Job

PLCH2_human-child_34

Submission Status: Success!

Full Status

1. Iteration

Blast

Select Sequences

Alignment

RNAcode

Input

TTGACCCCCGTTTGGGGGGGCGCTGACCCCCGTTTGGGGGGGCGCTGACCCCCGTGTGGGGGTGGCGCTGACCCCCGTGTGGGGGTGGCGCTGACCCCCGTGTGGGGTGGCGCTGACCCCCGTGTGGGTGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGGGCGCTGACTCCCGTGTGGGTGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGGGCGCTGACTCCCGTGTGGGTGGCGCTGACTCCCGTGTGGGTGGCGTTGGCTCCCGTGTGGGGGGTGTTGACTGCTGTGTGGGGGAGGTGTTGACTCCTGCGTGGGTGTTGTTGACTCCCGTATGGGTGATGTTGGCTTCCGTGTGGGTAGTGTTAACTGCTGTGTGGGGTGAGTATATGGAGGTGGCTGTGGGTTGAAGGTGAAAAGCATATGGCTTCAGGCAGGTGCGTCAGTTCTGCATTTTCATGGGGCTGTCCTCCTGGTGGGTGGGCCCGTGCCCTGGGGAGTGATTGGAGGCCGTGACAAGGGCAGTGGAGTAGAGGAGGGTGGGCTTGCATGTTGGTCTTGACTGGGGAGTGGGGTGGTCCTGAAGGACCCCTGTGCATGCAGGCCCTGGTCGAGGTGCCAATGGGGACCCAAGGCCTTGCATTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCACCAAGGGACGCTGGGTTTTGAAGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCAGCCTGCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAGCAGAAGGTGTGCTGCCCGGGGCAGGTGTTGGGGGGCCAGCCATCAGGCCTCGCCTTCTGTTCTGAGCTTTGAGCTTCAGTCAGGGGACAGTGGTGATGGGGGAGCTGTCTGAAGCTATCCCAGGCCAGGGATGGGCTAC

Selection Arguments

Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.

Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.

Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.

Results

Coding Regions.

High Scoring Segment plot

Distribution of HSS in the input sequence

HSS Segment Plot

Filter regions

p-val
Select the result by p-value. Show only results which have a lower p-value than provided. Must be above 0 and below 0.05. Check the box if you wish to see only the best segment in a group of multiple overlaping segments. Often a strong conservation signal can be observed as a shadow on the opposite strand.

Result Table

HSS id Strand Frame Length Start End Score P Show Result
1 0 + 1 70 17172 17381 36.921 4.631e-07 Plot
2 1 - 3 39 17180 17296 17.570 0.011 Plot

Predicted protein sequence Download sequences as fasta

HSS id Sequence
1 0 GTQGLALQEADTDDHQGTLGFEEFCAFYKMMSTRRDLYLLMLTYSNHKDHLDAASLQRFLQVEQKVCCPG
2 1 SMSR*RSRRVDIIL*KAQNSSKPSVPWWSSVSASCNARP

