Job

PLCH2_human-child_32

Submission Status: Success!

Full Status

1. Iteration

Blast

Select Sequences

Alignment

RNAcode

Input

CCACGGGAGGAGGCAAGGCTGGTCCCCAGTGGCAGGCTGGTGGCTGCTGCTGTCCATGGTGCCGAGCCGGCCCTGGTTCCTGCTCAGCTGAGGCACATCTGCAGGCCGAGGCGGGGCCCTGGGTACTCTCCTGTGGACCAGGACATTAAGCTGTCCTGAGAGGCATGGCCAGCGTGCAGGTGGCCCTTTGTAGCCTGCTTCCTCGACCCCACTCTGGGCTCCTCGCAGGCCCCCTTGGAGCCCCTGGGTGGGCTGCTGAGAGCACGCCGTCCTCAGCCTGTGTGGGCTCTGGGAAGAGGACCCAGCGGGGCTTGTCTGGAAGCCCAAATCACGAAGCCTCTAGACTACTGCTGTGGTGGATGCAGCACCTCCTCGACTTTTGGAGGTATTTCCTGCTTCTCAGGGCACCCAGTCTGGGGCTTCCGTGGAGGCCTGAGGACTCAGCCAGTGTAGGCGGACACCTGCTGGCTGGGTGTCGGTGTGGCCAGGCCTGGGGTGAGCAGGCGCAGGGCGGAACCCTGCCTTCAAGGCATATCTGATCAGCCCGTCCCATCTCTGGCCACATCCTCAGTGGGGGGCCAGGGCCGAAGTGACAGCAGGCGGCTCACTGGGAGCGTAGGACCCCTCAAGATGCTGAGCAGCTGGGCAGGTGTGAAACGAGCTGTCAGGGCTGCCCCTGCCTGAAATGTTGAACTCTGGAACTCTTTGAAGAGCAGGGCTAGGCACTGCGTCCCTTTGGGCCTGGTGTTCCTCGTGAGTAGGGGCTGAGCTGGGGTGTCACACTGGGGCCATGTCACCTCCAAGCAGGTCATGCTCTCACCCTGCCCTGCCCAGCCCTGGGCTCCCATACCCTTGTGAGGCAAAGTCCTCAATCCTTAGGGCTCAAGGATTTCAAGCATCCCCTTCCATGGGGACTTTATTGCTGCCATGGGATTCCCATGGCCCCTGTAGCACCTTGGGTTTCTGCTGGGATGCCCAGCCTCCAGCCCAGAGTGTGTTG

Selection Arguments

Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.

Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.

Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.

Results

Coding Regions.

High Scoring Segment plot

Distribution of HSS in the input sequence

HSS Segment Plot

Filter regions

p-val
Select the result by p-value. Show only results which have a lower p-value than provided. Must be above 0 and below 0.05. Check the box if you wish to see only the best segment in a group of multiple overlaping segments. Often a strong conservation signal can be observed as a shadow on the opposite strand.

Result Table

HSS id Strand Frame Length Start End Score P Show Result
1 0 - 3 8 15977 16000 7.556 0.011 Plot

