TTGACCCCCGTTTGGGGGGGCGCTGACCCCCGTTTGGGGGGGCGCTGACCCCCGTGTGGGGGTGGCGCTGACCCCCGTGTGGGGGTGGCGCTGACCCCCGTGTGGGGTGGCGCTGACCCCCGTGTGGGTGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGGGCGCTGACTCCCGTGTGGGTGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGGGCGCTGACTCCCGTGTGGGTGGCGCTGACTCCCGTGTGGGTGGCGTTGGCTCCCGTGTGGGGGGTGTTGACTGCTGTGTGGGGGAGGTGTTGACTCCTGCGTGGGTGTTGTTGACTCCCGTATGGGTGATGTTGGCTTCCGTGTGGGTAGTGTTAACTGCTGTGTGGGGTGAGTATATGGAGGTGGCTGTGGGTTGAAGGTGAAAAGCATATGGCTTCAGGCAGGTGCGTCAGTTCTGCATTTTCATGGGGCTGTCCTCCTGGTGGGTGGGCCCGTGCCCTGGGGAGTGATTGGAGGCCGTGACAAGGGCAGTGGAGTAGAGGAGGGTGGGCTTGCATGTTGGTCTTGACTGGGGAGTGGGGTGGTCCTGAAGGACCCCTGTGCATGCAGGCCCTGGTCGAGGTGCCAATGGGGACCCAAGGCCTTGCATTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCACCAAGGGACGCTGGGTTTTGAAGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCAGCCTGCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAGCAGAAGGTGTGCTGCCCGGGGCAGGTGTTGGGGGGCCAGCCATCAGGCCTCGCCTTCTGTTCTGAGCTTTGAGCTTCAGTCAGGGGACAGTGGTGATGGGGGAGCTGTCTGAAGCTATCCCAGGCCAGGGATGGGCTAC
Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.
Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.
Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.
Distribution of HSS in the input sequence
HSS id | Strand | Frame | Length | Start | End | Score | P | Show Result | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 0 | + | 1 | 70 | 17172 | 17381 | 36.921 | 4.631e-07 |
Plot |
2 | 1 | - | 3 | 39 | 17180 | 17296 | 17.570 | 0.011 |
Plot |
HSS id | Sequence | |
---|---|---|
1 | 0 | GTQGLALQEADTDDHQGTLGFEEFCAFYKMMSTRRDLYLLMLTYSNHKDHLDAASLQRFLQVEQKVCCPG |
2 | 1 | SMSR*RSRRVDIIL*KAQNSSKPSVPWWSSVSASCNARP |
Reference sequence (1): Target Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% |
cov pid 1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . . . 4 . . . . : . . . . 5 . . . . : . . . . 6 . . . . : . . . . 7 . . . . : . . . . 8 . . . . : . . . . 9 . . . . : . . . . 0 . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . ] 1372 1 Target 100.0% 100.0% ----------------------------------------------------------------------------------------TTGACCCCCGTTTGGGGGGGCGCTGACCCCCGTTTGGGGGGGCGCTGACCCCCGT-GTGGGGG--TGGCGCT-GACCCC------CGTGTGGGGGTGGCGCTGACCCCCGTGTGGGGTG---GCGCTGA-CCCCCGTGTGGG---TGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGGG-----------CGCTGACTCCC------------G---TGTGGGG-GGGCGCTG--ACTCCCGTGTGGGTGG----CGCTGACTC----------------------------------------------------CCGTGTGGGGGGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGGGCGCTGA--CTCCCGTGTGGGTGGCGCTGACTCCCGTGTGG-GTGGCG--------TTGGCTCCCGTGTGGGGGGTGTTGACTGCTGTGTGGG----------------------------------------GGAGGTGTTGACTC-----CT-----GCGTGGG----TGTTGTTG------ACTCCCGTATGGGTGA---------------TGTTGGCTTCCG-TGTGGGTAGTGTTAACTGCTGTGTGGGGTGAGTATATGGAGGTG----GCTGTGGGTTGAAGGTGAAAAGCATATGGCTTC----AGGCAGGTGCGTCAGTTCTG-CATTTTCAT---------GGGGCTGTCCTCCTGGTGGGT-------------------------------GGGCCCGTGCCCTGGGGAGTGATTGGAGGC-----------CGTGACAAGGGCAGT--GGAGTAGAGGAGGG---------TGGGCTTGCATGTTGGTCTTGACTGGGGAGTGGGGTGGTCCTGAAGG--ACCCCTGTGCATGCAGGCCCTGGTCGAGGTGCCAATGGGGACCCAAGGCCTTGCATTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCACCAAGGGACGCTGGGTTTTGAAGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCAGCCTGCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAGCAGAAGGTGTGCTGCCCGGGGCAGGTGTTGGGGGGCCAGCCATCAGGCCTCGCCTTCTGTTCTGAGCTTTGAGCT----TCAG--TCAGGGGACAGTGGTGA-TGGGGG-AGCTGTCTGAAGCTATCCC----AGGCCAGGGATGGGCTAC---------- 2 Colobus_angolensis-NW_012122820.1-209017_209943 96.7% 75.7% -----------------------------------------------------------------------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNN----TTTTT-GACTCC------CATGTGGG--TGGTGTTGACTCCCGTGTGGGTGG----TGTTGA-CCGCTGTGTGGGG--TGGTGTTGGCTCCTGTGTGGGGTGG-----------TGTTGGCTC--------------C---CTTGTGGGTGGTGTTG--ACTCCTGT--GTGGGC----GTTTTTGAC---------------------------------------------------TCCCATGTGGGTGGTGTTGACT-CCCGTGTGGGTGGTGTTGACCACTGTGTGGGGTGGTGTTGG--CTCCCGTGTGG--------------------G-GTGGTG--------TTGGCTCCCTTGTGGGTGGTGTTGACCGCTGTGTGG-GGGGTG------TAG-------------ACTCCCATGTGGGTGGTGTTGACCGC-----TG-----TGTGGGG----GGGTGTAG------ACTCCCATGTGGGTGG---------------TGTTGACTCCTG-TCTGGGTGGTGTTGACTGCTGTGTGGGGTGAGTATATGGAGTTG----GCTGTGGGTCGAAGGTGAAAGGCATATGGCGTC----GGGCAGGTGCGTCAGTTCTG-CATTTTCAT---------GGGGCTGTCCTCATGGTGGGT-------------------------------GGGCCCGTGCCCTGGGGAGTGACGGGAGGC-----------TGTGACGAGGGCAGT--GGAGTAGAGGAGGG---------TGGGCTTGCGTGTTGGTCTTGACTGGGGAGCGGGGTGGCCCTGAAGG--ACCCCTGTGCATGTAG-CCCTGGTCGAGGTGCCAATGGGGACCCAAGGCCTTGCACTGCAGGAAGCAGACACGGACGACCACCAAGGGACGCTGGGTTTTGAAGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCAGCCTGCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAACAGAAGGTGCGCTGCCCGG-GCAGGGGTTGGGGGGCCAGCCATCAGGCCTCGCCTTCTGTTCTGAGCTTTGAGCT----TCACAGTCAGGGGACAGTGGTGA-CGGGGG-AGCTGCCTGAGGCTATCCC----AGGCCATCCCTGGGCTACCT-------- 3 Rhinopithecus_roxellana-NC_044560.1-202440_203417 97.1% 82.6% --------------------------------------------------------------------------------------------------CTGGGCTGCCTGGCCGCCAGCCCAGGGGATGTTGTTGACCCCCAT-GTAGGGG----GTGTT-GGCTCC------CGTGTGGG--AGGTGTTGATTCCTGTGTATGTGGGGGATGTTGG-CTCCCGTGTGTGTGGGGATGTTGGCTCCTGTGTG-GGGGG-----------CGTTGATTCCC------------G---TGTGTGTGGGGTGTTG--GCTCCCGTGTAGGGGG----GTGTTGGCT---------------------------------------------------CCCGTGTAGGGGGGTGTTGGCT-CCCGTGTGGGGGGTGTTGACTGCTGTGTGGGGGGGTGTAGA--CTCCCAGGTGGGTGGTGTTGACTCCTGTCTGG-GTGGTG--------GTGGCTCCCGTGTGGGTGGTGTTGACTGCTGTGGGGGGGGGGG------GTA-------------GACTCCCAGGTGGGCGTTTTTGACTC-----CC-----GTGTGGG----TGGTGGTG------GCTCCCATGTGGGTGG---------------TGGTGGCTTCCG-TGTGGGTGGTGTTAACTGCTGTGTGCAGTGAGTATATGGAGTTG----GCTGTGGGTCGAAGGTGAAAGGCATATGGTGTC----GGGCAGGTGCGTCAGTTCTG-CATTTTCAT---------GGGGCTGTCCTCATGGTAGGT-------------------------------GGGCCCGTGCCCTGGGGAGTGACGGGAGGC-----------TGTGACGAGGGCAGT--GGAGTAGAGGAGGG---------TGGGCTTGCGTGTTGGTCTTGATTGGGGAGCGGGGTGGCCCTGAAGG--ACCCCTGTGCATGTAG-CCCTGGTCGAGGTGCCAATGGGGACCCAAGGCCTTGCACTGCAGGAAGCAGACACGGACGACCACCAAGGGACGCTGGGTTTTGAAGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCGGCCTGCAGCGTTTCCTGCAGGTGGAGCAGAAGGTGCGCTGCCCGG-GCAGGTGTTGGGGGGCCAGCCATCAGGCCTCGCCTTCTGTTCTGAGCTTTGAGCT----TCACAGTCGGGGGACAGTGGTGA-CGGGGG-AGCTGCCTGAGGCTATCCC----AGGCCAT--------------------- 