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 1 Target                                                  100.0% 100.0%    ------------------------------------------------------------------------------------------------CGGCACCACAGCCTCCCAAGTCCATACTGCAGTGCAGGGCGTGCGACGCAGA--CATTC-ATGGCA----CCATTCGTGGCGCTTGTTGCACATGAGGGG---------------TGGGGGCTTTCCTGG-----------A--GATGCCCCAGGCAG-GGGCACAGGCACTCAGGA-ATTCGACCGCTCCCAG----G--------AG--------CCACCTGTGGCCAGGGGCGG----------------G----------GGCAGGGGCATGGGGTTGCTGCCT----GCTAGGCCCACCCCGCCCCTGACAAG--GG-GCCTCCACTGCACTATGGCCCCAGA------CAGCCAGCCCAGCCACC--TCATCTGTCTTGCCTCGTGCC-----C-GGCCTTCCCATTGTTGAGT--------TCTGTGCTGGCTCCGTCTGAGTGGTAGCTCTCGGGGCCCCAGGCCCAGCGCCGGTTACCAGGGCTGCTAGGACTGG---TCCA-------------GGAGG-TGGTGGGAGTGGCAGGTGGCCGAGCAGGGTG------GGGAGCAGGGCCCTCAGTTCCCAGGACCATCTGGGGA---GGAGTGGCAGGGCCCAGCTGAGCTGTGTGACCCAGGCAAGCCGGCACCTGGGGTG-GA--GGTGGCCCTGGGCTCTGGCCTTTGCCCTGTCACTGGCA--------GGGCGGTGT--GGGCGGGGCCGGG-----CGAGGTGAGGAGTGGCCGTGCCTCCGCTGACGGCCGTGTTTCTCCCGTGAGGAGTGGCCGTGCCTCCGCTGACGGCCGTGTCTCTCCTGCGAGGAGTGGCTGTGCCTCCGCTGACAGCCGTGTCTCTCCCGTGTCCAGTGGAGCGGTGCATGGGTGCCATGCAAGAGGGGATGCAGATGGTGAAGCTGCGTGGCGGCTCCAAGGGCCTGGTCCGCTTCTACTACCTGGACGAGCACCGCTCCTGCATCCGCTGGAGGCCCTCACGCAAGAACGAGAAGGCCAA-------GAGTGAGTGGGAGCCCTGGGGTGGGGACAAATCAGAGTCCCTGGGGGGACACG-ACGGTAGGGACC---------------CTCCCAGGGCAGCCACTGATGGCTGAG-GAGCAGCGAGA--CCCTAGGCCTGGACACCTCTGGGCTCAG---------------------------------------------------------------     
 2 Piliocolobus_tephrosceles-NC_045434.1-202776_203733      95.8%  82.5%    ----------------------------------------------------------------------------GGTTGTGAAGCTCGGA--TCCAGCGCTGCAGCCTCTCAAGTCCATACTGCTGTGCGGGGCCTGGGATGTGCA--CATTT-GTGGCA----CCATTCGTGGCCCTTGTTGCACATGAGGGG---------------TGAGGGCTTTCCTGG-----------A--GATGTCCCAGACAG-GGGCATAGTCACTCAGGA-ATGCGACTTTGCTCCC----A--------GGAGTGGCCTGTGACTGGGGGCGGGGGCGG----------------G----------GGCGGGGGCATGGGGTTGCTGCCT----GTTAGGCCCACCCTGTGCCTGGCAAG--GG-GCCTCCACCGCACTGTGGCCCCAGA------CAGCAGGCCCAGCCACC--TCGTCTGTCTTGCCTCACGCC-----C-GGCCTTCCCACTGTTGAGT--------TCAGTGCTGGCTCCGTCTGAGTGGTGGCTCTGGGGGCCCCAGGCCCAGCACCGGTTCCCAGGGCTGCTGGGACTGG---TCCA-------------GGAGG-TGTTGGGAGCGTCAGGTGGCTGAGCAGGGTG------GGGAGCAGCGTCCTCAGTCCCCAGGACCATCTGGGGA---GGAGTGGCAGGGCCCAGCTGGGTTGTGTGACCCAGGCAAGCCGGCACCTGGGGTG-GA--GGTGGCCCTGGGCTCTGGCCTTTGCCTTGTTGCTGGCA--------GGGCGGTGT--GGGTGGGGCCGGG-----CGAGGTGAGGTGTGGCTGTGCCTCCGCTGATGGCTGTGTCTCTCCCGTGAG------------------------------------------GACTGGTCGTGTCTCTGCTGACGGCCGTGTCTCTCTCATGTCCAGTGGAGCGGTGCATGGGTGCCATGCAGGAGGGGATGCAGATGGTGAAGCTGCGTGGCGGCTCCAAGGGTCTGGTCCGCTTCTACTACCTGGACGAGCACCGCTCCTGCATCCGCTGGAGGCCCTCACGCAAGAACGAGAAGGCCAA-------GAGTGAGTGGGAGCCCTGGGAGGGGGGCAGGTCAGAGTCCCCGGGGCAACACA-AGGGTAGGGACC---------------TTCCCAGGGCAGCCGCTGATGGCTGAG-GAGCAGCGAGA--CCCTAGGCCTGGACACCTCTGGGCTCAGTGACCTTGGGGATCCGC----------------------------------------------     
 3 Pongo_abelii-NC_036903.1-202916_203653                   96.0%  73.9%    -----------------------------------------------------------------------------------------------------CCACAGCCTCCCAAGTCCATACTGCTGTGCAGGGCCTGGGACGCGGA--CATTC-GTGGCA----CCATTCATGGCCCTTGCTGCACATGAGGGG---------------TGGGAGCTTTCCTGG-----------A--GATGCCCCAGGCAG-AGGCACAGGTACTCGGGA-ATGTGACTCAGGAATG----CGACC---GCTGGCAGGAGCCGCCTATGGCCAGGGGTCA----------------G----------GGCAGGGGCATGGGGTTGCTGCCT----GCTAGGCCCACCCCGCCCCTGGCAAG--GG-GCCTCCACTGCACTATGGCCCCAGA------CAGCCAGCCCAGCCACC--TCATCTGTCTTGCCTCGCGCC-----C-GGCCTTCCCACTGCTGAGT--------TCAGTGCTGGCTCCGTCTAAGTGGTGGTTGTCAGGGCCCCAGGCCCAGCGCCGGTTCCCAGGGCTGCTAGGACTGG---TCCA-------------GGAGG-TGGTGGGAGTGGCAGGTGGCTGAGCAGGGTG------GGGAGCAGGGCCCTCAGTTCCCAGGACCATCTGGGGA---GGAGTGGCAGGGCCCAGCTGAGCTGTGTGACCCAGGCCAGCCGGCACCTGGGGTG-GA--GGTGGCCCTGGGCTCTGGCCTTTGCCCTGTCACTGGCA--------GGGCGGTGT--TGGCGGGGCTGGG-----CGAGGTGAGGAGTGGCCGTGCCTCCACTGACAGCCATGTCTGTCCCGTGAGGAGTGGCTGTGCCTCCGCTGACGGCCGTGTCTCTCCCTTGAGGAGTGGCTGTGCCTCCGCCGACAGCCATGTCTCTCCCTTGAGGAGTGGCTGTGCCTCCGCTGACGGCCGTGTCTCTCCCTTG--AGGAGTGGCTG--TGCCTCCGCCGACAGCCGTGT-------CTCTCCCTTGAGGAG---TGGCTGTGCCTCCGCTGACGGCCGTGTCTCTCCCGCGAGGAGTGGCTGTGCCTCCGCTGACAGCCGTGTCTCTCCCGTGTCCAGTGGAGCGG----------------TGCATGGGTGCC---------------ATGCAAGAGGGGATGCAGATGGTGAAG-CTGCGTGGTGGCTCCAAGGGCCTGGTCCGCTTC------TACTACCTGGACGAGCACCGCT-------------------------------------------     
