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 1 Target                                                  100.0% 100.0%    -------------------------CAGGCGCAGG-GCGGAACCCTGCCTTCAAGGCATATCTGATCAGCC-CGTCCCATCTCTGGCCACATCC----------------------------------------------------------------------------------------------------------TC---------------------AGTG----------------------------------GGGGGCCAGGGCCGAAGTGACAGCAGGCGGC---------------TCACTG-GGAGCG-TAGGACCCCTCAAGATGCT---GAGCAGCTGGGCAGGTGTGAAACGAGCTGTCAGGGCTGCC-----CCTGCCTGAAATGTTGAACTCTGGAACTCTTTG-AAGAGCAGGGCTAGGCACTGCGTCCCTTTGGGCCTGGTGTTCCTCGTGAGTAGGGGCTGAGCTGGGG-TGTCACACT-GG--GGCCATGTCACCTCCAAG---CAGGTCATGCTCTCACCCTGCCCTGCCCA----------GCCCTGGGCTCCCATACC----------CTTGTGAGGCAAAG-----TCCTCAATCCTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGCATCCCCTTCCATG---------------GGGACTTTATTGCTGCCATGGGATTCCCAT-------GGCC--------CCTGTAGCAC-CTTGGGTTTCTGCTGGGATGCCCAGCCTCCAGCCCAGAGTG--------------TGTTGTTGACCCCCG-TTTGGGGGGGCGCTGACCCCCGTTTGGGGGGGCGC-TGACCCCCGTGTGGGGG-TGGCGCTGACCCCCGTGT-GGGGGTGGCGCTGACCCCCGTGTG-GGGT--GGCG-CTGACCCCCGTGTGGGTGGCGCTGACTCCCG-TGTG---------------------------------------G---GGGGGCGCT--GACTCCCGTGTGG--GGGGGCGCTGA---------------------CTCCCGTGTGGGTGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGGGCGCTGACTCC-CGTGTGGGGGGGCGCTGACTCCCGT-GTGGGGGGGCGCTGACTCCCGTGTG-----------GGTGGCGCTGACTCCCG------------------------------------------TGTGGGTGGCGTTGGCTCCCGTGTGGGGGGTG-TTGACTGCTGTGTGGGGGAGGT-----G-TTGACTCCTGCGTGGG-TGTTGTTGAC-T---CC------------------------CGTA-TGGGT---------------GATGTTGGCTTCCGTGTGGGTAGTGTTAACTGCTGTGTGGGGTGAGTATATGGAGGTGGCTGTGGGTTGAAGGTGAAAAGCATATGGCTTCAGGCAGGTGCGTCAGTTCTGC---------------------     
 2 Pongo_abelii-NC_036903.1-208564_209487                   89.6%  74.5%    ----------------------GAGCAGGCACAGG-GCGGAACCCTGCCTTCAAGGCATATCTGATCAGCC-CGTCCCATCTCTGGCCACATCC----------------------------------------------------------------------------------------------------------TC---------------------AGTG----------------------------------GGGGGCCAGGGCCGAAGTGACAGCAGGCGGC---------------TCACTG-GGAGCG-TAGGACCCCTCAAGATGCT---GAGCAGCTGGGCAGGTGTGAAATGAGCTGTCAGGGCTGCC-----CCTGCCTGAAATGTTGAACTCTGGAACCCCTTG-AAGAGCAGGGCTAGGCACTGTGTCCCTTTGGGCCTGGTGTTCCTCGTGAGTGGGGGCTAAGCTGGGG-TGTCACACT-GG--GGCCATGTCACCTCCAAG---CAGGTCATGCTCTCACCCTGCCCTACCCA----------GCCCTGAGCTCCCATACC----------CTTGTGAGGCAAAG-----TCCTCAATCCTTAGGGCTCAAGAATTTCAAGCATCCCCTTCCACG---------------GGGACTTTATTGCTGCCATGGGATTCCCAT-------GGCC--------CCTGCAGCAC-CTTGGGTTTCTGCTGGGCTGCCCAGCCTCCAGCCCAGGGTG--------------TGTTGTTGACCCCCA-TGTGGGTGGCGTTGGCTCCTCTGCGGGGGGTGCTG---GCTCCCGTGCGGGGG-GCGCTGGCTC--CCATGT--G-GGGGGCGTTGGCTGCTGTGTG-GGGG--GCGTCG--GCTCCCGTGTGGGTGGTGTTGGCTCCCG-TGTGG---GTGGTGTTAACCTGTGTGGGTGTTGGCTCCCATGTG---GGGGGCGTT--GGCTGCTGT--GT--GGGGGTGTTGG---------------------CTCCCGTGTGGGTGGTGTTGGCTTCCGTGTGGGTGGTGTTAACCT-------------------------------GTGTGGGTGTTGGCTCCCATGTG-----------GATGGCGCTGACTCCCGTGTGGGGGCGCTGGCT-CCCGTGTGGGGGGCGTTGGCTCCCGTGTGGGGGGTGTTGACTCCCTTGTGGGTGGTG-TTGACTGCTGTGTGGAGGGGT-------GTTGACTCCTGTGTCGG-GGGTGTTGAC-T---GCTGT-GTGGAGGGGTGTTGACTCCCGTGT-GGAGG---------------GGTGTTGACTCCCATGTGGGGGGTGTTGGCTCCCGTGTGGGGGGTGTTG------------------------------------------------------------------------------------     
 3 Trachypithecus_francoisi-NW_022681457.1-201798_202728    97.9%  75.4%    ------------------------GCAGGCACAGG-GCAGAACCCTGCCTTCAAGGTACATCTGATCACTC-CATCCCATCACTGGCCACATCC----------------------------------------------------------------------------------------------------------TC---------------------AGTG----------------------------------GGGGGCGGGGGCCGAAGCAACAGCAGGCGGC---------------TCACTG-GGAGTC-TAGGACCCCTCAAGATGTT---GAGCAGCTGGGCATGTGTGAAACGAGCTGTCGGGGCTGCC-----CCTGCCTGAAATGTTGAGCTCTGGAACTCGTTG-AAGAGCAGGGCGAGGCACTGCGTCTCTTCGGGCCTGGTGTTCCTCGTGAGTGTTGACTGAGCTGGGG-CGTCACACT-GG--GGCCATGTCATCTCCAAG---CAGGTCGTGCTCTCACTCTGCCCTGCCCA----------GCCCTGGGCTCCCATACC----------CTTGTGAGGCAAAG-----GCCTCAATCCTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGCATCCCCTTCCATG---------------GGGACTTTATTGCCGCCATGGGATTCCCAT-------GGCC--------CCTGTATCAC-CTTGGGCTTCTGCTGGGCTGCCCGGCCGCCAGCCCAGGGGA--------------TGTTGCTGACCCCCA-TGTAGGGGGTGCTGGCTCCCGTGTGGGGGGTGCTG---GCTCCCGTGGGGGGG-GTGCTGGCTC--CCATGT--GGGGGGGTGTTGGCTCCCGTAGG-GGGG--GTGCTGGCTCCCGTGTGTTGGGGGTGTTGGCTC-----------------------------------------CCGTGTG---GGGGGTGCT--GGCTCCCGTGTGT--GGGGGTGCTGG---------------------CTTCCATGTGGGGGGTGCTGGCTCCCGTGTGTGGGGGTGCTGCTCCCGTGTGTGGGGGGGTGTTGGCTCCGTG-TGTGTGGGGTGTTGGCTCCCGGTGG-----------GGGGTGCGGCTCCCGTGTGTG----TG--------------------------------------GGGTGTTGGCTCCCGTGTGGGGGGTG-CTGGCTCCCGTGTGTGGGGGGG-----TGTTGGCTCCCGTGTGGG-GGGTGCTGGC-T---C----------------------CCGTGTG-TGGGG---------------GGTGCTGGCTCCCGTGTGGGGGGTGCTGGCTCCCGTGTGTGGGGGGTGC--TGGCTCCCGTGTGTGGGGGGGTGTTGGCTCCCGTGTGTGTGGGGTGTTGGCTCCGTGTGGGGGGT-----------------     
