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 1 Target                                              100.0% 100.0%    -------------------------GCACTCGGCACAGCTGACACCGCAGGAGAGCTCGAGGAACATGCCCTGTGCAGGTGGCTCTTGCAGGGCCC-------G-AGCTGAGAGGCGTTCCTTTATTTTTA------TCCCAAGGTGTCTAGGTGGGGGAGAGTGGCC--ATC------TGTGGCTCTGCTGGGCAGCCAGCTGGGCCTG-TGCAAAAC-CTGGAGATGCAT------------------------------------------------------------------CTGCGGGTCCAG--GAGA-----------GTGGTCCCCTGCAGACCTCAGGTCTGAG--------------------CGGCTGCTGGGGGT-TCTGTGCTCAGGGAAGGCTTCCTGCAGGAGGAGGAGGGGC-TCAGGCACAGCCACGAAGGTTGGGGGAGGAGCGGGAATCC-CCC-CTGATGAGA-TGCACTC---CTTGCCTGGTG----TGGACACACAC-CCCAGAAGGGTCTCAGAGTCTTTG-GTAC-AGGCGAG-GG-------------------GCGGAGCTGATCCCA----AGGCCAGGC---CGGGACGCGTTCAGCCCTGGAGCTCACGGAGGG-CGTGGCCCAGGTAAAGGGGGTGTCTGTGCACTGGGGGTCGTGGGGATGGCAAATCCCACTGAGGGACACTTGTGCCTCTCTGTC---CCCC----TGGGGTAGCCGGTGTCCCCTCTGCCCATG------------------AACCTTGAGGACGTGAGACCTCTACTCACGAG-------------TCCCTGAGGCCCGGGGGCAGCAGGAATGGGTATCTTGGGGAGAGAAG-CCGGTGGG-TAAGGAGGGGCCCCACCC------------CCAGAAAGCTGAGC--ACAACCCGGT-GAGTGCTTGTGCAGCCAACAG-CCT-T------G--CCCCG--------T---GAGGACCCT-TCCC-----------TGAGCACCCCCTCGGGGCCCAGAACCCAGCCTCCCTGACAGAGGCAG---G-GCTGGGGGGCC---T--GCTGCTGGCTGAGACCCTCCACCACC----------------ATCCAGGCC---CC-----CTCAC--CTGGGCC-TTCTG-----------CTGCCTGC-AG-------------CCCCTTG-----GAGCATAGTTGGGTCTTGCTGTCT--------CCTCTGTTTGGGAGTCCCAGGGGTGACA-A----CGGGTCTGG--------------CCGTGCAGTACGGGC---TGTGTCTGGCCGTC-CGTCTCCTGGGTCAGCGCGTGCCTCTCCTCG-------------------------------------------------------------------------     
 2 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-197496_198444     94.6%  75.5%    TTGCGTTTCCGCCCACGGCCTGAGTGCACTCGGCACAGCTGACACCGAAGGAGAGCTCCAGGAACACGCCCTGTGCAGGTGGCTCTCGG--GTCCC-------G-AGCCGACAGGCACTCCTTTATTTTTA------TCCCGAGGTGTCTGGGTGGGGAGGATG-GCC--ATC------T-GTGGCTCCCTGGGCAGCCAGCTGGACCTG-TGAAAAAC-CTGGAAAGGCAT------------------------------------------------------------------CTTCAGGTCCAG--GAGA-----------GTGGTCCCCTGTGGACCTCACGTCTGAG--------------------CGGCTGCTGGGGGCGCCTGTGCTCAGGGAAGGCTTCACGCGGGAGGAGGAGGGGC-TCAGGCACAGCCACTAAGGCTGGAGGAGGATTGGAGGTCCGGCC-CTGGTAAGA-TGTACTC---CTTGCCGGGTG----GGGACACACA---CCAGAAGAGTCCCAGAGCCTTTG-GCAC-AGGAGAG-GG-------------------TGGGGCCG-ATCCCC----AGGCCAGGC-----CGGAACATTCAGCCCTGGAGCTCAGTGGGGG-CAAGGCCCAGGTAAAGGGG--GTGTCTGCATTGGGGGTTGTGGGGATGGCACACCCCACCGACGGACACTTGTGCCTCTCTGTC---CCCC----TGGGCTAGGCAGTGTCCCCTCTGTCCGTG------------------AACCTTGAGGACACGAGGCTCTTCTC-ATGGG-------------CCCCTGAGG-CCAGGGGCAGCAGGAATGGGTATCCAGGGGAGAGAAGCCGGATAGG-TAAGGAGGGGACCCACCC------------GCAGAGATCTGGGC--ACAGCCCAGT-GAGTGCTTATGCTACCAACAG-CCT-C------G--CCCCA--------T---GGGGACCCT-CTC----------------------------------------------CCTACAGAGGCAG---G-GCTGGGGGGCC---T--GCTGCTGGCTGAGACCCTCTGCCCCC----------------ATCCAGGCC---CC-----CTCCCTTCCTGGCC-TTCTG-----------CTGCCCGC-AG-------------CCCCTGG-----GAGCATGGTTGGGTGTCGCTGCCC--------CCTGTGTGGG----AGTCCGGGGTGACA-G----CAGGTCTGG--------------CTGTGTAGTACGTG-----CTGTCTGGCCGTC-CGTCTCCTGGGTCAGCACATCCCTCTCCTTGGTCACG-CCTGGATTGACAGTCGCT------------------------------------------------     
 3 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-196967_197132        87.2%  46.9%    -------------------------GCACTTGGCACAGCTGACACCGCGGGAGAGCTCGAGGAACGCTCTCCGTGCAGGTGGCTCTCGCAAGTCCC-------G-TGCTGACAGCATGCCTTTATTTTTAG------TCCTGAGCTGTCTAGGTGGGGAGAACTTGGTCTATC------TGAGGCTCCCATGGGCAGCCAGGTGGGTCCT-GGACTGAGTGTGGAGCTGCCCTGCCAGGTGGGAGTTGATGTTCAGTCTCTGCTTTCC-TCGACTGCGCAACACCTGGGGTATAC-CTGGGGGAGCACAG--GAGCACA--------GTGCGGCCCCTGGGACCATCTGTCTGAG--------------------C--TGTTGCTAGGGGCTGGTGCTCATGGAAAGCTTCCTGGAGGAGGAGGAGCT----CGGACTGAGCAC-CAAGGTGGAAGGAAGAGCAGGAACTCCCACCTTGATCTGT-AGCACCAGGGCTTTCCCCTGCTGGGTGGTGACACAG-CCCAGACGGGTCTGACAGACCTTTGGGGT-GGGTGAGAGGGGCGTGCATAGTGAAGATGGCTGAGCCACTCCAC----AGGCAGGGTTGGAGGAGCACACTGAACCGCGGGGCTCACTGGTGG-GGTGAACCAGGCAGAGGGGA-GTGTATGTACAAGGGATCCTGGAGATGGCCAATCCCACCATGAGTCACTCCTCTGTCCCCCCGG-GGAAG----TGTCATGAACATTGTTCCCTCTGTATGTG------------------AGCTCTGCAACACGAGGCCCTC---------T----------------------TCCTGTGGGACCAAACCGGAGGCTCTGGGGGGCAGAAGCTGGGTGGG-CATGGAAGGGGACCCCCA------------CCTGCTGTGCTGGG--ACAACTCCAG-TGGTGCTGCTGCAGGTCAGTG-GGT-G-CCTGTGCTCCCTC--------AGCTGGGGACCCTGCCCCTGC---CCCCTTCCCCCTCCCAGATAGGCCCAAACTGGGACCTTCTCCACTGAGGACA---G-GGTCTAATGGG---TCTAATGGCAGCTCTGTCCATGGGGAGGA----------------TCCT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAGAGGCTGTCCA----GGCCACTTT--------------GCTTCCTGTGCTTGC---CCTGGGGTG---GGCTATGTCCTGGGGC-------------------------------------------------------------------------------------------     