 4 Callithrix_jacchus-NC_048389.1-184113_184981             85.9%  61.5%    ------------------------GATGGGGGGA---GGAGAAGGAACG--GGACAGGTGGCCTCAGGGAGGGGAGGGTTGGGAAGCTCGGA--T-CCAGCCCACAGCCTCCCGAGTCCGTACTGCTGTGCAGGCCCTGGGACGGGG-----------CGTT----CATGGCACTGCCCTTGTTGCTCCTGAAGGG---------------TGGGGGCTCTCCTGG-----------A--GATGCCCCAGGAAG-GGGCGCAGGCACTCGGGA-ATGCGAATATCTGCTC----CCAGG---AGCCGC---CTGTGGCTGGTGGCAGGGGC-G----------------G----------GGGCAGGGTATGGGGTTGCTGC-C----TGTTGGCCCACCCTGTGCCTGGCAAG--GG-GCCTCCACTCACTGTGGCCCTGGAC------AGCTGGGGTCAGCCGCC--TCGTCTGTCTGGCCTTGTGCC-----T-GGCCTTCCCACTGTTGAGT--------TCAGTGCTGGCTCTGTCAGAGTGGTGGCTCTTGGGACCCCAGGCCCAGTGCCGGTTC--------------------------------------------------------CCAGGTGGCTGAGCAGGGTA------GGGAGCAGGGCCCTCAGTCCCCAGGACCATCTGGGGA---GAAGTGGCAGGGCCCAGCTGGGCTGTGTGACCCAGGCATGTCAGCACTTGGGGTG-GA--GGTGGCTTTGGGCCCTGGCCTTTGCCTCGTCACTGGCA--------GGGTGGTGT--GGGCAGAACCAGT------GATGTGAGGA------------------------------------------------------------------------------------GTAGCCGTGCCTCTGCTGACAGCCGTGTGTCTCCTGTGTGCAGTGGAGCGATGCCTGGGTGCCATGCAGGAGGGGATGCAGATGGTAAAGCTGCGTGGTGGCTCCAAGGGCCTGGTCCGCTTCTACTACCTGGACGAGCACCGCTCCTGCATCCGCTGGAGGCCCTCTCGTAAGAACGAGAAGGCCAAGAGTA-------AGTGGGTGCCCTGGAGTGGGGGTAGGCTGGAGTCCCTGGGGGCACAC--GGGGTAGGAAGC---------------CTCCCAGAGCAGCTGCTGATGGTTGAG-GGGTGGTGAGA--CCCTAGGCCTGGACACCTCTGGCTC-AGTGGTCTTGGGGATCAGCAGTGACCTCTGGGCTATAGGGTGGGAGGGACCCAGGCCCCTGCCCA     
 5 Pteropus_giganteus-NW_024346980.1-167357_167531          89.0%  35.4%    -----------------------------------------------------------------------------------------GCA--CTTATGGGAGCAGCGAGCTGGTGCCGGACACAACGGCCCTTACAGTGGACCTCACTGCCTGGCCCCAGTGAGCCACTGTCCCAGCTGGCACCACCTCCCCTGGGAC--CTGGG-AGGCTTGCAGGCTGCAGATGGGGCCAAACGCACAGAGGAGGGACAG--GGCGTAGGGGGCCGGGA-GGGGGA---ATGGTTT----GGAGC------------TCAATCTCAGCACTGTGCCTCCCCAGACCTGTGCTCCCCCCACCCACTGTGGCCTCCACGTGTACTGGTGCCA----CC--CTGGGCCATTGCACACAGGAGGAGGA-GGAGGTTTTCCTGGATGTGCCACAT-------GGGGTGCCGGCACTTGG-GAGCGGCCTGTGGCTGGGCCAGCGAGC-AAGGCTGAGCGTCCTGTGG------CTGCCGGGGCCGCTCCCGGCGGTAGATGGGGGTGGGGCGTGGGCAGGTGGCCCGTCCTGGGGCCTCACCTGGCCCCCAGGCCCCA-------------GGGCCATCGGGGCCAGCTCCCCCGACTCCCAGGAGCT--------GGCTGGGCAGAAAGCTTCCTCTTTGGCTC-TG-GT---CCTGAACAGGGTCCCAGATTGGTGTGCG-------------------------------------------------ACCC------------------------AGGCCAGCGCCTGGG-GGTCGCAGGCA-C-CTAGTGGGCCGGTGCTT----------GAGCAGGT-GGGGGTGGGGGAGCAGGCTGCAGTGGGCGGCGGGGCAGCCGCAGCGCTCACCGGCACCCGTCTGCTTGTCTGTCTCTGCCGTGCGTCCGTCCGCTCGCCCAGTGGAGCGGTGCATGAGCGCCATGCAGGCGGGGACCCAGATGGTGAAGCTGCGAGGCGGCTCCAAGGGCCTGGTGCGCTTCTACTTCCTGGACGAGCACCGCTCCTGCATCCGCTGGCGGCCCTCACGCAAGAACGAGAAGGCCAAGAGTGAGTGGGGCGCCTGGGGTGGGGGGCCCCTCCCGGAGCAGCCCGCGCCGGGCGTCTC---AGGGGGCTCCGG---GCCACGCTCACGGGCTCAGCGGGCCCCGGAGTTCTGCAGT--GACCTGAGCACACAGGACG---------------------------------------------------------------------------------     
 6 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-170145_170314          82.9%  32.9%    --------------------AGCAGATGTGCAGACCCCAAAGAGGGCGG--GGACTACTGGTTCCTGTACTGGGCTAGCTGACTCTGGCCTGGACTCCTAGAGGCCCAGG---------------TACAAA--TA-GGAGACCATG----GATGC-CGGGGG----CA-------GGGGGAGGCAGGAGTGCTCAGATCCATCTTTGA---------ACCTG--------TACCCTGC--TATTG-----GACT-GTGCCTGTGGACCTTGGG-GAGT-----GGACGTG-----TTAGTGCCATC-TTTGCTGCATGTAGGGCCAAGGGCCTCCA--AGGAGGGCCCCA---------GAGAGGAGTCCAGGC-----------------------------------------------------CCTCAGGAGCAGCCTGT-----GGCTGGTGTGGGGTGGCCG-GGGCCTGCCTTGAATCAGGCAC--AGG-GACCTCCAGAGAGCTGGAGC-----AGCTGCCAGCCTCTGTCCCCTCAT----GTCCTTGCC-TCCTTGCTCCTGAGTTTCATACTGGCTCCATTTGAGTGATGGCCCCC----------CACAGTCCCTCAGGCCCAC-ACAGGTTGCTGGCCATTGCT------GGGT-CTGGCCCAGGTGGTGGCAGGAGGGGTAGG-TG---GCTGAGCAGGGAAGAGCAG-----GGTC---------CTACTGGGCAGTGGGATTGGATTGATGAC--CAA------------------------TGTGGCA----GGCAGGCCT--GGGTCAGCCTTGGCC-CTGCGGGGGGCAGGTGAGAGGC-CTGGCCAAGTGGCAGG-GTGTGCGCTGTGGTGAGGAGTGGG-G-GTGCTGCAAC-GCTCACCAGCACCTATGTCTATCATCTCTGTGTCCGTC-TGTCTGCCCGCCCATCCGTCCAGTGGAGCGGTGCATGAGTGCCATGCAGGAGGGGACGCAGATGGTGAAGCTCCGGGGCAGCTCCAAGGGCCTGGTCCGCTTCTACTACCTGGATGAGCACCGCTCCTGCATCCGCTGGCGGCCCTCCCGCAAGAACGAGAAGGCCAAGAGTGAGTGGCTGCCCTGGCAGGGGCAGGCCCAATGCCCCAGGGAGCACACAGGGG-CA--GGTGTCCCTCCCAGC--AGCTGCCATGTGGCTCTGAGCCCCCGTGGACCATGGGGAGGGGCCGTGCCCACCCAGC------------------------------------------------------------------------------------     