4 Macaca_nemestrina-NW_012011823.1-208979_209932 97.0% 79.9% -------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGGAGTGTAGACTCCCCTGTGGGTGGTGGTGGCTTCCAT-GTGGGAG----GTGTT-GACTCT------CGTGTGGG--TGGTGTTGGCTCCCGTGTGGGTCA----TGTTGG-CTCCCGTGTGGGT--GGTGGTGGCTTCCG--TGTAGGAGG-----------TATTGACTC--------------T---CGTGTGGGTGGTGTTG--GCTCCCGT--GTGGGT----CATGTTGGC---------------------------------------------------TCCCGTGTGGGTGGTGGTGGCT-TCCGTGTAGGAGGTATTGACTCTCGTGTAAGGTGGTGTTGA--CTCCCATGTGGGTGGTGTTGGCTCCCGTGTGG-GTGGTG--------TTGGCTCCCATGTAGGTGGTGGTGACTGCTGTGTGCGGGGGTG------TAG-------------ACTCCCGTGTGGGTGGTGTTGACTCC-----TG-----TCT-GGG----TGGTGTTG------GCTCCCATGTGGGTGG---------------TGGTGGCTTCTG-TGTGGGTGGTGTTAACTGCTGTGTGGGGTGAGTATATGGAGTTG----GCTGTGGGTTGAAGGTGAAAGGCATATGGCGTT----GGGCAGGTGTGTCAGTTCTG-CATTTTCAT---------GGGGCTGTCCTCATGGTGGGT-------------------------------GGGCCCGTGCCCTGGGGAGTGACTGGAGGC-----------TGTGACAAGGGCAGT--GGAGTAGAGGAGGG---------TGGGCTTGAGTGTTGGTCTTGACTAGGGAGCGGGGCGGCCCTGAAGG--ACCCCTGTGCACGTAG-CCCTGGTCGAGGTGCCAATGGGGACCCAAGGCCTTGCACTGCAGGAAGCAGATACGGACGACCACCAAGGGACGCTGGGTTTTGAAGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCAGCCTTCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAACAGAAGGTGCGCTGCCCGG-GCAGGTGTTGGGGGGCCAGCCATCAGGCCTTGCCTTCTGTTCTGAGCTTTGAGCT----TCACAGTCAGGGGACAGTGGTGA-TGGGGG-AGCTGCCTGAGGCTATCCC----AGGCCATCCCTGGGCTACCTGGG----- 5 Gorilla_gorilla-NW_022150805.1-21175_21909 92.3% 69.7% -----------------------------------------------------TTGGGCCTGGCGTTCCTCGTGAGTAGGGGCTGAGCTGGGGTGTCACACTGGGGCCATGTCACCTCCA-AGCAGGTCATGCTCTCACCCTGCCCTGCCC--AGCCCTG-GGCTCCCATACCCTTGTGAGGCAAAGTCCTCAATCCTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGCATCCCCTTCCATGGGGACTTTATTGCTGCCATGGGATTC-----------CCATGGCCCCTGTAGCACCTTGGGTTTCTGCTGGGATGCCCAG--CCTCCAGCCCAGAGTG---TGTTGTTGAC---------------------------------------------------CCCCGTGTGGGGGGCGTTGACT-CCCGTGTGGGTG-------------------------------------------CATTGTTGACTCCCGCGTGGGGCGGCG--------CTGG---------------------------------------------------------------CTCGCGCGTGGGGGGCGTTGGCTC-----GC-----GCGTGGG----GGGCGTTG------GCTCCCGTGTGGGTAG---------------TGTTAACTCCCG-TGTGGGTAGTGTTAAGTGCTGTGTGGGGTGAGTATATGGAGGTG----GCTGTGGGTTGAAGGTGAAAAGCATATGGCTTC----AGGCAGGTGCGTCAGTTCTG-CATTTTCAT---------GGGGCTGTCATCTTGGTGGGT-------------------------------GGGCCCGTGCCCTGGGGAGTGATTGGAGGC-----------CGTGACAAAGGCAGT--GGAGTAGAGGAGGG---------TAGGCTTGCGTGTTGGTCTTGACTGGGAAGTGGGGTGGTCCTGAAGG--ACCCCTGTGCATGCAG-CCCTGGTCGAGGTGCCAATGGGGACCCAAGGCCTTGCATTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCACCAAGGGACGCTGGGTTTTGAAGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCAGCCTGCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAGCAGAAGGTGTGCTGCCCGGGGCAGGTGTTGGGGGGACAGCCATCAGGCCTCGCCTTCTGTTCTGAGCTTTGAGCT----TCAG--TCAGGGGACAGTGGTGA-TGGGGG-AGCTGCCTGAAGCTATCCC----AGGCCAGGGATGGGCTAC---------- 