Alignment Info

Alignment Tree

Alignment Tree

Full Alignment

Reference sequence (1): Target
Identities normalised by aligned length.
Colored by: consensus/70%
                                                          cov    pid  1 [        .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         .         .         .         4         .         .         .         .         :         .         .         .         .         5         .         .         .         .         :         .         .         .         .         6         .         .         .         .         :         .         .         .         .         7         .         .         .         .         :         .         .         .         .         8         .         .         .         .         :         .         .         .         .         9         .         .         .         .         :         .         .         .         .         0         .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         . ] 1372
 1 Target                                              100.0% 100.0%    ----------------------------------------------------------------------------------------TTGACCCCCGTTTGGGGGGGCGCTGACCCCCGTTTGGGGGGGCGCTGACCCCCGT-GTGGGGG--TGGCGCT-GACCCC------CGTGTGGGGGTGGCGCTGACCCCCGTGTGGGGTG---GCGCTGA-CCCCCGTGTGGG---TGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGGG-----------CGCTGACTCCC------------G---TGTGGGG-GGGCGCTG--ACTCCCGTGTGGGTGG----CGCTGACTC----------------------------------------------------CCGTGTGGGGGGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGGGCGCTGA--CTCCCGTGTGGGTGGCGCTGACTCCCGTGTGG-GTGGCG--------TTGGCTCCCGTGTGGGGGGTGTTGACTGCTGTGTGGG----------------------------------------GGAGGTGTTGACTC-----CT-----GCGTGGG----TGTTGTTG------ACTCCCGTATGGGTGA---------------TGTTGGCTTCCG-TGTGGGTAGTGTTAACTGCTGTGTGGGGTGAGTATATGGAGGTG----GCTGTGGGTTGAAGGTGAAAAGCATATGGCTTC----AGGCAGGTGCGTCAGTTCTG-CATTTTCAT---------GGGGCTGTCCTCCTGGTGGGT-------------------------------GGGCCCGTGCCCTGGGGAGTGATTGGAGGC-----------CGTGACAAGGGCAGT--GGAGTAGAGGAGGG---------TGGGCTTGCATGTTGGTCTTGACTGGGGAGTGGGGTGGTCCTGAAGG--ACCCCTGTGCATGCAGGCCCTGGTCGAGGTGCCAATGGGGACCCAAGGCCTTGCATTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCACCAAGGGACGCTGGGTTTTGAAGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCAGCCTGCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAGCAGAAGGTGTGCTGCCCGGGGCAGGTGTTGGGGGGCCAGCCATCAGGCCTCGCCTTCTGTTCTGAGCTTTGAGCT----TCAG--TCAGGGGACAGTGGTGA-TGGGGG-AGCTGTCTGAAGCTATCCC----AGGCCAGGGATGGGCTAC----------     
 2 Colobus_angolensis-NW_012122820.1-209017_209943      96.7%  75.7%    -----------------------------------------------------------------------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNN----TTTTT-GACTCC------CATGTGGG--TGGTGTTGACTCCCGTGTGGGTGG----TGTTGA-CCGCTGTGTGGGG--TGGTGTTGGCTCCTGTGTGGGGTGG-----------TGTTGGCTC--------------C---CTTGTGGGTGGTGTTG--ACTCCTGT--GTGGGC----GTTTTTGAC---------------------------------------------------TCCCATGTGGGTGGTGTTGACT-CCCGTGTGGGTGGTGTTGACCACTGTGTGGGGTGGTGTTGG--CTCCCGTGTGG--------------------G-GTGGTG--------TTGGCTCCCTTGTGGGTGGTGTTGACCGCTGTGTGG-GGGGTG------TAG-------------ACTCCCATGTGGGTGGTGTTGACCGC-----TG-----TGTGGGG----GGGTGTAG------ACTCCCATGTGGGTGG---------------TGTTGACTCCTG-TCTGGGTGGTGTTGACTGCTGTGTGGGGTGAGTATATGGAGTTG----GCTGTGGGTCGAAGGTGAAAGGCATATGGCGTC----GGGCAGGTGCGTCAGTTCTG-CATTTTCAT---------GGGGCTGTCCTCATGGTGGGT-------------------------------GGGCCCGTGCCCTGGGGAGTGACGGGAGGC-----------TGTGACGAGGGCAGT--GGAGTAGAGGAGGG---------TGGGCTTGCGTGTTGGTCTTGACTGGGGAGCGGGGTGGCCCTGAAGG--ACCCCTGTGCATGTAG-CCCTGGTCGAGGTGCCAATGGGGACCCAAGGCCTTGCACTGCAGGAAGCAGACACGGACGACCACCAAGGGACGCTGGGTTTTGAAGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCAGCCTGCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAACAGAAGGTGCGCTGCCCGG-GCAGGGGTTGGGGGGCCAGCCATCAGGCCTCGCCTTCTGTTCTGAGCTTTGAGCT----TCACAGTCAGGGGACAGTGGTGA-CGGGGG-AGCTGCCTGAGGCTATCCC----AGGCCATCCCTGGGCTACCT--------     
 3 Rhinopithecus_roxellana-NC_044560.1-202440_203417    97.1%  82.6%    --------------------------------------------------------------------------------------------------CTGGGCTGCCTGGCCGCCAGCCCAGGGGATGTTGTTGACCCCCAT-GTAGGGG----GTGTT-GGCTCC------CGTGTGGG--AGGTGTTGATTCCTGTGTATGTGGGGGATGTTGG-CTCCCGTGTGTGTGGGGATGTTGGCTCCTGTGTG-GGGGG-----------CGTTGATTCCC------------G---TGTGTGTGGGGTGTTG--GCTCCCGTGTAGGGGG----GTGTTGGCT---------------------------------------------------CCCGTGTAGGGGGGTGTTGGCT-CCCGTGTGGGGGGTGTTGACTGCTGTGTGGGGGGGTGTAGA--CTCCCAGGTGGGTGGTGTTGACTCCTGTCTGG-GTGGTG--------GTGGCTCCCGTGTGGGTGGTGTTGACTGCTGTGGGGGGGGGGG------GTA-------------GACTCCCAGGTGGGCGTTTTTGACTC-----CC-----GTGTGGG----TGGTGGTG------GCTCCCATGTGGGTGG---------------TGGTGGCTTCCG-TGTGGGTGGTGTTAACTGCTGTGTGCAGTGAGTATATGGAGTTG----GCTGTGGGTCGAAGGTGAAAGGCATATGGTGTC----GGGCAGGTGCGTCAGTTCTG-CATTTTCAT---------GGGGCTGTCCTCATGGTAGGT-------------------------------GGGCCCGTGCCCTGGGGAGTGACGGGAGGC-----------TGTGACGAGGGCAGT--GGAGTAGAGGAGGG---------TGGGCTTGCGTGTTGGTCTTGATTGGGGAGCGGGGTGGCCCTGAAGG--ACCCCTGTGCATGTAG-CCCTGGTCGAGGTGCCAATGGGGACCCAAGGCCTTGCACTGCAGGAAGCAGACACGGACGACCACCAAGGGACGCTGGGTTTTGAAGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCGGCCTGCAGCGTTTCCTGCAGGTGGAGCAGAAGGTGCGCTGCCCGG-GCAGGTGTTGGGGGGCCAGCCATCAGGCCTCGCCTTCTGTTCTGAGCTTTGAGCT----TCACAGTCGGGGGACAGTGGTGA-CGGGGG-AGCTGCCTGAGGCTATCCC----AGGCCAT---------------------     
