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 1 Target                                                   100.0% 100.0%    ---------------------------------------------------TCTGTGGAGGGGGCC------------GCATCTCTGCCCA--GCTCAGCCACAGGCCCTG-----------------------GGAGGGCC-TCT-GGCCTGGG-CTTTGTCCCATGGCCCCTGG-GAGGGCCATCAGCCC-AGGCTCTGTCCCATGGG--GGCC-----------CTTTGAGCTGCAGTGTGT-CCCC-------TCATG--GCTGTCCTGGGTG--CAGTGAGTGGGCACCCCCAGACTT-GGGGCTACCCTCACACCTCGCACCAGG--C-ACCCCAGGGCTTCAT--CTGGTGTGTGCT-GGGCCCAGTGCATGTG--------------------------GCTT---TAGCTGGGCC--------------CTTCATGCCACGCTGGCCTCATCCCAG------------------------CCTTGGTGTGGGCACACAGCCTGTCC-CTGGGGTCCTGACCCACCTTCATGCCAAGCCGTGGGTGTAGGGCGTGTGGCA--GCCA--GGGCTCTGCCCTGGGGACAGGGACAAAGGGGCTGATG--G---GG--CCACCTGACTGGTGACTCCCCTGGCTCAGAGGGGATCCCAGGGGAGCTGGCACCACCACCCCTGGCCACCCCAGATCGTGGCCACGGGAGGAGGCAA---GGC-TGGTCCCCAGTGGCAGGCTGGTGGCTGCTGC--TGTCCATGGTGCCGAGCCGGCCCTGG-TTCCTGCTCAGCTGAGGCACATCTGCAGGCCGAGGCGGGGCCCTGGGTACTCTCCTGTGGACCAGGACATTAAGCTGTCCTGAGAGGCATGGCCAGCGTGCAGGTGG-CCCTTTGTAGCCTGCT-TCCTCGACCCCACTCTGGGCTCCTCGCAGGCCCCCTTGGAGCC--CCTGGG-TGGGCTGCTGAGAGCACGCCGTCCTC------AGCCTGTGTGGGCTCTGGGAAGAG----GACCCAGCGGGG-CTTGTCTGGAAGCCCAAATCACGAAGC----------CTCTAGACTACTG-CTGTGGTGGATGCA-GCACCTCCTCGACTTTTGGAGGTATTTCCTGCTTCTCAGGGCACCCAGTCTGGGGCTTCCGTGGAGGCCTGAGGACTC-------AGCCAGT-------------------GTAGGCGGACACCTGC-TG----GCTGGGTGTCGGTGTGGCCAGGCCTGGGG--TGAG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 2 Rhinopithecus_bieti-NW_016807514.1-201018_201908          96.9%  83.3%    ------------------------------------CCGAGCATTTTTGTTCCTGCTCAGTGGTGA------------GTGGCTCACCCTG--GCACACAGCCACTCTGTG-----------------------GAAGGGCTGCAT-CTCTGTCC-AGCTTAGCCACAGGCCCTGG-GAGGGCCACCAGCCC-AGACTCTGTCCCACGGG--GGTC-----------CTTTGAGCTGCAGCCTGTGCCCC-------TCACG--GCTGTCCTGGGTA--CAGTGAGTGGGCACCCCCAGACTT-GGGGCTACCCTCACACCTCGTACCAGG--C-AACCCGGGGCTTCAT--CTGGTGTCGCTG-GGTCCCAGTGCATGTG--------------------------GCTT---TAGCTGGGCC--------------CTGCATGCCATGCTGGCCTCATCCCAG------------------------CCTTCGTGTGGGCACACAGCCTGTCC-CTGGGGTCCTGACC----TTCATGCTAAGCCATGGGTGTAGGGCGTGCAGCA--GCCA--GGGCTCTGCCCTGGGGACAGGGACAAAGGGGGTGATG--G---GG--CCACCCGACTAGTGACTCCCCT--------------------------GGCACCACCACCCCTGGCCACCCCAGATCGTGGCCCCAGGAGGAGGCAA---GGC-TGTTCCCCAGTGGCAGGCTGGTGGCTGCTGC--TGTCCATGGTGCTGAGCCGGCCCTGG-TCCCTGTTCAGCTGAGGCACATCTGCAGGCCGAGGCGGGGCCCTGGGCACTCTCCTGTGGACCAGGACATTGAGCTGTCCTGAGAAGCGTGGCCAGGGTGCAGGTAG-CCCTTTGTGGCCTGCT-CCCTCGACCCCACTCCAGGCTCCTCGCAGGCCCCCTTGGAGCC--CCTGGG-TGGGATGCTGAGAGCACGCCGTCCTG------AGCCTGTGTGGGCTCTGGGAAGAG----GACCCGGTGGGG-CTTGTCTGAAAGCCTGAATCACGAAGC----------CTCTAGGCTACCA-CTGTGGCGGATGTG-GCACCTCCTCGACTTTTGGAGGCATTTCCTGAT-CTCGGGGTACCCAGTCTGGGGCTTCCGTGGAGGGCCGAGGACTC-------AGCCAGT-------------------GTAGGTGGACACCTGC-CG----GCTGGGTGTTGGTGTGGCCAGGCCTGGGG--TGAGCAGGCACAGGGCAGA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 3 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-108560_109406              92.3%  67.5%    ---GGTTGGGCTCAGGCCCCCCGAGGGCCTCACCGTCCGGGCAGTTTTGCTCCTGCTCAGTGGAGA------------GTGGCTCACGCTG--GTGCACA--GCCTCTCCA-----------------------TGGAGGGGCCT--------------------CATCTGCCCAG-CTCAGCCACAGGCCC-AGACTGTGTCCCACGGG--GCCC-----------CTTTGAGCTG-TAGCATGTACCC-------TCATG--GCTGTCCTGGGTG--CAGTGAGTGGGCAGCCTCAGACTT-GGGGCTGCCCTCACACCTCATGCCAGG--C-ACCCTGGGACTTCGT--CTGGTGTGTGCTGGGCCCTGGCGTATGTG--------------------------GCTC---TAGCTGGGTC--------------CTTCATGCCATGCTGGCCTCATCCAAG------------------------CCTTGGCCTGGGCACACAACCTGGCC-CTAGGGTCCTGACCTACCTCTA----------TGGGTCTAGGGCAGGCGGTA--GCCG--GGGCTCTGTCCTGGGGACAGGGATGAAGGGGGTGATG--G---GG--CCACCTGACCG-TGATCCCCCTGGCTCAGAGGGGACCCCAGGGGACCTGGCACCACCATCCCCTGCCACGCCAGATCA----GATGGGAGGCAAGG-----------TTGGTCCCAGGCGGCTGGTGGCTGCTGC--TGTCCATGGTGCTGAGCTGGTGCCAG-TCCCTGCTCAGCTGAGGCACATCCCCAGGCTCAGGCAGTGCT---------CTCCTGTGGACTAGGACATGGGGCTGCCCTG--------------------------AGAGGCGTGGCCTGCT-CCCTCGACCCTGCTCTGGGCTCCTCCCAGGCCCCCTTGGAGCC--CCTGGG-TGGGCTGCTGAGAGCATGCTGTTCTC------AGCCTATGTGGGCTCTGGGAAGAG----GGCCCGGTGGGG-TTTGCCTGGGAGCCTGAATCATGAAGC----------CTCTAGGCTGCTT-ATGTGGTGGATGCA-GCACCTCCTCGACTTCTGGAGGTATTTTCTGCTTCTCAGGGGACCTGGTCTGGGACTTCTGTGGGGGCCTAAGGACTC-------AGCCAGT-------------------GTGGGTGAACACCTGC-CA----GCCGGGTGTCGGTGTGCCCAGCCTGGGGT--GAACAGG-CACAGGCAGAACCCTGCCTTCAAG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 4 Sapajus_apella-NW_022437067.1-183440_184168               92.7%  62.9%    