6 Piliocolobus_tephrosceles-NC_045434.1-208534_209366 94.0% 76.4% -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCTGCCCTGCCC--AGCCCTG-GGCTCCCATACCCTTGTGAGGCAAAGGCCTCAATCCTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGCATTCCCTTCCGTGGGGACTTTATTGCCGCCATGGGATTC-----------CCACGGCCCCTGTATCACCTTGGGCTTCTGCTGGGCTGCCCGG--CCTCCAGCCCAGGGGA---TGTTGACCCC---------------------------------------------------CATATA---GGGGGTGTTGGCT-CCTGTGTGGGTGGTGTTGACTCCTG-GGTGGGTGGTGTTGA--CTCCCGTGTGGGCGTTTTTGACTCCTGTGTGGG-TGGTG--------TTGGCTCCCGTGTGGGTGGTGTTGACTGCTGTGTGGGGNNNNNNNNNNGTTG-------------ACTGCTGTGTGGGGGGGTGTAGACTC-----CC-----AGGTGGG----TGGTGTTG------GCTCCCGTGTGGGTGG---------------TGGTGGCTTCCG-TGTGGGTGGTGTTGACTGCTGTGTGGGGTGAGTATATGGAGTTG----GCTGTGGGTTGAAGGTGAAAGGCATATGGCGTC----GGGCAGGTGCGTCAGTTCTG-CATTTTCAT---------GGGGCTGTCCTCATGGTGGGT-------------------------------GGGCCCGTGCCCTGGGGAGTGACGGGAGGC-----------TGTGATGAGGGCAGT--GGAGTAGAGGAGGG---------TGGGCTTGCATGTTGGTCTTGACTGGGGAGCGGGGTGGCCCTGAAGG--ACCCCTGTGCATGTAG-CCCTGGTCGAGGTGCCAATGGTGACCCAAGGCCTTGCACTGCAGGAAGCAGACACGGACGACCACCAAGGGACGCTGGGTTTTGAAGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGACGCCGCCAACCTGCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAACAGAAGGTGTGCTGCCCGGGC-AAGTGTTGGGGGGCCAGCCATCAGGCCTCGCCTTCTGTTCTGAGCTTTGAGCT----TCACAGTCAGGGGACAGTGGTGA-CGGGGG-AGCTGCCTAAGGCTATCCC----AGGCCATCCCTGGGCTA----------- 7 Sapajus_apella-NW_022437067.1-184846_185627 86.3% 63.5% ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGCATCCTCTTCCATGGTGCCTTTATTGCCACCATGAATTCC-----------CT-TGGC-CCCTGCACACCTTGGGCTTCTGTTGCGCTGCCC-G--GCTCCAGCCCAGGGGA---TGCGGTTAACTCCTACA------TAGGGGTGTTGGCTCCCACGCTTGCGGGTGGTGTTGACTCCCATGTGAGGGTTGTTGGCT-CCTGTGTGGGTTGTGTTCACTCCCGTGTGGGGTGGTGCTGG--CTCCCATGTGAGTGGTGTTT-------TCTGTGTGGGTG--------TTGGCTCCCATGTGGGTGGTGTTGACTCTCGTGTTGGGGGCATTGACCCCTGTGTTGTGGGTGCTGGCTCCCCTGTGGGTGATGTTGGCTC-----CA-----GTGTTGG----GGGTGCTG------ACTCCCCTGTGGGTGGTGTTTTCTGTGTGGGTGTTGGCTCCCC-TGTGGGTGGTGCTGGCTCCTGT----GTGAGCTGAGTGGACTTG----CTTGTGGGTCAAAGGTGGAAGGCACATGGCGTC----GGGCAGGTGTGTCAGCTCTG-TATTTTCAC---------GGGGCTCTCCTCTTGGTGGGT-------------------------------GGGCCTGTGACCTGGGGAGTGATTGGAGGC-----------CATGACAAGGGCAGT--GGCATGGAGGAGGG---------TGGGCTTGCGTGTTGGTTTTGACTGGGGAGAGA-GTGCCCCG-AAGG--ACCCCTGTGCGTGCAG-CCCTGGGCGAGGTGTCCGTGGGGACCCAGGGCCTTGCATTGCAGGAAGCAGACACGGATGACCACCAAGGGACACTGGGGTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAGCCACAAGGACCACCTGGATGCTGCCAGTCTGCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAGCAGAAGGTGTGCACCCCCAGGCAGGGGTGGGGCG----GCCATCAGGCCTCACCTTCTATTCTGAGCTTTGACTG----AGAACTTAGGGTGGGGCAGGTCA-CAGCCC-AGCATTTGACTTTAGTTTTGAT-ATTACAGGGTGCGCCCTATGGGACGAC- 8 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-189380_190095 