 4 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-249987_250483  94.5%  52.8%    ---------------AGGCATTCCTTT-ATTTTTAGACCTGAGATGTCTGGGT-----AGGGAGAACGTGGCCCACCTGAGGCTCTGGCAGGTGGC-------A---------GGTGGGCCTGTGT---CT------TGTGGAGTTGCCTGGCCAGGTGGGAGCTGACG-TCA------TGCCTCTGCTTTCCTCAGCCAAACGCACCTG-GGGCGCAC-CTGGGGGTGCAC------------------------------------------------------------------CGGGGGC-ACAG--GAGAGTAG-------CCTGGCCCCTGGAGATGGTGCATCTGGG--------------------C--AGCTGCTGGGGGCCTGTGATCAGGGAAGTCTTCCTGGAGGAGCAGGAGGGGC-TCAGGCTGAGCCTGCAAGGTGTGGGGAGGAACAGAGAATCCCACCCTGACCTGC-AGCACCAGGCTGTCCCTGCCA----GGCGATGGCAG-CCC-AGAGGGTCCAAGAGCCCTTCAGGAT-AGGCAGGAGG-------------------GTTGAACTGACCCCC----AGCCTGGGGCAGGGGATCTCATCCCGCCACAGAGCTCACTGAGGA-GGTGTCCCAGGCAGAGACAGGAGCATCTGTGTGCGGGTTATGGAGGTGGCGATTCCTACTAT---------GTGTCTCTCTGTCC--CCCC----TGGGCTGAGCATCGTCCCCTTTGCATGGG------------------AAACTTGAGGACAGGAGGTACAACTCGGGGGT-CCTTGTGGGAGAGAACAGGAGGCTGGGGGCAGCAGGAGTGGATATCTAGGGGAAAGAAA-----------------GGGATCCCCAC------------CTGAAGTGCTGGGC--ACAGGTCCAC-TGGGTGCTGGCCAAGGACAGC-CCT-T------G--CCCTC--------TGCAGGGGACCCTACCCT-----------GCAGCTCCCCAGCCAGGCCCAGCACTGGACCTCCCCCATTGAGGATG---G-GTTGGCTGGGC---TCTGCTGGCAGCTCTGTCCA-------------------------TGGCAGGGA---CC-----CTCGCTGCTGTCCA-GGCAT-----------GTGCCCAC-TG-------------CATGGTG-----CACTGTGTCTGCCCACAGCCACCCTGCAGGTGGTCGGCTCGGGGCATGCCAGGGATGGCAGA----GGATTCTGG--------------TCTTGCGGTGCGGGC---TGCGGCTGGCCACCATGTCTCCCAGGCCAGTGCGCGCTCCTCCTT--------------------------------------------------------------------------     
 5 Lemur_catta-NC_059130.1-182800_182948                82.3%  40.1%    ------------AGCG------------CTCGGCACAGCTGATGCCGCCCGAGAGCTTGAGGAAC--GTGTGCGGCAGGCGGCTCTCGCGGGTCCCG------T-GCCGACAGGCGTTCCTTTATTTTTAG------TCCCGAGATGTCTGGGCGAGGAGAATGTGGCCCACC------TGAGGCTCTGGTGGGC--------------T-GTGCTCAGCGTGGAGCTACCCCGCCGGGCGGGAGATCATGTTAATTCTCTGCTCTCC-TCGGCCACGCAAAACCA-GGTGCAC-----CTGGGCATG-G--GAGCGT---------GGCCTGGTCCCTGGGCCTCACGTCTGAG--------------------CTGCTGCT---CGGCCCTG--CTCAGGGAAGGCTTCCTGGA--------GGGGGA-GGAGGAGCTCAGGCCAAAC--------------------CCCACCCTGACCAA--AGCACCAGGCACTCC-TAGGCTGAGGGGTGA--CAG-CCCTGGTTGGTCCGGGGGCCTTTTGGGAC-GGGCAGGAGG-------------------GCTGAGCGGACCCCC----AGGCTGGGGGGGGG------------------GGCTCACTGGGAGGAGTGATCCAGGC-AAAGGGGGCTGTCTGTGGGGGCCGTGG--------AAAGGGCCCACCGAGCGTCACTCACGCCCCTGCCCT------------CTGCATGTG-------------------------------------AGCCTTGAGGACACAAAGCCCTGC-T-------------CTGGG-GTCCCTGAGGCCTGGGACAGTGGGAATGGGTATCTGGGGGCGGCAGC-CAGATACG-CAAAGAAGGGCCCCC-CC------------GCAGTGCCCACGAC---------------AGGCC-TCGCCCCTGCTGG-GGA-C-CCTGCCCCACCCG---GGT---GCTGGAGGCC-GTGCGCT---------GCGACCT----------------------------TCCCTGTGAGCTG-----GGTGGCTGGGA---TCTGCTGGTGGCTCTGACCCTGGGGTGGA----CACGGCACTGCTGTCCGGGGC---GC-----CTTGCCCTGTGCTC-GCCCCATGACAGGCGTGTCCCGGG-GGCAGGAGGGGCCTGGCCGGAGC-----------------CCTCTGGGTCTAGCTGG--CTCTTCAGCACGGACACCCGGGGTGACGGC----AGATTCTCA--------------CCACGCGGGGTGGGCTGCGGTCGGCTGCCATGTC---TCCTGGGCCAGCATGCACCGCTCCTCAGTCCTG-CCTGGATTTATAGT----------------------------------------------------     
 6 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-150214_150377        78.8%  31.9%    ----------------------------------------------------------------------------------------ACAGGCCATGGAGCAC-TCAGTGCAACTGACACCGATCGTTAG------TCCTGTGGTTTCTGGGTGAGGAGGACACAGCCATCT-------GAGGCTGTGCTGGGTGGCCAGGTGGGCCTT-GTGCCGACTGTGGAGCTGCC-------CACTGTGGGAAGCTGACGTCTCTGCCTTCC-TTGGCCAAGCAAAACCTGGGGGTGCA-CCTGGGGACACA-G--GGGAGG---------AGCCTGGCCCTGGGGACCTCAGTCTGAG--------------------CTGCTGCT---GGAGGGTTGTGCTTGGGAAGACTTCCTGGAGAAGGAGGGGCTCA-GGCAGCACCACCAAGGTGG--------------------GGG-------------TGGAGTGGAAAGGCC-CATCCTGATGCTAAGCCCCGCCTCAGGCCAGCGATAGGGACCTTG--------GAAGGAT------------------------------TCCAG----AGCCTCTGGGATGGGTGGGAGCTA-GGG------AGGGCCATGGGGTGTGGCCCAGGT-AAAGTAGGGAATGGGGG-GGTGGAGAC--------AGCAAGTCCCCCACGCATCACTTGTGTCCCTTGGCA------------CCCTGGGTAAGCCCCGCCCCCCTGCATG------------------AGCCCTGAGGACACACCCTACTGACTGGG----------GAAAG-GGAGCTGAGGCCCCAGGGA---ACAGATCGGAATTGGGGTGGGGTGC-CAGAGGAG-CAAGGAAGGCCCCCACCC------------CCGGGGCAGAGCTGGGAAAGCGCAGC-AGACGACTGTGCCACCAGCAACAGG-C-CTTGCCCCTCTGG---GCTTGCCCCGGAGCCCCCTCAGGT--------CCAGCACT----------------------------GCCCTTCCCTGGG---G-GATGGGCTGGG---TCTGCTGGTGGCTCTGTGGGGCGGATCCT----GC-----ACGGTGTCCAGGCC---AG-----CTGGCATCCTGTGC-TCACCCGTGACGGGGTATCC--------------------------------TGGGCTGGCTGGGCAGAGCTGTCTGCGTGG--CTGCATGCCGGG----------------------T----------------------GACGGTGGGTCTGGCTACAGCGCCCCCACCCTTCCCACCCCCCAGGCCAGTGCATCTCTCCTCAGTTAGG-CCTGGATTTACAGCTGCTCATCTTTGGGT-A--ACTGCGCATTTCAGGGTGTTTAAAGAGCTGCGA     
 7 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-184248_184364   84.0%  39.2%    ------------CCAC------------GGGCTGCGGCGCGCTCGGCACAGCTGATGCGAGGAAC--GTGCGCTGCAGGCGGCTCTCGCGGGTCCCG------T-GCCGACAAGCGTTCCTTTATTTTTAG------TCCTGAGATGTCTGGGCGAGGAGAACGTGGCCCACC------TGAGGCTCTGATGGGC-------------TT-GTGCTCAGCGTGGAGCTACCCCGCCAGGCGGGAGAGGATGTTGAGTCTCTGCTCTCC-TCGGCCCGCAAAACCAG-GTGCACC-----TGGGGCCCG-G--GAGCGT---------GGCCTGGTCTCTGGGCCTCCCGCCTGAG--------------------CTGCTGCT---GGGCCTGC--CCAGGGAAG-GCTTCCTGAG----------GGGG-AGGAGGGGTCAGGCCAAAT--------------------CCCACCCTGACCAA--AGCACCAGGCACTCC-CAGGCTGGGTGGTGA--CAG-CCCTGGCTGGTCCGGGAGCCTTAGGGGAC-AGGCAGGAGG-------------------GCTGAGCGGATCTCC----AGGCTGGGGCAGGGGACTTAGCTG-GCCTCAGAGCTCAGTGGGGGGAGTGATCCAGGC-AAAGGGGGGTGTCTGCGGGGGCCATGG--------AAAGGGCCCACCACGCGTCACACACGCCCCTTTCCT------------CTGCATGTG-------------------------------------AGCCTTGAGGACACGAGGCCTCAC-T-------------CTGGG-GTCCCTGAGGCCTGGGGCGGCAGGAGTGGGTATCTGGGGGAAGCAGC-CAGATGTG-CAAAGAAGGGGCCCCCCC------------AGCATGCCCACGAC---------------AGGCC-TTGCCCCTGCTGG-GGA-C-CCTGCCCAACCCC----------CTGGAGGCC-GTGCACT---------GCGACCT----------------------------TCCCTGTGAGCGG---G-GGTGGCTGGGG---TCTGCTGGTGGCTCTGACCCTGGGGTGTA----CC-CGTACTGCCGTCCGGGCC---AC-----CTTGCCCTGCGCTC-ACCCCGAGACGGGCGTGTCCTGAG-GGCGGGAGGGGCCT-GGCAGGGC-----------------CCTCTGGATCTAGCTGG--CTCTTCTGCATGGATGCTCGGGGCGACAGC----GGCTTCTGG--------------CCACGTGGGGTGGGCTGCGGTCGGCCGCCACGGC---TCCTGGGCCAGCACGCGCTGCTCCTCAGTCATG-CCT---------------------------------------------------------------     
 8 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-182109_182185      81.5%  33.9%    ------------------------------------TGCATTTCTG--CCCATGGGCCATGGAGA--GCTTGGCACAGCTAACACCAGCAGAGAGCTTGAGGAA-CACACTCGGCAGGTGTCTCTCACAGG------TCCCAAGATGTCGAGGTGGGGAGAACAAGCCCCACC------TGACGCTCTTGTGGGC-------------TG-TGCTTGGTGGAGTTGCCTGTCG-----GTGGGAGTTGATGTCAA--------------------------------------C-----TCCTGTGGG-A--GAACAG---------GCTGGTCCCTCGCAGGCCTCAGGCTGAG--------------------CTGCTGCT---GGGGGCCCTGCTTGGGGAAGGCTTCCTGTAGGAGGAGGCAGGGA-GGAAGGGCTCAGGCTGAGT--------------------GTCACCCTGACCAA--AGCACCAGGCACTCC-CAGGCTGAGTGGTGACATAG-CCCTGGCAGGTCTGAGAGCCTTTGGGGAT-GGGCGGGAGG-------------------GCCAAGCCAATCCCC----AGGCTGGGGCAGGGAATTCAGCTG-GCTTCAGAGCTCACTGGGTAGGTGTGGTCTAGCCAAAGAGGGGACAGCTGGGGGTGTTGTG--------GAATGACCTACCAGGAGTCACTCATGCCTCTGCCCT------------CTGTATGTG-------------------------------------AGCCTGGAGGAACATGAGCCCCAC-T-------------CTGGA-GTCCCTGAGGCCTGGGATGGCAGGAGTAAGTGTGGGAAGGAAGCAGC-CAGGTGCA-TAAGGAAGGGGCCCTCAC------------CCACATTGGGGCTG---------------CACACTCTGACCCTCCCCA-AGA-G-CATGGACTGGTT-------------------------------------------------------------------------------------------------GGGA---TCTGCTGGTGGCTGG-GCCAGGAAGTGGA----CCTTCCCCTGCTGTCCAGGCC---AC-----CTTGCCCTTGGCCC-ACCCCATGATGGGTGTGTCCCACA-GTCCCTCTGTGGTCTAGCCATGCAGTGTGGGCTGCCAGGCCTCCCCAGCCAGCACAG--CTCCTCCTCAGTTATGCCTGGGTTTATAGT----TGCCCATGACTGTCAGAGACTGTGGCATTTGGGGGGCCTTTAGAGAGCTGTGG--------AGCATGTCAGCCTCAACTGGCCCTGAGCACAC-TGTGAATGTGG-------CTTCCAGTGCCTG--CCTCTGCCTAGTGCTC--TGTGGGGGAGAG---     
 9 Microcebus_murinus-NC_033661.1-182764_182845         78.6%  36.8%    --------------------------------------------------------TGCCGGAAC--GTGCGCTGCGGGCGGCTCTGGCGCGTCCCG------T-GCCGACGGGC-GTCCTTTATTTTTAG------TCCTGAGACGTCTGGGCGAGGAGAACGGGCCCACCT--------------------------------------CGGGCTCTGGTGGAGCTACCCCGCCCGGTGGGGGATCATGTTCAGTCTCTGCTCTCC-TTGGCCACGGAAAAGCAGGTGCACC-----TGGGCCACG-G--GAGCGT---------GGCCTGGTCCCTGGGCCTCTTGTCTGAG--------------------CTGCTGCT---GCCGGGTCGGCGCAGGGAAGGCTTCCTGGA--------GGGGGA-GGAGGGGCTCAGGCCAAAT--------------------CCCACCCTGA--CA--AGCTCCAGGCGCTCC-CAGGCTGAGCAGTGA--CAG-CCCTGGCTGGTCCGGGAGCCTTTGGGGAC-GGGCAGGAGG-------------------GCAGAGTGGATCCCC----AGGCTGGGGCGAGGGACTCAGCTG-GCCTCAGAGTTCACTGGGGGGAACGATCCAGGC-AAAGGGGGGTGTCTCGG-GGGCCGTGG--------AAAGGACCCACCAAGCGTCACTCACGCCCCTGCCCT------------CTGCGTGTG-------------------------------------AGCCTTGAGGACACGAGGCCCCGC-T-------------CTGGG-GACCCTGAGGCGCA--------GGAAGGGGCATCTGGGGGAAGCAGC-CAGTTGTG-CAAAGAAGGGCCCCCCCT------------GCAGTGCCCGAGAC---------------AGGTC-TCGCCGCTGCTGG-GGA-C-CCCACCCTACCCC----------CTGGGGACT-GTGCACT---------GTGACCA----------------------------TCCCTGTAAGCGG---G-GGCGGCTGGGG---TCAGCTGGGGGCTCTGACCCCGGAGTGGA----CACGGCACTGCCATCAGGGCC---GC-----CTGGCCCTGTGCTC-GCCCGCGACGGCAT---GTCCTGG-GGGAGGAGGGGCCTGGCCAGGGC-----------------CCTCTGGGTCTGGCTGG--CTCTTCTGCATGGATGCCCAGGATGGCGGC----AGGGCCTGG--------------CCACACGGGGTGGGC-CGTGTCGGCTGCCACGCC---TCCTGTGCCAGCACGCACCGCTCCTCAGTCATG-CCTGGATTTGTACCGTGTTTCCCCGAAAATAAGACAGGGCCTTATATTT--ATTTTTCATC-----     
10 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-196229_196303     77.7%  27.3%    --------------GGTCC---------CACAGTGCAGCT-GGTGGCACCAGAAATTCGGGGGTCGCTTTCTGTGCAGGTGGCTCCTGCAGGTCCCTT-------GCTGACAGGGGGTCATTTATTTTCAG------TCCCGAGACGTCTAGGTGGGGAGGGCGCAGAGCTTC------TGCAGCTCTGGTGGGTGGGCGGGCG------------------TGGTGCTGCCCAGCC--AGGGAGTCGCCGTGAACTCCCTGCCTTCCCTTGGCCATAAATACCCGGGCGCACCCGGG--------------GTGCACAGGAGGGCAGCCTGGTCCGGGGGACCTCGTGTCTGAGCCGCCTT-------------CTGTGTAAGGGGGAGCGGGCACTCAGGGACGGCTTCCTGGAG--GAGGAGGAG----------------------------CTCAGGTTGAGCTGCCAGGCGTTGGGGT--TGGGGG--AATCAGA---GAAT---CCC-GCTGCCA--C--CAGCAGCACCAGGCCCTCCCCTGCT-GA--GACGTG-----------GGCAGGGGGATGAGGG-A---------------AGTGG-----A--------GCCATGGAAATCTCTGAGGGAGGTCCAGGCAGAGGAGGGAG------CATCTGGGCAGTGG-GGTCACGGACACGCCCCTGACGTGCCTCTCTGTCCCCTCTGCCAGAGAGC--CTGAGGCTACACTCTCCATTCCCTGGGCCCC----AGCGAGGG-----TC-CCTGTGGGAGAGGGCAGGGGGCGTGGAGTG-------CAGCAGGAGTGGCTAT-----------------------CTGGAGGGAAAGAAGCGATGGGC-AAGGAAGGGGACCCCCGC------------CTGCAGTGCTA-GG-CACCGCTCCAG-AGGGCGCTGGTGCTGGCCGAGGGCA-GGCCTGGTCCTCCG-----------CGGGACC---------C-----AGCCCCCCAAGCCCACAGTGTGGCTAGGACTGGACCTTCTTGGTCAGGCGGGGCCTGCTGGGCTTGGCCC-T---------------------------------------------------------------------------------------------------GTGGGCAGCGCTC----T-GTCCGAGGTGT-GGCCGCTTCTCTGCCTGTTGCCCAGG--CT--GCCT----CACCCTGCTGTGCTTCCGTGAG-------CACTGAGCTGTG--TCCCGGG--GGGGCAGGGGCC---CGCTGGGGGGCCTCCATTGCCTACAGGGT----------------GGTCAGAGCTCTGGTCGGAGCT----GTCTCCCCGG-----CCAGGCTC-------------------------     
11 Choloepus_didactylus-NC_051313.1-183034_183125       81.0%  33.9%    -------------------------------------------------------------------GGTGCGTGCAGGTGGCCCCGGGCGGCCCTG-----------GGCTGGTGGCGCCCCGTGTTTAG------TCCTGAGGCTCCCGGCTGAGAACAGCACAGCACCTG------TGCGGCAAGCA--------CACC------TG-CGCCGGGATAGGCAGGTGCCG---------------------------------CCC-AG---AAAGTTGCACCAAGGGGGCAG-CAACGGGGGTGA-C--CAGAAGTGGGGTGCAGCCTGCCCCAAGGGGACGCGTGTCTCAGGGGTTTTTGCATGACAGGGGATGAGGCTGCTGGGGCCTGTGATCAGGGAGGGCTTCCTGGAGGAGGGGATGGGGC-TCAGGCTGAGCTGTGAAGGGGGAGG----AGGGGGTGCCCCCAGACTAG----------------------------------------------------------CAGGG-TTG--------------------------------------GGGTGAAGGCAC----AGCCTGGGGGTGAGCAGGGC--C--AAGTCCAGGGTGACGGGGAG-AGGGTCTCACGGGGTGTGGAGCTCCGAGTGGGGGTCTAGGCAGAGAG-GGGTGTCCGTGCAGCCCCCACATGGGCTCCTGCCTTTCTGCCC-CCTCGGGGTAAGCCCTGCTCTCTCTGAACATG------------------GACTTTGGGGGGTGAGGCCTGTGGTC---------CTGTGGGAGCGTGAGAGGCTCGGGGTGCAGCAGGAGG-----------GGAGGGGGGCCC-------TCTGCCGGGGACCCTGGG------------CCACAGTGGGCA----GCAGCTTCCT-GGGGGGCTGTGCCAGCAAGGGGCCCCGCCATGGCCCGATCGACAGGCGCCCGTGGGCCCCGTGTGCCTGCTGCCCTCGGGGTGATGTTTGAAGGCCCCAGGGTGTGTCAGGAGCCCCTGAGAAGCTGAGGGCCACACGGGGGCTGCTGTGGCTGGAGCTGGAGAGACAGACAG----ACGTCCAAGAATGCGGGATGG---GG-----CTCGCAGCCTGGGC------------------GCCCCG--AG------------------A------GGGCGAGGCTGTGCCTGGGGTGTTG-------GGCAGCTGGAGCGGCCGGTGGGGGAGCAGG----CAGGACGCC--ATCG--------CACCCCAGGGGCAGC---TGT-----------------GAAGGAGCTGGCCGGGCCCCTCCACCTGACGG-GCCGCGTTGGAGCG----GAGCCAG--------AGGCCGCAACATGCTC-----------------     
12 Castor_canadensis-NW_017871110.1-180826_180912       79.3%  34.6%    ---------------------------------------------------------CTTGGCA---CAGCTATGCAGGTGGCTCATTGCAGGTCCCAG----T-CCGTGCACACAGGACTTTATTTTTAG------TTCCCAGACGTTTAGCAGGAGAGTGTGGCCC-------------------------------------------------ACTGTGGGTCCACTC---AACCAGGTGGGGTTGATGTCAGTTCTGCTTTCT-TTGGCCAAGCAATTCCTGGGGAGGGG-CTCTTGGGAACACA--CAGCAGAACAGTCTGACTGGTCCTGGCTGCCCTTGTGTCTGAG--------------------AGGCCACTG--AGGGGCCTGTGCTCAGGAGGGCTCCCTGAAGGAGGAGAGGAGGGCTTGGGCTGAGCCACTCAGGTGGGA-------GGGCAAATGCCCCGCTCTAACTGTGGCACTAGGTTCTTC-CTGCCTG-ACCATGACAAGA--CCCCACAGGGCTCAGGGCCCTTA-GGAC-AGGCGGGAGGGGTGTGCAGAGTGGAGCTAAATAGAGGCAGA-------GGGCCATGGGTAGGGCACTCGTCCAGCCAGGGAGCTCTGGGGCAG---TGGTCTGGGC-ACACA-------------GGGTCGTCACAAAGATGGCAAGTCGCACCTT---------GTGCCCCTCTTTCTGTGGGA----CGGGCTGGGTGCTGGCCCCTCTGCATGTG------------------AACCTTAAGAACATGAGGCTGTACTTGGGGAT-CCCTGTGGAGAGCAGGA--TGCCTGGGGGCAG--CAGGTGGATACCTGGGGGACAGAAG-CC--------------CTGACACACCC------------AGTG-------------------------GGTGCTGACCAGCAGTAGT-CCT-G----GCTCTCCACT------------G-------------------------CTTTCCCTCAGTGAGGCCCAATGCAGGATCTTTCCTGAAGAGGTG---------------GC---TCTGTCTGTGGATGCACTCT-----------------GCAACACTGTCCAGGTC---TT-----ATTGTTTCCCAGCTTACCCTACCACCAAAAGGGGCCCAGGGGTGGTGGGGGCCT-AG-----------CCCTTAGCTGCCCACACGCAGTCTAGAGT-GGCTGGAT-----------TGAGAGGACA------CTGGCCTTCCCGTTGCAAGCT--GTGTCTGGGTGCTACATCTCAGGGCTGTCATG---TACCTCCTTACAACACCAGAATGTGGTCATTTGTG-ACTGTGGTTACGGT----------------------------------------------------     
13 Miniopterus_natalensis-NW_015504651.1-687253_687337  79.6%  27.5%    -------------GGGGTG---------TGGGGTGCAGCT-GGCGCCACCACAAACTCGAG--GATCGCTCCGTGCAGGTGGCTCCCACAGGTCCCTT-------GCTGACAGGTGGCTCTTTATTTCAGG-------CTCAAGATGTCTAGGTGGAGAAAACAGTGC----C------TGAGGCTCCAGTGGGCCGGTGGGCGGGCAGGCAGGCGGGCGGGCAATGTGCCCAGCCA--AGCAAAGCCATGTGAAGTCCCTGCTTTCCCTCAGCCAGGCAGCCCCTGAGGGCACACCTGGGGATGCACCTGGGGGCACGTGTGGGCAGCCTCAC-CCTGGGGCCTTGCGTCTGAGCAGCTTC-------------CTC---GAGGGGGGTTAGGCACTCAGAGAAGGCTCGGAGGAGGAGAGGGGAAG----------------------------CTCAGGCTGAGCTGCTGGGTGCGAGGAC--TTGGGGGGCAGTGGG---AAAT---TCC-AGCCTTG--C--CAGCAGCACCTGCTCC-CTCCTGCT-GG--GA--------------------------TGACC-C---------------AGTAG-----A--------GCCACAGAGCAATGTG----AGGGGGACTCAGGTGGGGTGG------CATCTAGGCCAGTG-GGTTCATGGACATGCCTCGAGGTGCCTGTCTGTCCTGTCTGCTGGAGGGC--CTGAGGCCGTGGACCCCATTTCATGGGTCCC----AGGGGGGC-----CC-C-TGTGGGAA-AGGGCAGGTGTGTGGAGTG-------CAACAGGCATATCTAT-----------------------CTGGAGAGGAAGCAGCAGAAGGGCAAGGAAGGGGACCGCCCC------------ACCCTGTGTGCTGG-CACAGCTCCTG-CGGGTACTGGT-GCCCCCAAGGCCA-GGCCTGGACCTCTG-----------CAGGATA---------C-----CCAGCCCCCAGCTCCCAGAAGGTCCAGGGCTGGGCCTTCTTGGCCAGGAGGGGTCTGGCCCGAGG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTGTGCTC----C-ATCCTAGGTGC-AGACTCTCCTCCGCCTGCCGTCTAAA--CC--GCCTCCCTCCCACCCCCGAGTTCTCTGTGA-------GCACCGGCTGTG--TCCAAGG--CAGGAG--GGAC---CCATGTGGGTCCTCTACTGCCCACAGCCCCCCTGAGGGGGTTGGGGCTTGGGGCTTGGGTTGGTGCT----GTCTC-------------------------------------------     
14 Marmota_monax-NW_025724459.1-182788_182878           83.4%  37.2%    ----------------------------------CGGGGGCAGAGAGTCCACGGGAGCCACGGACTCGCTCTGTGCAGGTGGCTCTCGTGGGTCCCTGC---------ACACAGTCTTGCCTTACGTCTCC------TGCCCAGATGTCGAGGCAGCAG----------------------------------------------------AGTGTGGCCCTCGTGAGGCTCTGCACAGCCGGAGGTTGATGTTACCCTCTGCTCTCC-TTGGCCACGGAGCACCTGGGGGCACC-TGTGGCGACATACA--GCC-------------------CACCTTGGGCCTGGGTGGCA------------------------GCAGTGGTGGGGGCTGTGCTCAGAGAGGACTTCCTGGGGGAGGGGAAGGGGC-TCAGGCTGAGCTCCGAGGTG-GCAG----AAGTGGGGGTCCCACCCTGCAGCGTCGGCTGCAGGCTCCTC-TCTGTCTTGCCATGACACAG--GACAGAGGAGCTGAGACCC-TCAGGGAC-AAGCCAGAGGGA--CATATGGTGGAGCTAGAAGCAGGGGGACATGGGAGGGCCACAGAGGACTCATTCATCCACCCAGGGAGTCCACAGGGGCCGGGTTGGCAG---GCGGGGGGGCACCTGTGGGCACTGTGGTGGAGATGGATGGTCCCGCCATGAGTCACTTGGACCCTCTCTTCT----------CTGGCTGGGCACTGTCCCCTCTGTATGTG---------------AGGACCCTTGGGGACATGAGGCCCTGCTCAGGGGT-CCCTGTGAGAGGGCAG-----------------------------------GGTAGATACCGGGGG-A-ATGGGAGAGGACCCCCAG------------CCCCGGTGCTGGG---GCAACTCCGG-AGGGTGCTGGACAATAACAGG-CCT-C-----AC---CTT--------CTGCTGGGGACCGT-CCCC---------------AGCTCTAGCAAGGTCCAGCACAGGACCCTCCTCATTGAGGGTG---G-GCCCGCCAGGC---ACTGTCTGTAGAATGGCCCCTCGGCGGGT----------------GGCCGGCTG---AG-----CTGTTTCCTGTGGG-GACCTGCGACG-----GGGCCCAG-TGTGGGCTG------TGGCTAGC----TGCCATTGCTCAGGACCACCAGCCACCTCG--CCTTAGTTGTGCCCAGATTGGGGTCACA------TGGGGCTTAGCAGCAGCAGCATTCTGGGTGATGCTTGA----AAAGGC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
15 Neomonachus_schauinslandi-NC_058406.1-195299_195332  77.6%  27.8%    -----------------------------------------------------------------------------------------------CAT-------ACACCCACCCCCCCCCACCAAACCCG------TCCCCGGATTTTTGGGTGGGGAGGACACAGAGCACA------TTTGGCTCGGGTATGTGAGCAGGTGGGCAAC-----------------ATGTCCAGTATGGTGGACACGATGTGAAGTCCCTGCTTTCCCTTGACCAAGCAATATCTGGGCAAGCACCC--GGAAACTTGGGGACACACAGGATGGCCGCTTGGACCTGGGAAACATG--TCTGTGTGATTTT-------------TTGCGTGAGGAGGAGCAGGTACTCAGGGAAGGCTTCCTGGAGGAGGAGGAGG---AAGAGT---AGGAGAAGCAGTAGCAGCTCAGGCTGAGCCACCAGGCATGGAGCT--TGGAGGGGGCGTCAG---GGAA---GGCACCTTGCA--G--CACT--AG-----GCCATCCCTGCT-GG--GACATG-----------GGTAGGGGGACAATGG-G------------GG-GTGCG-----G--------GGCACAGAGCTCTATGAAGGGGGGCTAGGCAGAGGGGGGAG------CATCTGGGCAGTGG-GGTCATGCACATGCACCCAACACGCCTCTCTGTCCCCTTGGCCGGGGGCC--CGAGGCCGCGGTCCCCCACCCCCCGGGAGGT----CC-CTGTG-----TG-G------GAGAGG-----------GCAGGT-------GGCT-CAGAGTGCAGT-----------------------CAGACGGGC----------------AAGGAGGGGACCCTGGT------------CTGCAGTGCTG-GG-CACACTCTA---GTGGTGCTGGTTCTGGCCAAGGACA-GGCCTGATTCTCTG-----------GGAGGAACCCA-GCACC-----CCCCTCCCCGACATCCAGAGGGGCCAGGACGGGACCTGCTTGAACAGAAGGGGCCGGCCGGGCCGTGCCC-TGCCCCCTGTGCTCTGTCCAGGGCATGGGTGCTCCGCAGCCTGCCGTCCTGCCCGCCCCACCCCCCCCTTCAGAGCTCTCTAGGGTCACCAGGCTGTGGGGGGTGGGCAGGAG----T-GGCCC-AGTGT-AG-CCC---------TCCGCTGCCCA--CA--GCCTCCCTGAGGGTGGTCGGAGCTCG----------GGCCTGGGCTGTAACCCCTGCCAAGCTCGGGCGTGT---GGGCGTTGGGGGGGGTGGCAGCGGATTCTGGCTGA--GGCT------------------------------------------------------------------------------     
16 Ursus_arctos-NW_020656172.1-196584_196617            77.6%  27.2%    ------------------------------------------------------------------------------------------TGTGGTCT-------GTGCACACCTGTGCATCCATAACCCG------TCCCCACATTTCTGGGTGGGGAGGACACAGAGCGCC------------TACAGTGGGTGACGAGGTGGGCAGT-----------------ATGTCCAACATGGGGGACATGATGTGAAG-TCCTGCTTTCCCTTGACCAAGCAGTATCTGGGCATGTACCT--GGGAACTTAGTGACATGCAGGATGGCCGCTTGGACCTGGGAGGCTTAGGGTTGTGTGACTTT-------------TTGCATGAGGGGGAGCAGGTACTCAGGGAAGGCTTCCTGGAGGAGGAGGAGGACGAACAGG---AGGAGAAGCAGTAGCAGCTCAGGCTGAGCCACCAGGCATGGAGCT--TGGAGGGGGCATCAG---GCAA---TCCACCCTGTT--C--CCAG--CA-----GCACTAGGCTCT-CT--GCTGCT-----------GGG---------------------------AC-ATGGG-----C--------AGGGGGACATTGGGGTGTTGGGGTCTAGGCAGAGGGGGGAG------CATCTGGGCAGTGG-GGTCATGCACATGCCCCCAACATACCTCTCTGTCCCCTTTGCTGGGGGGC--CCGACGCTGTGGCCCCTACCCTCTGGGAGTT----CC-CCGTG-----TG-G------GAGAGG-----------GCAGGT-------GGCT-CAGAGTGCAGT-----------------------CTGATGGGC----------------AGGGAGGGGACCCCAAT------------CTTCAGTGCTT-GG-CACAACTCTAG-TGGGTGCTGGTGCTGGCCAAGGACA-GGCCTGATTCTCTG-------------GGGGACCCA-GCACC-----TCCCTCCCTGACATCCAGAGGGGCCAGGACTAGACCTCCTTGATCAGAAGGGGCTGGCCAGGCCAGGCCT-TGCAGCCTGCGCTCTGTCCGAGGCGTGGATGGTCCTCCGCCGGCTGTCCTGACCGCCCCACCCCACCCTGCTGAGCTCTCTAGGGTTACCAGGCTGTGTCTAGGGGGCAGGAG----T-GGCCC-AGTGC-GGGCCC---------TCTGTTGCCCA--CA--GCCTCCCTGAGGGTGGCCGGAGCTCA----------GGCCTGAGCTGTAAGCCCTGCCAAGCTCTGGCTTGC---GGGCGTTGGGGGTGACAG---TGGATTCTGGCTGA--GGCTGCAGCTGCTTCTC-----------------------------------------------------------------     
17 Manis_javanica-NW_023436200.1-185480_185512          75.4%  24.2%    --------------------------------------------------GGAAGCTCAAGGGTCCCTCTCCATGCAGATGGC-CCCCCAGGTCATGT-------GCTGATAGCTGGTCACTTATTTCCAG------AGGGCCAGTGTCTC------------------------------------TGGTGGGTGG--------GCAGGCA----GCATGGTGGTCCTGCCTGGCTAAGCAGTGATGATGTGAAGTCCCTGCTTTTCCTAGGCAGGCAA-----------------------AATGTGGGGGCGCTCAGAAGAGTAGCCTGGCCCTGGGGACCTTGTGTCTGAGCAGCCTT-------------CTGCATGGGGGGGAGCAGGTGCTCAGGGAAGGCTTCCTGGAG--GAGGTGGAG----------------------------CTCAGACTGAGCTGCCAGGCATGGGGAT--TTGATGCGGGGAGCA---GGGA---GTCCCACCCCA--C--CAGAGGCACCAGGCCC-TCCCTGCT-GT--GACGTG-----------GGCAGGGGGCCGCCAG-G---------------GGGTG-----G--------AGCTACGGAGT--CTCTGTGGGGTCCAGGCAGAGAGGGGAG------CGTCTAGGCAGCGG-GGTA-TTGGATGTACCTGGACGTGCCTCT--GTCCCCTCTGCCCGAGGGC--CCGAGGCCCCCCTGAGGTCCTTGTGGGATGG----GGCAGGTG-----GG-G------------------------------------------CCGAGGCTGT-----------------------CTGGAGGGGAGGAAGAGGACAGGCCAGGAGGGGACCTGTTTG------------CC----------GC-GC-----------CAGCTGTGGGTGTGGCCGAGCACA-GGCCTGGTCCACTG-----------CTGGG-A---------C-----CTAGACCCCAGATGCCAGCGTGGCCAGGGCTGGACAGTCTTGGTCAGGAGGGGCTTGTGGGCCTGGCCCA-CACCTCTCCTTGGCTGTGCCCCGCCCACTGGCACTTGGT-------------------------ATGCAGCATTGCAGGAGATGTTTAAACAGCTGCGAAGCGGGTCAGCCTC----A-GCTGGCTCTGA-ACACTGAACTCGGCTTCCAGTGTCTC--TG--C----CGGCCCACTGTGGAGTCATCAGTGAATCAGGAAAACAGGCTGGCATTGCTGGGGCACAGGGGGTGAC---ACGTGTACAGGCAACTCAAGCCTTAGCCGCCCTGAGCGCCTTCAGTGTTGTGGGCC--------TGT----GCCTCTCCGC-----GCAGCCCACCAGAGGG--CACAAAGGGCACA--     
18 Cavia_porcellus-NT_176233.1-185086_185157            79.4%  27.5%    -------------------------------------------------------------------------------------------TGCACAACCAGTGCATTTGGAGGCAGACGTTTGCCTTTCCGCCCACGGCCCAGTGTGCTTGGCAGGCACACATAGGCCTGGCTTTGTTTCAGTCCCCAGGCATCCAAGTGGGACAGCAT-GGCCCACCTGAAGCTCTGCCCGGCCAGGTGCATGCTGACGTTAAGTCTCTGCTTTCC-TTGGCTGGGTGACACCTGGCAGGGACAC--------TC----------------------GGGAGCTTGACTGCCTCATGTCTGAG--------------------CAGCTG----------CTGGGGTCTTCCAGGAATAGCAGCAGCAGGAGGAGGGGC-TCAGGCTGGGCCACTGCAGTGGGAGCAGGGCCAGGGAGCCGGGCTGGAC------CACACTGTCCAAGAAGGCCTCGG-GGCCTCGTCATT-CTCACCATTACCTCTGTCTCCCTCGTGCA-GAGCAAAGCTG-------AGGAGGACACGGAGTCCGGGGAG--G----AT-GCCGGGGTCAGC-AGA-------CGCAACAGCCGCCTTCTCATGAGTAGCTTCTCCAAGC-----GCAAGGTCCGGGCCGCTCCTGGGCTGGGTGCTAGTGGGCT---------------CAGGCTC-----------AGATGCCTTGATGGCCCCTTCTGGCCTGG------------------CCAGTGCCTGAGCTCAGACACCTGGGGCT-GCCCCGAGTTGCAGGG---------CCT------------CGGGGGAGCTG------AGTGGCTGGGTGGG-AAAGGCTTGGCAGCC-TA------------TGTG-------------------------ACTGCCAGGAACGCAGAGGGCCC-AGCCAAATGAG-------GGCCCCGCAGGTCACGGC-TCTGT-----CCTCTGGCACAGAAAAAGGGTAGCAAGCTAAAGAAGGTGGCCAGCACGGAGG--AG-GGGGACGAGGA----------CCCGGACTCGCCAGGAAGCCAG----AGCCGAGGGTCAGT---GCCC---TT-----CGAGAGGCAGGGGA---GTC----ACCCTGGGGGCCTGGGGGCGGT---------GGCCCCA-----CGCCCTTCTT-TGCATGCCCCCCTT---GG-GGCCTTCCCCAGACAGCTGTGGGAAGGAA-G----CCAGTGT-------------------CCCAGTGACAGCCACAGAGGGATGTGCAGGT----GGCATGGGCAGCCTGGCGGCTGGACACTGGGA-CAGGGCTGGCGGGT-------C--------------------------------------------     
19 Myotis_davidii-NW_006296809.1-198578_198624          79.1%  23.7%    -----------------CC---------CCAGGTGCAGGG--------------GCTGAAGGTGGCACCTACAGACTCGAGGGCGCCCCATGCCGGGG-------GCTGACAGGC-GGCGTCTA-TTTCAG------TCTCAAGATGCCCAGGGGGAGGA--GACAGTGC--C------TG------AGGTCCAGGGGGCGGCG--------------------GGCAGTGAGCCCAGCCGGGCAGTGGTGTGAGGTCCCTGCCGTTCCTCCGCCGGGCAGCCCCTGGGGGCACCGGG--GGGGCACAGGA---------------GGCAGCGGGCCCTGGG-----------------------------------------GGGATGGGAGGCATTCAGGGAAGGCTTCCTGGAGGAGGGGAGGGG-------------------------AAGCTCAGGCTGAGCCTCCAGGTGTGAGGAT--GGGGGTGGCAGCACC---TGCT---CTCTCCTGCTG--G--GGTGACCGGGT---AGAGCCACAGA-GA--ATCAGG-----------GGGACCCAGGCAGTGA-GTCCCC----CTGTGCTTGTC-----C--------ATCACGGACCCCTTGGCCTCAGGTGCACCCCCAGCCGGACA-CAGATGAGTCAGGAGGGGG-TCCCAGGGCCCGAGCAGAGCTGGACCCGTCTGTCAGCCTCTGGAGGGGGC--CAGGGGCTCCGGACGCT-GGCACAGGCTCCC----AGGAGCGC-----TGGGCCT-------GTGCGTGAGCTTCGGGAGG-------GAAGGGCCAGCTGTGCCTGG-----------GGAGGGGCCTGGCAGGGAGGGGGCCCTGTCA-ACAGTGCGGCTCAGTCCTGTGGAGCCGGGTTCACCGAGGTG-AG-CAGAGCCGCTGTGGGGGGCTGCCCTGGGGGTCACATA-AGCCAGCTTCCCTG-----------AGGGCTG---------T-----CCCCCCCCAGACGGCATTGGTTACGTGGCCGCCACCTGCGAACGGGGCACGTAATGAGTGTCAGGCAGCC-CCCCAGGA--AGG--GGCCAGCCAGCTCACCTGCTACCCCCTCC--CT--CAG----CCCCCTCCTCCAGGAAGGCCGCCTGGCTCCCTGGAGAAGCTGCCTGCCCACCCGCC----T-GCCTG-GTGCT-GGGCTCACCTGTCCCCTGTCTGCCCT--C---CCCCACCCCCCCAGGCTGAGGA---------------GGACGTGGA--------GGCCGGGG---------A---GGACG----------------CTGGGGCCAGCAGAC-----------------------------------------------------------------------------------     
20 Vulpes_vulpes-NW_020356486.1-196319_196348           79.1%  26.3%    -----------------------------------------------------------------------------TGTGCACACCTGAGCACATGT-------GTGCATACACACACCCCCAAAACCCA------TCCCCATAT-GTCCCGTGGGGAG--GACAGAGCACC------CACAGTCCTGGGGGGTGAGCAGGTGGA---------------------------------CAGCATGCCCAGTGAAGTTCCTGC-TTTCCTTGACCAAGCGATATCCAGGCGTGTGCCT--GGGAACCTGGGGACACACAGGATGGTGGCCTGGACCTGAGAAACCTATGTCTGTGTGACTTT-------------TTGCATAAGAGGGAGCAGGGAGTCAGGGAAGGCTTCCTGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGGAGAAGAGGAGAGGCAATAGCAGCTCAGGCCAAACCAACAGACATGGGGCC--TGGAGAGGGCATCAG---GGAA---ATCCACTTTGT--TCCCAGCTGCACTAGGCCCTGCTCTGCT-GG--GATGTG-----------GGTAGGAGGGAAATGG-G---------GGGGGTGTGCA-----G--------GGCACGGAGT-TCTCCGAGGGGGTCTAGGCAGAGGGGGCAG------CGTCTGGGCCGCGG-GGCCTGGCACATGGCCCCAACAGGCCTCTCTGTCCCCTTGGCTGGAGGGC--CCGAGGCCGTGGCCCCCCCACCCCTGGCAAG----TCCCTGTG-----CG-G------GAGAGGGCAAGTGGCTCAGACTG-------CAGTAGGAGTGGCGGT-----------------------CTGGTGGGGAAGGAGCAGGTGC--ACAAGGAAGGGTCCTGGT------------CTGCAGTGCTG-GG-CACAACTCTGG-TGGGTGCC-CGGCTGACCAAGGATG-GGCCTGGTTCCCTG-----------AGGGACC------CAGC-----ACCCCTCCCGACTTCCAGAGTGGTCAGGACTGGACCTTCCTTCCTGGT---------------CTGGTGC-TGCAGCTTATGCCCTGTCCAAGGCGTGGATGCTCCTCCCCCTGCTGTCCTGAGGCCCCC-----ATGCTGCCAAGCTCTCTGTGGTCAACCAGCTGCGTCCAGGGGTCAGGAG----T-GGCCTGG-GGC-GGGCCC---------TCTGCTGTCTC--TG--GTCATCAGGCTGCATCTGGGGGACAGGAG------TGGCCCAATGCGGGCCCCCTGCTGCTCATGGGCTCCC---TGAGGGTGGTTGG----------------------------------------------------------------------------------------------------------     
21 Meles_meles-NC_060066.1-195933_195981                77.7%  27.9%    -----------------------------------------------------------------------------------------CACCCGTGC-------GTAC-ACCCCCACCCTCACCAAACCC------GTCGCAGGTTTCTGGGTGGGGCGGACTCAGAGCACC------TTGGGCCCTGGTGGGTGAGCCGATGGGCAGT-----------------GTGTCTGGTGC-GGTCACACGGCGTGAAGTCCCTGCTTTCCCTCGACCACGCAATGTCTGGGCATGCACCT--GGGGAGTTGGGGAC--ACAGGATGGCCATTTGGACCTGGGAAACTTACCTCTGTGTGATTTT-------------CTGCATGGGGGGGCG---GTCCTCAGGGAGGGCTTCCTGGAGGAGGAGTAGG---AAGAGG---AAGAGCAGGAGAAGCTGCTTAGGCTGAGCGGCCAGGCGTGGCTCT--TGGAGGGGATCGGGG---AACC---ACCCTGTCCCC--A--GCACTAGG-----GCTTCCCCCGCT-GG--GACATG-----------GGTAGGGGGACAATGG-G------------GAGGTGTG-----G--------GGCACAGAGCTCTCTG----AGGGGGGTCTAGGCAGGGGGA------CATCTGGGCAGTGA-GGTCATGCGCAGGCCCCCAGCACACCTCTCTGTCCCCTTTGCTGGGAGGC--CTGCGGCTGCAGCCCCCCATCCCTCGGGAGG----TC-CCGTG-----TG-G------GAGAGG-----------GCAGGT-------GGCT-CGGGTGCCGT------------------------CAGAGGAGTAAG--GAGGGGAC--CCCGGTCGGGACCCCGGT------------CTGCAGTGCTG-GG-CGCAGCTCTA--GTAGGGGCTGCGCTGGCCAAGGACA-GGCCCGATTCTCTG-----------GGAGAGACGCA-GCGCC-----GCCTTCCCCGACATCTAGAGGGGCCGGGACTGGACCTTCTTGATGAGAGGGGGCCGGCTGGGCTGGGCCC-TGCCGTCTGTGCTGTGTCCGAGGCGCAGAAACACCTTCTCCTGCGGTCC-GAGTGCCCCGCTCCACCCTGCTGTGCTCTCTGGGGTCAGTAGGCTGTGCCTGGGGGGCAGGAG----T-GGCCC-AGGGC-GGGTCC---------TTTGCCGCCCA--CA--GCATCCCTGAGGGCGGTGGGAGCTCG----------GGCCCGTGCTGTGACCCAGCCGGGCTCAG-ACGTGT---GGGCGCTGGGGGGGTG-ACGGCGGATTCTG-----------------------------------------------------------------------------------------     
22 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-183602_183743     80.9%  30.1%    ----ATTTCCC---AGGCC---------CTTGGGGAGGC---------GGGGAGACTGGGAGGGGTTTCTTCCTGGCTGTGGCTGTGTCCTGCAAGGACCAGTATTTTTGGAGGCAGGCGTTTGTGTTTCCACCCACGGCCCAGCGTTCTTGGCGGGTGCACACAGGCTTGGCTCTATTTCAGTCC-CAGGCATCCAGGTGGGGCAGCGT-GGCCCACCTGAAGCTCTGCCTAGCCAGGTGGG-GTTGATGTTAAGTCTGTGCTTTCC-TTGGCCAAGCAACACCTGGCAGGGCACCAGGGGACGCT----------------------GTGAGCCTGACTACCTCACGTCTGAG--------------------CAGCTG----------CTGAGGGCTTCTAGGAACAGCAGGAGGAGGAGCAGGGGC-TCAGGCTGGGCCACCGCGGTGGGAGGAGGCCCAGGCCCCCGATGGCAGC------AGCAGGCTGTCCTCTGCCGGCCC------AGGTCAG-CTCAGAAGGGCCCGAGAGCCCTCAGGGAC-AGCCATGTATG-------TGGTGGACACAGGGGTGGGGCTA--A----GGGGATGTGTCCAGC-AGGGATTCAGAGTGGAGAACGCCTGTTCCAGGCTGCCATAGACACAGGAA-GTCCTGTTGAGAGCCCCTCAGGCTCTACCTG---CTGGACA---------------GGGTGTC-----------GA--------------CCCTCTGCATGGG------------------CACCTGGAGGACATGAGACCCCCTTGGGGAGGCTCAGGCAGTAGGGCAG---ATGCCTGGGGAGACAGAGGGCTTCAGCTG------AAGTGCTGGGTGCC-AGGACAGGGCACGCC-CC------------TGGG-------------------------GATCCTGTGAGGACAGAGCAGCA-GCCCTGCTGTGGCTC---TGTCCCTCAGGGTCCCTC-AGTGT-----AGCCTGACTCACCCACCTGCTGGG-----------CTCACCCAGGAC---AG--AC-GGTGGCTCAGG----------GCTGGGAGGGCCAGGCCGCCAG----CTGCCTACAGCCCCGTGGTGG---TC-----AGTGGAGCTGACGC---CTC----TATGTGGATGCCCT---GGGGT---------GGCAGCA-----GGT---------------------T---CT-GGCCTTGCTGTGTGGGTTGTGGGTGGCCA-C----CTGTTCT-------------------T-CAGGGCCATC-----------GTGCACCT----CTCCTTAGG------------------------------------------------------------------------------------------     
23 Myotis_brandtii-NW_005362885.1-1141682_1141727       77.1%  23.7%    -------------------------------------------------------------------CCTACAGACTCGAGGGCGCCCCATGCGGGGG-------GCTGACAGGC-GGCGTCTATTTTCAG------TCTCAAGATGCCCAGGCGGAGGA--GACGGTGC--C------TG------AGGCCCAGGGGGCGGCG--------------------GGCAGTGAGCCCAGCCGGGCAGTGATGTGAGGTCCCTGCCCTTCCTCAGCCAGGCAGCCCCGGGGGGCACCGGG--GGGCAC-AGGA---------------GGCAGCGGGCCCTGGGGCCTTGGTCTGAGCAGCTTC-------------CCCGTGGGGGGAGGGGAGGCATTCAGGGAAGGCTTCCTGGAGGAGGCGAGGGG--------------------------AACTCAGGCTGAGCCCCCAGGTGTGAGGAT--GGGAGGCAGCACCTG---CTCT---GCCCCCTGCCC--C--CGGCCGCTCCTGGGGGAGCCATTTGAGCGTTGCCTG-----------GGGCTGGGGGCAGGCC-CTCCCA----CTGAAGGGTCT-----C--------CTGAGTGACAGGGAGGGACAGGCCGGATC-T---CAGGTCC-AAGCCCATCCTGGGGGGGC-TGCCTAGAGCCCCCCACAGC--------------CTCGTGGGAAAGGGCA--GCTGGGCTCGGAGAAGTATCCTCAGTGACAA----AACAGGGG-----TGGGCTGTCACAGCAGGCATGAGGTGCGGGGGT-------GCCAGCCTG-------------------------GGTCAGTGAGGCTGAGCCCTCGGGGTCC-CTGGGGGGGCAGCGAGCCTTGAAGCAGCAGCGA----------G-CCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNACCTGTCTC-----------AGGGGAG---------C-----CCTGCCCACCCCGTC-TC--AGACC--CCACCGCCCTGCAAGCCCGGT-GGGGAGGGGAGGCAGCTCCCC-GCCAAGGT--GAGGAGGGCCGGCCTCTTGGGTATGTTCAGATGCGGGT--GTGCGTCCCACCCCCGGGTGCAGGGGGCGCTGGCACCCTACAGACTCGAGGGCGCC----CCA----T-GC------GGG-GGGCTGACAGGCGGCGTCTATTTTCA--GT--CTCAAGATGCCCAGGCGGAGGA---------------GACGGTGCC--------TGAGGCCCAGGGGGCGGC---GGGCA----------------GTGAGCCCAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------------NNNNN-------------------------------------------     
24 Suricata_suricatta-NC_043707.1-198657_198687         73.9%  26.2%    ----------------------------------------------------------------------------------------------CCAT-------GCAGACAGGGGATCGCTTATTTTCTG------GGCCCAGATTTCTAGGTGGGGAGGACACAGAGCACC------TGCCGCTCTGGTGGCTGGGCAGGTGGGCAGT-----------------ACGCCCAGTGTGGTGGAGACCGTGTGCAGTCCCTGCTTCCC-TTGACCAGGAAATATCTGAG--CACAACT--AGGGGCTTGTAGAAGTGCAGGATAGCAGCTTGGACCTGCGGAACTTCTGTCTGTGTGACTTT-------------TTGCATGACGGGGAGCAGGGACTCAGGGAAGACTTCCTGGAGGAGGAGGAGGAGGAG---------------------CAGCTCAGGCTGAGCCTCCAGGCGTGGAGCT--TGGAGGGGGCATCAG---AGAG---GCCCCCTCCCC--C--CAGCAGAACTAGGCCCTCCCCTGCT-GG--GACATG-----------GGCATGAGCAGGGAGC-G---------ATGGGGGTGCG-----G--------GGCCCAGAGCTCTGTGAGGGCGGTCTGGGT---------------------------GGGG-GGTCATGCACACGCT-------------------CCCTTTGCTGAGCGGC--CAGAGGCCGTGGCCCCCGCTCCCTGGGAGGC----TG-CTGCG-----AA-G------AGGGCGGTAGGAATTGGCAGGAA-------AAGG-GAGGGCAGGCT-----------------------GGGGGGGAAAAG--CAGAGGGG--CAAGGAGGGGACCCCCAT------------CTTCAGTGCCA-GG-TGCAAGTGCAG-TGGGTGCTGGTGTTGGCCAAGGGCA-GGCCTGATCTGGGC-----------GGG----------ACCC-----AGTTCCCCTGACATCCAGAGTGGCCAGGACTGGATGTTCTTGCCCAGAAGGGGTGAGCAGGGCAGTGCAC-TCCTCTGCCCGCCGTCCC---------------------------------GCTGCCCTGCCCAACCGCGCAGGGCTCTCCGTGTTCACTGGGCTGTGTCCTAGGAGCAGGGG----C-GGTCCAGTGCG-GGGCAC---------TCTGCTCCCCA--CA--GCCTCCTTGAGGGAGGTCAGAGCTCA----------AGCCGGAGCTGTAACCTCTGCCAAGCTTGGGGGTAC---AGGGGTGTGGGCATGCAGTG-TTGCGGGTGTCAGA--GTGTGCAGAGGGGGTGGGTGTGTGGGTGGC----ATGTGGGGGT-----ACAGGGGTGCTGAGTA--TGTGGGGG-------     
25 Jaculus_jaculus-NC_059106.1-181851_181952            80.8%  34.0%    -----------CCCACAGCCCTAGAGAGCTC-----------------AGCGCAGCTGATGCTGGGAGCTGTGTGCAGGTGGCTTACACAGGTCCCGTGCACAC-AGGCTTCTCTTTATATTTAGCTCATA------GACGCAGATGTTCAGGTGGGAG-AGTGTGGCCTACC------TGAGGCTCCAGCCAGC---TAGGTGGGGGTT-GATGCTAGTGCGTATGTTGTATAGGAGCCTGTGCCAAAGTTTGCATGTGTACATTGG-GCTGCTTTCCTTAACCAGTGAGAGGGGCACTTGAGGACA-A--GAGGGC--------AGCCTGGCCCTAGTCACCTCATGTCTGAA--------------------TAGTTGTT---AGAAACTGTGCTCAGGGAGGGCTTCCTGGAGGAGGCTTGGTTGA----------GCCACTTGGGTGGGAGGAGAAGCTAGGAGCCCAACCTTGACAGT--ATTATCAGCCTTTCC-CTTACGGGCCTGGAATATAG-CCCACAAGGGAAC--------GTGGGAAA-A---------------------------------------------------------------G-----------------CTGACTGAGCTATAGGTCGGAGGA-CCAGGG--GGAGCGTTATGGGATGACCCAGGCAGAGAGGAATGCACCATGAGTCACTCCAGCCTTTTTGTGCCCTGGCTGGGCAAGGCACTGATTGTCCCCTCTGCCCATGAACCATGAGATGCTCATGAACCTTGGGAACTCAAGGCTTTACTA-GAACT-TCCTCTGGAAGGGCAGGAGGCCCTAGGGTCAG--CAAGTGAGTACCTGGGG----------------G-GACAGAAGGGGCACCCCC------------TGACAGTGTTGGAT--GCAACCCTAG-AGGGTGCTGGCCAGCAACAGG-CCT-G-----ACCCTCCTC-----------TGTGG------------------------------------TCTTGCTCATAGGACCTTCTCTGCTTAGGATG---G--------TGGC---TAGGGTGGTGGCCCTGTCTTTGCATGGGA----CCCTCTGATGCTGTTCAGGCT---CT-----CTTGTCCTAAGCTC-ATCTCATTATAAG---CTGCTCAT----------------AGTCAATAAGGGTGGCCAGGTTGAGCTGATTCCTATGCATGGTGCTCTTGGGCTGACGGAGTTCTTGTCCTGGG----TGTGGCTGGTGGGCACACA----CCTTT-AGGGCTGGC--------------ATA--------------------CAC----------------------------------------------------------------------------------     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *   .     * .