 7 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-237674_237946      88.5%  37.8%    ------------------------------------------------------------------------------------------AG--GCCAAGTGGACAGAGGAGATGGGGGAGACAGGCAGGTGGCTCTGGGGAGGGTGCAGTTGTG-GAGCTCAGATCCAGA--GCTGGCTCCCCAGATCTGCGCCCTTGG--------GCGGGGCCT---CCCTGTG---GCCTCGGG--GCGTGGGTGCCA-T----CCTAGCTGTACGTGG-GGAAAGGTGGCTTTCCTGTGGATGATGCCGTCTGTGGCAGGGGCTGGCAGCCAGGCTGGGCACAGGGTGGCTGCCTGC--CCGAAGCACCATGCACCAGGCATGGGGTCT----TCTATGCAGTGGCTCCTGAGGGCTGGCTCA-GCCATCATGCCTCTGTCCCCTCAAG-------TTCTAGCCTTGGTTACT---------TTTAGCGCTTTCC---AGG-TCCTGCTCAGGTTATCAGTGGTTGCTTGGACAGGTCCAGATCGTGGGGGGTTGGACTGAGTGGGGAAGAGCAGGACCTTGTCTGGCACCTTGTAGGGCCCTCAGTCCCCA-------------GGGCCATC--------------------AGGGGAGGG--------AG-GCAGGGACCCGGATGTGTGACAAA-----------------------------------GGTGT----CCCTTGGCCAGCACCTGGGGTG-GCAGCAGCCCACCAGGCCTGGTCTT-GGCCCCATAGTGGGCAGGT-----GGGTGGTGGATGGTCGGGTTCTGTGT-C-TGCCCTGGGCACACGGGGTCCTGGGGTGGGTGGC---------AGGGACCAGGCTGCAGTGAGGGTCGTGTTG---CCGAGAACTCACAGGCGTCCATGTCTGTCTCTCTCTGTGCCGGTCTGTCCGTCTGTATCCAGTGGAGCGATGTATGAGTGCCATGCAGGAGGGGACACAGATGGTCAAGCTCCGCGGCAGCTCCAAGGGCCTGGTCCGCTTCTACTACCTGGACGAGCACCGCTCCTGCATCCGCTGGCGGCCCTCGCGCAAGAACGAGAAGGCCAAGAGTGAGTGGGCAGCCCGGGGGCGCAGGGGGCAGGGGCACAC-------------------------GGGGGGG-----------ACCCTTCCAGAGCAGTCGCTGGGCAAC-TGAGGGGCAGGGAGACCCCGAGCCCTGGACGTCTCCAGCCTCAGCTGG------------------C----------------------------------------     
 8 Lemur_catta-NC_059130.1-171215_171443                    87.7%  37.3%    --------------------------------------------------------------CCTGGGCTGGGGCCGGCTGACTCTGGCCTGGGCTTGGGCCCAGCTATGACAGGAGG-CCCCTGGACAGG--GT-GGGGGCAGGGGAGAGGCAG-GTGGCC----CG-------GGGC-AGGCTGTGGAGCTCAGACCCACCACGCAGG-TCCCAGATCTG--------CACCCTGG--TAGGCACGGGGCCT-CGCCACAGGCCTCGG--G-CGTG-----GGTGTGT-----GCAGTGCCATC-CTTGCAGCGTGGGGGCAGGG-GC-GTCCA--GGAAGGGCC--C---------AGGAGGGGTGCAGGCCCTCA---------------GGCGGGAGGCTCCT-GCTCTGGGA-GCCGCTGGTGGCCGGCCAGCAGCGG-----GGCTGGGTGTGGGTGGCTG-GGGCCGGCCCTGCACCAGGCAC--GGG-GGCCTTCCGAGAGCTGGCGC-----AGCCGCT--CCTCTGCCCCCGGTT----GTCGTCCCCGTTCCCGCTGCTGAGTTTGATGCCGACTCTGA----GTGACGCCCCCT------------CAGGGCCCCAGGCCC-A-CGGGGTTGCCTGGCCC--------------------------------------AGGCGG-TG---GCTGAGCGGGGAGGGGCAG-----GGTC---------CTGCTGGGCAGTTGGGTTGGGTGGGTGAT--CGAGGCGTGTCCC-CCACCAGCACCTCGGTGGCA----GGCAGCCCC--GGGCCAGCCCTGGCC-CCGCGGTGGGCAGGTGGGTGGC-CTGGCCGGGCGGCAGG-GGACGGGCCGCGGTGAG-GAGTGGGG-GTGCCGTGGC-AGTCAC-----CCCGCGCCGTGTCTGTCACCGTGTGTGTGTCTGTCCGGCCGTGACGTGCAGTGGAGCGATGCATGAGTGCCATGCAGGAGGGGACGCAGATGGTGAAGCTCCGCGGCAGCTCCAAGGGCCTGGCCCGCTTCTACTACCTGGACGAGCACCGCTCCTGCATCCGCTGGCGGCCCTCGCGCAAGAACGAGAAGGCCAAGAGTGAGTGGCCGGCCCGGAGGGGGGCGGGCCCAGAGCCCCCGGGGAGCACGCGG--GGTGGGGGTCCCTCCCGGG------------CAGCTCCGGGATCAGGTGGCCTTGGAG-TTCCACAGTGACCCCTGGGCCACGGGGAAG--------------------------------------------------------------------------     
 9 Balaenoptera_acutorostrata-NW_006725355.1-181848_182131  89.3%  40.3%    ---------------------------GTGTGGC--------------------------GCCTTGGCCTCGT---GGAGGCTCCTCCGTGG--CCCCCGGGTGGATGTGTGTGGTACCACCCCTGTGGCGTGTGTGAGGAGGGCGGCTTTCCTG-AAGATG----CCACGGGAAGGGGATGCAGGCTCTCAGGAGTGCCTGCGGCC-GGGCCAGTGAGC---------------------------CAGGCTG--GGCATCG-----TGGGG-GGCTGCCTGCATGCCG-----CCCACCTGGGCCCACCCTGTGCCTGGCCCGGGACCTCGTTG--------------------------------------------------------CATAGCAGCTCCTGAGAGCGGGCTCG-GCCACCCCTTCCCTGTGTCCTCTCG-------TGTGTTG-TAGCCTTTG-GGGCAGGTCATGGTGGTGGAA---GGG-GGTGGGTGG---------------------GAGGCCGCTGAAGCAGGGC-----AGAGCTG-GGGGGTGGGCAGGGCCCGTCTGGGACCTCACCTGGGCCTTGGGCCGCA-------------GGACCACTGGGGAGGCCAACAGGAGCCCGGCTGGGCA--------GA-ATCGGTCTGATTCTCTGTGTGGACTCTGG-CC---TCTGATCAGGGTCCCAGATTGGACCTGTG----ACCTGGGCCGGCGCCTGGGGCC-GCAGGCAGGCCTGGGGGTCTGAGTT-CGGTGCCCT-------------------GGTGGGTGGGTGGTCTCTGCAC-C-CCCCTGAGCACGTGGGGGGTGGGGCTGAGGCTGCGAT---GAGCACAGAGGGGCTGCCGCAGCGCTCACCGGC---CCCCCGTCTGTGTCTGCCTGTCTGTGTCGGTCCGTCTGTGTGCCGGGTCGGCGGGCCTCCAGTGGAGCGATGCATGAGCGCCATGCAGGCGGGGACACAGATGGTGAAGCTTCGTGGCAGCTCCAAGGGCCTGGTCCGCTTCTACTTCCTGGACGAGCATCGCTCCTGCATCCGCTGGCGGCCCTCACGCAAGAACGAGAAGGCCAAGAGTGAGTGGGGTGGCCCTGGGTGGGGGAGCGGTGGGCAGGGCAGAGCCCGCAG-ACCAGCACCCAGGGGGGCAG-------AGGACCCTCCCAGAGCAGCCACTGGGCAGCTGAAGGGGCAGCAAGACCCTGAGCCCTGGAAGTCCC------------------------------------------------------------------------     