89.4% 59.1% ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCCC--AGCTCTG-GGCTCCCATGCCCTCGTAGGACCAAGGCCCCAGTACTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGTATCCTCTTCCATGGCACCTTTATTGCCTCCATGAATTCC-----------CT-CAGC-CCCTGCACATCTTGGGCTTCTGCTGTGCCGCCC-A--GCTCCAGCCCAGGGGA---TGCGGTTAACTCCCGCA------TAGGGGTGTTGGCTCCCATGCTTGCGGGTGGTGTTGACTCCCTTGTGAGGGTTGTTGGCT-CCTGTGTGGGTTGTGTTCACTCCCGTGTGGGGTGGTGTTGG--CTCCCATGTGGTCATTGACT-------CCCATGTGGGTG--------GTGTTTTCCAT------------------------------------------------------------------GTGGGTGTTGGCTC-----CA-----GTGTTGG----GGGTGTTG------ACTCCCATGTGGGTGGGGTTTTCTGTGTGGGTGTTGGCTCCCC-TGTGGGTGGTGCTGGCTCCCAT----GTGAGCTGAGTGGACTTG----CTTGTGGGTTGAAGGTGGAAGGCACCTGGCATC----GGGCAGGTGTGTCAGCTCTG-CATTTTCAC---------AGGGCCGTCCTCTTGGTGGGT-------------------------------GGGCCCGTGACCTGGGGAGTGATTGGAGCC-----------CATGACAATGGCAGC--GGCATGGAGGAGGG---------TGGGCTTGCGTGTTGGTTTTGACTGGGGAGAGA-GTGTCCCTGAAGA--ACCTCTGTGCACGCAG-CCCTGGGCGAGGTGTCCATGGGGACCCAGGGCCTTGCTTTGCAGGAAGCAGACACGGACGACCACCAAGGGACACTGGGGTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGACGCCGCCAGTCTGCAGCGCTTCCTGCAGGCGGAGCAGAAGGTGTGCACCCCCAGGCAGGCGTGG-GTG----GCCGTCAGGCCTCACCTTTTATTCTGAGCTTTGACTG----AGGGTTTAGGGTGGGGCAGGTCA-CAGCCC-AGCATGTGAGAGCCCCCTCACA-TTGGCTTTAGTTTTGATATTACAGGGTG 9 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-110068_110673 83.0% 47.8% TGAGGGCTGAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTTGTGAGTGAGGGCTGAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTTGTGAGTGAGGGCTGAGCTGGGGTGTCACACTGGGGCCATGTCACCTCCAAGCAGGTCATGCTCTCAGCCCTGCCCTGCCC--AGCCCTG-GGCTCCCATGCCCTT-GCTAGGACCAAGGCCAGTACTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGCGTCCTCTTCCGTGGCACCTTTATTGCCGCCATGAATTCC-----------CT-CGGC-CCCTGCACAGCTCGGGCTTCTGCTGCGCCACCC-G--GCTCCAGCCCAGGGGA---TGCGGTTCACTCCCGTG------TAGGGGTGTTGAC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCCTGTGT-AGGAGCATTGACCC-----CT-----GTGTTGG----GGCTGTTG------GCTCCCT-------------GTGGGTGGCGTTGGCTCCCGTGT-GGGTTTTGGTGTCAGCTCCTGT----GTGAGCTGAGTGCGCTTG----CTTGCGGGTTGAAGGTGGAAGGCACGTGGCGTC----GGGCAGGTGTGTCAGCTCTG-CATTTTCAT---------GGGGCTCTCCTCTTGGTGGGT-------------------------------GGGCCTGTGACCTGGAGTGATTGG-------------AGGCCGTGACAAGGGCAGT--GGCGTAGAGGAGGG---------TGGGCTTGCGTGTTGGTTTTCACTGGGGAGTGA-GTGCCCCTGAAGG--ACCCCTGTGCATGCAG-CCCTGGGCGAG-TGTCCATGGGGACCCAAGGCCTTGCATTGCAGGAAGCAGACACGGATGACACC--GAGGACACTGGGGTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACGCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAAGACCACCTGGATGCCGCCAGTCTGCAGCGCTTCCTGCAGATGGAGCAGAAGGTGTGCACCCCTGGGCAGGGGTGGGGCG----GCGATCAGGCCTCACCTTCTCCTCTGAGCTTTGACTG----AGAGCTTAGGGTGGGGCGGGTCA-GAGCCC-GGCATTTGAGAGCCCCCACGTT-TGGCTTTAGTTTTGATATTAC------- 10 Callithrix_jacchus-NC_048389.1-189813_190474 88.6% 55.7% ---------------------------------------------------------------------------------------------------------GCCATGTCACCTCCAAGCAGGTCATGCTCTCACCCTGCTG-TGCCC--AGCTCTG-GGCTCCCATTCCCTTGTAGGACCAAGGCTCCAATACTTAAGGCTCAAGGATTTCAAGCATCCTCTTCCATGGCACCTTTATTGCCACCATGAATTCC-----------CT-CGGC-TTCTGCACACCTTGGGCTTCTGCTGCACTGCCC-G--GCTCCAGCCCAGGGGA---TGTGGTTAACTGCCGTA------TGGGGTGTTGGCTCCCA-----CGCGGGTGGTGTTGGCCCCTGTGTTTGGGGTGTTGGCT-C---------------------CCATGTGGGCATTG---------ACTCCTGTGTGGGTGTTT-------TCTATGTGGGTG--------TTGGCTCCCCTGTGGGTGGTGTTGATTCTCGTGTTGGGGGCATTGACCCCTGTGT--------------------------------------------------------------------------------------------------TGGGGGTGTTGGCTCTCG-TGTTGGTGGTGTTGGCTCCCGT----GTGAGCTGAGTGGACTTG----CTTTCGGGTTGAAGGTGAAAGGCACGTGGCATC----CGGCAGGTGTGTCAGCTCTG-CATTTTCAC---------AGGACTCTCCTCTTGGTGGGT-------------------------------GGGCCCGTGACCTGGGGAGTGATTGGAGCACGGGAGTGGCCCGTGACAAGGGCAGT--GGCATATAAGAGGG---------TGGGCTTGTGTGTTGGTTTTGACTGGGGTGACA-GTGCCCCTGAAGG--ACCCCTGTGCATGCAG-CCCTGGGTGAGGTGTCCATGGGGACCCAAGGCCTTGCATTGCAGGAAGCAGACACGGATGACCACCAAGGGACACTGGGGTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAATCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCGGTCTGCAGCGCTTCCTGCAGGTGGAGCAGAAGGTGCGCACCCCCAGGCAGGGGTGGGGCG----GCCATCAGGCCTCACCTTCTATTCTGAGCTTTGACTG----AGAACTTAGGGTGGGGCAGGTCA-CAGCCT-GGCATTTGAGAGCCCCCAGCAT-TGGCTTTAGTTTTGATATT--------- 11 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-177560_177872 85.8% 43.9% ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCCCCCACCGGTC-CC-------------CCAGCAG--CCCTCTGTGACTCCGACCACCTG-GGCAGGTGTGTGA---------CGAGCTGTCAGGGCTGCCCCAGCCTGATGTATTGCGCTCTGTTGCTCTGTGGAGTGTGG-----------GGTTGGGCGCTGCCAGGC-----ATTCCCGGTGAGGGGCCTGA--GCTGGGGCGTCACGCCAGGGCCCCAACACTGCCAAG------GAGGCC-------------------ATGTGGTCACCCCACCCCACC-GGGGTCCCTCGC--CCTCGCTGGATA----AAGCCCCAATCTTTAGGCCTCAAGG-------------GTTTCAAGCAGCCCCTTCTATGGGAGCC--------TTTC-----------------TTGGCCATTCCCAGGGACCCCCCGAGCCCTACA----GCACCTCAGCTTGCATCTGGGCAGCCTGGCCGCTAGCCAG-----CCCAGTG----CGCTCTTG------ACTCACATG---------------------------------------CGGAGT-------------------------GTGGACTCC----AGTGTGGCTCGATCTTGAAAGGCATGCAGACGC----GTAGGGGCGCGTCAGATATG-CGTCTTTCCGAAAGGCCATTGCCTGTTCTCTGGGTGGGAGGGCACCGGG---GAGCCCAGCGAGCCACGGCTGCATGTGCCCAGGGAGCAAACTAAGGC------------CGCGGCGTGGGCAGTGGCGAGGCGGGGAGGA---------GGGGCTCGCAGCCTGGCCTTGACTGAGGAGGGGGCGGGCC-TGCAGG--GCC-CTTCGGGTGCA--GCGCTGGGCGGGCTGTGCATGGGACCCGAGGCCTTGCCTTGCAGGAAGCAGACACGGATGACCACCAGGGGACCCTGGGCTTCGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACGCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGACCCCACCGACCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGCTGCGGAGCTTTGGCGGAGGGCGTGGGGACAAGGCAGTCACAGGCAGCATCCAGCACCCC--G----TGGGCTTCAGTCCCCATGTTCCA-GGGAGC-AGCCCCT-GGGGCTGCCACGTGGGCGGGAAAGGTTTGCA------------ 12 Artibeus_jamaicensis-NW_023552099.1-176503_176732 82.9% 36.8% ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGCTCTGGGTTGGCCCTGTCCCAGCCTAGGCCTGGG---------------TCCCTGGCAT----------GGGCTCTCAGGTCCTGGAGCAAGAATGCGGGGCC----CTG---CCCGGTGCCCACTGTGCCGCAGCGCCCGGAGCAGCAGCAGCCAGG-AGCACAGGACGGGACC---TAG-----CTTT-------------------CCCGGAGACCCACTCTCTTCGGAGACGG--GGACACAGGGATGGCTGTGGCCACTTGCCTCG---GTGATGCTCCTGGTTCAGAGGGGGCC-------CCAGGGACCTGGCAC-CCACCCCAGGGCCACCCAGAC----TGTGTGGCCACGTGAGGGACACCAGC-CAATGGCCTACAGGTCTGGCAGGTGCTGCTG---TCCATGGTGCTGACC-TGGGGTCTGTCCTGGCTGGAGAT-A-----TCTTCAC----GCTGGTTCTGTCCGCCTCCCGCCCCCTGGGCCAAA---GAACCGGACTCTGCACTCCGGGTCTTGAGCAGCACCTTCTCAGGTTCTGACTCTCACCAGCTCC---CAGTGACTCCC--AGCCTCAGAGCACCTGAAGGC-----CT--TG------------------GTCAC---CGG--ACACCCTTGTCCTCTGGTCTAT--CCC--GTC-TTGAGCCCCACGGGGCAGGGCA------------GCACT---------------------------------TGGTCCTCAGTGTCCCTGGG---------ACAGTGAGGTTTGTGGGGACGGTCAAGAGGTGG--GGGTGGGCCTGG--AGGCCTGTGTAGGCTC----CGGGGGGGGACGCAGGGGGACCCACAGGCCTTGTGCTGCAGGAGGCGGACACGGATGACCACCAGGGCACGCTGGGCTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGATGCCGCCAGCCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGCCCCGGTGGGGATGAG--GT--GTC--GGGGGGACCACACTCGACCACAGCACCATGTGGGCCCCT-TGTGGGTCTAGGGTGACTGGGCC-CAGCCTTCCTCTCTGCAT-CCCCGTCCC--CCGAGCTCCATGCCATTGT--------- 13 Sturnira_hondurensis-NW_023520724.1-177163_177362 83.5% 37.6% ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCTAGGCCTGGG---------------TCCCCAGCAT----------GGGCTCTCGGGTCCTGGAGCAAGACAGTGGGGCC----CTG---CTGGGTACCCACGGTGCCGCAGTGCTGGGAACAGCAGCGGCCAGG-AGCACAGGACAGGACC---TAG-----CTTT-------------------CTCGGAGGCCCACTCTCTCCGGAGACGG--GGACACGGGGGTGGCTGTGGCCACTTGCCTCA---ATGATGCTCCTGGTTCGGGGGG---G-------GCAGGGACCTGGCAC-CCACCCCAGGGCCGCCCAGAC----TGTGTGGCCACATGAGGGACACCAGTCAGATGGCCTACAGGTCTGGTAGGCACTGCTG---TCCATGGTGCTGACC-TGGGGTCTCTCCTGGCTGGAGGC-A-----CCTTCAG----GCTGGTTATGTCCGCCTCCCGCCCCCCAGGCCAAA---GAGCCGGGCTTGGCCACCCGGGTCTTGAGCAGCAACTTCTCAGGTTCTGACTCTCACCCGCTCC---CAGTGACACTCCCAGCCTCATAGCACCTGAAGGC-----CT--TGGGGCGGCCCGGCC-CCTGGTCAC---TGG--ACACCCTTGTCCTCTGGTCTGT--CCCCAGTC-TTGAGCCCCATGGGGCAGGGCG------------GCACCTA------------------------------GGTCCTCAGATGCTCCTTGGG---------ACAGTGAGGTTTGTGGGGGCAATCAAGAAGTGG--GGGTGGGCCTGG--AGGCCTGTGTAGACGTGGCTCAGGGTGGGACGCAGGGGGACCCACAGGCCTTGCGCTGCAGGAGGCGGACACGGATGACCACCAGGGCACGCTGGGCTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGACGCTGCCAGCCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGGCCCCTGGCGGGGATGAGGTGCCGG--GGGGAGCCCACACTTGGCCACAGCACCCTGTGGGCACCT-TGTGGGTCCAGGGTCCCCAGGCC-CAGCCTTCCTCTCTGCGT-CCCCGTCCC--CCAAGCTCTGGGC--------------- 14 Molossus_molossus-NW_023425372.1-174422_174724 82.2% 38.1% ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAAGGCTGGTGGACACTGCTGTCCATGGTGCTGACCCGGGGT-------------------CTCCCTGCCGGGAGTCA-CCTCCAAGT-GGGTTAGGTTCGCACCCTGTCC-------------CCACCTGCACCCCT-------CAGGGCCAGAGAGCTGTCT-------TTACACTCGGGGTCTTG-AGCAG-CACCTTCTAAGGTCC--CGACCTTGCTTCCTCCTGGGGTCTCTCAGCCTTGTA--GCCCCTT-----------GGCT-----TCAGCTCCCCAGGGCCTGACACCGGGACGCTCCCTGA---GCCAGTGGGTTCATAAAGGGCCCATGGCCTCGTTGG-----------------GGTCCCGGTGGCTTTGCCCCTGGGGGTTCCTGTGGGTGTTG--CGTG---AGCCACTCTGTCTGCAAAAGGGGGGCAGTGGCTGAGACCGAGCACACCATGGGCAGCCATTGTAGTGACAGGATCAAGGCCCAGGGGGA-------------CACTGACTCC----AGGGGCTGTCGGCTCCGAGTATGATGTCACTGTGCTGGGCTCA----GCTGCAGGTTAACCGTGAAAGGCTTGGACCAG---------------------------------------------GGTCAGTGGTCTTGGTGGGACAGTCAGAAG-------------GGGAGCCCGGTGAGGGTCCCGGGGAACAACCAGG-----------AGGCCGTGACATGGGCAGTGGCACTGGAAGGGGGAGGGT------GGATTT-------------------GTGGGGGTGACTGAGAGTGGG--GGTGGGTCTGGAGGACCCCTGGGTGTGGCTCCAGGTGGGACCCACGGGCTGTGCGTTGCAGGAGGCGGACACGGATGACCACCAAGGCACTCTGGGCTTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACTTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGACGCCGCCGACCTCCAGCGCTTCCTGGAAGTGGAACAGAAGGTGAGTGTGCCCAGCAGGCTGGGGCTGCAGGCGGCACACCCCTGCGCTTCCAGAG-GGAGCCCCCCTCG----ACCGCA--GCTTCCCAGT------CCAGCCTGCCCTGCTCCC--GGCCCCGCCTCCTCCGTCCACCCACTTGTCCGGCAGAC 15 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-187877_188194 81.6% 39.8% -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGGGGTGTTGGCTTCCAGGGTGGGGCGTTGACTCCAGGGTGAAGTAT---TGG-------------------CTCCAATGTGGGGTGTTGGCTCCCATG-GTGAGGTGTTGACTCCCAGGGAGGG-----------CTGTTGGCTCCC-----ATGTGGGGTGTTGACTCTGTGTGTGG---TGTTGACTCCCAGAGTG-GGATGTTGACTTCAGGGTGAGGTGTTGGATCCAATGTGGGGTGTTGGC--TCCCAAGGTGGTGCATTG----------------------------------ACTCCCAGGA--------------------AGGGGTGTTGAC------------TCCCACAGTGGG--GCA-TTGA---CTGCAGGGTGAGATATTGGCTCCAATGTGGGGTGTTGGCTCCCAGGG---TGGGGTGTTGGCTTTCAGTGTGGGGTGTTGACTCCAGAGTG----------AGG---TG---TTG------ACTCCAGT-------------------------------------GTAGGGTATTGGCTCTCAGTGTGGGGTGACTGTGACAGGTTCA----GCTGCAGGTTGACTTTGAAAGGCTTGGACTCG----GGGA-----GAGTGACGTCAG-TTCTGTGTTAAAGAGTCCCTCAGTGGCTTCTTGGTGGGAGAGTCAGAGG-GGGTGTCCAGTGAAGAAGCTGCCTGAGGGGCCTGGGCAGCAATCAT-----------GGGCCGTGACATGGTTAGTGGCGTTGGAAGGCGGAGTG------TGGATTTGTCATTCAGTGTTGACTGAGGCGCGGGGGTGGGCCTAGAG--GACCCCTCATGAGCGTGGCTCAGGGT-GGGATGTGGGGGACCCAGAGGCCTTGCGTTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCAGCAGGGGACACTGGGCTTTGAGGAGTTCTGCGCCTTCTACAAGATGATGTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACCTACAGCAACCACAAGGACCACCTGGACGCCACTGACCTCCAGCACTTCCTGGAGGTGGAGCAGAAGGTGAGGGCACCCTGGCAGGAGAGTGGGTCCTGGCCAACGTGGCGCCACCTCAGGT----TCCCGGAGCG----TTTGAGCCTGCTCAGTGTGGCT--GAGAGCTTGGGGAAGGGT-GGGCCATGGCCTGGCATTCGAGGTCC------------- 16 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-188807_189131 84.5% 40.1% 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19 Lipotes_vexillifer-NW_006774135.1-188161_188479 80.6% 37.5% 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20 Dipodomys_ordii-NW_012267222.1-173104_173339 79.4% 37.3% 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22 Phyllostomus_hastatus-NW_025334013.1-176669_176868 82.9% 35.6% 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23 Sus_scrofa-NC_010448.4-177083_177282 82.1% 34.5% 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24 Neomonachus_schauinslandi-NC_058406.1-187991_188190 82.3% 39.3% 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25 Physeter_catodon-NC_041216.1-190627_190887 80.1% 36.9% 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