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PLCH2_human-child_3

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RNAcode could not find significant results in the alignment.

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CGTCCTCAGGGTTCCCTGGAGTTACACTCTGGTCTGGCCCATCCCGCTCCGCTCCGGGTTGGAGATTTCTTGCTGTGATCTGTCACGCTTTCCTGACCTGGGAGCCGGACATTGCCCTGCGCAGACAGAGCGGAGCAGCAGGGGTGGCGGAAGCCCCGGGGCTGTTCACAGCAGGAGCTTCCGAGGGGCATCCTGGGCAGGCCCCTTCAGCACTGGCTGGGGCAGGGTCTACAGCTCCCCAAACACAGCGCTAGCTCTGGGCCAGAGGGGCAGGGTCTCCAGCTCCCCAAACACAGCGCTAGCTCTGGGCCAGGGGCGGGGAGAGGAAAACGTGAAGGGGGACAGTGGCCACGGCTGCAGAAGAAGTGGCTCAGGCCAGACACCAGGAGGAACTCCTGGGTTTCCAGGGACAGTAGGAGCTTGCCTCCTGGTGGTTTGGAACCTGCTTGTTCTGCCCTGTGATTGGCATGGACACGTGGGGTGGGACATGGCATCGCTGCTGGGCAGACTGGGGACGGGTTGCTGGTTTTTGCCTCTGATAAACCGTGTGACCTCACACAAGGGACTGAGCCTCTCTGAGCCTCCATGGGCAAGAGGGATAGCATGGGGCGCTTTCACAGGGTGGCTGTGGGCATTCAGAGCAAGCCTGTCTGCAGTGGTCATGCCGTGCCTGGCCTGTGCAGCTGCTCCAGGGTGCCTGTCCCCTCCTCTGTCCCACCCCCAGTGGAGGTGCCCTCTCTGAATGGAGAATAGTGTGGCAGATGTAACCAGGGCTGCTGGGCAGACACTGTTTGTAGGATGGGCTGTATATTCAGGTCACTCCAGGTGCACCCACTCGCTGACCGCAGCCCCCATCCCAGGGCTCTCCTGGGCACGTTGTCCCTGGTTCCTGCCTGTCTGGCCTGCAGAGAGCTCCCTGGAGTCACTGCCCTGTGCTGGCCACTGGGCTCAGGATGCCTGCCTGCTGTGGACAGGGGCTGGCTGCTGCCGGGTGGCCCCA

Selection Arguments

Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.

Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.

Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.

Results

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Alignment Tree

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Reference sequence (1): Target
Identities normalised by aligned length.
Colored by: consensus/70%

                                                            cov    pid  1 [        .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         .         .         .         4         .         .         .         .         :         .         .         .         .         5         .         .         .         .         :         .         .         .         .         6         .         .         .         .         :         .         .         .         .         7         .         .         .         .         :         .         .         .         .         8         .         .         .         .         :         .         .         .         .         9         .         .         .         .         :         .         .         .         .         0         .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         .    ] 1375
 1 Target                                                100.0% 100.0%    --------------------------------------------------------------------------CGTCCTCAGGGTTCCCTGGAGTTACACTCTGGTCTG------GCCCATCCCGCTCCGCTCCGGGTTGGAGATTTCTTGCTGTGATCTGTCACGCTTTCCTGACCTGGGAGCCGGAC-ATTGCCCTGCGCAGACAGAGCGGAGCAGCAGGGGTGGCGGAA----GC-----------------CCCGGGGCTGTTCACAGCAGGAGCTTCCGAGGG-GCATCCTGGGCAGGCCCCT---TCAGCACTGGCTGGGGCAGGGTCTACAGCTCCCCAAACACAGCGCTAGCTCTGGGCCAGAGGGGCAGGGTCTCCAGCTCC-CCAA-----ACACAGCGCT-AGCTCTGGGCCAGGGGCGGGGAGAGGAAAACGTGAAGGGGGA---CAGTGGCCACGGCTGCAGAAGAAGTGGCTCAGGCCAGACACCAGGAGG----AAC------------------TCCTGGGTTTCCAGGGACAGTAGGAGCTTGCCTCCTGGTGGTT----TGGAACCTGCTTGTTCTGCCCTGTGATTGGCATGGACACGTG---------------------------------------------GGG----------TGGGACATGGCA---TCGCTGCTGG----GCAGACTGGGGACGGGTTGCTGGTTTTTGCCTCTGATAAACCGTGTGACCTCACACAAGGGACTGAGCCTCTCTGAGCCTCCATG-GGCAAGAGGGATAGCATG-GGGCGCTTTC---------ACAGGGTGGCTGTGGGCATTCAGAGCAAGCCTGTCTGCA--GT------------GGTCATGCCGTGCCTGGCCTGTGCAGCTGCTCCAGGGTGCCTGT---------C-CCCTCCTCTGTCCCACCC-CCAGTGGAGGTGCCCTCTCT------GAATGGAGAATAGTGTGGCAGATGTAACCAGGGCTGCTGGGCAGA---CACTGTTTGTAGGATGGGCTGTATATTC---AGGTCACTCCAGGTGCACCCACTCGCTGACCGCAGCCCCCATCCCAGG-GCTCTCCTG-GGCACGTTGTCCC---TGGT---------------------TC---CTG----CCTGTCTGGCCTGCAGAGAGCTCCCTGGAGTCACTGCCCTGTG------CTGGCCACTGGGCTCAGGATGCCTGCCTGCTGTGGACAGGG--GCTGGCT------------------------------------------GCTGCCGGGTGGCCCCA----------------------------------------     
 2 Trachypithecus_francoisi-NW_022681457.1-187129_188099  94.4%  81.1%    ----------------------------------------------------CTGCA----GTTGCT----GTGCATCCTCAGGGTTCCCTGGAGTCACACGCTGGCCCG------GTCCAGCCCGCTCCGCTCCGGGTTGGAGATTTCTTGCTGTGATCTGTCACGCTTTCCTGACCTAGGAGCCGGAC-ATTGCCCTGTGCAGACAGAGCAGAGTGGCAGGGGTGGCGGGG----G------------------CCCTGGGCTGTTCACAGCAGGAGCTTCCGAAGG-GCGTCCTGGGCAGGCACCT---TCAGCACTGGCTGGGGCAGGGTCTCCAGCTCCCCAAACACAGCGCTAGCTCTGGGCCAG-------------------------------------------------------GGGCAGGGAGAGGAAAAGGTGAAGGGGGA---CAGTGGCCACAGCTGCAGAAGGAGTGGCTCAGGCCGGACACCGGGAGG----AAATTCCTGGGCTTCCAGG-GACAGTAGGTTCCAGGGACAGTAGGAGCTTGCCTCCTGGTGGTT----TGGAACCTGGTTGTTCTGTCCTCTGATTGACGTGGACACGTG---------------------------------------------GGG----------TGGGACATGGCA---TCGCTGTGGG----GCAGACTGGGGATGGGTTGCTGGTTTTTGCCTCTGATGAACCTTGTGACCTCACACAAAAGACTGAGCCTCTCCGAGCCTCCATG-GGTGAGAGGACTAGCATG-GGCTGCTTTC---------ACAGGGTGGCTGGGAGCGTTCAGAGGAAGTGTGTCTGCAAAGT------------GGTTGTGCTGTGCCTGGCCCATGCCGCTGCTCCAGGGTGCCCGT---------C-CCCTCCTCTGCCCCACCC-CTGTCGGAGGTGCCCTCTCT------AAATGGAGGTCAGTGTGGCAGGTGTAACCAGGGCTGCTGGGGCAGACACTCTGTTTGTAGGATGGGCTGCATATTC---AGGTCACTCCAAGTGCACCCACTCGCTGACCGCGGCCCCCATCCCAGG-GCTCTCCTG-AGCACATTGTCCC---TG------------------------GTTCCTGCCTGTCTGGC----CTGCAGAGAGCTCCCTGGAGTCACTGCCCTGTG------CTGGCCACTGGGCTCAGGATGCCTGCCTGCTGTGGACAGGG--GCTGGCT------------------------------------------GCTGCCAGGTGGCCCCAAAGCCCCAGGTTC---------------------------     