Predicted protein sequence Download sequences as fasta

HSS id Sequence
1 0 AHPRPGHT

Alignment Info

Alignment Tree

Alignment Tree

Full Alignment

Reference sequence (1): Target
Identities normalised by aligned length.
Colored by: consensus/70%
                                                          cov    pid  1 [        .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         .         .         .         4         .         .         .         .         :         .         .         .         .         5         .         .         .         .         :         .         .         .         .         6         .         .         .         .         :         .         .         .         .         7         .         .         .         .         :         .         .         .         .         8         .         .         .         .         :         .         .         .         .         9         .         .         .         .         :         .         .         .         .         0         .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         .         .    ] 1385
 1 Target                                              100.0% 100.0%    ------------------------------------------------------------------------------------------------CCA------------CGGGAGGAGGCAAGGCTGGTCCCCAGTGGCAGGCTGGTGGCTGCTGCTGTCCATGGTGCCGAGCCGGCCCTGGTTCCTGCTCAGCTGAGGCACATCTGCAGGCCGAGGCGGGGCCCTGGGTACTCT--CCT---GTGGACCAGGACATTAAGCTGTCCTGAGAGGCATGGCCAGCGTGCAGGTGGCC-CTTTGTAGCCTGCTTCCTCG---AC-CCCACTCTGGGCTCCTCGCAGGCCCCCTTGGAGCC------CCT--GGGTGGGCTGCTGAGAGCACGCCGTCCTCA---GCCTGTGT-----GGGCTCTGGGAAGAGGACCCAGC--GGGGCTTGTCTGGAAGCCCAAATCACGAAGCC----------TCTAGACTACTGCTGTGGTGGATGCAGCACCTCCTCGACTTTTGGAGGTATTTCCTGCTTCTCAGGGCACCCAGTCTGGGGC--TTCCGTGGAGGCCTGAGGACTCAGCCAGTGTAGGCGGACACCTGCTGGCTGGGTGTCGGTGTGGCCAGGCCTGGGGTGAGCAGGCGCAGGGCGGAACCCTGCCTTCAAGGCATATCTGATCAGCCCGTCCCATCTCTGGC-----CACATCCTC----------------------------------------------A-GTGGGGGGCC-AGGGCCGAAGTGACAGCAGG---CGGCTCACTGGGAGCGTAGGACCCCTCAAGAT-GC------------------------TGAGCAGCTGG-GCAGGTGTGAAACGAGCTGTCAGG--G-CTGCCCCTGCCTGAAATGTTGAACTCTGGAACTCTTTGAAGAGC-------A-------G----------------GGCTAGGCACTGCGTCCCTTTGGG-----------------------------------CCTGGTGTTCCTCGTGAGTA-----GGGGCTGAGCTGGGGT------GTCA-----C-ACT--------GGGG-CCATGTC----ACCTCCAAGCAGGTCATGCTCTCACCCTGCCC-----TGCCCAGCCCTGGGCTCCCATACCCTTGTGAGGCAAAGTCCTCAATCCTTAGGGC-----------TCAAGGATTTCAAGCATCCCCTTCCATGGGGAC-TTTATTGCTGCCATGGGATTCCCATGGCCCCTGTAGCACCTTGGGTTTCTGCTGGGATGCCCAG--CCTCCAGC-------------CCAGAGTGTGTTG-------------------------     
 2 Cercocebus_atys-NW_012001716.1-207388_208335         95.1%  82.1%    ----------------------------------------------------------------------ACCCCTGGCCACCACAGATCGTGGCCCC---------------AGGAGGAGGCAAGGCTGTTCCCCAGCGCAGGCTGGTGGCTGCTGCTGTCCATGGTGCTGAGCTGGCCCTGGTCCCTGTTCAGCTGAGGCACGTCTGGAGGCCGAGGCAGGGCCCTGGGCACTCT------------------CCATTGAGCTGTCCTGAGAAGCGTGGCCAGCGTGCAGGTAGCC-CTTTGTGGCCTGCTCCCTCG---AC-CGCACTCTGAGCTCCTTGCAGGCCCCCTTGGAGCC------CCC--GGGTGGGCTGCTGAGAGCACGCCGTCCTGA---GCCTGTGT-----GGGCTCTGGGAAGAGGACCTGGT--GGGGCTTCTCTGAAAGCCCGAATCACGAAGCC----------TCTAGGCTACCACTGTGGCGGATGCAGCACCTCCTCGACTTTTGGAGGCATTTGCTGATCTCAGGGT----------------------------------GACTCAGCCAGTGTAGGTGGACACCTGCCGGCTGGGTGTTGGTGTGGCCAGGCCTGGGGTGAGCAGGCACAGGGCAGAACCCTGCCTTCAAGGTACATCTGATCAGTCCATCCCATCTCTGGC-----CACATCCTC----------------------------------------------A-GTGGGGGGCC-AGGGCCGAAGTGACAGCAGG---CGGCTCACTGGGAGCCTAGGAC-CCTCAAGAT-GC------------------------TGGGCAGCTGG-GCATGTGTGAAACGAGCTGTCGGG--G-CTGCCCCTGCCTGAAATGTTGAGCTCTGGAACTCGTTGAAGAGC-------A-------G----------------AGCTAGGCACTGCGTCCCTTCGGG-----------------------------------TCTGGTGTTCCTCGTGAGTG-----GCGACTGAGCTGGGGT------GTCA-----C-ACT--------GGGG-CCGTGTC----ACCTCCAAGTAGGTCATGCTCTCACTCTGCCC-----TGCCCAGCCCTGGGCTCCCATACCCTTGTGAGGCAAAGGCCTCAATCCTTAGGGC-----------TCAGGGATTTCAAGCATCCCCTTCCATGGGGAC-TTTATTGCCGCCATGGGATTCCCACGGCCCCTGTATCACCTTGGGCTTCTGCTGGGCTGCCCGG--CCTCCAGC-------------CCAGGGGATGTTGTTG-ACCCCCATGTGGGTGGCATT-     
 3 Mandrillus_leucophaeus-NW_012103199.1-207368_208242  98.5%  78.2%    ---------------------------------------------------------------------------------------ATGGTGGCCCCA------------GGAGGAGGCAAGGCTGTTGTTCCCCAGCGCAGGCTGGTGGCTGCTGCTGTCCATGGTGCTGAGCTGGCCCTGGTCCCTGTTCAGCTGAGGCACGTCTGGAGGCCGAGGCAGGGCCCTGGGCACTCT------------------CCATTGAGCTGTCCTGAGAAGCGTGGCCAGCGTGCAGGTAGCC-CTTTGTGGCCTGCTCCCTCG---AC-CGCACTCTGGGCTCCTTGCAGGCCCCCTTGGAGCC------CCC--GGGTGGGCTGCTGAGAGCACGCCGTCCTGA---GCCTGTGT-----GGGCTCTGGGAAGAGGACCTGGT--GGGGCTTGTCTGAAAGCCCGAATCACGAAGCC----------TCTAGGCTACCACTGTGGCGGATGCAGCACCTCCTCGACTTTTGGAGGCATTTCCTGATCTCAGGGTACCCA-GTCTGGGCC--TTCCGTGGAGGCCCGAGGACTCAGCCAGTGTAGGTGGACACCTGCCGGCTGGGTGTTGGTGTGGCCAGGCCTGGGGTGAGCAGGCACAGGGCAGAACCCTGCCTTCAAGGTACATCTGATCAGTCCATCCCATCTCTGGC-----CACATCCTC----------------------------------------------A-GTGGGGGGCC-AGGGCCGAAGTGACAGCAGG---CAGCTCACCGGGAGCCTAGGAC-CCTCAAGAT-GC------------------------TGGGCAGCTGG-GCATGTGTGAAATGAGCTGTCGGG--G-CTGCCCCTGCCTGAAATGTTGAGCTCTGGAACTCGTTGAAGAGC-------A-------G----------------AGCTAGGCACTGCGTCCCTTCGGG-----------------------------------CCTGGTGTTCCTCGTGAGTG-----GCGACTGAGCTGGGGT------GTCA-----C-ACT--------GGGG-CCGTGTC----ACCTCCAAGTAGGTCATGCTCTCACTCTGCCC-----TGCCCAGCCCTGGGCTCCCATACCCTTGTGAGGCAAAGGCCTCAATCCTTAGGGC-----------TCAGGGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNN-------------NNNNNNNNNNNNNNNN-N-----NN-------------     
 4 Cebus_imitator-NW_016107460.1-183455_184429          95.5%  73.1%    --------------------------------------------------------------------------------------GATCAT---------------------GGCCATGGGAGGCAAGGTTGGTCCCAGGTGGCTGGTGGCTGCTGCTGTCCATGGTGCTGAGCTGGTGCCAGTCCCTGCTCAGCTGAGGCACATCCCCAGGCTCAGGCGGTGCCC---------T--CCT---GTGGACTAGGACATGGGGCTG-------------------------CCCTGAG-AGGCACAGCCTGCTCCCTCA---AC-CCTGCTCTGGGCTCCTCCCAGGCCCCCTTGGAGTC------CCT--GGGTGGGCTGCTGAGAGCACGCTGTCCTCA---GCCTATGG-----GGACTCTGGGAAGAGGGCCCGGT-GGGGTTTTGCATGGGAGCCTGAATCATGAAGCC----------TCTAGGCTGCTGCTGTGGCGGACACAGCACCTTCTCGACTTCTGGAGGTATTTTCTGCTTCTCAGGAGACCCGGTCTGGGAC--TTCTATGGGGGCCTGAGGACTCAGCCAGTGTGGGTGGACACCTGTCAGCTGGGTGTCAGTGTGCCCAGCCTGGGGTGAACA--GGCACAGGCAGAACCCTGCCTTCAAGGCAAGTCTGATTAGCCTGCCTCGCCTCTGGC-----CATGTCGTC----------------------------------------------A-GCGGAGGGGCTAGGGCCGAGGTGACAGAAGG---TGGCTCACGGGGAGCCTGGGGCCCCTCAAGAT-GCCTCTCGA------------GATGCCGAGCAGCTGG-GCAGGTGTGAAACCGTCTGTCAGG--G--TGGCCCTGCCTGAAGCCTTGAGCTCTGCCATTCTTCCAAGTGC-------A-------G----------------GGTGAGGCACTGGGGTTCCTCGTGAGTGGGG-----------GCT--GAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTCGTGAGTG-----GGGGCTGAGCTGGGGT------GTCA-----C-ACT--------GGGG-CCATGTC----ACCTCCAAGCAGGTCACGCTCTGACCCTGCCC-----TGCCCAGCTCTGGGCTCCCATGCCCTTGTAGGACCAAGGCCTCAATACTTAGGGC-----------TCAAGGATTTCAAGCATCCTCTTCCATGGTGC--CTTTATTGCCACCATGAATTCCCTCGGCCCCTGCACA-CCTTGGGCTTCTGTTGCGCTGCCCGG---CTCCAGC-------------CCAGGGGATGCGGTTA-A--------------------     
 5 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-108955_109731         94.8%  63.6%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAGATGGGAGGCAAGGTTGGTCCCAGGCGGCTGGTGGCTGCTGCTGTCCATGGTGCTGAGCTGGTGCCAGTCCCTGCTCAGCTGAGGCACATCCCCAGGCTCAGGCAGTGCTC---------T--CCT---GTGGACTAGGACATGGGGCTG-------------------------CCCTGAG-AGGCGTGGCCTGCTCCCTCG---AC-CCTGCTCTGGGCTCCTCCCAGGCCCCCTTGGAGCC------CCT--GGGTGGGCTGCTGAGAGCATGCTGTTCTCA---GCCTATGT-----GGGCTCTGGGAAGAGGGCCCGGT--GGGGTTTGCCTGGGAGCCTGAATCATGAAGCC----------TCTAGGCTGCTTATGTGGTGGATGCAGCACCTCCTCGACTTCTGGAGGTATTTTCTGCTTCTCAGGGGACCTGGTCTGGGAC--TTCTGTGGGGGCCTAAGGACTCAGCCAGTGTGGGTGAACACCTGCCAGCCGGGTGTCGGTGTGCCCAGCCTGGGGTGAACA--GGCACAGGCAGAACCCTGCCTTCAAGGCAAATCTGATTAGCCTGCCTCGCCTCTGGC-----CACATCATC----------------------------------------------A-GCGGAGGGGCTGGGGCCGAGGTGACAGCAGG---TGGCTCAAGGGGAGCCTGGGGCCCCTCAAGAT-GCCCCTCAAGATGCCCCTCGAGATGCCGAGCAGCTGG-GCAGGTGTGAAACCATCTGTCAGG--G--TGGCCCTGCCCAAAGTCTTGAGCTCTGGCATTCCTCCAAGTGC-------A-------G----------------GGCGAGGCACTGGTGTTCCTCATGGTTGGGG-----------GCT--GAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTCGTGGTGG-----GGGGCTGAGCTGGGGT------GTCC-----T-GGT--------GTTC-CTTGTGA----GTGAGGGCTGAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTT-GTGAGTGAGGGCTGAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTTGTGAGTGAGGGCTGAG--C-----------TGGGGTGTCACACTGGGGCCATGTCAC-------CTCCAAGCAGGTCATGCTCTCAGCCCTGCCCTGCCCAGCCCTGGGCTCCCATGCCCTTGCTAGG---ACCAAGG-------------CCAGTACTTAGGGCT-----------------------     
 6 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-187697_188422     93.5%  59.2%    --------------------------------------------------------------------CCATCCCCGGCCACACCAGATCAT---------------------GGCCATGGGAGGCCAGGTTGGTCCCAGGCAGCTGGTGGCTGCTGCTGTCCATGGTGCTGAGCGGGTGCCAGTCCCTGCTCAGCTGAGGCACATCCCCAGGCTCGGGCGGTGCCC---------T--CCT---GTGAACTAGGACATGGGTCTG-------------------------CCCTGAG-AGGCACGGCCTGCTCCCTCA---AC-CCTGCCCTGGGCTCCTCCCAGGACCTCTTGGAGTC------CCC--AGGTGGGCTGCTGAGAGCACGCTGTCCTCA---GCCTATGT-----GGGCTCTGGGAAGAGGGCCCAGGTGGGGTTTTGCCTGGGAGCCTGAATCATGAAGCC----------TCTAGGCTGCTGCTGTGC-GGACGCAGTGCCTTCTCGACTTCTGGAGGTATTGTCTGCTTCTCAGGGGACCTGGTCTAGGCC--TTCTGTGGGGGCCGGAGGACTCACCCAGTGTGGGTGGACACCTGCCAGCCCGGTGTCGGTGTGCCTAGCCCGGGGTGAACA--AGCACAGACGGAACCCTGCCTTCAAGGCAAATCTGATTAGCCTGCCTCGCCTCTGGC-----CACGTCATC----------------------------------------------A-GCAGAGGGGCTAGGACCGAGGTGAGAGCAGG---CAGCTCACGGGGAGCCTGGGGCCCCTCGAGAT-GCCCCTTGAGATGC------------CGAGCAGCTGG-G--CAGGTGAAACCATCTGTCAGG--G--TGGTCCTGCCTGAAGCCTTGAGCTCTGGCATTTCTCCAAGTGC-------A-------G----------------GGTGAGGCACTGGTGTTCCTCGTGAGTCGGG-----------GCT--GAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTCGTGGTGG-----AGGC-TGAGCTGGGGT------GTCC-----T-GGT--------GTTC-CTCGTG-----GTGAAGGCTGAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTC-GTGG-TGAAGGCTGAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTCGTGGTGGAGGCT-GAG--C-----------TGGGGTGTCCTGGTGTTCCTCGTGGTGGAGGCT-GAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTCGTGGTGGGGGCTGAGCTGGGGTGTCCTGGTGTTCCTCGT---GGTGGAG---------------------------------------------------     
