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 1 Target                                              100.0% 100.0%    ----------------------------------GTGCAGGAAGGAGAACTGGACCCCCTGGGT-CAG--------AGTGGAAG-------CCCGCAGC------AGCCCAGTATGAGGTGG----------GCAGGGGCC-CTGGGCCAGGGC--------TATGGCCGTCTGGTCTGTCTCCAGGCCCT---CAGGCCACC-TCCTGGCCCCTGCG--CT--------------------GCCCCTTACACGGTGGCCT-TCCCCGAGGCCCTGTCTTCCTGAGGACGCCCGGGACTCCAGCCCCTCTCCTCTCCCTGCAGCTCATGGCTCCCTAATCTAATTCCACGGCAGAGCCCAGAAACGCCTGC--TGACCTGCTTCCGCCGAGAGCA---GCAGAGCCT--GTGAC-GGGGCCCCTGGTGG-GGGCCTGGGTTGGCTCTGTGCTGACTGCAT-CTGATCTGGCTGGGTGTGGCCCTGGTTGTCAGTGGTCAG------CTGGAGACGC--ATGGCCATCTCCTCAGGGACTGCCACCTCCCACG----CCTG-----AC---CTTGGCCCCGGGGCTCTGCCAGGATGCCCAGCCCTGGCACCTCCCTGTCCTGGGCTCTGCAG----------------------GCCAAACTCCTC---CCCTGGTAT-GGGGGGAGGCGAGCAGCTGCCCGGAACCTTCCAGTCCTTGTTGCTGGAGCCAGTAGAGCCTGGGCAGTG----GGTGGGAAGAAGGGCGGGGTTCTCCCCAGTGTGGTCACGAAGCATGGGCATGG---CCAGGACAC--------AGGTGG-C---TGGTGTTCAGCCGGGGTCTGCCCAC------------CTCCCATTCCCACAGCTGCCCCTGG----------TGTCCCGGCCTGGACTTGGG------GATGG-GAGAGC-C-----TGTGCTGTCCTGTAGTGCG-------------------GGGCCAGTACACAGGGT--GGGCTGTGTGGTCCTGGTGGCAGTGGGACC----TGGAGTCCTTTCCTCA---------------GTGG---------GAGCTGAGACGGTG---G--GGTGGGTCCTCCTT--------G-GGCGAGGC----CC---------CTGTC--CAGGT-----CAGATGGCTGTCATCCCTGCAG-----GGCAGAATGT-GGGG----ACAAACGTGCCCTGGGCAT--GGGGCCACCTCCTCCGCCACAGCTCGGTGAC---------CGTG----GAGAAAGGTCAGGCTGGGGCTGCAGCTGCAT---GA-----     
 2 Callithrix_jacchus-NC_048389.1-181412_182258         98.4%  75.4%    ------------------------G---------GCGCATGAGGGAGAACTGGATGCCCCTGGT-GGG--------AGTGGAAG-------CCTGTAGTCTGGTGTGGCGAGGCATCAGTGG----------ACCGGAGCC-CTGGGCCAGGGC--------TGTGGCTGTCTGGTCTGTCTCCAGGCCCT---CGGGCTGCC-TCCTGGCCCCGGAG--CT--------------------GCCCCTGACATGGTGGCCGTGCCCCAAGGCCCTGTTTTTCTGAGGATGACCAGGACTCTAGCCTCTCTCGTCTCCCCAAGGCTCATGGCTCCCTAATCTAATTCCACAGCAGAGCCCAGAAACACCTGC--TGACCTGCTTCCGCCAAGAGCA---GCAGAGCCT--GTGAG-CAGC-CCCTGGTG--GGTCCTGGGTTGGCTCTGTGCTGAGTGCAT-CTCATCCGGCCAGGCACAGCCCTGGTCATCCGTGGTCA-------GTGCAGATGC--ACGGCCATCTCCTCAGGGGCTGCCTCCTCCCATG----CCTG-----AC---TTTGGCCCCAGGGCTCTGCCAGGATGCCCAGCCCTGGCACTTCCCTCTCCTGGGCTACACAG----------------------GCCAAACTCCTC---CCTGG-AGT-GGAGAGAAGAGGGCAGTTGCCCGGGGCCTTGGGGTCCTTGTTGCTGGAGCCAGTGCAGCTGGGGCAGTG----ACTGAGAAGAAGGGCAGGGTCCC--CCAGCATGGCCATGCAGCGTGGGCATGG---CCAGGACAC--------AGGTGG-C---TGGTGTTCAACA-GGGTCTGCCCAC------------CTCCCATGCCCATAGCTGCCCCTGG----------TGTCCCTGCCTGGACTTGGG------GATGG-GGGAGC-C-----CGTGCTGTCCTGTGGTGCC-------------------AGGCCAGTAAACAGGGT--GGGT-ATGTGGTCCCGGTGGCAGCAGGACC----TGGGGTCCTCACCTCA---------------GT---------GGGAGCTGAGACGGTG---T--GGTGGGTCAGCAGG--------A-ACCACTCA----GA---------GGCCCTCCTAAG-----TAGAGATGTGGGGTGAGGGCAG-----GGACCACTCC-AGGCCAGCCTCAGCATGGTGGGTGCAC--AGCGGGGAGGCCCATCCCACATAG-GGTCCC---------CTGA----GGCCCATGCCCCATAGGCCTTCCAGCTG-------------     
 3 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-180395_181227     96.9%  71.9%    ----------------GTCCCTGAG---------GTGCATGAGGGAGAACTGGATGCCCCTGGT-GGG--------AGTGGAAG-------CCTGCAGTCTGGCGTGGCGAGGCATCGGTGG----------GCTGGGACC-CTGGGCCGGAGC--------CGGGGCCGTCCGG----------------------TCTGCC-TCCTGGCCCCGGAG--CT--------------------GCCTCTGACACAGTGACCGTGCCCCGAGGCCCTGTCTTTCTGAGGACGACCAGGACTCCAGCCTCTCTCGTCTC--CCCGGCTCATGGCTCCCTAATCTAATTCCACGGCAGAGCCCAGAAATGCCTGC--TGGCCTGCTTCCGCCGAGAGCA---GCGGAGCCT--GTGAG-CCGGCCCCTGGCG--GGTCTTGGGTTGGCTCTGGGCTGAGTGCAT-CTCATCTGGCCGGGCATGGCCCTGGTCATCAGCGGTCA-------GTGCAGAGGC--ACGGCCATCTCCTCAGGGGCCGCCTCCTCCCATG----CCTG-----AC---TTTGGCCCCAGGGCTCTGCCAGGATGCCCAGCCCTGGCCCCTTCCCGTCCTGGGCTCCGCAG----------------------GCTAAACTCCTC---CCTGG-AGT-GGGGAGAGGAGGGCAGTTCCCCGGGGTCTTGGGGTCCTTGTTGCTGGAGCCAGTGCAGTTGGGGCAGTG----GCTGGGAAGAATGGCGGGGCCCC--CCAGCGTGGCCATGCAGTGTGGGCACGG---TCAGGACAC--------AGGTGG-C---TGGTGTTCAGTG-GGGTCTGCCCAC------------CCTCCACACCCATAGCTGCCCCTGG----------TGTCCCCGCCTGGACTTGGG------GATGG-GGAAGC-C-----CGTGCTGTCCTGCGGTGCC-------------------AGGCCAGTAAACAGGGT--GGGT-GTGTGGTCCCAGTGGCAGCGGGACC----TGGGGTCCTCACCTCA---------------GTGA-----GTGGGAGCTGAGATGGTG---C--AGTGGGTCAGCAGG--------A-ACCGCTCA----GA---------GGCCCTCCTGAG-----TAGGGATGTGGGGTGAGGGCAG-----GGACCACTCC-AGGCCAGCGTCAGCGTCCATGGCA--C--AGTGGGGAGGCCTATTCCACACAG-GGTCCC---------CGGA----GGCCCGTGCCCCACAGGCCTTCCAGCTGTGT---TCTCCAG     
