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 1 Target                                                  100.0% 100.0%    -----------------------------------------------CTTGAA---GGAACCAGG-AGCTGTG----GC----------CGGTGGATCCCGCAGTCCTGCTGTGGGTGGG--A-CAGAGTGGGGAG--C-GTGGGTGGGCCCTA--CAGACCCTCCAC-AGGGTGACAGTGCTGGTGGGCGCCTGTGCT-GGGGACACGGTCTCC-TGGTGCACAGA------GCCTCCTTGCAGACCTCGAAGGAGCCAGGAGCTGTGGC---------CGGCAGATCCCGCAGTCCTGCTG------------CG--GGTGGGGCAGA--------GTGGGGAGCGTGGGTGGGC---CCTACAGACCCTCCACAGGGTGACAGTGCTGGTGGGCGCCCA---TGCTGGGGACACGGTCTCCTGGTGCCTGGAGAGCCCTACCGTGCCCTG-----TGGCACCGGCTCGTTCTGCCTGT----CCCTGCAGGGAC--------CT------------TG-------CTCTTTTCCTAACCCTTG--GGGAGGGTGGGAAGGTGACTTCTCCCTG---------------GCCAAGTGAGGGTGCTGTGTCCCCT----TCCAGGACCAGTATTTTTAGACTCAGGTGTTTGCGTTTCCGCCCACGGGCCTCGG--AGCACTCGGCACAGCTGACACCGCAGGAGAGCTCGAGGAACATGCCCTGTGCAGGTGGCTCTTGCAGGGCCCGAGCTGAGAGGCGTTCCTTTATTTTTATCC-CAAG------GTGTCTAGGTGGGGGAGAGTGGCCATCTGTGG-CTCTGCTGGGCAGCCAGCTGGG-------CCTGTGCAAAACCTGGAGATGCA-TCTGCGGGT-CCAGGAGAG------TGGTCCCCTGCAGACCTCAGGT----------CTGAGCGG----------------------------------------------------------------CTGCTGGGGGT---------TCTGTGC--TCAGGGAAGGCTTCCTGCAGGAGGAGGAGGGGCTCA---------------------GGCACAGCCACGAAGGTTGGGGGAGGAGCGGGAATCCC--CCCTGA-TGAGATGCACTCCTTGC-------CTGGTGTGGACACACACCCCAGAAGGGTCTCAGAGTCTTTGGTACAGGCGAGGGGCGGAGCTGATCCC---------------------AA-GGCCAGGCCGGGAC--GCGTTCAGCCCTGGAGCTCACGGAGGGCGT-GGCCCAGGTAAAGGGGGTGTCTGTGCACT----GGGGGT-CGTGGG--------------------------------------------     
 2 Chlorocebus_sabaeus-NW_023666054.1-216825_217681         99.3%  86.0%    ------------------------------------------GCCCCCCACAC---CCCGCCTGG-AGCTGC-----------------CTGTGGCCAC-GTGGGGAAGCTTCCACGTGA--A-GCGAATGGCCCT--C-AGGGGCTGTCATGG--CAGACACAGTGG-AGTGTGTGTGGGGTGAGAGGTGACAGGCAG-GGCGGGCCGGGTCCT-GTGGTCACAGA------ACCTCCTTGCAGACCTCAAAGGAGCCAGGAGCTGTGGC---------CGGCAGATCCTGCAGTCCTGCTG------------TG--GGTGGGACCGA--------GTGGGGAGCGTGGGTGGGC---CCTAAAGACCCTCCACAGGGTGACAGTGCTGGTGGGCGCCTG---TGCTGGGG--ACAGTCTCCTTGTGCCTGGAGAGCCCTACTGTGCCCTG-----TGGCACTGGCTCGTTCTGCCTGT----CCCTGCAGGGAG--------CT------------TG-------CTGTTTTCCTAACCCTTG--GAGAGGGTGGGAAGGTGACTTCTCC-TG---------------GCCAAGTGGGGGTGCTGTGTCCCCT----TCCAGGACCAGTATTTTTAGACTCAGGTGTTTGCGTTTCCGCCCACGGGCCTCGG--AGCACTTGGCACAGCTGACACCACAGGAGAGCTCGAGGAACATGCCCTGTGCAGGTGGCTCTTGCGGGGCCCGAGCTGAGAGGCATTCCTTTATTTTTATCC-CAAG------GTGTCTAGGTGGGGGAGAGTGGCCATCTGTGG-CTCCGCTGGGCAGCCAGCTGGG-------CCTGTGCAAAACCTGGAGCTGCG-TCTGCAGGT-CCAGGAAAG------TGGTCCCCTGCAGACCTCACAT----------CTGAGCTG----------------------------------------------------------------CTACTGGGGGT---------TCTGTGC--TCAGGGAAGGCTTCCTGCAGGAGGAGGAGGGGCTCA---------------------GGCACAGCCACTAAGGTTGCGGGAGGAGCGGGAATCCCA-CCCTCA-TGAGAGACACTCCCTGC-------TGGGTGCGGACACACACCCCAGAAGGGTCCCAGAGCCTTTAGCACAGGCGAGGGGCGGAGCTGATGCC---------------------AA-GGCCAGGCCGGGAT--GCATTCGGCCCTGGAGCTCACCGGGGGCGT-GGCCCAGGTAAAGGGGGTGTCTGTGCACT----GGGGGT-CGTGGGA-------------------------------------------     
 3 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-117739_118584             97.4%  72.1%    -----------------------------CACGACTGCCCTCCCTGCCTATGC---CCCTCCTGG-AGCTG------------------GTCGTGGCCACGTGGGGAAGTTTCCACGTGG--A-GCGAATGGCCCT--T-GGGGGCTGTCACGG--TAGATGCAGTGG-CGTGTGTGT----------GGGTGAGAGGT-GCCAGGCAGGGTCGG-CAGGTCCCACA------GCCTCCTTGCAGCCCTTGAAGGATCCAGGAGCCATGGC---------TGGCGGGTCCTGCAGTCCTGTAG------------TG--GGTGGGGCTGA--------GTGGGGAACGTGGGTGGGC---CCTGAAGACCCTCCACGGGGAGACAGTGCTGCCGGGCGCCAG---TGCTGGGT----ACTCTCCTGGTACCTGGAGCGCCCTACTGTGCCCTG-----TGGTGCCAGCTGACTCTGCCTGT----CCCCACAGGGAC--------CT------------TG-------CTGTTTTCCTAACCCTCA--GGGAGGGTGGGAAGGTGACTTCTCCCGG---------------GCCAGGTGGGGGTGCCATGTCCCCTTCCTTCCAGGACCAGTATTTTTAGACCCGGGTGTTTGCATTTCCGCCCA-CGGCCTGAG--TGCACTCGGCACAGCTGATACCGAAGGAGAGCTCGAGGAACAT--GCCCTGTGCAGGTGGCTCTCGGGTCCCGAGCCGACAGGCGTGCCTTTATTTTTATCC-CGAG------GTGTCTGGGTGGGGAGAAT-GGCCATCTGTG--GCTCCCCGGGCAGCCAGCTAGA-------CTGGTACAAAACCTGGAAATGCA-TCTTCGGGT-CCAGGAGAG------CGGTCCCCTGTGGACCTCACGT----------CTGAGCGG----------------------------------------------------------------CTGCTGGGGGG---------CCTGTGCCCAGCAGGAAGGCTTCCCGTGGGAGGAGGAGGGGCTCT---------------------GGCACAGCCACTGAGGCTGGGGGAGGATCGGAGGTCCCG-CCCTGG-TGAGATGTACTCCCTGC-------CGGGTGGACACACACACAACAGAAGAGTCCCAGAGCCTTTGGCACAGGCGAGGGCGGGGCCGATCCCC---------------------A--GGCCAGGC--CGGA--ACATTCAGCCCTGGAGCTCACTGGGGGCGA-GGCCCAGGTAAAGGGGGTGTCTGCGTTGG----GGGTCG-TGGGGAT-------------------------------------------     
 4 Callithrix_jacchus-NC_048389.1-197123_197920             92.8%  62.9%    CTGGGAGCTTC-----CCAGCTGGGGGGACACGACTGCCCTCCCTTCCTATGC---CCTGCCTGG-AGCTG------------------GTCATGGCCACGTGGGGAAGTTTCCACGTGG--A-GCGAATGGCCCT--T-GGGGGCTGTCACGG--CAGACGCAGTGG-TGTGTGTGT----------GGGTGAGAGGT-GCCAGGCAGGGTCGG-CAGGTCCCACA------GCCTCCTTGTAGCCCTTGAAGGAGCCAGGAGCTGTGGC---------TGGCGGGTCCTGCAGTCCTGCGG------------GG--GGTGGGGCTGG--------GTGGGGAATGTGGGTGGGC---CCTGAAGACCCTCCCCAGGGGGACAGTGCTGTGGGGCGCCAG---TGCTGGGG----ACTCTCCTGGTACCTGGAGCACCCTACTGTGCCCTG-----TGGTGCCGGCCGACTCTGCCTGT----CCTAA--------------------------------------------------TGCTCA--GGGAGGGTGGGAAGGTGACTCCTCCTGG---------------GCCA-GGTGGGGTGCCATGTCCCCTTCCTTCCAGGACCAGTATTTTTAGACCT-GGTGTTTGTGTTTCCACCCA-CGGCCTGAG--TGCACTCGGCACAGCTGACACTGAGGAGAG-CTCGAGGAACATGCCTGTGCAGGTGGTGGCTCTCGGGTCCCAAGCCGACAGGCGTTCCTTTATTTTTATCC-TGAG------GTGTCTGGGTGGGGAGAAT-GGCCATCTGTG--GCTCCCTGGGCAGCCAGCTGGA-------CCTGTGCAAAACCTGGAAATGCA-TCTTCAGGT-CCAGGAGAG------CGATCCCCTGTGGACCTCAGTC----------TGAGTGGC---------------------------------------------------------------------------------------------TCAGGGAAGCCTTCCTGCAGGAGGATGAGGGGCTCA---------------------GGCATAGCCACTAAGGCTGAGGGAGGATTGGAGGTCCCA-CCCTGG-TGAGATGGGACCTGCCG-------GGTG----GGGACACACACCAGAAGAATCTCAGAGCCTGTGGCACAAGAGAGGGCGGGGCTGATACCC---------------------A--GGCCAGGC--CGGA--ACATTCAGCCCTGGAGCTCACTGGGGGCGA-GGCCCTGGTAAAGGGGGTGTCTGTGTTGG----GGGTCA-TGGGGATGGCACACCCCAC--CGAGGGACACTT-----------------     
 5 Lemur_catta-NC_059130.1-182530_182948                    86.7%  41.1%    --------------------------TGGGGCGTGTGGCCA------CCCTCCCGGCCCACACGT-G----------------------CTCGCGGCCGCGTGGAGAGGCCTCCACGCAGAGACGCCAGCCG--------GCAGGGCGGCGACA--CACGCG--CAGT-GACGTGTGTCT--------GGGTCAGGGGC-GCCGGGCAGGGCGGG-GCCAGCGCCTGG-T-G-CCTGCCTGGGGCGAGGACGGGCACTTCTGCTGTGTGGCCCG--AGCTGTG--CTGTGGTGGGC-------------AGGGAGCT--GGCCTGGGGCC--------AGTGGGCATGTGGGTGGGC---CCTGCAGACCCCGGCCT-CAGGTGAGCC--A--------------CCAGCAGGGCTCTGTCTCCTAGC-GCCGGGGAGCCCTGCAGTGCCCCG-----CGGCACCGCTCACCCCACGCCCT---TCCCT-----GCA--------GA----------CCTC-----GCTGTTTGCCGCACGCTTGA--GGGTGGGTGGGAAGGTGTCTTCTCCCTGGCAGGGGGA----------------GGGGGGAGCCGTGTCCCCCTCTGGGACCAGTATTTTTAGATGCCAATGTTTGTGTCTCCGCCCACGGGCCACGG--AGCGCTCGGCACAGCTGATGCCGCCCGAGAGCTTGAGGAACGT--GTGCGGCAGGCGGCTCTCGCGGGTCCCGTGCCGACAGGCGTTCCTTTATTTTTAGTCCCGAG------ATGTCTGGGCGAGGAGAATGTGGCCCACCTGAGGCTCTGGTGGGCT-GTGCTC------------------AGCGTGGAGCTACC-CCGCCGGGC-GGGAGATCATG---TTAATTCTCTGCTCTCCTCGGCCACGCAA-AACCAGGTGCA---------------CCTGGGC-ATG-GGAGCGTGGCCTGGTCCCT--GGGCCTCACGTCTGAGCTGCTGCTCGG----------CCC--TGCTCAGGGAAGGCTTCCTGGAGGGGG--------AGGA-------------GGAGCTCAGGCCAAACCCCAC-CCTGACCAAAGCACCAGGCACTCC------------------------------TAGGCTGAGGGGTG--ACAGCCCTGGTTGGTCCGGGGGCCTTTTGGGACGGGCAGGAGGGCTGAGCGGACC--CC-----------------CA-GGCTGGGGGGGGGGGCTCACTGGGA-----------------GGAG-TGATCCAGGCAAAGGGGGCTGTCTG--TG----GGGG-C-CGTGGAAA------------------------------------------     
 6 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-184017_184364       86.7%  41.4%    ------------------------------GCGTGTGGCCA------CCTTCCCAGCCCATGAGT-G----------------------CTCATGGCCACATGGGGTGGTATCCACGTGGAGACACCAGCCG--------GCAGGGCTGCAGCG--CACATG--CGGT-GACGTGTGTAT--------GGGTGAGGGGT-GCCGGGCAGGGCCGG-CAGGGCCAGCTC-T-T-GGTGCCTCCCTGGGGGACGGGCACTTCCGCCGAGTGGCCAG--AGCTGGC--GATCCCTTGGTGCTGTGGTGGACAGGGCAAGT--GGCCTGGAGCCAGG-----TGGGGGCGTGTGGGTGGGC---CCCGCAGACGCCGGCCT-CAGGAGAGCCGTG--------------CCGGCAGGGCACTGTCTCCTAGTGCCCGGGGAGCCCTGCTGTGCCTCG-----CGGCACTGCTCCCTCCATGCCCG---TCCCT-----GCA--------GA----------CCTT-----GCTGTTTCCCGAACCCTTGA--GGGTGGGTGGGACGGTGTCTTCTCCCTGGCAGCGGG---------------GAGGGGGGAGCTGTGTCCCCCTCCGGGACCAGTATTTTTAGATGCCAATGTTTGTGTTTCCACCCACGGGCTGCGG--CGCGCTCGGCACAGCTGATGCGAG-------------GAACGT--GCGCTGCAGGCGGCTCTCGCGGGTCCCGTGCCGACAAGCGTTCCTTTATTTTTAGTCCTGAG------ATGTCTGGGCGAGGAGAACGTGGCCCACCTGAGGCTCTGATGGGCTTGTGCTC------------------AGCGTGGAGCTACC-CCGCCAGGC-GGGAGAGGATG---TTGAGTCTCTGCTCTCCTCGGC-CCGCAA-AACCAGGTGCA---------------CCTGGGGCCCG-GGAGCGTGGCCTGGTCTCT--GGGCCTCCCGCCTGAGCTGCTGCTGGG-------------CCTGCCCAGGGAAGGCTTCCTGAGGGGGA--------GGAG---------------GGGTCAGGCCAAATCCCAC-CCTGACCAAAGCACCAGGCACTCC------------------------------CAGGCTGGGTGGTG--ACAGCCCTGGCTGGTCCGGGAGCCTTAGGGGACAGGCAGGAGGGCTGAGCGGATC--TC-----------------CA-GGCTGGGGCAGGGGACTTAGCTGGCCTCAGAGCTCAGTGGGGGGAG-TGATCCAGGCAAAGGGGGGTGTC-------------------------------------------------------------------     
 7 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-196865_197132            87.4%  44.6%    CAGATAG-------------------------------------------------CCTCATAGG-GACTGTG----GG----------CAGCA--------------GCTCCAACACAC--A-GAGAAGTGTGTTTTTGGGGGTATGTCAGTGGTCAGACCCAGCAA-TCAGGGCGCCTCCTTGG--AGGAGGGGACT-GC-AAAACTGGAAGG-ACAGGCATATT------GGCTGAGTGACCCA---AGCAAAGGAAAGAACTATGGCAGG--A-CCTAGCAAATCCTGCCGAGGCTTGGTGTGTGAGGCAGCT--GCCCTGGGTGCAG------AGTGGGGGTGTGGGCTGGC---CCTGCAGACTCCATCCTCCCGCAGTGTGAGCAA------------GGC-----------TGGAGGGCCCCAGGGTGGGGACAGCCATGTCCTG-----AGGCACCAGCTGAATCCATACCCTATTCTTTACATAGAC--------CT----------TACCATTTTCCAGCCCTTGTTGGGGGCTG--GAGGAAGCAGGAAGGTGTCTCTTCC-TG---------------ACTGGGGTGAGGGTTGGGCTGTGCTCCCCACCAAGACCCGTATTTTTAGAAGCCAGTGTTTGTGTTTCTGCCCA-CGGGCTCAG--AGCACTTGGCACAGCTGACACCGCGGGAGAGCTCGAGGAACGCTCTCCGTGCAGGTGGCTCTCGCAAGTCCCGTGCTGACAGCATGC-CTTTATTTTTAGTCCTGAG------CTGTCTAGGTGGGGAGAACTTGGTCTATCTGAGGCTCCCATGGGCAGCCAGGTGG-----GTCCTGGACTGAGTGTGGAGCTGCC-CTGCCAGGT-GGGAGTTGATG---TTCAGTCTCTGCTTTCCTCGACTGCGCAA-CACCTGGGGTATACCTGGGG-GAGC---------ACA-GGAGCACAGTGCGG-CCCCTGGGACCATCTGTCTGAGCTGTTGCTAGG---------GGCTGGTGCTCATGGAAAGCTTCCTGGAGGAGGAGGAGCTC---G---------------------GACTGAGCACC-AAGGTGGAAGGAAGAGCAGGAACTCCCACCTTGA-TCTGTAGCACCAGGGCTTTCCCCTGCTGGGTGGTGACACAGCCCAGACGGGTCTGACAGACCTTTGGGGTGGGTGAGAGGGGCGTGCATAGT----------------------------------------------------GAAGATGGCTGAGC-----------------------------------------------------------------------------------------------     
 8 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-249578_249911      85.4%  40.7%    ---------AA-----ATGGCTGGAGTGC---CAGGGCCCTGGCAGGAGCTGACAGACCTGTTGT-GGCTGTG----GT----------AGGTGGGCAGCAGGCCTC-AGTGCCTGGTGCCCA-GCCAGTGCACCC--TGCCCGGAGCTGCTCA--CAGCCTCATGGA-GAAGTAT---------------------------CCGCCAGGCCGA-GGGGTCGGAGT------GCCTCCTTGGAGGGGGAAGCAAACCTTGAAGGATGGAC-----A-CATGGGCCAAATGGCTGGAGTGCCA------------GG--GCCCTGGCAGGAG------CTGACAGACCTGTTGTGGC---TGTGGTAGGTGGGCAGCAGGCCTCAGTGCCTGGTGGGGTGTG---TGG-------GGATGGCCACATCCCCATGGCAACCCTGCCGTGCCCTG-----TGGCACTGGCTCACTCCCTGCTG--CTCCCCGCATGACC--------TT----------GGCG-------ATGATTTTCCCAGCTCGT--GGGGAGGGTGGAAGGTGGCTTCTCCCTG---------------ATGGAGTGAGGGT----------------GCCGGGAACAGTGTTTCTAGATGC--AGGTATTTGTTTCCGCCCACAGGGCACAG--GGCACTCGGCACAGCTGATGACACAGGAGACTTGGTGAATGC---TCTGTGCACGTGGCTCT-TGTGGTCCCGTGCTGAAAGGCATTCCTTTATTTTTAGACCTGAG------ATGTCTGGGTAGGGAGAACGTGGCCCACCTGAGGCTCTGGCAGGTGGCAGGTGGG-------CCTGTGT--CTTGTGGAGTTGCC-TGGCCAGGT-GGGAGCTGACG---TCATGCCTCTGCTTTCCTCAGCCAAAC-G-CACCTGGGGCGCACCTGGGG-GTGCACCGGGGGCACA-GGAGAGTAGCCTGGCCCCTGGAGATGGTGCATCTGGGCAGCTGCTGGG---------GGCCTGTGATCAGGGAAGTCTTCCTGGAGGAGCAGGAGGGGCTCA---------------------GGCTGAGCCTGCAAGGTGTGGGGAGGAACAGAGAATCCCACCCTGA-CCTGCAGCACCAGGCTG-------TCC-------------------------------------C---------------------------------------------------TGCCAG------GC--GATGGCAGCCCAGAGGGTCCAAGAGCC---------------------CTTCAGGATAGG----CAGGAG-GGTTGAACTGACCCCCAG---CCTGGGGCAGG------------------     
 9 Microcebus_murinus-NC_033661.1-182267_182845             85.3%  39.7%    -------------------------------------------------------GCCCACGAAT-G----------------------CTCTCAGCCCCATGGGGAGATCTCCATACAGCGGGACCAGCCG--------GCAGGGCTGCGATG--CACACG--TGAT-GACATGTGTGT--------AGGTGAGGGGT-GCCGGGCAGGGCCGG-TGGGGCCAGCGC-T-T-GGTCCCTCCCTGGAGGGCCAGCACTTCCGCGAGGCGGCCCA--AGCTGGC--GAGTCCCTCGGTGCTGTGGCGGGTGGGGCGCT--GGCCTGGGGCCAGG-----TGG-GGCGTGTGGGTGGGC---CCTGCA--GACCCGGCC-ACGGTGAGCTGTG--------------CCGGCCGGGCACTGTCTCCTGGCGCCTGGGGAGCCCTGCTGTGCCCGC-----AGCCCCGCCC-----------GC---TCCAC-----GGA--------GA----------CCTT-----GCTGTCTCCCGA-CCCTCAG--GGGAGGGTGGGAAGGTGTCTTCTCCCTGGCGGGGGGTGGGGTGGGGGTGGAGCTGTGTGCCCTCCCCACCCCCCCGGGACCAGTATTTTTAGATGCCAATGTTTGTGTTTCCGCCCACGGGCCAGGG--AGCGCTCGGCACAGCTGATGCCGG--------------AACGT--GCGCTGCGGGCGGCTCTGGCGCGTCCCGTGCCGACGGGCG-TCCTTTATTTTTAGTCCTGAG------ACGTCTGGGCGAGGAGAACGGGCCCACCTCGGG------------------CT------------------CTGGTGGAGCTACC-CCGCCCGGT-GGGGGATCATG---TTCAGTCTCTGCTCTCCTTGGCCACGGAA-AAGCAGGTGCA---------------CCTGGGCCACG-GGAGCGTGGCCTGGTCCCT--GGGCCTCTTGTCTGAGCTGCTGCTGCC----------GGGTCGGCGCAGGGAAGGCTTCCTGGAGGGGG--------AGGA---------------GGGGCTCAGGCCAAATCCC-ACCCTGACAAGCTCCAGGCGCTCC------------------------------CAGGCTGAGCAGTG--ACAGCCCTGGCTGGTCCGGGAGCCTTTGGGGACGGGCAGGAGGGCAGAGTGGATC--CC-----------------CA-GGCTGGGGCGAGGGACTCAGCTGGCCTCAGAGTTCACTGGGGGGAA-CGATCCAGGCAAAGGGGGGTGTCTC--GG----GGGC-C-GTGGAAAGGACCCACCAAG--CGTCACT----------------------     
