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 1 Target                                                  100.0% 100.0%    ---------------------------------------------------------AGGGCGAGGATGG-GAGTGGCAGGAGGAG--CC--TTGGGAATCCCAGGTAGGGTCTGGGTGGGTTTTACCCAGGATCTCCCAGCAGTAC-------------------------CCCACCCCCAAGCTTACCACAAACCCAGAG------CTGGCCTTTGGG-GCTGTCCCTGGGCCTGAGCT-CCCGGGATGCCCCCA----CCTGGCCGGGGCAGC------TTGCCAGGCTCC--ATCCCGTG-------------------GCAGCCGCTTCTCCAGTCCTGCAGGCAT-------GACACCCGGGACGCATGGCCCAGGCAGGGGAAGCTAGCA---CCA-GTTGGCTAGACCCCACTGTCT----CGGATGCCCTGTGCCCTGGCCACCAGGGGCGG--CACCAGCATGTGT---CTGTGGGTGACCTGGCTGCA----------------------------------GATAGTAGGTCCTCTGTCCCAGTAAAGGCAGAGGTGGGAATGGGGCCTGGATAGGGGATTGGCAGGCAGAAGTGACCCTTCCCTCCCTGACCTTTGCCCCAAGCCTTGTGGA-----ACCCTCTGTGCACTCAGGAGCCAGAGTCCTC----------CAGCCGGCAACTGGTGCCCTTTGCCTGGCCTCCTGGTTGCT--GGGCCTCCCC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A----------------GGGG---C------CCACAACTGGCTCTGGGCTCCCC--------------------------CA-CCTGTTACCTCACCATGTTCCCAGGGACCTCCAAGAAGC-CGTGTCAG----------------T-------------GGGCTGGGCAGCTCCTGGCCCA-GCTGCAC---CATAGCGC-CC-TGGAGGTCCCTTGGCCTGTG--ATGCCTGGGGTGGC------------------CTGGGCTGGGCCGGACTGTGGTGCTCAGATCTCTTGGGAGGGTTAGTGTGT------------------GACGGCTTGGGCAGACAGTGGGAGGGGCTGGATGAG---GGGGCTGCCTGTGCC----TGCCTGGCTCTGCCAAGGGGGCATGAAGATTCT-TGCTCTCCTG-TACCCACCCACACAT-GGCCTCTGCT-CCGTGCCA---------------GGCCCACTCTGG--GCCACAGGTCTCGCAC----------------TGG-TGTGGGGTGGTCCAGCTGATGAGGTCAGAG-GCCCCTCCCGTGCCGTCAGAGTTCATAGTCAGAGCAAGCCATCCAAAAGCCACGTGATCC--AC---------------------------------------------------------------     
 2 Trachypithecus_francoisi-NW_022681457.1-204807_205751    99.9%  88.3%    --------------------------------------------------------GAGGGGGAGGATGG-GAATGGCAGGAGGAA--CC--TTGGGAATCCCAGGTAGGGTCTGGGTGGGTTTTACCCAGGATCTCCCAGCAGTAC-------------------------CCCACCCCCGAGCTTACCACAAACCCAGAG------CTGGCCTTTGGG-GCTGCCCCTGGGCCTGAGCT-CCCGGGATGCCCCCA----CCTGGCCGGCGCAGC------TTGCCAGGTTCC--ATCCCGTG-------------------GCAGCTGCTTCTCCAATCCTGCAGGCAC-------AATGCCTGGGAGGCATGGCCCAGGCTGGGGAGGCTAGCA---TCA-GCTGGCTGGACCCCACTGTCT----CAGATGCCCTGTGCCCTGGCCACCAGGGGTGG--CACCGGCATGTGT---CTGTGGGTAACCTGGCTGCA----------------------------------GACAGTAGGTCCTCTGTCCCAGTAAAGGCAGAGGTGGGAACGGGGCCTGGATGGGGGATTGGCAGGCAGAAGTGACCCTTCCTTCCCTGACCTTTGCCCCAAGCCTTCTGGA-----ACCCTCCCTGCAATCAGGAGCCAGAGTCCTC----------CAGCCGGCTACTGGTGCCCTTT-CCTGGCTTCCTGGTGGCT--GGGCCTCCCC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A----------------GGGT---C------CCACAGCTGGCTCTGGGGTCCCC--------------------------CA-CCTGTTACCTCACCATGTTCCCAGGGAACTCGGAGAAGC-CCCGTCGG----------------T-------------GGGCTGGGTAGCTCCTGGCCCA-GCTGCAC---CATAGCGC-CC-TGGAGATTCCTTAGCCTGCG--ATGCCTGGGGCGGC------------------CTGGGCTAGGCTGGACTGTGGTGTTCAGATCTCTTGGGAGGGTTTGTGTGT------------------GGGGACTTGGGCAGACAGTGGGAGGGGCTGCATAAG---GGAGCTGCCTGTGTC----TGCCTGGCTCTGCCAAGGGGGCATGAAGATTGT-CGCTCTCCTG-TGCCCACCCATACAC-GGCCTCTGCT-CCACGCCA---------------GGCCCACTCTGG--GCCACAGCTCTTGCAC----------------TGG-TTGAGGGTGGCCCAGCTGGTGAGGTCAGAG-GCCCCTCCTGGCTCTTGCACTGGTTGAGGGTGGCCCAGCTGATGAGGTCAGAGGCCTCTC--CT---------------------------------------------------------------     
 3 Sapajus_apella-NW_022437067.1-186429_187425              96.4%  74.1%    --------------------------------------------------------TGAGGGGGAGGATG-GGAGTGGCGGAGGGG--CC--TTGGGAAGCCCAGGTGGGGTCTGGGTGGGTTTTACGCAGGATCTTACGGCAGTAC-------------------------GCCACCCCTGAGCTTACCACAAACCCAGAG------CTGGCCTTTGGG-GCTGGCTCTGGGCCTGAGCT-CCCAGGAGACACCCA----CCTGGCTCGTGCAGC------TTTCCGGGCTCC--ATCCCATG-------------------GCAGCCGCTTCTCCTTCCTGCAGGC-AC-------GATGGC-----------CAGGAGGCATGGGAGGCTGGCA---CCA-GCCGGCTGGACCCCACTGTCT----CAGGTGCCCTGTGCCCTGGCCACCAGGGGTGG--CACCAGCATGTAG---CTGTGGGTGGCCTGGCTACATTGGCACGTGGCTGTGGGTGGCCTGG---CTGCAGATAGCAGGTTCTCTGTCCCAGTAAAGGCAGTGGTGGGAACGGGACCTGG-AT-----GGGGTGGGCAGAAGTGACCCTTCCCTCTGTGACCTTTGTCCCACGCCTTCCGGA-----ACACTCCCTGCACTCAGGAGCCAGATAGAGCGCC------CCAACTGGTGACCGGTGCCCTTGGCTCAGACCTCTGGTTGCT--G-GGCCTCCC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A----------------GGGG---C------CCACAGCTGGCTCTGGGCTCCCC--------------------------GA-CCTTTTACCTCACCATGTTCCCAGGGACCTCCGAGAAGC-CCGTCGGT-------------------------------GGGGTGGCAGCTCCTGGCCTG-GCTGTAC---CACAGGGC-CC-TGGAGGTCCCTCGGCCTACG--ATGTCTGGGGTGGC------------------CTGGGCTGGCCTGGACCCTGGTGCTCAGCTCTCCTGGA-GGGTCAGTGTGT------------------GGGGACATAGGCAGACAGCGGGAGGAGCTGGAGAA----GGGGCTGCCTGTGCC----TGCGTTGGCATGAGGGT-------------CCT-CATTCTCTTGTACCCACCCCACACAC-GGCCTCTGCT-CCATGCCA---------------GGCCCACACGGG--GCCACAGCTCTCGCAC----------------CAG-TGTGGGGTGGTCCAGCTGACAAGGTCAGAG-GCCCCTCTGGTGCCGTCAGAGTCTGCAGTCAGAGCAAGCATCCAAAAACCACGTGACCCA--TG---------------------------------------------------------------     
 4 Callithrix_jacchus-NC_048389.1-191279_192230             93.9%  70.4%    --------------------------------TGTCAGCCTCTTGGTGATGG--TCTTAGGGGGAGGATG-GGAGTGGCAGAGGGG--CC--TTGGGAAGCCCAGGTCAGGCCTGGGTGGGTTTTATGCAGGATCTTATGGCAGTAC-------------------------CCCATCCCTGAGCTTACCACAAACCCAGAG------CTTCC--------------CCTGGGCTTGAGCT-CCCAGGAGACACCCA----CCTGGCTGGTGCAGC------TTTCAGGGTTCC--ATCCCATG-------------------GCAGCGGCTTCTCCATCCTGCAGGC-AT-------GATGCC-----------CAGGAGGCATGGGAGGCTGGCA---CCA-GCCAACTGGACCCCCCTGTCT----CAGGTGCCCTGTGCCCCGGCCACCAGGGGTGG--CACCAGCATGTGG---CTGTGGGTGGCCTGGCTGCAGACAGTAGGCC------------------------------------CTGTCCCAGTAAAGGCAATGGTGGGAATGGGACTTGGATG-----GGGGTGGACAGAAGCGACCCTTCCCTCCTTGACCTTTGTCCCAAGCCTTCTGGA-----ACCCTCCCTTCACTCAGGAGCCAGACAGAACCCT------CCAGCTGGCAACTGGTGCCCTTGGCTCAGACCCCTGGTTGCT--G-GGCCTCCC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A----------------GGGG---C------CCACAGCTGGCTCTGGGCTCCCT--------------------------GA-CCTATTACCTCACCATGTTCCCAGGGATCTCCAAGAAGC-CTGCTGGT-------------------------------GGGGTGGCAGCTCCTGGCCTG-GCTGCAC---CACAGGGT-CC-TGGAGGTCCCTCAGCCTGTG--ATGCCTGGGGTGGC------------------CTAGGCTGGCCTGGACCCTGGTGCTCAGCTCTCCTGGGAGGGTCAGTGTGT------------------GGGGGCTTAGGCAGACAGCGGGAGGAGCTGGAGAAG---GGGGCTGCCTGTGCC----TGCCTTAGCATGAGGGT-------------CAT-CATTCTCCTGTACCCACCC--CACAT-GGCCTCTGCT-CCATGCCA---------------GGCCCACACTGG--GCCACAGCCCTCACAC----------------CAG-TGGGGGGTGGTCCAGCTGACAAGGTCAGAG-GCCCCTCCGGTGCTGTCAGAGTCTGCAGTCAGAGCAAGCATCCAAAAACCATGTGACCCA--TGGTAGTCCCAA-GT-CATGTAACAC---------------------------------------     
 5 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-189843_190199         85.3%  43.5%    ------------------------------------------------------------------------------CTGTGGGA--CC----CAAGCTGGGTCT-----GTG---TGATGTTTGCCCAGGATCTCCCACCTCTGCTGTCCTGGGTTG--------GTGCCCTGCCCCACGAGGCTGCCCCAAACCTAGGG------TGTGACTTAGGG-GGCTGTCCCCGCGCTGTGCT-CTG-GGGTCCCTTCC----CACTGATGTCACACAC---TCTGCCAGGGCTCT--GTTCTTGTGGCAG----------CCCATCTGCCTCCTCT------------------------CTAGTCTGG-------------GCCAGAGAGGCCAGCA---CCAGCGTGGGTGGATCCCAGTGCCCCGGAGACTCACTCCCAGCC-CTGTCACTGTGGGTGG--TATTAGAATGAGG---CTGTGGGTCCTCTGTCCTGG------------------------------------CTGC-------TGGTGTACATGGGGGCAGAGGGCAGGAATGTGGCCTGGTCTGGGAA----GGGCAGAACTGACCCGTTGCTCCCTGACCTTTGCCCCAAGC----TTTCCAGA-ACTCTCCCTATAGTCTGGGGCCGAAACTGTCCAC------CAGGTGGGTGGCTTGAGCCCTGGCCTGGCCCCTTGGACTCTG--GGCCTCCCAAGGT--TCAGAGCAGCTCTGAGCTGTGACCCCACTC-TCCCCCCT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCTCCTCCCCCTCCAC----------TC-CCATACTCATACCCACCTTCCTGGGGACTTCCTGGGAGC-CCCGCTGG----------------TGGGCCAACCACGGGGAACTGGGGGCTCCTGGCCTGGGCTGCAC---TGCAGGGCCCT-GGGAGGTCGCTCAGCCCCTG--ACCCGCGGGGTCTCCTTGGGCTCAG-----------------------------------CTGTGGTGTGCAGCTTTCCTGTG------------------AGGGACTTAGGTGGCAGAGGAG--GGAGCAGGTGAAGAGGAGGCTCGCATG------TCCCCAGGCTCCTCCAAGGTGGGACGTGGGTCCT-GGCTCTCCTACA-CCTTCTCACACAT-GGGCCTCGCT-CCCTGCCAGCCCGTCCT-GGTCCACAGCTCTCAGG--ACCTCTAACACGGCAG----------------GG--GG----GTGGCCCAGCTCATAAGGACAAAG-ACCCCTCCCCTGCTTCCAGGATGCTCAGTCAGAGCCAGCTCTTCCAAAGCCATGTGACCC--ACCTG------------------------------------------------------------     
 6 Equus_asinus-NC_052181.1-189968_190128                   85.7%  42.9%    ----------CT--------------------------------------------GCAGGCTGGGTGGT------GACTGCAGGA--CC----CAGGCTGGGTCT-----ATG---GGGTCTTTGCCCAGGATCTCCCACCTCTGCAGTCCTGGGTCCCATC-T--GCGCTCTGTCCCACAAGGCTGCCCCAAACCCAGGG------TGTAACTTAGGG-GCCTGCCCCTGGGCTGTGCT-CCTGGGATCGCTCCC----CAATGCTGTCACACAG---TCTGCCAAGACTCT--GTCCTTGTGACAG----------CCCATCTACCTCCTCT------------------------CCAATTCTGGGGTCTTGCTCAGGCCAGAGTGGCTAGAA---CCAGTATGGCTGGATCCCACTGCTCTGGGAGACTCACTCTCAGT-CAGCCACTGTGAGCAG--GATTGGAATGAGG---CTGTGGGCCCTCTGTCCTCG------------------------------------CTGC-------TGGAATGCGTGGGGACAGAGGGCAGGAATGTGGCCTGGCTTGGGAT----GGGAAGAACTGACCCGTTACTCCCTGACCTTTGCCCCAAGCAAGTTCTTGAGA-ACTCTCCCTATAGTCTGGGGCCAAAGCCGTCCAC------CAGGCAGGCAACTTGAGCCCTAGCCTGGC-CCTTGGACTCTG--GGCCTCCCAAGAT--TCATAGCGGCTCTGGTCAGTGACCTCATTT-GCCCCCTT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCCCCTCCCCCCTATG----------CC-CACCT---------------CCCACTGGTTCCTGGAAGA-CCCACTGG-----------------------CAGGCCTGCCACCGGGGGCTCCTGGCCTGGGCTGCAC---TGGAGGGCCCT-GGGAGGTCACTCAGCCTCCA--CCCCATGGGGCCGCCTTGGGCTCGG-----------------------------------CTGTGGGACACAGCTTTCCTGCG------------------AGGGACTTGGGTAGACAGAGCA-GGAAGCAGGTGAAGAGGAGGCTCCCGTG-------ACTCGGGCTCCTCCAAGGTGGGACGTGGGG----------CCTGTG-CCTTCTCACATGT-GGCCCTCGCT-CCCTGCCAGCCTGTCCT-GGTCCACAGCTCTGGGG--ACCCCTAACATGGCAG----------------AGG-GG----GTGGCCCAGCTGATGAGACCAAAG-GCCCCTCCCCTGCTTCCAGGATGCTCAATCAGAGCCAGCTCTTCCAAAGCCATGTGA----------------------------------------------------------------------     
 7 Castor_canadensis-NW_017871110.1-173868_174027           73.4%  29.1%    ---------------GCACTCCT--------GTAGGAGGGTCT--CAGGCAC--CACGAGGGACCCATAG-GACTCTCA--------------------------------------TAGA-----------CATTTTCTAGGGAGGCGGGCAGGGATAGG---------GGCAGGCCTTGGGGCCAGGCACCTGACCTGGA------CACTGCTGAGGGACCCTCTGCTCTGCCTAACCA-AGAATCCCC--CACT----CCCACCAGCTGCCTC-------CTCT--GGTCT--GCACTGTGGGCTT-------------TCCTGCCCCACCTCGTTGTGT--TGGCTGGG-----CCCATCCTGTCCCTCTACCACCCCCTAGCAGGGCA--------------GGCTGGTCCCA--TGTGGCTGGATCCTCCTCCTCACCCCCTCCACAGTGGGCAA--TACTAGTATGAGG---CTGTGGGATGTGGCCCGAGA--CAGCAAGCCCTCTGCTGG----------------GC---------ACTGGTACTTGGAGACTGAGGTCAGGAACGTAGC---CCAGATGGAGGATGGGCAGAACTGACCCTTCCTTCCCTGATCTTTGCCTCAAGTTTCTGGAA-----CCTTTCCCTGTAGCCCGGGACCCAAATAGTATCT-----TCTGGCAGGTGAATTGAGCCCTCAGGCCCAACTGCCTGGACTCTGGGCCTCCCCAAGGGCCACAGCTGGCTCTGGGCTTTGGCCTCATTT-TGCCTACT-CCCCTTACCTCTCACCTGGTCCCTGGGGATTTCATGGAGGCCCCTGGTGGGCCAGCCTCAGGACC----------TATTCACAAGATCTTGATT-----------AAACTGTTCTGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTTCAGAGCTCCCTCAGGGATGG-GCTGCAGTGAGGTCACTGAGCAGAAAGGTATGCTCCCTGTGCCTGCCAGCAGGAGCCA-------AG-----CCCAAACTTC-TGGAGAATTCTCAGCCACCC--AGTCCC-----CT-------------------CCCTGATGTGGTGGCCCATGGCCCACCACTGTGAG-----GGTGACTCCCA----------GC------ATGTGGGTAGGCAGAGCAGAGGGTGCCTGGTC--------------CAAAGGTC----AGCCTTGATCC-CCAAGGTAGAATGAGGGCTTCACTCCTTGCTCCACCCTACATG------GATTTCTGCT-CTACTCCAG---TCCCC-TTTGCACAGCTTTGGGA--CC-CCT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 8 Leopardus_geoffroyi-NC_059328.1-191974_192217            85.2%  42.0%    --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCCCCCCCCCACCGCGGCTGTCCTGGGTTGGTG-----------------------------TCTGCCCCACC------TTACCCCACGCG-GCCGTCCTCGGGGCTGTGCT-CCCAGGACCCCTCCC----CGCTACTCACACAG-----TTTGCTGGGGTTCC--ATCCTCGTGGAAG----------TGTGCCTGCCTCCTCTCCTATCCT--CCTAGG-------GGAAGCCCTGGGGTCTGACCCAGGCAGGAGAGGCTGGCA---CCAGCGTGGCTGGATGCTGATGCCCCGGGCAACTCACTCCCAGCCCAGCCACTGTGGGCAG--CATTGGGATGAGG---CCGTGGGTTCTCTGTCCCTG------------------------------------TTGC-------CGGTGTACGTGGGGGTGGAGGGTGGGAAAGTGGCCCTGTCTGGGAA----GGGCAGTACTGACTCATTATTCCCTACCCTTTGCCCTAAGCTTTCCAGAAG----CTTTTCCCTATATCTGGGGCCAAAGCTGTCCAC------CAGGTGGGTGGTTTGAGCCCGGACCCAGC-CCCCAGACTCTG--GGCCTCCCAAGGT--CCACAACTACTCTGGGCTCTGACCCCGTTT-GCCCCGCT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCCCCACTATCACCTGAT--------AT-CCCTCCCCCACCCCCGCCTACACGGGACTTCCTAGAAGC-CCTGCTGG----------------TGAACTTGCTTCCGGGAACTGAGGGCTCCCGGCCTGGGCTGCAT---GGCAGGGCCCT-GGGAGACCACTCAGCCTCTG--ACCAGGGCAGGGTGGCGGGGGTGGGGGGCGGCATCGATGCCCAGGGCCGCTTGGACTCGGCTTCCGTGTGCAGCTTTCCCGAG------------------ATGGATGTGGGTTAGGCAGCAGGGGGAGCCAG-GTAGGGGAGGCTCCCTGT----GCCCCTGGGGCTCCTCCA--------AGGGGGGACT-GGTTCTCCTGCA-CCTTCTCACACAT-AGGGCTCCCT-GCCAGGCC---TGCCCT-GGTCTGCAGCTCTTGAG--ACCCCGAC-ACGGTGG----------------GAA-TGAGGGGTGGGCCAGCTGATGGGACCAAAG-ACCCCTCCCCTGCGTCAAGGATCCT--GTCCGACACAGCTCTTCCAAAGCCATGTGATCC--ACC--------------------------------------------------------------     
 9 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-243254_243377      77.5%  34.5%    --------GT----------CTT-------------GGGGCCAAAATGCCCC--GGCCTGGGGCCTGCTC-AGGGCTCCACCACTC--TG--CGCAGCCACCTGTGCGGAGTTGTCATGACGATGGAC---TATGGGCCACCGCCACCAAGCAGAGTGGGGGC-T--GGGAGGTGGGAA------------CAGCAGGAGGA------ACAGCCTCGGGA-TCCCGGGCTGGGTTTGTGCG-GG--TTTTACACAGA----ACCTTCTACTATCGCCTTCGTGGTTGGTGCCCT--GCCCCTGGAGGCCACCCCTGCCCTGGCCTGGCCTCCTCTGTAGTTCTGCTGGCG--------GGAACCCTGGGGGTCTTGCCCAGGCAGGAGAGGCTGGCA---CCAGCTTGGCTGGATCCAC-TG-CCCAGGGGGACTCACTCCTGCTCAGCCACTGTGGGCGG--AATCGCTATGAGG---CTGTGGGGGACGTGGCCTGG------------------------------------------------------------------------------ACGGCGGGTCCTCTGTCCTGGCACTGGCCCACCCTTCCCTCCCTGACCTTTGCCCCAAGCTTTCTGGAACAG-TGTCCTCTGGCAGGC----------------------------------GATCGGAGCCCTTGGCCAGGCGTCCCGGACTCT--GGGCCTCCCTGGGCCTGCTGCCGGCTCTGTGCTCTGGCCCGTTTT-GCCCACCT-TCCCCCCAA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT-ACCCCACCCCCGCCATGTTCCTGGGGACGTCCTGGAAGC-CCCACCAG-----------------------------------------------------------------------------TGGGTCACTTGGCCTCTG--ACTCTTGGGGCATG----------------------------------------GCTGGGCTGCGGTGTTCAGGTTTCCTGTGGGGTGACCATGC------ACGGACTCAGGCAGACAGCAGGAGGGTCTGAA--------------------------------------GGAGGAGGAGATGTATGTCCT-CACCCTCCTGCC-GCTCCCCCCACATGGGCCTCTGCTCCACGCCAGGCCCACCCT-GGACCACAGCTCTCAGG--ACCCTTTACATGGCAG----------------TGG-G---GGGTGGC---------CCAGCCAAAG-ACACCTCCCCTGCTGTAAAAATCCTCAGTGAGAGCGAGCTATTCAAAGGACTTGTGACCTATTGGTAGTCCTGCTGGCCACTGAGTCCCAAGTCACGTGACACTGGAGGTGGCCAGTGGCCCTAGCC     
10 Hipposideros_armiger-NW_017731634.1-176301_176513        86.5%  43.2%    -------------------------------------------------------------GGAATAGCC------GGCGGAGCGG--CT----GCCGGGTCCTGG-----CCG---TAGTGTTTGCCCGTGACCTCCCACCACTGCTGTCCCTGGTTGGTC-----CTACCCTGCCCCGTGAGGCTGCCCCAAACCCAGGG------TGAGGCTGAGGG-AGCTGCCCCTG-GCTGTGCT-CCCGGCTCCCCTTCT----CAGTGCTGGCACAGCT---T--GTTGGGGCTCT--GTCCCAGTGGCTG----------CCTGTCTGTCTTCTCG--CTATGC--TGCTGG-------CGGGAGCACTGGGTCTTGCCCAGGCGGGAGAGGCTGGCA---CCAGCCTGGCTGGGTCCTGCTGCCCTGGGCAACTTGCTCTCAGCCCGGCCACTGTGGGCAG--CGTTGGAACGAGG---CT-GGGGTCCTCTGTCCCAG------------------------------------CTGC-------CTGTGTGTGTGGGGGCAGAGGGCGG------------GCAGAGGGC----GGGCAGAACCCACCCTTTGCTCCCTGAGCTTTGCCCCAAGCCTTCCAGA-GCT-CTTCTAAACTCAGCCTGGGGCCCAAACTGTCCTC------TCCGTGGGTGGTTTGAGCCCAGGCCC--------------CA--GGCCTCCCAAGGT--CTACAGCTGCTATGAGCTCGGAACCCGTTT-GTCCCCTT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCCTC-----TACCA----------CC-TGTATCCACCCCCCACATTCCTGGGGACTTCCCGGAAGC-CCCACTGG----------------TGGCCCTGCCACCGAGAACCGGGGGCTTTTGGCCTGGGCTGCAC---CCCAGGGCCCT-GGAAGACCATGCAGCTCCCG--ACT-CCGGGGCCGCTTCGGGCTTGG-----------------------------------CTGCAGTGGGCAGCTTTCCTGTG------------------AAGGACTTGGGGAGGCCGCAGGAGGGGCCAGGTGAAGAGGCGGCTCCCTGTGGCCCCGCCTCGGGCTCCTCCAAGGTGGGCTCTGGGTCCT-GGCTCA-------CCTTCTCACACAG-GGCCCGTGCT-CTCTGC---------CA-GGCCCACAGCTCTCAGG--ACCCCTAACATGGCAA----------------TGA-GGGGGGGTGGCCCCACTGAGGAGGCCAAAGGCCCCCTCCCCTGCCTCA----AGGGTCCTTACAGCCAGCTCTTCCAGAGCCATGGGACCC--AC---------------------------------------------------------------     
11 Camelus_bactrianus-NW_011514262.1-178913_179116          87.9%  38.0%    --CCTTTCGCCTCCACGGCTGCT----------------------------------------CCTGGGC-CCCTGGGCAGGGCTG--GG----TGCTGGGCATTGGGAGCAGC---GGC------------TGGACGCTGCGGGACCCAGGCTGGTCTGG------GTGCTGTCTGTCCGGGACCTGC--CCTCACCAGGG------CC-CCACGAGG---------CCGCACCAAACCC-AGGGCATGACTCAGG----GGC------TGTCTCC---C-CAGAATGTGCTT-----------TCAA----------GGTCCCTCAGTCTTCTGGGACTCTGTTCCTGTGGCA---GCCCACCTG--------CCTCCCCCCAGTCGTGCTGGTGGGAGCACT-GGGGGCTTGCCCAGGT----GGGAGATGCTCAGGGCAACTCGCTCCCAGCCTGGC--CACTGGAGTGCGG---CT-GGGGCCCTCTGTCCCAA------------------------------------CAGC-------TGGTGTGCC-CAGGGTGGGGAGAAGGAATGTGGCTTGGTTTGGGACGGGCAGAACTGACCCACCCGTTGCTCCCTGACCTTCGCCCTAAGCTTTGCAGA-----ACTACCCCCACAGTCTGGGGCCAAAGCTGTCCAC------CAGCTGGGTGGCTGGAGCTCTGACCCCTGGACTCTGGACCTC--TGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G---GCCACAGCTGCTCCGAGCTCTGGCCTCATTTGCCCTTCTGCCTCCACT--------GC-CCATACCCACCCCCTCATTCCTGGGGTTGGCCAGGAGGC-CCCGTTGG----------------TGGGCCTGCCTCCGGGAGCTGGGGGGTCCCGGCCTGGGCT-GCA---CTCGGGGCCCT-GGGAGGTCGCTCAGCCTCTG--G---------------------------CGCGCAGATGGGCACAGCCGCTGCGGCCTTGGCTGCCACACGCAGCCTTCTCGCC------------------AGGGACTTGGGCAGGCAGCAGGGG--GCCA----------------GGAGAGCC----CCCCGGGCTCTTCCAAGGTGGGACGTGGGGCCG-GGCTCTCCTGCG-CCTTCTCCCACCA-GGC--CTGCT-CCCTGCCGGCCCACCCT-GGTCCACGGTTCTCAGG--ACCCCTCACACAGCGG-----------------GG-TGGGGGGTGGCCCAGCCGAGGAGGCCAAAG-ACCC-CTCCCCTG-CCGAGGACCGCA--GTAGCGCCAGCTCTTCCAAAGCCATGTGACC--------------------------------------------------------------------     
12 Mustela_putorius-NW_025422005.1-191053_191112            89.0%  37.5%    --------GC-----------------CCAAA--------------------------AGTCCCTGGCAG-GCATTGGCCGTACCT--C----------------GACCTGCAGGGCTGCCTCAAGCCCAGGACATCAGAGAGGGCTACAGCTGGGACAGT------TCTCCCAGAACGCCTCCCCTAA--CATGT---------------ACAGATTAA-TGCGTTCTGTTCTTGTGGCC-GCACTGCTAGAAAAG----CTCTGGGGTTGGACAG---GAGAGACTTGCACC--AGCC-----TCAC--------------GGTTCCTGATGTCCAGACCAACTCCAAACCCTAACCCTAACCCTAGCCCTAACCCTAGCCCTTACCCCAACCCTA--TCC-CTATCCCCTAACCCT-ACCCCTAACCCTAACCTCCTCAGCCCAGCCACTGTGGGCAG--CCCTGGGACGAGG---CTGTGGGTTCTCTGTCACGG------------------------------------TGGC-------TGGTGTGCATGGGGGGAGGGTAGAGGTGAGAGTACGGTCCTGTCTGGGATGGGCAGTTCTGACTCATTATTCCCTGTCCTTCACCCTAAGCTTTCTAGA-----ACATCTA------TCTGGGACAAAAACTGTCCAC------CAGGAAGGCCGTTTGAGCCCTCAGCCAGGCCTCTGG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ACTCTGGGCTCTGACCCGCGGTGCCCC------------------------------CTTTCCCTTCTGTCACCAGTGACGCACCCACA-GCTGCATTAC----TCGGGAATGGTGGGTCTGCATCTGGGACCTGGGGGCTCCAGGCCTGCT-G-CAC---CACAGGGCCCT-GGGAGGTCCCTTGGCCTCTG--GCT-------------------CCTGGGGTCACTGATGTGCAGGGCTGTCTTGGGCTCATCTTTGTGGTGCAGCTCACCCGTG------------------AGAGATGTGGGGAGGCAGCAGGAGAGGCAG----------------GGAGAGGAGGCGCCCTGGGTCCCTCCAAGGTTGGCCTGGGTCCTG--GTTCCCCTGTA-CCTCCTCCCATAC-GGG---GACT-TCTGCCGGGACAGCCCT-GGTCCATAGCTCTTGAG--TTGCCTAGCCCGGTGG----------------GGA-TGAGGGGTGGCCCAGCCGATGGAACCAAAG-ACCCTTCCCCGGCTTCAAGGATCTGAAGCCGTAGACAGTTCTTCTGAAGCCGTGTGACCC--AC---------------------------------------------------------------     
13 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-190225_190348            77.2%  32.8%    --------------------------------------------------------GTGGTGGGAATAGC-AGGAAGCGGATACAG--CT--TTAGGGATCCCAGGCTGGGCTTACGTGGGTTTTAGCCAGGATCTGTCTTTGCACCCCACCCAGCA----------------------CCTTGAGTAC--CAGACCGAGGG------CTGGCCTTAGGA-GCTGCCTCTGGACCTGCACT-CCTAGGGTTCTCTCC----CTGTCCTTCTGCCAC-------------AGTTT--GTCCTGTG-GTCA----------CACCTTTGCCTCCTCT--CTGCCTGCTGCAT--------GAAGCCCTGGAGGTCTTGACCAGGCAGGAGAGGAGGCACAGCCCG--CTGGATATGCAGCC----CTGTGTGACTCTGTCCCCAGCCCAGTCACTGTAGGCAG--CATTGGTATGAAG---CTGTGGGGGATGTGGCTCAGGACAGTGGGTCCTCTGTGC-----------TGGCCAGTGC-------TGGCATACATGGACTCGGAGGGCAGGAATGTGATTGGGA----GGGAGATGAGCAGAACTGACCCTTCCCTCCTTGACCTTTGTCCCAGCTTTCCAGAT-----CCTCTCCTTGTGGTCTGGGACCAAAACAGTGTCCC----TTGAGCAGGTGATTTGCACCCTTGGCCTGGACTCCAACCTCAT--TTTCCTACCT------CTGCCCACCTCATTCCCTTGATCCTGGGG-ATTCTCAT-TGCCTAGGG--CCA---------------------CCCTGGGCTGGGTGAGGCTCAGTGGTCA------------------------GTT------------------CTCCTGTGAGGGTCACTGAACAGGGGCTTAGGCAGACAAAGAGAGGGCCAGGGAAGGGGGCGCTCTGTGCCCACAGGGCTCCTCCAAAGTAGG--------ATATGGTCCTTACTCCCTGGCTCCTCCTCACATGAGGGCCTC---CACTGT---------------ATGCCCAGCCCACCCTGGCCCCAGCTCTCAGGACCTT-----TA-----ACACGGCAGT-CAGGAACCATTCAGTCGATG--AGGCAGGATCCCTCCCTGCTGTTAG----AATCCTTAGAGCAAGCTACTCGTTGACTCACTTGTGAT----------------------------------------TTGGCCAATCCCTGAGTCCAGTCA---------------------------------------TGTGATATGGCAAGTGGCCAGT-GCCTGGCCTCAAACATTGCCC-------------------------------------------------------------------------------------------------------CTCTGGTCAGCCCTG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
14 Balaenoptera_acutorostrata-NW_006725355.1-189163_189229  71.0%  30.3%    --------GCCTTCAGGCCTGGTCCAGCCACGTGGGTCTGGCCGGCTCCCAC--CCCCAGGGCTCTGGGC-CCATTGCCAGCTCAC--TC----CAGCATTCGTCCAGCAGACG---TGC------------AGATGCCTCTGGGTGCCAGCAGGGTGTGC------CTGCCCACCGT-CC-------T--CGACCCCA-GG------CT-GCCCCACC---------CCTCCTGAGAGGC-CGAGTGCTCCCCGGG----CAC------TGCCTAG-----CTGAA------------------------------------GCTCAGGGGTCTGGACCCCTCATCCCGGGCCC---GGGCTGGGGAGGGGAAGGCCACCCGCTGAGGGGACAGCGCTCCCACAGGGGGGCTTGGACCGC--------AGACAGCCTGGG--TGCGGCTACTGTGGGCAG--CACCGGAGTGAGG---CTGAGGGGCCGCTCTTCCAA------------------------------------CAGC-------TGCCAGGCTCGGGGGTGGGGGGAGGGAATGTGGCCTGGGCTGGGAT----GGGCAGAACTGACCCGTTGCTCCCTGACCTTTGCCCTAAGCTCTCCAGA-----ACTCTTCCTACCGTCTGGGGCCAAAACTGTCCAC------CAGCTGGGTGGTTTGAGCCCTGGGCCCCTGACTCTGGGCCTC--CTGGTCCAGTAAC--AGCTGGGCCAGGCAGGGCCTGTGTGTGTCA-GCGGCCCG-GGGCCACAG--ACACCTGGTGTCAGA--------CGCCTGCGACAGTGGTGGCTCTGGCACTAAC----------TGCCCTTAAGAAGTTACTCTGT--GT--CCAGACTCAACTTGCTGTCACTCAGAATGGCTATAGAAACTGTTGAA---CAAAATCCAGCTCCGAGCTCTAACCCCATTTGCCCCTCCCCCTCCACT--------AC-ACACCCACCCCCCCACATTCCCGGGGACGTGCAGGTAGC-CCCACTGG----------------TAGCCCTGCCTCTGGGAGCGGGGGGCTCCTGGGGGCTGCA-CC-----GTGGGGCCCT-GGGAAATCACTCAGCCTCTG--ACA-------------------CACGGGTCCACCGATGGGCAAGGCCACCTTGGGCTCGGCTGCCATGCGCAGTTTTCTTGCG------------------AGGGACTTGGGGAGGTGACAGGAGGGGCCG----------------GGGGAGCC----CCCTGGGCTCCTC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
15 Lemur_catta-NC_059130.1-176840_176950                    81.5%  30.7%    --------------------------------------------------------------------------TGCTCACAGGCCGGTGCCTGGGCCCTGCCCCACTGACCAGGGACCTGGAGTCCTGAGGTTCAGCCCCTCAGCCCAGGCCCAGGTGGGGACGGGGTGACCACCCTGGTGGCAGAAATGGAGC--------------CACGCTGGAGAGGGGAAACCAGACCCGGTGGAACGAGTGGTCCCGTGGGAGGGGCTCAGGCTGCATGGGGCCCCCAGGGCCTTCGG-GTGCTGCTGAGCCCCCTGGAG-C--CCTCAAGATGCTCCCAGTCCTGCTGGGG---------TGACACCCTGGGGCCTGGCCCAGGTGGGAGGGGCCC-CA---CCAGCCCGGCTGCGTCCCT-----------------------GGCCTGTCGCT--GGGCAG--CAGGGC-TGCGGT---GACGT--------GGCCCCA------------GACAGCCGGGCCT-----------CG---------TCCTGGCCAAGGTGACAGAGGGCGG-----GAATGTGGCCCGAGGAGAAAGGGCAGGACTGACCCCTCCTTCCCTGACCTTTGGCCGGAGCTTCCAGCA-----CTTCTCCCTAAAAACCCGTGTCCTCC---------------GGGCAGGGAAGTTGAGCCCCTGGCCTGGCTCCCGGGCCCTA--AGCATCC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCACCCCCCTCCACGGTC-CTGGGACCCCCGG---GGG-CCCTGCC----------------GGTGGGCTGCCCTGGGGGCCTGGGCGCTGCTGGCCGTGA-GGCAC---CGCGGGGCCC--TGGAGGTCCTCGGTCTTCAA--CGC--------------------GGGGCTGCACTGAGCCGGGCTGCCCG-----GGTGCCCC-----GCGA----------GG--------GTTACTGCACAGGGACCCGGGCGGACGGCAGG-GGCGG------------------------------GGGACGGGGGCTCCCAGGCAGGATCTGGGTCCT-CGCCCTCCCGCG-CCTCCCCACTCTCTGGCCTCCACTCCACGCTGCACCCACCAG-CGACCCCAGCCCTCAAG--TCCCACCCAAGGTGGC-CGTCCCCATCGGGGCTGGCAGGGACGGGGCCGGGAG-GGGTGGAGGGAG---GGCTGGGG-AGCCGCCTGAGGCCAGCCCTGGCCG-G-TGAGGGCCCAGCCTGGG------TTCCGCCCCTGCTGTGGCCTAG---ATGACAGGCGTGACCCTCGAGAGCT---------------     
16 Oryx_dammah-NW_024070205.1-179417_179459                 83.9%  33.0%    ------------------CTGGCCCCAGGACTTCTCAGGGCCCTCATCCCAC-------CTGCCTCACAT-GCAGTGTCAGCTCAT--G-------------------GTGATGGGCTGGGGGTGA------CCACCACTGGGAAGG---------GCTGG------GGGCTGGGTATTGGGAACCAGG--AGTGGCTGTGG------ACTCATCCTGGA-TCTGGGTGGTGTTCACCTTG-GACCTCTTGCCAGTG----TCC------TGACCCG---GGGAGCTGCCCCCG----C------ACTG----------TGCTCCTGGGTCCCCTCCCCCACACTGCCATCACGC---TGTTTGCT-----GAGGCCTCCCTCCTGCCTTGCTGATGG--GGACATGGGGGTTCACCCA------GGCAGGAGAGGTGGGTACCAGGCTGGCTGTGGGCAG--TGTTGGCATGAGG---CTGAGGGGCAACTGTCCCAA------------------------------------CAGC-------TGGCATACCTGGGGGTGGAGGGAGGGAATGGGGCCCAGTGTGGGAA----GGGCAGCAGTGACCCCTTGCTCCCTGACCTTTGCCCTAAGCTTTCCACA-----ACTCTCCCTACAGTCTGGGGCCCAAATCAACTGG------GTGGTTTGGCGTCCTGGATCTG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAGCTGCTCCAAGCTTTGACCCCATCTGTCCACTCCAC--------------TG-TCCCTACCTGCCCCAGATTCCTGGGGGTGTCCAGGAAGC-CCTACTGGAA----GCCCAGAGGGTGGGCCTGTCTCCAAGAGCTGGAGGTTTCTGGGGGCTGCA-CT-----GTGG-G--------------------GCCCT--AAG-------------------AATCGCTCAGCCTCTGACATGGGGCCACCTGGCCTTGGCTGTTGTGTGCAACTTTCTTGAG------------------AGGGACTTGGGCAGATGGCAGGAGGGGCCA----------------GGTGAGCC----CCCTCCGCTCCTCCAACATGGGACACTGTCCTG--GCCCTCCTGCA-CCTTCTCATACCA-GGC-CTCACT-CCTGCTAGCCC-ACTCT-G--------------AG--ATCCCCAGCATGGTGT----------------CAG-TGGGGGATGGCCCAGCTGATGAGGCCAAAG-ACCC-TCCCCCTG-GCAGGGATCCTTGGCCAGTGCCAGCTCTTCCAAAGCCAGGGGACCC--TCTATCTTCTGCTGGCCATCGAGTCCCAAGTCTT-------------------------------     
17 Lipotes_vexillifer-NW_006774135.1-189600_189749          85.0%  36.2%    ----------------------TCCAGCCACGTGGGTCTGGCCAGCTCCCAC--CCCCAGGGCTCTGGGC-CCACTGCCAACTCAC--TC----CAACATTTGTCCAGCAGACG---TGC------------AGGTGCCTCTGGGTGCCAGCAGGGTGTGC------CTGCCTCTACTGTC-------C--CCGGCCCC-AG------GC-GCCCCATC---------CGTCCTGAGAGGC-TGAGCGCTCCCTGGG----CGC------TGCCTGG-----CTGAAGCTCAGG-----------GCCC----------AGAGGCTCAGGGGTCTGGACCCCTCATCCCGGGCCC---GGGTTGGGGAGGGGAAGGCCACCCCCTGAGGGGACAGCGCTGCCACAGCGGGGCTTGGACCGC--------AGATGGCGTGGG--TGCGGCTACTATGGGCAG--CGCCGGAGTGAGG---CTGAGGGACCACTGTTCCGA------------------------------------CA--------------------GGGGTGGAGGGAGGGAATGAGGCCCGGGCTGGGAT----GGGCAGAACTGACCCGTTGCTCCCTGACCTTCGCCCTAAGCTCTCCAGA-----GCTCTTCCTACCGTCTGTGGCCAAAACTGTCCAC------CGGCTGGGTGGTTTGAGCCCTGGGCCCTGACTCTGGGCCTCC--TGGGTCCACA-GC--TGCTCTGAGCTCTGACCC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CATTTGCCCC-TCCCCCCCACT--------AC---ATACCCATCCCCACATTCCTGGGGATGTCCAGGTAGC-CTTGCTCG----------------TGGGCCTGCCTCTGGGAGCGGGGGGCTCCTGGGGGCTGCA-CT-----GTGGGGCCCT-GGGAAATCACTCAGCCTCTG--ACA-------------------CACGGGTCCACCGATGGGCAAGGCCACCTTGGGCTCGGCTGCCATGTGCAGCTTTCTTGCG------------------AGGGACTTGGAGAGGCGACAGGAGGGGCCA----------------GGTGAGCC----CCCTGGGCTCCTCCAAGGTGGGACGTGGTCCTA--GCCCTCCGGCA-CCTTCTCACACCA-GAC-CTCGTT-CCCTGCCAGTCCGCCCT-GGTCCACAGCCCTCGAG--ACTGTCGAG------------------------GG-TGGCGGGTGACCCGGCTGATGATGCCAAAG-ACCC-CTCCCCTG-CCAAGGGTCTCA-GTCAGCACCAGCTCTTCCAAACCCAGGGGACCC--TCT--------------------------------------------------------------     
18 Cavia_porcellus-NT_176233.1-180213_180299                71.6%  27.1%    -------------------TCCC-------------TGAGGCAGGCTGTGGG--GCCCAGCCCTGCCTGG-GACTTCCTGGGGCCC--TG--CCCCACCAGCCTCTGGCTCAGAGTCAGCCTCTTGTGAAGGCCATGTCACCACCAGGTGGGTGGTGCT--------GGGTGCAGGA--------------CAGCAG---GA------GGGGCACCACGGAGATCCTCCTGGGGCTGCCCA-AGCCGGGCCT-GAGG----GCCTGCCCCTCCCC----------AGGGGCTGT--GTGGCAGGTCCTG-------ACCCCTGGCAGCCATGGCTACCTCTCT----G-----------CTGGCCTGGTGGT---GTCCCTGGGGAGAAGGCGGGCA---CCCTCATGGCCGGATCCCACT------------------GCCCTTGTGGCACTGGGCAGGG--GGTGGGGGTATGG------------------CCCTG--------------GGCAGGGGCGCTGTCCTGGCACTGGC---------ACTGGCATGGGAGGCAGGGCTGGGCATGGGGGCTGGA----TGAGGACAGGTAGAGCTGACCCTTTC-TTCCTGACCTTTGTGCCCGGCTCTTGGAAGCCT-CTTCCTGTGGTGGCCTGAGCCCAGGCCCAACCAA-------CCTCCTGTACTTCAGGACCTAATCGGTCATAGCTAGGTCTG--GGCTC-------------TGACACATGTGTCCGCTCCCTGGACTG-TCA-------------CCTCCCACCTGTTGCCTCCCACTCTCCCAGATGGCCCGATGGCT-CTGCCTCAGGGCT-----GGTGCAGGGCTCTGGGGGCTGCTTGGCTTTGGGGATCAGTTCTCTAGGAGTCACCCAGCAGGGACCCAGTGATA------------------GCAGGTGGCTCTGGTGCCTGCTGGCTC------------------------------------------CTTGGAGTGGTATGTGGAGC-CCTGCATA----------------------------CAGGTGTGGGACCCTCCCTCCAC--GCTGCAC---AAGGTGCCCAGCGGATGAGTCCAGAGACCCTACCCCTGCTGGAAGAACCCCAGG-CCAG--GGAC-ACTGGGTGGTCTGTGCCTCTGGCCTCAAATGTCACCCTGCTGT----GGTC------------------AGTTAGATGTGCTGGTGAGATGGGGAGCTGTGGAAGGGTGACCCTCGCTGCCCT---------G------GCCAG-----------------------CC-----CGCACTCACACCC----------------CCGACCCGGCCCA-GATGCAGGGC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
19 Physeter_catodon-NC_041216.1-191622_191688               82.6%  35.2%    TTGGCCCAGCCTTCAGGCCTGGTCCAGCCATGGGGGTCTGGCCGGCTCCCGC--CCCCAGGGCTCTGGGC-CCGTTGCCAAC----------------------------TCCG---TGC------------AGCTGCCTCTGGGTGCCAGCAGGGGGTGC------CTGCCCGCTG-TCC-------C--CGACCCCA-GG------CC-GCCCCATC---------CCTCCTGAGAGGC-CGAGTGCTCCCCGGG----CAC------TGCCTAG-----CTGAAGCTCAGG-----------GTCC----------GGAAGCTCAGGGGTCTGGACCCCTCATCCCGGGCCC---GGGTTGGCGGGGGGAAGGCCACCC-CCGAGGGGACAGCGCTCCCACAGGAGGGCTCGGGCCGC--------AGACAGCGTGGG--CGCGGCCGCTGTGGGCAG--CACTGGAGCGAGG---CTGAGGGGCTGCTGTTCCAG------------------------------------CAGC-------TGCCGTGCTCGGAGGTTGGGGGAGGGAATGTGGCCCGGGCTGGGGC----GGGCAGAACGGACCCGTTGCTCCCTGACCTTTGCCCTAAGCTCTCCAGA-----ACTCTTCCTGCCGTCTGGGGCCCAAACTGCCCGC------CAGCTGGGTGCTTTGAGCCCTGGCCCCTGACTCTGGGCCTCC--TGGGTCCACCAGC--TGCTCCGAGCTCTGACCC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CATTTGCCCCTCCCCCTCCACT--------GC---ATACCCATCCCCACATTCCTGGGGATGTCCAGGTAGC-CCCGCTGG----------------TGGGCCTGCCTCTGGGAGCGGGGGGCTCCTGGGGGCTGCA-CT-----GTGGGACCCT-GGGAAATCACTCAGCCTCTG--ACA-------------------CACGGGTCCACCGACGGGCCAGGCCACCTTGGGCTCGGCCGCCATGCGCAGCTTTCTTGCG------------------ACGGATTTGGGGAGGTGACAGGAGGGGCCA----------------GGTGAGCC----CCCTGGGCTCCTGCAAGGGGGGACGTGGTCCCG--GCTCTGCTGCG-CCTTCTCACACCA-GGC-CTCGTT-CCCTGCCAGCCCACCCT-GGTCCACAGCTCTCGAG--ACCCCTAGCGCGGCAG----------------CGG-TGGCGGGTGGCCGGGCTCCTGATGCCAGAG-ACCC-CTCCCCTG-CCAAGGATCCTCAGTCAGCGCCAGCT---------------------------------------------------------------------------------------     
20 Orycteropus_afer-NW_006921723.1-171436_171518            66.7%  24.0%    -------------------------------------------------------------------------------------------TGTCAGGAACTG--------C-----TGGG---A-----CCACCTGCAAGGGATCCCAAGCTAGAGGTATGGGT--CTGCCCGCAGTGCCCCCACTGCCCTCCCAGTTCG-------GAACCCTCTGCACCCCGCCTCTTG----------AGGCTGCCCCCTAGG---CCCATGTTCCTGGGCCC-----CCCTTGACCTGT---AGCTGTTGGGGT--------TCCCGCACTCTGTGCTGTCCTCTTGTCCTGCCGTGCAGCACAACGTGCTGGCCATCTTATCAGGCTGGGTTCTGCTGCTGC--TGCTCTGGGGTGATTCCCT------------------CCCTAGCTTGGCTACTGTAGGGGCATCAGTGAGGTGACCTGGTCATGGATAGTAGGTTCGAG---GTAGGTTAATAGGTAGGCTAGAGCCTCTGTCT-AGGC----TCCTGGCCTCTGTAA--AGGAGAGGAAGGAATGTGGCCC--AGGATAGGAGATGAGCAGAAATGATCTTTCTGTCCCCAACCTTTGCCCTCAAGCTTTCCAGAGTC--TAGGGCATAGTGCCTAAGACATTTGACTGCTAA--CCAGAAGGTTGGTGGTTCAAACCCACCAGCCACTCTGCGGAAGGAA----T-------------ACTGGGCAATCTACGTCCATAATGATTTACTGCCTCAGAATCCCAAAGGGGGTCACTATGAGTCAGAATTGACTCTATGGCAGTGAGTTTGGTTCTGGAGGGCTGAAACAGTACCCACAGCAAGAGGTTGTAGCCTTGGC--TGTGTCTCCTGGCTCTGGGCCTCCCCAAGGGCACAT------------------AGCTGGAAGCAAGCATTGACCGCTTTTTCACCCACCTCGCCCATCTCCACCCCTCCCTGCCACATGCACACATTCCTGGGGACTTCCTGGGAAG-CCCTGATG---------------GAGGAACTGCTGCT-GAAAACCAAAGTTCTTGGCCTTGACAGCAC----------CACT-AGATGAGTCCTGGAGTGGGG--ACT-AAAGAGCCACTTGGCTACTGTGTGCAGGAACACCTTGAGGGTGGA-TTGGGGTTCAAATTCCCATGAAGGTGACCTGCA-------------------AGGACTATAATATATGACAGGGAGCT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
21 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-175656_175704          82.2%  31.1%    ---------------------------------------------------------------------------------ATGCAGGGGATTGCGGGAAAGCCTCATGGCCAGGACTCAGGTGG-----------------------------GTGAG-------GGTGAGGGGTGGGACGGCAGGAGGACAGCCCCAGGAACCCAGGCAGGTTATGTGGGTTTTACCAGGGTCTGCCTC---ACTGCTGTTGTAACTGGCAGCCGGGTTCCCC-----ACACATGGAGGTCAGGTCACAGCTTACCAGGCTCAGTCCCATGGCAGCTATCTCTCCAGCCCTGCAGGG---------GAATGCCCTGAGGCCTGGCCTGGGGGGAGGTGG----CA---CCAGCCCAGCTGCATCCTGTA-CACCTGGCTGACTTCTCCCCAGCCTGTCACTGTGGGTGG--CACAGCTATAGTG---ATGTG--------GACCCAG------------ACAATGGGGCCTC-----------CA---------TCCTGGCAAAGGTGTGTGTGGAGGC-----AGAGTGTGGGAA--TGTGGCCTGAAGGGGGAAGGGCAAGACCCTGAAGCTTTCCAGCACCCCTCCCTAC-----AGTCTGCAGCCAAACCAGTGTCCTCC---------------AGGCAGGTGAT-TTGGCCCGTGTCCTGGCTCCTAGGTTCTG--AATACCA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCCCCAA--------CTCTGCCCACACATTTCTGAGAG-CCCTGCC----------------AGTGGCCTGCCATGGGGGCCTGGGTGCTTCTGGCCCTGACTGCAC---AACAGGGCTC--TGAAAATCCCTCAGCCTTTA--ATGCTT-----------------GGGGCCAGGCTGAGCTGGGGGGTAGC-----ACTAGGCTTTCCTGTGATGGCCACTAGG----------GCAGACAACAGGGATCGGGAGATGGAGGCTCCCTGTG------------------------------CCCCTGGCTCCTCCCAGGCAGGATATAGGTCCT-CACCCTCCTGCG-TCTCCCCACTCTCCAGTCTCTGCTCCATGCTGGGCCCACCAG-TGACCCCAGCCCTCAAG--CATCACCCCACCGTGGCCATCCCTGATGTGGTAACCAGAGGCAGGGCCTGGATGTGGTGGAGGGAA---GACTGGGG-AGCTGCCTGAGGCTAGCCTGGG-TCAA-TGATGAGCTAGCCTGGT------TCACGCTCCTGCTCTGGCTTAG---ATGATGGATGTGACCCTTGAAAGC----------------     
22 Miniopterus_natalensis-NW_015504651.1-677134_677238      70.6%  27.3%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GACAGTGGCCGAGACCAGGGTCCTCTCATCTCTGC-TGTGGAGACT---GGAGCCAGGCCCCCCATGCACATCATAGGCCCCGGGGCTCT-GCTGCTTGAGGGGCAGCTATT--------GTCACAACGGGCGCACGGCCCAGGGTGGGCAT--TGGCTCCGGGAGG---CTGCTGGCTCCTGGTGCAGGG-GCCTGGCTCTCAGGGTGGGTCACGGTGCTGGGTTCAGCTGCAGGTTCACCTCCAAAGG-CTTGGGCTAGGGGAGGTGGGGTCAG-----GTCTGTGTTAGAGGCTCACCCAGTGGTCTCGGTGGGA-----------GTCCGAAGGGG-AGTCTGCTGAGGGTCCCACACATGCACAGCGACATGCAAGGAGGAGGGTGTGTGTGGGGCTGACTGAG-------AAGTGGGTGTGGGCCAGGA--------GGACCCCTGTGAATGCGGCTCAGGCTG-GGCCGCAG-GGACCCACGGGCCCGGTGTTGCAGGAGGCGGACACGGATGCCCAGCAGGGC---------ACCCT----------GGGCTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCT--ACAAGATGATGTCG----------------------ACCCGCCGGGA------CCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGTGA--------------------------CCACAAGGACCACCTGGCTGCCGCCGACCTCCAGCGCTT-CCTGGAGG----TGGAGCAGAAGGTGGGGCGCCCGGCAGGGG--TGGGGCTCCTGGCCACAGG--CA----CTGAGCTTCAA-GGGGGAGCCCAC---ACGTG--ACCACGGCACCATCCTCAG--TGGGGAGCACTTCCAGGGGCCAGG-GTTCCCGGCCTAGCCTTCCCC----CCTGTTCCTGCCACATGGGTCTGGCTGGCTCATGCCCCGTGTGGGCAGCAGGAGGGGCCAGGTGCAGGGGAGGCTCCCTGTGCC----------------------------------------------CCCA-GGCTCCCCCCAGT-GGGCCCCGCTCCCTGCCAAGCCCACTCT-GGCCCACAGCTCTCAGG--GCCCCTAATGCAGC-------------------AA-TAGGGGGTGGCCTGGCCGATGAGGCCAAAG-ACCCCTCCCCTGCTTGGAGGATACTTAGTTATGTGACCCACCTGTAGTCTGCTGAC-----------------------------------------------------------------------     
23 Microcebus_murinus-NC_033661.1-175604_175714             83.1%  33.9%    -----------------------CCC-AGTAGGACATGTGGCCCCTTCCCTCGGCTGGAGGGAGCCCTGT-CCATGCTCACAGGCCAGTGCTTGGGCCCTGCCCCGCTGACCAGGGACCTGGTGTCCAGAGGTTTAGGCCCTGGGCCCAGGTAGGGATGGGGA-----TGACCACTCTGGTGGCAGAAATGGAGGTCCAG--------CCATGCCGGGGAGGGGAAACTAGACCCCTGGTGGAAAGAGCTCCCGTGGGAGGGCCTGGGGCTGCACGGGGCTGGCAG----------------GTGAGCTCCCTGGAGCC--CTCACAGATGCTTTCCGGTCCTGCTGGG---------TGGCATCCTGGGGCCTGACCCAGGTGGGAGAGGCAG-CA---CCAGGCCAGCTGCGTCCCC-----------------------GGCCTGTGGCT--GGACAG--CCAGGC-ATGGTG---ATGT---------GGCCCAG------------ACGGCCAGGCCTC-----------CC---------TCCTGGCAAAGGC-------GCGTG-----GGGCAGCAGAGGGTCGGGAAGTGCAGGACTGACTCCTCCTTCCCTGACCTGTGGCCCGAGCTTCCAGCA-----CCTCTCCCTAAAAACCAGTGTGTCCTG-------------TGGGCAGAGGATCTGAGCCCCTTGCCTGGCTCTCGGGCTCTG--AGCGTCC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCACTACCCCACCACGGTCATGGGGTCCTACGGGGCCC-CCTGCCA----------------GTGGGCCTGCCCTGGGGGCCTGGGCGCTCCTGGCCCTGACGGCAC---CGCAGGACCC--CGGAGGTCCTTGGCCTTCAA--CAC--------------------GGGGCTGCGCTGAGCTGGGCTGCGGC-----GCTTGGCTGTCCTGCGAGGGTTACCGTGG--------GTTACCGTGCAGGGACTTGGGCGGACGGCAGGGGTCAG------------------------------GGGATGGGGACTCCCAGGCGAGATCCGGGTCCT-CTTCCTCCTGCG-TCTCCCCACACTCCG-GCTCCACTGCACGCTGGGCCCACCGG-TGACCCCAGCCCTCAAG--GACCACCGAGG-TGGC-CGTCCCGGACGGGGTTGGCAGGGCCGGGGCCAGGAGGGGGTGGAGGGAG---GGCTGGGGGAGCTGCCTGAGGCCAGCCTGGGGCCAG-TGAGGTGCCAGC----------------------------------------------------------------------------     
24 Sus_scrofa-NC_010448.4-178903_178988                     87.6%  36.1%    -------GGCCTCCG-------------------TGCCCCCCTGCCTCCC---------GTGCAGAGTCA-CCGTGGGCCAGATGG--GG----CACTGGGCATGGCAGGGACTGGGTGGCGTTTG------CCCTGGATCTCCCGCTCTGCCCGGTGAGG------CTGCCCCAAA-------CCTGG--CAGTAACAGGC------TGTGCCCCAGGC-TCCTTTCCGGACTGTGCCCC-AGGCTCCTTTCCGGC----CGC------TGTGACA---GTTTGCAGGTCTCT--ATCCTTGTGGCCG----------CCCACCTGCCTCCCCTGTACCCCCG-TCCTGCTGGT---GGGAGCACTGGGGGCTGGCC-CAAGCAGAGGAGGCTGG----CTCCAGCCTGGCTGGCCCTGTTGCTCAGGGCACCCGTTCCCAGCCTGGCCACTCTGGGTGG--TGTGGGAGCCAGG---CTATACGTCTTCCGTCCCGT------------------------------------CAGC-------TGGTGTGCTTGG-------GGGAGGGGAGGGAATATTGCCCATCTGGGATGGGCAGGACTGACCAGTTTCTCCCTAACATTTGCCCTAAACTTTCCAGC-----ACCTTCTCTCCAGTCTGGGGCCAAGACTGTCCAT------GAGCCGGATGGTTTGAGCCCTGACCCTGGGACTCTGAGCCTC--CTGGGTTCACAGC--TG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCCAAGCTCTGAGCCCATTTGCCCC------TCACCC--------CC-CCATACCCACTCCCACATTCCTGGCGATGTCCAGGAAGC-CCCTCTGG----------------TGGGCCTGCCTCGGGGAGCTGGGGTTCCTG-----------CCC---CACAGGGCCCT-GGGAAACTCTTCAGCCTCTG--GCG-------------------CACGTCCCCACTGAAGGGCGGGACCAGCTTTGGCTCAGCTGCTGTGTGCAGCTTTCTTGTG------------------AGAGACTCAGGCCGGCGACAGGAGGGGCTC----------------CTCCCAGT----G-------------------GGACGTCGTCCTG--GCTCTCCCACA-CCTTCTCGCTCTG-GGC-CTCGCC-CC-TGGCAGCC-CACCT-GGTCCACTAGTCTTGGG--AA-------------T----------------GGG-ATGGGGGTGGCCCAGCTGACAAGGCCAGAG-ACCCCTCCCCCTG-CCAAGGATCCTCAGCCAGTGTTGGCTCTTCCTAAGCCATGGGACCC--TCCT-------------------------------------------------------------     
25 Loxodonta_africana-NW_003573446.1-172481_172523          77.3%  27.2%    -----------------------------------------------------CCAGCAGGGACTTGGATTCCATGGCCCAGACTT------TGGG---------------AACTGCTCCC-----------ACATGCCCATGCTCCCTGCATGGGTCTGG------CTGGCC------------------CCTCCCCAGAG------CTCGCTCAGGGCCACCTCCACTCATCATTTGCC-CGGCAAACGCCCAGT----GCCTCCTGGTGCCCA--------------------------TG-AG--------------ACCCACCCACCTCTGTACCTTGACTCCAGAA------AGCACC-----------ATCCAGCCCAGGGTCCAG--------------TGCAAGAACCATGTTCTCCTGGGACT------------GCGCTACT--------------GGCCTGAGC---CC-----------------------------------------------------------------TAGTGTCCAGAGGCTCAGGGGTCTGGACTGTCCTCCTGGGCCCCTCTGATGTGTAG-----GACCTGAGGTGCATGCCTTTGGCTGAAAGCCTGCCATGGTGGGAAGAGGCAGAGACCCTTGAAGAGAATGCTTCCATGGGAGGGGCCCAGGCAGCATGTGCCCTGCACCCTCAGTGCTG--------------------------------------------ATAGGGGTG-GCCACCAT-------------------------------------------------GAGGACCAGTGTCAT-------------GGGCTTCTCCTCCTAGGACCCTCATGGACC--CTCTTTAGGGAG-----GAGCAGGGGAGGGGCAGGTCTTGGG------CAGCCACACCCGGGGGCTCAGCGGCTTTCCCCA------CCTA---------------TGACAGAGCCCCGTTGTCACTCAGCCGTGAGGGCACAGTCAGCCTTGTGGTGACAAGCC--ATGGGCGTCTTCGAGTGCAGGTGGGGTTGGGGTGCTGGACTGGTCCTGGAGGGGGGACC-AGAGAGCCGCTCAGCCTCCG--ATGTGCAGAGCCTTCT------CAG----------GAGTG-------GC-TGGGGGTCCAGCTTCCCATGACAGTCACCTGCA------------------GGGACCTGGGGTAGATGGCAGGGGGCTC------------------CCCCATGC----CCCTGAGTTCCCCAAGCCTGGGATGTGGTCCTG--GCTGTC-TGTA-CGTCCCCACACGT-GGCCTCTGCTCCATGCTGGGCCCACCTGCTGAGCACAGACCCCAGTCTGTCCCAAGTCATGTGA------CACTGG----GGG-TAGCCAGTGAGCCTTCTGGGGAGGAGGAAG-CTGGCTGCAA--------GGACAGGAGGTGGGAGGCAG------------------------------------------------------------------------------TGGCAATG---     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .             .                                          *                                         .  *