 4 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-167029_167305      80.4%  28.8%    -------------------ACTGGCTTTC-----GGGTATGTGGAAAGTGG-------CTGTGGGCCCCCAGGGACATCTGAAG-------GATAT----------GG-------------TGCAGGCACTGGGTGGGGGG----GCCAGGCTGTGAGCCAGCCCTCTGTTCCTAGGTGTGTGCACTTGCCTCTGGGA-----------------------TTTCTGGGC---TCCACCCGCCTGGCTGGCTATGCTGGCAGGGCCCTGCGCCCCATCTTCCCAAGTACTCCTGGGACTCTGGCCCCTTTCCTGTCCCAGCAGCTAATGGCTCCCTAATCTAATTCTGCCTGCT---------------GACCTCCTGTGAGCAGAG-----------TCAGAGCTTCTGTGAC-AAAGGCTCCTTATTGGGTCTGGGGTTTGGCTTTGAGCTGATTACAGGGGATCTGGCCGGGTGTGGTCCTGGTTCACTGTGGTCAG------CCCAAGATGCCCTGCTATCT--CCTCATGGCCTGCCACCTCCCCAA----CCTTGCCCCCC---CTG---------GCTAGGCCAGGCTGCCTGGCCTCCAGCTCCTCCTGCCTGTGCAGAGAGGGGAGAGTGTGACAGTCTCACTGGAGTGGGCACAGC-CTGGGGGTCGG-CAGGAAGGAGGCCTGGAGGCTCCCAAGGAGGAG--------GGGGTCCTTCAACCGGA-----------------------AAGCCACCTCTGACTAGGG-----G---------------------------------------------------------------------TGAGAGA------------GCCAGAGCCCACAAGTTGTCCCTGTGTTGCAGGTGGTATAAT--T----GCAGGGCTCAGTGGCAG-GAGGGT-TC---------TAGGTCTTGCCTATAGTGG----------------GAGCTGGGGCTGGGC-AGCCCAGTGTCAGGTGTCCAGCTGGGCAGATGTCCCATAC-------CCATCTCCTCTACTCCCA-CTCCCAGGGCTGCACACGCATCTGTGGCCCCTCAGGGGCTCTGCTG--------AAGGTACTGGCATGGCTTTTGC-TGGGCTCCTGTGGCTCCTTCCAGTCAGGTGGCCATCACAATGGTG----AAGGAAGTGCCCTTGTGCATCGGGCTGCAGC--------AGCAAGCGTGGGAAGGGCTGGGCTGGGGCTGCAGCTGTGTGAGTG--AGGCAGAGGAACCTGACCAGGGCTCAAGGGACCCACAGC--     
 5 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-169450_169659   81.8%  30.8%    ----------------------------------------GCGGCAAGTGG-------CCCGGGGCCTCCAGACACGCATGAAG-------GAAGG-GTCGGGCAAGG-------------ACGGCCGTGTAGCTTGGGGC----ACCGGGCCATAGGCCGCCCGTCCGTCCCTAGGTAATTGGACCCGCCTCTTGGG-----------------------GCTTCTGGG---CTCCCCCTGCACAGTGGCCGTGCTGTCAG-GGCCTGCACCCCATCTCCCTGAGGACTCCCAGGACTGGGCC-CCCTTCCTGTCCCTGCGGCTAATGGCTCCCTAATCTAATTCCATGCAGAAA-GCGCAGAGCTGCCCCCTGACCTGCGAACGG-----------TCAGAGCCTCTGTGAC-AAAGGCCCCTAATTGGGTCTGGGGTTTGGCTTTGAGTTGATTACACGGGATCTGGCCGGGGGTGGTCCTGTTCTCTGTGGCCAG--------CCGCAATGCCCTGGCCATG-AACGCGCGGCCCGCCGCCCC----C----GACCGCAGCGC---CCG---------CGGCTCTCCAGCTGCCCAGCTTCCGGCTCCTCCCG-TCCGTGTGGGGAGAGAGGG-TTGAGAATCTCGCTGGGGCCAGCACAGCCTGGGGTGGGCA-GGGGGAGGAGGCCTGGCGGCTCCCAAGGGTGGT--------CACAGGCCTGGGCACGTCCAG-----G----------GGATGGGCTGCCTGGCCTCCCGTCCGCCCTCGGGATTCAGGGGTC------------------------CGTCA-G---GAGGTCCTCAGCACGAGGGGTGTGG------------GGACGAGAGCAGGGACTTCCCCAGGGCCCAGGCTGGGACGGCGGG----GGTGGGATGCCAGCCTT-GGGCAC-CC---------GGCGTGGGCAGGATGGCAGGGAGACCCGCCCCA--CGGGGTCTGATTATG-CTCCCTGGGGGGGGGGTCCATGAGACCGGTGCCCCTGGGCTTCACAGCTGCATCCTTTGGGTTCC-CAGGAGGGGCCGCCCGTTGGTCCT---GTTGTCATTCCTCAACCCCC-------AGAGGGGTCGGGGGCCTGGGCC-TTGGGAAGCACTGCT----GCATCCAGCCGTCCTG------------------C---------AGCCAGCTGGGAGCTCCC---T--TGGCCTCAATCCTCGGGCCAGCT-GGGCT-----------GGATCC--T----------------------------------------     
 6 Microcebus_murinus-NC_033661.1-166249_166452         82.5%  31.3%    -------------------------------------GTGGCAGCGAGTGG-------CCCGGGGCCTCCATACACGCGTGAAG-------GAAGGGGCGGGGCGAGG-------------AGGGC-ATGTAGCTTGAGGC----ACCGAGCCATGGGACACCCCTCCGTCCCTAGGTGCGTGGACCTGCCTCTCGGA-----------------------GCTTCTGGG---CTCCCCCTGCACAGTGGCCACGCCGTCAG-GGCCTGCACCCCATCTTCCTGAGGACTCCCAGGGCTGAGCC-CCTTCCTGTCCCG-GCGGCTAATGGCTCCCTAATCTAATTCCTGGCAGAAA-GCGCAGAGCCGCCCGCTGAC----CTGTGA-----------ACAGAGCCTCTGTGAC-AAAGGCCCCTAATTGGGTCTGGGGTTTGGCTTTGAGTTGAATACTCGGGATCTGGCCGGGGGTAGTCCTGGTTCCCTGGTCAG--------CCCGCGATGCCCCGGCTGTT-CACGCACGGCCTGCTATCCCCCCCA----ACCCCAGCCAC---CCC---------GGCCAGCCCAGACGCCCAGCCTCTGGCTCCTCCCATCCGGTGCAGGGAGAGAGGGGGTGGCAGTCTCACTGGGGCCAGCGTGGC-CTGGGGGTGGG-CAGGGAGGAGGCCTGGTGGCTCCCAAGGGTGGT--------CACAGGCCCGGGTATGTCCAG-----G----------GGATGGGCTGCGGTGTTCAGACTGAGGTCTGTCCCCTCCCGATCC------------------------ACTGG-C---CGACACTGGAGGACG-----TGAGA------------GGCAGAGCCCATTG--CTGCCCTGTGCTGTTGGCAGAGTGACTAG----GGTGGGCTCAGTGGCAG-GAGGAC-TC---------TGGGGTTCCCAGTAGGAGCTGAGACTGCGCAGGGGTGAAGTGGGCTGGGT-TGCCCAATGACCTTGGAGCAGCAGAGCCGGCT-----GTCTCATCCTC---------TGTCCCCA-CACCCCAAGCTGCACACAGTGCCAAGGCTCCTTGGTGCTCCACCACC-------CCATGGCTGCTGTGGCCTTCAC-TGGGCTTCTGTGCCA----GGGGTCAGGTGGCCATGGAGGTGGGG----A---CAGCCAGCTCAGCCCCAGGGCAGACACA---G--TGAAGAAAGTGCTGGGTACTGGG-CTGGG------------------------------------------------------------     