 7 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-176803_177310   81.3%  34.2%    TGGGGACAGGGAAGCAGGGGGTTGTGGCCACATTGCTCTTGAGAGTCTCCTGGCTCAGAGGGG---------ACCTGGCACCACCAGC---------CC---AGACCGTTGCCACGTGGGGAGTCGCTCCCG-TGGCTGGCAGGCCAGAGTGTGCTGCTGTCCATGGTGCTGGCCCAGCGTCTGCCCT-----------------------------GC------TCTGGGCCCTCC--CCT---GT---------------GGTGTCCTGAGAGGTGTGACTAGCTTGGGGGACAGCCCCGTGGCCTGT------------------------------TCCCAGCCTCCCTGGGAGGC------ACT--GGGTGGGCTGCTCAGAGCACCCCT-----A---AGCCCACA-----GGT-GATGGGAGCAGGACCCCAGTGAG-GTTCATCCGAGACCCCCAGTCATGGAGTGCCCAGGCGCCCCCATGCTGTGGGTGTGGCGGGTGGGGCCACCCCTA-CT-TCTAGGAAGTGCTTGTACTTCTCAGGGGACAGAATCTGGAAC--TTCTGTGGAGGCCCAAGGACTGGGCCAGTATTTGGGGACATGTGCCAGCCATGCGTCTGTGTGTCCAGGTCTGGGGGTGGGTGGGGCATGGGACAGGACCCTGCCTTCAAGGCATGTGGGATCCAGCCTCTGGCCACATTGTCAGTGGAGGGTC----------------------------------------------AGGGCCAAGGTGGGTGGCTGACCCCCCCACCGG---TCCCCCAGCAGCCCTCTGTGACTCCGACCACC-TG---------------------------GGC--AGG-TG-----TGTGACGAGCTGTCAGG--G-CTGCCCCAGCCTGATGTATTGCGCT-CTGTTGCTCTGTGGAGTG-------T---GG--GG-TTGGGCGCTG----CCAGGC------------------ATTCCCG---GTGAGGGGCCT--GAGCTGGGGCGTCACGCCAGGGCCCC--AACA-----CTGCCAA----GGAGGCCATGTGGTCAC--CC-CACCCCACCGGGGTC-CCTCGCC----CTCGCTGGATAAAGCCCCAATC-TTTAGGCCT-C-AAGGGTTTCAAGCAGCCCCTTCTATGGGAGCCTTTCTTGGCCAT----TCCCAGGGACCCCCCGAGCCCTACAGCACCTCAGCTTGC-----------------------------------------------------ATCTGGGCAGCCTGGCCGCTAGCCAG--CCCAGTGC------------------G---CTCTTGACTC-------------------     
 8 Lemur_catta-NC_059130.1-175666_175968                82.8%  35.5%    -------------------------------------CTGGAGAGTCTCCTGGCTCAGAGGGG---------ACCTGGCAGCACCACCCCGGCCACCCA---GACCGTGGCCACGTGGGGAGAGTCTCTCCC-GGGCTGGCAGGCCAGCGTGTGCTGCTGTCCGTGGTGCTGGCCCAGCGTCTGCCCT-----------------------------GC------TCTGGGCCCTCC--CCT---GTGGGCGTGGGCAGTGAGCGGTCCTGAGAGGTGCGACTAGCTTGGGGGACAGCCCCGTGGCCTGT------------------------------TCCCAGCCTCCCTGGGAGAC------ACC---GGTGGGCTGCTCAGAGCACCTCTCC--TT---GGCCCGCA-----GGT-GACGGGAACAGGACCCCGGTGGG-GTTCATCTGAGAGCCCCGTTCACGGAGCGCCCAGGCGGCCCCCTGCTGTGGGTGTGGTGGGTGGGGGCCACCCCGACTTCCGGGAGGTGCCTTCCACTTCTCAGGGGACCGAATCTGGAGC--TTCCGTGGAGGCCCAGGGACTGGGCCAGTGTCTGGGGACACGTGCCAGCCATGCGTTTGTGTGTCCGGGTCTGGG-GTGGGCTGCGCATGGGAGCAGAGGCCTCGTGTTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCGCCAGGGC---ACCCTGGGCTT----------------------------------------------C--GAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATG---TCCACGCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCT-GA---------------------------CCT------AC-----AGCGACCACAAGGACCA--C-CTGAGCGTGGCCGACCTGCAGCGCT-TCCTGGAGGTGGAGCAGA-------AGGTGA--GGCCGCCGGGCTGGCCGCTGAGC------------------TTCAGCA---GAGACG--TGG--GGACGAGGCAGTCACAGCCGGCATCC--AGGA-----CCCCGTCGGCTGCGGCCCCCGTGTTCCA--GG-GAGCAGCCCG------------C----GTGGGTGGGAAAGGTTTGGGGC-TTCTC--CT-C-GGGGCCCGT----------GTCAGTCCTGGCCGTTGACGCCCCGAGG-CCCTGGGGACAGCCACGGCTCGACACGGCACCAGCTGCGGTAT-----------------------------------------CCAGCGTCCTGTGGACAGGGGTTCTGTGGCCCAG--CCACACGG------------------GCCTGGCTGGCCTCCCCCTGGTGCCCA------     
 9 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-174237_174455      83.1%  32.9%    --------------------------------------------------TGGCTCAGAGGGG---------ACTTGGCACCA-------------------AATGGTGGCCCCTATGAGGAAGGCTGTCCC-TTGCTGGCAGGCCAGCGCGTGCTGGTGTCCAAGGTGCTGGCCCAGTGTTTGTTCC-----------------------------TGATCTGGGCCCTCCCCTTT--CCA---CTGGATGAGGACAGTGAGCTGTCCTGAGAAGTGTGATTTGCTTGGAGGATGGCCCCTTGTGGCTTGCTCCCTGG---ACACCCCCTCAGGACTCCTCCCAGCCTCCTTCAGAGAC------ACC--AGGTGGCCTGCTCAGAGTGCACCCCTGCTC---AGCCTGTT-----GATGGGTAGGACAAGGACCCTGATGTG-GTTTGTCTAAGAGCCCTGTTCATGGAGCCCCTCAGGGGAGTGCTCT------------------------------------------------------------------------------------------------------------GAGGAGGCAGTGGCAGAGGAGGGGAGTGTGACTGAGGAGTGGGGGCCTGCTGCAGATGGGGACCAGAGGCCTTACATTGCAGGAAGCAGACACAGATGACCACCAGGGG---ACACTGGGCTT----------------------------------------------T--GAGGAGTTCTGCGCCTTCTACAAGATGATG---TCTACTCGTCGGGACCTCTACCTGCTCATGCT-GA---------------------------CCT------AC-----AGCAACCACAAGGACCA--C-CTGGATGCTGCTGACCTGCAGCGCT-TCCTAGGGGTGGAGCAGA-------AGGTGA--GGGGCCACTGGGGCTTCCTGGCCACACTGCTGGCCCTGACCTTTGGTG---GAGAGCATAGG--GACAAGACAAGGCACAGGTAGCATGCCAGGCC-----CCACATCAGCTTCAGTTCCCATATTCTA--GG-AAGCACCCCACAGGG-CTGTTAC----ATGGGGGAGGAGGT-TTCTGGT-TTCTCCTCC-A-AGGTCCTC----TGACCTGCTCAGTCCTCGTCATCGACACCCGTGGC--------ACCAGCTTCAGTGTTAAGCATCTTGAGATGAGGGTTCTGAGACCCTGCTTTCTCGCTATATCCCAGACACATGGGCCTCGCCATCCTCTTCCCCAGGGCTCTGGGCCACTG--CCACATCCATTCACCCTGTGTCCAGCACGTACCTCCATGCCTCCTGGTGCCCAGCAAGG     
10 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-141462_141636        86.0%  38.5%    ---------------------------------------------------GCCCTACCC----------AGCCCTGCCTAGCCCTGCCACG-GTCCC----TGGAGGGCGACCAGCCCAGTCAAGGGGGCCCAAGACCAGCAGGCCATGGGAGCTGCTGTCCATGGTGTTGACCTGGCATTTGTCACTGTTGGGCTATGGTGCCTCCATGGCTCGAGGA-GGGATCTGGGTGCTTT--CCT---GTGGGCCTGAATGTTG------------------------------GAGACAGCCGTTGTGGCCT---GCTCCC---ACTGCCACGCTGGGCTCCTCCCAGCCTCTGTTGGAGAC------CAC---GGCGGCCTGCTGAGCACACAGCTCTTCTG---CCTGCTGA-----GGGCTCTGGGAGGACAGTGG--------CTTCATCTGCAAAGAGGCCTCTG----------GGCAGCCCATGACTGCTGGGATGGCAGCCCAGGCATTTCTGGGAC-ATTCAACGGGCTTTTCCCACATCATGGGGGAT-GGCCCTGAT--CTGCTGTGTGGGCCAAGGACACAGCCAGTGTCTGTGGACATGAGCCGGCCAGACATCTGTGTGTCCAGGGCTAGGTGGATGGCGCATAGAGCAGAGCCTGCCTTCAAGGCACATCAGATGCAGCCTGTGCCACCTCTGAC-----TACACCATC----------------------------------------------CGTGGTGGGCAGGGTGGAGGTGGTGGCAGGC------TGCCCACCGGTCCCAGCAGCCTTCTGGGAGGCTGAGCCAGGGAGGTTGCTAGGAGTGCGA-GAC-CCGG-AGCTGTGTCCCTCCGCCAGGCACC--C--GAGAGCAAGCTGAGCTGTGTCACACTGGTGCCTGATGCCTCTC-------AGCAGCTTGTGTGCTCACCTGGTTGCAGGCTCCTGTGCCCTTTTTGGGCCCAAACC---CGGTCCTTAGG--GCTCAAGGGTGTCCGGCAGGCCCTTCCAAGGA-----GCCCATCCCCAGGGTT---------CC----C-ACT-------------------C----AC--------AGCCTTTGGCACCTCCGCATCC----TCTGGGAGGCCCGGCCTCCAGCCCAGTGGGACTCCAG---GGTAGGTGGTGTGGAC----TCCAGCATGGGCAGTGTAGAC--------T-----------CTATGTGGACAGTGTGGGCT----------CCA-----GTGTGGACTCCGGGCGGGGT-------------------------------------------------------------------     
11 Microcebus_murinus-NC_033661.1-174186_174458         84.7%  36.2%    --------------------------------------TGGAGAGTCTCCTGGCTCAGAGGGG---------ACCTGGCACAGCCACCCTGGCCACCCC---AGACCGTGGCCACAAGGGGAGTCTCTCCTG-TGGCCAACAGGGCGGCATGTGCCGCTGTCCATGGTGCTGGCCCAGCATCTGCCCT-----------------------------GC------TCTGGACCCTCC--CCT---GTGGACGTAGACAGTGAGCTGTCCTGACAGGTGTGACTAGCTTGGGGGACAGCCCTGTGGCCGGT------------------------------TCCCAGCTTCCCTGGGAGAC------ACC--AGGTGGGCTGCTCAGAGCACCCCTCC--TC---AGCCTGCA-----GGT-CATGGGAACAGGACTCCAGTGGG-TTCCATCCGAGAGCCCCATTCATGGAGCGGCCAGGTGGCCCCACACTATGGGTGTGGCACGTGGAGGCCATCCCTACTTCTAGGAGGTGCTTTCTGCCTCTCAGGGGACCAAATATGGAAC--TTCCACAGAAGCTCAAGGACTCGGCCAGTGTTTGGGGACACATGCCAGCCATGCATCTGTGTGTCCAGGTCTGGGGGTGGGCTGTGCATGGGACTGGAACCCTTGCATTGCAGGAAGCAGACACGGATGACCACCAGGGG---ACCCTGGGCTT----------------------------------------------C--GAGGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATG---TCCACGCGCCGGGACCTGTACCTGCTCATGCT-GA---------------------------CCT------AC-----AGCGACCACAAGGACCA--C-CTGGACGCCGCTGACCTGCAGCGCT-TCCTGGAGGTGGAGCAGA-------AGGTAG--GGCTGCACCGCTGGCCGCCCAGC------------------TTTGGTG---GAGGCCG-TGG--GGACAGGGCAGTCACAGCCAGCCTCT--GGGA-----CCCCGTGGGCTCAGTC-CCCGTGTTCCA--GG-GAGCAGCCCTTGGGG-CTGGCGC----ATGGGTGGGAAAGGTTTGCGGC-TTCTC--CT-C-CGGGGCGTC---TAGCCAGCTGAGTCCTGCCCGTTGATGCTCTGTGGCCCTGGGGCATGGCCACAGCTTGACGCGGCACCAACTGTGGTGC-----------------------------------------CCAGCGTCCTGTGGACAGGGGGTCTGTGGCCAAG--CCACATGG------------------GCGTGGC--------------------------     
12 Castor_canadensis-NW_017871110.1-171292_171481       88.5%  37.7%    --------------------------------------------------------------------------------------TCAGCC-ACTCCA---AGTTATGTGGCCCTGAGAGAGGCTATTCTATGACTGGTGCACCCAGCGACAGCTGCTGTCCATGGTGCTGGGCCTGCATCTGTCTCCTGAGCTGAGATAAGGCTCCGAGCCCTTCCCC-------------------------TAGGGCGTGAACACTGAGCTGTCCTGAGAGCATGCCGGCTTA----GAGGGCAGCCCTATGGCCTGCTCCCTAA---GTGCCCATTCTGGGCTCCTCCTGGCCTCTCTAGAAGAC-------CCCAGGGTGGGCTTCTGAGACCTTACCCTCTCC----TCCTCAGTCCACTGATGGCTCTGGAAAGAGAACCTCAGAGGGTTTCATCTGGGTGCCCATGCTTGGAGCCTCCTGGTGGCCCCAGGGCTGTGGTGTGGTAGATTTAGTGGCACTTCTACTTTGAGGAAGTGTCTTCTGCTTAATATGGACTGCACCTGA------AACATAGAGGCCTGAGGACTCAGCCAGTGTCTGTAG-TACCTGCTGGCCAAGCACCTGTGTGCCTGGACCTGGGGGTAACAGGCCACAAGATAGAACATGCCTT------CAAGGCACATGGTCAGTGGAGGGTCAGGA-------CTGAAGC----------------------------------------------AAGAGGCTGAGCCCTGGCTAAGCCATGTTCT-----GGGTCTCCTCAGCAGGGTTC---CATGGCAC----------------------------TGAGCACCTAG-ACAGGTGTGTTTTGAGCTGTCAGG--G-CCACCCCAGCCCAACTCATTGAATACTGCAGAGTCCACGCTGTC-AAGCTTTCCCTATGGAGGCTGATTCAGG-----TGCTAAGCTGGGGCCCTGTCACCTCCAAG-C-AGGTCCTGGTCTTGCCCTGCCCCACCCACTGGGCCCTCA--CAGG-----CTCCAAAGTCAGTCTTTAAGGTTTCA--------AG--------CAGC-CCCTTCC----ATAGGGGCCTTTCTGGCTCACTCCTAGGGACTTC-ATGGGCCACGACATGCCTCAGACTTCCTCTCTGTAGCCCACCTCCAGCTGTAGGTGC-------------CTTTGTCTCCAGGATTTGCCT-----------TTG------------------------------------GCCGGGGCATGGGGCTATGCAGC-----TCCCTGG----ACTTC---TAC------------------------------------     
13 Microtus_oregoni-NW_024543064.1-173642_173743        84.3%  26.3%    ---------------------------------------------------------CAAGGCTCAGGTCACTCTGATAATCAGTGTTAGGATGGTCTG--GATCTGTTTA--GTCAGAGCAGAGGCCTGTGAAGTGGATACAAT-GCTGTGACATAATTTCATTAAGTCTA-----AAATAAGATGGGAATGA--------GGGCCAGTGCACTGGTCCTCAGCTTTAATGGCCCA--AGAGTATCTTTGGGCTAACCAGGGCTCAACCCAGAAGAGG-----CTT-GGCAAAAGGTTCCTTT------------------CCATGCTGCCAGGGCTCCACTTGGGTTAAACAGTCAGT-----ATCAGACTGG--GTTCCTCCCATCTTTCCTAGGGAACCCTCTTCAGTC---------C-ATGAAT----------GGCCAGGGGAAAAGAAGCCCAAATGTGCAGAGCCTCCATGAGGCCCTACAACTGTGGTGTGGCAGATTTGGTGA--------------T-GCCGTTTGCCATGCCACAC-CGGACATATCTAGAAC--TCCTACAGAGGCCCGAGGAGTCAGCCAGTGTCGGCGGACAGCTGCTGACTGGCATCT-GTTTACCCAGATCTGGGATGACGAGTCACAGGATAGAACCTGACTTCAGGGCCCATGGTCAGTGGAGGACAAGAACTGAACCTTGGACAAGCTATG----------------------------------------------GCTGGGATCCTG-GCAACTCTGTGGTGGTTC-----TGAACCATTCGGGCCACCCCAGTCCTGTACTG-GG--------------------CACTG---------T-CCCCGGCACTGAGCCGTGGTCCCCTTGGGGTAAACTCCCTACAGGAAGTGTTTAC-------------------------------------------------------CCACAGGTCCTCGCAGAGCTAAAGC-C-CAGTCTTTA----GAACTCAA---------GCAGCCTCTTCTTGG------------------GCCAATCCTGAGCCC--CTGAGGACACTGTTAAGTCCACTTCAATCCCTGGCGTCCTTATTTTCTGAATCTTCCCCTG------GCCTG-----GGCCCGGGGTATGCACTGCCTCA--AACG-TCAGCATCCTAGGGA----------TTGGCACCCTTGGCAGATGCTTCTTATGGCTA-TGACAGATGGGAA-----GAAGTCGTGCTTCCTTGGGCCTCCAGTGGAATGGTTCCTGGGGGTA-----------T-------------CTT-------GTGAGC-CCCCCCCTCTTTCTTTCAA--     
14 Jaculus_jaculus-NC_059106.1-171990_172145            85.5%  32.0%    ------------------------------------------------------CTTCAG----------GGGACCCAGTACAATTCTGTGG-CCTCCA---AGTTGTGTGGCCATAGGAAAGGCTGTTCCCCAGGTGGTGCAGCCAGTGAGTACCACTGTCTTTGGTACTGGCCCTTGGTCTGTCCCTCTTCCTTGAAGTGGGATTCTGGGCCTTCCCC-------------------------TGTAG----------------------------------ATA----TGGACATGAATTGTGGCCTGTTCCCTCA---ATGCCCATTCTAAGCTCCTGTGGCAGCTTGGAG-ACAC-------CCTGGGGTGAGCTACTGACAGCCTACCCCTCCTG---AGCCCATGGCTAGCCTGGGGAAAAGAAGCCAGAGGCAGAGCGGTCTTCTCAGTGCCCCATGCATGGAGCCTCCATGTGGCCCTACAACTGTGGTATGACACATTAGGTGTCACCTCCACTTTTAGGAGGCATTTCCCACACACAGAGAAAGGAATCTGGAAC--TTCTGTAGAGGCCTGGGGACTCAGCTGGTATCTGTGGACACCTGCTGATCAGGCACCTGTGTGCCCTGGCTTGGGGGTGACTAAACGCAGGATCGAACCTGCCTTCTGGGACAAGACACATGGTCAGTGTAAGGTCAGGG-------CTGAATT----------------------------------------------CGGAGGCTGAGCTCTGGCTAAACCATGGCCT-----GAGTCCCCTGGCAGCCCTCT---TGTGGCTC----------------------------TGAGCCATCTG-G-------------------------G-TCACTCCAGCCCAAAACACCCAGCACTGCCACT-AGACGATGAA-TAG--CAACCGATCGGGCCAAATTCTCCACAGAGAATTCCAAGCTAGGATGTCACTTCCAAA-T-A-GGCGTAGGCTCACCCTACCTCATCTACCTGGCTGTCA--TGGA------GCCAAAGTCTAATATTTAGGGCTCA--------GT--------CAGC-CATTTCT----ACAGAGGCCTTTTCTGGGCCACCC--------TA-ATGGCCCTTGTCATAGCTCAGGCTTCCTTGACACACCCAACCTCTAGTCCTGGGTGC-------------CCTTGTCCTTTGGGTGGTGGT-----------GTG-------------CATTGCCTCAGACTTGATCATTCTCAGAGACTGGCACCTTAGCAGA-----TATACCC----TATGCCTGTGAA------------------------GGCAA------     
15 Cricetulus_griseus-NW_003616165.1-50119_50197        87.5%  30.8%    ---------------------------------------------------------------------------------------TATGGTGGTCTA--GAGCTGTTTA--GTCAGAGCAGAGACCTGTGAAGCAGACACAGTGGCTTTGGCATAATTTTATTAAAGCTG-----AGATAAGACTGGAATGT--------GGGTGAGCACACTGGTCCTCAGGTTCAATGGCCCA--AGAGTACCCTTGGGCTAACCAGGGCTTGACTCAGCAGAGG-----GCT-TGGCAAGAGGTGCTTTTGGTAGCTTCGTTCC---CCGGGCTGCCAGGGTTCCACTTGGGTTGAACAGTCAGA-----AACCCATTCTGGGTTTCTCCTGTCTCTCCTAGGGACTCCCTGGATGGC---------C-AGGGAGAAAGAAGCCAGTGGGCTAATGGGAGTGCCCAAATGAACAGAGCCTCTATGAGGCTCTACAACTTAGGTGTGACCGATTTGGTGA--------------CACTCATTTGCCATGCCACAG-ACGACATATCTCGAAC--TTCTATAGAGGCCTGAGGAGTCAGCCAATGTCTGTGGACAGCTGCTGACTGGCATCT-GTATGCCCAGGCCTGGGATGACAGCACACAGGATAGAACCTGATTTTAGGGCCCATGGTCAGTAGAGGATGAGAACTGAGCCTTGTATAAACTGTG----------------------------------------------GTCTGGGTCCTTGGAAGATCCTTGGTGGTTC-----TGAGCCATTTGGGCCACCCCAGTCCTGTATCC-AG--------------------GTACTGAGCACTGTC-ACTCAACAGTGAGCAGTGGTCCCCTTGGGATAAACTCTCTACAGTAAGTGCCAATGCAGGCACTT-CTGAGC-------AAGTGT-GGGCTCACCTAC------CCCACCCAGTAGGTCCTTTCAGAACTAAAGC-C-CGGTTTTTA----GAACTCAA---------GCAGCCTCCTCTGCA-----GAGCCATTCCTGGGCCACTCCTGAGACCCTTGGGGCCACTGTTAAAGCCCACTTCAGTCCCTGGTGTCCTTATTTTCTCAATCTCCCCCTG------GCCTG-----GGCTTAGGGTATGCACTGCCTCA--AACT-TTAGCGTCCTAGGCA----------ATGGCACCCTCGGTAGATGCTCCTTATGCCTG-TAAAGACTGGGAA-----GAGGTCATGC---------------------------------------------------------------------------------------------------     
16 Arvicanthis_niloticus-NC_047662.1-172658_172753      80.5%  24.3%    CACAGTAACCTCTATAGGCACTTGAAGCCCC-------AGGATGGAAATGTAGCTTTCTGGGAGGCTCAGCCCCCTCTGACCAGTATCAGAGTGGTCTG--GAATTGTGTA--ACTGGAGCAGGGACATATGTAGCAGATGCAGTGGCTTTAACATAATTTCATTAAATCTAAGATAAGATCGGAATGTGGGGC--------TGATCAGCACACTGGTCTTCAGGTTTAATGACCCA--AGAGCACCCTTGGGCCAATCAGGGCTCTACTCAGCAGGGA-----CTT-GGTGGCAGC-TGCTTTTGGTGTTTGCATTTCCCTTGCTGCTGTCTGGGCTTCACTTGTGTTAAACAGTCAGA-----TACCCATTCTGGCTTCCTCCTCTGTGAGGCCCTAC------------------------------------------------------------------------------------------AACTTAGTGTGACAGAGTTGGTGA--------------CACCCATTTGCAATGCTATAGAAGGACATAT---------CTAGATAGAGGCCTGAGGAGTCAGCCAGTGTCTGT-GACAGCTGCCAGCTGGCACCT-GTGTGCCCAGGCCTGGGATGACAAGGCACGGGATAGAACCTGACTTCTGCC--CTTGGTCAGTGAAGGATGAGAGCTGAGTCCTGTGTCATAGTGA----------------------------------------------GAAATCTGGAATTTTGGTTTCTTTAAAAA---------------AGAAAACACAGAAATCGTACAAGA-AT--------------------ATGCTTTTGTCTTAA-TCTCAGGTGTGGGATGTGGG---GCTGCTTCAC---------AGCCCCTGACTATGACTTACCTC-ATGCTC-------TAGCAG-GGATG-TGGTTT------TGCCAGAGGCAGATAGTTTCTGAAATTGTGT-G-AC--CTTTA----GAACTCTG---------GGGACTTTTCAG----------------------AGGGTGTGAAAATGC----TGGGCCCAGAGAGGCAGGGTCGG-GTGCTGCTGGTCACAGTTTGCTAAGCAGTCATAA------GCAAGAAAGAAGAAATTAGATATCATGGCGGCAAAGACCTAACTTGCCCCGAGGA----------ATGATAAACTCA---AACACCCCTAATCAGCAGAAAGTAGTTTAAC-----GATAACATTGCTCTCTTTCCAACCCTCGGCTTTATTCAGGGAT---------------------------------------------------CTCTTTCCTT-----     
17 Peromyscus_maniculatus-NC_056009.1-173765_173817     85.9%  27.0%    ---------------------------------------------------------------------CACTCTGATAATCAGTATTATGGTGGTCTG--GAACTGTTTA--ATTGGAGCAGAGACCTGTGAAGTGGATACAGTGGCTTTGACAACAT-----TAAATCTA-----AGATAAGATTGGAATGT--------GGATCAGCACACTGGTCCTAAGGTTTAACGGCCCA--AGATTACCCTTGGGCTAACCAGGGCTCAGCTCAGCAGAGG-----GCT-TGGCCAGA--GGCTTTTGGTAGCTTCTTTTC---CCATGCTGCCAGGGCTCCACTTGGGTTAAACAGTCAGA-----TGCCCATTCCGGTTC-CTCCTGTCTTTCCTAGGGACCCTCTTTTGTCC---------ATGGATGGCCAGGGGAGAAGAAGCCAGTGGGTTAATATGAGTGCACAGAGCCTCCATGAGGCCCTACAACTTTGGTGTGACAGATTTGGT-------------------------GACATGCCACAG-AGGACATATCTAGAAC--TTCTGTAGAGGCCTGAGGAGTCAGCCAATGTCTGTGGACAGCTGCTGACTGGCATCT-GTATGCCTGGGTCTGGGAGAGCA--AGACAGGATAAAACCTAACTTTAGGGCCCATGGTCAGTGGAGGATGAGAACTGAGCCTTGGGTAAGCTGTG----------------------------------------------GCCTAGGTCCTTGGCAGCTCTATCGTGGTTC-----TGAGCCATTTGGGCCACCCCAGTCTTGTATCC-AA--------------------GTACTGAGCACTGTC-ACTCAACAGTGAGCAGTGGTCCCTTGGGATAAA-----CTACACTAAGTGACAACACAGGCACTT-CCAAGA-------AAGTGT-GGGCTCACCCAC------CCCACCCAGCAGGTCCTTGCAGAACTAAAGC-C-CAGTCTTTA----CAACTCAA---------GCAACTTCTTCCTGG------------------GTCACTCCTGAGACCC-TTGGGGCCACTGTTAAGCCCACTTCAATCCCTGGTGTCCTTAGTTTCTGAATCTTCCCGTG------GCCTG-----GGCCTGGGGTATGCACTGCCTCA--AACT-TTAGCATCCTAGGGA----------ATGGCAGATGT----------------GTCTG-TAAAGGTTGGGAA-----GAGGTCATGCTTCCTTGGGCACCCTGTGGAATGGGTCCTGGGGGTA-----------T-------------C-------------------------------------     
18 Meriones_unguiculatus-NW_018657773.1-173805_173882   87.6%  30.9%    ----------------------------------------------------------------------------------------------AAACC--TAACCCTTAA--CCTAACCCTA--ACACTTACCCTAACCCTAACCCAACACTAAACCTAACCCTAAAACTA-----ACACTGGAATGTGGGGC--------TGGTCAGCACACTGGTCCTCAGGCTTAATGGCC-C--AATGTACCCTTGGGCTAATCAGGGTTCAACTTGGCAGAGG-----GCT-CTGTGAAAGCTGCTTTTGGTGGCTGCATTTC---CCTTGCTGCCAGGGCTCCATCTGGCTA-AACAGTCAGA-----TACCCATTCTGGATTCCTCTGGTCTTCCCTAGAGACCTTGCTCCAGCCCATGGATCGCCAGGGAAAGAGAAGCCAGAGGGTTAATATGAGTGCCCAAATGCACAGAGCCTCCATGAGGTCCTGCAACTTTGGTGTGACAGATTTGGTGA--------------CACTCCTTTGCCATGCCACAGAAAGACATATCTAGAAT--TTCTGAGGAGGCCCGAGGAGTCAGCCAGTGTCTGTGCACAGCTGCTGACTGGCACCT-GTATGCCCAGGTCTGGGATGATA--AGACAGGACAGAACCTGACTCTAGGGCCCGTGGTCAGTGGAGGATGAGAGCTGAGTCTTTGGAAACAGTGG----------------------------------------------CCCGGGTGGCTTGTTAGCCCAATGGTGCTTC-----TGAGTCATCTGGGCCACTCCAGCTCTGCATCC-AA--------------------GGACTGAGCACTGTC-ACTCAACAGTGAGCAGCAGTTCCCTGGGATAAGCCCTC-TACAGTAAATGCCGATGGTGGGCCGT-T-------------ACCTC-CAAGCAAGCCAC------CTCACCTAGCAGGTCCTTGCAGAGCTGAAGT-C-CAGTCTTTA----GAGCTTGTAGAGCTGAAGCACCCCTGTCCCCA-----GAGTCCTGCCTGGGCCACTCCTGAGACC--TCGGGGCCACCGGGAAGCCCATTTCAACTCCTGAGACCCTTATTTTGGAGTCCTCCC---C------AGCAA-----GGGCCTGGGGTGTGCATGCCTCA--CACA-CTGGCATCCTAGGGA----------AAGGCGCTCTTGGGAGATGCTCCTTATGCCTG-TAGAGGGCGGAAG-----ACGTCCGCAGGGCTC----------------------------------------------------------------------------------------------     
19 Urocitellus_parryii-NW_020540697.1-280625_280740     84.3%  32.1%    -----------------------------------------CGAGTRTCCTGGCATGGAGGGCTCCTCGGGGACCTGGCCTCATCTCCTGGCCACACTAGGCTGAATGGCCACACAGGGAAAGGCCGTCCTGTGGCTGGCAAACCCAGCATGTGCAGCCGTCCATGGTGATGGGCCTGCCTCCCTTCT-----------------------------GGCCCC-------------A--CCT---GTGGACATGG------------------------TCATCGCCTGGGGGATGGC-GCCTGTGGTCTGCTCCCTCA---GT-GCCCACATGGGCTCCTCCTGGCCTCCCTGAGAGCC-------CT--GGATGGGCTACTGAGAACCTAAACCCCCTC---AGCCCACT-----GATGGCTCTGGGCAGGGGACCCTGGGC-TG---TCTGAG--TGCCTGCCCAGGAAGCCTCAGGTGG-CCACAGCTGTGGAGGGGC--------AGACTCAGTGCACTTCCMTCCAGGCTGTCCACTTCACAGAGGGCTGGACCTGGACG--TTTTGTGCAGGCCCAAGGATTCCGAGGACCTCTGGATGCTGCT---GGTCAGGCACCTGTGTGCCCAGGCCTGGGGTGCCAGGGCCCAGGACAGAGCCTGCCT----TTGGGCAGATGGTC---AGTGGAGGGCCAGGAT-TGAGGCAGGAGGC----------------------------------------------TGAGCYGTGTCCTGGGCCCC--CAGACGTCC-----TGTGCTGCTGAGCACCTAGGCAGGCACGTGTC-CA---------------------------GCCCAGGG-CCACCCCAGCCCAGGCCATGGACA----CTGCCACTCTGTGAAGTGCAGGGTCCCTCTGGCCAAGCACTCTT-------TGGTGA--GAGGGCTGGTCTG----GGTGCCACACCAGGGCCCCTCACCTCCAGGC---CAGTAG--TGG--GC--TTGATCTGCCCACCCACCCC------------------------------ACCCTGGTCAC--CC-AGGCTTTGCAGGGCC-CCAATTC----CTAGGGAACGAAGGCCTCAATTCGCCTCTTCC-A-CTGTGGCCTTTCTGGCCYTCCC-AGGGACCCCGTGGAC-CCTGTGGTGCCTTAGGCCTCCTCTGGGCAGCCCAGCTTTCCACGAGGGGGTGCCCTGGTGCTCCKGTCTGCCCT---------------GGGCTGA-----CCCTTGCAGGGGCAGGTGCTCCCCAC--GCCTGTGG---------------A------------------------G----------     
20 Grammomys_surdaster-NW_021620991.1-173219_173307     86.1%  27.2%    -----------------------------------------------------------------------------------GTTTCAGGGTGGTCTG--GAACTGTGTA--ACTGGAGCAG---AGACTGTAGCAGATGCAGTGGCTTTAATATAATTTCATTAAATCTAAGATAAGAACGGAATGTGGGGC--------TGGTCAGCACACTGGTCTTCAGGTTTAATGACCCA--AGAGCACCCTTGGGCCAATCAGGGCTCAACTCAGCAGGGG-----CTT-GGTGGCAGC-TGCTTTTGGTGTTTGCATTTTCCTTGCTG---TCTGGGCTCCACTTGGGCTAAACAGTCAGA-----TGCCCATTCTGGCTTCCTCCTGTCTTCCCTAGGGACCCTGTTCAGCCC-ACGGATGGTCAGGGAGAGAGAAGCCAGTGGGTTAATATTAG--TGCCCAAATGCAGAGCCTCCGTGATGCCCTACAACTTTGGTGTGACAGAGTTGGTGA--------------CACCCATTTGCCGTG-----CTATCTAGAAT---------GTCTATAGAGGCCTGAGGAGTCAGCCAGTGTCTGT-GACAGCTGCCAACTGGCACCT-GTGTGCCCAGGTCTGGGATGACAAGGCACGGGATAGAACCTGACCTTTGCC--CTTGGTCAGTGAAGGATGAGAGCCGAGTCCTGTGTCGTAGTGA----------------------------------------------GAAGTATGGAATTTTGGTTTCTTATTGAA------------------AAACACAGAAATCGTACGAGA-AT--------------------ATGTTTTTGTTTTAA-TCTCAGGTGTGGGATACGGGGCTGCTGCTTCAC---------AGCCGCTGACTATGATTTGCCTC-ACGCTC-------TAGCAG-GGACG-TGGTTT------TGCCAGGGGCAGATAGTTTCTGAAATTGTGT-G-AC--CTTTA----GAATTCTG---------GGGACTTTTGAG----------------------AGGGTATTAAAAAAATGCTAGGGCCCAGAGAAGCATGGTTGG-TTGCTGTTGGTCACAGTTTGCTAAGCCGTCGTAC------TTGAAAAAGAAGAAATTAGATATCATGATGGCAAAGATCTAACTTACCCTGAGGA----------ACGATAAACTGA---AACACCCCTAATCAGCAGAAAGAAGTTTAAC-----GATAACATTGCTCTT--CCCAACCCTCGACTTTATTCAGGGAT---------------------------------------------------CTCTTTCCT------     
21 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-187178_187270        90.3%  33.7%    -----------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTGACCATATGAGAAAAGGCTATTCCATGGGGCAGGGTCGCATGTGCTGCTGTCCATGGTGCTGACCCGCACCTGTTCCTGTGGGCTGAGTGG-CCTTGCAGGGCTTGTGGTAGGGCTCTAGGCTCTCA--TCT----------------------------GTGGACATGGAGCAGCCTGGAGGTGGC--CCCCATGGCCCGTTCCCTGC---CTGCCCTCTCTGGGCTCTTACTGGCCTCTCTTTGGAGA------TGCAGGGGCAGGCTTCTGAGAGACTGAGAGCCTCA----TTTTGCT-----GATGGCTCTGAACAGAGGACCCAGTGAGGTTTGTCTGAG-CACCCATTCACAGAGCC----------TCCATGACTGCTGGGTGGCAGATAGACTGGCACCTCTACTTTTGAGTGAATCCGGACTTTCTGTGAGACCTGAAGACTTAGCCTAAGTACCCTGCCTTCAAGGTGCATTAGCTCTGTCTGGCCACTGCATCAGTCTATTTGTGTGTGACAGAATGCCACAGACGGGGTGATTTATAAGGAAGGGAAGTTTATTCCTTGCAATTCTGGAGGCTGAAAATCTGAGA-TCAAGATGCCAAC-------------------------------------------------CCCTGGCTTTCTTGCTGCATCGTCCTGTGG---CAGAGGTGGAAAGGCA-AGAGAGGGTCAGAAT-GA-GACACAGAGG---------GGGCCAAGCTCACTG-T-----TATAACGACCCACTCACACTAACAAACCCACC-CCAATGATTACAGTATTAACCCATTTGTGAAGG---------------CAGAACCCTCATGG---CCCAATCCTCTCTTAATGATCCCAACTCTGG----ATACTTTT----GCAGTGAC------GACTGAATTTCA--ATGC-----GAGTTTTAGAGGGAAGGTTCATACCAT----A-GCACCTGCCTCCAGC-CACATCA-TCAGTGTAGGGTCAAGG-CTGAGCCCTGGCC---------GAGCTACAGCTCAGCCCGCAGCTGGGTCCCTTCAACAAGTGGGGC-TG-AGCTGG----------AGGGCTGAGCTGTAGCTGTGGCTTCCACACAGGTCATG-------------TGCTCACCTTGTCTC-------ACCTCTTCCTGTCTCAGGCTCCC-------------------------------------------------TTGTTCTC-------     
22 Fukomys_damarensis-NW_022900935.1-176922_177032      81.4%  28.0%    -------------------------------------CAGGCCAGGCCTCTGCCCTGAGG---------------------------CCCTG-----T------------------GGTTGAGG-ATGTGCCCTGGAAGTTCT---GCTGGCACGTCCTGTGGACACTGCAGATTGTAGCCACGTAGGGAA------------------GGGGCTGATGCGTGGCTGTCATGTCCAGCAGGTGACACTGTCTCTGGCATTGGCTTGTCTCCATCCC--------TCTTGGTTGTGGC--AGCTCTGGGCCATCCTGCTCCCCAGCACCAAGCTGGGCTCTTCCTGGCCTCCCTGGGAGGC------CCC--GCAGTGGCTGCTGAAAGCCTGTTGCTCCTG---------------------------------------------------------------------------------------AGGCCCTGCTGTGGGGCTGGGAAGAGGACCTCAGGTTCTGAGAACCATTTTCCATTTTGTGGGCATGGAAA-CA---G--CAGTACTGTGGACTGAGGACTCAGGCAGTGTCTGGACTACA-----------------------CCTGGGTGGGGGGGACAAGACAGGAGACAGGACCTGCCCTTAAGGTGTGGGGTCAGTAGAGTGTGAAGTCTGGGGTGGGAAGCTGAGCTTCACTAAGCTACAGTAGGGTCCCCAGCAGCCCTGCAAGGCCCTGAGCCCCAGGCAGGTGTGTCCAGCGGTCAGGGTCTTG---GCCCATGTCCTGAGAAGTGCCATTCTGCAAGG-TG---CAGG-GCCCCCGTTGGGGTGCCAAGCCAGAAGCCCAATTCTGCAGTCAGGTGTT-----G-ATGACCCTGTCCCACGCAGCCAGCCCTGGCCTGCCTCCCTCATTGGGGCTCACAGGC--TGCTCTGACCATGC---CCAGAGACCTAGGTCCTTGGACTGCCCACCT-C-CAGCCATGGGT--GCCCTGTG---CCCCAGCTATCCCAGAGCTGGGACCTCTGCATCCTCAGGGGGTGGGATGGCAGC---A-CATTCCCCCT-ACGCCCAGGAGG----AGGGAGGAGCCTGTGTTCTCAGGTCTCCCTGC---TGGGGCAGCTTCTTGAGTCCCTGGTGAATGAGGGAGCC-----------CCTGAGAG-----------TTCCTGGGGCTGCCCGTGGGCCTTCTCTG-----CAAAATGAGGG-----CAGTGGCCTTGACCCCTC----AACCTGCAGGGGTACCTGAG-------------------------------------------------------------------     
23 Molossus_molossus-NW_023425372.1-173863_173899       88.0%  33.4%    -----------------------------------------------------------------------------------------------------------GTGGCCACAGGAGGCACTAGCCAGATGGCCTGCAAGGCTGGTGGACACTGCTGTCCATGGTGCTGACCCGGGGTCTCCCTGCCGGGAGTCA-----CCTCCAAGTGGGTTAGGTTCGCACCCTGTCCCCA--CCTGCACCCCTCAGGGCCAGAGAGCTGTCTTTACACTCGG------------GG------TCTTGAGCAGCACCTTCTAA---GGTCCCGACCTTGCTTCCTCCTGGGGTCTCTCAGCCTTGTAGCCCCTTGGCTTCAGCTCCCCAGGGCCTGACACCGGGA---CGCTCCCTGAGCCAGTGGGTTCATAAAGGGCCCATG--G--CCTCGTTGGGGTCCCGGTGGCTTT--GC-----------CCCTGGGGGTTCCTGTGGGTGTTGCGTGAGCCAC-----------------TCT-------------------------GTC--TGCAAAAGGGGGGCAGTGGCTGAG--------ACCGAGCACACCATGGGCAGCCATTGTAGTGACAGGATCAAGGCCCAGGGGGACACTGACTCCAGGGGCTGTCGGCTCCGAGTATGATGTCACTGTGCTGGGCTCAGC-----TGCAGGTTA----------------------------------------------ACCGTGAAAGGCTTGGACCAGGGTCAGTGGTCTTGGTGGGACAGTCAGAAGGGGAGCCCGGTGAGGGT-CC---CGGG------------------GAACAACCAG-GAGGCCGTGACATGGGCAGTGGCA----------CTGGAAGGGGGAGGGTGGATTTGTGGGGGTGACTGAGA-------GT------GGGGGTGGGTCTG----GAGGACCCCTGGGTGTGGCTCCAGGTGGGACCCACGGGCTGTGCGTTGCAGGAGGCGGACACGGATGACCACC--AAGG-----CACTCTGGGCTTTGAG-------------------G--------AGTT-CTGTGCC----TTCTACAAGATGAT-GTCCACCCGCCGGGACCTCTACCTGCTCATGCTGACTTACAGCGACCACAAGGACCA----CCTGGACGCCGCCGAC-CTCCAGCGCTTCCTGGAAGTGGAACAGAAGGTGAGT--------GTGCCCAGCAGGCTGGGGCTGCAGGCGGCACAC-----CCCTGCGCTTCCAGAGGGAGCCCCCCTCGACCGCAGCTTCCCAGT----CCA------GCCTGCCCTGCTCCCGGCCCC--------     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                   .     .                                                                                                                                                                        :   .                                    *                                                                                                                                                                                                                                                             .     .               .     .                                         .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            

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