 4 Theropithecus_gelada-NC_037668.1-207901_208828           93.6%  70.9%    ------------------------GCAGGCACAGG-GCAGAACCCTGCCTTCAAGGTACATCTGATCAGTC-CATCCCATCTCTGGCCACATCC----------------------------------------------------------------------------------------------------------TC---------------------AGTG----------------------------------GGGGGCCAGGGCCGAAGTGACAGCAGGCGGC---------------TCACCG-GGAGCC-TAGGAC-CCTCAAGATGCT---GGGCAGCTGGGCATGTGTGAAACGAGCTGTCGGGGCTGCC-----CCTGCCTGAAATGTTGAGCTCTGGAACTCGTTG-AAGAGCAGAGCTAGGCACTGCGTCCCTTCGGGCCTGGTGTTCCTCGTGAGTGGCGACTGAGCTGGGG-TGTCACACT-GG--GGCCGTGTCACCTCCAAG---TAGGTCATGCTCTCACTCTGCCCTGCCCA----------GCCCTGGGCTCCCATACC----------CTTGTGAGGTAAAG-----GCCTCAATCCTTAGGGCTCAGAGATTTCAAGCATCCCCTTCCATG---------------GGGACTTTATTGCCGCCATGGGATTCCCAC-------GGCC--------CCTGTATCAC-CTTGGGCTTCTGCTGGGCTGCCCGGCCTCCAGCCCAGGGGA--------------TGTTGTTGACCCCCA-TGTGGGTGGCATTGATTCTTGTGTGGGTGGCATTG---ACTCCTGGGTGGGGT-GTCATTGGCT--CCCGTG--TGGGTGTCATTGGCTCCCGTGTG-GGGG--GCATTG--GCTCCCGTGTGGGTGGCATTGGCTCCCG-TGTGG----GGGGC---------------ATTGGCTCCCGTGTG---GGTGGCATT--GGCTCCCGTG-TG--GGGGGCATTGG---------------------CTCCCGTGTGGGTGTCATTGGCTCCTGTGTGAGGTGGTGTT-----------------------GACTCCCAT-GTTAGGTGGCGTTGGCTCCCGTGTG-----------GGGGGCGTTGATTCCTGTGTGTGCGGGGGGTGT-----------TGGCTTCCGTGTGGGGGGGGGTGTTTTTGGCTCCCGTGTGGGTGGTG-GTGACTGCTGTGTGGGGGAG--------TGTA--------------------GACT-----------------------------CCCCTG-TGGGT---------------GGTGGTGGCTTCCGTGTGGGAGGTGTTGACTCTCGTGTGGG----TGGTGTTGGCTCCCGTGTGGGT---CATGTTGGCTCCCGTGTGGGTGGTGG-TGGCTTCCGTGTAGGTGGTGTTG-------------     
 5 Gorilla_gorilla-NW_022150805.1-20674_21318               90.0%  63.3%    ----------------------GAGCAGGCACAGG-GCGGAACCCTGCCTTCAAGGCATATCTGATCAGCC-CGTCCCATCTCTGGCCACATCC----------------------------------------------------------------------------------------------------------TC---------------------AGTG----------------------------------GGGGGCCGGGGCCGAAGTGACAGCAGGCGGC---------------TCACTG-GGAGCG-TAGGACCCCTCAAGATGCT---GAGCAGCTGGGCAGGTGTGAAACGAGCTGTCAGGGCTGCC-----CCTGCCTGAAATGTTGAACTCTGGAACTCTTTG-AAGAGCAGGGCTAGGCACTGCGTCCCTTTGGGCCTGGCGTTCCTCGTGAGTAGGGGCTGAGCTGGGG-TGTCACACT-GG--GGCCATGTCACCTCCAAG---CAGGTCATGCTCTCACCCTGCCCTGCCCA----------GCCCTGGGCTCCCATACC----------CTTGTGAGGCAAAG-----TCCTCAATCCTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGCATCCCCTTCCATG---------------GGGACTTTATTGCTGCCATGGGATTCCCAT-------GGCC--------CCTGTAGCAC-CTTGGGTTTCTGCTGGGATGCCCAGCCTCCAGCCCAGAGTG--------------TGTTGTTGACCCCCG-TGTGGGGGGCGTTGACTCCCGTGTGGGTG-------------------------------------------------CATTGTTGACTCCCGCGTG-GGGC--GGCG-CTGG---------------------------------------------------------------CTCGCGCGT---GGGGGGCGT--TGGCTCGCGCGTG--GGGGGCGTTGG---------------------CTCCCGTGTGGGTAGTGTTAACTCCCGTGTGGGTAGTGTTAAGTGCTGTGTGGGGTGAGTATATGGAGGTGGCTGTGGGTTGAAGGTGAAAAGCATATGGCTTCAGGCAGGTGCGTCAGTTCTGCATTTTCATGGGGCTGTCA-TCTTGGTGGGTGGG-CCCGTGCC--CTGGGGAGTGATTGGAGGCCGTGACAAAGGCA-----GTGGAGTAGAGGAGG---------GTAGGCTTGCGTGTTG----GTCTTGAC-T---GGGAA-GTGGGGTGGTCCTGAAGGACCC-------C---------------TGTGCATGCAGCCCTGGTCGAGGTGCC------AATGGGGACCCAAGGCCTTGCATTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCACCAAGGGACGCTGGGTTTTGAAGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATG------     
 6 Chlorocebus_sabaeus-NW_023666054.1-207623_208552         94.2%  70.0%    ------------------------GCAGGCACAGG-GCAGAACCCTGCCTTCAAGGTACATCTGATCAGTC-CATCCCATCTCTGGCCACATCC----------------------------------------------------------------------------------------------------------TC---------------------AGTG----------------------------------GGGGGCCAGGGCCGAAGCGACAGCAGGCGGC---------------TCACCG-GGAGCC-TAGGACCCCTCAAGATGCT---GGGCAGCTGGGCATGTGTGGAACGAGCTGTCGGGGCTGCC-----GCTGCCTGAAATGTTGAGCTCTGGAACTCATTG-AAGAGCAGAGTGAGGCACTGCGTCCCTTCAGGCTTGGTGTTCCTCGTGAGTGGCGACTGAGCTGGGG-TGTCACACT-GG--GGCCGTGTCACCCCCAAG---TAGGTCATGCTCTCACTCTGCCCTGCCCA----------GCCCTGGGCTCCCATACC----------CTTGTGAGGCAAAG-----GCCTCAATCTTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGCATCCCCTTCCATG---------------GGGACTTTATTGCCACCATGGGATTCCCAC-------GGCC--------CCTGTATCAT-CTTGGGCTTCTGCTGGGCTGCCCGGCCTCCAGCCCAGGGGA--------------TGCTGTTGACCCCCA-TGTGGGTGGCATTGACTCTCGTGTGCGTGGCATTG---ACTCCTGGGTGGGGT-GTTGTTGGCT--CTCATG--TGGGTGGTGTTGACTCCCATGTG-AGGT--GGCGTT-GGCACCTGTGTGGGGAGCGTTGACTTCCA-TGTGA---GGTGGC---------------ATTGATTCTCATGTG---GGTGGCGTT--GACTCCTGGGTGG--GGTATTATTGG---------------------CTCCCGTGTGGGTGGTGTTGGCTCCTGTATGAGGTGGTGTT-----------------------GACTCCCGT-GTAAGGTGGCATTGGCTCCCAGGTG-----------GGTGGCATTGACTCCTGGGTGGGGTGTTGTTGG-----------CT---CCCAGGTGGG------TGGCGTTGAGTCCCGTGTGGGGGGCA-TTGATTCCCGTGTGTGCAGGGG-----GTGTT--------------------GGCC-C---C----------------------CGTGGGG-GGGGG---------------GGTGTTGGCTCCCGTGTGGGGGGTGTTTGCTCCCGTGTAGGGGGTTGTTTTTGGCTACCGTGTGGGT---AGTGGTGACTCCCGTGTGGGGTGTTG-TTGACTCCCCTGTGTTTTT-----------------     
