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 1 Target                                                  100.0% 100.0%    ---------------------CCCTGGCCAGGTGACTGGTGGGTGGGGGCTGTTC------CTGGAGGTGGGGGAAGCCTGGGCCTCCATCCCATCCTGCACTC-GCC--------TCCCCTGTCCCCCGGG---TGCTCTAGGGATCATGTGGGTCCAGCAGCGTCGGCTGGCCCTGCCCCTCAGCCGCTCAGAGGCGTGCTCAGCACACCTC-GGTCTCCCAGGCACCTGCAGGGCCTGGGGGCTGAACCCAAGGGGGCGAGGGGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATCTCAGGTGGCTCCAATGCTCTCATTGAAGGGGTGCCTTGTGCTCT-----------------------------GGGGGTCAGTGGTGCTTGCAGCCCAGGCGGCTGGGCTGGCATCCTGGTGCCG---------GACATGAGGGCCTTTGCCGTTA-------------GGAGACTCTGCAGAG----GAGACTGGCTGGGTATGGCTGGGAGGGTGGAGTGTGTGTCTTGTGGTGGCCTGTGGAGGGCCCCGG---TCCGGGCTGGCCTGCCAGCTCTCTGTTCCAGCGGCAGA--------------CAGGGTCCTGTCCAGGCTGCCCTGTTGCAGGCCTCTG---CCCGCCCCCTGCCCCTGTGTCCTGCCTCACCCCTCTCCTAAATCCCTGCAGCCATACCTGCGTCTTCACCTCCCAT-GTGCCCCGGAGAGCCCAGCCCCCCAT-------------------------GCCATGGCTTCCATCCCTTCAATTCCCCTCTGCTCGTGATCACGTAGTAGCT---TCCCCAAGAA-----GGCCCGGCC-AGTACTGCCCTTGGT-------------CCTCTACAACGCCCCCGCCAGGGTCCCTCAGCGTGCAGACCTGGG-GTGGGGATTAACGTCTCTGTGCTTTAGCAGATGGTAC-CTCTGGGA-CCCGGGCTTTCTGTGAGCAGGTGTGCAGGAACCGAGGGGGTGAGACCAGTCTGTTCCT-----------------------------GGGCTGGGACAGCTGACTC-----TGGCCTGGACTCCCTGGAC-------CCTGCAGCCCCCTCTCCTGGGACAAGCTACAGCAGGAGGCTGAATGGAGAGAGGAGGGGAGAGAAGGAGCGAGG--CAGGCA------GCCT-GGGGGAGGGGAGGGGAGGGGTTGTGAAGCTCGGATC--------------------------     
 2 Chlorocebus_sabaeus-NW_023666054.1-201768_202722         96.2%  83.2%    GTGACCCGGAATGAGTGCTGGCCCTGTCCAGGTGCCTGGCGGGTGGGGGCTGCTC------CTGGAGGTGGGGGAAGCCTGGGCCTCCATCCCATCCCTGCACTCGCC-------TCTCCCGTCCCCCTGGG---TGCTCTAGGGGTCATGTGGGTCCAGCAGCGTCGGCTGGCCCTGCCGTTCGGCCGCTCAGAGGCATGCTCCGCACACCTT-GGTCTCCCAGGCACGTGCAGGGCCTGGGGGCTGAACCCAAGGGG-CAGGGGGAG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ACCTCAGGTGGCTCCAATGCTCTCATTAATGGGGTCCCTTGCACTCT-----------------------------GGGGGTCATTGGTGCTTGCAGCCCAGGCGGCTGGGCTG-----------------------GACATAGGGGCCCTTGCTGTTA-------------GGAGACTCTGCAGAG----GAGACTGGCTGGGCATGGCTGGGAGGGGGGAGTGTGTGTCTTGTGGTGGCCTGTGGAGGGCCCTGG---TCCATGCTGGCCTGCCAGCTCTCTGCTCCAGCGGCAGA--------------CGGGGTCCCATCCAGGCTGCCCTGTTGCAGGCCTCTG---CCCACCCCCCGCCCCCGTGTCCTGCCTCACCCCTCTTCTGAATCCCTGCAGCCGCACCTGTGTCTTCACCTGCCAT-GTGCCCCGGAGAGCCCAGTCCCCGGT-------------------------GCCATGCCTTCCATCCCTTCAGTTCCCCTCTGCTTGTGATCATGTAGTAGCT---TCCCCAGGGA-----GGCCTGGTC-AGTACTGCCCTTGGT-------------CCTCCACAATGCC-CCGCCGGGGTCCCTCAGTGTGCAGACCTGGG-GTGGGGATTAACGTCTCTGTGCTTTAGCAGATGGTAC-CTCTGGGA-CCTGGGCTTTCTGTGAGCAGGTGCACAGGAACCGAGGGGGT---------------------------------------------------GGGACAGCTGACTC-----TGGCCTGGACTCCCTGGAG-------CCTGTAGCCCCCTCCCCTGGGACAAGCTACAGCAGGAGGCTGAATGGGCAGAGGAGGGGAGAGAAGGAACGAGG--CAGGTG------GCCT-GAGGGAGGGGAGGGGTTGTGAAGCTCGATCCGGCAC------CACAGCCTCCCAAGT-----     
 3 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-182035_183016         77.8%  44.7%    ------TGGGCTGAGCGCAGGC------------CCTGGCGGGTGGGGGCTGCCCCTGGAGGTGGAAGTGCCAGAAGCCTGTGGCTCTATCCCACCCCAGCACTTGACTCCGCCTCCCCCGCCCAACTCTAG---GGGTCA--------CGTGGGTCCGGCAGCATCGGCAGGCCCTGCCTCTCAGCCGCTCAGAGGCGCCCTCAGCACACCTT-GGTCTCCCAGGTGCCTGCAGGGCCTGGGGGCTGAACCCAGGGGGAAAGATTGGGGGAATTCAGTGGCTCCAATGCTCTGTGCTCTC--ACTGACGGGGTCCCTTGTGCTCTGCGGTT------------------GGTGGTGCTTGCAGCCCAGGTGGCTGGGCGGGCTGGACATAGGGACCCTTGCCATTAGGAGACTCTGCAGAAGAGACAGGCTGGGCATGGCTGGGACGCCAGAGTGT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTGTCTGGGTGGCCCGTGGAGGGCGGAGC---CTGTGTCTGGGTGGCCTG-TGGAGGGTGG--AGCCTGTCTGGGTGGCCTGCGGAAGGCCCAGTCGGGGCTGACCCGTCTTAGGTCTC--------------------TGGGTCC-TGCCTTACTCCCTCCCACATCCTTGTAGCCACCCTGT-GTCTTCACCACCCGA-GTGCCCCAAAGAGCCCAGCCC--CTC-------------------------TGCCATGCCTTCCATATCTCAGTTCCCCTCTGCTCCTGATCACCTAGTAGCT---TCCCCAAGGG-----GGCCTGACC-GGCACTGCCCTGGTC-------------CTCCAC---AACACCCCCTGGGGTCCCTCAGCCTCAGACGTGGG---GTGGGGTTAGCACCTCTGAGCTTTAGCAGATGGTGC-ACATGGGC-CCGGGGCTTTCTGTGAGCAGGTGCACAAGGCCCGAGGGGGTGGGACCAGCCTGTTCCT-----------------------------GGGCTGGGGCGGCTGAGTC-----TGGCCTGGACTCCCTGGAG-------CCTGCAGCCCCCTCCCCTGGGACAAGCAACAGCAGGAGGCCGAATGGATGGTGAGGGGGGCAAGGGGGAGGGAG--AGGAGA------AGAA-ACGGGACAGGAGCCTCAGGGAGGGGAGGGTTAGGAA------GCTCGGATCCA---------     