 7 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-175719_176056     82.5%  32.5%    -------------------------------------------GGAGGGGT---------------------------------------GAGTGTCACAGGGCCCAG--GACACGAGGTGTGGACCATGGGGC--CTTGTCCAGGCCGATCCCTCAGACCCGCCCCCGGCCCCGCTCTGGTCCTGATGCTCCCCAGCTTTCTGGTTCCCCTTTCCCCAGACCCCCTGCG---CAAGCGG-------CGATGCTGTCAGCGGCTCCAGCAGCCCCGTCTTCCTGAGGATGCCCGGGACTCGTTCCCCTTTCCTATCCTAGAGGCTGATGGCTTCCTAGT-------CTA---ATTCCATG----------CAGAACCGTCTCCTGCA-----------AGGGACCGAGTCAGTG-CCTTTTTGGCAAAGGGTTCTGGCATTTGGCTTTGAGTCGATTACCTTGGATCTAGCTAGGTGGGGCCCTGGTTATCTGTGGTCA------GGCCAGGATGCCCATCACTATCTCCTCACAGCCTGCAGCCTCCCACC----C-TTGCAAACC---TTGGACTTAGCAGCTGTACCAGGCTGTTTGGCCTCTGGTGCCTCTTGTCCTCGGCTCTGTGC----------------CCCTGGCCCCAGCTCCTC-CCCTCTGTGCT-GGGGAGGGAAGGGTGGCTGCCCCTGTCTCAGCAC-----AGCCCAGAAGCGGTGGGATTTATGGCAAT----------GAGGACAGAGGGCTT------------------------------TCA---AGG---------------GCAGC-C---CAGCACTGC-CTCAGGCTGCCCCTG------------ACCCAGGGACCCATGCTGGCCCTGCCATGCCTGGGCAGTTGGCACAA--GGTGGGCTGTGGGCTCT-TGGGCCCAGTGGCAGGAGCACCCTGGGGCCCTCGGAACCAGGCCCCAGTCC-TCACCACAGC----------TGTGA-------CTGT-GGGGTGGGGTTC---TGCCCCTTGGGCCTTGTGCCACCCCTTGGC-CAGGCTGGCCTGCCCTGGCCTG------------GTGGCCCCTGGACCATG---AG-AGGCGGCCATGCCATCTTC-TCTGTCTCTCCTGCT--TGCGTGC-TCCTCCTCAGAGTGC-GGTC---GGCTCCTCTGGGCTCGCTGCCCC------------------------GAGGACTGCCCTAGTCTGGGCCTTAGCTGGTGTGGCTG--TGACTGGGCCT-GTGTCCAGTCAGCAGGCAA----------     
 8 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-176008_176111        80.8%  27.1%    ----------------------GCCC----------TCTGACGGAATAAGG-------CATAGCTC----------GC-TTGTG-------CACAGGGC--------A-------------GGGGACATGTGGCTCCGGGCATGGAGCATGGGGTCCCCAGGGCCAGTGTCCCCAGGTACTTGGACTCGCCTCCTGACCT--------------------AGCTTTGGCC---CTGATGCTCCCCTGGGGATGCCCTTACACGGGTGGCAGTGCTGTCTTCTGGAGGACTCCCAGGACTCCTGC-CCTTTCCTGTCTCTGTGGCTAATGGCACCCTAATTCAATTCCATGGCAGAAAGTGCAGAGCCGCCT--------------GC-----------TGGCCCCCGCTGTACA-ACTGCTCCTAATTGGGTTCTGGGGTCTGGCTTTGAGTCGATTACAGGGGATCTGGCCAGGCTTCCTGTTGTCCAGGGCATGTTGA------TGGTGAATAGGGAGGGATGG-GGGGCCCAGGGGCCCAGTGGCCAAA----GGAGTCCCCAG---TAG---------GGTTGTTGCAGCT---ATGGGGCCAGCTCAGCTGG-CAGGGGCTCCCAGG------GCCAACCTGTCCTTTAATGGGGGCCTGGCAGGGGTGAGAT-AGCTTGGGATGCCCAGTGACCCCCATCTCTCCTG-----CTCTCCACTCCCCAGAGCTCCAC-----T----------GGAGGA-GTGCCCTCTGCTCCTTAGGTGCTCGA-------TG-------------------------------------------------------TCCCCAG------------GGCAGCCGTGGCTGGCTTCCACTGTGCCCTACAGCCAGCT-GGCT----GGTGGGAGGGTGGGCAG-GCCCTC-CCTGACCAGGCCCCCTCTCCAATCAGGTGGCC-----ATGAGGGGGCAGAATGTG-----G-TGATGAAT---------GTGGCTGGGCACTGC-----GCCGCCTCCTCTGCAGGCTGTGGCCTG---GGGAAAG-GTCAGATGGGAGCCCAGGCCTCGGGGCCTCCCATGAGCAAGGGAGACAGCAGTGCTGGACCACACTC-CGGGGACCTA--CACCCTCCAGCCGAGGTGACGGTTGCAGCAGAAGGGGCATGCAGGGCCGGGGTCAGAAAGGCCTAGCAA---G--TGGCCCTGGTCCACTGGGCTGTG-CTTTCCAGCACCGGAGGGCCA------------------------GGCGCTGGCACAAGCTGCTG     
 9 Equus_przewalskii-NW_007674960.1-178992_179194       81.2%  31.0%    ---------------GACCACA------------GCAGGCGAGGTGGTGGG---------------------------------------GAGTGTCACCGGGCCCAG--GACACCAGGTGTGGACCACTGGGC--CTCGTCCAGGCTGATCCCTTGGGCCTGC----------CCTCTGGTCCAGATGCTCCCCGGCTTTCTGGTTCCCCTCCTCTCGGACCCCCGGTG---CAGACAGCAGATGGCGATGCT-GTCAGGGCTCCGGCAGCCCTGTCTTCCTGGGGATGCCTGGGACTCGT-CCCCTTTCCCACCCCAGAGGCTGAGGGCTCCCTGGT-------CCG---ATTCCACG----------CAGAACTGCCTCCAGCA-----------AG-GGATGAGTCAGTG-CCTCTTTGGCAAACGGCTCTGGCATTTGGCTTTGAGTCGATTACTTTGGATCCGGCCGGGTGTTCCC-TGGTTCTCTGTGGTCAGCCCAGAACCAGGATGCGCGTTGCTATCTCCTCGGGGCCTGTCACCTCCCACC----C-TTGCCAACC---TTAGACACAGCAGCTGTTCCAGCCTGCCCAGCCTCTGGCTCTCCTGT-CCTTGGCTCTGTG-----------------GCCCGGGCCCGGCTCCTC-CCCTCTGTGCC-CAGGAGGGAAGGGTGGCTGCCCCTGTCTCAGCAC-----AGCCCAGGAGTGGTGGGATTTATGGCGAT----------GAGGACAGGGGGCTT------------------------------TTG---TGG---------------GCAGC-C---CAGCCCTGC-CACAGGCTGCCCCTA------------ACACAGGGACCTATGCTGTCCCTGCCGTGCCTGGGCAGGGGACAC-A--GGTGGGCTGGGGGCTCC-TGGGTCCAGTGGCAGGAGCACCCTGGGGTCCTCAGGACCAGGCCCCAGTCC-TCACCGCTTC----------TGTGA-------CTCT-GGGGTGGGATTC---TGCCCCTTGG-CCTCGGGCCACCCCTTGGC-GAGGCTGACCTGCCCTGGCCCA------------GTGGCCCCTGGACTGCG---AG-AGGCGGCCGTGCCATCTTC-CCTGTCTCTCCTGCT--TACCTGC-TCCTGCTCACAGTGC-ACTC---AGCTCCTCTGGGCTTGGCTGCCC------------------------TTGTCCAGGCC-----------GTAGCTGGTATGGCCT--TGACTGGGCCTTGTGTCCGGTCAGCAGGCAG----------     
10 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-233966_234039  91.7%  48.1%    --------------------------------------------AAGGGGTGCATGGCCCTGGA-CAC--------AGAGGGTG-------CGGGCCATCCTGTCTCATCCAGCCTTGGGGTCCTTGATGGCCCCTGCGTC-CCCAGTGCTTGA--------ACCTGCCTCCTGGTCTCAGTCCTGTCCCG-------ACGC---TCTGTTGGGCTTC--CG--------------------GCGCCCCCCCCCCACGGGTGGGCACACTGTCAGGGGCTCCTGAGGACTCCCAGGACTCTTGCCCCTTTCCTGTCCCAGCAGCTACTGGCTCCTTAATCCAATTCTGCGGCACAAAACGTGGGGCCATTTGCTGACACCCTCCAGCGAACAAACGAGCCAAGGCCTCCATGACCAAGGCTCCCAGCGG-GCTCTGGGGTTTGGCTTTAGTGGATTGTGT-GGGACCCGGCCGGGCAGG----------------GTCAG------CCTCAGACGCCTCTCGCTATCTCCTCACGGCCTGCACCCCC---------CGTC-----CT---TGGACCCTGGTGGCTATGCCAGCCTGCCTGGCCGTGGCACCTCCACGTCCTGCGCTCTGTGG----------------------CCCCGGCTCCTC---TCCTCTGTG-CCGGAGAGAAGTGTGACTGTCCCGAGTACTTTCAACAGTCTCTCTGGAGCCAGTGCAGCCTGGGGAAGG----CGGTCACTCC-------------------------------TCCTGGGCA-CA---GGAGGAAAC--------AGGCTG-C---CGGCGTTCACACGAGGCCTGCCCCT------------CCATGGTGCCCACAGTTTCCCCTGGGCCCC--TGCTGTCCCTGCAGAGTCTGGGCAGGGTAGACCG-GGGACC-G-----TGGGCTTGGCTGGGCAACGAGTCCCCCATCTCTGTTGCTCCCCACTCCCCAGGGC-TGCTCTGGTTGGTGTGGCCTCCACTGGGCCC----CGCAGCCGGCTGGCTG---------------GTGG------------GTGGGC--------A--GGCGGGTCCTTGCT--------G-GGCCCGGT----C----------CCCTCCCCAGGT-----CAGGTGGCCTTCCTGAGGGGCTGCCCGTCCAGCCTCCCAGGCAAGACGCAGTGATGAGGTCGGCC--CGGGCTTGGGCCACCTGCATGGTGCTGGCCCTTGGTGGGCGGTG----GGGAAAGGTCAGGCTGGGCG-----CTGGGC---CTTG---     
11 Lemur_catta-NC_059130.1-167966_168042                83.4%  31.4%    ---------------------------------------GGCAGCGAGTGG-------CCTGGGGCCTCCAGACAGGTGAGAAG-------GAAGGGGCCGGGCGAGG-------------AGGGCCGTGTAGCTTGGGGC----ACCGGGCTG--TGGGCCGCCCCCGTCCCTAGGTTTGTGGACCCGCCTCTTGGG-----------------------GCTTTTGGG---CT-CCCCTGCACGGAGGCTGTGCTGTCGG-GGCCTGCACCCCGTCTTCCTCAGGACTCCCAGGACTGGGCC-CCCTTCCTGTCCC-AGCGGCTAATGGCCCCTAATCTAATTCCACGCAGGAA-GCA----------------T----GAACAG-----------TCAAAGCCTCTGTGAC-AAAGGCTCCTCACTGGGTCTGGGGTTTGGCTTTGAGTTGGTCACGTGGGACCTGGCCAGGGGTGGCCCTGGCTCTCTGCGGTCAG------CCCGTAACTTCCCGGCTGTC-CATGCACGGCCTGCCGCCCCCCAAC----CTCAGCG-------CCC---------CCCCAGCCCAGCTGCCCAGCCCCCGGCTCCTCC-CGTCCCTGTTGGGAGAGACGCTGTGACAGTCCCGCTGGGGCCCCCAGAGC-CTGGGGGTGGG-CGGGGAGGAGGCCTGGGGGCTCCCAAGGGTGGT--------CACAGGCCTGGGCACGTCCAG-----G----------GA-CGGGCTACCGTGCTCAGACTGAGGTCTGCCACCCCCCGAAGC------------------------CCCGG-C---CGAGACTCGGGCGTG-----GGAGA------------GGCAGAGCCCACCTGCTGCCCCTGGGCTGCCTGCAGTGTGACCAG----GGTGGGCTCAGTGGCAG-GAGGGC-CC---------TG------------------------------GGGCAAAGTGGGCTGGGC-TGCCCGGTGACCCTGGAGCAGCAGAGCTGTGT-----GTCCCATCCTCTGTGTCCTCTGTCCCCA-CTCCCTGAGCTGCACACAGAGCCGAGGCTCCTAGGTGTCCCACGACC-------CCAGGGG---------CTGCTG-TGGTCTTCACTGGGG----TCAGGCAGGTGGCCTTCGAGGTGGGG----G---CAGCCAGCTCAGCCTCAGGGCAGATGCC---G--TGAGGACAGTGCCCTGGGCATCG-GGCCGCAGCAGTGGGCGGAGAG--TGGCCAGGCTGGGGCTGCACAGCCGAAGGGACACAG-----     
12 Heterocephalus_glaber-NW_004624818.1-170830_171030   82.6%  27.2%    ------------------------------------------------------CAGGAAGTGAGTGC------CC-----TGA------CTGTGGGGAGGGACACTGA--TGCCACGGGGCAGACAAGGAGGCTGCGGCCTCTCACCCAG-C-----------CTCGGGTCCTTGGTG----------GC-CCCAGTGTCTCCTGGTACTTGGACCTGTG--TCCCGGCCTGGCTGCCTGGAGCCCCTGGGGTTCACACACGGGGATTCTAGGGGGCTC-CCAGGGACTCTCAGGACTGCAGC-CCCTTCCTGTCCTGGAGGCGAAAGCGTCCCTAATCTGATT--CGAGCAGAGGGGAGGCTGCCT------GCTGACCTCCAGCTGGAAAACG--AGGCAGGGCCTCTA-C-CAGGGCCCCTAATTAGGTTCTGGGCTTGGCTTTGAGCTGATTATATCCGATCTGGCCTGGTGGGTCGTGGTTCTCTGTGGCCAGG------GTTCCTGTTGCCAGGGATGC--AGGGATGGCAGGCCTGGGATGACAGGGCGGGCTTGGGCGA-GAGCACCAAACATCCTCATCCCAGTGGTGCTTGGCTGGGCATGTGG---TCAGCACA---GGG----------------CCTGGCCAGGGAGGT------GGGTGAGGCAGGACTCTCGTGTCCC-CTCCTCCCAC-CAGGGCAGCCCAGCACACCTAGCCAGCACTGCAGCTGATGTGACCGGGCCGGGGTCTGGGGCCCTT---GCTGGTAGATGGGGCTCCTGCCTGGGTTGGAGGACATCACGA-------------------GGGGCAGCCTCCCCGCATGCCAGCC---TCAGGGC--ACAGTGCAGCGATGGATAGGTCCAGAGTGGCGGCTGACTCCAGGGCCCTGGTCCCGTGGGCGAGGGGAAAGGTCGGTCTGGGGCTGGGCCTTGGGGTGGAACTGCAAAGCCCTGGCCCTGGAGTGAGGTGGAGGAGAGGG---CCTGGCT-------CAGGGACCCA------CGC-CATCCTGCCTGGCCAGGAGTCACA-G---------------------------CAG-AAAGGGGCCCTGCGCCG-----AGGCCTGCAGCGGAGGAGGTTCAGGTCCTGGGCCTGGGCTTTGG------AGCACATG-TTG----------C-TGCTTCCATCCTGCCCTCTGGTCCTCTTGC---------TT----GCCCGGGACATCC-------------------------------------------------------------------     
13 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-134847_135070        86.8%  39.5%    -------------CAGGAACCTTTG---------GCTGTTGGGGAGGAAGTGAAGACCCCATGT-GG--------------------------------------------------TGGGAACCTGATGGGACCGGGGAC-TG-------------------GCTGGGGACCCATCTGTCTCCAGGTACT---CGGACCCGCCTCCTGCCCTGGCTC--GGGCCCTGGGCTCCTTGGGTTTGGGGCTCTCCTACC-CAGGTGTCCACCTGCACTCACCTTCCTGGGACTCCCAGGTGTCTT--CCCTGTCCCCGCAGGCAACTTGATGGTTCCCTAATCTAACTCCATGGTAGAGAGTGTCGGGCCTCCTGCTGCCCTTATGCCGATGGAAGCAGAGCTTGTGACA--------CACGGCCCTGGCCAGGCACTGGAGTTTGGCTTTGAGTTGATGA-C-ACCAATCCTGTGGGTGTAGCCCTGGGTCTCTGTGGCCAG------CCAGAGATAC--TCAGCCGTCTCCTCATGGCCGGCTGCCTCCTATT----CCAG-----CC---TTGGCTCCGGCACCGCCCTTC----------------------------CCAGGCTCTGC-------------------------------------------------AGGGGGAGGAGGCTCCCTGCCCCAGACCCTGGTG-ACTGTCTCCTGGGGCCAGCACAGCCTAGGGCGTG----AGTGGGTGAGGGCTGGGGGCAC---CCGAGGGGCTTGCTCAACCTGGGCATGG---CCCAGAGCA--------GGGTAG-C---CCACATTCATTG-TTCTCTGCCCAGC-----------CCTGAGTGCCCACAGCTACCC-----------TGGTGTCCTGGCCAGGATGCCGGGGTGGAGGGCA-GAGCCC-A-----TTGCTCACGCTGCCCTGCT----CCCTAGGCCTGGGGAGCATGGGTCCAGAGG-------------GGTCCCCACCACAGTGGGAGC----TGAGGCACTGGGACAGGGTCAGCAGGAGGGACTCCCAGGGCCACAAGGTGCCCTGGAGACAC--AGCCGGCCCCCTGC--------A-GGCCCGCC----CA----C-CTTGGGGCCCCATTG-----GAGGTCCCTGTAAGTGAGGAGTGTGGGAGTGAGCTTA-GGGGCTTCTTTAGAGCCTGGGACGGAGAGAGATGGACACCACCCTTCCCACACCGGGCCCGATCACGTGCCTG----GGGACCCATGAGG------------ATCATC---CCCCCA-     