 7 Colobus_angolensis-NW_012122820.1-207714_208471          92.4%  58.9%    ----------------------GAGCAGGCACAGG-GCAGAACCCTGCCTTCAAGGTACATCTGATCAGTC-CATCCCATCACTGGCCACATCC----------------------------------------------------------------------------------------------------------TC---------------------AGTG----------------------------------GGGGGCCAGGGCCGAAGCGACAGCAGGCAGC---------------TCACTG-GGAGCC-TAGGACCCCTCAAGATGTT---GAGCAGCTGGGCATGTGTGAAACGAGCGGTCGGGGCTGCC-----CCTGCCTGAAATGTTGAGCTCTGGAGCTCGTTG-AAGAGCAGGGCGAGGCACTGCGTCCCTTCGGGCCTGGTGTTCCTCGTGAGTGTCGACTGAGCTGGGG-TGTCACATG-GG--GGCCGTGTCACCTCCAAG---TAGGTCATGCTCTCACTCTGCCCTGCCCA----------GCCCTGGGCTCCCATACC----------CTTGTGAGGCAAAG-----GCCTCAATCCTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGCATCCCCTTCCATG---------------GGGACTTTATTGCCGCCATGGGATTCCCAT-------GGCC--------CCTGTATCAC-CTTGGGCTTCTGCTGGGCTGCCCGGCCTCCAGCCCAGGGGA--------------TGTTGACCCCCATAT-A---GGGGGTGTTGGCTCCTGTGTGGGTGGTGTTG-A--CTCCTGGGTGGGGGGGTGTTGGCTCCCGTGTGT-GTGGGGGTTGTTGGCTCCCATATC-GGGGGGTGTTTTTGGCTCCTGTGTGGGTGGTGGTGACTCCCG-TGTGG---GTGGTGTTGACT----------------GCTGTGTG---TGGGGGTGT--AGACTCCCATGTG--GGTGGTGTTGA---------------------CTCCTGTCTGGGTGGTGTTGGCTCCCGTGTGGGTGGTGTTGACTGCTGTGTGGGGGGGTGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNN-----------NNNN-NNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNN-N---NN--------NNN-NNNNN-N--NNNNNNN-NNNNN---------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNNNNN---NNNN--NNNNNN----------------------------------------------------------------------------     
 8 Piliocolobus_tephrosceles-NC_045434.1-208045_208796      89.4%  64.7%    ---------------------TGAGCAGGCACAGG-GCAGAACCCTGCCTTCAAGGTACATCTGATCAGTC-CATCCCATCACTGGCCACATCC----------------------------------------------------------------------------------------------------------TC---------------------AGTG----------------------------------GGGGTCCAGGGCCAAAGCGACAGCAGGCGGC---------------TCACTG-GGAGCC-TAGGACCCCTCAAGATGTT---GAGCAGCTGGGCATGTGTGAAATGAGCTGTCGGGGCTGC------CCTGCCTGAAATGTTGAGCTCTGGAATTCGTTG-AAGAGCAGGGCGAGGCACTGCGTCCCTTCGGGCCTGGTGTTCCTCGTGAGTGTCGACTGAGCTGGGG-TGTCACACG-GG--GGCCGTGTCACCTCCAAG---CAGGTCATGCTCTCACTCTGCCCTGCCCA----------GCCCTGGGCTCCCATACC----------CTTGTGAGGCAAAG-----GCCTCAATCCTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGCATTCCCTTCCGTG---------------GGGACTTTATTGCCGCCATGGGATTCCCAC-------GGCC--------CCTGTATCAC-CTTGGGCTTCTGCTGGGCTGCCCGGCCTCCAGCCCAGGGGA--------------TGTTGACCCCCATAT-A---GGGGGTGTTGGCTCCTGTGTGGGTGGTGTTG-A--CTCCTGGGTGGGTG-GTGTTGACTCCCGTG-----TGGGCGTTTTTGACTCCTGTGTG-GG-T--GGTG-TTGGCTCCCGTGTGGGTGGTGTTGACTGCTG-TGTGG---GGNNNNNNNNNN---------GTTGACTGCTGTGTG---GGGGGGTGT--AGACTCCCAGGTG--GGTGGTGTTGG---------------------CTCCCGTGTGGGTGGTGGTGGCTTCCGTGTGGGTGGTGTTGACTGCTGTGTGGGGTGAGTATATGGAGTTGGCTGTGGGTTGAAGGTGAAAGGCATATGGCGTCGGGCAGGTGCGTCAGTTCTGCATTTTCATGGGGCTGTCC-TCATGGTGGGTGGG-CCCGTGCC--CTGGGGAGTGACGGGAGGCTGTGATGAGGGCA-----GTGGAGTAGAGGAGG---------GTGGGCTTGCATGTTG----GTCTTGAC-T---GGGGA-GCGGGGTGGCCCTGAAGGACCC-------C---------------TGTGCATGTAGCCCTGGTCGAGGTGCC------AATGGTG---------------------------------------------------------------------------------------------     
 9 Cebus_imitator-NW_016107460.1-183909_184777              73.9%  43.2%    ---------------------------AGGCACAG-GCAGAACCCTGCCTTCAAGGCAAGTCTGATTAGCC-TGCCTCGCCTCTGGCCATGTCGTCAGCGGAGGGGCTAGGGCCGAGGTGACAGAAGGTGGCTCACGGGGAGCCTGGGGCCCCTCAAGATGCCTCTCGAGATGCCGAGCAGCTGGGCAGGTGTGAAACCGTCTGTCAGGGTGG--CCCTGCCTGAAG--CCTTGAGCTCTGCCATTCTTCC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAGTGCAGGGTGAGGCACTGGGG--TTCCTCGTGAGTGGGGGCTGAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTCGTGAGTGGGGGCTGAGCTGGGG-TGTCACACT-GG--GGCCATGTCACCTCCAAG---CAGGTCACGCTCTGACCCTGCCCTGCCCA----------GCTCTGGGCTCCCATGCC----------CTTGTAGGACCAAG-----GCCTCAATACTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGCATCCTCTTCCATG---------------GTGCCTTTATTGCCACCATGAATTCCCTCG-------GCCC--------CTG--CACAC-CTTGGGCTTCTGTTGCGCTGCCCGGCT-CCAGCCCAGGGGA--------------TGCGGTTAACTCCCG-CGTAGGGGTGTTGGCTCCCACGCTTGTGGGTGGTGTTGACTCCCATGTGAGGG-TTGTTGGCTC----CTGT-GTGGGTTGTGTTCACTCACGTGTG-GGGTGGTGCT---GGCTCCCGTGTG---GGCATTGACTCCCA-TGTGA---GTGGTGTT-TTCTGTGTGAGTGTTGGCTCCCATGTG---GGTGGTGTT--GACTCTC-GTGTT--GGGGGCATTGACCTCTGTGTTGTGGGTGCTGGCTCCCCTGTGGGTGATGTTGGCTCCAGTGTTGGGGGTGCTGACTCCCCTGTGGGTGGTGTTTTCT-----------GTGTGGGTGTTGGCTCCCCTGTG-----------GGTGGTGCTGGCTCCCGTGTGAGCTGAGTGGACTTGCTTGTGGGTCAA----AG-----GTGGAAGGCACATGGCGTCGGGCAGGTGTGTC----AGCTCTGTATTTTCAC----------GGGGCTCTCCTCTTGG-TGGGTGGGCC-T---GTGAC-CTGGGGAGTGATTGGAGGCCA--------------------------TGAC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
