GATGGCAAATCCCACTGAGGGACACTTGTGCCTCTCTGTCCCCCTGGGGTAGCCGGTGTCCCCTCTGCCCATGAACCTTGAGGACGTGAGACCTCTACTCACGAGTCCCTGAGGCCCGGGGGCAGCAGGAATGGGTATCTTGGGGAGAGAAGCCGGTGGGTAAGGAGGGGCCCCACCCCCAGAAAGCTGAGCACAACCCGGTGAGTGCTTGTGCAGCCAACAGCCTTGCCCCGTGAGGACCCTTCCCTGAGCACCCCCTCGGGGCCCAGAACCCAGCCTCCCTGACAGAGGCAGGGCTGGGGGGCCTGCTGCTGGCTGAGACCCTCCACCACCATCCAGGCCCCCTCACCTGGGCCTTCTGCTGCCTGCAGCCCCTTGGAGCATAGTTGGGTCTTGCTGTCTCCTCTGTTTGGGAGTCCCAGGGGTGACAACGGGTCTGGCCGTGCAGTACGGGCTGTGTCTGGCCGTCCGTCTCCTGGGTCAGCGCGTGCCTCTCCTCGGTCATGCCTGGATTTACAGTCGCTCGTGGCTCTGGGTCACTGCAGCATTTTGGGGATGTTTAAGGAGCTGTGAAGTGTGGTGGCCCCGACCGGCTCCAGGCGCACTGTCAGTCTGGCTCCTAGCGCCTCTCCCGGCAGCCGTGGCACCAATAAATTCAGAGGAAACCGGGGCTGGCTTTTCTGGAGGTGGAGAGAGACGAGCATGTCTGAGAGCCATGTGGACCTGGACAACCTGGGAGCCTCCTGCTGCAGTGCACGTGGGGCCTCGGGCTCCAGCCAGTGCAGCCTGGTGACGGGAAGGCCCCTTGGCCACTCTGGGCCGTGGGGAGGGCCGTCCAATCCCATCCTGGCTCCCTATGAGGGTGAAGGAGGGGCAGGGCACACCTCTGGGCCGTGGTACCCAGAGCACAGGGAGGCTGGCGGGAGCTCCCCGGCCGCATCAACAGGACTGAGAGGCCCGTCTGGCATGGGGCCTGCGGACGCGACGTGCCCTGATTTCC
Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.
Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.
Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.
Distribution of HSS in the input sequence
HSS id | Strand | Frame | Length | Start | End | Score | P | Show Result | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Plot |
HSS id | Sequence | |
---|---|---|
1 | 0 | PVGATTLHSS |
Reference sequence (1): Target Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% |
cov pid 1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . . . 4 . . . . : . . . . 5 . . . . : . . . . 6 . . . . : . . . . 7 . . . . : . . . . 8 . . . . : . . . . 9 . . . . : . . . . 0 . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : ] 1354 1 Target 100.0% 100.0% ----------------------------------------------GATGGCAAATCCC----------------------------------------------------------ACTGA--------------GGGACACTTGTGCCTC--TCTGTCCCCCTGGGGTAGCCGGTGTCCCCTCTGCCCATGAACCTTGAGGACGTGAGACCTCT----------ACTCAC---GAGTCCCTGAGGCCCGGGGGCAGCAGGAATGGGTATCTTGGGGAGAGAAGCCGGTG-GGTAAGGAGGGGCCCCACCCCCAGA--AAGCTGAGCACAA--------CC-CGGTGAGTGCTTGTGCAGCCAACAGC----------CTTGCCCCGTGAGGACCCTTCCC---------TGAGCACCCCCTCGGGGCCCAGAACCC-AGC-CTCC--CT--GA--CAGAGGCAGGGCTGGGGGGCCTGCTGCTGGCTGAGAC------------CCTCCACCACCATCCAGGCCCCCTCACCTGGG--CCTTCTGCTGCC--------------------TGCAGCCCCTTGGAGCATAGTTGGGTCTTGCTGTCTCCTCTGTTTGGGAGTCCCAGGGGTGACAACGGGTCTGGCCGTGCAGTACGGGCTGTGTC----TGGCCGTCCGTCTCCTGGGTCAGCGCGTGCCTCTCCTCGGTCATGCCTGGATTTACAGTCGCTCGTGGCTCTGGGTCACTGCAGCATTTTGGG-GATGTTTAAGGAGCTGTGAAGTGTGGTGGCCCCGACCGGCTCCAGGCGCACTGTCAGTCTGGCTCCTAGCGCCTCTCCCGGCAGCCGTGGCACCAATAAAT------TCAGAGGAAACCGGGGCTGGCTTTTCTGGAGGTG---G--AGAGAGACGAGCATGTCTGAGAGCCATGTGGACCTGGACAACCTGGGAGC-CTCCTGCTGCA-GTGCACGTGGGGCCTCGGGCTCCAGCCAGTGCAGCCTGGTGACGGGAAGGCCCCTTGGCCACTCTGGGCCGTG----GGGAGGGCCGTCCAATC--CCATCCTGGCT--CCCTATGAGGGTGAAGGAGGG-------GCAGGGCACAC------CTCTGGGCCGTGGTACCCAGAGCACAGGGAGGC---T--GGCGGGAGCTCCCCGGCCGCATCAACAGGACTGAGA-GGC------C--CGTCTGGCATGGGGC-----CTGCGGACG---CGACGTGCCCTGATTTCC--------------------------------------------------------------------------------------- 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---------------------------CTGTGTTGGGGGTCATGGGGATGGCACACCCC----------------------------------------------------------ACCGA--------------GGGACACTTGTGCCTC--TCTGTGCCCCTGGGCTAGGCAGCATCCCCTCTGCCCATGAACCTTGAGGACACAAGG-CTCT----------TCTCAT---GGGCCCCTGAGGCCTGGGGGCAGCAGGAATGGGTATCTGGGGGAGAGAAGCCGGATGGGTAAGGAGGGGACCCATCTGCAGA--GATGTGGGCACAG--------CC-CAGTGAGTGCTTATGCTGCCAACAGC----------TTCGCCCCACAGGGACCCT----------------------------------------------CTC--CC--CA--CACAGGCAGGGCTGGGGGGTCTGCTGCTGGCTGAGAC------------CCTCTGCCCTCATCCAGGCCCCTCTCCTTCTG--GCCTTCTGCTGT--------------------CCGAGCCCCTGGGAGTGTGGTTGGGTGTTGCTGTCTCCTGTGTGGGAG---TCCCGGAGTGACAGCAGGTCTGGCCGTGTAGTACGTGCTGTGTCTGGCCGGATGGCCATCTCCTGGGTCAGCACATGCCTCTCCTCAGTCATGCCTGGATGGACAGTCGCTTGCGGCTCTTGGTCACTGCAGCATTTTGGG-GATCTGTAAGGAGCTTTGAACTGTGGCGACTCCGACTGGCCCCAGGCACACTGTGAATCTGGCTCCCAGCGCCTCTCCCGGCAGCCGTGGCATCAATAAAT------TAAGAGGAATTTGGGGCTGGCTTTGCTGGAGGTG---G--AGAGAGAGGAACACCTCC--GAGCCTGCAGGGCCTGCACAACCCGGGAGC-CTTCTGCCGCG-GTGCACACCGGGCCTTGGGCTCCGGCCAGTGCCACTTGGGAACGGGACGGTCCCTTGGCCACTCTGGGCCATG----GGAAGGGCCATCCGATC--CTATCCTGGCT--CCCTAGGAGGGTGAAGGAGGG-------GCAGGGCACAC------ACCCAGGCCAAGCTACCCAGAGCACAGAGAGGC---T--GGCAGGAGCTCCCCAGTCATGTCCACAGGACCGAGA-GGC------C--GCCTGGCATGGGGCC-----TGCCATGTG---TGTCCTGATTTCCAATATGCCCAGTGAGGAAGTGT---------------------------------------------------------------------- 3 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-118585_119286 86.9% 61.0% -----------CAGGTAAAGGGGGTGTCTGCGTTGGGGGTCGTGGGGATGGCACAGCCC----------------------------------------------------------GCCGA--------------GGGACACTTGTGCCTC--TCTGTCCCCCTGGGCTAGGCAGCGTCCCCTCTGCACATGAACCTCGAGGACACAAGG-CTCT----------TCTCAC---GGGCCCCTGAGGCCTGGGGGCAGCAGGAATGGGTATGG--GGGAGAGAAGCCGGATGGGTAAGGAGGGGACCCACCCACAGA--GATCTGGGCACAG--------CC-CAGTGAGTGCTTATGCTGCCAACAGC----------CTCGCCCCACGGGGACCCT----------------------------------------------CTC--CC--CA--CAGAGGCGGGGCTGGGGGTTCTGCTGCTGGCTGAGAC------------CCTCTGCCCCCATCCAGGCCCCCTCCCCTCCTGGCCTTCTGCTGCC--------------------CGCAGCCCCTGGGAGCGTGGTTGGGTGTCGCTGTCTCCTGTGTGGGAGTCC-------------------------------CGGGGTGATGGTGGGTCTGGCCGTCCATCTCCTGGGTCAGCACATGCCTCTCCTCGGTCACGCCTGGATTGACAGTCGCTTGTGACTCTTGGTCACTGCAGCATTTTGGG-GATGTGTAAGGAGCTGTGAACTGTGCGG-CTCCGACTGGCCCCAGGTGCGCTGTGAATTCGGCTTCCAGCGCCTCTCCCGGCAGCTGTGGCATCAATAAAT------TAAGAGGAAACTGGGGCTGGCTTTGCTGGAGCTG---G--AGGGGGAGCACCTCCGAG-----CTGGCAGGGCCCGCACAACCCCGGAGC-CTTCCGCCGC---------------------------------------------------------GGTGCACACGGGGCCTTG----GGAAGGGCCATCCGATC--CTACCCTGGCT--CCCTATGAGAGTGAAGGAGGG-------GCAGGGCACAC------ATCCAGACCCAGGTACCCAGAGCACAGCGAGGC---T--GGCAGGAGCTCCCCAGCCACGTCCGCAGGACTGAGA-GGC------C--GCCTGGCATGGGGCC-----TGCCATGACGTGTGTCCTGATTTCCAATGTGCCCAGTGAGGAAGTGTCCAGGCAGGCGCCGGTCCAGGCTGGTGAGGCCGGGGAGCAGGAGGCGCTGTGGCACGGCTGAGCGCCACG 4 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-185095_185345 91.1% 46.1% ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAAAG-GGGGGTGTCTGCGGGGGCCATGGAAAGGG--CCCACCACGCGTCACACACGCCCCTTTCCTCTGCATGTGAGCCTTGAGGACACGAGG-CCTC----------ACTCTG---GGGTCCCTGAGGCCT-GGGGCGGCAGGAGTGGGTATCTGGGGGAAGCAGCCAGATG-TGCAAAGAAGGGGCCCCCCCAGCAT--GCCCACGACAGGC--------C--TTGC-----------------------------------CCCTGCTGGGGACCCTGCCC---------AACCCC----CTGGAGGCCGTGCACTG-CGA-CCTT--CCCTGT--GAGCGG-GGGTGGCTGGGGTCTGCTGGTGGCTCTGACCCTGGGGTGTACC-CGTACTGCCGTCCGGGCCACCTTGCCCTGCGCTCACCCCGAGACGGGCGTGTCCTGAGGGCGGGAGGGGCCT-GGCAGGGCCCTCTGGATCTAGCTGGCTCTTCTGCATGGATGC--TCGGGGCGACAGCGGCTT--CTGGCCACGTGGGGTGGGCTGCGGTCGGCCGCCACGGCTCCTGGGCCAGCACGCGCTGCTCCTCAGTCATGCCTGGATTTATAGTTGCTTGTGGTTCTTGGAGACTGCGGCGTTTTGGG-GACGTTTACAGAACCGCGGGGTGTGTTGGCCTCAACTGGCTCCCAGCACACCGTGCATGCGGCTCTCGGCGCCCTGCCGGCGGCTGGGGGTCAGCAGTGAG----------GAGGGTATGGGGCTG-CACC--GCGGGGGC---T--G-CAGCAGTGGCGTCTGCAAACGCA-CTCGGGCGCAGATGGCCTGACCGCCTCCGTGGCCGGGGCTCTGCCCGTGCTGTGGCCTGCGCGGCCTG-------GTGACTAGC-GGGCCCTGGGCCCCTCTGGGCAGGA----T---GGACCATCCAGCCT-GCATCCTGGCT--CCCCATGAGGCGGGAGGGGGC-------AGGGCTGCTGG--------GAAGGCCCCGGAAGGGGCAGAGCACA-----------GGAGCGTCCGGACCGTGCGC-----GGCA-CCGAGC---C------T--GCGCGGCACCGAGCC------GGTGACGGCACCGTGCTCGTTTCCAGTGTGTCTGACCAGGTGATGTCGGGGCGG--GCCGT------------------------------------------------------- 