10 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-150214_150377            82.5%  29.8%    --------------------------------------------TGGGGACGCTATCTCCTGTGT-----------------------------------CTGGAGAGCCCTGCCGCAC-----CCCATGGC--------ACTGACTGGCTTCACCCACTCCCTGTGCGGACCTAGTTAT--------TTTTCCC--------AGCTTTGGGGGAGGCTGGGAAGGT----G-GCTTCCCCTGGAATGG-GGAGCTGTGTCCTTTCCAGATCA----GTATTTTAATTAATTTATTTTTTTTAGTTGGGGTCTCATTCTGTCACCCAGGCTG---------GAGTGCAGTAGTGC-----GATCACAGCTCACTGCA---GCATCGACCTCCTGGGCTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCACAACA-------CCACGCCTAGCTAATTTTTTGTTTTGTAGAGATGACA-------TCT--------CGCTATGTTGCCCAGGATCATCTCGAACTCC--TGGGCTCAATGATCTTGCCTCG-GCCTCCCAA----AGAGCTGGGATTATAGGCAGGAACCACTGTGCCTGGCTGGGGACCAGTATTTTTAGATGGGAGTGTTTGTGTTCCTGCCCACAGGCCATGG--AGCACTCAGTGCAACTGACACCGATCGTTAGTCCTGTG---------------------------------------------------------------------------GTTTCTGGGTGAGGAGGACACAGCCATCTGAG-GCTGTGCTGGGTGGCCAGGTG-----GGCCTTGTGCCGACTGTGGAGCTGCC-CACTGTG---GGAAGC--------TGACGTCTCTGCCTTCCTTGGCCAAGCAA-AACCTGGGGGT------------GCACCTGGGGACACAGGGGAGGAGCCTGG--CCCTGGGGACCTCAGTCTGAGCTGCTGCTGGA---------GGGTTGTG-CTTGGGAAGACTTCCTGGAGAAGGAGGGGCT---CA---------------------GGCAGCACCACCAAGGTGGGGGTGGAGT-GGAAAGGCCCATCCTGATGCTAAGCCCCGCCTCAG-------GCCA-GCGATA-GGGACCTTGGAAGGATTCCAGAGCCTCTGGGATGGGTGGGAGCTAGGGAGGGCCATGGGGTGTGGCCCAGGTAAAGTAGGGAATGGGGGGGTGGAGACAGCAAGTCCCCCACGCA------------------------TCACTTGTGTC----------------------------------------------CCTTGGCACCCTGGGTAAG--     
11 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-181817_182006          83.9%  35.1%    -------------------GTCACAGTCCAGGCTCTGCAGG-----ACACAGGAATTGAGCCAGT-C----------------------CTTGGGGTTCTCTGGCAGGCCTATGACTGCCCCTCTCTACCCA--------GAACTGCTCACAGC--CACGTGGGGAGG-TCTTTGCGTGT--------GTGTGAGGGGT-GCCGGCTAGGGCTGG-CTGGCCCTGAGCTT-G-GGTTCCTCCTTATTGGTCAGGCACTTCTGCTGAGTGGCCAG--AAACTGGCAAATTGCTTGGTACTGTGATGGCCAGTGCAGGT--GGCCTAGGGCCAGG-----TGGGGCA-T-GGGATAGGC---CTTGCAGACATTGTCCACAGGGGGAGCTGTA--------------CTGGCAGGGCATTGCATTCCT--------------------------------GGCACCCGCTTGCTCCATGCCCT---TCTCTGCCTGGAC--------CT----------GCCA-----TGTCTTGAACCCTGTCCCCA--AGGTGGCTGGGAAGGTGTCTTCTCCCGGCAGTAGGGAGT------------GGGGAGCTGTGTCTTGCTCTGGGGCCAGCCAGTATTTTTAGATGCCAACATTTGCATTTCTGCCCATGGGCCATGG--AGAGCTTGGCACAGCTAACACCAGCAGAGAGCTTGAGGAACAC--ACTCGGCAGGTGTCTCTCACAGGTCCCAAGATGTCG--------------------------------------AGGTGGGGAGAACAAGCCCCACCTGACGCTCTTGTGGGCTGTGCTTG------------------GTGGAGTTGCCTGT------CGGT-GGGAGTTGATG---TCAACTCCT---------GTGG-GAGAAC-AGGC-------------------------------------------TGGTCCCTCG--CAGGCCTCAGGCTGAGCTGCTGCTGGG----------GGCCCTGCTTGGGGAAGGCTTCCTGTAGGAGGAGGCAGGGAGGA-------------AGGGCTCAGGCTGAGTGTCAC-CCTGACCAAAGCACCAGGCACTCC------------------------------CAGGCTGAGTGGTGACATAGCCCTGGCAGGTCTGAGAGCCTTTGGGGATGGGCGGGAGGGCCAAGCCAATC--CC-----------------CA-GGCTGGGGCAGGGAATTCAGCTGGCTTCAGAGCTCACTGGGTAGGT-GTGGTCTAGCCAAAGAGGGGACAGCTGGG----GGTG-T-TGTGGAATGACCTACCAGG--AGTCACTCATGCCTCTGCC----------     
12 Jaculus_jaculus-NC_059106.1-181749_181952                77.2%  28.7%    ---AGGTCTCA-----GGAGTGACAGGGAGGGAACAGCA------GTATCTCAGAGCCCAGCTGGGGTCTGCTCCT-CCCCCCTGGAAGCTG--TTCATAGATGCATAGGAAGTATCCACACGGGAGAACAGCCAT----CAGGGCAGTGCTGA--CCTGCA--TGAT-GAAGTGTG---------------------------TGTGGTGGAGGGTGGGCATCAGG--T-A-GGCTCAGCCAGGCTGTACAGTCAGTGTGCCTCTTCAGCAGGGGCAGCAAACCAAGTCTGAAGGATTGGGTGAACTTCAGCAGAG-TGGCCCAAACAAAGGAGG-----CACATAGCT---------------------GTCCTAGATGGACAGCTGGCCTTGC---------AGCTGGGC--AGGATATGCGCA--GGGGGAGAAGGCTGGGGTG--------------------------------------GATTCCAGGGT-CTGGAATTC-C------AGCTCACTTCTTGCCATTTCCCAGGCCCCCA--GGGAGGACAGAA------------------------AGGGGATTTCTCTAGGCTGGAGCTGTGCTCTCCCCTGCTGGGACCAGTATTTTTAGAGGCGGGTGTTTGTGTTTCCACCCACAGCCCTAGA--GAGCTCAGCGCAGC-TGATGCTGGGAGC-----------------TGTGTGCAGGTGGCTTACACAGGTCCCGTGCACACAGGCTTCTCTTTATATTTAGCTCATAGACGCAGATGTTCAGGTGGGAGAGTGTGGCCTACCTGAGGCTCCAGCCAGCTAGGTGGGGGTTGATGCTAGTGCGTATGTTGTATAGGAGCC-TGTGCCA---AAGTTTGCATGTGTACATTGGGCTGCTTTCCTTAACCAGT-------GAGAGGGG-CACTTGAG-GACA-------------AGAGGGCAGC-CTGGCCCTAGTCACCTCATGTCTGAATAGTTGT-TAG---------AAACTGTGCTCA-----------GGGAGGGCTTCCTGGAGG-------------------AGGCTTGGTTGAGCCACTTGGGTGGGAGGAGAAGCTAGGAGCCCAACCTTGACAGTATTATCAGCCTTTC----CCTT--------------------------------------------------------------------------------------------------ACGGGCCTGGAATATAGCCCACAAGGGAACGTGGGAAAA---------GCTGACTGAGCTATAGGTCGG----AGGACCAGGGGG----AGCGTTATGG--GATGAC--CCAGGCAGA------------     
13 Castor_canadensis-NW_017871110.1-180482_180616           86.0%  31.6%    --------------------------------------------------------CCCTGCCTGGAGCTGCTCAC-AA-----------------CAGCATGGGAAA--ATATCTACACAGAGAGAATGGCCATC----AGGGACTGTCATGG--CGGACA--TGAT-GAAGTGCT---CTTGGGATGCGTGCGTGCATGCCGTGTGTGTGTGTGTGGTGTGCCAG--C-A-GGGTCAGCCAGGCTGAGTGGACTGTGCCTCTTTGGAGGGGC--------AACAGCCTTGAAGGATGGGTTTAT---CAGCCAAG-TGGCCTGAATAGAGGAGTTGAGTCGTGCAGCAGCTGACA---AATGGTGGCTGTGGTGGGACAGGCAGCTGGCCTTGG---------AGCTGGGC--AGATCATCTGTA--GGGTGAATAGGCTGGAGTGTCTCC-----CAGTGCCTGAAAAGCCCACTGTGCC-----------------CCTGCTG-T------CAGCCCATTCTTGCTGTTTTCCAGGCTCTCT--GGAGAGTGGAAA------------------------GGGGGCTCTTCCCAGTTTGGGGCTG---TGCCCCCTGCCAGGACCAGTATTTTTAGAGATAGG--TTTGTGTTCCCACCCACAGCCCTGGA--GTGCTTGGCACAGC-TATGCAG-GTGGC-----------------TCATTGCAGGTC--------CCAGTCCGTGCACACAGGACTTTATTTTTAGTTCCCAGAC----------GTTT-AGCAGGAGAGTGTGGCCCA-CTGTGGGTCCACTCAACCAGGTGGGGTTGATGTCAGTTCTGCTTTCTTTGGCCAAGCA-ATTCCTGGGGAGGGGCTCTTGGGAACACACAGCAG---------AACAGT-------CTGAC-----------------------------------------TGGTCCTGGCTGCCCTTGTGTCTGAGAGGCCACTGAG--------GGGCCTGTGCTCA-GGAGGGCTCCCTGAAGGAGGAGAGG-AG-------------------GGCTTGGGCTGAGCCACTCAGGTGGGAGGGCAAATGCCC-----CGCTCTAACTGTGGCACTAGGTTCTT----CCTGCCTGACCATGA-CAAGACCCCACAGGGCTCAGGGCCCTTAGGACAGGCGGGAGGGGTGTGCAGAGTG--GAGCTAAATAGA-----GG-CAGAGGGCCATGGGTAGGGCACTCGTCCAGCCAGGGAGCTCTGGGGCAGTGGTCTGGGCACACAGGGTCGTCAC-----------------------------------------------------------------     
14 Ictidomys_tridecemlineatus-NW_024405058.1-182540_182744  88.8%  36.8%    -------CTTG-----TGAGTGGGATTGA-------------------GCAGGTGGCCCCTGGGG-GACTGTG-----------------------------GCTCCTCTTGGAAGGGAATTTGAGCAATGCCACGTTGGTGAGGGTCCCATGA--GTGACGGGGGG---CATAGTGGGTCTTGGCAGCTGT--------------CCAAGTGGG-CATGGCTCAGC------CCTGCCTGAGCGCTCACAGCTGCGTG---GGGACGGCCA------CCAGCGACCACATGGAAGAGGGACGTGTTTTCAGGAGTT--GGGGTGCCAGG--------CAGGGTGTCCGGGATGGGT---GGTGAGGTGCCTCTTTGGGGGCAGCAGGCCTCGAGGAACAGG---TGATC---------AGCCAAGCTGCCTGAGCACAGAGGCCATGCACTG-----CTGGACAGTCCATGGCAGCTGGGC-AGCTGGGCCCAGAA--------CT----------GGGC------AGGCCTCTGTGGGGACCTG--CAGGCCCTCGGGAGGGGGAAGG----GA---------------GGGCATCCCCTGGCTGGGCTGTGCCCCCTGCCAGGACGAGTATTTTTGGAGGTGGGTGTTTGTGTTCCCGCCCATGGCCCAGAG--TCCACTGCGCGGGAGAGTCC--ACGGGAGC----CGCGGACGCGCTCTGTGCAGGTGGCTCTCGTGGGTCCCTG-CACACAGTCCTGCCTTACGTTTC-CTGCCCAG------ATGTCAAGGCAGCAGAGTGTGGCCCTCGTGAGGCTCTGCACAGCTGGAGGTTGAT-------------------------------------------------------GTCACCCTCTGCTCTCCTTGACCACAGAG-CACCTGGGGCGACATACAGC---------------------------------CCCCCTTGGGCCTGGGTGGCCGCAGT--GGTGG---------GGGCTGTGCTCCGAGAGGACTTCCTGGGGGGGGA---GGGGCTCA---------------------GGCTGAGCTCCGAGGTGGCAGATGGGGG-------TCCCACCCTGC-AACATCGGCTGCAGGCTCTTCTCTGTCTTGCCATGACACAGGACAGAGGAG-CTGAGACCCTCAGGGACAAGCGGGAGGGACATTTGGTGGA---------------------GC-TAGAAGCAGGGGGA--CATGGGAGGGCCACAGAGGACTCATTCACC-CACCCAGGGAGTTCCAGGGGCCGGGTTGG----CAGGCG-GAG----GGCACCTG-----------------------------------     
15 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-196229_196303         82.1%  33.2%    ---------------------------------CCTCGTGGGGG-AGCG---------------------------------CACTGAGCTCTGGGCAGTATCCCCGTGGAGAGAACGGTGTAGGGGC----TGCC----CAGAGCTGGCATGA--CAGAC---GTGA-AGCGTGG---------GGG-----------------------GGGGGGGCAGGCT---------GGGCCAATGATGCTGAGTGGTTGGGGTCCCTCCTGGAGAG---GGGGCAGCAAATCTTGAAGGATGGTTCGTATCAGCCGAGTG--GCCCGAGGGCCAGCAGATCCCATGGGGCTGTGGTGGGCAGGTCAGCTGGCC-CTGGGGCCAGGGAAGGTGCCGTCGG---------CCCTGCAG--ACCCAGT-TTTGCAGGTGAACAGGGCTGGGGGGCAGGTGGTGGAGACGGTGTCTCCCTGTTTTTGGAGAGCTCTGCCCTGCCCCCCTACCCCCCCCCCCACCGCAGGGACCTGTCCACCTTCTGAGCCCTG--GCAGAGGTGGGAAGGTGGCCCCTCCCTGGCCG-------------------GGGC-GCGGGGGGCTGGGCACCCCCAGGACAGTGTTTGTGGATG----TGTTTGTGTCCCGCCCACGGGTC-CCAC--AGTGC-------AGCTGGTGG-CACCAGAAATTCGGGGGTCGCTTTCTGTGCAGGTGGCTCCTGCAGGTCCCTTGCTGACAGGGGGTCATTTATTTTCAGTCCCGAG------ACGTCTAGGTGGGGAGGGCGCAGAGCTTCTGCAGCTCTGGTGGGTGGGCGGGCGT------------------GGTGC----TGC-CCAGCCA---GGGAGTCGCCG---TGAACTCCCTGCCTTCCCTTGGCCATAAATACCCGGGCGCACCCGGG--------------GTGCACAGGAGGGCAGCCTGG-TCCGGGGGACCTCGTGTCTGAGCCGCCTTCTGTGTAAGGGGGAGCGGGCACTCAGGGACGGCTTCCTGGAG--GAGGAGGAGC-TCA---------------------GGTTGAGCTGCCAGGCGTTGGGGTTGGGGG--AATCAGA-GAATCCCGCTGCCACCAGCAGCAC---------------------CAGGCCCTCCC---CTG------CTGAGACGTGGGCAGGGGGATGAGGGAAGTG---------------------------------------------GAGCCATGGAAATCTCTGAGGGAGG---TCCAGGCAGAGGAGGGAG-----CATC------T------G-------------GGC--AGTG-------------------------     
16 Camelus_dromedarius-NC_044523.1-197317_197514            82.2%  31.0%    -----AGCCTAGAGCACGGCTTGGGGCC-----------------AGAGGCCAGGCCCCACCCACCCGGGGAGCCGGGGCAGTCCTGGGCCGCTGTCCTGATGCTCCTGCACGGAGTCCCCCAGGGAAGCTCCGGG----AAGGACCCCCATGG--AGAGA---GTGC-TGTGGGGCTGTCATGGCAGGTGCGAAGC----------GTGGGGGGCCTTGGGCT---------GTGTCAGTGACACTGAGCGGTTGGGGTGCAGCTGGAGGGG----GCTCAGC-------------------------------------------------AAACACTGAAGGGCGGTCA-GGTTAGCTGAGTGGCTGCAGGGGTGGTGGTGGGTGCTGGTTGG---------TCCTGCAG--ACCCCAT-TTTGCAGGTGAGCAGCGCTGGGGAGTGTTG----------------CCCTGTTCTTGGGGGGCCCGGTTGTACCTCTAGTGCGA-----------------CCCCGCCATTGTCCAAGTTCTG--GGGGGCCTGGGAAGGTGGCTTCTCCCTGGCTG-------------------GGTGATTGGGGTGCTGGGTGCCTCCAGGACAGTATTTTTGGATGTGGGTGTTTGTGTCCCACCCATGGGGGCACAA--GGGGT-------AGCTGGCAC-CCCCGGAAATGTGAGGGTGGCTCTCTGT-GTGGTGGGTCCCGCTGGCCCCGTGCCGACAGGCGGTCGGTTATTTTCAGTTCTGAG------CTGGCTAGGCAGGTGAACGCAG-GGTGCCTGTGGCCCTGGCGGGCGGGCGGGCAGCGTGTG-------CGGCGTGGTG----CGG-CCGGCCG---GGGGTGCGACG---TGAGGTCTCTGCTTTCCCCCGGCTCGGGGCATGG---------------------------GCACCCAGGAGGGCAGTCTGG-A-CCCAGGACCTCGTGTCTGTGTGGCCTCCTGTGTGCGGGACAACAGGCGCTCAGGGAAGCCACCAGGTGTGGGAGCTGACTG-GGC---------------------AGCAGGGAACCCC---------------ACCCCATCCCT-GA-CCCCCACAGCATCACCAGCCA---------------------CC-CCTCCACC---CTG------CTGGGACAGGGGCAGAGGGGCAAGGGGGCTG---------------------------------------------GAGCCACGGGGTTCTCTGAGGGGAG---CATCTGGGCAGCAGGTTTGTGGACACA------TC-C-CGA-------------GGC--CATGGCCCCCTGTCC--------------     
17 Choloepus_didactylus-NC_051313.1-183034_183125           83.4%  31.1%    ---------------------------------------------GGCCCAGAGAGGGCGGGCGC-C-----------------------C---------------------CC--------------------------GGGTGATGGCGGGAGTGACAGGCTGGGG-GCCGGC----------------------------AGCCTGTCCCGTGAACGGCCCAGC------AGTGGCTGGGGGAAGATGGGGTGACTGGCCCCATGGGGCAG--CTCAGGCCCCTTCCTC-CGGGGCCACCTGGGGAGCGGAGGTCTCGGCTCTGACCAGGGTGTCCTGAGCTGCCAGGCTGGGA---GCTGCCACCCCCCTGCA---GCCCTGCCACA---------TG---TGGACAGG--GGTCACTCCATCT-----GCCACCACCTCTGCCCCATG-----AGGGAGATTGTGCACACAGTGGGTGCACCAGGCTGGGGTCCTCGTGGCT-------------G------AAGGG-TCGGGCCTCCCTA--GAGGGGCTCCCC----GCCACCCCC-TG-AGCTCCCGGGGAAGGTGGGCAGGACCCCCTCCCTTGGCCTCCTGTCGGGACCAGTATTTTTAGACACGGTTGTGTTTGCTTCTGCCCACGCAGAGGGG--CTGCGGAGGGGCTGGTGCCATGGG---CATGGGGGGGGACGG---TGCGTGCAGGTGGCCCCGGGCGGCCCTGGGCTGGTGG----CGCCCCGTGTTTAGTCCTGAG------GCTCCCGGCTGAGAACAGCACAGCACCTGTGCGGCAAGCACACCTGCGCCGGGAT----AGGCAGGTGCCGCCCAGAAAGTTGCA-CCAAGGGGG-CAGCAACGGGG---GTGACCA-----------GAA------------GTGGGGTG------------CAGCCTGCCCCAAGGGGACGCGTGTCTCAGGGGTTTTTGCATGACAGGGGATGAGGCTGCTGG---------GGCCTGTGATCAGGGAGGGCTTCCTGGAGGAGGGGATGGGGCTCA---------------------GGCTGAGCTGTGAAGGGGGAGGAGGGGG----TGCCCCCAGACTAGCAGGGTTGGGGTGAAGGC---ACAGCCTGGGGGTGAGCAGGGCCAAGTCCAGGGTGACGG-----GGAGAGGGTCTCACGGGGTGTGGAGCTC--CGAGTGGGG--------GTCTAGGCAGAGA-GGGGTGTCCGTGCAGCCCCCACATGGGCT--------------------------CCTGCCTTTCTG----CCCC-C-TCG------------------GGGTAAGCCCTGCTCT-------------     
18 Orycteropus_afer-NW_006921723.1-179060_179194            83.8%  27.6%    --------------------GCAAAAGGAT---------------GAAGCCTCCTGCCCAGGGCCTCCCTGCC----CA-------------------------GTGCCTGCCCTCTGCCGGGAGCCACTCACAGC--C-CTGTGCGGCACTTATCTGCATGGAGAGCAGCCATCGGAG------G--GTCT----------------GGGCAGA-CACAGGGAAGTGT--G-TGTCTGG-GGGACTGGCTGGGCAGTGAGGCCGAGCAC-CCT--AGCACAGCCAGCCCAGAACGTTGGCTC-CC---TGTTCAGT--GGCCTGAGGGGCCAGA---GGTAGCATTGGTGCT---------GCCTAGGGGCAGAGGCAGGCCTGGAGGGGGCACA----TG---GGGTTTGA--CGAGAGG-GTGAGCAGAGTAGAGAGCACAGACGATGGG--GTGGCGT-CTCCCCATTCTT----GGAGAGCTCACCCTACAG-ATGCTTCCT--------------------CACCCCCCGACTTTCCTGC---AGCCC-----------CTCGCT---GCTTTCCAGATTTAGGGGCGAAGCAGTGGCTCCTCCTTGGGTCCCCGCCGGGACTTGTATTTTTAGACACGGTTGTTTTTGTTTCCACCCACGAGCACAGC--ACCATGCTGCACAGCTGATGCCCGGGGA-------ACTCAGACACTCTGTGCAGGTGGCCCCGGCAGGTCCCGTGCT-GCCAGACACTCACTTTTTCTAGTACAGAG------ATGGAGAGGTGGAGTGAAAGCTGGCCACCCGTGCTCTGGGTCACCTG----CTTC--TCTAGGGTGGGTGGTGTGGGAGCCCAGT-CCTGCCGGC-CAGAAGGGAGC---TGA---------TGTAGCTGACATTA----CACCTGGGGTC---CTGGGA------------TGTACATCTGG-CC-TCCTGGAAGCAA--ACCTGGGGGCTCTGG-------GGACACATC---TCAGGGTACTAG----GGCACACCTGGAGGTCCTAGAAGA--TGG--------------TCTCTGGACCTTGGGTCTGAGTGGCCTAGAAGCACCAGGGTGGTGAAGGACCC-AGGCTTGGGGAAGGCCT-------CCT----GGAGGCAGAGAAGGGAGCATTCAGG----CTGAGCTTTGGGGGTGGAAGGCTATAGATGGA---AGG-------------------------CAGGGAATCCCAC----------CCCACCCAGCTGACCC-------------AG---GACCTGCCCTAT---AG--------------------------------------------------------     
19 Chrysochloris_asiatica-NW_006408691.1-179662_179817      82.6%  28.1%    -TG-------------GGTCCCCTGCCGAA---------------GGCACTCTCTGCCTTGGTCCCCTGACTG----AT-------------------------GACTCCCCTGCCGGATGGGAGCCATTCACAGC--T-CCGTGGGCCAATTATCCTCATGGAGACTGGCTGTAAGAG------G--GGGG-------------TCAGGGCAGA-TGTGGGGCCCGCT--G-GG-CAGG-AGATCTGGGGGCCCGCTGGGCAGGAGG---TCA-------AG--CGTGCCTGGGTACGGCTC-TC---CACCGACT--ATCCCAAGCAGCCTCA---GGCAGCATTGGTGCT---------TCCTGAGTGTTGGGGCAGGCGCAGGCCTGGAGT------------------------GGG-GTGGGCAGGGTGGAGGGCACCCATGGAGGG--TAGGGGTGCCTCCCATTCTTGGTTCATAGAGCCCCACTGTAG-GTGCTGGCT--------------------CACCCTGCACACCCCCTGA---AACCTCTTGCCTTTCCAGATTT---TGGTGGGGGTGGGGGTGGGGTAGCAGTGGCTCCTCCCCGTGCCCCTGCTGGGACCTGTATTTTTAGATGCGGTTGTTTTTGTTTCCGCCCACCAGCACAGC--ATCACACTGCACAGCTGACGCCCGGGGA-------TCTTGGTGACACTCTGCAGGTGGCCCCAGCAGGTCCCGTGGT-GCCAGGCGCACACTTATTCTGGTCCCCTG------ACAGAGAGGTGGAGCGAAAGCTGACCACCTGTGCTCCAGAGCACCTG----GCAC--TCTCAGGTGGCCAGAAGATAGCCCATGT-TATACCTGG-GGATCCTAGAA---ACATACCTAGG-GGTCCTAGAGGTGA----CACATAGGGGT---CTTGGG------------TTCAAAGGAAA-GC-AGCTGACTTCTGGAAACTTGAGTCTGAGT-------GGTCTTCTG---TGACAGTAAGGCAGGGCTCACTCCTGGAGATGGACAAG-G--TGG--------------GTGCTCAGGCTAAATTT---GGGGGGTG---------GGAGGCTGTGGAATCC-CACCTTGACCCCACCC---------------CCCACCCCAGGCCCTCTCTTACAGA----GTAGAGTCTAGTGGGGAGTGGGGAAGAATGCA---GCCCAGAA-------TGATT-------GGAGGGGCCTTGGG----------GACATGCTGGAGCCCA-------------GC---AAGGT--------------------------------------------------------------------     
20 Loxodonta_africana-NW_003573446.1-179098_179242          84.6%  29.8%    ------------------------------------------------------------------------------G-----AAGG-TTGGAGCCTCCCTGCCCAGGGCCCCCATGCTGGGAGCCACTCACAGC--C-CCATGGGGCACTTATCCACATGGAGAGCGGCTGTAAGGG------G--TGTC-------------AG--GGCAGA-TACAGGGAAGCGTGTG-TGTCCGGGGACCCTGACTGGGCAGTGAGGCTGAGCCTCTGG--GCTGCAGCCAGCCTGGAGGGATGGCTC-CT---CAACAACT--GGCCTGAGGAGTCAGA---GGTGCTTCCCTTATGGCGGGGGCAGGTGCAGACATGGGGTGGGGCAGGTGGCGGGGGG----CG---TTGATTGC--CCTCCCC-CCTCAACCTGGAGAGGGCACTCATGGTGGG--TGTGGCC---GCCTCCACATTCTTGGAGAGCCCGCCATGCAG-GCACTGGCT--------------------CACCCTTCCCCTTCCTGCA---GCCC--------CGCCCGCTTT---CCAAATTTTGGCGGGGGGGGCAGCAGTAGCTCCTTCCTGTGCCCCCACTGGGACCTGTATTTTTAGACGCAGTTGTTTTTGTTTCCACCCACAAGTGTGGC--ACCACGTTGCACAGCTGACGCTTGGGGAA-----CTCAGCGACACTCTTTGCAGGTGGCCCCGGCAGGTCCCGTGCC-GCCAGGCGCTTGCTTATTCTAGTCTTGAG------ATGGAGAGATGGAGCCCCGGCAGGGGCAGGGGCGAGGGGAGGGGGGACTTTGTCA--GCCATGGAGCTCGCTCACGGAGGGGTGCAGACTCCAGG-CAGAGGGGGCG---TCAATGCAGGG-GGTCCCACCACAGC----CACTTGGGCCC---CATGGG------------GGCAGGCACTG-TCCTCCCCAGAGCTGACCCCTAAGGCGTGAGCCTGG-GTCCTGAATGC---TATCCATCCTACAGGGGGGTCCTGTAGGGAAGGAGGAG-----------------------GCACTGAGTTCAGCATG-GGGGACACCT-------GG---------------ACACTTGGAGGCGAGGG-------ACG----GATGAGCACGAAGTGCCTCTGCAGT-----ACAGGACAACTCCGGGGGAGCTGGTGCTGGC---CAA------------------------GGCGAGGCCTCGCCCTCTGCTGGGGACCCTGTCCTGCCCA-------------GC---CC--TCCC-----------------------------------------------------------------     
21 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-182803_182863         80.4%  30.2%    ---------------------TAGGGTGGTGAGGGTCTC----------ATGAGTGACAGAGGGT-GACCAAG----GT----------CTCGGGGCACCAGGGCTG---------------------------------GGAGACATCCAGCAGGTAGACGCGGCTG-CCCC---------------GCCTCAGCC------GGCCACAGCTGG-GGGGTGGCGTC------C---CCACGGAGATGATGGCTGACAGAGGCTATCATGAC-------ATA---CACCATGGAGCGTGGGCGCGTGCATGTCTGTG--TGTGTGCAAGCATG-----CGTGCTGGGGAGGCAGGGA---CAGGGGGCCTCTCTGGA-CAGGGCAGCAAGCCTTGGA--------GGCTGGCC-ACATCTGCCAAGGGGCCCAAGCCAAGCAGCTGCGCAATG-----TTGGCAAATCAGGACGTGGCGGTGACTGGAGACCTGTGGGCTGGCGTCTCA------GGCTGGCTCCTGGCCATTTCCCAGGCCCTTG--GGGAGGCGGGGA----------------------GACTGGGAGGGGTTTCTTCCTGGCTGTGGCTGTGTCCTGCAAGGACCAGTATTTTTGGAGGCAGGCGTTTGTGTTTCCACCCACGGCCCAGCG--TTCTTGGCGGGTGCACACAGGCTTGGCTCTATTTCAGTCCC----------------------------------------------------------------AG------GCATCCAGGTGGGGCAGCGTGGCCCACCTGAAGCTCTGCCT-----------------------------------------------AGCCAGG-TGGGGTTGATG---TTAAGTCTGTGCTTTCCTTGGCCAAGCAA-CACCTGGCAGGGCACCAGGG-GACGCTGTGA----------------------GCCTGACTACCTCACGTCTGAGCAGCTGCTGAG---------GGCTTCTAGG--------AACAGCAGGAGGAGGAGCAGGGGCTCA---------------------GGCTGGGCCACCGCGGTGGGAGGAGGCCCAGGCCCCCGATGGCAGC------AGCAGGCTGTCC----TCTGCCG--GCCCAGGTCAGCTCAGAAGGGCCCGAGAGCCCTCAGGGACAGCCATGTATGTGGTGGACACA--GGGGTGGGG--------CTAAGGGGATGTGTCCAGCAGGGATTCAGAGTGGAGAACGCCTGTTCCAGG-CTGCCATAGACACAGGAAGTCCTGT-TGA----GAGCCC-CTCAGGCTCTACCTGCTGGACAGGGTGTCGACCCTCTGCATGGGCACCTG     
22 Elephantulus_edwardii-NW_006399795.1-178755_178922       84.3%  27.5%    -----------------------------------------------CTCTCTGTGCCCTCGTCCCCCTTTCT----AC-----CTGA-TGTCCCTCTGCCTGGTGCCCCCTACCCCTGCTGGAGCCACTCACATC--C-CTATGGAGCACTCAGTCACACAGAGAGTGGCCTTAGGCA------A--ACAT-------------G---GGCAAG-TGAAG----------G-GGGGGGG-GGCGCTAGCTGGGGAGTGAAGCTGAATGC-TGA---ATACAACCAGCTGGGAAGGGTGGCTC-CC---CACTGAGT--GGTCTGAGAGCTGG-----GTCTGTGTGGGGGCT---------TTGCCAGGCTGGGGGGGGGGGAGAGGCAGGTCTA----TG---GGGTTGGT--GAAAGGG-GCGGGGATTGGAGAAGTCAAGCACAGTGGG--TGTGGCTGCCTCTCTCTCTCTCT-GGAGAGCCAACTATTAGC-GTGCTGGCT--------------------TGC-CTGTCCCTTCCCTGC---AGACCC------------TTGC---CACTTTCTAGATTTAGGGGGGAGCATTGGCGTCTCCCTGTGCCCCCGCCAAGACCTGTATTTTTAGACGTGGTTGTTTTTGTTTCCGCCCACGAGAACGCAGCACCAGGCTGCACAGCTGACGCCAGGGAA------CTCTGTGACACTTAGTGCAGGTGGCCCCAGCAGGTCTCGTGCTTGCCAGACGCTCACTTATTCTAGTCCCCAG------ACAGGGCGGTAGGACATGCAAACA-----------CCAGGGCACCTG----ATGC--TCTGAGGTGGGTGGTGTGAGGGGCTGGC-CTTGCCAAA-CCGGAAG--------------------GGAGCTGGTATTA----CACCTGGAGCC---CTGGGG------------GTGCACACTTGAGGTTGCACACTTGGGGGTCCTGAGGTCCGAGGGTTATAGAGGGACATA---CAGGGGTCCTGGAGTGTGAAG----------GAGAGCAGT--TGA--------------TCTCTGAGACCTTAGGCCTAAGTGGCATTTGGCACCAGGG-------------------TGGGCAAGGTCT-------CCT----GAAGGTGGAGAAGTG-GGACTCAGG----TTGAGCCTTGAGGCTGGGAGGCTGGGGATGAG---AGGTGGAT-------CCCCA-CGCTGACCAGCTGCTCCAGGCTCTCCCCCAGGCATCGTGAAGGGGG-------------AT---GATGCAGCTTAG---AATGG-T---------------------------------------------------     
23 Miniopterus_natalensis-NW_015504651.1-687253_687337      78.5%  29.2%    -AGGGAGGGGCAGGCAGGACTCAGGGCCAAGCCAATCCTGGGGA-GCTGCCCAGAGCCCCCCAGCCTCGTGAGAAAGTGC--AGCTGAGCTCTGGGAAGTATCCTGGTGGATG----------------------------------------A--AACAG---CTGC-TGTCTCG--------GCAG-----------------------GCGTGAGGGGGGG---------TGGGCAGCAAGGCTGAGCAGTCGGGGTCCCTCTGGGAGGG-----GCCTGCAAA-CCTCGAAGGACAGGCCTGTCATCCGAGTG--GCCCCCAACCATCGAGTTCCTCAGGGGCTGTGGTGGGCAGGTCAGTGGCCT-TGGGGCAGG---GGCGTTTGGTTGG---------CTCTATAG--ACCCTTT-TCCACAGATGAGCAGATG------GAAGTGGGGTGGAAAACAGTCTCCTCGTTTCTGGAGAGTCCTGCCCACCGTCACAGACCCCACC-------------GCTGTACAAGCC----CAGGGG--GTGGGGGGTGGAAGGTAGCTCCTCCCTGGCAG-------------------AGGT-GAGGAGGGCTGGGCGCCCTAC--AGAGTATTCAGGTGGG----GATGTGTGTCCTGCCCACGGGGT-GTGG--GGTGC-------AGCTGGCGC-CACCACAAACTCGAGGATC--GCTCCGTGCAGGTGGCTCCCACAGGTCCCTTGCTGACAGGTGGCTCTTTATTTCAGG-CTCAAG------ATGTCTAGGTGGAGAAAACAGTGC----CTGAGGCTCCAGTGGGCCGGTGGGCGGGCAGGCAGGCGGGCGGGCAATGT----GCC-CAGCCAA---GCAAAGCCATG---TGAAGTCCCTGCTTTCCCTCAGCCAGGCAGCCCCTGAGGGCACACCTGGGGATGCACCTGGGGGCACGTGTGGGCAGCCTCA-C-CCTGGGGCCTTGCGTCTGAGCAGCTTCCTCG---AGGGGGGTTAGGCACTCAGAGAAGGCTCGGAGGAGGAGAGGGGAAGC-TCA---------------------GGCTGAGCTGCTGGGTGCGAGGACTTGGGGGGCAGTGGG-AAATTCCAGCCTTGCCAGCAGCAC---------------------CTGCTCC-CTC---CTG------CTGGGATGA---------------CCCAGTA---------------------------------------------GAGCCACAGAGCAATGTGAGGGGGA---CTCAGG----TGGGGTGG-----CATC------T------A-----------------------------------------------     
24 Nannospalax_galili-NW_008355419.1-178164_178283          79.1%  28.4%    ------------------------------------------------------------TCTGGGAACTGCCCCT-CACCCAGATCAACCCAGAGCTGTGTCCCCGGGGAGATACACAGACTGGCCATCAGAGAC----C------ACCATGG--CAGGTG--TGAT-GAGGCGGG---------------------------G----GTGGGAGCAGGTGCCAGG--C-A-GACTTGACCAGGCTTTGCAGTCAGTGTGCCTCTGGTGGGG--GCAGCAAGCCAAGCTTGAAGGACAGGTGCAT---CAGCTAAG-TGTCTGGAATGAAGGAGC-----CATGTAGCAGC-TGGC---TGTGGTGGCAATGATGGGCCAGGCAGCCGGCCTCTC---------AGCTGGGC--CGGGCATCTGCA--GGGTGAGAAGGCTGAGAGGCCCCC-----AGTCCCCAGACAGTCTTCCTTGCCCTGCCCTACCCTTCA-TGTGGCACT-G------GACTCACTTTGTGCTGTTTCCAAGGCCCTTG--GGAATGGCCAGA------------------------AGGGGGTTTCTCCCAGCTGAGGCTGTACCTTCCCCTACTGGGACCAGTATTTTTAGAGATGGGTGTTTGTGTGTCCACCCACAGCCCTGGA--GGGCTCAGGCAGCT--------------------------------CTGTCCAGGTGGCTCACATAGGTCCCATGCCCACAGCCCTCTATTTTTAGCTCCCAG----------ACATTTAGGCGAGAGGGTGTAGCCCACCTAATACTGTGCTCAGCCAGGTGGGGGTTGGCTCTATTCTCTGCTTTTCTTG---------------------------------------------------GCCAAC-------AAGAAGGG-CACTTGGG-GACA-------------GTAGCACAGC-CTGGCCCAGCA-ACCTCATGCATGAAAAGCCATTGGG---------CACCTGTACTCA-----------GAGAGGAGGAGGAAGAGG-------------------GGCTTTGC-TGA-------GGTTGGAGGTTGAAGTTTGGAGCCCCATCCTGACAGCATCTCCAAGCTCTC----TAGGACAGCCTG----------------------------TAAGGGATAAGCAGGAAGGGTATATGTAGTG--GAGCTGGCTAAGTTAGAGACAGGAGGATCATGGGGTAGGAACTCGGTCTGCCAGGGAACTTCTTGGGGGTTATCAAGGAAGAAAGGGGTGTATCTCTGTAGGGTTGTCATGGGGATAGAAAGTCCTAC--CATGAG--GCACTTCAGCCT---------     
25 Neomonachus_schauinslandi-NC_058406.1-195299_195332      78.0%  24.7%    --------------------------------------------TGG------------------------------------------TTCAGGGCCTGCTGGTCACTGCCTGTGGCTCTGGGGCAAATCACAGG-----CCTGCTGTCTGGC--CCTGTGGTGGGGTGGTGTGAGG-----------ATA-AAGCAACGCCATGTAGGAGTGAGTGTGCGGCTGGGGCTGGGGGTGAGAATCCAAGATGGGG--TTCTGGCTCCCCAGCTC---CAGCAGGCCCCTCCAGCAGGGACCTTGGGG-GCCGTCACCGCTGCTGCCACAGGCTG-----GGGACTGATGGCACGGGGT-GGCCGTCCGGCTCTGGCAG-GTCGCCACCAATCGGAA----------GCGTGTGG--AAAACATCGCCA-----AGAAGAAGCTGGATTCCCTAA--TGAAGGAGTCGAAGATTCGGGACTGTGAGGACCCAAATGACT-TCACCGTGTCC-----ACACTGCCCTCATCTGGAAAGCTTGGGCACAAGGCAGAGGGCAAAAAGGTGAGAGCCC--TGCAGC-CCATGA---GGTCAAC--CTGC----GGCTGAGGGAAGGGCTTGGAACATCCGGTCTGTGCACACCTGTTCATACATACACCCACCCCCCCCCA---------------------------------------------------------------------------------------------CCAAACCCGTCCCCGG------ATTTTTGGGTGGGGAGGACACAGAGCACATTTGGCTCGGGTATGTGAGCAGGTG------------GGCAACATGTCCAGTATGG-----------TGGACACGATG---TGAAGTCCCTGCTTTCCCTTGACCAAGCAATATCTGGGCAAGCACCCGGA--AACTTGGGGACACACAGGATGGCCGCTTGG-ACCT--GGGAAACATGTCTGTGTGATTTTTTGCGTGAGGAGGAGCAGGTACTCAGGGAAGGCTTCCTGGAGGAGGAGGAGGAAGAGTAGGAGAAGCAGTAGCAGCTCAGGCTGAGCCACCAGGCATGGAGCTTGGAGGGGGCGTCA----------------GGGAAGGCAC----CTTGCAG--CACTAGGCCATCCCTG---------------CTGGGACATGGGTAGGGGGACAATGGGGGGT-------------------------------G------------CGGGGCACAGAGCTCTATGAAGGGGG----GCTAGGCAGAGGGGGGAGCATCTGGGCAGTGGGGTCATGCACATGCACCCAACAC-----------GCCTCTCTGTC----------     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .          . .        *    .      **.                                                                                                                                     .  ..