14 Octodon_degus-NW_004524689.1-171520_171617           80.1%  23.9%    --------------------------TCCTGGTCCATTTTCCA-CAGCTCAGAGCAGGATGTGTT-GG------CT-----GGG------TGGTGTGGAGGGACATCTGATGCCCCGGGGGCAGGCGAGAGGGCCGCCACATCTCACCCGGCC-----------TGGGGGACACCAGAG----------GC-CACAGTGTCTCCTGGTACTTGGACCAGTG--TCCCAGCTTGGTTCTCTGGGCCTTTGGATCCCCATAGAGGCC----TCC-----------------------AGGACCACA-CCCCTTCCGTCCCAGAGTAGAATGCACCC-TTAATCTAAT--GGGGAAGAGGGCAGGCTGCCT------GCCGACCTCCAGCCAGAAAATG--AGGCAGGGCCTCTGGC-CAGGGCCCCTAATTGGGTTCTGAGTTTGGCTTTGAGCTGATTACATCTGATCTGGCCGGGTGGGTCCTGCTTCTCTGTGGCCAGG------GTTCCTGTTGCCAGGGATAC--TGGAATGACAGGCATGGGATGACAGGGCATCCTTG------------------------TCCCAGTGGTGCTTGACTGGGAGTGTGT---GGCCAGCGGTGGGG----------------CCTGGCCAGCAAGGC------AGCTGTGGT-GGGATCCAGAGTCCT-CCCCTCCCAC-CCAGGGCAGCCCAG----CGAC----------TCCTGC--AGCCTGCCTGGCGTTCTGGGGCCCTC---GCTGGTACATGCGGCTCGTCCCGG--GCAGTCACCCGCTCAGGTTGGGGAAGTGGCCCGGGTGCCACCCCAGGCTGGTGGACGCTT---CCAGGC-----------------TCTGGCCCCGGGGTGAGGGGAGAGTCAGTGTGG----------------------------------GTCTGGGCAGTGGGGTGGAGCCCCAGAGCCCCG------------GCCAGAGGAGACAGTGCTCAGGCT-------CAGGGCCCCC------ACC-CGTC-TGCTGTGCCACGGGTCACG-TGGAACGGGGTCCCT-TATCCC---AACTGG-ACAAGTGCCCGGCACTG-----AGGGCTGTGGTAAAGGAGGGCC-CAGCCTGGGCCTGGACTTTGG------GGTGCCTA-TTG----------C-TGCCTCTACCCCACCTGT-GGCCCTCTTGC---------TC----CCCCAGGACAGCAGGGAGCCACTCAGAGGTGTCTGGAAGTGTGAGGGACTGCGT----------AGGCAGCA-AGGGCTT     
15 Leopardus_geoffroyi-NC_059328.1-180670_180771        82.1%  28.5%    --AGGCTTTGAGGC-------------------------------AGGAGGGGATGCCCCAGCGTCAGGGAGGGCCCGCCGATG------GAATGGGGCCGTGACACAGGACCGGCAG-----------------------------GTGTGG---------CCTGGGGAGCCAGCCTCGGACCCGCCTCCCGGCCTCCTGCTCTGGTCCCTCTGCCCCGCTCCAGCTGC---CCCCCCGAACACGCAGATGCTGTCAGGGCTCCGCAGCCGCGTCT--CCT------GGAGGAGACCCAGGAC-CCTTTCTCTTTCTAGAGGCTGGTGGCTTCCTAACCTGATTCCACATAGCGCCGCC----------TCCTGAAGGGACGGACT-----------CGGAGCCGCTCTGGCA-AAGGCTCCTAAGTGGGTTCTGGCATTTGGCTTTGAGTCGACTGCGTTGGCTCTGGTCGGGTGGGGCCCTGT-TCCCTG------TGGTCAGCCCGGGACGCCCATCACTAGCTCCTCAAGGCCTGCCACCTCCCCAC----CCCCGGCCCCC---CCGCTCCGACCTCG---------GACC------------GGCTT--GTGCCCAGCTCTGTGG----------------CCCAGGCCCCAGCCACTC-GCCTCTGTGCT-GGGGACGGAAGGGTGACAGCCCAGTGATGCCTGG-----GTAGAGGGCACGTGGGGGAC-----C--A----------GGGGCTCGGGGGCTCAGCGACAGACGGGCTCCGAGGTCCTCGGGACCG---GGC---------------GCCAG-T---CCTCGCGGCCGCTGGGTCGATGTGA------------CCGTGAGGTGGGGTTCTGCCCCTCGGGCCTCGGGCCCTGGGAGAG----GGGGGCGTGCCACCCTG-TCTG---TCTGTCTTTGCCCGGCTCTCCTCCTCGTGCCCAG-AGCTGCCCG-CCCCAAAGGGCTGTCC-TCCTCTGGGCC--TTCGCT-GGTGTCGCCGTG---AGTGGGCCTTGTGTCTGATCAGCGGGTGTG-CAGGCAGGTCCTCCCTGGGCCCGGCTCTCCCCCACCAGGCCGGGCCCGCCA---AGGGAGGGCAG----------C-CTCTGGGGGCAGAGC--TCGGCGACGAATGCGCCCAGGGCAGTGG------GCCACCTC-----------C----------------------------------------------CGGAGCGCTCTGCCCCAGGGGCTGGTCCTTGGGAGCTGAGGCGGCACAG---CCG----     
16 Nannospalax_galili-NW_008355419.1-161505_161718      82.5%  24.2%    -----------------------------------------------------AGAGGATCACGTGGC------CCTGGAGCAC------TCAGAGTATGTGCCCCATCTTGGCCAGCCTTAGGCTCCTGCAGCCCTCTAG--ATACTTGGA----------------------CCTCT--------TCTT-CCCCAGCTTCGGCTTCACAGCTCCCTGGGGATTCTGGGAGCTGCCTATACAGGTGACCACACCGTCAGCATCTCCTGTGACCTGTCTCCCTGGGGACTGATAGGACTTTTGC-TCCTTCCTGCCCTAGCAGCAAATGGTTCCCTAATCCAATTTGCAGCAGAAAGGGCCTGTC------------GACCTCCAGCCAGCAGATG--AGGCAAAGC-TTCGGG-CCAAGCTCCTAATTGGGTCCTGGGTTTGGCTGTGAGTTGATTACATCAGATCTGGCTCAGTGGGTCCTGGTTCCCTGTGGCTGAG------CTGCCTGTTGCCCAGGACAT--AGAGACAAGCAGGCTGGGGTTAACAAGGTGGGCTGGCAAG--AGGACCCAGGGTACTTCTTGTGGGGGTACTGTGGGTATAGGATGT---GGTCATTTGATTCC----------------CAAGCGATGCTGCCCCTTGCCAGTAACAGGAGCCTGGTGGGGGTTGGCAGGTAAGATGCCCATGACCCCAAGACAGTGAAGCCCACC-CCCACTTCTGTTCT--CACTATA-TCCCACCCCCTGGTTGCCCAGAGTATGGAATACAGCACTGAACCA--ACACTGCCAATGTGTCTTAGGTACTC---TGCTACCCCAGGGTTGCCTGTGGTT---GGTGTGG--AGTGGTGACCTCTACTTGGT--------------TCC----------ATAGTCAAGTC---------CCTGGCAGGTGGGAAGATCTTCCCTGGATCCTGGGTCCTCTTCCCTGTCAGGAGACTGTTATGAGGGATCAGGCTGCCCAGGT----------GTAC-CC------AGC-CTGG-GGT-GCAGCATGCAGTG----ATGAACATGCT-----CTGGG---TGCTGG-GCCACCTCCATGGCTCT-----C-ACC-TTAGTGGAGGAAGGTCATCCTGGGGGCGGGGGCCTTGGCCTTGGGGTGTCAG-TTG----------C-ATAGGGGA-GTTGCAGAAGGTTCA-----------------------GGAGTCCTACATCCTCC-------------------------------------------------------------     
17 Phoca_vitulina-NW_022589705.1-180224_180345          81.3%  29.1%    ------------------------------------------------------------CCGTGTCGGGGAGGACAGCTGATG------GAATGCAGCAGTGACGCAGGACAAGCAGGTGGGGGGGAGCGGGGACCACCCTTGGACCCATGG---------CCTGGCCCC--CACTCTGGTCCTGATGCTCCCCGGGGGTTTATGGTCCCCTTGCCCCGCTCCGATGCCCC----CCACTCGGCGCAGAAGCTGTCAGGGCTCCGGCAGCCCCCACCTTCCCGAGGAGGCCCAGGACCCACTC-CTTTTCCCGTTCCAACAGCTTCC-------TAATCTAATTCCACACAACACTCCT----------CCTGCAAGGGACCGAGT-----------CAGCGCCGCTTTGGGA-AAAGCTTTTAATTGGGTTCTGGCATTTGGCTTTGAGTCGATTATGTTGGATCTGGTCAGGTGGGGCCCTGGCTCTCTG------TGGTCAGCCCAGGATGCCCATCGCTGTCTCCTCATGGCCTGTGGCTTCCCACC----CTCTCTGACCT---TGGACCAGGCTGCCTGTGACCAGC-------------------------------TCTGTGG----------------CGCAGGTCCTGGATCCTC-TCCTCTGCGCT-GGGGACAGAAGGGTGACCGTCCCTGTCTCAGCAC-----AGCCCAGCGAGGCCCGGGGCTGTTCTTGT----------GGTGCTGGGGCAGAGGGCACAA-GCAGGCTAGGGGCTCATGGGCCCA----GTG---------------GGGGG-A---CCAGGCCCCAGTCCTCACCGTAGCC------------AGTAGTGGTGGGGTTCTACCCCTCGGGGCTCTCACCACCCATCTGCCAGGCTGGCCTGCCCCCCTC-TCTG---T-TCTCTTTGCCT------GGCTCTCCTGCCCCAGAGCTGCCCG-G-AGTGTGGT------------CGGCCA--CCCTGA-GGACTGTCCTTG---TCTGGGCCTTGTGTTCAGTCTGCGGATGGG-CGAGCGGGTCTTCCCTGGGCCTGGCTCTCCTCCCTTAGGCCAGGTCCTTCA---TGAGGAGACCCAGCCCAGCCCA-GCCTCTGGGCAGGAC--TCAATGATTAATGCACCGAGGGCCGTGG---GCCGCCACCGC-----------C----------------------------------------------CAGAGAGGTCAGGCCTTGGGGCTGGTCCTTGGGAACCGAAGCTGCACAG---CCAG---     
18 Ailuropoda_melanoleuca-NC_048228.1-180708_180808     81.5%  31.1%    -----------------------------------------------------------------TCGGGAGGGGCAGCTGATG------GGATG-----GGGGCAGTAACGTAGAACAAGGGGGGGAGTGGGGACCACCCTCGGACCCATGT---------CCTGGTCCC--CACTCTGGTCCTGATGCTCCCCAGGGGTTTCTGGTCCCCCTGCCCCGCTCTGAGCGCCCCCCCCCAAGTCGCGCAGAGGCTGTCAGGGCTCCGACAGCCCCTATCTTCCAAAGGAGGCCCAGGACCCACTC-CCTTTCCTGTTCCCGAGGCTGACAGGTTTCTAATCTAATTCCA---CACGGCACT----------CCTGCAAGGGACCGAGT-----------CAGCACCGCTCCGGCA-AAGACTCTTAATCGGGTTCTGGCGTTTGGCTTTGCGTCGACTATGTTGGGTCTGGTCAGGTGGGGCCCTGGCTCTCTG------TGGTCAGTCCAGGATGCCCATCGCTGTCTCCTCATGGCCTGCGGCCTCCCACC----CTTTCCGACCT---TGGACCAGGCTGCCTGGCCTCTGGCAC------------CTGCTGTGACCAGCTCTCCTGGG----------------TTCGGGTCCTGGCTCCTC-TCCTCTGCGCT-GGGGATGGAAGGGTGACCGTCCCTGTCTCAGCGC-----AGCACGGCTAGGGCCGGGGCTGTTCTTGC----------GGTGCTGGGGCACGGGGTGCAGGGCGGGCTAGGGACTCATGGGCCCA----GCG---------------GCAGA-A---CCGGACCCCAGTCCTCACGGCAGCC------------GGCTGCAGTGGGGTTCTGCCCCTCAGGGCACGCGTCACCTGTCTGCCAGGCTGGCCTGCCCCC-TC-TCTG---T-TCTCTTTGCCTGGCTGTCCTCCTCATACCCCAGAGCTGCCCG-G-AGTGTGGT------------CAGCCA--CCCTGA-GGACTGTCCTTG---TCTGGGCCCTGTGTCCGGTCAGCAGATGGG-TGAGCGGGTATTCCCCGGGCCCGGCTCTCCTCCCCTAGGCCAGGTCCGTCA---TGAGGAGGCCCAGAGCAGCCCA-GCCCCGGGGCAGGAC--TTGGTGATGAATGTGCCCAGGGCAGCAG---GCCGCCACTGC-----------C----------------------------------------------CAGAGAGGTCAGGCCGAGGGGCTGGCCCTTGG---------------------------     
19 Hipposideros_armiger-NW_017731634.1-165225_165311    80.5%  27.9%    TTGGGTAGGAGGGAGGTCCAGTGTCGTGGCGGGACGGCTGCTGGAATGGGGCAATGACCACAGG-ACC---AGCAGGAGAGGCGGTCTGGGAGTGTCCCCTGGTCCAAGGCGCTGAGAGCATGGGCCACTAAGC--CTCGTCCAGGCCGGCC--------------------------------CCCGGACCGCAGGGTTTCTGGTTCCCCTCCTCCAG-CTCCCCA----------GTGCAGGCGGAGACACTGTCAGGGGCT-CCAGCAGCCCGTCTTCCTGAGGACGCCCAGGCCTGGCTCCCA------------GAGGCTAATGGCTTCTAATCCAATCCCACA---ATCCCACG----------AGGAAAGGCCTTTTGCG-----------AG-GGGCCGGTCACAG-CCTCTTTGGCAA----------------------AGGCTGTGAACTGGGCTCTGC-----------CCAGGCCCTGAGTTGATGACGTCAGCCCAGCGTGCCCATCGCTATCTCCTCAAGC--TTCCGCCTCCCACC----CTCCCCGACCT---TGGACCCCAGTGGCTGTACCAGGCTGCCCAGCCTTGGGCACCTGCAGTCCCCAGCTCTGTGG----------------CCTGGGCCCCAGCTCCTC-CCCGCTGTGCC-AGGGTGGGAAGTGGGCCTGCCCCGTC---TGCAC-----AGCCCAGGAGTGGTGGGGTTTATAGTAGT----------GAGAATGGGGCTCGTGAGGGCAGC-----ACATGAGTGCACTGCCCAC---CTC---------------CAAGC-C---CAGCACTGC-CACAGGTTGCCGGGG------------ACATGGAGACCCGTGCTGCCCCTGTGGAGCCTGGGCAAGGGGCATGG--AGGGGGCTGGGGGCACG-TGGTCCCTGTGGCAGAAGGACCAGG-----------------CCCCAGGCC-CCACTGTAGC----------CAGTTACT--GTGACTGTGGGGTGGGTTC---TGCCCCTTGAGCCTCATGCCATCTGTCTGC-CACGCTGGCATGCCCTGGTGGCCTGTGGCTC-CGGTGGCCCCTGGACCACG---AGAGGCAGGTG--GGCCTTCTC-TCTGTCTCTCCCGCT--TGCCCGCCGCCCC----------------------------------------T------------------------CCACATGGCCCTTGTCTGGGCCTTAACTGGTGTGGCCT--TGGCTGGGCCTTGTGTTTGGTTAGCCCCTCC---C------     
20 Chinchilla_lanigera-NW_004955486.1-168978_169074     82.2%  23.8%    --------------------------------CCCATTTTCCA-TGGCTCAGAGCAGGATGTGAGTGG------CC-----GAG------CTTCCTGAAGGGACATTTGATGCCCTGAGGGCTGGTGAGGGGGCCACAGCATCTGACCCAGCC-----------TTGGGGACACCAGCG----------GC-TGCAGTGTCCCCTGGTACTTGGACCTGTG--TCCCAGCCTGGCTTCCTGGGGCCTCTGGGGTCCTCACACAGGGCTTCCA-----------------------GGACTGCGG-CCCCTTCCGTTCCAGAGCAGAATGCATTCCTAATGCGATT--GGGGTGGAGGGCAGGCTGCCT------GCCGACCTCCAGCCAGAAAATG--AGGCAGGGCCTCTGGC-CAGGGTCCCTAATTGGGTTCTGGGTTTGGCTTTGAGGTGATTACATCCGATCCAGCCGGGTGGGTCCTGGTTCTCTGTGGTCAAG------TTTTCTGTTGCCAGGGATAC--AGGGATGGCAGGCCTGGGACGACAGATGTCCTTGTCCTGTCTGGGACCAGACATCCTCATCCCAGTTTTGCCTGGCTGGGTGTGTGT---GGCCAGTAGCAGGG----------------CCTGGGCAACGAAGT------GGTGGGGGTGGAACTCCAGTGTCTT-TTCCTCCCAC-CCAGGGCAGCCCAG----CGACCGCCCACAGCTGCTGC--AGTCTGCCTGGGGGTCTGGGCCCCTT---GCTGGTAGAGGTGGGCTCTTCCCTAGGCAGTCACCTCCCCAAGCTGGTGGCCATCAGG---AGGGATAGCTGCCTGCATGCCAACT---CCAGGGC--ACAGTGCAGCTACAGATGTGCCCAGGGTGATGGCTGCCTCCAGGGC-----------------------------------TCTGGCCCCGAGTGGTGGAGCCACACAGCCCTGGGCCTGGAGGGAGGTAGAAGACATGGGGCTCAGGCT-------CAGGGGCCCC------ACC-ATCCTGCCTGTGCCAGAGGTCACA-GGGAACGGGGTCCTTCGTACCC---TACTGG-ACAAGTGCCCTGTGCTG-----AGGGCTGCAGCGGAGGAAGGCC-CGGCCTGGGGGCGCATG-------------------TTG----------C-TGCTTCTACTCCACCTTCAGGCCCTCTTGC---------TT----CTCTAAGATGGCAGGGAG--------------------------------------------------------------     
21 Physeter_catodon-NC_041216.1-181635_181767           79.1%  27.0%    --AGGCTTTGGGGCGGGAGTGTGTGGTCCAGGGCCACGGAGGGGATGAGGGCAGTGACCACAGG-AAGGGTGAGCAGGAAGGAGGGGTGGGCATCACACGGGGTCCAGGGCACCGAGAGTGTGGGCCACTGGGC--CTCGGCCGGGGCCATCCCTGG-------------CCTTGCTCTGGTCCTGATGCACCCGGGGCTTTCTGGTTCCCCTTCCCCGCC--------------------------GCCCATCACAGGGGCTCCGGCAGCCTGCGTCTTCCTGAGGACGCCTAGGACGGAGTCCCCTTTCCAGCTCCGTGCAGAGCCACCTTCTGCAGGGACGGAGCC-------------------------AGT----------------------G----CCTCCTGGGC-AAAGCTCCTAACTGGGTTCGGGCATTTGATTCTGAGTCGATGACGGGAC------------------------CCTGGTTCTTGTGGTCAGCCCA-GGTGACCCGTCCTGTCTCCTCAGAGTCTGTG-CCACCTACC----CTCCCTGACCC---TGGACCCAAGGGAGTGTCCCAGGCTGCCCGGCCTCTGGCGCCCTCTGGCCCTGGCTCTGTGG----------------CCTGGCCC-GGGCTCCGC-CCCTCTGGCTG-CCGGGGGGAAGGCTGA------GGGCCCCGGCAC-----AGCCCAGGAGCAGTGGGGTTTATGGCAGT----------GAGGACTGGGGGGTG------------------------------------------------------CTGGC-C---CAGCACTGC-CACAGGCGG--CCTG------------GGACACGGATTCATGCTGTCCCTGCGGTGCCTGGGCAGGGGGCACAG--GGTGGGCTAGGGGCTCG-TGGGCCCAGCAGCAGGAGGAACGTGAGGTCTTCGGGGCAAGACCCAGTCCT-CCC-CGCTGC----------CGCGA---------CT-GGGGTGG--GTT---TCTGCCCCCGGCCTGTGTCCCCTTGTCTGC-CAGGCTGGCCTGCCCTGGGACCCTCTGACGCCCGGCAGCCCCTGGCCCCCA---GG-AGGAGGGGATGCCACCCGC-CCTGCCTCCCCTGGT--TGCCCCTCGTCTGGGCCTTAGCTGGGTG---GCCTTGACTGGGCCTTGTGTTGG------------------------GTCAGCAGGCAG----------CAGGCAGGTCTTCCCT--GGGCCCGGCCCTCCTCCTCCAGGACAGGTCG---GC-----     
22 Camelus_bactrianus-NW_011514262.1-167641_167684      82.8%  28.8%    ----------------------------------------CAGGAGGGGTG---------------------------------------GAGTCACGCCCGGCCCAGGGCACTGAGAGTGTGCGCCATCGGGC--CTCAGCCAGGCCTGTCCCTGGACCTGCCTCCTGGCTCTGGGCTGGTCCTGTTGCTCCCCTGGGGTGTCTGGGTCTCCCTCC--------------------CTCCAGAACCCCCAAGGCAAGGGGTGCCGGCAGGCCCCATCTTCCTGAGGACACCTGGGACTCCTTCCCCTTTCCCGTTCCAGAGGCGAGAAGCTCCCAAGT-------AGG---ACTGCCTC----------TGCGAGGGGCCGACCAG-----------TGCCTCTTGG---GCA-GAGGCTCTTAACTGGGTTCTGGCGCTTGGCTTTGAGTCCGTCACAGCGGGCCTGGCCGCTGGG---------GCCTGGTCCTCGTGGTCAGCCCAGGCGGCCTATCGCTGTCCCCTGAGAGCCTGCTGCCACCTCCC----T-CCCTGA-CC---TGGGACCTCAGCCAGTGTCCCAGGCTGCCGGCCTCTGGTGCCTCCCGTCCCTGGCTCTGTGG----------------CCTGGGCCCCCGCCCCTC-CCCTCTGCACT-GGGGAGGGCAAGGTGACTGCCCCTGTCTCAGCAC-----AGCCCGGGAGCAGTGGGATTCATGGCATG----------AGGATGAGGGCT----------------------------------------TG---------------CAAGC-C---CAGCACCGC-TACGGGCTGCTGGGG------------ACACAGGGACCTGTGCTGTGCCTGCGGTGCTTGGGAGGGGGCT--CC--GGGGGGCTGGGGGCTCG-TGGGCTCAGTGGCAGGAGGACCCTGAGTTTCTGGGGACAAGGTCCCCGTCC-TTGCTGCTGC----------CAGTTGCT--GTGGCT-GGGGGGGGGTCC---TGCCCCTCCGGCCTTGGGTCACTGTATGCC--AGGCAGGCCTTCCCTGGGAGCCTGGGATACCCAGCGGCCCCTGGCCCACG---GGAGGAGGGTGTTATCACCCTC-TCTGTCTCTCCTGCT--TGCCCCAGAGCTGCCCACGGGGC-AGAC---GGCTCCTTCTGGGCTCTGCTGCC------------------------CTCAGCTGCCCTTGTGTGGGCCTTAGCTGGTGTGGCCT--TGACTGGACCTTGTGTCTGGTTTGCTGGAAG---CG-----     
23 Dipodomys_spectabilis-NW_024870976.1-160074_160254   83.4%  26.1%    -------------------------------------------------CGAAGGGAAGTCTGATGCA------CC---GTGAG------CGGGCGTGAGCTGCCCATCCTGCCTTCC-TTGGGGT-------CCCTGGTG--GCCCCAGGGC-----------CTCGGGTTTGTGTCC--------CCAT-CCCCTGCTCTGGCACTGCTGCTTCCTGGGAGCCCTGGGCTCCCCATCCACGAGTAGCCACGCTGCCAAGGCCCTGTGGCCCCTC-----TCTG-GAGTTCCTCAGGACTCAG-TCCTTCCTGTCCCGGCTGCTAATGGTTCCCTAATCCAATCTGAGGCAGAAAGGGCATGCTGCC------TCCGACCTCCAGCGAGCACACG--AGGCAGGGCCTCTGGC-CAGGGCTCCTAATTGGGTTCTGTGTTTGGCTTTGAGTTGATTACATCAGATCTGGGCTGGCAGGGCCTGGTTCACTGGGGTCAGA------CTTCCTATGGCTAAGTACGT--GGAAATAACCGGGGCTTGCA-GGC---TGGGCCAGGCAGG--AGGAACGAGGGTCCTGGTCAACGTGG-GCTGCTGTGGGCTGGGGT---CCTCGGTGGGGTTC----------------CCAGGGCACAGCCTGCCCTGCTGGCACGGGGCCTGGCATGGGGGAGGCAGCCCC----GGGGAGAGCGGGAGGGCTGTATGGTTCCTTCCCCTTCCACCGCC--CCTAATGGGCCTGTGGCTAG-----GTGGGGGGCCAGTGGCAGCTG----------TCAG-----------GTAGGTGGGC---TGGGTC----CCC---TCCTTGGGT---TGTG-------AGGGGCAGCCTGCCCGGG-------CATCGTAGCCTTGGGCATAGGTGCAGCAGTC---------TATGTGCTCTGGGCAATGGGTCACTAGCACCTCTGGCCCTAAAGGTCAGACCTGGGCGACCTTGGGGTAAAGGCCCCACAGCC-------CAGGGACCTA------GA-----------GCAGAATGAAAGAGA-CAGGAAGTGGCAGAAGGCTCGG---AGACCT-CCCACCGGCCTGTGTTA-----AGAACTGAGATGGAACATGGTCCCTGATACCTTGGGTCCAGCTCCCCAGGCTGGGCAG-TGG----------C-CCCGCCCCGGCTCAGCTTTGGCCTCCAGCC---------TCCGAGCCTGGGCCCTGGATGCTGGG------------------------------------------------------------     
24 Trichechus_manatus-NW_004444058.1-161239_161309      88.8%  37.6%    -------------------------------------------------GTATAGGCCATGGGA-TC----------------T-------CAACCAAGCTGGGGTCCACCAGCTGTGGGATCCCTCCCCAGCCGTGGCTC-TGGTCCAGGAAG--------GGAGGTTTATGGGCCTTGGTTCTGACACTCCTTGGGGATCCCCCCAGACCGCTGGC--AC----AGGCA-----------GCAATGCTGTTGGGGGGGGCATCCAGGAGCCCCGTC-TTCCTGAGACGCACAGG----CCTCCCCCTTCCTGTTCCAGGGGCTAATGGTTTCCTAATCCAATTCTGAAGCAAAATATGCAAAGCCGCTG----ACCGCCCTCTGCAGATAAGTCAGTTAGGGCTTCCTTGACAAAGGCATTTAACTGGGTTCTGGAATTTGGCTTCCAGTTGATCACA-CTGGCTGTGGCTGGGGGGG------TTCTGGGTTCTCTG------GTCCAT---------GTCCTCTCTGCCTGCATTTCTGCCTTCTCAG----TGAC-----CT---TGGTCCCCTGCAGCTCTGCCAG---------------GCCCTCCCTGTTTTGGGCTCTCCGG----------------------CCCCTCCCTCTG---TGCAG-------AGCGCAGGGGTTAAC-----CACCCATCGTAGACATTTCTGACAGAATCATGGGAGCCTCAGGACAG----CCGGGGAGGGGAGGTGGA--------------------GGCTCCTGGGCATAG---TCAGTAGGG--------TGGGCGGC---CAGCACTCATG--AGGTCTGCCCATGCCAAAGCCCAGGCACTGCCTGCAAAGCTGCCCCTGGAGACTGCCGGGCTTCCAGCAGGACCCTGGGATGGGTGAGGC-AGATGC-C-----TGGCCGGCCCTTCGAGGCC-------TGGCAGTGCCCATGCAGAAGGAACAGGGT-GGGCATGGGAACTGGGCTT----GAGGGCCC----CACGGGTGGGTCCTTTGCACAGTGGGTGGCCAGG----------ACTGTGGTCAGTCAGCAG--CAGGGGTCCCAG----------A-GCTGTCCC----AA----C-CCTGGGGCTTCTGTG-----CAACCCCCAGATGCCCCCAACCAGGAGGATGGTTTGCCAAGC-TGGTCTGGGGGTGAGGTAGGCTG-GGGTGCCCAGCAGCACCCCAGCAGTCGGCCC----------TAG----TGGCCGAGTCCCCTCTGTCT----------------TTC--     
25 Urocitellus_parryii-NW_020540697.1-272982_273164     82.7%  26.7%    -------------------------------------------------------------CCCTGGA------AC---ACCAC------GGGTATGGGCCTCGCCCTCCTGCCCAGCCTTGGTGTCCAGAGGCCCTGGCA--TCCCCAGAGC--------------TTGGCCTGCTTC--------CTCT-CCCTGGCTCTAGTCCTACTGCTCCCTGGGGGTTCCAGGCTCCCCCTCCCCAGGTGGCCATGCTGTCKGGGGCTCCTGCCGCTTGTCTTTCCGG-GGACTCTGGGGCTCATGC-CCCTTCCTGTCCCAGTGGCTGAAGGTTCCCTGATCCAATTCAAGGCAGAAAGGGCAGGCTGCT------GCTGACCTCCAGCCAGCAGATG--AGGTAGGGCCTCTGGC-CAGGGCTCCTAATTGGAGTCTGGGTTTGGCTTTGAGTCGATTATATCGGATCTCTGTGGCCAGCTTCCTGCTGCCCAGGGACAGG------CAGGCCAGGGCCACTCGGGC--TGGCTGGGACAGGAGGCCCAGAGG---TCCTCCTYACCGT--GARTGCTGTGGTCRTACAACA------GCTGCCCCCGGCAGGGCT---GGCCTGTGCTGTCG----------------TGTGGGGCCTGGCG-----------GGGGGAGCTGGCCAGGGAGAT----GCCC-----AGAGATCCCGGAGGTGTGGAGGCCTCCATTTCCCTCCTCTGCC--CCAGGGCAGCCCGAGCACTGTTTGCTCCTAGGACGTGTGGCTKCCCTGGGGCT--GTCTGGGCAG---CTTGTGGCTCCAC---TGGGACCCTTGGC---CACTTGGCT---GGTG--G--ATAGGTGGGCCCTCGTGGGG---------CCTGACCCCTTCCCAGGTCTGGAGGCGGC---------ACAATGAAGTGGTGACTGTGCCCCTGGAAACAGCTGCCCCATGRCTCAGCCCTGTGGGCG--TGGGGA-AAGGCCAGGCTGGACGGCCAGCAGGGGCCTA------GGG-CTGG-GGA-GGACCTGGGGAGCCA-CAGACAGAGCTCAAGGGCCCTG---GGCTCA-C-----CCCCTGTGCTG-----GGAGCTGGAGCAGAGAGGTGTCCTGTGTGACCTGGGAGAATGGC------CTGGGSAA-GTG----------G-CCTGCAGAAGCTGGTCACTGGGCCA------------------GGCTTTGGGAAAACATGCTGCCACT---------------------------------------------------------     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .                                                                                                                                                                                                                                              .                                                                                                                                                          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .