RNAcode could not find significant results in the alignment.
GCCGTTCCAGCTCCCCCAGGGCTCTGTGCACACGGACCAGGAGCCACCCAAGGGGGCAGAACAAAGTCAGGCCCCAGGGCCCCCTCCGGCCTGCTCCCCTGCCGAGCTGGGTACTGCCATGGGGTCAGGCCCTTCCCTCCACAACGCCCCCACCTCCTGCTGAGAGCTGGAGTGGCTGCCACACGGAGGGCGCTGCCAGAGGAGAGGGCAGAGCGTCTGTCCCTGCGGTGCCCTCCAGGTGTGCCTAGGGTGGCCCCAGCCCCACAGGCCCCGGGCACTTGCCCTTGGTTCCCCTGCCCTTGCTGGGACCCCTCAGGCCCAGCCTGACTCTGGGATCCCTGGGCTCCTAGCACGACCACTCTGGGGTCCTGCCTGTGGGGAGGGCTCGAGGCACCGACTCACACTCCTGATAAAATAAAAATAGTTGGGGAGGAGGCTCCCAGACGTGCGGGGGGACAAGTGGCTTCTCTCAGACGTTTAAATAATCTCCGCCATATGTGTGTGGGCCCGGCCCTCCCTCCCGTGCGGCGCCAGTCCAGGGGCCCGGCTGATCTCCAGTGAGCACTGTGGCTGGGGCAAGGTGGCCACTTCCTCCTCCCTCCCGTCCACCCAAGCACAGCCTCAGCCCCTCCTGCATGCTGGGCCGGCCCTTGGGGGCAGCACGGGAGGGGGATGCTGGGGCTGCGAGGGGCAGGGGGGCGCGGAAGAGCCAGGGCCAGGAAGGGCTGCAGGAGCATCTGGCCCTCATGCCTCACTGCTGCTGAGGTCCTTTGCTCTCCTAGCCCTGGGATGCGGCTGCCTCAGGGACTCTTGGTGGCCCTGGAGGGTGGGTAGGCTGGCCTGGGGGCCATTGGGACAGCAGGTGACGGTCAGGCCAATGCCAGCCGGGCCCAGGCACAGCCCTGTGGGGGCTTCAGAGGGAGACACGGGTGGGCCCAGGGAGGTCCTTTGAAATGTCCTGCTGAAAGGCAGCAAGCGTCGGGAGAGGAGGGGGCTTAGA
Sequences in the aligment must have a pairwise distance to any other sequence of 10.0%.
Sequences can only have pairwise distance to the input sequence of 60.0%.
Sequences are searched in the RefSeq Representative Genome Database.
Reference sequence (1): Target Identities normalised by aligned length. Colored by: consensus/70% |
cov pid 1 [ . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . . . . : . . . . 4 . . . . : . . . . 5 . . . . : . . . . 6 . . . . : . . . . 7 . . . . : . . . . 8 . . . . : . . . . 9 . . . . : . . . . 0 . . . . : . . . . 1 . . . . : . . . . 2 . . . . : . . . . 3 . ] 1315 1 Target 100.0% 100.0% 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2 Aotus_nancymaae-NW_018508829.1-98721_99412 91.4% 64.4% 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3 Propithecus_coquereli-NW_012152752.1-166783_167068 83.4% 36.9% 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4 Microcebus_murinus-NC_033661.1-163678_163938 83.1% 35.7% 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15 Cervus_elaphus-NC_057828.1-179047_179397 87.7% 41.5% 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25 Equus_przewalskii-NW_007674960.1-175304_175667 87.3% 32.4% 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