 4 Macaca_nemestrina-NW_012011823.1-208979_209932       97.0%  79.9%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGGAGTGTAGACTCCCCTGTGGGTGGTGGTGGCTTCCAT-GTGGGAG----GTGTT-GACTCT------CGTGTGGG--TGGTGTTGGCTCCCGTGTGGGTCA----TGTTGG-CTCCCGTGTGGGT--GGTGGTGGCTTCCG--TGTAGGAGG-----------TATTGACTC--------------T---CGTGTGGGTGGTGTTG--GCTCCCGT--GTGGGT----CATGTTGGC---------------------------------------------------TCCCGTGTGGGTGGTGGTGGCT-TCCGTGTAGGAGGTATTGACTCTCGTGTAAGGTGGTGTTGA--CTCCCATGTGGGTGGTGTTGGCTCCCGTGTGG-GTGGTG--------TTGGCTCCCATGTAGGTGGTGGTGACTGCTGTGTGCGGGGGTG------TAG-------------ACTCCCGTGTGGGTGGTGTTGACTCC-----TG-----TCT-GGG----TGGTGTTG------GCTCCCATGTGGGTGG---------------TGGTGGCTTCTG-TGTGGGTGGTGTTAACTGCTGTGTGGGGTGAGTATATGGAGTTG----GCTGTGGGTTGAAGGTGAAAGGCATATGGCGTT----GGGCAGGTGTGTCAGTTCTG-CATTTTCAT---------GGGGCTGTCCTCATGGTGGGT-------------------------------GGGCCCGTGCCCTGGGGAGTGACTGGAGGC-----------TGTGACAAGGGCAGT--GGAGTAGAGGAGGG---------TGGGCTTGAGTGTTGGTCTTGACTAGGGAGCGGGGCGGCCCTGAAGG--ACCCCTGTGCACGTAG-CCCTGGTCGAGGTGCCAATGGGGACCCAAGGCCTTGCACTGCAGGAAGCAGATACGGACGACCACCAAGGGACGCTGGGTTTTGAAGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCAGCCTTCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAACAGAAGGTGCGCTGCCCGG-GCAGGTGTTGGGGGGCCAGCCATCAGGCCTTGCCTTCTGTTCTGAGCTTTGAGCT----TCACAGTCAGGGGACAGTGGTGA-TGGGGG-AGCTGCCTGAGGCTATCCC----AGGCCATCCCTGGGCTACCTGGG-----     
 5 Gorilla_gorilla-NW_022150805.1-21175_21909           92.3%  69.7%    -----------------------------------------------------TTGGGCCTGGCGTTCCTCGTGAGTAGGGGCTGAGCTGGGGTGTCACACTGGGGCCATGTCACCTCCA-AGCAGGTCATGCTCTCACCCTGCCCTGCCC--AGCCCTG-GGCTCCCATACCCTTGTGAGGCAAAGTCCTCAATCCTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGCATCCCCTTCCATGGGGACTTTATTGCTGCCATGGGATTC-----------CCATGGCCCCTGTAGCACCTTGGGTTTCTGCTGGGATGCCCAG--CCTCCAGCCCAGAGTG---TGTTGTTGAC---------------------------------------------------CCCCGTGTGGGGGGCGTTGACT-CCCGTGTGGGTG-------------------------------------------CATTGTTGACTCCCGCGTGGGGCGGCG--------CTGG---------------------------------------------------------------CTCGCGCGTGGGGGGCGTTGGCTC-----GC-----GCGTGGG----GGGCGTTG------GCTCCCGTGTGGGTAG---------------TGTTAACTCCCG-TGTGGGTAGTGTTAAGTGCTGTGTGGGGTGAGTATATGGAGGTG----GCTGTGGGTTGAAGGTGAAAAGCATATGGCTTC----AGGCAGGTGCGTCAGTTCTG-CATTTTCAT---------GGGGCTGTCATCTTGGTGGGT-------------------------------GGGCCCGTGCCCTGGGGAGTGATTGGAGGC-----------CGTGACAAAGGCAGT--GGAGTAGAGGAGGG---------TAGGCTTGCGTGTTGGTCTTGACTGGGAAGTGGGGTGGTCCTGAAGG--ACCCCTGTGCATGCAG-CCCTGGTCGAGGTGCCAATGGGGACCCAAGGCCTTGCATTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCACCAAGGGACGCTGGGTTTTGAAGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCAGCCTGCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAGCAGAAGGTGTGCTGCCCGGGGCAGGTGTTGGGGGGACAGCCATCAGGCCTCGCCTTCTGTTCTGAGCTTTGAGCT----TCAG--TCAGGGGACAGTGGTGA-TGGGGG-AGCTGCCTGAAGCTATCCC----AGGCCAGGGATGGGCTAC----------     
 6 Piliocolobus_tephrosceles-NC_045434.1-208534_209366  94.0%  76.4%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCTGCCCTGCCC--AGCCCTG-GGCTCCCATACCCTTGTGAGGCAAAGGCCTCAATCCTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGCATTCCCTTCCGTGGGGACTTTATTGCCGCCATGGGATTC-----------CCACGGCCCCTGTATCACCTTGGGCTTCTGCTGGGCTGCCCGG--CCTCCAGCCCAGGGGA---TGTTGACCCC---------------------------------------------------CATATA---GGGGGTGTTGGCT-CCTGTGTGGGTGGTGTTGACTCCTG-GGTGGGTGGTGTTGA--CTCCCGTGTGGGCGTTTTTGACTCCTGTGTGGG-TGGTG--------TTGGCTCCCGTGTGGGTGGTGTTGACTGCTGTGTGGGGNNNNNNNNNNGTTG-------------ACTGCTGTGTGGGGGGGTGTAGACTC-----CC-----AGGTGGG----TGGTGTTG------GCTCCCGTGTGGGTGG---------------TGGTGGCTTCCG-TGTGGGTGGTGTTGACTGCTGTGTGGGGTGAGTATATGGAGTTG----GCTGTGGGTTGAAGGTGAAAGGCATATGGCGTC----GGGCAGGTGCGTCAGTTCTG-CATTTTCAT---------GGGGCTGTCCTCATGGTGGGT-------------------------------GGGCCCGTGCCCTGGGGAGTGACGGGAGGC-----------TGTGATGAGGGCAGT--GGAGTAGAGGAGGG---------TGGGCTTGCATGTTGGTCTTGACTGGGGAGCGGGGTGGCCCTGAAGG--ACCCCTGTGCATGTAG-CCCTGGTCGAGGTGCCAATGGTGACCCAAGGCCTTGCACTGCAGGAAGCAGACACGGACGACCACCAAGGGACGCTGGGTTTTGAAGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGACGCCGCCAACCTGCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAACAGAAGGTGTGCTGCCCGGGC-AAGTGTTGGGGGGCCAGCCATCAGGCCTCGCCTTCTGTTCTGAGCTTTGAGCT----TCACAGTCAGGGGACAGTGGTGA-CGGGGG-AGCTGCCTAAGGCTATCCC----AGGCCATCCCTGGGCTA-----------     
 7 Sapajus_apella-NW_022437067.1-184846_185627          86.3%  63.5%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGCATCCTCTTCCATGGTGCCTTTATTGCCACCATGAATTCC-----------CT-TGGC-CCCTGCACACCTTGGGCTTCTGTTGCGCTGCCC-G--GCTCCAGCCCAGGGGA---TGCGGTTAACTCCTACA------TAGGGGTGTTGGCTCCCACGCTTGCGGGTGGTGTTGACTCCCATGTGAGGGTTGTTGGCT-CCTGTGTGGGTTGTGTTCACTCCCGTGTGGGGTGGTGCTGG--CTCCCATGTGAGTGGTGTTT-------TCTGTGTGGGTG--------TTGGCTCCCATGTGGGTGGTGTTGACTCTCGTGTTGGGGGCATTGACCCCTGTGTTGTGGGTGCTGGCTCCCCTGTGGGTGATGTTGGCTC-----CA-----GTGTTGG----GGGTGCTG------ACTCCCCTGTGGGTGGTGTTTTCTGTGTGGGTGTTGGCTCCCC-TGTGGGTGGTGCTGGCTCCTGT----GTGAGCTGAGTGGACTTG----CTTGTGGGTCAAAGGTGGAAGGCACATGGCGTC----GGGCAGGTGTGTCAGCTCTG-TATTTTCAC---------GGGGCTCTCCTCTTGGTGGGT-------------------------------GGGCCTGTGACCTGGGGAGTGATTGGAGGC-----------CATGACAAGGGCAGT--GGCATGGAGGAGGG---------TGGGCTTGCGTGTTGGTTTTGACTGGGGAGAGA-GTGCCCCG-AAGG--ACCCCTGTGCGTGCAG-CCCTGGGCGAGGTGTCCGTGGGGACCCAGGGCCTTGCATTGCAGGAAGCAGACACGGATGACCACCAAGGGACACTGGGGTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAGCCACAAGGACCACCTGGATGCTGCCAGTCTGCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAGCAGAAGGTGTGCACCCCCAGGCAGGGGTGGGGCG----GCCATCAGGCCTCACCTTCTATTCTGAGCTTTGACTG----AGAACTTAGGGTGGGGCAGGTCA-CAGCCC-AGCATTTGACTTTAGTTTTGAT-ATTACAGGGTGCGCCCTATGGGACGAC-     
 8 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-189380_190095     89.4%  59.1%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCCC--AGCTCTG-GGCTCCCATGCCCTCGTAGGACCAAGGCCCCAGTACTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGTATCCTCTTCCATGGCACCTTTATTGCCTCCATGAATTCC-----------CT-CAGC-CCCTGCACATCTTGGGCTTCTGCTGTGCCGCCC-A--GCTCCAGCCCAGGGGA---TGCGGTTAACTCCCGCA------TAGGGGTGTTGGCTCCCATGCTTGCGGGTGGTGTTGACTCCCTTGTGAGGGTTGTTGGCT-CCTGTGTGGGTTGTGTTCACTCCCGTGTGGGGTGGTGTTGG--CTCCCATGTGGTCATTGACT-------CCCATGTGGGTG--------GTGTTTTCCAT------------------------------------------------------------------GTGGGTGTTGGCTC-----CA-----GTGTTGG----GGGTGTTG------ACTCCCATGTGGGTGGGGTTTTCTGTGTGGGTGTTGGCTCCCC-TGTGGGTGGTGCTGGCTCCCAT----GTGAGCTGAGTGGACTTG----CTTGTGGGTTGAAGGTGGAAGGCACCTGGCATC----GGGCAGGTGTGTCAGCTCTG-CATTTTCAC---------AGGGCCGTCCTCTTGGTGGGT-------------------------------GGGCCCGTGACCTGGGGAGTGATTGGAGCC-----------CATGACAATGGCAGC--GGCATGGAGGAGGG---------TGGGCTTGCGTGTTGGTTTTGACTGGGGAGAGA-GTGTCCCTGAAGA--ACCTCTGTGCACGCAG-CCCTGGGCGAGGTGTCCATGGGGACCCAGGGCCTTGCTTTGCAGGAAGCAGACACGGACGACCACCAAGGGACACTGGGGTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGACGCCGCCAGTCTGCAGCGCTTCCTGCAGGCGGAGCAGAAGGTGTGCACCCCCAGGCAGGCGTGG-GTG----GCCGTCAGGCCTCACCTTTTATTCTGAGCTTTGACTG----AGGGTTTAGGGTGGGGCAGGTCA-CAGCCC-AGCATGTGAGAGCCCCCTCACA-TTGGCTTTAGTTTTGATATTACAGGGTG     
 9 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-110068_110673         83.0%  47.8%    TGAGGGCTGAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTTGTGAGTGAGGGCTGAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTTGTGAGTGAGGGCTGAGCTGGGGTGTCACACTGGGGCCATGTCACCTCCAAGCAGGTCATGCTCTCAGCCCTGCCCTGCCC--AGCCCTG-GGCTCCCATGCCCTT-GCTAGGACCAAGGCCAGTACTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGCGTCCTCTTCCGTGGCACCTTTATTGCCGCCATGAATTCC-----------CT-CGGC-CCCTGCACAGCTCGGGCTTCTGCTGCGCCACCC-G--GCTCCAGCCCAGGGGA---TGCGGTTCACTCCCGTG------TAGGGGTGTTGAC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCCTGTGT-AGGAGCATTGACCC-----CT-----GTGTTGG----GGCTGTTG------GCTCCCT-------------GTGGGTGGCGTTGGCTCCCGTGT-GGGTTTTGGTGTCAGCTCCTGT----GTGAGCTGAGTGCGCTTG----CTTGCGGGTTGAAGGTGGAAGGCACGTGGCGTC----GGGCAGGTGTGTCAGCTCTG-CATTTTCAT---------GGGGCTCTCCTCTTGGTGGGT-------------------------------GGGCCTGTGACCTGGAGTGATTGG-------------AGGCCGTGACAAGGGCAGT--GGCGTAGAGGAGGG---------TGGGCTTGCGTGTTGGTTTTCACTGGGGAGTGA-GTGCCCCTGAAGG--ACCCCTGTGCATGCAG-CCCTGGGCGAG-TGTCCATGGGGACCCAAGGCCTTGCATTGCAGGAAGCAGACACGGATGACACC--GAGGACACTGGGGTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACGCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAAGACCACCTGGATGCCGCCAGTCTGCAGCGCTTCCTGCAGATGGAGCAGAAGGTGTGCACCCCTGGGCAGGGGTGGGGCG----GCGATCAGGCCTCACCTTCTCCTCTGAGCTTTGACTG----AGAGCTTAGGGTGGGGCGGGTCA-GAGCCC-GGCATTTGAGAGCCCCCACGTT-TGGCTTTAGTTTTGATATTAC-------     
10 Callithrix_jacchus-NC_048389.1-189813_190474         88.6%  55.7%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------GCCATGTCACCTCCAAGCAGGTCATGCTCTCACCCTGCTG-TGCCC--AGCTCTG-GGCTCCCATTCCCTTGTAGGACCAAGGCTCCAATACTTAAGGCTCAAGGATTTCAAGCATCCTCTTCCATGGCACCTTTATTGCCACCATGAATTCC-----------CT-CGGC-TTCTGCACACCTTGGGCTTCTGCTGCACTGCCC-G--GCTCCAGCCCAGGGGA---TGTGGTTAACTGCCGTA------TGGGGTGTTGGCTCCCA-----CGCGGGTGGTGTTGGCCCCTGTGTTTGGGGTGTTGGCT-C---------------------CCATGTGGGCATTG---------ACTCCTGTGTGGGTGTTT-------TCTATGTGGGTG--------TTGGCTCCCCTGTGGGTGGTGTTGATTCTCGTGTTGGGGGCATTGACCCCTGTGT--------------------------------------------------------------------------------------------------TGGGGGTGTTGGCTCTCG-TGTTGGTGGTGTTGGCTCCCGT----GTGAGCTGAGTGGACTTG----CTTTCGGGTTGAAGGTGAAAGGCACGTGGCATC----CGGCAGGTGTGTCAGCTCTG-CATTTTCAC---------AGGACTCTCCTCTTGGTGGGT-------------------------------GGGCCCGTGACCTGGGGAGTGATTGGAGCACGGGAGTGGCCCGTGACAAGGGCAGT--GGCATATAAGAGGG---------TGGGCTTGTGTGTTGGTTTTGACTGGGGTGACA-GTGCCCCTGAAGG--ACCCCTGTGCATGCAG-CCCTGGGTGAGGTGTCCATGGGGACCCAAGGCCTTGCATTGCAGGAAGCAGACACGGATGACCACCAAGGGACACTGGGGTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAATCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCGGTCTGCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAGCAGAAGGTGCGCACCCCCAGGCAGGGGTGGGGCG----GCCATCAGGCCTCACCTTCTATTCTGAGCTTTGACTG----AGAACTTAGGGTGGGGCAGGTCA-CAGCCT-GGCATTTGAGAGCCCCCAGCAT-TGGCTTTAGTTTTGATATT---------     
11 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-177560_177872   85.8%  43.9%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCCCCCACCGGTC-CC-------------CCAGCAG--CCCTCTGTGACTCCGACCACCTG-GGCAGGTGTGTGA---------CGAGCTGTCAGGGCTGCCCCAGCCTGATGTATTGCGCTCTGTTGCTCTGTGGAGTGTGG-----------GGTTGGGCGCTGCCAGGC-----ATTCCCGGTGAGGGGCCTGA--GCTGGGGCGTCACGCCAGGGCCCCAACACTGCCAAG------GAGGCC-------------------ATGTGGTCACCCCACCCCACC-GGGGTCCCTCGC--CCTCGCTGGATA----AAGCCCCAATCTTTAGGCCTCAAGG-------------GTTTCAAGCAGCCCCTTCTATGGGAGCC--------TTTC-----------------TTGGCCATTCCCAGGGACCCCCCGAGCCCTACA----GCACCTCAGCTTGCATCTGGGCAGCCTGGCCGCTAGCCAG-----CCCAGTG----CGCTCTTG------ACTCACATG---------------------------------------CGGAGT-------------------------GTGGACTCC----AGTGTGGCTCGATCTTGAAAGGCATGCAGACGC----GTAGGGGCGCGTCAGATATG-CGTCTTTCCGAAAGGCCATTGCCTGTTCTCTGGGTGGGAGGGCACCGGG---GAGCCCAGCGAGCCACGGCTGCATGTGCCCAGGGAGCAAACTAAGGC------------CGCGGCGTGGGCAGTGGCGAGGCGGGGAGGA---------GGGGCTCGCAGCCTGGCCTTGACTGAGGAGGGGGCGGGCC-TGCAGG--GCC-CTTCGGGTGCA--GCGCTGGGCGGGCTGTGCATGGGACCCGAGGCCTTGCCTTGCAGGAAGCAGACACGGATGACCACCAGGGGACCCTGGGCTTCGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACGCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGACCCCACCGACCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGCTGCGGAGCTTTGGCGGAGGGCGTGGGGACAAGGCAGTCACAGGCAGCATCCAGCACCCC--G----TGGGCTTCAGTCCCCATGTTCCA-GGGAGC-AGCCCCT-GGGGCTGCCACGTGGGCGGGAAAGGTTTGCA------------     
12 Artibeus_jamaicensis-NW_023552099.1-176503_176732    82.9%  36.8%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGCTCTGGGTTGGCCCTGTCCCAGCCTAGGCCTGGG---------------TCCCTGGCAT----------GGGCTCTCAGGTCCTGGAGCAAGAATGCGGGGCC----CTG---CCCGGTGCCCACTGTGCCGCAGCGCCCGGAGCAGCAGCAGCCAGG-AGCACAGGACGGGACC---TAG-----CTTT-------------------CCCGGAGACCCACTCTCTTCGGAGACGG--GGACACAGGGATGGCTGTGGCCACTTGCCTCG---GTGATGCTCCTGGTTCAGAGGGGGCC-------CCAGGGACCTGGCAC-CCACCCCAGGGCCACCCAGAC----TGTGTGGCCACGTGAGGGACACCAGC-CAATGGCCTACAGGTCTGGCAGGTGCTGCTG---TCCATGGTGCTGACC-TGGGGTCTGTCCTGGCTGGAGAT-A-----TCTTCAC----GCTGGTTCTGTCCGCCTCCCGCCCCCTGGGCCAAA---GAACCGGACTCTGCACTCCGGGTCTTGAGCAGCACCTTCTCAGGTTCTGACTCTCACCAGCTCC---CAGTGACTCCC--AGCCTCAGAGCACCTGAAGGC-----CT--TG------------------GTCAC---CGG--ACACCCTTGTCCTCTGGTCTAT--CCC--GTC-TTGAGCCCCACGGGGCAGGGCA------------GCACT---------------------------------TGGTCCTCAGTGTCCCTGGG---------ACAGTGAGGTTTGTGGGGACGGTCAAGAGGTGG--GGGTGGGCCTGG--AGGCCTGTGTAGGCTC----CGGGGGGGGACGCAGGGGGACCCACAGGCCTTGTGCTGCAGGAGGCGGACACGGATGACCACCAGGGCACGCTGGGCTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCAGCCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGCCCCGGTGGGGATGAG--GT--GTC--GGGGGGACCACACTCGACCACAGCACCATGTGGGCCCCT-TGTGGGTCTAGGGTGACTGGGCC-CAGCCTTCCTCTCTGCAT-CCCCGTCCC--CCGAGCTCCATGCCATTGT---------     
13 Sturnira_hondurensis-NW_023520724.1-177163_177362    83.5%  37.6%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCTAGGCCTGGG---------------TCCCCAGCAT----------GGGCTCTCGGGTCCTGGAGCAAGACAGTGGGGCC----CTG---CTGGGTACCCACGGTGCCGCAGTGCTGGGAACAGCAGCGGCCAGG-AGCACAGGACAGGACC---TAG-----CTTT-------------------CTCGGAGGCCCACTCTCTCCGGAGACGG--GGACACGGGGGTGGCTGTGGCCACTTGCCTCA---ATGATGCTCCTGGTTCGGGGGG---G-------GCAGGGACCTGGCAC-CCACCCCAGGGCCGCCCAGAC----TGTGTGGCCACATGAGGGACACCAGTCAGATGGCCTACAGGTCTGGTAGGCACTGCTG---TCCATGGTGCTGACC-TGGGGTCTCTCCTGGCTGGAGGC-A-----CCTTCAG----GCTGGTTATGTCCGCCTCCCGCCCCCCAGGCCAAA---GAGCCGGGCTTGGCCACCCGGGTCTTGAGCAGCAACTTCTCAGGTTCTGACTCTCACCCGCTCC---CAGTGACACTCCCAGCCTCATAGCACCTGAAGGC-----CT--TGGGGCGGCCCGGCC-CCTGGTCAC---TGG--ACACCCTTGTCCTCTGGTCTGT--CCCCAGTC-TTGAGCCCCATGGGGCAGGGCG------------GCACCTA------------------------------GGTCCTCAGATGCTCCTTGGG---------ACAGTGAGGTTTGTGGGGGCAATCAAGAAGTGG--GGGTGGGCCTGG--AGGCCTGTGTAGACGTGGCTCAGGGTGGGACGCAGGGGGACCCACAGGCCTTGCGCTGCAGGAGGCGGACACGGATGACCACCAGGGCACGCTGGGCTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGACGCTGCCAGCCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGGCCCCTGGCGGGGATGAGGTGCCGG--GGGGAGCCCACACTTGGCCACAGCACCCTGTGGGCACCT-TGTGGGTCCAGGGTCCCCAGGCC-CAGCCTTCCTCTCTGCGT-CCCCGTCCC--CCAAGCTCTGGGC---------------     
14 Molossus_molossus-NW_023425372.1-174422_174724       82.2%  38.1%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAAGGCTGGTGGACACTGCTGTCCATGGTGCTGACCCGGGGT-------------------CTCCCTGCCGGGAGTCA-CCTCCAAGT-GGGTTAGGTTCGCACCCTGTCC-------------CCACCTGCACCCCT-------CAGGGCCAGAGAGCTGTCT-------TTACACTCGGGGTCTTG-AGCAG-CACCTTCTAAGGTCC--CGACCTTGCTTCCTCCTGGGGTCTCTCAGCCTTGTA--GCCCCTT-----------GGCT-----TCAGCTCCCCAGGGCCTGACACCGGGACGCTCCCTGA---GCCAGTGGGTTCATAAAGGGCCCATGGCCTCGTTGG-----------------GGTCCCGGTGGCTTTGCCCCTGGGGGTTCCTGTGGGTGTTG--CGTG---AGCCACTCTGTCTGCAAAAGGGGGGCAGTGGCTGAGACCGAGCACACCATGGGCAGCCATTGTAGTGACAGGATCAAGGCCCAGGGGGA-------------CACTGACTCC----AGGGGCTGTCGGCTCCGAGTATGATGTCACTGTGCTGGGCTCA----GCTGCAGGTTAACCGTGAAAGGCTTGGACCAG---------------------------------------------GGTCAGTGGTCTTGGTGGGACAGTCAGAAG-------------GGGAGCCCGGTGAGGGTCCCGGGGAACAACCAGG-----------AGGCCGTGACATGGGCAGTGGCACTGGAAGGGGGAGGGT------GGATTT-------------------GTGGGGGTGACTGAGAGTGGG--GGTGGGTCTGGAGGACCCCTGGGTGTGGCTCCAGGTGGGACCCACGGGCTGTGCGTTGCAGGAGGCGGACACGGATGACCACCAAGGCACTCTGGGCTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACTTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGACGCCGCCGACCTCCAGCGCTTCCTGGAAGTGGAACAGAAGGTGAGTGTGCCCAGCAGGCTGGGGCTGCAGGCGGCACACCCCTGCGCTTCCAGAG-GGAGCCCCCCTCG----ACCGCA--GCTTCCCAGT------CCAGCCTGCCCTGCTCCC--GGCCCCGCCTCCTCCGTCCACCCACTTGTCCGGCAGAC     
15 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-187877_188194     81.6%  39.8%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGGGGTGTTGGCTTCCAGGGTGGGGCGTTGACTCCAGGGTGAAGTAT---TGG-------------------CTCCAATGTGGGGTGTTGGCTCCCATG-GTGAGGTGTTGACTCCCAGGGAGGG-----------CTGTTGGCTCCC-----ATGTGGGGTGTTGACTCTGTGTGTGG---TGTTGACTCCCAGAGTG-GGATGTTGACTTCAGGGTGAGGTGTTGGATCCAATGTGGGGTGTTGGC--TCCCAAGGTGGTGCATTG----------------------------------ACTCCCAGGA--------------------AGGGGTGTTGAC------------TCCCACAGTGGG--GCA-TTGA---CTGCAGGGTGAGATATTGGCTCCAATGTGGGGTGTTGGCTCCCAGGG---TGGGGTGTTGGCTTTCAGTGTGGGGTGTTGACTCCAGAGTG----------AGG---TG---TTG------ACTCCAGT-------------------------------------GTAGGGTATTGGCTCTCAGTGTGGGGTGACTGTGACAGGTTCA----GCTGCAGGTTGACTTTGAAAGGCTTGGACTCG----GGGA-----GAGTGACGTCAG-TTCTGTGTTAAAGAGTCCCTCAGTGGCTTCTTGGTGGGAGAGTCAGAGG-GGGTGTCCAGTGAAGAAGCTGCCTGAGGGGCCTGGGCAGCAATCAT-----------GGGCCGTGACATGGTTAGTGGCGTTGGAAGGCGGAGTG------TGGATTTGTCATTCAGTGTTGACTGAGGCGCGGGGGTGGGCCTAGAG--GACCCCTCATGAGCGTGGCTCAGGGT-GGGATGTGGGGGACCCAGAGGCCTTGCGTTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCAGCAGGGGACACTGGGCTTTGAGGAGTTCTGCGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGACGCCACTGACCTCCAGCACTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGGCACCCTGGCAGGAGAGTGGGTCCTGGCCAACGTGGCGCCACCTCAGGT----TCCCGGAGCG----TTTGAGCCTGCTCAGTGTGGCT--GAGAGCTTGGGGAAGGGT-GGGCCATGGCCTGGCATTCGAGGTCC-------------     
16 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-188807_189131        84.5%  40.1%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCTGCTAAGAGTCCTTGTCCTCCAGGTCTGTCCCCAGGTCTGGG-------------GCAGGGCAGAACCAGGTCACACAGGGCCTT-GGGCCTTGGCATTTCCAGGATATGACACCACA---GTAGATGCTCCTTGGGC-CAATGGATGCACAGAGAAGGCTGTAACAGGTTCACTGG-GGTCCTG-GCGGGTTTTCTC--------------------------------------CTTGTAG-----------------------CCT-----TGACCCCTGCGCAGCCTTGCCCTTGAGGTAGCCTTGAGGATTCCTGGAGGTGTTTTATAAGCCCCTTCTGCC---------------------TGTGAAAGGAGGACAGCAGCCA------AGACTTACTTCTAATGCAG---AGACCTGAACC------AGGACACTCCTGGGCCCCCGGGGC----TGCATGC-----ATTTCTAATCAGTGGGTAGCCA----------------------------AT-------TAGGTGTCATTGACGCCAGA-GTGGGGTGACTTGCAGGGCTTG----GTGGCCAGTCAACCTTGAAAGGCATGGAGGAGG----------GCAGAGTGGGTCAGAGCTATTTTCAAAAGGTCACTCCATGTCTTCTTGGTGGAAGAAAGCAAGC-TGGAGTCCAGTGCGCTGCAGCCATGTGTGTCTGGAGGAACCATCTG-----------AGGCTGTGACAGGGGCAGTGGCGGAGGAAGAGAGG------A--TGGGTTTGCAATTCAGGCTTGACTGAGGAGCAGGGTGTGACTCCAAGACCCTCATGGATGCAACTTGGAGGATTCAGACACAGATGGTGACCCGACACCTTGCATTGCAGGAAGCAGACACGGATGACCACCAGGGAACTCTGGGCTTTGAGGAGTTTTGCGCCTTCTACAAGATGATGTCTACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACTTGGATGCTGCCGACCTGCAGCGCTTTCTGGAGGTGGAGCAGAAAGTGAGCTTGGGCAGGAGCAATGGGCCTGCCAAAATGGTCTCATCTTCGCTCTGGT----TCACTTTGTGCAAATTGGCTTCGGTTCCCCCATTCCCTGGGGACTGACAGGTGGGG------------AATGCTTGTGGTTTCTCTTC--------     
17 Miniopterus_natalensis-NW_015504651.1-676625_676925  81.7%  35.8%    -------------------------------------------------------------------------------------AAG------GCCGGTATGTT------------CCCACCCGGTCCCCCGTGTACCCTTGTCCTCTGGTCTG-TCCCTGGGCTTGA--------------------------------------GCCCTGTGGGACAGG-GTAGCACCT-TGTCCTCGGTGTCCCCAGGGCCTGACACCCACCTCAGAGATGCTCCCTGGGC-CGGTAGGTTCATGAAGGGCCCA-CGG---TCTCCTTGG-GGTCCTG-GTGGCTTTGCCCCTGGGGGTTCCTGTGGGTGCTGCGTGAGCCACTCTGTCTGCACAAGGATGACAGTGGCCGAG------------------------------------------------------ACCAGGGTCCTCTCATCTCTGCTGTGGAGACTGGAGCCAGGCCCC--CCATGCACATCATAGGCCCCGGGGCTCTGCTGCTTGAGGGGCAGCTATTGTCA---CAACGGGCGCACGGCCCAGGGTGGGCATTGGCTCCGGGA------------------GGCTGCTG------GCTCCTGG-------------------------------------TGCAGGGGCCTGGCTCTCAGGGTGGGTCACGGTGCTGGGTTCA----GCTGCAGGTTCACCTCCAAAGGCTTGGGCTAGG----------GGAGGTGGGGTCAG-GTCTGTGTTAGAGGCTCACCCAGTGGTCTC--GGTGGGAGTCCGAAGGG-----------------------------------GAGTCTGCTGAG-----------GGTCCCACACATGCACAGCGACATGCAAGGAGGAGGGT-------GTG-------TGTGGGGCTGACTGAGAAGTGGGTGTGG---GCCAG--GAGGACCCCTGTGAATGCGGCTCAGGCTGGGCCGCAGGGACCCACGGGCCCGGTGTTGCAGGAGGCGGACACGGATGCCCAGCAGGGCACCCTGGGCTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCGACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGTGACCACAAGGACCACCTGGCTGCCGCCGACCTCCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGGGGCGCCCGGCAGGGGTGGGGCTCCTGGC--CACAGGCACTGAGCTTCAAGGGGGAGCCCACACGTGAC-CACGGCACCATCCTCAGTGGG---GAGCACTTCCAGGGGCCAGGGTTCCCGGCCTAGCCTTCCCCCCTGT------------     
18 Desmodus_rotundus-NW_020090861.1-191629_191888       83.0%  35.9%    --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCAAGTTGGCCTGTCCCAGCCTAGGCTCAGG---------------TCCCTGGCAT----------GGGCTCTTGGGTCTTGGAACAAGACAATGGGGCC-----TG---CTGGATGCCCACTCTGCCGCAGTGCCAGGAGC-------------------AGTGGTGGCCT---GGACCTAGCTTT-------------------CCCGGAGGCCCACTCTCTTTGGGGACGG--GAACATGGGGATGGCTGTGGCCACCTGCCTCA---GTGATGTTCCTGTTCCGGAGGGGGCC-------TCAGGGACCTGGCAC-CCACCCCAGGGCCACCCAGAC----TGTGTGGCCACATAAGGGACACCAACCAGATGGCCTGCAGGTCTGGCAGGCGCCACTG---TCCACGGCGGTGACC-TGGGGTCTCTCCTGGCTGGAGGC-A-----CCTTCAC----GCTGGTTATGTGCGCC-------CCCCAGGACAAA---GAACCGGACTTGTCACTTGGGGTCTTGTGCGGCACCTTTTCAGAGTCTGACTGTCACCCACTTC---CAGTGACTTCCAGCCTCGTTGCGCCT--CAGGCC-----TC--TG--------GGCAG-CCCCGTCAC---TGG--ACACCCTTGTCCC--------------CAGGC-TTGAGCCCCATGGGGAAGG----------------GCAGCACCTTGGTCC-------TCGGAGTCCCAGGGGCCTCAGGGATGCTCCCTGGA---------CCAGTGAGGTTTGCAGGGACGACTGAGAAGTGG--GGGTGGGCCTGG--AGGCCCATGCAGGCGTGGCTCAGGGTGGGACGCAGGGGGACCCACAGGCCTCGCGCTGCAGGAGGCCGACACGGATGACCACCGGGGCACACTGGGCTTTGAGGAGTTCTGCGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGACGCCGCCAACCTGCAGCGCTTCCTAGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGGCCCCTGGTGGGGATGGGGTGCCCAGGGGGGAGCCCACACTGGACCACAGCACTGTGTGGGCACCT-TGTGGGTCTAGGGTCCCCAGGCC-CAGCCTTCTCCTCTGTGT-CCCCCGAGC--TCCGGGCCGTTG----------------     
19 Lipotes_vexillifer-NW_006774135.1-188161_188479      80.6%  37.5%    ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCCATGACTTCCTAAGGGCAGCCTGGCCTCCAGCACTGGGTGC---CCT--------------------TGTCCTCTGGGTCTGTCCCTGGCCTG-GGCTCTTGGTGTCCCCAGGGTCTGACACCTCA---GCAGGTGCTCCCTGAGT-GAGTGGATTCATGAAGGAGTCTGTGG---TCTCATTAG-GAGCCTG-GTGGGTTGGCCTGGGGGGTTCC-TGTGGGTATTGTGTGAGCTGCTTTCTGGTCTCAGCC----------------------------------------------------A--------------------CTGTCCTCTCATCTCTGCT--GTGGCAGCCAGTCTG--GGA-TTCCTACATGCCCGGGGGCCCGGTGCTTCTCTAATCAATGGACGGCCAACCCTA---ATTACAGATCACAGCCCAGTGTAGGCATTAACTCCTGGGTG----------GGG---TGTTGTTG------GCTGCAGG-------------------------------------ATGGG--GTATTTCTCCAGGGTGGGGTGACTTTGCTGGGTTCA----GTTGCAGGTTGACCTGGGAAGGCTCGGAAA-G----CGGG-----AGGTGGGGTGAG-AGCTATGTCAACGGGTCACTCGGTGGCTTCTTGGTGGGAGAGGCGAGGG-GGA-GCCCAGTGAGGATGCCGCTGCCGGGCTTGGGGAGCATTCATG-----------AGCCCGTGACATGGGCAGTGGTGCTGGAAGGGGGAGGG------GTGATTCG--ACTCAGGGTTGACTGAAGAATGG---GGAGCTTGGAG--GCACCCTCGCGGTTGAGGCCCAGGGTGGGATGTGCGGGGACCCGGAGGCCTTGCGTTACAGGAAGCAGACACAGATGACCACCAGGGGACGCTGGGCTTCGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACTTGCTCATGCTGGCCTACAGCGAGCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCGACCTGCAGCGCTTCCTAGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGCGTCCCCAGCAGG-AGCCGGGCTCCTGGTGGCTGTGGCCTCACCACGGCC----TCCCGGGGCA----TTTGAGCCCGTCCACAGTGTGGCTGAGAGCTTGGACAAGCGT-GGGCACTAGTCTGGCATTTGAGGCCCA------------     
20 Dipodomys_ordii-NW_012267222.1-173104_173339         79.4%  37.3%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTGAATCCAGGGTCTGGGCA----CTGTCCCTG-AGTTTTTCTGATCA----CAGCTAGCACTTTG----CT-CTACTTCCAGCGTTTCAGTGGCTAATTAGAGGTAGA------GTCTCACAGACTTCTATGCCCAGGCTTCCTCTGAAC-------CATGATCCTCAGATCTCTGCCTCCTGAGTCCTTAGGATTACAGG--------------------TGTGA--GCTGCAGGCCCCTGTCT-------------------CATTAACTCTTAGATAACCCTTGAACTTGGGGCTT------TCCCAGCACACTTGTGCTCAGGCCTAACTGCCCA---------GGAGCCCCCTGGG--CTGGCTGGAGCCTGG--CTTGGTGTATCATGGCTCTGAGCTC------T--------------GTG----TGGCTTCTTCG---GGTGTGTATTCTGTCTTGTTGCTGGGG------ATGACAGGCAGATACTGGTGCTGGGTTCTGGGCCGCACAAGCCCAGGCCAGTGGGCAGGGAGGCCAGTGGTTCTGAGGCCCAGCCGT--GCTGCGGGAGTCCGCTCATCCTGGGGAGGGTGGCCAGCCTGTCGCTCCCCTGGGCAAGAGGAGCA-----GTCAAGTCTCAGGGCCAAGCCCAT-----CGTCAGT-----------------CTGGCATCAGAAGCATGGCTGCCCCCTTGGGTGGCTGCGTGGCCCGGGCCCGGGGCAGGGCCTGGGGCGGGCAGTGCCCTGGG---CCTGGAGGGGGTGGGTCATGAGGGCCCTGTGGTGTAGCACGGTGGTGACCAAGAGCCTGGCATTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCGCCAGGGAACCCTGGGCTTTGATGAGTTCTGCGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGACGCTGCTGACCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAACAGAAGGTGGGGCCCGGGCGGGGGCAGCGTGCTGGCCGTCCAGCCCCATCCTAGCGCCCGTGCGATGCCCTCACA----GA----CCTGCTCAGGGTGGATTTCAACCCGCGGCGCCCCAA-CTGG----------CTTCAGCTCCCATTCTCCACAGAA-     
21 Phyllostomus_discolor-NC_040907.2-176588_176802      83.0%  38.0%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCGGCAT----------GGGCTCTCGGGTCCTGGAGCGAGACAGTGGGGCC----CTG---CTGGGTGCCCATTGTGCCACAGCGCCGGGACTGGCGGTGGCTAGG-AGCACAGGACAGAATC---GAG-----CTTT-------------------CCCGGAGGCCCACTCTCTTTGGGGACGG--GGACACGGGGGTGGCTGTGGCCACCTGCCTCGTCGGTGATGCTCCCAATTCAGAGGGGGCC-------GCAGGGACCTGGCAC-CCACCCCAGGGCCACCCAGAC----TGTGTGGCCACATGAGGGACACCAGCCAGATGGCCTGCAGGTCTGGCGGGCGCCGCTG---TCCAGGGTGCTGACC-CGGGGTCTCTCCTGGCTTGGAGACA-----CCCTCAC----GCTGGTTCTGTCCGAC-------CCCCGGGCCGAA---GAGCTGGACTCGACACTCGGGGTCTCAACTGGCACCTTCTCCGGTCCTGACTGTCACCCACTCC---CAGTGACTCCCAGCT--GCACAGCACCCGAAGGC-----C---TCAGGGCAGCCGGCC-CCTGGTCAC---CGG--ACACCCTCGTCCTTTGGTCTGT--CCCCAGGC-CTGAGCCCTGTGGGGCAGGCAG------------GGCAGCCCCTTGGTCC-------TCAGTGTCC--CTGGCGCCTCGGATGCTCCCTGGG---------ACAGTGAGGCTTGGGGGAGGGCC-AAGAACCGG--GGGTGGGCCT-G--GGGCCCGTGTAGGT-GTGGCTCGGGGGGGACGCAGGGGCACCCACAGGCCTTGCGCTGCAGGAGGCGGACACGGACGACCGCCAGGGTGCGCTGGGCTTCGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGGTGTCCACCCGCCGGGACCTCTATCTGCTCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGACGCCGCCAGCCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGGCCCCTGGCAGGGACGAGGTGCCGG-GGGGGCGCCCACACTGGACCACAGTGCCGTGTGAGCACCT-TGTGGGTCTAGGGTCCCTGGGCC-CAGCCTTCCTCTCTGTGT-CCCCGAGCT--CTGGGCCATCG-----------------     
22 Phyllostomus_hastatus-NW_025334013.1-176669_176868   82.9%  35.6%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGGCTGTATCCAGACTTC-------------------------AACCCCAT----------CCCCCCT-------------------GGGGAGCC----CTG---GAGAGTCGGAGATCCCCCGCA--GCCGGGGTCAGGCAGCAAGGGG-GGCTCCGGGCTGACTC---TGGAGAGAAGTG-------------------CACAGGGGGCGGTTGGCCCGGAGCTCCG--GCCCACAGGC-----CTGGGGCTGCTCAGGCAGCGGGGCCCCGCTCCGCTGGGGGGACCCC-------ACGGGGACCTGGCAC-CCACCCCAGAACCACGCAGAC----TGTGTGGCCACATGAGGGACACCAGCCAGATGGCCTGCAGGTCTGGCGGGCGCCGCTG---TCCAGGGTGCTGACC-CGGGGTCTCTCCTGGCTTGAGGC-A-----CCCTCAT----GCTGGTTCTGTCTGAC-------CCCTGGGCCGAA---GAGCCGGACTTGGCACTCGAGGTCTCGACTGGCACCTTCTCCGGTCCTGACTCTCACCCACTCC---CAGTGGCTCCCAGCC--TCACAGCACCCAAAGGC---------CTCGGGGCAGCGGCC-CCTGGTCAC---CGG--ACACCCTTGTCCTCCGGTCTGT--CCCCAGGC-CTGAGCCCTGTGGGGCAGGCAG------------GGCAGCCCCTTGGTCC-------TCGGCGTCC--CTGGGGCCTCGGATGCTCCCTGGG---------ACAGTGAGGCTTGCGGGGAGGGCCGAGAACCGG--GGGTGGGCCTGG--GGGCCCGTGTAGGTGTGGCTCAGGGTGGGACGCAGGGGCACCCACAGGCCTTGCGCTGCAGGAGGCGGACACGGATGACCGCCAGGGCTCTCTGGGCTTCGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGGTGTCCACCCGCCGGGACCTCTATCTGCTCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGACGCCGCCAGCCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGGCCCCTGGCGGGGACGAGGTGCCCG--GGGGTGCCCACACTGGACCACAGCGCCGTGTGAGCACCT-TGTGGGTCTCAGGTCCCTGGGCC-CAGCCTTCCTCTCTATGT-CCCCCGATC--TCTGGGCCATCAT---------------     
23 Sus_scrofa-NC_010448.4-177083_177282                 82.1%  34.5%    ------------------------------------------------------------------------------GGGGCCCGAG----GGCCCAGTCCTAGCACACCC-CCCCCCCCCCCGCAGCCCGGTAGCACTTCAGTCTTCCTTGGGCAGCCCGGCCTCCATCACTGGGTGC---CCT--------------------TGTCCTCTGGGCCCGTCCTTGGCCTT-GGCTTTCAGGGTCCCCAGGGCTTGATGCCTCC---GTAGGTGCTCCCAGAGT-GAGTGGATTCATGGAGGAGCCTGTGG---CCTCAGTAGGGGTCCAG-TGGGCTTGC-TGGTTTGGAGGCGGGGGTGTCCTGTGTGAGCTGCTGTCTGAGCGTAAGG-------------------------------------------------------------------------AGGTCCTCGCAGCTCTGCCGTGGCAGCCAGAGTCAG--GAT-GCTCCTGTCGGCCCCTCGTCCTGCACTTTCCGAATCAATGGGCAGACC----------------CCCTAACCACAGGCTGGGCGTTAACCCCCAGGTG----------GGG---TG---TCG------GCTCCGGG-------------------------------------GGGGCGGTTCTCCAGGGTGGGGTGAGGCAAGTTGCCAGATTCA----GACGTAAGTTGACCTTGGAGGGCCTGGAGG-----------------AAGGTGGGTG-AGGTTTGTGTAAGGGTCACTCTGTGGCTTCCTGGAGGGAGAGGCAGGGT-GAGGGCAC-----------TGCTGCAAG-GCCTGGGGGCACTCATG-----------AGCCAGGGACCTGGGCAATGACATGGGAAGGGCGT---------------------------------GGGGGATCCTTGACTCTGGGCAG--ACTGAGGAGTGGTTGTGGCTCAGGGAGGGGCATGAGGGGACCCAGAGGCCTCGCGTTTCAGGAAGCGGACACGGATGACCACCAGGGGACACTGGGCTTCGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAAATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCGGCCACAAGGACCACCTGGACGCCGCGGACCTGCAGCGCTTCCTGGAGGGGGAGCAGAAGGTGAGGGCGCCCCAGCTGGAGGCTTCCTCTTG----CTGTGGCCTCACCTTGGCC----TCCCAGGGGG----GCCGAGCCCATCAGCAGGGTGGCTGAGAGCTCGGGGAAGGGG--GGCACTAGCCTGGCATTCGAGGTCCACTTA--------     
24 Neomonachus_schauinslandi-NC_058406.1-187991_188190  82.3%  39.3%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGGCCTT-GGTGTTTGGGGTTCCCAGGGTCTGACACTTCA---GTAGATGCTCCCTGAGT--GGTGGGTTCATGAAGGAGTCTGTGG---TCTCACTGGGGTCCCAG-CGGGTTCTTGCT---------------GATGTTGTGTGAGCTGCCCTGTGTGCAAGAGAAAGACAGTGGCCAGGTCCTCTCCC-----TCTCTGCTGTGGAGACTGAAGCCAGGGCACC--CTGT---ACCCTGGGGCCTTGAGCTAACCAATGGGCAGCCAAGTGTAATTACAGGCTCACAGCCCAGGCTGGGCATTAACTCCAAATTGGGGTGTTTTCTCCCACAG---TGAGGTGTTGACCCCCAAGGTGAGGTGTTGGCTCTAATGTG----------GGG---TG---TTG------ACTCCAGG-------------------------------------ATGGAGTATTGGCCCCCAGATGGGGTGTTGGTTCCCAGGGTAG----GGTGTTGGTTCCAAGGTTGGGGTATTGATTCAGATGGGGCATTGACCCCCAGTGTGG-AGTTTTGATTCCAGTGTGGGGTGTTGGTTCTCAGTGTGGGGTGACTGTGCCAGGTTTAGGTGTAAGTTGACCTTGAAAGGCTGGGACTAGGG-----------------TAGGGGAGGTTGAGATCTGTGTTAAAGGGTCACTCAGTGG--CTTCTTGGTGGGAGAGTCAGAGGGGAAGCCCAGCGAATTCACTGGGG--AAATCATCCCAGGGAGCTATCAGGGTGGGACACTAGGGGTCACAGAGGTTTTGGCTTGCAGGAAGCAGACACAGATGACCACCAGGGGACGCTGGGCTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTATAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCTGACCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGGCATGGGCAGTAGGAGCAGGGTCCTAGCCTAGGTGAGGCCACCTCGGGC----TCCCAGGGCC----CTTGAACTGGTTCAGTGTGGCTGAGAACCCTTCAATGTGGAA-GGATGGGCCACA--GCCTGGACCTGCTT-----------     
25 Physeter_catodon-NC_041216.1-190627_190887           80.1%  36.9%    -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTAGCGCCTCAGGCTTCCTAGGGGCAGCCTGGCCTCCGTCCCTGGGTGC---CCT--------------------TGTCCTCTGGGTCTGTCCCTGGCCTT-GGCTCTTGGTGTCCCCAGGGTCTGACGCCTCA---GCAGGTGCTCCCTGAGT-GAGGGGATTCATGAAGGAGTCTGTGG---TCTCATTAG-CGGCCTG-GTGGGCTTGCCTGGGGG-TTCC-TGTGGGTATTGTGTGAGCTGCTTTCTGGGCAAAATGAGGACAGTG----------------------------------GCTGAGACCA--------------------GCGTCCTCTCATCTCGGCCGTGGCAGCCAGAGCCTG--GGA-TTCCTACATGCCCGGGGGCCCTGTGCTTTTCTAATCAATGGATGGCCAACCCTA---ATTACAGGTCACAGCCCAGCGTAGGCGTTAACTCCTGGGTG----------GGG---TGTTGTTG------GCTGCAGG-------------------------------------GCGGG--GTATCCCTCCTGGGCGGGGTG------------------------------ACCTTGGACGGCTCGGAAA-G----GGGA-----AGGTGGGGTGAG-AGCTGTGTTAACGGGTCCCTTGGTGGCTTCTTGGTGGGAGAGGCGAGGG-GGA-GCCTAGTGAGGACGCCGCTGCCGGGCTTGGGGAGCCCTCGTG-----------AGCCCGTGACGTGGGCAGTGATGCTGGAAGGGGGAGGG------GTGGTTCG--ACTCAGGGTTGACTGAGGAATGG---GGAGCTGGGAG--GCACCCTCGCGGTTGAGGCCCAGGGTGGGATGCGAGGGGACCCGGGGGCCTTGCGTTACAGGAAGCAGACACAGATGACCACCAGGGGACGCTGGGCTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGGCCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGGCGCCGCTGACCTTCAGCGCTTCCTGGTGGTGGAGCAGAAGGTGAGGGCCCCCAGCAGG-AGCCGGGCTCCTGGCCGCTGTGGCCTCACCTCGGCC----TCCCGGGGCG----TCTGCGCCCGTGCAGGGTCCCGGGGCGTCTGCGCCCGTGCAC-GGCCCCGGGG----CGTCTGAGCCCGTCCACA-------     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *                                                                                                                                                                                .                                    .                   .            .                          *  ..*  . .    *   * *****.** ** **.** *.*.    ..*  * ***** ** ** ***** ** ******** **.***.**** ** **************  ***********.* ***** .. *****.****** ***   * .* .. ** ****. ** **. :.. ***.*****.*** *                                                                                              .                                                            

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