10 Sapajus_apella-NW_022437067.1-184555_185132              79.3%  45.3%    -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCTCTCGAGATGCCGAGCAGCTGGGCAGGTGTGGAACCGTCTGTCAGGGTGG--CCCTGCCTGAAG--CCTTGAGCTCTGCCATTCTTCCAAGTGCAGGGTGAGGCACTGGTGTTCCTCATGAGTGGGGGC---------------TGAGCT-GGGGTG-TCCTGGTGTTCCTTGTAGT----GGGGGCT----------GAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTC----CTCGTGAGTGGGGGCTGAGCTGGGGTGTCCTGGT--GTTCCTTGTAGTGGGGGCTGAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTTGTGGGTGGGGGCTGAGCTGGGG-TGTCACACT-GG--GGCCATGTCACCTCCAAG---CAGGTCAGGCTCTGACCCTGCCCTGCCCA----------GCTCTGGGCTCCCATGCC----------CTTGTAGGACCAAG-----GCCCCAATACTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGCATCCTCTTCCATG---------------GTGCCTTTATTGCCACCATGAATTCCCTTG-------GCCC--------CTG--CACAC-CTTGGGCTTCTGTTGCGCTGCCCGGCT-CCAGCCCAGGGGA--------------TGCGGTTAACTCCTA-CATAGGGGTGTTGGCTCCCACGCTTGCGGGTGGTGTTGACTCCCATGTGAGGG-TTGTTGGCTC----CTGT-GTGGGTTGTGTTCACTCCCGTGTG-GGGTGGTGCT---GGCTC---------------------CCA-TGTGA---GTGGTGTT-TTCTGTGTGGGTGTTGGCTCCCATGTG---GGTGGTGTT--GACTCTC-GTGTT--GGGGGCATTGACCCCTGTGTTGTGGGTGCTGGCTCCCCTGTGGGTGATGTTGGCTCCAGTGTTGGGGGTGCTGACTCCCCTGTGGGTGGTGTTTTCT-----------GTGTGGGTGTTGGCTCCCCTGTG-----------GGTGGTGCTGGCTCCTGTGTGAGCTGAGTGGACTTGCTTGTGGGTCAA----AG-----GTGGAAGGCACATGGCGTCGGGCAGGTGTGTC----AGCTCTGTATTTTCAC----------GGGGCTCTCCTCTTGG-TGGGTGGGCC-T---GTGAC-CTGGGGAGTGATTGGAGGCCA--------------------------TGACAAGGGCAGTGGCATGGAGGAGGG---TGGGCTTGCGTGT----------------------------------------------------------------------------------------     
11 Callithrix_jacchus-NC_048389.1-189192_189967             73.5%  36.4%    ----------------------------------------------------------AATCTGATTAGCC-TGCCTCACCTCTGGCCAGGTCATCAGCAGAGAGGCTACGGCAGAGGTGACAGCAGGTGGCTCACGGGGAGCCTGGGGCCCCTCAAGATGCCCCTCGAGATACCAAGCAGCTGGGCAGGTGTGAAACCATCTGTCAGCGTGGCCCTGCCCGAAGCC----TTGAGCTCTGACATTCTTCC-AACTGC----------------------------------------------------AGG-GAGAGG-CACTGGTGTTCCTCGTGGT----GG----------------------------------------------------AGGCTGAGCTGGGGTGTCCTGGT--GTTCCTCCTGGTGGGGGCTGAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTCGTGAGTGAGGGCTGAGCTGGGG-TGTCACACT-GG--GGCCATGTCACCTCCAAG---CAGGTCATGCTCTCACCCTGCTGTGCCCA----------GCTCTGGGCTCCCATTCC----------CTTGTAGGACCAAG-----GCTCCAATACTTAAGGCTCAAGGATTTCAAGCATCCTCTTCCATG---------------GCACCTTTATTGCCACCATGAATTCCCTCG-------GCTT--------CTG--CACAC-CTTGGGCTTCTGCTGCACTGCCCGGCT-CCAGCCCAGGGGA--------------TGTGGTTAACTGCCG-TATGGGGTGTTGGCTCCCAC-G----CGGGTGGTGTTGGC----------------------CC----CTGT-GTTTG-----------------------GGGTGTT---GGCTCCCATGTG---GGCATTGACTCCTG-TGTG------GGTGTT-TTCTATGTGGGTGTTGGCTCCCCTGTG---GGTGGTGTT--GATTCTC-GTGTT--GGGGGCATTGACCCCTGTGTTGG-----------------------------------------------------------------------------------------GGGTGTTGGCTCTCGTGTT-----------GGTGGTGTTGGCTCCCGTGTGAGCTGAGTGGACTTGCTTTCGGGTTGA----AG-----GTGAAAGGCACGTGGCATCCGGCAGGTGTGTC----AGCTCTGCATTTTCAC----------AGGACTCTCCTCTTGG-TGGGTGGGCC-C---GTGAC-CTGGGGAGTGATTGGAGCACGGGAGTGGCC---------------CGTGACAAGGGCAGTGGCATATAAGAGGG---TGGGCTTGTGTGTTGGTTTTGACTGGGGTGACAGTGCCCCTGAAGGACCCCTGTGCATGCAGCC-CTGGGTGAGGTGTCCATGGGGACC------------     
12 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-189089_189624         81.7%  42.6%    ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTTCCTCGTGGTGGAGGCT-----------GAGCTGGG---GTGTCCTGGTGTTCCTCGTGGTGGAGGCTAAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTCATGAGTGAGGTCTGAGCTGAGGTGTCCTGGTGTTCCCTCTGGTGGAGGC---------------TAAGCT-GGGGTG-TCCTGGTGTTCCTCGTGGT----GGGGGCT----------GAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTC----CTTCTGGTGG-AGGCTAAGCTGGGGTGTCCTGGT--GTTCCTGGTGGTGGAGGCTGAGCTGCGGTGTCCTGGTGTTCCTCGTCAGTGGGGGCTGAGCTGGGG-TGTCACACT-GG--GGCCATGTCACCTCCAAG---AGGCTCAAGCTATCACCCTGCCCTGCCCA----------GCTCTGGGCTCCCATGCC----------CTCGTAGGACCAAG-----GCCCCAGTACTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGTATCCTCTTCCATG---------------GCACCTTTATTGCCTCCATGAATTCCCTCA-------GCCC--------CTG--CACAT-CTTGGGCTTCTGCTGTGCCGCCCAGCT-CCAGCCCAGGGGA--------------TGCGGTTAACTCCCG-CATAGGGGTGTTGGCTCCCATGCTTGCGGGTGGTGTTGACTCCCTTGTGAGGG-TTGTTGGCTC----CTGT-GTGGGTTGTGTTCACTCCCGTGTG-GGGTGGTGTT---GGCTCCCATGTG---GTCATTGACTCCCA-TGTGG---GTGGTGTT-TTCCATGTGGGTGTTGGCTCC--------------------------------------------------------------------------------------------AGTGTTGGGGGTGTTGACTCCCATGTGGGTGGGGTTTTCT-----------GTGTGGGTGTTGGCTCCCCTGTG-----------GGTGGTGCTGGCTCCCATGTGAGCTGAGTGGACTTGCTTGTGGGTTGA----AG-----GTGGAAGGCACCTGGCATCGGGCAGGTGTGTC----AGCTCTGCATTTTCAC----------AGGGCCGTCCTCTTGG-TGGGTGGGCC-C---GTGAC-CTGGGGAGTGATTGGAGCCCA--------------------------TGACAATGGCAGCGGCATGGAGGAGGG---TGGGCTTGCGTGTTGGTTTTGACTGGGGAGAGAGTGTCCCTGAAGAACCTCTGTGCACGCAGCC-CTGGGCGAGGTGTC----------------------     
13 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-109807_110160             82.9%  40.2%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGATGCCGAGCAGCTGGGCAGGTGTGAAACCATCTGTCAGGGTGGCCCTGCCCAAAGTC----TTGAGCTCTGGCATTCCTCCAAGTGCAGGGCGAGGCACTGGTGTTCCTCATGGTTGGGGGC---------------TGAGCT-GGGGTG-TCCTGGTGTTCCTCGTGGT---GGGGGGCT----------GAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTC----CTTGTGAGTGAGGGCTGAGCTGGGGTGTCCTGGT-GTTCCTTGTGAGTGAGGGCTGAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTTGTGAGTGAGGGCTGAGCTGGGG-TGTCACACT-GG--GGCCATGTCACCTCCAAG---CAGGTCATGCTCTCAGCCCTGCCCTGCCC---------AGCCCTGGGCTCCCATGCC-----------CTTGCTAGGACCA-----AGGCCAGTACTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGCGTCCTCTTCCGTG---------------GCACCTTTATTGCCGCCATGAATTCCCTCG-------GCCC--------CTG--CACAG-CTCGGGCTTCTGCTGCGCCACCCGGCT-CCAGCCCAGGGGA--------------TGCGGTTCACTCCCG-TGTAGGGGTGTTGACTCCTGTGTAGGAGCATTGAC-----CCCTGTGTTGGGG-CTGTTGGCT-----CCCT-GTGGGTGGCGTTGGCTCCCGTGTG-GGTTTTGGTG---TCAGCTCCTGTG---TGAGCTGAGTGCGC-TTGCT---TGCGGGTT-GAAG--GTGGAAGGCACGTGGCGTCGG---GCAGGTGTGTCAGCTCTGCATTTT--CATGGGGCTCTCCTCTTGGTGGGTGGGCCTGTGAC--C---TGGAGTGATTGGAGGCCGTGACAAGGGCAGTGGCGTAGAGGAGGGTGGG--CTTGC-----------GTGTTGGTTTTCACTGGGGAGTG-----------AGTGCCCCTGAAGGACCCCTGTGCATGCAGCCC-------TGGGC-----------------GAGTGTCCATGGGGAC-CCAAGGCCTTGC----ATTGCAGGAAGCAGAC----------ACGGATGACACCGAG---------GAC-A---------CTGGGG---------------------------------------TTTGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAA-----------------GATGATGTCCACGCGCCGG-----------GACCTCTACCTGCTCATGCTGAC-CTACAGCAACCACAAA--------------------     
14 Oncorhynchus_tshawytscha-NC_056435.1-221291_221527       76.1%  28.9%    ---------------------------------------------------------------------CA----CATTTGTTTGTC----------------------------CC----TG-------------------TTTAGTGAGCATCC-------------TTTGCCAAGATAATCCA------TCCATCTGAT-----GGGTGTGACATATCAAGAAGCTGATTAAACAGTATGATCATTAC------A-CTGGTGCACCTTGTGCTGGTGACAATATAAGGCCACTCTAAAATGTGCAGTTTTTGTCACA-TAACACAATTCCGCAGGTTT--TGAGAGCTCGTGCAATTGGCATGTTGACTGCAGGAATGTCTGCCAAAGCTGTTTTAACTTAAG-TAGGCAAGCCAGTT-AAGAACC--------ATTTTTATTTTTACTGACATGGGGATCCCAATCACTGCTGGTTGTGATACAGCTTGGAATCAGGGTCTGTAGTTATGCCTCTAGC---ACTGAGATGCAGTGCCTTAGACCACTGCACCACTCAGGAACCCTCTGTTTCCAGAGAATTGAATGTCCATTTCTCTTCCAT-AAGCCACCTCCAATGTCGTTTTAGAGAATTTGGCAGTACGTCCAACCGGCCTCACAACTGCAGACCATGTCTAACCACGTCA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCCAGGACCTCTACATCCCC----------------------TTTCATGGGGAAAAACTCATT-----CTGA-TTCACTGGGCCTGGCTCCCCAGTG-GG----TGGGCCTGGCTCCCCAGTGGGTGGGCCTGGCTCCCC-AGT-------------------------------------------GGGTGGGCCT--GGCTCCCCAG-TG--GGTGGGCCTGGCTCCCCAGTGGGTGGGCCTGGCTCCCCAGTGGGTGGGCCTGGCTCCCCAGTGGGTGGGCCTGGCTCCCCAGTGGGT--------------------------GGGCCTGGCTCCCCAGTG-----------GGTGGGCCTGGCTCCCCAGTGGGTGGGCCTGGCTCCCCAGTGGGT---------------------GGGCCTGGCTCCCCAGTGGGTGGG------CCTATGCCCTCCCGGACCCT--TCCATGGCAACACCCCTGCCCATACATGTGAAATCTATATATTAGGGCCT-AATGAATTCATTT----CAC---------------TTGACTGATTTCCTTAAATGACCTGT------------AACTCAGTAAAATCGTTGAA------------ATTGTTGCATATATATTTTTGTTCAGTATATTTCATTTTCAT-----------TAC-------     
15 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-176925_177310       83.9%  40.3%    ----------GGTCTGGGGGTGGGTGGGGCATGGG-ACAGGACCCTGCCTTCAAGGCATGTGGGATCCA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCCTCTGGCCACATTGT-----CAGTGGAGGGTCAGGGCCAAGGTGGGTGGCTGACCCCC-------------CCACCGGTCCCCC-AGCAGCCCTCTGTGACTCC---GACCACCTGGGCAGGTGTGTGACGAGCTGTCAGGGCTGCC-----CCAGCCTGATGTATTGCGCTCTGTTGCTCTGTG-GAGTGTGGGGTTGGGCGC------------TGCCA--GGCATTCCCGGTGAGGGGCCTGAGCTGGGG-CGTCACGCC-AG--GGCCCCAACACTGCCAAG---GAGGCCATGTGGTCACCCCACC------------------CCACCGGGGTCCCTCGC----------CCTCGCTGGATAAA-----GCCCCAATCTTTAGGCCTCAAGGGTTTCAAGCAGCCCCTTCTATG---------------GGAGCCTTTCTTGGCCATTCCCAGGGACCC----CCCGAGC--------CCTACAGCAC-CTCAGCTTGCATCTGGGCAGCCTGGCCGCTAGCCAGCCCAG--------------TGCGCTCTTGACTCA-CATGCGGAGTGTGGACTCCAGTGTGGCTCGATCTTG--AAAGGCATGCAGACGCGTAGGGGCGC-GTCAGAT-ATGCGTCTTT------C-CGAAA--------GGCCATTGCCTGTTCTCTGGGTGGGAGGGCACCGGG--GAGC----CCAGCGAGCCAC-------GGCTGCATGTGCCCAG---GGAGCAAACTAAGGCCGCGGCGTG--GGCAGTGGCGA--GGCGGGGAGGAGGGG----CTCG---CAGCCTGGCCTTGACTGAGGAGGGGGCGGGCCTGCAGGGCC------------CTTCG-----------GGTGCAGCGCTGGGCGGGCTGTG-----------------CATGGGACCCG------AGGCCTTGCCTTGCAGGAAGCAGACACGGATGACCACCAGGGGACCCTGGGCTTCGAGGAGTTCTGTG----CCTTCTACAAGATGATGTCCACGCGCCGGGACCTCTACCTGC-TCATGCTGACCTACAGCGACCACAAGGACCACCTGGACCCCACCG---A-----------------CCTGCAGCGCTTCCTGGAGGTGGAGCAGA---AGGTGAGGCTGCGGAGCTTTGGCGGAGG-------------------------------------------------------------------------     
16 Coregonus_clupeaformis-NC_059215.1-259717_259963         71.4%  25.4%    GTAAAGTGTTGGTCCCATGTTTCATGAGGTGAAATAAAAGATCCCAGA--------AATGTTCCATTCGCA----CATTATTTATCTCATATTTTGTGCACAAATTTGCTGACACCCCTGTTG-------------------GTGAGCATTTCTCC-------------TTTGCCAAGATGATCTA------TCCACC-----------------TGCCAGGTGCAGCTGATTAAACAGCATGATCCTTAC------A-CAGGCACACCTTGTGCTGGGGACAATAAAAGGCCCCTCTGAAATGTGTAGTTTTGTCAGACAACACAATGCCACAGATGTTT--TGAGGGAGCGTGCAATTTGCATTCTGACTGCAGGAATGTCCACCAGACCTGTTG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCAGAGATTTGAATGTTCATTTCTCTACCAT-AAGCTGCCTCCAACGTCGTTTTAGAGAATTTGGCAGTACGTCCAACCAGCCTCACAACCACAGACCACATGTAACCACGCCAGCCCAGGGCCTC----CACATCC--------GTTTCTTAAC-CTGCGGGATCGTCTGAGACCAGCTA---CCCGGACAGCTGA--------------TGAAACTGAGGAGTATTTCTGTCTGTAATAAAGCCC----------------------TTATGTGGGGAAAAACTCATT-----CTGA-TTTGGTGGGCCTGGCTCCCCAGTG-GG----TGGGCCTGGCTCCCCAGTGGGTGGGCCTTGCAACCA-AGTG----------------------GGTGGGCCTTGCAACCAAGTGGGTGGGCCT--GGCTCCCCAG-TG--GGTGGGCCTGGCTCCCCAGTGGGTCAGCCTGGCTCCCCAGTGGGTGGGCCTGGCAACCAAGTGGGTGGGCCTGGCAACCAAGTGGGT--------------------------GGGCCTGGCACCCCAGTG-----------GGTGGGCCTTGCTCCCCAGTGGGTGGGCCTGGCTCCCCAGTTGGT---------------------GGGCCTTGCAACCAAGTGGGCGGG------CCTATGCCCTCCCAGGCCCA--CACATGGCTGCGCCATTGCCCAGTCATGTGAAATCCATAGATTAGGGCCT-AATTAATTTATTT----AAA---------------TTGACTGATTTCCTTATATGAACTGT------------AACTCAGTAAAATTGTTGAA------------ATTGTTGCATGTTGTGTTTTATATT--------------------------------------     
17 Castor_canadensis-NW_017871110.1-171895_172017           76.5%  31.3%    --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGCCAGTG------------TCTGTAGTACCTGC------T----------------GGCCAAGCACCTGTGTGCCTGGACCTGGGGGTAACAGGCCACAAGATAGAACATGCCTTCAAGGCACATGGT-----CAGTGGAGGGTCAGGACTGAAGCAAGAGGCTGAGCCCTGGCTAAGCCATGTTCTGGGTCTCCTC-AGCAGGGTTCCATGGCACT---GAGCACCTAGACAGGTGTGTTTTGAGCTGTCAGGGCCACC----CCAGCCCAAC-TCATTGAA------------------TAC----------TGCAGAG------TCCACGCTGTCAAGCTTTCCCTATGGAGGCTGATTCAGG-TGCTAAGCT-GG--GGCCCTGTCACCTCCAAG---CAGGTCCTGGTCTTGCCCTGCCCCACCCA---------CTGG-------------------------------GCCCTCAC-----AGGCTCCAAAGTCAGTCTTTAAGGTTTCAAGCAGCCCCTTCCATA---------------GGGGCCTTTCTGGCTCACTCCTAGGGACTT----CATGGGC--------CACGACATGC-CTCAGACTTCCTCTCTGTAGCCCACCT-CCAGCTGTAGG----------------TGCCTTTGTCTCCAG-GATTTGCCTTTGGCCGGGGC------ATGGGGCTAT--GCAGCTCCCTGGACTTCTACTTGCACCTTGCCAA-GTGCTCCCTA--AGTCCATGGATG-TGGAGCTTCCCTGGGCTCCCTGGTGGGATGGCCTGGGGGAGCCCCTG-----AGGGT---TCCTGAGGTCATCTTGTCTACAAAAGGAAGACAGCAGCCAAGACTCCTTACCTC------CTCATGAGACCTGAGCCAG-GACACTGCTTGGCA--CCTGTGCATTTCTAATCAGTGGATAGGGTCCAGTGGTAACT-------------------ACAG--GTGTGGGGACCTAGAGTCCAGGGAG----------------GGAGCAGTCCTGTGTAG-GTGACTGTAGTTGGTTACAAGGTGA---C-------ATGGC-AAGGCATGGAGTG-GAGAGGTGGTTC----CAACCTGCTTTCCAGTGT--------CATAGTGATTACTTGG-TGGGAGAAGGGC---GGGGGGCGGGGAACTCACTGAGCTTCATGTACACAA---------------GGTAGTAAGCTGAGTGGTG---ATGCAGG---CAATGGCGGGGGCTGGGCTTGTGA-----------------------------------------------------------------------------     
18 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-141543_141636            83.4%  34.7%    ------------------------ATGGCGCATAG-AGCAGAGCCTGCCTTCAAGGCACATCAGATGCAGCCTGTGCCACCTCTGACTACACCATCCGT------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGTGGGCAGGGTGGAGGTGGTGGCAGGCTGC-------------------------------------------------------------CCACCGGTCCCAGCAGCCT--------------------TCTGGGAGGCTGAGCCAGGGAGGTTGCTAGGAGTGCGAGACCCGGAGCTGT-------GTCCCTCCGCCAGGCACCCGAGAGCAAGCTG---AGCTG-TGTCACACT-GG--TGCCTG-ATGCCTCTCAG---CAGCTTGTGTGCTCA-----------CCT---------GGTTGCAGGCTCCT-GTGC----------CCTTTTTGGGCCCA-----AACCCGGTCCTTAGGGCTCAAGGGTGTCCGGCAGGCCCTTCCAAG---------------GAGCCCATCCCCAGGGTTCCCACTCACAGC--------------------CTTTGGCAC-CT-CCGCATCCTCTGGGAGGCCCGGCCTCCAGCCCAGTGGGACTCCAGGG-TAGGTGGTGTGGACTCCAG-CATGGGCAGTGTAGACTCTATGTGGACA----GTGTGGGCTCCAGTGTGGACT----------C----CGGG-CGGGGTGGTACAAGCACTGCTGCTCGTGCCCTGGGAGTGCCCGTGATGTGGGCAGAGTAGGAGGGAAGAGTGGGCTGTGGGCTTGGCTGGATGCGGTGCTGGGTGGGACGTG---AATGGGGACAGAGGCCTCGTGCTGCAGGAGGCGGACACGGATGATCAGCAGGGGA---CGCTGGGCTTCGAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCACACGCCGAGA-----CCT-------------CTACCTACTCCTGCTCACCTACAGCGACCACAA-GGACTACCTGGCTGCCGCCGA--CCTGCAGCGCTTTCTGGAGGTGGAG-CAGAAG----GTGGGAGCTGGGTGGGGCAGGGC---TGGGCC-AGGGCTGGTGCCTCCCTGGGCCCA---CAGTGGCTCTAGGCTCCC-GCTCCAGCACCCGC-CATGCTCTGGGGCCTCCCGGAAGTCCCGCC-ACAGA---------------CTTGCCCCGGG-----------CCGGGGGCTCCCGGCTTCGGCTGTA----TCACTGGG-----------CCCTTGGGGTCCCTTGGTCTCGGGCC-CTCA----------------------GG--------     
19 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-186793_187012         72.5%  23.6%    -------------TCCATGATGGGGCATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NN----------N--NNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGACTCCCAGGGTGTGA----TGTTGGCTCCATGATGGGGCATTGGCTCCCAGGCTGGGGTGCTGGCTCCCAGGGTGGGGTGTTGGCTCCCAGGGTGGTTGTTGACTCCCAGGGA-GGAATGT-TGGCTCCC--AGGGTGAGGTGTTGACTCCCAT---GGTGTGATGTTGGCTCCAGG---ATGG------------TGCATTGACTCCCAGGGT-------G--TGATGTTGGCTTC------AGGTTGGAGCGTTGGCTCCCAAGCTGGGGC--ACTGGCTCCCAGG---------------GTGGGGTGTTGGCTCC-AGTGTGGGGTGTTGGCTCCCAGGGTGGGGTGTTTATTCCCAGGGTGTGGTATTGGCT--------------CCAATGT-G------------------GAGTATTGGCTCCCAGTGTGGGGCAT-TGACTTCCAG-----GGTAGGGCGTTGACTTCCAGGGAGGG--ATGTTGACTC----CCAG--GGAGGGGCATTGACTCCCAGGGT-GG-----GGTGTTGGCTCCCAGGGT-GGGGCATTGACTCCTGGGGAGGGGTATTGAC---AACAGTGTGGGGTGTGATTGACTCCCAGTGGGGGGTATC--GGCTCCCAGGGTG----AGGTGTTGAC-TCCCAGGGTGGGATGTTGGCTCCAG--GATGGGGTGTTGGT--------------------TTCCATTGTGGGGTGTTGACTCCCAGGGTGGGGTGTTGACTCCCAGGGAGGGGTGTTGACTCCCAGGGAGGAATGTCAACTCCAGGGTT--GGGTGTTGGCTCCTGGGGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
20 Equus_asinus-NC_052181.1-187926_188042                   77.2%  28.7%    ----------------------------------------------------------------------------------------------------------T--GACTCCATGTGTGGGGTATCAGCTCCCAGGGTGGAGTGTTGACTCCA-----------GGGTGAGGTATCGGCTACCCGAGTCAGGTGT--TG----------C--CTCCCAGTGTGGG---ATATTGGCTCCCAGTTTGGA----------GTGTTGACTCACGGTGTGGGATGTTGTCTCCCAGGGTGGGGTGTTGTCTCCCAGGGAGG-GGTGTTGACTCCTGGTGTGGGGTGTTAGCTCACAGGGTGGGGTGTTGACTCCCAGGGAAGGA----TGTTGAATCCAGGGTGAGGTGTTGGCTCCCAGGGTAGGGTGTTGACTCCCAAGAAGGGGTG-------------------TTGACTTCAAGGGT-GGGGTGT-TGGCTCCC--GTGGTGGGGTGTTGACTCCCAG---GGAGGGGTGTTGACT----------------------------------CCCAGAGT-------G--GGGTGTTGACTCC------AGGGTGGGGTGTTGGCTCCCAGGGTGGGGT--ATTGACTCCCAGA---------------GAGTGGTATGGACTCCCATGGTGGGGTGTTGACTCCCAAGGAGGGGTGTTGACTCCCAGGGTGGAGTGTTGCCT--------------CCAGGAT-G------------------GGGTGTTGGCTACCAGGGTGGGGTGT-TGACTCCCAG-----AGAGAGGTGTTGACTCCCAGGGAGGG--GTATTGACTC----CCAT--GCTGGAGTGTTGACTCCCAGGGA-GG-----GGCGTTGACTCCCATGGT-GGGGTGTTGACTCCCAGGCTGGGGTGTTGAC-------------------------TCCCAGAGAGGGATGTT--GAATCCTAGGT-T----GGGCGTTGAC-T-CCAGGGTGAGGTGTTGGGTGGGT--CCAAAGTGGGTGTTTAGGGTGGGCGTGATCCCAGGGTTGAGGTTTGATCCAGGGTGACAGGGTGGGATATTGACTCCCAGGGAG------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGTGTT---GACTCCCAGTATAGGGT---------GTTGGCTCCAATGTGGG---GTGTTGACTC---C-----AGGGTGGGGTGTTGACTCCAGTGTA-GAATGTTGGCTTCAGAGTGGGGTGTTGGCTCCTAGTTCAGGGTGTTGGCTCCAGTGTAGGGTGTTGACTCTCAGTGTGGGGTGAC----TATGCCAGGTTCAGCTGTAGGATGACCTTGAA-------------------------------     
21 Equus_przewalskii-NW_007674960.1-189470_189682           80.4%  31.4%    --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAGGGTGGG----------GTATCGGCTACCCGAGTCAAGTGTTGCCTCCCAGTGTGGGATATTGGCTCCCAGTTTGG-AGTGTTGACTCACGGTGTGGGATGTTGGCTCCCAGGGTGGGGTGTTGTCTTCCAGGGAGGGA----TGTTGAATCCAGGGTGAGGTGTTGGCTCCCAGGGTAGGGTGTTGACTCCCAAGAAGGGGTG-------------------TTGACTCCAAGGGT-GGGGTGT-TGGCTCCC--GTGGTGGGGTGTTGACTCCCAG---GGAGGGGTGTTGACT---------------------------CCCAACTCCCAGAGT-------G--GGGTGTTGACTCC------AGGGTGGGGTGTTGGCTCCCAGGGTGGGGT--ATTGACTCCCAGA---------------GAGTGGTATGGACTCCCATGGTGGGGTGTTGACTCCCAAGGAGGGGTGTTGACTCCCAGGGTGGAGTGTTGCCT--------------CCAGGAT-G------------------GGGTGTTGGCTACCAGGGTGGGGTAT-TGACTCCCAT-----GGTGGAGTGTTGACTCCCAGGGAGGG--GCGTTGACTC----CCAT--GGTGGGGTGTTGACTCCCAGGCT-GG-----GGTGTTGACTCCCAGAGA-GGGATGTTGAATCCTAGGTTGGGCGTTGACT---CTAGGGCGAGGTGTTGG-----CTCCAATGTGGGGTGTT--GAATCCTAGGT-T----GGGCGTTGAC-T-CCAGGGTGAGGTGTTGGGTCCAA--AGTAGGGTGTTGGCTCCC--------------------AGGGTGGAGTATTGACTCCCAGGGTGGGATATTGACTCCCAGGGAGGGGTGTTGACTCCCAGTATAGGGTGTTGGCTCCAATGTG--GGGTGTTGACTCCAGAGTAGGGTATTGACTCC----AGTGTTGGATGTTGGCTTCAGAGTGGGGTGTT---GGCTCCCAGTACAGGGT---------GTTGGTTCCAATGTGGA---GTGTTGACTC---C-----AGGGTGGGGTGTTGACTCCAGTGTA-GAATGTTGGCTTCAGAGTGGGGTGTTGGCTCCTAGTTCAGGGTGTTGGCTCCAGTGTAGGGTGTTGACTCTCAGTGTGGGGTGAC----TATGCCAGGTTCAGCTGTAGGATGACCTTGAAAA-------------------GCTT------     
22 Lagenorhynchus_obliquidens-NW_020837953.1-292656_292707  79.7%  31.5%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGGTGGAGGCACAGCGTGGAGGCACCCG-CTGCAATCCC----TCCACCCTGCAAGCTCTCCCTAGGCAGGCCCTGCTCAGAA----------GGCGTCCTCC---CCCTCCTCACAGCCCTACTGCCCCACCTGCGGGCCCAGCTTCTCTTACC-GGGGTGACCTCCTCCTTCCCCTCCCCTTCCCAGCCTCCCGCCCTGCCCACCC-------------ACCGAGGCCGCCCTGGC----------CCCGAGGACAGAAGCAAACACCGCCTCCGCTGAGCCTGCTCCTTGGGCCTCCCCCTGCGCCCCGGGTCAGAAAAGCAGGGTCTGCTTTGCGCTACTGTGCTTCTCACTTCG--C--TAAC--------CAACGAGCTG-CTCCCGCAGGCCCTGTGGAGCCAGAGT-CAAGGCCAGGGAGACACTCTCCGGGCGCCCCCTGCACTGCCAGCGCCTGCCAGCATGACCCAGGGGC-TGGGGTTGCGTTTGCTCCCGAGGGACGGGCAGAGCGGTGCGT-CCAG-GAGGTCTGTGGTGGACTCGGCCTC-GGCC---TCG-CTGGATGCCGCAGGGCCAGGCCAGAGA-----TCAGA----GGGCGCTGTCCGCCCTGGCACTTCTCTCCCTGGGG---ACTGCTGGGTTGAGTCCCCTGCTG-------------CCCCCGTCTGGATGGCGCTGCCC-CCGTCTGGATGGCGCTGCCCCCCGTCGGATGGCGCAGCCCCGAGA-----GCCGATGCCTCTCCTCTG-----GCCCCCAGGCTCACTCTCCTTTTCTGAGTGTG--ACTGAAGCCCACTCCCCAAA---CCTGCCAAAATGCCTAACCTCTTCCGCCGAA-----CTGG--CCCGGATAAATACGCTGGCCTCATTCGTCTCCTCCTGCTGCCAAGAGCCCA---CAGTGGCCCCCCACGGAC-TGAACGGGCACATTCCAGACCCTCCCTCTTCCATGCAGCCAG-------------------------GTACTAGCAACGCCCCGATCCCCGCCTGTCCCCAGGAGAGCACAGGGCACCCAGCACCCGGCGG--------GCTGAACGCA---TGGTCCTGTCTTCCCACCAGCCCGACCGCGCACACAGGCTGGCGGGA     
23 Tursiops_truncatus-NC_047034.1-296993_297042             72.4%  28.2%    -------------------GTAGCCCA----------------------------------------------------------------------------------GCGCCTGGCCGGGTTGCCCTGAGTTCATGAGGGTGTCAGCTTCCTGG-----------------------------GCTGCGGCCTGCACATA----GAGGATGGAGGGAGGAAGGTC----AGGTCAACCCAGAACACTGA------------AGGCCCC---------------TCACGGGCTGGCCGCTGCTTGTTCCCCAGGCAGAA-GCTGCCCGCTCCCTCTGGAA--GGGGTGGAGGCACAGCGTGGAGGCACCCG-CTGCAATCCC----TCCACCCTGCAAGCTCTCCCTAGGCAGACCCTGCTCAGAA----------GGCGTCCTCC---CCCTCCTCACAGCCCTACTGCCCCACCTGCGGGCCCAGCTTCTCTTACC-GGGGTGACCTCCTCCTTCCCCTCCCCTTCCCAGCCTCCCGCCCTGCCCACCC-------------ACCGAGGCCGCCCTGG-----------CCCGAGGACAGAAGTAAACACCGCCTCCGCTGAGCCTGCTCCTTGGGCCTCCCCCTGCGCCCCGGGTCAGAAAAGCAGGGTCTGCTTTGCGCTTCTGTGCTTCTCACTTTG--C--TAAC--------CAACGAGCTG-CTCCCGCAGGCCCTGTGGAGCCAGAGT-CAAGGCCAGGGAGACACTCTCCGGGCGCCCCCTGCACTGCCAGCGCCTGCCAGCATGACCCAGGGGC-TGGGGTTGCGTTTGCTCCTCAGGGACGGGCAGAGCGGCGCGT-CCAG-GAGGGCTGTGGTGGACTCAGCCTC-GGCC---TCG-CTGGATGCCGCAGGGCCAGGCCAGAGA-----TCAGA----GGGCGCTGTCCGCCCTAGCACTTCTCTCCCTGGGG---ACTGCTGGATTGAGTCCCCTGCTG-------------CCCCCGTCTGGATGGCGCTGCCTCCCGTCTGGATGGCGCTGCCCCCGTCTGGATGGCGCAGCCCTGAGG-----GCCGATGCCTCTCCTCTG-----GCCCCCAGGCTCACTCTCCTTTTCTGAGTGTG--ACTGAAGCCCACTCCGCAAA---CCTGCCAAAATGCCTCATCTCTTCCGCCGAA-----CTGG--CCCGGATAAATCCGCTGGCCTCATTCGTCTCCTCCTGCTGCCAAGAGCCCA---CAGTGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
24 Lynx_canadensis-NC_044310.1-189731_189795                77.4%  26.1%    ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCAGGGAC-----------CTGGCACCCACCCCCCAGCCACCCCAGATTG--TG----------T--CACCACATACGGA---AACAC-----------TCCA----------GATGGCGCTCAGAGCCGGAAGCGCTGCTGTCCATGGTG-----CT--GAC-------CC-AATGTCAATGCCTGCTGTGCAGCCAA-CCTCCAGACAGGTCCTTCT----CACACCCCACCC----CCACCCCACCAGCCCTAAGAACTGGGGCTCTGGATCAGCACCTT-------------------CTGCGGGACCTTTCTTGTCAATTCCCAGGGA-TCACCGT-GGCCCCAG--GG-C--ACCTCAGGCTCCTCTG---GG--CAGCCTGGCCTCCAGTCGCTGGG------------TGCCCTTGTCCTCTGTGT-------C--TGTCCCTGGCCTT------GGCGTTTG----GTGTTCCCAGGGTCTGAC--------------A---------------CTTCAGTAGATGCTCCCTGA-------------------GTAAGTGGGTTCATGAAGAAGTTCATGGTCTCACT--------------GGGGTCTCG------------------GTGGGTTTGCCCCCGGCGGGTCCTGC-AGGAGTCGTG-----CGAGCTGCCCTGTCCGCAAGAGAAAG--ACA----GTG----GCCA-------GGT-------------------------CCTCTCATCTCTGCTG-TGGAGACTGAAGCCTGGACACTCCTGTGCAC---CCTGGGGCCTTG--TGC---TTTTCTAATCAATGGGCAG--CAATTGTAATT-A----CAGGCTCGCA-G-CCCAGGGTGGGCATTAACTCCAG--GGTGGGGTGTTAGCT-CCCAGAGTGCCGTGTTGATTCCATAGTGAGGTGTTGACCCCCCGGATGGGATGTTGGCTTCCTGAATAGGGTGTTGGATCTCAGGGTAGAGTGTTGACTCCCAGGTG--AGATGTTGGCTCCAGGGTGGGGTGTTGACTCT----AGGGTAAGGTGTTAGCTCCAATGTAGGGTGTA---GGCTCCCGGAGTGGGGT---------GTTGGCTCCAATGTGAG---GTGTTGACTC---C-----AGGGTAGGGTGTTGGCTCCCAGTTTAGAGTGTTGTTTCCCAGGAGGGGCATTAACTCCCATAGTGGGGTTTTGACTCCAATGTTGGATGTTGGCTCTCAATGTGGGGTGAC----TGTGCCAGGTGTAGGTGCAAGTTGACCATGAAAG-----------------------------     
25 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-241601_241650      80.8%  30.4%    -------------------------------CTCA-CCAGCACCCGCTTTTGCTGCCTGCCTGGGGCTGAGCCATGTCCACCACCACCCCAGCCTCTG-----------GGGCAGCTCTGCGG-------------------TCGGTGGGCCCTTC----------------------------CACAGCGGTGGGGCTGTGCCAGGACCTGGGCAACAGGGTGAGG-----TAGGATGT---------------------GGGGTCCCAAGCAGCCCTTGGAGGTGGGGGC--------------------------AC-AAATGCGCCTCACTGGATC---GGGCACGAGGTACAGGCTCC--TGGGGCATGAAGGTCCC-------AACTCCAA-GTCCTGGCTGGAAATGCTCCGTG--GTAGGAGCTCCAGGAAA-----CCCTTTTGTGAAGATGCACCTTTTGTGAGGACGCTGGGCCTGTGGGCACACAGC-AGGCACCCGTGGTCCCTCTGGC---CATGTCCAGC---CAGATTGCCTAGGGGA---------AGCCCTGGGCAG------------------------CGAGAGA-----GACCCTGAGCCTGGGGCTGGCAGGTGTTGCTAAGTCCCAGGCCTGGCTCTGGAGAGGGTGGGGGACTGTTGCCCTGAATCCATGGCCTCAGACCCCAGACCCTGTGTGGCACAGACCTG-GTGGCCTTTCTTCACAGTGGTCAGG---CCAGCCCGAGA----------------TGGCCCTGGTCCCAA-AGCACCCAGCCTCCCTGCCCATCTCTGCAGGGCTCTGGAGCTGAAGGAAGGAAAATGTGACCTCAAGCCACTGTGGGGAGCTGCTGGCTCCAGTGTG-GGG---AGCTGCTGGCTCCAGTGTGGGGTGACTCCGTGGGGC-TCAGT--TGTAGGGTG-----------ACCTTGTATGGCACACA----------G-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TAGGGCAGGGATGGGTCGGATGAG-----------------CAGGAGCCCAGTGAGATGTCCTGTTGC----TCACAGAA-------ATGA---CGGGGACAGAGGTGGACGAGGGTGGATGGGCT-TGGGCTTCGGACTGATGAGG-------------------CGTGG----------------------------GTGGGCCTGCATGACCCCTGTGGAA---------------GCTGCAGGCGGCAGCGGGGGAGGGCTGTG----GATGGGAACCAGAGGCCTCGTGTTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCAGCAGGGAACCCTGGGCTTCGAGGAGTTCTGTGCCTTCT--------------     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                   .