10 Peromyscus_leucopus-NC_051064.1-171183_171373            92.5%  40.4%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCCCCTAGGCTGG-----CACTGCCTGTGGTTTTCTGCACTGCC----CACCTGGGGGTACCTCATTTTAAGATGCAGTGCCCTCTGG----CTCCTGGGCTTCCAGT-----------A--TATAGATAGATATGCAGCCTGAGGAAGCTTGGC-CCTGGCCTGGACTCTTTG--AAACTTGTGGA-----CCTTACCCTGGGACAGGAGGCCT--------------AGT----------GGACAAGGAAAGAGGAGGTTGTAGA---CTTAAACCCAGCTCTCAGCCTCCCAGCTCT-GCGCCTTCCCATAGGATTTCTCTTT------GACCTTGCTGCCCATGAG-ACAGATGTTGTTCCTGATGCTGCAAGAAGGGGCAGTAGGATCTCAGG------AGTGGCTCATGGCTGGGGCTAGGGGTCAGGCTTGGT-GCATGGTGCCTAGGCCCACCTTGTGCCCAGCATGGGAGCTCCATGCAC-------------AGTGGATTTGGGGAGT--------GGTCTGTCCTCTGGTCTCTGACTGCTTGGCAGTCTAA-GTGAAGGCCACTTCG-GG---TCTCAGCAGTTTCTGGGACTGGCCATGTG----TT--GGGGGATAGGCTATTGCTGAATGTCCTCC-CTGGTGCC-----T-CAACCCACCTCAGACCACCT--CAGGACCAATC-AGAGAAGGAGTAGTAA-C-CACTCTGTTCCATGCTTGGACAGGGCCACAGA-----------GGCACACAGGGCCCTTTG----GAGAGAAGTGAAATGACCATAGCTCTCATAGCTTCTGTCTGTCTGTCTCTGTCATGTGTCCACCTGTGTCTAGTGGAGCGATGCATGAGTGCCATGCAGGAGGGGACCCAGATGGTGAAGCTCCGTGGCAGCTCCAAGGGCCTGGTCCGCTTCTACTACCTGGATGAACACCGCTCCTGCCTCCGCTGGCGGCCCTCACGCAAGAACGAGAAGGCCAAGAGTGAGTGGACAACCCAGGGATGGGGATGGGTGGGCCTGGGCCCGGGGAGCACAGGACAGGGAGGCCTCCCA----------------------AGTAGACGCTGTTGTGGGCTAAG-CCCCACTGAGATGGTGTGCTGGTCATCTCTAGACTT-----------------------------------------------------------------     
11 Miniopterus_natalensis-NW_015504651.1-671986_672164      85.9%  37.0%    --------------------CCAGGAGGTGCAAA--------------------------CTGTAGACAGCAGGCTGGGCGCACAGAGGAGG--GTGTGGGGAAGAGGCAGGTGGGCCCCGTGCGCGAAGGGGTTTGATTTGGGCTCCGATCTGC-GTGGG----------GCAGTGGCCTGCATG---TGTGCAGTGCCACCCGGCGACACGCAGGATG-----TG---GCTTTCTG--AACATGCCAGGCAG--GGTGCAGGCAGCTAGGA-GCCAGGCTGGGCATCA-----TGGAGGGGGCACCGCCCTATGCCTGGCACCGAGGCTCCTGA--------------------------------------------------------GAG----------GGGCTCAGCCGCC-CTGTCCCTGCCCGTGTGTCTCCTCC-------TGTGTAG-TAGCCTTTG-GGGCAAGTCATGGTGGTTGCC---GGG-GCTGGTCCAGGTGGTGGACGGTCGGATGGGCAGGTGGCCAGTC----------------------------------CTGCCTGAGGCCTCAGCTGGCCCTCAGGCCCTG-------------GGACCATCGGGGAGGGCAGC------AGGGCGGCTGG--------GA-GAATCGCTGTTTCTCCTCGAGGGCTCTGG-CC---CTTGAACAAGGTCCCAGATGGGGTGCTTG----ACCCGGGCCAGCACCTGGGGCCCCA--GGTGCCCTGGGGGTCTGAGCT-CAGCCCCCAGTGGGCAG--G----GGGTAGGCGATGGGTGGTCTCTGCAT-C-CACCTTGGCACATGGGGGATGGGCGACGAGTTGAGGG------GGTGTTGGGGATGCTGCGGTGC-TCACGGT---GCCCCGTCTGTCTGTCTGTCCCCTCCCGTCGTCTCCCTGTTCATGTCGGCCGGCGTGTCCAGTGGAGCGGTGCATGAGCGCCATGCAGGCAGGGACGCAGATGGTGAAGCTTCGAGGCGGCTCCAAGGGCCTGGTGCGCTTCTACTTCCTGGACGAGCACCGCTCCTGCATCCGCTGGCGGCCCTCGCGCAAGAACGAGAAAGCCAAGAGTGAGTGGGGCGCCCGGGGTGGGCCCCCTCCCAGAGCAGCCTGGGGAGGGGGCAGCAAGACCTTGGGCCCCGGATGTCTCAGGCGGCTCCCGGCCCCGCCTGTGGGCTCAGTCG------------GCCTTGGCCATCTGA-----------------------------------------------------------------------------     
12 Microcebus_murinus-NC_033661.1-169530_169747             87.0%  35.7%    -----------------------------GCAGAGCCCGAGGAGGCAGG--GCCAGCCTGTCCCTGGGCTGAGGCTGGCTGCCTCTGGCCCGGACCTGGGTCTAGCTACGACAGGAGG-CTGATGGACGGG--GC-GGGGGCAGGGGAGAGGCAG-GTGGCC----CC-------GGGGAAAGCTGTGGGGCTCCCAG-------------------ATGTG--------CACCCTGG--AATGCACGGGACCT-CGCCCCCAGGCCTCAGGG-GACA-----GACGGAC-----GCAGGGCTGTC-CTTGCTGCATGTGGCG-------------------------------------------GAGGGGCTTCCAG---------------GCCAGGAGGCTCCTGCTCTTGGGA-GCCACCTGTGGCCGGCCAGCAGCGG-----GGCTGGGTGTGGGTGGCCA-GAGCCCGCCCTGCATCGGGCAA--GG--GACCTCCTGAGAGCTGGTGC-----AGCCGCTGGCCTGT-GACCCTGGT----GTCATCCCCCTTCCTGCTGTTGAATTTGATGCTGACTCTGA----GTGACGACCCCT------------CAGGCCCCTGGCCCA-C-CC-AATTGCCAATTGTTGGG------GGGC-CT----------------GGTCCAGGCGG-GG---GCTGAGCAGGGCAGGGCAG-----GGGT---------CGGCTGGGCAGTGGGGTTGGGTGGGTGAT--CGGGGTGTGTCCC-CAGCCAGCACCTGGGTGGCA----GGCAGCCCC--GGGCTGGCCCTGGCC-CGCAGTGG-GCAGGTGGGTGGC-CCGACCGGGTGGCAGG-GGACAGGACGGGTGGCGGGAGCAGGG-GGAGCCTCGG-CACTCA---------CCCGCACCATGTCTGTCACCGTGTGTGCCTGTGTGCCCGCCGAGCAGTGGAGCGATGCATGAGCGCCATGCAGGAGGGGACGCAGATGGTGAAGCTCCGCGGCAGCTCCAAGGGCCTGGCCCGCTTCTACTACCTGGACGAGCACCGCTCCTGCATCCGCTGGCGGCCCTCCCGCAAGAACGAGAAGGCCAAGAGTGAGTGGCCGCCCCGCAGGTGGGGTGGGCCCAGAGCCCCCGGGGGGCACATGG-GGTGGGGATCCCTCTGGGG-----------GGGGCTCCTGGTGGCACTGGGGGAGGGC-TTTGCCGCA-AACACCGGCTCAGGCCCCGG--------------------------------------------------------------------------     
13 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-171871_172036         86.8%  37.3%    -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G-GTTTCCTAAAAAGAGGTGTATGGGCCTG---AGTGGGATGTGACCTGTCCCTGGGCTGGGACCAGCTGACTCTGGTCAAACACACTGCACCCCTTCCCTAGGACCTGGGACAGGAGGCCGAGAGGAT-------GGAGGGGGCAGTGTCTCAGGGGAGGGGCAGGTGTGCACTCCAGCCTGGTGCCTCA------GCTCCCGACTCCGGGCCCTCCACCATGACAGCTTGCTGGTGGAAGCACCTGGGAGCAGAT-GCTTGCACAGCTAGCAGTGCCACAT-----GGGGGACAGCCACTTTCCC-GGGGAAGTGGAGGGGAGG-------------------TGTG---GATGCTTCGAGCCGTTC-ACACTGGGGCAGCAG----CCAGGCCAAGCGTTGGACTGGCA-CTGCCTGGGCCCTGCCCTATGCCCTGCACAGTGG---CCTCTGCTCTGTGGCTCCCAC-AA--GCCGCTGGGCCACTGCT--TCATCCTGGGC-AGTGGGCGTCCAGTGCTTGGGAAGTTCGGGTGACCGTCCCCTTGGGGCCAGGGGTGGAATGAC------------AATGGGCCCCA-----GCTGAGCGGCCAGCAGCACGGCCCCTGGGACCTCAAGTGGTCT-CA----GTCCCCACAGCCAGTGGGGCAGGGGT-GGCAAGTG-ACCC-TGGGTGTCTAACCCCCAGCCTCAGCGGGCAGGTCGGTAGGGGTGGCTTT----TGTGCCCCTTGGGCACACTCAGTCCAGCCCGCTCACAGCCCCACCTGTCCTGTGTCACCTTCCCCGTGTCCAGTGGAGCGGTGCATGAGTGCCATGCAGGAAGGGACGCAGATGGTGAAGCTCCGAGGCAGCTCCAAGGGCCTGGTCCGCTTCTACTACCTGGATGAGCACCGCTCCTGCCTGCGCTGGAGGCCCTCGCGCAAGAACGAGAAGGCCAAGAGTGAGCGGCTGTCCGGGCCCCCCGGGGCACTCTGGGTGGTGGAGTGGGAGGGGCCGGCCCTGCCCAGCTGCCC------ACC-TGGCAGCACCCTGGGC----------CTGG-ATGGCTCTGGG--CCAGATGGTGGGGTGGAGGGGA---------------------------------------------------------------------     