 4 Callithrix_jacchus-NC_048389.1-183163_184108             78.5%  43.6%    ---------------AGGTGCA------------AGAAGCCTGGGGCTGCATCCCACTCCTGCAGCTCTATCCCACCCCAGCAGCTCTATCCCACCCCAGCACTTGACTCCCCTCCCGCCCCCTCACTCTAG---GGGT--------CACGTGGGTCTGGCAGCATCAGCAGGCCCTGCCTCTCAGCCGCTCAGAAGCGCCCTCAGCACACCTT-GGTCTCCCAGGTGCCTGCAGGGCCTCGGGGCTGAACCCAGGGGGGAAGATTGGGGGAGTTCAGTGGCTCCAATGCTCCATGCTCTC--ACTGACGGGGTCCCTTGTGCTCTGGGGGT-----------------CAGTGGTGCTTGCAGCCCAGGTGGCTGGGCGGGCTGGACGTCGGGGCCCTTGCCATTAGTAGACTGCAGAA--GAGACTGGCTGGGCATGGCTGGGAGGCCGGAGCATGTGTCTG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGTGGCCTGCAGAGGGCGGAGCGGGGGTCTGGGTGGCCTGCGGAGGGCGGAGC---CTGTGTCTGGGTGGCCTG-TGGAGGGCGGAGCATGTGTCTGGGTGGCCTGCGGAGGGCCTGGTCGGGGCTGACCTGTTGTAGGCCTC--------------------TAGGTCC-TGCCTTACTCCCTCCCACATCCTTGCAGCCACCCCTGTGTTTTTACCTCCCGA-GTGCCCCAGAGAGCCCAGCC-------------------------------CCTCATGCCTTCCATACCTCAGTTCCCCTCTGCTCCTGATCACCTAGTAGCT---TCCCCAAGGA-----AGCCTGACT-GGTACTGTCCCAATC-------------CTCCAC---AACGCCCCCTGGGGTCCCTCAGCCTCAGACGTGGGG-GAGGGGGTTAGCACCTCTGAACTTTAGCAGATGGTGC-CTCTGGAA-TCCGTGCTTTCTGTGAGTGGGTGCACAGGGCCTGAGGGGGTGGGACCAGCCTGTTCCT-----------------------------GGGCTGGGGCGGCTGAGTC-----TGGCCTGGACTCTCCGGAG-------CCTGCAGCCCCCTCCCCTGGGACAAGCAAGAGCAGGAGGCCGAATGGATGGGGGGAGGAGAAGGAACGGGACAG--GT-------------------------GGCCTCAGGGAGGGGAGGGTTGGGAA------GCTCGGAT------------     
 5 Sapajus_apella-NW_022437067.1-178762_179224              75.8%  44.1%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCGCCCCCCTCCCCCCAACTCTAG---GGGTCACGTGGGTCCGGCAGCATCCCAGCATCCGCAGGCCCTGCCTCTCAGCCGCTCAGAGGCACCCTAAGCACACCTT-GGTCTCCCAGGTGCCTGCAGGGCCTGGGGGCTGAACCCAGGGGGGAAGATTGGGAGAATTCAATGGCTCCAATGCTCCATGCTGTC--ACTGACAGGGTCCCTTGTGCTCTGGGGAT-----------------TGGTGGTGCTTGCAGTCCAGATGGCTGGGCAGGCTGGACATAGGGGCCCTTGCCATTAGGAGACTGCAGAA--GAGACTGGCTGGGCATGGCTGGGAGGCCGGAGCCTGTGTCTGGGTGGCCCGCGGAGGCCGGAGC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTGTCTGGGTGGCCAGCGGAGGCCGGAGCCTGGGTCTGGGTGGCCTGCGGAGGCCGGAGCCTGTGTCTGGGTGGCCTGCGGAGGCCGGAGC---CTGGGTCTGGGTGGTCTG-CGGAGGCCGGAGCCTGTGTCTGGGTGGCCTGCGGAGGGCTTGGTTGGGGCTGACCTGTTGCAGGCCTC--------------------TGGGTCC-TGCCTTACTCCCTCCCACATCCTTGCAGCCACCCTGC-GTCTTCACCTCCTGA-GTGCCCCAGAGAGCCCAGCCC--CTC-------------------------TGCCATGCCTTCCATACCTCAGTTCCCCTCTGCTCCTGATCACCTAGTAGCT---TCCCCAAGGG-----GGCCTGACC-GGCACTGCCCCGGTT-------------CTCCAC---AACGTCCCCCGGGGTTCCTCAGCCTCAGACGTGGG---GTGGGGTTAGCACCTCTGAGCTTTAGCAGATGGTGC-CTCTGGGA-CCCGGGCTTTCTGTGAGCGGGTGCACAGGGCCCGG-GGGGTGGGACCAGCCTGTTCCT-----------------------------GGGCTGGGGTGGCTGAGTC-----TGGCCTGGACTCCCTGGAG-------CCTACACC-CCCTCCCCTGGGACAAGCAACAGCAGGAGGCCGAATGGATGGGGGGAGGAGAAGGAACGGGACAG--GC-------------------------AGCCTCAGGGAGGGAGGGTTGGGAA-------GCTCTGATCCAGCCTGCAG-     
 6 Cebus_imitator-NW_016107460.1-178365_178819              72.4%  43.7%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGGGAGAATTCAGTGGCTCCAATGCTCCATGCTCTC--ACTGACGGGGTCCCTTGTGCTCTGGGGAT-----------------TGGTGGTGCTTGCAGTCCAGATGGCTGGGCAGGCTGGACATAGGAGCCCTTGCCATTAGGAGACTGCAGAA--GAGACTGGCTGGGCATGGCTGGGAGGCCGGAGCCTGTGTCTGTGTGGTCCTCGGAGGCCGGAGCCTGTGTCTGGGTGGCCCACGGAGGCCGGAACCTGGGTCTGGGTGGCCCGCGGAGGCCGGAGCGTGTGTCTGGGTGGCCCGCAGAGGCCGGAGCCTGGGTCTGG-GTGGCCCGCGGAGGCCGGAGC-GTGTGTCTGGGTGGCCCGCGGAGGCCGGAGCCTGGGTCTGGGTGGCCCGCGGAGGCCGGAGCCTGGGTCTGGGTGGCCCGCGGAGGCCGGAACCTGGGTCTGGGTGGCCCTTGGAGGCCGGAGC---CTGGGTCTGGGTGGCCCG-CGGAGGCCGGAGTGTGTGTCTGGGTGGCCCGCGGAGGGCCCGGTTGGGGCTGACCTGTTGCAGGC--C--------------------TCGGTCC-TGCCTTACTCCCTCCCACATCCTTGCAGCCACACTGC-GTCTTCACCTCCTGA-GTGCCCCAGAGAGCCCAGCCC--CTC-------------------------TGCCATGCCTTCCATACCTCAGTTCCCCTCTGCTCCTGATCACCTAGTAGCT---TCCCCAAGGG-----GGCCTGACC-GGCACTGCCCTGGTT-------------CTCCAC---AACGTCCCCCGGGGTTCCTCAGCCTCAGACGTGGT---GTGGGGTTAGCACCTCTGAGCTTTAGCAGATGGTGC-CTCTGGGA-CCCGGGCTTTCTGTGAGCGGGTGCACAGGGCCCGG-GGGGTGGGACCAGCCTGTTCCT-----------------------------GGGCTGGGGTGGCTGAGTC-----TGGCCTGGACTCCCTGGAG-------CCTGCACC-CCCTCCCCTGGGACAAGCAACAGCAGGAGGCCGAATGGATGGGGGGAGGAGAAGGAACGGGACAG--GC-------------------------GGCCTCAGGGAGGGAGGGTTGGGAA-------GCTCTGATCCAGCCTGCAG-     
 7 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-104572_105062             73.4%  44.7%    ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGTGGCCTGTGGGGGGCGGAGTGTGTGTCTGGGTGGCCTGCGG---GGGGCGGAGCC--TGTGTCTGGGTGGCTTGTGGGGGGCGGAGCCTGTGTCTGGGGTGGCCTGTGGAGGGTGGA--ACCTGTGTCTGGGTGGCCTGTGG-----AGGGCTGGG--TGGCCTGCGGGGGGCGGAGCGTGTGTCTGGGTGGCCTGTGGAGGGCAGAGCCTGTGTCTGGGTGGCCTGCGGAGGGCGGAGCGTGTGTCTGGGTGGCTTGTGGGGGGCGGAGCCTGTGT-------------------------------------------CTGGGTGGCCTGTGGAGGGCTGG-GTGGCCTGCGGAGGGCGGAGT-GTGTGTCTGGGTGGCCTGCGGGGGGCGGAGCGTATGTCTGGGTGGCCTGCAGAGGGAGGAGCGTGTGTCTGGGTGGCCTGTGGAGGGCAGAGCCTGTGTCTGCGTGGCCTGCGGAGGGCGGAGC---GTGTGTCTGGGTGGCCTG-TGGAGGGCGGAGCCTGTGTCTGGGTGGCCTGCGGACGGCCCAGTCGGTGCTGACCTGTTGCAGGCCTC--------------------TGGGTCC-TGCCCTACTCCCTCCCACATCCTTGCAGCCACCCTGCATC-TTCACCTCCC-G-AGTGCCCAGAGAGCCCAGCCC--GTC-------------------------TGCCATGCCTTCCACACCTCAGTTCCTCTCTGCTCCTGATCACCTCGTAGCT---TCCCCAAGGA-----GGCCTGACC-GGCACTGCCCCGGTC-------------CTCCAC---AGCGCCCCCCGGGGTCCCTCAGCCTCAGACGTGGG---GTGGGGTTAGCACTTCTGAGCTTTAGCAGATGGTAC-CTCTGGGA-CCCGGGCTTTCCGTGAGCGGGTGCACAGGGCCCAACGGGGTGGGACCATCCTGTTCCT--GGACTGGGGCGGCACCATCCTGTTCCTGGACTGGGGCGGCTGAGTC-----TGGCCTGGACTCCCTGGAG-------CCTGCAGCCCCTTCCCCTGGGACAAGCAACAGCGGGAGGCCGAATGGATGGGGGAGGAGAAGGAACGGGACAG---GC-------------------------GGCCTCAGGGAGGGGAGGGTTGGGAA------GCTCGG--------------     
 8 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-236371_236913      79.3%  36.3%    -----------------------------------------------------------------------------TCTCCCATCCCAGCCCTGCACAAAG-CTCTG------TCCTCCCACCACCTCGGGCCTCCGTCTGGGGGTCACGTGGGTCCAGCAGCTGAGGCTGGCCCCACGCCTCAGCC-CC--TCCACCCTCCAGGGTCACTGA-GTGT---CCTGAAGACGTGGGTCTTGGAGGCTGAAACCCAGGTGGGAAGGGGGTTGGG-GCAGGGTGGGGCCAGACACAG---GG----CGCTGGTTGGACGTGCTCCATGGGAGCT--------------------CAGGTGGCTCTGAAGCTTTCGCTGAGAGG------------GGTCCCTGGCACTTCGGGGGC--------------------------------------AGGTGC----CAGACACAGT-------GGC---CCTTGGCCC----------TTAGAGGTGGGC--AGAGG-----------------GCCCCTTGGTGCTGTGAGACCCTGGATTGGGGAGGAGGAGACTTGCTGGGTGGCTGA-TGGGAGGGTCGTGTGTGTGTCTCTGG---------GGG---------------------GCCATGGAAGGCCCCTGAAGT----CAGGGCTGTTCTCCCCGCCAGGTCTCTGCTCCAGCAGGCAGACAGGGCCCCGTCCAGGCTGCCCCCT-TCTG------GA---------------------------------------ACCCTGTTGTAACCTCTGGGGCCTGTCCCTGTCCCCTGCGTCACCCCTTCC---------------CCTCCATCCCTGCAGCCACACCTGTGTCCTCGCCTCCCTATG--TCCCCGAGAGCCCAGCCTCTCTGTGCCA-------------------------CGGCCCTATGCCTGTGGCTCCCTTCTGCTCATGGTCAGATATTAGCT---TCCTCCAAGAAGTC-CTCCTGGGCTGGCACTGCCCGTGGTCC-----------TCTGGG-ACACCCACCTGGGGGGTCCCTCATCATGCGGACCTCG---ATGGGTTTAGTCACTCTGTGCTTCCGCAGGCAGTGCCTTCTGGGT-CCTGGGCTTTCTGTAAGCAGGTGTGCAGGGCCCGAGGCGGGTGGGCACTGACCTGGCCCTGGGTTGGACTCC-CTGGAGC-------------------CTGCCGCCCCTTCCCCTGGGAACTGGGAGAT-----------------------------GCTGGGAGATGCACAAGCTA--C--AGACAGAAGGCCAAGTGGACAGAGGAGATGGGGGAGACAGGCAGG----TGGCTCTGGGGAGGGTGCAG----T----------------------------------     
 9 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-171153_171510       77.6%  30.1%    ---------------------------------------------------------------------------------------------ATCTACGGACAGCGG------GGCCCAGAGAACGGTGGC-CTGCCTGGC--GGAGGTGTTCCTCTGGGTTGGA------------------G--------GGAGTGTGGTGCTGTCTTCGA-GGTG---GCAGCTCGG---CCCACTGGGTAAGAA-----GGGGCG-GGGCCGCCCAGGTGCCCA----GGG--AGGGTGG---GG----CCCCTCCTGGAGGTGCAAAAGGCTCAGG--------------------GCCTCCCACCCACTGCTCTCGG-------------------GAT--------CAGCGGGTCCAGC-------------------ATGT-CGGCTGGCCCCA---TC----CCTCAGCTGC-------CCA---GAGCCCCCACCCCAG---GTGACAGGGG------GTCA-----------------GGCTGGGACC-CTGGTCCAATGTGCCGTGTGGGGGATGTAGGTGGCTCTGAAGCTTCACTGAGGGGGTCCCTAGCTCTCTGGGGGGCAGCAGCACC---------------------TTCAGCCAAGGTGGGGGCTTC----TGCTGGTGCTGGACACAGAGCCCTGAGGCTCCAGACGCTGGCG------TGGGGTGCGGGAAGCCTG-CCGG-TGCTGGCAGGAGGGCTGAGTC---------TCTGTTCCAGCCTCCAGATGCCCTGGGGCCTCTGGGGCCTGTCCCTGTCCTGCCTCA---------------C---GTGC--CACTACATCCCACAGCCACACCTGTGTCCTCACTTCCCTGTGTCCCCTGGTGACCCCAGCCTCCCCG------------------------------TGCTTCTCCTGCGGCAGTTCCCTTCTGCTCATGGTCAGACGTTAGCT---TCCTCCAAGAAGTC-CTCCTGGGCTGGCACTGTCCATGGT-------------CCTCCT-CACCGCCCACTTGTCATCCCTTGTTGGGAGCACCTCG---CGGGGGCTAATTGCTATCTGCCTTACTAGGCAGCACCTCCTGGGA-CCTGGGCTCTCCGTGAGCAGGAGTGCAGGGCCCAAGTGGGACAGGGGCCAGCCTGTCCCTGGGCTGGGGCCGGCTGACTCTGGCCTGGACTCGGGCCCAGCT---------ACGACA-GGAGGCCGATGG----------------------A------CGGGGC--GGGGGCAGGGGA--G--AGGCAGGTGGTCCCGGG-------GAAGGCTGTGGAGCTCTGACC----CATCCCTC-------AGC-----CTCCCAGACCTGCACCCTGGTACACATGGCT-----     
10 Lemur_catta-NC_059130.1-170209_170529                    77.8%  30.3%    ------------------------------------------------------------------CATGTCCG---------GCCCCTGGCCATCTACAGACAGCCG------GGCCCAGAGCACGGTGGC-CTGCCTGGC--GGAGGTGTTCCTCTGGGTTGGA------------------G--------GGAGCGTGGTGCTGTCTTCGA-GGTG---GCAGCTCGG---CCCACTGGGTAAGCA-----GGGGCAGGGGCCGCCCAGGTGCCCA----GGG--AGGGTGG---GG----CCACTCCTGGAGGTGTGTAAGACTCGGG--------------------GCCTCCCACTCCCTGGTCTTGG-------------------GCT--------CAGTGGGTCCAGG-------------------GTGT-CAGCTGGCCCCA---CC----CCTCAGCTGC-------CCG---GAGGCCCCAGCCCAG---GTGGCAGGGG------GTCA-----------------GGTTGGGACC-CTGGTCCAGTGTGCCGTGTGGGGGATGCAGGTGGCTCCGAAGCTTTGCTGAGGGGGTCCCTGGCTCTCTGGG-GGCAGCAGCACC---------------------TTCAGCCAAGGTGGGGGCTTC----CGCTGGTGCTGGGCACGGAGGCCCTGAGGCTCAGACGCTGGCG------TGGGGTGCAGGAGGCC-T-GCGG-TGCTGGCGGGAGGGCTGAGTC---------TCTGCTCCAGCCGCCAGATGCCCTGGGGCCTCTGGGGCCTGTCCCTGTCTTGCCTCA---------------C---TTGC--CACACCTGT----------------GTCCCTACCTCCCTGTGTCCCCTGGAGAGCCCAGCCTCCCGA---------------------------TGCCCCCCACCCTGCGGCAGTTCCCTTCTGCTCATGGTCAGACGTTAGCT---TCCTCCAAGAAGTC-CTCCTGGGCTGGTGCCGTCCATGGT-------------CCTCCT-CAGTAGCCACTTGGCATCCCTCATCGAGTGCACCTCG---TGGGGGCTAATTGCTGTCTGCCTCACCAGGCAGCACCTTCTGGGA-CCTGGGCTCTCAGTGAGCCAGTGTGCAGGGCCCAAGGAGGGCAGGGACCAGCCTGTCCCTGGGCTGGGGCCGGCTGACTCTGGCCTGGGCTTGGGCCCAGCT---------ATGACA-GGAGGCCCCTGG----------------------A------CAGGGT--GGGGGCAGGGGA--G--AGGCAGGTGGCCCGGGG-------CA-GGCTGTGGAGCTCAGACC----CACCACGC-------AGG------TCCCAGATCTGCACCCTGGTAGGCACGGG------     
