Reference sequence (1): Target
Identities normalised by aligned length.
Colored by: consensus/70%

                                                              cov    pid  1 [        .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         .         .         .         4         .         .         .         .         :         .         .         .         .         5         .         .         .         .         :         .         .         .         .         6         .         .         .         .         :         .         .         .         .         7         .         .         .         .         :         .         .         .         .         8         .         .         .         .         :         .         .         .         .         9         .         .         .         .         :         .         .         .         .         0         .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         .         .         .         4  ] 1403
 1 Target                                                  100.0% 100.0%    ------------------------------------------------------------------------------------------------ATTTTCATGGGGCTGTCCTCC-TGGTGGGTGGGCCCGTGCCCTGGGGAGTGATTGGAGGCCGTGACAAGGGCAGTGGA---GTAGAGGAGGGTGGGCTTGCA--TGTTGGTCTTGACT---GGGGAGTGGGGTG--GTCCTGAAGGACCCCTGT--------GCATGCAGGCCCTGGTCGAGGTGCCAATGGGGACCCAAGGCCTTGCATTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCACCAAGGGACGCTGGGTTTTGAAGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCAGCCTGCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAGCAGAAGGTGTGCTGCCCGGGGCAGGTGTTGGGGGGCCAGCCATCAGGCCTCGCCTTCTGTTCTGAGCTTTGAGCTTCAGTCAGGGGACAGTGGTGATGGGGGAGCTGTCTGAAGCTATCCCAGGCCAGGGATGGGCTACCTGGGCTCATGCCCCTGCTCTGAGATGGAGAGA-----------TTAGG-GTGGGGCAGGTCACAGCCTGGCATTTGAGA------GCCCCCCAAGTTGGCTTTAGTTTTGATATTACAG-GG--TGCGCTCTATGGG------GCAGCCAAGCAGGTAGGGAAAGTTTGTGGTTTCTCC-----------TCC--AGGGGCCCCTGAATGGCTTGGTCCTGACTGTGAACACC------CTGCG--CCTCCCACAGCTTGACCATGCCTC-CTGCCTTGGTGTTGAG------CATCTTGTGGACTAGGGTTCTGTGGCCCAG-CCTTTGAGACCTGCCCCTGTGT-TCCAGCCACATGGGTCTGGCTGACTCGCTCCCCTAGGGTGCCAGGCCCGCCA-CAATATCCACTCACCTGTTTGTCCAGCAGACACTCAGATGCCTCCTGGAATCCAGAGGGGCATGCTCAGCCCTTTATCTAGACCCCAAGAAATCCTGGCCATCCTTAGAGACCAATGCCAAGGCCAAGTGC-------------------------------------------------------------------------TGCCCCACTGACCAAGGACCTCATTT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 2 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-190098_190574         89.6%  68.5%    CCTGTGGGTGGTGCTGGCTCCCATGTGAGCTGAGTGGACTTGCTTGTGGGTTGAAGGTGGAAGGCACCTGGCATCGGGCAGGTGTGTCAGCTCTGCATTTTCACAGGGCCGTCCTCT-TGGTGGGTGGGCCCGTGACCTGGGGAGTGATTGGAGCCCATGACAATGGCAGCGGC---ATGGAGGAGGGTGGGCTTGCG--TGTTGGTTTTGACT---GGGGAGAGAGTGT--C-CCTGAAGAACCTCTGT--------GC-ACGCAGCCCTGGGCGAGGTGTCCATGGGGACCCAGGGCCTTGCTTTGCAGGAAGCAGACACGGACGACCACCAAGGGACACTGGGGTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGACGCCGCCAGTCTGCAGCGCTTCCTGCAGGCGGAGCAGAAGGTGTGCACCCCCAGGCAGGCGTGGG-TGGCC----GTCAGGCCTCACCTTTTATTCTGAGCTTTGACTGAGGG--------------------------------------------------------------------------------------------T-----------TTAGG-GTGGGGCAGGTCACAGCCCAGCATGTGAGAG-----CCCCCTCACATTGGCTTTAGTTTTGATATTACAG-GG--TGTGCCCTATGGG------GCAGCCAGGCAGGTGGGAAGGTTTGC-GGTTTCTCCTC-----------C--AGGGGCCTCTGAATGGCTTGGTCCTGACCGTGGACACT------CTGCG--GCCCCC--CAGCTTGGCCATGCTC-CTGGTTTGGTGTTGAG------CATCTTGTGAACAAGGGTCCTGAGGCCCAG-CCTTTGAGGCCCGCCCCTGTGT-TCCAGCCATACGCGTTTGGCTGACTCGCTGCCATAGGGTGCCAGGACTGCCA-CAATGTCCACTCATGCGTTTGTCCAGCAGACACTCAGATACCTCCTGGATCCCAAAGGGGCATGCACACCCCTTTATCTAGACCCCAAGAAGTCCTGGCCATCCTTAGAGACCAATGCCAAGGCCAAGGGC-------------------------------------------------------------------------TCCCCGGATGCTGTCCCACTGACCAGGGA-CCTA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 3 Cebus_imitator-NW_016107460.1-184847_185272              88.2%  67.5%    --------------------------------------------------------------------------------------------CTGTATTTTCACGGGGCTCTCCTCT-TGGTGGGTGGGCCTGTGACCTGGGGAGTGATTGGAGGCCATGACAAGGGCAGTGGC---ATGGAGGAGGGTGGGCTTGCG--TGTTGGTTTTGACT---GGGGAGAGAGTGC--C-CCG-AAGGACCCCTGT--------GC-GTGCAGCCCTGGGCGAGGTGTCCGTGGGGACCCAGGGCCTTGCATTGCAGGAAGCAGACACGGATGACCACCAAGGGACACTGGGGTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAGCCACAAGGACCACCTGGATGCTGCCAGTCTGCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAGCAGAAGGTGTGCACCCCCAGGCAGGGGTGGGGCGGCC----ATCAGGCCTCACCTTCTTTTCTGAGCTTTGACTGAGAA--------------------------------------------------------------------------------------------C-----------TTAGG-GTGGGGCAGGTCACAGCCCAGCAT----------------------TTGACTTTAGTTTTGATATTACAG-GG--TGCGCCCTATGGG------ACAGCCAGGCAGGTGGGGAGGTTTGT-GGTTTCTCCTCTGAGAA-ACCAC--AGGGGCCTCTGAATGGCTCGGTCCTGACTGTGGACAGC------CTGTG--GCCCCC--CAGCTTGGCCATGCTC-CTGGTTTGGTGTTGAG------CATCTTGTGAATGAGGGTCCTGAGGCCCAG-CCTTTGAGGCCTACCCCTGTGT-TCCAGCCATATGCGTCTGGCTGACTTGCTGCCCTAGGGCGCCAGGCCTGCCA-CAATGTCCACTCACCCGTTTGTCTAGCAGACACTCAGATACCTCCTGGATCCCAGAGGGGCATGCACACCCCTTTATCTAGACCCCAGGAAGTCCTGGCTATCCTTAGAGACCAATGCCAAGGCCAAGTGC-------------------------------------------------------------------------TCCCCGGATGCTGCCCCACTGACCAGGGA-CCTAGT-------------------GTCCAGAGGTTCAGGG-CTCTGGCCACCTTGTCCCAGGCCTGGGCAGGGAATGGGTACTGTGTGTCCTGGTGGCAGGAGTTGTAGGTCCAGCCAGG--------------------------------     
 4 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-177560_177872       83.8%  36.3%    ----------------------------------------------------------------------------------------------GGGAGGGCACCGGGGAGCCCAGCGAGCCACGGCTGCATGTGCCCAGGGAGCAA-ACTAAGGCCGCGGCGTGGGCAGTGGCG-AGGCGGGGAGGAGGGGCTCGCAGCCTGG--CCTTGACT---GAGGAGGGG--------GCGGGCC------TGCAGGGCCCTTCGGGTGCAGCGCTGGGCGGGCTGTGCATGGGACCCGAGGCCTTGCCTTGCAGGAAGCAGACACGGATGACCACCAGGGGACCCTGGGCTTCGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACGCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGACCCCACCGACCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGCTGCGGA------------GCTTTGGCGGAGGGCGTGGGGACAAGGCAGTCACAGGCAGCATCC------AGCACCCCGTGGGCT-------------TCAGTCCCCATGTTCCAGGGAGCAGCCCCTG----------------------------------GGGCTGCCACGTGGGCGGGAAAGGTTTGCAGCTTCTCCTCC-GCG-----GCCTCTGACCGGCTCAGTCCTGGCCGTTGACGCT-CT--GCAGCCCTGGGGG--ACAGCCACAGCTCTACACGGCACCAGCTGTGGTGTCCAGCGT---CCT-GTGGA--CAGGGGTTCTGTGGTCCCAGCCACACGC-----------GCCTGGCTGG--CCGAGTGGGGCATGCGGCCCTTTCCCTCGGCCGGAGGGAGCCCTGTCCATGCTCACAGGCCGGTGCCTGGGCCCTGCCCCACTCACCAGGGACCTGGTGT-CCAGAGGTTCAGGGTCTGGGCCCCTCAGCCCAGCCA------------G---------CCATGCCAGGGA----------------------------------------GGGGAAACGAGA-CCCCAGTGGAA----AGAGCTCCCGTGGGAGGGGCTTGGGCTACAC---------GGTGCC-------CTCGGGGCTGGCGCAGCGCAGGTTA---CCTCCCTGGAGCCC------------------------TCATAGACGCTCCCCCGTCCTGCTGGGTGGCACCCTAGGGCCTGGCCCAGGT-GGGAGAAGCAGCACCAGC-CCGGCTGCGTGCTGGCCTGTCATTGGGCAGC--------------------------------------------------------------------------------     
 5 Artibeus_jamaicensis-NW_023552099.1-176503_176732        79.3%  31.8%    ----------------------------------------------T-----GAAGGC--------------CTTGGTCACCGGACACCCTTGTCCTCTGGTCTATC--CCG---------TCTTGAGCCCCA---------CGGGGCAGGGCAGCAC-----------------------TTGGTCCTCAGTGTCCCTGGGACAGTGAGGTTT---GTGGGGACGGTCAAGAGGTGGGGGTGGGCCTGGAGGCCTGTGTAGG----CTCCGGGGGGGGACGCAGGGGGACCCACAGGCCTTGTGCTGCAGGAGGCGGACACGGATGACCACCAGGGCACGCTGGGCTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCAGCCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGCCCCGGTGGGGATGAGGTG------TCGGGGGGACCACA-CTCGACCACAGCACCATGTGGGCCCCT--TGTGGGTCT-------------AGGGTG-ACTGGGCCCAGCCTTCCTCTC-----TGC--------ATCCCCGTCCCCCGAGCTCC---------------ATGCCA-TTG-------TCTTTGTCCT-----TTGCCCATCAGTCCAGCAGACG-------CCCAGATGCCGCTGGG------TGCCAGGG--GGCCACGCTCATCCCTT--TCCTT--GACCCCTGGAAGCTCTGTTCATCCCAAGGGGC--TGTGTGCTCTGTGGACACTGCCCTGC----TGACTGGTGGCCCAGTGTCCAGAGACCAAAGCATCTG--GA------------------CCCCTTGTCCTG-------------GGCCCAGGGAGGGGCCGGGTGCCACC---TGGAAGCC-CGAGG----TGGGGG--------------------A--GCACGCGGCAGGGCCCGGAGCCCACCCCCACTTTGGCTGGCC-------CGGATGTGGCGATCAGAGC-TGG--GG-TGGAG-GCA----------GTGGCTCTGGCGGCAGAGGACC--GGCAGGGTGATGCCCTGGTGATGGCCTGGCTGGCCGGG------GCTCTGCCGCTTCT---CTGGCCCAGATG----ACCAGCGTGAC-----------------GCTGGAGAGCTGCCAGGCTGTGATC---CAGCAGTTCGAGCCCTGCCCGGAGAACAAGAGCAAGGGGGTGCTGGGCATCGACGGTGAG-TG---------------GGGTGCCTCC-------------------------------------------------------------     
 6 Molossus_molossus-NW_023425372.1-174422_174724           80.0%  31.2%    ----------------------------------------------------------------------------GTCAGTGG-------TCTTGGTGGGACAGTC--AGA---------AGGGGAGCCCGGT-----GAGGGTCCCGGGGAACAACCAG--------GAGGCCGTGACATGGGCAGTGGCACTGGAAGGGGGAGGGTGGATT---TGTGGGGGTGACTGAGAGTGGGGGTGGGTCTGGAG-----------GACCCCTGGGTGTGGCTCCAGGTGGGACCCACGGGCTGTGCGTTGCAGGAGGCGGACACGGATGACCACCAAGGCACTCTGGGCTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACTTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGACGCCGCCGACCTCCAGCGCTTCCTGGAAGTGGAACAGAAGGTGAGTGTGCCCAGCAGGCTGGGGCTGCAGGCGGCACACCCCTGC-GCTTCCAGAGGG---------AGCCCC--CCTCGACCG-------------CAGCTT-C-CCAGTCCAGCCTGCCCTGC-----TCC--------CGGC------------------------------------C-CCG-------CCTCCTCCGT-----CCACCCACTTGTCCGGCAGACG-------CCCAGACCC---TCCG------GTGCCGTG--GGGCAGGCCCGTCCTTCT-TGCTC--CACCCCAGGCAGCTCTGTCTGT-CCTGAGGGC--TGACTGCTCCCTGGGTGCTGTCCTGC----TGACTGGCGGCCCAGTGACCAGAGACCTGGGTCT-----GG------------------ACCCTTGTCCCA-------------GGCCCAGGGAGAGGCTGGGTTCCCCC---TACTCTGG-TGGGC----AGGAGGCTGGGCGTCCAGGGAAGGCCG--GTGTCCCCTGAGGA-GAGAGGGCACGCGTGGGGACTCAGACAGCGTAACCACCTCGAGGCTGGTGGGA-GGC--GG-CGGT--GAGGTCGCCTTCTGGGCCTGGGCCTTCCTGGGA-----------------CCTCACTTTGGGGTGGAGAGCGGGA------GGGGAAAAACTTCT---GGGGCCAGGCACCCAGGCCAGGGAGTC-----------------AGCCCTGGGGTCTCAGGCAGCGGCC---GCTGGG-CAGGGCCAGGGCGGGGGCAGGAGCAGCAGGAACCGCTGGGGGTCCAGGCGGGT-CT---------------GGGGCGGTGCCGAGATCTAGCTC------------------------------------------------     
 7 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-187877_188194         85.1%  37.6%    ----------------------------------------------------GTCAGAGG-----------------------GGGTGTCCAGTGAAGAAGCTGCCTGAGGG---------GCCTGGGCAG-----------CAATCAT--GGG-CCGTGACATGGTTAGTGGCGTTGGAAGGCGGAGTGTGGATTTGTCATTCAGTGTTGACT-G-AGGCGCGGGGGTGG------------GCCTAGAGGACCCCTCATGAGCGTGGCTCAGGGTGGGATGTGGGGGACCCAGAGGCCTTGCGTTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCAGCAGGGGACACTGGGCTTTGAGGAGTTCTGCGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGACGCCACTGACCTCCAGCACTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGGCACCCTGGCAGGAGAGTGGGTCCTGGCCAACGTGGCGCCACCTCAGGTTCCCGGAGCGTTTGAGCC--TGCTCAGTG--TGGCT-GAGA----GCT-TGGGGAAGGGTGGGCCATGGC-----CTGGC-----ATTCGAGGTCCCCATACCCAC---------------CTCCAC-TTAGTGGACTGGCCGCGGTTCCCATCACAGG-CCATGCCAGTGTATTCCAGGATGTGTCCCATGGGGGCTGCAGTGTGGGTGGGGAAGGTTTGTGATTTCTCCTCTGCGG--GCCTCTGAGCAGCTCAGCCCTGACTG-CAGACACCCAGAGCTTCCAGAGGGGAGCCTGCG--CTTGACCACAGCACTGAC-TG--CAGCATGGGGCATCTCCTGGGGC----------TAGGGTTCCATGGCGCAGCCCTCCCACG-TGTTCCAGCCATGTGGGTCTGGCTGGC---TTGCGCCC-TGGG-----------------------------------------CCCATTG-CCACCTCCATTCTCCCATATGTCCAGCAGACACTCAGATGCCTCTGGGTGCCAGCAGGGCA-TACCTGCCTGTTTCCCTCCACCTCAGGCAGTCCTG-TCC----------ATCCTGACAGGCCAAGTGCTCCCTGGACACGA-------TCCTGC----------TGACTGCAGGCCCA-G----------------------------TGTCCA---------------GAGGCTTAGGGGTCTGGACCCCTG------GTCCCCGGCCC----------------AGGCAG---------------------------------------------------------------------------------------------     
 8 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-188807_189131            87.7%  38.6%    --------------------------------------------------------------------------------------------------AAGCAAGCTGGAGTCCAGTGCGCTGCAGCCATGTGTGTCTGGAGGAACCATCTGAGGCTGTGACAGGGGCAGTGGCGGAGGAAGAGAGGATGGGTTTGCA--ATTCAGGCTTGACT---GAGGAGCAG--------GGTGTGACTCCAAGACCCTCATGGATGCAACTTGGAGGATTCAGACACAGATGGTGACCCGACACCTTGCATTGCAGGAAGCAGACACGGATGACCACCAGGGAACTCTGGGCTTTGAGGAGTTTTGCGCCTTCTACAAGATGATGTCTACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACTTGGATGCTGCCGACCTGCAGCGCTTTCTGGAGGTGGAGCAGAAAGTGAGCTTGGGCAGGAGCAATGGGCCTGCCAAAATGGTCTCATCT----------TCGCTCTGGTTCACT------TTGTGCAAATTGGCT-------------TCGGTTCCCCCATTCCCTGGGGA-------------------------------------------------CTGACAGGTGGGGAATGCTTGTGGTTTCTCTTCTGAGG-----ACCTCTGAATGGCTCAGTCCTGACCAAGAACACC-TT--GAGCCTGCAGAGGGGTGCCCCCAGCTTGACTGTGGCAATAGCTCTGGTGTTGAACAT---CTG-ATGGA--CTAGGGCTCTGTGGCTCAGCCTTTAAGAACTGCCCCCT--------GGG--ACCAGCAGATGGTGTAATGGTTGC-----ATTGCTGGACTC------CCATGTAGTAGACGGTGGTTTGAGTCCCAGGCCCAGCAACTTAAAACTCATGC-TGAG--GGTGTGTGTGTGTGTGCATGTGCTCAAGAT------------C---------CTGAGA-AGAGAGTGGAGGACAAGGGATTG--CAGAGTGGCCATCCCCATGGGGAGTAATTTCTCACTTTCTGTCTCTCTCGGTCTCTCTGGTGAGTGC-ATGTGCCCTAC---------------------------AGCAAAAATCTCTCTCTTAA---AAACAAAACAAAAC------------------------AAAAACAAAACCCTGCCCCTTACTTGTTGCATTGCAGCCACATGAGTCTGGC-TGGCTTGCTTCCCCAGGG-CCTGCAGACACCTCCCAC---------------------------------------------------------------------------------------------     
 9 Miniopterus_natalensis-NW_015504651.1-676625_676925      85.1%  32.6%    -------------------------------------------------------------------------------------------TCTGTGTTAGAGGCTC--ACC---------CAGTGGTCTCGGT-----GGGAGTCCGA-----AGGGGAGTCTGCTGAGGGTCCCACAC--ATGCACAGCGACATGCAAGGAGGAGGGTGTGT---GTGGGGCTGACTGAGAAGTGGGTGTGGGCCAGGAGGACCCC-TGTGAATGCGGCTCAGGCTGGGCCGCAGGGACCCACGGGCCCGGTGTTGCAGGAGGCGGACACGGATGCCCAGCAGGGCACCCTGGGCTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCGACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGTGACCACAAGGACCACCTGGCTGCCGCCGACCTCCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGGGGCGCCCGGCAGGGGTGGGGCTCCTGGCCACAGGCACTGAG-CTTCAAGGGGGAGCCCACACGTGACCA--CGGCACCATCCTCAGT-GGGGAGCACTT-CCAGGGGCCAGGGTTCCCG--------GC--------CTAGCCTTCCCCCCTGTTCC---------------TGCCAC-ATG-------GGTCTGGCTGGCTCATGCCCCGTGTGGGCAGCAGGAG-------GGG---------CCAG------GTGCAGGG--GAGGCTCCCTGTGCCCCC-AGGCT--CCCCCCAGTGGGCCCCGCT----------------CCCTGCCAAGCCCACTCTGGCCCAC-AGCTCTCAGGGCCCCTAATGCAGCAATAGGGGGTGGCCTG--GC------------------CGATGAGGCC--------------------------------AAAGACCCC---TCCCCTGC-TTGGAGGATACTTAGTTATGTGACCCACCTGTAGTC--TGCTGACCACAGTC-CCAAGTCACGTGATACTGGAGGTGGCCGGTGAGCCCCCAGGCGGGGGGGGGGACGACACTG-CAGGGGCCAGAGCCACGCCCTGCTGTGGGAGGCAGTGGCCA--TGGAGGCGGATGCTGGGCTAGTGACAGGCTGGCCTGGG------CTCTTGTCCCCTCT---CTGGCCTAGATG----TTGGGTGTGAC-----------------ACTAGAAAGCTGCCAGGACATCATC---GAGCAGTTTGAGCCCTGCCCAGAAAACAGGAGTAAGGGGGTGCTGGGC-----------------------------------------------------------------------------------------------------     
10 Desmodus_rotundus-NW_020090861.1-191629_191888           82.7%  32.7%    ---------------------------------------------------------------------------------TGGACACCCTTGTCC----------C--CAG---------GCTTGAGCCCCA---------TGGGGAAGGGCAGCACCTTGGTCCTCGGAGTCCCAG-GGGCCTCAGGGATGCTCCCTGGACCAGTGAGGTTT---GCAGGGACGACTGAGAAGTGGGGGTGGGCCTGGAGGCCCATGCAGGCGTGGCTCAGGGTGGGACGCAGGGGGACCCACAGGCCTCGCGCTGCAGGAGGCCGACACGGATGACCACCGGGGCACACTGGGCTTTGAGGAGTTCTGCGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGACGCCGCCAACCTGCAGCGCTTCCTAGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGGCCCCTGGTGGGGATGGGGTGCCCAGGGGGGAGCCCACA-CTGGACCACAGCACTGTGTGGGCACCT--TGTGGGTCT-------------AGGGTC-CCCAGGCCCAGCCTTCTCCTC-----TG--------------TGTCCCCCGAGCTCC---------------GGGCCG-TTG-------TCTTTGTCCT-----TCACCCATTTGTCCAGCAGATA-------CCCAGATGCCTCCAGG------TTCCAGGG--GACCATGCCCACCCCTTT-CCCTC--GACCCCAGGCAGCCCTGTTCATCCCAAGTGGC--TGCGTGCTCCCTGGACACTGCCCTGC----TGGCTGGTGGCCCAGTGTCCAGAGACTCAGGCTTCTG--GA------------------CCCCTTGTCCCA-------------GGCCCGGGGAGGGGCCGAGTGCCACC---TGCTCTGG-TGGAC----AGGAGGCTGGAAGCCTGAGGTGGGG-A--GCATGCTGCGGGGGCCAGAGCCCGCCCCTGCTGTGGTTGGCC-------CCGATGTGGCCAGGGTGGA-GGC--AG-GGCTT-TGG---------TGGCAGAGGACTGGCAGGGCCCC--GAGGCTAGCCTGCCCTGGTGACGGCCGGGCTGGCCTGG------GCTCTGCCCCTTCT---CT-GGCTAGATG----ACCAGTGTGAC-----------------ACTGGAGAGCTGCCAGGCCATCATC---GAGCAGTTTGAGCCCTGCCCAGAGAACAAGAGCAAGGGGGTGCTGGGCATC--------------------------------------------------------------------------------------------------     
11 Dipodomys_ordii-NW_012267222.1-173104_173339             83.3%  30.7%    -------------------------------------------------------GGC--------------AAG-----AGGAGCAGTCAAGTCTCAGGGCCAAGC--CCA---------TCGTCAG--------------TCTGGCA--TCAGAAGCAT------GGCTGCCCCCTTG--GGTGGCTGCGTGGCCCGGGCCCGGGGCAGGGC---CTGGGGCGGGCAGTGCCCTGGGCCTGGAGG----GGGTGGGTCATGAGGGCCCTGTGGTGTAGCACGGTGGTGACCAAGAGCCTGGCATTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCGCCAGGGAACCCTGGGCTTTGATGAGTTCTGCGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGACGCTGCTGACCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAACAGAAGGTGGGGCCCGGGCGGGGGCAGCGTGCTGGCCGTCCAGCCCCATCCTAGCGCCCGT--------GCGATGCCCT--CACAGACCTGCTCAGG-GTGGATTTCAA-CCCGCGGCGCCCCAACTGGCT-----TCAG-------CTCC-CATTCTCCACAGAAT---------------GCCCTG-TGG-------TGTGTTCCGTGACATGCCCGCAGAACTGC--CAGGTG----GG-TGGAGACGCGGGCAGG------GTCTCCCCCAGTGTCTCCCTGCAGCTCT-GTCTT--GACCATGGACATCCCGAGC-TTTCAGGGAGG----CACTGGTGGCCGACCGGTGGCCC------TGACAGAGCATCGTGTGGTGTGCGTAGGAGGAATCTGTTAGCCCC-----A-CCTTTGGGAATCTCTTCCTTCCCATGTGGT---CCAGCCCCAGGGGCCTGAGGCTCCC---TGCCCTGG-CTTGCT---TGT------------------------------CCACCTAACACCCGATTCCCAGGGTGCTGTGTCTTTTCCTTGACCCCACACAGTCTGTCCACCCCTAG--TG-GGCTGAGTTGAGTGGCCCATGGCAAGGCCCTGCAGACTA-----------------GCAGAAGTGTCCAAAGCC-ACAGGG------GCCAACGCCAGTCC---TG-GGCAGAGAGCAAGTACTGC------------------------CCATCGGGTGGCAGCACC-CACG---GGTCAGCCTAGGCC---------------------------GCAGGGAAGCCACGCCCAC-TG---------------GGGAGGGA---------------------------------------------------------------     
12 Lagenorhynchus_obliquidens-NW_020837953.1-178048_178374  80.7%  35.1%    -------------------------------------------------------------------------AGAGGCGAGGGGGAGCCCAGTGAGGATGCCGCTGCCGGG---------C-TTGGGGAG-----------CAGTCGT--GAGCCCGTGGCATGGGCAGTGGTGCTGGAAGCA-------GGAGGGGTGATTC------GACT-C-A---GGCTTGACTGAGGGATGGGGAGCTTGGAGGTACCCTCGTGGCTGAGGCCCGGGGTGGGATGTGAGGGGACCCGGAGGCCTTGCGTTACAGGAAGCAGACACAGATGACCACCAGGGGACACTGGGCTTCGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGGCCTACAGCGAGCACAAAGACCACCTGGACGCCGCCGACCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGCGTCCCCGGCAGGAGCCGGGC-TCCTGGCGGCTGAGGCCTCACCGCGGCCTCCCGGG----------------------------------------------------------GCATTTGAGCCCGTC-----CACAGTGTGGCTGAGAGCTTG---------------GGGAAG-TGTGGGCACCAGT----CTGGCATTTGAGGCCCCCTTACTGCACCTGCCTCGGTTCCTGGCTCGGGCCAC----------------------AGCCTCCAAGCCGGTGGG--GAAGGAGAGGGGCTCAGCCCTGACCGTGGCCCCCCCGGAGCTCCCAGAGGGGAGCCCGTG--GTTGACCCCGGCCCCGAC-AC--TGGCGTCGAGCATCTTCTGGC------------CTAGGTCCCTTGGCCCAGCCTTCGGGCC-TGGTCCAGCCACGTGGGTCTGGCCGGC---TCCCACCC-CCAGG---------G-----------------------CTCTGGGCCCACTG-CCAACTCACT-CCAACATTTGTCCAACAGACGTGCAGGTGCCTCTGGGTGCCAGCAGGGTG-TGCCTGCCTCTACTGTCCCCGGCCCCAGGCGCCCCATCC----------GTCCTGAGAGGCCGAGTGCTC-----------------------------CCTGCCTGGCTCAGGGGTCTGG-----------------------ACC-CCTCATCCCGGGCCCGGGTTGGGGG---GGGAAGGCCACCCCCTGAGGGGACAGCGCTGCCACAGGGGGGCTCGGACCGCAGACGGCG-TG---------------GGTGCGGCTACTGTGGGCAGCGCCGGAGTGA----------------------------------------     
13 Phyllostomus_discolor-NC_040907.2-176588_176802          84.6%  34.2%    ------------------------------------------------------------------------------------------TCGTCCTTTGGTCTGTCCCCAG---------GCCTGAGCCCTGT-----GGGGCAGGCAGGGCAGCCCCTTGGTCCTCAGTGTCCCTG-G--CGCCTCGGATGCTCCCTGGGACAGTGAGGCTT---GGGGGAGGGC-CAAGAACCGGGGGTGGGCCTGG-GGCCCGTGTAGG-TGTGGCTCGGGGGGGACGCAGGGGCACCCACAGGCCTTGCGCTGCAGGAGGCGGACACGGACGACCGCCAGGGTGCGCTGGGCTTCGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGGTGTCCACCCGCCGGGACCTCTATCTGCTCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGACGCCGCCAGCCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGGCCCCTGGCAGGGACGAGGTGCC-GGGGGGGCGCCCACA-CTGGACCACAGTGCCGTGTGAGCACCT--TGTGGGTCT-------------AGGGTC-CCTGGGCCCAGCCTTCCTCTC-----TGT--------GTCC-------CCGAGCTCT---------------GGGCCA-TCG-------TCTTTGTCCT-----TCGCCCATCGGTCCAGCAGATG-------CCCAGATGCCCTTTGG------GTGCCAGG--GGCCATGCCCACCACTT--CCCCT--GACCCCAGGCAGCCCTTCCCCTCCTGAGGGGC--TGAGTGCCCTCCGGACACTGCCCTGC----TGACTGGTGGCCCAGTGTCCAGAGACTCAAGCATCTG--GA------------------CCCCTTGTCCCG-------------GGCCCGGCGAGGGGCTGGGTGCCACC---TGCCCTGG-GGGGC----AGGAGGCTGGGAGCCCAAGGTGGGGGA--GCACACGGCAGGGGCCAGAGCCCATCCCCATTGCGGTCGGCC-------CTGGTGTGGCAATCAGAGC-CCG--GG-TGGGG-GCAGTGGCTTCGGCGGCAGAGGACCAGCAGGGCCC--GAGGCTAGCGCACCCTGGTGACTGCTGGGCTGGCGGGG------GCTCTGCCGCTTCT---CTGGCCCAGATG----ACCAGCGTGAC-----------------ACTGGAGAGCTGCCAGGCCGTCATT---GAGCAGTTCGAGCCCTGCCCGGAGAACAAGAGCAAGGGAGT------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
14 Sus_scrofa-NC_010448.4-177083_177282                     74.1%  30.5%    -------------------------------------------TTGT-----GTAAGGGTCACT-CTGTGGCTTCCTGGAGGGAGAGGCAGGGTGAGGGCACTGCTGCAAGG-----------CCTGGGGG-----------CACTCAT--GAGCCAGGGACCTGGGCAATGACATGGGAAGGG-------CGT---------------------------------GGGGGATCCTTGACTCTGGGCAGACTGAGGAGTGGTTGTGGCTCAGGGAGGGGCATGAGGGGACCCAGAGGCCTCGCGTTTCAGGAAGCGGACACGGATGACCACCAGGGGACACTGGGCTTCGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAAATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCGGCCACAAGGACCACCTGGACGCCGCGGACCTGCAGCGCTTCCTGGAGGGGGAGCAGAAGGTGAGGGCGCCCCAGCTGGAGGCTTC-CT---CTTGCTGTGGCCTCACCTTGGCCTCCCAGGGGGGCCGAGCC----------------------------------------------------------CATC-----AGCAGGGTGGCTGAGAGCTCG---------------GGG-AA-GGGGGGCACTAGC----CTGGCATTCGAGGTCCACTTAAGGGACCTGCCTCGGTCCTCACCACGGGCCAG----------------------GCCG---------GCTGC--CAAGCAGAGCAGCTCAGCCCTGACCGT------------------------------GAG--CTTGACCACGACCCTGAC-TG--TAGCGTCAAGCATCCTCTGGCC-----------TGGGGTTCCGTGGTCCAGCCTTCCCGCC-CTGTCCAGCCACGTGGGTCTGGCTGGT---TCCTACCC-CCAGA---------G-----------------------CACCAGGACCATGG-CCGACTCCAT-CAAACCTTTGTCCCCCAGACGCCCAGATCTCTGGGGCCA---GCAGGGTC-TGCCTGCCCATTTCCCTCGACCCC-------GGATGGGC----------CCTCTGAGAGGCTGCATGCTCCCCGAGCCCTG-CCCGGCTGAAGCTCAGTGTCCAGACCCCTCGCCTGAGGCCCAGGCAGAGGCTGGT---GCTGCCC-GCTCTGCTGGAGGGAGGCTGGGAGCCTGTGGGTGGCGGCAGGGGGGAAGGCCAGCATCCCCAGAGGAGCCGTTCAACCTCAGCCTGCA-TG---------------CGGCCCCACCCTCAGGCTGAGGGAGGAGGTT----------------------------------------     
15 Physeter_catodon-NC_041216.1-190627_190887               83.6%  35.6%    ---------------------------------------------------------------------------AGGCGAGGGGGAGCCTAGTGAGGACGCCGCTGCCGGG---------C-TTGGGGAG-----------CCCTCGT--GAGCCCGTGACGTGGGCAGTGATGCTGGAAGGG-------GGAGGGGTGGTTC------GACT-C-A---GGGTTGACTGAGGAATGGGGAGCTGGGAGGCACCCTCGCGGTTGAGGCCCAGGGTGGGATGCGAGGGGACCCGGGGGCCTTGCGTTACAGGAAGCAGACACAGATGACCACCAGGGGACGCTGGGCTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGGCCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGGCGCCGCTGACCTTCAGCGCTTCCTGGTGGTGGAGCAGAAGGTGAGGGCCCCCAGCAGGAGCCGGGC-TCCTGGCCGCTGTGGCCTCACCTCGGCCTCCCGGGGCGTCTGCGCC--CGTGCAGGGTCCCGGG-GCGTCTGCGCC-CGTGCACGGCCCCGGGGCGTCTGAGCCCGTC-----CACAGTGTGGCTGACAGCTTG---------------GGGAAG-TGTGGGCACCGGT----CTGGCATTCGAGGCCCACTGATTGGACCTGCCTTGGTTCCTAGCACGGGCC------------------------AGCCACCAAGCTGGCGGG--GAAGGAGAGTGGCTCGGCCCTGACCGTGGCCCGCCCAGAACTTCCAGAGGGGAGCCCGTG--CTTGACCACGTCCCCGAC-GT--CAGCGTCGAGCATCTCCTGGC------------CTAGGTCCCTTGGCCCAGCCTTCAGGCC-TGGTCCAGCCATGGGGGTCTGGCCGGC---TCCCGCCC-CCAGG---------G-----------------------CTCTGGGCCCGTTG-CCAACTCCGT-GCAGCTGCCTC----------------------TGGGTGCCAGCAGGGGG-TGCCTGCCCGCTGTCCC-CGACCCCAGGCCGCCCCATCC----------CTCCTGAGAGGCCGAGTGCTCCCCGGGCACTG-CCTAGCTGAAGCTCAGGGTCCGGAAGCTCAGGGGTCTGG-----------------------ACC-CCTCATCCCGGGCCCGGGTTGGCGG---GGGGAAGGCCACCCCCGAGGGGACAGCGCTCCCACA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
16 Equus_przewalskii-NW_007674960.1-189954_190216           86.0%  36.3%    -------------------------------------------------------AGAGG-----------------------GGGAGCCCAGTGAAGATGCTGCCCAAGGG---------TCCTGGGGAG-----------CAATCAT--GGA-CCATAACATGGGTAGTGGCATTGGAAGGAGGAGTATGGATTTGTGATTCATGGTTGACT-G-AGGCATGGGGGTGG------------GCCTGGAGGACCCCTGATGGATGTGGCTCAGGGTAGGATGTGGGGGGACCCAGAGGCCTGTGTTACAGGAAGCGGACACGGATGACCAGCAGGGGACACTGGGCTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTATAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCATCTGGATGTTGCTGACCTCCAGCGCTTCTTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGGCAACCTGGCAGGAGCGTCGGTCCTGGCCGATGTGGCCTTACTTCAGCTTCCCAGGGCATTTGAGCC--TGTTCCCAGTGTGGCT-GAGA----GCT-TGGAGAAGGATG-GGCCACGG-----CTGGC-----ATTTGAGGTCCCCATACCTGC---------------CTCCAC-TTAGCGGACCGGCTTCAGTTCCCGTCACGGG-CCGTGCCAGTATATTCCAGGGTGTGTCCCGCGAGGGCCGCATAGTGGGTGAGGAGGGTTTGTGCTTTCTCCTCTATGG--GCCTTGGAGCAGCTCAGCCCTGACTG-CAGACACCCAGAGCTTCCAGAGGGGAGCTCGCC--CTTCACCATGGCACCAAC-TG--CATCATGGGGTGTCTCCTGGGCC----------TAGGGTTCCATGGTGCACCCCTCCCACC-TGTCCCAGCCATGTGAATCTGGCTGGC---TCGTGCCC-CCAGA---------G-----------------------CTCTGGGCCCATTG-CCACTTCCATTCACCCATATG-TCAGCAGATGCCCAGATCCCTCAAGGTGCCAGTGGGGTA-CGCCTGCCTACTTCTCTCCACCACGGGCAGTCCTA-TTC----------ATCCCAAGAGGCTGAGTGTTCCCTGGGCATGG-------TCTTGC----------TGACTGGGGGCCCCAG----------------------------CGTCCA---------------GAGACTCAGGGGTCTGGACCCCTG------GTGTCCAGC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
17 Microcebus_murinus-NC_033661.1-174483_174676             86.7%  35.0%    ---------------------------------------------------------------GCCC-------CACA------------CTATGGGTGTGGCACGTGGAGGCCA--------TCCCTACTTCT----AG-GAGGTG-CTTTCTGCCTCTCAGGGGACCAAATAT-GGAACTTCCACAGAAGCTCAAGGACTCGGCCAGTGTTT---GGGGACACA--------TGCCAGC------CATGCATCTGTGTGTCCAGGTCTGGGGGTGGGCTGTGCATGGGACTGGAACCCTTGCATTGCAGGAAGCAGACACGGATGACCACCAGGGGACCCTGGGCTTCGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACGCGCCGGGACCTGTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGACGCCGCTGACCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTAGGGCTGCACCGCTGGCCGCCCAGCTTTGGTGGAGGCCGTGGGGACAGGGCAGTCACAGCCAGCCTCT------GGGACCCCG-TGGGC-------------TCAGTCCCCGTGTTCCAGGGAGCAGCCCTTG----------------------------------GGGCTGGCGCATGGGTGGGAAAGGTTTGCGGCTTCTCCTCC-GGG-----GCGTCTAGCCAGCTGAGTCCTGCCCGTTGATGCT-CT--GTGGCCCTGGGGC--ATGGCCACAGCTTGACGCGGCACCAACTGTGGTGCCCAGCGT---CCT-GTGGA--CAGGGGGTCTGTGGCCAAGCCACATGGGCGTGGCTGGCTTCCCCAGGTG--CCCAGTAGGACATGTGGCCCCTTCCCTCGGCTGGAGGGAGCCCTGTCCATGCTCACAGGCCAGTGCTTGGGCCCTGCCCCGCTGACCAGGGACCTGGTGT-CCAGAGGTTTAGGCCCTGGGCCCAGGTAGGGATGGG------------G---------ATGACCACTCTGGTGGCAGA-----AATGG--AGGTCCAGCCATGCCGGGGAGGGGAAACTAGACCCCTGGTGGAA----AGAGCTCCCGTGGGAGGGC-------------------------CT-------GGGGCTGCACGGGGCTGGCAGGTGA---GCTCCCTGGAGCCC------------------------TCACAGATGCTTTCCGGTCCTGCTGGGTGGCATCCTGGGGCCTGACCCAGGT-GGGAGAGGC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
18 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-174525_174725          80.2%  39.1%    ----------------------------------------------------------------------------CACCAGGTGGCCTGCTCAGAGTGCACCCCTGCTCAGCCTGT-TGATGGGTA-------------------------------GGACAAGGACCCTGATG-TGGTTTGTCTAAGAGCCCTGTT--CATGGAGCCCCTCA---GGGGAGTGCTCTGAGGAGGCAGTGGCAGAGGAGGGGAGTGTGACTGAGGAGTGGGGGCCTGCTGCAGATGGGGACCAGAGGCCTTACATTGCAGGAAGCAGACACAGATGACCACCAGGGGACACTGGGCTTTGAGGAGTTCTGCGCCTTCTACAAGATGATGTCTACTCGTCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGATGCTGCTGACCTGCAGCGCTTCCTAGGGGTGGAGCAGAAGGTGAGGGGCCACTGGGGCTTCCTGGCCACACTGCTGGCC---CTGACCTTTGGTGGAGAGCATAGGGACA-AGACAAGGCACAGGTAGCAT---------------------GCCAGGCCCCACATCAGCTTCAG-------TTCCCATATTCTAGGAAGCACCCCACAGGGCTGTTACATG-GGGGAGGAGGTTTCTGGTTTCTCCTCCAAGG-----TCCTCTGACCTGCT-----------------------------CAGTCCTCG------TCATCGACACCCGTGGCACCAGCTTCAGTGTTAAGCATCTTGA-----GA--TGAGGGTTCTGAGACCCTGCTTTCTCGCTATATCC-------------------CAGACACA--------------------TGGGCCTCGC------CATCCTCTTCCCCAGGGCTCTGGGCCACTG-CCACAT-CCATTCACCCTGTGT-C---------------------------------------------------------------------------CAGCACGTACCTCCATGCCTCCTGGTGCCCAGCAAGGC---TGCCGCCCCTTCCCTCAACCCCAGAAAATCCCATCCATCCTTAGAGATCAAAGCCTGGATACTAGCCCACTGAGCTGGTGTCCAGAGGATCAGAGATTT---GGGCCCGTCAGCCCAGACCCTGCCGTGCCAGGGAGGCCTCAATGGAGAGTGCACTACCCTGAGAGGG-GCTCGAGTTTCATGGACCCCCTCGGGGCTGGTGGGGTACAG-GTGAGGGCCAGCTCCCTGGGACCTTTGCAGACCC-----------------------------------------------------------------------------     
19 Odobenus_rosmarus-NW_004450599.1-189359_189558           85.4%  35.4%    ----------------------------------------------------------GA-----------------------CTGTGCCAGGTTTAGGTGTAAGTTGACCT---------TGAA------------------AGCCTG--GGA-CTAGGGTAGGGGAAGGTGAGATCTGTGTTAAAGGGTCACTCAGTGGCTTCTTGGTGGGA-G-AGTCAGAGCGGGAGCCCAGCAAATTCACTGGGGCAAGCATCCCAGGGAGCTATCAGAGTGGGACACTAGGGGTCACAGAGGTTTTGGCTTGTAGGAAGCAGACACAGATGACCACCAGGGGACGCTGGGCTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTATAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCTGACCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGGCACGGGCAGTGGGAGCAGGGTCCTAGCCTATGTGGCCTCACCTTGGGCTCCCAGAGCCCTTGAACC--GGTTCAGTGTGGCTGA-GAACCCTTCAG-TGTGGAAGGATGGGCCACAGC-----CTGGC-----CTTCAGGGTTCTA------------------------------TTAGTGGACCTGCTTTGGTTCCCTTCATGGG-CCATGCCAGCGTATTTCGGGGTGTGTCCCATGGAGGCC-CTGAGCAGGTAGGAAAGTTCTGTGGTTTCTCCTCTGTGG--GCCTCTGAGCAGCTCAGCCCTGACCA-CAGACACCCCGAGCTTCCTGAAGGGAGCCTGCG--CTTGACCACAGCACCTTT-AG-----TGTGGAGCACCTCATAGAAT----------GGGGGTGCCACGTGCCAGCCTTCCCACC-TGTTCCCGCCACGGGTCGGGCCAGCTC---GTACCCCT-GAGCT---------C-----------------------CAGGCCCACCACTG-CCACCGCCATTCGCCCATTTGTCCAGCAGATGCCCGGATGCCCCTGGGTGCCAGAGGGGCA-TGCCTACCCATTTGTCTTGACTCTAGCCCCTCCTG-TCC----------ATCCTAAGACGTTGAGTGCTCCCTGGGCTTTG-------CCCTGC----------GGACTGGGGGCCCA-G----------------------------CGTCCA---------------GAGGCTCAGGGATGTGGACCCCTC------AACCTCGGCCT----------------GGGCAGGGGC-T---------------------------------------------------------------------------------------     
20 Sorex_araneus-NW_004545881.1-181982_182190               87.3%  35.9%    ----------------------------------------------------------------------------------GGAC-CCTATGGGATGCTGGGGATCGAACC-C-------AGGTCGGTC------------GCGTGCA--AGGCAAATGCCCTACTCACTGTACTGTCG--CTCCAGCCCCATGGACTTGGCCCTTGGTGTCC---GTGGGGAATGACG----TCACAGTGGGCACTCCTTGAGCCACTGGGGTCATGAGAGGTACGTGGGGACAGGGCCCCTAAAGGCTGGCATTGCAGGAAGCAGACACAGATGACCACCAAGGGTCCCTGGGCTTCGAGGAGTTCTGCGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGAGACCTCTACCTGCTCATGCTCACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGACGCCGCTGACCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGCTGACCGTCCACATGCCACTTGACGTGTGCGGCTGGGCACATCCAGTGTGGCCAAGCATGTCCACAG---ATGTCTGAACACATC------TGTGTG-T-GCCTGAGGGTGTCCACAGACG--ACTGTG-TCCACATGTGACTACACTCACTTAT---------------GTGCGG-CTT-AGCA--TGTCCACGTG-----TGACTGAGCATGTCCTTGTATGACTGTGTCCACACATCACTGATTGTGTCTGTGCATAACTGAGCGTGTCAGTGCTTGATTGTGCTCACTTATGTGTAGCTTAGAATGTCCAC--------GTGTGGCTGAGCAAATCCACGT-GTG--GCTGAGAGAG-TCCACG--TG--TAGCTGAGAGAGTCCACGTG-------------TAGCTGAGAGAGTCCCTGTGTGGCTGAACGAGTCCAC--ATGTGGCTGAGTGTGTC--TACATGTGGCTGAGAGGGTCCATGTGTGGCTGAGCATGTCC--------------ACGTGTG-GCTGAGCAAGTCCACGTGTGGCTGAGCATGCCCTTGTATGACTGTGTCCCCG------------CATCACTGATTGTGTCTAT---------------GCA----------TGACTGATAGTGTCAGTGCTTG----------------ATTGTGCTCACTTATGTGTAGCTTAGAATGT----CCAAGTGTA---------GCTGAGCGAGTCCACGTGTGGCTGAGCATGTCC-A-CGTGTGGCTGAGCAT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
21 Myotis_myotis-NW_023416355.1-1011861_1012069             84.6%  33.2%    ---------------------------------------------------------C--------------GCGTGCAGGAGGCCACCCATCAATGTGTGTCTCTC----A---------CATGGATGTT-----------TCTGCCT----------TTCCCTCTCTCTCTTCCTC----TCTCTCTAAAAATCGATGGAAAGGTCCTCGGGGGAGGATTAAAATAAAAGAAGTGGGGTGGGCCCAGGGGAGCCC----TGTGGGTGGGGCTGGGGTGGGCGCCGGGACCCGCAGGCCTCGCGTTGCAGGAGGCGGACACGGACGACCAGCAGGGCACGCTGGGCTTTGAGGAGTTCTGCGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCCTGCTGGCCTACAGCGGCCACAAGGACCACCTGGCCGCCGCCGACCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGGGCCCCGGGGGGGGGGGGGCAGGTCCTGGCAGCGGGCACCCCGGCTTCCAGAGGGAGCCCCCCGTGACCA--CGGCACGGTCTTCAGT-GGGGAGCCCCC-G-TGGGACTAGGCTTCCCCGT-----CCAGC-----CTTCCCACTTGGTCCTGTTCC---------------CGCCAC-GGG-------GGTCTGGCTGGCTCTGCCCCCTGAGCCCCTGGGAGGACTTGGGTAGCAGCAGGGGGGCAG------GTGAAGGG--CAGGATCCCTGGGCCCC--AGGAT--CCTCCCAGTGGGATGTGGATGGGCTCTGCTGCACCTTCTCACCCCCGGGCCCTGCCCGCT----GCCAAGCCCGCCCCGTCCACAGCACTCAGGGCCCCTAACGC------------------GGCCATGGCGGTGGCCATGGGGTGGGCCCAGCCGAGGGGGCCCAAGAGCCC---TTCTCTGA-TTGAAG------------------------------------GATCCAAGAGCCAAAGCCACGTGACCGCCTGGTCTGCTGGCCACAGTCCTGT---CATGTGATGCTGG-----AGGTG-GCCAGCGAGCC-CCGGGCAGGGGAGCCCAGGGCAG--GGCCCGAGCCACGCCCGCTGCGGGCAGCCATGACCTGG------CGTCAG----TTCC---GGGCGGGAGGCG------------GAG-----------------GCCCAGAGACTGACAGGTTGGCCCG---GCTC----TGCCCCTTCTCTGGCCCAGATGAC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
22 Dasypus_novemcinctus-NW_004486132.1-478448_478653        89.7%  35.2%    ----------------------------------------------------------------------------------AACCACTGGGCTGAGTCTGCTTCCCCCGTG----TGTGTCTTAAAGGAC-----------CACTCGGTGGG------GCCCGGGACACAGGGGTCCAGGGAGCAGCCGCGCGGC----CGTGACTGGGCAGT---GGCGAGGGGGGCG----GGCTGGTGCTTCCGGGCTGGGGGCCCTGGGGGCGCGTTCCGGGGTGGCCTGTGCCAGGACCCAGGCCTTGGTTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCGCCAGGGGACGCTGGGCTTCGGCGAGTTCTGCGCCTTCTACAAGGCCATGTCCACGCGCCGCGACCTCTACCTGCTCCTGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGATGCGGCCGGCCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGTGGCCCCGGGCGCGGCTCCGTGCTGGGGCGGGCGGGGCTTCCGGCTGGCGCTGTCCCGCGCCGCTCACCCC-CGGCTCCCTTGAAGCCCCAGCCGGCCTGCGCGGGGCGCCCCCTCCAGGGC-----CTGCGCGGCCCCCGCCAACCCTGCACCCTCC---------------ACCCCC-CCAGTGCAGCCGCCGAGGCC---CGAGACCC--CTCCCGCCCCAGGTTCCCCCTCGGAGCCTTCTAAGGC--------TCG-GG----------GCCGGCCTGC--A-----GGCTACTGGCCGCTGTGTCTCAAGC------C--ACGTGACTCTGGGATGTGGGCTCGCGGGCTCAAGTGGG-GGGCAGACTGC-AGGGCTGGATCCTCCTCTCGCTG-----CTGTCTCTCCTGACGTGGGGGGGCAGGCGGCACGGGCGCTGGGGGGGGG-GGGGGG-A------GACTGTCC-CTAGGT-----CTGCCTGGGCCTCCTGA----------CTCCCGATTCTTGGCCTAAATGACAGGGCGTGACGCT--------CGTAAAGCTGTCCCGGGGCCATCATCGAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNN--------------------------NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN---NNNNNN--NNN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
23 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-241816_242073      82.4%  44.0%    ------------------------------------------------------------------------AGGGCAGGGATGGGTCGGATGA---------------------------GCAGGAGCCCAGTGAGATGTCCTGTTGCTCACAGAAATGACGGGGACAGAGGTG-GACGAGGGTGGATGGGCTTGGG--CTTCGGACTGATGA---GGCGTGGG--T-G--GGCCTGCATGACCCCTGTGGAAGCTGCAGGCGGCAGCGGGGGAGGGCTGTGGATGGGAACCAGAGGCCTCGTGTTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCAGCAGGGAACCCTGGGCTTCGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGCGACCTCTACCTGCTCATGCTCACCTACAGCAGCCACAAGGACCACCTGGACGCTGCCGACCTGCAGCGCTTCCTGGAGGCAGAGCAGAAGGTGAGGGCTGGGCAGGAGCAGTGGGGCTGCAGTGTGGCCCCACCTTCCGCTCCTGTTCACAGTGTGCTGGGAGCCTGGGGACAGGGTGGTC--------------------------------------------------------------------------------------------------------ACAGCCCGGCACCCAA--G-----GCCCCCTGAATCAGCTTCAGATCCTGTGTTCCAG-GG--TGGTCCCCACAAG------GGCTGCCAAGTGGATGGGGGAGTTTGCAGTTTCTCCTCCGAGGG-C------------CTCTGAGCGGGTGGGTCCCACCTGCGGTGGT-------------------GAGCCCATGGATTGCCCAT-CGTCGCCGGCGCAGAG------CCTCTCGTGGGCTGGGCTTCCGCGGCTCAG-CCGTCCTG------CGCTGTGT-TCTTGCC-------------------------GCAGGGCTCCG---GGCCTG-CTGCCCCCACTCTCCCACTTGTCCAGCAAAAGCCCAGATGCCTCCTGGTGCCAAGTGGGGC-AAGCTACCCCCTTACCTTGACCTCAGGAAGTCCTGTCCATCCTTAGAGGCCAATTCCAAGGCCGAGTGC-------------------------------------------------------------------------TCTCTGGGCACTGCCCTACTGACCAGGGA-CCTAGA-------------------GTCTAGAGGCTCAGGG-ATCTGGGCCCCTTGTCTGGACC-TGGGCAGAGACCAGGTACCGCCTGCTCTGGTGGCAGGATGTGGAGATCCAGCCAAACCAGAGCCCCGTGGAGCCACCTCTCCTCTGCG     
24 Camelus_dromedarius-NC_044523.1-190288_190488            81.7%  32.2%    --------------------------------------------------------GT-------------------------GGCTTCTTGGTGGGAGAGTCGGAGGGGAG---------CCCAGTGA---------------AGACG--GCA-C---TGCGGGGCTTGGCGAGTACCCATGAACCCACAACATGGGTAGTGACATTGGCAAG-G-GGCGGGGGCAACGTGACTCAGGGTGGACTGGAGGCCCCCTCGTGGTCGGGGCCCAAGGTGGGACACTTGGGGACCCAGAGGCCTCCCCTTACAGGAAGCGGACACGGACGACCAGCAGGGGGCGCTGGGCTTTGAGGAGTTCTGCGCCTTCTACAAGGCGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGGCCCACAGCGGCCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCGACCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGCGGGCTCCCCAGCAGGAGCGGTGGTCCTGGGGGACGTGGCCTCACCTCATTTGGGCACTTGCAT-----C--CGTCTGTGGTGTGGCT-GAGG----GCT-GGGGGAAGGGTGGGCACCAGC-----CTGGC-----ACTCGAGGTCCCCTTACCGGA---------------CCTGCC-TTGCT--------------GCCCGTTG-CGG-CCCCGCCAGCCCGTTCCAGGGTGTGTCCCACAGGAGCCACA-AGCAGGTGGGGAAGGTGGGTGGCCCAGCCTGACCG------------------------------TGGCCCCCTGGAGCTTCCAGAGGGGAGCC-------------CATGGTCCTGT-TT--TAGTGTTGAGCATCTCCTGGGAC----------CAGGGTTCCATGGCCCAGCCTTCCCACC-AGGTCCTGCCACGGGGGCCCAGCTCAC---ACCCAGAG-CC---------------------------------------------CTGGG-CCCACTCCCCTCAAACGCTTGTCCAGCAGACACACAGAGGGCTCTGGGGGCTGGCAGGGTG-TC-CTGTCTATTTCCCTCGACTCCGAGCTGCTCCCTGGG----------CTCTGCCTCTCTTGGCCTGGGCCTGGGCAGTG-ACCAGGTCCTGCCCATTCCGGTGGACGGAGGCTGGCAG----------------------------TCTGTGGTGGGGGAGGGGAGGCATGCTCAGACCTCAGACAGCGTGCGGCCCCACCCCCAGGC----------------TGAGAGGGAG-TA---------------ACTCCTGGGACCCTGACTG----------------------------------------------------     
25 Hyaena_hyaena-NW_024080942.1-190104_190303               84.9%  34.0%    --------------------------------------------------------GTGA-----------------------CTGTGTCAGGTTTAGGTGCAAGTTGACCA---------CGAA------------------AGTCTG--GGG-CT--GGGAGGATAGGGTCAGATCTGTGTTAAAGGATCACTCGGTGGCTTCTTGGTGGGA-G-AGTCAGAGGGAGATGCCAGTAAATTCACTGTGCCAAGGATCCCAAGGAGCTATCAGGGTGGGACACTGGGGGACCCAGAGGCTTTGGCTTGCAGGAAGCCGACACAGATGACCGTCAGGGTACACTGGGCTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTATCTGCTCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACTACCTGGATGCCGCTGACCTCCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGGCACGACAGCAG--GCGTGGGTCCTGGTGTACTTGGCCTCGCCGTTGGCTCCCAGAGCACTTGAATC--CGTTCACTGTGACTGA-GAATCCTTCAG-TCTGGAAGGATGGGCCACAGC-----CTGGC-----ACTCAGGGTCCTCAAACCTGC---------------CTCCAC-TTAGTGGGCCTGCTTTGGTTCCCATCATGGG-CCATGCCAGCATATTTCAGGGTGCGTTCCCTGGAGGGC-CTGAGTGGGT----------------GGCTCCTCTGTGG--GCCTCTGAGTGGCTCAGCCATGACCA-CA--GACACTGAGCTTTCTCAAGGGAGCCTGCA--CTTGGCCGCAGCACCTTT-AG-----CATGTAGCACGTCGTAGAAC----------TGGGGTTGCATGGCCCAGCCTTCCCACC-TGTTCCAGCCATGGGTCTGGCTAGCTT---GTACCCCT-AAGCC---------G-----------------------CAGGCCCATTACCT-C---CACCTTTGATCCATTCTCCCGGTAGATGCCCAGATGCCTCCAGGTGCCAGAGGGGCA-TGCCCACCCATTTCTCTTGACTCTAGGCCTTTCTGTTCC----------ATACCAAGAGGCTGAGTGCTCCCTGGGCACTG-------CCCTGT----------TGACTGGGGGCCCA-G----------------------------CATCTG---------------GACGCTCAAGGATGTGGGCCCCTC------AACCATGGGCC----------------AGGCAGGGGC-TG---------------GGTG-------CCA---------------------------------------------------------     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *  ****.** *****.** *.**. *..**  * ***** ** *. ***** ** ******** **..  .**** ** ** ** ***** ** ******.**** .*  **** .. *****.*** *  ***     .* .. ** ****.***  *.  .* .**.*****.**. *