AGCACAGGGATTGGGCCTGGGGCTGGGCGGGGCTGAGGTCCTTTGCTCCCCCAGCCTTGGGAGGCGGCTGCGTCAGGGATTCCTTGGTGGCCCTGGAGGGTGGATAGGCTGGCCTGGGGGCCATCAGGACAGCAGGTGACGGTCAGGCCAATGCCAGCCGGGCCTGGGCACAGCCCTGTGGGGGCTTCGGAGGGCCCTGAGGAGGAGGAGGAAGAGGCAGAGGAGAGAAGGCCCCACGGAGGTCCTGTCGCCAGCGCTGCCACTGCCTGACCTCCGCTGCCCGAAGGCCGGTGGGCCTCTGTGGCCTCCGTGAAGCAGGCCCGGCTGTCGTCAGGCCATGTCTGGTCCATGGCCCTCCCCCGACAGCCGGACCAAGGGAACGGTGGCCTGGCTGGCGGAGGTACTCCTCTGGGTTGGAGGGAGTGTGGTGCTGTCTTCAGAGTGGCAGCTCGGCCCCCTGGGTAAGAAGGGGCAGGCGAGTGGCCTGGGCTGAGTGCTGGCCCTGGCCAGGTGACTGGTGGGTGGGGGCTGTTCCTGGAGGTGGGGGAAGCCTGGGCCTCCATCCCATCCTGCACTCGCCTCCCCTGTCCCCCGGGTGCTCTAGGGATCATGTGGGTCCAGCAGCGTCGGCTGGCCCTGCCCCTCAGCCGCTCAGAGGCGTGCTCAGCACACCTCGGTCTCCCAGGCACCTGCAGGGCCTGGGGGCTGAACCCAAGGGGGCGAGGGGGGATCTCAGGTGGCTCCAATGCTCTCATTGAAGGGGTGCCTTGTGCTCTGGGGGTCAGTGGTGCTTGCAGCCCAGGCGGCTGGGCTGGCATCCTGGTGCCGGACATGAGGGCCTTTGCCGTTAGGAGACTCTGCAGAGGAGACTGGCTGGGTATGGCTGGGAGGGTGGAGTGTGTGTCTTGTGGTGGCCTGTGGAGGGCCCCGGTCCGGGCTGGCCTGCCAGCTCTCTGTTCCAGCGGCAGACAGGGTCCTGTCCAGGCTGCCCTGTTGCAGG
Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.
Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.
Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.
Distribution of HSS in the input sequence
HSS id | Strand | Frame | Length | Start | End | Score | P | Show Result | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 0 | + | 2 | 50 | 9334 | 9483 | 33.872 | 7.720e-06 |
Plot |
2 | 1 | - | 1 | 40 | 9345 | 9464 | 17.763 | 0.017 |
Plot |
HSS id | Sequence | |
---|---|---|
1 | 0 | AMSGPWPSPDSRTKGTVAWLAEVLLWVGGSVVLSSEWQLGPLGKKGQASG |
2 | 1 | LPRGPSCHSEDSTTLPPTQRSTSASQATVPLVRLSGEGHG |
Reference sequence (1): Target Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% |
cov pid 1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . . . 4 . . . . : . . . . 5 . . . . : . . . . 6 . . . . : . . . . 7 . . . . : . . . . 8 . . . . : . . . . 9 . . . . : . . . . 0 . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : ] 1256 1 Target 100.0% 100.0% ----------------AGCACAGGGATTGGGCCTGGGGCTGGGCGGGGCTGAGGT--CCTTTGCTCCCCCAGCCTTGGGAGGCGGCTGCGTCAGGGATTCCTTGGTGGCCCTGGAGGGT----GGATAGGCTG-GCCTGGGGGCCATCAGGACAGCAG--GTGACGGTCAGGCCAATGCCAGCCGGGCCTGGGCACAGCCCTGTGGGGGCTTCGGAGGGCCCTGAGGAGGAGGAGGAAGAGGCAGAGGAGAGAAGGCC---CCACGGAGG-TCCTGTCGCCAGCGCTGCCACTGCCTGACCTCCGCTGCCCGAA----G---------GCCGGTGGGCCTCTGTGGC-CTCCGTGAAGCAGGCCCGGCTGTCGTCAGGCCATGTCTGGTCCATGGCCCTCCCCCGACAGCCGGACCAAGGGAACGGTGGCCTGGCTGGCGGAGGTACTCCTCTGGGTTGGAGGGAGTGTGGTGCTGTCTTCAGAGTGGCAGCTCGGCCCCCTGGGTAAGAAGGGGCAGGCGAGTGGCCTGGGCTGAGTGCTGGCCCTGGCCAGGTGACTGGTGGGTGGGGGCTGTTCCTGGAG-GTGGGG----------------------GAAGCCTGGGCCTCCATC-----CCAT------------------------CCTGCACTCGCCTCCCCTGTCCCCCGGGT-GCTC--------TAGGGATCATGTGGGTC------------CAGCAGCGTCGGCTGGCCCTGCCCCTCAGCCGCTCAGAGGCGTG-CTCA---GCACACCTCGGTCTCCCAGGCACCTGCAGGGCCTGGGGGC-TGAACCCAAGGGGGCGAGGGGGGATCT-CAGG---------------------TGGCTCCAATG----CTCTCATTGAAGGGGTGCCTTGTGCTCTGGGGGTCAGTGGT-----GCTTGCAGCCCAGGCGGCT---GGGCTGGCATC-------------------CTGGTGCCGG-----------------------------------ACATGAGGGCCTTTGCCGTTAGGA-------G--ACTCTGCAGAGGAGACTGGCTGGGTATGGCTGGGAGGGTGGAGTGTGTGTCTT--GTGGTGGCCTGTGGAGGGCCCCGGT--CCGGGCTGGCCTG-CCAG-------CTCTCTGTTCCAGCGGCAGACAGGGTCCTGTCCAGGCTGCCCTGTTGCAGG-------------------------- 2 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-181551_182448 95.1% 70.3% -TCCGGAGCTGGGATTAGCTCAGGGATTGGGTCAGAGGC-TGGGCGGGGCGAGGG--CCT-GAGCTCCCCAGCCCTGGGATGCGGCAGCCTCGGGGACTCCTTGGTGGCCCTGGAGGAT----GGGTGGACTG-GCCTGGGAGCTGTAGGGACAGCAG--GTGACGGTCAGACCAATGCCAGCCAGGCCTGGCCACAGCCCTGTGGGGGCTTTGGAGGTCCCTGAGGAGGAGGAAGAAGAGGCGGAGGAGAAAAG--------------G-TCGTGCCCTCAGCACTTGGACTGCCTGACCTCTGCAGCCTGAG----G---------GCCGGGGGACCTCTGTGGT-CTCCGTGAACCAGG-----CCAGTGTCAGGGCATGTCTGGCCCCTGGCCCTCCCCTGACAGCCGGACCAAGGGGACGGTGGCCTGGCTGGCGGAGGTGCTCCTCTGGGTCGGAGGAAGCGTGGTGTTGTCTTCACAGTGGCAGCTCGGCCCCCTGGGTAAGAAAGGGCAGGGGAGCGGCCTGGGCTGAGCGCAGGCCCTGGCGGGTGGGGGCTGCCCCTGGAGG------TGGAA-GTGCCA----------------------GAAGCCTGTGGCTCTATC-----CCACCC-CAGCACTTGAC----------------------TCCGCCTCCCCCGCCCA-ACTC--------TAGGGGTCACGTGGGTCCG------------GCAGCATCGGCAGGCCCTGCCTCTCAGCCGCTCAGAGGCGCC-CTCA---GCACACCTTGGTCTCCCAGGTGCCTGCAGGGCCTGGGGGC-TGAACCCAGGGGGAAAGATTGGGGGAATTCAG-------------TGGCT-CCAATGCTCTGTG----CTCTCACTGACGGGGTCCCTTGTGCTCTGCGG-TTGGTGGT-----GCTTGCAGCCCAGGTGGCT---GGGCGG-----------------------------GCTGG-----------------------------------ACATAGGGACCCTTGCCATTAGGA-------G--ACTCTGCAGAAGAGACAGGCTGGGCATGGCTGGGACGCCAGAGTGTGTGTCTG--GGTGGCCCGTGGAGGGCGGAGCCTGTGTCTGGGTGGCCTG-TGGAGGGTGGAGCCTGTCTGGGTGGCCTGCGGAAGGCCCAGTCGGGGCTGACCCGTCTTAGGTCT----------------------- 3 Cebus_imitator-NW_016107460.1-177085_178013 95.7% 73.0% -----------------------GGATTGGGTCAGAGGCTGGGCGGGGCCGAGGG--CCT-GCGCTCCCCAGCCATGGGATTTGGCAGCCTCGGGGACTCCTTGGTGGCCCTGGAGGAT----GGGTGGACTG-GCCTGGGAGCTATAGGGACAGCAG--GTGACGGTCAGACCAATGCCAGCCAGGCCTGGCCACAGCCCTGTGGGGGCTTCGGAGGTCCCTGAGGAGGAGGAAGAAGAGGCGGAGGAGAAAAGGCC---CCACAGAGG-TCCTGCCCCCAGCACTGCCACTGCCTGACCTCTGCTGCCTGAG----G---------GCCGGGGGGCCTCTGTGGC-CTCCGTGAACCAGGCCCAGCCAGCGTCAGGGCATGTCTGGCCCCTGGCCCTCCCCTGACAGCCGGACCAAGGGGACGGTGGCCTGGCTGGCGGAGGTGCTCCTCTGGGTCGGAGGAAGCGTGGTGCTGTCTTCACAGTGGCAGCTTGGTCCCCTGGGTAAGAAAGGGTGGGG-AGCTGCCCGGGCCGAGTGCAGGCCCTGGCGGGTGGGGGCTGCTCGTGGAGG------TGGAG-GTGCGA----------------------GAAGCCTGGGGCTGCATC-----CCACCC-CTGCAGCTGTATCCCA---CTCCAGCACTGACTCCGCCCCCCTCCCCCCA-ACTC--------TAGGGGTCACGTGGGTCCGG----CAGCATCCCAGCATCCGCAGGCCCTGCCTCTCAGCCCCTCAGAGGCGCC-CTAA---GCACACCTTGGTCTCCCAGGTGCCTGCAGGGCCTGGGGGC-TGAACCCAGGGGGGATGATTGGGAGAATTCAG-------------TGGCT-CCAATGCTCCATG----CTCTCACTGACGGGGTCCCTTGTGCTCTGGGGATTGGTGGT-----GCTTGCAGTCCAGATGGCT---GGGCAG-----------------------------GCTGG-----------------------------------ACATAGGAGCCCTTGCCATTAGGA-------G--ACTG--CAGAAGAGACTGGCTGGGCATGGCTGGGAGGCCGGAGCCTGTGTCTG--TGTGGTCCTCGGAGGCCGGAGCCTGTGTCTGGGTGGCCCA-CGGAGGCCGGAACCTGGGTCTGGGTGGCCCGCGGAGGCCGGAGCGT------------------------------------------ 4 Lemur_catta-NC_059130.1-169320_169793 89.1% 47.9% -----------------CGCAGGGGATTGGGCCGCAGGGTGGGCGGGGCAGAGGCCCTGCCCTGCCCCCAGCCCCTGGGACTCAGCCTCTTCAGGGACTCCTTGGTGGCCCTGGAGGGT----AG-TGGGCTGGCCTGGGGGCCGTCTGGGACAGCAG--GTGGCAGGCGGGCCAATGCCACTGGGGCCTGGGAACAGCCCTGTGGGGGCTCTGGAGGGTGCTGACGGGGAGGAGGAGGAGGTGGAGGAGAGAAGGGGAGCCCCGCGGAGCCCCCGCGCCCAACACCGCCTCTGCCGGGCCTGCAGCTGAGC---------------GCGGGGTGGCCCTCACTGGC-CTCCGTGAGTCAGCCTCCGCCATCGTCTGGGCATGTCCGGCCCCTGGCCATCTACAGACAGCCGGGCCCAGAGCACGGTGGCCTGCCTGGCGGAGGTGTTCCTCTGGGTTGGAGGGAGCGTGGTGCTGTCTTCGAGGTGGCAGCTCGGCCCACTGGGTAAGCAGGGGCAGGGGCCGCCCAGGTGCCCAGGGAGGGTGGGGCCACTCCTGGAGGTGTGTAAGACTCGGGGCCTCCCACTCCCT--------GGT-C-------TTGGGCTCAGTGGGTCCAGG-----GTGTCAGCTGG---------------CCCCACCCCTCAGCTGCCCGGAGGCCCCAGCCCAGGTGG----CAGGGGGTCAGGTTGGGACCCTGGTCCAGTGTGCCGTGTGGGGGATGCAGGTGGCTCCGAAGCTTTGCTGAGGG-----------GGTCCCTGGCTC-------TCTGGGGGCAGCAGCACC-TTCAGCCAAGGTGGGGGCTTCCGCT-----G-GTGCTGGGCACGGAGGCC-CTGAGGCTCAGACGCTGGCGTGGGGTGCAGGAGGCCT------------------G-------CGGTGCTGGCGGGAGGGCT---G--AGT--CTC-----------------TGCTCCAGCCGCCAGATGCCCTGGGGCCTCTGGG-GCCTGTCCCTGTCT-----------TGCCTCACT------------------------------------------TGCCACACCTGTGTCCCTACCTCCCTGTGTCCCCTGGAGAGCCCAGCCTC--CC--GATGCCCCC-CACCCTGCGGCAGTTCCCTTCTGCTCAT--GGTCAGACGTTAGCTTC----CT----------------------------------- 5 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-135896_136374 92.0% 51.8% ------------------------GATTGGGCCCAAGTG-TGGGCAGGCAGAGGC--CCTGCCTCTCCCTCACCCCGGAA-TGCTGTCTTCTCAAGACTCCTCGGTGG-CCTGGAGAGT----GGGTGGGCTGGCCTGGGGGCCGTCTAGGATAGCAG--GTGACAGTCAGGCCCGTGCCTGCTGGGCCTGGGCACAGCCCTGTGGGAGCTTCAGAGAGATCTGAGGGGGAAGAGGAAGAGGAGGATGGGAGAAGGGAGCCCCACGGAGG-CCGTGCACCCAGCACCACCACAGCCTGACCTGCCGCTGAGGGCAGGGCCCTGCCTGGCCTCCCCGGCCTCCCCGGC-CTCCCTG-AGCCAGTCCCGGCCATCTCTGGGCATGCCTGATCCCTGGCCATCCACCACCAGCCGGACCAAGGGGACGGTGGCCTGCCTGGTGGAGGTGCTCCTCTGGATTGGAGGCAGCGTGGCATTGTCTTCGAGGTGGTCGTTAGGCCCACTGGGTAAGAAGGACAGGGAAGTGGCACCCAGTGGGGTGCAGGCCTCAGGCTGTCCAGGTGCTCCGGGCGGGTGGGGGCTGCTCTGAGGC----------------------CCAGGGTTTCCGTGCTTC-----CCAG----------------------------CGCTCACCTCCACCTTCCCACCCCC-TCGGTGC----GCTGGGGCCACGTGAT-CCTG----CAG--------------CCCGCCCCGCCCCT-CGCCACTCAGAGGAGCTTCCCA---GCACCTCT--GCCCC-------CCCCCCGGGGCCTGGTGC-TGAACCCAGGGGAGCAGGTCAGGGCCTGGTCAGATGTGCCGTGTGGGAGC-CCAGGGGCCTTGG----AGCTTTCGTGGATGGTCCCTGGCAC---------TCGAGAT-----GGTGGCACCTCCAGTGGAT---CCGGCAGCCTG-------------------CTGGTGCCAACACAGGCGCTGGGCC--T------------GGAGGTGGCAGAGGCCCTGGCCGCTGTCC-------C--TCCATGGGGAGGAGGCTTCAGGAGCCCCGG--------TCAGGGCTGTTTCAC--CGGCTTGGTTA-----------CAGTGGCCAGAGGGCCCG-TCCAGGCCTCACCATACTAATTAGCCTC-----GGGGCCTGTC--------CCTGTGTTCTGC------------------------- 6 Puma_yagouaroundi-NW_024412388.1-179798_180359 83.3% 37.1% --------------TTGGGCAGGGGGTGGGCGGGG---CTTGCAGAGGCCCTGCGGCTGCCCTGCCCTCAGACTCTGGGACGCTGCTTCTTTGGGGATCCCTTCGTGGCCCTGGTGGAT----GGGCAGGCTGACCTGGGGGCCATCTAGGACGGCAG--GTGACGGTTGGGCCAATGCCAGAGGGACCTGGGAGCAGCCCCGCGGGGGCCTCGCAAGGCTCTAAGCAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAGAGAAGGAGGGCCCGTGGAGC-CCCTGTGCCACC---CGCCATTGCCTGACCTGCTGCTGAGG------CGGGGTGGGGGACGCGGGCGTCCTTTGGCCTCCGTGAG-CCACCCCTGGCCATCGTCCTAGCATGTCTGTCCCCTGGCCGTCTACCCCCAGCCGGACCGGGGGAACAGTGGCCTGCCTGGCAGAGGCCCTCCTCTGGGTGGGAGCGAGCGTGGCCGTGTCCCCGCCGTGGCAGCTCGGCCCGCTAGGTAAGGGGGCAGGCCTGGCCCTCCTCGGCG----G----------------------------------GAGTGCAGCCTCAGAGCCACAGGGGCCAGGAGGGTGGGGGCTGCTTCTGGGCGTGCA-----AA--------AG---GCCCCCCT--CCTCCAAAGCAAACCTATGAC-CTCCTGCCCCTCGGGTCTCCCTCTGGGGGTCACGGGGCTCCCG----CTGCACCCCCGGCCCACCTGTCTGACCCCAGGGCGCCAGGCAGGCAGCAGGGAGGGTG------------------------------------G----GGG-------TTCGGGGATCAGG-------------GGCAG-----GGC-T-GTGGT----GGGCATGCTGGCTGGG--CACTCA-----------GGT--------------------------GGCTAT----AAAACTTTTGCTGAGGGGTCCCTGGCACTTTGCAGGGGTGG-----GGGTGGCACCTTCAGCCGGGA--TGCGCTGGGGCTAGCGTGC---TGGTGAGGGGCGAG-----ACCGCGCCTAGAGGGGGGCAGAATGCTCCT----CGCTGGTGTGAGGCAGGG------GTGGGGTGGAGGCCTGCCCG-------GCCGGTGAT-GGGAAGGTTGTGTCTGTCC--TGGCTGG----GCCGGCCCACGGAAG-GCCCCACTTGGGACTGTGTCCCGCGCCCCTGGGG------ 7 Puma_concolor-NW_020338243.1-180602_181096 85.7% 29.6% -----------GGATTGGGCAGGGGGTGGGCGGGG---CTTGCAGAGGCCCTGCGGCTGCCCTGCCCTCAGACTCTGGGACGCTGCTTCTTTGGGGATCCCTTCGTGGCCCTGGTGGAT----GGGCAGGCTGACCTGGGGGCCATCTAGGACGGCAG--GTGACGGTTGGGCCAATGCCAGAGGGACCTGGGAGCAGCCCCGCGGGGGCCTCGCAAGGCTCTAAGCAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAGAGAAGGAGGGCCCGTGGAGC-CCCTGTGCCACC---CGCCATTGCCTGACCTGCTGCTGAGG------CGGGGTGGGGGACGCGGGCGTCCTTTGGCCTCTGTGAG-CCACCCCTGGCCATCGTCCTAGCATGTCTGTCCCCTGGCCGTCTACCCCCAGCCGGACCGGGGGAACAGTGGCCTGCCTGGCAGAGGCCCTCCTCTGGGTGGGAGCGAGCGTGGCCGTGTCCCCGCCGTGGCAGCTCGGCCCGCTAGGTAAGGGGGCAGGCCTGGCCCTCCTCGGCGGGAGTGCCGCCTCAGAGCCACAGGGGCCAGGAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----------------NN----NN--NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---N-NN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------------NNNNNNNNNNNNN-NNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN---------NNNNN-NNNNNNNNN---NNNN-NNNN---NNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNNNNNNN------NN--------NN------------N----NNNNNN------NN----------------------------------------------------------------- 8 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-235407_235914 87.5% 47.0% -----CACGGGGGATTGGCCGAGGCTCAG-----GCGGGGCGGAGGCTCTGCA--------GCTCCCCACAGCCCCGGGACAGGGC-TTCTTCAGGACGTCTCGGTGGCCCTTGAGGGT----GGGTAGGCTGG-CTGGGGGCTGACTGGGACAGCCG--CTGACGATCGGGCCAATGCCAGTGGGGCCTGGGAGCAGCCCTGAGGGGGCTTCAGGGGGCTCCGACAGTGGGGAGGAAGAGGCGGAAGAGAGAGGGAAGGGCCCGCGGAG-CCCCGTGCCTGACAGCGCCTCCGTCTGACCTGCCGCTGGGG-----GG-----CTGTGACACCGGCCCTCCCTGGCCT-CCGTGAGCGAGCTCCAGCCTCCGCCCAGCCATGTCCGACCCCCGGCCATCTACTGCCAGCCGGACCAAGGGAGTGGTGGCCTGCCTGGCGGAGGCGCTGCTCTGGGTTGGAGGGAGTGTGGCGATGTCTCCGGGGTGGCAGCTCGGCCCACTAGGTAAGAGGGTACAGGGAAGTGCCCTGGCTGAGGACTGGCCAGAGCCTGCCTGGCCGCCAGGCTATGGGACCGTGAGGGCTGTCCAG--GTACCTTGG-GAGGGTGGGGGCTGCTTCTGGAGGACGA-----GAGGCCCATGGTCTCCCATCCCA---GCCCTGCACAAAGCTCTGTCCTCCCACCACC-TCGG-------GCCTCCGTCTGGGGGTCACGT----GGGTCCAGCAGCTGAGGCTGGCCCCACGCCTCAGCCCCTCCACCCTCCAGGGTCACTGAGTGTCCTGAAGACGTGGG--TCTT--------GGAGGC-TGAAACCCAGGTGGGAAGGGGGTTG------------GGGCAGGGTGGGG-CCAGACACAGGGC----GCTGGTTGGACGTGCTCCATGGGAGCTCAGGTGGCTCTGAA-----GCTTTCGCTGAGAGGGGTC---CCTGGCACTTC-----------------GGGGGCAGGTGCCAGACACAGTGGCCC--TTGGC-CCTTAGAGGTGGGCAGAGGGCCCCTTGGTGCTGTGA-------G--ACCCTGGATTGGGGA--GGAGGAGACTTGC----------------------------------TGGGTGGCTGATGGGAGGGTCGTGTGT--------------------------------------------------------------------------------------------- 9 Balaenoptera_musculus-NC_045785.1-166301_166768 84.1% 38.4% -------CAGGGGATTGGGCAGAGGGTGGGCGGGG---CGGGCAGAGGCCCTGCAGCTTCCCCACCTCA-GGCCCTGGGGCGTTGCTTCTCCTGGGACCCCTCTGTGGCCCTGGCGGTG-----GGTGGGCTGGCTTGGGGGCCATCGGGGACAGCAG--GT----GAGAGGCCAATGCCAGAGGCGCCTGGGAGCAGCCCTGTGGGGACCTTGGTGGGCAGTGAGGGGGAG--GAAGAAGCCGAGGAGA-GAAGGGGGCCCCGTGGAGC-CCCCAGGCTGC----CGCCACCGCCTGACCTGCCCCTGA--------GGTGGGGCTGGGGGCTGGCCCTCTCTGGCCTCCGTGAGCCCACCCCTGGCCATCATCGGGGCATGTCTGTCCCCTGGCCATTTACCCCCAGCCGGACCAAGGGAACGGTGGCCTGGCTGGCGGAGGCCCTCCTCTGGGTCGGCGGGAGCGTGGCTGTGTCCCCGCAGTGGCAGCTTGGCCCACTAGGTAAGGGAGCAGCCCTGTCTGGTCA----TCTGGGGCGGGGACTGGCCTGCTCCTCCCTGGCCACAGCCCCGCCCAGCCCCAGGGTCACTGGGCTCAGG-AGGGGG-GGCTGCTCCTGGGGTTGTG-----AAAGGCCTGGGGGCTCCCACCCC--ACCTCCATGCAAACCTGTAGCCTCCTGACCCCTCGGGTCTCCCTCTGGGGATCACGGGGCTCCGG----CAGCAGCCCCCGGGGTGCCTCTCTGACCC---CCCC---ACTCAGGGCCTGGAGGCTGAACCCCAGGCGGGC---------AGTGAGGAAGGAAGGGGTGGGGGAGTCAGGGGTAAGGAGGG-------------GCCGGGGCCACGG-TCCTGGT----GGATGTGCGGC---------------------------------------------------------------TGGACACTCTCTGGGGGGTCCCTGTTACTTTGGGGGGCAGT---------GGCACCTTCAGCCCAGG--TGTGGTGAGGCCAGAGTGC---TGGTGCCAGACGTG-----TCGGCCCTTAGAGGCCGGCAGAGTGCCCGT----CACTGCGGTGAGACTCTG------GAGGGTA---------------------------------------GAGTGTCTGTCTTAGCGGG----GCCGGCCCACGGAGG-GCCCCATTC------------------------------- 10 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-168318_168754 87.4% 43.9% GGTCCAGGCTGGGATTAGTGCAGGGGATTGAGCTGAGGGTGGGCGGGGCATGGGCTCGGCCCTTCCCCCATCCCTTGGGGCGCAGCTTCTTCAGGGACTC----------CTGGAAGGT----AG-TGGGCTGGCCTGGGGGCCGTCTGGGACAGTAG--GTGACAGGCAGGCA-ATGCCACTGGGGCCTGGGAACAGCCCTGAGGGGG-----------------------GAGGAAGAGGTGGAGGA--GAGACAGGGGCCTCCAGAGCCCCTGTGCCCCATACTGCCTCTGCCAGACCTGCAGCTGAGC---------------GTGGGGCGGCCCTCTGCGTC-CTCCGTGAGCCTGCCCCTGCCATCATCTGGTCATGTCTGGCCCCTGGACATCCACGGACAGCTGGGCCCAGGGAACGGTGGCCTGCTTGGCGGAGATGCTACTCTGGGTTGGAGGGAGCGTGGTGCTGTCCTCAAGGTGGCAGCTTGGCCCACTGGGTAAGAAGGGGCAGGGCCATCCAGGTGCCTGGGAGG--GTGGGGCCACT-TTTGAGGTGCATAAGGCTCGGGTCCTCCACTTCCCC--------CCA-CCGTGTCTCTGGGGTCAGTGGATCTAGT-----GTGTTG-CTGG---------------CCCCACCCCTTAGCCACCCGCACTGCCCATCTGG------------CCTGTCAGTTCAGGGCCCTGATCAGATGTGCAGTGTG-GGCGTGCATGTGGCTGTAAAGCTTTGTTGAGAG-----------GTCGTTGACTCT-------CTGGGGGGCAGCAGCACC-CTCAGCTGAGGTGGGGACTGAATGC-----TGGTGTTGGACATAAAACCC-TTTGGCTCCAGACACTGCAGTGATGCACGAGGTGCCT------------------GCT-----GGTTGCTGACAGAAGGGCT---GAGAGC--CTC-----------------TGGTCCAGCCACCAGGTG--CTGGGGCCACTGGG-ACCCATCTGTGTCC-----------TGCCTCTCCCT-------T--CCACTGCATC----------------CCACAGCCACACCCATGTCTTTACCTCCCGCAATCC-CAGAACAGCCCAGCCTT--CTTGTGCCCCCAC-CACCCTGCTGCAGTTCTCTTCTGCTCAT--GGTCAAACATTAGCCCA----AGA------GG-------------------------- 11 Ursus_arctos-NW_020656172.1-181390_181811 85.5% 40.7% -------------ATTGGGCAAAGGATGGGCGGGG---CGGG---CAGAGGCGCTGCTCCCCTGCCCTCACACTCTGGGACGCTGCTTCTTTGGGGAATCCTTCGTGGCCCTGCTGGGT----GGGCAGGCTGGCCTGGGGGCCATGTTGGACTGCAG--GAGACAGTTGGGCCAATGCCAGAGGTGCTTGGGAGCAGCCCTGCAGGGGCCTCGAAGGGCTGTCAGGAGGAGGAGGCAGAAGCAGAAGAGAGAAGGGGGGCCCATGGAGC-CTCTGTGACACC---TGCCATTGCCTGACCTGCTGCTGAGG------TGGGGTGGGGGACACTGGCCCTCTCTGGCCTCTGGGAG-CCACCCCTGGCCATCG--TTAGCATGTCAGTCCCCTGGCCGTCTGCCCCCAGCCGGACCGGGGGAGCGGTGGGCTGCCTGGCGGAGGCCCTCCTCTGGGTCGGAGCGAGCGTGGCCGTGTCCCCACCGTGGCAGCTTGGCCCACTAGGTAAGGGGGCAGCCCTGCCTGGTTGTGAGG----GCCTAGGACAGGCCTACTGCTCCTGGGCTAGAGGTCCGCCCAGCCCCACAGCCCCTGGGGCCAGGAGGGTGGGGGCTACTTCTGGGGGTGTG-----CA--------AG---GCCTTCCT--CCTTCCAAGGAAACCTGTAAC-CTCCTGTCCCTCAGGTCTCCCTCTGGGGGTCATGGGACTCCAT----CAGCACCCCAGCTGG-CCCCTCTGACCGCCCCTCCCCCGCCCTGGGGCCTGGAGGCTAAACACCAGGCAGGC---------AGTGGGGTGG---GTGGGTGG-------GGGTCAGGGTCAG-------------GGAGG-----GAC-T-GGGGG----CAGGACCCTGGCTGGG--CACTCA-----------GGT--------------------------GGCTCT----AAAGCTTTTGCTGAGGGGTCCCTGGCACTCTGGGGGGCAGT---------GGCACCTTCAGCCCCTG--TGGGCTGGAGGCAGC-------ATGTGCAGGACATG-----GAAGCCCTCGGAGGTGGGCAGAATGGCCCT----CGCCAGTGTGAGACTCGG------GTGTGGAGGGGTCGAGGCCTG--CCTGGGAGGTGAC-GGGAAGCTTACGCGTCTGTGT------------------------------------------------------------------- 12 Pteropus_vampyrus-NW_011889090.1-170297_170703 85.9% 40.1% ---------CTGGATCCCGGCTCGGATTAGCGCAGGGGATTGGGCAGAGGCGCTCGGCCCCCCCGCGGCAGGCCCTGCCAGGCTGCTCCTTCGGGGATCTGCCCGGGGTCCTGGGGAT-----GGGTGGGCCGGCCCGGGGGCCTCCTGGGACAGCA---GGTAACAGCGGGCCAATGCCAGAAGGGCCTGGGAGCAGCCCTGTGGGGGCTGCGGGGGGCGCTGAGGGGGAAGTGGGGGACGCAGAGTAGGGGAG-GGTCCTCGCGGAGC-CTCTGAGCCGCC---TGCCACTGCCTGACCTCTG---------------------------CCGTGACGGGCCGGGGGCCCCGTGAGCCGCCCCGGCCCTCGTCCGGGGATGTCTGTCGCCTGGCCGTCCACCTCCAGCCGGACCAAGGGAACGGTGGCCTGCTTGGCAGAGGCCCTCCTGTGGGTTGGAGGGAGCGTGGCCGTGTCCCCGTGGTGGCAGCTTGGCCCACTAGGTAAGGGGGCAGGCCAACCTGCTCCTGCCCGGACGGAGCC-----------------------------CTACCCAGCCCCTGGGTGTGAAAGGCCTGG-----GGGTGCCCCCCCTG------------------------------------------------CAAACTGGCACCTCCTGCCTCCTGGGGTCCCCCTTTAGGGGTCGTGTGGCTCCAG----CAGCACCCCCCTCTGCTGAGCCCGCC--------------CTTGGGGCCCAGAGGCTGAACCACAGGGGGGC---------AGCGGGAAGGAGGGGCTGAGG-GCACAGCCCTGGCGGATGG-------------GCTGGCTGGGTAC-TCAGGCGGCTGTGAAGCCTTGGCGGGT--GGGTCCCTGGCACTTATGGGAGCAGCGAGCTGGTGCCGGACACAACGGCCCTTACAGTGGACCTCACTGCCTGGCCCCAGTGAGCCACTGTCCCAGC--------TGGCACCACCTCC----------CCTGGGACCTGGGAGG-CTTGCAGGCTGCAGACGGGGCCAAACGCACAGAGG-------AGGGGCAGG-------GCGTAGGGGGCCGGG------AGGGGGAATGG------TT-------TGG-----AG-CTCAATCTCAGCACTGTGCCTCCCCAGA----CCTGTGCTCCCCCCA-CCCACCGTGGCCTCCACGTGTA------------------ 13 Hipposideros_armiger-NW_017731634.1-166627_167100 84.1% 38.3% ----------GGGATTGGGCCAAGGATGAGCGGGA---CGGGCA-GACACGCTTGGCTCCCCCACCCACAGGCCCTGCCATGCTGCTGCTTTGGGGATCTGTCTGTGGCCCTGGTGGGT----GAATAGCCTGGCCAGGGGGCCCTCTGGGGCAGCAG--GTGACAGTTGGGCCAATGCCAGAGGGC-CTGTAGGCAGCCCTGTGGGGACCTTGGGGGGCTCTGAG---GAGGAGGAGGAGGAAGAAGAGAGAAGGGGGCCTCGTGCAGC-CCCTGTGCTGCC---CACCACTGCCTGACCTGCTGCTGAGG------TGGGCTGGGCGCTGCTGGCCCTCTCTGGCCTCCCTGAG-CCCACCTTGGTCATCGTCCGGGGATGTCCATCCTCTGGCCATCTACCTCCAGCCGGACCAAGGGAACGGTGGCCTGCCTGGCAGAGGCCGTCCTCTGGGTTGGAGGCAGTGTGGCTGTGTCCCCATGGTGGCAGCTTGGCCCACTAGGTAAGGGCACCGATTGCCTGTTCCTCCCTG----GCCAGA--------------------------GCGCCACCCAGCCCCAGGGCCAGTGGGGCCTGGAGGGTGTGAGGGGCCTGGGGGTGCCC--------------------------ACC--CCACCCCCACAAATCTGTAACCTCCTGCCCCCTTGTGTCTCTCTCTGGGGTTCATGTGACTCCAG----CAGCACCCCCCTTGTGGTGACCTCCCCTT--------------GGGGCCTGGAGGCTGACCCACAGGCGGGC---------AGCGGGAAGGTGGGGC-TGAGGGCATGACCCTGGTGGACGT-------------GCTGGCTGGGTGC-TTGGGCAGCTCTGAAACTTTGGCTGCG--GGGAAG-----------GGGGGTCCCTGGCATTTCGGGGCAG--CGGTGCCT----TTAACCCTGCCATGCTGGTGCCCGGCACAGTGGCCCTTAGA-------GTGCCCCCCGCTGCCTACA--GCCTCCCCAGCCCCAGGGA-GCTGCTGTCTTGGCCG----GCACCCCCTCC----------CCTGGGACCT----GGGAGGCATGCAAGCTGC------ATGGGGGGGCAGGTGGGCCCC--CCCCCAGGCTGGG---GACGCGTTTGGGT------T------------------------------------GGAGCTTCTA-------------------- 14 Hyaena_hyaena-NW_024080942.1-181985_182449 83.2% 36.2% --TAGCACAGGGGATTGGGCAGCGGGTGGGCGGGG---CCGGCAGAGGCCCTGCGGCTGCCCCGCCCTCCGACTCTGGGACGCTGCTTCTTTGGGGATCCCTTCGTGGCCCTGGTGGGT----GGGCAGGCTGGCCTGAGGGCCATCGAGGACAGCAG--GCGACAGTCGGGCCAATGCCAGAGGGACCTGGGAGCAGCCCTGTGGGGGCCTCGCAAGGCTCTAAACAGGAGGAGGAAGAAGCGGGAGAGAGGAGGGGGGCCCGTGGAG-------------------------CCTGACCTGCGGCTGCGG------CGGGGTGGGGGACACCGGCCCCCTTTGGCCTCCGTGGG-CCACCCCTGGCCGTCGTCCTAGAATGTCTGTGGCCTGGCCATCCACCCCCAGCCAGACAGGGGGAGCAGTGGCCTGCCTGGCAGAGGCCCTCCTCTGGGTCGGAGCGAGTGTGGCTGTGTCCCCGCCGTGGCAGCTCGGCCCACTAGGTAAGGGAGCCCTGCCCTAGGGCCACTGGG----CCGGGAGGG------------------------------------------------------------TGGGGGCTGCTTCTGGGGGTGCG-----AA--------AGCCCCCCCCCCC--CCGCCGAAGCAAGCTTGTAAC-TGCCTGCCCCTCAGGTCTCCCTCTGGAGGTTACGGGATTCCCG----TGGCAGCTCCGGCCCCCCCCCCCCCCCCCC----------CCCCGGGCCTAGACGCTGAGCACCAAGCAGGC---------GGCAGGGAGAGCGGGGGTGTGGGGATCAGGGGCAGGCCCCT-------------CGGTGTC---CCG-T-GTGGA----GCCCAGCCTCCCTGTG--CCCCCC-----------CACCCCCCCCCCC----ACC-GCCA--CCGCCACC----CTGGAGTGTCAGGAGTCCTCACTGGCTGGTCTCAGAGGGCA---------CGGGCCTTCATGGCAC-----CACTCAAGGGTCCCTTA-GTGGGTGGGTCACGTGGGGTTGAATTGCTGATGCTGCAGCTGACGGTACC----------TTCTGAGTCCTGG------GCTTTCTGTATGAAGGGCCT------GGG------------GGGCGGGGGCTGACCCATCCCTGG----CCTGGACCCCTGGAG-C-------CTGGAGCCTCTCCAGCCCTGGGGGGCTGC--- 15 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-177273_177782 87.9% 43.6% 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16 Equus_caballus-NC_009145.3-180402_180832 84.8% 38.3% 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17 Bubalus_bubalis-NC_059161.1-169385_169780 85.0% 38.6% 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18 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-177453_177843 84.7% 39.1% 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19 Desmodus_rotundus-NW_020090861.1-184732_185114 81.0% 33.8% 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20 Artibeus_jamaicensis-NW_023552099.1-170223_170589 82.0% 34.0% 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21 Peromyscus_maniculatus-NC_056009.1-167383_167760 84.9% 38.2% 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22 Cricetulus_griseus-NW_003616165.1-43432_43806 86.0% 43.6% 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23 Miniopterus_natalensis-NW_015504651.1-670473_670851 85.3% 34.6% 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24 Halichoerus_grypus-NW_023403807.1-181397_181876 86.3% 39.8% 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25 Camelus_dromedarius-NC_044523.1-182164_182635 83.4% 37.3% 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clustal .. . . .* * *.. .* . . .*. . ** *: :* .*.* ** .* .. .. .. ... . ... *. . .*. * . . *.* ...* .. . **.* *** ** .**.. * * *** * .*.* ** **** ** * ** .* .. *.****** . . |