11 Equus_asinus-NC_052181.1-179763_180224                   76.8%  31.7%    -------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTA------ACCTCCCACACCCTTGGGTCTCCCTCTGGGGGTCGTGGTGCTCCAGCAGCCTCTTCTGGTCT---GCCTGCCTC-TCTGAACACCGCCTCGGGGCCTGGA-GGCT---GAACCTCAGACGGGCAGCAGGGAAGGT-----GAGGGTGCGTGAGTCAGGG-GC-------AGGGAGGGGCTG---GG----GCCCTGGTGCACGTCCTTGCTGGGCGCT--------------------CAGACAGTTCCGAAGCTTTCA--CCAAGG------------GGT-CCTGGCACTTTGAGGGGTGGCAGCACCTTCAGCCCAGGGCG-----GTGGGGCCGGCAT------GTG-GGGCCA-------ACA---CAACGGCCC----------TTGGATGCAGGC--GGGGT-----------------GCACCTCTCTGCTGAGAGACGTGGGCATGGGGAGGACGAAGCCTGCC-GGGTGGGGA-TGGGAATGTGGAGTGTCTGTCTTTGG----GGGGCCAG---------------------CCCACAGGAGGC---CCCATT----CAGGGCTGTCTACCCAACCCGGTCTCTGGTTCAGCTGCCAGACGGGGCCTGGTCCAGGA--------------------A---------------------------------------TCCTGTTCTAGGCCTCTGGGGCCTGGCCCTGTCACCATCTCCTGCCTCACCC-CTCCCACCTGTTACCTGCATCCCAGCAGCCCCACCTGTGCCCTCACCTCCCC-TGTCCCCTGTGGAGCCCAGCCTCCCCG--------------------------------TGTGCC--CTCCCCCGGCACATGCGCTCAGGGTCAGAGAATGGCT---TCCTCCAAGAAGTC-CTCACTGGCTGGTCCCCTTGGGCTGGCGCTGCCCATGGGCCTCC-ACAAACCACCTGAGGGTCCCTCACTGTCTGGACCGCG---TGGGGTTTAATGACTTGGCACTTCAGTGGATGGCCCTT-TTGGGT-CCTGGGCTTTTTGTAAGCAGGTGTGAGGGGCCCAAGAGGGGCCAGGACTACACTAGCCTGGACCTCTGGAGC---------------------------CTGCAGCCTCCCCAACCCAGGGAGCTGCTGTCCTGGCCGGCACCC--CCCTCCCCTGGGACCTGGAAGACATGTAAAAGCTGG--AGACAGGTGGCCAGGTGGACAGAGGAGGGGAGGGGAGGACAGAGG----GG----------------------GTGG-------------------------------     
12 Balaenoptera_musculus-NC_045785.1-167619_167895          75.9%  30.6%    -----------------------------------------------------------------------------------------------------G-GGTCT------CCCTCTGGGGATCACGG--------------GGCTCCGGCAGCAGCCCCCGG-------GGT---GCCTCT----CTGACCCCCCCACTCAGGGCCTGGA-GGCT---GAACCCCAGGCGGGCAGTGAGGAAGGA-----AGGGGTGGGGGAGTCAGG--GGTAA---GGAGGGGCCGG----------------GGCCACGGTCCT------GGTGG--------------------ATGTGCGGCTGGAC--ACTCT--CTGGGG------------GGTCCCTGTTACTTTGGGGGGCAGTGGCACCTTCAGCCCAGGTGT-----GGTGAGGCCAGAGTG----CTGGTGCCAG-------ACG---TGTCGGCCC----------TTAGAGGCCGGC--AGAGT-----------------GCCCGTCACTGCGGTGAGACTCTGGAGG-------------------------------------GTAGAGTGTCTGTCTTAGC----GGGGCCGG---------------------CCCACGGAGGGC---CCCATT----CAGGTCCGCCCGCCCCTCCGGCTCTCTGTTCCAGCCGGCGGATGGGGCCTGGTCCAGGTACCACCTT-CCAG------AA---------------------------------------CCTGGTTCTAGGCCTCTGGGGCCCGTCCCTGTCCCCATCCCCGGCCTCCTGC-CTCCCCCCTGCTACCTGCGTCCTGGCAGGCACACCGCGTCTTTT-CCTCCCGGTGTCTCCCCTGGAGCCCAGCCTCCCTGTGCGCGGCTCCCCGCTGTGCCCGGCTGCCCGCTGTGCCCCCCGCCCAGTGCCTGCAGTTCAAGGTCAGAGGTTGGCT---TCCTCTGAGAGGTC-CTCACTGCCTGTTCCCTTGGGCTGACACTGCCCACGGGCCTCCA-CAACACCACCTGAGGGTTCCTCATCGGGGGGACC--T---CGTGGGTTAATTACTTGGTGCTTCACCAGATGGTACCTCCTGGGT-CCTGGGCTTCCTGTAGGCAGTTGTGAAGGGCCTGAGGGGG-CCAGGACAGACCTGTCCC-------------------------TGGGACTCCTGGAGCCTGCTGCCTCTCCAGCCTGGCCAGCCACGGCCT------------------CTCCTGGTACCTGGGAGACGTGCAAGCTG--C--AGACAGGAGGCTGAATGGATGGAGGAGGAGGAGGAGAAAGGAGGA----GAGGGGAGGGGGAGGAGAAAGGAGGAGAGGGGA------GGGGGAGGAGA---------     
13 Urocitellus_parryii-NW_020540697.1-275336_275483         82.8%  38.9%    --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ACGAGGTGAGAAGGGCCAGGGAGC---------AGTTGCCCTGCTGAGGCCTGGCCAAGCTCTACCGGGCCATGGGGCTGTCCAGGTGCCTTGGGGCAGTAGGGGCTATCTTGGAGGTGCAAGG--------------GGCCTGGGGTCTCCCAT---CCC-----------------------------ATCCTGGGGATGAACAGGGTCCTGC----------AGTGTTG-----GCTGTTTCACTCTCGGCCA--------CTCGGGCAGTCT------GCGGGTACCCCGGCCTCCTGGGG---GCTGAACCCG-GGGTGGGAAGCCGGC--AGGGCCAGGGCTAGGGCCTGGAGGAATGTGCTGGGGGCAGCTTGGGTGCTCCAAGCTGCCTT-------------CCAGGGGGACTGGGGCACCTTCTGCCCAGGCAGGGTGGGCTGCTGTGCTGAGCTGG----------CCAGGAGGGCCCCTAGGGA---------------GGTGAGACTGAACGA---GGAGGCGCGCTGT----GCTGCCCGGAAGGCCTGGCATCGCGTCCTGTGGCCCCCGGAGGCCGCGGTCAAGGCTCTCTGCCTCTCCAG---CCTGCTCTGCTGGCAGA-------------GGGGG-TCTCATCCAGCTCAGCCCTCCAAAACCCTGTG---GTGGCCTCAAGGACCTGTGTGTCCCCTGTCCCTGCTGC----ACCAAGCAGTCACACCTGTGTCTTCCTGAGCCTCGCTCCCTGTGAGTGCG------------------------------------------------GAGCCTGCGGCTCCTGTTTGCTTGTGGTCAGCACTAGCTC---CCTCCTCAGA-----GTCCCCAGGTGGAGCTGCCCAGGTC-------------C-CCTGCA-GCACCCACCAGGGGTCCCTCCCTATGTG--CCTCTC-ACAGGGTTGGACACTGTTGAGCATCAGCAGCTGTAGC-TCTTAGGG-CTTGGGCTTTCTGTAAGCAGGTATGCAGGGCTTGGGGGCAG-ATACTGACCTGTCCC----------------------------TGGGCCAGGGCCAGCTGACCC-----TGGCCTGGACTCCTTAAAG-------CCTATGGCCCCCTCTCCTTGGACAGAAAAGGGAGATTTGACTAGTCCCTCCGACCTCAGATCTGTGCCCTCATG--CTTCTG------T--------------GGCCTTGGAGAGTAGACAGTGGAGTG------TCCTTGCTGCCCC-------     