TGGAAGTGGGCCGGACCCAGCGCGGGGCCTAATTGCCA--------AAGGGCACGCTGGGTGGGCA------------CCGAGGCAGGCTC--GGCCAAGGTGCAGTTCAA-----------------------CAGCTGCGGCT--------------------TCCCTTTGTGG-GAAGAAAAGATGCTG-TGACTGTATCTGGGGTGTTCTGG-----------GGTTGGGCTC-AGGCCCACGAGG-------GCTTC--GCTGTCCGGGCAG--TTTT--GTTCCTGCTCAGCGGAGA-GCAGCTCACGCTGGTGCACAGCCTCTC--C-GTGGAGGGGCTTCAT--CTGGTGTGTGCTGGGCCCCAGCGTATGTG--------------------------GCTC---TAGCTGGGTC--------------CTTCATGCCATGCTGGCCTCATCCCAG------------------------CCTTGGCCTGGGCACACATCCTGGCC-CTGGGGTCCTGACCTACCTCCA----------TGGGTCTAGGGCAGGCGGCA--GCCA--GGGCTCTGTCCTGGGGACAGGGATGAAGGGGGTGATG--G---GG--CCACCTGACTGGTGATCCCTTTGGCTCAGAGGGGACCCCAGGGGACCTGGCATCACCATCCCCTGCCACGCCAGATCATGGCCATGGGAGGCAAGG-----------TTGGTCCCAGGTGGCTGGTGGCTGCTGC--TGTCCATGGTGCTGAGCTGGTGCCAG-TCCCTGCTCAGCTGAGGCACATCCCCAGGCTCAGGCGGTGCC---------CTCCTGTGGACTAGGACATGGGGCTGC-CTG--------------------------AGAGGCACGGCCTGCT-CCCTCAACCCTGCTCTGGGCTCCTCCCAGGCCCCCTTGGAGTC--CCTGGG-TGGGCTGCTGAGAGCACACTGTCCTC------AGCCTATGGGGACTCTGGGAAGAG----GGCCCGGTGGGGTTTTGCATGGGAGCCTGAATCATGAAGC----------CTCTAGGCTGCTG-CTGTGGCGGACACA-GCACCTTCTCGACTTCTGGAGGTATTTTCTGCTTCTCAGGAGACCCGGTCTGGGACTTCTATGGGGGCCTGAGGACTC-------AGCCAGT-------------------GTGGGTGGACACCTGT-CA----GCTGGGTGTCAGTGTGCCCAGCCTGGGGT--GAACAGG-CACAGGCAGAACCCTGCCTTC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 5 Physeter_catodon-NC_041216.1-189346_189571                80.5%  32.6%    --------------------------------------------------------GCCCAGCCCGGAGC-CC-----G-CGGAGAGGCCA--GGTCACCCTGCAGGTGGA--------------CACTCAGCGGATGGGCACCTC----TGCCCAGCTGCGGCCACGGCCCCTGG-GAGGGCTACCAGCCC--GACTCTGTCCCAAAGG-------------GGCCCTTTGACCTGCAGTGAGTGCCCT-------GCCCG--GG-------------TCTGTCCCACCAGCTCTAGA-CAC-GGGGCTGCCCCCAAACCTGGCAC-------AGACACAGGGGTCCTCATCTGGCC--TCTGCTGGCCCCGTGCCGGTGGCCCTGGGCTGGGCCCCTCATACCAAGCTGGCCCTGTCCTGGCCTTGGTGTGAGCAC-------------CCGGGTCCTGGAGGGAGAAGCTCGGGCTGTGCTGGGCGCCCACCTAGGGGCCAAGCCACAGGGC-CGGGGC-----------------------A-------GGCAGGGCAGCCTTCCCGGGAGCCCGACTCTCTCTGGGGCCGGGGACATGGGGGTGGCTGCAGCCTGCACCTGGCTCGCTGGTGATCCTTCTGGTTCAGAGGGGGCCTCATTCCCATCTCCA------------GCCACCCCA--GATTGTGTGGCCGCAGGAGAAAAGACAATGCAGACGCCCCGAGAGGCTGG-CTGCACTGC--TATCCATGGTGCTGAACCTGGCGCCTCTTTCAGCTGGGCTGTCGCAGCCCCCCGGCCCCGC-----------------------------------------------------------------------------CCCTGGCCCCCGGCCCCCCG-GCCCGGCCCCT-GCTCTCCGGGCAGAGGACCCAACC--TCGGCACTCAGGG---TCGTGAGCGCCTC---C--CACGTGGCCCTTCTTGCCCAGCTCCTGG----GACCCCCGGGAC-CCTGTAGCGCCTCAGGCTTCCTAGGGGCAGCCTGGCCTCCGTCCCTGGGTGCCCTTGTCCTCTGGGTCTGTCCCTGGCCTTGG------CTCTTGGTGT-------CCCCAGGGTCTGACGCCTCAGCAGGTGCTCCCTGAGTG-------AGGGGATTCATGAAGG---------AGTCTGTGGTCTCATTAGCG----GCCTGGTGGGCTTGCCTGGGG--GTTCC-------TGTGGGTATTGTGTGAGCTGCT-TTCTGGGCAAAATGAGGACAGTGGCTGAGACCAGCG---------------------------------------------------------------------------------------     
 6 Neophocaena_asiaeorientalis-NW_020174791.1-187341_187585  78.4%  30.4%    ----------------------------------------------------------TCAGCCACCACCTCG-----G-CCTGCTGCCCA--GCCCGGAGCCCGCGGAGA--------------GGCCAGATCACCCCGCATCTC----TGCCCAGCTGCAGCCTCGGCCCCTGG-GAGGGCCTCCAGCCC--GACTCCGTCCCAGAGG-------------GGCCCTTTGACCTGCAGCGAGTGCCCT-------GCCTG--GG-------------TCCGTCCCACCAGCTCTAGA-CAC-AGGGCTGCCCCCAAACCTGGCAC-------AGACACAGGGATCCTCATCTGGCA--TCTGCTGGCCCCGTGCAGGTGGCCCTGGGCTGGGCCCCTCATACCAAGCTGGCCCTGTCCTGGCCTTGGTGTGAGCACCCGGCATGGGCACCCGGGTCCTGGAGGGAGATGCTCGGGCTGTGCTGGGCGCCCACCTAGGGGCCAAGCCACAGGGC-CGGGGC-----------------------A-------GGCAGGGCAGCCTTCCCGGGAGCCCTACTGTCTCTGGGGCTGGGGACATGGGGGTGGCTGTAGCCTGCACCTGGCTCGCTGGTGATACTTCTGGTTCAGAGGGGGCCTCATTCCCATCTCCA------------GCCACCCCA--GATTGTGTGGCCATAGGAGAAAAGACAGTGCAGACGCCCC-AGAGGCTGGCGTGCACTGC--TCTCCATGGTGCTGAACCTGGTGTCTCTTTTTGCCGGGCAGTCGCACCCACCCCCACC----------------------------------------------------------------------------------------------CCCCTG-CCCCCCACCCT-GCTCACCAGGCTAAGGACCCAACC--TTGGCACTCAGGG---TCTTGAGTACCTT---C--CACATGGCCCTTCTGGCCCAGCTCCAGG----GACCCC------------------CATGACTTCCTAATGGCAGCCTGGCCTCCAGCACTGGGTGCCCTTGCCCTCTGGGTCTGTCCCTGGCCTGGG------CTCTTGGTGT-------CCCCAGGGTCTGACACCTCAGCAGGTGCTCCCTGAGTG-------AGTGGATTCATGAAGG---------AGTCTGTGGTCTCATTAGCA----GCCTGGTGGGTTTGCCTGGGG-GGTTCC-------TGTGGGTATTGTGTGAGCTGCT-TTCTGGTCTCAGCCACTGTCCTCGCATCTCTGCTGGGGC-AGCCGGAGTCT-----------GGGATT-------------------------------------------------------     
 7 Hipposideros_armiger-NW_017731634.1-173075_173288         77.4%  27.3%    -----------------------------------------------------------TGGTACAGGGC-CC-----CCGGGAACCCAGA--TCGCCCTGTGGGCCAGAT--------------GCCCAACAGAACGGGCATCTC----TGCCCAGCTCCAGTTACATCCCCTGG-GAGGGCTACCAGCCT--GGCTCTGTCCTGAAGG-------------GGCCCTTTGACCTGCGCTGTGTACCCT-------GGCTT--G--------------TCTGTCCTG-CCAGCGTCGGACAC-AGAGCTTCCCTCACACCTAGCACCAAG--CACACCAGGGCCTTCGACAGACGTC--AGGTGTGTCCCCAGC-ACGTGGCTCTGAGCTGAGCTCCTCACCCCAAGCTGGCCCCATCCCAGCCTTGGCACAGGCCCCCAGCATGAGCACTCAGGTTCTGGACTGAGACGCTGGGGCCCCACCGGGCACCCACCTCACTGCCATGCCACAGTGC-CAGGGGCAAGCTGCAGCCAAGGGCACAGGT-------CAGGACCCAGCTTTCCCGGGAGCCCTACTCTCAATAGGGACGGGGACACAGGGGTGGCTGTCG---ACACTTGACTCTCTGGAGATGCTCCTCGTTCAGAGCTGGCCTCAGGGACCTGGCACCCACCTCCG---GCTGCCTCA--GACTGTGTGGCCACATAAGA-----CTATCCAGACGGCC-GGCAGGGAGGTGAGCAGTGC--TGTCCATGGTGCTGTCCTGTGTCT-G-TCGCTGCCTGGAGTTGTCCCCAGGCAGGTCATGCTCACACCCCCTC--CACCCGCACCCCGCCAGGACAAAG----------------------------------------------------------------------------------------AAATG-TC--TCCAGCATCAG-GCCATGAGCAACACCTT---C--TAAGGTTCTAGTTCTTCCCCCTTCC--------------------------------------------------------CAGGACCCCACACCCCATAGGACTTCAGGCT---------------------------CTGAG-------CCGCCCGGCCTCCAGTTCCTGG----GTGCCCTTGTCC-------TCTGGTC-TGTCCCT-----------GGACTTGGGCTCCTTGAGG---CAGAGTAGTGCTGTGGCCCTCGGGGTCCC-------CAGGTCTGACACCTCAGGAGAT-GCTCCCTGAGCCAGTGGTTCACAGAGGAGTCAATGGTCTCGGT-------------------GGGGCCCCGGTGACTTTACCCCGGGGACTCCTG--G---------------GAGTGTTG--     
 8 Balaenoptera_acutorostrata-NW_006725355.1-186852_187100   86.1%  33.5%    ---------------------------------------------------------CCCAGCCCGGAGC-CC-----G-CGGAGAGGCCA--GATCACCCTGCAGGTGGA--------------CACTCAGCAGATGGGCATCTC----TGCCCAGCTGCAGCCACGGCCCCCGG-GAGGGCGACCAGCCC--GACTCTGTCCCAGAGG-------------GGCCCTTTGACCTGCAGTGAGTGCCCT-------GCCCG--GG-------------TCTGTCCCACCAGCTCTAGA-CAC-AAGGCCGCCCCCAAACCTGGCAC-------AGACACAGGGGTCCTCATCTGGCA--TCTGCTGGCCCCGTGCAGGTGGCCCTGGGCTGGGCCCCTCGTACCAAGCTGGCCCTGTCCTGGCCTTGGTGTGAGCACCCGGCGTGGGCACCCGGGTCCTGGAGGGAGATGCTCGGGCTGTGCTGGGCGCCCACCTGGGGGCCAAGCCACAGGGC-CGGGGC-----------------------A-------GGCAGGGCAGCCTTCCCAGGAGCCCGACTCTCTCTGGGGCCGGGGACATGGGGGTGGCTGCGGCCTGCACCTGGCTCGCTGGTGATCCTTCTGGTTCAGAGGGGACCTCATTCCCATCTCCA------------GCCACCCCA--GGTTGTGTGGCCGTAGGAGAAGAGACAATGCAGACGCCCCGAGGGGCTGGCGTGCACTGC--TATCCATGGTGCTGAACCTGGGGTCTCTTTTTGCCGGGCAGTAGCACCCACCCCCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCCCGCCCCCA-CCCCCCACCCT-ACTCACCGGGCTAAGGACCCGACC--TCGGCACTCAGGG---TCTTGAGCACCTT---C--CACATGGCCCTTCCTGCCCAGCTCCAGA----GACCCCCATGAC-CCTGTAGCACCTCAGGCTTCCTAGGGGCCGCCTGGCCTCCATCACTGGGTGCCCTTGTCCTCTGGGTCTGTCCCTGGCCTTGG------CTCTTGGTGT-------CCCCAGGGTCTGACACCTCAGCAGGTGCTCCCTGAGTG-------AGTGGATTCATGCAGG---------AGTCTGTGGTCTCATTAGCG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 9 Molossus_molossus-NW_023425372.1-173365_173595            76.4%  27.3%    -----------------------------------------------------TGCGGCCCAGACAGAGC-CC-----AGT-------GGA--GCAACCACCACCCTGTGG--------------GCCGGACAGAATGGGCATCTG----TGTCCAGCTCCAGCCATGCCCCCTGG-GAGGGCTGTCAGACA--GGCTCTGTCCCAGAGG-------------GGCCCTTTGACCTGCCCGAGCCTGGTC-------TGTCC--A--------------TCTGTCCTGGTAGCTCTCGGACAC-AGGGCTTCCCTCAAACCCAGCACCAGA--CACACCAGGGCCTTTGTCTGGCATC--TGCTGGGCCCCAGTGCATTGGGATCTGGGCTGGGGTCTTCCCACCAAGCTGGTCCTGCCCCAGCCTTGGCAT-GGGTACCTGCATGAGTACTCAGGTCCCGGAGCGAGATGCTGGGGCCCCACCGCAGTGCCAGGCCA-----------CAGGGC-CGCG-GGAGGCAGCTGCCCAGGGCAG-AGG-------TTGGACCCAGCTTTCCTGGGAGCCCTACCCTTGTTGGCGA-TGGGACATGGGGATGGCTGGGG---CCGCCTGGCTCATTGATGATGATCCCGATTCAGAGGGG-CCTCAGGGACCTGGCACCCACCCAGG---C-CACCCTG--GACTGTGTGGCCACAGGAGGCA---CTAGCCAGATGGCCTGCAAGGCTGGTGGACACTGC--TGTCCATGGTGCTGACCCGGGG-T-C-TCCCTGCCGGGAGTCACCTCCAAGTGGGTTAGGTTCGCACCCTGTCCCCACCTGCACCCCTCAGGGCCAGAG----------------------------------------------------------------------------------------AGCTG-TC--TTTACACTCGGGGTCTTGAGCAGCACCTT---C--TAAGGTCCCGACCTTGCTTCCTCCT--------------------------------------------------------GGGGTCTCTCAGCCTTGTAGCCCCTTGGCTT---------------------------CAGCT-------CCCCAGGGCCTGACACCGGGAC----GCTCCCTGAGCC-------AGTGGGTTCATAAAG----------GGCCCATGGCCTCGTTGGGG----TCCCGGTGGCTTTGCCCCTGGGGGTTCC-------TGTGGGTGTTGCGTGAGCCACT-CTGTCTGCAAAAGGGGGGCAGTGGCTGAGACCGAGCACACCAT-------------------GGGCAGCCATTGTAGTGACAGGATCAAGGCCCAGGGGG--------ACACTGACTCCAGG-     
10 Manis_pentadactyla-NW_023457939.1-177151_177372           73.8%  25.6%    ---------------------------------------------------------CCTGGCACAGAGC-CT-----GGCATGAGG-CCA--GCCACCCTGTGGGCTGGA--------------TACTGACGAAATAGGCATTTC----TGCCCAGCTCCAGCCACACCCCCG-G-GGAGGCTACCAGCCT--GCCTGTGCCCCAGAGG-------------GGCTCTCTGACCTGCAGTGTGACCCG--------GCCCT--G--------------TCTATCCTG-CCAGCTCCCAGATG-TGGGGCTGCCTCAAATCTAGCACCAGC--CACACCAGGATTTTCATCTGACATC--TGCTGGGCCCCAAAGCATGTGGCTCTGGGATGGCCCCTCATG-CCAAACTGGCCCTGCACCAGTGTTGGCATGGGCACATTGGGT------------CCTGGAATGAGAAGCTGCCTCGTGACGAGCC-----------------------------------GCAGTGCTGGCATGTGTGCAGGT-------CGGGGCCCAACCTTCCC-AGAGCCCAGCTCCTGCTAGGGA-TGGGGATGGGGAGGCTGTGGCC---ACCTGGCTTACACTGGTGGTGCTCCCAGTTCAGAGGGGCCCTCAGGGACCTGGCACCCACCCCGG---C-CACCCCG--GATTGTGTGGCCCAATGAGGAAAGACGATCCAGGCGGCCTGCAAGGCTGGCGCGCACTGCGCTGTCCACGGTGCTGACTCGGCATCTG-TCCCTGCAGTCG-CGTTGCCCCACTCCCACCTGCTGGGTCAGAA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCCATCTTTAGCACGCAGAGCAGCACCTT---C--TAGGGCCCTCCCTTGTCTGCACCCCCAG----GGCCTCCT-----------------------------------------CTGGGCAGCCTGGCTTCCAGGCCTTCTGGGTCTGCCCCTGACCTTGG------CTCTTGACAT-------CCCCAGGGTCTGACCCCTCAGCAGATGCCTCCCAAGCA-------AGTGGATTCATGGAGG---------AGTCCATGGTCTCCCTGGCTGGGGTCCTGGTGGGTTTGCTCCTGGAGCCCCTGCAGGCGTGCAGAGGTCGTGTGAGCCGCA-CTGCCTGCAAAGC----AGATGGGCTGAGACCAGGGTCCTCTCCTCTCTGCC---G------TGGATACTGGAGCCAGGACACCCTTGCAGCCCTGGGGCCCTGTGCTCTTCTAATTGATGGG     
11 Lemur_catta-NC_059130.1-175401_175573                     85.2%  43.5%    --------------------------GCCTCAGCATCACAGCACCCTGGTTCCTGCGCA-GGGCCAGCAGGCAGATGCCCCCCCT-GG-------ACTGTGGGCATGGTGA---------------GCTGACCCTGGGCACAGCCA--CGCAGGG---CCCAGCCACGGCCCCTGG-GAGGGCGACCCTCCTAGCTGCCTGTCCCAAAGG-------------GGTCCTTGGAGCTTCAGCGTGT-GCCC-------TGACCCAGCTGTCCTGG--------------------GTGCAGAGA-GCGGCTG------GCTCTCGGCCCAGA--C-CCACCAGGTCCTCC-----AGCCTCTGCTGGGCCCCAGCACCTGTG--------------------------GCTT------GAGC---CTTGGCTTGGG-CACCTGGCGGGGCACTTGGGTCCTGCTGGGGA-----------------------------TCCACCAAGCCACGGTGC-CAGGGGAGCAG-GCAGCCAGGAGCACCCCT-------CAGGGCCCGGCCTGCCCCAGG--GCCCACCCCGCTGGGGACAGGGGTGCAGGG-GGTTGT--G---GC-CACGTTGCTCTGGAGAGTCTCCTGGCTCAGAGGGGACCTGG---C-------AGCACCACCCCGGCCACCC-----AGACCGTGGCCACGTGGGGAGA---GTC-TCTCCCGGGCTGGCAGGCCAGCGTGTGCTGC--TGTCCGTGGTGCTGGCCCAGCGTCTG-CCCTGC---------------TCTGGG-------------------CCCTCCC-CTGTGGGCGTGGGCAGTGAGCGGTCCTGAGAGGTGCGACTAGCTTGGGGGACAGCCCCGTGGCCTGTTC---------------------------CCAGCCTCCCTGGGAGAC--ACC-GG-TGGGCTGCTCAGAGCACCTCT----C--CTTGGCCCGCAGGTG---ACGGGAACAG----GACCCCGGTGGGGTTCATCTGAGAGCCCCGTTCACGGAGCGCCCAGGCGGCCCCCTGCTGTGG-GTGTGGTGGGTGGG-GGCCACCCCGACTTCCGGGAGGTGCCTTCCACTTCTCAGGGGACCGAATCTGGAGCTTCCGTGGAGGCCCAGGGACTG-------GGCCAGT-------------------GTCTGGGGACACGTGC-CA----GCCATGCGTTTGTGTGTCCGGGTCTGGGG--TGGGCTG-CGCATGGGAGCAGAGGCCTCGTGTTGCAGGAAGCGGACACGGATGACCGCCAGGGC--------------------------------------------------------------------------------------     
12 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-174237_174455           77.9%  32.5%    -------------AGGCTTCCTGGGAGCCTCAATTTCATAGCATCTTCATTCCTGCTCAGGAGACAGCAGGAGGGTGCCCCACCCTGG-------ATTCCTGGTGTGGTTAGCAG--GGGAGGCCAGCTGACCCTGGGCACAGCCA-CTAC--GC---CCCAGCCATGGCCCCTGG-AAGGGCAACCAGTCCAGCCCCTTGTCCCAAAGG-------------GGCCCTTGGAGATGCCTGGTTG-TCCT-------AGGTGCAGTGAATGGTTGGC--CT----------CAGGTCAGGATT-GCCCTTG------AATCCAGCATCAGA--TGCACCAAGGTCTTCT-----GGGGTCTGCTGGGCCCCTCATGCCAAG--------------------------CTGGCCCTG-TTCTAGCCTTGGCATGAGCACATGA--TAGGCATTTGGGTCCTGCTGCAGTCCAC-----------------CTC-----CATGCTAAGCCACAGCGT-CAGGGCAGTGTAGCAGCTGGCAGCACAAGT-------CAGGTCCCCACCTGCCCCGAA--GCCCG--CCACTGGGCATGGGGACACAGTGGGATTGT--G---ACTGTGTCACTCATGGAGATTGTCCTGGCTCAGAGGGGACTTGG---C-------ACCAAATG---------------------GTGGCCCCTATGAGGAA---GGC-TGTCCCTTGCTGGCAGGCCAGCGCGTGCTGG--TGTCCAAGGTGCTGGCCCAGTGTTTG-TTCCTGAT---------CTGGGCCCTC-------------------CCCTTTC-CACTGGATGAGGACAGTGAGCTGTCCTGAGAAGTGTGATTTGCTTGGAGGATGGCCCCTTGTGGCTTGCTCCCTGGACACCCCCTCAGGACTCCTCCCAGCCTCCTTCAGAGAC--ACCAGG-TGGCCTGCTCAGAGTGCACCC----CTGCTCAGCCTGTTGATGG--GTAGGACAAG----GACCCTGATGTGGTTTGTCTAAGAGCCCTGTTCATGGAGCCCCTCAGGGGAGTGCTCTGAG---------------------------------------------------------------------------------GAGGCA-----------------------------------------------------GTGGC-AG----AGGAGGGGAGTGTGACTGAGGAGTGGGGG--CCTGCTGCAGATGGGGACCAGAGGCCTTACATTGCAGGAAGCAGACACAGATGACCACCAGGGGACACT-GGGCTTTGAGGAG----------TTCTGCGCCTTCTACAA----------------------------------------     
13 Artibeus_jamaicensis-NW_023552099.1-176004_176175         77.6%  26.4%    ------------------------------------------------GCAGTGG-------------------------GGGGTGGGCAA--GCCCAGTGGGGGCCACAC--------------CACCCCGT----GGGCCGGACTGAATGCCCAGTGCCTAGCCCCAGCCATGCCCCGGCAGGGCTGTCA--ACCCCCCTGCCCCAGG-------------GGCCCTTTGACCCACACTGGG-----------------------------------GGGGC----------CCTTGGACG-CAGGCTGCCCTCAA--ACCCGGCACTG--CACACACAGGGCCTCGGGGGGGGCATCTGCCGGTCCCCTGTGC-------------------TCGTGGCTCTGGGTTGGCCCTGTCCCAGCCTAGGCCTGGGTCCCTGGCATGGGCTCTCAGGTCCTGGAGCAAGAATGCGGGGCCCTGCCCGGTGCCCACTGTGCCGCAGCGCC----------CGGAGCAGCAGCAGCCAGGAGCACAG-G-------ACGGGACCTAGCTTTCCCGGAGACCCACTCTCTTCGGAGACGGGGACACAGGGATGGCTGTGG---CCACTTGCCTCG---GTGATGCTCCTGGTTCAGAGGGGGCCCCAGGGACCTGGCACCCACCCCAG---GGCCACCCA--GACTGTGTGGCCACGTGAGGGACACCAGCCAA-TGGCCT-ACAGGTCTGGCAGGTGCTGC--TGTCCATGGTGCTGACCTGGGGTCTG-TCCTGGCTGGAG-ATATCTTCACGCTGGTTCTGTCCGCCTCCCG-------------CCCCCTGGGCCAAAGAACCGGACTCTGCACTCCGG-----GTCTTGAGCAGCACCTTCTCAGGTTCTGACTCTC-ACCAGCTCCCAGTGACTCCCAGCCTCAGAGCAC-CT--GAAGGCCTTGGTC--------AC--------------------------------------CG----GACACCCTTGTC-CTCTGGTCTATCCCGTCTTGAGC---CCCACG-------GGGCAGGGCAGCACTTGGTCCTC--------------------------------AGTGT-------CCCTGGGAC------------------------------------AGTGAGGTTTGTGGGGACGGTCAAGAGGTGGGGGTGGGCCTGGAG----GCC--TGTGTAGGCTCC-GGGGGGGGACGCAGGGGGACCCACAGGCCTTGTGCTGCA-G---------GAGGCGGACACGGATGACCACCAGGGCACGCTGGGCTTTGA-----------GGAGTTCTGTGCCTTCTACAAGATGATGTCCAC-CCGCCGGGA------------------     
14 Acinonyx_jubatus-NW_020834739.1-188850_189035             79.9%  30.9%    ----------------------------------------------------------------TTGGGGATG-----GGGGGAGGCCAAA--TCGCCCTGCGGGCTGGAC--------------ACTCGACACACTGGGAATCTC----TGCCTGGCTCCAGCCACACCCTGGGG-AGGGCTGCTG-GCCC--GGCTCTGTCCCAGGGG-------------GGTCCTTTGGTCTGCAGTGTGAGCCAG-------AGCCT--ACAGCCAGAGCCTGGCTGAGCCTGCCGGCTCTCAGACCC-AGGGCTGTCCTCAAACCGAGCTCCAGG--CACAATGAGGTCTTTGT--CTGGTG--TCTTCTGGGCCCCTGCACATGTG---------------GCTCTGGGCTCTGGTCCTGTCCCAG-------------CCTTGGCACAGACGCTGGGGTCCTGGGGTGGGATGCTGGGACCTTGCTGGGTGTCCACTTCAGTGCCG--------------------------AGCCAG---------------------GACTGGCCTTCCCAAGAGCAGTACTCTCCCTGGGGACAGGGACATGGGGGTGGCTGTGG---CCACTTGATTCTCTGGTGATGCTTCTGGTTCAGAGAGGGCCTCAGGGACGTGGCACCCACCCCCCA--GCCACCCCA--GATTGTGTCACCACATAAGGAAAGACT--CCAGATGGCGC-TCAGAGCCGGAAGCGCTGC--TGTCCATGGTGCTGAGCCAATGTCAA-TGCCTGCTGTGCAGCCAACCTC------------------------------------------------------------------------------------------CAGACAGGTCCTTCTCACA-CCCCACCCCCA-CCCC------------ACCAGCCC--TAAGAACTGGGGCTCTGGATCAGCACCTT---C--TACGGGACCTTTCTTGTCCATTCCCAGG----GATCACCGTGGC-CCCAGGGCACCTCAGGCTCCTCTGGGCAGCCTGGCCTCCAGTCGCTGGGTGCCCTTGTCCTCTGTGTCTGTCCCTGGCCTTGG------CGTTTGGTGT-------TCCCAGGGTCTGACACTTCAGTAGATGCTCCCTGAGTA-------AGTGGGTTCATGAAGA---------AGTTCATGGTCTCACTGGGG----TCTCGGTGGGTTTGCCCCTGGTGGTTCC-------TGCAGGAGTCGTGTGAGCTGCC-CTGTCCGCAAGAGAAAGACAGTGGCCAGGT------CCT-CTCATCTCTGCT---G------TGGAGACTGAAGCCTGGACACTCCTG--T--------------------------------     
15 Castor_canadensis-NW_017871110.1-171292_171481            89.4%  40.2%    ------------------------------CTGCTTCACAGAACTTCATTGGCTGCTGAGGGGCAGGGGCTCCACTCTTAGCTACAGGCAG----ATACCTGTCCTGGCTCCTGGCCGTGCTGCCCAGCACCCTAGGGCACAGCCA-CTTAGGTGGGCTCATCTCAGGGAGAGTGG-CAGGGAGC----GTGGCTCCTCTGTCTCAGAGG-------------GGCCTTTTGACTTG--TGATGT-GCAT-------TGGCCCTGTTGCCCTGGGTA--AGAGTGGTCA--AGCCTCAGAATT-AGGGCTGTCTGCCAATCTAGCACTAGA--TACACTGGGGTCCCAG---TGAGTGTCTGCTGGGCCCA----GTGCAT--------------------------GTGACTCTG-GCCCAGCCTTGATGTAGGCTCATGGCACAGGCACTGGAGTCAT---------------------------------------------GCC-----------ACCAAGAAAGCTTGGGACAGCACAAGT-------CAGGGCCTGCCTGCCCTGGGG--CCCCCTCTCACTGAGGATAGGAATGTTGGGGTAGTGT--G---TT--TGCCTTGCTCACCAGTGGTTCTGGCACAGAGAGGACCTTG---G-------GAGACCTGTCCTTCAGCCACTCCAAGTTATGTGGCCCTGAGAGAGG---CTA-TTCTATGACTGGTGCACCCAGCGACAGCTGC--TGTCCATGGTGCTGGGCCTGCATCTG-TCTCCTGAGCTGAGATAAGGCTCCGAG-------------------CCCTTCC-CCTAGGGCGTGAACACTGAGCTGTCCTGAGAGCATGCC--GGCTTAGAGGGCAGCCCTATGGC--CTGCTCCCTAAGTGCCCATTCTGGGCTCCTCCTGGCCTCTCTAGAAGAC--CCCAGGGTGGGCTTCTGAGACCTTACCCTCTCCTCCTCAGTCCACTGATGGCTCTGGAAAGAG----AACCTCAGAGGGTTTCATCTGGGTGC-CCATGCTTGGAGCCTCCTGGTGGCCCCAGGGCTGTG-GTGTGGTAGATTTAGTGGCACTTCTACTTTGAGGAAGTGTCTTCTGCTTAATATGGA-CTGCACCTG----AAACATAGAGGCCTGAGGACTC-------AGCCAGT-------------------GTCTGTAGTACC-TGC-TG----GCCAAGCACCTGTGTGCCTGGACCTG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
16 Equus_przewalskii-NW_007674960.1-187988_188172            81.7%  29.5%    -------------------------------------------------------------------------------------GCCAGA--CCACCCTGTGGGCTGGAC--------------ACTTGACAGATTGGGCATCTC----TGCCCAGCTCCAGCCACACCCCCTGG-GAGGGCTACC-AGCC--AGGCTTGGTCCCGAGG-------------GACCTTTTGACCTGCAACAC----------------------ATGCCCTGGCTCGGTCTGTCCAGCCAGCTCTCAGAAGC-AGGGCTACCCTCTGAGACAGCACCAGA--CACACCAGGGTCACTTCCTCTGGCA--CCTGCTGGGCC-----------C---------------TCATGCCAAGCTAGTCCCCTCCCAG-------------CCTTGGCATGGGTGCTCGGGTCCTGGAGGGAGATGCTGTGGCCCTGCTGGGTGCCCGTCTCAATGCCAAACCACAGTGC-CCAGGGAAGGCAGCAGCCAGGAGTACTG-T-------CAGGGCCCGGCCTTCCTGGGAGCCCTGCTCTCCCTGGGGATGGGGATGTAGGAGAGGCTGTGG---CCACCTGGCTCACTGGTGATGCTTCTGGTTCAGAGGGGGCCTTAGGGACCTGGCACCCACCTCTA---GCCACCCCA--GATTGTGTGGCCATGTGAGAAACACTATCCACGTGGCTGG-CAGGTCTGGCTAGTGCTGC--TATCCATGGTGCTGACCTGGTGTCTG-TCCCTGTCAGCCCGTCACCTC-------------------------------------------------------------------------------------------CAAGCAGGTTGTGCTCACG-TCACACTCCCA-CCCCACTGGACTAAAAACCTGTCT--TGAGTACTCAGAACCTTGAGCATCACCTC---C--CACAGATCCTTTCTTGCCCAACCCCAGG----GACCCCACGGCC-TTGTAGCACCTCAGACTTCCTCTAGGCAGCCTGGCCTCCAGTCACTGGGTGCCCTTGTCCTCTAGGTCTGTCCCCGGCGTTGG------CCCTCAGCAT-------CCCCAGGGTCTGACACCTCAGGAGATGCTCCCTGAGCC-------AGTGGACTCATGAAGG---------ATTTCATGGGCTCATTGGGG----TCATAGTGGCTTTGCCCCTGAGGGTTCC-------TGAGAGTGTTATGTGAACTGCT-CTGTCTGCAAAGAAGGACAGTGGCCAAGACCAAGGTCCT-CTCATCTCTGCTG---------TGGAGTGGGA---------------------------------------------------     
17 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-176115_176213        81.4%  40.3%    -----------------------------------------------------------------------------TGCCGCCCTGG-------ACTGCGGGCGTGGTGAGCAG--TGG-AGCTGGCCGACCCTGGGCACAGCCA-CTCAGGGC---CCTGGCCACGGCCCCTGG-GAGGGTCACCCTCCCAGCTCCCTGTCCCAGAGG-------------GGTCCTTGGCGCTCCAGCGTGT-GCCC-------TGACCCAGCTGTCCTGG--------------------GTGCAGTGA-GCAGCTG------GCTCTCGGCCCAGA--C-CCACCAGGTCTTCT-----GGCATCTGCTGGGCCCCAGCACATGTG--------------------------GCTC------AAGC-----------------CTTGGCGTGAGCACTTGGTCCTGCTGGGCG-----------------------------TCCACCAGGCCACGGTGC-CAGGGAAGTACCGCAGCCAGGAGCGCCCGT-------CAAGGCCTGGCCTGCCCCAGA--GCCCACTCCACTGGGGACAGGGAAGCAGGG-GGTTGT--G---GC-CACATTGCTCTTGAGAGTCTCCTGGCTCAGAGGGGACCTGG---C-------ACCACCAGCCCAGACCG--------------TTGCCACGTGGGGAG---TCG-CTCCCGTGGCTGGCAGGCCAGAGTGTGCTGC--TGTCCATGGTGCTGGCCCAGCGTCTG-CCCTGC---------------TCTGGG-------------------CCCTCCC-CTGT---------------GGTGTCCTGAGAGGTGTGACTAGCTTGGGGGACAGCCCCGTGGCCTGTTC---------------------------CCAGCCTCCCTGGGAGGC--ACTGGG-TGGGCTGCTCAGAGCACCCC---------TAAGCCCACAGGTG---ATGGGAGCAG----GACCCCAGTGAGGTTCATCCGAGACCCCCAGTCATGGAGTGCCCAGGCGCCCCCATGCTGTGG-GTGTGGCGGGTGGG-GCCACCCCTAC--TTCTAGGAAGTGCTTGTACTTCTCAGGGGACAGAATCTGGAACTTCTGTGGAGGCCCAAGGACTG-------GGCCAGT-------------------ATTTGGGGACATGTGC-CA----GCCATGCGTCTGTGTGTCCAGGTCTGGGG--GTGGGTGGGGCATGGGACAGGACCCTGCCTTCAAGGCATGTGGGATCCAGCCTCTGGCCACATTGTCAGTGGAGGGTCAGGGCCAAGGTGGGTGGCTGACCCCCCCACCGGTC----CCCCAGCAGCCCTCTGTGACTCCGACCA-----     
18 Microcebus_murinus-NC_033661.1-173917_174458              85.7%  42.3%    -------------------CCCAAGAGCCTCAGCATCACAGCACCTTCATTCCTGCGTG-GGGCCAGCAGGCAGATGCCCTGCCCTGG-------ACTGTGGGCGTGGTGAGCAG--CGGAGGCCAGGTGACCCTGCTCACAGCCT-CTCGGGGC---CCCGGCCACGGTCCCTGG-GAGGGTGACTGGCCCAGCTCCCTGTCCCAAAGG-------------GGTCCTTGGAGCTGCAGTGTGT-GCCC-------TGACCCAGCCGTCCCAG--------------------GTGCAGGGA-GCGGCTG------GCTCTCAGCCCAGA--C-CCACCAGGTCTTCC-----GGCGTCTGCTGGGCCCCAGCACGTGTG--------------------------AGGG------CTCAGGCCTTGGCGTGAGCGCCTGGTGTGGACACGTGGGTCCTGCTGGGCG-----------------------------TCCACCAGGCCATGGTGC-CAGGGGGGTACTGCAGCCAGGAGTACCCGT-------CAGGGCCTGGCCTCCCCAA----GAGCCTGCCCCTGGGGACAGGGGTTCAGGG-GGTTGT--G---GC-CACGTTGCTCTGGAGAGTCTCCTGGCTCAGAGGGGACCTGG---C-------ACAGCCACCCTGGCCACCC-----CAGACCGTGGCCACAAGGGGAG---TCT-CTCCTGTGGCCAACAGGGCGGCATGTGCCGC--TGTCCATGGTGCTGGCCCAGCATCTG-CCCTGC---------------TCTGGA-------------------CCCTCCC-CTGTGGACGTAGACAGTGAGCTGTCCTGACAGGTGTGACTAGCTTGGGGGACAGCCCTGTGGCCGGTTC---------------------------CCAGCTTCCCTGGGAGAC--ACCAGG-TGGGCTGCTCAGAGCACCCCT----C--CTCAGCCTGCAGGTC---ATGGGAACAG----GACTCCAGTGGGTTCCATCCGAGAGCCCCATTCATGGAGCGGCCAGGTGGCCCCACACTATGG-GTGTGGCACGTGGA-GGCCATCCCTACTTCTAGGAGGTGCTTTCTGCCTCTCAGGGGACCAAATATGGAACTTCCACAGAAGCTCAAGGACTC-------GGCCAGT-------------------GTTTGGGGACACATGC-CA----GCCATGCATCTGTGTGTCCAGGTCTGGGG--GTGGGCTGTGCATGGGACTGGAACCCTTGCATTGCAG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
19 Cricetulus_griseus-NW_003616165.1-50119_50197             77.8%  24.2%    -------------------------------------------------------------------------------------GAGGGAAAGCACCCTTGTGTGGGATTGGAG----------GGTGTAAGCTCCAGGCCTTGG-----------TTGGAGCTACTCCATGTGT---TAGCCCTCAGAGT-TTATGCTTTCCAGCCCATTGTTGGGAGATCAGGCCTCTGGGTACTGATTAGTTCCTGAGGTCCCTCTGGGTGATCTCAGGCTTACCTCCTTCACATTGCA-ATAGGAAGC----CCTGGGCAGAGACTAAAGGCCATG--AACTGAGGGGCTAACAG--CTGGGGTGTGTAGGTGGGATGGAGTTCTA-------------------GG-----GTTGAGTCTGGAAAGG---------------------AAGGTTGTGGGGTTGTTGCCCTGGAGAC--------------------------------------------------------------------------------------------ATG---------AGCCTTGCATCTTAGCTCTCACAGA--GT------------------TATCTG---TGGTGATCAGCCAGCTATAGAGATT-CCAA------------CCCTGAAAGCC-TGCTTTCCCTGCCTGTGTGGGGTCCCATTAGGCCAAG----CACCTCATGGTAGGCACTTGGAGCCCCAGGA--TAGAAATGGTGCTGTCTACCAGGCTT----------ATCTGACTCTGATAATCAGTATTATGGTGGTCTA--------GAGCTGT----TTAGTCAGAGCAGAGACCTGTGAAGCAGACACAGT-----------GG--CTTTGGCATAATTTTATT-----AAAGCTGAGATAAGACTGGAATGTGGGTGAGCACACTGGTCCTCAGGTTCAATGGCCCAAGAGT---ACCCTTGGGCTAACCAGGGCTTGACTCAGCAGAGGGCTTGGCAAGAGGTGCTTTTGGTAGCTTCGTTCCCCGGGCTGCCA-------GGGTTCCACTT-GGGTTGAACAG----TCAGAA--ACCCATTCTGGGTTTCTCCTGTCTCTCCTAGGGACT-CC-------------CTGGATGGCCAGGGAGAAAGAAGCCAGTGGGCTAATGGGAG-TGCCCAAATGAACAGAGCCTCTATGAGG----CTCTACAACTTAGGTGTGACCGATTTGGT---------GACACTCATTTGCCATGCCACAGACGACATATCTCGAACTTCTATAGAGGCCTGAGGAGTCAGCCAATGTCTGTGG-ACAGCTGCTGACTGGCATCTGTATGCCCAGG--CCTGGGAT---------------GAC-------     
20 Phyllostomus_discolor-NC_040907.2-176047_176228           81.1%  26.7%    -------------------------------------------------CTGTGG-------------------------AGGAATCTCAG--CGTGTCTGTGCCTCGAAA--------------GTGCCCGACTGGGGGCATACCTGTGTGGTCGTGTGGTGGG-CAGAGAGGGTCTCGAATGTAGTGTCA--TCCAGTCTGAGACGAC-------------A---GTGTG-----------G-----------------------------------TGTGG----------GCGAGGTCC-CCCGTGGCTCTCGGGCCTCATGGCCCA--CACACACAGGGCCTCTG-TCAGGCACCTGCCGGGCCGCCGCGCTCATGGCTC----------CGGGCTGGTGTGCTGGCACCTGTCCCAGCCCAGGCCTGGGTCCCCGGCATGGGCTCTCGGGTCCTGGAGCGAGACAGTGGGGCCCTGCTGGGTGCCCATTGTGCCACAGCGCC----------GGGACTGGCGGTGGCTAGGAGCACAG-G-------ACAGAATCGAGCTTTCCCGGAGGCCCACTCTCTTTGGGGACGGGGACACGGGGGTGGCTGTGG---CCACCTGCCTCGTCGGTGATGCTCCCAATTCAGAGGGGGCCGCAGGGACCTGGCACCCACCCCAG---GGCCACCCA--GACTGTGTGGCCACATGAGGGACACCAGCCAGATGGCCT-GCAGGTCTGGCGGGCGCCGC--TGTCCAGGGTGCTGACCCGGGGTCTC-TCCTGGCTTGGAGACACCCTCACGCTGGTTCTGTCCGA--------------------CCCCCGGGCCGAAGAGCTGGACTCGACACTCGGG-----GTCTCAACTGGCACCTTCTCCGGTCCTGACTGTC-ACCCACTCCCAGTGACTCCCAGCTGCACAGCAC-CC--GAAGGCCTCAGGG--------CAGCC-------------GGCCCC---------TGGTCACCG----GACACCCTCGTC-CTTTGGTCTGTCCCCAGGCCTGA---GCCCTGTGGGGCAGGCAGGGCAGCCCCTTGGTCCTC--------------------------------AGTGT-------CCCTGGCGCCT----------CGGATGCTCCCTGGGAC-------AGTGAGGCTTGGGGGA-GGGCCAAGAACCGGGGGTGGGCCTGGGG----CCCGTGTAGGTGTGGCT-CGGGGGGGACGCAGGGGCACCCACAGGCCTTGCGCTGCA-G---------GAGGCGGACACGGACGACCGCCAGGGTGCGCTGGGCTTCGA-----------GGA----------------------------------------------------------     
21 Callorhinus_ursinus-NW_020313076.1-188247_188425          75.2%  25.0%    CTGAATGGA-----GACCAGGCAGCCACCC---CAGCCTGGACTCCTGGCTGTACCGCCCCGCACAGAACTGG-----GTGGGAGGCCAAA--TCACCCCGTGGGCTGGAC--------------ACTCAATGCAATGGGCATCTC----CGCCCAGCTCCAGCCACGCCC------------------------------------------------------------------------------T-------GGGGA--GGGCTGCCCGCCTGCCCTGTCCTGCCAGCTCTCAGACCC-AGGGCTGCCCTCAAACCGAGCTCCAGA--CACA-AGTGGTCTTTGT--CTGGTG--TCTTCTGGGCCCCAGCACATGTG---------------GC-------TCTGGTCCTGTCCCCG-------------CCTTGGCACAGATGCTGGGGTCCTGGAGTGAGGCTCGGGGGCCTTGCTGGGTACCCATCGCAGTGCCA--------------------------AGCTAGGAGCAGAT-G-------GTAGAGGTCAGCCTTCCCAGAGCAGTTCTCTCACTGGGCACAGGGACATGGGGGTGTCTGTGG---TCACCTGGTTCCCTGGTGATGCTCCTGGTTCAGAGGAGGCCTCAGGGACCTGGCACCTAGCCCCTA--GTCACCCCA--GATTGTGTCAGCACATGAGGAAAGACGATCCACATGGCGC-ACAGAGCAGGGAGTACTGC--TGTCCATGGTGCTGATCTGATGTCCA-TTCCTGCTGTGCCGTCCAACCT-----------------------------------------------------------------------------------------CCAGGCAGGTCCTGCTCAC---CCCCAACCTA-GCCC------------ACGAGCCC--AGACCACTCGGGGTCTGGAACAGCATCTC---C--TGTGGGGCTTTTCTGGCCCATTCCCAGG----GATTGCCACGGC-CCCAGGACACCTCAGGCTCCTCTGGGCAGCCCGGCCTGCAGTTGCTGGGT-CCCTTGTCCTCTGGGTCTGTCCCTGGCCTTGC------TGTTTGGTGT-------TCCCAGGGTCTGACACTTCAGTAGATGTTCCCTGAGTG-------GTGGGTTCATGAAGGA---------GTCTGGT---CGCACTG------------------GGGTCCCAACGGGTTCC-------TGCTGATGTTGTGTGAGCTGCC-CTGTCTGCAAGAGAAAGACAGTGGCCAGGT------CCT-CTCTCTCTCTCTGTTG------TGGAGACTGAAGCCAGGGCACTCTGT--ACCCTGGGGCCTTGA--------A---------     
22 Peromyscus_leucopus-NC_051064.1-175851_175911             78.6%  23.6%    -------------------------------------------------------------------------------------ACACCCTTGGTAGGTTGTATATGATTGGAG----------GCTTTAAGCTCCAGGCCTTGG-----------TTGGAGCTACTCCGTGTGG---TAGAACTCAGGAA-TTTGTGCTTTCCAGCCTATTGTGAGAGGTCAGGCCTCTGGGTACTAATTAGTTCCTGGGGTCCCTCTGGGTGATCTCAGGCCTACCTCCTTCATATTGCCTATAGGAAGC----TCTGGACAGAGACAAAAGACCATG--AGCTGAGAGGCTAACAG--CTGGGGTGTGTAGGTGGGATAGAGTTCCA-------------------GG-----GTTAGGTGTGGAAAGG---------------------AAGTTG-TGGGGCTGTGGTCCTGGAGAC--------------------------------------------------------------------------------------------ATG---------GGCCTCGTACCTCAGCTCACACAGT--CCAGACCCATTGG---TCTCTATTTG---TGGCAGTCAGCCAGCCACAGAGATTCCAAA------------CCCTGAAAGCC-TGATCTCCCTGCCCACGCAGGGTCCCATTAGGCCAGTTATGGTAGTCTCCATAAGCACTTTGAGCCCCAGGA--TGGAAATGCTGCCTTCTACAATGCTC----------AGGTCACTCTGATAATCAGTATTATGGTGGTCTG--------GAACTGT----TTAATTGGAGCAGAAACCTGTGAAGTGGATACAGT-----------GG--CTTTGACATCATTA----------AATCTAAGATAAGATTGGAATGTGGATCAGCACACCGGTCCTAAGGTTTAACGGCCCAAGATT---ACCCTTGGGCTAGCCGGGGCTCAGCTCAGCAGAGGGCTTGGCCAGAGGCTTTGGTAGCTTCT-----TCCCGTGCTGCCA-------GGGCTCCACGT-GGGTTAAACAG----TCAGAC--GCCCATCCCGG-TTCCTCCTGTCTTTCCTAGGGACC-CTCTTTG----GTCCATGGATGGCCAGCGGAGAAGCAGCCAG--------TGGGTT-AATATGAGTGCACAGAGCCTCCATGAGG----CCCTACAACTTTGGTGTGACAGATTTGGT---------G----------ACAATGCCACAGAGGACATGTCTAGAACTTCTGTAGAGGCCTGAGGAGTCAGCCAATGTCTGCGG-ACAGCTGCTGACTGGCATCTGTATGCCTGAG--TCTGGGAG---------------AACA------     
23 Jaculus_jaculus-NC_059106.1-171990_172115                 89.5%  34.5%    ------------TGGCCTTGCTA-----------------------TGGGGCATACAGAGTGGGCACTAGAGATTTGTTGCCCTCTGCCAGTAGGGCACATTACATGTTGAGGAGTGGATAGG---------AAGGAGCACAGTTG-GGCTGGAG---AGATGGTTCAGTGGTTAG-AAGTGTTTGCTGCTCATGCCTGGCAAC-CTAAG-------------TGTATA----------TCCTCA-G----------CACCCATGTGAAACTGGAAG--CCAGT---AG--TGCATGTCCATA-ACACCTGTGTGCCCATGGCAATGGGCAGCAAAGTTAGGAGACTCCT--GAAGCCCCTGGGCCAGCCTGGCATTTGCA--------------------------GTGGCAAAACGAGAGACCTTGTCTGAAACAAGGTGGAAGGCAACGATGGACATTCCAACATTGTC-----------------CTCTGACCTCCACATGTGCACTGTGA-CATGCATGCATGCATACACACACACACACACACACA-CACACACACACCGGC-CCTGG--GCCCCGTGTGCTGAGGATGGGATCTTGCAAGTGGTGG----------TGGTTGCCTTGCTCAC-----TGGCCTAGGGGGCCTTCAGGGGA-------CCCAGTACAATTCTGTGGCCTCCAAGTTGTGTGGCCATAGGAAAGG---CTG-TTCCCCAGGTGGTGCAGCCAGTGAGTACCAC--TGTCTTTGGTACTGGCCCTTGGTCTG-TCCCTCTTCCTTGAAGTGGGATTCTGG-------------------GCCTTCCCCTGTAGATATGG-------------------------------------AC--ATGAATTGTGGCCTGTTCCCTCAATGCCCATTCTAAGCTCCTGTGGC-AGCTTGGAGACAC--CCTGGGGTGAGCTACTGACAGCCTACCC----CTCCTGAGCCCATGGCTAGCCTGGGGAAAAGAAGCCAGAGGCAGAGCGGTCTTCTCAGTGCCCCATGCATGGAGCCTCCATGTGGCCCTACAACTGTG-GTATGACACATTAGGTGTCACCTCCACTTTTAGGAG-GCATTTCCCACACACAGAGAAAGGAATCTGGAACTTCTGTAGAGGCCTGGGGACTC-------AGCTGGT-------------------ATCTGTGGACACCTGC-TG----ATCAGGCACCTGTGTGCCCTGGCTTGGGG--GTGA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
24 Microtus_oregoni-NW_024543064.1-173642_173686             77.9%  23.6%    ---------------------------------GCT----------CAGAGCGCCCTGAGAGGAAAGAGG--------GGGGAAAACACTCTGGGTAGGTTGTGTGCTATTGGAG----------AGTTTAAGCTCCAGGCCTTGG-----------TTGGAGCTACTCCATGTAA---ATCACTCC---GG-AGTCTGCTTCCCAGCCCATTGTGAGAGGTCAGGCCTCTGGGTGCTGATTAGTTCCCGGGGTCTGTCTGGGTGATCTCAGACCTACCTCCTCCAAATTGCCTATAGGAAGGAAGCCTTGGACAGAGACGAAAGACCATG--AGCAGAGAGGCAAACAG--CTGGGGTGTGTGGGTGGGATGGAAAGGAA------------------------------------------------------------------GCTGTGGGGTTCTTGCCCCCGAGAC--------------------------------------------------------------------------------------------ATG---------GGCCTTGTACATCAGCTCACACAGC--TCAGACTCAGTAG---CCTTTATCATCTGCGGTGGTCAGCCAGCCACAGAGATCCCAAA------------CCTCC----------CTACTCACGCAGGGTCCCGTTAGGCCAAGCACCTCATGGTAGCCTCCGCAGGCACTTGGAACCCCAGGA--TGGGAATGATGCCCTCCGCAAGGCTC----------AGGTCACTCTGATAATCAGTGTTAGGATGGTCTG--------GATCTGT----TTAGTCAGAGCAGAGGCCTGTGAAGTGGATACAAT-----------GC---TGTGACATAATTTCATT-----AAGTCTAAAATAAGATGGGAATGAGGGCCAGTGCACTGGTCCTCAGCTTTAATGGCCCAAGAGT---ATCTTTGGGCTAACCAGGGCTCAACCCAGAAGAGGCTTGGCAAAAGGTTC---------------CTTTCCATGCTGCCA-------GGGCTCCACTT-GGGTTAAACAG----TCAGTA--TCAGACTGG--GTTCCTCCCATCTTTCCTAGGGAACCCTCTTCA----GTCCATGAATGGCCAGGGGAAAA--------------------GA-AGCCCAAATGTGCAGAGCCTCCATGAGG----CCCTACAACTGTGGTGTGGCAGATTTGGT---------GATG-CCGTTTGCCATGCCACACCGGACATATCTAGAACTCCTACAGAGGCCCGAGGAGTCAGCCAGTGTCGGCGG-ACAGCTGCTGACTGGCATCTGTTTACCCAGA--TCTGGGAT---------------GACG------     
25 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-141222_141331             92.1%  43.2%    ----------------TCCTGGAAGCTGCGGCTTGAACACGCACCTTAGTTGTGGCTCTGGGAAGCCCCTGCTCGTCCGCGCCTCTTGGGA--GGATTCT--GAACCTCTG-----------------------GGTACACAGCGC-CCCCTTCC-TGTGGTCCCTCT--GACCAG-CCCAGGCTTCGCCCT-GCACTGGCTCCAACCAGAACTTGAGAAAGCATAGGGGAGATCTCAAGCGGGGTGCAG-------GCAGGGTGGACTCCAGGGTA--GGCTCTGGAGGGAAGCCAGGACCT-G-----------GGACCCCAGCCCTTG--C-GGTCAAGGCCCACGG--CCCATG-------GTGGTCAGGCCAGCTG---------------------------------GAGATGGCCC--------------AGTCCCGAGCGCCTGGCCTAGAGCCCG---CGTG-----------------CACTGCCCTCTGCGGGGGCCCTGGGACAAAGGGAGGAGGGCTCCCTTCCTGC-------TTGGTGGCACACAGGCAGCA--GCCC--CACCCTGGACATGTGGCCAG-CATG---GGGGCAGAG--A---GG--CTAGCTCATGG-GGAGCAGCCACAGTGGAATGGGCCTCAGCCCTACCCAGCCCTGCCTAGCCCTGCCACGGTCCCTGGAGGGCGACCAGCCCAGTCA---AGG-GGGCCCAAGACCAGCAGGCCATGGGAGCTGC--TGTCCATGGTGTTGACCTGGCATTTG-TCACTGTTGGGCTATGGTGCCTCCATGGCTCGAGGAG-GGATCTGGGTGCTTTCCTGTGGGCCTGAATGTTGGAGACA------------------------------GCCGTTGTGGCCTGCT-CCCAC--TGCCACGCTGGGCTCCTCCCAGCCTCTGTTGGAGAC--CAC-GG-CGGCCTGCTGAGCACACAGCTCTTCT------GCCTGCTGAGGGCTCTGGGAGGAC----AG-------TGGCTTCATCTGCAAAGAGGCCTCTGGGCAG----------CCCATGACTGCTG-GGATGGCAGCCCAG-GCATTTCTGGGACATTCAACGGGCTTTTCCCAC-ATCATGGGGGAT-GGCCCTGATCTGCTGTGTGGGCCAAGGACAC-------AGCCAGT-------------------GTCTGTGGACATGAGC-CG----GCCAGACATCTGTGTGTCCAGGGCTAGGT--GGATGGCGCATAG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
   clustal                                                                                                                                                                                                              .                                                                                                                                                                                                         *.            .                                                                                                                                                                                                                                                                                         .                                                                             ..                         .    .        .   *      * *.                                                                                                                                                                                                   .