CGGCAACTGGTGCCCTTTGCCTGGCCTCCTGGTTGCTGGGCCTCCCCAGGGGCCCACAACTGGCTCTGGGCTCCCCCACCTGTTACCTCACCATGTTCCCAGGGACCTCCAAGAAGCCGTGTCAGTGGGCTGGGCAGCTCCTGGCCCAGCTGCACCATAGCGCCCTGGAGGTCCCTTGGCCTGTGATGCCTGGGGTGGCCTGGGCTGGGCCGGACTGTGGTGCTCAGATCTCTTGGGAGGGTTAGTGTGTGACGGCTTGGGCAGACAGTGGGAGGGGCTGGATGAGGGGGCTGCCTGTGCCTGCCTGGCTCTGCCAAGGGGGCATGAAGATTCTTGCTCTCCTGTACCCACCCACACATGGCCTCTGCTCCGTGCCAGGCCCACTCTGGGCCACAGGTCTCGCACTGGTGTGGGGTGGTCCAGCTGATGAGGTCAGAGGCCCCTCCCGTGCCGTCAGAGTTCATAGTCAGAGCAAGCCATCCAAAAGCCACGTGATCCACGGTAGTCCCAAGTCATGTGACACTGGAGCTGGCTGGCCATGGTCATCCCTGGTGTAATCAGAGACAGGCAGGGGACAGTGGTGATGGGGGAGCTGCCTGAGGCTATCCCAGGCCAGGGATGGGCTGCCTGGACTCATGCCCCTGCTCTGGCCTAGATGGCGGGTGTGACCCTCGAGAGCTGCCAGGACATCATCGAGCAGTTTGAGCCATGCCCAGAAAACAAGAGTAAGGGGCTGCTGGGCATTGATGGTGAGTGGGGCGCTGCCCTCAGCCCAGCTGTCCTGGGATGCTGGAGGGGCAACGAGGGCCCAACCTGTGGGCCGGGACAGGTGTTCTGTGTTCTGTGTGGCATGGGGGCAGGTGGTCATGAGACGAGGCTGGTGGTGGGCTGACATGGCCCCTATGCCACGCCGTCCTGCAGGCTTCACCAACTACACCAGGAGCCCTGCTGGTGACATCTTCAACCCTGAGCACCACCATGTGCACCAGGACATGACGCA
Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.
Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.
Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.
Distribution of HSS in the input sequence
HSS id | Strand | Frame | Length | Start | End | Score | P | Show Result | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 0 | + | 1 | 29 | 19896 | 19982 | 26.429 | 3.377e-04 |
Plot |
2 | 1 | + | 3 | 38 | 19649 | 19762 | 24.957 | 6.780e-04 |
Plot |
HSS id | Sequence | |
---|---|---|
1 | 0 | APMPRRPAGFTNYTRSPAGDIFNPEHHHV |
2 | 1 | A*MAGVTLESCQDIIEQFEPCPENKSKGLLGIDGEWGA |
Reference sequence (1): Target Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% |
cov pid 1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . . . 4 . . . . : . . . . 5 . . . . : . . . . 6 . . . . : . . . . 7 . . . . : . . . . 8 . . . . : . . . . 9 . . . . : . . . . 0 . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : ] 1358 1 Target 100.0% 100.0% -------CGGCAACTGGTGCCCTTTGCCTGGCCTCCTGGTTGCTGGGCCTCCCCAGGGGCCCAC-------------AACTGGC--TCTGGGCTCCCCCACCTGTTACCTCACCATGTTCCCAGGGACCTCCAAGAAGCCGTGTCAGTGG-GCTGGGCAGCTCCTGGCCCA-GCTGCACCAT-AG-----CGC-------CCTGGAGGTCCCT------TGGCCTGT--------------GATGCCTGGGGTGGCCTGGGCTGGGC----------------CGGACTGTGGTGCTCAGATCTCTTG-GGAGGGTTAGTGT--GTGACGGCTTGGG-CAGA-CAGTGGGAGGGGCTGGATGAGGGGGCTGCCTGTGCCTGCCTGGCTCTGCCAAGGGGGCATGAAGATTCTTGCTCTCCT-GTACCCACCCACACATGGCCTCTGCTCCGTGCCAGGCCCACTCTGG-----GCCACAGGTCTCGCAC--TG-------------GTGTGGGGTGGTCCAGCT--GATGAGGTCAGAGGCCCCTCCCGTGCCGTCAGA-------------GTTCATAGTCAGAGCAAGCCATCCAAAAGCCACGTGATCCACGGTAGTCCCAAGTCATGTGACACTGGAGCTGGCTGGCC-ATGGTCA--------------TCCCTGGTGTAATCAGAGACAGGC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGGGGACAGTGGTGATGGGGGAGCTGCCTGAGG--CTATCCCAGGCCAGGGATGGGCTGCCTGGACTCATGCCCCTGCTCTGGCCTAGATGGCGGGTGTGACCCTCGAGAGCTGCCAGGACATCATCGAGCAGTTTGAGCCATGCCCAGAAAACAAGAGTAAGGGGCTGCTGGGCATTGATGGTGAGTGGGGCGCTGCCCTCAGCCCAGCTGTCCTGGGATGCTGGAGGGGCAACGAGGGCC----CAACCTGTGGGCC-G-------------GGACAGGTGTTCTGTGTTCTGTGTGGCATGGG-------GGCAGGTGGTCATGAGAC------------------------GAGGCTGGTGGTGGGCTGACA-----TGGCCCCTATGCCACGCCGTCCTGCAGGCTTCACCAACTACACCAGGAGCCCTGCTGGTGACATCTTCAACCCTGAGCACCACCATGTGCACCAGGACATGACGCA------------------------ 2 Callithrix_jacchus-NC_048389.1-191751_192341 90.6% 72.7% --CCAGCTGGCAACTGGTGCCCTTGGCTCAGACCCCTGGTTGCTGG-GCCTCCCAGGGGCCCAC-------------AGCTGGC--TCTGGGCTCCCTGACCTATTACCTCACCATGTTCCCAGGGATCTCCAAGAAGCCTGCTGGT--G-GGGTGGCAGCTCCTGGCCTG-GCTGCACCAC-AG-----GGT-------CCTGGAGGTCCCT------CAGCCTGT--------------GATGCCTGGGGTGGCCTAGGCTGGCC----------------TGGACCCTGGTGCTCAGCTCTCCTG-GGAGGGTCAGTGT--GTGGGGGCTTAGG-CAGA-CAGCGGGAGGAGCTGGAGAAGGGGGCTGCCTGTGCCTGCCTTAGCATGAGGGTCA-------------TCATTCTCCTGTACCCACCC--CACATGGCCTCTGCTCCATGCCAGGCCCACACTGG-----GCCACAGCCCTCACAC--CA-------------GTGGGGGGTGGTCCAGCT--GACAAGGTCAGAGGCCCCTCCGGTGCTGTCAGA-------------GTCTGCAGTCAGAGCAAGCATCC-AAAAACCATGTGACCCATGGTAGTCCCAAGTCATGTAACACTGGGGGTGGCTGGCC-AGTGCCCCCGCCATGGCCA--TCCCCGGTGTGATCAGAGATGGCCAGGGGACAGCGGTGAGGGGAACTG--------GCTGATAGACAGGGGACAGCGGTGA------------------------------------------GGGGAGCTGGCTGATGGACAGAGCACAG--------------------------------CAGTCAGGTGGAGCTGGTCGAGG--CTTTCCCAGGTCAGGGATGGGCTCCCTGGGCTCATGCCCCTGCTCTGGCCTAGATGACCGGTGTGACCCTGGAGAGCTGCCAGGACATCATCGAGCAGTTTGAGCCGTGCCCCGAAAACAGGAGTAAAGGGCTGCTGGGCATCGATGGTGAGTGGGGCGCTGCCGTCTGCCTGGCGGTCCTGGGATGCTGGAGGGGCAATGAGGGCC----CAGCCTGTGGACT-G-------------GGACAGCTGCTCTGTGTCCTGTCAA--GTCGG-------GGCAGGTGGCCATGAGAG------------------------GAGGCCGGGGGCGGGCTGACA-----CGGCCCCTACGCCGCACTGTCCTCAGGC-TTCACCAACTACACG-------------------------------------------------------------------------------------- 3 Sapajus_apella-NW_022437067.1-186950_187532 84.9% 67.9% ---CAACTGGTGACCGGTGCCCTTGGCTCAGACCTCTGGTTGCTGG-GCCTCCCAGGGGCCCAC-------------AGCTGGC--TCTGGGCTCCCCGACCTTTTACCTCACCATGTTCCCAGGGACCTCCGAGAAGCCCGTCGGT--G-GGGTGGCAGCTCCTGGCCTG-GCTGTACCAC-AG-----GGC-------CCTGGAGGTCCCT------CGGCCTAC--------------GATGTCTGGGGTGGCCTGGGCTGGCC----------------TGGACCCTGGTGCTCAGCTCTCCTG-GAG-GGTCAGTGT--GTGGGGACATAGG-CAGA-CAGCGGGAGGAGCTGGAGAA-GGGGCTGCCTGTGCCTGCGTTGGCATGAGGGTCC-------------TCATTCTCTTGTACCCACCCCACACACGGCCTCTGCTCCATGCCAGGCCCACACGGG-----GCCACAGCTCTCGCAC--CA-------------GTGTGGGGTGGTCCAGCT--GACAAGGTCAGAGGCCCCTCTGGTGCCGTCAGA-------------GTCTGCAGTCAGAGCAAGCATCC-AAAAACCACGTGACCCATGGTAGTCCCAAGTCATGTAGCACTGGGCGTGGCTGGCC-AGTGCCCCTACCATGGCTG--TCCCTGGTGTGATCAGAGATGGCCAGGGGACAGTGGTGAGGGGGAGCTG-------GCCGATGGACAGGGGACAGCGGTGAGGGGA-----GCTGGCCGNNNNNNNNNNGGGGACAGCGGTGAGGGGAGCTGGCCGATGGACAGGGGACAGCGGT---GAGGGGAACTGGCCGATGGGGGACAGCGGTGAGGAGAGCTGGTCGGGG--CTCTCCCAGGCCAGGGATGGGCTCCCTGGGCTCATGCCCCTGCTCTGGCCTAGATGACGGCTGTGACCCTGGAGAGCTGCCAGGACATCATCGAGCAGTTTGAGCCGTGCCCCGAAAACAGGAGTAAGGGGCTGCTGGGCATTGATGGTGAGTGGGGCGGTGCCGTCTGCCTGGCGGTCCTGGGATGCCGGAGGGGCAACGAGGGCC----CAGCCTGTGGACC-G-------------AGACAGCTGCTCTGTGTCCCGTCGA--GTCGG-------GGCAGGTGGCCGTCA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 4 Cebus_imitator-NW_016107460.1-186593_187179 85.1% 49.8% ---CAACTGGCGACCGGTGCCCTTGGCTCAGACCCCTGGTTGCTGG-GCCTCCCAGGGGCCCAC-------------AGCTGGC--TCTGGGCTCCCCAACCTGTTACCTCACCATGTTCCCAGGGACCTCCGAGAAGCCCGTCGGT--G-GGGTGGCAGCTCCTGGCCTG-GCTGTACCAC-AG-----GGC-------CCTGGAGGTCCCT------CGGCCTAC--------------GATGTCTGGGGTGGCCTGGGCTGGCC----------------TGGACCCTGGTGCTCAGCTCTCCTG-GAGG-GTCAGTGT--GTGGGGACATAGG-CAGA-CAGCGGGAGGAGCTGGAGAAGGGG-CTACCTGTGCCTGCGT-------------TGGCATGAGGGTCCTCATTCTCTTGTACCCACCCCACACACGGCCTCTGCTCCATGCCAGGCCCACACGGG-----GCCACAGCTCTCGCAC--CA-------------GTGTGGGGTGGTCCAGCT--GACAAGGTCAGAGGCCCCTCTGGTTCCATCAGA-------------GTCTGCAGTCAGAGCAAGCATCC-AAAAACCACGTGACCCATGGTAGTCCCAAGTAATGTAGCACTGGGCGTGGCTGGCC-AGTGCCCCTGCCATGGCCG--TCCCTGGTGTGATCAGAGATGGCCAGGGGACAGCGGTGAGGGGGAGCTG-------GCCGATGGACAGGGCACAGCGGTGAGGGGA-----GCTGGCCGATGGACAGGGCACAGCGGT---GAGGGGAGCTGGCCGATGGACNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAGCGGTGA--GGGGAGCTGGCCGATGGACGGGGC-------ACAGCGGTGAGG------GGAGC----TGGCCGATGGACGGG-------------GGACAGCGGTGAGGGGAGCTGGCCG--ATGGG-------GGACAGCGGTGAGGGGAG------------------------CTGGCCGATGG-------ACA-----GG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 5 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-192396_192821 84.3% 49.5% -----------------------------------------------------------------------------------C--TCTGGTGCCGTCAGAGTCTGCAG---------TCAGAGCAAGCATCCAAAAACCATG----------------------------------------TG-----ACC-------CATGGTAGTCCCA------AGTCATGT--------------AACACTGGGGGTGGCTGGCCAGTGCCCCTGCCATGGCC----ATCCCTGGTGTGATCAGAGATGGCC-AGGGGACAGCGGT--GAGGG-GAGCTGG-CAGA-TGGCCAGGGACAGTGGTGAGGGGAGCTGGCAGATGGCCAG---------GGGACAGCGGTGAGGGGACTGGCCGATGGCCAGGGACAGCGGTGAGGGGAGCTGGCCGATGGCCA----------------GGGACAGCGGTGAGGG--GA-------------GCTGGCCGATGGCCAGGG--GACAGCGGTGAGGGGAGCTGGCCAATGGCCAGG-------------GACAGCGGTGAGGGGAGCT-GGCAGATGGCCAGGGGA----------------------CAGCGGTGAGGGGAGCTGGCC-GATGGC-----CAGGGACAGCGGTGAGGGGAGCTGGCAGATGGCCAGGGGACAGCGGTGAGG-GGAGCTG-------GCAGATGGCCAGGGGACAGCGGTGAGGGGA-----GCTGGCAGATGGCCAGGGACAGCGGTG----AGGGGAGCTGGCAGATGGCCAGGGACAGCGGTGAGGGGAGCTGGCCAATGGCCAGGGGACAGTGGTGAGGGGAGCTGGTTGAGG--CTCTCCCAGGCCAGGGATGGGCTCCCTGGGCTCATGCCCCTGCTCTGGCCTAGATGACGGGTGTGACCCTGGAGAGCTGCCAGGACATCATCGAGCAGTTTGAGCCGTGCCCCGAAAACAGGAGTAAGGGGCTGCTGGGCATCGATGGTGAGTGGGGCGCTGCTGCTCGCCTGGCGGTCCTGGGATGCTGGAGGGGCCACAAGGGCC----CAGCCTGTGGACT-G-------------GGACAGCTGCTCTGTGTCCCGTCGA--GTCGG-------GGCAGGTGGCCGTGAGAG------------------------GAGGCCGGGGATGGGCTGACA-----CGGCCCCTATGCCGCGCTGTCCTCAGGC-TTCACCAACTACACGAGGAGCCCCGCTGGGGACATCTTCAACCCTGAGCACCACCGCGTGCACCAGGACATGACGCGCC---------------------- 6 Odobenus_rosmarus-NW_004450599.1-191592_192044 79.8% 44.4% --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTGCTAGAAGCCCTGCTGGTGGGCCTGCCTCTGGGAACTGGGGGTTCCTGGCCTGAGCTGCACCCC-AG-----GGCC------CTGGGAGATCCCTCAGCCTCTTA--------------------TGCTTGGGGCCATCGGTGTGCAGGGCCACCTTGGGT----TCAGCTTTGTTGTGCAGCTTTCCTG-TGATAG---------------ATGTGGGGAGCAAGCAGG-G-AGAAGCAGGGAGAAGAG---------GCCCCTGGGT-TTCTCCAAGGTGGGACTGGGTCCTGGTTCTCCTGCACCCCTGTACACACAGGGCT--CCCTGCCAGGA---CTGCCCTGG-----CCCATAGCTCTTGAGACCCCTAACACAGTGGGGATGAGGGGTGGCCCAGCT--GATGGAACCCAAGACCCTTCCCCTGCTTCAAGG--------------A--------TCC-----------GC-----AGTCGGTGACAGGTCTTCCAAAGCCATGTGATCCACCAGTAGTCCTCTG-----GC-----C-ACCGAGC---CTG--AGTCTTGTGACACTGGGGGTGGCCAG----CGTGTCCCCCAGTCTGGGAAGCACACTGCAGGGGCCTGAGCCTCCCCCC------------GCCGTGGTTAGTCTTGATGTGA-CC----AACAGAGGCCGGGTGGGAGGCAGTGGTGGTGGTGGTGGA---GGAGGGC-----------------CTGCTGCCTGAGGC-TAGCCCAGGCCAGTGACGGGCTAGCCTGGGCTTAAGCCCTTGCTCTGGCCTAGATGGCGGGTGTGACCCTTGAGAGCTGCCGGGACATCATCAAGCAGTTTGAGCCTTGCCCAGAAAACAAGAGTAAGGGGGTGCTGGGCATTGATGGTGAGTGGGGGCGTCACTGCGGTCCAGCTGTCCTGGCAGGCCAATGGGGGGGTGCT--GGCGGGCAACCTGTGGGCCTGGACAGGTGGCCTGAGTGGGCAGCTTCCTGTTCCACATGGCGCGGA-----GA-TG-GGTGGTCCTGAGATGAGC------------------CTTGTGATGGGGCCGGCGTGTGGGGGCTAAGCACCC-ACCGTGCTCCCCACACAGGCTTCACCAACTATACTCGGAGTCCTGCTGGCGACATCTTCAACCCAGAGCACCATGGTGTGC---------------------------------------- 7 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-176390_176819 81.1% 40.9% ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTGATGT----------G-GACCCAGACAATGGGGCCTC-CATCCTGGCA-AA-----GGT-------GTGTGTGGAGGCAGAGTGTGGGAATGT--------------GG-CCTGAAGGGGGAAGGGCAAGACCCTGAAGCTTTCC----AGCACCCC-TCCCTACAGTCTGCAG--CCAAACCAGTG--TCCTCCAGGCAGGT-GATTTGG-CCCGTGTCCTGGCTCCTAGGTTCTGAATACCACCCCCCAA--------CTCTGCC----------------------------------------CACACATTTCTGAGAGCCCTGCCAGTG-----GCCTGCCATGGGGGCC--TG-------------GGTGCTTCTGG---CCCT--GACTGCACAACAGGGCTCTGAAAATCCCTCAGCCTTTAATGCTTGGGGCCAGGCTGAGCTGGGGGGTAGCACTAGGCTTTCCTGTGATGGCCACTAG--GGCAGACAACAGGGATCGGGAGATGGAGGCTCCCTGTGCCCCTGGCTCCTCCCAGGCAGGATATAGGTCCTCA-----------CCCTCCTGCGTCTC-------CCCACTCTCCAGTCTCTGCTCCATGCTGG------GCCCACCAGTGACCCCAGCCCTCAAGCAT-CACCCCACCGTGGCCATCCCTGATGTGGTA-ACCAGAGGCAGGGCCTGGATGTGGTGGAGGGAAGACTGGGG-AGCTGCCTGAGGC-TAGCCTGGGTCAAT-GATGAGCTAGCCTGGTTCACGCTCCTGCTCTGGCTTAGATGATGGATGTGACCCTTGAAAGCTGCCAGGACATCATTGAGCAGTTTGAGCCATGCCCAGAAAACAAGAGTAAGGGGCTGCTGGGCATTGATGGTGAGTGGGGTGTCGCCCTGAGTCCACTTGTCTCAGGGGGTTGGGGGGTACTG--ATGGC----CAGCCTGGGTCCA-G-------------GACAGGTGGTTCCACGTTCCACATGGCACTGGGGCGGGTGAGTCCTGCTCAAGGGAAGAGG------------------CCATGGTATGCTGGCCAAGGCGGTGCTGAGCAGCCTTTGCTGCCCCGCCCTGCAGGCTTCACCAACTACACCAGGAGCCCCGCGGGCGACATCTTTAACCCCGAGCACTATCGTGTGCACCAGGAC-------------------------------- 8 Castor_canadensis-NW_017871110.1-174665_175105 82.6% 40.4% ------------------------------------------CAGGACCTATTCACAAG------------------------ATCTTGATTAAACTGTTCTG---------GTGTT--CAGAGCTCCCTCAGGGATGGGCTGCAGTGAGGTCA--CTGAGCAGAAAGGTATGCTCCCTGTGCCTGCC--AGCAGGAGCCAAGCCCAAACTTCTGGAGAATTCTCAGCCACCCAGTCCCCTCCCTGATGT------------GGTGGCCCATGGCCCACCA-CTGTGAG-----GGTGACTCCCAGCA-TGT------------------GGGTAGG-CAGAGCAGAGGGTGC--CTG-GTCCAAAGGTCAGCCTTGATCCCCAA-G-GTAGAATGA--------GGGCTTCACTCCT--TGCTCCACCCTACATGGATTTCT--GCTC-TACTCCAGTCCCCTT--------TGCACAGCTTTGGGACCCCT-TGCA---TGGCAGCAGAGGATGGTACCTCT--GATGAGGTCAGGGATCCCTCGCCTTTGGAAATA--------------CCTTCAGTCTGA-----------GA--------------AAGTGATTAAAAATTCATGTGATCCCCTTATAGTCTTCTG-----GC-----T-GCTGAGT--CCCA--GGTAATATGGCCCTGGGGATAGTCAG-----------------------------TGCCTC-----CAGTCCTAAAGTGCAAGCAACCTCAGCTGCTATCAGCCCAGATGTGG-TG----ACCAGAGGCAGGAGCAGG--AG----------------------------GCAGTGGAAGGATGTGAGAGTTGCCTAAGGTTAGCCCAGACTGGTGATGGGCTAGCCTGAGCTCAAGCCCCTGCTC-TGCCTAGATGAAGGGTGTGACACTTGAGAGCTGCCGTGGCATCATCGAGCAGTTTGAGCCCTGCCCAGAAAACAAGAGCAAAGGGATGCTGGGCATTGATGGTGAGTGGGACGCCACCCTCAGTCCAGCTGGCCTGGGAGGAGGATGGGGCACTGAT----------------GGGCAACTGTGGGC--------CAGGTTGCTCCACAGTCCATGTAGTGTATA-----GG-GCAGGCGGGCATGAGCTCAG---------------------------CCCAGTGGCAAGGCTGACCC-CACACCCACCCCACACTCCCCTGCAGGCTTTACCAACTACACACGGAGCCCTGCTGGCGACATCTTCAACCCCGAGCACCACAGTGTACACCAAGACATGACGCG------------------------ 9 Lemur_catta-NC_059130.1-177406_177798 81.8% 37.5% -----------------------------------------------------------------------------------------TCCCT-----------GGCCTGTCGCTGGGCAGCAGGGCTGCGGTGACGT----------G-GCCCCAGACAGCCGGGCCTC-GTCCTGGCCA-AG-----GTG-------ACAGAGGGCGGGAATGTGGCCCGAGGA--------------GAAAGGGCAGGACTGACCCCTCCTTCCCTGACCTTTGG----CCGGAGCT-TCCAGCACTTCTCCCT--AAAAACCCGTGT--CCTCCGGGCAGGG-AAGTTGAGCCCCTGGCCTGGCTCCCGGGCCCTAAGCATCCCCCACCCCCCTCCACGGTCCTGG----------------------------------------GACCCC-CGGGGG---CCCTGCCGGTG-----GGCTGCCCTGGGGGCC--TG-------------GGCGCTGCTGG---CCGT---GAGGCACCGCGGGGCCCTGGAGGTCCTCGGTCTTCAACGCGG---GGCTGCACTGAGCCGGGCTGCCCGGGTGCCCCG-----CGA----------GGGTTACTGCACAGGGACCCGGGCGGACGGCAG-GGGCGGGGGACGGGGGCTCCCAGGCAGGATCTGGGTCCTCG-----------CCCTCCCGCGCCTC-------CCCACTCTCTGGCCTCCACTCCACGCTGC------ACCCACCAGCGACCCCAGCCCTCAAGTCC-CACCCAAGGTGG-CCGTCCCCATCGGGGCT-GGCAGGGACGGGGCCG-GGAGGGGTGGAGGGAGGGCTGGGG-AGCCGCCTGAGGC-CAGCCCTGGCCGGTGAG-GGCCCAGCCTGGGTTCCGCCCCTGCTGTGGCCTAGATGACAGGCGTGACCCTCGAGAGCTGCCGGGACATCATCGCGCAGTTCGAGCCGTGCCCCGAGAACAAGAGCAAGGGGGTGCTGGGCATTGACGGTGAGTGACGCTGCCCTCACCCAGGTGTCCTGGGAGGCCGGGTGGGGGGCACC--AGGGC--------CTGGACACG-C-------------AGCCCCACGTCCCGTGTGACAAGGGCGAGTGG---CCGTGAGCAGAGGTGGGGTGGGC-----------------------------------------------TGACCCGCCCCCACCCGCCACCCCCGCAGGCTTCACCAACTACACCAGGAGCCCTGCCGGCGACATCTTCAACCCCGAGCACCACCGCGTGCACCAGGACATGACGCGGCCGCTGAGC-------------- 10 Ursus_arctos-NW_020656172.1-191621_192046 80.8% 42.9% -----------------------------------------------------------------------------------------------CCCCCCCGCAGTCCTCGGGACTTTCTAGAAGCCTGGCTGGCGGAACTGCGTCTGG-GAACTGGGGCTCCTGGCCTGGGCTGCCCCTC-AG-----AGCC------CTGGGAGATCACTCAGCCT-CTG--------------------TGCGTGGGGTCGTCGATGTGCAGGGCCGCCTTGGGC----TCGGCTTTGTTGTGCAGCTTTCCTG-TGAGAG---------------ATGAAGGCAGCAGGGGGA-G-GCA---GGGAGAGGAGGTTCCCTGTGCCCCTGGACT-TCCTCCAAGGTGGGACTGGGTTCTGGTTGTCCTGCACTCCTGCACACAGGAGGCT--CCCTGCCAGGA---CGGCCCTGC-----TCCATAGCTCTTGAGA--CCTAACACGGTGGGCATGAGGGGTGGCCCAGCT--GATGGAACCAAAGACTCCTCCCCTGCTTCAAGG--------------A--------TCT-----------GC-----AGTCAGGGACAACTCTTCCAAAGCCA------------GTAGTCCTCTG-----GC-----C-ACCAAGT--CCCG--AGTCTTATGACACTGGGGGTAGCCAG----TCAGGGAAT------------CAGCCTGCAGGGGCCCGAGCCT----CCCCCCCCCCCCCCGCCATGGTCGGTCTTGACGTGA-CC----ATCAGAGGCAGAGTAGGAGGCAGTGGTGGTGGTTGTGGA---GGAGGGG-----------------GTGCTGCCTGAGGC-TAGCCCAGGCCAGTGATGGGCTAGCCTGGGCTTAAGCCCTTGCTCTGGCCTAGATGGCAGGTGTGACCCTTGAGAGCTGCCGGGATATCATCGAGCAGTTTGAGCCCTGCCCAGAAAACAAGAGTAAGGGGGTGCTGGGCATTGACGGTGAGTGGGGGCGTCGCTGCTGTCCTGGCAGGCCGATGGGT--------GGTGCT----------------GGCGGGCAACCCGTGGGCCTGAGCGGGCAGCCTCCTGTTCTGCATGGTGCGGG-----GA-TG-GGTGGTGCCGAGATGAGC------------------TGTGTGGTGGGGCCGGCGCGCGGGGGCTAAGCACCCAC--CGTGCCTCCGCGCAGGCTTTACCAACTATACTCGGAGTCCTGCCGGCGACATCTTCAACCCCGAGCACCACGGCGTGCACCAGGACATGACG-------------------------- 11 Equus_przewalskii-NW_007674960.1-192396_192831 79.5% 40.9% ------------------------------------------------------------------------------------------------CTATGCCCACCTCCCACTGGTTCCTGGAAGACCCACTG-------GCAGGCCTGCCACCGGGGGCTCCTGGCCTGGGCTGCACTGG-AG-----GGCC------CTGGAAGGTCACTCAGCCTCCAC------------------------------------CCCGCGGGGCCGCCTTGGGC----TCGGCTGTGGGGCACAGCTTTCCCG-TGAGGG---------------ACTTGGGTAGACAGAGCAGGAAGCA-GGTGAAGAGGAGGCTCCCGT-GACCCGGGCT-CCTCCAAGGTGGGACGTGGGG---------CCTGTGCCTTCTCACATGTGGCCCT--CGCTCCCTGCCAGCCTGTCCTGG-----TCCACAGCTCTGGGGACCCTTAA----CATGGCAGAGGGGGTGGCCCAGCT--GATGAGACCAAAGGCCCCTCCCCTGCTTCCAGG--------------A--------TGC-----------TC-----AATCAGAGCCAGCTCTTCCAAAGCCATGTGACCACCCTGTGGTCCACTG-----GC-----C-ACTGAGTGTCCCA--AGTCACATGACACGGAGGGTGGCCAG----TGAGCTCCTCAGCGGGAAAAGCACACTGCAGGGGCCACGGCCTCACCCC-----------TGCTGTGGTCAGCCCCACACG-G-CA----ACTGGAGATGGGCTGGGAGGTCGTGGCACTGGGGGTGGAGGAC----------------------GGGCAGCTGCCAAGGCTAGCTCAGGCCAGCAATGGGCTAGCCTAGGCTTATGCCCCTGCTCTGGCCTAGATGACGGGTGTGACACTTGAGAGCTGCCAGGACATCATCGAGCAGTTTGAGCCCTGCCCAGAAAACAAGCGAAAAGGCGTGCTGGGCGTTGACGGTGAGTGGGCACCCCTTGGTCCGG--CTGTCC-T-----GGGAGGCTGAGGGGATGCTGATGGGCAGCCTGTGAACCTGGATGGGTGTCCTGAGCAGGTTGCTCCACATTCCGCATGGTGTGCG-----GGGCG-GGTGGTCCTGAGAGGAGCTCA-------------GTGGTGGGGCCA---GCACTCGGG-GGCTGAGTCCCCACCCCATGCTCCCCCTGCAGGCTTCACCAACTACACGCGGAGCCCGGCTGGTGACATCTTCAACCCGGAGCACCACGGCGTGCACCAG----------------------------------- 12 Enhydra_lutris-NW_019154122.1-192396_192867 80.5% 43.1% --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCGTGTTCCTCGGGAATGGTGGGCCTGCATCTGGGAACTGGGGGCTCCTGGCCT--GCCGCACCAC-AG-----GGCC------CTGGGAGGTCACTTGGCCTCTGG--------------------TCCATGGAGTCACTGATGTGCAGGGCTGTCTTGGGC----TCATCTTTGTGGTGCAGCTTTCCTG-TGAGAG---------------ATGTGGGGAGGCAGCAGG-G-GGAGGCAGGGAGAGGAGGCTCCCTGCGCCCCTGGGT-CCCTCCAAGGTCGGCCTGGGTCCTGGTTCCCCTGTACCTCCTCCCATACGGGGAC--TTCTGCCGGGA---CAGCCCTGG-----TCCATAGCTCTTGAGATGCCTAGCCCGGTGGGGATGAGGGGTGGCCCAGCC--GATGGAACCAAAGACCCTTCCCTGGCTTCGAGG--------------A--------TCT-----------GA-----AGTTGGAGACAACTCTTCCGAAGCCATGTGACCCACCAGTAGTCCCCTG-----GC-----C-ACCAAGT--CCCA--AGTCTTGTGACACTGGGGGTAGCCAG----CGTGCCCCCTGGTCCAGAAAGCACACCACAGGGGCCTGAGCCTCCCCCC------------GCTGTGGTTAGTCTTGATGTGA-CG----ATCAGAGGCAGGGGGGAGGCAGTG------GTGGCGGTC---GGGGGGA-----------------TTGCTGCCTGAGGC-TAGCCCAGGCCAGTGATGGGCTAGCCTGGGCTTAAGCCCCTGCTCTGGCCTAGATGGCGGGTGTGACCCTTGAGAGCTGCCGGGACATCATCCAGCAATTCGAGCCCTGCCCGGAAAATAAGAGGAAGGGGGTGCTGGGCATCGACGGTGAGTGGGGGCGTGTCTGCGGTCTAGCTATCCTGGCAGGCCCATGGGGGGTGCTG--CCCGGC--AATGCGAGGGCGGGACAGGTGGCCCGAGCGGGCAGCTTCCTGTCCTACGTGGCGTGGG-----GG-TG-GGTGGTGCTGAGATGAGC------------------CTTGGGGCAGGATCAGCGTGAG-GGGCTAAGCGCCC-CCCGTGTCCCCCACGCAGGCTTCACCAACTATACTCGGAGTCCCGCCGGTGACATCTTCAACCCCGAGCACCACGGCGTGCA--------------------------------------- 13 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-243950_244349 80.5% 39.8% -------CGGACTCTGG-------------GCCTC--------------------------------------------------------------------------------------------CCTGGGCCTGCTGCCGGCTCTGTGCTCTGGCCCGTTTTGCCCAC-CTTCCCCCCA-AT-----TACCCCACCCCCGCCATGTTCCTGGGGACGTCC-TGGAA-GCCCCACCAGTGGGTCACTTGGCCTCTGACTCTTGG-----GGCATGGC----TGGGCTGCGGTGTTCAGGTTTCCTG-TGGGGT---------------GACCATGCACGGACTCAGGCAGACA---------GC-----------AGGAGGGTCT-GAAGGAGGAGGAGATGTATGTCCTCACCCTCCTGCCGCTCCCCCCACATGGGCCTCTGCTCCACGCCAGGCCCACCCTGG-----ACCACAGCTCTCAGGACCCTTTACATGGCAG---TGGGGGGTGG-----------CCCAGCCAAAGACACCTCCCCTGCTGTAAAA--------------A--------TCC-----------TC-----AGTGAGAGCGAGCTATTCAAAGGACTTGTGACCTATTGGTAGTCCTGCT-----GG-----CCACTGAGT--CCCA--AGTCACGTGACACTGGAGGTGGCCAG----TGGCCCTAGCCCTCAAGCATCTCCTC----------------------------------CTCTGTGGTCAGCACTGATGTA--------ATCGGACACAGGGCAGGAGGCGGTGGCGACGGTGGGAGGATGGTGGGAG-------GACGGTGGGAGGACGGTGGGAGGACGGTGGGAGGATGGCG-ACAGGCCAGCCTGGGCTCATGCTCTGCTCTGGCCTAGATGATGGGTGTAACCCTCGAGAACTGCCGGGACATCATCGAGCAGTTCGAGCCCTGCCCAGAGAACAAGAGTAAGGGGGTGCTGGGCATTGACGGTGAGTGGGATGTGGCCCTCGGTCCAGTTGTCCTGGGACGCCAGGGG----GGCACCGAGGGGGCAGCCCATGGGCCTGGACAGGTGGCCTGAGCAGGTGGCTTCATGTTCCATGTGGTCGTGA-----GATGAGGCCAGTGGTGGACTCGGGCCC-------------------TAGGGCTACCCCCAGGGGCTGACTCCCTCCCTGCCCCATGCCACCCTGCAGGCTTCACCAACTACACGAAGAGCCCCGCCGGTGACATCTTCAACCCCGAGCACCATGGCGTGCACCA------------------------------------ 14 Prionailurus_bengalensis-NC_057345.1-192396_192827 77.7% 44.9% --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ACTGAGGGCTCTCGGCCTGGGCTGCATGGC-AG-----GGCC------CTGGGAGACCACTCAGCCTCTGACCAGGGCAGGGTGGCGGGGGTGGGGGGCGGCATCGATGCCCAGGGCC-GCTTGGGC----TCGGCTTCCGTGTGCAGCTTTCCCG-AGAGGG---------------ATGTGGGTTAGGCAGCAGGAGGAGCCAGGTAGGGGAGGCTCCCCGTGCCCCTGGGGC-TCCTCCAAGG-------TGGGACTGGTTCTCCTGCACCTTCTCACACATAGGGCT--CCCTGCCAGGC---CTGCCCTGG-----TCTACAGCTCTTGAGACCCC-GACACGGTGGGAATGAGGGGTGGGCCAGCT--GATGGGACCAAAGACCCCTCCCCTGTCTTTGGT--------------CCCATCAAGGGA-----------CC-----TGTCCGACACAGCTCTTCCAAAGCCATGTGATCCACCAGTAGTCCTCCG-----GC-----C-AGAGTC----CCA--AGTCTCACGACACTGAGGGTAGCCGG----TGTGCCGCCCAGTCGGGAACACCCTGCGGCG---C-----CCGAGCCTCCCCCTGACGCCCACCGTGGGCAGTCTTGATGCGA-CA----ATCAGAGGCAGCCTGGGAGGCAGCGGTGGTGCAGGAGGAGGAGCGGGGG-----------------GAGCTGCCTGAGGCTAGCCCGGGGCCAATGACGGGCTAGCCTGGGCTGAAGCCCCTACTCTGGCCTAGATGACGGGGGTGACCCTTGAGAGCTGCCGGGACATCATCGAGCAGTTTGAGCCCTGCCCAGAAAACAAGAGCAAGGCGGTGCTGGGCATTGACGGTGAGCGGGGCATCG-CTGCGGTCCGGCTGTCCCGGCGGGCTGATGG----------------GCAACCTGGGGGCCAGGACAAGTGGCCTGGGCAGAGAGTTTACGGTTCCACGTGGCGGGGG-----TGGGG-GGCGGTCCTGAGATGAGCCCC-------------ATGGGGGGGGGGAGCTGGCACGCAGGCGCTAAGCACCCTCCCACGCTCCCCACGCAGGCTTCACCAACTACACTCGGAGCCCCGCCGGCGACATCTTCAACCCAGAGCACCACGGTGTGCACCAGG---------------------------------- 15 Hyaena_hyaena-NW_024080942.1-192396_192823 78.3% 42.6% 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16 Jaculus_jaculus-NC_059106.1-175804_176171 83.2% 36.8% 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17 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-189843_190797 78.7% 40.6% 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18 Vulpes_vulpes-NW_020356486.1-191587_192077 78.9% 42.0% 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19 Nannospalax_galili-NW_008355419.1-172081_172479 83.4% 40.7% 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20 Ictidomys_tridecemlineatus-NW_024405058.1-177333_177808 87.8% 43.9% 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21 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-179052_179419 83.5% 37.0% 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22 Microcebus_murinus-NC_033661.1-175929_176351 81.8% 37.7% 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23 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-191229_191671 79.1% 36.6% 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24 Camelus_bactrianus-NW_011514262.1-179286_179695 80.2% 41.7% 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25 Phocoena_sinus-NC_045763.1-180101_180467 83.8% 42.0% 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clustal . . . . . .. . . . . .. . . .. . .. . . . .. : .. ***.* *. |