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 1 Target                                                100.0% 100.0%    --------------------------------------------------------------------------------------TCGGGGGGCAGGCCCAGGACCCCTGCTTCCCAGCAGCCACCAGGGCCAGGCAGTCAGGGTGGGCCGGTGCAGCCCAGGTGCGGGGGC--TGAGCCCAGG---GGATCACGGG-CGCATTCCTC-T--GCGTGTCACCGTGGGGCCCGCAGAGCCCTCCCATGCACTCTCCCCAACTGGGGTGCAGCCCCGTCTGCCCGT----------------------CTGTCCACCC--ATCC-GCCC--------ATCTGGGTGCATCTGTGTGGGAGGCTTCTCCAGGCCCAGG-GCTGAAGCCGGCCAGACCC-TT---------GAG--------AGCTGGACCCTGGACACCA--------------------GTGTGGACACTGGCTCCCGTCACCTCCTCAGAGCAGGCCTGGTGG-CCTTAGCTGCC-----TCTGTCCTGCCCGT------------------------------------------CCCTCCCTGTCCACCTGTGTCCAGCCAGCGCCTGCTACGTGTTGGATCATGGCCTCACAGG-GACAGAGCAGGGAGGAGGACT-TCGAGGTCCCTGCCCCAGGGA-TGTCCCGGGGTCAGGCAGTGCTCTGAGGACTGGGGAGCCCCACTGTGCTGTGCAGGGACCTGGGGGAGCAGCAG----------GTGAGCCAGGGCC-CTCCTCTCCCCGACGGAGCCT-------------ATATCTGCC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C--GACCAGGACTGC-CGGC-----------CCTTCCCAGTCTGGCCTC---TGGTGTGGGCCCACAGCCAGGTGCATTGCTACAATCCCACCTGAGCTCCCACATCAGGTGTCCTGGCTCAGGCTCACG-----GGAGGGGCCGAGGCG--GCCTGGGG---GTGGGTGTGGACCATGGCTGAGGGCTGGGCCCCTGTGTGGAACCACAGAGCAGAGCGTGGCTTCTTCGGCCTCCCTGTGGGCTTTCAGGATGGCCGGGCCCTGGCTCAGGGCA-----------------GGCAGGGTGAGCATGAGGGCCCGTCAGTGCAGGCTGTGGGGCTGGGCTCG------------------CCTGCCGGCATGGGGGTGGGGCAGCCCCCTCCGTGACCTTGTGTGGG-GGCTGGGCTGGGCCCTGGGCCGGCTCACAGGCAGCACGTGGGGAGGGGTTCTTAAGTCTCTGGGCCTGGGCCC--------------------     
 2 Trachypithecus_francoisi-NW_022681457.1-192396_193357  96.8%  86.1%    ----------------------------------------------------------------------CAGTCAGGGCGAGCTGGTGCAGCCCAGGTCCAGGACCCCCGCTTCCCAGCAGCCGCCACAGCCAGGCAGTCAGGGCGAGCCGGTGCAGCCCAGGTGCGGGGGC--CGAGCCCAGG---GGATCATGGG-CGCCTTCCTC-T--GGGTGTCACCGTGGGGCCCGCACAGCCCTCCCGTGCACTCTCCCCACCTGGGGTGCGGCCCCGTCTGCCCGT----------------------CCATCC-----------GCCT--------GTCTGGGTGCATCTGTGTGGGAGGCTTCTCCA-----------------------GGCCC-TG---------GAG--------AGCTGGACCCAGGACACCA--------------------GTGTGAACGCTGGCTCCCGTCACCTCCTCAGAGCAGGCCTGGTGG-CCTTAGCCTCC-----TCGGTCTTGCCCGT------------------------------------------CCCTCCCTGTCCACCTGTGTCCAGCCAGTGCCTGCTGTGTGCCGGGTCATGGCCTCACAGG-GGCAGAGCAGGGAGAAGGACT-TTGAGGTCCCTGCCCCAGGGA-TGTCTCGGGGTCAGGCAGTGCTCTGAGGACTGGGGAGCCCCACTGTGGTGTGCAGGGACCTGGGGGAGCAGCGG----------GTGAGCCAGGGCC-CTCCTCTACCCAACGGAGCCT-------------GTATCTGCC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTTGACCAGGACCTC-CGGC-----------CCCTCCCGGTCTGGCCCC---CGGCATGGGCCCACAGCCAGGTGCATTGCTTCAATCCCACCTGAGCTCCCACATCAGGTGTCCTGGCTCAGGCTGACG-----GGAGGGGCCGAGGCG--GCCTG-GG---GTGGGTGTGGACCATGGCTGAGGGCTGGGCCCCTGTGTGGAACTGCAGAGCCGAGCATAGCTTCCTCGACTTCCCCGTGGGCTTTCGGGATGGCCGGCCCCTGGCTCAGGGCA-----------------GGCAGGGTGAGCATGGGGGCCGGCCAGTGCAGGCTGTGGGGCTGGGCTCG------------------CCTGCCGGCATGGGGGTGGGGCA-CCCCCTCCGTGACCTTGTGTGGG-GGCTGGGCTGGGCCCTGGGCTGGTTCATAGGCAGCACGTGGGGAGGGGTTCTCAAGTCCCTGGGCCTGGGCCCCTGCCACATCTCTTG-----     
 3 Saimiri_boliviensis-NW_024100927.1-178939_179892       89.1%  60.9%    ------------------------------------------------------------------GACAGGGAGGACCACCCAAGGTCAGGAACAGGTCTGGGACCCCTATTTCCTAGCAGCTGGTAGGACCAGGCAGTCAGGGCGAGGCCGTGCAACCCGTGTGTGGGGGC--CGAGCCCAGG---GGGTCACAGG-TGCCTTCCT-----GGGTGTCACTGTGGGGCCCGAAGAGCCCTCCCGTGAACTCTCCCCAAGTGGGGTGTGGCCCTGTCCACCCTT----------------------CCATCCGCCC--CTCT-GCCCGTCCGTCCATCCGGGTGCATCTGTGTGGGAGGCTTCTCCCGTG------------------------------------------------------------------------------------------TGGGCGCTGGCTCCTGTCACCTCAAAG---CAGGC-CTGCTG-GCCTTAGCCGCCCTGTCCTGCCTGTCCAGT------------------------------------------CCCTCCCTGTCCACCTGTGTCCAGCCAGCACCCTCTGTGTGCCTCACAGGGACA-----------GAGCAGGGGAGAAGGACT-ATGAGGTCCTTGGCCCAGGGATGTCCTGGGGGTCAGGTAGTGCTCTGAGGACTGGGGACCCCCACTGTGGTGTGCAGGGACCACGGGGAGCAGCGG----------GTGAGCCAGGCCC--TCCCACCCCTGTGTCCTCTCCCCCGAAGAGCCTGTATCTCCC-----CTCCGCTC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCCAC------------------------------GGAGCCCCTGTCTCTCCCTGACCAGGACTCT-CAGCTTCTACCATGGCAGGTGCAGGTCCGCCTC---TGGTGCCGGCCCACGGCCAGGTGCGGCCCTTCAATCCCACCTGAGCCCCGGCATCAGGTGTCTCGACTCCGGCTCACG-----GGAGGGGCCGAGGCA--GCCTGGGG---GCGGGTGTGGAGCATGGCTGAGGGCTGGGCCCTGGGTG-GAGCTGCA--GAGCAGTGTGGCTTCCTCGGCCTCCCTGTGAGCTTTCG---------GCCCCTGGCTCAGGGCA-----------------GGCAGGGTGAGCGTACGGCGGGTCC-T-GGAGGCTGTGGGGCCGGGCTTG------------------CCTGGTGGCACGGGCGTGACC-----------------TCGTGGTGGGGGCTGGGCTGGG-------TC---TACCCATAGGCAGCAGGTGGAAGGTTCTTAAGTCGCTGGGCTTGGGTCCGTCCCACGTCCCTGGCCTG-     
 4 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-99970_100469            76.9%  55.4%    ----------------------------------------------------------CACCG--AGACAGGAAGGACCACTCAAGGTTAGGGGCAGGTCTGGGACCCCTACTTCCCAGCAGCTGGCAGGACCAGGCAGTCAGGGCAAGGCCGTGCAGCCTAGGTGTGGGGGC--TGAGCCCAGG---GAGTCACAGC-TGCCTTCCT-----GGGTGTCACTTTGGGGCC-CAAGAGCCCTCCCGTGAACTCTCCCCAAGTGGGGTGCGGCCCTGTCCGCCTGT----------------------CCATCCGCCC--CTCT-GCCTGTCCTTCCATCCCGGTGCATCTGTGTGGGAGGCTTCTCCTGTG------------------------------------------------------------------------------------------CGGGCGCTGGCTCCTGTCACCTCCTCAGAGCAGGC-CTGCTG-GCCTTAGCTGCCCTGACCTACCCATCCCGT------------------------------------------CCCTCCCTGTCCACTTGTGTCCAGCCAGCGCCCCCTGTGTGCCTCACAGGGACA-----------GAGCAGGGGAGAAGGACT-ATGAGGTCCCTGGCCCAGGGATGTCCCAGGGGTCAGGTAGTGCTCTGAGGACTGCGGACCCCCACTGTGGTGTGCAGAGACCAGGGGGAGCAGCGG----------GTGAGCCAGGGCC-CTCCCACCCCTGTGTCCCCTCCCCCACGGAGCCCGTGTCTCTC-----CTCCTCG-----------------------------------------------TGTCTCTCCTCTTCTGCCCCACGGAGCCCGTGTCTCTCCTCCTCTGCCCCACGGAGCCCGTGTCTCTCCTCCTCTGCCCCACGGAGCCCGTGTCTC--------------------------------------------------------TCCTCCTCTCCCCCACGGAGCCCGTGTCTCTCCTCCTCTCCCCCACGGAGCCCGTGTCTCTCACTGACCAGGACTCT-CGGCTTCTACCATGGCAGGTGCAGGTCCGCCTC---TGGAGCCGGCCCACGGCCAGGTGCGGCCCTTCAATCCCACCTGAGACCCCGCATCAGGTGTCTTGACTCAGGCTCACG-----GGAGGGGCCGAGGCG--GCCTGGGG---GCGGGAGTGGAGCCTGGCTGAGGGCTGGGCCTTGTGTG-GAGCTGCA--GAGCAGTGTGGCTTCCTCGGCCTCCCCGTGGGCTTTCG---------GCCCCTGGCTCAGGGCA-----------------GGCAGGGTGAGCGTTC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 5 Sapajus_apella-NW_022437067.1-174845_175379            67.5%  48.7%    --------------------------------------------------------------G--AGACAGGGAGGACCACCCAATGTCAGGGGCAGGTCTGGGACCCCTACTTCCCAGCAGCTGGCAGGACCAGGCAGTCAGGGCGAGGCCGTGCAGCCCGGGTGTGGGGGC--CAAGCCCAGG---GGGTCACAGG-TGCCTTCCT-----GGGTGTCACTGTAGGGCCCAAAGAGCCCTCCCGTGAACTCTACCCAAGTGGGGTGTGGCCCTGTCTGCCCAT----------------------CCATCCGCCC--CTCT-GCCCGTCTGTCCAT-CGGGTGCATCTGTGTGGGAGGCTTCTCCCATG------------------------------------------------------------------------------------------CGGGCGCTAGCTCCTGTCAC---CTCAGAGCAGCC-CTGCTG-GCCTTAGCCGCCTTGTCCTGCCCGTCCCAT------------------------------------------CCCTCCCTGTCCACCTGTGTCCAGCCAGCGTCCCCTGTGTGCCTCACAGGGACA-----------GAGCAGGGGAGAAGGACT-ATGAGGTCCCTGGCCCAGGGATGTCCCGGGGGTCAGGTAGTGCTCTGAGGACTGGGGACCCCCACTGTGGTGTGCAGGGACCGGGGGGCA--GTGG----------GTGAGCCAGGGCC-CTCCCACCTCTGTGTCCTCTCCCCCACAGAGCCTGTATCTCCC-----CTCCTCTC-----CCAGACTGAGCCCCGGTCTCTCCTCTCCCAGGCTGAGCCCCTGTCTCTCCTCCTGTCCCCCACGGAGCCTCTGTCTCCCCTCCTGTCCCCCATGGAGCCCCTGTCTCTCTTCCTCTCCCCCATGGAGCCCGTGTCTCTCCTCTCCCCCACAGAGCCCCTGCCTCCCCTCCTGCCCCCCACGGAGCCCCTGTCTCCCCCCCCTGCCCCACGGAGCCCCTGTCTCTCCTCCTCTCCCCCAGGGAGCCCCTGTCTCTCCCTGACCAGGACTCT-CGGCTTCTACCATGGCAGGTGCAGATCCACCTC---TGGTGCCAGCCCATGGCCAGGTGCGGCCCTCCAATCCCACCTGAGCCCCTGTATCAGGTGTCTTGACTCAGGCTCACG-----GGAGGGGCTGAGGCG--GCCTAGGG---GCGGGTGTGGAGCATGGCTGAGGGCTGG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 6 Callithrix_jacchus-NC_048389.1-179989_180424           84.5%  55.1%    ----------------TGCAGGAGCAA------ACTTTTCACAGCAGGGAAACTGAGGCACCG--AGACAGGGAGGACCACCCAAGGTCAGGGG-----------------------CAGGTCTGGCAGGACCAGGTAGTCAGGGTGAGGCCGTGCAGCCCAGGTGT--GGGG--CTGAGCCCGA---GGGTCACAGG-TGCCTTCCT-----GGGTGTCACTATGGGGCCCGAAGAGCCCTCCCATGAACTCCCCCCAAGTGGGGTGTGGCCCTGTCCGCCTGT----------------------CCGTCCATCT--GGG---------------------------TGTATGGGAGGCTTCTCCCGTG------------------------------------------------------------------------------------------TAGGCGCTGGCTCCTGTCACCTCCTCAGAGCAGGCCTGCTGG-CCTTTAGCCGCCCTGTCCTGCCCATCCCGT------------------------------------------CCCTCCCTGTCTACCTGTGTCCAGCCAGCACCCCCTGTGTGCCTCACAGGGACA-----------GAGCAGGGGAGAAAGACT-ATGAGGTCCCTGGCCCAGGGATGTCCCGGGGGTCAGGTAGTGGTCTGAGGACTAGGGACCCCCACTGTGGTGTGCAGGGACCAGGGGGAGCAGTGG----------GTGAGCCAGGGCC-CTTCCACCCCTGTGTCCTCTCCCCCATGGAGCCCGTGTCTCTC-----CTCCTCTC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCCATGGAGCCCCTGTCTCTCCTCCTCTCCCCCATGGAGCCCATGTCTCTCCCTGACCA--GGACT-CGACTTCTGCCATGGCAGGTGCAGGTCTGCCTC---TGGTGCTGGCCCACGGCCAGGTGCGGCCCTTCAATTCCACCTGAGCCCCTGCATCAGGTGTCCTGACTCAGACTCACG-----GGAGGGGCCGAGGTG--GCCTGGGG---GAGGGTGTGGAGCATGGCTGAGGGCTGGGCCTTGTGTG-GAGCTGCA--GAGCAGTGTGGCTTCCTCGGCCTCCCCGTGGGCTTTCG---------GCCCCTGGCTCAGGGCA-----------------GGCAGGGTGAGCGTACGGCCTGGTCAC-AGAGGCCATGGGGCCAGGCTTG------------------CCTGGTGGCATGGGCGTGACC-----------------TCGTGT-GGGGGTTGGGCTGGG-------TC---TAGCCACTTGCAGCAGGTGGAAGGTTCTTAAGTCCCTGGGCTT--------------------------     
 7 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-167832_167981     78.4%  30.0%    -------------------------CTGACTCCTCATCCTCAAGCAGCCGCCGCCTGCTGCCG--TCCCATGCAGGGCCCGGGGAAGAAAGGAGGGGC---------------------TACAGGGGAAACTGAGGCACAGAGGGGA-G---ACCCG--------CCCAAGGCCAGGGGAGGTCT---GGGTCTCCTGTTCCCTCCCGGGCAGGCAGGGCCCTGGGC-----------ACCCTCCTCT-----------------GGGTGTCGGCACGGAGCCCTCCTATGGCCTCGCCCCTGCCGGGGGTGGCCCT--GCCC-GTCCACCTGTCTGTCCTTGTGCGTCCATGCACCAGGCTTCTCTAGGACCGAGGGTGACAGCTGTG-------------------CAGG-----GTGCTGGCT--------CCTGTC---------------------TCCCAGAG-----------------CA-----GGCTTGGTGG-CCG----TGGCTCTCCGCAGTCCTGTCCGT------------------------------------------CCCCACTGGCCCACACTGGCCCAGCAAGCGCCTGCTGTGTGCCGGGTCGCGGCCTTGCAGC-GACAGAGCGGGGCCCAGGGCC-CTGAGGTCCCACCGGTGC---------------------T----CCAAGAGCTGGGGTGCCG--CTGCCGTGTGCAGGGACCTGGGG-------------------GGCGGTGAACAGT-GAGGCCAGGGCCCTGCCTCCC-CCCC-C----------------------CAGCTG-----CTGGCCCCCGCCTGGCCTGGCCTG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGCCACAGGGGTTGTCCTGGTGGCAGGTCCAGCCTCCTGCAGGGCTGAGGCCAGCTGTGGTGCTCTG--TG---GCCACCTGAGCCCCTGTGGGGGCAGGTGCAGGGTAGCTGGGCC------------------GGGGCTGGGGGCTCTGC-----AGGAGGAGCTGGGGGGCACTGCCTGAG---GGGGCACGGCTGTGGT-TGGGGCCCGAAGCCTGTGAGGACCTGCAGGGCAGAGCGCTGTTGGGG--GCAGCCAGTGCCCGGCCTGGGGCAGGCGGGGTGAATGCAGGGCCAGGCAGTGGCGAGGCGTGGGGGAGGGGTG-GCCGCCTTCATGACCTTGTTGTGGGGGGTGGGGCCCCTCTGGCCTCCAGGTGTGGGCCCTGGGTCTGCTTTCCGGCA-------------GCCCATGGGGTCA--GGGTTTCTGGGGT----------CTCTGGCCCTGGCCCTGCGTGTGACGCTGAGGAA-----------------------------------     
 8 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-174147_174462          80.4%  35.8%    -------------------------------------------------AAACTGAGACACAG--AGATGGGGGAGGGCTCCCACGGACAGGGGAGGGTCTG------CCAAT-------------------------GTCCAGGTCATTGGGTGCAGCCACAATGCAGTG----ACTGAGCTGA---GGGTCATGGGCGGCCTCCTTG-G--GGGTGTCAGTGTGGGACTTGAGCCCTCTCTCCATCGGGGC----CGGAGGGGGGGTGGCCCTGCCGGTCTGC-----------------------------------------ACAGCCATCTGTCCTGATGCATCTGTT--CCAGGCTTCTCTGGACCCAGCTGGAGCTGGCC---------------------TAGCCCTAGAGAGCTGGACCCACCACACCAGT----GCTGGCATTGGCAGTGCCAGGTGCTGGTTTCTGCCACCTCCCAGGAGTGGACTCGGTGG-TCTTGTTCTCCTCTGTCCTGCCCACTT--T------------------------------------------TCCTCTTCACCCACACTTGTCCAGCAAGTGCCTGAGAGGTGCTGGGTTGTTGCATGTGCAGGGATTGAACAGGGAGCAGGAGG-GTGAGA-TCCTGCCCACGGGGCACCCCAGGGGTCAGACAGTGCTGGAGGGACCTTAAGGAGCAAAGTGGGGGCTGAGGGAG----AGGAGTGGCCT----------GGGAAATAACCCC-TAGACCAGCGCTTTGCCTTTTCCCCACGGATGCTCTTCCCCGAC----AAGGGCTG-----CCAGTGCCCACTTGGCCTGG-----------------TCTGAGCGGCTGGAGAGCGGGTGTAGC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCACCTGGGAGCAGTAACTCGACTCCTA------------------------TCTGAGCC-------------------------CCTGCAGGGGC--------AACTGCAGGGCGC----------------------TAGGCAGGAGAGGCTGTTTCAGGTGTCCTGGTTCATCTTGGGC-----AGAAGGAA---CTGA--AGCAGGCT---GGAGGCGTGGACCATGGTAGGAGCTGGTGGCCTTTGAGAGA--CA----CAGCATCCTGGCTGT-----------CTTGGTTGCTCGGGGCAGCTGGTGTGTGGTCCAGGACA-----------------GGAAGGGCAAGCTCCCTTTCATG-------AGCTCATATGGGGGCACTATCTGGCCTCCAGGT-------------------GTTGGCCCTGGGTCTTC-------TCTAG------------------------------------GCAGCACCTGGGTAGGTTTCTCAAGTCCCTGGACCTGGGCTCTGAGTGTGA-----------     
 9 Lemur_catta-NC_059130.1-166453_166581                  75.3%  27.7%    -------------------CCGCGTGGACTCCTTGTACTTCAAGCAGTCGCCGCCGACCCCTATAGGGCCCCGAGGAAGAAAGGAAGAAAGGAGGGGC---------------------TGCAGGGGAAACTGAGGCACAGAGACAGGGGAGACCCG--------CCCAAGGCCAGGGGAGGTCT---GGGTGTCCTGCTTCCTGGCAG----------------GC-----------AGGGGCCGTG-----------------GGGTGTCGGCACGGAGCCCTCCTGTGGCCTCTCCCCAGCCGGGGGTGGCCCT--GCCC-GTTCACTTATCTGTCCTTGTGTGTCCATGCGCCAGGCTTCTCTCAGACCGAGGGTGGCAGCCGTG-------------------CAGTGCAGGGTGCTGGCT--------GCTGTC---------------------TCCCAGAG-----------------CG-----GGC-TGGTGG-CCG----TGGCTCTCCTTGGTCCTGTC-GT------------------------------------------CCCTCCTGGCGCACACGTGCCCAGCGAGCGCCTGCTGTGTGCCGGGTCTCGGCCGTGCAAT-GACAGAGCAGGGCCCGGGCCC-CGCGG-------------------------------------------------TCCCAACA--GTGCTGTGTGCAGGGACCTGGGG-------------------GGCAGCGAGCAGA-GAGGCCGGTGCCCTGCCTCCCCCAAC-C----------------------CAGCTG-----CTGGTGCCCACCAGGCCTGGCCTG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGCCCCAGGGGTGGTCCTGCTGGCAGGTCTGGCCTCCTGTAAGGGCGAGCCCAGCTGCGGTGCTCCG--GG---CCACCTGGGACCCTGC-GGGGACGTG--TGTAGGACGGCGGGC------------------CAGGCTGGGGGCTCTGC-----AGGAGGAGCTGGAGGCCGCCTGAGGGGCG------CGGATGTGGTT-GGGGCCTGAAGTCTCCTGAGGACCCGCAGGGCAGAGCGCGGTTTGGG--GCAGCCAGTGCCGGCCGGGGCAGGCGGG---GTGAGCGCGAGGCTGGCTGTGGCGAGGCGTGGGGGAGGCGTG-GGCTCCTCCGTGGCCTTGTAGTGGGGGTTGGGGCCCCTCTGGCCTCCAGGTGTGGCCCTGGG-CCTGCTTTCCGGCA-------------GCCCCTGGGGTCG--GGGTTTCTGGGGT----------CCCTGGCCCCGGCCTTGTGTGTGACCCTGAGGAAGAGAGGGTGGGGCTGGCTGGGTGA-CCCCACGTGG     
10 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-232286_232443    80.0%  29.3%    ---------------------------------------------------------CAGCTGCTGCCTGTGCAGAGCTTGGGGAAGGAGGGAAGGGCTGCAGGAGCACACCTTTACA-TGACAGGGAAACTGAGGCACCGAGACAGGGAGGACCAC--------CCCAGGGCCAGGTGGTCAGGGTCAGTGGTGCAGCCACGTGCCATGCAGGGGCTGAGCAGAGGAGGACCTTGGCACCGTCCTCTGGC-AT-------------------CTCAGTGTGGGGCCTGAGGCCCATCTCCCCAGCGGGGTTGTGGC--TGCA-----GTCCGTCTGTCCTGGTGCATGTGTGCACCAGGCTCCTCTAGGGCCAGCGCTGGAGCTGGCT-------------------GAGCCCTGGAAAGCTGGAGCCGCCA----CCT---------------------CCGCACAGCAGGCTTG-----------------------------G----TGGCCTCTGTC----------TG------------------------------------------CTGTCCCGTCCACTCCTTGCTCACACTTGTCCTGCTGGGTGCTGGGTCTCAGCCGTGCAGG-GATGGAGCAGCAAGTGGCACC-GCGAGGTCCCTGCCTCAGTAGTGCCCTGGGGTGCAGGGAT----CCAAGGGCCTAGAAGGAG--TAACGCGGGTCATGGACCCAGCAGGGGTGCCGCTGGTGTGTGCGGGGCGTGGTGC-ATGACGAGGGCCCAGCCTCCACCCCACT----------------------GAGCCC-----CTGCAGGGCCACCTGTCGG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCTCCTGGCTCTGGCACTGTAGGAA-GAGCTGGCAGCCGCACGTGTGGGGACCATGGCTGGGCCTG---GG---GCCTCCTGGGGTCCGCTGGGGCAGTGGGCGTCCGGGCCGG-----------------------------------GGC-----AGGAAGGGCAA--GC--GCACCAGGGCTCTGGCAGTGGAGGGAGTT-GGGGTGGGGCAACCCCCGAGTCCCCACCGTGACCTTGTCGGAGGGGG--ACACCCTCTGACCTCCAGGAGT----TGGCCCTCAGGTGGGTCTGCTCTCGGGCAGCACCTGGGAAGGGTGTTTTCTCAGTCCCTGGACCTGCGCCCT-----------GAGTGTGACTCAGGGAGTCCAGGGTGGGGCTGCT----GGGT-------------GGCCCTGTGTGGA--CGGGTGGAGGTCG------------GCTGGCACTGCCCGCCTTGTGGCTTTGAGGAGCTGGGGGGTA-------------------------     
11 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-132861_132936          85.6%  39.2%    --------------------------------------------------CTCTCTGCCAGGA--AGACAGATTTAAGCCAGC------------------GCTGCCCATACTTCCGACAGTGTGGGCTCTTCCTCC------TGTGAGCAGCTGCCACCCACCCATGCAGGGCTGGAGGGAGGG---GCTGCAGGGG-CACCTTTGAC-------------AGTGGGGAAACTGAGGCACAGGGATGAGGAGGA-CCACCCAAGGTTGGGGCAGGTCTGGGACT----------------------CTGTTCCCTG--GCAG-CTGCCATGGCCAGCCAGGCGAGGTCGGTGGGGCATCCAAGTGCAGAGGCCAGCTGAGTGTCCCTGGAAAGGC-TT--------GGACACAAAGAGCCCTCCCTATGCCCCTCCC--------------------CACCCTGCAGCAGCACCTGTCACCTCCTTGGAGCTGGTGTGGGGG-CCTCGGCCTCCTCTGT-----CTGTCT---------------------------------------------TCCTCCTCACCCACACGTGTACAATGAGCAT---CTGTCTGTGTGTGCT-------------AGGCCGTGGCTGAGCAGGAAG-CAGAGGTTCCTGCCCAAGGGGTGTCCCAGGGGTCAGATGGTGCACAGAGGGCTGGGGCGTTGCTGGGGT--GTGCAGGGATGCACAGACCAGGCGA----------GGGCAGCAGAC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAGGCGAGGGCCT--------GCCTCTGCCCCACAGAACCTCGACTGCTCCCTGACCCTGGCTGG-GCCTGGGTGGAGCCTTCTGTGGGGGCCCGCCTGACCTGGTGTGGGACAGCTGGGCAGG-----------------------GAGGCTGTTCAGGTATTCCTGCATAGGCTTTTA-----GGAGGGGC-CGGGCC--ACCTGAGG---GTGGGTGTGGACTGTGGCCGGGGTCCTGGGCCTTGCACAGAATGGCAGAGCAGAACCAGGCCTT---------CCTGTGTGTCCTCTGGGCAGCTGGCGCCCAGTCAGGGGCG-----------------GGCAGGGCCAGCTGGGGCCGGGCAT---GGAGG-GAGGGGGCAGGACTCGCCGGCCTGTACTAGTGGACCTCGTGGGACCTTGTTGGTGGTGGACCCTCTGTGTCCTTGTGAGGTGGACCTTCCTTGACCTTCTGG------------------GGGTGGACCCTCCATGACTTCATGGGGAAGGACGCTTTG--------TGACCT--     
12 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-173366_173586       72.8%  28.6%    ----------------------------------------------------------------------------ATGGGTGAAGA--------CCACCTGAGGACTCTGCTTCCTGGCACCTGCCAAGGCCAGGCCATCTGGGTCAGCGGTTCAGCCACTGTGCAGGGGCCAAGCCGAGGAG-----AGTCACGGGCACCTCTACTC-T-GGGGTGTCGGTGGGG-----------------------------------GGTTGAGGGCACTGCAGGCTCTTCCTGTGCCCTCTCCCCACCTCGGGAGGTGGCC--CTGCCCATCTGTGTCTGAGCTGGGCACGTCTGTGTGCCAGGCTCCTCTAGGACCTCAGCTGGAGGTGTAGGCGCTTCCTGGAGATGGCTGAGCCCTAGAGAGCTGGACGGCCATGGCAATGCCA-GTGA----TGGCTGTGCCAGGCGCTGGCTCCATGCCACCTCCCAGAGCTGGCTTGGTGG-CCTTGGCATCGGGGGTCCAGCCA----------------------------------------------------------GTGCTCACCCCCACTCCAGTGCCTGGTGTGGGCCA-GTCCTGGCTGGTGCAGGGACAGAACAGGACAGGACTGGGGAGGGGGCCTGCCCAGGAGCACCCAGAGGTGCTCACACAGTGTGCAGACGAG------------TGCACATGGACCT-----------------------------GTCAGGC---AGCCTCGAGGCAGCTACAAGGAGCCTTGAA-GGAATAACTGGGTCACAA-GGACCAGAGAGAGGAGAGTGCCCCGGGGTGTGTGGG------------CAGGCGTGAGGAGGAGGGGCTGGAGAGCAGCGGATG-------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGGCCAGGTTCCCCTCTCCCTGACAGAGCCCTCCTGCCCCTTCCTGACCAGGGCTGCCGGCCCCC---------C----AT-TCGGGCCGCTGGG-CGCGGG--GTG---GTCCTGGTGCAGGG----CTAGCTTCCTGCATGGGCCCG-------T------------TGGTCAGGTGTGGGA---CTGG-TGCGAGGGCCCAGAGGCCAG-------GTGT---GGCGGC--TTCACTCCCACCTGAGCCCCT--GCGG---GGCTGGTGGGTGCAGCTGTCTCAGCAGCTGCATCAAGTGTCCAGG-----------CTCAAG---GC-------------C-GGGGCAGGAGCA-----------------GGGAGGGTGTGGACCATGGTCGGGGCCTGGGGTCTTGTTTG-TCAGT----TTCCCCCTGGGC--ACTCAGGGCTCTGGGGC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
13 Camelus_bactrianus-NW_011514262.1-165383_165517        73.1%  23.2%    ------------------------------------------------------------------------------ACCTGCTGA----------CAGACGGGGAACTGAGGCACGGGGCTAGACGAGGCCAGGCTGTCCGGGTCAGTGGTTCTGCCACGGTGCGGGGGCCGATGCCAGGAG-----GGTCCCAGGCGCCTCTTCTG-T-GGGTGTCCCTGTGGG-----------------------------------GTCAG---AGCACCACGGGCCTCCCTGTGCCCTCTCCCCGCCTCGGGAGGTGGCG--CTCCCTGTCTGCTGGGC--------ACCTCTGTACACCAGGCTCCCC-GGGGCTGCAGCTGGAGGTGTTGGCGCTGCCTGGA--CAGCTGAGCCCCGGAGAACTGGCCTGCTGTGGCAGTGCTG-GTGA----CAACCACGCCAGACACTGGCTTCGGGCCGCCTCCAGGGGCTAGCTTGGCGA-CCTGGCCCTGTG------------------------------------------------------------------------CTCGCTCACCCTCAAGTGTCTGCTGCGGGGGCCGGTCCCAGCAGTGCAGGGGCAGAGCCGGATGGGACGGG-----ACATCCCCACCCAGGAGTGCCCCGGGGGTGACACAGCGTGCAGACGTG------------TACATGTGGTCCC-----------------------------GTCAAGC---GGCAGCGAGGAGCCTTGAGGGAATAATTCA-GGGTCACCAGACAGAGGA-CCAGG----AGAGGGCAGTGCTGCAGAGAGGCTTGCAGG-TGGTGCCCCTGGTGTGTGCCGGGCGCGCGTGAGG-AGGAAGAGG-------------------------------------------------------------------------------------------------------CCTGGGGAGCTGCAGATGGGGGCCTGGGGACCCCCTACTCCTTCCTGACCAGGGCTGCTGGCTCCC---------T----GT-CCTGGTCTGGGGG-CCCGCG--GTG---GTTCCAGTGCAGGG----CGAGCCTCCTGTCTGGGCCTG-------T------------CGGTCAGGGTGGGAC---TTGT----GGGGGCCCAGAGGCCAG-------AGGC---TGCTGC--TCCATTTCCACCTGAGCACCC--TCAC---ACCCAAGGGCCAGTGCAGTG----------CACCAGGCGTCTGGG-----------CTCCAG---CA-------------GAGAGGCTCCCTAC-----------------CCGAGGGTATGGACCACAGCTGGGGTCTGGGACCTTCTGAG-ACAGG----GCAGCCTCCCCT--GGGCAGTGTGCTGGGACCCCAGCA--------GTAGGGAGCGCGTTGGGTAGGGGTTGGTTGGCT----------C-TC-----------------------------------------------------------------     
14 Lynx_canadensis-NC_044310.1-178890_178956              74.0%  24.9%    ----------------------------------------------------------------AGGAGGGAGGGCCTGTGGGGCAT--------CCTCTGACAGACAGGGAAACTGAGGCATGGAGACAGGCAGGCCGTCCGAGTCAGCGGTTCAGCCACGGTGCAGGGCCGAGC-TGAGGAA-----GGTCATGGGGACCTTTCCTC-T-GGGGTGTCAGTG-----------------------------------------------TGGGGGGAGCCCTCCCTGTGCCCTCGCCCCCCCCGGGAGGGGGTGC--CA---CCCGTTCATCTGTGCCGGGCGCGTCCAGGCACCAGCCTCCTCGGGGACGGCAGCCGGAGGTGCCGGCACTGGCTGGCGGTGGCCAAGCCCTGGAGGCTGGACGG-CCACTAGCTGACCA-GTGA----CGGCCATGCTGGGCGCTGG-CTCGTGTCACCTCGTGGGGCTGGCTTGGCGG-CCTTGGCACCAGGGGCCCAGCCT----------------------------------------------------------GTGCTTCTGC----------------TGTGGGC-CAGTCCCGAATGGCACAGGGACAGAGCAGGACAGGACAGGGTGGTCC---CTGCCCGGCGGTGCCCCGGGGGATCAGGCAGTGTGCAGATGAA------------TGTGTGCGGTCTC-----------------------------GTCCGGA---AGCCACAGGGCAGGCGGGAGGATGCTCAGA-GGAGCAACTCAGGTCACAGGACTGAGAGCCAGGAGAGGTGTG--------------------TGGGGCAGGCGTGAGGAGGA-----------------AGGG-------------------------------------------------------------------------------------------------------GCTGGGGGGACCCCTTGTGCCCCCTGGAGCCCTCCTGCCCCTTCCTGGCGAGGCTCCTGGCTGACC---------C----GG-GTAGGTCAAGTGTAGACTGG--TTC---CAGGCTGTGGAGGC----CAAGTGTGGAGACTGAGCCCCCGCAGGGC------------TGGTGACATGTGGCTGCTCTGG-TGGCCACATCTATGGCACTG-------TTGGGGCTGGAGG--TGGGGACCGACCAGGGAGTGGACTCTGGCTGGGGTCAGGGTGCTGGGATGTCAGTCTCCCCC--------GGACG-----------CTCTGG---GC-------------GGCTGGTGCTCGCA-----------------GGCCAGGTGGGGTGGTGGCGAGTGTCCT---GGGTGCGGAG-GGAGT----GAGCCCATGGGT--GG--GGTGGGCTGGGCTCCTATCC--------CT--------CCCGGTGTTGGCCTGGGTCTGCT----------C-CCACGCAG-----------------------------------------------------------     
15 Microcebus_murinus-NC_033661.1-164682_164829           75.9%  27.7%    GCACTGCCCCGGCTCCTGACAGCGCCAGCTCCTCGTCCTTTAAGCAGCCACCGCCTGCCGCTG--CCCCATGCAGGGCCTGGGGAAGAAAGGAGGGAC---------------------TGGAGGAGAAACTGAGGCACGGAGACTG-GCAGACCTG--------CCGAAGACCAGGGGAGGTCT---TGCTCTCCTGTTTC-----------------------CG-----------CCCCTCCTTG-----------------GGGTGTCAGCCCAGAGCCCTCCTGTGTCCTCTCCCCAGCCAGGGGTGGCCCT--GCCT-GTCCACCT----GTCCTTGGGTGTCCATGCATCACACTTCTCTGGGACCGAGGGTGACAGCTGTG-------------------CGGG-----GTGCTGGCT--------TCTGTC---------------------TCCCAGAG-----------------CA-----GCT-CGGCGG-CCG----TGGCTCTCCTCAGTCCTGTCGGT------------------------------------------CCCTCCTGGCCCATACT-GCCCAGCAAGCGCCTGCCGCGTGCTGGGTCTCAGCCCTGCAGC-GGCAGAGCCCGGCCCGGGACC-CCAAGGTCCCGACAGTGC---------------------T----CCGAAGGCCAGGATGCTG--CTGCTGTGTGCAGGGGCCCGTGG-------------------GGCAGCGAGCACT-GAGGCCAGGGCCCCGCCTCCCCCCAC-T----------------------TGGCTG-----CTGGCCCCCGCCTGGCCTGGCCTG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGCCACAGGGATGGTCCTGGTGGCAGGTCCAGCCTCCTGCAGGGGTGAGGCCAGCGGTGGTGTTCTG--CG---GGCACCCGAGCCCCTGGGCAGCTGGG---------------CC------------------GGGGCTGGGGACTCTGC-----AGGGGGAGCTGGAGGGCACCTGGGGGGCCTGGACATAGACGTGAGT-GGGATCCGAAACCTTGTAAGGACCCCCAGGGCAGAGCACAGTTTGGG--GCAGCCGGTGCCCGGCCTGGGACAGGCAGGGTGAGCGTGAGGCCGGGCAGTGGCGAGGCGTGGGGGAGGGGTG-GACTCCTCCGTGACCTTGTTGTGGGGGGTTGGGCTCCCCTGGCCTCCAGGTGTGACCCTGGG-TCTCTTTCCTGGCA-------------GCCCCTGGGGTTG--GGGTTTGTCGG-----------------GCCCTGGCCCTGTGTGTGACTCTGAGGGTGGGGCTGGCTGGTGACCCCA---------------     
16 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-165833_165961        83.2%  29.6%    ----------------------------------------------------------------------------GAGAAAAGAAGAAAGGAGGGAT---------------------TGCAGGGGAAACTGACACATGGAGACCATCCAGGGTCCAGGCAGCTGCCAAAGCCAGGCAG-GCAG---GGCCAGCAGTGCTACCACCATGCAGGGGCCAACCTGAGCAGGGTCCCAGGTGCCTTCTCTGGGTGTCCGCATGGGACCTCAGGCCCACAGAGCCCTTCCTGTGGCCTCTCCCCACCTGAAGGTGGCCCT--GCCT-GTCCGCTGTCTGT--CCTGTGTGCTCATGTACCAGGTTTCTCCTGGATCAAGGCTGGAGCTGGCC-------------------GCACCCTAGAGAGCAGAGCCTGTCAGGCTAGT---------------------GCTCAGGCCAGCTGTGCAAGGTGCTGG-----CTGCCATTGA-CCA----TGCCCCAGAGCACACATGGTGGT------------------------------------------CCCTCCTGGCTCACACTTGTCCAGTGAACACCTGCTGTGGGCTAGGTAGTGGCCATGTAGC-AACAGAGCAGTGGCAGGACCC-CAAGG-TCCTGACAG-----------------------------------------------------TGCTCTAAGGGACCTGTGG-------------------GACAGTGAGCAGG-GAGATCAGGGTCCTGCCTTGCCTACC------------------------TATCTG-----C--TGGCTCCCCTGGCCTGGCCTG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGCCATGGGGC-TGGTCCAATGGCAGGTCCAGCCTCCTGCATGGGTGAATGCTATGC-------------T---CCCACCTAAGCCCCTGTGGGGGCAAGTGCAAGGCAGCTGGGCTGGGAGCTGTGTCAGGTGTCCTAGCTCAGGCTCTGG-----GGGAGGAGCTGGAGGTAACCTGAGG-----GAGTGTGGATGTGTTT-GGGGCCCCAAGCCTTGTGAGGACCCACAGGGCAGAGGTCTATTCCCG--AGGCCTCCCTGTGGGCCCTTGG---------GGCAGATGGAGGCCGGGCAGCATAGGCAGCAGGAGGAGGGTT-GACCCTTCCGTGGTCTTGTTGGAAGGATGCAGCCCCTTCTGGCCTCCAGGTGTTGGCTCTGGGTCTGCTTTCTGGCA-------------GCACCTGGGGTTG--GGGTTTCTGCTCT----------GAGGAAGCAGAGGGTGGGGCTGGCAGGGTAATGCATGTGGGTGTGGGGGC-------------------     
17 Myotis_myotis-NW_023416355.1-221504_221443             69.7%  25.4%    ---------CACCTGCTTTGGTGACACGGCTCTGGGACATGGCGCTCCAGCCTCGGGTGCCGCCTTGACGTCCAGACGGGTAATGAGCTGGCAGACAC-CAGCAGGCGCGAGCTGCCACGGTTTCGCCTGGCCAGGC--------------CGTCCTCACTGCCTCTGTCGCACAGGCTGCTTCA----GGCGCTGGAACGCGGACGGGAGTGCCAGCTGCGTGCGGTGCAGGAACGGGACCCACAGCAGCTC----C--GAGTGCAGAGGCCGTAGGTCGCCGGTCCCCGTCCCCTCCCCCGACGCCCCCTG-----------------CCCACTCTCCCCGAGGC-CTCAGCTCCAGGCCTTGCCTGTCCCAGGGCAGTGGGGCCCC------C------------TCGCCCGGCCCCTCTCCTCGTCCCTCCCGTCC----GACAGCTGTGGCTGAGAGCTGTCTGCCTCCCTG----GTCACACCCGCGACCCCTGTGGACTGTGTCTGGCTCCAGGGGGTCCTTCTCGG----------------------------------T-------CCCCCCGCGGGGCCCGCACTGACAGGTGTGCCCCCACAGTGGCTGGCCAGGGCA-----CA-CAGTCCCCCGAAAACAGGAGCACAGGGACGCCTGGGCGGCCGAGTCCC--------GGTGAGTGCGCTGGTGCC------------CAGGCCCGAGCAGGGCCCCCCCGCAGGGT--------GGGGGGAGGGGCATCGTCAGACCCAGTCCCAGTGCCGATCCGACCATGGTGCTGGCCATGTCCA--CGTCCACGTCAGGGCCAGACCACCCCAGCCCTGGGCTG-----------------TGTGCATGGAGAGTGGTCCCGGCAGGGGGAG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCTTCGAGCCACGCGTCCACCCTCTGCCTCCCTCCCAGCCCGCCAGGCCCCTTG------------TCCATGTGACCGGGATGTGTGTTCTCAGCGG----------------------CCGGAGGCCACCCAGGTC-------------CCGCGCTGTCCCCTGGCTCTGCTAGGAC--GGGGGGCTCGGA-----GGGTGCAGACACGGC--ACCCA------------GACAAGGGCGCCTCAGCTCCGGGGCCCCGGGGCGG--------GCACAGGACCCCCTT---------CCCTGATGCCTGCTGGGCCACTGCA-GTCAGGCAGGGCCG-----G-----------GACAG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
18 Trichechus_manatus-NW_004444058.1-158838_158875        70.2%  22.5%    ---------------------------------------------------------------------AGGCAGAGCGGGGCTAGG-----------ACCCC----------TCCCCCCGCCTGCCAGGGTTGGGCCTGCATGGGCGCACCTTTCCTCTCCGGGGTCAGTGCGTGCCGGGTGG-----AGG----GCATTGGAGGCTC-T-GGGT-----TCC-----------------------------------------------A-AAG--AGTCCTGCCTTTATCCTCTCCCTAACCTGGAGAGTGACC---TCGTCTGTCCTCTCTGTCCCTGGTGTGTCCCTGCACCCTGGATCCTCTAGGATGGGGCTTGGACTGCTGGTGCTGGCTGGAGGTGGCTGAGTCCTAGAGAGCTGGGCTCCAAGCCCGTCCAGCAGTGTC-------CAGGCCAGGAGCCGGCTGCAGTCACCTCCTCAGAGCTGGCATGGTGG-ACTTGGTACCAGTGGCTGTGTCATCCCCTGTCCTTGAGGGCTGAGCTTGTGCTCTCTGGGACATCCCCTCTGATCTGTCTCATCTCCCTCACCTATGGAGCATCCACTGTGCATCATGTCTTAGGCCATGTGCT--GAGAACGGAGCAGGCTGCAGGGGTGGCTCCATGCCCAAGGGGCCCTGGGAGATGGGACGGTAAGCAGATAAA------------CACACGTGGTTGG-----------------------------GTAGCCCCAAGGCCATGGGGAATCTTGTAGGAATAAAACA-GGGTTACAGAACAGAGGACAAG------AGAGGGGCAGCCTGGGTG--GGGCTGGGGG-GGCTGCCGCTGGTGTGTGTGGATGGGGGAGG-GGATT---AGGG-------------------------------------------------------------------------------------------------------GGATGAGGCAGGGTACATCCCTCTCCCA----TGGAGCCCCCTCCTGAC-----------------------------------TCAGGGCCGTGC-CCCCAC--CTG--CCCCGCCCTGGGGGGCTGGTGGACCTGGGGGATGGGTGGG-CCTGAGG------------GAGTACGTGGTCCGGGGTGGGTCTAGCCTCCATGCAAGGGGTG-------GGGGGTGCGGCTG--TGCATTCCCACCTGAGTGCTG------------------------GGGGCTGTAGGGCTATACCAGGTGTGTCTA-----------CCTA-----------------------GGCCACAGGGA-----------------GCCAGTGAAAAGGAG----TAGGATGGCCCTGGGCC---------------AGGACCATGGTTAGGGCCCCGGCTCTGTGATGGGCTGA--------AGA----G--CACAGG------------------------------------------------------------------------------------------------     
19 Loxodonta_africana-NW_003573446.1-158019_158061        69.5%  21.3%    -----------------------------------------------------------------GGATTGACACAGTGGCTGCAGC-----------ATATGGGCTTAAGCATATCAGTGATTGGGAGGATGGCGCAAGACTGGGCAGTATTTTGTTCTGTT-----------------GTAC-----ATG----GGGTTGCTATGAC-T-CGGA-----GCC-----------------------------------------------CACTC--GAAGGCACCTAACAACAACAACAAACCTAGGGAATGACCTTGCCAGTCCTTCTGTCTGTCCCTGCTGTGTCCCTGCGCCCTGGATCCTCTAGGACG-GATTGAAGCTGCTGGTACTGGCTGGAAGCGGCTGAGTCCTAGAAAGCTGGACCCCAAGCCTGTCCAGGGGTGTC-------CAGGCTAGGAGCTGGCTGCAGTCACCTCCTCAGAGCTGTCGTGGTGG-ACTTGGCACCAGTGACTGTGTCATCACCTGTACTTGAGGACTGGGCCTGGGCTCTCTGCAACGCCCCGCCCCCATCTCTCTCGTCACCTCACCCGTGGAGCGTCCATTGTGTGCCAGGTCCTGGGCCAGGTGCT--GGGAACAGAGCAGGGGGCAGGGGCTGCTCTGTGCCCAAGGGGCACCGG-GGATCAGATGGTGAGCAGATAAA------------TACATGCGGTCGG-----------------------------GTAGC-CACAGGCCATGGGGAGCCTTGTGGGAATAAAACA-GGGTCACAGGACAGAGGATTAG------AGAGGTGGCAGCCTGGGAGGGGCTGGGGGG-GGTTACCACTGGTGCGTGTGGATAGGGGAGGGGATTG---GGGG-------------------------------------------------------------------------------------------------------GGATGAGGCAGGGTACATCTCTCTCCCA----TGGAGCCCCCTTCAGAC-----------------------------------CCAGGGCCATGT-TCCTAC--CTG--CCTTGGCCTGGGGGGCTGGTGGGCCTGGGGGATGGATGGG-CCTGGGA------------GAATGGGTGGTCCAGGGTGGATCTAGCCTCCATGTGAGCCAGG-------GAGGTGTGGCTGC--TCCCTTCCCACCTGAACTCTG------------------------GGGGCTGCAGGGCTATACCAGGTGTGTCTG-----------CCTA-----------------------GGCCACAGGGA-----------------GGCCCATGAAAAAGAAGGGCAGGGCGGCCCTGGGCT---------------GGGACCATGGCTGGGGCCCAGGGTCTGTGAGTGCCGCA--------GGA----C--A-----------------------------------------------------------------------------------------------------     
20 Chrysochloris_asiatica-NW_006408691.1-160493_160532    66.0%  19.8%    --------------------------------------------------------------------TTGGAAAGATGGG----GG-----------A----------------ACTGAGGCT------------CAGGTGTTGGCACCAGGCTAAGGTCAGCTGGAAGTCAGAGAAGGGTGG-----AGGTAGGGCTAGGACTTCAC-A-GGGTACCTCTCC-----------------------------------------------TCTCTGGTATCCACAGAGTCCTCTCTGTATCCTCTCCTGGGAGGTGAACCTGCCTGTCCTGTCTATCCCGGGTGTGTCCCTGCACCCTAGATCCTCTAGGACAGAGCTGGAGCTTCAGGTGCTGGCTGGAGATGGCGGAGTCCTAGAGAGTGGGCCCTAAA-CTTGTCCAGCAGTGTCCAGGCCATGAGACAGGAGCTGGCTGCTGTCACTTCCTCAGAGCTGGCCCGGTGG-ACTTGGTGCTAGAGACAGTGTCATCCCCTGTCCTAGAGGGCAGGGCCAGTGTTCTCTGTGACACCTTGTCCTGTCTCTCTTGTCCCCCTCATCCACAGTGTGTCTGGTGTATCCCGGGGCTTGGGTCTGGCGCT--AGGAACAGAACAGGGAACATTGTGG-------------------------GAATGGACAGTGTGCAGATAAA------------CACATGGTTA-------------------------------------CCTTGGGTAGCTGTGAGCTCTATAGGAATAAAGCA-GGGTCACAGGACAGAGGACAAG------GAAGGGGACAGCTGAGAGGGGCTGGGTGGG-GGC---AGCTGGTATGTGCAGAGTGGGAAG--GTGTT---GAGG-------------------------------------------------------------------------------------------------------TGATGAGCTAGGGCCTAGGAGTATGCCGCACCTGCTCCACCCTGGGGGATAGGTAGGCCTGGAAGAGTGGGCCAGG---GGT-ACAGCTGCTGTGT-TCCTAC--CTG--AGTGCAGGGTGGGGGCTGTACCATGTGTGTCTTCAGAGGC-CTTGGGG------------ATCCAAGGAGATAGGAGCAGAGGCCCCAGTTCTGTGAGTGGCCACAGAGCACAGGACAGCTTC--CTAGTTTTCCCCGGGACACTG------------------------GGCAGTGTCCGACCTGGTGTGGGGCAGGCA-----------CCTA-----------------------GTCTGGACTG-------------------------AGTGGAGGCTAGAAAGGCTGTACTGGACA---------------TAGACCGAGAGTCAGTAACTTGGCTCTTGAGCCAGGAA--------TGA----G--TG---G------------------------------------------------------------------------------------------------     
21 Manis_javanica-NW_023436200.1-169566_169613            74.8%  26.8%    -------------------------------------------------------------------AGGGAGGCT-GGTGGGGGCC--------GCCTGGGG--------ACTCACTGCTACCTGCTGCCAGTGTCACGCTGGGCCAGCAGTTTGGCCACAGCGCAGGGCCCTAGCCAGGAAG-----AGTC-ATGGCCCTTCTCCTC-T-GGGCTGTTGGTATAG-----------------------------------GGTCAC----------TGCGCGCCCTGAGGC---------CCTGGAAGCCCCCCT--GGGTCCCTAACCCAAGGAGGTGGCCCTGCCT---GTCCACCTGTGTGCCAGAACGCAGCTGGAGGTGTTTGCACTGCCTGGCGGTGGCCCAGCCCTAGGGCACGGATGG-CCAT-----------GGCT----ATGCCACCGGTGGCCATGGCTCCAGGTCACCTCCCAGAGCTGGCTTGGTGG-CCTCAGGACTGGGGGCCCAGTTT----------------------------------------------------------GTGTGCACCCACACTCGAGCGCCCACTGTGGGCTG-GTCACAGCTGGTGCAGGGGCCCAGCGGGACAGGCCTGGGTGATCCTACTCGG---------GAGAGCCTGGGGTCGCAGTGTGTGGACAGG------------TGCATGTGGTCCT-----------------------------GTCAGGC---GGCTGGGAGGAGCCTGGACCAGTCAACCCC-TGGTCACTGAC-CGAGGA----------CAAGGG----------GGGGGGCTTGGGAG-CGGTGCTCCTGGAGCGAGGAGGAA----------------GGGG-------------------------------------------------------------------------------------------------------CCTGGG---AGCACCCCCCTCCCACGGAGCCCTCCTGCCCCC-CCTGACCTGGCCTGGGGGTGCCGGGCGGGCTGG----GT-GCAGGGCTGGCCTTCCCTGT--GCG--CCTGCTGGTCAGGCG----GGGGTCAGGTGCATCTGACCCCCCT--GG------------AGGCCAGGGGCGGCTGCTTCAGCTGTCCGGGCTCCAGGCCGGG-------GCAGAGCATGTAG--ACCGCTGGGCCAGGGGCACTGGCCGCGGTTGGGGCCTGCGGCCTGTGCGATACGCAGAGCGGGCAGGGCACTTCT-----------TTGCCGGCCTCC------------CTGGGCTCGGGGCT-----------------GGCAGGGTGAGAGTGCGGGCTGGGCAGTGGGGGATGCACCG-GGTGGTGTGAGCGCCCTGGGTGTGGAAGGTGCGCCAGGGGTCCCTCT--------GTG---AC--CCCATTGTGGGGGCAGGGTG----------------------------------------------------------------------------------     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .