Reference sequence (1): Target
Identities normalised by aligned length.
Colored by: consensus/70%

                                                            cov    pid  1 [        .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         .         .         .         4         .         .         .         .         :         .         .         .         .         5         .         .         .         .         :         .         .         .         .         6         .         .         .         .         :         .         .         .         .         7         .         .         .         .         :         .         .         .         .         8         .         .         .         .         :         .         .         .         .         9         .         .         .         .         :         .         .         .         .         0         .         .         .         .         :         .         .         .         .         1         .         .         .         .         :         .         .         .         .         2         .         .         .         .         :         .         .         .         .         3         .         .         .         .         :         .         .         .         .         4         .         .         .  ] 1433
 1 Target                                                100.0% 100.0%    ------------------------------------G-GC--AGCCAGGGCCACCTC--TGGACAGGCCTGGAAGAGGTGG-------GGCC-----C----CTG------CCCGTCCCGTACACGCTCGTGAAG------GGAAGAGGTTGGTGGAGGGGCATGTGCAGTCCCCATGCCCCTGTCGT--GGGAGGG-----GCTGCGGTACCCAAAGCTGCCCCGGGTGTGTGTGTACATGCC-GGGAGGCCTGTGGGTGTGATTTGTGGGTTTTGTTGGAAGATTC-ATTATTTTCCAGCCTTCCCCAGGGGAGAGGCGG-AGATGCTGAGCCACCGCTGGCCCCTTGTTGATGACAGCCGCGAGGCCCATGCTGCCTGCTGTGTTAGGACAAGATCGATCTCCGCCATAAAAACAAAATTAAGCCAACACCGCCCTGGCTTCTGACAGCGCG--------CGCTCTTCCTCTAATC------AGCTGCCACCCGCCCGGTT--------------------------------CCAGCCT-TGGGA--AGAAAGGA--AGGGGCTGCAGGAGCAA---ACCTCTCACAGTGGGGAAACTGAGGCACTGAGACAGGGAGGACAACCCAAGGTCGGGGGGCAGGCCCAGGACCCCTGC---TTCCC----AGCAGCCACCAGGGCCAG-G-------CAGTCAGG-G---TGGGCCGGTGCAG------------------CCCAGGTGCGGGGGCTGAGCCCAGGGGATCACG-----------------------------------------------------------------------------------------------GGCGC--ATTCCTCTGCG--TGTCACCGT-GGGGCCCGCAGAGCCCTCCCATGCACTCTCCCCA--A-----CTGGG---GTGCAGC-------CCCGTCT--------GCCCGT--C-TGTCC----ACCCATCCGCCCATCTGGGTGCATCTGTGTGGGAGGCTTCTCCAGGCCC-AG-----GGCTGAAGCCGG-CCAG---ACCCTTGAGAGCTGGACCCTGGACACCAGTGTGGACACTGGCTCCCGTCACCTCCTCAGAGCA------GGCCTGGTGGCCTTAGCTGCCTCTGTCCTGCCCG---TCCCTCCCTGTCC-ACCTGTGTCCAGCCAGCGCCTGCTACGTGTTGGATCAT-GGCCTC---ACAGGGACAGAGCAGGGAGGAGGACTTCGAGGTCCCTGCCCCAGGGATGTCCCGGGGT-CAGGCAGTG------------CTCTGAGGACTGGGG----------------------------------------------A------------------------------------------------     
 2 Trachypithecus_francoisi-NW_022681457.1-191626_192202  93.2%  64.6%    ----------------------------------GAG-GC--AGCCAGGGCCACCTC--TGGACAGGCCTGGAAGAGGTGG-------GGCC-----C----CTG------CCCGCCCCACACGTGCTTGCGAAG------GGAAGAGGTCGGTGGAGGGGCATGTGCAGTCCCCGTACCCCCGTCGT--GGGAGGG-----GCTGCGGCACCCAAAGGTGCCCCGGGTGTGT--GTACGCGCC-GGGAGGCCTGTGGGTGTGATTTGTGGGTTTTGTTGGAAAGTTCCATTGATTTTCCAGCCTTCCCCGGGGAGAGGCGG-AGATGCTGAGCCCCCGCTGGCCCCCTGTCGATGACAGCCGCGAGGCCCGTGCTACCTGCTGTGTTAGGACAAGATCGATCTCCGCCATAAAAACAAAATTAAGCCAACACCGCTCTGGCTTCTGACAGCACA--------TGCTCGTCCTCTAATC------AGCTACCACCCGCCCGGTT--------------------------------CCAGCCT-TGGGA--AGAAAGGA--AGGGGCTGCAGGAGCAA---ACTTCTCAAAGTGGGGAAACTGAGGCACTGAGACAGGGAGGACAACCCAAGGTCAGGGGCA-GGTCCAGGACCCCCAC---TTCCC----AGCAGCCGCCAGAGCCAG-G-------CAGTCAGG-G---CGAGCCGGTGCAG------------------CCCAGGTCCAGGACCCCCGCTTCCCAGCAGCCGCCACA-------------GCCAGGCAGTCAGGGCGAGCCGGT---GCAGCCCAGGTCCAGGACCC-----------CGGCT--TCCCAGCAGCCGCCACA--GCCAGGCAGTC--AGGGCGAGC-CGGTGCAGCCCAGGTCCAGGACCCCCG---------------CTTCC---CAGCAGC-------CGCCACA--------GCCAGG---------------CAGTCAGGGCGAGCTGGTGCAGCCCAGGTCCAGGACCCCCG-------------------CTTCCCA-GCAG---CCGCCACAGCCAGGCAGTCAGGGCGAGCCGGTGCAGCCCAGGTGCGGGGGCCGAGCCCAGGGG------ATCATGGGCGCCTTCCTCTGGGTGTCACCGTGGG---GCCCGCACAGCCC-TCCCGTGCACTCTCCCCACCTGGGGTGCGGCCCCGTCT-GCCCGT---CCATCCGCCTGTCTGGGTGCATCTGTGTGGGAGGCTTCTC-CAGGCCC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 3 Rhinopithecus_bieti-NW_016807514.1-191824_192400       93.2%  80.8%    ----------------------------------GAG-GC--AGCCAGGGCCACCTC--TGGACAGGCCTGGAAGAGGTGG-------GGCC-----C----CTG------CCCGCCCCACACGTGCTTGCGAAG------GGAAGAGGTTGGTGGAGGGGCATGTGCAGTCCCCGTACCCCCGTCGT--GGGAGGG-----GCTGCGGCACCCAAAGGTGCCCCAGGTGTGT--GTACGCGCC-GGGAGGCCTGTGGGTGTGATTTGTGGGTTTTGTTGGAAGGTTCCATTGATTTTCCAGCCTTCCCCGGGGAGAGGTGG-AGACGCTGAGCCCCCGCTGGCCCCCTGTCGATGACAGCCGCGAGGCCCGTGCTGCCTGCTGTGTTAGGACAAGATCGATCTCCGCCATAAAAACAAAATTAAGCCAACACCGCTCTGGCTTCTGACAGCACA--------TGCTCGTCCTCTAATC------AGCTGCCACCCGCCCGGTT--------------------------------CCAGCCT-TGGGA--AGAAAGGA--AGGGGCTGCAGGAGCAA---ACTTCTCAAAGTGGGGAAACTGAGGCACTGAGACAGGGAGGACAACCCAAGGTCAGGGGCA-GGTCCAGGACCCCCAC---TTCCC----AGCAGCCGCCAGAGCCAG-G-------CAGTCAGG-G---CAAGCCAGTGCAG------------------CCCAGGTCCAGGACCCCCGCTTCCCAGCAGCCGCCAGA-------------GCCAGGCAGTCAGGGCGAGCCGGT---GCAGCCCAGGTTCGGGGGCC-----------GAGCC--CAGGGGATAACGGGCGC--CTTCCTCTGGG--TGTCACCGT-GGGGCCCGCACAGCCCTCCCGTGCACTCTCCCCA--C-----CTGGG---GTGCGGC-------CACATCT--------GCCCGT---------------CCATCCGCCTGTCTGGGTGCATCTGTGTGGGAGGCTTCTCC-------------------AGGCCCT-G----------G--AGAGCTGGACCCAGGACACCAGTGTGGACGCTGGCTCCCGTTACCTCCTCAGAGCA------GGCCTGGTGGCCTTAGCCTCCTCTGTCTTGCCCG---TCCCTCCCTGTCC-ACCTGTGTCCAGCCAGTGCCTGCTGTGTGCCGGGTCAT-GGCCTC---ACAGGGGCAGAGCAGGGAGAAGGACTTTGAGGTCCCTGCCCCAGGGAT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 4 Galeopterus_variegatus-NW_007727608.1-231701_232075    90.5%  47.7%    --------------CGAGGCTGCGCCGGGCCGGCAGG-TG--GGGCAGAGCCAGTTC--CACACAGGGAGGTGGGAGATGT-------GTCC-----C----CTG------CGCCTGGGCCCCGCACATGCCTGA------GCAA---------------GGGGGTTGCATCCAGGT-----GCGGGG--GGCGGGG-----GCTGAGGCTCCCGCAGGTGC-CCGTCCGTGTG-TGCACACAC-CAGAAGCCTGTGGGTGTGATTTGTGAGTTTTGTTGGAAGATTC-ATTGATTTTCCAGCCTTCCCAGGGGAGAGGTGG-AGACGCTGAGCTGTTGTTGGCCACGTGTT--GAGCAGCCGCAAGGCCCGTGTTGCCTCCTGCGTTAGGACAAGATCGATCTCCGCCGTAAAAACAGAATTAAACCAACGCTGCCCTGGCTTCCTATGGCGTG--------GGATTTTCCTCCTTTA------AACAGCAGCTGCTGCCTGTG-------------------------------CAGAGCT-TGGGG--AAGGAGGG--AAGGGCTGCAGGAGCAC--ACCTTTACATGACAGGGAAACTGAGGCACCGAGACAGGGAGGACCACCCCAGGGCCAGGTGGTCAGGGTCAGTGGTGCA----GCCA----CGTGCCATGCAGGGGC-----------TGAGCAGA-G---GAGGACCTTGGCA------------------CCGTCCTCTGGCATCTCAGTGTGGGGCCTGAGG-CCCA-------------TCTCCCCAGCGGGGT--TGTGGCT---GCAGTCCGTCTGTCCTGG--------------TGCA--TGTGTGCA-----CCAG--GCTCCTCTAGG--GCCAGCGCT-GGAGCTGGCTGAGCCCTGGAAAGCTGGAGCCGCC--A-----CCTCCGCACAGCAGG-CTTGGTGGCCTCTGT----CTGCTGTC--C-CGTCC----ACTCCTTGC-TCACACTTGTCCTGCTGGGTGCTGGGTCTCAGCC-GTGC-AG-----GGATGGAGCAGC-AAGTGGCACCGCGAGGTCCCTGCCTCAGTAGTGCCCTGGGGTGCAGGGATCCAAGGGCCTAGAAGGAGTA------ACGCGGG------------------------------TCATGGACCCAGC-AGGGGTGCCGCTGGTGTGTGCGGGGCGTGGTGCATGAC-GAGGGC---CCAGC-----------CTCCACCCCACTGAG--------CCCCTGCAGGGCCACCTGT-CGGGC-----------------TC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 5 Tupaia_chinensis-NW_006198262.1-173652_174012          88.1%  47.7%    ------------------------------------------------GTGGAACCC--CACAGAGAGGGTAGAGACATGTTCCCC--GTGC-----C----CTA------GCCCCCCCATACATGCTTGCTGAG------TGAAGCGTGAGTGAATAGGGTGTGCACCATCCCCACACCCCTGTTAC--GGGAGGAGGCGCTGTAAAGGTGTCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCTCT-GGGAAGCTCGTGGGTGTGATTTGTGAGTTTTGTTGAAAGATTAAGTTGGTTTTCCAGCCTTCCCCAGGGAGAGGTGG-AGATGCTAAGCTGCCGCTGGCCTCTTGG---TGACAGCAGCCGAGCCCGTGTAGCCTACTGTGTTAGGGCAAGATCGATCTCCGCCATAAAAACACAATTAAACCAACGCTGCCCTGGCTTCCGACAGTGCA--------GGCTCCTTCCTCAAGC------AGCTGCTGCCTGTGTCCTGT-------------------------------GCAGGGCTTGGGG--AAGAAGGA--GTGTGGAGCTGCAGGGATGTGCTTACGACCATGAGGAAACTGAGACACAGAGATGGGGGAGGGCTCCCACGGACAGGGGAGGGTCTGCCAATGTCCAG---GTCATTGGGTGCAGCCACAATGCAG---T-------GACTGAGCTG---AGGGTCATGGGCG------------------GCCTCCTTGGGGGTGTCAGTGTGGGACTTGAGCCCTCT-------------CTCCATCGGGGCCGGAGGGGGGGTGGCCCTGCCGGTCTGCACAGCCA-----------TCTGT--CCTGATGCATCTGTTCC--AGGCTTCTCTG--GACCCAGCT-GGAGCTGGCCTAGCCCTAGAGAGCTGGACCCACC--A-----CACCA---GTGCTGG--------------------------------------------CATTGGCAGTGCCAGGTGCTGGTTTCTGCCACCT---------------------------------------------------------------------------------------------CCCAGGAGTG------GACTCGGTGGTCTTGTTCTCCTCTGTCCTGCCCACTTTTCCTCTTCACCC-ACACTTGTCCAGCAAGTGCCTGAGAGGTGCTGGGTTGTTGCATGT---GCAGGGATTGAACAGGGAGCAGGAGGGTGAGATCCTGCCCACGGGGCACCCCAGGGGT-CAGACAGTG------------CTGGAGGGACCTTAAGGAGCAAAGTGGG-----------GGCTGAGG--------------GAGAGGA------------------------------------------     
 6 Castor_canadensis-NW_017871110.1-160470_160737         82.9%  38.7%    ------------------------------------------GAGCCACAGCTGCAC--TGGACAGGGAGGAGGGAGACTGTCCCC--ATGC-----C----CAG------CCCTGTCT----GTGCTCACTAAG------TGGA-GGTGAGTGGATAGGGCATGCCTGTCCTGTGTGTGAGAGATGT--GTGTGGGGGGCCCTGCTGCACCCAAAGTTACCCCTGTGCTTGTGTGCACACGCC-GTGAAGCCTGTGGGTATAATTTGTGGATTTTGTTAGAGGATTAAATTGATTTTCCAGCTTTCCCTGGGGAGAGGTGG-AGCTGTTGAGCTGCCGCTGGCCTCTTGTTGATGGCAGCCACGAGACCGTGTT--GCTGCTGTGTTGGGACAAGAAGAAGCTCCACCACAGGAACAAAA-CCACACAGTGCTGCCCTGGCTTCCGACAGTGCA--------GGCTCTTCCTTCTTCC------AACAGCTGCATGGGCTCGGG-------------------------------AAGAAGG-------------AGC--CAGGGCTGCAGGGATGT--GACTTTTAGCAATTGGAGAATTGAGGTGCAGAGATGCAGTGTCTATGGTAGGGAGGTTGGGG-----------CTCTCA---TTTTCT---GACAGCTGCCAGGGCCAG-C-------AAGTGTGGGA---CTGAGCTGAGAAG------------------GAGGATCACCGGGAGTAAATGTGGGACCAGAGGTCCAAAGAGC--CCTCCCTATATGCTCTCCCAGCTTCAGAGTGTCTCTGTCCATCCGT-------------------CTGT--CCTGCAAAGCTGGTCAC--CAGGATCTCTA--GGATGGGGCAATTGTTGGCCAAACTCTGGCATCACACCA--GTG--C-----TGACAGTTGTGCAGG-CATGAGCTGCCTTCA----CTTCCCAGA-G-TAGACAACATAGCCTTGGCTCTCCTCTTCCCACCTGCTTGCTCCTCCT------------C-----GCTTGCACTTGT-CC------------AGAGA-----------ATGCCTACTGTGTGCTGGGTACAGAAGA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGACAGAAGAGGGAGCAGGCCCTTGAGGTCCTTGCCTGAGGTGCACCCTTGGGT-CAGCCAGAA------------CTCCAGGGTCATGAAGGAGTCATGGGGATCAGAATGGAGTACTGGGG--------------GAGGGGAGTGGTCACTGGTGTGTG-----TGGGCATAGC----------     
 7 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-167328_167606     84.5%  32.5%    -------------------CCAAGACGTATCAGAAGAGGA-AGGGGCTCAGGGGGCC-------------------------------GGGCCAGACCTGGGGCG------GGT---GCCGGGCTGTCCCCCGT-GC----CCTGGGGTCAGCGGACAGGGCGTGTGCAGTCCCCGCACTCC---GCT--GTGGGGGGCC-------GTGGCACCTGCAGGCACCCCTGGACATGCACACAAGG-GGGAAGCCTGTGGGTGTGATCTGAGGGTTTTGTTGGAAGATTAAATTGATTTTCCAGCCCCCCGGGGAGAGGC-GGATGCCGCGCTGC-CCC---TGGCCT-CTTGTCAGTGCAGCCGCGAGGCGCGTGTCGCTGGCTGTGTTAGCACAGGATCGATCTCCGCCGTAGACACACAATCACATCCACACTGTCCTGGCTCCTGACAG-----CGCT---GACTCCTCATCCTCAAGCA---GCCGCCGCCTGCTGCCGT----------------------------CCCATGCAGGGCCCGGGGA-AGAAAGGAGGGG--------C-TACAGGGGAAACTGAGGCACAG----AGGGGAGA------CCCGCCCAAGGCCAGGGGAGGTCTGGGTCTCCTGT----TCCC-------TCCCGGGCAGGCAGGGCCCTGGGCACCCTCCT---CT--------GGGTGTCGGCACGGAGCCCTCC------TATGGCCTCGCCCCTGCCGGG---------GGTGGCC--------------CTGCCCGTCCACCTGTCTGTCCTTGTGCGT-------------------------------------------------CCATGCACC--AGGCTTCTCTAGGACCGAGGGT-GACAGC------TGTGCAGG-----GTGCTGGCTCCTGTCTCCCAGAGCAGGCTTGGTGGCCGTGGCTCTCCGCAGTCCTGTC----CGTC--------CCCACTGGCCCACACTGGCCCAGCAA--GCGCCTGCTGTGTGCCGGGTCGCGGCCTTGCAGCGACAGA-GCGGGGCCCAGGGC---------CCTGAGGTCCCACCGGTGCTCCAA-GAGCTGGGGTGCCGCTGCCGTG-TGCA-GGGACCTGGGGGGCGGTGAACAGTGAGGCCAGGGC--CCTGCCT-CCCCCCCCCAGCTGCTGGCCCCCGCCTGGCCTGGCCTGGG-CCACAGGGGT---TGTCCTGGT-GGCAGGTCCA-GCCTCCTGCAG----------GGCTGAGGCCAGCTGT-GGT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 8 Carlito_syrichta-NW_007256000.1-132273_132636          87.3%  39.4%    ---------------------GACAAGTGTTGGAGGA-GG--AGAGGGCTTCAGGGC--TGGGCCGTGCGGTCTGGGGTGCTGGAG--GGCC-----C----CGG------GGAGGTGGCACCCTGCAGGGAGTGGGGCCCCTGCACGTCTCTCAGTGAGGGGTCCATGGACAAAGCATGCCAGCTG---------------TGGGGGCTGGGCACCTAAGGGTGCTGGATGTGTGCACACGCC-GGGAAACCTGTGGGTGTGATTCGTGAGTTTGTTGGAAGATGTC-ATTGATTCCCCAGCTCCCCTGGGGGCA-GGAGC-T-GC-----------GCTG------------GCCTCTTGGTGGCAGCCGTGTTGCCTACAATGCCAGGGCAAGATTGCTCTCTGCCAGGAAGACAGATTTAAGCCAGCGCTGCCCATACTTCCGACAGTGTG--------GGCTCTTCCTCCTGTG------AGCAGCTGCCACCCACCCAT-------------------------------GCAGGGCTGGAG---------GG--AGGGGCTGCAG-----GGGCACCTTTGACAGTGGGGAAACTGAGGCACAGGGATGAGGAGGACCACCCAAGGTTGGGGCAGGTCTGGGACTCTGTT-------CCCT---GGCAGCTGCCATGGCCAG-C-------CAGGCGAGGTCGGTGGGGCATCCAAGT-GC-A------------GAGGCCAGCTGAGTGTCCCTGGAAAGGCTTGGACACAAAGAGC--CCTCCCTATGCCCCTCCCCACCCTGCAGCAGCACCTGTCACCTCCT--------------------------------------TGGA--GCTGGTGTGGG--GGC-----------CTCGGCCTCCTCTGTCTGTCTTCCTCCTCA--C-----CCACACGTGTACAAT----GAGCATCTGTCTGTGTGTGCTAGGC-CGTGGCTGAGCAGGAAGCAGAGGTTCCTGCCCAAGGGGTGTCCCAGGGGTCAGATGGTGC-AC-----AGAGGGCTGGGG-C----------------------------GTTGCTGGGGTGTGCAGGGATGCACAGACCAGGCGAGGGCAGCAGACAAGGCGAGGGCCTGCCTCTGCCCCACAGAACCTCGACTGCTCCCTGACCCTGGCTGGGCCTGGGTGGAGCCTTCTGTGGGGGCCCGCCTGACCTGG---TGTGGGACAGCTGGGCAGGGAGGCTGTTCAGGTATTC-------------------------------------------CTGC----------------------------------------------------------------------------------------------------------     
 9 Otolemur_garnettii-NW_003852462.1-164837_165138        77.8%  31.6%    ----------GAAGAAATGCAAAAAAATCTCAGAAGAAAATCTTCAGGGAGCCAGGCTAG---------------------ACCTGCAGTGGG-----------T------GCTATGCCGTCCTTGTGCCCAGGGTC----AGTG------GTAAATATGTGTAGTCCCTGTGCCCCAGCAGTG------GGAGGGGGCTGTGGC--TCCTGAAGG--C-ACTGCTGGACGTGTGTGCACAAGC-CAGGAGGCTGTGGGTGTGATCTGCGGGTTTCAGTGTTAGATTAAATTGATTTTCCAGCTTCCCCTGGGAGGGGAGGGTACGATGAGCT-G---------------TGGCTGTTGACAGCAGCCCGCGTGTTGCCTACTGTGTTAGGACAAGATCGATCTCCACCATAAAAACGAAATTAAGCAGATACTGCCCTGGCTTCCGACAG-----TGCC---GGCTGTTCATCCTCCAAGC---AGTTGCCACCTGCTGCTGT---------------------------CCCATGCAGGGTCTAGGGG-AGAAAAGAAGAAAGGAGGGAT-TGCAGGGGAAACTGACACATGGAGACCATCC----------------------------------AGGGTCCAGG----CAGC-------TGCCAAAGCCAGGCAGGCAGGGCCAGCAGTGCTACCACCATGCAGGGGCCAACCTGAGCAGGGTCCC------AGGTGCCTTCTCTGGGTGTCC--------------------GCATGGGA--CCTCAGGCCCACAGAGCCCTTCCTGTGGCCTCTCCCCACCTGAAGGTGGCCCTGCCTGTCCGCTGTCTGTCCTGTGTGCTCATGTACC--AGGTTTCTCCTGGATCAAGGCT-GGAGCTGGCCGCACCCTAGAGAGCAGAGC--CTGTCAGGCTAGTGC-TCAGGCCAGCTGTGCAAGG------------TGCTG----GCTG--------CCATTGACCATGCCCCAGAG----CACACATGGTGGTCCCTCCTGGCTCACACTTGTCCA-GTGAACA-CCTGCTGTGGGCTAGGTAGTGGCCATGTAGCAACAGAGCAGTGGCAGGACCCCAAGGTCCTGACAGTGCT-CTAA-GGGACCTGTGGGACAGTGAGCAGGGAGATCAGGGT--CCTGCCTTGCCTACCTATCTGCTG---GCTCCCCTGGCCTGGCCTGGG-CCATGGGGCT---GGTC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
10 Vicugna_pacos-NW_021999318.1-176888_177101             78.4%  31.7%    ------TTCTTCGAGAAGGCAAAGAGGTATCAGAGGAGGGAGGGGCTGGAGGCAGAC----------------------------------------ATGCAGGG------AGAGGAGACTGCTGGCTTGGTCCATG----AAGGGCGA--GGGAACAAGGCGTGT------GCACCTGCTGGGGAGGGGCCCGCAGCACCTAGAAAGTCCGCACACTTGTGTGTGTGCGTGCGCGCTCGCACT-GGGAAGCCTGTGGGTGTAATTTGTGGGTTTTGTTGGAAGATTAAATTGATTTTCCAGCCTTCCCTGGGGGCGAGGCGG---------A-G---------------ATGCTGACTGCCGCTGTCCC-TTGCTGCCTGCTGTGTTAGGACAAGATCGATCTCTACCGTAAAAACAAA-ATTAAGCTGGTGCTGCCCGGCTTCCGACTG-----CAAG---GGCTCTTCCTCCTCGGAGC---AGCTGTCACCCGTGTCCTGTGGCTGCCTGTGTCCTGTGGCTACCATCCTCTGCAGAGCTTGGGGA-AGGAAGGAGTGAGGGGGC--T-GGGGTCACCTGCCGACAGACAGGGGAACTGAGGCACGGGGCTAGAAGAGGCCAGGCTGTCCGGG------------------------------------------------TCAGTGCTTCTGCCATGGTGCGAGGGCCGATGCCATGAGGGTCCC------AGGCGCCTCTTCTGTGGGTGTCCCTGTGGGGGTCAGA-GC--------------------ACCATGGGCCTCCCTGTGCCCTCTCCCCACCTCGGGAGGTGGCCC----------------------------------------------------------------T-----CCCTGTCTGCTGGGCACCTCTGT--------------------------------------------------------G--------CACCAGGCTCCCCGGGGCTGCAGCTGGAGGTGCTGGTGCTGCCTGGAC-GGCTGAG--CC-GTGGAGA-ACTGGCCTGCTGTG-----G---CAGTGCTGGTGACAACCACACCAG-ACACTGACTTCGGGCCACCTCC-AGGG-GC------TGGCTTGGTGACCTGGCCC-TGTGCT---------------CGCTCATACTCA----AGTGTCTGCTGTGGGGGCCGGTCCCAGCGGT---GCAGGGGCAGAGCCGGATGG-GACTGGGACATCCCT--GCCCAGGAATGCCCCGGGGGTGACACAGCGTGCAGGCTTGCTTATGTGGTCCTGTCAA---------GCAGCAGTGAGCAGCCTTGAAAGAA------------------------------------------------------------     
11 Ceratotherium_simum-NW_004454172.1-172969_173586       82.2%  36.4%    ----------------------------GGTCCCGCCTGAAGTCCAGG-GCCAGCACCCTGCAGGGAGTGGGGA--TGT--GCCGC----------------ACG------CCAGGCTCGTGCGTGTTTGCTCAGTG----ACGGGA-CCAGTGAGCAGGGCGTGTACACATGCCTGCGCCCCACTTGTGGGAGGGGCGCTTCCGCACCTCCAGGG--TCTGCCTGTGTGTGTGTTCTCGCGCC-GGGAAGCCTGTGGGTGTAATTTGTGGGTTTTGTAGGAAGATTAAATTGATTTTCCAGCCTC-C-CCGGAGAGAGGCGG---------A-G---------------ATACTGACTGCTGCTGGCCTCTTGTTGCCGGCCGTGTTAGGACAAGATCCATCTCTGCCACAG-AACAAA-ATTAAACCAGCGCTGCCCAGCTTCTGACAG-----CGAG---GGCTCTTCCTCCCTGGAGT---AGCTGCCGCCCGTGTCCTGCGGCCGCCGCCGT--------------CCTCTGCAGGGCTTAAGGA-AGAGAGGAGTGA-GGGGC--T-GGAGGCGCCTTCTGACAGATGGGGGAACTGAGGCACGGAGATGGGTGAAGACCACCTGAGGACTCTGCTTCCTGG----CACC-------TGCCAAGGCCAGGCCATCTGGGTCAGCGGTTCAGCCACTGTGCAGGGGCCAAGCCGAGGAGAGTCAC------GGGCACCTCTACTCTGGGGTGTCGGTGGGGGGTTGAGGGCACTGCAGGC--TCT-----------------TCCTGTGCCCTCTCCCCACCTCGGGAGGTGGCCCTGCC-CATCTGTGTCTGAGCTGGG--CACGTC----------------------------------------------------------TGT-------------------------------------------------------GT--------GCCAGGCTCCTCTAGGACCTCAGCTGGAGGTGTAGGCGCTTCCTGGAG-ATGGCTGAGCC-CTAGAGA-GCTGGACGGCCATGGCAATG---CCAGTGATGGC-----TGTGCCAG-GCGCTGGCTCCATGCCACCTCC-CAGA-GC------TGGCTTGGTGGCCTTGGCATCGGGGGT--CCAGCCAGTGCTCACCCCCACTCC----AGTGCCTGGTGTGGGCCAGT-CCTGGCTGGT---GCAGGGACAGAACAGGACAG-GACTGGGGAGGGGGCCTGCCCAGGAGCACCCAGAGGTGCTCAC-----------------ACAGTG-------------------------------------------------------------------------------------------------------     
12 Hipposideros_armiger-NW_017731634.1-162552_162792      83.9%  36.4%    ------------------------------TTGAGCAGGGCTTGCTGG-GGGTGGGGGGAGTCCAGGGAGGTGGGGGTGC-CCCCT----------------GCC------CAGCCCCCAGGCATGTCTGCTCAATG----ACGGGGCGAGTGAATCAGGGTGTGTGCCTGTGCTGCACCCACT------GTGGGTGGGGGGCTGCATCTCAAGGTTCTGCCCGCGTGTGTGCGGGCTCTCGCC-GGGAAGCCCGTGGGTGTACTTTGTGGGTTTCTTTGGAAGATTAGATTGATTTTCCAGCCTTCCCCGGGGGAGAGGCGG---------A-G---------------ATGCTGACTGCCGCTGGCCTCTTGTCGCCTACTGTGTTAGGACAAGATCGATCTCTTCTATAAAAACAAA-ATTAAACCAGTG-CTCCCAGCTCCTGACAG-----TGAA---CGCTCTTCCTCCCAGGAGC---AGCGGCCACCCGTGTCCTGAGTCCGCCACTGT--------------CCTCTGCAGGGTTTGGGGA-AGAAAGGAGCAG-GGGCC--T-GGGGGCGCCTTCTGGCAGATGGGGGAACTGAGGCTGGGAGACAGGTGAGGACGGCCCCGGGACTTCTCTTACCGG----CTGC-------TGAGGCC----AGGCTCTCAGGTCAGCAGTTCAGCCCCGGTGCAGGGGCGGAGC-TGGGAGGGTCAT------GGACACCCCTCCTCTGGGGTGTCAGTGTGGGGTCCCTGAGGTCC------------------GCGGGCCCTCCCTGTGCCCTCCCCCCACCTC-------------------CCTTGGTGGGTGTCTGC--GCTGAG----------------------------------------------------------CAT-------------------------------------------------------GT--------GCCAGGCTCATCCAGGTCTGCAGCTGGAGGTGTTGGTGCTGCCTGGTG-GCGGCCAAGCC-CTAGAGA-GCTGGACAGCCATGGCCGCC---CCAGTGATGGCCGCACCGTGTCAG-GCGCCGGCTCCGTGTCACTCCC-CAGA-GC------TGGCTTGGTGGCCTTGGCACTAGGAGC--CCAGCCTGTGCTGTCCCACACTCG----AGCACCTGCTGTGGGCTGGT-CCCAGCGACT---GAAGGAACAGAGCTGGACGG-GACTGGGGAGGTCCCCACCCAGCCGTGCCTTGTGTGTGTGTGTGGGGGGCAC--------ACAGCGTATAGATA-----------------------------------------------------------------------------------------------     
13 Lemur_catta-NC_059130.1-165877_166310                  83.5%  30.9%    ---------------GAGGCCAGGAAGTATCAGAAGAGGAAGGGGCTTCAGGGGGCC-------------------------------GGGCCAGACCTGGGGCG------GGT---GCCAGGCTGTCCCCCGT-GT----CCTGGGGTCAGTGGGGAGGGCGTGTGCAGTCCCTGCACCCCTGCTGT--GGGGGGAGCC-------GTGGCACCTGCAGGCACCTGCGTACGTGCGCACAAGC-GGGAAGGCTGTGGGTGTGATTCGAGGGCTTG-TTGGAAGATTAAATTGATTTTCCAGCCCCCCAGGGAGAGGCGGGAGGCGGAGCTGC-CCC---TGGTCT-CCTGTCAGTGCAGCCGGGA-GGCCGTGTCGCCCGCTGTGTCGGGACAGGATCGGTCTCCACCGTAAACACAAAATCACACTGGCCCTGCCCTGGCTCCTGACCG-----CGTG---GACTCCTTGTACTTCAAGC---AGTCGCCGCCGACCCCTATAG-------------------------GGCCCCGAGGAAGAAAGGA-AGAAAGGAGGGG--------C-TGCAGGGGAAACTGAGGCACAGAGACAGGGGAGA------CCCGCCCAAGGCCAGGGGAGGTCTGGGTGTCCTGC----TTCC-------TGGCAG----------------GCAGGGGCCG---TG--------GGGTGTCGGCACGGAGCCCTCC------TGTGGCCTCTCCCCAGCCGGG---------GGTGGCC--------------CTGCCCGTTCACTTATCTGTCCTTGTGTGT-------------------------------------------------CCATGCGCC--AGGCTTCTCTCAGACCGAGGGT-GGCAGC------CGTGCAGTGCAGGGTGCTGGCTGCTGTCTCCCAGAGCGGGCT-GGTGGCCGTGGCTCTCCTTGGTCCTG-T----CGTC--------CCTCCTGGCGCACACGTGCCCAGCGA--GCGCCTGCTGTGTGCCGGGTCTCGGCCGTGCAATGACAGA-GCAGGGCCCGGGCC---------CCGCGGTCCCAA-------------------------CAGTGCTGTG-TGCA-GGGACCTGGGGGGCAGCGAGCAGAGAGGCCGGTGC--CCTGCCTCCCCCAACCCAGCTGCTGGTGCCCACCAGGCCTGGCCTGGG-CCCCAGGGGT---GGTCCTGCT-GGCAGGTCTG-GCCTCCTGTAA----------GGGCGAGCCCAGCTGC-GGTGCTCCGGGCCA-------CCTGGGACCCT---------------------------------------------------------------------------------------------------     
14 Equus_asinus-NC_052181.1-174534_174737                 79.9%  33.1%    -----------CGAGAAG-------GGTCAGGCTGCAGGGAGTCCGGG-GCCGGCAGCCCGCAGACAGGGGGGGGATGTG-CGCCT----------------AAG------CCTGGCCCGCACCTGTCTGCTCATGA----AGGGGCACTGGTGAATAGGGCATGT-------GCGAACCTCACTTTGGGGAGGGGGCCCGGCGGCATCTCCAGGG--TCTGCCTGTGTGTG-------TGCGC-GGGAAGCCTGTGGGTGTAACTTGTGGGTTTTGTTGGAGGGTTAAATTGATTTTCCAGCTCC-CCCCGGGGAGAGGTGG---------A-G---------------ATGCTGACTGCCGCTGGCCTCTTGTTGCC----GTGTTAGGACAAGATCGATCTCTGCCGCAGAAACAAA-ATTAAACCAACGTTTCCCGGCTTCCGACAG-----CGAG---CGCGCTTCCTCTTTGGAGA---AGCTGCTGCCTGAGTCCTGTGGCCACCACTGT--------------CCTCTACGGGGCGTGGGG--AATGAGGATCGA-GGGGC--T-GGGGGCGCCTTCTGACAGATAGGGGTACTGAGGTGCGGAGATGGGTGAAAGCTGCCTGAGGACTCTGCTTCCTGG----CACC-------TGCCAG-GCCGGGCCATCTGGGTCAGCGGTTCAGACACTGTGCAGGGGCCGAGCCGAGCAGGGTCAT------AGGCATATCCCCTCTGGGGTGTCCATCTGGGGTCGAGGGCACTGCAGGC--CCTGCAGCCCACAGAGCTCTCCCTGTGCCCTCTCCCCACCTCAGGAGGTGGCCC-TGC-TCGCTGCGTCTGTGCTGGG--CACGTC----------------------------------------------------------GGT-------------------------------------------------------GT--------GCCCGGCTCCTCTAGGACCTCAGCTAGAGGTGTTAGCACTGGCTGGAG-GTGGCTGAGCC-CTGGACA-GCTGGGCAGCAACAGCAAAG---CTGGTGATAGC-----CGTGCCAG-GCATTGGCTTCATGCCACCTCC-CAGA-GC------TGGCTTGGTGGCCTTGGCACTGGGGGT--CCAGCCTGTGCTCACTAACACCAG----AGTGCCTGCTGTAGGCCAGT-CCTGGCCAGT---GAGGGACAG-AACAGGACCG-GACTGCGGAGGTTCCT-GCCCTGGAGCACCCTGGCTCACA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
15 Nannospalax_galili-NW_008355419.1-159166_159367        86.3%  34.5%    -------------------------------------GGG--GTGGGCAGCTAGTTG--TGTAGCCTAGGGCTGGGGCTGC-CACT--GGCT-----A----TGG------GAGATGGTCTCCATGCTTAGCCCA-------TAG--TGCTCACACGGTAACATGTGTGGGTC--CTGTCCCACCTGT--GGAATGA--GGGCTGTCGTACCTGAAGGTGCCTCTGTGTACATGTGCATGCTCC-GTGAGGCCTGTGGGTGTGATTTGTGGGTTTATTGGGAGAAGAA-ATTGATTTTCCAGCTTTCCCTCGGGAGAGACAA-GTCTGCTGAGCTGCCGTGGGCTCTTGTTC--ATAGCAGCCACCAAGCTGTGTTGCCTACTGTGTTAGGACAAGATTGATCTCCATCCCAGAGACAAAAACCACCCTGCCGCTGCCAGTGTCTGTGGGCTCTG--------GGAGGGTGGAGCCCAG------GGCTGCAGGGACAT---------------------------------------------------------------------------------GCCTTTTGACAGTGGGGGGACTGAGACACAGGGTGGAGAGGACACCCAAGCTTGATATGTAGGAGTTCCTGTTTGCTGGCAGCTGCCTTGGCCAGGCCACCAGGGCCAG-T-------AGGTATGAGG---CTGGTCATGGTA-------------------TCTTCCCATAGAAAATCAGTGTGAGACCAAAGACCCACGGGGC--CCTCTCCAGCTTCAGGGTTACCCTGTCCA----CCTGTGTGTCTGTTCTATACA---------TCTGAA--CACCAGAACTAGGCCAAGATTGCAACTGCCTGTCCCCTGGA-GAGAGAAACCCTTCAGTTTGTGGCTGAGTGGCAC--AGTTGCCCACACCAGAGCAGGTTATGTGGCCTTGACT----GTTCTCGGT-C-CCTC-----T-CACCCAGCTTTTTCCATTACTTGCTAGTTGCTGGGTAATGCTGGGAC-AGAACAGGAAACAGGCCTT-TAGGGTCAAACAGCATTTC-------AT-GAAGGAGTTGTGTGGGTCAGTATGGGGTA--GGTAAAGATAGAGCAGAGGATGGAGAGCTGACGTCCT-----------------------------------------GCCTACGTGTCCTGGGAGCTGGGTGGTTGGGGGCAGCTATGCCTCCCCAGATGGGCTGCCACTTGTACCTTC-----------------TCTTCT-CACAC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
16 Monodon_monoceros-NW_021703774.1-178759_178971         76.8%  29.3%    GGAGGAAAGGGCTGGAAAGAGACAAGCAGGGAGGGCAGATACTGGTTTGCCCCACGAAGGGCAAGCGAACATGGTGTGTATCCCTTCTGGGGCGGGCCTGCGGCT------CCGCAGGAGTCCATGCGTGCGCACGT----------------------------------------------------------GCGTGTGTGCGTGTGTGCGCGTGTGTGTGCATGTGTGTGCGCTCGTGCT-GGGAAGCCTGTGGATGTAATTTGTGGGTTTTATTGGAAGATTAAATTGATTTCCCAGCCTTCCCTGGGGGAGAGGTGG---------A-G---------------ATGCCGCTG-TCACTGCTCC-CTCGTTGATGCCGCGTTAGGACAAGATCAATCTCGGCCATAAAAAAAAAAAAGAAGCCAGAGCTACCCGGCTTCTGACCG-----TAAG---GGCGCTCCTTCCTTGGAGC---CATGGCCGCCAGTGTCCCGCGGCC-------------GGCCGCCGTCCTCCGTGGGGCTTGGGGC-AGGAAGGAGCCAGGGGCT--G-GGGGCCGCCTTCTGACAGCTGGGGGACCTGAGGCAGGGGGCCGGGCGAGGCCCATCTGAGGCCTCCGTTTCCTGG----CGGC-------TGCTGGG--CCAGGTGTCCTGGGCGGCGGTTCTGCCGCAGTGCAGCGGCTGAGGCGAGGAGGGCCCC------GGGCGCCTCTCCCC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGGGGGTCGTGTGGGGTCGAGGGTGCTGTGCTCTCTCCTCG-CCTCAGGAACTGGCCCTGCCCGTCC--CGTCTGCTG----GGCG--------CGTCTGCACGCCAGGCTCTGCAGCTGGAGGTGTCGGTGCTGCCTGGTG-AGGCTGA--G----------------------CC-----C---TAGAAGGCTGGACGGCCAGGCCAG-ACGCCGGCTCCGTGTCACCTCC-TGGA-GC------TGGCTTGGTGGCCTGGGCCCTGTGCC---------------CACCCCCACTCG----AGCGCCTGGT-----------CCCAGCTGGT---GCAGGGGCAGAGCCGGACAG-GCCCGGACGTCCCCT--CCC-TGGAGCACACGGTGTG------------CAGGCGAATACGCGTGGTCCTGTCAGCAGCCACGAGGCAGTGTGAGGAGCCTTGAAGGAATCACCCAGGGTCACGGGACAGGACCTGG--------------------------------     
17 Mesocricetus_auratus-NW_024429219.1-164250_164443      89.3%  35.2%    -------------------------------------CCC--GAGGAGGCTCGAGGC--TACAGGAAAAGGGCTGGGGGGAGCT----TTGT-----T----CCC------TCATGTCCCATGCTGCTGGCCTTT-------GGAGCCCCACTTGCT---AGGTAACACGTGC--AAGTCCTGTTGGT--GGGATGAGGGTCATCGTACCCCAAAGGTGCCCCCTGTGTGCATGTGTGCATGTC-TGGCAAGGCCTGTGCGTGTGATTTGTGGTTTATTGGGAGAGTAAATTAATTTTACAGCTTTCCCCGGGGAGAGGCGA-GTTTGTTGAACGGCCGCTGCTCTCTTGTTCACC-GCAGCCCTCAAGCTGCGTTGCCCACTGCGTTAGGACAAGATCGATCTCCCTCACAGAAGTAAAACGGCACCAGCGGGCCCTGCCTCCCCCCCCGGGGGACAGCATGGGCTCTTCCTCCTTCC------AGCAGCTGCCAGTATCTGTG-------------------------------GGCGC---CAAGG--CAGGAGGATCCAGGGCTGAGGGGGCAT--GCCTCTCATCCGCAGGAGGACTGAGGCGCAGAGGTGATGAGGACAGAGGGGACCACCTGTAGTCCTACAGCTGGCTGC-----ACTC----TGGAGAGACTATAACCCG-C-------TAGACGCTAC---TATGGCCTGGGTGACAC-A------------GTTGCTCCCAGCTTCTGGAGGAGAGACTATGTGGCCT------------------------TGGATCTTCTTGGTCCCCTTATCCATCCCAT-----------------CTCTT--GCTTGCTGGGGTGCTGG--GTGCTGCTGAGACGGAGCA----AGTGAGGAGACCCCCCTGGGGGCAGGCAG--CAT--TCTGGGAAGGAGTTGTGTAGGTCAGCGTGGGGTGG------GTGAAGTT------G--------GGGAC---AGAGGAGTTGAGAAGTTACCGTCCTGCCTCTGCCTGTCC-TGGAGATGGGTGGTTGGGA-CAAG----------TGTGC--------------TTTTCTGGTGGGTAAGCAAACACACCAGCTC-CTCTC--GCACACGAGGC----TTTGCTCGGACTGG---------------TACATGGGCA-GCAAGTCCCATTGCAGCGCCTGCCTGAGTG------------------AGAACCATGGCGGA---------TGCTTCACCTTCCTGGAGGCTGCAAATCCTTGACT-CCTAA--------------------G---------------------------------------------------------------------------------------------------------     
18 Sturnira_hondurensis-NW_023520724.1-169200_169304      77.9%  27.8%    ----------------------GAAGAGGAAGGGGCAGGAG---------ATGGAGG------------------AGCAGGGCCTTCAGGGGGGCCGGCGGGACGTGCACCCCCACGCCGCCGGAGCTTCCCCAGTG----GAGGTGCAAGTGACTTGGGGCTTGT---------GCACTGG--------CTTGCCCGCCGCGGTGGGAGGGCCTGCC-----TGCATGAGCGTGTGCTCCGGC-GTGAAGCCCATGGGTGTGCTTTGTGGGTTTTGTTGGGAGATTACATTGATTTCCCAGCCTTCCCCAGGGGAGAGGCGGGGGTGCTGAC--------------------------TGCGCTGGCCTCTTGTCACCTGCTGTGTCAGGACGAGATTCGTCCCCACCGTGAGGACAAAACTAACCCAA--GGCTCCTGGCTTCTGACCG-----TGAG---GGCTGGTCCCTGG---AGC---GGCTGCCTCGGTGGCCTGAGG--CCGC--------------TTTGTCCCCTGCAGGGCT-TGGGGAAGAAGGGAGCCT-GGGGC----GGGCCTG------------------------------------------------------CCTCCCCTTCCTGG----GAGC-------TGCTGAGGCC-AGGCGTCTGGGCCAGG--------CACAGTGCAAGGGCCCAGCCAAGGGGGACACCCCTCTCTGGGCCGTCCTGGTGGGCTTGAGGGCCCTCCCTCCACTGCCCTTGGAAGCTGGCCCTGTCCATCCGCCTGTCTGTATGCCAGCCTCCTCCAGGATGAGGGGT--------------------------------------------------------------GGCCGTGACC-ACCCCCATGTCAGCGTGCCCCGT-------GC--------------------------GGCTCAGGGGCCTTGGCACCGGGCCCAGCCTGTGCTCACCTGCACTGGAGCTCCTGTGGGGGCCAGTCCTGGCCGGAG----------CAGGGACAGA-GCTGGACAGGGGTGGGAGGT--------CCCTGCCCTGGGGGTCTCGGGCAGCCGCACAGTGCAGACGTG-TGTG-GGCCCGTCAGGCAGCCGAGAGGCAGCCCTGAGGAG--ACGTGAAGGGCTCTCTCATGTCCA----GGGACAAGAAGTA-----------GGGAATT---GGGGAGGGCGGGCAGGCGCC-GTCTCTGGAGTCCTGGGGCC-CTGGGGCCCTGGCTGT--GCACCGCGGCCGCA------GGACTGGGCCTGCCTG--------------TCTCTGGAACGTCCAAGG------------TGGGG---------------------------------------------     
19 Artibeus_jamaicensis-NW_023552099.1-168612_168803      78.4%  30.6%    ----------------------CCAGATGAAAGAGCAGGGCCTGCCGGGGGGCCGGT------------------GGGACGCCCCCCCCCCCCACACCGACGGAACTCACCCCCACGCCGCCGGAGCTTCCCAAATG----CAGGCGCAAGTGTCTTGGGGTCTGT---------GCACCAG--------CCTGCACCCCTCGATGGGAGGGTCTGCCCGCGTGGCGTGTGCGTGAGCTCCGCC-GAGAAGCCCGTGGGTGTGCTCTGTGGGTTTTGTTGGGAGATTACATCGATTTCCCAGCCTTCCCAGG--GAGAGGCGGGGGTGCCGAC--------------------------TGCGCTGGCCTCTTGTCACCTGCTGTGTTAGGACGAGACTCGTCCCCACCATGAGGACAAAACTAACCCAA--GGCTCCTGGCTTCTGACCG-----CGAG---GGCTCTTCCCTGG---AGC---GGCTGCCTGGTGTCCT-GAGG--CCGC--------------TTTGTCCCCTGCAGGGCTTTTTGGGAGAAGGGAGCCT-GGGGC----GGGGATGCCTCCCAATAGGTGCGGACAGAGGT-------------------------GAGGACCCCCTTTCTTGG----GAGC-------TGCCTAGGCC-AGGCGTCTGGGCCAGG--------CACCGTGCAAGGGCCCGGCGGAGGGGGACACCCCCTC-TGGGCTGTCCCC-ATGGGGTTGAGGCCCTCCCTCCACTGCCCTTGGAAGCTGGCCCTGCCCATCTGCCTGTCCGTGTGCCAGGCTCCTCCAGGACGGAGGGGT-------------GGTG----GTGG--CCGAGCCCC--AGAAAGC----------TGGGT-GGCCGTGACC-ACCTCCGTGTCAGCGTGCCCTGT-------GCTGGCTCTGTGTCGCTGCCCCGAGCTGCCTCGGGGGCCTTGGCACCGGGGCCCAGCCTGTGCTCACCTGCACTGGAGCACCTGTGAGGGCCAGTCCTGGCCGGAG----------CAGGGACAGA-CCTGGATGGGGGTGGGAGGT--------CCCTGCCCTAGGGGTCCCGGGGGGCTGCACAGTGCAGTCTTG-TGTG-GGCCCATGAGGCAGCTGAGAGGCAGCCCCGAGGGG--ACGTGAAGGGCTCTCTCAGGTCCA----GGGACAAGGAGTA-----------GGGAATT---GGGGGGGGGGTCGT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
20 Bison_bison-NW_011494861.1-165670_165771               79.0%  28.7%    -------------AGAAAGCGCAGAAGCCTTAGAGGAGGGAGGGGCTGGAGGCAGGC-----AAGC---------------------AGGAGGGGAGAT----------------------ACAGGTTTGCCCTCTG----AAAGGTGA--GTGGATAAGGCAGGT------GCCCCGCATGGAGAGCCTGGGTGCCGCAAGTGTCCGTGTGCATGCGTGCGTGTGTG--TGTGTGCTCGCGCC-AGGAAGACTGTGGGTGTAATTTGTGGGTTTTGTTGGAAGATTAAATTGATTTTCCAGTCTTCCCAAGGGGGAGGTGGA---------G-----------------GT---------------------GCTGGCTGCTGTGTTAGGACAAGATCGATCTTGGCCATAAAAACAAA-ATTAAGCCAGAGCTGCCCAGCTTCTGACCGGACTGCGAG---GGCACTCCCTCCTTGGCGC---AGTGGCCGCCCATGTCCCATG-----------------GCCGCTGTCCTCCTCAGGGCTTGGGGA-AGGAAGGAGCGAAGGGCT--G-GGGGCCACCTTCTCACAGCCAGGGGAACAGAGGCGGGGGACAAGGTGAGGCGCCTGAGGC--CTCCACTTCCTGG----CGGT-------GCTGTGG--CCAGGTGTCCCGGCCAGCAGTCCAGCTGTGGGGCAGCGGCTGAGGCGGGGCAGGCCCC------CGGGGCCTCTCCTCCAGGGGTTGTTGTNNNNNNNNNN-NN--------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNTTGTTGTAGGATCAAGGGCACTGTGCTCTCTCCTGG-CCTCAAGAGGTGCCCTGCCCCCTGTCTGCTGTGTCC----TCTG--------GCCAAGGTCCCCCAGGGCTGCAGCTGGAGGTGTTGGTGCTGCCTCAGG-AGGCTGA--G----------------------CC-----T---TAGAAGGTTGGACGGCCGGGTCAG-ATGCTGGCTCCTTGTCACCTCC-TGGA-GC------TGGCTTGGTGGCCTGGGCCCTGTGCC---------------CCCCCCCCCNNN----NNNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNN--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
21 Bos_taurus-NC_037343.1-166932_167033                   76.3%  30.7%    ---------------AAAGCGCAGAAGCCTTAGAGGAGGGAGGGGCTGGAGGCAGGC-----AAGC---------------------AGGAGGGGAGAT----------------------ACAGGTTTGCCCTCTG----AAAGGTGA--GTGGATAAGGCAGGT------GCCCCGCATGGAGAGCCTGGGTGCCGCAAGGGTCCGTGTGCATGCGTGCGTGTGTGTGTGTGTGCTCGCGCC-AGGAAGACTGTGGGTGTAATTTGTGGGTTTTGTTGGAAGATTAAATTGATTTTCCAGTCTTCCCAAGGGGGAGGTGGA---------G-----------------GT---------------------GCTGGCTGCTGTGTTAGGACAAGATCGATCTTGGCCATAAAAACAAA-ATTAAGCCAGAGCTGCCCAGCTTCTGACCGGACTGCGAG---GGCACTCCCTCCTTGGCGC---AGTGGCCGCCCATGTCCCATG-----------------GCCGCCGTCCTCCTCAGGGCTTGGGGA-AGGAAGGAGCGAAGGGCT--G-GGGGCCACCTTCTCACAGCCAGGGGAACAGAGGCGGGGGACAAGGTGAGGCGCCTGAGGC--CTCCACTTCCTGG----CGGT-------GCTGTGG--CCAGGTGTCCCGGCCAGCAGTCCTGCTGTGGGGCAGCGGCTGAGGCGGGGCGGGCCCC------CGGGGCCTCTCCTCCAGGGGT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTTGTAGGATCGAGGGCACTGTGCTCTCTCCTGG-CCTCAAGAGGTGCCCTGCCCCCTGTCTGCTGTGTCC----TCTG--------GCCAAGGTCCCCCAGGGCTGCAGCTGGAGGTGTTGGTGCTGCCTCAGG-AGGCTGA--G----------------------CC-----T---TAGAAGGTTGGACGGCCGGGTCAG-ATGCTGGCTCCTTGTCACCTCC-TGGA-GC------TGGCTTGGTGGCCTGGGCCCTGTGCC---------------CACCCACACTCG----AGTGCCAAGT-----------CCCAGCCAGT---GCAGGGGCAGAGCAGGACAG-GCCCGGACTTCCTCT--CCC-AGGAGGTGGGGATTGC-----------AGAGGTGAATACACGCGGTCCCATCAGTAGCTGCAAGGT-GGACGAGGAGCCTTGAAAGAGTCCCCGGGG-TCACAGGACAGAGGACTCCACACAGTGGAGGGGGTTTCTCAGGTCCTGGG     
22 Heterocephalus_glaber-NW_004624818.1-169230_169376     86.0%  35.8%    ----------------------------GCGGGAACG-GT--C--CCTCAGCCCGGC--TGCACA---TCCTCTGAGTTAGTCT----GTGC-----A----G-T------TGCTGTGCCCTGCTCCTGGG-AGG------GGGC----TGCACACCTGCAGGTGCCCCGTGTGTGTGTGTGTGTGT----GTGTGT--GTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGCACTCACAGGCACACGCGTGCACCACTAAGCCCATGGGTGTCACTGTGTGGGTTTTGTTGGAGGATTAAATTGATTTTCCAGCTTTCCCCGGGGAAGAGGCAGGGACACTGAGCTGCTGCTGGCCTCTTGTGGATGGTGGC--CCGAGGCCAGGTCACCTGCTGCTGTAGGACAAGACTGATCCTCAGCGCACACAACCGCACG--GCACCGCCACCAGCATCACCAG---TGCT--------CCCT---CCTCCTCAT------GGCTGCCTCTGGGTCCTGT--------------------------------GCAGGCT-TGAGG--AGGAAGGA--GTGTGGGTGAGGCAGGTGCGCCTTGGCACTGTGGGGAAACTGAGGCATGGGTGGGTAGGTGCTGCCGTGGGGGGCGGAGCTCCGCTC----------------CCC----AGCAGCCACT-----GAGGC-------TAGGCTGACA-GGAGCCCCATGAGCCCACC-A------------TGCCCTCTCCCAAGTCCAGGGTGGCTCCAGCTGTCTCTCTGCC--TGTCCTGGGCATGAGGGTAGCGGTGACTGTGGGCTCATGTGCAC--------AC---------TGTGCC--CATCACATGTTTGTGTC--CAG----TGAG--TGC--------CTGCTGGGGACAGGGTGGGGAGCAGGTCCTCAG--AGCGCCCGGGCTCACAGGAGTCCTGGGGCACCACCTAGGGAGGGCCCCTG-GGGAGCTGTGGTGGACACCGTCCCTCCCTGGCCAGGGTGGGAGCCCTGGTCTGGGTGCAG-GGCTGGTGCCAGCAGCTGGTCCTCAACAGCTGTCAGTCCTGGGCCCCT-GGTCCAGATTTGGGGGAGCCTGGGCTGCCTGGGTGTGGGCC-----------------ATGGCCGAGCAGGG---------------TGCTGCATCCTTGGCTGCCCAAGGCAGCAGGTGCCAGG---------------------CCCTGGGCC-----AGCAGGAGAAGCTTTAGGTCCGAACCC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
23 Fukomys_damarensis-NW_022900935.1-169044_169190        83.1%  30.8%    ------------------------------CGAGAAT-TG--T--CCAGAAACTGGC--TGCATC---TTCCCTGAGTTGGGCT----GTAC-----A----G-G------CCCTGTGCCCTGCTGTCAGGAGGA------GGGC----TGCACACCTGCAGGTGCCATGTGTGTGCATACGTGTGT----ATGTG----TGTGTGTGTGTCTGCACATGTGTGTGTCTGCACGTGTGTGCACCGCCAAGCCCATTGGTGTCACTTTGTGGATTTTGTTGGAGGATTAAATTGATTTTCCAGCTTTCCCCGGGAGAGGCAGAGA--TGCTGAGCTGCTGCTGCCTC-TTGTGGATGGCAGC---CAAGGCCAGGTCCCTTGCTGCCATAGTGTG--ACTGGTCCTCGGGC-------------------ACCACCACAGCATTGCTGG---TGCT--------CCCT---CCTCTGCAT------GGTGTC---------CTGT--------------------------------GCAGACT-TGGGG--AGGAAG-----------------GGGCAAACCTTTGCACCATGGGGAAACTGAGGCATGGGTGGGTGATACTGCATG--GCAGGTGGGCCTCTGCCC----------------CCC----AGCAGGCACCTAGGCTAGGC-------TAGGCTGACA-GGAGCCCCATGGCCCC-CC-A------------TGTCCTTTTCCAACTCTAGGGTGGCATCATCT--------ACC--TGTCCTGGGCATGAGGGTACCAGTGACTGTTTCTCTCACCCCCAGGGCAGGCCC---------TGTGCC--CTTGGCCTCCTGTCCAT--CTGTGTCTAGT--AGA--------GTGCCTGCTGGGGATTGGGGGGCAGGTCCCCAA--AGAGCCCAGGCTCACAGGAGTCACAGCACACCACTGAGGGAGGGC-CCAG-GGGAGCTGTGGTGGACAGG------------------GTCCCTCCCTGGTCTGGTTGCAG-AGCTGGTGCCAGCAGCTGGTCCTCAGTGGCTGTCGGTCCTGCACTCCT-GGTCCAGGTCTGCAGGAGACTGGGCTGCCTGGGTATGTACC-----------------ATGGCTGAGCAGGG---------------GGCCATGTCCTCTGGCCATACTGGTTTCAGGGTGGCAC---------------------AGTTGCCCAGGGCCAGGCACTCCCCTGTGATGTCCCAGTCTGGGATGTCGCCTCACTT-GGCCA-----------------T--GGC--------------------------------CACTGC---------------------CTATGTCCACCTGTCCCT-------GAGTGTC------------     
24 Orycteropus_afer-NW_006921723.1-156934_157088          89.0%  36.9%    --AGG---GTT---AAGGGCCAAGCTAGGCTGGACAGGTC--TGTGGCCCCTGGGGC--TGCAGGGATGGGGAAGATGTGG-------CCCC-----T----GGC------CCTAGTCCCCCCATGTATGCTAAA------CGAT----GGGTGAATGAATGAGGATGCATCCCTTCACTCCAGCTG---------------------GGGGGCCAGCCCCTGAAGGGTCATCTCTGCCTCTGC-CAGAAGCCCATGGGTGTCGTTTGTGGGTTTTGTTGGAAGATTAAATTGATTTTGCAGCCGTCCTCTGGGGAGAGGCA-AGATC----------------------TCACCGCCGGCACTGCGGGCCCTGTTGCCTACTGTGTTAGGACAAGATCGATGTGGGCTATAAAAGCAAAATTAAACAGTGGGGCCCCAGCTTCCACAGGCGCAA--------CTGGCTACCCGTTGTTGCTCTGAGTGACCGCCACCCACTG---------------------------------CAGGGGCTCGGGG--AGGAACAAGCAAGGGGCTGGGAAGATGTCTTCTTGGAAAGATGGGAAAACTGAGGCTCACACAGGTGGAACCAGCCCACGGTCGCACTGAA-AGTCAGAGGGGACCAGGGCGGGGCTAGGGCCACTCCCCCTAGCTGC-C-------AAGGC--------TGGGCCTTCCCAGGAGCAT------------CTCTCCTCTGCAGGGTCAGTGTGGGGTCAAGGGCACTG-----------------------------------------CAGG----CTCT------------------GGGGT--CCACAGAGCCCTCCCTG--TACCTTCTCCC--TAACCT----GGAGGTGGCCCTGCCTGTCCTGTC------------------TATCCCTGGTGTGTC-CCTGAGCCCTGGACTGTCTAGGATGGGG-C-TGGC-----TGGAGGTGGCTGAGTCCTAGAGTACTGAGGCCCAAGCCT------GTCC-AG-----CAGTGTCAAGGC-CAGGGGCAGCCTGCTGTCACCTCCTCAGAGCTGGCATGGTGCTGGTGACTGCGCCACCCGTCTG----------------GGGTGGGCTTATGCTCTCTGTGACACCCAT---C--TCATTTCTCC-TGTCATTCATGGAGCATATGTTGTGTGTACCAGGCCCTGGGCTGGGTGCTAAGGACAGAGCAGGGGGC---AAGGAAGGCTCTGTACC-CAAGGGGCCCCAAGA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------     
25 Orcinus_orca-NW_004438465.1-165383_165577              79.6%  32.3%    --------------------------------------------GTTTGCCCCACGAAGGGCAAGCGGGGGGGGGGGGTGTCCCTTCTGGGGCGGGCCTGCGGCT------CCGCAGGAGTCCATGCGGGCACGGGG----GGGGGGGT--GTGTGTGCGCGTGTG------CGCGCGCGTGCGTGTGTGTGTGCGCACGCGTGCGGGGGGGGGGGCACGCGTGCGTGTGTGTGTGCTCGTGCT-GGGAAGCCTGTGGGTGTAATTGGGGGGGGGGGTTGGAAGATTAAACTGATTTCCCAGCCTTCCCTGG-GGAGAGGTGG---------A-G---------------ATGGGGGGG-GGGGTGCTCC-CTCGTTGCTGCCGCGTTAGGACAAGATCAGTCTCGGCCATAAAAACAAA-ATGAAGCCAGAGCTCCCCGGCTTCTGACCG-----TAAG---GG-CCTCCTTCCTTGGAGC---CATGGCCGCCAGTGTCCCGTG-----------------GCCGCCGTCCTCCGTGGGGCTTGGGGC-AGGAAGGAGCCAGGGGCT--G-GGGGCCGCCTTCCGACAGCTGGGGGCCCTGAGGCAGGGGGCCGGGCGAGGCCCATGGGGGGGGGGGGTTTCCTGG----CG-C-------TGCTGGG--CCAGGCGTCCTGGGCGGTGGTTCTGCCG--------CGGGGGGGGGGGGGAGGGCCCC------GGGCGCCTCTCCCC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGGGGGTCGTGTGGGGTTGAGGGTGCGGGGGGGGGGGCTCG-CCTCAGGAGCTGGCCCTGCCCGTCC--CGTCTGCTG----GGCG--------CGTCTGCGGGGGGGGGGGTGCGGCTGGAGGTGTCGGTGCTGCCTGGTG-AGGCTGA--G----------------------CC-----C---TGGAAGGCGGGGGGGGGGGGCCAG-ACGCCGGCTCCGTGTCACCTCC-TGGA-GC------TGGCTTGGCAGCCCGGGCCCTGTGCC---------------CACCCCCACTTG----AGCGCCTGGT-----------CCCAGCTGGT---GCAGGGGCAGAGCCGGGCGG-GGGGGGGGGTCCCCT--CCC-TGGAGCACACAGTGTG------------CAGGCGAATACGCGTGGTCCTGTCGGGGGGGGGGGGGCAGCGTGAGGAGCCTTGAAGGAATCCCCCAGGGTCACGGGACAGGACGGGGGG----------GGGGGAGCACA---------     
   clustal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       . .      *            * .       .  ..  :. .  . **   ..      *   *                                                                       .    .* . .  *