 3 Callithrix_jacchus-NC_048389.1-175291_176221           91.7%  70.5%    --------------------------TGCTGCTTTCTCTGAGG-------GCCGGCA----ATTGCT----GTGCCTCTTCAGGGTTCCCTGGAGTCACAGGCTGGCCC-----------AGCCCATCCCGCTCTGGGTTGGAGATTTCTTGCTGTGATCTGTCATGCTTTCCTGACCTGGGAGCTGGGC-ATTGCCCTACACAGACAGAGCAGAGCGGCTGGGGTGGCGGGA----GC-----------------CCTAGGGCTGTTCACAGCAAGCGCTTCTGAAGG-GCGTCCTGGACAAGCCTCT---TCAGCACTGGGTGGAGCAGGGGCTCCAGCTCCCCGAGCACAGCCTAGCTTGG---------------------------------------------------------GCCAGGGGTGGGGAGAGGAAAAGGTGAAGCGGGA---CAGTGGCTGTGGTGGCAGCAGGAGTGGCTTGGGCTGGATACCAGGAGG----AACTTCC-----------------TAGGTCTCCAGGGAGAGTAGGAGCTTGCCTCCGGGTGGCT----TGGATCCTGGTCGTTCTGCTCTCTGACTGGCGTGGACATGTG---------------------------------------------GGG----------TGGGACATGGCA---TCACTGCTGG----GCAGACTTGGGCCAGGTTGCTGGTTTTTGCCTCTGATGAACTGTGTGACCTCACACAAGGGAC------TCTCAGAGCCTCCACA-GGTAAGAGGGATAGCACT-GGGTGCTTTC---------ACAGGGTGGCTGTGAGTGTTCAGGGCCAGTGTGTCTGCAAAGT------------GGTGGTGCCATGCCTCGCCCGTGCAGCTGCTCCAGGGTGCCTGT---------C-CCCTCTCCTGCCCTACCCCCAGGCAGAGGTGCCCTCTCT------GAATGGAGGACAGCATGGCAGGTGTGACCAGGCCTGCTGGGGCACACACTCTGTTTGTAGGATGGGTCACTCCAGA---TGTG-------------CCTGCTCACTGACCAAAGTCCTGATCCCAGG-GCTCTCCTG-GGCATGCTGTCCC---TG----------------------------GTTTCTGCCTGTCTGGCCTGCAGAGAGCTCCCTGGAGTCACTGCCCTGTGCT------GGCTGCTGGGCTCAGGACACCTGCCTGCTGTGGACAGAGGGGCTGGCT------------------------------------------GCTGCCACATGGCCCTGAAGCCGTAAGGTCCGGGAGACCCAGC-------ACACCT-     
 4 Rhinopithecus_roxellana-NC_044560.1-187113_187855      93.4%  70.1%    ----------------------------------------GGG-------ACCTGCA----GTTGCT----GTGCATCCTCAGGGTTCCCTGGAGTCACATGCTGGCCCG------GTCCAGCCCGCTCCGCTCCGGGTTGGAGATTTCTTGCTGTGATCTGTCACGCTTTCCTGACCTAGGAGCCGGAC-ATTGCCCTGTGCAGACAGAGGAGAGTGGCAGGGGTG----------G------------------CCCCGGGCTGTTCACAGCAGGAGCTTCCGAAGG-GCGTCCTGGGCAGGCACCT---TCAGCACTGGCTGGGGCAGGGTCTCCAGCTCCCCAAACACAGTGCTAGCTCTGGGCCAG-------------------------------------------------------GGGCAGGGAGAGGAAAAGGTGAAGGGGGA---CAGTGGCCACAGCTGCAGAAGGAGTGGCTCAGGCCGGACACCGGGAGG----AAATTCCTGGGCTTCCAGG-GACAGTAGGTTCCAGGGACAGTAGGAGCTTGCCTCCTGGTGGTT----TGGAACCTGGTTGTTCTGTCCTCTGATTGACGTGGACACGTG---------------------------------------------GGG----------TGGGACATGGCA---TCGCTGTGGG----GCAGACTGGGGATGGGTTGCTGGTTTTTGCCTCTGATGAACCTTGTGACCTCACACAAAAGACTGAGCCTCTCTGAGCCTCCACG-GGTGAGAGGAATAGCATG-GGGTGCTTTC---------ACAGGGTGGCTGGGAGCGTTCAGAGCAAGTGTGTCTGCAAAGT------------GGTTGTGCCGTGCCTGGCCCGTGCCGCTGCTCCAGGGTGCCCAT---------C-CCCTCCTCTGCCCCACCC-CTGTCGGAGGTGCCCTCTCT------AAATGGAGGCCAGTGTGGCAGGTGTAACCAGGGTTGCTGGGGTCTCTAAATGGAGGTCAGTGTGGCAGGTGTAACC---AGGGCTGCTGGGGTCTCTAAA-TGGAGGT-------CAGTGTGGCAGG-TGTAACCAG-GGCTGCTGGGGTC---TCTA---------------------AATGGAGGTCAGTGTGGCAGGTGTAACCAGGGCT-GCTGGGGTCTCTAAATGGAGGTCAGTGTGGCAGGTGTAACCAGGGCTGCTGGGGTCTCTAAATGGAG--GTT--AG------------------------------------------TGTGGCAGGTGTAACCAGGGACTGCTGGGG---------------------------     
 5 Balaenoptera_musculus-NC_045785.1-158165_158853        83.7%  41.6%    ---------------------------------------------GGGCAGCGGCAG----CC----------------TCTACCTGAGGGAC-----------CTGCCCTTGTTTGCTGAACCCTGGC--ACCTGTGTGGGCAAGTTCTTGCTCAAATCTGTCATGCTGTCTTGATCTGGGGGCCAGGGCACTGCCCCGGGCAGACAGCACAGATCAGCAGGGGTGGCAGGAGCTGCCCGGCAC-----------CAAG-------------------------GGG--CTTGGATGTAGAGGGGCCGGGTGCTTGGTGTCAGGGCCCATCCTGCAGGGACGGGATGGGGC-AGAGCTTCTCCA---------AAGAGGGTCTCTGTCTGT-CCCCAGTGCAGCACTTGCTCTGGACCAGGG----GTGGGAGTGGCAGGGAGGGAAGGGGGGCCA-G---CACCACGGCTGCAGCAGGAGTGACTTGGGCCAGACAGCAAAAGCACT-----TCCTGATTAAGGG------CTGGGATTCCAAGGACAGTAGGAGC-TGCCTTCTGGTGATTTGTCTGGATCCTGGTTGTTCTGGACCTGATTTGTTCTGCCCTCTGATTGGCATGGACACGGGGGAGGGCCTGGGGAGC-----------CTTGGAAAGGCAGGGGC------------ATTACTGCCAGG----CGGACTGAGGATGGGTC-CCCGCCAGTGCCTCTGATGAGCTGTGTGACCTCAAGCAAGGCACTGACCCTCTCTGAGCCT-------------------CTCATGGAGTAGAGGG-----------ACAGCATGGGGTTGCCTTCATAGGGTGGCCTTAAGAAGA--------------GTGCGCCTGGCCCGT-------GTGGCTGCTCCAGGAATGCCTGTCGCCTCCTGCC---------------TCCCAAGATGAGTTGCCCTTTAT------GAATTCAGGACGGTGTGGTGGGTGTAGACGGGGCTGGTGGTGCAGACGTTCCCAGTTTGGCCGGGTGCTCAGGCCACC-CCCG--GTGCA------CCCACTCCCTGACCGCAGCCCCCAGCGC-----AGG-GCAGGGTTCCCATGGGTGGGTGGTCCCTGG--GGAGGGCCTGGCCCAGCACATTCCTGCCAATCTGGCCTGCAGAGAACTCTGTGGAATCAACAGTCCTGGGCCGGCCCGGCC---TCGTTCAGAACCGCTGGGTGCAGGATGCCTGCTT----------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 6 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-168345_169059       84.8%  42.2%    ---------------------------------------------------------------------------------------AGCTGT-----------TTGCTCTCAGGTTCTGGCCCTGGCA--CCCAGGGTGGGAGATTTCTTGCTCAGAATTTTCATGCTGTCCTGACCTGGGGGGCTGGGCATTGCCCTGGGAAGACAGCACAGATCAGCAGGGATGGCAGGAGCCCTCCCAGGC-----------TGCC-AGGGCTCCCTGGCCCCAA-----GGAGTTTGGGCACAAGAAGGGGCCGGGTGCCTGGTGTCGGGGCCCGTCCTGCAGGGACAGGAGCAGGC-AGAGCTTCTCCC--------AGGCAGGGTCTCTGTCTGC-TCCCAACGCAGCACTTGCTCTGGGCCAGGG----GTGGGGAGAGTCCAAAAGGGACT-----------------CTTGGGAAGTAGGGGTGACTTGGGCCAGACAGCAAGAGAACT-----TCCTGAGTAAGGG------CTGGGATTCCAAGGAGAGTAGGAGCTTGCCTTCTGGCAACTTGTTTGGATCCTGGTTGTTCTGGACCCAATTTGTTCTGCCCTCTGGTGGGCATGGACACAGGGGAGGGACGGGGGAGC-----------CTTGGAGAGCACGTGTAGGGAGCAGGGGCATCGTTGCTGGG----CGGACTGAAGATGGGTC-CCTGGTGGTGCCTCTGAGGAGCTGTGT-----------GACCACCGACCCTGTCTGAGCCT-------------------CTCGTGGAAGAGTGGG-----------ACAGCCTGGGGTCACCTTCGTAGGGCAGCGGTGAGCAGA--------------GTGTGCCTGGCCCGT-------GTGGCTGCTCCAGGAACGCCTGTTCCCTCCTGCCC---------TCCCCTCCCCGGCTGAGATGCCCTTTAT------GAATGGAGGACAGTGTGGCAGGTGTAGACGGGCT-GGTGGTGCAGACACTCCCTGCTTGGCTGTGTGTTTGGGTCACCCCCAG--GTGTC------ACCACTCCCTGGCCGCAGCCCCCACCCGAGTGCGGGGCAGGGCTCCCACGG-GTGAGTGGTCCCTGG--GGAGGGCCTGGCCCAGCACGTTCCTGCCTGTCTGGCCTGCAGAGAGCTCCATGGAATCAATAGCCCTGGGCTGGCCCAGCC---TCAGTGAGGACCCCTGGGTACAGGAAACCTACC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 7 Equus_asinus-NC_052181.1-169828_170848                 85.0%  42.3%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTCCAGCCCTGCCA--CCCAGGGTTGGCAGATTTCTTGCTCAGAATGCCATGCTGTCCTGACATGGGGGCCCGGGCACTGCCCTGGGCAGACAGTACCGATCAGCAGGGGTGGCAGGAGCCCTCCGAGGC-----------TGCCCAGGTCTCCCTGGTACCAA-----GGAGTTTGGGCGCTAGAAGGGGCTGGGTGCCTGGTGTCTGGGCCCATCCTGCAGGGACCTGATGGGGC-AGAGCTTCTCCC--------AGGCAGAGTCTCTGTCTGC-TCCCAACGCAACACTTGCTCCGGGCCAGGG----CTGGGAAGAGTCAGAGGGGGAAGGAAGCCA-G---CACCGTGGCTGCAGCAGGAGTGACTTGGGCCAGACACCAGAAGAACT-----TCCTGAGCAAGGG------CTGGGATCCCAAAGAGAGTAGGAACTTGCCTTCTGGTGACTTGTCTGGATCCTGGCTGTTCTGGACCCAGTTTATTCTGCCCTCTGATTGGCGTGGACGCAGGGGAGGGGCTGGGGAGC-----------CTGGGAGAGCATGCATAGGGAGCAGGGGCGTCACTGCTGGG----TGGACTGAGGACGGGTC-CCTGGTGACGCGTCTGATGAGCTGTGT-----------CACCACCCACCCTATCTGAGCCT-------------------CTCGTGGAAGAGCTGG-----------GCAGCCTGGGGTCACCTTCATAGGGTGGCGGTGAGCAGA--------------GTGTGCCTGGCCTGT-------GTGGCTGCTCCGGGAACGCCTGTTTGCTCCCACCC---------TCCCCTCCCCAGCTGAGATGCCCTTTAT------GAATGGAGGACAGTGTGGCAGGTGTAGATGGGCT-GGTGGTGCAGACACTCCTGGCGTGGCTGTGTGCTCGGGCCACCCCCAG--GTATA------CTCACTCCCTGACCCCAGCCCCCACCCCAGTGCGGAGCAGGGCTCCCATGTGGGGGGTGGTCCCTGG--GGAGGGCCTGGCCCAGGACGTTCCTGCCTGTCTGGCCTGCAGAGACCTCCATGGAATCAATAGCCCTGGGCCGGCCCAGCC---TCAGTCAGAGCCCCTGAGTGCAGGACCTCTGCCTG---------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 8 Castor_canadensis-NW_017871110.1-156377_156834         90.6%  46.7%    ---------------------------------------GGAG-------TTCTCCA----TAAGGA----GCCCGTGCCCTGCTTTGGTCAGCACCATGGACAGGGCAGCTGTTTTCCCTCCAGGGGCCTGCATTGTTTGCTTAGTGTCTTCAGGGTTCTGCCCCACTTTCCTGACCTGTGAGCCAGGC-TTTGCCCTGGGCAGGCAG------------------------------------------------CATGGAGTCCCC-TGAGGCTGACTGGGGCTGCTGGGGTGTGAGAAGGGACTGTTATCAGGGCTTCCTGAATTGGTACCTTTCATGCTGTGCAGGACAGAGCTTCTCCCAGACAG--------GGTCTCTGTCTGC-CCCA-----AACACAGTGG-TAGCTCTGGACCAGGGCTGGAGAGGCTGAGAGTGAAGGGGGT---CTCTGGCTGTAGCAACAGCAAGAGTGACTTGGGCTGGAAAGCAGGGAG----AACTTTCTGATCAAGG-------GCTGGGGTTCCAAGAGAGTAAGAGATTGCCTTCTGGCCATTTGTTTAGATTCTGGTTGTTCTGG-GCTCCACTAGTTCTGC----------------------------------------------------------------TGCAGTTGGCAT---GGATGGTGGG----GAGGAGTTGCGGGAGCTT----------------GGAGGGCTGTGTGACCTC----ACACGGAGGACCCTCTTTGAGCCTCC-AGAGACCAGAAAGACAGTGTGGGGCCACTTCA---------TAGAGCAGTTTGTGAACATTCAAAGCCAGTATGCCTGCAAAGT------------GTCA-CTCCATGCCTGGCCTGTGCGGCTGCTCCAGGAATGTCTGTTCCCTTCCT-GCAGTCCCTCCTCCCTTCTCCAGCTGAGATGCCCTTTAT------GAATGGAGGACAGTGTGGCTGGTGTGTCCAGGGCTGCCAATGCACACTCCATCGGGCCCTGTGGGACCCAGTGACT---TCGT--CTTCAGGTGTTCTCACTCCCTAACCACAGCCTCCACCCCAGG-GCAGCAGCAAGGCTGCTTAAGTA---CATTGCTTG--GGGACGGCCTGGCCAGTATTTTCCTTCTTGTCTGACCTGCAGAGAGCTCCATGAAGTCAGTGCCCTAGGTT------GGCCACTGGGCTCAGGACACCTGCTTGCTGGTGGGCAACAGTGA------------------------------------------------T------------------------------------------------------     
 9 Microcebus_murinus-NC_033661.1-160906_161617           84.1%  40.9%    --------------------AGTGGCTTCGGTCAGCACCATGGACAGGGCAGCTGCC----CTTACT----CCCAGGGCCGCTGTTTGCTGGGGTTCC-CAAGTAA------------------AGGCTGCCGGCCTGGGGTT-------GGAGAGTTCCTGCCACACTTTCCTGCCTGGGGGGCCGGGC-ATGGCCCTGGCAG-ACCGTGCGGAGTGGTGGGGTGGACGGAG-----------------------CCCTCGGGC-TGCCCGGCTGCCCCGCAAAGAG---CTCGGGGGAGCAGGGCCG-TTCCGGGGCTTCCTGAGCAGGAGTCTTCAGACTGGGCGGGCA-GAG-CCTCTCCG--------GGGCAGGATCTCGTCCG-C-CCCAAACAGAGCGCTGGCTCTGGGCCAGAGGGGAGGAGACGCTAACAGAGGGTGAAGGGGGC---TAGAGGCTGCAGCTGCAGCAGGAGTGACTTGGGCCAGATACCAGGAAG----AACTTCCTGGCGAGGGGCT------GAGTTTCCTCG-GAGGTGGGAGCTCGCCTTCTGGCGATTTGTTTGGATCCTGGCTGTTCTGGACCCAGTTCTGCCCTCTGATTGGTGTCGCCCCGGGG---A-GG----------GG-----------CTGTGCCAGCACGTGGGGACATGGGTT---TCACCACTGG----GTGGACTGGGGCCAGGGCCACGGTGGG--GCCTATGACGCCTGTGTGACCCCGA-GAAGGCGCTGACCCTCTCTGAGCCCCCA-CGGTCAGGAGGGGTGGC----------------------------------GTGGGGAGCCTCCAAAGCGCGT--GTC----------------------CGTGAAGCGCCCCGCTGGCCGCTGCTCCAGGAAG-G------------------CCGGCCCCCCCACACCCTGCTGAGCTGCCCTTTAT------GAATGGCGGGCGGCGTGGCGGTA-------------------CAGACTCTTGGCCC------TC-TTAGGACAGG------CTGTGTCTGGGTCACCCTGGTGCCCCA----CCCCCTGACCACAGC-C-CCACCCG--------------------------------GGCCTGGCCCGGCACGTCCCTCCCCTCCTGGCCTGTAGCGAGCTCCGTGGAGCCACCACGCTGGGCT------GGCCACTGGGCTCAGGACGCCTGCCTGCCTGCGGCTGGGCAGGGGCTGGCCGCTGCCAGGGCCCCCAGGCCCCGGCTT---------------------------------------------------------------------     
10 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-161063_161769        85.2%  39.4%    ---------------------------TCATTCAGCACCATGGACAGGGCAAGTACCGGCTTTTCCCCAGGGACTGCCCCGTTGTTTGCTAAGGTTCC-CTGGAGTGGAA----TGGGCCGGCCCGCCTGGCAACCCTGGATTGGAGATGTTCTCATGTCTGCCACACTTTTCTGACTGGGAAGCCAGGA-ATTGCCCTGGGTAGACAGAGCAGAATGG----------------------------------------CAGGGG-CGGCTGGGGCTGCTTCAGAGAT---TCTGAGGGAGAAGGGGCTGTTCCGCGGCTTCCTGAGCAGAAGTCTTCAGACTGGGGGAGCA-GAG-CTTCTCAA--------TTT--------------------------AGCGCTAGCTCTGGGCCAGCAGT------GGGGAGAGACAGAGGGTCAGGGGC---TGGCGACTGCAGCAGCAGCAGAAGTCACTTGGGTCAGATATCAGGAAG----AACTTTCTGATTCAGGGCT------GGGTTTCCAGGGAGAGTAGGTACTTGCCTTCTGGCAATGTGTTTGGATCCTAGTTGTTCTGGACCCAGTTTGTTCTGCCCTCTGGTTGGGTCACACTGGGGA-GGGGCTAGGGGAGC-----------CTTGAAGAACACGTGGGGGCATGGGCA---TCGCTGCTGG----GCAGACTGGGGACGGGTCATGGCAGTG--CCTCAGAGGAGCCCTGTGACCCAGT-GAGCCTCCATGAGAGGGATGGCGTGGGCCGCCTCCGGAGGGCAGCT----------------------------------GTGAGCCTTCAAAAGGAGTTGT-CTGC----------------------GAAGCACCGTGCCCCTGGGCGCTGCTCCAGGGATGCCAG------------GTCCCTCCCTTCTCCCTCCCCACAGAGATGCCCTTTAT------GAATGGAGGACAGCATGGCCAGTCCAGACAAGGTCACCAGGGCAGACACTCTGTTCAGCCCTTGCAGGATGGGCT------GTGTGTCCGAGTCACCTGGTGTACCCA----TTCTCTGACCACAGC-CCCACCTTG--------------------------------GGCCTGGCCTAGCATG--------TTCCTTCCCTGCCAAGAGCTCTGTGGGGTCACTGCCTTAGGCT------GCCCACTGAGCTTGGGATGCCTGTCTTCTGACTGTTTGAGAGCTGGCTGCTGCCAGAGT----------------------------------------------------------------------------------------     
11 Lipotes_vexillifer-NW_006774135.1-171237_171654        85.6%  30.9%    ----------------------------------------------------------------------------------------------------------GCCCTTGTTTGCTGAGCCCTGGC--ACCTGTGTGGGCAAATTCTTGCTCAGATCTGTTGTGCTGTCTTGATCTGGGGGCCAGGGCGCTGCTCCGGGCAGATAGCAGAGATCGGCTGGGCTGGCAGGAGCCCTCTGAGGC-----------TGCCCGGAGCTGCCCGGCACCGA-----GGAG--CTTGGATGGAGAGGGGCGGGGTGCTTGGTGTCGGGGCCCGTCCTGCAGGGACAGGATGGGGC-AGAGCTTCTCCA---------AAGAGGGTCTCTGTCTGT-CCCCAATGCAGCAGTTGCTCCGGACCAGGG----GTGGGAGTGGCAGGGAGGGAAGGGGGGCCA-G---CGCCACAGCTGCAGCAGGAGTGACTTGGGCCAGACAGCAAAAGAACT-----TCCTGCTTAAGGG------CTGGGATTCCAAGGACAGTAGGAGC-TGCCTTCTGGTGACTTGTCTGGATCCTGGTTGTTCTGGACCCGATTTGTTCTGCCCTCTGATTGGCATGGACACGGGGGAGGGCCTGGGGAGC-----------CTTGGAAAGCATGTGTAGCAGGCAGGGGCGTTACTGCCAGG----CGGACTGAGGGTGGGTC-CCCGCCGGTGCCTCTGATGAGCTGTGTGACCTCAAGCAAGGCACTGACCCTCTCTGAGCCT-------------------TTCATGGAGAAGAGGA-----------ACAGCATGGGGTTGCCTTCACAGGGTGGCCTTAAGAAGG--------------GTGCGCCTGGCCCGT-------GTGGCTGCTCCAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN--NNNNN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------------NNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
12 Odocoileus_virginianus-NW_018338731.1-175875_176382    83.6%  41.8%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCAAATCTGTCATGCTGTGTTGACCCAGGGGCCTGGGCACTGCCCCGGGCAGACAGCCCAGGCCAGCAGGGGTGGCAGGAGTCCTCTGAGGC-----------TGCCCGGAGCTTCCTGGAACAAG-----GAACTT---GAGTGTAGAGGGGCCAAGTGCTGGGTGTCGGGGCCTATCCTGCAGGGATGGGATGGACA-GAACTTC--TCC--------AAAGAGGGTCTCTGTGTGT-CCCCAGTGCAGCACTTGGTCTGGACCAGGG----GTGGGAGAGGCAGGGAGGG-AAGGGGTCCA-G---CCCCACGGCTGCAGCAGGAGTGACTCTGGCCAGACAACACAAGAACTGAGATTCTAAGTTAAGGG------CTGGGATTCCAAGGACAGCAGGAAC-AGCCTTCTGGTGACTTGTCTGGAT-CCGGTTGTTCTAGACCCAGTTTGTTCTGCCCTCTGATTGGCATGGGCACGAGGGAGGGCCGGGTGGGGGG----AGGGCCTTGGAGAGCCTGTGTAGAAGGCAGGGGC-----TTTATTGCCAGTGGACTGAGCATGGGTC-CCTGGTGGTGGCTCTGATGAGCTGTGTGACCTCAAGCAAGGCACTGGCCCTCTCTGAGCCT-------------------CTCATGGAAGAGAAGG-----------ACAGCATGGGATTGCCCGCATAGGGTGGGCTTGAGAAGA--------------GTGTGCCTGGTGCCTGGCCTATGTGGCTGCTCCAGGATTGCCTGTCCCCTCTCCTGTTCCTCCCCCCACTCCCCCGAGCTGAGTTACCTTTTAT------GAGTGGAGGACAGTGTGGCTGGTGGTACAGATGC-GATGGTGGTACAGTTCCCGGTCTGGCTGCATGCTCATGCCACCCC-GG--GAGCA------CCCACTCCCTGACCACAGCCCCCA------GTGCAGGGCAGGGCTCCCATGAGTGAGTGGTCCCTGG--GGAGGGCCTGACCCAGCGTGTTCCTGCCAGTCTGACCTGCAGGGAGCTCTGGCCTGGCCCA-----------------GCC---TCCTTCAGAGCCTCTGGGTACAGGGTGCCCGCCTACAGACT-----------------------GTGTGG------------GCATGGCTGCTGCCA---------------------CGT-------------------     
13 Hipposideros_armiger-NW_017731634.1-158574_158973      84.6%  38.4%    -----------------------------------------------------------------------------------------GTTT-----------GCTGAGCCCTCGAGGTTCTGGCCCAGCTCCCAGGAGGGAGATTTCTTGCTCAGATCTGTCACGCTGTCCTGACCTGAGGGCCTGGGCACCGTCCTGGACAG--AGCACAGATCGGCACGGGTGGCAGGAGCTCTCTGAGGC-----------TGCCCAGGGCTGCCCAGCACCAA-----GGAACTTGGGCACAAGCAGGGGCCGGGTGCGTCAAC-----GCTGGTCCTGCAGGGACCAGATGGCTG-GAGGTT--CCCA--------AGGCCGGGTCTCCGTCCGC-CCCCAGGGCAGCACCTGCTCTGGGCCAGGG----CTGGGGAGGGTCAGCGAGAGAAGGAGCCGGCG--------------TCGCAGGAGCGAT--GGGCCGGAC--------A--GCAGAGCTTCCCGTCGGGG------GCTGGGGTGCAAGGAGCGTAGGAGCTTGCCTCCTGGTGACGTGTCTGGACCCTGGCTGTCCTGCACCCGGTTTCTTCTGCCCTCTGGTTGACGTGGACACAGGCGAGGGGCCGGGAGCCTT------------GGCGAGCACGTTCAGGGAGCAGGGGTGTCACTGCTGAG----CA---GACAGGTGGTGGTCCTGGCAGTGCTGCTGACAAACTGTGTGACCTCAAGCAGGGCACCAACCCGCTCTGAGCCT-------------------CTTATGAAAGGGGGAC-----------AGCACGGGGCG---CCTTCACAGGGTGGCTGTGAGCATT--------------CAAAGTGAGT------------------GCGCCTGGCC----------CATGCGGCTGGCCCTCCCGCCTGTCCCCTCCCGAGTTGCCCTTCAT------GAATGGAGGACAGTGTGGCAGGTGTGCAGGGGCT-GGTGGTGCAGACACTCTG-GCTTGGCTGTGTGTTCCTGCCACCCCCAA--GGGCA------CCAACTCCCGGTGCACAGCCTCCACCGCTGT-TGGGGACTGGGCTCCCGTGGGCGGGTGGCCCCTGG--GCAGGG----------------CCTGTCTGGCCGACTTGCAGGGAGCTCTGTGGAGTCAACAGCCTCAGGCTGGCCCAGAC---CTCGCAGGGACCGGCTGCTGCCATGTGGCCCCGAGGGCCCT-----------------------GGGTCC-------------GGGGAGACCTGACA---------------------CACCCAGG--------------     
14 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-128228_128391          81.3%  29.0%    ------------------------------------CACATCCTCAGG--------G----CT----------------CCTGAGTCA--ACG-----------CTGTGGCTAGCCTGGCCGGCCCTGGCACCCTGGGTTTGAGATTTCTTGCTGCGATCTGTCACGCTTTTCTGGCCTGGGAGCCAGGCATTGC-CCCGGACAGCCGGTGCAGCGCAGCGATGGCGACAG-------------------------TCCC--------------------------------------------------------------CAGGCTGCCCCAGCAGAGAGCTTCTGCGG-------GTGTCAT--------GA-----GCGGGCGTCTTCAGCCCTGGGTGGTGCTAGCTCTGGCCCGGG-----TTGGGGAGAGGCAGAAGGTGAAGTGGAG---CAGCAGTCCCAGCTGCAGCAGAAGTGACTTGGGCCTGACATTAAGA----AGAACTTCCTGATTAAGGG------CTGGGTTTCCAAGGAG---AGGAGCAAGCCTTCTGGTGATGTGTTCAGATCTTGGTCGTTCTGGATCCACTTTGCTCTGCCCTGATTGATGTGGATCCTGGGGAGTTGGG--GGGGC-------------CTTGGAGACCACATGGGAGAG-CATGGGCATCACTCCTGGGCAGGCTGGA---GGCAGGGCC-----------------CTCTGATGTGTGATCACACACAAGGAACCAGCCCTCTTGGATGGCAAGGGGTGCCTCGTGGGCAGCTGTGGACATGCAGAGCACCTGCCCCCTCCCTGTGCCATGCCCTTAGTGAGTGAAGGATGGCATGGCGGGTGCAGACAGGGCTGCAGGGCCTCTGGCATGGGCCACGTGCTCTGGTCACTCCGAGTGCCCCACTCC------TGGATCCGCCCCAACCTGGGCAGGACAGGGCCCCCTTGCAGAGAGCTCCTGGGGC----------CCTGCCCTGGGCTGCCCAGGCTCA--GGACACCTGCCTGCTATGGGCAGGGCTGG--CTGTGGC--TAGGCAGCCCGATGCCCCAGGTTCT----------GGGGA----ACTGCCATGCCTGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNN---NNNNNN--NNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------------------------NNNN-------------NNN-NNNNNNNN------------------------N---N----------------     
15 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-227998_228113    87.9%  40.0%    -----------------------------------------------------------------------------------CTTCAGTCAGCACCA--------------------------------------------------------CGGACAGGGCGGTTGTTTGTGGTCT---GGCCAGGC-AGTCCCTGGCACGCTGGGTTGGAGATTT----CCTGTTCAGATCTGTCACACTTCCTGACCTGGGAGCTGGGCATTGCCCCAGCAAACAGTGTGGAACAGCTGGCTGGC----AGGAGCCCTGGGGGCTGCCTGCAGCAGGGAGCCTGTGAGGGAGAAGGG-GTGGTCCACGG---------GGCTGCCCGAGCAGAGCGG-GCAT-----CTTCAGTGCTGGGTCTAGGCCAGGGCTGGGGAGAGGCTGAGAGTGAACGGGGC---TGGTGGCTGGGCCTGCAGCAGGAGTGGCT--TGGCCATCAGCAGCAAG----AACTTCCTGGTGAAGGGCT-------GGGTTTCCAAGGAGGAGGGGGCTTGCCTTCTCGAGATTTGCTTGGATCCCGGTTGTTCTGGACCCGACTTGCTTTGCCCTCTGATTGGCGTGGATGCCGGGGAGGGGATGGGGAGC-----------CTTGG----------AGAGCATGTCGG---GGAGCATGCA----GCAGACTGGGGACGGGCCCCTGGGTGGGTCCTTCGATGAGCTGTGTTACCTTGCTCAGGGAACCCACCCTCCCTAAGCCTACATG-GCC-----------------------TCC---------ACAGGGCAGCTGTGAGCATTCGAAGCGAGTGTGTCTGCAAAGT------------GCCTGTACCCTTGTGGCCGCCTGTCT---CCTCCTCTCCTCCTGT--------------CCCGCCTGTCTCCTCCTGGCTGAGATGCTCTTTAC------GAGTGGAGGACACTGTGGCCGGTGTAGACAGGGCTGCCAGTGTAGATGGGGCTGCATGTGCAGCCAGTCCACTCAGCCCTTGTAGGACTGAATGGG--TGTTTGTGTTGCTCCAGGTACACCCCAGG-ACAGGGCAGGACCCCCATGGGTGGGCTGGCCCTGA--GGAGGGCCAGGCTCAGCGTGTTCCTGCCTGTCTGGCCTGTAGGGAGCTCCACGAAGCTGATGCCCTGGGCT------GGCCACTGGGCTTGGGATGCCACCTACTGACCAGGCAAG-GGCTGGCT------------------------------------------GCTGCCAGGTGGCCCCA----------------------------------------     
16 Lemur_catta-NC_059130.1-161977_162362                  82.9%  38.5%    -----------------------------------------------------------------CA----GGGCTTGCCGTTGTTTGCTGGGGTTCC-GGCGTCAAAGG----CTGCCGCGCCGGCACTGGCACCTGGGGTT-------GGAGAGTTGCTGCCACACTTTCCCGACTGGGGCTGGGCAT----GGCCTGGCAG---ACAGGGCAGCACGGGGGTGGACAGAG-----------------------CCCTGGGGG-TGCCCGGCTGCCCCACAAGGAG---CTCGGGGGAGCAGGGCTGCTCCTGGGGCTTCCTGAGCAGGAGTCTTCAGACTGGGTGGGCA-GAG-CCTCTCTG--------GGGCAGGGTCTCTGTCCGC-CCCAGACACAGCGCTGGCTGTGGGCCACAGTG------GGGGAGACAGAGGATAAAAGGGGC---CGGAGGCTGCAGCTGCAGCAGGAGTGACTTGGGCCAGATACCAGGAAG----AACTTCCTGGTGAGGGGCT------GGGTTTCCGCG-GGGGTGGGAGCTCGCCTTCTGGTGATTTGTCTGGATCCTGGTTGTTCTGGGCCCAGTTGTGCCCTCTGATTGGAGTCACCCCGGGG-----AG----------GG-----------CTGTGCCAGCACGTGGGGACATGAGCG---TCGCTGCTGG----GCAGACTGGGGCCGGGGCCACAGTGGG--GCCTGCGATGCCTGTGTGACTCCGA-GAAGGCACCGACGCTCTCTGAGCCCCCA-CGGGCGGGAGGGGCAGC----------------------------------GTGGGGCGGCTGCGAGTCTCCA--AAG----------------------CGCGTGTCTGTGAAGTGCCCTC------------------------------------------CCCGCCCTCCCGAGCTGCCCT-TAT------GAATGGAGG-CCGCGTGGCCGGG-------------------CAGACTGGC--CCT------CG-TAGGACGGCT------GCGTGTCTGGGTCACCCTGGTGCACCC----ACCCC----CCGACC-A-CAGCCCC--------------------------------ACCCAGGCCCGGCACGTTGCTCCCCTCCTGGCCTGCAGAGAGCTCCGTGGAGCCACCGCCCTGGGCT------GGCCCCCGGGCCCAGGACGCCTGCCTGCCACCGGGCAGGGCTGGCCGCTTCCTGGGGCCCTGACACACCGGGGGTCTGCAGCCGACGAGGGCAGCGGCCTGGTCCCGGGAGGGCAGAGGCTGAGAGCCCCCCGCCCCCGCCCCCCGG     
17 Camelus_bactrianus-NW_011514262.1-161089_161383        82.7%  37.2%    ----------------------------------GCACCATGGACAGGGCAGCATCC----AC----------------TCTCCCTGAGGGAC-----------CTGCCCTTGTTTGCTGAACACTGGCACCGGGGTGTGGACCATTTCTTGCTCAAATCTGTCACGCTATCCTGACCTGGGGGCCTGGGCACTGCCCTGGGTGGGCTCACAGG-----------------------------------------------------------TCAGCA-----GGGG--CCTGAGCAAAACCAAGGGGCTTGGGTGCGAGAAGGCCCCATTCTGCAGGGATGGAATGGGGC-AGAGCGTCTCT----------GGGGCAGCCTCTGTCTGC-CCCCAGCGCAGCACTTGCTCTGAACCAGGG----CTGGGAG--------------GGGAGGCCA-G---CGGCGTGGCTGCAGCAGGAGGAACTTGGGCCAGACAACAGAAGAACT-----TCCTGATTAAGGG------CTGGGATTCCAAGGACAGTAGAAGC--TGCTTCTGGTAATTTGTCTGAGTCCTGGTTGTCTAGGACCTGATTTGTTCTGCTCTCTGACTGACGTGGACACAAGGGAGGGACTGGGGAGC-----------CTTGGAGAGCATGTGTAGGGAGCAGGGAAATCATTGCTAGGTGGATGGACTGAGAATGGGTC-CCTGCCAGTGTCTCTGATGAGCGGTGTGACCTCAAGCAAGGCACTGGCCCTCTCTGAGCTT-------------------CTGGTGGAAGAGAGGG-----------ATTGCATGAGTTTGCCTTCATATGGTGGCTGTGAGAAGA--------------GTGTGCCGGGCCCGT-------GTGTCTGCTCCAGAAATGCCTGTCCCCTCCCGGGC---------CACCCCTCCCGGCTGAGATGTCCTTTAT------GACTGGAGGACAGCGTGGCAGGTGTAGACAGGACTGGTGGTGCAGACACTCCTGGCTTGGCTGCGTGCTCAGGCCCCCACGGG--GGC-A------CCCACTCCTCGACTGCAGTCCCTA------GTACGGGGCAGCGTTCACATGGGTGGGTCGTCCCTGG--GCAGAGCCTGGCCCAGCCCGTTCCTGCCAATCTGGCGTGGAGAGAGCCCCGTGGACTCGGCATCCCGGGGCCAGCCCAGCC---TCGGCCAGGACCACTGGGTTCAGGATGCCTCAAAGCCGCAA---------------------------------------------------------------------------------------------------     
18 Nannospalax_galili-NW_008355419.1-155272_155516        89.4%  44.3%    -----------------------------GGACAGAACCCCAG-------GGCTTTT----TATTTC----CATCCTGCGGTGGTTTGCAGGGCACCATGAGGTGCTCTGGAGTTAAACACTCACACGCTTGCTCA--------------------GATCTGTCCCACTTTCCAGGATAGGGA-ACTGGC-ATTGCCCTGGGCAGACAAGGTGTGTGGGCCATCAGGGGTGCATGAGTC-----------------CCCAAGGCGCCCA-GAGCGACAAATCAAGGAGGTTGGGTGTGAGAAGAAGCTGTTCTTTCGGTTTCTTGAGTAGGCGTCTTTAGTGCCCTGGGGCAGGCAGAGCTTCTCCTGGGC--------AGGGTCTTGTCTG-CTCC-----AACACAATGC-TGGATCTGAGTCAGTGTGGGAGAGGCTATAAGTGAAGGGGGC---CCATGGTTATAACTACAGCAGGAGTTACTTGGGTTAAGTAGCAGGAAA----AACTTATGTTCAAGGT-------CCCGGGTTCCAAGGAGAGTAGT--------TCTGGGTGATTCATTTGGAACCTGGTTGATCTGGGACTGGATTTGTTCTGC----------------------------------------------------------------CCTTGGTTGACA---TGAATGTTGG----GTAGGGATGGGAGAGCTT----------------GAAGGGCTGTGTGACCTCCT-CACACTAGGAACCCTCTCTGAGCCTTCAGGGTTGGAAAAGGATAGTGTGGGGCTACCTCA---------TAGGGCAGCTTGTAAGCATTCAAATCCAGTGTGTATG--CAGT------------GCCA-TGCCATGCCTGGCCTCTATGGCTGCTCCAGGAATGCCTGTCCCTTCCTT-CCTGCCCCTCCTCCCCTCCCTGGCTAAGATGCCCTTTAT------GACTAGAGGACAGGATGGCCAGTGTGGACAGGGCTACTGGTGCGCTCTGTTG-GGCCCTTGTGGGACCCAATGGCC---TAGT--GTTTGGATGCACCCCCTCTCTGACCACAGCCCCCATCCCAGG-GTGGCAGCAGGGTTAGTTGA-----------CCTG--AGGAAGGTCTAGCTGGTGTGTTCATGCTTGGTTGGTCCACAGTGTGCCCCATGGAGTCTGTGCTCTGGTTG------GGTAT-TTGGCTTGGAACACCTGCTCGTTAAGGGGGAAGA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------     
19 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-168323_168843          87.6%  44.8%    ------------------------------------------------------------------------------------TTC-TTGCT-------------------------------------------------------------TTGAACTGTCACACGTTTTTGACCTGGGGGCAGTGC-ACTCTCTTGGGCAGAGAGCTCAAGACAGCAGAGGAGGTAAGAGCCCTCCAGGCTACTTAGGTGTACCCACGGCAAAGAACTTGGACATAGCAGGGACCATCCTG--------------TCCACAGGGCTTCCT-AAGCAGGCATCTTCCACTAGGGTGGGCCATAGCTTCTCT---------GGGACAGGTCTCTGTCTTC-CCCA-----CTGCAGTTCTAGCTCTGGGTCGGAGGTGGGGAAAGGCCAAGCATGGGGGCA-C---CAGCGGCTGTGGCTATGTTATGAGTGACTTGGGCTGGACAGCAGGAAG----AACTTCCTGATTAAGGGCTGATTAAGGGTTTTCAAGGAGACTAGGTGCTTGCCTTCTGGTGGTTTGTTTGGGTTCTAGTTTTTCTGGACTAGACTTGTTCAGCC-CTTGATTGGTGTGGATGCCAGGGAGGACTGGGGAAGC-----------CTTGG----------TGTTCATGGGGA---GACATGCCAG----GTAGACTGGGGACAG-------GGCAGGGTGTCTGATGAGCTGTGTGATCTTGCACAAGGCACTAACCTTCTCTGAGCCTTTGTG-GACCAGAGGGATAGTGTGGGACTGCCTCT---------GTAGGGTAGTTGTGAGCACTCACAGGGCTTGTGTCTGCTAAGT------------GCTCACACCACGCCTGGCCCAAGTGGCTGTTCCAGGGTTGCCTGA--------------CACTTCTCTCCTCCCTTCTCTGAGATGCCCTTTAT------GAATGGAGTGCAGCATGGTAGGTGTAGACAGGGCTGCCAATACAGACACCTGCTCTGCCCTC---ATGGGAGTAACACGCTGCATGTTCAGGTGGACCTGGGTGCACACACTCCCTGATCACCTAGG-GTGGGACAGGCCTTCCATGGGTGGATTGCCTCTGT--GAAGGGCCTGGCCCACCATGTTCTGGTCTGCCTGGCCTGCAGAGAGTTTCATGGAGT----GACCTCGGCT------GGTTACTGGGCTTAGGACGCCTGCCTGCTGGCTGGCAGT-GACTAGCT------------------------------------------CCTGCC---------------------------------------------------     
20 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-164311_164461     82.0%  39.0%    GCCAGGGCGGTGGAGGCGGCCCTGGCTTCGGTCAGCACCACGGACAGGGCGGCCGCC----TTTCCTCCCAGGGCTCGCTGCTGTTTGCTAGGGCTCC-GGAGTCGAAGG----CTGCT-----GGCGCCCGGTACTGGGGTT-------GGAGAGTTCCTGCCACACTTTCCTGACGGGGCGTCGGGCA---TGCCCTGGCAG-ACAGTGCAGAATGGTGGGGTGGACGGAG-----------------------CCCTTGGGC-TGCCCCTGCAAGG-------AG---CTCGGCG----GGGGTAGGGGATGTTCCGGCTTCCTGAGGAGTCTTCAGACTGGGCGGGCC-GAG-CCTCCCTG--------GGGCAGGGTCTCTGTCCAC-CCCAAACGCAGCACTGGCTCTGGGCCAGAGG-------GGGCAGACAGAGAGTGAAGGTGGC---CGGAGGCTGCAGCTGCAGCAAAAGTGACTTGAGCCAGATACCAGGAAG----AACTTCCTGGTGAGGGGCT------GGGTTTCTGCG-GAGGTGGAAGCTCGCCTTCTGGCGATTTGTTTGGATCCTGGTTGTTCTGGGCCCAGTTCTGCCCTCTGACTAGTGTCATCTGGGGA-----GG----------GG-----------CTGAGCTAGCATGTGGGGACATGGGCG---TCGCAGCTGG----GCAGACTGGGAGCGGGGCCACAGTGGG--GCCTACGATGCCTGCGTGACCCCCA-GAAGGCACCGATCCTCTCTGAGCCCCCA-CGGTTGGGATGGGCAGC----------------------------------GTGTCTGTGAAGCGCCCGCTGG--CAC--------------------------------------------TGCTCCAGGAAGGC------------------CAGCCCCTCCCGCCCCCTCCTGGGCTGCCCTTTAT------GACTGGCGGGCAGCGTGGTGGCGCAGA-CACGGCTGCCAGCGCAGACTCTGGCCCT------CG-CAGGACGGCT------GTGTGTCTGGGTGGCCCTGGTGCCCCCCCT-ACCCCCGACCGCAGC-C-CCACCCG--------------------------------GGCCTGGCCCGGCACGTCCCTCCCCTCCTGGCCTGCAGAGAGCTCCCTTGCC---------TGGGCT------GGCCACTGGGCTCAGGACGCCTGCCTGCGACTGGACAGGGGCTGCTGCTGCCAGGGCTTCCTGGGGACCTGAC--------------------------------------------------------------------------     
21 Zalophus_californianus-NC_045598.1-173760_174108       84.2%  39.8%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCTCCGGGTTCCAGCCCTGGCGCCCCCGTGGGAGAGTTCTTGCTCAGATCTGTCACTCTGTCCTGACCTGGGGGCCTGGGCACTACCCTGGGCAGACGGCAGAGATCAACAGGGGTGGCAGGAGTCCTCTGAGGC-----------TGCCCAGGGCTGCCCAGCACCAA-----GGAGCTTGGCTGCACGGGGTCAGGGC----------------CTGTCCTTGCAGGGAGCAGATGGGGC-AGCGCCTCTCAG--------GGACAGGGTGTCAGTCTG--CCCCAGGACAGCACTTACTCCAGGCCAGGA----GAGGGGAGAAGCGGAGAGGGAAGG-GGCCA-G---AGCCACAGCTCTAGCAGGAGTGACCGCGGCCAGA------CGCGCAAGAACTTCCTGCTTAAGGG------CTGAGACCCCCAAGGGGGGTATAGCTTGCCTTCTGGCTATCTGTCTGGATCCAGGTTGTTCTGGACCCAGTTTGTCCCGCCCTCTGATTGGTGTGGACACAGGGGAGGGACTGTGTGGC-----------CTTGGAGAGAATGTGTGGGAGCAGGGACA-TCACTGCCGG----CTAGACTGAGGATGAGTCCCCCGCAGGTGCCTTCGGTGAGCTGTGGGACCACAGGCAAGGCACCAACCCTCTCTGAGTCT-------------------CTTGTGCAAGAGAGGG-----------ACAGCATGGAGTTGCCTTCGTAGGGTGGCTGTGGGCAGA--------------GTGTGTCCTGTCTGT-------GTGGATGCCTCGGGAATGCCTGTCCCCTCCACACC---------TTCCCTCCCTCCCTGGGATGCCCTCTAT------GAATGGAGGACAGGGTGCCAGGTGGAGATGGGGCCGGTGCTGCAGAAACTCCTGGCTGGGCTGTGTGCTTGGGGCACTCGCA--------GGTATACCCACCCGATGACCACAGCCCCCGTGCC--TGTGTGGGGCAGGGCTCCCATGGTGGGTGGTCCCTGG--GAAGAGGCTGGTCCAGCACATTCTTGCCTACCTGGCCTGCAGAGAGTTCGGGGGAATCAGCAGCCAGCCTTGGTCAGAACC---ACAGGA------------TGCAGGATGCCTCCCTGCTAGCG-------------------------GAGT------------GGA-------------------------------------------------------     
22 Felis_catus-NC_058375.1-173790_173893                  83.4%  35.7%    ------------------------------------------CCT------GAGGCG----CC----------------TGCTGAGCCCTCAG-----------GGTTCCGCCAGGCTCCCCACCCCCCCCACCCCGGTGGGAGATTTCTTGCTCAGATCTGTCACTCAGTCCTGACCTGCGGCCCCGGGCACTGCCCTGGGCAGACAGCATAGATCAACAGGGGTGGCAGGCGCCCTCCAAGGC-----------TGCCGGGAGCTGCCCAGCACCAA-----GGAGCTTAGGTGCAGGGTGTCAGGGC----------------CCGTCCCCGCAGGGACCAGATGGGGC-AGCACTTCTCAG--------GCAGCATTTGCT---------------------------CCCGGCCAGGA----ATGGGGAGAAGCAGAGAGGGGAGAGGGCCCAGAGCCACCACAGCTGTAGCTGGAGGG---------ACC------GGAGTCAGCAGAACTTCCTAAGGGC------TGAGACCCCCCAAGGAGAGTTGAGCTTGCCTTGTGGCCATTTGTCTGGATCCCGGTTGTTCCGGACTTAATTAGTTCTTCCCTCTGATTGGTGTGGACACACGGGAGGGACTGTGGAGC-----------CTCGGAGAGCAGGCGGGGGAGTGGGGACA-TTACTGCCAG----GTCGTCTGAGGGCGAGACCCT-GGCGGTGCCTTTGATGAGCTGTGTGACCACAGG-CAGATGCCAACCCTCTCTGAGTCT-------------------CTTGTGGAAGACAGCG-----------ATGGCATGGAGTTGCCTTGGTAGAGTGTCTGTGAGCAGA--------------GTGCGCCCTGTGTGT-------GTGATGCTCCAGG--ATGCCTGTCCCCTCACCAC----------CCCCTTCTCTTGCTGAGATGCCCTTTAT------GAGTGGAGGACAGCATGG-----CAGTAGAGGGCTGGTGGTGCAGACACTCCTGGCTTGGCTGTGTGCTTGGGCCGCTCGTCG-------GGACACCCCCCCGGATGACCACAGCCCCCATGCC--AGTGTGGGGCAGGGGTCCCATAGTGGCTGGTCCTCGG--GGAGAGCCTGGCCCAGCACATCCCTGCCTATCTGGCCTGCAGAGAGATCCATGGAATCAGCAGCCAGCCTTGGTCAACCTT---GGTCAG------------AACCAAGGGTTCCGGGGTGCGGG-----------------------ATGCCT------------GCCTGCGAAC------------------------------------------------     
23 Ailuropoda_melanoleuca-NC_048228.1-173943_174042       84.0%  38.7%    ----------------------------------------TCCCC------CGGGGG----CC----------------TGCCCTTGT--TTC-----------CTGAGCCCTCAGAGTTCCAGCCCTGGCACCCCCGTGGGAGATTTCTTGCTCAGATCTGTCACTTTGTCCTGACCTGGGGACCCGGGCACTACCCTGGGCAGACAGCAGAGATCAACAGGGGTGGCAGGAGTCCTCCGAGGC-----------TCCTGGGGCTG----CCCGGCAC-----TAAGCTTGGTTGCAGGGGGTCAGGGC----------------CTGTTCTTGCAGGGACCAGATGGGGC-AGCGCTTCTCAG--------GGGCAGGGTGTCAGTCCA--CCCCAGGGCAGTCCTTGCTCTGGGCCAGGT----GTGGGGAGAAGCAGAGAGGGAAGGGGGCCA-G---AGCCACAGCTGTAGCTGGAGTGACTGCAGCCAGA------CGCA---GAACTTCCTGATTAAGGG------CTGA-GACCCCAAGGACAGTACAGCTTGCCTTTTGGCAATCTGTCGGGATGCTGGTTGTTCTGGACCCAGTTTGTCCTGCCCTCTGATTGGTATGGACACAGGGGAGGGACTGTGCGGC-----------CTTGGAGAGCATGGGTGGGAGCAGGGACG-TCACTGCCGG----CTAGACTGAGGGTGAGACCC-CGCAGGAGCCTTGGGTGAGCTGTGTGACCATAGGCAAGGCTCCCACCCTCTCTGACTCT-------------------CTTGTGTAGGAGAGGG-----------ATAGCATGGAGGTGCCTTCGTAGGGCGGCTGTGGGCAGC--------------ATGTGTCCTGTATGT-------GTGGATGCTTCGGGAATGCTCGTCCCCTCCCCGCC---------CCCCCCAGC----TGAGGTGCCCTCCAC------GACGGGAGGACAGTGGGGCAGGTGGAGATGG-GCTGGCGCAGCAGACACTGCTGGCTTGGCTGCGTGCTTGGGCCACTCACTG--ATGACCCGGTGACCACCCGATGACCACAGCCCCCACGCC--AGTGTGGAACGGGGCTCCCGTGATGGGTGGTCCCTGG--GGAGAGGCTGGCCCAGCACATTCCTGCCCATCTGGCCTGCAGAGAGCTCTGAGGAATCAGCAGCCAGCCTTGGTCAGAACC---GTGGGC------------TGCAGGAT------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
24 Desmodus_rotundus-NW_020090861.1-179440_179632         81.1%  33.4%    GGGTGGGTGGAGGGGTGGTGGCCGACTTTGGTCAGCACCACGGACAGGGCAGC---A----GC----------------TGCCCTTCCCAGAG-----------GGG-AGGGGAATGCAGGTCTCTGCGGCAATGTGGGAGGGAGATTCTTGCTCAGATCTGTCACCCTGTCCAT---------------CACTGCCATGGACAGACAGCACAGGTCAGCAGGACTGAC-----------------------------------------CGGCACCAA-----GGA---GGGGGCATGAGGAGGGGCCTGCGCATGGTGTCAGGGCTGGGCGTGCAGGGACCCGACGGGCC-AGGGCTTCTCTG--------AGGCAGCGTCTCCATCTGC-CCCCAGTACAGCACTTGCCCCGGCGGGGGG----TGGGGAGAGGATGTGAGGG------------CAGGGGTCACGGCTGCAGCAGGAGTGACTTGGACCAGACAGCTGAAGGA-----TTTCCTGGC-TAAGG------GCTGGGGTCCAAGGAGAGTAGGAGCTTGCCCTCTGGCAACTTGTTTGGGTCCTGGTTGTCCTGGACCTAACTTCCCCTGCCCTCTGATTGGTGTGGGCACAAGGGTGGGGCTGGGGACA-----------CTAGAAGAGCGTGTGTGGGGCACAGGGGCGTCATTGCCAGACAC-GCCAAGG-ATCATGCACTCCTGGCAGTGCCTCTGATGCGCTGTGTGGTCTCAAGCAAGGCGCCGACCCTCTCTGGGCCT-------------------CTCTGGAAGAGGGACA-----------GCGT---GGGACAGCCCTCACGGGGTAGATGCACACCTA--------------GACTTCACGC----------------------------------------CATCCCCTCCCACTCCTCCAGTTCCTGGCAGAGATGCCCTTTGTGACTGTGGGTGGGGGACAGTGTGGCAGATGTGGAGGGGTG-GCTGGTGCGGACGCTCCCGTCTTGGCTGCGTGCTGAGAAGAATGTGCG--GGTGC------CCCGCTCC-TGGGGAGAGAACAACCTCAAATGTGCAGCTGAGGATGGAGCAGATGGCTGGAGTCTTG--TCCGGCCCT----------CCATCTGCGCAGCTCACGCGCTGATGACGATGGTCTCCCTCCT--------CCTGGCACCTT---TCTCCTGGAAAGCCTGTGCACGGAAGTGCTCCTCTCC-------------------------------------------------------------------------------------------------------     
25 Sus_scrofa-NC_010448.4-162461_162648                   84.1%  36.5%    --------------------------------------------------------------------------------------CAGGGAC-----------CTGCCCTA-GTTTGCCGAACCCTGGCACCTGGGGTGGGCAATTTCTTGCTCAAATCTGTCCTGACCTGGGGCCG------------GCACTGCCTGGGCAGACGGCACAGGTCAGTAGGGGAGCAGGGAGCTCTCCGAGTC-----------TGCCCGGGGCTGCCCAGCACTGA-----GGAGCTTGGGAT------AACAGCTGGAGCTTGGTGTCAAGCCCTGTCCTGCAGGGACAGGATGGGGC-AGAGCTTCTCAC--------AAGA-----GGGTCTCTGT-CCCCAAAGCAGCAGTTGCTCCAGACCAGGG----GTGGGAGAGGCAAAGGGGGGAAGCAGCCAG------TGCTTCGCCGCCGCAGGCGCGACTCGCGCCAGACCACAGGA-----GAACTTCCTGATGAAGGG------CTGGG---GTCTGTGGAGGGGGGCGCTGCCTTCTGGTGATTTGTCTGCATCCTGGCTGTTCTGGACCTGATTTCTTCTGCCCTCTGATGCCGCGGGCTTCGAGGGTGGGGGTGGGGGGGGGGCGGAGAGCCCTGGAAAGCTGGTATGGTGAGCAGGGGTGTCATTGCCCC----GCAGACTAAGGATGGGTC-CCTGGCAGTTCGTCTGATGAGCCGTGTGACCTCAAGCAAAGTGCCCACCCTCTCTGAGCCT-------------------CTCTC--AAGGGAGGA-----------ACCGCAGGGGGTTGCCTTCCTAGGGTGCCCGTGAGAAGT--------------GAGTGCCTGGCCTGT-------GTGGCTGCTTCAGGAGGGCCTGTTCCCCCCTCCCC----CCACCCCCCGTCCTGAGCTGAGTTGTCCTCTAT------GAATGGAGGACAGTGGGGCAGGTGTGGATGGGCT-GGTGGTGCAGACATACCTGGCTTGGTCGTGTGCTCAGGCCACCCTGGG--GGCACC-------CCCTCTTTGACCGTAGCCCAGG--------GCAGGACAGAGCTCCCATGAGTGGGTGGTCCCTGGAGGGGGGTGCTGGCCCAGCATATCTCTGTCAGTCTGGCCTGCAGAGAGTCATGGTATCAGCCGTTCTGGG--CTTGTCCAGC----CGGGTCAGAAGCCCTGGGTGCAGGACACAT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                          *                            .   .                                                                                                                                                                                                                                   . .                                           : . *                                                      .        . .                    *  .       . .    .    :   .                                                                                                                             .                         .   *                             ..                                                                                                                                                                                         .                        .        .

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