14 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-178522_178666            75.4%  26.6%    -------------------------------------------------------AAGTGTGGA---AGTCCTGGGGTCTCACATTGGACCC-CACTCAAGC-CTCTA------ACTTCCCAGCACCTTGGCTGTCCCTCTGGGGGGTCAAGAAAACTGGTAATGATGGCTGTCCCCACCCTTCT--------GCTTCTCAGAGGAGCCCTCCA-AGCC---CTGTTGCCTCTCCTCTGTGG----------------------------------------GGAGGGGAAGGGA---CA----GGCCTGGTGTGAGTGTGCCGTGGAAACT--------------------CAGGTAGCTCTGACGCTTTTGTTGTGGGA------------GGTTTCTGGCATCTTGGGGGTCAGTGGCACATTCAGCCTGGGTGG-----AGGTGGGCCAGGGGG----CTGATACCAG-------GCA---CAATGGCCCTTGATG---CTTAGAGGTGGGC--AGAGG-----------------GCCTCTGGCCTCTGTGAGACTGCAGAGTTGGGAGGGGCCTGCAGGCAG-------------AAGAGCTGAGCGTGTCTCTCGGTGGCCCGTGGGAG---------------------CCCTGTCAGAGC----------------------TGTCCGTGCTGCCTGTCTGCTCCAGCGG-TAGACAGGGCCTGTCCAGGCAGCCACCTT-CCAG------AG---------------------------------------CCCCGCTCACACAGCTAGTAGTGTGCCCCTGGGAGGGTCCCAGGCTTGAGCC-CAGACAT--GGGTCCTGTTCTATGCCTGTGGGGCC------------TGTC--CTTGTCCCCAGCAGCCACACCTG--TG-----------------TC-------------CTCACCTGCCTGCAGTTCCCTTCTACTTACATTCAGATATCAGCCTCTCCTTCTAAGAGGTT-CTCCAGGGCTGGTGCTGGCCATGGT-------------CCTCTG-TGATGCCTACTG-----TGGTGGGGAGGGTCCCATTA---TGGAGGTTAGTTTCCTTGTGCTTCAGAAGATGGTACT--TCTAGG-CCTGGGTTTTCTGTAAGCAGGTGGGCAGGGCCTGAGGGGTGCAGGGTTGACTCGTTCCTGGGCTGGGGCCGG-ATGACCTGGTCTGACCTGCCTGGAGCCCACGGCCT---------------------------------------CCTCCTCTGGGGCCTGGGAAATACACAGCTGC-----AGGGAGGAGGTGGACAGAGGAGAGGGGGCAGGT---GGGCACAGG----TGAGTGTGTGCTATGGAA------CTCAAAT--------CTAGGGCCACG---------     
15 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-178336_178819         76.5%  30.8%    ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CACCCCCTTGAGTCTCCCTCTGGGGGTCATGGGGCTCCAACAGCATCTCCCCGTCT---ACCTTGTTG-ACTGCCCCCC--CTCGGGGCCTGCA-GGCT---GAGCCCCAG-GTGGCAGCAGGGAAGGT-----GGGGGTGCACGAGTTAGGG-GCTGA---GGAGCTGGGGGCA---GG----GCCCTGGAGGATATGCTTGCTGGGCACT--------------------CCGGTGGCTCTGAAGCTTTCA--CTGAGG------------GGTCCCTGGCACTTTGGGGGGTGACAGCACCTTCAGCCCAGGTGG-----AGTGGGGCTGGCG-T----GTGGTGCCAG-------ACA---CGACGGCCC----------TTAGAGCCAGGG--AGAGT-----------------GCGCCTCACCGCTATGAGAC--TCGGATGGGGAGAACAGAGCCTGTC-CAGCAGGGG-ATGGGGGGTGGAGGGTCTGTCTTGGT----GGGGCCAG---------------------CCCACAGAAGGC---CCCATG----CAGGGCTGTCCACCCCACTCAGTCTCTGCTCCAGCTGGCAGACAGGGCCTGGTCTAGGCACCACCTT-CCAG------AA---------------------------------------CCGTGTTCTAGGCCTCTGGGCCCTGTCCCCGTCCCCATCTCGTGTCTCACCC-CTCCTACCTGCTACCTGCATCCCAGCAGCCCCACCAGTGTCCTCGCGTCCCACTGTCCACCGTGGAGCCCAGCCTCCCTG--------------------------------TGTGCCCTCCCCCCCGACACCTGTGTTCAGGGTCAGAGATTGGCT---TCCTCCAAGAAGTC-CTCACTGGTCGGTCCCCTCGGGCTGACACTGCCCATGGGCCTCC-GCAAACCACCTGAGGGTCCCTCACTGGGTGGACCTCG---TGGGGTTTAATTACTCAGTGCTTCAGCAGATGGCGCCTGTTGGGT-CCCACGCTTTTTGTAAGCAGGCGTGAAGGGTCCAAAGGGGGCCAGGACTGACCTGTCCTGGAGCTCACAGC----------------------------------CTCCCCAACCCCAGGGAGCTGCTATCCTGGTCGGCAACC--CCGTTCCCTGGGACCTGGGAGACATGCAAGGTG--C--AGACAGGAGGCCAAGTGGATGGAGGAGGGGAGAGAAGGAGAGGGG----TG----------------------GGGTG------------------------------     
16 Balaenoptera_acutorostrata-NW_006725355.1-180660_180969  77.5%  30.6%    -------------------------------------------------------------------------------------------------CGGCA-GCCTT------CCCTCCCCAGCCAGAGGG----GCGGAGCCCGGGCCAGGCCACAGAGCCAGGG--CCAGAGG---GCGCCG----GAGGGCACCAGAGGCCGGGCAGCCT-GGGA---CACTCCCTTG--GGTCCAGGGTCAGGG-----AGGGTAGGTGGCGCAGGCT-CTGAG---GAGACAGGACG----------------GGTCACCTGGGC------TGACC--------------------ACAAGAACCTGGAC--ACTGT--CTGGGG------------GGTCCCTGTTACTTTGGGGGGCAGTGACACCTTCGGCCCAGGTGT-----GGTGAGGCCAGCGTG----CTGGTGCTGG-------ACG---TGTCGGCCC----------TTAGAGGCCCGC--AGAGT-----------------GCCCGTCGCTGCGGTGAGACTCCGGAGG-------------------------------------GTAGAGTGTCTGTCTTAGC----GGGGCCGG---------------------CCCACGGAGGGC---CCCATT----CAGGTCCGCTCGCCCCTCCGGCTCTCTGTTCCAGCCGGCGGATGGGGCCTGGTCCAGGTACCACCTT-CCAG------AA---------------------------------------CCTGGTTCTAGGCCTCTGGGGCCCATCCCTGTCCCCATCCCCGGCCTCCCGC-CTCCTCCCTGCTACCTGCGTCCTGGCAGGCACACCGCGTCTTTT-CCTCCCGGTGTCTCCCCTGGAGCCCAGCCTCCATGTGCCCG-----------------GCTGCCCGCTGTGCCCCCCGCCCAGTGCCTGCAGTTCAAGGTCAGAGGTTGGCT---TCCTCTGAGAGGTC-CTCACTGCCTGTTCCCTCGGGCTGACACTGCCCACGGGCCTCCA-CAACACCACCTGAGGGTTCCTCACTGGGGGGACC--T---CGTGGGTTAATTACTTGGTGCTTCACCTGATGGTACCTCCTGGGT-CCCGGGCTTCCTGTAGGCAGTTGTGAAGGGCCTGAGGGGGCCCAGGACAGCCCTGCCCC-------------------------TGGGACTTCTGGAGCCTGCTGCCTCTCCAGCCTGGCCAGCCACGGCCT------------------CTCCTGGTACCTGGGAGACGTGCAAGCTG--C--AGACCGGAGGCTGAATGGATGGAGGAGGAGGAGGAAGAGAAAGGA----GGAGAGGGGAGGGGGAGGAGAG--GAGAGGGGA------GGGGGAGGAGA---------     
17 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-169406_169501          77.4%  27.5%    --------------------------------------------------------------------------------------CCTGGACATCCACGGACAGCTG------GGCCCAGGGAACGGTGGC-CTGCTTGGC--GGAGATGCTACTCTGGGTTGGA------------------G--------GGAGCGTGGTGCTGTCCTCAA-GGTG---GCAGCTTGG---CCCACTGGGTAAGAA-----GGGGCAGGGCCATCCAGGTGCCTGG----GAG----GGTGG---GG----CC-ACTTTTGAGGTGCATAAGGCTCGGG--------------------TCCTCCACTTCCCCCCACCGTGTCTCTGG------------GGT--------CAGTGGATCTAGT-------------------GTGT-T-GCTGGCCCCA---CC----CCTTAGCCAC-------CCG---CACTGCCCATCT-----------GGCCT------GTCA-----------------GTTCAGGGCC-CTGATCAGATGTGCAGTGTGGG-CGTGCATGTGGCTGTAAAGCTTT-GTTGAGAGGTCGTTGACTCTCTGGGGGGCAGCAGCACC---------------------CTCAGCTGAGGTGGGGACTGAA---TGCTGGTGTTGGACATAAAACCCTTTGGCTCCAGACACTGCAG------TGATGCACGAGGTGCCTG-CTGGTTGCTGACAGAAGGGCTGAGAGCC-------TCTGGTCCAGCCACC--AGGTGCTGGGGCCACTGGGACCCATCTGTGTCCTGCCTCTC--------------C---CTTC--CACTGCATCCCACAGCCACACCCATGTCTTTACCTCCCGCAATCCCAGAACA-GCCCAGCCTTCTTG-------------------------TGCCCCCACCACCCTGCTGCAGTTCTCTTCTGCTCATGGTCAA-----ACAT---TAGCCCAAGAGGTC-CTCCTGGGCTGGCACCATCCATGGT-------------CCTCCA-CAGCTCCTACTTGGCATTCCTCATTGCTTGGACCTCA---CAGATTTTAATTGCTGTCTGGTTCACCAGGAAGTACTTTTTTGGGACCTGGGCTTTTTGTAAGCAGATGTGCAGACCCCAAAGAGGGCGGGGACTACTGGTTCC--TGTACTGGGCTAGCTGACTCTGGCCTGGACTCCTAGAGGCCCAGGT-----ACAAAT-AGGAGACCATGG----------------------A------TGCCGG-----GGGCAGGGG--G--AGGCAGGAGTGCTCAGA-------TCCATCTTTGAACCTGTACCC----TGCTATTG--------GA------CTGTGCCTGTGGACCTTGGGGAGTGGACGT-----     
18 Halichoerus_grypus-NW_023403807.1-182403_182609          78.0%  31.3%    ---------------------------------------------------------------------------------------------------CCA-AGGAA------ACCTGTAACCTCCTGCCCCTTCCCTCTGGGGGTCATGGGACCCCAACGGCACCCGCAGTTCACCTCTCTGACCA-CCC-CTCCCCTGGCACTGGGGTGGA-GGCT---GCACACCAGGCAGGCAGTGGGGAGGAT-----GC-GGCGGGGGGGCCAGGG-GCA-------------GGGAG---GG----GCTGGGGGCAGGACCCTGGCTGGGCGCT--------------------CAGGTGGCTCTAAAGCTTTTG--CTGAGG------------GGTCCCTGGCACTTGGGGGGCAAT--GCACCTTCAGCCCCGATGG-----GCTGGAGGCAGCGTG----TGGGTGCAGG-------ACA---TGACAGCCC----------TCAGAGGTGGGC--AGAAG-----------------GCCCCTCTCCGGTGGGAGACGCGGGTGTGGGGGG--TCGAGGCCTGCCCGGCTGTGA-CGGGAAGGTTGCGTGTCTGTTCTGGC----AGGGCTAA---------------------CCCATGGAAGGC-----CCCA----TCTGGGCTGTGTGCCCCCCGGGTCTCTGCTCCAGCTGAGAGATGGGGCCTGGTCCAGCTGCCGCCTC-TAG--------A---------------------------------------ACCTGTTCTGGGCCTCTGGGCCGCC--CCTGGGCCGTG-TCCTGCCTCATCC-CTCCGCTC-TCTCCCTGCACACTAGCAGCCGCACCTGTGTCCTCACCTCCC--GGTCCCCTGTGGAGCCCG---------------------------------------GCCTCCCTGTGGGCCCTCCCGCTGCAGTGCAGGGTCAGGGATTGGCT---TCCTCCAGGGGGTC-CTCCCTGGCTGGGCTCCTCTGGCTGGC-------AGGTGCCTCC-GAGCACCACTCGAGGGTCGCTCACTGGGTGGGTCTCG---TGGGGGTTAATTACTTGATGCTTTAGCAGATGGCACCTTCTGAGT-CCTGGGCTTTCTCTGACTAGGTGTGAGGGGGCTGGGGCAGGGGGCCACGACTGACCCCAC--CCCTGGGCC---------TCTCTCCA------------------------GCCCCAGGGGACTGCTGGCCTGGCTGGGAGCCCCCCTGACCCTGGGACCTGGGAGACACGCAGGCTG--C--AGACAGGAGGCCAGTGGACAGAGGAGGGGAAGGGACGCTGGGGGA----GGGGTCTGT------GTTCTGGAGCTGA-------------------------------     
19 Ailuropoda_melanoleuca-NC_048228.1-182989_183078         76.6%  31.4%    ----------------------------------------------------------------------------------------------------------GT------AACCTCCTGTCCCTCGGGTCTCTCTCTGGGGGTCATGGGACTCCAGCAGCACCCCTGTCGTT-CCCTCTGACCA-CCCCTCCCCCGCCCTGGGGCATGGA-GGCT---AAACACCAGGCAGGCAGTGGGGAGGGT-----GGGGGTGGGGATGTCAGGG-TCA-------------GGGAG---GG----GCTGGGGGCAGGACCCTGGCTGGGTACT--------------------CAGGTGGCTCTAAAGCTTTTG--CTGAGG------------GGTCCCTGGCACACTGGGGGGCAGTGGCACCTTCAGCCCCTACGG-----GCTGCA----GGCAG----CACGTGCAGG-------ACA---TGGAAGCCC----------TCGGAGGTGGGC--AGAAT-----------------GGCCCTCACCAGTGTGAGACTCGGGTGTGGAGGGGTCGAGGCCTGCCCGGGAGGTGA-CGGGAAGCTTCCGCGTCTGTTTTGGC----AGGGCTGA---------------------CCCGTGGAAGGC-----CCCA----CCGGGGCTGTATGCCCCCTGGGTCTCTGCTCCAGCTGAAAGACGGGCCTGGTCCAGGTACCGCCTTC-TGG--------A---------------------------------------ACCTGTTCCGGGCCTCTGGGCCACC--CCTGTCCCCATGTCCTGCCTTATCC-CTACGCT------CCTACATACCAGCAGCCCCACCTGTGTC---------------CTCACCGGGAGCCTG---------------------------------------GCTTCCCTGTGGGCCCTCCCCCTGCAGGGCAGGGTCAGGGATTGACT---TCCTCCAGGGAGTC-CTCCCTGGCTGGGCTTTTCCGGCCGGC-------AGGGGCCTCC-ACCACACCCTCGAGGGTCCCTCACTCGGTGGGTCTCG---TGGGGGGTAATCACTTGATGCTTCAGCAAAATGGCACCTCTGAGT-CCTGGGCTTTCTGAAAGTAGGTGTGAGGGCCTC------GGGGGCCATGCCTGACCCCAT--CCTTGGGCC---------TCTCTCAA------------------------GCCCCAGGGGGCTGCTGGCCTGGCGGGAAGCCCCCC-AACCCCGGGACCTGGGAGACATGCAGGCTG--C--AAACAGGAGGCCAGGGGGACAGGGTGAGGAAGAGAGGGGAGGAAC----GCTGGGGGAAGCTGGAGGCTGGTGCTGCCCCCCTGCCCCCTGGCGCCAGCC--------     
20 Lipotes_vexillifer-NW_006774135.1-180673_181044          77.0%  28.7%    -------------------------------------------------------GGTTGTGAA---AGGCCTGGGGGCTCCCACCCCACCTCCATGCAAAC-CTGTA------GCCTCCTGACCCCTTGGGTCTCCCTCTGAGGGTCACGGGGCTCTGGCAGCACC--CCCGTGC---ACCTCT----CTGACCACCCCGCTCAGGGTCTGGA-GGCT---GGACTCCAGGTGGGCAGCGGAGAAGGA-----AGGGTAGGGGGAGTCAGGG-GCAAA---GGAGGGGCCGG----------------GGCCACGGTCCT------GGTGG--------------------ATGTGCGGCTGGAC--ACTCT--CTGAGG------------GGTCCCTGTTACTTTGGGGGGCAGTGGCACCTTCAGCCCAGGTGT-----GGTGAGGCCAGCATG----CTGGTGCCAG-------ACG---TGTCGGCCC----------TTAGAGGCCGGC--AGAGT-----------------GCCCGACACTGCGGTGAGACTCTGGAGG-------------------------------------GTAGAGTGTCTGTCTTGGC----GGGGCCGG---------------------CCCACGGCGGGC---CCCATT----CAGGTCCGCCCACCCCTCTGGCTCTCTGTTCCAGCTGGTGGATGGGGCCTGGCCCAGGTACCGCCTT-CCAG------AA---------------------------------------CCTGGTTCTAGGCCTCGGGGGCCCGCCCCTGTCCCCATCCCCGGCCTCCCCC-CTCCCACCTGCTACCTGCGTCCTGGCAGCCATACCACGTCTTTA-CCTCCCGATGTCTCCCCTGGAGCCCAGCTTCCCTGTGCACGGCTCCCCACTGTG------------------CCCCCACCCAGTGCCTGCAGTTCAAGGTCAGAGGCTGGCT---TCCTCTGAGGAGTC-CTCACTGCCTGTCCCCTCGGGCTGACACATCGCCA------------------CCTGAG---GGCTCCTCACGGGGGCC--T---CGCGGGTTAATTACTTGGTGCTTCACCAGACGGTACTTTCCTGGG-T----------CCCAGGCAGTTGTGAGAGGCTGGAGCGGGGCCAGGACAGGCCTGTCCC-------------------------TGGGACTTCCCGAGCCTGCTGCCTCTCCAGCCGGGCCAGCCACGGCCT------------------CCCCTGGTACCTGGGAGACACGCAAGCTG--C--AGACAGGAGGCTGAACAGATGGGGGAGGAGGGAGGGGAGAGGGAG----TGGGGCCCCCTGGGGGAAGGTGTGGGCTC------------------------------     
21 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-170932_171229         81.3%  38.1%    -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTGGAGGGAGTGTGGTGGTGTCGCCGCGGTGG---------CAGCTCAGCCCACT------------------AGGTAAGGGGGGCAGGGACGCACAAGGCCTGGCTGAGGCCAGCCGGACCCCACAGGGTGGGG-GGCCATCCGTGCCCTCACCCTC----C----CTCCCACAGCAGCTGCTCCCCTGGGTTTCCC-TGTGTGG------GTCACCAGGGCTCAGCAGTGTTGGCTGCTG-----CA-------CCC--------CTCAGCCACTCA-------------------------------------------------GAAGC---------CCCCCAAGTCTCCCAACCCCTGGAGTAGGGCCTGGAGCTAAAGC----------------------------CCAGCAGACCAGGCCGAGGGTGGATATGAGAGGGGTCA--GGGCGTGCTGGGCGGGGGCAGAGCTGACGCGGTGGCCCTGGCAGTGG--CAGGTGGCCCTGTGTGCCTCTCTGAGAGGGGAGAGGGGGCCCACACACCATGGGGG------GTTCTGAAGGTGCCCAGGCCGCAGAGGCTGCTCA------GGCCTCTCTGCGCTAGTCCTGGCTC---TGGCTGGCAGAGAGGCCTTCTGCAG------------CTGCCTCCTCTGCGCTCCCTGCCCCAGGCCCTGAGGACCTGCCTCT---GCCCTCCCGCCCCCGCTGCCTGGCCCCCACACCTGTGTCCTCACCTGCCAC-ATCCCCTGGGGAGTCGGCCTC-CCTG-------------------------TCC----CCGCCCCGTCCTGGATCTGCAGCTCCCTCTGCTCATGTAGTAGCT---GCCTCTTCCAAGAAGCCCCTGGGCTGGCACTGCCCATGGC-------------CCCTGC-ATTGCCCACCCAGGGGCCCCACTGTATGGACCTC------ATGGGTTGGATTTCTCTGAGCTTTGGCACGAGATT--TCCTGGGT-CCCGGGTTTCCTAAAAAGAGGTGTATGGGCCTGAGTGGGATGTGA----CCTGTCCCT--G--------------------------GGCTGGGACCAGCTGACTC-----TGGTCAAA----------C-------ACACTGCACCCCTTCCCTAGGACCTGGGACAGGA---GGCCGAGAGGATGGAGGGGGCAGTGTCTCAGGGGAGGGGCAGGTG------TGCACTCCAGCCTGGTGCCTCAGCTC-CCGACTCCGGGCCC------TCCACCATGACAGCT-----     
22 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-136940_137006            75.1%  25.7%    -----------------------------------------------------------------------------------------------------CCAGCCG------GACCAAGGGGACGGTGGC-CTGCCTGGT--GGAGGTGCTCCTCTGGATTGGA------------------G--------GCAGCGTGGCATTGTCTTCGA-GGTG---GTCGTTAGG---CCCACTGGGTAAGAA-----GGACAGGGAAGTGGCACCCAGTGGG----GTG--CAGGCCT---CA----G--GCTGTCCAGGTGCTCCGGGCGGGTG--------------------GGGGCTGCTCTGAGGCCCAGGGTTTCCGT------------GCT--------TCCCAGCGCTCACCTCCACCTTCCCACCCCCTCGGT-GCGCTGGGGCCAC-GTG----ATCCTGCAGC-------CCG---CCCCGCCCCTCGCCA---CTCAGAGGAGCT---TCCCA-----------------GCACCTCTGC-CCCCCCCCCGGGGCCTGGTGCT----GAACCCAGGGGAGCAGGTCAGGGCCTGGTCAGATGTGCCGTGTGGGAGCCCAGGGGCCT---------------------TGGAGCTTTCGTGGATGGTCCCTGGCACTCGAGATGGTGGCACCTCCAGTGGATCCGGCAGCCTGCTGGTGCCAACACAGGCGCTGGGCCTG-GAGG----TGGCAGAGGCCCTGGCC----------GCTGTC-----CCTCCATGGGGAGGAGGCTTCAGGAGCCCCGGTCAGGGCTGTTTCAC--------------CGGCTTGG--TTACAGTGGCCAGAGGGCCCGTCCAGGCCTCACCATACTAATTAGCCTCGGGGCCTGTCCCTG-TGT-------------------------TCTGCCACACCCCTCCACTGCATTCGGGTCTC-----------------CCC---AGGCCTATAGAAGT-CCTCCAGGCTGGCACTCTTCATGGT-------------CCTCTG-CGATGCCCTCT--GGGTTCCTCCTTGGGCTGGCCTCA---TGGGGCGTGACTGCTCTATGCTTTAGTAT--------ACCTTGGGCCCTGGGCTTTCTGTGAGCAGGGGTGCAGGGCCTGGTTTGGTGGGA-----------------------CCCAGCTGACTGTGGCCTGGGCTTCCTGGAGCCTCCCACCCTTCCCACAGGGGGCCACATGG----------------------G------CAGGGGAGGAGGAAAGCAGA--G--AGGCCGGCGGACCCAGGGAAGGTTGGAGGCTGTGGAGCTCAGACC----CAGCTGCA--------GC-----CTCCCAGATCTGCCCCTGG-TCCATGGCCCTGGGGA     
23 Dipodomys_ordii-NW_012267222.1-167017_167130             70.5%  25.9%    -AGGCCCTGGCTGAGAACTGGCCAAGC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCAGGG---GCACAGGCCCTGCAGGAGCCTGGGGAGGGTAGGGGACCCCTGGAGGTGCTA---------------AAGGCCTGTACTCCACCTAAACCCCACACCAACCTCTAACCTCCTACCCTTTACCTC---TCCCCTGGG---GGCCACCAGGGTCTAGAAATACTGACTGCTTAGCCCCCAAAGGAGGCCTCC-CAGACTCCTGGAGGGT--AAATGCAGGTGGAGAGGGG-GCGCGGCAGGGCTGAAGCCCACGCCGGATCGCCGGGGTGGGGGG------------------------CACAGGGGCCCCTAAGCTCTCACAGTGTCAGGGTCCCTGTCACTTTGGGGGGGTCAGCAGCATCCTCTGGCCAGTTAGGGTGGACTG-TGTGCTGGTGCGGGGTA-CCCTGGCCCCTAGAGGTGGACAGACGGCTGGTCAGATGTGAGTTGGGTGGAAAAA--AGACAGCGGGTC-----AGGGACGGGATGGTCCAGTGTGTGTCCTGGGTGGGCCGGAAGGCCCCGGTCAGGACTGTCTGCTTTGCTCG----TTTCTGCTGTTACCGGCCATGGGGGC--------------------CACAGGCATTTGCCACCTTCCTGTGTGGGCTCTGGGGCCTGTCTCGTCTCCTGTCCCCAGCCCACGGAACCAGTGACCACGCT------------------GTGCCTTGGAGAGTCCAGCCTCCCCG-------------------------CCT--------------------CCCCATGCCCACACAGTCAGAGGG-ATCT---TCCTTCAAGA--AGTCTCCCAGGCTGGTCCTGCACAGTGT-------------GCTCTG------------------------ACTTCTGACCTTCCAACTATTGTGTGACCCTTGT-------GGCATTGAGCTT-CAGCTGGG-GGGGGGCTTTCTGTAAGCAAGTCTGCAGGGTCTACAGTGAG-GGACTGGCCTGTCCCT-----------------------------AGGCAAGGCCAGC-TGGCC-----TGACCCGAACTCCCCAGAG-------CCTGCAGCCTTTTCCTCTGGGACCTGGGTCAGGAAACCAAGAGGACAGGAAGGCAGGGGTCTGAGAAAGGGAGTGGGTTGTGGGCTCAACCTCTCAGCACAGTGCCTTCACCTAGAGGCCT----------------------------------     
24 Jaculus_jaculus-NC_059106.1-165457_165498                76.1%  25.1%    --------------------------------------------GGCTGAACTCCAGGTGGGGAGGGAGAGAGCAGGGCTAGGACCAGGGCCCAGCCCTAGATGGATA------TTCTGTTTTTTTGTTTGTTTTGTTTTTG---TTTTTGTTTTTCG-AGGTAGGGTCTTACTCTAAGCTCAGGCTG-ACCTGGAATTCACTATGCAGTCTCA-GGGT---GGCCTTGAA-CTCGTGGTGGTCCTCCTACCTCTGCCTCCTGAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCGCCACCATGC---CT----GGCTGGGTGAATATTCTGGATG-GCTCC--------------------TATGTGGCTCCAGAGCTCTTGCTGAGGGG------------AATCCTTGCCATTTTGGATGGCACCAGCACCTCCAGCCTAGTTAG-----GGAGGTGTGCAGATG----TAGATACCAT-------GCA---GAGAGCCCCTGGACT---ATTAGGC--------------------------------------------TTAGAATGAGAAG--------AGGAGAGATGCTGGGCTGCTAG-AAGGAGGGTCCAGCATATCTTTCATC----TCAGACAG---------------------CCCACACAGGGC-------------------TG--TCTACTGTAAAACTCCTGCTACAGCTAGCAGAGGG-TGGTCATTCAGCCACCTCCTT-CTAG------AA---------------------------------------CCTTGTTGTGGGCTTCGGGTATCTGTCTGTTCCTTGCTTCCC------------------------ACTGCACCC-GGAAGCCACTCCCGGGTCCTCAG-AAGTCATATCCCCTCGAGACCCCATCCTCCCTGGGCA--------------------------------GATCCTATGCATGCAGTTCCCTTCTGTTCGTGACAGTAGTGGCTTCTTCCAAGAAGGT-CCCCTGGGCTGGCACTGCCTGTAGT-------------CTTTTT-GTCTGCCTGTCATGGGTTCTTCACAT-----------------TGT-------GTGATCCTTGTGAGTTTTAGTCCCTGCTGGCT-CCTGGGCTTTCTGTAAGTAGGAGTGTAGGGCCTGGGGAAAGGGCATTGGCTTGTGAGCCAGTCTACTCTGG-----------CTTGGATTCCCTGGAGTCTGTAGCCC---------------------------------------CCTCTCCTGAAACCTGGGGCAAGAGGCCAAGCA-G--ACAGAAGAGGCAGGTGGCCTCTGG--------------TCAGGAT----AGATTGTGGACTCAGACC------CAGCATCTCAGCCTCCCAGCTCCACAG--------     
25 Camelus_bactrianus-NW_011514262.1-170618_170716          74.2%  25.3%    -----------------------------------------------------------------------------------------------CTCAAAC-CTGTA------ACCTCCTGACCCCTCAGGTTTCCCTGTGGGGTCATGGGGTCCCAGCAGCATC---CC--CAT---GCCTGC----GTCTCTGACCCTGACTCGGCCTGGA-GGCA---GAACCCCAGCCGGGCAGTGGGGAAGGA-----GGGGGTGAAGGAGTCGAGG-GGAAG---GGGGGTGCGGGTG---GG----GCCCCGGTGGATGTGCTGGGGGCCGTCA--------------------GGCAGCTCCAGAGCTTTCTCT--GAGGGG------------GGTTTCTG-GTTCTTTGGGGGCAGTGGCACCTTCAGCCCAGGTGG-----GGTGAGGCCAGCACG----TGA-----------------------TGGCCC----------TTCGAGGCAGGC--AGACT-----------------GCCCTTGGCTGCTGTGAGACTCCGGCAG-------------------------GTGA-TGGGAGGGTGGCATGTCTGTCTTGGGGGGCGGGGGCGG---------------------CCCACAGAAGGCCCGTTCGGG----TCTATCCTCCTGCCCCGCCGGGCCTCTGTTCCAGCTGGCAGATGGGGCCTGGTCCAGGTGCCACCTT-CCGG------AA---------------------------------------TCTTGTTCCAGGCCTCTGGGGCCTGGCTCTGCCCTGTCTCCT-GCCTCACCC-CTCCCTCCTGCTGCCTGCG----TCCCATGGTGCTGGGTCCTTA-CCTCCCGAAGTCTCCCGTGGAGCCCAGCCTCCCTGGGTACCACTCCCTGCG-------------CTGCCCCCACCCTCCACAGTGTCTGCAGTTCAAGGTCAGGGATTGGCT---TCCTCCGAGAAGTC-CTCACTGACTGATCCCCGAGGCTGGCGCTGCCCGTGGGCGGCGA-GCACTGC--CTGAGGGTCCCTCACTGGGGGACCT--C---GTGGGTTTTATTACTGTTCACTACGTGTGCCCTGCG-----------------CTTTCTGCGGCAGTTGTGAAGGGTCCGATGGGG-CCAGGATGGAAATGTGCCTGGGCCCAGTCCG-CTGACCCTGGCCTGGACTTCCAGACCCCGCAGCCTCTCCAGCCCCGGGTGCTGCTGTCC------------------TGGTGGGCACCCCCCTCCACTGGGACCTG--G--GAGC---AAGCTGCAGGGAGGCTGGATGCACAGAAGGGTT--------------------GGGGAGAAAGGCAGGTGGG-----------------------------     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .                                                                                                              .        .  .   .                                                                                                                                       .   .    . ...