14 Equus_przewalskii-NW_007674960.1-182824_183083           90.0%  39.6%    ---------------------------------------------------------------------------------CCCTCCGTGGT--CTCCGGGGCAGATGTGCGTGGTGCCATCCTTATTGCTTG---TAGGCGGGCTGCTTTCCTG-AAGATG----CCACAGAAAGGGGGTGCAGGGGCTCCGGAGCAAGGCCGTCT-GCTCTCAGGAGTTGCCTAC---GGCTGGGC--CAGCAGCCAAGCCA--GATGTCG---TCGGGGC-GGCCGCCTGCCTGCTG-----CCCACCGGGGCCCACCCCATGCCTGGCACAGAGGCTTGCTG--------------------------------------------------------CACA--------------GCAGCTCA-GCCACCACGCACCTGTGTCTTCTCC-------TGTGTCA-TAGCCTTTG-GGGCAGGTCATGGTGGCCGCT---GGG-TCTGGTCCAGGTGGTGGAGGCTGGGATGGGCAGGCAGCCAGATGGGAGC-----AGAGTTA-GGGAGGAACAGGGTTCGGTCTGGGACCTTGCCTGGGCCTCAGGCTCCA-------------GGACC-ACAAGGAGGG-----------TGGCTGGGCA--------GA-ATCGGTTTGTTTCTCTGCGTGAACTCTGG-CC---CTTGAGCAGGGTCCCAGATTGAATGTGTG----ATCCAGGCCGGCACCTAGGGGTTGCAGGCAGCCCTGGGGGTCTGAGTT-CAGCCCCCTGGTGGGTAAGC----AGATGGTGGATGGGTGGTCTCTGCAC-C-CCCTTGATCACGTGGAGGTGGGTGTG-GGGCTGGGCTCCGGTGAGCGGTGGGGCTGCCGCAGCACTCACCGGC---GCCCTGTCTGTCTGTCTCTGTGTTGGTCATCCATCTGTGTGACGGGGTCTGTGGATGTCCAGTGGAGCGATGTATGAGTGCCATGCAGGCAGGGACGCAGATGGTGAAGCTCCGTGGCAGCTCCAAGGGTCTGGTCCGCTTCTACTTCCTGGACGAGCACCGCTCCTGCATCCGCTGGCGGCCCTCGCGCAAGAACGAGAAGGCCAAGAGTGAGTGGGGCAGCCTGGGGGAG-GGGCCAGGGCCCCAGACCAGCA---------------CTCGGGGTGCAG-------GGACCTCTCCCAGAGCAGCCACTGGACAGCGTGTGA-GCTGCCAGACCCTGAGACCGGCAAGTCTCCAGGTGGC----------------------------------------------------------------     
15 Urocitellus_parryii-NW_020540697.1-275953_276126         81.3%  28.9%    ------------------------------------CCTCAGAGTCCCCAGGTGGAGCTGCCCAGGTCCCCTG-CAGCACCCACCAGGGGTCCCTCCCTATGTGCCTCTCACAGGGTT-GGACACTGTTGAGCAT-CAGCAGCTGTAGCTCTTAGGGCTTGG-GCTTTCTGTAAGCAGGTATGCAGGGCTTGGGGGCAGATACTGACCTGTCCCTGGGCCAGGGCCAGCTGACCCTGGCCTGGACTCCTTAAAGCCTATGG--------------------------------------------CCCCCTCTCCTTGGACAGAAAAGG---GAGATTTGACTAGTCCCTCC------GACCTCAGATCTGTGCCCTCATGC------------TTC---TGTGGCCTTGGAGAGTAGACAGTGGAGTGTCCTTGCTGCCCCCT-----GGGGAGG-A-GGAGGTTCC-TGGGGATGCCACAGGAAG-----------------GGGGTGCTGGCTCTCAGGTG-------------TG--------------GCCTGTGGGCATGGGTAGCACCTGC--TGGGTCTGCCCTGTGCCTGGCTGAGGGGTCTCTTCTGCTCAGTGGCTCCTGAGAG--CCAGGCTAGCCACGGGGCCCTGTGTCTAGC-TGTGGGCTTTCCATGCTCCTTCAGTCTGCGTGGTGGCYCCTCAGGGTC-----------------------------------CAG-----ACTGA-----CTGCAGCATCGTCCAGGT-------GTTTCTGG-GA----TGGGCCACGGCCCAGC---AGAAAAG-GGCAGGTC-CCCC-CTGGGGTCTCGCCT--GGCCCCAGCC-----CTGGG--TGGGTGGATGG----GGTA-------GGCAGG---GCGTGGGCTGCCGCAGCTCTCCCGGCCCTGAGGTCTGTCTCTGCTGTGTCCAGTGGAGCGGTGCATGAGCAGCATGCAGGAGGGGACCCAGATGGTGAAGCTCCGAGGCGGCTCCAAGGGCCTGGTCCGCTTCTACTACCTCGACGAGCATCGCTCCTGCCTCCGCTGGCGGCCCTCRCGCAAGAACGAGAAGGCCAAGAGTGAGTGGGCAGCTTGGGGAGCGGGRGGGACAGTCCCAGGGCTCAGGAGCCC----TTCCAGAGCAGCTGCTG------GAC-AGTTGGGTGCC---------GAGCCCCTGC-GTCTGGGGTAT--CTCTAGACTCAGGTGGCCTTGGAGT------------------------------------------------------------------     
16 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-179785_180044         89.1%  39.1%    ---------------------------------------------------------------------ACGG---AGACTCCCTCCGTGGC--CTCTGGGGTAGACGTGAGTGGTGCCATCCTTATTGCGCGTAGAAGGAGGGCGACTTTCCTG-AAGATG----CCACAGGAAGGCGGTGCAGGTGCTCAGGAGTGAGACCTTCT-GCTCTCAGGAGTTCCTGT----GGCTGGGC--CAGCAGCCAGGCTG--GGTGTCG---TGGGGGT-GGCTGCCTGC-----T-----GCCCGTGGGGCCTGCCCTGTGCCTGGCACAGAGGCTTGTTG--------------------------------------------------------CACA--------------GCAGCGCA-GCCACCGTGCCCCTGTGTCCTCTCG-------TGTGTCA-CAGCCTTTG-GGGCAGGTCATGGTGGTCGCT---GGG-TCTGGTCCAGTTGGTGGAGGGTGGGATGGGCAGGCAGCTAGATGGGGAC-----AGAGTTG-GGGAGTAGCAGGGTCCTGTCTGGGACCTCGCCTGGCTGTCAGGCTCCA-------------AGACC-ACAGAGAGGGGGGCAGGAGCCTGGCCAGGCA--------GA-ATTGGTCTGTTTCTCTGTGTGGACTCTGG-CC---CTTGAGCAGGGTACCAGATTGGATGTGC-----------------ACCTGGGGGTCGCAGGCAGCCCTGGGGGTCTGAGTT-CAGCCCCTGGTGGGTGGGCA----GGTGGGTGTATGGGTGGTCTCTGCAC-C-CCCTTGAGCACACGGAGGTGGGTGCTGGGAGTGGGCTGTGGTGAGTGGTGGGGCTGCCGCAGCGCTCACTGGC---GCCCTGTCTGTCTGTCTGTCTCTGTGTTGGTCGTC------CATCTGCGTGCCGCGGTCCAGTGGAGCGATGTATGAGTGCCATGCAGGCAGGGACGCAGATGGTGAAGCTCCGCGGCAGCTCCAAGGGTCTGGTCCGCTTCTACTTCCTGGACGAGCACCGCTCCTGCATCCGCTGGCGGCCGTCACGCAAGAACGAGAAGGCCAAGAGTGAGTGGGGCAGCCCTGGGGGGCGGGCCGGAGCCCCAGGCCAGCC---------------CTCGGGGGACAG-------GGACCCCTCCCAGAGCAGCTGCTGGACAGCGAGAGG-GCAGCCAGACCCTGAGCCCGACAAGTCTCCAGGTGG-----------------------------------------------------------------     
17 Rousettus_aegyptiacus-NW_023416284.1-175922_176095       87.1%  34.9%    ---------------------------------------------------------------TTGGCGGTCG-----GCT---CCCTGGCA--CTTTCGGGAGCGGCGAGCTGGTGCCGGACACGAGGGCCCTTACACTGGACCTCACCACCCGGCCCCAGGGAGCGGCTGTCCCGGCCGGCACCACCTCCCCTGGGAC--CTGGG-AGGCACGGGGCT-GCAGACGGGGCCCAGCGCACGGAGGCGGGGCAG--GGCGGAGGGGGCCGGGG-GAGAGGGTTTGGGTTT----GGAGC------------TTGATCCTGGTGCTGCGCC--------CCCTGGACCTGTGCGCCCCCCGTGGCCTGCAGGTGTGCCGCTGCCA----CG--CGGGGCCACCGCACACAGGACGAGG-------GTTCCCTGGACGTGCCGTGC--------CGGGTGCCGCACTCGG-GCGCGGCCTGCGGCTGGGCCAGCGAGC-AAGGCTGGGCGTCCTGAGGGGGTGGCCGCCGGGGCCGCTCCAGGTGGCAGATGGGGGCGGGGCGTGGGCAGGTGGCCAGTCCTGGGCCCTCACCTGGCCCCAGGCCCCAG-------------GGCCT-TCGGG----------GAGGGCGGCAGGAGCT--------GGCTGGGCAGAGCGCTTCCTCTCTGCCCCTGG-CC---CCTGAACAGGGTCCCACATTGGCATGCG-------------------------------------------------ACCC------------------------AGGCCAGCGCCTGGG-GGTCGCAGGCA-G-CCCTGGGGGGGCCGACG----------CTGGAGCAGGCGGGGTGGGGAGCGGGCTGCAGCGGGCGGCGGGGCGGCCACGGCGCTCACCGGCTCCCGTCCGCTG--TCTGTCTGTGCGTGCGTCTGTCGGCTCGCCCAGTGGAGCGGTGCATGAGCGCCATGCAGGCGGGGACCCAGATGGTGAAGCTGCGAGGCGGCTCCAAGGGCCTGGTGCGCTTCTACTTCCTGGACGAGCATCGCTCCTGCATCCGCTGGCGGCCCTCGCGCAAGAACGAGAAGGCCAAGAGTGAGTGGGGCGCCGGGGCGGGGGCCCC---------------CGCGCCGGGCGTCTC---AGGGGGCTCCGG---GCCTCGCGCGCGGGCTCGGCCGGCCCTGGAGTTCTGCGGG--GACCTGTGCGCACAGGGCGGGACGTGGCCGGGC-------------------------------------------------------------------     
18 Heterocephalus_glaber-NW_004624818.1-173411_173573       87.0%  36.3%    ----------------------------------------------------------------------------------------------GTGCAGACC------TTGGGGCCT-GGATTTCTCTGAGCTT-TGGTGTGG-GACC-TTCTGGGTCCTG-GTTTCCTAGGAGCACGCGTGCAGGCCTG---AGTGGGGGCTGACCTGTCCCTGGGCTGGGACCACCT----------------------------CCCCAGAGCCCAGGACAGGAGGCAGAGAGGCC-------AGAGGAGGCAGTGTCTCCAG-GAGGGCCAGGTGTGCACTCGGGCCCGATGCCTTG------GCTCCCAGCCCCGAGCCCCACTC------TGACAGCCCCCGGGTGGCCCTGGGAGTGGAT-GCTTGCAGAGCCAGCAGTGCCAGGT-----GCAGGGACAGTGACTTTCC-TGGGGAGGAGAGGAAGGGGC---------AGGGCAGGTGTGATGGTCTTCAGGATCGGCCC-ATGCTGGGGCAGCAG----CCAGGCTGGGCACTGGGCTGGCGCCTGCCTGGGACCTACCTTGTGCCCAGCACTGTGG----CTCTGCTCTGAGGCTGCCGCAAG--CCAGCTGGGCCGCTGCT--CCGTCCTGGGC-CGGGGCCCT--CATGCTTTCGAGGTCTGGGTGACAGTTGCCCTGGGGCCGGGCATGGGGTGAT------------GCTGGGCCTTG-----GCTGAATGGGCGGGAGCACAGCCCTGGGACCAGGTGGCTG----TG----GTCC---CTGTCA-----GCAGGGGC-GCCGAGTG-AC---CTGGTGGCTGATCCCTGGCCTCAGTG--------------CGCGGGCGG----GGTGGCCCTCAGGCACCCTGGGTGCAGGCTGCTCACAGCCCCT-------CTGAGTCGTCCGTCTGTGTCCAGTGGAGCGGTGCATGAGTGCCATGCAGGAGGGAACGCAGATGGTGAAGCTCCGCGGCAGTTCCAAGGGCCTGGTCCGCTTCTACTACCTGGATGAGCACCGCTCCTGCCTGCGCTGGAGGCCCTCACGCAAGAATGAGAAGGCCAAGAGTGAGTGGCCTTTTGGGGCTCCCCGGCTCTGGGCTGC---GGGGTGGGAGGGGTCAGCCCACCACGCAGGAC--------------------C----------------CTGG-GTGGCCCCGGG--CCATATGCTGGGGTGAGGGATTGAGAACCCAGCTGGGC------------ACCCTG-----------------------------------     
19 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-179329_179609            84.9%  32.8%    ---GGGGCC--------GGATGACCTGGTCTGACCTGCCTGGAGCCCAC--GGCCTCCTCCTCTGGGGCCTGGGAAATACACAGCTGCAGGG--AGGAGGTGGACAGAGGAGAGGGGGCAGGT--------GGGCACAGGTGAGTGTGTGCTATG-GAACTCAAATCTAGGGCCACGACTTCCCAGATCTATGTCCTCGA--------GCAGGGCTTACTCCCTGTG---GCCTTGGG--GAGCGAACAGAGAT--GATGCTTCCTTGTGTGG-GGGAGGGTAGCTTTCCTAAAGATGC--------------------------------------------------------------CACAGTAACAGGGCATGGGGACT----CAGGAACAAGACCTATGACTGGGGCCAGCA-GCCAGGCTGGGCGT----GGGGTAG-------CTCTGCCTGGGGCTCCT-TCCCCAGTGGCTCCTGAGGGC---CAG-CCCAGCTCAGCTGCTGCATCTGTGCATCCCCAGGTCACCACCCTGCTGACTTCCAGTGCTCTTCAGTCTGAAT-------GATGGCCAGGTGGAGGGGGACAA----GCA-------------GATGGCTA--------------------GGCAGGCAG--------GA-GCAAGGGCCTATCTGGGACTGAGC-----------------------------------TGTGT----CTCTGAGCCAGCACCTGGAGCG-GCAGGCAGCCCTGGGGGTCCGGCCT-TGGCTAGCAGTGGGCAAGCGGGCAGATAGGTAGGTGGTCGGCCTCTGTGC-C-CATCTTGAGCACATGGGATCCCCGGGCAGGTG---------------------------------GTGGGCTT---TGTCGTGGTGCTTGTTGACACACTGTGTCTGTCTCTGAGTTAGTCTGTCTGTCTACTTCCAGTGGAGCGATGTATGAGCACCATGCAGGAGGGGACACAAATGGTGAAGCTCCGTGGCAGTTCCAAGGGCCTGGTCCGCTTCTACTACCTGGATGAGCACCGTTCCTGTATCCGCTGGCGGCCCTCGCGCAAAAACGAGAAAGCCAAGAGTGAGTGCGCAGCCCGGGAAGGGGTGTGGGACAGCTCAGAGCCCTTGGGTGAGC-----ACATAGGGTGGGG-----------ACCACTCCCAGAGCTGCGCTGGACAGT-TGAGGGGCAGTAAGAGCCTGAGCCCTGGACATCTCCAGAC-------------------------------------------------------------------     
20 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-172197_172378       88.0%  36.9%    --------------------------------------------------------------------CTGGGGCCGGCTGACTCTGGCCTGGACTCGGGCCCAGCTACGACAGGAGG-CCGATGGACGGG--GC-GGGGGCAGGGGAGAGGCAG-GTGGTC----CC-------GGGGAAGGCTGTGGAGCTCTGACCCATCCCTCAGCCTCCCAGACCTG--------CACCCTGG--TACA----------------CATGGCTCGG--G-GGTG-----GACGTAG-----GCAGTATCGTC-CTTGCTGCGTGTGGGGCAGG-GGCTTCCA--GGAAGGGCCCCA---------GGAGGGGCTGCAGGCCCTCA---------------GGAAGGAGGCTTCTGCTCCTGGGA-GCCTCCTGGGGCCGGCCAGCAGCCG-----GGCTGGCTGTGGGTTGCCG-GGGCCCGCCCTGCACCAGGCAC--GGG-GGCCTCCTGAGAGTTGGCAC-----AGCCGCTGGCCTCTGCCCCCGGGT----GTCATCCCCCTTCCCGCTGCTGAGTTTGATGCTGACTCTGA----GTGACGACCCCT------------CAGGGCCCCAGGCCC-A-CGCGGTTGCCTACTGTTGCA------GGGC-CTGGTCCAGGCGGCG-GTGGGAGAGGCGG-TG---GCTGAGCGGGGCAGGGCAG-----GGGC---------CCGCTGGGCAGTCGGGTTGGGTGGGTGAT--CGAGGAGTGTCCC-CGGCCAGCACCTGGGTGGCA----GGGAGCCCC--GGGTCGGCCCTGGCC-CCGTGGTGGGCAAGTGGGTGGC-CTGGTGGGCGGCACGG--GACGGGCCGCGGTGAG-GAGGGG---TTGCC---------------------GTGGCACTCACCCGCGCGATGTCTGTCTGTCCGCCCGTCGCGTGCAGTGGAGCGATGCATGCGCGCCATGCAGGAGGGGACGCAGATGGTGAAGCTCCGCGGCAGCTCCAAGGGCCTGGCCCGCTTCTACTACCTGGACGAGCACCGCTCCTGCATCCGCTGGCGGCCCTCGCGCAAGAACGAGAAGGCCAAGAGTGAGTGGCCGGCCCGGCAGGTGGGGGGGTGGCTCATGGGGTGG----GGATC--CCTCCCGGGCAGCTGCCGG------------TGGCTCTGGGATCAGGTGGCCTTGGAG-TTCCGTAGTGACCCCTGGGCCATGGGGAGGGCCC-----A----------------------------------------------------------------     
21 Fukomys_damarensis-NW_022900935.1-173202_173383          81.2%  30.8%    NNNAGCTCCCTCTGCTCACGTCAGTATCAGCCTCTTCCAAGGAGACCCTGGTAGGCACTGCCCATGGTCCCTG-TGACACCCACCTAGACCCCATTGTGCAGA------CCTCGGTTT-GGATTTCTCTGAGCTT-TGGCACCA-GACC-TTTTGGGACCCG-TTTTCCTAGATGGAGGTGTGCAGGCCTG---AGTGGGGCTG-ACCTGTCCCTGGGCTGGGGCCGCCT----------------------------CCCCAGGACCCAAGATGGGAGGTGGAGTGGAC-------AG-----------------AGGAGGGCC---------------AGGTGTGCCTCA------GCTCCCAGCCCCATGCCCCACTCTATGGCAG-----CCCCCAGGTGGCCCTGGAGTGGAC-GCTTGCAGAGCCAGCAGTGCCATGC-----AGAGGGACAGTGACTTTCC-AGGGGAGGGAGGGGCAGG--------------GCAGGTGTGGGTAGTGCT------------------TAGGGTCGT----CCACCCTGGGCATTGGGCTGGTACCTGCCTGGGGCTTACCTTGTGCCCAGCACAGTGG---CCTTTCCTCT---------------------GAGGTCACTGCT--CCATCCTGGGC-TGTGGGCCTCCAGTGCTTGTGAAGTCTGGGTGACAGTCCCCTTGGGCCCAGGGGTGGGATAAT------------GCGGGGCCTCA-----GCTGAGCAGGCCTCAATTCCCCACCATTG----------------------------------------GAGGGGT-GGCGAGTG-AC-C-TGTGTGTCTGACCCTCGGCCTCAGTGGA---------------TGGGCA----GGTGGCCCTCGGGCACATGTGGTGCAGGCTGCTCATGGCC------CCGCTGTGTTGTCTGTTCTGTGTCCAGTGGAGCGGTGCATGAGTGCCATGCAGGAGGGGACGCAGATGGTGAAGCTCCGCGGCAGTTCCAAGGGCCTGGCCCGCTTCTACTACCTGGATGAGCATCGCTCCTGCCTGCGCTGGAGGCCCTCACGCAAAAACGAGAAGGCCAAGAGTGAGTGACCCATGGGGCTCCCTATTGCTCTGGGCTAGGGTGGGAGGGCCGG---GCCCTTGCCCAGTTGCCC------ACC-TGGCAGGTCCCTGGTCTCCAGGACAGCTGG-GTGGCCCTGGT--CCAGATGCTGGGGT-----------------------------------------------------------------------------     
22 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-137759_137925            89.5%  39.2%    -------------------------------------------------------------------------------TTCCTGGAGCCT-------CCCACCCTTCCCACAGGGGGCCACATGGGCAGGGGAG-GAGGAAAGCAGAGAGGCCG-GCGGAC----CCAGGGAAGGTTGGAGGCTGTGGAGCTCAGACCCAGCTGC-AGCCTCCCAGATCTG--------CCCCTGGT--CCATG----GCCCT-GGGGAGTGGGCACTAGTG-GTCCCTCTTGCGTGGG-----GCGGTGCTTTC-CTGGAGACATCCAGGAGTGAGGCTGTCTG--------CTCCCA---------GGAGCGGGTATGGCTGCCACTG-----------CGGCCACCCTGCGCCTGGCTGT--GG-GCCTCCTCAGCACTGTGACCCCTGT-----GCCTCTGTCTCCCATGCCG-TGGCCCTCCCG------------------CTGCTGTGTTCCCTGCAGG-----CTCCGCTGTTCCATGGCCCTCGGA---GCCCCAGGCCGGCACTGGATCTGGGATTGCTGGGACTGGTCCTGTGTTGGGGAGGGCA----------GGCGGCCGAGCAGGGCG-G-GCAGAGTCCTCTCTGGGCCC------CGGC-CTGGCCCT----------CCATCCCTGGG-CT---GTTGGGAGAGGGATTGCAG-----GGAC---------CCGGCTGGGCCGTGGCCTGGCCATGTGAC--TGCGGTGTGTCCC-TAGCCAGCATCTAGGGGCCC----GGGATCTGG--CCTCAGCCTTAGCATGGGCAGGTGGGCTAGTGGGTGGC-CTCTGTGCCCTGGACACACACGGTCCCGGGTGGG-CAGG-----TTGGGGGTG----------GTGAGGGCAGGGCGTGTCCCTGCTCACGATGCTCACGTCTGTCCCCATGTGCAGTGGAGCGGTGCATGAGTGCCATGCAGGAGGGTACACAGATGGTGAAGCTCCGTGGCAGCTCCAAGGGCCTGGTGCGCTTCTACTACCTGGACGAGCATCGCTCCTGCATCCGCTGGCGGCCCTCACGAAAGAGCGAGAAGGCCAAGAGTGAGTGGGCTGGGGGATCTGCGGGCCTGGGGCGGGGACCCTCTGGAGCAGCTGTCAGATGCCGAGGGCCAGGG--AGGATCTGGGCATCGCTGGGCTCAGCTGGTCTTGGGG-GTCCGCCGTGACATCGGG--------------------------------------------------------------------------------------     
23 Canis_lupus-NW_023365093.1-182812_182984                 88.8%  36.1%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGGTGCCTCTCT-------AGTG-CCAGGAGGCTGCCGGCCTGCTGGGTGCCCCCTGACCCCAGGACCTGGCAGACATGTAGGCTGCA-----------GGCAGGAG-----------GCCCAGTGGACAGAGGAGTGGGAAGAGAGGGAAGGAACGCCAG-GGAGGGGTTTGCGTTCT---GGAGCTGAAGTCTGCTTCTGCACCTGCTGCAAAGCCTTGGCCTCACAGGGCCTCCC-----C--CCAGGGGTGGACGAGTGCTATGC-----------TCCCCTTACTGCACAGAGGAGGAGGA-GGAGGTTGGCTTTCCTGGACACCAC---GGGAAGGGGGCTCAGGCTCTCAGGAGAGCCTGTGGCCGCTGGC---TGC-TGTCTATGCCCAGCTCAGGGTCTCAATGCACAGAAGCCCCTGC------------GAGTGGCTCAGCCACCACAGCCCCTCATGTGTCATAGACTTTGGGGGTGGGTCAT--------------GGCGGTCAGTGGGGCCAACAGAGGGTGGGTGGGCAGGTAGCTGGAGGAAAGGAAAGCAAAGCTGTGGAGGAGCTGG-GC---CCGACCCGGGACCTCCCCCAACCCAGGAG----AGGCTGGCCACATCCTGG---------CCAGGCCCAAGAGCTGGGCTC-CTAACCCCCATGGGCTGGCG----GGGGGTGCGGTGGATGGTCTC----C-A-CGCCTCGGCAGCACGTG-------------------GTTGGTAGGCGGTGGGGCTGGCCCAGCCCTCAT-------GCCACTCCTGTCT-ATCTCTGTGTCTGTCATCTGTCTGCCTGCTGCGTCCGTGGACATCCAGTGGAGGGATGCATGAGTGCCATGCAGGCGGGGACACAGATGGTGAAGCTCCGTGGCAGCTCCAAGGGCCTGGTCCGCTTCTACTTCCTGGACGAGCATCGCTCCTGCATCCGCTGGCGGCCCTCACGCAAGAATGAGAAGGCCAAGAGTGAGCGGGGCAGCCCTGGGGGGAACGACTGGGGGGGCATCTCAGGGGGAGCAGCATC----CTGAGCCCTGG---GCCTGG-CACGTGGGTCCAGTGGCCTTGGGGTTTTGAGGTGACCTCTGGATGC---------CAGGTGGGA-----------------------------------------------------------------------     
24 Dipodomys_ordii-NW_012267222.1-167965_168137             90.7%  34.8%    --------------------------------------------------------------------------------------------------GGGGAGGCTAGCACTGGAT--TTGATCCTTAG------GAGAGAGGGTGGTCGTCCT-GAGGAT-ACTGCAAGAAGGGAGCGTGGCAC---TCAGAAGTGGGA-CTGTG-ACTCCCAAGAGTGGCTCA----------CG--GCTGGT----G-----CCAACAGCCAGCCTGGGCACCGGGATGTGCTTTGCC--CACACTGTGCCCCCTGGAGGCCT-GTGCACAGTGGCTCC--------------CGTGCACAC-ACGGCTCTGGGCCATGTGTGTGTGTGT--------GTGTGTGTGTGTGTGTGTGCACGCGC-ACATGCATGCATAAGCATGCACGTCAGTCAGTAAGGAGCTTGAACTCAG-GGGCTTGCAGTTTTACTTACTCTCAGC-TGGCACGCTACCACTTGAG--------CCACGCCTCCATTTTGCATTTTGCTGATTAGTTGGACATAGAGCCTTGCAAACTTTGGGCTGTGAAC-------------TT---------------GTAGATC---------TCAGCTTCCTGAATAGCT--------GGGATTTACAGAT---------GGGAGCCACTGGTAC---GTGGCTCTGGCTGTGGGCTTCGGATCAGT----AGCCAGTCTGGCTGGTGG-----TCAGTGGGCCCTGGTGGTTACTGGG-GCTGCCAGTGGTGGCAGGCT----GGACTGTAGCTGAGCAGGGCCGGGCATATCCTCTCTGGAGCTGGCCTCACCTCAGTGTCTCGGG----CCATCAGAGGAGGGGTGGTGG-----GCAGACAGGGGTCCTTGAACAACTCCGCAGAGCTCATGGGCTGTCTTTGTGTCCTCCGTGTGCCCGTGTCCAGTGGAGCGATGCATGAGCGCCATGCAGGAGGGGACGCAGATGGTCAAGCTTCGAGGCAGCTCCAAGGGCCTGGTCCGCCTCTACTACCTGGACGAGCACCGCTCCTGTCTCCGCTGGCGACCCTCGCGCAAGAACGAGAAGGCCAAGAGTGAGTGGGCAGCCCACTGGGAGGACGGTG-GGCTGGAGCCTGGGCAGCCCGCTGGGAGGACGGTGGGCTGGA-----GCCTGGGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------------------------------------------------------------------     
25 Dipodomys_spectabilis-NW_024870976.1-163324_163505       87.2%  35.3%    ------------------------------------------CTTCACC--GGAGGCCTCCCTCAGGCTTGGGGAGG-A---------------CTT-GGGGAGGCTAGCACTGGAC--TTGATCCTCAG------GAGAGAGGGTGGTCGTCCC-GAGGAT-ACTGCAAAAAGGGAGCGTGGCAC---TCAGAAGTGGGA-CTGTG-ACTCCCGAGAGTGGCTCA----------CG--GCTGGT----G-----CCAACAGCCAGCCTGGGCACCGGGATGTGCTTCGCC--CACGCTGTGCCCCCTGGAGGCCT-GTGCACAGTGGCTCC--------------CGTGCACAC-ACGGCTCTGGGCCGTGTGTGTGTGTGT--------GT--------------GTGCGTGTGC-ACATGCATGCATGTGCATGCACGTCAGTCAGTAAGGAGCTTGAACTCAG-GGGCTTGCAGTTTTACTTACTCTCAGC-TGGCACGCTACCACTTGAG--------CCACGCCTCCATTTTGCATTTTGCTGATTAGTTGGACATGGAGCCTTGCAAACTTTGAGCTGTGAAC-------------TT---------------GTAGATC---------TCAGCTCCCTGAATAGCT--------GGGATTTACGGAT---------GGGAGCCACTGGTAC---GTGGCTCTGGCTGTGGGCTTCGGATCAG--------------------------------TGGGCCCAGGTGGTTACTGGG-GCTGCCGGTGGTGGCAGGCT----GGACTGTAGCTGAGCAGGGCCGGGCATACCCTCTCTGGACCTGGCCTCACCTCAGTGTCTCGGG----CCATCAGAGGAGGGGTGGTGG-----GCAGACAGGGGTCC-TGAACAACTCCGCAGAGCTCATGGGCTGTCTTTGTGTCATCTGTGTGCCCGTGTCCAGTGGAGCGATGCATGAGCGCCATGCAGGAGGGGACGCAGATGGTCAAGCTTCGAGGCAGCTCCAAGGGCCTGGTCCGCCTCTACTACCTGGATGAGCACCGCTCCTGTCTCCGCTGGCGACCCTCGCGCAAGAACGAGAAGGCCAAGAGTGAGTGGGCAGCCCATGGGGGGGCAGGGTGGGCTGGAGCCTGGGGAGCTCGCGGGGGGGGGGGGGGGACGGG-----GGGGGCTGGAGCCTGGGGAGCTTACGGGGGTG--------GG-------GCTGGAGCCTGGGGAGCTCGCGG--------------------------------------------------------------------     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                *****.   .   . *   .  .   :. .    .   .  :**: :.***    *      **.* .* *  *         :** *** ** **.    *    ** .* *****..*.** *  *  :. .. ***.*.   .: