGCAGGGCTGTGTCTG-------TG----GGCATTGTGCGGGGGCGCCCACAGT-------------GGTGGCGTGCAGATGTGTGCGTAC-------GGGACCAGCCT------GGGGGAAGCCTC--GGAGGGGGTTGGCGCAGG--GAGGGCCTCTGTGCTCAG-GAAGGCTGAGTGGCCTGGAGTCACTGTGCCCTGAGGCTGAAGG-GGAGCAGCTCTGGGGGGTGGTGTCTGATCC-TG--AGAGGACACCCCTGGAGTTGCAGGGATCCTGTGAAAAC-----CTTGCATAAGCAGGCGCAGC---TGGGAAATGTTCTAGACACACAAACAGCGTTTCTCATGCAGTCACTGTGGGAAAAACTC--AGAACTGGGAACCTAATGAGTTTAAAACA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
23 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-197621_197666         78.5%  27.4%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTTGAAAGAGCTGC-CAGGCGCGTCGGCCTCAAGTGG-C-CTGAACGCTGTGAGCTCAGCTCCCA-GG--CCACCG-TCAGCAG---CTGCGGAATCATCAATGAATTAGGAGGAAGATGGGCT-GGTGTTGCTGGGG----CTG---GAGAGAGAAACATCTCCG-TCAGCAATTTGGGCCTCAGACGGTCCTGAGCGCCTGCCTGATTGCGGAT----CAGCACCTCGGGGTTGGGAGCGCCTCTCTGCGCAGCCTGCGACCGGATGCAC---ATGGAGAGGGCACAGCAGCCCCCTCGGCTGCTCTGGGGGAGCCGA--------GAGGAGGGAGGGCAGACC-----CAGGCCG-CGGGCGGGAGCCAGAGAGGC-TCCCATCCTGAC----TCCCCACAAGGGCGAAGGAGGGGAGCAGGGCTCAGGTGAGGGCTG---AGCTGCTCCCAGAGCCAGGAGCGGGCAGGGGTCAG--------------------------------GGGAGCAGCTGACC-GGGGTCCAGACCC--TGC---CAGGTGGGGTCCG--CGG---CCCCTGCTCTGTTTGCCAGCAAGTGAGCTGAGACGG----TGTCCAGGCAGACGAGACC----GAGGGGGCATGCACCCT-------GGGCCCCAGGGCTGTCAGATGCCCACAGTGGGTT-----------CTTTGACACAGCTCTGGAGCACAGGGTC-----CCCTCCCCTTTGCCCACGGGGTGGATGCTGACCATCCGCCCTCCC---CCACTGGCCAGGCAGAGTGGGCCTGGACTCC------------------------------CTAGCTCG--AGCTCCAGGCTGTC-------------TCAGCCAGGTGACCAGAATCTGTACCAGAGGGTTCCTCCCTCCTGTCCTGGATGAGAGGCCGGCGGACAGGCAGGGGCATGGTCGTGGGGGAGGTGCGTGTGTGCAAGGG-GCATCCACAGGGGTGTGTGTACA---GAAGTGCACGTGGGTGTGTG-------CGGG-CC--GTGTGCAGACGTGTGCAAGGGTGCATGAGGCGTG------TCTGTCTC----------TGGCTGAAGGCCCTTTCTAACACG-----------------------------------GACCCTCA---GCCAAA-GGTGCCCGGT-TCCAGCATGCCTGACAAA----AACCAG-----------------CCCCTGTCCTGGATGGGG---A----------     
24 Sorex_araneus-NW_004545881.1-337105_337024               79.0%  21.5%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGCAGGTGTGGGGGT------------GCAGGTGAGTGTGGGTGCAGGGGTGTGTGGGTGCAGGTGTGTGTGGGTGCAGGTGTGTGCGGGAGTACAGGTGAGTGCGGGTGCAGGGGTGTGTGGGTG-------CAGGTG-AGTGTGA---GTGCAGGGGT--GTGT------------------------GGGTGCAGGGGTGTGTGG----GTGCAGGGGTGTGTGGGTGCAGGTCTGTGGGAGTGCAGGGAGTGTGGGTGCAGGTGTGGGTGCAGGTGAGTGTGGGTGCAGGTGCTTGGGGGTGCAGGTGCGTGGGGGTGC-----A--G--------GGAGTGTGGG-------TGCAGGAGTG-------------------------TGGGTGCAGGAGTGGGTACAGGTGAGTGT-GGG-TACAGGTGAGTGTGGG-TGCAGGGG--------TGGGTGCAG-GGGTGGGT-------GCAGGGGTGTGTGGGT--------------GCGGGTGTGGGTGCAGGTGCGTGGGGGTGCAGG--------G----A----GTGTGGGTGCAGGTGAGTGGGTG-CAGGTGTGGGTAC--AGG---TGAGTGTGGGTGC--AGG---TGTGTGGGGGTGCAGGG-GTGGGTGCAGGTGTACATGGGCGCAGGTACGGGAATTTTGGGGTATACCTTGTCGATAGCACAGCGGGTAGGGCAA------CTTCCTTGCACACAGCTGATCCGGGTTCCATTTCTCTGCCCCTCTCGGAGAGCCCGGCAAGCTACCGAAGTATCTCGCCCACCCGGCAGAGCCTGGCAAGCTCC-CCGTG------------GCGTGT--TCCATATGCCAAACACAGTAACAAGTCTCACAGTGGAGACGT--TACTGGTG-----CCC-GCTCGA--GCA--AAT----------TGATGAACAGGATGACAGTGACAGTGACG-TTGACCTTGTCGGGTG-------------CAGA------GGGAGGGGTGCGCAGTAGGCCTGG---AGCCAGTCTATGTGGGCAGGTCTGGGGGGGGG--GGCGGC-CCACTGGGGCTCAGGCCGTCCCGCT------GGGGCCGAGCACGGG------------------------GGGGAGTG--------------TGAGTGCAGTGAGTGTAGGTGCAGGTGTGGGTGC------AGGTGAGTGTG-GGCTGGGAACC---GCCAAA-------GGCC-CTGCCAGGGCTGCGTGGG----GGTCCC-----------------TGCATCGC------------------------     
   clustal