5 Lemur_catta-NC_059130.1-183751_183916 89.0% 43.7% -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G-GGGGCTGTCTGTGGGGGCCGTGGAAAGGG--CCCACCGAGCGTCACTCACGCCCCTGCCCTCTGCATGTGAGCCTTGAGGACACAAAG-CCCT----------GCTCTG---GGGTCCCTGAGGCCT-GGGACAGTGGGAATGGGTATCTGGGGGCGGCAGCCAGATA-CGCAAAGAAGGGCCCCC-CCGCAGT--GCCCACGACAGGC--------C--TCGC-----------------------------------CCCTGCTGGGGACCCTGCCC---------CACCCGGGTGCTGGAGGCCGTGCGCTG-CGA-CCTT--CCCTGT--GAGCTG--GGTGGCTGGGATCTGCTGGTGGCTCTGACCCTGGGGTGGACACGGCACTGCTGTCCGGGGCGCCTTGCCCTGTGCTCGCCCCATGACAGGCGTGTCCCGGGGGCAGGAGGGGCCTGGCCGGAGCCCTCTGGGTCTAGCTGGCTCTTCAGCACGGACAC--CCGGGGTGACGGCAGATT--CTCACCACGCGGGGTGGGCTGCGGTCGGCTGCCATGTCTCCTGGGCCAGCATGCACCGCTCCTCAGTCCTGCCTGGATTTATAGTTGCCTGTGGCTCTCGGAGACTGCGGCGTTTTGGG-GACATTTAAAGAACTGTGGGGCGTGTCGGCCTCAACGGGCTCCAAGTGCACCGTGAACGTCCTCCCGGCGCCCCTGCCGGCACTGTCGGGTCCGCAGGGAG----------GAGGACGCTGGGCTG-CAGT--GACGG--------------------TGGCTGCGAAAGCACTCAGGGTGCAGACGGCCTGGCCACGCCCCTGCCGTGGCTCTGCCTCGCGCCGTGGCCCGCGCGGCCTG-------GTGACTAGA-GGGCCCCGGGCCACTCCGGGCAGGA----T---GCACCGTCCAGCCT-GCGCC-TGGCT--CCCCATGAGGGAGGAGGGGCC-------GGGGCTGCTGG--------GAAGGCCCCGGAACGGGTGGAGCACA-----------GGGTGCGGCAGGAGTGTCCA------------GGCC---G------T--GCCTGGCACCGAGCC------GGTGGTGGTGACG-TGCTGTTTCCAGTGTGTCTGACCAGGTGGTGTCGGGCGGG--AGGTGTCCAGGCAGAAGAGATCAAAG---------------------------------- 6 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-150971_151120 88.6% 39.1% -------------------------------------------------------------------------------------TAAAGTAGGGAATGGGGGG-GTGGAGA------CAGC---AAGTCCCCCACGCATCACTTGTGT--C--CCTTGGCACCCTGGGT-A--AGCCCCGCCCCCCTGCATGAGCCCTGAGGACACACCCTACTG----------ACTGGGGAAAGGGAGCTGAGGCCCCAGGGAA---CAGATCGGA-ATTG-GGGTGGGGTGCCAGAGGAGCAAGGAAGGCCCCCACCCCCGGG--GCAGAGCTGGGAAAG------CG-CAGCAGACGACTGTGCCACCAGCAAC-------AGGCCTTGCCCCTCTGGGCTTGCCC--------------------CGGAGCCCCCTCAGGTC-CAG-CACT--GCCCTT--CCCTGGGGGATGGGCTGGGTCTGCTGGTGGCTCTGTGGGGCGGA----TCCTGCA-CGGTGTCCAGGCCAGCTGGCATCCTGTGCTCACCCGTGACGGGGTA----------------------TCCTGGGCTGGCTGGGCAGAGCTGT-----CTGCGTGGCTGCATGCCGGGTGACGGTGGGTCTGGCTACA------------G--CGCCCCCACCCTTCCCACCCCCCAGGCCAGTGCATCTCTCCTCAGTTAGGCCTGGATTTACAGCTGCTCATCTTTGGG----TAACTGCGCATTTCAG-GGTGTTTAAAGAGCTGCGAAGCGTGGCAGCCCCGGCGGGCTCCAGCGC-GT-GGTGATCCGGCTTCTAGTGCCTCTCCCTGGCCGAGGCATCACCACTGCA------CC--AGAGGGAGCGGGCTGGCTCAGCCGGGAGCT---T--AGCATGAGTG-TCCCTCCCTGGGGCATCTGGGGCTCGCCCTCC-GGCAGCCTGGTGACCGG---------AAGGCCCCTTGGTGCAGGGGTATG-------CCTATGGGAGTGTCTGTGGGGTGTCCACGGTCACAGACAGGGGTGCATGTGCTGTGT-CTGCTCTGGCT--GAAGCCCTTCTCTAA--------------------CG----------GGGACCCCAGGCGGGCACCCAGCTGCA--TG---T--GTTTGACAGAGACCAGTCCCCAC--CCAGGGTGCA-----------A--GGTATGGGTGGAGCA-----TGCAGAGTGCAGCATGCAGGGTGCAGCTGAGCCTGAGCTC---CGGTCG------------------TCTGTGGA-----GGGGGCAGCAGGT------------------------ 7 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-198035_198143 87.2% 38.7% ------------------------------------------------------------------------------------------------------AG-ATGGCCAATCCCACCAT------------GAGTCACTCCTCTGTCCC--CCCGGGGAAGTGTCATGAACATTGTTCCCTCTGTATGTGAGCTCTGCAAC-ACGA--------GGCCCTCTTCCTGTGGGACCAAACCGGAGGCTC-TGGGGGGCAGAAGCTGG----GTGGGCATGGAAGGGGA--------------CCCCCACCTGCTGT--GCTGGGACAACTC------------CAGTGGTGCTGCTGCAGGTCAGTGGGTGCCTGTGCTCCCTCAGCTGGGGACCCTGCCCCTGCCCCCTTCCCCCTCCCAGATAGGCCCAAACTGG-GAC-CTTC--TCCACT--GAGGACAGGGTCTAATGGGTCTAATGGCAGCTCTGTCCATGGGGAGGATCCTCAGAGGCTGTCCAGGCCACTTTGCTTCCTGTGCTTGCCCTGGGGTGGGCT-------------------------ATGTCCTGG-------GGCAGG------AG-GGGCGCAGGCCAGGGCCTTCTGCTGCCT--CTGCCTGGCATGTGCTGG---GTGTCAGTTGCTGCTTCTCATTGGCCAGCACGTGCTTCTCCTCAGTTAAGCCCAGATTTACAGTGGCTCGTCATTCGCTGAAACCACAGCGTTTCAGGAGATGTTTAAAGAGCTGTGAAGCGTGTCAGCCTCGAATGGGTCTGCACACACCACGAATAAGCTCCGG--GGCCTCCCCTGGCGCGC---TGCAGAATCATCAATATATCTGGAAGAAAACAGGCTGAAGCCTGGGGAGAAT---------GAGACAAGTGTCTCTAAAGGCAGT-CTGGCTGTGACGTCCCGAGCACCTCTTGTCATCA------TGAATCTGCGT--------------------------------CAGCTCTGGGTCAGCGCAGCCAGG------------TGGGAAAGTCCCCTAACCTGACT--TCCCATGAGGACGAGGAGGGG-------ACAGGGCACAC------ATCTGGGCTGTAGTGCTGAGAGAGGGCCCCTGA---A--CGGACCAGAACACAGGACAGCCGGCAGAAGCTCCCAGCCCTGTCTCC--AGGACGGAAAGGGCCCTATCTGGCATAGAGCCTGCAGCCAGCACCACGGTCCCTCTCCCA-TCACGTCTGACGAGGTG---CGCC---------------------------------------------------- 8 Callorhinus_ursinus-NW_020313076.1-196763_196951 84.3% 30.1% ----------------------------------------CCCA-CCAAACCCGTCCCCGGATTTCTGGGTGGGGAGGACACAGAGGCCCTACAGCTCTGGCGTGTGAGCAGGTGGCAGTATGTCCAGTGTGGTGGACACGATGTGAAGTCCCTGCTTTCCCTTGACCAAGCGATATCTGGGCATGCACCCGGGAGCTTGGGGACACAGACAACGG-CCGCTT--GAACCTGGGAGGGACCCA--GCACC-CCCCTGCC-CGACATCCAGAG-----GGGC--------------CAGGACGGGACCTGCTTGAACA--GAGGGGGCCGG----------CT-GGGCC--GGGCCCTGCCCCCTGTGCT---------CTGTCCAGGGCATGGGTGCTCC-----------TCCGCCTGCTGTCCTGCCTGCC-----CCACCCCACCCTGCGGA--GC-----------TCTCTAGGGTCACCAGGCTGTGGGGGCGGGACAGGAGTGGCCCAGT-G-CAGC-CCTCCGCTGCCCAC--AGTCTCCTTGAG---------------GGTG---GTCGGAGCTCGGGTCCGTGCTGTAACCCCTGC----CAAGCTTGGGTGTGTGGGCGTT--GGGGG-G---GGGCGGC-AGCAGATTCTGGCTGAGGCTGCCGCTGCTTCTCCA----------------------------------------------------------GGGTGCGCGGCGTTTCGGGCGGTGTTTACAGAGCTGCGAAGCGTGTCGGCCCCGACTGGCTCCAGACACACCACGCACACGGCTCCCAGCGCCTCTGCCAGTGTGCCGTGGAACCATCAAT---AAACTAGGAGGGAGACGGGGCGGTGTTGCTGGGCTGG-GGAAGAGAAAGAGAAACACTTCTGAGA-GCAATTGGACTGTAGCTGATGCTGAGC-ACCCCTGTTGCTGCTGACCTGGGCCTCAGGCTTCGGGCCGGCTC------CTTCTGTGCTG---------ACTAGCAAGGTGTGA----G-CAGAGCGGCCCCAGGGCGGACACCGGAGCTGCAGAGCTGACCATCATGTGT--------CCCCCTGTTGGGCACAGTGGGGCCCAGCTTGAGCTCCAGGGTCCAGGCTGCAA--GCCTGGCAGTCCAGGCTGGGCCGGGGTTGGCGG-----------GG---AGGTGTGGACGTGCA-GGGGTGCGC-----------------CCACGGGTGTGTGTGGA-----CGGGGC------------------------------------------------------------------- 9 Equus_asinus-NC_052181.1-197531_197673 83.6% 29.0% ------------------------------------ACCCTGGG-CCCAGCAA--------GTTTCTCTGTGGGAGAG-GGCAGGGGGCGTGCGGTGTGGCAGGAGTGGCTACCTGGAGGGGAAGAAGCGGATGGGCAAGGAAGGGCACCCT-----------CACCTGCAGCGGTAGGTACAACTCCAGAGGGCGCTGGTGATGGCCAAGGTCAG-GCCTGG--TCCTCTGCGGAG---------GACC-CAGCCCCC-CAGCCCCCGGTG-----TGGC--------------CGGGGCTGGAGCTTG------------------------------GT-CAGGC--AGGGCCTGTGGGCGCCGCT---------CTGTACGAGCTGTGCCTGCTCC-----------TCCGCCTGCCATCCAGGCCGCC-----TCCCACGTGGAGCCCCC--T-----------------GCGGGCTCTGAGCTGTGTCCCGACGGCGGGAGGGGCCCACT---GGGGGCCTCCACTGCCCAC--A-GCCCCCCGAG---------------GGTG---GTTGGAGTTCCAGTCGGAGTGGTCTGCCTTGC----CAAGCTCGGGGTGCACGGGGAC--ATGCAGA---GGGTGAC-AGTGGACT---CTGGCCATGGCCACAGACACTTCA------GGACCCTGGGCCAGTGTGCGCCTGCCTTGGTTGTGCCCAGTTTTATAGGCGCTTTTGTGCGGCGTTTCAGGCGATGTTTAAAGAGCTGTGAAGCGTGTTGGCCTCAACTAGCTCTGAGCTCCGTGAACACAGCTCC--CAGCGCCTCTGCCAG-CAGCCGCGGAATCTTTAAT---AAATTAGGAGGAAAG-CAGCTGGTGTTGCTGAGGCCGGAGA---GACAGAGAAACATCTCTAAAAGCACTTTGGGACTTAGACGGTCCTGAGC-GCCAGGGTCACTGCGGATCTGCGATTCTCTGGCGGCCT-----------------------GCCAACCGGATGTGCATG-TGGAG----G-GTCAGCAGGCCACTCGGCTGCTCTGGGG--------------GAGGGCAGACCCAGGCTGGAGGCAGGAGCCGGAGGGGTGCCCGTCCCGACTCCCCACGAGGGCAGAGGAGGGGAGCGGGGCGCAGATGTGGGCCAAGAGGCTCCT-----------GG---AGCCAGGAGCGGGCA-GGGCCAGGGGAGTGGCTGGAGCTCGGGCAGCTGCC----CAGA-----GCCTCCA------------------------------------------------------------------ 10 Mirounga_angustirostris-NW_025578519.1-196732_196862 83.3% 29.9% ----GCAGTGG------------------GGTCACGCACATGCA-CCCAACAT--GCCTCTCTGTCCCCTTGGCTGGGGGCCCGAGGCCGTGGTTCCCCACCCC-CCGGGAGGT-----------CCCTGTGTGGGAGAGGGCAGGTGGCTCAGAGTGCAGTCAGACGGGCAAGGAGGGGACCCTGGTCTGCAGTGCTGGTGCTGGCCAAGGACAG-GCCTGA--TTCTCTGGGAGGAACCCA--GCACC-CCCCTCCC-CGATATCCGGAG-----GGGC--------------CAGGACGGGACCTGCTTGAACA--GAAGGGGCCAG----------C--GGGCC--GTGCCCTGCCCCCTGTGCT---------CTGTCCAGGGCATGGGTGCTCC-----------GCAGCCTGCCGTCCTGCCCGCC-----CCACCCCGCCCTTCAGA--GC-----------TCTCTAGGGTCACCAGGCTGTGGGGGGTGGGCAGGAGTGGCCCAGT-G-CAGC-CCTCCGCTGCCCAC--AGCCTCCCTGAG---------------GGTG---GTCGGAGCTCGGGCCTGGGCTGTACCCCCTGC----CAAGCTCGGGCGTGTGGGCGTT--GGGGG-----GGGCGGC-AGCGGATTCTGGCTGAGGCTGCCGCTGCTTCTTTA----------------------------------------------------------GGGCGCG-TGCGTTTTGGGCGGTGTTTACAGAGCTGCGAAGCGTGTTGGCCCCGACTGGCTCCAGACACACCACGCACACGGCTCCCAGGGCCTCCGCCAGTGTGCCGTGGAACCATCAAT---AAATTAGGAGGGAGACGGGCGGTTGTTGCTGGGCTGG-GGAAGAGGAAGAGAAACACTTCTGAGA-GCAGCTGGACCGTAGCTGATGCTGAGC-ACCTCTGTTGCTGCCGACCTGGGCCTCGGGCTTCGGGCTGGCTC------CTTCTGTGCTG---------ACTAGCAGGGCGTGA----G-CAGAGCGGCCCCAGGGCGGACACCGGAGCTGCAGAGCTGACCATCATGTGT--------TCCCCCGTCGGGCACAGTGGGGCCCGGCTTGAGCTCCGGGGTCCAGGCTGCGA--GGCCGGTGGTCCAGGCCGGGCCATGGTTGGCAG-----------GG---AGCTGCAGATGTGCA-GGGGTGCGC-----------------CCACAGGTGTGTGCGGA-----TGCGT-------------------------------------------------------------------- 11 Microcebus_murinus-NC_033661.1-183384_183510 89.4% 35.8% ------------------------------------------------------------------------------------------------------------ACGATCCAGGCAAA-GGGGGGTGTCTCGGGGGCCGTGGAAAGGA--CCCACCAAGCGTCACTCACGCCCCTGCCCTCTGCGTGTGAGCCTTGAGGACACGAGG-CCCC----------GCTCTG---GGGACCCTGAGGCGC-A--------GGAAGGGGCATCTGGGGGAAGCAGCCAGTTG-TGCAAAGAAGGGCCCCCCCTGCAGT--GCCCGAGACAGGT--------C--TCGC-----------------------------------CGCTGCTGGGGACCCCACCC---------TACCCC----CTGGGGACTGTGCACTG-TGA-CCAT--CCCTGT--AAGCGG-GGGCGGCTGGGGTCAGCTGGGGGCTCTGACCCCGGAGTGGACACGGCACTGCCATCAGGGCCGCCTGGCCCTGTGCTCGCCCGCGACGGCAT---GTCCTGGGGGAGGAGGGGCCTGGCCAGGGCCCTCTGGGTCTGGCTGGCTCTTCTGCATGGATGC--CCAGGATGGCGGCAGGGC--CTGGCCACACGGGGTGGGCC-GTGTCGGCTGCCACGCCTCCTGTGCCAGCACGCACCGCTCCTCAGTCATGCCTGGATTTGTACCGTGTTTCCCCGAAAATAAGACAGGGCCTTATATT-TATTTTTCATCAAGAAGACACCCTA--GGGCTTATTTTCAGAGGAT------GTGTTATTTTTTTTAAGTACGGTACAACGATCTACACTTATTCAAATAC----------AGTTAAGTCGTCTTC-TTCT--GGAACATC---G--T-CATCAC---TCTCCAAACCCCGAATTCC-ATCCTGAATTTCTTGCGACTCTATTTCCTT---------TAGAACCATCGGCCCCCATCTCTCCTGT-CGAGCACTAGA-GCTCTCACGGGGCAGGTGAGAAGGG----C---TGCTCGTCTTTCCC-GCTC--TGCGA--CGACATG--CACGGGTTGTGC-------AGATGCGCTGC--------GTAGCCACGCCCATTACCGGGTCTTATTTTC---A--GGGTGGGGCTTCTATTGCGC-----AAATGCTTAGA---A------A--TCCTGCTGGGGCTTA------TTTTATGGGTAGGTCTTAGTTTCAAGGAAA-C----TCGGTAGTGGCT--TGTG--GCTCTCGGAGACTGTGGAGATTCG------------------------------------ 12 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-182744_182878 81.5% 32.2% CATAGCCCTGGCAGGTCTGAGAGCCTTTGGGGATGGGCGGGAGGGCCAAGCCAATCCCCAGGCTGGGGCAGGGAATTCAGCTGGCTTCAGAGCTCACTGGGTAG-GTGTGGTCTAGCCAAAG-AGGGGACAGCTGGGGGTGTTGTGGAATGA--CCTACCAGGAGTCACTCATGCCTCTGCCCTCTGTATGTGAGCCTGGAGGAACATGAG-CCCC----------ACTCTG---GAGTCCCTGAGGCCT-GGGATGGCAGGAGTAAGTGTGGGAAGGAAGCAGCCAGGTG-CATAAGGAAGGGGCCCTCACCCACA--TTGGGGCTGCACA-------------------------------------------------------------------------------------------------------CTC-TGA-CCCT--CCCCAA--GAGCATGGACTGGTTGGGATCTGCTGGTGGCTGG-GCCAGGAAGTGGACCTTCCCCTGCTGTCCAGGCCACCTTGCCCTTGGCCCACCCCATGATGGGTGTGTCCCACAGTCC----------------------------------------------------------------CTCTGTGGT--CTAGCC----------ATGCAGTGTGGGCTGCCAGGCCTCCC-CAGCCAGCACAGCTCCTCCTCAGTTATGCCTGGGTTTATAGTTGCCCATGACTGTCAGAGACTGTGGCATTTGGGG-GGCCTTTAGAGAGCTGTGGAGCATGTCAGCCTCAACTGGCCCTGAGCACACTGTGAATGTGGCTTCCAGTGCCTGCCTCTGCCTAGTGCTCTGTGGGGGAG-----------AGGAAATCGGGTTGTCACTGTTGGAGGTT---G--G-AGGGACAAGTGTCTCCAGAAGCAATCTGGGACCCAGGTCACCCCTGCCTCTCTCTCTCTTTTGTTTTGTAGCGACAGAGTCTCACTTTATTGCC-----TTCGGTAGA-GTGCTGTGGCGTCACATAGCTCACA--------GCAACCTCCAACTCCCGGGCTTAGGT--GATTCTCTTGCCTCAGCCTTC-------CGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCACGACAACGCCCGGCTATTT---TT---T--TGTTGCAGTTTGGCTGGGGC-----CGGGTTTGAAA---C------C--GCCAC-----CCTTG------GTATATGGGGCCGATGCCTTACCCACTGAACCA---CAGGTGCTGCCCACC----------------------------------------------------------------- 13 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-250743_251038 85.7% 38.9% 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14 Orycteropus_afer-NW_006921723.1-180628_180811 85.1% 27.2% 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